View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9893_low_55 (Length: 243)

Name: NF9893_low_55
Description: NF9893
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9893_low_55
NF9893_low_55
[»] chr3 (222 HSPs)
chr3 (12-224)||(9994369-9994581)
chr3 (12-224)||(12249915-12250127)
chr3 (12-224)||(9982361-9982573)
chr3 (12-224)||(12238089-12238301)
chr3 (12-224)||(6490825-6491037)
chr3 (12-224)||(6501479-6501691)
chr3 (12-224)||(23635256-23635468)
chr3 (12-224)||(4175233-4175445)
chr3 (12-224)||(5537497-5537709)
chr3 (12-224)||(5548081-5548293)
chr3 (12-224)||(6181004-6181216)
chr3 (12-224)||(6221178-6221390)
chr3 (12-224)||(13121209-13121421)
chr3 (12-224)||(13557121-13557333)
chr3 (12-224)||(14475768-14475980)
chr3 (12-224)||(23767441-23767653)
chr3 (12-224)||(37865992-37866204)
chr3 (12-224)||(37885125-37885337)
chr3 (12-224)||(39673359-39673570)
chr3 (12-224)||(13131451-13131663)
chr3 (12-224)||(19788569-19788781)
chr3 (12-224)||(23756845-23757057)
chr3 (12-224)||(5866172-5866386)
chr3 (12-224)||(5876771-5876985)
chr3 (12-224)||(20720658-20720872)
chr3 (12-224)||(24383995-24384209)
chr3 (12-224)||(23647295-23647508)
chr3 (12-224)||(19777932-19778144)
chr3 (12-224)||(20684255-20684466)
chr3 (12-224)||(5580110-5580324)
chr3 (12-224)||(12297278-12297492)
chr3 (12-224)||(18483590-18483803)
chr3 (13-224)||(933174-933386)
chr3 (12-224)||(10655740-10655952)
chr3 (12-224)||(504644-504857)
chr3 (12-224)||(527010-527223)
chr3 (12-224)||(4743284-4743497)
chr3 (12-224)||(4753871-4754084)
chr3 (12-224)||(8774203-8774416)
chr3 (12-224)||(10098614-10098827)
chr3 (12-224)||(11272860-11273074)
chr3 (12-224)||(12287456-12287670)
chr3 (12-224)||(24659446-24659659)
chr3 (12-224)||(24670026-24670239)
chr3 (12-224)||(28314709-28314922)
chr3 (12-224)||(28325323-28325536)
chr3 (12-224)||(35186923-35187136)
chr3 (12-224)||(38194270-38194483)
chr3 (12-224)||(39382236-39382449)
chr3 (12-224)||(41683224-41683437)
chr3 (12-224)||(41693793-41694006)
chr3 (12-224)||(37759216-37759428)
chr3 (12-224)||(5510242-5510455)
chr3 (12-224)||(5520420-5520633)
chr3 (12-224)||(5628494-5628707)
chr3 (13-224)||(10627418-10627629)
chr3 (12-224)||(16385621-16385834)
chr3 (12-224)||(39371599-39371812)
chr3 (12-224)||(29461689-29461901)
chr3 (12-224)||(29472541-29472753)
chr3 (12-224)||(38204805-38205019)
chr3 (12-224)||(13373142-13373356)
chr3 (12-224)||(13394330-13394544)
chr3 (12-224)||(20673670-20673882)
chr3 (13-224)||(1794960-1795170)
chr3 (12-224)||(13383736-13383950)
chr3 (12-224)||(8784817-8785031)
chr3 (13-224)||(17910481-17910692)
chr3 (13-224)||(48336790-48337000)
chr3 (13-224)||(7804994-7805205)
chr3 (13-224)||(24707031-24707242)
chr3 (13-224)||(1784547-1784757)
chr3 (13-224)||(11206550-11206760)
chr3 (32-224)||(9391680-9391872)
chr3 (32-224)||(11217201-11217393)
chr3 (13-217)||(19887837-19888040)
chr3 (13-223)||(4403822-4404030)
chr3 (13-224)||(7795083-7795294)
chr3 (33-224)||(11163398-11163588)
chr3 (33-224)||(13262149-13262340)
chr3 (13-223)||(4433309-4433517)
chr3 (13-223)||(15194516-15194726)
chr3 (35-224)||(9381134-9381323)
chr3 (13-224)||(9535157-9535368)
chr3 (13-205)||(13601782-13601973)
chr3 (13-224)||(38314243-38314452)
chr3 (13-224)||(28168659-28168870)
chr3 (13-224)||(14258542-14258751)
chr3 (12-166)||(33650747-33650901)
chr3 (33-224)||(14322168-14322358)
chr3 (12-211)||(27882930-27883127)
chr3 (31-224)||(8740602-8740795)
chr3 (12-211)||(8996447-8996644)
chr3 (12-142)||(11530344-11530474)
chr3 (16-211)||(9006999-9007192)
chr3 (12-224)||(1053255-1053467)
chr3 (33-224)||(16076494-16076687)
chr3 (54-209)||(18857426-18857580)
chr3 (13-171)||(19121370-19121527)
chr3 (12-224)||(1063684-1063896)
chr3 (13-224)||(29906658-29906869)
chr3 (12-224)||(17281911-17282122)
chr3 (39-166)||(24393356-24393483)
chr3 (12-121)||(35579002-35579111)
chr3 (45-224)||(29934037-29934217)
chr3 (45-224)||(29983191-29983371)
chr3 (33-224)||(29947823-29948016)
chr3 (33-224)||(29996977-29997170)
chr3 (12-224)||(13199723-13199936)
chr3 (33-222)||(27172428-27172622)
chr3 (14-120)||(13076442-13076547)
chr3 (33-223)||(51989627-51989821)
chr3 (12-224)||(15663213-15663427)
chr3 (15-224)||(15651578-15651789)
chr3 (33-224)||(10528733-10528930)
chr3 (16-223)||(31114468-31114677)
chr3 (33-224)||(2245928-2246123)
chr3 (33-224)||(17017389-17017585)
chr3 (12-194)||(21735713-21735896)
chr3 (16-223)||(13953607-13953817)
chr3 (33-223)||(22150605-22150800)
chr3 (33-225)||(17006553-17006750)
chr3 (31-223)||(15832765-15832962)
chr3 (97-224)||(16671638-16671766)
chr3 (13-111)||(7608861-7608958)
chr3 (12-77)||(27244975-27245040)
chr3 (16-223)||(41045086-41045297)
chr3 (31-223)||(49989618-49989815)
chr3 (12-208)||(14580685-14580881)
chr3 (31-224)||(37411992-37412191)
chr3 (31-224)||(45862163-45862362)
chr3 (31-224)||(13147650-13147850)
chr3 (16-117)||(27849572-27849668)
chr3 (31-222)||(15848499-15848695)
chr3 (26-117)||(13931347-13931439)
chr3 (31-208)||(12753243-12753425)
chr3 (33-107)||(17960968-17961043)
chr3 (33-138)||(17769645-17769754)
chr3 (33-138)||(19070946-19071055)
chr3 (53-118)||(13410752-13410817)
chr3 (34-208)||(51340340-51340519)
chr3 (31-112)||(2560542-2560624)
chr3 (52-118)||(11078134-11078200)
chr3 (12-54)||(30390841-30390883)
chr3 (39-112)||(3238057-3238130)
chr3 (26-118)||(21316905-21316998)
chr3 (39-112)||(23538884-23538957)
chr3 (52-104)||(20724466-20724518)
chr3 (52-115)||(50299613-50299677)
chr3 (52-118)||(6252799-6252866)
chr3 (51-118)||(19198588-19198655)
chr3 (54-109)||(22804746-22804801)
chr3 (35-223)||(11909646-11909840)
chr3 (31-112)||(17239643-17239725)
chr3 (52-118)||(22770571-22770637)
chr3 (31-112)||(26418397-26418479)
chr3 (52-113)||(47207083-47207145)
chr3 (40-117)||(8693512-8693589)
chr3 (40-117)||(9045399-9045476)
chr3 (168-224)||(13953791-13953848)
chr3 (168-224)||(14580871-14580928)
chr3 (45-117)||(15647145-15647218)
chr3 (168-224)||(18006023-18006080)
chr3 (52-104)||(6090105-6090157)
chr3 (52-112)||(14063710-14063770)
chr3 (31-113)||(28581462-28581546)
chr3 (54-113)||(49669207-49669267)
chr3 (39-117)||(12410413-12410492)
chr3 (53-112)||(13939275-13939334)
chr3 (51-118)||(14078029-14078096)
chr3 (31-112)||(49554216-49554299)
chr3 (40-117)||(932249-932327)
chr3 (68-118)||(6174730-6174780)
chr3 (31-112)||(12963806-12963888)
chr3 (52-118)||(13698783-13698849)
chr3 (26-100)||(16305781-16305855)
chr3 (72-138)||(20736609-20736673)
chr3 (31-112)||(29952157-29952239)
chr3 (31-112)||(30001311-30001393)
chr3 (52-113)||(30054898-30054960)
chr3 (168-224)||(11909615-11909672)
chr3 (168-224)||(12753196-12753253)
chr3 (53-113)||(13823446-13823507)
chr3 (57-110)||(20645537-20645590)
chr3 (53-113)||(31302728-31302789)
chr3 (39-104)||(52919830-52919895)
chr3 (26-138)||(1463738-1463853)
chr3 (31-113)||(2782835-2782919)
chr3 (55-119)||(12396450-12396514)
chr3 (52-111)||(20628153-20628213)
chr3 (31-113)||(21638991-21639075)
chr3 (54-113)||(22463751-22463811)
chr3 (54-113)||(22465209-22465269)
chr3 (31-113)||(40850333-40850417)
chr3 (168-223)||(51340509-51340565)
chr3 (53-112)||(12967687-12967746)
chr3 (51-138)||(20747293-20747377)
chr3 (52-114)||(53057446-53057509)
chr3 (52-113)||(1728734-1728796)
chr3 (52-113)||(2025467-2025529)
chr3 (52-118)||(4243830-4243896)
chr3 (39-112)||(11189378-11189452)
chr3 (68-118)||(15961340-15961389)
chr3 (52-113)||(40799276-40799338)
chr3 (52-113)||(46797114-46797176)
chr3 (168-224)||(4243696-4243753)
chr3 (86-138)||(4768229-4768281)
chr3 (168-205)||(8710418-8710455)
chr3 (168-205)||(9062305-9062342)
chr3 (31-95)||(10849947-10850012)
chr3 (52-112)||(12726955-12727016)
chr3 (168-224)||(13410623-13410680)
chr3 (52-112)||(13781306-13781367)
chr3 (168-224)||(15663183-15663240)
chr3 (168-224)||(22150774-22150831)
chr3 (168-224)||(31114437-31114494)
chr3 (168-224)||(49989789-49989846)
chr3 (81-113)||(2784473-2784505)
chr3 (168-223)||(15848700-15848756)
chr3 (52-111)||(29854784-29854844)
chr3 (168-223)||(29934008-29934064)
chr3 (168-223)||(29983162-29983218)
[»] chr4 (159 HSPs)
chr4 (12-224)||(18763581-18763793)
chr4 (12-222)||(5022302-5022512)
chr4 (12-224)||(18752971-18753183)
chr4 (12-224)||(27815427-27815639)
chr4 (12-224)||(48370697-48370909)
chr4 (12-224)||(450142-450354)
chr4 (12-224)||(4947903-4948115)
chr4 (12-224)||(15561561-15561773)
chr4 (12-224)||(19955444-19955656)
chr4 (12-224)||(21995979-21996191)
chr4 (12-224)||(22006577-22006789)
chr4 (12-224)||(30926976-30927188)
chr4 (12-224)||(460723-460935)
chr4 (12-224)||(14844135-14844347)
chr4 (12-224)||(19944809-19945021)
chr4 (12-224)||(30937554-30937766)
chr4 (12-224)||(52703354-52703566)
chr4 (12-224)||(18130722-18130936)
chr4 (12-224)||(17917617-17917830)
chr4 (12-224)||(17928265-17928478)
chr4 (12-224)||(16255432-16255643)
chr4 (12-224)||(16266025-16266236)
chr4 (12-224)||(40454831-40455043)
chr4 (12-224)||(40471069-40471281)
chr4 (12-224)||(18078388-18078602)
chr4 (12-224)||(10741076-10741289)
chr4 (12-224)||(10954845-10955058)
chr4 (12-224)||(24639813-24640026)
chr4 (12-224)||(27656164-27656378)
chr4 (12-224)||(27666737-27666951)
chr4 (12-224)||(29042138-29042351)
chr4 (12-224)||(36017901-36018114)
chr4 (12-224)||(36028454-36028667)
chr4 (12-224)||(49517700-49517913)
chr4 (12-222)||(10751652-10751863)
chr4 (12-222)||(10965421-10965632)
chr4 (12-224)||(24028567-24028782)
chr4 (12-224)||(25656701-25656913)
chr4 (12-224)||(55745734-55745947)
chr4 (12-224)||(55756345-55756558)
chr4 (13-224)||(10908975-10909185)
chr4 (13-224)||(16304674-16304884)
chr4 (13-224)||(16316898-16317108)
chr4 (13-224)||(25008463-25008673)
chr4 (13-224)||(10695209-10695418)
chr4 (13-224)||(47152531-47152740)
chr4 (13-224)||(14836584-14836794)
chr4 (16-224)||(3370284-3370492)
chr4 (16-224)||(3390024-3390232)
chr4 (13-206)||(19143504-19143696)
chr4 (36-224)||(19580830-19581017)
chr4 (13-224)||(5872939-5873148)
chr4 (13-224)||(15207870-15208079)
chr4 (31-224)||(11535428-11535622)
chr4 (33-224)||(10300120-10300312)
chr4 (12-218)||(24712993-24713198)
chr4 (71-224)||(4986892-4987045)
chr4 (33-160)||(8183486-8183613)
chr4 (12-122)||(9920958-9921068)
chr4 (12-224)||(11514601-11514812)
chr4 (12-121)||(28050129-28050238)
chr4 (12-224)||(31267274-31267485)
chr4 (12-121)||(49509543-49509652)
chr4 (13-141)||(19570584-19570711)
chr4 (12-166)||(10290191-10290345)
chr4 (16-224)||(16819828-16820038)
chr4 (15-224)||(49002463-49002670)
chr4 (16-224)||(23508713-23508923)
chr4 (16-223)||(19241589-19241798)
chr4 (16-224)||(14711256-14711468)
chr4 (16-224)||(14778920-14779132)
chr4 (15-224)||(55650893-55651100)
chr4 (32-121)||(17199074-17199163)
chr4 (12-95)||(3188988-3189071)
chr4 (12-95)||(20649445-20649528)
chr4 (12-93)||(29030156-29030237)
chr4 (16-208)||(18775179-18775372)
chr4 (33-224)||(36210588-36210784)
chr4 (12-138)||(39532269-39532395)
chr4 (16-223)||(18007569-18007778)
chr4 (16-189)||(18775515-18775689)
chr4 (31-223)||(33377762-33377959)
chr4 (16-108)||(18775930-18776020)
chr4 (26-112)||(13693194-13693280)
chr4 (52-118)||(19889651-19889717)
chr4 (12-58)||(43347078-43347124)
chr4 (52-112)||(55379683-55379743)
chr4 (26-118)||(14903084-14903177)
chr4 (52-112)||(11900564-11900624)
chr4 (52-112)||(15015064-15015124)
chr4 (31-113)||(16939352-16939436)
chr4 (16-99)||(17994362-17994442)
chr4 (26-118)||(18473414-18473506)
chr4 (31-113)||(19884084-19884168)
chr4 (31-118)||(20571666-20571754)
chr4 (111-205)||(8997740-8997831)
chr4 (53-112)||(12600134-12600193)
chr4 (31-112)||(15135080-15135163)
chr4 (72-138)||(19052738-19052803)
chr4 (39-138)||(24619079-24619181)
chr4 (69-138)||(7221936-7222007)
chr4 (148-224)||(17994270-17994345)
chr4 (54-112)||(23749899-23749957)
chr4 (52-112)||(14190088-14190149)
chr4 (39-112)||(16476056-16476129)
chr4 (52-112)||(16847921-16847982)
chr4 (52-112)||(16852877-16852938)
chr4 (39-112)||(17788718-17788791)
chr4 (31-111)||(41115436-41115517)
chr4 (31-113)||(6516839-6516923)
chr4 (31-117)||(17527016-17527104)
chr4 (31-110)||(22089637-22089717)
chr4 (31-113)||(22676198-22676282)
chr4 (52-112)||(29681194-29681254)
chr4 (31-113)||(54679279-54679363)
chr4 (53-112)||(6641059-6641117)
chr4 (53-112)||(8686121-8686180)
chr4 (31-112)||(14154672-14154755)
chr4 (55-118)||(16325167-16325230)
chr4 (57-138)||(32491438-32491521)
chr4 (39-112)||(16631800-16631874)
chr4 (45-135)||(22223437-22223525)
chr4 (39-112)||(36470329-36470403)
chr4 (52-113)||(55731221-55731283)
chr4 (45-132)||(8911037-8911122)
chr4 (39-112)||(18773455-18773528)
chr4 (168-224)||(18775132-18775189)
chr4 (31-113)||(3106094-3106178)
chr4 (53-112)||(8103659-8103719)
chr4 (52-112)||(11915074-11915134)
chr4 (53-112)||(14605582-14605642)
chr4 (31-113)||(17399350-17399434)
chr4 (168-224)||(18773578-18773634)
chr4 (31-113)||(45832738-45832822)
chr4 (39-118)||(10661838-10661917)
chr4 (39-118)||(10875983-10876062)
chr4 (84-138)||(13977914-13977968)
chr4 (39-113)||(15475819-15475898)
chr4 (51-118)||(18393952-18394019)
chr4 (31-104)||(19665716-19665791)
chr4 (52-95)||(37986307-37986350)
chr4 (52-113)||(13576791-13576853)
chr4 (52-113)||(17701431-17701493)
chr4 (45-135)||(19556050-19556137)
chr4 (52-109)||(37436212-37436270)
chr4 (168-224)||(1671908-1671965)
chr4 (53-118)||(13890209-13890274)
chr4 (45-86)||(15193165-15193206)
chr4 (168-224)||(19241772-19241829)
chr4 (168-224)||(19889517-19889574)
chr4 (168-224)||(33377933-33377990)
chr4 (53-113)||(39420380-39420441)
chr4 (168-224)||(55651073-55651130)
chr4 (52-104)||(3395023-3395075)
chr4 (54-118)||(10249309-10249373)
chr4 (168-223)||(24619175-24619231)
chr4 (72-131)||(39981226-39981284)
chr4 (31-113)||(40860022-40860106)
chr4 (54-113)||(56033948-56034008)
[»] chr5 (179 HSPs)
chr5 (12-224)||(7031608-7031820)
chr5 (12-224)||(10755088-10755300)
chr5 (12-224)||(40390953-40391165)
chr5 (12-224)||(40401615-40401827)
chr5 (12-224)||(9336551-9336763)
chr5 (12-224)||(9347138-9347350)
chr5 (12-224)||(16003343-16003555)
chr5 (12-224)||(23362707-23362919)
chr5 (12-224)||(27602870-27603082)
chr5 (12-224)||(36582009-36582221)
chr5 (12-224)||(36592564-36592776)
chr5 (12-224)||(39353084-39353296)
chr5 (12-224)||(43043123-43043335)
chr5 (12-224)||(5290027-5290240)
chr5 (12-224)||(5300598-5300811)
chr5 (12-224)||(6131387-6131599)
chr5 (12-224)||(15992781-15992993)
chr5 (12-224)||(27622219-27622431)
chr5 (12-224)||(34772506-34772718)
chr5 (12-224)||(34783451-34783663)
chr5 (12-224)||(39365077-39365289)
chr5 (12-224)||(14557467-14557681)
chr5 (12-224)||(14568104-14568318)
chr5 (13-224)||(22560033-22560244)
chr5 (12-224)||(23296873-23297087)
chr5 (12-224)||(23307441-23307655)
chr5 (12-224)||(23708038-23708252)
chr5 (12-224)||(30226946-30227160)
chr5 (12-224)||(30237473-30237687)
chr5 (12-224)||(40513439-40513653)
chr5 (12-224)||(42043380-42043594)
chr5 (12-224)||(42053955-42054169)
chr5 (12-224)||(30069355-30069568)
chr5 (12-224)||(22147119-22147330)
chr5 (12-224)||(6976405-6976619)
chr5 (12-224)||(6986895-6987109)
chr5 (12-224)||(22676713-22676927)
chr5 (12-224)||(22686604-22686818)
chr5 (12-224)||(23697380-23697594)
chr5 (12-224)||(33951250-33951464)
chr5 (12-224)||(35216102-35216315)
chr5 (12-224)||(35226686-35226899)
chr5 (12-224)||(39490400-39490614)
chr5 (12-224)||(39501590-39501804)
chr5 (16-224)||(22157702-22157909)
chr5 (12-224)||(27204388-27204600)
chr5 (12-224)||(31419259-31419471)
chr5 (12-224)||(9376913-9377126)
chr5 (12-224)||(14030640-14030853)
chr5 (12-224)||(14041193-14041406)
chr5 (12-224)||(14446452-14446665)
chr5 (12-224)||(14457064-14457277)
chr5 (12-224)||(15693483-15693696)
chr5 (12-224)||(15740564-15740777)
chr5 (12-224)||(15769724-15769937)
chr5 (12-224)||(17719513-17719726)
chr5 (12-224)||(17730165-17730378)
chr5 (12-224)||(24567685-24567898)
chr5 (12-224)||(24816337-24816550)
chr5 (12-224)||(24826925-24827138)
chr5 (12-224)||(27460757-27460970)
chr5 (12-224)||(27471156-27471369)
chr5 (12-224)||(31834079-31834295)
chr5 (12-224)||(31844557-31844773)
chr5 (12-224)||(37728703-37728916)
chr5 (12-224)||(37740019-37740232)
chr5 (12-224)||(1121354-1121566)
chr5 (12-224)||(31449150-31449362)
chr5 (12-224)||(17607655-17607868)
chr5 (12-224)||(17618270-17618483)
chr5 (12-224)||(24808508-24808721)
chr5 (12-224)||(27041663-27041876)
chr5 (12-224)||(27052287-27052500)
chr5 (12-224)||(31349129-31349342)
chr5 (12-224)||(31359743-31359956)
chr5 (12-224)||(36688290-36688503)
chr5 (12-224)||(36698856-36699069)
chr5 (12-224)||(1108596-1108808)
chr5 (13-224)||(20798292-20798502)
chr5 (13-224)||(19464567-19464779)
chr5 (13-224)||(23407042-23407252)
chr5 (13-224)||(19478597-19478809)
chr5 (13-224)||(17446150-17446359)
chr5 (13-224)||(36229335-36229545)
chr5 (13-224)||(36085057-36085267)
chr5 (13-224)||(42395580-42395790)
chr5 (13-224)||(8522437-8522648)
chr5 (13-224)||(20552411-20552622)
chr5 (16-224)||(21702581-21702788)
chr5 (32-224)||(34063218-34063409)
chr5 (13-224)||(43621347-43621558)
chr5 (13-224)||(23392997-23393207)
chr5 (13-224)||(34052557-34052766)
chr5 (13-224)||(24982872-24983084)
chr5 (32-224)||(17456784-17456975)
chr5 (32-224)||(24925609-24925803)
chr5 (36-224)||(20562921-20563110)
chr5 (33-224)||(37407244-37407434)
chr5 (16-224)||(21705421-21705635)
chr5 (12-224)||(20625362-20625574)
chr5 (12-224)||(106716-106927)
chr5 (12-224)||(21420215-21420426)
chr5 (15-224)||(20417500-20417707)
chr5 (12-224)||(35543694-35543908)
chr5 (33-224)||(13522581-13522776)
chr5 (16-224)||(40033322-40033534)
chr5 (33-223)||(20215702-20215897)
chr5 (16-224)||(36096218-36096428)
chr5 (16-224)||(36097675-36097885)
chr5 (33-224)||(32753418-32753609)
chr5 (16-224)||(20168633-20168843)
chr5 (33-224)||(23487908-23488103)
chr5 (33-223)||(23477732-23477926)
chr5 (31-223)||(40228012-40228210)
chr5 (16-178)||(13533323-13533486)
chr5 (16-224)||(1914787-1914999)
chr5 (26-117)||(26056184-26056276)
chr5 (112-224)||(13403702-13403814)
chr5 (31-223)||(25112463-25112661)
chr5 (31-223)||(25171554-25171752)
chr5 (31-223)||(32160102-32160300)
chr5 (45-113)||(21659581-21659649)
chr5 (31-112)||(7746396-7746478)
chr5 (31-104)||(31117232-31117306)
chr5 (52-118)||(31589637-31589703)
chr5 (52-116)||(6513128-6513193)
chr5 (31-113)||(10848126-10848210)
chr5 (52-112)||(13546223-13546283)
chr5 (53-112)||(9399318-9399377)
chr5 (16-225)||(11208593-11208806)
chr5 (31-112)||(25097528-25097610)
chr5 (31-112)||(25155498-25155580)
chr5 (52-118)||(26120517-26120583)
chr5 (52-112)||(11993265-11993326)
chr5 (168-224)||(32160274-32160331)
chr5 (52-112)||(90125-90185)
chr5 (31-113)||(3246140-3246224)
chr5 (55-114)||(26764883-26764943)
chr5 (31-113)||(28138958-28139042)
chr5 (31-113)||(28465036-28465120)
chr5 (31-113)||(30742336-30742420)
chr5 (31-113)||(35932706-35932790)
chr5 (53-112)||(643402-643461)
chr5 (31-112)||(17814317-17814400)
chr5 (53-112)||(19536999-19537058)
chr5 (31-112)||(22000729-22000811)
chr5 (31-112)||(26766537-26766619)
chr5 (53-113)||(13736773-13736834)
chr5 (39-112)||(23880428-23880501)
chr5 (53-113)||(33022040-33022101)
chr5 (53-118)||(39799536-39799601)
chr5 (31-113)||(4886317-4886401)
chr5 (31-109)||(6498666-6498746)
chr5 (45-132)||(9823663-9823749)
chr5 (168-223)||(12078357-12078413)
chr5 (53-112)||(12353496-12353556)
chr5 (52-112)||(20968623-20968683)
chr5 (52-112)||(21199702-21199762)
chr5 (45-137)||(24495158-24495248)
chr5 (86-138)||(26013259-26013310)
chr5 (31-113)||(30116535-30116619)
chr5 (31-113)||(33932622-33932706)
chr5 (31-113)||(35986932-35987016)
chr5 (170-224)||(11208564-11208619)
chr5 (31-109)||(23413679-23413758)
chr5 (52-113)||(15516347-15516409)
chr5 (51-132)||(22747800-22747880)
chr5 (52-118)||(23589095-23589161)
chr5 (168-224)||(23477900-23477957)
chr5 (168-224)||(23589238-23589295)
chr5 (168-224)||(25112432-25112489)
chr5 (168-224)||(25171523-25171580)
chr5 (39-112)||(26783716-26783789)
chr5 (168-224)||(32753582-32753639)
chr5 (168-224)||(40228184-40228241)
chr5 (31-113)||(9088324-9088408)
chr5 (81-113)||(14087239-14087271)
chr5 (31-109)||(29139107-29139187)
chr5 (81-113)||(31487643-31487675)
[»] chr2 (140 HSPs)
chr2 (12-224)||(30489319-30489531)
chr2 (12-224)||(16768464-16768676)
chr2 (12-224)||(43082175-43082387)
chr2 (12-224)||(1099690-1099902)
chr2 (12-224)||(4099335-4099547)
chr2 (12-224)||(4209410-4209622)
chr2 (12-224)||(7006302-7006514)
chr2 (12-224)||(9773799-9774011)
chr2 (12-224)||(11389304-11389516)
chr2 (12-224)||(22960827-22961039)
chr2 (12-224)||(24328229-24328441)
chr2 (12-224)||(24338899-24339111)
chr2 (12-224)||(40250714-40250926)
chr2 (12-224)||(43092784-43092996)
chr2 (12-224)||(4220002-4220214)
chr2 (12-224)||(9763263-9763475)
chr2 (12-224)||(17857932-17858144)
chr2 (12-224)||(22915359-22915571)
chr2 (12-224)||(29243743-29243955)
chr2 (12-224)||(29254322-29254534)
chr2 (12-224)||(18393132-18393346)
chr2 (12-224)||(34477449-34477662)
chr2 (12-224)||(40221853-40222065)
chr2 (12-224)||(11395667-11395881)
chr2 (12-224)||(11405983-11406197)
chr2 (12-224)||(34790712-34790924)
chr2 (12-224)||(34804855-34805067)
chr2 (12-224)||(10266514-10266727)
chr2 (12-224)||(10277091-10277304)
chr2 (12-224)||(27220901-27221114)
chr2 (12-224)||(32217393-32217607)
chr2 (12-224)||(35252502-35252715)
chr2 (12-224)||(35263111-35263324)
chr2 (12-224)||(35273736-35273949)
chr2 (13-224)||(36252339-36252550)
chr2 (12-224)||(9908657-9908872)
chr2 (12-224)||(2561009-2561221)
chr2 (12-224)||(21651000-21651213)
chr2 (12-224)||(39170590-39170803)
chr2 (12-224)||(9898069-9898284)
chr2 (13-224)||(21172961-21173174)
chr2 (12-224)||(43344928-43345141)
chr2 (12-224)||(43354543-43354756)
chr2 (13-224)||(24428081-24428291)
chr2 (13-224)||(28721811-28722021)
chr2 (13-224)||(28732397-28732607)
chr2 (13-224)||(24415516-24415726)
chr2 (13-224)||(26866595-26866804)
chr2 (32-218)||(26879202-26879387)
chr2 (13-224)||(18769400-18769609)
chr2 (33-224)||(38586582-38586775)
chr2 (33-218)||(27978883-27979068)
chr2 (33-218)||(28065412-28065597)
chr2 (12-224)||(36785294-36785506)
chr2 (13-178)||(30794332-30794497)
chr2 (15-224)||(22763176-22763387)
chr2 (12-224)||(967999-968210)
chr2 (12-211)||(1041671-1041868)
chr2 (16-224)||(19498458-19498668)
chr2 (33-224)||(22773896-22774091)
chr2 (12-224)||(17970765-17970975)
chr2 (16-224)||(24274552-24274758)
chr2 (12-223)||(19355838-19356051)
chr2 (33-224)||(19302919-19303114)
chr2 (33-224)||(19313485-19313680)
chr2 (34-223)||(23393219-23393412)
chr2 (16-224)||(38033299-38033510)
chr2 (16-223)||(20647108-20647317)
chr2 (50-224)||(22754871-22755051)
chr2 (16-161)||(38040521-38040669)
chr2 (34-223)||(24802099-24802293)
chr2 (12-67)||(20221144-20221199)
chr2 (34-223)||(24815066-24815260)
chr2 (45-117)||(22682798-22682871)
chr2 (45-117)||(14794452-14794523)
chr2 (45-117)||(19321021-19321093)
chr2 (16-108)||(22615225-22615315)
chr2 (52-112)||(24851329-24851389)
chr2 (34-208)||(1083368-1083547)
chr2 (51-118)||(24843578-24843645)
chr2 (31-112)||(21537852-21537934)
chr2 (51-120)||(8684995-8685062)
chr2 (52-112)||(22257575-22257635)
chr2 (53-112)||(28141268-28141327)
chr2 (31-112)||(10010418-10010500)
chr2 (148-224)||(19300478-19300553)
chr2 (52-118)||(22382859-22382925)
chr2 (31-112)||(24376458-24376540)
chr2 (53-118)||(21845537-21845602)
chr2 (54-118)||(10899171-10899235)
chr2 (51-119)||(17418219-17418285)
chr2 (52-112)||(18702114-18702174)
chr2 (52-112)||(22271504-22271564)
chr2 (52-112)||(25828536-25828595)
chr2 (45-132)||(26655322-26655408)
chr2 (31-113)||(44839785-44839869)
chr2 (52-119)||(21822976-21823041)
chr2 (53-112)||(26367074-26367133)
chr2 (12-47)||(38207709-38207744)
chr2 (31-112)||(19539768-19539850)
chr2 (31-112)||(40781828-40781910)
chr2 (168-224)||(1083537-1083594)
chr2 (168-224)||(21845679-21845736)
chr2 (53-118)||(21911489-21911554)
chr2 (53-118)||(24838480-24838545)
chr2 (70-138)||(27766146-27766213)
chr2 (52-112)||(18431604-18431664)
chr2 (42-138)||(27939418-27939516)
chr2 (53-112)||(39038307-39038367)
chr2 (12-43)||(5027893-5027924)
chr2 (52-110)||(13964641-13964700)
chr2 (71-118)||(15671234-15671281)
chr2 (31-112)||(20569416-20569499)
chr2 (57-112)||(23184968-23185023)
chr2 (57-112)||(23596231-23596286)
chr2 (73-112)||(27296835-27296874)
chr2 (52-113)||(6574761-6574823)
chr2 (183-224)||(19356040-19356082)
chr2 (51-117)||(21770295-21770359)
chr2 (52-113)||(22782279-22782341)
chr2 (52-113)||(22786319-22786381)
chr2 (52-113)||(22801845-22801907)
chr2 (39-112)||(24575395-24575469)
chr2 (52-113)||(28701876-28701938)
chr2 (52-113)||(34322596-34322658)
chr2 (53-113)||(22316967-22317028)
chr2 (168-224)||(22383002-22383059)
chr2 (168-224)||(24802068-24802125)
chr2 (168-224)||(24815035-24815092)
chr2 (52-104)||(25188772-25188825)
chr2 (52-112)||(30557988-30558049)
chr2 (53-112)||(6392038-6392098)
chr2 (81-113)||(22188767-22188799)
chr2 (53-112)||(22455625-22455685)
chr2 (168-223)||(22763360-22763416)
chr2 (69-109)||(26623123-26623163)
chr2 (31-113)||(28551583-28551667)
chr2 (81-113)||(28712362-28712394)
chr2 (54-113)||(40331163-40331223)
chr2 (31-113)||(40331462-40331545)
[»] chr1 (157 HSPs)
chr1 (12-224)||(51629707-51629921)
chr1 (12-224)||(51656968-51657182)
chr1 (12-224)||(35012403-35012615)
chr1 (12-224)||(4177390-4177602)
chr1 (12-224)||(5640230-5640442)
chr1 (12-224)||(12898501-12898713)
chr1 (12-224)||(19178434-19178646)
chr1 (12-224)||(19187313-19187525)
chr1 (12-224)||(23580816-23581028)
chr1 (12-224)||(5650787-5650999)
chr1 (12-224)||(10998304-10998516)
chr1 (12-224)||(12614836-12615048)
chr1 (12-224)||(12624301-12624513)
chr1 (12-224)||(21863136-21863348)
chr1 (12-224)||(35638558-35638770)
chr1 (12-224)||(35404912-35405126)
chr1 (12-224)||(35649211-35649425)
chr1 (12-224)||(36236949-36237163)
chr1 (12-224)||(36247496-36247710)
chr1 (12-224)||(38094549-38094763)
chr1 (12-224)||(38105174-38105388)
chr1 (12-224)||(12730022-12730234)
chr1 (12-224)||(12740615-12740827)
chr1 (12-224)||(21877241-21877453)
chr1 (12-224)||(5832692-5832905)
chr1 (12-224)||(5843294-5843507)
chr1 (12-224)||(7506775-7506989)
chr1 (12-224)||(7517372-7517586)
chr1 (15-224)||(33084039-33084249)
chr1 (12-224)||(5973233-5973445)
chr1 (12-224)||(3171096-3171309)
chr1 (12-224)||(3181698-3181911)
chr1 (12-224)||(47608451-47608664)
chr1 (12-224)||(47619059-47619272)
chr1 (12-224)||(2538010-2538223)
chr1 (12-224)||(154808-155021)
chr1 (32-224)||(7689979-7690174)
chr1 (32-218)||(20441842-20442028)
chr1 (32-224)||(18382424-18382615)
chr1 (13-208)||(47194680-47194873)
chr1 (13-224)||(4251084-4251298)
chr1 (13-218)||(39586448-39586651)
chr1 (13-223)||(7677320-7677530)
chr1 (33-224)||(17956734-17956926)
chr1 (12-161)||(16710308-16710457)
chr1 (12-224)||(12944685-12944896)
chr1 (12-224)||(20196212-20196424)
chr1 (12-142)||(4717606-4717736)
chr1 (13-224)||(39194613-39194826)
chr1 (59-208)||(9050994-9051143)
chr1 (12-224)||(11195588-11195800)
chr1 (12-224)||(14388648-14388860)
chr1 (79-224)||(148733-148879)
chr1 (12-122)||(25218042-25218152)
chr1 (12-122)||(36551159-36551269)
chr1 (12-121)||(13223528-13223637)
chr1 (12-121)||(24049120-24049229)
chr1 (12-121)||(36100015-36100124)
chr1 (12-224)||(18311493-18311705)
chr1 (12-119)||(9749843-9749950)
chr1 (12-224)||(674922-675132)
chr1 (12-224)||(46181370-46181585)
chr1 (12-211)||(41133153-41133349)
chr1 (12-224)||(22610495-22610709)
chr1 (16-224)||(45071120-45071330)
chr1 (16-224)||(20251148-20251360)
chr1 (16-223)||(28379337-28379548)
chr1 (16-223)||(5929054-5929262)
chr1 (31-223)||(22642220-22642418)
chr1 (147-224)||(4166869-4166946)
chr1 (33-223)||(22018690-22018885)
chr1 (16-208)||(19170869-19171063)
chr1 (16-208)||(23926406-23926601)
chr1 (33-223)||(26548784-26548979)
chr1 (73-224)||(28473660-28473815)
chr1 (33-223)||(17370400-17370595)
chr1 (12-75)||(19087862-19087925)
chr1 (16-108)||(19037351-19037441)
chr1 (12-68)||(10256424-10256480)
chr1 (16-112)||(21541148-21541243)
chr1 (16-108)||(23058938-23059028)
chr1 (12-64)||(5234663-5234715)
chr1 (45-117)||(23975486-23975558)
chr1 (112-224)||(20884373-20884483)
chr1 (74-224)||(44200443-44200601)
chr1 (52-208)||(7745595-7745752)
chr1 (34-225)||(34256042-34256238)
chr1 (54-112)||(22202376-22202434)
chr1 (168-224)||(19965769-19965825)
chr1 (16-99)||(52351269-52351350)
chr1 (39-117)||(31358730-31358809)
chr1 (12-54)||(11958472-11958514)
chr1 (31-112)||(7309175-7309256)
chr1 (26-118)||(22601219-22601311)
chr1 (39-117)||(22639682-22639762)
chr1 (171-224)||(47194896-47194949)
chr1 (52-112)||(12283800-12283860)
chr1 (52-112)||(12625195-12625255)
chr1 (52-112)||(22427980-22428040)
chr1 (45-107)||(8698265-8698327)
chr1 (39-112)||(26702771-26702845)
chr1 (52-113)||(44824399-44824461)
chr1 (148-224)||(52351177-52351252)
chr1 (53-118)||(16233759-16233824)
chr1 (53-113)||(23037145-23037206)
chr1 (168-224)||(23926591-23926648)
chr1 (31-113)||(1577223-1577307)
chr1 (58-118)||(18614301-18614361)
chr1 (31-113)||(21215316-21215400)
chr1 (52-115)||(25449196-25449260)
chr1 (53-112)||(10756803-10756862)
chr1 (45-116)||(12669814-12669883)
chr1 (31-112)||(21192506-21192589)
chr1 (148-224)||(21543549-21543623)
chr1 (57-112)||(22465452-22465507)
chr1 (39-113)||(22600826-22600901)
chr1 (52-113)||(10250367-10250429)
chr1 (52-113)||(21121704-21121766)
chr1 (52-113)||(21983974-21984036)
chr1 (31-112)||(28492924-28493005)
chr1 (52-112)||(2328076-2328137)
chr1 (168-224)||(9346299-9346356)
chr1 (168-224)||(16233626-16233683)
chr1 (163-223)||(19037499-19037560)
chr1 (168-223)||(22642392-22642448)
chr1 (26-110)||(26702965-26703049)
chr1 (39-113)||(36133569-36133644)
chr1 (32-113)||(48570868-48570951)
chr1 (53-112)||(48703642-48703701)
chr1 (53-111)||(9346157-9346215)
chr1 (52-118)||(17017969-17018035)
chr1 (52-113)||(21205512-21205574)
chr1 (52-118)||(21684593-21684659)
chr1 (52-113)||(21702193-21702255)
chr1 (52-113)||(23024171-23024233)
chr1 (52-138)||(27858155-27858241)
chr1 (168-225)||(34256012-34256069)
chr1 (52-113)||(38281763-38281825)
chr1 (168-224)||(5929236-5929293)
chr1 (52-112)||(14293265-14293326)
chr1 (168-224)||(17370569-17370626)
chr1 (81-118)||(18130613-18130650)
chr1 (168-224)||(19170822-19170879)
chr1 (170-222)||(22639779-22639832)
chr1 (168-224)||(22642422-22642479)
chr1 (26-98)||(24218713-24218786)
chr1 (168-224)||(26280548-26280605)
chr1 (168-224)||(28379522-28379579)
chr1 (53-113)||(46088368-46088429)
chr1 (76-112)||(14264070-14264106)
chr1 (31-118)||(23053731-23053819)
chr1 (52-112)||(26280687-26280746)
chr1 (31-113)||(32786578-32786662)
chr1 (53-112)||(33256992-33257052)
chr1 (53-112)||(33277164-33277224)
chr1 (81-113)||(38281974-38282006)
chr1 (168-208)||(47194863-47194903)
[»] chr8 (135 HSPs)
chr8 (12-224)||(6319026-6319238)
chr8 (12-224)||(3220190-3220402)
chr8 (12-224)||(26110789-26111001)
chr8 (12-224)||(32088779-32088991)
chr8 (12-224)||(36292477-36292691)
chr8 (12-224)||(36303080-36303294)
chr8 (12-222)||(43247883-43248093)
chr8 (12-224)||(9856987-9857199)
chr8 (12-224)||(19128306-19128518)
chr8 (12-224)||(31214570-31214782)
chr8 (12-224)||(32078206-32078418)
chr8 (12-224)||(210663-210877)
chr8 (12-224)||(241380-241594)
chr8 (12-224)||(251965-252179)
chr8 (12-224)||(724286-724500)
chr8 (12-224)||(794735-794949)
chr8 (12-224)||(849477-849691)
chr8 (12-224)||(18448928-18449140)
chr8 (12-224)||(3349137-3349350)
chr8 (12-224)||(3359734-3359947)
chr8 (12-224)||(29076288-29076501)
chr8 (12-224)||(29086539-29086752)
chr8 (12-224)||(6150627-6150838)
chr8 (12-224)||(6160582-6160793)
chr8 (12-224)||(19138838-19139050)
chr8 (13-224)||(26120465-26120679)
chr8 (12-224)||(13689078-13689292)
chr8 (12-224)||(13697189-13697403)
chr8 (12-224)||(36077494-36077707)
chr8 (12-224)||(36088080-36088293)
chr8 (12-224)||(44480648-44480861)
chr8 (12-224)||(44491264-44491477)
chr8 (12-224)||(15791809-15792022)
chr8 (12-224)||(20161741-20161953)
chr8 (12-224)||(9340701-9340914)
chr8 (12-224)||(9367845-9368058)
chr8 (13-224)||(18157815-18158025)
chr8 (13-224)||(15781220-15781432)
chr8 (13-224)||(23469971-23470181)
chr8 (12-224)||(19224492-19224704)
chr8 (12-208)||(20195543-20195739)
chr8 (13-224)||(18153297-18153506)
chr8 (13-224)||(19417911-19418122)
chr8 (13-224)||(19428486-19428697)
chr8 (13-224)||(16746560-16746770)
chr8 (13-224)||(30315211-30315421)
chr8 (15-224)||(40213679-40213887)
chr8 (13-224)||(18769648-18769858)
chr8 (12-151)||(23290458-23290596)
chr8 (13-139)||(26735573-26735698)
chr8 (12-224)||(22136369-22136583)
chr8 (12-224)||(22167534-22167748)
chr8 (12-224)||(3843081-3843291)
chr8 (32-142)||(23270531-23270641)
chr8 (13-142)||(15998808-15998936)
chr8 (16-211)||(20260143-20260335)
chr8 (16-211)||(21046773-21046965)
chr8 (12-224)||(7018927-7019141)
chr8 (12-224)||(23363687-23363901)
chr8 (16-224)||(19460556-19460766)
chr8 (16-224)||(19558234-19558444)
chr8 (16-224)||(22211872-22212082)
chr8 (16-224)||(23271690-23271900)
chr8 (35-224)||(29378961-29379156)
chr8 (12-89)||(21547625-21547702)
chr8 (33-224)||(17519661-17519857)
chr8 (31-223)||(40002576-40002774)
chr8 (16-224)||(8031392-8031605)
chr8 (40-117)||(12541041-12541118)
chr8 (16-108)||(15969520-15969610)
chr8 (45-138)||(24498761-24498857)
chr8 (33-138)||(17687372-17687479)
chr8 (52-223)||(28902839-28903014)
chr8 (31-112)||(15934381-15934463)
chr8 (31-223)||(45568521-45568719)
chr8 (45-138)||(24634749-24634847)
chr8 (31-112)||(19942585-19942667)
chr8 (35-223)||(21287756-21287950)
chr8 (39-112)||(19706874-19706947)
chr8 (26-118)||(24679101-24679194)
chr8 (31-113)||(22673149-22673233)
chr8 (51-138)||(23433607-23433693)
chr8 (31-109)||(20383060-20383139)
chr8 (52-118)||(16376048-16376114)
chr8 (54-112)||(19153407-19153464)
chr8 (31-112)||(19957057-19957139)
chr8 (31-223)||(21298332-21298530)
chr8 (31-112)||(26832425-26832507)
chr8 (52-113)||(43773491-43773553)
chr8 (68-138)||(1210399-1210471)
chr8 (168-224)||(21287924-21287981)
chr8 (168-224)||(45568490-45568547)
chr8 (31-113)||(22662436-22662520)
chr8 (51-118)||(18557421-18557487)
chr8 (39-130)||(27739279-27739374)
chr8 (52-114)||(30422117-30422180)
chr8 (53-112)||(43644269-43644328)
chr8 (50-120)||(13644660-13644728)
chr8 (50-120)||(13745085-13745153)
chr8 (68-118)||(17928475-17928525)
chr8 (52-113)||(33560932-33560994)
chr8 (54-114)||(14990196-14990257)
chr8 (39-112)||(18772050-18772123)
chr8 (168-224)||(21298534-21298591)
chr8 (168-224)||(21540474-21540531)
chr8 (57-118)||(23192484-23192545)
chr8 (39-112)||(25163429-25163502)
chr8 (52-112)||(29692683-29692744)
chr8 (57-113)||(40846106-40846163)
chr8 (53-113)||(43639155-43639215)
chr8 (52-112)||(45539155-45539215)
chr8 (53-112)||(15336807-15336867)
chr8 (53-112)||(15425872-15425932)
chr8 (53-112)||(15517176-15517236)
chr8 (31-113)||(16206620-16206703)
chr8 (53-112)||(18121827-18121887)
chr8 (173-224)||(24678972-24679024)
chr8 (45-138)||(17879066-17879161)
chr8 (26-109)||(19506063-19506146)
chr8 (53-112)||(20256232-20256291)
chr8 (53-112)||(25850708-25850767)
chr8 (31-112)||(12758456-12758538)
chr8 (168-217)||(17879155-17879205)
chr8 (31-112)||(18679163-18679245)
chr8 (31-112)||(18718352-18718434)
chr8 (52-113)||(39692907-39692969)
chr8 (50-119)||(5825261-5825328)
chr8 (168-224)||(7018897-7018954)
chr8 (42-110)||(17796783-17796852)
chr8 (83-139)||(29772215-29772272)
chr8 (168-224)||(40002748-40002805)
chr8 (81-113)||(6407159-6407191)
chr8 (31-113)||(18152393-18152477)
chr8 (168-223)||(21298504-21298560)
chr8 (69-117)||(33052303-33052351)
[»] chr6 (174 HSPs)
chr6 (12-224)||(9123619-9123831)
chr6 (12-224)||(26043709-26043921)
chr6 (12-224)||(9112982-9113194)
chr6 (12-224)||(12865044-12865256)
chr6 (12-224)||(32962421-32962633)
chr6 (12-224)||(12717323-12717537)
chr6 (12-224)||(12727972-12728186)
chr6 (12-224)||(17982988-17983202)
chr6 (12-224)||(17985197-17985411)
chr6 (12-224)||(3671544-3671756)
chr6 (12-224)||(27505439-27505651)
chr6 (12-224)||(25985577-25985791)
chr6 (12-224)||(31983113-31983326)
chr6 (12-224)||(34818279-34818493)
chr6 (12-224)||(32973040-32973253)
chr6 (12-224)||(34807647-34807862)
chr6 (12-224)||(3660880-3661092)
chr6 (12-224)||(12854518-12854730)
chr6 (12-224)||(27372329-27372541)
chr6 (12-224)||(27462679-27462891)
chr6 (12-224)||(16929947-16930160)
chr6 (12-224)||(26024955-26025168)
chr6 (12-224)||(26035529-26035742)
chr6 (12-224)||(27341190-27341403)
chr6 (12-224)||(27401930-27402143)
chr6 (12-224)||(27412589-27412802)
chr6 (12-224)||(32301530-32301743)
chr6 (12-224)||(32312219-32312432)
chr6 (12-224)||(4630367-4630580)
chr6 (12-224)||(16959118-16959331)
chr6 (12-224)||(26864282-26864495)
chr6 (12-224)||(26874906-26875119)
chr6 (12-224)||(29384248-29384461)
chr6 (16-224)||(28252049-28252257)
chr6 (16-224)||(28357196-28357404)
chr6 (12-224)||(27383930-27384143)
chr6 (12-224)||(27474314-27474527)
chr6 (12-224)||(27503812-27504025)
chr6 (12-224)||(33198824-33199037)
chr6 (12-208)||(12353080-12353277)
chr6 (13-224)||(20030391-20030601)
chr6 (12-203)||(25583409-25583600)
chr6 (13-224)||(12827191-12827401)
chr6 (13-224)||(20063142-20063352)
chr6 (13-224)||(18926251-18926460)
chr6 (13-207)||(10404043-10404236)
chr6 (12-194)||(11147708-11147888)
chr6 (13-224)||(25787201-25787410)
chr6 (16-224)||(7751722-7751932)
chr6 (13-224)||(7376245-7376456)
chr6 (33-224)||(32756918-32757107)
chr6 (33-224)||(16124023-16124214)
chr6 (12-167)||(12416901-12417055)
chr6 (12-224)||(18835120-18835331)
chr6 (12-224)||(17746271-17746483)
chr6 (12-224)||(31571912-31572124)
chr6 (12-224)||(18826725-18826936)
chr6 (31-224)||(27166929-27167123)
chr6 (35-211)||(5844605-5844781)
chr6 (33-224)||(29765053-29765245)
chr6 (12-224)||(17047082-17047296)
chr6 (12-121)||(1902231-1902340)
chr6 (12-121)||(27819055-27819164)
chr6 (16-224)||(31930950-31931160)
chr6 (12-224)||(22308285-22308497)
chr6 (16-224)||(18554797-18555007)
chr6 (33-224)||(25687237-25687432)
chr6 (16-224)||(12953589-12953799)
chr6 (16-224)||(11205472-11205682)
chr6 (16-223)||(7586751-7586960)
chr6 (16-223)||(11234995-11235204)
chr6 (16-223)||(21127576-21127785)
chr6 (15-194)||(9934131-9934308)
chr6 (12-99)||(12575773-12575860)
chr6 (12-99)||(18720210-18720297)
chr6 (12-160)||(22292390-22292538)
chr6 (15-224)||(17742192-17742400)
chr6 (33-224)||(25518201-25518395)
chr6 (12-222)||(17063726-17063935)
chr6 (13-121)||(30120483-30120590)
chr6 (31-223)||(20635079-20635276)
chr6 (33-223)||(17608901-17609095)
chr6 (45-138)||(14757752-14757848)
chr6 (16-223)||(19453116-19453327)
chr6 (16-223)||(22386149-22386359)
chr6 (39-118)||(15551392-15551471)
chr6 (12-69)||(18576226-18576283)
chr6 (33-108)||(25678926-25679001)
chr6 (12-64)||(11021457-11021509)
chr6 (12-62)||(5521748-5521798)
chr6 (26-117)||(18027387-18027479)
chr6 (51-118)||(21034409-21034476)
chr6 (31-112)||(3680470-3680552)
chr6 (16-143)||(21119154-21119285)
chr6 (45-117)||(15478450-15478522)
chr6 (26-118)||(24719437-24719530)
chr6 (31-118)||(25929835-25929923)
chr6 (31-113)||(13435242-13435325)
chr6 (52-225)||(14070665-14070843)
chr6 (52-118)||(17927171-17927237)
chr6 (112-224)||(19289840-19289950)
chr6 (31-112)||(20113347-20113429)
chr6 (52-112)||(14101148-14101208)
chr6 (52-112)||(24116206-24116266)
chr6 (53-113)||(29917407-29917467)
chr6 (33-138)||(30372716-30372823)
chr6 (52-118)||(12347471-12347537)
chr6 (53-111)||(15395333-15395391)
chr6 (52-113)||(18377821-18377883)
chr6 (54-112)||(18434919-18434977)
chr6 (52-113)||(19482131-19482193)
chr6 (52-113)||(21234538-21234600)
chr6 (31-112)||(25591979-25592061)
chr6 (52-112)||(16528689-16528750)
chr6 (53-118)||(18172925-18172990)
chr6 (53-118)||(18226811-18226876)
chr6 (31-103)||(19623336-19623409)
chr6 (31-113)||(12422621-12422705)
chr6 (52-112)||(15301594-15301654)
chr6 (13-65)||(17573069-17573120)
chr6 (53-112)||(21624471-21624531)
chr6 (51-118)||(7811387-7811454)
chr6 (53-116)||(19470047-19470110)
chr6 (69-112)||(19625206-19625249)
chr6 (52-113)||(10631513-10631575)
chr6 (52-113)||(15954077-15954139)
chr6 (52-113)||(17380956-17381018)
chr6 (52-109)||(19952282-19952340)
chr6 (53-118)||(24729222-24729288)
chr6 (52-113)||(26588977-26589039)
chr6 (12-85)||(27720866-27720937)
chr6 (166-224)||(28252020-28252077)
chr6 (166-224)||(28357167-28357224)
chr6 (52-112)||(12716132-12716193)
chr6 (168-224)||(14051955-14052012)
chr6 (52-104)||(14052099-14052152)
chr6 (168-224)||(14070636-14070693)
chr6 (57-118)||(17303976-17304037)
chr6 (45-113)||(21617618-21617687)
chr6 (168-224)||(24719303-24719360)
chr6 (168-224)||(24729088-24729145)
chr6 (183-224)||(27384131-27384172)
chr6 (183-224)||(27474515-27474556)
chr6 (183-224)||(27474544-27474585)
chr6 (183-224)||(27504013-27504054)
chr6 (33-130)||(31720245-31720345)
chr6 (70-118)||(14883651-14883699)
chr6 (31-118)||(14923879-14923966)
chr6 (45-138)||(24471041-24471137)
chr6 (31-118)||(32335199-32335287)
chr6 (31-112)||(13601523-13601606)
chr6 (52-114)||(32543644-32543707)
chr6 (68-118)||(19875234-19875284)
chr6 (52-118)||(26185164-26185230)
chr6 (52-113)||(33352935-33352997)
chr6 (45-119)||(34659352-34659424)
chr6 (52-112)||(7763031-7763092)
chr6 (52-112)||(9717222-9717283)
chr6 (168-224)||(11235178-11235235)
chr6 (52-104)||(12041230-12041283)
chr6 (168-224)||(17608870-17608927)
chr6 (53-113)||(19066726-19066787)
chr6 (72-121)||(21689533-21689580)
chr6 (168-224)||(22386333-22386390)
chr6 (53-118)||(23006704-23006769)
chr6 (53-118)||(23781597-23781662)
chr6 (168-224)||(25687207-25687264)
chr6 (169-224)||(7586720-7586776)
chr6 (45-116)||(16739828-16739900)
chr6 (81-113)||(19688192-19688224)
chr6 (169-224)||(21127760-21127816)
chr6 (81-113)||(22801549-22801581)
chr6 (45-138)||(24481086-24481182)
chr6 (52-100)||(29537991-29538039)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (12-224)||(11885-12097)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (12-224)||(7358-7570)
[»] chr7 (171 HSPs)
chr7 (12-224)||(166426-166638)
chr7 (12-224)||(177018-177230)
chr7 (12-224)||(9084815-9085027)
chr7 (12-224)||(9094529-9094741)
chr7 (12-224)||(20989184-20989396)
chr7 (12-224)||(48711048-48711260)
chr7 (12-224)||(5685050-5685262)
chr7 (12-224)||(9432795-9433007)
chr7 (16-224)||(21003565-21003773)
chr7 (12-224)||(26653882-26654094)
chr7 (12-224)||(26700211-26700423)
chr7 (12-224)||(37343731-37343943)
chr7 (12-224)||(2706169-2706383)
chr7 (12-224)||(26390653-26390867)
chr7 (12-224)||(26401295-26401509)
chr7 (12-224)||(40042665-40042879)
chr7 (12-224)||(40053214-40053428)
chr7 (12-224)||(14746226-14746439)
chr7 (12-224)||(26294586-26294799)
chr7 (12-224)||(468138-468350)
chr7 (12-224)||(6867782-6867994)
chr7 (12-224)||(6878414-6878626)
chr7 (12-224)||(9443391-9443603)
chr7 (12-224)||(20490538-20490750)
chr7 (12-224)||(22099269-22099481)
chr7 (12-224)||(2716773-2716987)
chr7 (12-224)||(17950675-17950889)
chr7 (12-224)||(17961281-17961495)
chr7 (12-224)||(8627478-8627692)
chr7 (12-224)||(3165266-3165478)
chr7 (12-224)||(22088654-22088866)
chr7 (12-224)||(1987070-1987283)
chr7 (12-224)||(1997691-1997904)
chr7 (12-224)||(11004715-11004928)
chr7 (12-224)||(24734282-24734496)
chr7 (12-224)||(24744229-24744443)
chr7 (12-224)||(42865357-42865570)
chr7 (12-224)||(42875983-42876196)
chr7 (15-224)||(24931160-24931370)
chr7 (12-224)||(8616916-8617129)
chr7 (12-224)||(8002622-8002835)
chr7 (12-224)||(8013267-8013480)
chr7 (12-224)||(540644-540857)
chr7 (12-224)||(4211569-4211782)
chr7 (12-224)||(4222138-4222351)
chr7 (13-224)||(15888885-15889095)
chr7 (33-224)||(31117067-31117258)
chr7 (32-224)||(588764-588956)
chr7 (13-224)||(1367163-1367373)
chr7 (13-224)||(30049053-30049263)
chr7 (13-224)||(21770499-21770709)
chr7 (13-224)||(9169719-9169929)
chr7 (12-208)||(44280055-44280251)
chr7 (13-224)||(9159264-9159474)
chr7 (33-224)||(40055310-40055501)
chr7 (12-224)||(17064086-17064297)
chr7 (33-208)||(38594256-38594430)
chr7 (12-142)||(19986159-19986289)
chr7 (12-140)||(20967200-20967328)
chr7 (12-155)||(457618-457761)
chr7 (13-224)||(38403768-38403979)
chr7 (12-224)||(18440727-18440938)
chr7 (15-211)||(12734736-12734929)
chr7 (12-224)||(48381718-48381930)
chr7 (15-224)||(8933099-8933306)
chr7 (16-224)||(3476898-3477104)
chr7 (12-224)||(24882948-24883162)
chr7 (33-160)||(25212471-25212598)
chr7 (45-224)||(18418677-18418857)
chr7 (15-224)||(26210106-26210313)
chr7 (15-224)||(29589523-29589734)
chr7 (12-138)||(11015335-11015463)
chr7 (16-224)||(15215852-15216059)
chr7 (12-224)||(13681853-13682062)
chr7 (12-100)||(23643198-23643286)
chr7 (33-223)||(8999498-8999694)
chr7 (33-223)||(11087608-11087803)
chr7 (12-89)||(1251598-1251675)
chr7 (12-87)||(23303859-23303934)
chr7 (35-223)||(13175169-13175362)
chr7 (151-224)||(455356-455429)
chr7 (12-80)||(12220354-12220422)
chr7 (12-77)||(22499347-22499412)
chr7 (12-107)||(6044957-6045050)
chr7 (12-75)||(1775665-1775728)
chr7 (37-130)||(1878923-1879018)
chr7 (12-68)||(45930881-45930937)
chr7 (31-222)||(4412573-4412771)
chr7 (31-219)||(4433149-4433343)
chr7 (45-117)||(11572876-11572949)
chr7 (171-222)||(11095744-11095795)
chr7 (35-138)||(12223090-12223196)
chr7 (12-61)||(6169834-6169883)
chr7 (51-118)||(7488620-7488687)
chr7 (31-112)||(4820839-4820921)
chr7 (31-138)||(16105624-16105733)
chr7 (39-113)||(19711733-19711807)
chr7 (45-117)||(2501662-2501735)
chr7 (39-112)||(13259125-13259198)
chr7 (39-112)||(13266465-13266538)
chr7 (45-117)||(25806797-25806869)
chr7 (12-55)||(24072140-24072183)
chr7 (40-117)||(15871754-15871832)
chr7 (52-118)||(16308426-16308492)
chr7 (52-118)||(16411383-16411449)
chr7 (31-113)||(1292443-1292527)
chr7 (31-109)||(11318757-11318837)
chr7 (52-112)||(11792284-11792344)
chr7 (52-112)||(14187063-14187123)
chr7 (53-112)||(13261338-13261397)
chr7 (31-112)||(5001549-5001631)
chr7 (31-112)||(10883894-10883976)
chr7 (31-112)||(13302213-13302295)
chr7 (31-112)||(13645803-13645885)
chr7 (52-113)||(28623080-28623142)
chr7 (26-117)||(16464371-16464461)
chr7 (52-112)||(24787735-24787796)
chr7 (52-142)||(602139-602236)
chr7 (52-112)||(5034669-5034729)
chr7 (31-113)||(8182312-8182396)
chr7 (31-113)||(13879522-13879606)
chr7 (52-112)||(16317278-16317337)
chr7 (52-112)||(19237758-19237818)
chr7 (52-112)||(29936069-29936128)
chr7 (53-112)||(21211267-21211326)
chr7 (51-117)||(23125356-23125423)
chr7 (53-112)||(41843147-41843206)
chr7 (31-112)||(44466446-44466529)
chr7 (31-115)||(331003-331089)
chr7 (39-112)||(2499424-2499498)
chr7 (31-112)||(4493927-4494009)
chr7 (52-113)||(15087925-15087987)
chr7 (31-112)||(16310630-16310712)
chr7 (52-113)||(19339969-19340031)
chr7 (52-113)||(30946079-30946141)
chr7 (31-104)||(33604259-33604333)
chr7 (52-113)||(35954625-35954687)
chr7 (52-113)||(48237561-48237623)
chr7 (52-116)||(2914329-2914394)
chr7 (57-130)||(10257765-10257841)
chr7 (52-112)||(13034560-13034621)
chr7 (168-224)||(16308292-16308349)
chr7 (52-112)||(16546057-16546118)
chr7 (52-112)||(16619544-16619605)
chr7 (31-113)||(13138617-13138701)
chr7 (56-112)||(14425926-14425982)
chr7 (54-113)||(19328732-19328792)
chr7 (53-112)||(21284096-21284156)
chr7 (68-112)||(21691751-21691795)
chr7 (31-113)||(33421104-33421188)
chr7 (52-112)||(39285226-39285286)
chr7 (51-118)||(13173065-13173132)
chr7 (39-113)||(22579903-22579978)
chr7 (39-113)||(23280673-23280748)
chr7 (52-113)||(2266234-2266296)
chr7 (52-113)||(9069134-9069196)
chr7 (52-113)||(9710524-9710586)
chr7 (75-113)||(15467316-15467354)
chr7 (31-112)||(16315262-16315343)
chr7 (52-113)||(16557309-16557371)
chr7 (52-113)||(16608291-16608353)
chr7 (168-224)||(8999467-8999524)
chr7 (33-86)||(9802571-9802624)
chr7 (39-112)||(12367460-12367533)
chr7 (31-102)||(15705218-15705291)
chr7 (168-223)||(9802671-9802727)
chr7 (81-113)||(16155483-16155515)
chr7 (68-112)||(18362253-18362297)
chr7 (27-75)||(20597757-20597805)
chr7 (31-113)||(27871070-27871154)
chr7 (81-113)||(33692421-33692453)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (12-224)||(30658-30872)
scaffold0133 (32-224)||(43036-43233)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (12-224)||(40969-41181)
scaffold0047 (13-224)||(33418-33628)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (12-224)||(7487-7701)
scaffold0105 (12-224)||(37474-37688)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (12-224)||(2218-2430)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (12-224)||(14111-14323)
scaffold0028 (12-224)||(54639-54851)
scaffold0028 (52-112)||(80775-80835)
scaffold0028 (54-113)||(24446-24506)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (13-224)||(2734-2946)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (13-224)||(37250-37460)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (12-224)||(7400-7611)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (16-224)||(11122-11329)
scaffold0068 (16-224)||(8275-8489)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (12-168)||(23299-23455)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (13-159)||(8650-8796)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (12-156)||(1-145)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (12-224)||(12633-12845)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (32-188)||(1-156)
scaffold0171 (31-112)||(28098-28181)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (12-137)||(155682-155807)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (12-224)||(40030-40241)
[»] scaffold0084 (5 HSPs)
scaffold0084 (12-224)||(57299-57511)
scaffold0084 (31-223)||(944-1142)
scaffold0084 (31-112)||(31943-32026)
scaffold0084 (39-112)||(48698-48772)
scaffold0084 (168-211)||(927-970)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (12-121)||(4255-4364)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (16-129)||(1743-1856)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (33-211)||(21-199)
scaffold0570 (33-224)||(2228-2424)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (12-224)||(4825-5035)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (12-121)||(61136-61245)
[»] scaffold0002 (6 HSPs)
scaffold0002 (13-138)||(100148-100272)
scaffold0002 (35-223)||(475808-476001)
scaffold0002 (35-223)||(482328-482521)
scaffold0002 (52-138)||(111786-111874)
scaffold0002 (168-224)||(475777-475834)
scaffold0002 (168-224)||(482297-482354)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (15-224)||(15259-15467)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (16-224)||(10278-10488)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (16-224)||(1528-1738)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (12-224)||(35064-35277)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (12-224)||(16130-16344)
scaffold0012 (33-224)||(127190-127386)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (16-224)||(276-486)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (12-178)||(174909-175074)
scaffold0017 (33-223)||(59414-59608)
scaffold0017 (33-223)||(40868-41064)
scaffold0017 (168-224)||(59383-59440)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (45-224)||(1554-1733)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (12-211)||(5331-5531)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (45-224)||(10804-10984)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (16-224)||(29285-29495)
scaffold0001 (12-76)||(411983-412047)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (13-120)||(1418-1524)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (16-103)||(52370-52457)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (16-224)||(60598-60810)
scaffold0005 (53-112)||(211736-211796)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (16-224)||(29003-29212)
scaffold0163 (31-112)||(25817-25899)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (16-224)||(57894-58104)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (20-207)||(18742-18941)
scaffold0099 (42-224)||(17475-17673)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (15-222)||(38487-38695)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (32-130)||(4437-4535)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (16-224)||(763-973)
scaffold0752 (112-224)||(1478-1588)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (69-224)||(958-1117)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (16-223)||(32335-32546)
scaffold0185 (168-224)||(32520-32577)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (16-224)||(204-414)
scaffold0090 (16-224)||(4584-4794)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (33-223)||(61090-61287)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (16-194)||(5747-5927)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (33-223)||(11091-11285)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (12-78)||(10201-10267)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (31-223)||(4474-4672)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (16-80)||(17865-17929)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (31-223)||(20930-21127)
scaffold0177 (168-224)||(20899-20956)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (33-222)||(34977-35170)
scaffold0050 (168-224)||(35175-35232)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (13-96)||(21348-21430)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (34-223)||(1492-1686)
[»] scaffold1263 (2 HSPs)
scaffold1263 (34-223)||(1685-1879)
scaffold1263 (168-224)||(1654-1711)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (33-143)||(1882-1998)
[»] scaffold0207 (3 HSPs)
scaffold0207 (34-221)||(19923-20115)
scaffold0207 (168-224)||(10250-10307)
scaffold0207 (168-224)||(20151-20208)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (12-67)||(17858-17913)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (31-112)||(20-102)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (34-223)||(7040-7234)
scaffold0018 (168-224)||(6979-7036)
scaffold0018 (168-223)||(7010-7066)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (13-90)||(7198-7274)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (79-208)||(13934-14068)
scaffold0349 (12-85)||(10284-10355)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (35-224)||(2339-2534)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (45-187)||(16338-16484)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (31-208)||(165204-165386)
scaffold0011 (168-224)||(165157-165214)
scaffold0011 (40-116)||(251037-251114)
scaffold0011 (52-118)||(58944-59010)
scaffold0011 (52-113)||(66074-66136)
scaffold0011 (31-113)||(145119-145203)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (26-138)||(9630-9745)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (51-118)||(87788-87855)
scaffold0004 (31-112)||(219597-219679)
scaffold0004 (31-112)||(244952-245034)
scaffold0004 (53-112)||(378218-378277)
scaffold0004 (53-119)||(382181-382245)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (39-121)||(2443-2525)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (31-112)||(9263-9345)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (31-223)||(33-231)
scaffold0211 (168-224)||(2-59)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (52-118)||(76625-76691)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (52-118)||(95-161)
scaffold0003 (75-113)||(90725-90763)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (31-113)||(16385-16469)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (52-112)||(16800-16860)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (52-112)||(20141-20201)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (57-112)||(2056-2111)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (31-117)||(37412-37499)
scaffold0120 (69-117)||(41545-41593)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (31-208)||(9325-9507)
scaffold0297 (168-224)||(9497-9556)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (31-112)||(14475-14557)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (52-118)||(268162-268228)
scaffold0009 (39-113)||(83759-83834)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (39-104)||(6815-6880)
scaffold0040 (53-112)||(2731-2790)
scaffold0040 (168-207)||(8279-8318)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (52-112)||(73961-74022)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (26-117)||(3925-4016)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (31-113)||(3337-3421)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (52-112)||(32457-32517)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (52-112)||(59459-59519)
scaffold0026 (31-112)||(7283-7364)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (52-112)||(144285-144345)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (39-118)||(4027-4106)
scaffold0622 (52-104)||(2040-2092)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (39-113)||(6359-6434)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (31-143)||(1191-1310)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (52-113)||(2361-2423)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (68-118)||(19473-19523)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (52-113)||(24010-24072)
[»] scaffold0908 (2 HSPs)
scaffold0908 (168-224)||(4424-4481)
scaffold0908 (123-208)||(4471-4554)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (53-118)||(3689-3754)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (52-112)||(9343-9404)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (52-112)||(7412-7473)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (51-112)||(22396-22457)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (168-224)||(38610-38667)
scaffold0132 (31-222)||(38642-38839)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (52-112)||(2610-2671)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (52-112)||(5939-6000)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (52-112)||(701-761)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (52-112)||(650-710)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (56-112)||(1327-1383)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (52-112)||(2688-2747)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (33-138)||(17387-17495)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (52-111)||(611-671)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (31-118)||(18558-18646)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (26-117)||(17000-17092)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (31-113)||(35415-35499)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (31-112)||(11554-11637)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (39-113)||(321-396)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (52-118)||(1538-1604)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (52-113)||(19292-19354)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (52-113)||(18411-18473)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (31-100)||(10791-10861)
scaffold0161 (31-100)||(15455-15525)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (26-112)||(2433-2519)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (150-211)||(59792-59851)
scaffold0007 (52-112)||(46044-46105)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (53-112)||(5595-5655)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (81-113)||(18435-18467)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (81-113)||(2643-2675)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (52-112)||(111322-111382)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (53-112)||(102950-103010)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (52-112)||(36809-36869)
scaffold0022 (52-112)||(134869-134929)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 222)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9994581 - 9994369
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994581 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9994482  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994481 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9994382  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9994381 gcaagagacttct 9994369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12250127 - 12249915
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250127 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12250028  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250027 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12249928  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12249927 gcaagagacttct 12249915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9982573 - 9982361
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982573 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9982474  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982473 ataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9982374  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9982373 gcaagagacttct 9982361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12238301 - 12238089
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238301 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12238202  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238201 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12238102  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12238101 gcaagagacttct 12238089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6491037 - 6490825
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6491037 gagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6490938  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490937 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6490838  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6490837 gcaagagacttct 6490825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6501691 - 6501479
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501691 gagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6501592  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501591 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6501492  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6501491 gcaagagacttct 6501479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 23635256 - 23635468
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635256 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23635355  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635356 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 23635455  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  23635456 gcaagagacttct 23635468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4175445 - 4175233
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175445 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4175346  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175345 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 4175246  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  4175245 gcaagagacttct 4175233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5537709 - 5537497
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537709 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5537610  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537609 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5537510  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  5537509 gcaagagacttct 5537497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5548293 - 5548081
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548293 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5548194  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548193 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5548094  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  5548093 gcaagagacttct 5548081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6181216 - 6181004
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181216 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6181117  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181116 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6181017  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6181016 gcaagagacttct 6181004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6221390 - 6221178
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221390 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6221291  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221290 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6221191  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6221190 gcaagagacttct 6221178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 13121209 - 13121421
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121209 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13121308  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121309 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 13121408  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  13121409 gcaagagacttct 13121421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 13557121 - 13557333
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557121 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13557220  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557221 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 13557320  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  13557321 gcaagagacttct 13557333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14475768 - 14475980
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475768 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14475867  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475868 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 14475967  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  14475968 gcaagagacttct 14475980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 23767441 - 23767653
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767441 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23767540  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767541 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 23767640  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  23767641 gcaagagacttct 23767653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 37865992 - 37866204
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865992 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 37866091  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866092 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 37866191  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  37866192 gcaagagacttct 37866204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 37885125 - 37885337
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885125 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 37885224  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885225 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 37885324  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  37885325 gcaagagacttct 37885337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39673570 - 39673359
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673570 gagcagagaaaagaaagacaaagaca-aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39673472  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673471 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 39673372  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  39673371 gcaagagacttct 39673359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 13131451 - 13131663
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131451 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagctgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13131550  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131551 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 13131650  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  13131651 gcaagagacttct 13131663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19788569 - 19788781
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788569 gagcagaaaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19788668  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788669 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19788768  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19788769 gcaagagacttct 19788781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 23756845 - 23757057
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756845 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttgtcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23756944  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756945 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 23757044  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  23757045 gcaagagacttct 23757057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5866386 - 5866172
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866386 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5866287  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5866286 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 5866187  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5866186 aagcaagagacttct 5866172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5876985 - 5876771
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876985 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5876886  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5876885 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 5876786  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5876785 aagcaagagacttct 5876771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 20720658 - 20720872
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720658 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20720757  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20720758 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 20720857  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  20720858 aagcaagagacttct 20720872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24384209 - 24383995
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384209 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcttggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24384110  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384109 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24384010  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24384009 aagcaagagacttct 24383995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 23647295 - 23647508
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647295 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23647394  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647395 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 23647494  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  23647495 agcaagagacttct 23647508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19777932 - 19778144
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777932 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagttgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19778031  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778032 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19778131  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19778132 gcaagagacttct 19778144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20684466 - 20684255
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684466 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20684367  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684366 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 20684268  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  20684267 gcaagagacttct 20684255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5580324 - 5580110
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580324 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5580225  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580224 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5580125  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5580124 aagcaagagacttct 5580110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12297492 - 12297278
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297492 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12297393  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297392 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12297293  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  12297292 aagcaagagacttct 12297278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 18483590 - 18483803
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483590 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18483689  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483690 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 18483788  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  18483789 aagcaagagacttct 18483803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 933174 - 933386
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933174 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 933273  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933274 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 933373  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  933374 gcaagagacttct 933386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10655952 - 10655740
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655952 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10655853  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655852 ataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 10655753  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  10655752 gcaagagacttct 10655740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 504857 - 504644
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504857 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 504758  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504757 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 504659  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  504658 aagcaagagacttct 504644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 527223 - 527010
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527223 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 527124  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527123 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 527025  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  527024 aagcaagagacttct 527010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4743284 - 4743497
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743284 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4743383  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743384 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4743482  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  4743483 aagcaagagacttct 4743497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4753871 - 4754084
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753871 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4753970  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753971 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4754069  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  4754070 aagcaagagacttct 4754084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 8774203 - 8774416
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774203 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8774302  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774303 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8774401  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  8774402 aagcaagagacttct 8774416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 10098614 - 10098827
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098614 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10098713  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098714 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10098812  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  10098813 aagcaagagacttct 10098827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11273074 - 11272860
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11273074 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11272975  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11272974 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 11272875  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  11272874 aagcaagagacttct 11272860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12287670 - 12287456
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287670 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12287571  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287570 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12287471  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    || ||||||||||||    
T  12287470 aaccaagagacttct 12287456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24659446 - 24659659
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659446 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24659545  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659546 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24659644  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24659645 aagcaagagacttct 24659659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24670026 - 24670239
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670026 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24670125  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24670126 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24670224  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24670225 aagcaagagacttct 24670239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28314922 - 28314709
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314922 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 28314823  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314822 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 28314724  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  28314723 aagcaagagacttct 28314709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28325536 - 28325323
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28325536 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 28325437  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28325436 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 28325338  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  28325337 aagcaagagacttct 28325323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 35186923 - 35187136
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35186923 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35187022  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187023 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35187121  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35187122 aagcaagagacttct 35187136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 38194270 - 38194483
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194270 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 38194369  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194370 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38194468  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  38194469 aagcaagagacttct 38194483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 39382236 - 39382449
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382236 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39382335  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382336 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39382434  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39382435 aagcaagagacttct 39382449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 41683224 - 41683437
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683224 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 41683323  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683324 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 41683422  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  41683423 aagcaagagacttct 41683437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 41693793 - 41694006
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693793 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 41693892  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693893 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 41693991  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  41693992 aagcaagagacttct 41694006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 37759216 - 37759428
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759216 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 37759315  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759316 ataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 37759415  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  37759416 gcaagagacttct 37759428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5510242 - 5510455
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510242 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5510341  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510342 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5510440  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5510441 aagcaagagacttct 5510455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5520420 - 5520633
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520420 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5520519  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520520 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5520618  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5520619 aagcaagagacttct 5520633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5628707 - 5628494
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5628707 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcact 5628609  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628608 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5628509  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5628508 aagcaagagacttct 5628494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10627629 - 10627418
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627629 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttttcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10627530  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627529 taatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 10627430  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    ||||||||||||    
T  10627429 caagagacttct 10627418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16385621 - 16385834
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16385621 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttact 16385720  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385721 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 16385819  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  16385820 aagcaagagacttct 16385834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 39371599 - 39371812
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371599 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39371698  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371699 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39371797  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39371798 aagcaagagacttct 39371812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29461901 - 29461689
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461901 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29461802  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461801 ataataacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 29461702  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  29461701 gcaagagtcttct 29461689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29472753 - 29472541
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29472753 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcact 29472654  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472653 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 29472554  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  29472553 gcaagagtcttct 29472541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 38204805 - 38205019
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagt-cccccttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204805 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcac 38204904  T
Q  111 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38204905 tataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 38205003  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  38205004 taagcaagagacttct 38205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13373356 - 13373142
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373356 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13373257  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13373256 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13373157  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  13373156 aagcaagagacttct 13373142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13394544 - 13394330
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394544 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13394445  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13394444 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13394345  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  13394344 aagcaagagacttct 13394330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20673882 - 20673670
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673882 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcact 20673783  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673782 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 20673684  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    || |||||||||||    
T  20673683 agtaagagacttct 20673670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1795170 - 1794960
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795170 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 1795072  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795071 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 1794972  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  1794971 caagagtcttct 1794960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13383950 - 13383736
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383950 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13383851  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  13383850 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttccaatgctcaagaact 13383751  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  13383750 aagcaagagacttct 13383736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 8784817 - 8785031
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8784817 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8784916  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac- 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8784917 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacg 8785015  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
     | |||||||||||||    
T  8785016 caggcaagagacttct 8785031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17910692 - 17910481
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910692 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 17910594  T
Q  113 taatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910593 taatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 17910494  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  17910493 gcaagagtcttct 17910481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 48336790 - 48337000
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48336790 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 48336888  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48336889 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 48336988  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  48336989 caagagtcttct 48337000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7805205 - 7804994
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7805205 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 7805107  T
Q  113 taatcacaaagattaca-aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7805106 taatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7805007  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  7805006 gcaagagtcttct 7804994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24707242 - 24707031
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707242 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 24707144  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707143 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 24707044  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||| ||||    
T  24707043 gcaagagatttct 24707031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1784757 - 1784547
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1784757 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 1784659  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1784658 taatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 1784559  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  1784558 caagagtcttct 1784547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11206760 - 11206550
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206760 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 11206662  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206661 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 11206562  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  11206561 caagagtcttct 11206550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9391872 - 9391680
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391872 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagaagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 9391773  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9391772 tgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgctcaagcactaagcaagagtcttct 9391680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11217393 - 11217201
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11217393 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 11217294  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11217293 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 11217201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19888040 - 19887837
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888040 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 19887942  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887941 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 19887842  T
Q  213 caaga 217  Q
    |||||    
T  19887841 caaga 19887837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 4403822 - 4404030
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4403822 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 4403920  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4403921 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 4404019  T
Q  213 caagagacttc 223  Q
    |||||| ||||    
T  4404020 caagagtcttc 4404030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7795294 - 7795083
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7795294 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagtagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagatttcacta 7795196  T
Q  113 taatcacaaagattaca-aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795195 taatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7795096  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  7795095 gcaagagtcttct 7795083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 11163398 - 11163588
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163398 agacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 11163497  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11163498 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 11163588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13262340 - 13262149
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13262340 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccgttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 13262241  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13262240 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 13262149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 4433309 - 4433517
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4433309 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 4433407  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4433408 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 4433506  T
Q  213 caagagacttc 223  Q
    |||||| ||||    
T  4433507 caagagtcttc 4433517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15194726 - 15194516
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15194726 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcctaggagatttcacta 15194628  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15194627 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcactaa 15194528  T
Q  212 gcaagagacttc 223  Q
    ||||||| ||||    
T  15194527 gcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9381323 - 9381134
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9381323 acacaagcagttaccctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgc 9381224  T
Q  135 tcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9381223 tcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 9381134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 9535157 - 9535368
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9535157 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcacta 9535255  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9535256 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaa 9535355  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  9535356 gcaagagtcttct 9535368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 13601782 - 13601973
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601782 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 13601880  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601881 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 38314243 - 38314452
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38314243 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcagttccaaggagatttcacta 38314341  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38314342 taaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcactaag 38314440  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  38314441 caagagtcttct 38314452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 28168659 - 28168870
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28168659 agcagagaaaagaaaaacga-gacacaagtagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 28168757  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |     
T  28168758 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacag 28168857  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  28168858 gcaagagacttct 28168870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14258751 - 14258542
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258751 agcagagaaaagaa-gaataagacataagcagttatccttgttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 14258653  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258652 taatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 14258554  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    || ||| |||||    
T  14258553 caggagtcttct 14258542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 33650747 - 33650901
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650747 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 33650846  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33650847 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14322358 - 14322168
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14322358 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaat 14322259  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14322258 gctcaatactctctaactatgagacttctcaaaa-tgctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 14322168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 27882930 - 27883127
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27882930 gagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27883027  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  27883028 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 27883126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8740795 - 8740602
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8740795 aaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcgaaagtagtccagtctcccttgctcttccaaggagatttcactaataatcacaaagattaca 8740696  T
Q  130 aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8740695 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 8740602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8996644 - 8996447
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996644 gagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattattttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8996547  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8996546 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcacta 8996448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Original strand, 11530344 - 11530474
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530344 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11530443  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11530444 ataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9007192 - 9006999
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ata 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9007192 agagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaata 9007095  T
Q  115 atcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9007094 atcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaa 9006999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 1053255 - 1053467
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1053255 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 1053352  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  1053353 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcact 1053451  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  1053452 aaagcaagagtcttct 1053467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 16076494 - 16076687
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaa 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16076494 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaa 16076593  T
Q  131 atgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16076594 atgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 16076687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18857580 - 18857426
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatg 153  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18857580 ttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatg 18857481  T
Q  154 agacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18857480 agacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19121527 - 19121370
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121527 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 19121429  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19121428 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgct 19121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 1063684 - 1063896
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1063684 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccagaagttgtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 1063781  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  1063782 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcact 1063880  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  1063881 aaagcaagagtcttct 1063896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29906869 - 29906658
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact 111  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29906869 agcagagaaaagaaa-agtaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccact 29906771  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     |||||| || |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||     
T  29906770 aataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcccta 29906673  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  29906672 aagcaagagtcttct 29906658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17282122 - 17281911
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17282122 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 17282025  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  17282024 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 17281927  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  17281926 aaagcaagagtcttct 17281911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24393483 - 24393356
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24393483 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaatacaaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaa 24393384  T
Q  139 tactatcaaagtatgagacttcacaaaa 166  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24393383 tactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 35579111 - 35579002
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35579111 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35579012  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  35579011 ataatcacaa 35579002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29934217 - 29934037
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29934217 ttatcctggatccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatact 29934118  T
Q  143 atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29934117 ctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 29934037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29983371 - 29983191
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29983371 ttatcctggatccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatact 29983272  T
Q  143 atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29983271 ctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 29983191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29948016 - 29947823
Alignment:
Q  33 agacacaagcag-ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattaca 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  29948016 agacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattaca 29947917  T
Q  130 aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  29947916 aatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttct 29947823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29997170 - 29996977
Alignment:
Q  33 agacacaagcag-ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattaca 129  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  29997170 agacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattaca 29997071  T
Q  130 aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  29997070 aatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttct 29996977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13199936 - 13199723
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13199936 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 13199839  T
Q  111 t----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 206  Q
    |    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||    
T  13199838 taaaaataatcacacagattacaaatgcttaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagc 13199742  T
Q  207 act-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  13199741 actaaagcaagagtcttct 13199723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Original strand, 27172428 - 27172622
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact------ataatcacaaagat 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||    
T  27172428 agacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacagat 27172527  T
Q  126 tacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27172528 tacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 13076442 - 13076547
Alignment:
Q  14 gcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13076442 gcagagaaaagaaaggcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 13076540  T
Q  114 aatcaca 120  Q
    |||||||    
T  13076541 aatcaca 13076547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51989821 - 51989627
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||| | |||||    
T  51989821 agacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagatt 51989722  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51989721 acaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 51989627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15663427 - 15663213
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15663427 gagcagagaaaagaaagata--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaactgaaagtagaccagtcccccttgcactttcaaggagattttcac 15663330  T
Q  111 ta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    ||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  15663329 taagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 15663233  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  15663232 cactaaagcaagagtcttct 15663213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15651789 - 15651578
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta- 112  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15651789 cagagaaaagaaagata--gacgcaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaa 15651692  T
Q  113 ----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||  | || |||| |||||||| |||||||||    
T  15651691 gagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcac 15651595  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | ||||||||| |||||    
T  15651594 taaagcaagagtcttct 15651578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 10528733 - 10528930
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  10528733 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 10528832  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10528833 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttcataaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 10528930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31114677 - 31114468
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  31114677 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 31114580  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||  ||| | ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  31114579 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagactt--caataatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 31114483  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     ||||||||||||||    
T  31114482 aaagcaagagacttc 31114468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 2245928 - 2246123
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  2245928 agacacaagcaattatcatggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 2246027  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2246028 acaactgctcaatactctc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 2246123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 17017389 - 17017585
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17017389 agacacaagcgattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17017488  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17017489 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 17017585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 21735713 - 21735896
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21735713 gagcaaagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 21735810  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 194  Q
    |     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  21735811 taagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 13953607 - 13953817
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta-- 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  13953607 agagaaaagaaaga--aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 13953704  T
Q  113 --taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  13953705 tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcac 13953801  T
Q  209 -taagcaagagacttc 223  Q
      ||||||||||||||    
T  13953802 acaagcaagagacttc 13953817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 22150605 - 22150800
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  22150605 agacacatgcaattatactggttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 22150704  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22150705 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 22150800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Original strand, 17006553 - 17006750
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17006553 agacacaagcgattatactggtttcttccacaaactggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17006652  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctt 225  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17006653 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctt 17006750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 15832765 - 15832962
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  15832765 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 15832864  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15832865 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 15832961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671638
Alignment:
Q  97 caaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||    
T  16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttcc 16671668  T
Q  196 aatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 16671638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7608958 - 7608861
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608958 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27245040 - 27244975
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27245040 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 27244975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 41045086 - 41045297
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-- 112  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||| || |||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  41045086 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactagttccttctacaaactggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 41045183  T
Q  113 ---taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
       |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  41045184 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 41045281  T
Q  209 t-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||||    
T  41045282 taaagcaagagacttc 41045297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 49989618 - 49989815
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  49989618 aaagacacagacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 49989717  T
Q  125 ttacaaatgctcaatact-atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  49989718 ttacaattgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 49989814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 14580685 - 14580881
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14580685 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcac 14580778  T
Q  111 t------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtct--tccaatgctc 202  Q
    |      |||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||    
T  14580779 taaatcaataatctcacagattacaactgctcaatactttc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttctcaaatgctc 14580875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 37411992 - 37412191
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 123  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  37411992 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 37412091  T
Q  124 attacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37412092 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 37412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45862362 - 45862163
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  45862362 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 45862263  T
Q  124 attacaaatgctcaatact-atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 221  Q
    ||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45862262 attacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagact 45862166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 13147650 - 13147850
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  13147650 aaagacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 13147749  T
Q  125 ttacaa-atgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 221  Q
    ||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||| ||||||||||||    
T  13147750 ttacaacttgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagact 13147847  T
Q  222 tct 224  Q
    |||    
T  13147848 tct 13147850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 27849572 - 27849668
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||||||     ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27849572 agagaaaagaaagacaaa-----aagcaattatcctcgttccttccacaatccggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 27849666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Original strand, 15848499 - 15848695
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  15848499 aaagacacagacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactga 15848598  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  15848599 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactt 15848695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 13931347 - 13931439
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaag-cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13931347 aagagaaagacacaaaacagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccctttgcacatctaaggagatttcactataatc 13931439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12753425 - 12753243
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| | | |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  12753425 aaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 12753326  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  12753325 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 12753243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Original strand, 17960968 - 17961043
Alignment:
Q  33 agacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 107  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17960968 agacacaagcaatttatactggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagattt 17961043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17769754 - 17769645
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattac 128  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17769754 agacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattac 17769655  T
Q  129 aaatgctcaa 138  Q
    || |||||||    
T  17769654 aattgctcaa 17769645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19071055 - 19070946
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-tcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattac 128  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19071055 agacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattac 19070956  T
Q  129 aaatgctcaa 138  Q
    || |||||||    
T  19070955 aattgctcaa 19070946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13410817 - 13410752
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13410817 gttccttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13410752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 51340340 - 51340519
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 126  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  51340340 gacacaagcaattatacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 51340439  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  51340440 acaactgctcaatactacacctagtatgagatttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 51340519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 2560542 - 2560624
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2560542 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2560624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 11078134 - 11078200
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11078134 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 11078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Original strand, 30390841 - 30390883
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30390841 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 30390883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 3238057 - 3238130
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3238057 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3238130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 21316905 - 21316998
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaag-cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21316905 aagacaaagacacaaatcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcttgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21316998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23538957 - 23538884
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23538957 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggagagttcacta 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Original strand, 20724466 - 20724518
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20724466 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 20724518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Original strand, 50299613 - 50299677
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50299613 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataa 50299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 6252799 - 6252866
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtc-cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6252799 ggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 6252866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19198655 - 19198588
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19198655 tggttccttccacaatccgggagtagtccactcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatca 19198588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22804801 - 22804746
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22804801 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaatgagatttca 22804746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11909840 - 11909646
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  11909840 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 11909741  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11909740 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagacttc 11909646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17239725 - 17239643
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17239725 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 17239643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22770637 - 22770571
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22770637 ggttccttccacaattcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaatca 22770571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26418479 - 26418397
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26418479 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccccttgcacttccaagtagagttcacta 26418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 47207083 - 47207145
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47207083 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 47207145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 8693512 - 8693589
Alignment:
Q  40 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  8693512 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 8693589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 9045399 - 9045476
Alignment:
Q  40 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9045399 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 9045476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 13953791 - 13953848
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13953791 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 13953848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 14580871 - 14580928
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14580871 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 14580928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 15647145 - 15647218
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  15647145 ttatcccggttccttccacaatgcggaagtactccagtaccccttgcacttccaagaacattttcactataatc 15647218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006080
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 18006080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Original strand, 6090105 - 6090157
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6090105 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6090157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14063770 - 14063710
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14063770 ggttccttccacaaactggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14063710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 28581462 - 28581546
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28581462 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28581546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49669267 - 49669207
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49669267 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 49669207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12410492 - 12410413
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12410492 aagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagcttcccttacacttccaaggagattttcactataatc 12410413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 13939275 - 13939334
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13939275 gttccttccacaaaccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13939334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14078096 - 14078029
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14078096 tggttccttccataatctggaagtagtccactcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatca 14078029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 49554299 - 49554216
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49554299 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 49554216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 932249 - 932327
Alignment:
Q  40 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  932249 agcaattatcatggttccttccacaatacagaagtaacccagtccccctcgtacttccaaagagattttcactataatc 932327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 6174730 - 6174780
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6174730 cggaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 6174780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12963888 - 12963806
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12963888 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtaatcatgtcccccttacacttccaaggagagttcacta 12963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 13698783 - 13698849
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13698783 ggttccttccacaatccggtagtagtcttgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13698849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16305855 - 16305781
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 100  Q
    |||| |||||| |||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16305855 aagagaaagacgcaagaaattatacaggttccttccacaattcggaagtagacctgtcccccttgcacttccaag 16305781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20736673 - 20736609
Alignment:
Q  72 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  20736673 agtagtccagtcccc-ttgcactttcaagg-gatttcactataacctcaaacattacaaatgctcaa 20736609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29952239 - 29952157
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  29952239 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 29952157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30001393 - 30001311
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  30001393 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 30001311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30054960 - 30054898
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30054960 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30054898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11909672 - 11909615
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11909672 tgctcaagcccacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 11909615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12753253 - 12753196
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12753253 tgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 12753196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 13823446 - 13823507
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13823446 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13823507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Original strand, 20645537 - 20645590
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20645537 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 20645590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 31302728 - 31302789
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31302728 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 31302789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Original strand, 52919830 - 52919895
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52919830 aagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 52919895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Original strand, 1463738 - 1463853
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatca-caaa 122  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||   ||    
T  1463738 aagaaaaagtcacaagcaattatcatggtttcttccacaatcaagaattagtctagtcccccttgcacttccaaagatatttttcactataatcatgcaa 1463837  T
Q  123 gattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||| |||||||    
T  1463838 gattacaattgctcaa 1463853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 2782835 - 2782919
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2782835 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactat 2782919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 119
Target Start/End: Original strand, 12396450 - 12396514
Alignment:
Q  55 tccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 119  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12396450 tccttccacaaaccggaagtagtcctatctcccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatcac 12396514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20628213 - 20628153
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628213 ggttccttccacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 20628153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21639075 - 21638991
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21639075 aaagacacaagcaatttatacaggttccttcctcaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21638991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22463811 - 22463751
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22463811 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 22463751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22465269 - 22465209
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22465269 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 22465209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 40850333 - 40850417
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40850333 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 40850417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51340565
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttc 51340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 12967687 - 12967746
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  12967687 gttccttccacaacccgaaagtagtcatgtccccattgcactttcaaggagagttcacta 12967746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20747377 - 20747293
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  20747377 tggttcctcccataacacaaaagtagtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcactataa-cctaaacattacaaatgctcaa 20747293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 53057509 - 53057446
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  53057509 ggttccttccacgaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactata 53057446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1728796 - 1728734
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1728796 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 1728734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 2025467 - 2025529
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2025467 ggttcctttcacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2025529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4243896 - 4243830
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  4243896 ggttccttccacaatccggaagtaatattgtcccccttgcacttccaaagagacttcactaaaatca 4243830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 11189378 - 11189452
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11189378 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaacgagagttcacta 11189452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15961389 - 15961340
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15961389 cggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15961340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 40799276 - 40799338
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40799276 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggatagttcactat 40799338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 46797176 - 46797114
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46797176 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 46797114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4243753 - 4243696
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  4243753 tgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttct 4243696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4768281 - 4768229
Alignment:
Q  86 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-agattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4768281 ccttgcacttccaag-agatttcactataatctcactagattacaaatgctcaa 4768229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Original strand, 10849947 - 10850012
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 95  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10849947 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtagtccactcctccttgcactt 10850012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12727016 - 12726955
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12727016 ggttccttctacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 12726955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13410680 - 13410623
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13410680 tgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13781367 - 13781306
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13781367 ggttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacatccaaggagagttcacta 13781306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15663240 - 15663183
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15663240 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 15663183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 22150774 - 22150831
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22150774 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 22150831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31114494 - 31114437
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31114494 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 31114437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 49989789 - 49989846
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49989789 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 49989846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Original strand, 2784473 - 2784505
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2784473 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2784505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848756
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Original strand, 29854784 - 29854844
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29854784 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcact 29854844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29934064 - 29934008
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29934064 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttc 29934008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29983218 - 29983162
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29983218 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttc 29983162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 159)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18763793 - 18763581
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763793 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18763694  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763693 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 18763594  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  18763593 gcaagagacttct 18763581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 5022302 - 5022512
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022302 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5022401  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022402 ataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5022501  T
Q  212 gcaagagactt 222  Q
    |||||||||||    
T  5022502 gcaagagactt 5022512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18753183 - 18752971
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18753183 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgctcttccaaggagatttcact 18753084  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18753083 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 18752984  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  18752983 gcaagagacttct 18752971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27815639 - 27815427
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815639 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27815540  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815539 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27815440  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27815439 gcaagagacttct 27815427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 48370697 - 48370909
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370697 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 48370796  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370797 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 48370896  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  48370897 gcaagagacttct 48370909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 450142 - 450354
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450142 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 450241  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450242 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 450341  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  450342 gcaagagacttct 450354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4947903 - 4948115
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4947903 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4948002  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948003 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 4948102  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  4948103 gcaagagacttct 4948115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15561773 - 15561561
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561773 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 15561674  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561673 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 15561574  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  15561573 gcaagagacttct 15561561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19955656 - 19955444
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955656 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19955557  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955556 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19955457  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19955456 gcaagagacttct 19955444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 21995979 - 21996191
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995979 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 21996078  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996079 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 21996178  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  21996179 gcaagagacttct 21996191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 22006577 - 22006789
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006577 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22006676  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006677 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 22006776  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  22006777 gcaagagacttct 22006789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30927188 - 30926976
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927188 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 30927089  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927088 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 30926989  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  30926988 gcaagagacttct 30926976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 460723 - 460935
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460723 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 460822  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460823 ataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 460922  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  460923 gcaagagacttct 460935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14844347 - 14844135
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844347 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14844248  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844247 ataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 14844148  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  14844147 gcaagagacttct 14844135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19945021 - 19944809
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945021 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19944922  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944921 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19944822  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19944821 gcaagagacttct 19944809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30937766 - 30937554
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937766 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagatttcact 30937667  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937666 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 30937567  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  30937566 gcaagagacttct 30937554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 52703354 - 52703566
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52703354 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcact 52703453  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52703454 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 52703553  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  52703554 gcaagagacttct 52703566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18130936 - 18130722
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130936 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18130837  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130836 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 18130737  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  18130736 aagcaagagacttct 18130722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 17917617 - 17917830
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917617 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17917716  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917717 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 17917816  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  17917817 agcaagagacttct 17917830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 17928265 - 17928478
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928265 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17928364  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928365 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 17928464  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  17928465 agcaagagacttct 17928478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16255432 - 16255643
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255432 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 16255531  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255532 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 16255630  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  16255631 gcaagagacttct 16255643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16266025 - 16266236
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266025 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 16266124  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266125 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 16266223  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  16266224 gcaagagacttct 16266236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40455043 - 40454831
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40455043 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40454944  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454943 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40454844  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40454843 gcaagagacttct 40454831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40471281 - 40471069
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471281 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40471182  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471181 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40471082  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40471081 gcaagagacttct 40471069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18078602 - 18078388
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078602 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18078503  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18078502 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcact 18078403  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  18078402 aagcaagagacttct 18078388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10741289 - 10741076
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741289 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10741190  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741189 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10741091  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  10741090 aagcaagagacttct 10741076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10955058 - 10954845
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955058 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10954959  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10954958 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10954860  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  10954859 aagcaagagacttct 10954845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24639813 - 24640026
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24639813 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24639912  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24639913 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24640011  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24640012 aagcaagagacttct 24640026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27656164 - 27656378
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656164 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27656263  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27656264 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 27656363  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27656364 aagcaagagacttct 27656378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27666737 - 27666951
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666737 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27666836  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27666837 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 27666936  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27666937 aagcaagagacttct 27666951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29042351 - 29042138
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042351 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29042252  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042251 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29042153  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  29042152 aagcaagagacttct 29042138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36017901 - 36018114
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36017901 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36018000  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018001 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36018099  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36018100 aagcaagagacttct 36018114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36028454 - 36028667
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028454 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36028553  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028554 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36028652  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36028653 aagcaagagacttct 36028667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 49517700 - 49517913
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517700 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 49517799  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517800 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 49517898  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  49517899 aagcaagagacttct 49517913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10751863 - 10751652
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751863 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10751764  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751763 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10751665  T
Q  210 aagcaagagactt 222  Q
    |||||||||||||    
T  10751664 aagcaagagactt 10751652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10965632 - 10965421
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965632 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10965533  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965532 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10965434  T
Q  210 aagcaagagactt 222  Q
    |||||||||||||    
T  10965433 aagcaagagactt 10965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24028782 - 24028567
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028782 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24028683  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028682 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 24028583  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  24028582 taagcaagagacttct 24028567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 25656701 - 25656913
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656701 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 25656800  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656801 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 25656900  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  25656901 gcaagagacttct 25656913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55745947 - 55745734
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745947 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 55745848  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55745847 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 55745749  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  55745748 aagcaagagacttct 55745734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55756558 - 55756345
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55756558 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 55756459  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55756458 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 55756360  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  55756359 aagcaagagacttct 55756345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 10908975 - 10909185
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908975 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10909073  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909074 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 10909173  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  10909174 caagagtcttct 10909185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 16304674 - 16304884
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16304674 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcacta 16304772  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16304773 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 16304872  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  16304873 caagagtcttct 16304884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 16316898 - 16317108
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16316898 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcacta 16316996  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316997 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 16317096  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  16317097 caagagtcttct 16317108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 25008463 - 25008673
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25008463 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcacta 25008561  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25008562 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 25008661  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  25008662 caagagtcttct 25008673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 10695209 - 10695418
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695209 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10695307  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695308 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 10695406  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  10695407 caagagtcttct 10695418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47152740 - 47152531
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152740 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 47152642  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152641 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 47152543  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  47152542 caagagtcttct 47152531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14836794 - 14836584
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14836794 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcacta 14836696  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836695 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 14836596  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  14836595 caagagtcttct 14836584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 3370284 - 3370492
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3370284 agagaaaagaaacacga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 3370382  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3370383 tcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagca 3370482  T
Q  215 agagacttct 224  Q
    |||| |||||    
T  3370483 agagtcttct 3370492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 3390024 - 3390232
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390024 agagaaaagaaacacga-gacacgagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 3390122  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390123 tcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagca 3390222  T
Q  215 agagacttct 224  Q
    |||| |||||    
T  3390223 agagtcttct 3390232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19143696 - 19143504
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143696 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 19143598  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143597 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 19580830 - 19581017
Alignment:
Q  36 cacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19580830 cacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 19580929  T
Q  136 caatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19580930 caatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 19581017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 5872939 - 5873148
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5872939 agcagagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttcctcccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 5873037  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5873038 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 5873136  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  5873137 caagagtcttct 5873148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15208079 - 15207870
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15208079 agcagagaaaagaa-gaataaggcacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacca 15207981  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207980 taatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 15207882  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  15207881 caagagtcttct 15207870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 11535428 - 11535622
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11535428 aaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattaca 11535527  T
Q  130 aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11535528 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 11535622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 10300120 - 10300312
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10300120 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 10300219  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10300220 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 10300312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 24712993 - 24713198
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24712993 gagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccattgcacttccaaggagatttcact 24713091  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24713092 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaaaa-tgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcacta 24713190  T
Q  211 agcaagag 218  Q
    ||||||||    
T  24713191 agcaagag 24713198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4987045 - 4986892
Alignment:
Q  71 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgc 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  4987045 aagtagtccagtcccccttacacttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgc 4986946  T
Q  171 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4986945 tcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 4986892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8183613 - 8183486
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183613 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 8183514  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttc 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8183513 gctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9921068 - 9920958
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9921068 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9920969  T
Q  112 ataatcacaaa 122  Q
    |||||||||||    
T  9920968 ataatcacaaa 9920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 11514601 - 11514812
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11514601 gagcagagaaaagaaagaga--gatgcaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 11514698  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  11514699 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 11514796  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  11514797 aaagcaagagtcttct 11514812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 28050129 - 28050238
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050129 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 28050228  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  28050229 ataatcacaa 28050238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31267485 - 31267274
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31267485 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagatttccac 31267389  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  31267388 taataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 31267290  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  31267289 aaagcaagagtcttct 31267274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 49509543 - 49509652
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49509543 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 49509642  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  49509643 ataatcacaa 49509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Original strand, 19570584 - 19570711
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570584 agcagagaaaagaa-gaataagatacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 19570682  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570683 taatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 10290191 - 10290345
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10290191 gagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10290289  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 166  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10290290 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16820038 - 16819828
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  16820038 agagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 16819941  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  16819940 aaataatcacacagattacaactgctcaatactaac-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 16819844  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  16819843 aaagcaagagacttct 16819828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49002670 - 49002463
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  49002670 cagagaaaagaaagaga--gacacaaccaattattctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 49002573  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  49002572 taatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 49002476  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  49002475 gcaagagtcttct 49002463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 23508713 - 23508923
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  23508713 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttcattccacaaaccggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 23508810  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  23508811 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 23508907  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  23508908 aaagcaagagacttct 23508923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 19241589 - 19241798
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||       
T  19241589 agagaaaagaaagataaa--cacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaag 19241686  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19241687 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 19241783  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     ||||||||||||||    
T  19241784 aaagcaagagacttc 19241798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14711468 - 14711256
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  14711468 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 14711371  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  14711370 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 14711273  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||||||    
T  14711272 taaagcaagagacttct 14711256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14779132 - 14778920
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  14779132 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 14779035  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  14779034 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 14778937  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||||||    
T  14778936 taaagcaagagacttct 14778920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 55650893 - 55651100
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  55650893 cagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttctacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 55650990  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  55650991 aaatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 55651087  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  55651088 gcaagagtcttct 55651100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 17199163 - 17199074
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199163 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 17199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3189071 - 3188988
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189071 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 3188988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20649528 - 20649445
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649528 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 20649445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29030237 - 29030156
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29030237 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 29030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18775372 - 18775179
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  18775372 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatg 18775275  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||  |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  18775274 aaataatcacacagattacaactgctcaatact-gcctagtgggagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 18775179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36210784 - 36210588
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  36210784 agacacaaacaattatactggttcgttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 36210685  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||| ||||  |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36210684 caactgctcaagactacacctagtatgagaattcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 36210588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 39532395 - 39532269
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39532395 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttacaaggagattttcac 39532298  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  39532297 taaaaatcacacagattacaaatgctcaa 39532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18007778 - 18007569
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  18007778 agagaaaagaaagaga--gacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 18007681  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||  | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  18007680 aaataatcacacagattacaactgcttaatacta-cctagtatgagactt--ccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 18007584  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     || |||||||||||    
T  18007583 aaatcaagagacttc 18007569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18775689 - 18775515
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||       
T  18775689 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttccactatg 18775592  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagag 189  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||    
T  18775591 aaataatcacacagattacaactgctcaatact-gcctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagag 18775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 33377762 - 33377959
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  33377762 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 33377861  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| | ||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  33377862 ttacaacttctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 33377958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18776020 - 18775930
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 108  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18776020 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttc 18775930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Original strand, 13693194 - 13693280
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13693194 aagagaaagacacaagcaattatacaggttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19889717 - 19889651
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19889717 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19889651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 43347124 - 43347078
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcct 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43347124 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcct 43347078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 55379683 - 55379743
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55379683 ggttccttccacaaaacggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 55379743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14903177 - 14903084
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14903177 aagagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14903084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 11900564 - 11900624
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11900564 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11900624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15015124 - 15015064
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15015124 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcacta 15015064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 16939352 - 16939436
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16939352 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16939436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17994442 - 17994362
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 99  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17994442 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtccccc-tgcacttccaa 17994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 18473414 - 18473506
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  18473414 aagagaaatacaaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatca 18473506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 19884084 - 19884168
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19884084 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19884168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20571754 - 20571666
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  20571754 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 20571666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
Q  111 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 12600134 - 12600193
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12600134 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 12600193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 15135080 - 15135163
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  15135080 aaagacacaaagcagttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagttcacta 15135163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 19052738 - 19052803
Alignment:
Q  72 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19052738 agtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19052803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 24619079 - 24619181
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgct 135  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24619079 aagcaattatcctgattccttccataatttggaagtagtctagtcccccatgcacttccaatgagatttttcactttaatcacacaagattacaattgct 24619178  T
Q  136 caa 138  Q
    |||    
T  24619179 caa 24619181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Original strand, 7221936 - 7222007
Alignment:
Q  69 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  7221936 ggaagtagtccagtccgccttgcactttcaatgagatttcactataatc-caaatttgattacaaatgctcaa 7222007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17994345 - 17994270
Alignment:
Q  148 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17994345 agtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 17994270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Original strand, 23749899 - 23749957
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23749899 ttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23749957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14190149 - 14190088
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14190149 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14190088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16476129 - 16476056
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16476129 aagcagttatacatgttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 16476056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 16847921 - 16847982
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16847921 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16847982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 16852877 - 16852938
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16852877 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17788791 - 17788718
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17788791 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 17788718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 41115517 - 41115436
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41115517 aaagacacaaagcaattatacaggttccttcctcaaaccggaagtagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 41115436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 6516839 - 6516923
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6516839 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6516923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17527104 - 17527016
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17527104 aaagacacaaagcaattattctggttccttccatgatcggaaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 17527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 110
Target Start/End: Original strand, 22089637 - 22089717
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22089637 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaattagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22676282 - 22676198
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22676282 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22676198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29681254 - 29681194
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29681254 ggttccttccacaaaccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29681194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 54679279 - 54679363
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54679279 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 54679363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 6641059 - 6641117
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6641059 gttccttccacaa-accgaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 6641117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8686180 - 8686121
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8686180 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgccccccttgcactttcaaggagagttcacta 8686121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14154755 - 14154672
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14154755 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcacta 14154672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16325230 - 16325167
Alignment:
Q  55 tccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16325230 tccttccataatccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16325167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32491521 - 32491438
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc-acaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  32491521 cttccacaatccagaagtagttcagtccctcttgcactttcaaggagattttcactataatctacactgattacaaatgctcaa 32491438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 16631800 - 16631874
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16631800 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16631874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22223525 - 22223437
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 135  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  22223525 ttatactggttcctcccacaacacaggagtagtcaagtcctc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatctcacatattacaattgct 22223437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 36470329 - 36470403
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36470329 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 36470403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 55731221 - 55731283
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55731221 ggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 55731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 8911037 - 8911122
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 132  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8911037 ttatactggttcctcccacaacacaggagtaatccag--ccccttacacttctaagg-gatttcactataatcacacaagattacaaat 8911122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 18773455 - 18773528
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  18773455 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgccctttcaaggagagttcacta 18773528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18775189 - 18775132
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18775189 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 18775132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3106178 - 3106094
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3106178 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 3106094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 8103659 - 8103719
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8103659 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 8103719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 11915074 - 11915134
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11915074 ggttccttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 11915134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14605642 - 14605582
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14605642 gttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14605582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17399434 - 17399350
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17399434 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 17399350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 18773578 - 18773634
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||    
T  18773578 tgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcacaaatcaatagacttct 18773634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 45832738 - 45832822
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45832738 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 45832822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10661917 - 10661838
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  10661917 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatca 10661838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10876062 - 10875983
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  10876062 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccacttgcacctcccaggagagttcactaaaatca 10875983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13977968 - 13977914
Alignment:
Q  84 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13977968 ccccttgcacttc-aaggaattttcactataatcactaaagattacaaatgctcaa 13977914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15475898 - 15475819
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccag-----tcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15475898 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagcccccccccccctgcacttccaaggagagttcactat 15475819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 18393952 - 18394019
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  18393952 tggttccttccacaattcggaagtagtttactcccccttgcacttccaaagaaattttactaaaatca 18394019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 19665716 - 19665791
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19665716 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 19665791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 37986350 - 37986307
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 95  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37986350 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcactt 37986307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13576853 - 13576791
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13576853 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 13576791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17701493 - 17701431
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17701493 ggttccttcaacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17701431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19556137 - 19556050
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct 135  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  19556137 ttatactggttcctcccacaacaca-aagtagtccagtcccg-ttgcacttccaatga-atttcactataatctcatatattacaattgct 19556050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 37436270 - 37436212
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37436270 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttca 37436212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671965
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 1671965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 13890209 - 13890274
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  || |||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13890209 gttccttccacaattcgaaagtagttttgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatca 13890274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 86
Target Start/End: Original strand, 15193165 - 15193206
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc 86  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15193165 ttatcctggttccttccataattcggaagtagtccagtcccc 15193206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 19241772 - 19241829
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19241772 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 19241829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19889574 - 19889517
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19889574 tgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 19889517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 33377933 - 33377990
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33377933 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 33377990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39420441 - 39420380
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39420441 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttacaaggagagttcactat 39420380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 55651073 - 55651130
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55651073 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttct 55651130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Original strand, 3395023 - 3395075
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  3395023 ggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtccctcttgcacttccaaggaga 3395075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 10249309 - 10249373
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  10249309 ttccttccacaaaccggaactagtcatgtcccccttgcacctccaagaagagttcactaaaatca 10249373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 24619175 - 24619231
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24619175 tgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39981284 - 39981226
Alignment:
Q  72 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa-gattacaaa 131  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39981284 agtagtccagtccac-ttgcacttccaagga-atttcactataatcataaaggattacaaa 39981226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 40860022 - 40860106
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | || |||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40860022 aaagacacaagcaatttatacaggctccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 40860106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Original strand, 56033948 - 56034008
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56033948 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 56034008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 179)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 7031608 - 7031820
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031608 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7031707  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031708 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7031807  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  7031808 gcaagagacttct 7031820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10755300 - 10755088
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755300 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcctttcacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10755201  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10755200 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaactaa 10755101  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  10755100 gcaagagacttct 10755088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40391165 - 40390953
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40391165 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagatttcact 40391066  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40391065 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40390966  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40390965 gcaagagacttct 40390953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40401827 - 40401615
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40401827 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcact 40401728  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401727 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40401628  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40401627 gcaagagacttct 40401615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9336763 - 9336551
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336763 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9336664  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336663 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9336564  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9336563 gcaagagacttct 9336551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9347350 - 9347138
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347350 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9347251  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347250 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9347151  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9347150 gcaagagacttct 9347138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16003343 - 16003555
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003343 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 16003442  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003443 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 16003542  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  16003543 gcaagagacttct 16003555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23362919 - 23362707
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362919 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23362820  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362819 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 23362720  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  23362719 gcaagagacttct 23362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27602870 - 27603082
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602870 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27602969  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602970 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27603069  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27603070 gcaagagacttct 27603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36582009 - 36582221
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582009 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36582108  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582109 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 36582208  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  36582209 gcaagagacttct 36582221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36592564 - 36592776
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592564 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36592663  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592664 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 36592763  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  36592764 gcaagagacttct 36592776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39353296 - 39353084
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353296 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39353197  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353196 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 39353097  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  39353096 gcaagagacttct 39353084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 43043123 - 43043335
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043123 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 43043222  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43043223 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataa 43043322  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  43043323 gcaagagacttct 43043335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5290027 - 5290240
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290027 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5290126  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290127 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 5290226  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  5290227 agcaagagacttct 5290240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5300598 - 5300811
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300598 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5300697  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300698 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 5300797  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  5300798 agcaagagacttct 5300811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6131599 - 6131387
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131599 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6131500  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131499 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6131400  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6131399 gcaagagacttct 6131387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 15992781 - 15992993
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992781 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 15992880  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992881 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 15992980  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  15992981 gcaagagacttct 15992993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27622219 - 27622431
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622219 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27622318  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622319 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27622418  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27622419 gcaagagacttct 27622431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34772718 - 34772506
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34772718 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcact 34772619  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772618 ataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 34772519  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  34772518 gcaagagacttct 34772506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34783663 - 34783451
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34783663 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcact 34783564  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783563 ataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 34783464  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  34783463 gcaagagacttct 34783451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39365289 - 39365077
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365289 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39365190  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365189 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 39365090  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  39365089 gcaagagacttct 39365077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14557467 - 14557681
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557467 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14557566  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557567 ttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14557666  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  14557667 aagcaagagacttct 14557681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14568104 - 14568318
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568104 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14568203  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568204 ttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14568303  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  14568304 aagcaagagacttct 14568318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22560244 - 22560033
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560244 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 22560145  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22560144 taatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 22560045  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    ||||||||||||    
T  22560044 caagagacttct 22560033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23297087 - 23296873
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23297087 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23296988  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296987 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23296888  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  23296887 aagcaagagacttct 23296873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23307655 - 23307441
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307655 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23307556  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307555 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23307456  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  23307455 aagcaagagacttct 23307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23708252 - 23708038
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708252 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23708153  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708152 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23708053  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  23708052 aagcaagagacttct 23708038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 30226946 - 30227160
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30226946 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 30227045  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227046 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 30227145  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  30227146 aagcaagagacttct 30227160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 30237473 - 30237687
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237473 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 30237572  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237573 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 30237672  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  30237673 aagcaagagacttct 30237687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 40513439 - 40513653
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513439 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40513538  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513539 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 40513638  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  40513639 aagcaagagacttct 40513653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42043594 - 42043380
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043594 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 42043495  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043494 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42043395  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  42043394 aagcaagagacttct 42043380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42054169 - 42053955
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42054169 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 42054070  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42054069 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42053970  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  42053969 aagcaagagacttct 42053955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 30069355 - 30069568
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069355 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 30069454  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069455 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 30069554  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  30069555 agcaagagacttct 30069568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22147330 - 22147119
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147330 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22147231  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147230 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 22147132  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  22147131 gcaagagacttct 22147119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6976619 - 6976405
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976619 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6976520  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976519 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 6976420  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  6976419 aagcaagagacttct 6976405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6987109 - 6986895
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6987109 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6987010  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6987009 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 6986910  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  6986909 aagcaagagacttct 6986895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22676927 - 22676713
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676927 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22676828  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676827 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 22676728  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  22676727 aagcaagagacttct 22676713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22686818 - 22686604
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686818 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22686719  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686718 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 22686619  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  22686618 aagcaagagacttct 22686604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23697594 - 23697380
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697594 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23697495  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697494 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 23697395  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  23697394 aagcaagagacttct 23697380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 33951250 - 33951464
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951250 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 33951349  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33951350 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 33951449  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  33951450 aagcaagagacttct 33951464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35216315 - 35216102
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216315 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35216216  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216215 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35216117  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35216116 aagcaagagacttct 35216102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35226899 - 35226686
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226899 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35226800  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226799 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35226701  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35226700 aagcaagagacttct 35226686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 39490400 - 39490614
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490400 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39490499  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490500 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39490599  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39490600 aagcaagagacttct 39490614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 39501590 - 39501804
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501590 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39501689  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501690 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39501789  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39501790 aagcaagagacttct 39501804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22157909 - 22157702
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157909 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 22157810  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 215  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157809 tcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 22157711  T
Q  216 gagacttct 224  Q
    |||||||||    
T  22157710 gagacttct 22157702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27204600 - 27204388
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204600 gagcagagaaaagaaagacagagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27204501  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27204500 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaa 27204401  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27204400 gcaagagacttct 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31419471 - 31419259
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31419471 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagaagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31419372  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31419371 ataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 31419272  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  31419271 gcaagagacttct 31419259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9376913 - 9377126
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9376913 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9377012  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377013 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 9377111  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  9377112 aagcaagagacttct 9377126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14030853 - 14030640
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030853 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14030754  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030753 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14030655  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  14030654 aagcaagagacttct 14030640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14041406 - 14041193
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041406 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14041307  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041306 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14041208  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  14041207 aagcaagagacttct 14041193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14446452 - 14446665
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14446452 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcact 14446551  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446552 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14446650  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  14446651 aagcaagagacttct 14446665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14457064 - 14457277
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14457064 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcact 14457163  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457164 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 14457262  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  14457263 aagcaagagacttct 14457277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 15693483 - 15693696
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693483 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 15693582  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693583 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 15693681  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  15693682 aagcaagagacttct 15693696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15740777 - 15740564
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740777 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 15740678  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740677 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 15740579  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  15740578 aagcaagagacttct 15740564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15769937 - 15769724
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769937 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 15769838  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769837 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 15769739  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  15769738 aagcaagagacttct 15769724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17719726 - 17719513
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719726 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17719627  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719626 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17719528  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17719527 aagcaagagacttct 17719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17730378 - 17730165
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730378 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17730279  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730278 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17730180  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17730179 aagcaagagacttct 17730165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24567898 - 24567685
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567898 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24567799  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567798 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24567700  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24567699 aagcaagagacttct 24567685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24816337 - 24816550
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816337 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24816436  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816437 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24816535  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24816536 aagcaagagacttct 24816550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24826925 - 24827138
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826925 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24827024  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827025 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24827123  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24827124 aagcaagagacttct 24827138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27460970 - 27460757
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460970 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27460871  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460870 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27460772  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27460771 aagcaagagacttct 27460757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27471369 - 27471156
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471369 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27471270  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471269 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27471171  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27471170 aagcaagagacttct 27471156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31834295 - 31834079
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834295 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31834196  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834195 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 31834096  T
Q  208 ctaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  31834095 ctaagcaagagacttct 31834079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31844773 - 31844557
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844773 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31844674  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844673 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 31844574  T
Q  208 ctaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  31844573 ctaagcaagagacttct 31844557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 37728703 - 37728916
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728703 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 37728802  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728803 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 37728901  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  37728902 aagcaagagacttct 37728916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 37740019 - 37740232
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740019 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 37740118  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740119 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 37740217  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  37740218 aagcaagagacttct 37740232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 1121354 - 1121566
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121354 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 1121453  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121454 ataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 1121553  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  1121554 gcaagagtcttct 1121566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31449362 - 31449150
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449362 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31449263  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449262 ataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 31449163  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  31449162 gcaagagacttct 31449150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17607868 - 17607655
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607868 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17607769  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607768 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17607670  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17607669 aagcaagagacttct 17607655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17618483 - 17618270
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618483 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17618384  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618383 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17618285  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17618284 aagcaagagacttct 17618270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24808721 - 24808508
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808721 gagcagagaaaagaaagacaaagacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24808622  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808621 ataatcac-aagattacaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 24808523  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24808522 aagcaagagacttct 24808508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27041663 - 27041876
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041663 gagcagagaaaagaaagacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27041762  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041763 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27041861  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27041862 aagcaagagacttct 27041876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27052287 - 27052500
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052287 gagcagagaaaagaaagacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27052386  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052387 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27052485  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27052486 aagcaagagacttct 27052500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31349342 - 31349129
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349342 gagcagagaaaagaaagacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31349243  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349242 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 31349144  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  31349143 aagcaagagacttct 31349129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31359956 - 31359743
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359956 gagcagagaaaagaaagacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31359857  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359856 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 31359758  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  31359757 aagcaagagacttct 31359743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36688503 - 36688290
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688503 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36688404  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688403 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36688305  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36688304 aagcaagagacttct 36688290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36699069 - 36698856
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36699069 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36698970  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698969 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36698871  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36698870 aagcaagagacttct 36698856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 1108596 - 1108808
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108596 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 1108695  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108696 ataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 1108795  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||| || |||||    
T  1108796 gcaaaagtcttct 1108808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20798502 - 20798292
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20798502 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatatttcacta 20798404  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798403 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 20798304  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    ||||||||||||    
T  20798303 caagagacttct 20798292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19464779 - 19464567
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464779 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 19464680  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464679 taatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19464580  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  19464579 gcaagagtcttct 19464567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23407252 - 23407042
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23407252 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 23407154  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23407153 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 23407054  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  23407053 caagagtcttct 23407042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19478809 - 19478597
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478809 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 19478710  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478709 taatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19478610  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  19478609 gcaagagtcttct 19478597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 17446150 - 17446359
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446150 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 17446248  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446249 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 17446347  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  17446348 caagagtcttct 17446359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36229545 - 36229335
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229545 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 36229447  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229446 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 36229347  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  36229346 caagagtcttct 36229335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36085267 - 36085057
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36085267 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 36085169  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36085168 taatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 36085069  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  36085068 caagagtcttct 36085057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42395790 - 42395580
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42395790 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttcacta 42395692  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395691 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 42395592  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  42395591 caagagtcttct 42395580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8522648 - 8522437
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522648 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 8522550  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8522549 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcattaa 8522450  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  8522449 gcaagagtcttct 8522437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20552622 - 20552411
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552622 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 20552524  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20552523 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaa 20552424  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  20552423 gcaagagtcttct 20552411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 21702581 - 21702788
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702581 agagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 21702679  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702680 tcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 21702779  T
Q  216 gagacttct 224  Q
    ||| |||||    
T  21702780 gagtcttct 21702788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34063409 - 34063218
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063409 aagacacaaacagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 34063310  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34063309 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 34063218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 43621347 - 43621558
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621347 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacagatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 43621445  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621446 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 43621545  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  43621546 gcaagagtcttct 43621558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23393207 - 23392997
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393207 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 23393109  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23393108 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcactaag 23393009  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  23393008 caagagtcttct 23392997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34052766 - 34052557
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34052766 agcagagaaaagaagaataaa-acacaaacagttatcctgattccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 34052668  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34052667 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 34052569  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  34052568 caagagtcttct 34052557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 24982872 - 24983084
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982872 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 24982970  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa-ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982971 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 24983070  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    |||||||| |||||    
T  24983071 agcaagagtcttct 24983084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Original strand, 17456784 - 17456975
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17456784 aagacacaagcagttatcctggttccttccataaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacgataatcacaaagattacaaa 17456883  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17456884 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagtaagagtcttct 17456975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Original strand, 24925609 - 24925803
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24925609 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 24925708  T
Q  131 atgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa-ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24925709 atgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 24925803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20563110 - 20562921
Alignment:
Q  36 cacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20563110 cacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgc 20563011  T
Q  135 tcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20563010 tcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttct 20562921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37407434 - 37407244
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407434 agacacaagcagttatcctcgttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 37407335  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37407334 gttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 37407244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 21705421 - 21705635
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705421 agagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 21705519  T
Q  116 tcacaaagattaca-------aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705520 tcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 21705619  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| |||||    
T  21705620 taagcaagagtcttct 21705635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20625574 - 20625362
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20625574 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 20625477  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20625476 taataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcact 20625378  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  20625377 aaagcaagagtcttct 20625362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 106927 - 106716
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  106927 gagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 106830  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  | ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  106829 taataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 106732  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  106731 aaagcaagagtcttct 106716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 21420215 - 21420426
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21420215 gagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 21420312  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  21420313 taataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaa--tggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 21420410  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  21420411 aaagcaagagtcttct 21420426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20417707 - 20417500
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20417707 cagagaaaagaaagaga--gacataagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 20417610  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20417609 taatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 20417513  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  20417512 gcaagagtcttct 20417500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35543908 - 35543694
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35543908 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 35543811  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||    
T  35543810 taagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaag 35543714  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  35543713 cactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 13522581 - 13522776
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  13522581 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 13522680  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13522681 acaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 13522776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40033534 - 40033322
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  40033534 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 40033437  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40033436 taataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 40033339  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||||||    
T  40033338 taaagcaagagacttct 40033322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20215897 - 20215702
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  20215897 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 20215798  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20215797 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 20215702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36096428 - 36096218
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  36096428 agagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 36096331  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||    
T  36096330 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcact 36096234  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  36096233 aaagcaagagacttct 36096218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36097885 - 36097675
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  36097885 agagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 36097788  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||    
T  36097787 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcact 36097691  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  36097690 aaagcaagagacttct 36097675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 32753418 - 32753609
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaa 130  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||     
T  32753418 agacacaagcaattatcctgattccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacag 32753517  T
Q  131 atgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32753518 atgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 32753609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20168843 - 20168633
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  20168843 agagaaaagaaagaga--gacataagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 20168746  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||| | |||||||||||||    
T  20168745 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcact 20168649  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  20168648 aaagcaagagacttct 20168633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 23487908 - 23488103
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||    
T  23487908 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagatta 23488007  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23488008 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 23488103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 23477732 - 23477926
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  23477732 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 23477831  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23477832 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 23477926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 40228012 - 40228210
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaaga 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||    
T  40228012 aaagacacaagcaattatactggttccttccacaaactagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacaga 40228111  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40228112 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagactt 40228209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Original strand, 13533323 - 13533486
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  13533323 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 13533420  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcac 178  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  13533421 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgaaacttcccaaa--tgctcaagcac 13533486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 1914787 - 1914999
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||       
T  1914787 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccataaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaag 1914884  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||| |||||  |||||||||||    
T  1914885 taataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcac 1914982  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||||||    
T  1914983 taaagcaagagacttct 1914999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26056276 - 26056184
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26056276 aagagaaagacacaaagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgaacttccaatgatatttcactataatc 26056184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403814
Alignment:
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-t 209  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||      
T  13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  13403800 aagcaagagacttct 13403814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25112661 - 25112463
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  25112661 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 25112562  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  25112561 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 25112465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25171752 - 25171554
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  25171752 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 25171653  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  25171652 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagact 25171556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 32160102 - 32160300
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  32160102 aaagacacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 32160201  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  32160202 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 32160298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Original strand, 21659581 - 21659649
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21659581 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 21659649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7746478 - 7746396
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7746478 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7746396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 31117232 - 31117306
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31117232 aaagacacaaagtagttatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 31117306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31589703 - 31589637
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31589703 ggttcattccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 31589637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 6513193 - 6513128
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6513193 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataat 6513128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 10848126 - 10848210
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10848126 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10848210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13546283 - 13546223
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13546283 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13546223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9399377 - 9399318
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9399377 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9399318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11208806 - 11208593
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac-- 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||      
T  11208806 agagaaaagaaaga--aagacacatgcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagtttcacta 11208709  T
Q  111 --tataatcacaa-agattacaaatgctcaatactatcaa--agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
      |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||  |||||  | ||||||    
T  11208708 agtataatcacaactgattacaactgctcaatacta-caactagtatgagacttc---aaaatgctcaagcacaca-gcaagatacttcctttactcaag 11208614  T
Q  206 cac-taagcaagagacttctt 225  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  11208613 cacacaagcaagagacttctt 11208593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25097610 - 25097528
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25097610 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25097528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25155580 - 25155498
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25155580 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25155498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26120583 - 26120517
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  26120583 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagaagtcactaaaatca 26120517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 11993265 - 11993326
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11993265 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11993326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 32160274 - 32160331
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32160274 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 32160331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 90185 - 90125
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  90185 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 90125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3246224 - 3246140
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3246224 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaacggaagtcggtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactat 3246140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 26764883 - 26764943
Alignment:
Q  55 tccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764883 tccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 26764943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 28138958 - 28139042
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28138958 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 28139042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28465120 - 28465036
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28465120 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28465036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 30742336 - 30742420
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30742336 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaccaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagggttcactat 30742420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35932790 - 35932706
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35932790 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35932706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 643461 - 643402
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  643461 gttccttctacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 643402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 17814317 - 17814400
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17814317 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagttcacta 17814400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19536999
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19537058 gttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcacta 19536999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22000811 - 22000729
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22000811 aaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaaccagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22000729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26766619 - 26766537
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  26766619 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaagaagagttcacta 26766537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13736834 - 13736773
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13736834 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13736773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 23880428 - 23880501
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23880428 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggatgtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23880501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 33022040 - 33022101
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33022040 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 33022101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39799601 - 39799536
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39799601 gttccttccacaattcagaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 39799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 4886317 - 4886401
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4886317 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 4886401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Original strand, 6498666 - 6498746
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6498666 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccacggagagttca 6498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 9823663 - 9823749
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 132  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  9823663 ttatactgattcctcccacaacacagaagtagtcca-acccccttgcactttcaagg-gatttcactatcatcacacatgattacaaat 9823749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 12078357 - 12078413
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12078357 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 12078413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12353556 - 12353496
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12353556 gttccttccacaagccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12353496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 20968623 - 20968683
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20968623 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaagcagagttcacta 20968683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21199762 - 21199702
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21199762 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcactttcgaggagagttcacta 21199702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24495248 - 24495158
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctca 137  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  24495248 ttatactggttcctcccacaacacaagagtagtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcattataatctcactgattacaattgctca 24495158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Original strand, 26013259 - 26013310
Alignment:
Q  86 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26013259 ccttgcactttcaagg-gatttcactataatctcatagattacaaatgctcaa 26013310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30116619 - 30116535
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30116619 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 30116535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 33932622 - 33932706
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33932622 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33932706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35987016 - 35986932
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  35987016 aaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcactaccaaggggagttcactat 35986932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11208619 - 11208564
Alignment:
Q  170 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11208619 ctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttct 11208564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23413758 - 23413679
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23413758 aaagacacaaagcaattatacaggttccttacacaaaccggaagtagtcttgtccccctttcacttccaaggagagttca 23413679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 15516347 - 15516409
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15516347 ggttcctaccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 15516409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 132
Target Start/End: Original strand, 22747800 - 22747880
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 132  Q
    |||||||| ||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22747800 tggttcctcccataacacaagagtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataataacataggattacaaat 22747880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 23589095 - 23589161
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  23589095 ggttccttccataattcggaagtagttctgtcccccttgcacttccgaggatagttcactaaaatca 23589161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 23477900 - 23477957
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23477900 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 23477957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 23589238 - 23589295
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  23589238 tgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttct 23589295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25112489 - 25112432
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25112489 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 25112432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25171580 - 25171523
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25171580 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 25171523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 26783716 - 26783789
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26783716 aagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtattgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 26783789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 32753582 - 32753639
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32753582 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttct 32753639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 40228184 - 40228241
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40228184 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 40228241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 9088324 - 9088408
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9088324 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaatcggaaatcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 9088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14087271 - 14087239
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14087271 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 14087239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 29139187 - 29139107
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29139187 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttca 29139107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Original strand, 31487643 - 31487675
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31487643 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 31487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 140)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30489531 - 30489319
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489531 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 30489432  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489431 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 30489332  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  30489331 gcaagagacttct 30489319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16768464 - 16768676
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768464 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 16768563  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768564 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 16768663  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  16768664 gcaagagacttct 16768676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 43082175 - 43082387
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082175 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 43082274  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082275 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 43082374  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  43082375 gcaagagacttct 43082387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1099902 - 1099690
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099902 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 1099803  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099802 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 1099703  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  1099702 gcaagagacttct 1099690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4099335 - 4099547
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099335 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4099434  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099435 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 4099534  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  4099535 gcaagagacttct 4099547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4209410 - 4209622
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209410 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4209509  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209510 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 4209609  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  4209610 gcaagagacttct 4209622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7006514 - 7006302
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006514 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7006415  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006414 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7006315  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  7006314 gcaagagacttct 7006302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9774011 - 9773799
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9774011 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9773912  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773911 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9773812  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9773811 gcaagagacttct 9773799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11389516 - 11389304
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389516 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11389417  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389416 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 11389317  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  11389316 gcaagagacttct 11389304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22961039 - 22960827
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22961039 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22960940  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960939 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 22960840  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  22960839 gcaagagacttct 22960827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24328441 - 24328229
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328441 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24328342  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328341 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 24328242  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  24328241 gcaagagacttct 24328229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24339111 - 24338899
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339111 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24339012  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339011 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 24338912  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  24338911 gcaagagacttct 24338899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 40250714 - 40250926
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250714 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40250813  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250814 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40250913  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40250914 gcaagagacttct 40250926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 43092784 - 43092996
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092784 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 43092883  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092884 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 43092983  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||    
T  43092984 gtaagagacttct 43092996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4220002 - 4220214
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220002 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4220101  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220102 ataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 4220201  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  4220202 gcaagagacttct 4220214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9763475 - 9763263
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763475 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9763376  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763375 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9763276  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9763275 gcaagagacttct 9763263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17858144 - 17857932
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858144 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17858045  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858044 ataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 17857945  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  17857944 gcaagagacttct 17857932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22915571 - 22915359
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915571 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22915472  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915471 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 22915372  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  22915371 gcaagagacttct 22915359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 29243743 - 29243955
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243743 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29243842  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243843 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 29243942  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||    
T  29243943 gaaagagacttct 29243955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 29254322 - 29254534
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254322 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29254421  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254422 ataataacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 29254521  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  29254522 gcaagagacttct 29254534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18393346 - 18393132
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393346 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18393247  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393246 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 18393147  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  18393146 aagcaagagacttct 18393132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 34477449 - 34477662
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477449 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 34477548  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477549 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 34477648  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  34477649 agcaagagacttct 34477662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 40221853 - 40222065
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221853 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40221952  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221953 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40222052  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40222053 gcaagagacttct 40222065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11395881 - 11395667
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395881 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11395782  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11395781 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 11395682  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  11395681 aagcaagagacttct 11395667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11406197 - 11405983
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11406197 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11406098  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11406097 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 11405998  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  11405997 aagcaagagacttct 11405983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34790924 - 34790712
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790924 gagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 34790825  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790824 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 34790725  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  34790724 gcaagagacttct 34790712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34805067 - 34804855
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34805067 gagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 34804968  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34804967 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 34804868  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  34804867 gcaagagacttct 34804855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 10266514 - 10266727
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266514 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10266613  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266614 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10266712  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  10266713 aagcaagagacttct 10266727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 10277091 - 10277304
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277091 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10277190  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277191 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 10277289  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  10277290 aagcaagagacttct 10277304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27220901 - 27221114
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220901 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27221000  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27221001 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27221099  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27221100 aagcaagagacttct 27221114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 32217393 - 32217607
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217393 gagcaaagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 32217492  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217493 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 32217592  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  32217593 aagcaagagacttct 32217607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 35252502 - 35252715
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252502 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35252601  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252602 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35252700  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35252701 aagcaagagacttct 35252715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 35263111 - 35263324
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263111 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35263210  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263211 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35263309  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35263310 aagcaagagacttct 35263324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 35273736 - 35273949
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273736 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35273835  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273836 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35273934  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35273935 aagcaagagacttct 35273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36252550 - 36252339
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252550 agcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 36252451  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252450 taatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcactaag 36252351  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    ||||||||||||    
T  36252350 caagagacttct 36252339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9908872 - 9908657
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9908872 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagatttcact 9908773  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908772 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 9908673  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  9908672 taagcaagagacttct 9908657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 2561009 - 2561221
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2561009 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaact 2561108  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561109 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 2561208  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  2561209 gcaagagtcttct 2561221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21651213 - 21651000
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651213 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 21651114  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651113 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 21651015  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  21651014 aagcaagagacttct 21651000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39170803 - 39170590
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170803 gagcagagaaaagaaagacaaacacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 39170704  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170703 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39170605  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39170604 aagcaagagacttct 39170590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9898284 - 9898069
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9898284 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccataacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9898185  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9898184 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 9898085  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  9898084 taagcaagagacttct 9898069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21173174 - 21172961
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21173174 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 21173075  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21173074 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 21172975  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    |||||||| |||||    
T  21172974 agcaagagtcttct 21172961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 43344928 - 43345141
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43344928 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 43345027  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345028 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 43345126  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  43345127 aagcaagagacttct 43345141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 43354543 - 43354756
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354543 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 43354642  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354643 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 43354741  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  43354742 aagcaagagacttct 43354756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24428291 - 24428081
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428291 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 24428193  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428192 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 24428093  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  24428092 caagagtcttct 24428081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28722021 - 28721811
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28722021 agcagagaaaagaaaggcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 28721923  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721922 taatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 28721823  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  28721822 caagagtcttct 28721811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28732607 - 28732397
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732607 agcagagaaaagaaaggcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 28732509  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732508 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 28732409  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  28732408 caagagtcttct 28732397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24415726 - 24415516
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415726 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagttgtccagtcacccttgcacttccaaggagatttcacta 24415628  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415627 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 24415528  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  24415527 caagagtcttct 24415516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 26866595 - 26866804
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866595 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 26866693  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26866694 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcactaag 26866792  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  26866793 caagagtcttct 26866804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 26879202 - 26879387
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879202 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 26879301  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 218  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879302 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 26879387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18769609 - 18769400
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769609 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggtttcttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 18769511  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769510 taatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 18769412  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  18769411 caagagtcttct 18769400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38586775 - 38586582
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38586775 agacacaagcagttatcctggttcattccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagt 38586676  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagact--tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38586675 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 38586582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27979068 - 27978883
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27979068 agacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 27978969  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 218  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978968 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 27978883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28065597 - 28065412
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28065597 agacacaagcaattatcatagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 28065498  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 218  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28065497 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 28065412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36785506 - 36785294
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36785506 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 36785409  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36785408 taagaatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatggtcaagcact 36785310  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  36785309 aaagcaagagtcttct 36785294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 30794332 - 30794497
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30794332 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 30794430  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcac 178  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30794431 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 22763176 - 22763387
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-- 111  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22763176 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaa 22763273  T
Q  112 ---ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
       |||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22763274 gaaataatc-cacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 22763370  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | ||||||||| |||||    
T  22763371 taaagcaagagtcttct 22763387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 968210 - 967999
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  968210 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgctc 968113  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  968112 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 968015  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  968014 aaagcaagagtcttct 967999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 1041671 - 1041868
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1041671 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 1041768  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  1041769 taataatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 1041866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19498668 - 19498458
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  19498668 agagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 19498571  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19498570 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 19498474  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  19498473 aaagcaagagacttct 19498458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 22773896 - 22774091
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || |||||    
T  22773896 agacacaagcatttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagatt 22773994  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22773995 acaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 22774091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17970975 - 17970765
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17970975 gagcagagagaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 17970878  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  17970877 taataatcacacagattacaaatgctcaatactaac-tagtatgaaacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 17970781  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  17970780 aaagcaagagtcttct 17970765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 24274552 - 24274758
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-at 113  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  24274552 agagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaat 24274649  T
Q  114 aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aag 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24274650 aatcacacagattacaaatgctcaatactcac-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaag 24274746  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  24274747 caagagtcttct 24274758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 19355838 - 19356051
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19355838 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggtttcttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 19355935  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |    
T  19355936 taacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcctaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcagg 19356032  T
Q  206 cact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19356033 cactaaagcaagagacttc 19356051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19303114 - 19302919
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||    
T  19303114 agacacaagcaattatcctggttccctccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagatt 19303015  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19303014 acaactgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 19302919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19313680 - 19313485
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||    
T  19313680 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagatt 19313581  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    | || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19313580 ataactgctcaatactaccga-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 19313485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23393412 - 23393219
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta---taatcacaa-agattac 128  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||    
T  23393412 gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgattac 23393313  T
Q  129 aaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    || ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23393312 aactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 23393219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38033510 - 38033299
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       
T  38033510 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaag 38033413  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| || |||||  ||||||||||||    
T  38033412 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca-aaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcact 38033315  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  38033314 aaagcaagagacttct 38033299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20647317 - 20647108
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  20647317 agagaaaagaaagaga--gacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 20647220  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||  | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20647219 aaataatcacacagattacaactgcttaatacta-cctagtatgagactt--ccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcact 20647123  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     || |||||||||||    
T  20647122 aaatcaagagacttc 20647108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 22754871 - 22755051
Alignment:
Q  50 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 143  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  22754871 ctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacacta 22754970  T
Q  144 -tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
      |  |||||||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22754971 cacctagtatgagacttcacaga--tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 22755051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38040669 - 38040521
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       
T  38040669 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaag 38040572  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttca 161  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38040571 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca 38040521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24802293 - 24802099
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcacaa-agatta 127  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||  |||||    
T  24802293 gacacatgcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagtttaatcacaactgatta 24802194  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24802193 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaaatgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 24802099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 20221144 - 20221199
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20221144 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 20221199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24815260 - 24815066
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 127  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  24815260 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 24815161  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24815160 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 24815066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 22682798 - 22682871
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22682798 ttatcctgtttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 22682871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14794523 - 14794452
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14794523 ttatcctggttccttcaacaattcggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatc 14794452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19321093 - 19321021
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19321093 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatc 19321021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 22615225 - 22615315
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 108  Q
    |||||||||||||| |  || ||||| | |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22615225 agagaaaagaaagaga--gatacaagaaattatactggttcattccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 22615315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24851389 - 24851329
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24851389 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24851329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 1083368 - 1083547
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 126  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||   |||    
T  1083368 gacacaagcaattatacatgttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaacttatt 1083467  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  1083468 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 1083547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 24843578 - 24843645
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24843578 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactccaccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24843645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21537934 - 21537852
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21537934 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21537852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 120
Target Start/End: Original strand, 8684995 - 8685062
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 120  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8684995 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccccttgcacttccaagg-gatttcactataatcaca 8685062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 22257575 - 22257635
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22257575 ggttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22257635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28141327 - 28141268
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28141327 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28141268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10010500 - 10010418
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10010500 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttacactttcaaggagagttcacta 10010418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19300553 - 19300478
Alignment:
Q  148 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19300553 agtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 19300478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 22382859 - 22382925
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22382859 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccccctggctcttccaaggagagttcactaaaatca 22382925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 24376458 - 24376540
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24376458 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 24376540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 21845537 - 21845602
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21845537 gttccttccacaatcgagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21845602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10899235 - 10899171
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10899235 ttccttccacaatccgaaagtagtccactcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 10899171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 17418285 - 17418219
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 119  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17418285 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccccttgcgcttccaagga-atttcactataatcac 17418219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 18702114 - 18702174
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18702114 ggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18702174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 22271504 - 22271564
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  22271504 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttggacttcaaaggagagttcacta 22271564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 25828536 - 25828595
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25828536 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcacta 25828595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26655408 - 26655322
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 132  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26655408 ttatactggttcctcccacaacacaggagtggtccagt-ccccttgcactttcaagg-gatttcactataatcacacatgattacaaat 26655322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 44839785 - 44839869
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44839785 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagaattcactat 44839869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 21822976 - 21823041
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 119  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21822976 ggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-cccattgcacttccaagg-gatttcactataatcac 21823041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26367133 - 26367074
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26367133 gttccttccacaaatcgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26367074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 47
Target Start/End: Original strand, 38207709 - 38207744
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagtta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38207709 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagtta 38207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 19539768 - 19539850
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  19539768 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatagtcctgtcccgcttgaacttccaaggagagttcacta 19539850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 40781828 - 40781910
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  40781828 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaataagagttcacta 40781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 1083537 - 1083594
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1083537 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 1083594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 21845679 - 21845736
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21845679 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttct 21845736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21911554 - 21911489
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  21911554 gttcattccacaatccggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtttactaaaatca 21911489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 24838480 - 24838545
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24838480 gttccttccacaaatcggaagttgttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24838545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27766213 - 27766146
Alignment:
Q  70 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27766213 gaagtagtccagtcccc-ttacacttccaagga-atttcactataatcacactagattacaattgctcaa 27766146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18431664 - 18431604
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  18431664 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtccccgttgcacttccaatgagagttcacta 18431604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Original strand, 27939418 - 27939516
Alignment:
Q  42 cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  | |||||||||||| || || |  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  27939418 cagttatcctggttccgtccacaatccggaagtagtcca-actcccttgcacttcgaacgatatttttcactataatcacagacgattacaattgctcaa 27939516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39038367 - 39038307
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39038367 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccgcttgcacttccaaggagagttcacta 39038307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 5027924 - 5027893
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagca 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5027924 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagca 5027893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 13964700 - 13964641
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13964700 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 13964641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15671281 - 15671234
Alignment:
Q  71 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15671281 aagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15671234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20569499 - 20569416
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20569499 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 20569416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23185023 - 23184968
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23185023 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23184968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23596286 - 23596231
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23596286 cttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23596231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 112
Target Start/End: Original strand, 27296835 - 27296874
Alignment:
Q  73 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296835 gtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 27296874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6574823 - 6574761
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6574823 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagtttactat 6574761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 19356040 - 19356082
Alignment:
Q  183 gcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19356040 gcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 19356082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21770359 - 21770295
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21770359 tggttcctcccacaacatgggagtaatccagtcccc-ttgcacttctaag-agatttcactataatc 21770295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22782341 - 22782279
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22782341 ggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22782279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22786381 - 22786319
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22786381 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagtttactat 22786319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 22801845 - 22801907
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22801845 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgttcactat 22801907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 24575395 - 24575469
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24575395 aagcaattatactggttccttccacaaaccggaagccagtcctctcccctttgcacttccaaggagagttcacta 24575469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28701938 - 28701876
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28701938 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 28701876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34322658 - 34322596
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34322658 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 34322596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 22316967 - 22317028
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22316967 gttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22317028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 22383002 - 22383059
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22383002 tgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 22383059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24802125 - 24802068
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24802125 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 24802068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24815092 - 24815035
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24815092 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 24815035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Original strand, 25188772 - 25188825
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25188772 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 25188825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30558049 - 30557988
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30558049 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 30557988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 6392038 - 6392098
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6392038 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcacta 6392098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22188799 - 22188767
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22188799 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22188767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22455685 - 22455625
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22455685 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcaattccaaggagagttcacta 22455625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 22763360 - 22763416
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22763360 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttc 22763416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26623163 - 26623123
Alignment:
Q  69 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26623163 ggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttca 26623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28551667 - 28551583
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28551667 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgcaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcgctat 28551583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28712394 - 28712362
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28712394 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28712362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Original strand, 40331163 - 40331223
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40331163 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 40331223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 40331462 - 40331545
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40331462 aaagacacaagcaatttatacaggttcctcccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactat 40331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 157)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51629921 - 51629707
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629921 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 51629822  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629821 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 51629722  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  51629721 aagcaagagacttct 51629707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51657182 - 51656968
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657182 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 51657083  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657082 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 51656983  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  51656982 aagcaagagacttct 51656968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 35012403 - 35012615
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012403 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35012502  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012503 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 35012602  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  35012603 gcaagagacttct 35012615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4177390 - 4177602
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177390 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4177489  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177490 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 4177589  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  4177590 gcaagagacttct 4177602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5640442 - 5640230
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640442 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5640343  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640342 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5640243  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  5640242 gcaagagacttct 5640230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12898713 - 12898501
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898713 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12898614  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898613 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12898514  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12898513 gcaagagacttct 12898501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19178434 - 19178646
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178434 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19178533  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178534 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19178633  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19178634 gcaagagacttct 19178646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19187313 - 19187525
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187313 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19187412  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187413 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19187512  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19187513 gcaagagacttct 19187525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23581028 - 23580816
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23581028 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23580929  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580928 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 23580829  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  23580828 gcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5650999 - 5650787
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650999 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5650900  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650899 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5650800  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  5650799 gcaagagacttct 5650787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10998516 - 10998304
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998516 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagatttcact 10998417  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998416 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 10998317  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  10998316 gcaagagacttct 10998304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12615048 - 12614836
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12615048 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcact 12614949  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614948 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12614849  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12614848 gcaagagacttct 12614836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12624513 - 12624301
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12624513 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcact 12624414  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624413 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12624314  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12624313 gcaagagacttct 12624301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 21863136 - 21863348
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863136 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 21863235  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863236 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 21863335  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  21863336 gcaagagacttct 21863348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35638770 - 35638558
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35638770 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcact 35638671  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638670 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 35638571  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  35638570 gcaagagacttct 35638558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35405126 - 35404912
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35405126 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35405027  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35405026 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35404927  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35404926 aagcaagagacttct 35404912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35649425 - 35649211
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649425 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 35649326  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649325 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 35649226  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  35649225 aagcaagagacttct 35649211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36237163 - 36236949
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237163 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36237064  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237063 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36236964  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36236963 aagcaagagacttct 36236949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36247710 - 36247496
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247710 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36247611  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247610 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36247511  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36247510 aagcaagagacttct 36247496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 38094549 - 38094763
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094549 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 38094648  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094649 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38094748  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  38094749 aagcaagagacttct 38094763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 38105174 - 38105388
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105174 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 38105273  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105274 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 38105373  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  38105374 aagcaagagacttct 38105388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12730022 - 12730234
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730022 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12730121  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730122 ataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12730221  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12730222 gcaagagacttct 12730234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12740615 - 12740827
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740615 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12740714  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740715 ataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12740814  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12740815 gcaagagacttct 12740827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 21877241 - 21877453
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877241 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcact 21877340  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877341 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 21877440  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  21877441 gcaagagacttct 21877453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5832692 - 5832905
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832692 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5832791  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832792 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5832890  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5832891 aagcaagagacttct 5832905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5843294 - 5843507
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843294 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5843393  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843394 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 5843492  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  5843493 aagcaagagacttct 5843507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 7506775 - 7506989
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506775 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7506874  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506875 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 7506974  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  7506975 aagcaagagacttct 7506989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 7517372 - 7517586
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517372 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7517471  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517472 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 7517571  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  7517572 aagcaagagacttct 7517586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 33084039 - 33084249
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084039 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 33084138  T
Q  115 atcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084139 atcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagc 33084238  T
Q  214 aagagacttct 224  Q
    |||||||||||    
T  33084239 aagagacttct 33084249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5973233 - 5973445
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973233 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5973332  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5973333 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcactaa 5973432  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  5973433 gcaagagtcttct 5973445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3171096 - 3171309
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171096 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3171195  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171196 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3171294  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  3171295 aagcaagagacttct 3171309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3181698 - 3181911
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181698 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3181797  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181798 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3181896  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  3181897 aagcaagagacttct 3181911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47608664 - 47608451
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608664 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 47608565  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47608564 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat 47608466  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  47608465 aagcaagagacttct 47608451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47619272 - 47619059
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619272 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 47619173  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47619172 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaat 47619074  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  47619073 aagcaagagacttct 47619059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 2538010 - 2538223
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538010 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 2538109  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538110 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 2538208  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  2538209 aagcaagagacttct 2538223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 155021 - 154808
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155021 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 154922  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154921 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 154822  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    |||||||| |||||    
T  154821 agcaagagtcttct 154808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7690174 - 7689979
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7690174 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaac 7690075  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac---tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7690074 tgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 7689979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20442028 - 20441842
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442028 aagacaaaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 20441929  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 218  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441928 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagag 20441842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18382615 - 18382424
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18382615 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaa 18382516  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18382515 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 18382424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 47194680 - 47194873
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47194680 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 47194778  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47194779 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcac 47194873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4251298 - 4251084
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4251298 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 4251200  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttc----acaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4251199 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 4251100  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| |||||    
T  4251099 taagcaagagtcttct 4251084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 39586448 - 39586651
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586448 agcagagaaaagaa-gaataagacacaaccagttatcctggttcattccataaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 39586546  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586547 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 39586645  T
Q  213 caagag 218  Q
    ||||||    
T  39586646 caagag 39586651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 7677320 - 7677530
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcct-ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7677320 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcattggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7677418  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7677419 ataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcactaa 7677518  T
Q  212 gcaagagacttc 223  Q
    ||||||| ||||    
T  7677519 gcaagagtcttc 7677530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 17956734 - 17956926
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956734 agacacaaacagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 17956833  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctc-aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17956834 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttct 17956926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 16710308 - 16710457
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710308 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 16710407  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttca 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16710408 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttca 16710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12944685 - 12944896
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12944685 gagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12944782  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||     
T  12944783 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaagagacttacaatgctcaagcacta 12944881  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  12944882 aagcaagagtcttct 12944896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20196424 - 20196212
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196424 gagcagagaaaagaaa-agtgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20196326  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||     
T  20196325 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 20196227  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  20196226 aagcaagagtcttct 20196212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Original strand, 4717606 - 4717736
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717606 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4717705  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4717706 ataatcacaaagattacaactgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39194826 - 39194613
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcc-ttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  39194826 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttcccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccagctagatttcact 39194728  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194727 acaatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 39194628  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  39194627 aagcaagagtcttct 39194613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9051143 - 9050994
Alignment:
Q  59 tccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagact 158  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9051143 tccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact 9051044  T
Q  159 tcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9051043 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11195800 - 11195588
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11195800 gagcagagaaaagaaagcga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcat 11195703  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11195702 taaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgatcaagcact 11195604  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  11195603 aaagcaagagtcttct 11195588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14388860 - 14388648
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14388860 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttcattccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 14388763  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  14388762 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 14388664  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  14388663 aaagcaagagtcttct 14388648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 148879 - 148733
Alignment:
Q  79 cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagca 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  148879 cagtcctccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagca 148780  T
Q  178 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  148779 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 148733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25218152 - 25218042
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218152 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 25218053  T
Q  112 ataatcacaaa 122  Q
    |||||||||||    
T  25218052 ataatcacaaa 25218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36551269 - 36551159
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551269 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36551170  T
Q  112 ataatcacaaa 122  Q
    |||||||||||    
T  36551169 ataatcacaaa 36551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 13223528 - 13223637
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13223528 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 13223627  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  13223628 ataatcacaa 13223637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24049229 - 24049120
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049229 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24049130  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  24049129 ataatcacaa 24049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 36100015 - 36100124
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36100015 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36100114  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  36100115 ataatcacaa 36100124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18311705 - 18311493
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18311705 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctaattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 18311608  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  18311607 taataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 18311509  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  18311508 aaagcaagagtcttct 18311493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9749950 - 9749843
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749950 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9749851  T
Q  112 ataatcac 119  Q
    ||||||||    
T  9749850 ataatcac 9749843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 674922 - 675132
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  674922 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 675019  T
Q  111 -tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  675020 aaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 675116  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  675117 aaagcaagagtcttct 675132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46181585 - 46181370
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaaggagattt-ca 109  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  46181585 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcca 46181488  T
Q  110 ct-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaa 204  Q
    ||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  46181487 ctaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaa 46181391  T
Q  205 gcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  46181390 gcactaaagcaagagacttct 46181370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41133349 - 41133153
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  41133349 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccac 41133252  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||    
T  41133251 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcact 41133155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22610709 - 22610495
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22610709 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctcgttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 22610612  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  22610611 taagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 22610515  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  22610514 cactaaagcaggagacttct 22610495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45071330 - 45071120
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  45071330 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 45071233  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||    
T  45071232 aaataatcacacaaattacaactgctcaatacta-cgtagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcact 45071136  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  45071135 aaagcaagagacttct 45071120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 20251148 - 20251360
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  20251148 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaac 20251245  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  20251246 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 20251343  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||||||    
T  20251344 taaagcaagagacttct 20251360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 28379337 - 28379548
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-- 112  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  28379337 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagattttcactaag 28379434  T
Q  113 ---taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
       |||||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||    
T  28379435 taataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgctcaagcac 28379532  T
Q  209 t-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||||    
T  28379533 taaagcaagagacttc 28379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 5929054 - 5929262
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-- 112  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  5929054 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggtttcttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaag 5929151  T
Q  113 ---taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
       |||||||| |||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5929152 aaataatcacacagatta-aactgctcaatactaccta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcact 5929247  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     ||||||||||||||    
T  5929248 aaagcaagagacttc 5929262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 22642220 - 22642418
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  22642220 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtttaatcacaactga 22642319  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22642320 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagactt 22642417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 224
Target Start/End: Original strand, 4166869 - 4166946
Alignment:
Q  147 aagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4166869 aagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 4166946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 22018690 - 22018885
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||| ||||||    
T  22018690 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatattttcactaagtttaatcacacagatta 22018789  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22018790 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttc 22018885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19171063 - 19170869
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  19171063 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 19170966  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  19170965 taataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 19170869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 23926406 - 23926601
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  23926406 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 23926503  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  23926504 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctc--aattgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 23926601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26548979 - 26548784
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    ||||    
T  26548979 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcactcttatta 26548880  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26548879 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 26548784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Original strand, 28473660 - 28473815
Alignment:
Q  73 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  28473660 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa- 28473757  T
Q  167 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28473758 -tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 28473815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 17370400 - 17370595
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 126  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  17370400 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 17370499  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17370500 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 17370595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19087925 - 19087862
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19087925 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 19087862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 19037351 - 19037441
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 108  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19037351 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccaccttgcacttccaaggagatttc 19037441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 10256424 - 10256480
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256424 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 10256480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 21541148 - 21541243
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21541148 agagaaaagaaaga--aggacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 21541243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 23058938 - 23059028
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 108  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23058938 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaactatactggttccttccacaaaccggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttc 23059028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 5234663 - 5234715
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5234663 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 5234715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23975558 - 23975486
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23975558 ttatcatggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttaactataatc 23975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884373
Alignment:
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 210  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |    
T  20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaa 20884387  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  20884386 agcaagagacttct 20884373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 224
Target Start/End: Original strand, 44200443 - 44200601
Alignment:
Q  74 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||      
T  44200443 tagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa-- 44200539  T
Q  168 tgctcaagca----cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||    | |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44200540 tgctcaagcatgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttct 44200601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7745752 - 7745595
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatca 146  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  7745752 ggttccttccacaaaccggaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaaaaataatcacacagattacaattgctcaatactacaa 7745653  T
Q  147 -aagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
     ||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7745652 caagtatgagacttc----ctttgctcaagcacaca-gcaagagacttcctatgctcaagcac 7745595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34256238 - 34256042
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatt 126  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  34256238 gacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 34256139  T
Q  127 acaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctt 225  Q
    |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  34256138 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagacttctt 34256042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22202434 - 22202376
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22202434 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 22202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965769
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttct 19965769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 52351350 - 52351269
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 99  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52351350 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtcccccctgcacttccaa 52351269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Original strand, 31358730 - 31358809
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31358730 aagcaattatcctggttccttccacaatctagaagtagtccaatcccccctgcacttccaaggagattttcactataatc 31358809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Original strand, 11958472 - 11958514
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958472 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 11958514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 7309175 - 7309256
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7309175 aaagacacaagcaattatataggttccttccacaaatcggaagtagtactgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 7309256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22601311 - 22601219
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22601311 aagagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaat-cggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 22601219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Original strand, 22639682 - 22639762
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatc 117  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22639682 aagcaattatcctatttccttccacaacctggaagtagtccagttccccttgcacttcaaaggagatttttcactataatc 22639762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 47194896 - 47194949
Alignment:
Q  171 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47194896 tcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 47194949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 12283800 - 12283860
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12283800 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12283860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12625255 - 12625195
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12625255 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12625195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22428040 - 22427980
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22428040 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22427980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 107
Target Start/End: Original strand, 8698265 - 8698327
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8698265 ttatcctcgttccttccacaatccagaagtagtctagtccccattgcacttccaaggagattt 8698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26702845 - 26702771
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26702845 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26702771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 44824461 - 44824399
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44824461 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 44824399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52351252 - 52351177
Alignment:
Q  148 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52351252 agtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 52351177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16233824 - 16233759
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16233824 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcgcttccaaggagagttcactaaaatca 16233759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23037206 - 23037145
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23037206 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 23037145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 23926591 - 23926648
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23926591 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 23926648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 1577223 - 1577307
Alignment:
Q  31 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1577223 aaagacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 1577307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Original strand, 18614301 - 18614361
Alignment:
Q  58 ttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18614301 ttccacaatccggaagtagtccactcccccttgaacttccaaggagaattcactaaaatca 18614361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21215400 - 21215316
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21215400 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggaattcactat 21215316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25449260 - 25449196
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25449260 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactataa 25449196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 10756803 - 10756862
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10756803 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 10756862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12669883 - 12669814
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 116  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12669883 ttatactggttcctcccacaacacaatagtagtccagt-ccccttgcacttccaagga-atttcactataat 12669814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21192589 - 21192506
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21192589 aaagacacaaagcaattatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21192506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Original strand, 21543549 - 21543623
Alignment:
Q  148 agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21543549 agtatgagacttca---aattgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 21543623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22465507 - 22465452
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22465507 cttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22465452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22600901 - 22600826
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22600901 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22600826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 10250367 - 10250429
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10250367 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10250429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21121766 - 21121704
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21121766 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21121704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 21983974 - 21984036
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21983974 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21984036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28493005 - 28492924
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28493005 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 28492924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2328137 - 2328076
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2328137 ggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2328076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 9346299 - 9346356
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  9346299 tgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttct 9346356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16233683 - 16233626
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  16233683 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttct 16233626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Original strand, 19037499 - 19037560
Alignment:
Q  163 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19037499 aaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19037560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 22642392 - 22642448
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22642392 tgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 26702965 - 26703049
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  26702965 aagataaagacacaagcaattatacaagttccttccacaatctggaagtagttctgtccctcttgcacttccaaagagagttcac 26703049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Original strand, 36133569 - 36133644
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36133569 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagccctggcccccttgcacttccaaggagagttcactat 36133644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 48570951 - 48570868
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48570951 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 48570868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 48703642 - 48703701
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48703642 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgcccccattgcacttccaaggagagttcacta 48703701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 111
Target Start/End: Original strand, 9346157 - 9346215
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||  || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9346157 gttccttccacaatccgtaagtagtcatgtcccctttgcacttccaaggagagttcact 9346215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 17017969 - 17018035
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17017969 ggttccttccataaatcagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatca 17018035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21205574 - 21205512
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21205574 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21205512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21684659 - 21684593
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  21684659 ggttccttccacaattcggaagtagccatgtcccccttgcaattccaagtagaattcactaaaatca 21684593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 21702193 - 21702255
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21702193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctatccctcttgcacttccaaggagagttcactat 21702255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 23024171 - 23024233
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23024171 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 23024233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 27858155 - 27858241
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27858155 ggttccttccacaattcggaagtagtcttg--ccccttacacttccaaggagagttcactaaaatcaaaatttgattacaaatgctcaa 27858241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34256069 - 34256012
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctt 225  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34256069 tgctcaagcacaca-gcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctt 34256012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 38281763 - 38281825
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38281763 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 38281825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 5929236 - 5929293
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5929236 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 5929293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14293326 - 14293265
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagta-gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14293326 ggttccttccacaaaccggaaataagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14293265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 17370569 - 17370626
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17370569 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 17370626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18130650 - 18130613
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18130650 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18130613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19170879 - 19170822
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19170879 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 19170822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639832
Alignment:
Q  170 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 222  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactt 22639832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 22642422 - 22642479
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22642422 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 22642479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Original strand, 24218713 - 24218786
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaag-cagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 98  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  24218713 aagagaaagacacaaggcaattattctggttccttccacgatccggaagtagtccagtcctcctttctcttcca 24218786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26280605 - 26280548
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26280605 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 26280548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 28379522 - 28379579
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28379522 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 28379579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 46088368 - 46088429
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46088368 gttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 46088429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14264106 - 14264070
Alignment:
Q  76 gtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14264106 gtcccgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14264070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 23053731 - 23053819
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  23053731 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatctaggagtagtccactcccccttgcattttcaaggagagttcactaaaatca 23053819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26280746 - 26280687
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26280746 ggttccttccacaatcaggaagtagtccta-cccccttgcacttccaaggagagttcacta 26280687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32786662 - 32786578
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32786662 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactat 32786578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33257052 - 33256992
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  33257052 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcacta 33256992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33277224 - 33277164
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  33277224 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtccctcttgtacttccaaggagagttcacta 33277164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Original strand, 38281974 - 38282006
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38281974 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 38282006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 208
Target Start/End: Original strand, 47194863 - 47194903
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47194863 tgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcac 47194903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 135)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6319238 - 6319026
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319238 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6319139  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319138 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6319039  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6319038 gcaagagacttct 6319026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3220190 - 3220402
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220190 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3220289  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220290 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 3220389  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  3220390 gcaagagacttct 3220402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26110789 - 26111001
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110789 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26110888  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110889 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 26110988  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  26110989 gcaagagacttct 26111001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32088991 - 32088779
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088991 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 32088892  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088891 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 32088792  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  32088791 gcaagagacttct 32088779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36292477 - 36292691
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292477 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36292576  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292577 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36292676  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36292677 aagcaagagacttct 36292691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36303080 - 36303294
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303080 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36303179  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303180 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36303279  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36303280 aagcaagagacttct 36303294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 43247883 - 43248093
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247883 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 43247982  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247983 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 43248082  T
Q  212 gcaagagactt 222  Q
    |||||||||||    
T  43248083 gcaagagactt 43248093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9857199 - 9856987
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857199 gagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9857100  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857099 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9857000  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9856999 gcaagagacttct 9856987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19128306 - 19128518
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128306 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19128405  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128406 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19128505  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19128506 gcaagagacttct 19128518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 31214570 - 31214782
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214570 gagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31214669  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214670 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 31214769  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  31214770 gcaagagacttct 31214782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32078418 - 32078206
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078418 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 32078319  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078318 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 32078219  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  32078218 gcaagagacttct 32078206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 210877 - 210663
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210877 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 210778  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210777 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 210678  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  210677 aagcaagagacttct 210663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 241380 - 241594
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241380 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 241479  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241480 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 241579  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  241580 aagcaagagacttct 241594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 251965 - 252179
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251965 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 252064  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252065 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 252164  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  252165 aagcaagagacttct 252179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 724500 - 724286
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724500 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 724401  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724400 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 724301  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  724300 aagcaagagacttct 724286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 794735 - 794949
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794735 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 794834  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794835 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 794934  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  794935 aagcaagagacttct 794949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 849691 - 849477
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849691 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 849592  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849591 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 849492  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  849491 aagcaagagacttct 849477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 18448928 - 18449140
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448928 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18449027  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18449028 ataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 18449127  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  18449128 gcaagagacttct 18449140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3349350 - 3349137
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349350 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3349251  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349250 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3349152  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  3349151 aagcaagagacttct 3349137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3359947 - 3359734
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359947 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3359848  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359847 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 3359749  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  3359748 aagcaagagacttct 3359734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 29076288 - 29076501
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076288 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29076387  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076388 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29076486  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  29076487 aagcaagagacttct 29076501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 29086539 - 29086752
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086539 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29086638  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086639 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29086737  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  29086738 aagcaagagacttct 29086752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 6150627 - 6150838
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150627 gagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6150726  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150727 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6150825  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6150826 gcaagagacttct 6150838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 6160582 - 6160793
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160582 gagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6160681  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160682 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6160780  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6160781 gcaagagacttct 6160793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19138838 - 19139050
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19138838 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcact 19138937  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19138938 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaa 19139037  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  19139038 gcaagagacttct 19139050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 26120465 - 26120679
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120465 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 26120564  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120565 taatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26120664  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26120665 aagcaagagacttct 26120679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13689292 - 13689078
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13689292 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcact 13689193  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13689192 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13689093  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  13689092 aagcaagagacttct 13689078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13697403 - 13697189
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13697403 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcact 13697304  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13697303 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 13697204  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  13697203 aagcaagagacttct 13697189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36077494 - 36077707
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077494 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36077593  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077594 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36077692  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36077693 aagcaagagacttct 36077707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 36088080 - 36088293
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088080 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 36088179  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088180 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 36088278  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36088279 aagcaagagacttct 36088293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 44480648 - 44480861
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480648 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 44480747  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480748 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 44480846  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  44480847 aagcaagagacttct 44480861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 44491264 - 44491477
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491264 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 44491363  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491364 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 44491462  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  44491463 aagcaagagacttct 44491477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15792022 - 15791809
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15792022 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 15791923  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791922 ataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcacta 15791823  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  15791822 agcaagagacttct 15791809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20161953 - 20161741
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161953 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20161854  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161853 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 20161754  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  20161753 gcaagagtcttct 20161741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9340701 - 9340914
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340701 gagcagagaaaagaaagacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9340800  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340801 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 9340899  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  9340900 aagcaagagacttct 9340914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9367845 - 9368058
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367845 gagcagagaaaagaaagacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9367944  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367945 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 9368043  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  9368044 aagcaagagacttct 9368058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 18157815 - 18158025
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18157815 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcacta 18157914  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18157915 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 18158013  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  18158014 caagagtcttct 18158025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15781432 - 15781220
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15781432 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcacta 15781333  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781332 taatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 15781233  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  15781232 gcaagagacttct 15781220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23470181 - 23469971
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23470181 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 23470083  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23470082 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 23469983  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  23469982 caagagtcttct 23469971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 19224492 - 19224704
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19224492 gagcagagaaaagaagggcaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19224591  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19224592 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19224691  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  19224692 gcaagagtcttct 19224704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 20195543 - 20195739
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20195543 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaact 20195642  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20195643 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 18153297 - 18153506
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153297 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 18153395  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153396 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 18153494  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  18153495 caagagtcttct 18153506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 19417911 - 19418122
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19417911 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcacta 19418009  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418010 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19418109  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  19418110 gcaagagtcttct 19418122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 19428486 - 19428697
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19428486 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcacta 19428584  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428585 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 19428684  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  19428685 gcaagagtcttct 19428697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 16746560 - 16746770
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16746560 agcagagaaaagaaaagcaa-gacaccagcagttattctggttccttccacaaaatggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttacta 16746658  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746659 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 16746758  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  16746759 caagagtcttct 16746770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30315421 - 30315211
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30315421 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 30315323  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30315322 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcactaag 30315223  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  30315222 caagagtcttct 30315211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40213887 - 40213679
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213887 cagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 40213789  T
Q  115 atcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagca 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40213788 atcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagca 40213689  T
Q  215 agagacttct 224  Q
    |||| |||||    
T  40213688 agagtcttct 40213679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18769858 - 18769648
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  18769858 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcaatttcaaggagatttcacca 18769760  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769759 taatcacaaagattaaaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 18769660  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  18769659 caagagtcttct 18769648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 23290458 - 23290596
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23290458 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23290557  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagta 151  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23290558 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagta 23290596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26735698 - 26735573
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26735698 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 26735600  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26735599 taatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22136583 - 22136369
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22136583 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 22136486  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  22136485 taagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 22136389  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22136388 cactaaagcaagagacttct 22136369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22167748 - 22167534
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22167748 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 22167651  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  22167650 taagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 22167554  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  22167553 cactaaagcaagagacttct 22167534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3843081 - 3843291
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc--a 109  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3843081 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccag 3843178  T
Q  110 ctataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  3843179 aaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 3843275  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  3843276 aaagcaagagtcttct 3843291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23270641 - 23270531
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23270641 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 23270542  T
Q  132 tgctcaatact 142  Q
    |||||||||||    
T  23270541 tgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15998936 - 15998808
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15998936 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttattctggttccttctacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 15998838  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15998837 taatcacaaagattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20260335 - 20260143
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-at 113  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20260335 agagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaat 20260238  T
Q  114 aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  20260237 aatcacacagattacaaatgctcagtactcac-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 20260143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21046965 - 21046773
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-at 113  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21046965 agagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaat 21046868  T
Q  114 aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  21046867 aatcacacagattacaaatgctcagtactcac-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 21046773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7019141 - 7018927
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7019141 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccac 7019044  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  7019043 taagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 7018947  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  7018946 cactaaagcaagagtcttct 7018927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 23363687 - 23363901
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23363687 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaatcaattatcctagttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 23363784  T
Q  111 t----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 206  Q
    |    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||    
T  23363785 taaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagc 23363882  T
Q  207 act-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  23363883 actaaagcaagagtcttct 23363901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 19460556 - 19460766
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  19460556 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 19460653  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19460654 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 19460750  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
      ||||||||||||||    
T  19460751 cgagcaagagacttct 19460766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 19558234 - 19558444
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  19558234 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 19558331  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19558332 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 19558428  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
      ||||||||||||||    
T  19558429 cgagcaagagacttct 19558444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22212082 - 22211872
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||       
T  22212082 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccctttgcactttcaaggagatttccactaag 22211985  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  |||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  22211984 aaataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 22211888  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  22211887 aaagcaagagacttct 22211872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23271900 - 23271690
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-- 112  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  23271900 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattaaactagttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 23271803  T
Q  113 ---taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
       |||||||| ||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23271802 aaataatcacacagattacaactactcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 23271706  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  23271705 aaagcaagagacttct 23271690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Original strand, 29378961 - 29379156
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcaca-aagattac 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||    
T  29378961 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattac 29379060  T
Q  129 aaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    || ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29379061 aactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 29379156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 21547625 - 21547702
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21547625 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 21547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17519857 - 17519661
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17519857 agacacaagcaattatactggttccttccaaaaaccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17519758  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| || |||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17519757 caactgatcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttct 17519661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 40002576 - 40002774
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaa-aga 124  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     | | |||||||||  ||    
T  40002576 aaagacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtttaatcacaactga 40002675  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40002676 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 40002773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 8031392 - 8031605
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||| ||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  8031392 agagaaaagaaagaga--ggcacaagcaattatattggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 8031489  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca- 207  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||| |||||  ||||||||||     
T  8031490 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcag 8031587  T
Q  208 ct-aagcaagagacttct 224  Q
    || |||||||||||||||    
T  8031588 ctaaagcaagagacttct 8031605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 12541041 - 12541118
Alignment:
Q  40 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541041 agcaattatcttggttccttccacaatccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 12541118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15969610 - 15969520
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 108  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15969610 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagatttc 15969520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24498857 - 24498761
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt--cactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24498857 ttatcctggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgcatttcgaaggagattttccactataatcacacaagattacaattgctcaa 24498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Original strand, 17687372 - 17687479
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattaca 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17687372 agacacaagcaattatcctggttccttacacaattcgg-agtagtcaagtctcccttgcacttccaaagagatttttcactataatcacataagattaca 17687470  T
Q  130 aatgctcaa 138  Q
    | |||||||    
T  17687471 attgctcaa 17687479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 28902839 - 28903014
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tc 145  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  28902839 ggttccttccacagatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacac 28902938  T
Q  146 aaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
      || |||||||||    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28902939 ctagcatgagactt---taaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttc 28903014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15934463 - 15934381
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15934463 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15934381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45568719 - 45568521
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| | | |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  45568719 aaagacacaggtaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 45568620  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  45568619 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 45568523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Original strand, 24634749 - 24634847
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca---aagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  24634749 ttatccaggtcccttccacaacccagaagtagtccagtctcccttgcccttccaaggagatttttcactataatcacacacaagattacaaattctcaa 24634847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 19942585 - 19942667
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19942585 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19942667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Original strand, 21287756 - 21287950
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 127  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  21287756 acacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaacgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 21287855  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21287856 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagtacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 21287950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 19706874 - 19706947
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19706874 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19706947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24679194 - 24679101
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24679194 aagagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatctggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 22673149 - 22673233
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22673149 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22673233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23433693 - 23433607
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  23433693 tggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-tcccttgcacttccaagg-gatttcactataataacacatgattacaaatgctcaa 23433607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20383139 - 20383060
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20383139 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagacttca 20383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16376114 - 16376048
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16376114 ggtttcttccacaaaccggaagtagtcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 16376048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Original strand, 19153407 - 19153464
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19153407 ttccttccacaa-actgaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19957139 - 19957057
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19957139 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagccctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19957057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 21298332 - 21298530
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  21298332 aaagacacagacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 21298431  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||  |||||| | ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  21298432 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctacagcacaaaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 21298528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 26832425 - 26832507
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26832425 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaacaggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 26832507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 43773491 - 43773553
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43773491 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1210471 - 1210399
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1210471 cggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 1210399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 21287924 - 21287981
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21287924 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 21287981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45568547 - 45568490
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45568547 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 45568490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 22662436 - 22662520
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22662436 aaagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22662520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 18557421 - 18557487
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18557421 tggtttcttccacaatccggaagtagtccactcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18557487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Original strand, 27739279 - 27739374
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttcc-ttccacaacacggaagtagtccagt-cccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27739279 aagcaattatcctggttcctttccacaattcggaagtagttcagtccccccttgcagtttcaaagagattttcactataatcacataagattacaa 27739374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 30422180 - 30422117
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30422180 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 30422117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 43644269 - 43644328
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43644269 gttccttccacaatccggaagtagtcctgccccccttgcaattccaaggagagttcacta 43644328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 13644660 - 13644728
Alignment:
Q  50 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 120  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13644660 ctggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccgcttgcactttcaagg-gatttcactataatcaca 13644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 13745085 - 13745153
Alignment:
Q  50 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 120  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13745085 ctggttcctcccacaacacaggagtagtccagt-ccgcttgcactttcaagg-gatttcactataatcaca 13745153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 17928475 - 17928525
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17928475 cggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17928525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33560994 - 33560932
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33560994 ggttccttgcacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33560932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14990257 - 14990196
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14990257 ttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 14990196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 18772050 - 18772123
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18772050 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccagaagtagtcctgtccccctcgcacttccaaggagagttcacta 18772123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 21298534 - 21298591
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21298534 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttct 21298591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 21540474 - 21540531
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21540474 tgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttct 21540531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23192545 - 23192484
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23192545 cttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcctttccaaggagaattcactaaaatca 23192484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 25163429 - 25163502
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25163429 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25163502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 29692683 - 29692744
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29692683 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29692744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 40846163 - 40846106
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40846163 cttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 40846106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 43639155 - 43639215
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43639155 gttccttccacaact-ggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43639215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 45539215 - 45539155
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45539215 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagatttcacta 45539155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15336867 - 15336807
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15336867 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15336807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15425932 - 15425872
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15425932 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15425872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15517236 - 15517176
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15517236 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15517176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 16206620 - 16206703
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16206620 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcactat 16206703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18121887 - 18121827
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18121887 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678972
Alignment:
Q  173 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc-actaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttct 24678972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Original strand, 17879066 - 17879161
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17879066 ttatcctggttccttccacaatccggaagtaatccagtccccttgtcacttacaagagatttttcataataatcacacaagattacaattgctcaa 17879161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19506146 - 19506063
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||  |||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||    
T  19506146 aagagaaagacacaagcaattatacaggttacttcgacaatccggaagtagtcatgttccacttgcacttccaaggagagttca 19506063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20256291 - 20256232
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20256291 gttccttccacaaaccggaaatagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcacta 20256232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25850767 - 25850708
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25850767 gttccttccacaatccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 25850708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12758538 - 12758456
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  12758538 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactgttaaggagagttcacta 12758456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 17879155 - 17879205
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaaga 217  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17879155 tgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga 17879205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 18679163 - 18679245
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  18679163 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcacta 18679245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 18718352 - 18718434
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  18718352 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacatccaaggacagttcacta 18718434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 39692907 - 39692969
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39692907 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtagagttcactat 39692969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Original strand, 5825261 - 5825328
Alignment:
Q  50 ctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 119  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5825261 ctggttccttccacaacacatgagtagtccagt-cccctttcactttc-aggggatttcactataatcac 5825328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7018954 - 7018897
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7018954 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 7018897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 17796783 - 17796852
Alignment:
Q  42 cagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17796783 cagttatacaggtttcttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 17796852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29772272 - 29772215
Alignment:
Q  83 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaat 139  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29772272 cccccttgcattttcaaggagttttcattataatcactaaagattacaaatgttcaat 29772215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 40002748 - 40002805
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40002748 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 40002805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Original strand, 6407159 - 6407191
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6407159 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6407191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18152477 - 18152393
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18152477 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 18152393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 21298504 - 21298560
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21298504 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 21298560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Original strand, 33052303 - 33052351
Alignment:
Q  69 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  33052303 ggaagtagtccaatctcccttgcactttcaagaagatttcactacaatc 33052351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 174)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9123831 - 9123619
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123831 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9123732  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123731 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9123632  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9123631 gcaagagacttct 9123619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26043709 - 26043921
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043709 gagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26043808  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043809 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 26043908  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  26043909 gcaagagacttct 26043921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9113194 - 9112982
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9113194 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcact 9113095  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113094 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9112995  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9112994 gcaagagacttct 9112982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12865044 - 12865256
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865044 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12865143  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865144 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12865243  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12865244 gcaagagacttct 12865256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32962633 - 32962421
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962633 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 32962534  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962533 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 32962434  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  32962433 gcaagagacttct 32962421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12717537 - 12717323
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717537 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12717438  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717437 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12717338  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  12717337 aagcaagagacttct 12717323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12728186 - 12727972
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728186 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12728087  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728086 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 12727987  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  12727986 aagcaagagacttct 12727972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17983202 - 17982988
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983202 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17983103  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983102 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17983003  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17983002 aagcaagagacttct 17982988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17985411 - 17985197
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985411 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17985312  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985311 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17985212  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17985211 aagcaagagacttct 17985197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3671544 - 3671756
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671544 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3671643  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3671644 ataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacaaa 3671743  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  3671744 gcaagagacttct 3671756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27505439 - 27505651
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27505439 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcact 27505538  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505539 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27505638  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27505639 gcaagagacttct 27505651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 25985577 - 25985791
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985577 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 25985676  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985677 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 25985776  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  25985777 aagcaagagacttct 25985791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31983326 - 31983113
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983326 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31983227  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983226 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 31983128  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  31983127 aagcaagagacttct 31983113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34818493 - 34818279
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818493 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 34818394  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818393 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 34818294  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  34818293 aagcaagagacttct 34818279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32973253 - 32973040
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagatttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32973253 gagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcac 32973154  T
Q  111 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32973153 tataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 32973054  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  32973053 agcaagagacttct 32973040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34807862 - 34807647
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807862 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 34807763  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac---aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807762 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 34807663  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  34807662 taagcaagagacttct 34807647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3660880 - 3661092
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3660880 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3660979  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3660980 ataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacaaa 3661079  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  3661080 gcaagagacttct 3661092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12854518 - 12854730
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854518 gagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttccttccacaacatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12854617  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854618 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12854717  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12854718 gcaagagacttct 12854730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27372329 - 27372541
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27372329 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcact 27372428  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372429 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27372528  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27372529 gcaagagacttct 27372541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27462679 - 27462891
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27462679 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcact 27462778  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27462779 ataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 27462878  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  27462879 gcaagagacttct 27462891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16929947 - 16930160
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16929947 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 16930046  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930047 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 16930145  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  16930146 aagcaagagacttct 16930160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26024955 - 26025168
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024955 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26025054  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025055 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26025153  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26025154 aagcaagagacttct 26025168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26035529 - 26035742
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035529 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26035628  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035629 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26035727  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26035728 aagcaagagacttct 26035742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27341190 - 27341403
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341190 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27341289  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341290 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27341388  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27341389 aagcaagagacttct 27341403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27401930 - 27402143
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27401930 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27402029  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402030 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27402128  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27402129 aagcaagagacttct 27402143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27412589 - 27412802
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412589 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27412688  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412689 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 27412787  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  27412788 aagcaagagacttct 27412802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32301743 - 32301530
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301743 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 32301644  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301643 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 32301545  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  32301544 aagcaagagacttct 32301530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32312432 - 32312219
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312432 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 32312333  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312332 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 32312234  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  32312233 aagcaagagacttct 32312219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4630367 - 4630580
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630367 gagcagagaaaagaaagtcaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4630466  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630467 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4630565  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  4630566 aagcaagagacttct 4630580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16959118 - 16959331
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16959118 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcact 16959217  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959218 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 16959316  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  16959317 aagcaagagacttct 16959331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26864282 - 26864495
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864282 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26864381  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864382 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26864480  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26864481 aagcaagagacttct 26864495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 26874906 - 26875119
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874906 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26875005  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875006 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 26875104  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26875105 aagcaagagacttct 26875119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 29384248 - 29384461
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384248 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 29384347  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384348 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 29384446  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  29384447 aagcaagagacttct 29384461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28252257 - 28252049
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252257 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 28252158  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 215  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28252157 tcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaa 28252058  T
Q  216 gagacttct 224  Q
    |||||||||    
T  28252057 gagacttct 28252049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28357404 - 28357196
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357404 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 28357305  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 215  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28357304 tcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaa 28357205  T
Q  216 gagacttct 224  Q
    |||||||||    
T  28357204 gagacttct 28357196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27383930 - 27384143
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27383930 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 27384029  T
Q  111 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27384030 tataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcacta 27384129  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  27384130 agcaagagacttct 27384143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27474314 - 27474527
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27474314 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 27474413  T
Q  111 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27474414 tataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcacta 27474513  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  27474514 agcaagagacttct 27474527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 27503812 - 27504025
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27503812 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 27503911  T
Q  111 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27503912 tataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcacta 27504011  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  27504012 agcaagagacttct 27504025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 33198824 - 33199037
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33198824 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttgact 33198923  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198924 ataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 33199023  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  33199024 agcaagagacttct 33199037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 12353080 - 12353277
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353080 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12353179  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353180 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20030601 - 20030391
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030601 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 20030503  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030502 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 20030403  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  20030402 caagagtcttct 20030391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 25583409 - 25583600
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25583409 gagcagagaaaagaatgacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 25583508  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25583509 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcatgagtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 12827191 - 12827401
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12827191 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaacta 12827289  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827290 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 12827389  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    ||| || |||||    
T  12827390 caatagtcttct 12827401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20063352 - 20063142
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20063352 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 20063254  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20063253 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaag 20063154  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  20063153 caagagtcttct 20063142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18926460 - 18926251
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926460 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggtttcttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 18926362  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926361 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-ttctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 18926263  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  18926262 caagagtcttct 18926251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10404236 - 10404043
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404236 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 10404138  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404137 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11147888 - 11147708
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147888 gagcagagaaaagaaagacaaagaca--agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11147791  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11147790 ataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 25787201 - 25787410
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787201 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 25787299  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787300 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaa-tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 25787398  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  25787399 caagagtcttct 25787410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7751932 - 7751722
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagattt-cactat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7751932 agagaaaagaaagacaaagaaacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaagagattttcactat 7751833  T
Q  114 aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagc 213  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7751832 aatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagc 7751733  T
Q  214 aagagacttct 224  Q
    |||||||||||    
T  7751732 aagagacttct 7751722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7376456 - 7376245
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7376456 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 7376358  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7376357 taatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7376258  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  7376257 gcaagagtcttct 7376245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 32756918 - 32757107
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756918 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 32757017  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32757018 gctcaatac--tctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 32757107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16124214 - 16124023
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124214 agacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 16124115  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16124114 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcactaagcaagagtcttct 16124023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12417055 - 12416901
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12417055 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 12416956  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac 167  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12416955 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 12416901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18835331 - 18835120
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18835331 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18835234  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||     
T  18835233 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 18835135  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  18835134 aagcaagagtcttct 18835120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17746483 - 17746271
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17746483 gagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17746385  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||     
T  17746384 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 17746286  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  17746285 aagcaagagtcttct 17746271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 31571912 - 31572124
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31571912 gagcagagaaaagaaaagcga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 31572010  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||     
T  31572011 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcacta 31572109  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  31572110 aagcaagagtcttct 31572124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18826936 - 18826725
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826936 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccataaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 18826839  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||     
T  18826838 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcacta 18826740  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  18826739 aagcaagagtcttct 18826725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27167123 - 27166929
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27167123 aaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaataatcacaaagattaca 27167024  T
Q  130 aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27167023 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 27166929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Original strand, 5844605 - 5844781
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatg 133  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5844605 acacaagcaattatcctgcttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatg 5844704  T
Q  134 ctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5844705 ctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5844781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 29765053 - 29765245
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29765053 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 29765152  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29765153 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 29765245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 17047082 - 17047296
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17047082 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 17047179  T
Q  111 ta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    ||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  17047180 taaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcatgcaggcaagagacttccaatgctcaag 17047276  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  17047277 cactaaagcaagagacttct 17047296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 1902231 - 1902340
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902231 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 1902330  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  1902331 ataatcacaa 1902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27819164 - 27819055
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819164 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 27819065  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  27819064 ataatcacaa 27819055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 31930950 - 31931160
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  31930950 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 31931047  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31931048 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcact 31931144  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  31931145 aaagcaagagacttct 31931160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 22308285 - 22308497
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  22308285 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccgtaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattttcaa 22308382  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  22308383 taataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 22308481  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  22308482 aaagcaagagtcttct 22308497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 18554797 - 18555007
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  18554797 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 18554894  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  18554895 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 18554991  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  18554992 aaagcaagagacttct 18555007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25687432 - 25687237
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || |||||    
T  25687432 agacacaagcaattatcctggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagatt 25687334  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25687333 acaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 25687237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12953799 - 12953589
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  12953799 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 12953702  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  12953701 aaataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcact 12953605  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  12953604 aaagcaagaggcttct 12953589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 11205472 - 11205682
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-- 112  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  11205472 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 11205569  T
Q  113 ---taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
       |||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11205570 aaataatcacacatattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 11205666  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  11205667 aaagcaagagacttct 11205682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7586960 - 7586751
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  7586960 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 7586863  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      |||||||||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  7586862 aaataatcacactgattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcact 7586766  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     ||||||||||||||    
T  7586765 aaagcaagagacttc 7586751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 11234995 - 11235204
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  11234995 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 11235092  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11235093 aaataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 11235189  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     ||||||||||||||    
T  11235190 aaagcaagagacttc 11235204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 21127576 - 21127785
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  21127576 agagaaaagaaagaga--gacataagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 21127673  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  21127674 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcact 21127770  T
Q  210 -aagcaagagacttc 223  Q
     ||||||||||||||    
T  21127771 aaagcaagagacttc 21127785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9934308 - 9934131
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  9934308 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaa 9934211  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||    
T  9934210 taatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12575860 - 12575773
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575860 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12575773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 18720210 - 18720297
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18720210 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18720297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 22292390 - 22292538
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22292390 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattttcac 22292487  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttc 160  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22292488 taataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 22292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17742400 - 17742192
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaaggagattt-cact- 111  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||     
T  17742400 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctagttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccacta 17742303  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||| |    
T  17742302 ataatcgcacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaa 17742206  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    |||||||| |||||    
T  17742205 agcaagagtcttct 17742192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 25518201 - 25518395
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact----ataatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||| ||||||    
T  25518201 agacacaaatagttatactggttccttccacaacccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaaaaataatcacacagatta 25518300  T
Q  128 caaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 224  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||||||| || || |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25518301 caactgctcaatacta-cctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttct 25518395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 17063726 - 17063935
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17063726 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcac 17063819  T
Q  111 t------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaa 204  Q
    |      |||||| || ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17063820 taaatcaataatctcacagattacaattgttcaatactatc-atgtatgagacttctcaaa--tgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaa 17063916  T
Q  205 gcact-aagcaagagactt 222  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  17063917 gcactaaagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30120590 - 30120483
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120590 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagtagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 30120492  T
Q  113 taatcacaa 121  Q
    |||||||||    
T  30120491 taatcacaa 30120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 20635079 - 20635276
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  20635079 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 20635178  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||| ||| |||||||||||||    
T  20635179 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagactt 20635275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17609095 - 17608901
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
T  17609095 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 17608996  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| | |||||||| |  |  ||||| |||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17608995 caactactcaataccacacctagtataagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 17608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Original strand, 14757752 - 14757848
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14757752 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaaatgctcaa 14757848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19453327 - 19453116
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||       
T  19453327 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattataccggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaag 19453230  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      | ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||    
T  19453229 aaaaaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcac 19453132  T
Q  209 t-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||||    
T  19453131 taaagcaagagacttc 19453116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 22386149 - 22386359
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta-- 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  22386149 agagaaaagaaaga--aagacacaggcaattatactggtttcttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 22386246  T
Q  113 --taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      |||||||||  |||||||| ||||||||| ||  |  |||||||||||||   ||| |||||||| || || ||| ||| |||||  |||||||||||    
T  22386247 tttaatcacaactgattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcac 22386343  T
Q  209 t-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||||    
T  22386344 taaagcaagagacttc 22386359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Original strand, 15551392 - 15551471
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15551392 aagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaaaatca 15551471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 18576226 - 18576283
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576226 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacg 18576283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 25678926 - 25679001
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 108  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678926 agacacacgcaattatcctggttccttccacaaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 25679001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 11021457 - 11021509
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11021457 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 11021509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 5521798 - 5521748
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5521798 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 5521748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18027479 - 18027387
Alignment:
Q  26 aagacaaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18027479 aagagaaagacacatagcaattatcctgatttcttccacaatctggaagtagtccagtctcccttgcacttctaaggagatttcactataatc 18027387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 21034409 - 21034476
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21034409 tggttccttccacaatacagaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21034476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 3680470 - 3680552
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3680470 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3680552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 21119154 - 21119285
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||       
T  21119154 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacatactggaagtagttcagtcccccttacacttctaaggagatttccactaag 21119251  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 143  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21119252 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta 21119285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15478522 - 15478450
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15478522 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 15478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24719530 - 24719437
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24719530 aagagaaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 25929835 - 25929923
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25929835 aaagacacaaagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 25929923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 13435242 - 13435325
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13435242 aaagacacaaagcaattatgcaggttccttccacaaaccggaagtagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13435325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14070843 - 14070665
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat 144  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  14070843 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatact-t 14070745  T
Q  145 caa--agtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctt 225  Q
    |||  |||| ||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14070744 caacaagtacgagacttcaaaa---tgctcaagcacacaa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctt 14070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 17927171 - 17927237
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17927171 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17927237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289840
Alignment:
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 210  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaa 19289854  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    || |||||||||||    
T  19289853 aggaagagacttct 19289840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20113429 - 20113347
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20113429 aaagacacaaagcaattatacaggttacttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 20113347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14101208 - 14101148
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14101208 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14101148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 24116206 - 24116266
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24116206 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 29917407 - 29917467
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29917407 gttccttccacaaaccggaagtagtctagtccccgttgcacttccaaggagagttcactat 29917467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Original strand, 30372716 - 30372823
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 130  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||    
T  30372716 agacacaagcaataatcttggttccttatacaatccggaagtagtccaatcccacttgcatttccaaggagattttcactataattacacaaaattacaa 30372815  T
Q  131 atgctcaa 138  Q
     |||||||    
T  30372816 ttgctcaa 30372823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 12347471 - 12347537
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  12347471 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggaaagttcactaaaatca 12347537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15395391 - 15395333
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15395391 gttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcact 15395333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 18377821 - 18377883
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18377821 ggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 18377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Original strand, 18434919 - 18434977
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18434919 ttccttccacaaatcggaagtactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18434977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 19482131 - 19482193
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19482131 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19482193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 21234538 - 21234600
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21234538 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21234600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 25591979 - 25592061
Alignment:
Q  31 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25591979 aaagacacatagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25592061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 16528689 - 16528750
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16528689 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16528750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18172990 - 18172925
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18172990 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18172925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 18226811 - 18226876
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18226811 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18226876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 103
Target Start/End: Original strand, 19623336 - 19623409
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 103  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19623336 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggag 19623409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 12422621 - 12422705
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12422621 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 12422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 15301594 - 15301654
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15301594 ggttccttccacaaaccagaagtagacctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15301654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17573120 - 17573069
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 65  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17573120 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaa 17573069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 21624471 - 21624531
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21624471 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21624531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 7811387 - 7811454
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  7811387 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactcctcattgcacttataaggagatttcactaaaatca 7811454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 116
Target Start/End: Original strand, 19470047 - 19470110
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19470047 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttctaaggagagttcactataat 19470110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Original strand, 19625206 - 19625249
Alignment:
Q  69 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19625206 ggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19625249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 10631513 - 10631575
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10631513 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10631575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 15954077 - 15954139
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15954077 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagatcactat 15954139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 17380956 - 17381018
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17380956 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17381018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19952340 - 19952282
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19952340 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttca 19952282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24729288 - 24729222
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  24729288 gttccttccacaatccggaagtagtcttgtcccccttgcactttccaaggagagttcactaaaatca 24729222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 26588977 - 26589039
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26588977 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 26589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 27720866 - 27720937
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccc 85  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  27720866 gagcagagaaaagaaagata--gacagaaacagttatactggttccttccacaatccggaagtagcccagtccc 27720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28252077 - 28252020
Alignment:
Q  166 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252077 actgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttct 28252020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28357224 - 28357167
Alignment:
Q  166 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357224 actgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttct 28357167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12716193 - 12716132
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12716193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12716132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14052012 - 14051955
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14052012 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttct 14051955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14052152 - 14052099
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14052152 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 14052099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14070693 - 14070636
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070693 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttct 14070636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17304037 - 17303976
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17304037 cttccacaaaccggaagtagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactacaatca 17303976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 113
Target Start/End: Original strand, 21617618 - 21617687
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21617618 ttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactat 21617687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24719360 - 24719303
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24719360 tgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 24719303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24729145 - 24729088
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24729145 tgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttct 24729088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 27384131 - 27384172
Alignment:
Q  183 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384131 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27384172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27474556
Alignment:
Q  183 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27474556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 27474544 - 27474585
Alignment:
Q  183 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27474544 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27474585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 27504013 - 27504054
Alignment:
Q  183 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27504013 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttct 27504054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31720345 - 31720245
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattaca 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| || |  |||||  || ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  31720345 agacacaagcaattatcctggttcattccacaacctggaagtagttcagtctccttatcacttagaatgagatttttcactataatcacacaagattaca 31720246  T
Q  130 a 130  Q
    |    
T  31720245 a 31720245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14883699 - 14883651
Alignment:
Q  70 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14883699 gaagtagtctggtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14883651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14923966 - 14923879
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcc-cccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14923966 aaagacacaaacaattatacatgttccttccacaatccggaagtagtc-attcctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14923879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24471137 - 24471041
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-cttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| || |||||||    
T  24471137 ttatcatggttccttctacaatccgaaagtagtccagtcccctcttgcacttctaaggagattttcgctataaccacacaagattataattgctcaa 24471041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 32335199 - 32335287
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  32335199 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaatccggaaatagtcatgtcccctttgcatttccaaggagagttcactaaaatca 32335287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 13601523 - 13601606
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13601523 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13601606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Original strand, 32543644 - 32543707
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  32543644 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcattttcaaggagagttcactata 32543707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 19875234 - 19875284
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19875234 cggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcactaaaatca 19875284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 26185164 - 26185230
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26185164 ggttacttccacaatccggatgtagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcactaaaatca 26185230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33352997 - 33352935
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33352997 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatatcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33352935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Original strand, 34659352 - 34659424
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 119  Q
    |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34659352 ttatactggttcctcccacaacacaagagtagtccagt-ccccttgtacttctaagg-gatttcactataatcac 34659424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 7763031 - 7763092
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  7763031 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcccgtcccccttgcactttcaagaagagttcacta 7763092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 9717222 - 9717283
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9717222 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 9717283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 11235178 - 11235235
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11235178 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 11235235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Original strand, 12041230 - 12041283
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12041230 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 12041283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17608927 - 17608870
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17608927 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 17608870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19066787 - 19066726
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19066787 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 19066726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21689580 - 21689533
Alignment:
Q  72 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21689580 agtagtccagtcccc-ttccacttccaagg-gatttcactataatcacaa 21689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 22386333 - 22386390
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22386333 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 22386390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23006769 - 23006704
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  23006769 gttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatca 23006704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 23781597 - 23781662
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  23781597 gttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttccactttcaaggagagttcactaaaatca 23781662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25687264 - 25687207
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25687264 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 25687207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7586776 - 7586720
Alignment:
Q  169 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7586776 gctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 7586720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Original strand, 16739828 - 16739900
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataat 116  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  16739828 ttatcctagtttcttccacaatccggaagtagtccagtccccttttcacttacaagagatttttcactataat 16739900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Original strand, 19688192 - 19688224
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19688192 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19688224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 224
Target Start/End: Original strand, 21127760 - 21127816
Alignment:
Q  169 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21127760 gctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 21127816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Original strand, 22801549 - 22801581
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22801549 gtcccccttgcatttccaaggagatttcactat 22801581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24481182 - 24481086
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtc-ccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| || |||||||    
T  24481182 ttatcctggttccttctacaatccgaatgtagtccagtccccccttccactcccaaggagattttcacaataaccacacaagattataattgctcaa 24481086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Original strand, 29537991 - 29538039
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29537991 ggttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaag 29538039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 11885 - 12097
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11885 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11984  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11985 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 12084  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  12085 gcaagagacttct 12097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7570 - 7358
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7570 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcact 7471  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7371  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  7370 gcaagagacttct 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 171)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166638
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166426 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 166525  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166526 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 166625  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  166626 gcaagagacttct 166638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 177018 - 177230
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177018 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 177117  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177118 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 177217  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  177218 gcaagagacttct 177230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9084815 - 9085027
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084815 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9084914  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084915 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9085014  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9085015 gcaagagacttct 9085027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9094529 - 9094741
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094529 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9094628  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094629 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9094728  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9094729 gcaagagacttct 9094741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 20989184 - 20989396
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989184 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20989283  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989284 ataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 20989383  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  20989384 gcaagagacttct 20989396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48711260 - 48711048
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711260 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 48711161  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711160 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 48711061  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  48711060 gcaagagacttct 48711048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 5685050 - 5685262
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685050 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 5685149  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685150 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 5685249  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  5685250 gcaagagacttct 5685262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9432795 - 9433007
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432795 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9432894  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432895 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9432994  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9432995 gcaagagacttct 9433007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21003773 - 21003565
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003773 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 21003674  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003673 taacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 21003574  T
Q  216 gagacttct 224  Q
    |||||||||    
T  21003573 gagacttct 21003565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26654094 - 26653882
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654094 gagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26653995  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653994 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 26653895  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  26653894 gcaagagacttct 26653882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26700423 - 26700211
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700423 gagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26700324  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700323 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 26700224  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  26700223 gcaagagacttct 26700211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 37343731 - 37343943
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37343731 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcact 37343830  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343831 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 37343930  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  37343931 gcaagagacttct 37343943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2706383 - 2706169
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706383 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 2706284  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706283 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 2706184  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  2706183 aagcaagagacttct 2706169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26390867 - 26390653
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390867 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26390768  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26390767 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 26390668  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26390667 aagcaagagacttct 26390653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26401509 - 26401295
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401509 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26401410  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26401409 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 26401310  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26401309 aagcaagagacttct 26401295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40042879 - 40042665
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042879 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40042780  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042779 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 40042680  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  40042679 aagcaagagacttct 40042665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40053428 - 40053214
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053428 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 40053329  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053328 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 40053229  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  40053228 aagcaagagacttct 40053214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14746439 - 14746226
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746439 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14746340  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctc-aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746339 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacacta 14746240  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  14746239 agcaagagacttct 14746226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26294799 - 26294586
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294799 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 26294700  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294699 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 26294600  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  26294599 agcaagagacttct 26294586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 468350 - 468138
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  468350 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 468251  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  468250 ataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 468151  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  468150 gcaagagacttct 468138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6867994 - 6867782
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867994 gagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6867895  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867894 ataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6867795  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6867794 gcaagagacttct 6867782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6878626 - 6878414
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878626 gagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 6878527  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878526 ataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 6878427  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  6878426 gcaagagacttct 6878414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 9443391 - 9443603
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443391 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 9443490  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443491 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 9443590  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  9443591 gcaagagacttct 9443603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 20490538 - 20490750
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20490538 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20490637  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20490638 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 20490737  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  20490738 gcaagagtcttct 20490750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 22099269 - 22099481
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099269 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22099368  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099369 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 22099468  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  22099469 gcaagagacttct 22099481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2716987 - 2716773
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716987 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 2716888  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2716887 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatggtcaagcact 2716788  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  2716787 aagcaagagacttct 2716773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17950889 - 17950675
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950889 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17950790  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950789 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17950690  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17950689 aagcaagagacttct 17950675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17961495 - 17961281
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961495 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 17961396  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961395 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 17961296  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  17961295 aagcaagagacttct 17961281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 8627478 - 8627692
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627478 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8627577  T
Q  112 ataatcacaaagattaca-aatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627578 ataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8627677  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  8627678 aagcaagagacttct 8627692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 3165266 - 3165478
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165266 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 3165365  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165366 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 3165465  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  3165466 gcaagagtcttct 3165478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 22088654 - 22088866
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088654 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 22088753  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088754 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 22088853  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  22088854 gcaagagacttct 22088866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 1987070 - 1987283
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987070 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 1987169  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987170 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 1987268  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  1987269 aagcaagagacttct 1987283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 1997691 - 1997904
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997691 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 1997790  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997791 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 1997889  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  1997890 aagcaagagacttct 1997904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 11004715 - 11004928
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004715 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 11004814  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004815 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 11004913  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  11004914 aagcaagagacttct 11004928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24734282 - 24734496
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734282 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24734381  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24734382 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 24734481  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24734482 aagcaagagacttct 24734496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 24744229 - 24744443
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744229 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 24744328  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24744329 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcact 24744428  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  24744429 aagcaagagacttct 24744443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 42865357 - 42865570
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865357 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 42865456  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865457 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42865555  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  42865556 aagcaagagacttct 42865570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 42875983 - 42876196
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875983 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 42876082  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876083 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 42876181  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  42876182 aagcaagagacttct 42876196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24931370 - 24931160
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931370 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 24931271  T
Q  115 atcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagc 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931270 atcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagc 24931171  T
Q  214 aagagacttct 224  Q
    |||||||||||    
T  24931170 aagagacttct 24931160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 8616916 - 8617129
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8616916 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8617015  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac-aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8617016 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta 8617115  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  8617116 agcaagagacttct 8617129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8002835 - 8002622
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002835 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8002736  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002735 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8002637  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  8002636 aagcaagagacttct 8002622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8013480 - 8013267
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013480 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 8013381  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013380 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 8013282  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  8013281 aagcaagagacttct 8013267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 540644 - 540857
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  540644 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcgct 540743  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-ta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  540744 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgca 540843  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||    
T  540844 ggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4211569 - 4211782
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211569 gagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4211668  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211669 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4211767  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  4211768 aagcaagagacttct 4211782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4222138 - 4222351
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222138 gagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcccggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4222237  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac--aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222238 ataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 4222336  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  4222337 aagcaagagacttct 4222351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15889095 - 15888885
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889095 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 15888997  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888996 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 15888897  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  15888896 caagagtcttct 15888885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31117258 - 31117067
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117258 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 31117159  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31117158 gctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttct 31117067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Original strand, 588764 - 588956
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  588764 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 588863  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  588864 tgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgttcaagcactaagcaagagacttct 588956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 1367163 - 1367373
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367163 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 1367261  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367262 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 1367361  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  1367362 caagagtcttct 1367373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 30049053 - 30049263
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049053 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 30049151  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049152 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 30049251  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  30049252 caagagtcttct 30049263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21770709 - 21770499
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770709 agcagagaaaagaaaagcaa-gatacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 21770611  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770610 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 21770511  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  21770510 caagagtcttct 21770499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 9169719 - 9169929
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169719 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaancagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 9169817  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169818 taatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 9169917  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  9169918 caagaggcttct 9169929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 208
Target Start/End: Original strand, 44280055 - 44280251
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44280055 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaact 44280154  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44280155 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 9159264 - 9159474
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159264 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 9159362  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159363 taatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 9159462  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  9159463 caagaggcttct 9159474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40055501 - 40055310
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40055501 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 40055402  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40055401 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttct 40055310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17064297 - 17064086
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064297 gagcagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttcact 17064200  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  17064199 aataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcacta 17064101  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  17064100 aagcaagagtcttct 17064086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38594430 - 38594256
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38594430 agacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 38594331  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  38594330 gctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19986289 - 19986159
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986289 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 19986190  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986189 ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 20967200 - 20967328
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967200 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 20967299  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaata 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967300 ataatcacaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 457761 - 457618
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457761 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 457662  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgag 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  457661 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38403979 - 38403768
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact 111  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38403979 agcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcact 38403882  T
Q  112 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact- 209  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  38403881 aataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcacta 38403783  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  38403782 aagcaagagtcttct 38403768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 18440727 - 18440938
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18440727 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 18440824  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  18440825 taataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 18440922  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  18440923 aaagcaagagtcttct 18440938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12734929 - 12734736
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12734929 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 12734832  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  12734831 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 12734736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 48381718 - 48381930
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48381718 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctagttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 48381815  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||    
T  48381816 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcact 48381914  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  48381915 aaagcaagagtcttct 48381930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 8933099 - 8933306
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8933099 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 8933196  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8933197 taatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 8933293  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  8933294 gcaagagtcttct 8933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3477104 - 3476898
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-at 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3477104 agagaaaagaaaga--aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaat 3477007  T
Q  114 aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aag 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  3477006 aatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgcttaagcactaaag 3476910  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  3476909 caagagtcttct 3476898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24883162 - 24882948
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24883162 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 24883065  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  24883064 taagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaag 24882968  T
Q  206 cact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  24882967 cactaaagcaagagacttct 24882948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25212598 - 25212471
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25212598 agacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaact 25212499  T
Q  133 gctcaatactatcaaagtatgagacttc 160  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  25212498 gctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 18418677 - 18418857
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18418677 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 18418776  T
Q  143 atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
     ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18418777 ctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 18418857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26210313 - 26210106
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-tcact-a 112  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  26210313 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccactaa 26210216  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26210215 taatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 26210119  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  26210118 gcaagagtcttct 26210106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 29589523 - 29589734
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-- 111  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  29589523 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 29589620  T
Q  112 ---ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
       ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  29589621 gaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 29589717  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | ||||||||| |||||    
T  29589718 taaagcaagagtcttct 29589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 11015335 - 11015463
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11015335 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagattttcac 11015434  T
Q  111 tataatcacaaa-gattacaaatgctcaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11015435 tataatcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 15215852 - 15216059
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact--a 112  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  15215852 agagaaaagaaaga--aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttaactaaa 15215949  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  15215950 taatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctaaagcactaaa 15216046  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  15216047 gcaagagtcttct 15216059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 13681853 - 13682062
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13681853 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccag-accccttgcacttcgaaggagatttccac 13681949  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  13681950 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 13682046  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  13682047 aaagcaagagtcttct 13682062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Original strand, 23643198 - 23643286
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23643198 gagcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 23643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8999694 - 8999498
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  8999694 agacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 8999595  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8999594 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttc 8999498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11087803 - 11087608
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     | | |||||||| ||||||    
T  11087803 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtttaatcacacagatta 11087704  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11087703 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11087608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1251675 - 1251598
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1251675 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 1251598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23303934 - 23303859
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23303934 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 23303859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13175362 - 13175169
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||    
T  13175362 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattaca 13175263  T
Q  130 aatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    | |||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || | || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13175262 actgctcagtactacacctagtctgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 13175169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455356
Alignment:
Q  151 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 12220354 - 12220422
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12220354 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12220422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22499412 - 22499347
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22499412 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagt 22499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 6045050 - 6044957
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 107  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045050 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcatggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Original strand, 1775665 - 1775728
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1775665 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 1775728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1879018 - 1878923
Alignment:
Q  37 acaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1879018 acaagcaattatcctggttccttccacaattcggaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatcacataagattacaa 1878923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45930937 - 45930881
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45930937 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacac 45930881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4412771 - 4412573
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt--agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa- 122  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||      
T  4412771 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaact 4412672  T
Q  123 gattacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4412671 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagac 4412575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4433343 - 4433149
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 123  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||  |    
T  4433343 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaactg 4433244  T
Q  124 attacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4433243 attacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaga 4433149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11572949 - 11572876
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11572949 ttatcctggttccttccacattccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 11572876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095795
Alignment:
Q  171 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 11095795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12223196 - 12223090
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
T  12223196 acacaagcaattatcctggtttcatccacaatccagaagtggtccagtcccccttgcacttctaaggagatttttcactataatcacacaagattacaat 12223097  T
Q  132 tgctcaa 138  Q
    |||||||    
T  12223096 tgctcaa 12223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6169883 - 6169834
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6169883 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 6169834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7488687 - 7488620
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7488687 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatca 7488620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 4820839 - 4820921
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4820839 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4820921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16105733 - 16105624
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattac 128  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||    
T  16105733 aaagacacaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgccctccttgcacttctaaggagagttcactaaaatcaatatcagattac 16105634  T
Q  129 aaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||    
T  16105633 aaatgctcaa 16105624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19711807 - 19711733
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19711807 aagcaattatactggttccttccataaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19711733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2501735 - 2501662
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2501735 ttatcctggttccttccataatttggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 2501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13259198 - 13259125
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13259198 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13259125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13266538 - 13266465
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13266538 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13266465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 25806797 - 25806869
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25806797 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtttagtccctcttgcacttccaacgagatttcactataatc 25806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 24072140 - 24072183
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggtt 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24072140 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggtt 24072183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15871832 - 15871754
Alignment:
Q  40 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15871832 agcaattatcctggttccttccacaatctggaagtagtccagtcccctttgtacttccaaggatattttcactataatc 15871754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16308492 - 16308426
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  16308492 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 16308426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 16411383 - 16411449
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16411383 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16411449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 1292443 - 1292527
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1292443 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 1292527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Original strand, 11318757 - 11318837
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 109  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11318757 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttca 11318837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 11792284 - 11792344
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11792284 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11792344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 14187063 - 14187123
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14187063 ggttccttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14187123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13261397 - 13261338
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13261397 gttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13261338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5001631 - 5001549
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5001631 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 5001549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10883976 - 10883894
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10883976 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 10883894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 13302213 - 13302295
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13302213 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 13302295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 13645803 - 13645885
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13645803 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtagtcctgtcccccttgcacttccaagcagagttcacta 13645885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28623142 - 28623080
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28623142 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28623080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 16464371 - 16464461
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16464371 aagagaaagacacaaagcaattatactagttccttccataatctggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggaga--tcactataatc 16464461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 24787735 - 24787796
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24787735 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Original strand, 602139 - 602236
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcaca-aagattacaaatgctcaatact 142  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  602139 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatact 602236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 5034669 - 5034729
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5034669 ggttccttccacaatccggaggtagtcctgtcccccttggacttccaaggagaattcacta 5034729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 8182312 - 8182396
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8182312 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 8182396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 13879522 - 13879606
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13879522 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactat 13879606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16317337 - 16317278
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16317337 ggttccttccacaaacaggaagtagtcc-gtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16317278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19237818 - 19237758
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19237818 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 19237758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29936128 - 29936069
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29936128 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 29936069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21211326 - 21211267
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21211326 gttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttgcaaggagagttcacta 21211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 117
Target Start/End: Original strand, 23125356 - 23125423
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 117  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23125356 tggttccttccacaatccggaagtagtccaatctcacttgcacttccaaggggattttcactataatc 23125423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 41843206 - 41843147
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41843206 gttccttccataaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 41843147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 44466446 - 44466529
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44466446 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 44466529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Original strand, 331003 - 331089
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  331003 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagttcactataa 331089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 2499424 - 2499498
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2499424 aagcatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 2499498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 4493927 - 4494009
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4493927 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtattcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcacta 4494009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 15087925 - 15087987
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15087925 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 15087987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16310712 - 16310630
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16310712 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcaattccatggagagttcacta 16310630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19340031 - 19339969
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19340031 ggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 19339969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30946141 - 30946079
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30946141 ggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30946079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 33604259 - 33604333
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33604259 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttccacttccaaggaga 33604333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35954687 - 35954625
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35954687 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 35954625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 48237623 - 48237561
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48237623 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 48237561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2914394 - 2914329
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2914394 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactataat 2914329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10257841 - 10257765
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcac-aaagattacaa 130  Q
    |||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10257841 cttccacaatccagaagtagtccaaacccccttgcacttccaaggacatttttcactataatcacaaaagattacaa 10257765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13034621 - 13034560
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13034621 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13034560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16308349 - 16308292
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16308349 tgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttct 16308292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16546118 - 16546057
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16546118 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16546057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 16619544 - 16619605
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16619544 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13138701 - 13138617
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13138701 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactat 13138617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Original strand, 14425926 - 14425982
Alignment:
Q  56 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14425926 ccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 14425982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19328792 - 19328732
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19328792 ttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19328732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21284156 - 21284096
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21284156 gttccttccacaaaccgggagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21284096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 21691751 - 21691795
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21691751 cggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 21691795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 33421104 - 33421188
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33421104 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 33421188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39285286 - 39285226
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  39285286 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtctcccttccacttccaaagagagttcacta 39285226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13173132 - 13173065
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||| ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  13173132 tggttcattccacaatctggaagaagtccactcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 13173065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22579978 - 22579903
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22579978 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaaagttcactat 22579903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23280748 - 23280673
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23280748 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttactat 23280673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2266296 - 2266234
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2266296 ggttccttccacaaaccggaagtcagccttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2266234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 9069134 - 9069196
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9069134 ggttctttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 9069196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9710586 - 9710524
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9710586 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 9710524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 113
Target Start/End: Original strand, 15467316 - 15467354
Alignment:
Q  75 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15467316 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 15467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16315343 - 16315262
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16315343 aaagacacaaagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatg-cccccttgcacttccaaggagaattcacta 16315262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16557371 - 16557309
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16557371 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactat 16557309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 16608291 - 16608353
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16608291 ggttccttgcacaaaccggaagtcagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcactat 16608353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8999524 - 8999467
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8999524 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 8999467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 86
Target Start/End: Original strand, 9802571 - 9802624
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc 86  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9802571 agacacaaacaattatcctggttgcttccataatccggaagtagtccagtcccc 9802624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12367533 - 12367460
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12367533 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtagttatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 12367460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15705291 - 15705218
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaagga 102  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15705291 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaagga 15705218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16155515 - 16155483
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16155515 gtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 16155483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18362297 - 18362253
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18362297 cggaagtggtcctgtcccccttgcccttccaaggagagttcacta 18362253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 75
Target Start/End: Original strand, 20597757 - 20597805
Alignment:
Q  27 agacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagta 75  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20597757 agacaaagacacaagcaactatcctggttcctttcacaatccggaagta 20597805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 27871070 - 27871154
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27871070 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 27871154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33692453 - 33692421
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33692453 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33692421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 30658 - 30872
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30658 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 30757  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30758 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 30857  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  30858 aagcaagagacttct 30872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43233 - 43036
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43233 aagacacaagcagttatcttggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 43134  T
Q  132 t-gctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac----tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 224  Q
      ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43133 acgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttct 43036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41181 - 40969
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41181 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 41082  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41081 ataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 40982  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  40981 gcaagagacttct 40969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33628 - 33418
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33628 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcacta 33530  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33529 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 33430  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  33429 caagagtcttct 33418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 7487 - 7701
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7487 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7586  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7587 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 7686  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  7687 aagcaagagacttct 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37688 - 37474
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37688 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 37589  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaac--tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37588 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 37489  T
Q  210 aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||||    
T  37488 aagcaagagacttct 37474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 2218 - 2430
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2218 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttgcacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 2317  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2318 ataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactat 2417  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  2418 gcaagagacttct 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14323
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14111 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 14210  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14211 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 14310  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  14311 gcaagagtcttct 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54851 - 54639
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54851 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 54752  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54751 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 54652  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  54651 gcaagagtcttct 54639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 80775 - 80835
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  80775 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcctcattgtacttccaaggagagttcacta 80835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24506 - 24446
Alignment:
Q  54 ttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24506 ttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 24446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2946 - 2734
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2946 agcagagaaaagaaaggcaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 2847  T
Q  113 taatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2846 taatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 2747  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  2746 gcaagagtcttct 2734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37460 - 37250
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37460 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 37362  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37361 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag 37262  T
Q  213 caagagacttct 224  Q
    |||||| |||||    
T  37261 caagagtcttct 37250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7611 - 7400
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7611 gagcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgact 7513  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7512 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 7413  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||    
T  7412 gcaagagacttct 7400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11329 - 11122
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329 agagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 11231  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230 tcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaa 11131  T
Q  216 gagacttct 224  Q
    ||| |||||    
T  11130 gagtcttct 11122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8489 - 8275
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8489 agagaaaagaaaaacga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 8391  T
Q  116 tcacaaagattacaaatgct-------caatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8390 tcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 8291  T
Q  209 taagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||| |||||    
T  8290 taagcaagagtcttct 8275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 23299 - 23455
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23299 gagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 23398  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaact 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23399 ataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8796 - 8650
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 8697  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagactt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8696 taatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 1
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145 gagcagagaaaataaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 46  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12845 - 12633
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12845 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 12748  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12747 taagaatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaaggact 12649  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  12648 aaagcaagagtcttct 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 1
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  156 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa 57  T
Q  132 tgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaaga 188  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  56 tgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28181 - 28098
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28181 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 155807 - 155682
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155807 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 155708  T
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctca 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  155707 ataatcacaaagattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 40030 - 40241
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40030 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 40127  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||    
T  40128 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcact 40225  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  40226 aaagcaagagtcttct 40241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 5)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 57511 - 57299
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57511 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 57414  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  57413 taataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaaaa-tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 57315  T
Q  210 aa-gcaagagacttct 224  Q
    || ||||||| |||||    
T  57314 aatgcaagagtcttct 57299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1142 - 944
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  1142 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 1043  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| | ||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  1042 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 31943 - 32026
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31943 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 32026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 48698 - 48772
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48698 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 48772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 927
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  970 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaa 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 4255 - 4364
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4255 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 4354  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  4355 ataatcacaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 1743 - 1856
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1743 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 1842  T
Q  116 tcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||||||||    
T  1843 tcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 21
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaa 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  199 agacacaagcaattatcctggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaa 100  T
Q  131 atgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  99 atgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaa 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2228
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 127  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  |||||    
T  2424 agacacaaacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacactgatta 2325  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2324 caactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttct 2228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 4825 - 5035
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4825 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 4922  T
Q  111 -tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  4923 aaataatcacacagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 5019  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  5020 aaagcaagagtcttct 5035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 61245 - 61136
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61245 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 61146  T
Q  112 ataatcacaa 121  Q
    ||||||||||    
T  61145 ataatcacaa 61136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 6)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 100148 - 100272
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100148 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 100246  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  100247 taatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 476001 - 475808
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||    
T  476001 acacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattaca 475902  T
Q  130 aatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  475901 actgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 475808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 482521 - 482328
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattaca 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||    
T  482521 acacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattaca 482422  T
Q  130 aatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  482421 actgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 482328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 111786 - 111874
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  111786 ggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtctcccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 111874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 475834 - 475777
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  475834 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 475777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 482354 - 482297
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  482354 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 482297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 15259 - 15467
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-a 112  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15259 cagagaaaagaaaga--aagacacaagcaattattctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaa 15356  T
Q  113 taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aa 211  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15357 taatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaa 15454  T
Q  212 gcaagagacttct 224  Q
    ||||||| |||||    
T  15455 gcaagagtcttct 15467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10488 - 10278
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  10488 agagaaaagaaagaga--gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatg 10391  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  10390 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcact 10294  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  10293 aaagcaagagacttct 10278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1738 - 1528
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  1738 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 1641  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1640 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcact 1544  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  1543 aaagcaagagacttct 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 35064 - 35277
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-ac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35064 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttctac 35161  T
Q  111 t----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 206  Q
    |    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||    
T  35162 taaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagc 35258  T
Q  207 act-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  35259 actaaagcaagagtcttct 35277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 16130 - 16344
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16130 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaactagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 16227  T
Q  111 t----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 206  Q
    |    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||    
T  16228 taaagataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagc 16325  T
Q  207 act-aagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  16326 actaaagcaagagtcttct 16344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 127190 - 127386
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||| || |||||    
T  127190 agacacgagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagatt 127288  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  127289 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 127386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 276 - 486
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  276 agagaaaagaaa--cagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 373  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||    
T  374 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcact 470  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  471 aaagcaagagacttct 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 174909 - 175074
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac 110  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  174909 gagcagaggaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcac 175006  T
Q  111 t-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcac 178  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  175007 taaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 59608 - 59414
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 126  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||    
T  59608 agacacaaacaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 59509  T
Q  127 acaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  59508 acaaatgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 59414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41064 - 40868
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  41064 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 40965  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40964 acaactgctcaatattacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttc 40868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 59440 - 59383
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  59440 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 59383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 1554 - 1733
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1554 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 1653  T
Q  143 atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
      |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1654 cac-tagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 1733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5331
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5531 gagcagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccac 5434  T
Q  111 t-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 205  Q
    |     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  | ||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  5433 taagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctc-tagtatgagacttcccaaa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 5337  T
Q  206 cactaa 211  Q
    ||||||    
T  5336 cactaa 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10984 - 10804
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 142  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10984 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 10885  T
Q  143 atcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
     ||  ||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10884 ctcttagtatgagacttctcaga--tgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttct 10804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29495 - 29285
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||       
T  29495 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaatgagatttccactatg 29398  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||    
T  29397 aaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcact 29301  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  29300 aaagcaagagacttct 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 412047 - 411983
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412047 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtag 411983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 1418 - 1524
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 1516  T
Q  113 taatcaca 120  Q
    ||||||||    
T  1517 taatcaca 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 52457 - 52370
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52457 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 52370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 60598 - 60810
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  60598 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 60695  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  60696 aaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 60793  T
Q  209 t-aagcaagagacttct 224  Q
    | |||||||||||||||    
T  60794 taaagcaagagacttct 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 211736 - 211796
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  211736 gttccttccacaaaccggaagtcattcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 29003 - 29212
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  29003 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 29100  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||    
T  29101 aaataatcacacagattacaactgctcaatac-atc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcact 29196  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     ||||||||| |||||    
T  29197 aaagcaagagtcttct 29212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 25817 - 25899
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25817 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 25899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 57894 - 58104
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  57894 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccataaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 57991  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||   | || |||| |||||||||||||||||||    
T  57992 aaataatcacacagattataactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcatgtaggcgagagacttccaatgctcaagcact 58088  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  58089 aaagcaagagacttct 58104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 18742 - 18941
Alignment:
Q  20 aaaagaaagacaaagacacaagc-agttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcc-agtcccc-cttgcacttccaaggagatttcactataat 116  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18742 aaaagaaaagcaaagacacaagcgagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataat 18841  T
Q  117 c-acaaagatta--caaatgctc-aatactatcaaagtatgagacttcacaaaa---ctgctcaagcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagca 207  Q
    | ||||||||||   |||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18842 caacaaagattaacaaaatgctctaatactctctaagtatgagatttctcaaaaattatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccaaatgctcaagca 18941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17673 - 17475
Alignment:
Q  42 cagttatcctggttccttccac-aacacggaagtagtccagt-cccccttgcac-ttccaaggag-atttcactat--aatcac-aaagatta--caaat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||   ||||    
T  17673 cagttatcctggttccttccacaaatacggaagtagtccagtccccccttgcactttccaaggagtatttcactattaaatcacaaaagattaacaaaat 17574  T
Q  133 gct-caatactatcaaagtatgagactt---cacaaaactgctcaag-cacacacgc-aagagtcttccaatgct-caagcactaagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||||||   || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17573 gctacaatactctctaagcatgagacttctacaaaaaatagctcaagtcacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38695 - 38487
Alignment:
Q  15 cagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-- 111  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||      
T  38695 cagagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccgtaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagatttccactaa 38598  T
Q  112 ---ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
       ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||    
T  38597 gaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtataagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagactt-caatgctcaagcac 38502  T
Q  209 t-aagcaagagactt 222  Q
    | |||||||||||||    
T  38501 taaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4535 - 4437
Alignment:
Q  32 aagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 130  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4535 aagacacaaacagttatcatggttccttccacaaatcggaaatagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 763 - 973
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  763 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaag 860  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| | | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| |||    
T  861 aaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagaatgcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggact 957  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  958 aaagcaagagacttct 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 1478 - 1588
Alignment:
Q  112 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| | | ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||| |    
T  1478 ataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagaatgcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgatcaagaactaa 1574  T
Q  211 agcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||    
T  1575 agcaagagacttct 1588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 958
Alignment:
Q  69 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  1117 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttccc 1019  T
Q  163 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1018 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 32335 - 32546
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||       
T  32335 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaag 32432  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
      ||||||||| |  |||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32433 aaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcac 32530  T
Q  209 t-aagcaagagacttc 223  Q
    | ||||||||||||||    
T  32531 taaagcaagagacttc 32546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 32520 - 32577
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32520 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 32577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 204 - 414
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||       
T  204 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttccttccacaaaccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaag 301  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  302 aaataatcacacatattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaact 398  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  399 aaagcaagagacttct 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 4584 - 4794
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact--- 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||       
T  4584 agagaaaagaaagaga--gacacaagcaattatcttggttccttccacaaaccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaag 4681  T
Q  112 --ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 209  Q
      ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  4682 aaataatcacacatattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaact 4778  T
Q  210 -aagcaagagacttct 224  Q
     |||||||||||||||    
T  4779 aaagcaagagacttct 4794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 61090 - 61287
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  61090 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagatt 61189  T
Q  127 acaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac--taagcaagagacttc 223  Q
    | || ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||   ||||||||||||||    
T  61190 ataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttc 61287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 5747 - 5927
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta-- 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  5747 agagaaaagaaaga--aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaag 5844  T
Q  113 --taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 194  Q
      |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5845 tttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11285
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-----tcactataatcacaaagatta 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||| | |||||||| ||||||    
T  11091 agacacaagcaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagtttaatcacacagatta 11190  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| |||||||||| |  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  11191 caactgctcaataccacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttc 11285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10201
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 10201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 4474 - 4672
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||  ||    
T  4474 aaagacagaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactga 4573  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  4574 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagactt--caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagactt 4671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 17865 - 17929
Alignment:
Q  16 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865 agagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21127 - 20930
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag-atttcacta----taatcacaa-aga 124  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||  ||    
T  21127 aaagacacatacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagtttaatcacaactga 21028  T
Q  125 ttacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    |||||| | ||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21027 ttacaactactcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 20931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20956 - 20899
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20956 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 20899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Original strand, 34977 - 35170
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 127  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
T  34977 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtagtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 35076  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 222  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  35077 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactt 35170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 35175 - 35232
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35175 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 21348 - 21430
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 96  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21348 agcagagaaaagaaaagcaa-gacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1686 - 1492
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 127  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  1686 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1587  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1586 caactgctcaatactacacctagtacgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1879 - 1685
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 127  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  1879 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1780  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1779 caactgctcaatactacacctagtacgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 1685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1711 - 1654
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1711 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1882
Alignment:
Q  33 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 126  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  1998 agacacaagcaattatactgttttcttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagatt 1899  T
Q  127 acaaatgctcaatacta 143  Q
    |||| ||||||||||||    
T  1898 acaactgctcaatacta 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 221
Target Start/End: Original strand, 19923 - 20115
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 127  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  19923 gacacatgcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 20022  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagact 221  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  20023 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagact 20115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10307
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 20151 - 20208
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20151 tgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 20208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 17858 - 17913
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 17913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 20
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 112  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  102 aaagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7040
Alignment:
Q  34 gacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 127  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  7234 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 7135  T
Q  128 caaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7134 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 7040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7036 - 6979
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7036 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 6979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 7010
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttc 223  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7066 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 7198 - 7274
Alignment:
Q  13 agcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttg 90  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7198 agcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Original strand, 13934 - 14068
Alignment:
Q  79 cagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||  ||||  |||    
T  13934 cagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttatcaaa--tgc 14030  T
Q  171 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14031 tcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 10284 - 10355
Alignment:
Q  12 gagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccc 85  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  10284 gagcagagaaaagaaagata--gacagaaacagttatactggttccttccacaatccggaagtagcccagtccc 10355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2534 - 2339
Alignment:
Q  35 acacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  2534 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 2435  T
Q  128 caaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 224  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2434 caactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttct 2339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 187
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16484
Alignment:
Q  45 ttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaa 138  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||    
T  16338 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaa 16437  T
Q  139 tacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaag 187  Q
    |||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||    
T  16438 tactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaag 16484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 165386 - 165204
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-g 123  Q
    ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |    
T  165386 aaagacacaggcaattatacaagttccttccacaaaccggaagtcactcctgtctcccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaatg 165287  T
Q  124 attacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  165286 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 165204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 165214 - 165157
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  165214 tgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 165157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 116
Target Start/End: Original strand, 251037 - 251114
Alignment:
Q  40 agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataat 116  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  251037 agcaattattctggttccttccacaatctggaagtagtcaaatctcccttgcactttcaaggagattttcactataat 251114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 58944 - 59010
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  58944 ggtttcttccacaattcggaagtagtcatgtccctcttgcatttccaaggagagttcactaaaatca 59010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 66136 - 66074
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  66136 ggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttccacttccaaggagagttcactat 66074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 145203 - 145119
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  145203 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagtatagttcactat 145119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9745 - 9630
Alignment:
Q  26 aagacaaagacac-aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--a 122  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||       
T  9745 aagagaaagacacgaagcaattatacaggttccttccacaatccgaaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatct 9646  T
Q  123 gattacaaatgctcaa 138  Q
    ||||||||||||||||    
T  9645 gattacaaatgctcaa 9630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 87788 - 87855
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  87788 tggttccttccacaatccggaagtagttcactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 87855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 219597 - 219679
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  219597 aaagacacaaagcaattatacaggtttcttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 219679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 245034 - 244952
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  245034 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcgtgtcccccttgcactttcaaggagggttcacta 244952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 378277 - 378218
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  378277 gttccttccacaaactggaagtagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcacta 378218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 119
Target Start/End: Original strand, 382181 - 382245
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  382181 gttccttccacaacacaggagtagtccact-ccccttgcagttctaa-gagatttcactataatcac 382245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2443
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 121  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2525 aagcaattatacaggttccttccacaattcggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaattacaa 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 9263 - 9345
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9263 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 231 - 33
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  231 aaagagacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 132  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  ||| ||| |||||   ||| ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  131 attacaactgctcaatactacacctagtttgacacttc---aaattgctcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 2
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  59 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 76625 - 76691
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  76625 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 76691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 95 - 161
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  95 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 90763 - 90725
Alignment:
Q  75 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  90763 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 90725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16469 - 16385
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16469 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16860 - 16800
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16860 ggttccttccacaaaccggaagtagtcacgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20201 - 20141
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20201 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 20141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2111 - 2056
Alignment:
Q  57 cttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2111 cttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 37499 - 37412
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  37499 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatc 37412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 117
Target Start/End: Original strand, 41545 - 41593
Alignment:
Q  69 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  41545 ggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatc 41593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Original strand, 9325 - 9507
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||    |||||||||  |    
T  9325 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtataactaagcttaatcacaactg 9424  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||    
T  9425 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagactccctttgctcaagcac 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9556
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact---aagcaagagacttct 224  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9497 tgctcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttct 9556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 14475 - 14557
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14475 aaagacacaaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Original strand, 268162 - 268228
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  268162 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctattccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 268228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Original strand, 83759 - 83834
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83759 aagcaattatacaggtaccttccataaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 83834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6815
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6880 aagcaattatacaggttcctttcacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 6815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2790 - 2731
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2790 gttccttccacaatccggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcacta 2731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8279
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 207  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8318 tgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 73961 - 74022
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  73961 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 74022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4016 - 3925
Alignment:
Q  26 aagacaaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4016 aagataaagacacagagcaattatcttggttccttgcacaatccggaagtagttcagtccct-ttgcacttccaatgagatttcactgtaatc 3925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3421 - 3337
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3421 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 3337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32517 - 32457
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32517 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 32457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 59459 - 59519
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  59459 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtaccccttgcacttccaaggagagttcacta 59519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 7283 - 7364
Alignment:
Q  31 aaagacaca-agcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7283 aaagacacatagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 144285 - 144345
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  144285 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 144345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4106 - 4027
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4106 aagcaattatacaggttccttacacaatccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 4027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Original strand, 2040 - 2092
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 104  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  2040 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccatttgcacttccaaggaga 2092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6434 - 6359
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6434 aagcaattatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 1191 - 1310
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    |||||||||  || |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  1191 aaagacacagacaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 1290  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta 143  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  1291 attacaactgctcaatacta 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2423
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2361 ggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 19473 - 19523
Alignment:
Q  68 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19473 cggaagtagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 24010 - 24072
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24010 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 24072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4481 - 4424
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4481 tgctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 4424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4554 - 4471
Alignment:
Q  123 gattacaaatgctcaatactat-caaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  4554 gattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcac 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 118
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3754
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3689 gttccttccacaatccggaagtagtcttctcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatca 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 9343 - 9404
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9343 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7412
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7473 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 112
Target Start/End: Original strand, 22396 - 22457
Alignment:
Q  51 tggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22396 tggttccttccacaatccgagagtagtccactcccccttgcactttcaaggagagttcacta 22457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38667 - 38610
Alignment:
Q  168 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38667 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 38610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38839 - 38642
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca-gtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 123  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  38839 aaagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcggtcatgtcccccttgcacatccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 38740  T
Q  124 attacaaatgctcaatacta-tcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  ||||||| |||||   ||| | |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  38739 attacaactgctcaatactacacctagtatgacacttc---aaatttctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagact 38643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 2610 - 2671
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacac-ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2610 ggttccttccacaaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 2671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6000 - 5939
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6000 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcacta 5939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 701 - 761
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  701 ggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 710 - 650
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  710 ggttctttccacaaaccgaaagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1327
Alignment:
Q  56 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1383 ccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagttcacta 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2688
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2747 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 2688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Original strand, 17387 - 17495
Alignment:
Q  33 agacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag-gagatttcactataatcaca-aagattaca 129  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||| |  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  17387 agacacaagcaatttatcctggttctttccacaatccggaagcagtctagtccccttgtcacttacaagagatttttcactataatcacacaagattaca 17486  T
Q  130 aatgctcaa 138  Q
    | |||||||    
T  17487 attgctcaa 17495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 611
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  671 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Original strand, 18558 - 18646
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  18558 aaagacacaaagcaattatagtggttccttccacaatccggaagtggtccactcctccttgcactttcaaagagagttcactaaaatca 18646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17092 - 17000
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 117  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||   | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17092 aagagaaagacacaaagcaattatactgatttcttccacaatctgaaagtagtccaatctcctttgcacttccaaggagatttcattataatc 17000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35499 - 35415
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35499 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 11554 - 11637
Alignment:
Q  31 aaagacacaagcagtt-atcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11554 aaagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcacta 11637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 321
Alignment:
Q  39 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  396 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcactat 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1538
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 118  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1604 ggttccttcaacaatctggaagtagtcttgtcacccatgcacttccaaggagagttcactataatca 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19354 - 19292
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19354 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcatccttgcacttccaaggagagttcactat 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 18411 - 18473
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18411 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactat 18473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10861 - 10791
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 100  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10861 aaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaag 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15455
Alignment:
Q  31 aaagacacaa-gcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 100  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15525 aaagacacaatgcaattatacaggttccttccacaaaccaaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaag 15455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2519 - 2433
Alignment:
Q  26 aagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||| ||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  2519 aagagaaatacacaagaaattatacaggttccttccacaatccggaagtagacctatcctccttgcacttccaatgagagttcacta 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 59851 - 59792
Alignment:
Q  150 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 211  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  59851 tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 59792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 46044 - 46105
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46044 ggttccttctacaaaccggaagtcagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 46105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5655
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5595 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaacgagagttcacta 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18467 - 18435
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18467 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 18435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2643
Alignment:
Q  81 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2675 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 111382 - 111322
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  111382 ggttccttccacaaaccggtagtcatcttgtccctcttgcacttccaaggagatttcacta 111322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 102950 - 103010
Alignment:
Q  53 gttccttccacaacacggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  102950 gttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 103010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 36809 - 36869
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  36809 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctatcccctttgcacttacaaggagagttcacta 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 134869 - 134929
Alignment:
Q  52 ggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 112  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  134869 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctatcccctttgcacttacaaggagagttcacta 134929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University