View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9795A_low_315 (Length: 240)

Name: NF9795A_low_315
Description: NF9795A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9795A_low_315
NF9795A_low_315
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (13-221)||(123369-123577)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (13-221)||(9582893-9583101)
chr7 (13-221)||(16119856-16120064)
chr7 (13-221)||(23515067-23515275)
chr7 (13-221)||(14551098-14551307)
chr7 (13-221)||(8717865-8718073)
chr7 (13-221)||(13673856-13674064)
chr7 (13-221)||(18593359-18593567)
chr7 (13-221)||(18618117-18618325)
chr7 (20-221)||(4312564-4312765)
chr7 (20-221)||(538762-538964)
chr7 (20-221)||(12567020-12567222)
chr7 (20-221)||(9003958-9004160)
chr7 (21-221)||(12548812-12549012)
chr7 (20-221)||(8780943-8781146)
chr7 (20-221)||(20108375-20108577)
chr7 (21-221)||(48801783-48801983)
chr7 (23-221)||(9264946-9265145)
chr7 (20-221)||(13657873-13658074)
chr7 (20-221)||(11921314-11921512)
chr7 (20-221)||(16532100-16532304)
chr7 (20-221)||(16633358-16633562)
chr7 (165-221)||(16465623-16465679)
chr7 (172-221)||(825783-825832)
chr7 (172-221)||(4461249-4461298)
chr7 (172-221)||(14221725-14221774)
chr7 (172-221)||(15916783-15916832)
chr7 (172-221)||(18287761-18287810)
chr7 (172-221)||(27291496-27291545)
chr7 (165-221)||(15206591-15206647)
chr7 (170-221)||(5397273-5397324)
chr7 (179-221)||(15065935-15065977)
chr7 (172-221)||(6713075-6713124)
chr7 (175-221)||(9194551-9194597)
chr7 (172-212)||(15522517-15522557)
chr7 (172-218)||(15348532-15348578)
chr7 (172-221)||(4791389-4791438)
chr7 (64-98)||(16465743-16465777)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (13-221)||(15699555-15699763)
chr6 (13-221)||(22165556-22165764)
chr6 (13-221)||(22243812-22244020)
chr6 (13-221)||(22061510-22061718)
chr6 (20-221)||(24855252-24855453)
chr6 (13-221)||(22767123-22767331)
chr6 (13-221)||(20170242-20170451)
chr6 (20-221)||(18448140-18448342)
chr6 (20-221)||(20107787-20107989)
chr6 (20-221)||(23023093-23023295)
chr6 (20-221)||(25625691-25625892)
chr6 (23-221)||(2181063-2181262)
chr6 (28-221)||(18854026-18854219)
chr6 (20-221)||(21560561-21560762)
chr6 (20-221)||(25631276-25631477)
chr6 (21-221)||(29595697-29595897)
chr6 (20-221)||(25963248-25963450)
chr6 (20-221)||(25967895-25968097)
chr6 (25-221)||(30671814-30672011)
chr6 (20-148)||(19585622-19585750)
chr6 (14-117)||(20016339-20016443)
chr6 (165-221)||(18184881-18184937)
chr6 (171-219)||(35270971-35271019)
chr6 (165-221)||(18731868-18731924)
chr6 (165-221)||(20218988-20219044)
chr6 (165-221)||(22113013-22113069)
chr6 (172-221)||(11204004-11204053)
chr6 (172-221)||(23517838-23517887)
chr6 (172-217)||(29686601-29686646)
chr6 (20-60)||(29686449-29686489)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (13-221)||(11496621-11496829)
chr4 (13-221)||(13822913-13823121)
chr4 (19-221)||(42709738-42709940)
chr4 (14-221)||(15254349-15254556)
chr4 (21-221)||(10630758-10630958)
chr4 (20-221)||(3354646-3354848)
chr4 (21-221)||(18291945-18292146)
chr4 (20-221)||(18081466-18081669)
chr4 (21-221)||(17484917-17485118)
chr4 (20-221)||(45234239-45234441)
chr4 (21-221)||(38426745-38426931)
chr4 (21-221)||(56580546-56580748)
chr4 (23-98)||(8092559-8092634)
chr4 (165-221)||(14654005-14654061)
chr4 (172-221)||(15865647-15865696)
chr4 (172-221)||(10650547-10650596)
chr4 (172-221)||(15260116-15260165)
chr4 (172-221)||(16682913-16682962)
chr4 (177-221)||(15409534-15409578)
chr4 (168-217)||(8092438-8092487)
chr4 (172-221)||(9488885-9488934)
chr4 (179-221)||(17296256-17296298)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (13-221)||(10602479-10602687)
chr3 (13-221)||(13504888-13505096)
chr3 (13-221)||(11947407-11947615)
chr3 (13-221)||(16448767-16448975)
chr3 (13-221)||(7600355-7600563)
chr3 (13-221)||(15556949-15557157)
chr3 (13-221)||(9360978-9361186)
chr3 (13-221)||(16373572-16373780)
chr3 (13-221)||(12187083-12187291)
chr3 (13-221)||(37942378-37942586)
chr3 (13-221)||(6814868-6815076)
chr3 (21-221)||(12193497-12193697)
chr3 (13-221)||(10147011-10147219)
chr3 (13-221)||(15645001-15645209)
chr3 (13-221)||(10160180-10160388)
chr3 (13-221)||(13187424-13187632)
chr3 (21-221)||(3245595-3245795)
chr3 (21-218)||(2721305-2721502)
chr3 (20-221)||(4382751-4382954)
chr3 (21-221)||(13001432-13001634)
chr3 (20-213)||(1992803-1992996)
chr3 (20-221)||(13097711-13097912)
chr3 (20-221)||(10546943-10547148)
chr3 (20-221)||(20156522-20156722)
chr3 (20-221)||(13690608-13690809)
chr3 (20-221)||(11398215-11398417)
chr3 (20-221)||(14348595-14348797)
chr3 (23-221)||(22637702-22637901)
chr3 (21-221)||(3279191-3279392)
chr3 (23-221)||(17387839-17388038)
chr3 (20-221)||(12160214-12160416)
chr3 (13-111)||(16655798-16655897)
chr3 (13-220)||(17045697-17045902)
chr3 (13-220)||(17047857-17048062)
chr3 (172-221)||(27356735-27356784)
chr3 (171-221)||(13601220-13601270)
chr3 (172-221)||(3339233-3339282)
chr3 (172-221)||(12776541-12776590)
chr3 (172-221)||(13136217-13136266)
chr3 (172-221)||(20584262-20584311)
chr3 (177-221)||(15946773-15946817)
chr3 (170-221)||(14445775-14445826)
chr3 (172-218)||(15619293-15619339)
chr3 (172-221)||(13195465-13195514)
chr3 (173-221)||(8686394-8686442)
chr3 (165-221)||(20225761-20225817)
chr3 (177-221)||(13068306-13068350)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (13-221)||(22665062-22665270)
chr2 (13-221)||(117543-117751)
chr2 (13-221)||(22044667-22044875)
chr2 (13-221)||(25357511-25357719)
chr2 (13-221)||(16775651-16775859)
chr2 (20-221)||(11622-11823)
chr2 (13-221)||(17590407-17590615)
chr2 (13-221)||(24795292-24795500)
chr2 (13-221)||(27627580-27627789)
chr2 (20-221)||(25144764-25144966)
chr2 (21-221)||(5500272-5500473)
chr2 (20-221)||(25804274-25804475)
chr2 (22-221)||(25370892-25371091)
chr2 (21-221)||(23798929-23799129)
chr2 (20-148)||(24502168-24502297)
chr2 (20-221)||(23643950-23644153)
chr2 (74-221)||(24178200-24178348)
chr2 (172-221)||(23159392-23159441)
chr2 (172-221)||(23570649-23570698)
chr2 (172-221)||(27631655-27631704)
chr2 (172-221)||(27768823-27768872)
chr2 (177-221)||(24171510-24171554)
chr2 (172-218)||(23257579-23257625)
chr2 (172-221)||(24321328-24321377)
chr2 (165-221)||(24506802-24506858)
chr2 (165-220)||(25337659-25337714)
chr2 (167-209)||(23648123-23648165)
chr2 (182-212)||(29955868-29955898)
chr2 (179-220)||(21512574-21512615)
chr2 (172-220)||(24019075-24019123)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (13-221)||(27046874-27047082)
chr1 (13-221)||(17094608-17094816)
chr1 (13-221)||(21798669-21798878)
chr1 (13-221)||(20237456-20237664)
chr1 (23-221)||(8653126-8653324)
chr1 (20-221)||(52938628-52938830)
chr1 (20-221)||(3989944-3990147)
chr1 (27-221)||(19364043-19364237)
chr1 (140-221)||(14070632-14070713)
chr1 (170-221)||(19875651-19875702)
chr1 (165-221)||(21784479-21784535)
chr1 (172-221)||(16382582-16382631)
chr1 (165-221)||(4027832-4027888)
chr1 (165-221)||(8947522-8947578)
chr1 (21-101)||(21784598-21784677)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (13-221)||(20595838-20596046)
chr5 (13-221)||(20602124-20602332)
chr5 (13-221)||(20608415-20608623)
chr5 (13-221)||(15735534-15735742)
chr5 (13-203)||(23710701-23710892)
chr5 (13-221)||(23748051-23748259)
chr5 (20-221)||(24940540-24940742)
chr5 (21-210)||(20622170-20622359)
chr5 (13-221)||(18072900-18073108)
chr5 (13-221)||(24953181-24953389)
chr5 (13-221)||(20790721-20790929)
chr5 (20-220)||(23600644-23600845)
chr5 (20-221)||(24219752-24219954)
chr5 (20-221)||(20444846-20445048)
chr5 (34-221)||(21387410-21387598)
chr5 (24-221)||(20916463-20916660)
chr5 (20-98)||(22948518-22948596)
chr5 (21-144)||(20575510-20575633)
chr5 (172-221)||(22317520-22317569)
chr5 (172-221)||(25006815-25006864)
chr5 (172-221)||(30759662-30759711)
chr5 (165-221)||(18484219-18484275)
chr5 (178-221)||(25116178-25116221)
chr5 (172-221)||(22855723-22855772)
chr5 (172-221)||(26847803-26847852)
chr5 (183-221)||(25175268-25175306)
chr5 (183-221)||(27270563-27270601)
chr5 (20-101)||(22317639-22317719)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (13-221)||(15678-15886)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (13-221)||(21382093-21382302)
chr8 (13-221)||(21098801-21099009)
chr8 (13-221)||(21104122-21104330)
chr8 (13-221)||(23911441-23911648)
chr8 (13-221)||(8314467-8314676)
chr8 (13-221)||(8322853-8323062)
chr8 (20-221)||(21843531-21843733)
chr8 (20-221)||(21940003-21940206)
chr8 (20-221)||(20038988-20039189)
chr8 (21-219)||(23454945-23455144)
chr8 (21-221)||(17620755-17620954)
chr8 (20-221)||(16418627-16418830)
chr8 (49-221)||(24034049-24034223)
chr8 (21-217)||(14352181-14352378)
chr8 (39-220)||(21538573-21538757)
chr8 (117-221)||(20712537-20712642)
chr8 (172-221)||(11346960-11347009)
chr8 (172-221)||(19767684-19767733)
chr8 (172-221)||(22370102-22370151)
chr8 (177-221)||(20002279-20002323)
chr8 (20-89)||(20712470-20712539)
chr8 (172-221)||(22033562-22033611)
chr8 (172-221)||(22099662-22099711)
chr8 (172-221)||(22102552-22102601)
chr8 (177-221)||(21831181-21831225)
chr8 (177-221)||(22817755-22817799)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (13-221)||(1038-1246)
scaffold0404 (155-221)||(3451-3517)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-221)||(622-831)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (20-221)||(220-421)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (23-221)||(2859-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (20-221)||(251877-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (28-221)||(11064-11257)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (20-221)||(2294-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-221)||(831-1034)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (21-221)||(14669-14869)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (23-221)||(482-680)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (20-221)||(7941-8142)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-221)||(120954-121155)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (70-221)||(164410-164562)
scaffold0011 (165-221)||(172254-172310)
scaffold0011 (165-221)||(161995-162051)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (20-221)||(1108-1311)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (20-221)||(58635-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (20-221)||(97733-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (20-221)||(517-718)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (110-221)||(10213-10325)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (81-221)||(8720-8862)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (23-221)||(13009-13207)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (23-221)||(35111-35307)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (67-221)||(12450-12604)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (67-221)||(232794-232948)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (127-221)||(38515-38610)
scaffold0096 (48-98)||(38625-38675)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (165-221)||(5232-5288)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (165-221)||(22162-22218)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (165-221)||(42237-42293)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (165-221)||(50513-50569)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (20-87)||(2859-2926)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (170-221)||(912-963)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (172-221)||(2762-2811)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (177-221)||(12743-12787)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (165-220)||(37751-37806)
scaffold0116 (21-101)||(37869-37948)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (172-221)||(10720-10769)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (172-221)||(1193-1242)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (172-221)||(54856-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (165-221)||(1839-1895)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (22-221)||(37722-37919)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (165-221)||(22756-22811)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (165-221)||(45235-45291)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (172-212)||(83174-83214)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (178-221)||(72579-72622)
scaffold0037 (178-221)||(84769-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (183-221)||(18218-18256)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123577
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  123569 gtgggggag 123577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583101
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  9583093 gtgggggag 9583101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119856
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  16119864 gtgggggag 16119856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515275
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  23515267 gtgggggag 23515275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551307
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    ||||||||||    
T  14551298 tgtgggggag 14551307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718073
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  8718065 gtgggggag 8718073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674064
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  13674056 atgggggag 13674064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593359
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  18593367 atgggggag 18593359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618325
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  18618317 atgggggag 18618325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312765
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 4312763  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  4312764 ag 4312765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538762
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 538765  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  538764 gag 538762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567222
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  | || || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggg 12567219  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  12567220 gag 12567222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004160
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 9004157  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  9004158 gag 9004160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548812
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548912 gagacatgt-atttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgggg 12548814  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  12548813 ag 12548812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780943
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  120 ggagacat--gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||| || ||    ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8780947  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  8780946 ggag 8780943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108577
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||    || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  20108575 gag 20108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801783
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 48801787  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  48801786 ggag 48801783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264946
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  123 gacatgtg-ctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||| || ||    || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658074
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 13658072  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  13658073 ag 13658074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921314
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 11921317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532304
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 117  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16532299  T
Q  217 gggag 221  Q
    |||||    
T  16532300 gggag 16532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633358
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 117  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  118 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16633363  T
Q  217 gggag 221  Q
    |||||    
T  16633362 gggag 16633358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16465679 - 16465623
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465679 tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 16465623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825832
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 825832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461249
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 4461249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221725
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14221725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916783
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15916783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287810
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 18287810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291545
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27291545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206591
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15206591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397324
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggag 5397324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065977
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15065977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713075
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggag 6713075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194551
Alignment:
Q  175 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggag 9194551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348578
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttgggg 15348578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4791438 - 4791389
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4791438 atgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 4791389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16465777 - 16465743
Alignment:
Q  64 attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465777 attataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 16465743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699763
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  15699755 gtgggggag 15699763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165556
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  22165564 gtgggggag 22165556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244020
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  22244012 gtgggggag 22244020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061510
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  22061518 atgggggag 22061510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855252
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24855255  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  24855254 gag 24855252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767123
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  22767132 tatgggggag 22767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170451
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatat-aactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  211 gtgtgggggag 221  Q
    || ||||||||    
T  20170441 gtatgggggag 20170451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448342
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18448339  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  18448340 gag 18448342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107787
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||| || | || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattgaattgtcatatg-tttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20107791  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  20107790 ggag 20107787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023295
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23023292  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  23023293 gag 23023295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625892
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggggg 25625890  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  25625891 ag 25625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181262
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854219
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  128 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggag 18854219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560561
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 21560563  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  21560562 ag 21560561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631276
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
     |||| ||  | |||||||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 25631281  T
Q  217 gggag 221  Q
    |||||    
T  25631280 gggag 25631276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595897
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29595797 gagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggga 29595896  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  29595897 g 29595897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963450
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25963447  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  25963448 gag 25963450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968097
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25968094  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  25968095 gag 25968097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671814
Alignment:
Q  25 acacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 124  Q
    ||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  125 catgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 30671814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585622
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcat 148  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattgtattgtcat 19585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaag 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  113 ccctt 117  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184881
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 18184881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271019
Alignment:
Q  171 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 35271019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731924
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggag 18731924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218988
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggag 20218988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113013
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggag 22113013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204053
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggag 11204053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517838
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggag 23517838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 217
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686646
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatggg 29686646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686489
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaata 60  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496621
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  11496629 gtgggggag 11496621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823121
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  13823113 gtgggggag 13823121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709738
Alignment:
Q  19 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 42709741  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  42709740 gag 42709738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254556
Alignment:
Q  14 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  114 ccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  214 tgggggag 221  Q
    ||||||||    
T  15254549 tgggggag 15254556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630958
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  10630957 ag 10630958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354848
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggg 3354845  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  3354846 gag 3354848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292146
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggggg 18292144  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  18292145 ag 18292146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081466
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18081470  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  18081469 ggag 18081466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484917
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 17484919  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  17484918 ag 17484917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234239
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggg 45234242  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  45234241 gag 45234239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426931
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||             || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 38426930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580546
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||| | |||||||   |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 56580549  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  56580548 gag 56580546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14654005
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14654005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865696
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15865696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650596
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 10650596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260116
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggag 15260116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682962
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggag 16682962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409578
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggag 15409578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092438
Alignment:
Q  168 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 8092438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488885
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggag 9488885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296256
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggag 17296256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602479
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  10602487 gtgggggag 10602479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504888
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  13504896 gtgggggag 13504888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947615
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  11947607 gtgggggag 11947615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448767
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  16448775 atgggggag 16448767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600563
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  7600555 atgggggag 7600563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556949
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  15556957 gtgggggag 15556949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360978
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  9360986 atgggggag 9360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373572
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  16373581 tatgggggag 16373572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187083
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  12187092 tatgggggag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942586
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  37942577 tatgggggag 37942586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815076
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | || |||||    
T  6815067 tatgagggag 6815076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193497
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggggg 12193499  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  12193498 ag 12193497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147219
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  10147210 tatgggggag 10147219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645209
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  15645200 tatgggggag 15645209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160180
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  10160189 tatgggggag 10160180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187424
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  13187433 tatgggggag 13187424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245595
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 3245596  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  3245595 g 3245595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721502
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| | |||    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2721405 gagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 2721502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382954
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4382950  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  4382951 ggag 4382954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001432
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13001435  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  13001434 gag 13001432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1992996
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 213  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1992903 ggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtg 1992996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097912
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggggg 13097910  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  13097911 ag 13097912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546943
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccct 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||| || |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  216 ggggag 221  Q
    ||||||    
T  10546948 ggggag 10546943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156522
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggg 20156525  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  20156524 gag 20156522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690809
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggggg 13690807  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  13690808 ag 13690809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398417
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  120 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
     |||||||  | ||| |||||||||||| | || ||    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggg 11398414  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  11398415 gag 11398417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348595
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||| || ||   | || |  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 14348598  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  14348597 gag 14348595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637901
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    | |||  | ||||||||||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279392
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||| || | |  | ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggggg 3279390  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  3279391 ag 3279392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388038
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    || ||  | ||||||||||||||||  |||||    || ||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160214
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||   ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 12160218  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  12160217 ggag 12160214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17045697 - 17045902
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17045697 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17045793  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045794 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17045893  T
Q  212 tgtggggga 220  Q
    |||||||||    
T  17045894 tgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17047857 - 17048062
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17047857 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17047953  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047954 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17048053  T
Q  212 tgtggggga 220  Q
    |||||||||    
T  17048054 tgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356735
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27356735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601270
Alignment:
Q  171 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggag 13601270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339233
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 3339233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776541
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 12776541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136217
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 13136217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584311
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 20584311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946817
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15946817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445775
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14445775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619293
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 15619293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195465
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggag 13195465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686394
Alignment:
Q  173 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 8686394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225761
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggag 20225761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068350
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggag 13068350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665270
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  22665262 gtgggggag 22665270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117751
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  117743 gtgggggag 117751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044667
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  22044675 atgggggag 22044667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357719
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  25357711 atgggggag 25357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775859
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  16775851 atgggggag 16775859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11622
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggggg 11624  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  11623 ag 11622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590615
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17590606  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  17590607 atgggggag 17590615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795292
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  24795300 atgggggag 24795292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627789
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  27627780 tatgggggag 27627789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144764
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25144767  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  25144766 gag 25144764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500272
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 5500274  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  5500273 ag 5500272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804274
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25804276  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  25804275 ag 25804274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370892
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  122 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||  ||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25370895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798929
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggga 23798930  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  23798929 g 23798929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502297
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttga 24502267  T
Q  120 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcat 148  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  24502268 ggagacataagtttttaattgaattgtcat 24502297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 23643950 - 23644153
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||    
T  23643950 cacacacgcacccacttaagacttgattgtagggttgaaaaaggattacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttg 23644049  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644050 aggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23644149  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  23644150 ggag 23644153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178200
Alignment:
Q  74 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  173 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggag 24178200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159392
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 23159392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570649
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 23570649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631704
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27631704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768823
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27768823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171554
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 24171554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257579
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 23257579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321377
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 24321377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506858
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggag 24506858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337659
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 25337659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  167 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 209  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 212
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955898
Alignment:
Q  182 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 29955898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512574
Alignment:
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatggggga 21512574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019075
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatggggga 24019075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047082
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  27047074 gtgggggag 27047082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094608
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  17094616 gtgggggag 17094608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798669
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  21798678 tatgggggag 21798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237664
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  20237656 gtgggggag 20237664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653324
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 8653322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938628
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 52938631  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  52938630 gag 52938628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990147
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggg 3990143  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  3990144 ggag 3990147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364237
Alignment:
Q  27 acactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 126  Q
    ||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  127 tgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    || | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 19364237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070713
Alignment:
Q  140 aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 14070713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875651
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 19875651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784479
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggag 21784479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382582
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 16382582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027888
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggag 4027888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947522
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggag 8947522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595838
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  20595846 gtgggggag 20595838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602124
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  20602132 gtgggggag 20602124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608415
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  20608423 gtgggggag 20608415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735742
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  15735734 gtgggggag 15735742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748259
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  23748251 atgggggag 23748259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940742
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24940739  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  24940740 gag 24940742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073108
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  18073099 tatgggggag 18073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953181
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  24953190 tatgggggag 24953181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790721
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  20790730 tatgggggag 20790721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600644
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23600646  T
Q  219 ga 220  Q
    ||    
T  23600645 ga 23600644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219954
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggg 24219951  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  24219952 gag 24219954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444846
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggg 20444849  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  20444848 gag 20444846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 221
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387598
Alignment:
Q  34 cttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 133  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  134 t-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 21387598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916463
Alignment:
Q  24 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  124 acatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||| | ||| ||| ||||||| | ||  ||     ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  20916560 acatgagttttgatttaattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggag 20916463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575633
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattg 144  Q
    |||||||| | ||| |||||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaattg 20575633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317520
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22317520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006815
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25006815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759662
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 30759662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484219
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggag 18484219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116178
Alignment:
Q  178 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25116178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855772
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22855772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847852
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 26847852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175268
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25175268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270601
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggag 27270601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22317719 - 22317639
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22317719 cacacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22317639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15886
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  15878 gtgggggag 15886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382302
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  21382293 tatgggggag 21382302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098801
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  21098809 gtgggggag 21098801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104122
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
    |||||||||    
T  21104130 gtgggggag 21104122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911648
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  23911640 atgggggag 23911648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314676
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | ||||||||    
T  8314667 tatgggggag 8314676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322853
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    | || |||||    
T  8322862 tatgagggag 8322853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843531
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 21843534  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  21843533 gag 21843531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21940003
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||     ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 21940007  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  21940006 ggag 21940003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038988
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
     |||||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  20038989 ag 20038988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455144
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  121 gagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455045 gagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620954
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttggt-tgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggga 17620953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418627
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 16418631  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  16418630 ggag 16418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034223
Alignment:
Q  49 ttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtca 24034148  T
Q  148 tttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    | |  || |  |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034149 tatattaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 24034223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  121 gagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||| | || || | ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538757
Alignment:
Q  39 aacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatta--gtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaa 136  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  137 ttgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21538673 ttgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtggggga 21538757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712642
Alignment:
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  216 ggggag 221  Q
    ||||||    
T  20712637 ggggag 20712642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346960
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 11346960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767733
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 19767733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370151
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22370151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002323
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 20002323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 89  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033562
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22033562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099662
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22099662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102601
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggag 22102601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831225
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 21831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817799
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggag 22817799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1246
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  113 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  213 gtgggggag 221  Q
     ||||||||    
T  1238 atgggggag 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 221
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3517
Alignment:
Q  155 taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3451 taactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 622
Alignment:
Q  13 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  112 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 211  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  212 tgtgggggag 221  Q
    ||||||||||    
T  631 tgtgggggag 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 220 - 421
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  320 ggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 419  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  420 ag 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2859
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251877
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggg 251880  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  251879 gag 251877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11257
Alignment:
Q  28 cactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  128 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11164 gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 11257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2294
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 218  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 2297  T
Q  219 gag 221  Q
    |||    
T  2296 gag 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 831 - 1034
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1030  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  1031 ggag 1034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14669
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 14670  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  14669 g 14669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 482 - 680
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8142
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
     |||||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  8141 ag 8142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121155
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 120  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  121 gagacatgtgctttaattgaattgtcat-ttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |  | |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 121153  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  121154 ag 121155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164410
Alignment:
Q  70 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  169 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggag 164410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172310
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 172310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162051
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 162051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1311
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1307  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  1308 ggag 1311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58635
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 58639  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  58638 ggag 58635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97733
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 118  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  119 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtggg 97737  T
Q  218 ggag 221  Q
    ||||    
T  97736 ggag 97733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 517
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  120 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 219  Q
    ||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggggg 519  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  518 ag 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10213
Alignment:
Q  110 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  209 aagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||    
T  10225 aagtttgggggag 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8862
Alignment:
Q  81 agtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgttta 178  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  179 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 8862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13009
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||  ||  ||||| ||||| |    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaa 13108  T
Q  123 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||  | |||||||||||| | || |||||    || |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13107 gacataagttttaattgaattattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggag 13009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35111
Alignment:
Q  23 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaa------ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||      |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |    
T  35307 acacacactcatttgaaacttcattgttgggttgaaaaaaaaaaaagattaccaagaatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagcctt 35208  T
Q  117 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 216  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35207 aaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgg 35116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12604
Alignment:
Q  67 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 12546  T
Q  165 t-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12547 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 12604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232794
Alignment:
Q  67 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 232852  T
Q  165 t-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232851 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 232794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38515
Alignment:
Q  127 tgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 38515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38675 - 38625
Alignment:
Q  48 gttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 98  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38675 gttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5288
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 5288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22162
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42293
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 42293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50513
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 50513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  20 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 912 - 963
Alignment:
Q  170 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2811
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 221
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12787
Alignment:
Q  177 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 12787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37751
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 37751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  21 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10769
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggag 10769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1242
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggag 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54856
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggag 54856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1895
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggag 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 37722 - 37919
Alignment:
Q  22 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggatgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    |  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||    
T  37722 cacacacactcacttgaaacttgtt-gttgggttgaataggt-tcgcaaggaatacttgatgttgtgattagtgtacacttgaaatt-aagcctttgagg 37818  T
Q  122 agacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 220  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||| |  ||    ||||  || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37819 agacataagattttaattgaattgtcatattttaattttgtttatgttgctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtggggga 37918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22811
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45235
Alignment:
Q  165 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggag 45235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  172 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72579
Alignment:
Q  178 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggag 72579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84769
Alignment:
Q  178 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggag 84769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18256
Alignment:
Q  183 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 18256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University