View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9795A_low_212 (Length: 251)

Name: NF9795A_low_212
Description: NF9795A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9795A_low_212
NF9795A_low_212
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (17-251)||(27629561-27629795)
chr6 (16-223)||(27359852-27360059)
chr6 (16-223)||(27450195-27450402)
chr6 (17-223)||(4525415-4525621)
chr6 (17-223)||(4757893-4758099)
chr6 (17-223)||(4773135-4773341)
chr6 (17-223)||(28207583-28207789)
chr6 (17-223)||(4545636-4545842)
chr6 (17-223)||(26116271-26116477)
chr6 (17-242)||(17025387-17025612)
chr6 (75-223)||(27007856-27008004)
chr6 (17-223)||(4723995-4724201)
chr6 (34-223)||(29549604-29549793)
chr6 (75-223)||(16749983-16750131)
chr6 (17-221)||(24863848-24864052)
chr6 (17-221)||(26989132-26989336)
chr6 (109-223)||(16674268-16674382)
chr6 (109-223)||(16943980-16944094)
chr6 (109-223)||(26777568-26777682)
chr6 (109-223)||(29501544-29501658)
chr6 (17-223)||(29573142-29573348)
chr6 (109-223)||(30557969-30558083)
chr6 (109-223)||(34463299-34463413)
chr6 (82-223)||(27485258-27485399)
chr6 (109-221)||(15424270-15424382)
chr6 (17-221)||(24304479-24304683)
chr6 (109-223)||(3696210-3696324)
chr6 (109-223)||(26918509-26918623)
chr6 (109-221)||(27000204-27000316)
chr6 (17-218)||(22934741-22934942)
chr6 (17-218)||(23857186-23857387)
chr6 (109-223)||(27044516-27044631)
chr6 (17-221)||(13298812-13299016)
chr6 (17-137)||(17092301-17092421)
chr6 (46-190)||(27272470-27272614)
chr6 (17-218)||(22456795-22456996)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (17-251)||(193-427)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (17-223)||(37671298-37671504)
chr5 (17-242)||(13324644-13324869)
chr5 (17-223)||(31431581-31431787)
chr5 (17-223)||(37358458-37358664)
chr5 (109-223)||(31826314-31826428)
chr5 (17-223)||(37755121-37755327)
chr5 (17-223)||(43078393-43078599)
chr5 (17-221)||(22998929-22999133)
chr5 (17-223)||(9548358-9548564)
chr5 (82-223)||(37770867-37771008)
chr5 (17-242)||(40473364-40473589)
chr5 (75-223)||(15658633-15658781)
chr5 (46-221)||(11549497-11549672)
chr5 (44-223)||(28959628-28959807)
chr5 (109-223)||(3789682-3789796)
chr5 (17-223)||(9317592-9317798)
chr5 (17-223)||(12132296-12132502)
chr5 (17-223)||(15758672-15758878)
chr5 (109-223)||(18500637-18500751)
chr5 (17-223)||(26480533-26480739)
chr5 (109-223)||(28649376-28649490)
chr5 (109-223)||(29966973-29967087)
chr5 (109-223)||(30029556-30029670)
chr5 (75-221)||(30934776-30934922)
chr5 (109-223)||(33516497-33516611)
chr5 (109-223)||(34616659-34616773)
chr5 (82-223)||(2511192-2511333)
chr5 (109-242)||(24681562-24681695)
chr5 (109-242)||(24724089-24724222)
chr5 (19-248)||(25199145-25199374)
chr5 (109-221)||(23717895-23718007)
chr5 (109-223)||(6874446-6874560)
chr5 (109-223)||(8665382-8665496)
chr5 (109-223)||(18375319-18375433)
chr5 (52-221)||(24970161-24970330)
chr5 (112-223)||(5638051-5638162)
chr5 (17-167)||(29888897-29889047)
chr5 (109-223)||(30152159-30152273)
chr5 (109-223)||(30168610-30168724)
chr5 (109-223)||(32599379-32599493)
chr5 (109-223)||(41674850-41674964)
chr5 (109-218)||(23752357-23752466)
chr5 (17-221)||(24687972-24688176)
chr5 (82-242)||(33292647-33292807)
chr5 (34-233)||(22888601-22888800)
chr5 (109-218)||(33777633-33777742)
chr5 (17-190)||(23892380-23892553)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (17-223)||(4417012-4417218)
chr3 (29-223)||(5713320-5713514)
chr3 (29-223)||(5724230-5724424)
chr3 (29-223)||(5757053-5757247)
chr3 (29-223)||(5767944-5768138)
chr3 (17-223)||(51782116-51782322)
chr3 (17-223)||(51797206-51797412)
chr3 (82-223)||(6542486-6542627)
chr3 (75-223)||(22870873-22871021)
chr3 (75-223)||(22885932-22886080)
chr3 (17-223)||(21674786-21674992)
chr3 (109-223)||(36997128-36997242)
chr3 (17-223)||(4346646-4346852)
chr3 (17-223)||(11110308-11110514)
chr3 (17-223)||(17984915-17985121)
chr3 (109-223)||(48466020-48466134)
chr3 (17-221)||(8301226-8301430)
chr3 (75-223)||(22387595-22387743)
chr3 (109-248)||(28021343-28021482)
chr3 (17-223)||(5013805-5014011)
chr3 (109-223)||(5467078-5467192)
chr3 (109-223)||(5596408-5596522)
chr3 (17-223)||(7073305-7073511)
chr3 (109-223)||(8211831-8211945)
chr3 (109-223)||(18277103-18277217)
chr3 (109-223)||(18292404-18292518)
chr3 (109-223)||(18307705-18307819)
chr3 (17-223)||(29148714-29148920)
chr3 (109-242)||(20576898-20577031)
chr3 (17-221)||(8296067-8296271)
chr3 (17-221)||(15892665-15892869)
chr3 (75-223)||(28115971-28116119)
chr3 (46-221)||(18051357-18051532)
chr3 (109-223)||(18225284-18225398)
chr3 (109-223)||(18242832-18242946)
chr3 (75-221)||(18330764-18330910)
chr3 (17-223)||(24328252-24328458)
chr3 (17-223)||(28339395-28339601)
chr3 (17-218)||(6192414-6192615)
chr3 (34-223)||(7996655-7996844)
chr3 (34-223)||(10643163-10643352)
chr3 (49-242)||(20066117-20066310)
chr3 (109-242)||(29665021-29665154)
chr3 (109-221)||(4796704-4796816)
chr3 (17-221)||(15741053-15741257)
chr3 (109-223)||(10396226-10396340)
chr3 (109-223)||(31964524-31964638)
chr3 (109-223)||(47023546-47023660)
chr3 (109-223)||(50134122-50134236)
chr3 (82-223)||(5609346-5609487)
chr3 (49-242)||(32439228-32439421)
chr3 (109-221)||(35880861-35880973)
chr3 (75-218)||(4721729-4721872)
chr3 (29-101)||(16626477-16626549)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (17-223)||(51638349-51638555)
chr1 (109-223)||(10962801-10962915)
chr1 (109-223)||(28585112-28585226)
chr1 (19-233)||(16207951-16208165)
chr1 (109-223)||(41793318-41793432)
chr1 (29-248)||(20340265-20340484)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (75-223)||(11635151-11635299)
chr2 (75-223)||(11641340-11641488)
chr2 (35-223)||(32049926-32050114)
chr2 (17-223)||(39890202-39890408)
chr2 (34-242)||(9349906-9350114)
chr2 (75-223)||(34286482-34286630)
chr2 (75-223)||(34291542-34291690)
chr2 (17-221)||(23128473-23128677)
chr2 (17-221)||(28882344-28882548)
chr2 (109-223)||(260752-260866)
chr2 (109-223)||(16829337-16829451)
chr2 (109-223)||(16892030-16892144)
chr2 (109-223)||(31876409-31876523)
chr2 (109-223)||(34279577-34279691)
chr2 (17-223)||(34861808-34862014)
chr2 (109-242)||(12716601-12716734)
chr2 (109-242)||(27777331-27777464)
chr2 (109-242)||(27817089-27817222)
chr2 (17-221)||(12655672-12655876)
chr2 (109-223)||(21677181-21677295)
chr2 (109-242)||(13936543-13936676)
chr2 (34-223)||(22925952-22926141)
chr2 (17-218)||(27434351-27434552)
chr2 (109-242)||(27803816-27803949)
chr2 (109-242)||(39051821-39051954)
chr2 (17-223)||(19416406-19416612)
chr2 (109-223)||(37375289-37375403)
chr2 (109-223)||(37685908-37686022)
chr2 (109-223)||(37701173-37701287)
chr2 (109-242)||(12586919-12587052)
chr2 (75-212)||(20838057-20838194)
chr2 (109-223)||(37925621-37925735)
chr2 (17-236)||(40233626-40233845)
chr2 (19-233)||(21703073-21703287)
chr2 (76-223)||(27393097-27393244)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (17-223)||(8081-8287)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (17-223)||(12092601-12092807)
chr8 (109-223)||(19674573-19674687)
chr8 (75-223)||(3329442-3329590)
chr8 (17-236)||(29829441-29829660)
chr8 (34-223)||(18710718-18710907)
chr8 (17-223)||(19208237-19208443)
chr8 (17-223)||(28361832-28362038)
chr8 (17-223)||(31489627-31489833)
chr8 (109-223)||(33258855-33258969)
chr8 (109-221)||(2137228-2137340)
chr8 (109-221)||(14557758-14557870)
chr8 (17-221)||(16277688-16277892)
chr8 (109-223)||(19286594-19286708)
chr8 (75-221)||(27608840-27608986)
chr8 (17-223)||(31354656-31354862)
chr8 (46-221)||(19688232-19688407)
chr8 (46-190)||(16283614-16283758)
chr8 (75-190)||(189259-189374)
chr8 (76-233)||(22080814-22080971)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (17-223)||(31564194-31564400)
chr7 (109-223)||(3445439-3445553)
chr7 (109-248)||(16736356-16736495)
chr7 (109-248)||(16751410-16751549)
chr7 (109-248)||(17523640-17523779)
chr7 (109-248)||(17529436-17529575)
chr7 (17-221)||(10916672-10916876)
chr7 (17-223)||(4144927-4145133)
chr7 (109-223)||(5147236-5147350)
chr7 (17-223)||(9618784-9618990)
chr7 (75-221)||(11424638-11424784)
chr7 (109-223)||(11441705-11441819)
chr7 (109-223)||(26435390-26435504)
chr7 (109-223)||(24592437-24592551)
chr7 (109-223)||(26319765-26319879)
chr7 (109-223)||(26537766-26537880)
chr7 (17-223)||(26669718-26669924)
chr7 (17-223)||(31125053-31125259)
chr7 (34-223)||(45387476-45387665)
chr7 (46-221)||(16503213-16503388)
chr7 (109-223)||(26274990-26275104)
chr7 (49-242)||(18540913-18541106)
chr7 (17-221)||(2154708-2154912)
chr7 (46-221)||(16518249-16518424)
chr7 (109-223)||(5128125-5128239)
chr7 (82-242)||(5159633-5159793)
chr7 (29-233)||(16449814-16450018)
chr7 (34-248)||(39210844-39211058)
chr7 (34-131)||(4200772-4200869)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (75-223)||(33673774-33673922)
chr4 (75-242)||(21969829-21969996)
chr4 (17-221)||(14665167-14665371)
chr4 (109-223)||(31126528-31126642)
chr4 (109-224)||(14098687-14098802)
chr4 (109-223)||(14763314-14763428)
chr4 (17-223)||(27163235-27163441)
chr4 (109-223)||(30753901-30754015)
chr4 (17-223)||(40105556-40105762)
chr4 (109-223)||(6570000-6570114)
chr4 (109-223)||(18800623-18800737)
chr4 (17-223)||(36344433-36344639)
chr4 (109-223)||(54833534-54833648)
chr4 (17-218)||(17014152-17014353)
chr4 (76-221)||(24592291-24592436)
chr4 (17-242)||(39850766-39850991)
chr4 (19-233)||(1900394-1900608)
chr4 (109-223)||(5006020-5006134)
chr4 (49-242)||(24112790-24112983)
chr4 (49-242)||(34188910-34189103)
chr4 (109-248)||(15227992-15228131)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (46-221)||(27426-27601)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (109-223)||(9698-9812)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (109-223)||(30584-30698)
scaffold0124 (19-233)||(20510-20723)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (17-221)||(46903-47107)
scaffold0089 (75-221)||(29897-30043)
scaffold0089 (17-221)||(39987-40191)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-221)||(47-251)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (109-223)||(7249-7363)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (109-223)||(14940-15054)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (109-223)||(26211-26325)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (109-223)||(9076-9190)
scaffold0159 (109-223)||(20147-20261)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (19-233)||(1838-2051)
scaffold0415 (109-223)||(6144-6260)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (29-248)||(2588-2807)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (76-233)||(21683-21840)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 27629561 - 27629795
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629561 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 27629660  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629661 agtcagctttccttggtcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 27629760  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttggtggtaatggatctgg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629761 agatcagtacgaaaccttggtggtaatggatctgg 27629795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360059
Alignment:
Q  16 tggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaa 115  Q
    |||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  116 aagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacactt 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  216 gagatcag 223  Q
    ||||||||    
T  27360052 gagatcag 27360059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450402
Alignment:
Q  16 tggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaa 115  Q
    |||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  116 aagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacactt 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  216 gagatcag 223  Q
    ||||||||    
T  27450395 gagatcag 27450402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525415
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4525422  T
Q  217 agatcag 223  Q
     ||||||    
T  4525421 ggatcag 4525415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757893
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4757899 agatcag 4757893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773135
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4773141 agatcag 4773135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207583
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  28207589 agatcag 28207583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545842
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4545836 agatcag 4545842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116477
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  26116471 agatcag 26116477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025387
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 17025413  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||||||  || |||||||| |||||    
T  17025412 agatcagagcggaaccttggaggtaa 17025387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27008004 - 27007856
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  27008004 tggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 27007905  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  27007904 tcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 27007856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724201
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| || |||||||| |||  | ||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4724195 agatcag 4724201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29549793 - 29549604
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29549793 gcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgat 29549694  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  29549693 caatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 29549604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16750131 - 16749983
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| |    
T  16750131 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccc 16750032  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16750031 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcag 16749983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863848
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  24863852 agatc 24863848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989132
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  26989136 agatc 26989132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16674382 - 16674268
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  16674382 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 16674283  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  16674282 cacatttgagatcag 16674268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 16943980 - 16944094
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  16943980 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagt 16944079  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  16944080 cacatttgagatcag 16944094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 26777568 - 26777682
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  26777568 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 26777667  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  26777668 cacatttgagatcag 26777682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29501658 - 29501544
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  29501658 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 29501559  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  29501558 cacatttgagatcag 29501544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573142
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  29573148 agatcag 29573142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 30557969 - 30558083
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  30557969 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 30558068  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| || |||||||    
T  30558069 cacatttaagatcag 30558083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 34463299 - 34463413
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  34463299 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 34463398  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  34463399 cacatttgagatcag 34463413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27485399 - 27485258
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  27485399 ggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 27485300  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  27485299 catgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 27485258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 15424270 - 15424382
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  15424270 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaat 15424369  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  15424370 cacatttgagatc 15424382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304683
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  24304679 agatc 24304683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3696324 - 3696210
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  3696324 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 3696225  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  3696224 cgcatttgagatcag 3696210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26918623 - 26918509
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  26918623 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 26918524  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  26918523 cacatttgagatcag 26918509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27000316 - 27000204
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  27000316 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 27000217  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  27000216 cacatttgagatc 27000204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22934942
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  22934941 ag 22934942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857387
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  23857386 ag 23857387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27044631 - 27044516
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataa-cacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaag 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  27044631 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaa 27044532  T
Q  208 tcacacttgagatcag 223  Q
    ||||| ||||||||||    
T  27044531 tcacatttgagatcag 27044516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299016
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||  || || | ||| || || ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  13299012 agatc 13299016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092421
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||| | || ||| ||||||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaat 137  Q
    ||||| |||||| || |||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaat 17092421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 190
Target Start/End: Original strand, 27272470 - 27272614
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    ||||| ||||| || || |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||  | | |||||||| |||||||| |||||||| || ||| | |    
T  27272470 acttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttt 27272569  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgaccca 190  Q
      || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  27272570 tcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgaccca 27272614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22456996
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | | ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||| | ||||||||| || || ||| |||  ||||| ||||||||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  22456995 ag 22456996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 193
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  427 ggacatctagtttgggtgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 328  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327 agtcagctttccttggtcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacgtcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 228  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttggtggtaatggatctgg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  227 agatcagtacgaaaccttggtggtaatggatctgg 193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671504
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  37671498 agatcag 37671504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324869
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||||||  || |||||||| |||||    
T  13324844 agatcagagcggaaccttggaggtaa 13324869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431581
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  31431587 agatcag 31431581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358664
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||| || | ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  37358658 agatcag 37358664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 31826314 - 31826428
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  31826314 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 31826413  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  31826414 cacatttgagatcag 31826428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755121
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  37755127 agatcag 37755121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078393
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  43078399 agatcag 43078393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999133
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||||| |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  22999129 agatc 22999133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548564
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  9548558 agatcag 9548564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 37770867 - 37771008
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  37770867 ggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 37770966  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  37770967 catgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 37771008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473589
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| |||||||| || |||||||| |||  | | ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 40473563  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||||||  || |||||||| |||||    
T  40473564 agatcagagcggaaccttggaggtaa 40473589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 15658633 - 15658781
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  15658633 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 15658732  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15658733 tcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 15658781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11549672 - 11549497
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11549672 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttct 11549573  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
      || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  11549572 tcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 11549497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 223
Target Start/End: Original strand, 28959628 - 28959807
Alignment:
Q  44 acacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcct 143  Q
    ||||||| ||||| ||||| || | ||| | ||| || ||||| || |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  28959628 acacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagttt 28959727  T
Q  144 ctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  28959728 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 28959807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3789796 - 3789682
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  3789796 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 3789697  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  3789696 cacatttgagatcag 3789682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317592
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  9317598 agatcag 9317592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132296
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  12132302 agatcag 12132296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15758878
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  15758872 agatcag 15758878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18500637 - 18500751
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  18500637 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 18500736  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18500737 cacatttgagatcag 18500751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480533
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  26480539 agatcag 26480533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28649490 - 28649376
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  28649490 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 28649391  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  28649390 cacatttgagatcag 28649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 29966973 - 29967087
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  29966973 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagt 29967072  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  29967073 cacatttgagatcag 29967087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30029670 - 30029556
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  30029670 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagt 30029571  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  30029570 cacatttgagatcag 30029556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30934922 - 30934776
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| |    
T  30934922 tggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccc 30934823  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  30934822 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 30934776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33516611 - 33516497
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  33516611 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 33516512  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| || |||||||    
T  33516511 cacatttaagatcag 33516497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34616773 - 34616659
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  34616773 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 34616674  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  34616673 cacatttgagatcag 34616659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2511333 - 2511192
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  2511333 ggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 2511234  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | ||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2511233 catgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 2511192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24681695 - 24681562
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  24681695 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 24681596  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  24681595 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 24681562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24724222 - 24724089
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  24724222 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 24724123  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  24724122 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 24724089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199145
Alignment:
Q  19 acatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  119 tcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    | | ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  219 atcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||| |||||    
T  25199174 atcagaacggaacctgggaggtaacggatc 25199145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 23717895 - 23718007
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  23717895 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 23717994  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  23717995 cacatttgagatc 23718007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6874560 - 6874446
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  6874560 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 6874461  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  6874460 cacatttgagatcag 6874446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 8665382 - 8665496
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  8665382 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 8665481  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  8665482 cacatttgagatcag 8665496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18375319 - 18375433
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18375319 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 18375418  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18375419 cacatttgagatcag 18375433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24970330 - 24970161
Alignment:
Q  52 atcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaa 151  Q
    ||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || |    
T  24970330 atcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacga 24970231  T
Q  152 tatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  24970230 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 24970161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5638162 - 5638051
Alignment:
Q  112 tcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcac 211  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  5638162 tcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcac 5638063  T
Q  212 acttgagatcag 223  Q
    | ||||||||||    
T  5638062 atttgagatcag 5638051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889047
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcata 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||  || || ||||| ||||||||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcata 29889047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30152273 - 30152159
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  30152273 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 30152174  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  30152173 cgcatttgagatcag 30152159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30168724 - 30168610
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  30168724 ttctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 30168625  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  30168624 cgcatttgagatcag 30168610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 32599379 - 32599493
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| || || || |||||||| |    
T  32599379 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaat 32599478  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  32599479 cacatttgagatcag 32599493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41674964 - 41674850
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || || | ||| || |||||||| |    
T  41674964 ttctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaat 41674865  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  41674864 cacatttgagatcag 41674850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Original strand, 23752357 - 23752466
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |    
T  23752357 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaat 23752456  T
Q  209 cacacttgag 218  Q
    |||| |||||    
T  23752457 cacatttgag 23752466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688176
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||  || || ||||| || ||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  24688172 agatc 24688176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33292807 - 33292647
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    |||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33292807 ggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacat 33292708  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  33292707 catgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 33292647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22888800 - 22888601
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  22888800 gcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgat 22888701  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 233  Q
    |||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22888700 caatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacct 22888601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33777742 - 33777633
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  33777742 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 33777643  T
Q  209 cacacttgag 218  Q
    |||| |||||    
T  33777642 cacatttgag 33777633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892380
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||| ||| |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgaccca 190  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||| |||  || || ||||| | |||||| || || || ||||| |||||||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgaccca 23892380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4417012
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4417018 agatcag 4417012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5713514 - 5713320
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || | |||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  5713514 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccc 5713415  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5713414 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 5713320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5724424 - 5724230
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || | |||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  5724424 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccc 5724325  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5724324 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 5724230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 5757053 - 5757247
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || | |||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  5757053 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccc 5757152  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5757153 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 5757247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 5767944 - 5768138
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || | |||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  5767944 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccc 5768043  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5768044 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 5768138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782116
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  51782122 agatcag 51782116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797206
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  51797212 agatcag 51797206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 6542486 - 6542627
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  6542486 ggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 6542585  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6542586 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 6542627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 22870873 - 22871021
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  22870873 tggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 22870972  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22870973 tcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 22871021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 22885932 - 22886080
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  22885932 tggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 22886031  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22886032 tcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 22886080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674786
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| |||||||| || |||||||| |||| | | ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  21674792 agatcag 21674786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 36997128 - 36997242
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  36997128 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 36997227  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  36997228 cacatttgagatcag 36997242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346852
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||||||||||||||| ||||| || ||   | | ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4346846 agatcag 4346852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110514
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||||||||| || || || | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  11110508 agatcag 11110514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985121
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||     
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattta 17985114  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  17985115 agatcag 17985121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48466134 - 48466020
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  48466134 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 48466035  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  48466034 cacatttgagatcag 48466020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301430
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  8301426 agatc 8301430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 22387595 - 22387743
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| |    
T  22387595 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccc 22387694  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22387695 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcag 22387743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28021482 - 28021343
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| |    
T  28021482 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaat 28021383  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    |||| ||||||||||  |  |||||||| |||||||||||    
T  28021382 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatc 28021343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013805
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  5013811 agatcag 5013805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5467192 - 5467078
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  5467192 ttctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 5467093  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  5467092 cacatttgagatcag 5467078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 5596408 - 5596522
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  5596408 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 5596507  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  5596508 cacatttgagatcag 5596522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073305
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| |||||||| || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  7073311 agatcag 7073305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8211945 - 8211831
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  8211945 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 8211846  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  8211845 cacatttgagatcag 8211831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18277103 - 18277217
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  18277103 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 18277202  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18277203 cacatttgagatcag 18277217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18292404 - 18292518
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  18292404 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 18292503  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18292504 cacatttgagatcag 18292518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18307705 - 18307819
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  18307705 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 18307804  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18307805 cacatttgagatcag 18307819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148920
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  29148914 agatcag 29148920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 20576898 - 20577031
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  20576898 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 20576997  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  20576998 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 20577031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8296067
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  8296071 agatc 8296067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892869
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  15892865 agatc 15892869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 28115971 - 28116119
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  28115971 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 28116070  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28116071 tcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 28116119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18051532 - 18051357
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    |||||||||||||| || || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18051532 acttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttct 18051433  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
      || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||  || ||||| ||||||||    
T  18051432 tcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatc 18051357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18225398 - 18225284
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18225398 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 18225299  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18225298 cacatttgagatcag 18225284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18242946 - 18242832
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||    
T  18242946 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagt 18242847  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  18242846 cacatttgagatcag 18242832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18330910 - 18330764
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| |    
T  18330910 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccc 18330811  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  18330810 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 18330764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328252
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  24328258 agatcag 24328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339395
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| || || || |||||||| ||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  28339401 agatcag 28339395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192414
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  6192415 ag 6192414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7996844 - 7996655
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  7996844 gcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgat 7996745  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | || ||| |||  || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  7996744 cgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcag 7996655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10643352 - 10643163
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  10643352 gcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgat 10643253  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | || ||| |||  || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  10643252 cgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcag 10643163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20066310 - 20066117
Alignment:
Q  49 tcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctgga 148  Q
    |||||||| || || |||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  20066310 tcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttga 20066211  T
Q  149 caatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  20066210 cgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 20066117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 29665021 - 29665154
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||| |    
T  29665021 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaat 29665120  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  29665121 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 29665154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 4796704 - 4796816
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  4796704 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 4796803  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  4796804 cacatttgagatc 4796816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741257
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||||  || || |||||||| ||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  15741253 agatc 15741257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10396340 - 10396226
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |    
T  10396340 ttctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaat 10396241  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  10396240 cacatttgagatcag 10396226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 31964524 - 31964638
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  31964524 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 31964623  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  31964624 cacatttgagatcag 31964638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47023660 - 47023546
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  47023660 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 47023561  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  47023560 cgcatttgagatcag 47023546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 50134122 - 50134236
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  50134122 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 50134221  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  50134222 cacatttgagatcag 50134236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 5609346 - 5609487
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| |||||||||||||  || || |    
T  5609346 ggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgt 5609445  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5609446 catgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 5609487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32439421 - 32439228
Alignment:
Q  49 tcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctgga 148  Q
    |||||||| || || |||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  32439421 tcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttga 32439322  T
Q  149 caatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  32439321 cgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 32439228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35880973 - 35880861
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |    
T  35880973 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaat 35880874  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  35880873 cacatttgagatc 35880861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4721872 - 4721729
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | |||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |  || |||||||| ||||  || |||| |    
T  4721872 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccc 4721773  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4721772 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 4721729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 16626477 - 16626549
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgagg 101  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16626477 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagg 16626549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638349
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  51638355 agatcag 51638349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10962915 - 10962801
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  10962915 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagt 10962816  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  10962815 cacatttgagatcag 10962801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28585226 - 28585112
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  28585226 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagt 28585127  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  28585126 cgcatttgagatcag 28585112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208165
Alignment:
Q  19 acatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  119 tcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    | | ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  219 atcagtacgaaacct 233  Q
     |||| ||| |||||    
T  16208151 gtcagaacggaacct 16208165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 41793318 - 41793432
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  41793318 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 41793417  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  41793418 cacatttgagatcag 41793432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Original strand, 20340265 - 20340484
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||    
T  20340265 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttcc 20340364  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacga 228  Q
    ||| | ||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || ||||||||||| |||| |||     
T  20340365 ttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgg 20340464  T
Q  229 aaccttggtggtaatggatc 248  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  20340465 aacctaggaggtaacggatc 20340484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 11635151 - 11635299
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  || || ||||| ||||||||||||| |    
T  11635151 tggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccc 11635250  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11635251 tcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcag 11635299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 11641340 - 11641488
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  || || ||||| ||||||||||||| |    
T  11641340 tggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccc 11641439  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11641440 tcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcag 11641488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32050114 - 32049926
Alignment:
Q  35 cttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatc 134  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  32050114 cttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatc 32050015  T
Q  135 aataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  32050014 aatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcag 32049926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890202
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  39890208 agatcag 39890202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 242
Target Start/End: Original strand, 9349906 - 9350114
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || | ||||||||| || || |||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9349906 gcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgat 9350005  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 233  Q
    |||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||  || |||||    
T  9350006 caatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaacct 9350105  T
Q  234 tggtggtaa 242  Q
    ||| |||||    
T  9350106 tggaggtaa 9350114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34286630 - 34286482
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  34286630 tggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 34286531  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  34286530 tcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 34286482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34291690 - 34291542
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  34291690 tggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 34291591  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  34291590 tcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 34291542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128677
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  23128673 agatc 23128677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882344
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  28882348 agatc 28882344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 260752 - 260866
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  260752 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 260851  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  260852 cacatttgagatcag 260866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 16829337 - 16829451
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16829337 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 16829436  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| || |||||||    
T  16829437 cacatttaagatcag 16829451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16892144 - 16892030
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16892144 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 16892045  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| || |||||||    
T  16892044 cacatttaagatcag 16892030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31876523 - 31876409
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  31876523 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagt 31876424  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  31876423 cacatttgagatcag 31876409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34279691 - 34279577
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |    
T  34279691 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaat 34279592  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  34279591 cacatttgagatcag 34279577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861808
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  34861814 agatcag 34861808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 12716601 - 12716734
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  12716601 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 12716700  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  12716701 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 12716734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27777464 - 27777331
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  27777464 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 27777365  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  27777364 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 27777331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27817222 - 27817089
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  27817222 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 27817123  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  27817122 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 27817089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655672
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  12655676 agatc 12655672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 21677181 - 21677295
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  21677181 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 21677280  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  21677281 cacatttgagatcag 21677295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 13936543 - 13936676
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  13936543 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 13936642  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  13936643 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 13936676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Original strand, 22925952 - 22926141
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || | ||| || ||||| || |||||||| |||  | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  22925952 gcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgat 22926051  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22926052 cgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 22926141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434552
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  27434551 ag 27434552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27803949 - 27803816
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  27803949 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaat 27803850  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  27803849 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 27803816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 39051821 - 39051954
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  39051821 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaat 39051920  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  39051921 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 39051954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416612
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||  |||  || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  19416606 agatcag 19416612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37375403 - 37375289
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |    
T  37375403 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaat 37375304  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  37375303 cacatttgagatcag 37375289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 37685908 - 37686022
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  37685908 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 37686007  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  37686008 cgcatttgagatcag 37686022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 37701173 - 37701287
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  37701173 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 37701272  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  37701273 cgcatttgagatcag 37701287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12587052 - 12586919
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  12587052 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 12586953  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  12586952 cacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 12586919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20838194 - 20838057
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| |    
T  20838194 tggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccc 20838095  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcaca 212  Q
    || ||||| ||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  20838094 tcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcaca 20838057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37925735 - 37925621
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| ||||    
T  37925735 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagt 37925636  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  37925635 cgcatttgagatcag 37925621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233626
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| |||||||| || |||||||| |||  | | ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||||||  || || ||||| || ||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttgg 236  Q
    || ||||  || ||||||||    
T  40233645 aggtcagaccggaaccttgg 40233626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703287
Alignment:
Q  19 acatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  119 tcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    | | |||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  |  ||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  219 atcagtacgaaacct 233  Q
     |||| ||| |||||    
T  21703273 gtcagaacggaacct 21703287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27393244 - 27393097
Alignment:
Q  76 ggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctct 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||| |  |    
T  27393244 ggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatcctt 27393145  T
Q  176 caacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    ||||||| || ||||  || || ||||| || || |||||||| ||||    
T  27393144 caacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcag 27393097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 8081
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  8087 agatcag 8081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092807
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  12092801 agatcag 12092807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19674687 - 19674573
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19674687 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaat 19674588  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  19674587 cacatttgagatcag 19674573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 3329442 - 3329590
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  3329442 tggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 3329541  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  3329542 tcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 3329590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829441
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattta 29829461  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttgg 236  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  29829460 agatcagagcggaaccttgg 29829441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18710907 - 18710718
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || | ||||||||| || || |||||||| ||   | | |||||||||||||||||||||||||    
T  18710907 gcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgat 18710808  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18710807 caatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcag 18710718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208443
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  19208437 agatcag 19208443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362038
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  28362032 agatcag 28362038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489833
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  31489827 agatcag 31489833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33258969 - 33258855
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  33258969 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagt 33258870  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  33258869 cacatttgagatcag 33258855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 2137228 - 2137340
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  2137228 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaat 2137327  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  2137328 cacatttgagatc 2137340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14557870 - 14557758
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  14557870 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaat 14557771  T
Q  209 cacacttgagatc 221  Q
    |||| ||||||||    
T  14557770 cacatttgagatc 14557758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277688
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  16277692 agatc 16277688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19286708 - 19286594
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  19286708 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 19286609  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  19286608 cacatttgagatcag 19286594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 27608840 - 27608986
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| || | |    
T  27608840 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccc 27608939  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  27608940 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 27608986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354656
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| || |||||||| |||  | | ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  31354662 agatcag 31354656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19688407 - 19688232
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  19688407 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttt 19688308  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
      || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  19688307 tcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 19688232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16283758 - 16283614
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    |||||||||||||| || || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16283758 acttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttct 16283659  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgaccca 190  Q
      || |||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||    
T  16283658 tcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgaccca 16283614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 189374 - 189259
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||| ||||| || |||| |    
T  189374 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccc 189275  T
Q  175 tcaacatcgtgaccca 190  Q
    || ||||| |||||||    
T  189274 tcgacatcatgaccca 189259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 22080814 - 22080971
Alignment:
Q  76 ggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctct 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||| | |||||| || ||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||| |  |    
T  22080814 ggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatcctt 22080913  T
Q  176 caacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 233  Q
    ||||||| || ||||  || || ||||| || || |||||||| |||| ||| |||||    
T  22080914 caacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacct 22080971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564400
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  31564394 agatcag 31564400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3445553 - 3445439
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  3445553 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 3445454  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  3445453 cacatttgagatcag 3445439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Original strand, 16736356 - 16736495
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16736356 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaat 16736455  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    |||| ||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||    
T  16736456 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatc 16736495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Original strand, 16751410 - 16751549
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16751410 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaat 16751509  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    |||| ||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||    
T  16751510 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatc 16751549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17523779 - 17523640
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  17523779 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaat 17523680  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    |||| ||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||    
T  17523679 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatc 17523640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Original strand, 17529436 - 17529575
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  17529436 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaat 17529535  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    |||| ||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||    
T  17529536 cacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatc 17529575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10916876
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  10916872 agatc 10916876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145133
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  4145127 agatcag 4145133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 5147236 - 5147350
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  5147236 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 5147335  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  5147336 cacatttgagatcag 5147350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618784
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  9618790 agatcag 9618784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 11424638 - 11424784
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| |    
T  11424638 tggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccc 11424737  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  11424738 tcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 11424784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11441819 - 11441705
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  11441819 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 11441720  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  11441719 cacatttgagatcag 11441705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26435504 - 26435390
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  26435504 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 26435405  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  26435404 cacatttgagatcag 26435390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 24592437 - 24592551
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  24592437 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 24592536  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  24592537 cacatttgagatcag 24592551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 26319765 - 26319879
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  26319765 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 26319864  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  26319865 cacatttgagatcag 26319879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 26537766 - 26537880
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  26537766 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 26537865  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  26537866 cgcatttgagatcag 26537880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26669924
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  26669918 agatcag 26669924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125053
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  31125059 agatcag 31125053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45387665 - 45387476
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  45387665 gcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgat 45387566  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    | || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  45387565 cgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcag 45387476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 16503213 - 16503388
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16503213 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttct 16503312  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
      || |||||||| ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  16503313 tcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 16503388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 26274990 - 26275104
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  26274990 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 26275089  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  26275090 cacatttgagatcag 26275104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18541106 - 18540913
Alignment:
Q  49 tcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctgga 148  Q
    |||||||| || || |||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  18541106 tcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttga 18541007  T
Q  149 caatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  18541006 cgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 18540913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154708
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || || | ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  2154712 agatc 2154708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 16518249 - 16518424
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  16518249 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttct 16518348  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
      || |||||||| ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  16518349 tcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 16518424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5128239 - 5128125
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || || | ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |    
T  5128239 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaat 5128140  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  5128139 cacatttgagatcag 5128125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5159793 - 5159633
Alignment:
Q  82 ggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacat 181  Q
    |||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  5159793 ggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacat 5159694  T
Q  182 cgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  5159693 catgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 5159633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 16449814 - 16450018
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||     | ||||||||||| | ||||||    
T  16449814 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttcc 16449913  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacga 228  Q
     |||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  16449914 ctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacga 16450013  T
Q  229 aacct 233  Q
    |||||    
T  16450014 aacct 16450018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 248
Target Start/End: Original strand, 39210844 - 39211058
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgat 133  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || | ||||||||| || || |||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39210844 gcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggt 39210943  T
Q  134 caataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 233  Q
     ||| ||| |||  ||||| || || |||||||| || |  || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||  || |||||    
T  39210944 taatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacct 39211043  T
Q  234 tggtggtaatggatc 248  Q
     || ||||| |||||    
T  39211044 gggaggtaacggatc 39211058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4200869 - 4200772
Alignment:
Q  34 gcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttg 131  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||    
T  4200869 gcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttg 4200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 33673774 - 33673922
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  33673774 tggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 33673873  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcag 223  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  33673874 tcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 33673922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21969996 - 21969829
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  21969996 tggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccc 21969897  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||  || |||||||| |||||    
T  21969896 tcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 21969829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665167
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||  || | ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  14665171 agatc 14665167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 31126528 - 31126642
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  31126528 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 31126627  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  31126628 cacatttgagatcag 31126642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14098802 - 14098687
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  14098802 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 14098703  T
Q  209 cacacttgagatcagt 224  Q
    |||| |||||||||||    
T  14098702 cacatttgagatcagt 14098687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 14763314 - 14763428
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  14763314 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 14763413  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  14763414 cacatttgagatcag 14763428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163441
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||  || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  27163435 agatcag 27163441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30754015 - 30753901
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  30754015 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 30753916  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  30753915 cacatttgagatcag 30753901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105762
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || ||||| || ||   | | ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  40105756 agatcag 40105762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6570114 - 6570000
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||| |    
T  6570114 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaat 6570015  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  6570014 cacatttgagatcag 6570000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 18800623 - 18800737
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  18800623 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 18800722  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  18800723 cgcatttgagatcag 18800737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344639
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  217 agatcag 223  Q
    |||||||    
T  36344633 agatcag 36344639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54833648 - 54833534
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  54833648 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 54833549  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  54833548 cacatttgagatcag 54833534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014152
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  17014153 ag 17014152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 24592291 - 24592436
Alignment:
Q  76 ggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctct 175  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| ||    
T  24592291 ggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccct 24592390  T
Q  176 caacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    | ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  24592391 cgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 24592436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850766
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || | ||| | |||||| || || ||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||     
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacattta 39850792  T
Q  217 agatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    |||||||  || |||||||| |||||    
T  39850791 agatcagagcggaaccttggaggtaa 39850766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900394
Alignment:
Q  19 acatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| |||||||||| |||   | | ||||||||||    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  119 tcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    | | ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||  || || |  |||||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  219 atcagtacgaaacct 233  Q
     |||| |||||||||    
T  1900408 gtcagaacgaaacct 1900394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5006134 - 5006020
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  5006134 ttctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 5006035  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  5006034 cacatttgagatcag 5006020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24112983 - 24112790
Alignment:
Q  49 tcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctgga 148  Q
    |||||||| || || |||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  24112983 tcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttga 24112884  T
Q  149 caatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  24112883 cgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 24112790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 242
Target Start/End: Original strand, 34188910 - 34189103
Alignment:
Q  49 tcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctgga 148  Q
    |||||||| || || |||| ||| | ||| || |||||||| |||||||| ||   | ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  34188910 tcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttga 34189009  T
Q  149 caatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaa 242  Q
    | || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||    
T  34189010 cgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaa 34189103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15228131 - 15227992
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||| || | |||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||  || || ||||| || |    
T  15228131 ttctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaat 15228032  T
Q  209 cacacttgagatcagtacgaaaccttggtggtaatggatc 248  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  15228031 cacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatc 15227992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27601 - 27426
Alignment:
Q  46 acttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctct 145  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27601 acttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttct 27502  T
Q  146 ggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
      || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  27501 tcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 27426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9698
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  9812 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaat 9713  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  9712 cacatttgagatcag 9698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30698 - 30584
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  30698 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 30599  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| || |||||||    
T  30598 cacatttaagatcag 30584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20510
Alignment:
Q  19 acatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  119 tcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    | |  |||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||||    
T  20623 tta-atttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  219 atcagtacgaaacct 233  Q
     |||| ||| |||||    
T  20524 gtcagaacggaacct 20510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47107
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  47103 agatc 47107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30043 - 29897
Alignment:
Q  75 tggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||||||| |||| |    
T  30043 tggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccc 29944  T
Q  175 tcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatc 221  Q
    || ||||||||||||| ||| || || || || ||||| ||||||||    
T  29943 tcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatc 29897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40191
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||  || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  40187 agatc 40191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 221
Target Start/End: Original strand, 47 - 251
Alignment:
Q  17 ggacatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaa 116  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||   | | ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  117 agtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  217 agatc 221  Q
    |||||    
T  247 agatc 251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 7249 - 7363
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  7249 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 7348  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  7349 cacatttgagatcag 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 14940 - 15054
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  14940 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagt 15039  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  15040 cacatttgagatcag 15054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 26211 - 26325
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  26211 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 26310  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    |||| ||||||||||    
T  26311 cacatttgagatcag 26325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Original strand, 9076 - 9190
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  9076 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 9175  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  9176 cgcatttgagatcag 9190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20261 - 20147
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagt 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  20261 ttctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagt 20162  T
Q  209 cacacttgagatcag 223  Q
    | || ||||||||||    
T  20161 cgcatttgagatcag 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2051
Alignment:
Q  19 acatctagtttgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaag 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  119 tcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgag 218  Q
    | |  |||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||||    
T  1938 tta-atttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  219 atcagtacgaaacct 233  Q
     |||| ||| |||||    
T  2037 gtcagaacggaacct 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6260 - 6144
Alignment:
Q  109 ttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactt-taaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatg-aaa 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  6260 ttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaa 6161  T
Q  207 gtcacacttgagatcag 223  Q
     ||||| ||||||||||    
T  6160 atcacatttgagatcag 6144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Original strand, 2588 - 2807
Alignment:
Q  29 tgggcgcttcttcatacacttcaatcatgtttactgcagtatggtctggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttcc 128  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||  || |  ||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||    
T  2588 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttcc 2687  T
Q  129 ttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctctcaacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacga 228  Q
    ||| | ||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| || || |  || ||||| |||||||  || || ||||| || ||||||||||| |||| |||     
T  2688 ttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgg 2787  T
Q  229 aaccttggtggtaatggatc 248  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  2788 aacctaggaggtaacggatc 2807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21840 - 21683
Alignment:
Q  76 ggaagaggattatcaaggacatgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcctctggacaatatactttaaagcataacacctct 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||   | |||||| |||||| | |||||| || ||||| ||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||| |  |    
T  21840 ggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatcctt 21741  T
Q  176 caacatcgtgacccaaggccccctgatgaaagtcacacttgagatcagtacgaaacct 233  Q
    ||||||| || ||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||| ||| |||||    
T  21740 caacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacct 21683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University