View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_5 (Length: 748)

Name: NF8890_low_5
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_5
NF8890_low_5
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (14-734)||(27187232-27187952)
chr6 (14-734)||(27261288-27262008)
chr6 (14-734)||(28292137-28292857)
chr6 (14-734)||(28262962-28263682)
chr6 (14-734)||(28341711-28342431)
chr6 (32-732)||(24312935-24313635)
chr6 (32-732)||(29591687-29592387)
chr6 (32-734)||(1542849-1543551)
chr6 (32-732)||(2874570-2875270)
chr6 (32-732)||(16626484-16627184)
chr6 (32-732)||(25112366-25113066)
chr6 (14-732)||(5838986-5839704)
chr6 (14-729)||(19864483-19865198)
chr6 (32-720)||(25609640-25610328)
chr6 (14-723)||(16927416-16928125)
chr6 (14-711)||(16963155-16963852)
chr6 (50-723)||(27331209-27331882)
chr6 (50-723)||(27391949-27392622)
chr6 (50-711)||(22078478-22079137)
chr6 (51-723)||(18407718-18408391)
chr6 (32-723)||(22762231-22762922)
chr6 (32-723)||(23078283-23078974)
chr6 (32-518)||(12497840-12498326)
chr6 (32-518)||(12510575-12511061)
chr6 (278-727)||(22433929-22434378)
chr6 (32-518)||(12505169-12505655)
chr6 (14-477)||(25765312-25765774)
chr6 (14-723)||(21471397-21472106)
chr6 (48-723)||(25768021-25768696)
chr6 (14-723)||(19879094-19879803)
chr6 (14-720)||(15459132-15459838)
chr6 (14-723)||(22796408-22797117)
chr6 (424-711)||(17032589-17032876)
chr6 (14-723)||(34645362-34646071)
chr6 (14-723)||(10468625-10469334)
chr6 (14-723)||(21563908-21564617)
chr6 (14-727)||(11280277-11280990)
chr6 (14-722)||(27560394-27561102)
chr6 (14-722)||(28282590-28283298)
chr6 (97-723)||(17415365-17415991)
chr6 (14-723)||(18794486-18795195)
chr6 (14-720)||(24364208-24364914)
chr6 (110-723)||(14381243-14381856)
chr6 (161-658)||(1640715-1641212)
chr6 (14-536)||(8766111-8766633)
chr6 (32-308)||(21833172-21833448)
chr6 (14-309)||(25750605-25750900)
chr6 (32-238)||(17032376-17032582)
chr6 (50-438)||(18197608-18197996)
chr6 (311-723)||(19453513-19453925)
chr6 (14-315)||(14131363-14131664)
chr6 (14-417)||(11287680-11288083)
chr6 (396-723)||(5296982-5297308)
chr6 (401-722)||(27559765-27560086)
chr6 (149-537)||(18800873-18801261)
chr6 (507-723)||(15896383-15896599)
chr6 (504-723)||(21569767-21569986)
chr6 (224-324)||(11291818-11291918)
chr6 (176-711)||(16382161-16382696)
chr6 (617-732)||(21836964-21837079)
chr6 (570-723)||(8762709-8762862)
chr6 (632-723)||(20637077-20637168)
chr6 (617-723)||(18197504-18197610)
chr6 (176-711)||(16098008-16098543)
chr6 (176-711)||(23996206-23996741)
chr6 (176-711)||(25742876-25743410)
chr6 (14-145)||(22433793-22433924)
chr6 (176-498)||(15078365-15078687)
chr6 (14-139)||(18787684-18787809)
chr6 (180-296)||(25750908-25751024)
chr6 (14-129)||(1640595-1640710)
chr6 (176-711)||(18837696-18838231)
chr6 (189-498)||(21412939-21413248)
chr6 (189-497)||(1648786-1649094)
chr6 (251-711)||(18571684-18572144)
chr6 (661-727)||(22442710-22442776)
chr6 (191-496)||(25655456-25655760)
chr6 (251-466)||(16233242-16233457)
chr6 (608-693)||(23027522-23027607)
chr6 (419-498)||(1652274-1652353)
chr6 (590-711)||(21927577-21927698)
chr6 (591-711)||(1648602-1648722)
chr6 (521-669)||(14625068-14625216)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (27-734)||(109434-110141)
scaffold0029 (14-723)||(112522-113231)
scaffold0029 (14-723)||(95636-96345)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (14-732)||(27668294-27669012)
chr5 (14-732)||(19769824-19770542)
chr5 (32-732)||(40708662-40709362)
chr5 (32-734)||(34566376-34567078)
chr5 (32-734)||(27518289-27518991)
chr5 (32-732)||(22332691-22333391)
chr5 (32-734)||(16356384-16357086)
chr5 (32-732)||(41770724-41771424)
chr5 (32-732)||(14999543-15000243)
chr5 (14-732)||(27610218-27610936)
chr5 (32-732)||(27685204-27685904)
chr5 (32-732)||(37291300-37292000)
chr5 (32-711)||(29475898-29476577)
chr5 (32-732)||(22134550-22135250)
chr5 (41-732)||(22348316-22349005)
chr5 (32-729)||(23573624-23574321)
chr5 (50-732)||(18775677-18776352)
chr5 (14-711)||(23516405-23517102)
chr5 (50-704)||(20798660-20799314)
chr5 (14-691)||(23440089-23440766)
chr5 (32-720)||(25423071-25423759)
chr5 (14-723)||(20467909-20468618)
chr5 (32-593)||(21984248-21984809)
chr5 (93-723)||(21497850-21498479)
chr5 (14-723)||(23471093-23471802)
chr5 (32-723)||(26738540-26739209)
chr5 (226-723)||(21339099-21339596)
chr5 (14-720)||(24749370-24750076)
chr5 (11-723)||(22235733-22236445)
chr5 (14-723)||(21563786-21564488)
chr5 (32-723)||(21890572-21891263)
chr5 (14-720)||(22502525-22503231)
chr5 (14-723)||(22381045-22381754)
chr5 (14-723)||(23079902-23080611)
chr5 (15-720)||(14886807-14887512)
chr5 (14-687)||(22461798-22462471)
chr5 (14-723)||(28923581-28924290)
chr5 (15-720)||(25847922-25848627)
chr5 (15-720)||(20342129-20342834)
chr5 (15-696)||(37545336-37546018)
chr5 (14-722)||(17269148-17269855)
chr5 (14-723)||(20821299-20822008)
chr5 (14-723)||(28894755-28895464)
chr5 (14-711)||(20773606-20774302)
chr5 (15-720)||(24798213-24798918)
chr5 (14-613)||(21404700-21405285)
chr5 (14-465)||(24735682-24736133)
chr5 (14-357)||(23442472-23442815)
chr5 (281-723)||(21831574-21831998)
chr5 (14-309)||(24737012-24737307)
chr5 (414-645)||(919-1150)
chr5 (485-720)||(24716342-24716577)
chr5 (14-255)||(20573385-20573626)
chr5 (491-720)||(24620111-24620340)
chr5 (432-723)||(28916226-28916517)
chr5 (32-228)||(21343666-21343862)
chr5 (14-279)||(21662297-21662561)
chr5 (491-723)||(21496481-21496713)
chr5 (176-711)||(21937013-21937548)
chr5 (609-723)||(21407597-21407711)
chr5 (176-711)||(24581219-24581753)
chr5 (176-711)||(27011092-27011627)
chr5 (176-498)||(11210732-11211054)
chr5 (49-279)||(21665758-21665987)
chr5 (14-102)||(21625382-21625470)
chr5 (563-711)||(25244175-25244323)
chr5 (563-711)||(25308327-25308475)
chr5 (251-466)||(23503526-23503741)
chr5 (401-468)||(21229241-21229308)
chr5 (563-624)||(16065604-16065665)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (32-734)||(15589251-15589953)
chr3 (14-723)||(53384888-53385597)
chr3 (32-734)||(20061913-20062615)
chr3 (32-734)||(10005169-10005871)
chr3 (32-734)||(10905779-10906481)
chr3 (32-734)||(48425016-48425718)
chr3 (14-734)||(16756444-16757164)
chr3 (32-734)||(16635342-16636044)
chr3 (32-734)||(43162666-43163368)
chr3 (32-732)||(15348106-15348806)
chr3 (14-734)||(6600298-6601007)
chr3 (32-732)||(13252259-13252959)
chr3 (14-732)||(5424791-5425508)
chr3 (50-732)||(15402371-15403053)
chr3 (32-732)||(15724795-15725494)
chr3 (32-732)||(26792260-26792960)
chr3 (32-732)||(15338838-15339538)
chr3 (32-732)||(16412143-16412843)
chr3 (14-732)||(12497799-12498517)
chr3 (14-732)||(14876360-14877078)
chr3 (14-732)||(16806787-16807505)
chr3 (50-729)||(16371000-16371679)
chr3 (32-723)||(17489419-17490110)
chr3 (32-732)||(16691729-16692433)
chr3 (32-723)||(16492051-16492742)
chr3 (32-723)||(9522288-9522979)
chr3 (50-723)||(15247734-15248407)
chr3 (14-723)||(15208442-15209151)
chr3 (14-723)||(15227210-15227919)
chr3 (14-723)||(13322511-13323220)
chr3 (18-723)||(15952827-15953532)
chr3 (17-723)||(13971979-13972685)
chr3 (17-723)||(14086237-14086943)
chr3 (14-713)||(18134215-18134914)
chr3 (17-723)||(12360401-12361107)
chr3 (14-722)||(8758942-8759650)
chr3 (14-722)||(41177083-41177791)
chr3 (422-729)||(11564545-11564852)
chr3 (14-720)||(13941585-13942291)
chr3 (206-715)||(15015634-15016131)
chr3 (14-723)||(11303632-11304341)
chr3 (443-723)||(14126464-14126744)
chr3 (14-722)||(44776808-44777516)
chr3 (15-720)||(10383531-10384235)
chr3 (15-720)||(47123506-47124211)
chr3 (14-720)||(10419907-10420613)
chr3 (14-722)||(16836370-16837072)
chr3 (14-624)||(11960992-11961602)
chr3 (86-723)||(12850138-12850775)
chr3 (17-723)||(16329520-16330224)
chr3 (484-729)||(15061777-15062022)
chr3 (18-722)||(16380788-16381491)
chr3 (380-720)||(28754245-28754585)
chr3 (386-723)||(17492563-17492900)
chr3 (413-723)||(14573889-14574199)
chr3 (380-717)||(4678365-4678702)
chr3 (14-315)||(14571409-14571710)
chr3 (344-615)||(13001800-13002070)
chr3 (386-627)||(26008948-26009189)
chr3 (176-711)||(8274281-8274816)
chr3 (569-723)||(16828061-16828215)
chr3 (176-711)||(16742585-16743120)
chr3 (176-710)||(15576473-15577007)
chr3 (14-138)||(31689067-31689191)
chr3 (14-138)||(31945033-31945157)
chr3 (503-723)||(16338371-16338591)
chr3 (189-704)||(18748401-18748916)
chr3 (14-75)||(12854365-12854426)
chr3 (224-466)||(17192865-17193107)
chr3 (249-463)||(6712539-6712753)
chr3 (176-466)||(13975172-13975462)
chr3 (326-498)||(14183007-14183179)
chr3 (562-711)||(6152733-6152882)
chr3 (541-711)||(13967222-13967392)
chr3 (14-46)||(14542883-14542915)
chr3 (392-466)||(6152978-6153052)
chr3 (584-678)||(17193224-17193318)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (32-734)||(16998581-16999283)
chr2 (32-734)||(16981733-16982435)
chr2 (32-734)||(17063298-17064000)
chr2 (32-734)||(9609717-9610419)
chr2 (32-734)||(10868431-10869133)
chr2 (32-734)||(27217597-27218299)
chr2 (14-732)||(44385731-44386449)
chr2 (32-732)||(22325018-22325718)
chr2 (32-734)||(17066959-17067658)
chr2 (32-732)||(24261951-24262651)
chr2 (32-732)||(24709614-24710314)
chr2 (32-732)||(27370850-27371550)
chr2 (32-734)||(21145201-21145892)
chr2 (32-723)||(23188589-23189279)
chr2 (50-729)||(24675088-24675767)
chr2 (32-729)||(24707647-24708344)
chr2 (14-729)||(21325431-21326146)
chr2 (32-569)||(16924841-16925378)
chr2 (41-570)||(24878319-24878848)
chr2 (14-729)||(22756630-22757343)
chr2 (49-720)||(23063675-23064346)
chr2 (346-732)||(41608547-41608933)
chr2 (109-704)||(24825472-24826067)
chr2 (14-723)||(30211088-30211797)
chr2 (50-723)||(45529116-45529783)
chr2 (14-723)||(23276339-23277048)
chr2 (17-723)||(27365250-27365956)
chr2 (14-723)||(23293521-23294230)
chr2 (14-612)||(23087013-23087611)
chr2 (14-722)||(27787304-27788012)
chr2 (15-720)||(20832549-20833254)
chr2 (14-711)||(11358057-11358754)
chr2 (15-720)||(31830222-31830927)
chr2 (14-722)||(12573916-12574624)
chr2 (15-720)||(1063315-1064020)
chr2 (32-324)||(23138618-23138910)
chr2 (32-324)||(23550408-23550700)
chr2 (50-264)||(27377101-27377315)
chr2 (572-734)||(16923010-16923172)
chr2 (570-734)||(16925479-16925643)
chr2 (386-723)||(19652223-19652557)
chr2 (577-732)||(20442675-20442830)
chr2 (565-732)||(24876911-24877078)
chr2 (14-191)||(41609047-41609224)
chr2 (419-720)||(20828227-20828528)
chr2 (14-291)||(24653908-24654185)
chr2 (426-723)||(24948564-24948861)
chr2 (14-220)||(24944930-24945136)
chr2 (190-711)||(22276018-22276538)
chr2 (542-720)||(21125331-21125509)
chr2 (635-723)||(23107901-23107989)
chr2 (228-656)||(23817291-23817719)
chr2 (608-723)||(23110892-23111007)
chr2 (569-723)||(24641860-24642014)
chr2 (176-498)||(12640315-12640637)
chr2 (176-711)||(24831370-24831905)
chr2 (278-711)||(25128474-25128907)
chr2 (224-711)||(22761752-22762239)
chr2 (189-711)||(24569851-24570373)
chr2 (278-332)||(27368394-27368448)
chr2 (14-112)||(24833355-24833453)
chr2 (422-498)||(23890753-23890829)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (27-732)||(16350293-16350998)
chr1 (50-732)||(51333187-51333869)
chr1 (32-732)||(33390723-33391423)
chr1 (32-732)||(19106332-19107032)
chr1 (32-732)||(21830268-21830968)
chr1 (14-693)||(41354202-41354881)
chr1 (32-732)||(21836915-21837615)
chr1 (32-732)||(17044709-17045409)
chr1 (32-732)||(16078350-16079027)
chr1 (32-711)||(50619959-50620638)
chr1 (41-723)||(16369271-16369953)
chr1 (32-595)||(20249815-20250378)
chr1 (50-605)||(20136761-20137316)
chr1 (14-723)||(19760569-19761278)
chr1 (14-720)||(19854261-19854966)
chr1 (32-468)||(21747500-21747935)
chr1 (14-719)||(20939770-20940475)
chr1 (14-725)||(22432817-22433528)
chr1 (15-720)||(37677027-37677733)
chr1 (14-711)||(20856476-20857173)
chr1 (14-720)||(20294359-20295065)
chr1 (86-723)||(20835591-20836231)
chr1 (474-723)||(21749348-21749597)
chr1 (17-357)||(19664945-19665285)
chr1 (149-653)||(41307907-41308411)
chr1 (503-723)||(22361947-22362167)
chr1 (14-471)||(31550136-31550593)
chr1 (14-304)||(20244147-20244437)
chr1 (452-723)||(24099306-24099577)
chr1 (32-240)||(50612602-50612810)
chr1 (419-723)||(19662844-19663143)
chr1 (17-315)||(20075170-20075468)
chr1 (476-720)||(31539703-31539947)
chr1 (598-723)||(20139361-20139486)
chr1 (176-711)||(20831107-20831642)
chr1 (14-165)||(21163227-21163378)
chr1 (147-315)||(11382674-11382842)
chr1 (15-225)||(20395194-20395404)
chr1 (641-711)||(20250376-20250446)
chr1 (14-102)||(24476927-24477015)
chr1 (176-711)||(20914319-20914854)
chr1 (228-464)||(22135520-22135756)
chr1 (189-342)||(21202371-21202524)
chr1 (562-711)||(22135272-22135421)
chr1 (686-731)||(41353357-41353402)
chr1 (176-350)||(46518830-46519004)
chr1 (569-678)||(20184683-20184792)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (32-734)||(8386362-8387064)
chr4 (32-732)||(18297155-18297855)
chr4 (14-730)||(19778157-19778873)
chr4 (32-734)||(29038764-29039466)
chr4 (32-734)||(12476550-12477252)
chr4 (27-732)||(27711281-27711986)
chr4 (32-732)||(14303340-14304039)
chr4 (32-732)||(23955697-23956397)
chr4 (32-732)||(40472990-40473690)
chr4 (32-734)||(12523626-12524328)
chr4 (32-732)||(8052985-8053685)
chr4 (32-734)||(14680517-14681219)
chr4 (14-625)||(14266368-14266979)
chr4 (32-729)||(16251810-16252507)
chr4 (32-732)||(18226808-18227508)
chr4 (14-723)||(16354816-16355525)
chr4 (32-726)||(7090383-7091076)
chr4 (14-723)||(14850737-14851446)
chr4 (221-726)||(1639793-1640298)
chr4 (355-729)||(15147249-15147623)
chr4 (14-545)||(14159424-14159955)
chr4 (14-723)||(15002995-15003704)
chr4 (14-528)||(14652240-14652754)
chr4 (14-723)||(15245856-15246565)
chr4 (14-723)||(1648908-1649617)
chr4 (242-723)||(8706078-8706559)
chr4 (15-720)||(3264428-3265133)
chr4 (15-720)||(11206865-11207570)
chr4 (15-720)||(29453171-29453876)
chr4 (222-723)||(15414657-15415158)
chr4 (26-723)||(33222862-33223564)
chr4 (17-627)||(16145847-16146459)
chr4 (17-723)||(20890918-20891623)
chr4 (14-531)||(15070345-15070862)
chr4 (32-276)||(15364336-15364580)
chr4 (14-720)||(44661500-44662206)
chr4 (50-360)||(15149740-15150050)
chr4 (149-723)||(15358721-15359295)
chr4 (158-723)||(27900462-27901027)
chr4 (272-723)||(15077825-15078276)
chr4 (14-537)||(51605998-51606521)
chr4 (533-723)||(14691353-14691543)
chr4 (217-380)||(16676417-16676580)
chr4 (582-723)||(14159970-14160111)
chr4 (14-282)||(42702835-42703103)
chr4 (251-669)||(13247814-13248232)
chr4 (572-723)||(15319641-15319792)
chr4 (176-711)||(14997410-14997945)
chr4 (32-202)||(14927151-14927321)
chr4 (176-711)||(9290929-9291464)
chr4 (176-498)||(15293013-15293335)
chr4 (176-498)||(55375214-55375536)
chr4 (158-315)||(16752669-16752826)
chr4 (14-119)||(15415214-15415319)
chr4 (189-466)||(12132298-12132574)
chr4 (14-139)||(15319515-15319640)
chr4 (14-75)||(15359336-15359397)
chr4 (249-669)||(12342548-12342968)
chr4 (32-101)||(18607823-18607892)
chr4 (69-211)||(18164332-18164474)
chr4 (176-332)||(16445234-16445390)
chr4 (580-720)||(18549694-18549834)
chr4 (386-498)||(16685557-16685669)
chr4 (584-623)||(15423974-15424013)
chr4 (350-465)||(18549949-18550064)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (50-734)||(18177699-18178383)
chr7 (32-734)||(8198567-8199269)
chr7 (14-734)||(10870916-10871636)
chr7 (32-732)||(11236844-11237544)
chr7 (32-732)||(15160688-15161388)
chr7 (32-734)||(44790980-44791682)
chr7 (32-732)||(8707544-8708244)
chr7 (32-732)||(18551389-18552089)
chr7 (32-732)||(14332336-14333036)
chr7 (32-732)||(13686002-13686703)
chr7 (32-734)||(11552731-11553433)
chr7 (32-734)||(12687440-12688142)
chr7 (32-732)||(16947-17647)
chr7 (32-734)||(14954559-14955261)
chr7 (14-612)||(23516520-23517118)
chr7 (32-726)||(15154294-15154983)
chr7 (272-732)||(9596236-9596696)
chr7 (14-723)||(12206418-12207127)
chr7 (86-723)||(15624545-15625182)
chr7 (14-723)||(15102221-15102928)
chr7 (14-723)||(14263862-14264571)
chr7 (14-723)||(19147133-19147842)
chr7 (14-723)||(20746532-20747241)
chr7 (32-603)||(15203818-15204389)
chr7 (27-723)||(11388046-11388741)
chr7 (14-723)||(21661885-21662591)
chr7 (242-723)||(11771881-11772362)
chr7 (29-723)||(16071912-16072606)
chr7 (11-723)||(6413430-6414142)
chr7 (14-722)||(18053572-18054280)
chr7 (23-720)||(8211749-8212446)
chr7 (15-720)||(11305884-11306589)
chr7 (14-723)||(13021279-13021988)
chr7 (14-723)||(14285994-14286703)
chr7 (15-720)||(49152224-49152929)
chr7 (28-723)||(16950089-16950784)
chr7 (14-722)||(14129795-14130503)
chr7 (14-723)||(13665475-13666168)
chr7 (383-723)||(14039986-14040326)
chr7 (383-723)||(14350016-14350356)
chr7 (14-722)||(14433613-14434321)
chr7 (14-720)||(23505491-23506197)
chr7 (26-723)||(1025-1722)
chr7 (14-666)||(23199418-23200070)
chr7 (197-567)||(35964646-35965016)
chr7 (14-723)||(12455625-12456333)
chr7 (50-378)||(14037764-14038092)
chr7 (50-378)||(14347794-14348122)
chr7 (147-720)||(26118226-26118799)
chr7 (248-722)||(15340587-15341061)
chr7 (383-720)||(13968289-13968626)
chr7 (608-734)||(23203242-23203368)
chr7 (608-734)||(23509369-23509495)
chr7 (253-611)||(12456940-12457298)
chr7 (189-711)||(14936443-14936965)
chr7 (14-315)||(26288063-26288363)
chr7 (176-711)||(4440011-4440546)
chr7 (176-711)||(7823983-7824518)
chr7 (176-711)||(27107426-27107961)
chr7 (189-711)||(15364036-15364558)
chr7 (14-170)||(15340418-15340574)
chr7 (224-466)||(12368473-12368715)
chr7 (176-711)||(21674185-21674720)
chr7 (279-435)||(12193742-12193898)
chr7 (380-669)||(45146842-45147131)
chr7 (14-139)||(15479340-15479465)
chr7 (14-119)||(26118806-26118911)
chr7 (182-719)||(40790-41327)
chr7 (590-711)||(17924148-17924269)
chr7 (596-704)||(23641951-23642059)
chr7 (563-685)||(15171642-15171764)
chr7 (191-332)||(13378796-13378937)
chr7 (380-498)||(13353438-13353556)
chr7 (629-687)||(17144936-17144994)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (14-730)||(17674090-17674806)
chr8 (32-732)||(19112706-19113406)
chr8 (14-693)||(19484974-19485653)
chr8 (32-682)||(20017865-20018515)
chr8 (32-732)||(22120239-22120939)
chr8 (32-732)||(30313209-30313909)
chr8 (32-713)||(15533396-15534077)
chr8 (50-732)||(32600178-32600860)
chr8 (50-711)||(22133127-22133788)
chr8 (32-732)||(22046389-22047089)
chr8 (54-711)||(16408131-16408788)
chr8 (32-732)||(19977983-19978683)
chr8 (32-711)||(22164278-22164956)
chr8 (14-729)||(21166606-21167320)
chr8 (32-723)||(23650057-23650748)
chr8 (32-723)||(21921809-21922500)
chr8 (32-723)||(21250958-21251648)
chr8 (32-723)||(21788433-21789123)
chr8 (32-723)||(21393939-21394630)
chr8 (292-732)||(18856853-18857293)
chr8 (14-723)||(22987199-22987903)
chr8 (319-732)||(22040162-22040575)
chr8 (171-723)||(22377528-22378079)
chr8 (171-723)||(22383703-22384254)
chr8 (17-723)||(20396199-20396905)
chr8 (26-711)||(20388109-20388794)
chr8 (14-723)||(23654925-23655634)
chr8 (14-711)||(19851409-19852106)
chr8 (14-711)||(19857445-19858142)
chr8 (14-723)||(1266237-1266945)
chr8 (14-723)||(22061507-22062216)
chr8 (14-723)||(31416548-31417257)
chr8 (254-721)||(23949158-23949624)
chr8 (14-723)||(20009974-20010683)
chr8 (14-723)||(21840415-21841124)
chr8 (14-723)||(29303500-29304209)
chr8 (15-720)||(14565141-14565846)
chr8 (14-722)||(31570917-31571625)
chr8 (15-720)||(6679110-6679815)
chr8 (15-720)||(803750-804455)
chr8 (15-720)||(6603657-6604362)
chr8 (14-720)||(12304756-12305462)
chr8 (161-722)||(22051008-22051569)
chr8 (14-411)||(21681856-21682253)
chr8 (32-323)||(22032048-22032339)
chr8 (386-723)||(20975725-20976062)
chr8 (14-429)||(20007848-20008263)
chr8 (14-402)||(21324804-21325193)
chr8 (383-720)||(16271301-16271638)
chr8 (14-289)||(23948887-23949162)
chr8 (50-255)||(15441215-15441420)
chr8 (14-288)||(16265127-16265401)
chr8 (447-723)||(22371371-22371647)
chr8 (503-720)||(27355035-27355252)
chr8 (176-711)||(16877181-16877716)
chr8 (189-711)||(22315364-22315886)
chr8 (176-711)||(21196588-21197123)
chr8 (15-226)||(27347225-27347436)
chr8 (15-291)||(28982356-28982632)
chr8 (15-291)||(28987576-28987852)
chr8 (605-732)||(22129005-22129132)
chr8 (176-711)||(21850423-21850958)
chr8 (176-495)||(20652635-20652954)
chr8 (176-711)||(22982596-22983128)
chr8 (380-711)||(23157098-23157428)
chr8 (686-731)||(19484130-19484175)
chr8 (562-711)||(23900822-23900971)
chr8 (599-725)||(19863639-19863765)
chr8 (599-725)||(19868276-19868402)
chr8 (182-465)||(19863223-19863506)
chr8 (182-465)||(19867860-19868143)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (14-732)||(377-1095)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (32-734)||(43135-43837)
scaffold0028 (41-732)||(8475-9155)
scaffold0028 (345-732)||(15241-15617)
scaffold0028 (17-723)||(50148-50854)
scaffold0028 (217-348)||(13832-13963)
scaffold0028 (176-704)||(106226-106754)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (32-732)||(601-1301)
scaffold0044 (32-732)||(14341-15041)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (32-732)||(6918-7620)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (32-732)||(7358-8047)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (32-732)||(65386-66086)
scaffold0042 (270-711)||(39466-39906)
scaffold0042 (14-220)||(39926-40132)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (14-732)||(33198-33916)
scaffold0109 (50-732)||(8595-9277)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (50-732)||(4030-4712)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (16-729)||(278458-279171)
scaffold0005 (50-373)||(308658-308981)
scaffold0005 (14-528)||(164538-165052)
scaffold0005 (14-722)||(260271-260979)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (32-723)||(6353-7044)
scaffold0403 (413-718)||(3153-3458)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (173-732)||(7519-8078)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (115-732)||(7854-8471)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (32-723)||(6004-6695)
scaffold0120 (37-723)||(1158-1844)
scaffold0120 (176-437)||(22819-23080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (14-729)||(63659-64374)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (14-728)||(5977-6691)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (116-732)||(21932-22548)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (32-725)||(657-1350)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (14-729)||(451-1165)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (49-723)||(14037-14711)
scaffold0106 (269-732)||(17660-18122)
scaffold0106 (14-723)||(31373-32082)
scaffold0106 (655-723)||(18489-18557)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (32-723)||(328-1018)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (50-723)||(5220-5893)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (50-723)||(9342-10015)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (32-723)||(229024-229715)
scaffold0012 (14-723)||(219051-219760)
scaffold0012 (176-687)||(32667-33176)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (14-723)||(14713-15422)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (64-723)||(49506-50165)
scaffold0081 (570-729)||(19121-19280)
scaffold0081 (629-729)||(34604-34704)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (32-729)||(180198-180877)
scaffold0020 (445-723)||(101186-101464)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (32-723)||(32387-33077)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (302-732)||(12738-13168)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (14-723)||(25353-26062)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (14-723)||(14840-15549)
scaffold0040 (491-723)||(113121-113353)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (14-723)||(111984-112693)
scaffold0004 (14-723)||(203102-203811)
scaffold0004 (15-723)||(117532-118240)
scaffold0004 (14-723)||(322667-323376)
scaffold0004 (14-723)||(385782-386491)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (32-723)||(26167-26858)
scaffold0011 (14-723)||(195338-196045)
scaffold0011 (14-719)||(148533-149238)
scaffold0011 (14-220)||(68577-68783)
scaffold0011 (176-466)||(121841-122131)
scaffold0011 (278-498)||(180151-180371)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (26-723)||(883-1580)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (14-719)||(3995-4699)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (41-723)||(3130-3812)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (50-711)||(1004-1659)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (32-600)||(1120-1688)
scaffold0894 (591-723)||(2914-3046)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (32-645)||(126911-127524)
scaffold0022 (532-723)||(80128-80319)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (50-723)||(116539-117212)
scaffold0037 (176-648)||(98140-98612)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (14-726)||(24702-25414)
[»] scaffold0507 (4 HSPs)
scaffold0507 (128-723)||(9047-9642)
scaffold0507 (176-339)||(351-514)
scaffold0507 (14-123)||(6940-7049)
scaffold0507 (380-495)||(216-331)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (228-723)||(15832-16327)
scaffold0333 (32-388)||(15474-15829)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (14-723)||(16050-16759)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (152-509)||(628-985)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (14-720)||(41970-42676)
scaffold0010 (14-723)||(47033-47742)
scaffold0010 (470-719)||(2340-2589)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (14-723)||(3838-4547)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (52-701)||(12633-13282)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (14-672)||(10425-11082)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (14-723)||(5225-5933)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (14-723)||(90566-91275)
scaffold0001 (14-507)||(448022-448515)
scaffold0001 (491-723)||(390834-391066)
scaffold0001 (32-314)||(162094-162376)
scaffold0001 (413-666)||(114542-114795)
scaffold0001 (149-219)||(175361-175431)
scaffold0001 (638-723)||(89888-89973)
scaffold0001 (176-320)||(78666-78810)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (14-723)||(9761-10465)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (14-723)||(19946-20655)
scaffold0298 (14-723)||(12995-13704)
scaffold0298 (14-723)||(16765-17474)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (14-693)||(27482-28161)
scaffold0139 (14-719)||(787-1491)
scaffold0139 (569-693)||(34290-34414)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (14-723)||(13535-14244)
scaffold0034 (86-723)||(4587-5224)
scaffold0034 (578-723)||(67897-68042)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (14-723)||(6670-7379)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (338-711)||(6336-6709)
scaffold0358 (32-111)||(6254-6333)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-723)||(27192-27897)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (250-726)||(4085-4561)
scaffold0023 (435-723)||(130532-130820)
scaffold0023 (269-723)||(58972-59426)
scaffold0023 (573-729)||(29008-29163)
scaffold0023 (435-537)||(134626-134728)
scaffold0023 (65-215)||(4567-4717)
scaffold0023 (14-102)||(18993-19081)
scaffold0023 (41-129)||(36974-37062)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (17-723)||(48841-49547)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (18-723)||(47091-47796)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (14-723)||(60848-61556)
scaffold0067 (14-723)||(51814-52522)
scaffold0067 (47-723)||(67236-67911)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-723)||(51497-52206)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (17-723)||(33311-34017)
scaffold0076 (176-711)||(40383-40918)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (14-723)||(18171-18880)
scaffold0326 (14-75)||(3637-3698)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (14-723)||(26105-26814)
scaffold0192 (389-723)||(26862-27196)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (14-723)||(39702-40410)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (14-723)||(28402-29112)
scaffold0064 (14-723)||(40393-41103)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (14-723)||(6146-6856)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (365-723)||(10-368)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (14-723)||(21305-22014)
scaffold0235 (251-498)||(26006-26253)
scaffold0235 (533-669)||(26288-26424)
scaffold0235 (650-723)||(11091-11164)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (14-658)||(9782-10426)
scaffold0483 (617-723)||(12060-12166)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (14-723)||(19083-19792)
scaffold0058 (95-315)||(58448-58668)
scaffold0058 (14-75)||(59054-59115)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (14-723)||(248576-249285)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (50-524)||(1-475)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (14-723)||(61-770)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (14-723)||(42746-43455)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (14-723)||(48668-49376)
scaffold0053 (14-663)||(57511-58159)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (14-723)||(491-1200)
scaffold0104 (656-723)||(12582-12649)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (14-710)||(37165-37861)
scaffold0026 (149-427)||(38103-38382)
scaffold0026 (149-309)||(27385-27545)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (14-723)||(2714-3423)
scaffold0035 (599-720)||(12833-12954)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (61-723)||(4760-5422)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (14-723)||(10851-11560)
scaffold0124 (14-723)||(38-742)
scaffold0124 (176-711)||(7456-7991)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (374-723)||(7963-8311)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (338-723)||(1552-1937)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (50-514)||(16986-17450)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (354-603)||(46531-46780)
scaffold0007 (14-713)||(86154-86847)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (14-723)||(6872-7577)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (14-720)||(16350-17056)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (17-723)||(43471-44177)
scaffold0114 (17-723)||(44483-45189)
scaffold0114 (17-666)||(20088-20737)
scaffold0114 (17-216)||(36021-36220)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (14-711)||(18812-19509)
scaffold0090 (149-711)||(23109-23671)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (431-729)||(197106-197404)
scaffold0017 (380-498)||(21927-22045)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (14-711)||(25511-26208)
scaffold0113 (14-315)||(16639-16940)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (14-723)||(26224-26933)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (14-722)||(12420-13124)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (14-515)||(5756-6256)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (14-614)||(13994-14594)
scaffold0203 (14-195)||(9039-9220)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (32-447)||(16375-16790)
scaffold0138 (650-723)||(8721-8794)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (491-729)||(4727-4965)
scaffold0761 (176-711)||(32-567)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (165-723)||(1908-2466)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (182-723)||(1-541)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (147-723)||(10865-11441)
scaffold0518 (14-58)||(10787-10831)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (482-729)||(3442-3689)
scaffold0375 (266-382)||(3694-3810)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (147-723)||(5309-5885)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (483-723)||(19636-19876)
scaffold0324 (41-236)||(16947-17142)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (381-647)||(1-267)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (443-723)||(18839-19119)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (269-720)||(2992-3443)
scaffold0222 (14-138)||(3487-3611)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (50-411)||(206-567)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (541-723)||(25464-25646)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (266-723)||(5086-5543)
[»] scaffold0682 (2 HSPs)
scaffold0682 (14-332)||(154-472)
scaffold0682 (638-723)||(470-555)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (206-711)||(880-1385)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (14-315)||(27930-28231)
scaffold0198 (650-729)||(24097-24176)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (32-309)||(30-307)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (14-447)||(4912-5345)
scaffold0249 (442-711)||(1618-1887)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (14-441)||(3854-4281)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (14-315)||(1211-1512)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (494-723)||(11302-11531)
scaffold0149 (503-723)||(6871-7091)
scaffold0149 (49-230)||(13380-13561)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (14-315)||(14049-14349)
scaffold0266 (521-711)||(9507-9697)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (482-723)||(2509-2750)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (248-685)||(86-523)
scaffold1710 (176-321)||(946-1091)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (15-483)||(38761-39229)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (387-723)||(5969-6307)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (14-259)||(1140-1385)
scaffold0165 (505-723)||(4884-5102)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (428-710)||(4945-5227)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (14-279)||(4217-4482)
scaffold0574 (569-722)||(844-997)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (572-723)||(1988-2139)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (482-723)||(41350-41589)
scaffold0126 (14-138)||(45807-45932)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (14-210)||(136082-136278)
scaffold0019 (419-531)||(136278-136390)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (176-711)||(46279-46814)
scaffold0066 (521-723)||(68225-68427)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (14-200)||(2023-2208)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (176-711)||(23519-24054)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (380-711)||(7497-7828)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (605-723)||(4425-4543)
scaffold0270 (605-723)||(11555-11673)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (176-711)||(14383-14918)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (483-723)||(32953-33193)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (176-711)||(3284-3818)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (569-684)||(17877-17992)
scaffold0244 (251-555)||(25959-26263)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (176-711)||(13033-13568)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (189-498)||(913-1222)
scaffold0808 (584-711)||(700-827)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (638-723)||(39645-39730)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (176-711)||(3521-4056)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (278-497)||(71446-71665)
scaffold0021 (596-711)||(33059-33174)
scaffold0021 (197-332)||(13397-13532)
scaffold0021 (617-711)||(24529-24623)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (189-466)||(14661-14938)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (176-711)||(24005-24540)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (251-488)||(1293-1530)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (14-101)||(9182-9269)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (176-711)||(27912-28447)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (596-719)||(81470-81593)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (17-119)||(875-977)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (224-711)||(3590-4077)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (189-498)||(9125-9434)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (176-711)||(14782-15316)
scaffold0132 (251-711)||(43738-44198)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (562-704)||(11167-11309)
scaffold0305 (380-466)||(10985-11071)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (249-500)||(8748-8999)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (569-711)||(5693-5835)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (541-711)||(18541-18711)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (189-321)||(5879-6011)
scaffold0447 (189-321)||(10493-10625)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (392-711)||(14478-14798)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (189-321)||(8488-8620)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (532-711)||(3565-3744)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (14-75)||(1-62)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (392-496)||(2897-3001)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (419-498)||(17-96)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (650-723)||(2187-2260)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 609; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187952
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27187531  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27187532 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcc 27187631  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187632 tgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 27187731  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27187732 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 27187831  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27187832 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 27187931  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  27187932 gcttcacaatctccttgatgt 27187952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261288
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27261709  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27261708 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcc 27261609  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261608 tgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 27261509  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27261508 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 27261409  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27261408 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 27261309  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  27261308 gcttcacaatctccttgatgt 27261288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292137
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28292558  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28292557 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttc 28292458  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  28292457 tgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccga 28292358  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28292357 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 28292258  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28292257 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 28292158  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  28292157 gcttcacaatctctttgatgt 28292137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28262962
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28263383  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28263382 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttc 28263283  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28263282 tgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtccca 28263183  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28263182 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactc 28263083  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28263082 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 28262983  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
     ||||| ||| || |||||||    
T  28262982 acttcaaaatctctttgatgt 28262962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28341711
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28342132  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28342131 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttc 28342032  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28342031 tgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtccca 28341932  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28341931 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactc 28341832  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28341831 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 28341732  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
     ||||| ||| || |||||||    
T  28341731 acttcaaaatctctttgatgt 28341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 24313635 - 24312935
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24313635 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24313536  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24313535 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24313436  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313435 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 24313336  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313335 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 24313236  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24313235 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaag 24313136  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24313135 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 24313036  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24313035 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24312936  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  24312935 t 24312935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 29592387 - 29591687
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29592387 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29592288  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29592287 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 29592188  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592187 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 29592088  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592087 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 29591988  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29591987 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgag 29591888  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  29591887 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaaccc 29591788  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  29591787 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttga 29591688  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  29591687 t 29591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 1543551 - 1542849
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1543551 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 1543452  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1543451 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaa 1543352  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1543351 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatc 1543252  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1543251 ttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatata 1543152  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543151 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaag 1543052  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1543051 aacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 1542952  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  1542951 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaa 1542852  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  1542851 tgt 1542849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 2875270 - 2874570
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2875270 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 2875171  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2875170 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 2875071  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2875070 aaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 2874971  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2874970 cgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatata 2874871  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874870 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 2874771  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2874770 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 2874671  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  2874670 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttga 2874571  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  2874570 t 2874570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16627184 - 16626484
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16627184 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16627085  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16627084 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16626985  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16626984 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 16626885  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626884 tgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16626785  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626784 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16626685  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||    
T  16626684 aacacaaattttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaaccc 16626585  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16626584 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16626485  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  16626484 t 16626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 25112366 - 25113066
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25112366 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 25112465  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25112466 ttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 25112565  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25112566 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatc 25112665  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25112666 tgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatata 25112765  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112766 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 25112865  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  25112866 aacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaaccc 25112965  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  25112966 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 25113065  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  25113066 t 25113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5838986
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5839405  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  5839404 attttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttc 5839305  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5839304 tacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaacggaagatgactatccca 5839205  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5839204 agttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 5839105  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5839104 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 5839005  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     ||||||||||||||||||    
T  5839004 acttcacaatttccttgat 5838986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 729
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19865198
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19864782  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19864783 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttc 19864882  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19864883 tgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccattccaataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagccca 19864982  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19864983 ggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 19865082  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19865083 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaa 19865182  T
Q  714 gcttcacaatttcctt 729  Q
     ||||||||| |||||    
T  19865183 acttcacaatctcctt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 25610328 - 25609640
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  25610328 acatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccg 25610229  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||    
T  25610228 ttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaa 25610129  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  25610128 aaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatc 25610029  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25610028 ttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccataca 25609929  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609928 aagcatcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 25609829  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  25609828 tacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaaccc 25609729  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25609728 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927416
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttc 16927826  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| |||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16927825 atcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttc 16927726  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  16927725 tgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtccca 16927626  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16927625 agttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 16927526  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16927525 aacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgca 16927426  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  16927425 acttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963155
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | || ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16963553  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  16963552 atcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttc 16963453  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  16963452 tgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtccca 16963353  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||| | |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16963352 agtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaattctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactc 16963253  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16963252 aacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 27331882 - 27331209
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | |    
T  27331882 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 27331783  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27331782 tctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttc 27331683  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  27331682 ttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtt 27331583  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27331582 tgttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgcca 27331483  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27331482 ttccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaa 27331383  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  27331382 gtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaactt 27331283  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27331282 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 27392622 - 27391949
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | |    
T  27392622 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 27392523  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27392522 tctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttc 27392423  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  27392422 ttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtt 27392323  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27392322 tgttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgcca 27392223  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27392222 ttccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaa 27392123  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  27392122 gtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaactt 27392023  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27392022 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22079137 - 22078478
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |    
T  22079137 acatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgata 22079038  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22079037 tctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 22078938  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||| |||    
T  22078937 ttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtt 22078838  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22078837 tgttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgcca 22078738  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||    
T  22078737 ttccaatactagaa--ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaa 22078640  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22078639 atcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaactt 22078540  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078539 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 18408391 - 18407718
Alignment:
Q  51 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  18408391 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 18408292  T
Q  151 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 250  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  18408291 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttct 18408192  T
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  18408191 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagttt 18408092  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18408091 gttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 18407992  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctatta-ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18407991 tccaatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaa 18407892  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18407891 atcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactt 18407792  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18407791 ttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22762922 - 22762231
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||    
T  22762922 acatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcg 22762823  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  22762822 ttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcac 22762723  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||    
T  22762722 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatc 22762623  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22762622 ttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacaca 22762523  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22762522 aagtctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcctcaag 22762423  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||     
T  22762422 tacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacct 22762323  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22762322 aaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 23078283 - 23078974
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23078283 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 23078382  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||||||    
T  23078383 tttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 23078482  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  23078483 aaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatc 23078582  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23078583 ttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatata 23078682  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078683 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 23078782  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | ||     
T  23078783 tacacaaactctcaacaagtattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacct 23078882  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078883 aaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 12497840 - 12498326
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12497840 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12497939  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||||||    
T  12497940 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12498039  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12498040 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 12498139  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498140 ttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 12498239  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498240 aagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12511061 - 12510575
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12511061 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12510962  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||||||    
T  12510961 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12510862  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12510861 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 12510762  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510761 ttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 12510662  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510661 aagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 278 - 727
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434378
Alignment:
Q  278 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagacca 22434028  T
Q  378 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 477  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22434029 ctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttatt 22434128  T
Q  478 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 577  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  22434129 gtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctcc 22434228  T
Q  578 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 677  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22434229 gactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggat 22434328  T
Q  678 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434329 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 32 - 518
Target Start/End: Original strand, 12505169 - 12505655
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12505169 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12505268  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||||||    
T  12505269 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12505368  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12505369 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatc 12505468  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12505469 ttaacattctcagtagtatgatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaa 12505568  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505569 aaacctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765312
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || ||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  25765574 cacagcg-tgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 25765476  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25765475 attttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttc 25765376  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25765375 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattatt 25765312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 21471397 - 21472106
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  21471397 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21471496  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  21471497 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgt 21471596  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21471597 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 21471696  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   || | ||  || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || ||  | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21471697 atcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcc 21471796  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  21471797 tgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatccca 21471896  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  || |||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21471897 agctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtcctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 21471996  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21471997 aatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgaa 21472096  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  21472097 acttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 48 - 723
Target Start/End: Original strand, 25768021 - 25768696
Alignment:
Q  48 ctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  |    
T  25768021 ctacatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcaga 25768120  T
Q  148 aatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcct 247  Q
     ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || ||||||    
T  25768121 tatctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctcct 25768220  T
Q  248 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 347  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || ||||| ||||    
T  25768221 tcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtag 25768320  T
Q  348 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 447  Q
    |||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  25768321 tttgatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgc 25768420  T
Q  448 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 547  Q
    ||| |||||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |    
T  25768421 cataccaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagc 25768520  T
Q  548 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 647  Q
    |||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  25768521 aaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaac 25768620  T
Q  648 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25768621 tcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 19879094 - 19879803
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  19879094 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 19879193  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |     
T  19879194 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgc 19879293  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  19879294 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttc 19879393  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||| || || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  19879394 atctgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggccccaacatcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttc 19879493  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  19879494 tgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatccca 19879593  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19879594 agctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactc 19879693  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19879694 agcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgca 19879793  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  19879794 acttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 15459132 - 15459838
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || ||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15459132 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15459231  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  15459232 ccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 15459331  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15459332 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 15459431  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   ||||||   |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| || |  ||||| |    
T  15459432 atcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcc 15459531  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  15459532 tacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttattgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatccca 15459631  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15459632 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactc 15459731  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  15459732 aacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgca 15459831  T
Q  714 gcttcac 720  Q
     ||||||    
T  15459832 acttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796408
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | || |||||  ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttc 22796818  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    ||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |  || ||||  || || || || || ||||||||||| || || || ||||| |    
T  22796817 atcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcgcaacactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcc 22796718  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22796717 tgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 22796618  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  22796617 atctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactc 22796518  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  22796517 aacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgca 22796418  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  22796417 acttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 424 - 711
Target Start/End: Original strand, 17032589 - 17032876
Alignment:
Q  424 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 523  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032589 accatataaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 17032688  T
Q  524 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 623  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17032689 tgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaact 17032788  T
Q  624 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032789 tcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 34646071 - 34645362
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  34646071 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacgtacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 34645972  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | || ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||    
T  34645971 caattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgt 34645872  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  34645871 cataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 34645772  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   |||| || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  34645771 atatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcc 34645672  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| |  || ||||||||    
T  34645671 tgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttataagtaaattctatcaacggtaagtggctatccca 34645572  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  34645571 cgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactc 34645472  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  34645471 aatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgca 34645372  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  34645371 acttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 10469334 - 10468625
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||    
T  10469334 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 10469235  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10469234 caactctatatgccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 10469135  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  10469134 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 10469035  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  10469034 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 10468935  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10468934 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatccca 10468835  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || | | |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10468834 agcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 10468735  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  10468734 aacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgca 10468635  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  10468634 gcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21564617 - 21563908
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  21564617 acatcatctctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaac 21564518  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  21564517 ccactctatacgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 21564418  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21564417 caaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttc 21564318  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   |||| || ||| || |   |||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  21564317 atctgttctcttatcaacttaaccttttttttagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcc 21564218  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
     ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||| || |||||  | || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21564217 ggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccataccaatactcgaatggtaactattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 21564118  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21564117 agctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactc 21564018  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| |    
T  21564017 aacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaa 21563918  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    |||| |||||    
T  21563917 gcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 11280990 - 11280277
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |  || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||    
T  11280990 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11280891  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||| |||||||||| ||    
T  11280890 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgt 11280791  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||  ||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11280790 cataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 11280691  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11280690 atatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttc 11280591  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||| ||| ||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||  ||||||| || |||||||||||    
T  11280590 tgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatccca 11280491  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  11280490 agctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactc 11280391  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  11280390 agcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgca 11280291  T
Q  714 gcttcacaatttcc 727  Q
     |||||||||||||    
T  11280290 acttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27561102 - 27560394
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  27561102 acatcatctctcggaatgacatgcgaagggtctgctacatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 27561003  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||||||||||||   | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  27561002 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 27560903  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27560902 catcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 27560803  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||   ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  27560802 atcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcc 27560703  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  27560702 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 27560603  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27560602 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 27560503  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27560502 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 27560403  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  27560402 gcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 28283298 - 28282590
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||| || || || |    
T  28283298 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 28283199  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||||||| || |   | ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  28283198 caactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 28283099  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28283098 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 28282999  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28282998 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcc 28282899  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  28282898 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 28282799  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28282798 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 28282699  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  28282698 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 28282599  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  28282598 gcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 97 - 723
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415991
Alignment:
Q  97 aagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaa 196  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  197 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  297 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 396  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || |||||  ||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcttctgactcaaa 17415664  T
Q  397 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaac 496  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||| ||    
T  17415665 ccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcgac 17415764  T
Q  497 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcg 596  Q
    || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17415765 ggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcg 17415864  T
Q  597 gatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 696  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  17415865 gatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 17415964  T
Q  697 cgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17415965 cgacggtacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 18794486 - 18795195
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  18794486 acatcatctctaggaataacatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 18794585  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  18794586 ccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgt 18794685  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18794686 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 18794785  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   |||| || ||| || || ||||| || || || || ||||| || || | ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  18794786 atctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaacatcacactttctcctaactcaaaccaacacaaaggagtta 18794885  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18794886 tgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaggtaaactctatcaacggtaggtgactatccca 18794985  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  18794986 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactc 18795085  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |    
T  18795086 agcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgca 18795185  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  18795186 tcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 24364208 - 24364914
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  24364208 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24364307  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| ||    
T  24364308 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 24364407  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  24364408 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 24364507  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| |    
T  24364508 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcactcgactcaaaccagcataaaggagtcc 24364607  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||    
T  24364608 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatccca 24364707  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  24364708 agctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 24364807  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  24364808 aacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaa 24364907  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    | |||||    
T  24364908 gtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 110 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14381856 - 14381243
Alignment:
Q  110 aaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacac 209  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14381856 aaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacac 14381757  T
Q  210 cagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 309  Q
    | ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14381756 ccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgc 14381657  T
Q  310 cttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgga 409  Q
     ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || | ||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||    
T  14381656 tttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacgacactctctcatgactcaaaccagcataaagga 14381557  T
Q  410 gttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 509  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  14381556 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgt 14381457  T
Q  510 cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccga 609  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14381456 cccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctga 14381357  T
Q  610 actcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacca 709  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  14381356 actcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggtactcca 14381257  T
Q  710 tgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||    
T  14381256 tgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 161 - 658
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1641212
Alignment:
Q  161 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 260  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||  ||||||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  261 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaa 359  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| |    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtctgatgaacta 1640913  T
Q  360 tctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatact 459  Q
    | |||||||| || |  || |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1640914 tatctggtcccaacattacactttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatact 1641013  T
Q  460 agaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagc 559  Q
     ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  1641014 cgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaac 1641113  T
Q  560 gactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 658  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641114 gactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 8766633 - 8766111
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  8766633 acatcatctattggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 8766534  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||    
T  8766533 ccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgt 8766434  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||| | | || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8766433 catagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttc 8766334  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || |||||  | || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  8766333 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtccccacacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcc 8766234  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8766233 tgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 8766134  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacac 536  Q
    || ||| ||||||||||||||||    
T  8766133 agctccaccttgctcaagaacac 8766111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21833448 - 21833172
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  21833448 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacca 21833349  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21833348 ttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21833249  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 308  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833248 aaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750900
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 309  Q
    || | || ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Original strand, 17032376 - 17032582
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17032376 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 17032475  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17032476 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaa 17032575  T
Q  232 aaacacg 238  Q
    |||||||    
T  17032576 aaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18197996 - 18197608
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| | |    
T  18197996 acatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgata 18197897  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||| |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | || ||||| ||| ||| || || | ||| ||    
T  18197896 tcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctc 18197797  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  || |||||||||||     
T  18197796 ttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtc 18197697  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctc 438  Q
    || | ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18197696 tgttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctc 18197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 311 - 723
Target Start/End: Original strand, 19453513 - 19453925
Alignment:
Q  311 ttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||    
T  19453513 ttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggag 19453612  T
Q  411 ttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatc 510  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || | |||||| ||||| || || ||||||||    
T  19453613 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtatgcgaactctatcaatggtaggtgactatc 19453712  T
Q  511 ccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaa 610  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19453713 ccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 19453812  T
Q  611 ctcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 710  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||    
T  19453813 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccat 19453912  T
Q  711 gtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||    
T  19453913 gtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14131664 - 14131363
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | || ||||    
T  14131664 acatcatctctaggaataacaggcgaaggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaac 14131565  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  14131564 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgt 14131465  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14131464 cataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 14131365  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  14131364 at 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11288083 - 11287680
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |  || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||    
T  11288083 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11287984  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  11287983 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 11287884  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11287883 cataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 11287784  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11287783 atatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttc 11287684  T
Q  414 tgca 417  Q
    ||||    
T  11287683 tgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 396 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 5297308 - 5296982
Alignment:
Q  396 accagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 495  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||    
T  5297308 accagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaa 5297209  T
Q  496 cggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 595  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5297208 cggtaggtgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctga 5297110  T
Q  596 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 695  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  5297109 ggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatac 5297010  T
Q  696 tcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5297009 tcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27560086 - 27559765
Alignment:
Q  401 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 500  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |    
T  27560086 cacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggta 27559987  T
Q  501 gatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 600  Q
    | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27559986 ggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatg 27559887  T
Q  601 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 700  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  27559886 ataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaa 27559787  T
Q  701 ggaacaccatgtagcttcacaa 722  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27559786 ggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 149 - 537
Target Start/End: Original strand, 18800873 - 18801261
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |    
T  18800873 atctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccct 18800972  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  18800973 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 18801072  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  18801073 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgaggcc 18801172  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 537  Q
    || |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  18801173 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctctagtacaca 18801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 507 - 723
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  507 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 606  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  607 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 706  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  707 ccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 504 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  504 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 603  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  604 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 703  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  704 acaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 324
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  224 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  324 g 324  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16382696 - 16382161
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16382696 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16382597  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16382596 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16382497  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  16382496 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 16382397  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16382396 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16382297  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16382296 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16382197  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382196 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 617 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836964
Alignment:
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  717 tcacaatttccttgat 732  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgat 21836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 570 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  570 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  670 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 632 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 617 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 16098008 - 16098543
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16098008 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 16098107  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16098108 tatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16098207  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  16098208 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatactagaatgaaaattgttg 16098307  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | ||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16098308 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16098407  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
        ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16098408 ttttctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16098507  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098508 atcccgatctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 23996206 - 23996741
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  23996206 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 23996305  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  23996306 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 23996405  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  23996406 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 23996505  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      || |||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  23996506 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 23996605  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |    
T  23996606 ccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcag 23996705  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996706 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 25743410 - 25742876
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || |  | ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  25743410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 25743311  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta-aga 374  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||| | |    
T  25743310 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctacaaa 25743211  T
Q  375 ccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatt 474  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25743210 gcact--ttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaactgtt 25743113  T
Q  475 attataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    ||  || ||||||    
T  25743112 gttgtaagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctagatagtcctc 25743013  T
Q  575 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 674  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||      
T  25743012 tccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaaacctca 25742913  T
Q  675 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742912 gatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433924
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttcc 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttcc 22433924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15078687 - 15078365
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | | ||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| |||||   ||    
T  15078687 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctcttct 15078588  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  15078587 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 15078488  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  15078487 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 15078388  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15078387 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15078365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 18787684 - 18787809
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |  || ||||    
T  18787684 acatcaactcttggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaac 18787783  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaact 139  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18787784 ccactctatatgccactgttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 296
Target Start/End: Original strand, 25750908 - 25751024
Alignment:
Q  180 acttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 279  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25750908 acttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtc 25751007  T
Q  280 atgataactcttttgtc 296  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  25751008 atggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 1640595 - 1640710
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||     
T  1640595 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 1640694  T
Q  114 ccactcgataagccac 129  Q
    |||||| ||| |||||    
T  1640695 ccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 18838231 - 18837696
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||||| |||| |||| | || | ||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  18838231 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 18838132  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  18838131 tatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtgctaacat 18838032  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| | || ||     
T  18838031 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaactgttg 18837932  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  18837931 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 18837832  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  18837831 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcgg 18837732  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837731 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21412939
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||| | |||| ||| ||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    |||  ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||  || ||||   | |||||||| |   | ||||| ||     
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtcctaacaatgcgctttctccg 21413049  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||    
T  21413048 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaactgttattgtaagtaaact 21412949  T
Q  489 cgatcaacgg 498  Q
    | ||||||||    
T  21412948 caatcaacgg 21412939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648786
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccg 1648895  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 1648795  T
Q  489 cgatcaacg 497  Q
    | |||||||    
T  1648794 caatcaacg 1648786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 711
Target Start/End: Original strand, 18571684 - 18572144
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  18571684 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagttt 18571783  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || | ||  ||||||| ||| |   | |||||||||||||||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || || | |||    
T  18571784 cttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcat 18571883  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 550  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| || ||| | | ||     |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  18571884 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 18571983  T
Q  551 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 650  Q
    ||||| |     || || ||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  18571984 tcctccaaactttggatagtcctctccgttttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaactct 18572083  T
Q  651 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  18572084 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactataaggaataccatg 18572144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 661 - 727
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  661 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 496
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655760
Alignment:
Q  191 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 290  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| | |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  291 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctga 390  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  |||| |||||| |   | |||||| ||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttttttcttagtctcttgcacaacttctgatcctaacaaagcactttca-ctga 25655654  T
Q  391 ctcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcg 490  Q
    ||||||||| |||||||   | || || ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||||| | || || || ||||| |||||     
T  25655655 ctcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatttcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcc 25655754  T
Q  491 atcaac 496  Q
    ||||||    
T  25655755 atcaac 25655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 466
Target Start/End: Original strand, 16233242 - 16233457
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || ||||| |    
T  16233242 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || ||||  ||  ||||||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16233342 cttgcacaacttccagtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 16233441  T
Q  451 tccaatactagaatga 466  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  16233442 tccgatactagcatga 16233457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  608 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 693  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 498
Target Start/End: Original strand, 1652274 - 1652353
Alignment:
Q  419 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1652274 ctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 1652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 711
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  590 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 689  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  690 caatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 521 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  521 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 620  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  621 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 600; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 600; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 110141 - 109434
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagc 126  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  110141 gaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagc 110042  T
Q  127 caccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  110041 caccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgact 109942  T
Q  227 ctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgga 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  109941 ctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgga 109842  T
Q  327 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109841 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacc 109742  T
Q  427 atacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 526  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  109741 atataaagcctcgaaaggtgccgttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgc 109642  T
Q  527 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  109641 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcg 109542  T
Q  627 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 726  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  109541 aacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctc 109442  T
Q  727 cttgatgt 734  Q
    ||||||||    
T  109441 cttgatgt 109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 112522 - 113231
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  112522 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 112621  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  112622 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 112721  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  112722 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 112821  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   ||||  |  || || |  |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||    
T  112822 atctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttc 112921  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  112922 tgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatccca 113021  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| ||| ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  113022 agctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacagatcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactc 113121  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  113122 agcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgca 113221  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  113222 gcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 95636
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | || ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 96046  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||   ||||| |  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || ||||| || ||||||||||| || |  |||||||    
T  96045 atcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagttc 95946  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  95945 tacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatccca 95846  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  95845 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactc 95746  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  95745 aacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgca 95646  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  95645 acttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 599; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668294
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27668713  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27668712 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 27668613  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27668612 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtccca 27668513  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27668512 agttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 27668413  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27668412 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgca 27668313  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  27668312 acttcacaatctccttgat 27668294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770542
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19770123  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19770124 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 19770223  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770224 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 19770323  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19770324 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 19770423  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19770424 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgca 19770523  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  19770524 acttcacaatctccttgat 19770542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 40708662 - 40709362
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40708662 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 40708761  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40708762 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40708861  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708862 aaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 40708961  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708962 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 40709061  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709062 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 40709161  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40709162 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 40709261  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  40709262 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttga 40709361  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  40709362 t 40709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 34566376 - 34567078
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34566376 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 34566475  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34566476 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 34566575  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566576 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 34566675  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566676 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 34566775  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566776 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 34566875  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34566876 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 34566975  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  34566976 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 34567075  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  34567076 tgt 34567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 27518289 - 27518991
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27518289 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27518388  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27518389 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27518488  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518489 aaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 27518588  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518589 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccataca 27518688  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27518689 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaag 27518788  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  27518789 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaaccc 27518888  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  27518889 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 27518988  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  27518989 tgt 27518991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22333391 - 22332691
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22333391 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22333292  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22333291 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22333192  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333191 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 22333092  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22333091 cggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 22332992  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332991 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 22332892  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22332891 aacacaaattctgaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 22332792  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  22332791 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttga 22332692  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  22332691 t 22332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 16356384 - 16357086
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16356384 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16356483  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16356484 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16356583  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356584 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16356683  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356684 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16356783  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356784 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16356883  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16356884 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 16356983  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  16356984 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 16357083  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  16357084 tgt 16357086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 41770724 - 41771424
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770724 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 41770823  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770824 ttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 41770923  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41770924 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatc 41771023  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771024 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 41771123  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41771124 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaag 41771223  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  41771224 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaaccc 41771323  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  41771324 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 41771423  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  41771424 t 41771424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15000243 - 14999543
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15000243 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15000144  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15000143 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15000044  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15000043 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 14999944  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14999943 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 14999844  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14999843 aagtctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaag 14999744  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14999743 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 14999644  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  14999643 aaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 14999544  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  14999543 t 14999543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610936
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttc 27610517  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27610518 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 27610617  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27610618 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtccca 27610717  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  27610718 agtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactc 27610817  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  27610818 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgca 27610917  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  27610918 acttcacaatctccttgat 27610936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27685904 - 27685204
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27685904 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27685805  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27685804 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 27685705  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27685704 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatc 27685605  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27685604 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 27685505  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685504 aggcctcgaaaggtgtcattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 27685405  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27685404 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 27685305  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27685304 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27685205  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  27685204 t 27685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 37292000 - 37291300
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37292000 acatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 37291901  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37291900 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 37291801  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37291800 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 37291701  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37291700 tgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 37291601  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291600 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 37291501  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  37291500 aacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 37291401  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  37291400 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 37291301  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  37291300 t 37291300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 29476577 - 29475898
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29476577 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29476478  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  29476477 ttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaa 29476378  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29476377 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatc 29476278  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29476277 cgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 29476178  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476177 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 29476078  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  29476077 aacacaaattctcaaaaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccc 29475978  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475977 caagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 22134550 - 22135250
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  22134550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactg 22134649  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22134749  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22134750 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 22134849  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22134850 tgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 22134949  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134950 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 22135049  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22135050 aacaaaaattctcaacaaattctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 22135149  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  22135150 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttga 22135249  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  22135250 t 22135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 732
Target Start/End: Original strand, 22348316 - 22349005
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactt 140  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  22348316 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactc 22348415  T
Q  141 tttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 240  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22348416 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 22348515  T
Q  241 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttc 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22348516 gtctccttcccgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttc 22348613  T
Q  341 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22348614 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcga 22348713  T
Q  441 aaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348714 aaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 22348813  T
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
     | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  22348814 ccccaacaaatcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctct 22348913  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22348914 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 729
Target Start/End: Original strand, 23573624 - 23574321
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  23573624 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 23573723  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  23573724 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 23573823  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23573824 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 23573923  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23573924 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatata 23574023  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574024 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 23574123  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  23574124 tacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 23574223  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23574224 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 732
Target Start/End: Original strand, 18775677 - 18776352
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |    
T  18775677 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgata 18775776  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18775777 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctc 18775876  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  18775877 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 18775976  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18775977 tgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcca 18776076  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18776077 ttcgaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatca-------atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaa 18776169  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  18776170 atcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactc 18776269  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  18776270 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgat 18776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23517102
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||| ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23516704  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23516705 atcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttc 23516804  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23516805 tgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatccca 23516904  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23516905 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 23517004  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517005 aatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 704
Target Start/End: Original strand, 20798660 - 20799314
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  | |    
T  20798660 acatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgata 20798759  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798760 tttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 20798859  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||     
T  20798860 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtc 20798959  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20798960 tgctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgcca 20799059  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20799060 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaa 20799159  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  20799160 atcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactt 20799259  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799260 ttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 691
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440766
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23440388  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23440389 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttc 23440488  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23440489 tgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatccca 23440588  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23440589 agttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactc 23440688  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 691  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440689 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 720
Target Start/End: Original strand, 25423071 - 25423759
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  25423071 acatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccg 25423170  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  25423171 ttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 25423270  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  25423271 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 25423370  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423371 ttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 25423470  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25423471 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaag 25423570  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  25423571 tacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 25423670  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25423671 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20467909
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||| | | | |||| || |||||| | |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttc 20468319  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  20468318 atcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcc 20468219  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20468218 tacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatccca 20468119  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20468118 agttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaagtcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactc 20468019  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20468018 aacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgta 20467919  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  20467918 gcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21984809 - 21984248
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21984809 acatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 21984710  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    ||||| || ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  21984709 ttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaa 21984610  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21984609 aaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 21984510  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984509 ttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccataca 21984410  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984409 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 21984310  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 593  Q
     ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984309 tacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 93 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21497850
Alignment:
Q  93 tcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgactt 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  193 caaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttt 292  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||  || || ||||| || |||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  293 tgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgact 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgact 21498180  T
Q  393 caaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgat 492  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  21498179 caaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacttttattttacgtgaactctat 21498080  T
Q  493 caacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtc 592  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  21498079 caatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatc 21497980  T
Q  593 tgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaa 692  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21497979 tgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaa 21497880  T
Q  693 tgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21497879 tgctcgaa-gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471802
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  | | |||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||   || ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttc 23471392  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23471393 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttc 23471492  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  23471493 tgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactctattaatgggagatgactatccca 23471592  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||     
T  23471593 agttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaacta 23471692  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23471693 aacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgta 23471792  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  23471793 gcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 26739209 - 26738540
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  26739209 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccg 26739110  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||| | ||||  | |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  26739109 ttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaa 26739010  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |  || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  26739009 aaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatc 26738910  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26738909 ttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccataca 26738810  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||  ||  ||||||||||| |||| |||| ||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738809 aagccttaaattgtgccattccattactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 26738710  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  26738709 tacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacct 26738610  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||                      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26738609 aaagcc----------------------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 26738540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 226 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339099
Alignment:
Q  226 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 325  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  326 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 425  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 21339397  T
Q  426 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 525  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339396 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 21339297  T
Q  526 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 625  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  21339296 ctcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaactta 21339197  T
Q  626 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21339196 gaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 24750076 - 24749370
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  24750076 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24749977  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  24749976 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24749877  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24749876 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 24749777  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   |||| || ||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  24749776 atctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcc 24749677  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24749676 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 24749577  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||    
T  24749576 agctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactc 24749477  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  24749476 aacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaa 24749377  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  24749376 gcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22235733
Alignment:
Q  11 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggta 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  111 aacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 210  Q
    |||| |||| ||| | ||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  211 agtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcc 310  Q
     ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgct 22236146  T
Q  311 ttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggag 410  Q
    ||||| ||||||  || |||||  |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || ||||    
T  22236145 ttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaactccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggag 22236046  T
Q  411 ttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatc 510  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  22236045 tcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatc 22235946  T
Q  511 ccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaa 610  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22235945 ccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 22235846  T
Q  611 ctcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 710  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  22235845 ctcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccat 22235746  T
Q  711 gtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||    
T  22235745 gtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21564488 - 21563786
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  21564488 acatcatctcttggaatagcatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21564389  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| || | |||| | ||  | ||||||||||||||||| |||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||  ||    
T  21564388 ccactctatatgccactgtccaaactctatcagatatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgt 21564289  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||    
T  21564288 cacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttc 21564189  T
Q  314 attttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
     | ||||||   |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| || ||| |||| || || || |||       |||||||||| || |||||||||    
T  21564188 gtcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtctgatgaactatatctagtcccaacactacactt-------actcaaaccaacataacggagtt 21564097  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21564096 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 21563997  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  21563996 aagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaact 21563897  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  21563896 caacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgc 21563797  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  21563796 agcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890572
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||  | ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |  |||||||| ||||| || ||||| |  |||| ||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||  || | |||||||||||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctgttcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccataca 21890864  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  21890863 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaag 21890764  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  21890763 tgcacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaaccc 21890664  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21890663 aaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 22502525 - 22503231
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  22502525 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22502624  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22502625 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 22502724  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  22502725 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttc 22502824  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||      
T  22502825 atcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtct 22502924  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  22502925 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatgccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatccca 22503024  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22503025 agctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 22503124  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  22503125 aatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaa 22503224  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  22503225 gcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 22381045 - 22381754
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  22381045 acatcatctcttggaatcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22381144  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  22381145 caactctataagccaccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 22381244  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  22381245 catcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 22381344  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22381345 atcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcc 22381444  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22381445 tacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccatacctatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatccca 22381544  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  22381545 agctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactc 22381644  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  22381645 aacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 22381744  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  22381745 gcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 23080611 - 23079902
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23080611 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaac 23080512  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  23080511 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgt 23080412  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  23080411 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttc 23080312  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  |||||||||||||| |  || || |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  23080311 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctcatgcaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcc 23080212  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23080211 tgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 23080112  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23080111 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 23080012  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  23080011 aacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgca 23079912  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  23079911 gcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14886807
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||| | | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 14887213  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  14887212 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 14887113  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  14887112 acacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaa 14887013  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14887012 gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 14886913  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  14886912 acttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaag 14886813  T
Q  715 cttcac 720  Q
    ||||||    
T  14886812 cttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 687
Target Start/End: Original strand, 22461798 - 22462471
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  22461798 acatcgtctcttggaatgacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 22461897  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22461898 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22461997  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22461998 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 22462097  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||    |||||||  |||||||| |||||||  ||||| |  || || || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  22462098 atcttctccctaatcatcttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcc 22462197  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| |||||    
T  22462198 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtccca 22462297  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22462298 agctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 22462397  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 687  Q
    ||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462398 aatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28923581
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28923991  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| |    
T  28923990 atcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttctcccgactcgaaccaacatagaggagtcc 28923891  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  28923890 tacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatccca 28923791  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  28923790 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactc 28923691  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| |    
T  28923690 aatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgca 28923591  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  28923590 acttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848627
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     ||||  || ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 25848221  T
Q  315 ttttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    | || |||   |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  25848222 tcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 25848320  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| |||||    
T  25848321 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtccca 25848420  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  25848421 agctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaaatcttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 25848520  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||| | ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  25848521 aacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaa 25848620  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  25848621 gcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342834
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||  ||||||||| ||| || || || |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 20342428  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||    
T  20342429 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcct 20342528  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  20342529 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaa 20342628  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  20342629 gctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 20342728  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||    
T  20342729 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaag 20342828  T
Q  715 cttcac 720  Q
    ||||||    
T  20342829 cttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545336
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  215 ataggactgactctca-aaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    | |||| |||| |||| |||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttc 37545719  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| |   |||||||||||||| |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  37545718 atcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 37545619  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||    
T  37545618 tgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatccca 37545519  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  37545518 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 37545419  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 696  Q
    ||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545418 aacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 17269855 - 17269148
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  17269855 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 17269756  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||||||| || |   | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  17269755 caactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 17269656  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17269655 catcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 17269556  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17269555 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcc 17269456  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  17269455 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 17269356  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |     
T  17269355 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaa-tt 17269257  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    | |||||| ||||| |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17269256 agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 17269157  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  17269156 gcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 20821299 - 20822008
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  20821299 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20821398  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | || ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  20821399 caattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20821498  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20821499 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20821598  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  |||||||  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || ||||| || ||||||||||| || |  ||||| |    
T  20821599 atcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcc 20821698  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||  |||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||  || ||||| || ||||||||||||||    
T  20821699 tacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtgagttctatcaatggtagatgactatccca 20821798  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20821799 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactc 20821898  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  20821899 aacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgca 20821998  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  20821999 acttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28894755
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28895165  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| |    
T  28895164 atcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttctcccgactcgaaccaacatagaggagtcc 28895065  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  28895064 tacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatccca 28894965  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  28894964 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactc 28894865  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| |    
T  28894864 aatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgca 28894765  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  28894764 acttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20774302
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20773905  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || ||  |||| || ||||| ||||| || || |||||      
T  20773906 atcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaaaacaacattttctcccgactcgaaccaacataaaggagtct 20774005  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  20774006 tacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatccca 20774105  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  20774106 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattgga-tgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactc 20774204  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  20774205 aatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 24798918 - 24798213
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  24798918 catcatccctcgtaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 24798819  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24798818 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 24798719  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| ||||||||| ||| || || || || ||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  24798718 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctca 24798619  T
Q  315 ttttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    | || ||    ||||| |||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||  |||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  24798618 tcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtctcgtgaaccaaatccagtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 24798520  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| |||||    
T  24798519 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtccca 24798420  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  24798419 agctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 24798320  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||  |||  ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |    
T  24798319 aacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaa 24798220  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  24798219 gcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 613
Target Start/End: Original strand, 21404700 - 21405285
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || ||||||||||| || |||||||    
T  21404700 acatcatctcttggaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaac 21404799  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| || || || |||||| ||||| |||||||||| |  ||||| |||  ||| ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| ||    
T  21404800 ccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggt 21404899  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||| |||||||| || |||||||                 || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  21404900 cacaagagtgactctaaaaaacacatgatctccttg----------------ttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttc 21404983  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| || ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |  | |||  | ||||| |||||| |||| ||||||| |||||    
T  21404984 atattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctggtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttc 21405083  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaa--gcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcc 511  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21405084 tgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcc 21405183  T
Q  512 caagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 611  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21405184 caagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgatacgccgaac 21405283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24736133 - 24735682
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  24736133 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24736034  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  24736033 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24735934  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24735933 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 24735834  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  |||   |||| || ||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| |    
T  24735833 atctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcc 24735734  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 465  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  24735733 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatg 24735682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23442815 - 23442472
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||     
T  23442815 acatcatctctcggaataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaa 23442716  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | | |||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  23442715 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgt 23442616  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23442615 cataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 23442516  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 357  Q
    || || |||   |||||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  23442515 atcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 281 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831574
Alignment:
Q  281 tgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 380  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| || |||||||| || ||||| || || || |    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  381 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 480  Q
      ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||| | || || || || ||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  481 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 580  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||                   
T  21831798 cgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactga--------------- 21831714  T
Q  581 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctc 680  Q
       |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21831713 ---ccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctc 21831617  T
Q  681 tatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831616 tatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24737307 - 24737012
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  24737307 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24737208  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  24737207 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24737108  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 309  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24737107 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgc 24737012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 414 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 919
Alignment:
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  1150 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccta 1051  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1050 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 951  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 645  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  950 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 485 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 24716577 - 24716342
Alignment:
Q  485 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 584  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24716577 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 24716478  T
Q  585 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 684  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  24716477 catctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatc 24716378  T
Q  685 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24716377 cgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 255  Q
    ||  ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 491 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 24620340 - 24620111
Alignment:
Q  491 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 590  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24620340 atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctg 24620241  T
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||    
T  24620240 tctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacac 24620141  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24620140 aatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 432 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 28916517 - 28916226
Alignment:
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  28916517 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaag 28916418  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||    
T  28916417 tacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatccc 28916318  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28916317 aacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21343862 - 21343666
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21343862 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 21343763  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 228  Q
    |||||||| ||||  | |||| ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21343762 ttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662297
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || ||||    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 279  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 491 - 723
Target Start/End: Original strand, 21496481 - 21496713
Alignment:
Q  491 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 590  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||||     
T  21496481 atcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatcta 21496580  T
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  21496581 tttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacac 21496680  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  21496681 aatacttgatggaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 21937548 - 21937013
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21937548 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 21937449  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  21937448 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 21937349  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  21937348 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 21937249  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  21937248 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 21937149  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21937148 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21937049  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937048 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 609 - 723
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  609 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 708  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  709 atgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 24581219 - 24581753
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || | ||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  24581219 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 24581318  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24581319 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24581418  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  24581419 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 24581518  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24581519 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24581618  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  24581619 ctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24581717  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581718 atcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 27011092 - 27011627
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  27011092 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 27011191  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27011192 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 27011291  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || ||  |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||| | || ||     
T  27011292 agcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaactgttg 27011391  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| ||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27011392 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 27011491  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27011492 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27011591  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011592 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11211054 - 11210732
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  11211054 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcctct 11210955  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  11210954 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 11210855  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||  || || || |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  11210854 aacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaactattg 11210755  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  11210754 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 11210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21665987 - 21665758
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaa 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| |     
T  21665987 tacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgat 21665888  T
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    ||||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| |||    
T  21665887 atctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgctt 21665789  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 279  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21665788 cttgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatg 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 563 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  563 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 662  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  663 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 563 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  563 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 662  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  663 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 466
Target Start/End: Original strand, 23503526 - 23503741
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  23503526 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 23503625  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || || |  || |||||||| |   | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||  || || |||||    
T  23503626 cttgcaccacttccggtcctaacaaagcactttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagccat 23503725  T
Q  451 tccaatactagaatga 466  Q
     || | ||||||||||    
T  23503726 accgacactagaatga 23503741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21229308 - 21229241
Alignment:
Q  401 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 468  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21229308 cacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgata 21229241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  563 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 624  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 599; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 15589953 - 15589251
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15589953 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15589854  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15589853 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15589754  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589753 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 15589654  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589653 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 15589554  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15589553 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaag 15589454  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15589453 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 15589354  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15589353 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttga 15589254  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  15589253 tgt 15589251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53384888
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 53385298  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53385297 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttc 53385198  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385197 tgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 53385098  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  53385097 agttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactc 53384998  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53384997 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 53384898  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  53384897 gcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 20062615 - 20061913
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20062615 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20062516  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20062515 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 20062416  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062415 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 20062316  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062315 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 20062216  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062215 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 20062116  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20062115 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 20062016  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  20062015 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttga 20061916  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  20061915 tgt 20061913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 10005169 - 10005871
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10005169 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10005268  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10005269 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10005368  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005369 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 10005468  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005469 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 10005568  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10005569 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaag 10005668  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10005669 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 10005768  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  10005769 aaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 10005868  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  10005869 tgt 10005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 10905779 - 10906481
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10905779 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10905878  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10905879 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10905978  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905979 aaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 10906078  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10906079 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccataca 10906178  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10906179 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaag 10906278  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10906279 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 10906378  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  10906379 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 10906478  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  10906479 tgt 10906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 48425016 - 48425718
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48425016 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 48425115  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48425116 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 48425215  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425216 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 48425315  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425316 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 48425415  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425416 aagccttgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 48425515  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  48425516 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 48425615  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  48425616 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 48425715  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  48425716 tgt 48425718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756444
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttc 16756865  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16756864 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttc 16756765  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16756764 tgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtccca 16756665  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16756664 agttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 16756565  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16756564 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 16756465  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16756464 gcttcacaatctctttgatgt 16756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 16635342 - 16636044
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16635342 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16635441  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16635442 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16635541  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635542 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16635641  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635642 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16635741  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635742 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16635841  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16635842 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 16635941  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  16635942 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 16636041  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  16636042 tgt 16636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 43162666 - 43163368
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43162666 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 43162765  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43162766 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 43162865  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162866 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 43162965  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162966 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 43163065  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163066 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 43163165  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43163166 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 43163265  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  43163266 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 43163365  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  43163366 tgt 43163368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15348806 - 15348106
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15348806 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15348707  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15348706 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15348607  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15348606 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 15348507  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348506 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 15348407  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348406 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 15348307  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15348306 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 15348207  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  15348206 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttga 15348107  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  15348106 t 15348106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6601007
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 6600597  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6600598 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttc 6600697  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6600698 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatccca 6600797  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6600798 agttcctccttgctcaagaac-----------acaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 6600886  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6600887 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 6600986  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  6600987 gcttcacaatctctttgatgt 6601007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 13252259 - 13252959
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13252259 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 13252358  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13252359 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 13252458  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252459 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 13252558  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13252559 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccataca 13252658  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13252659 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaag 13252758  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13252759 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 13252858  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  13252859 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 13252958  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  13252959 t 13252959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5424791
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425308 cataggagtgactctcaaag-cacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 5425210  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5425209 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 5425110  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5425109 tgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtccca 5425010  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5425009 agttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 5424910  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  5424909 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgca 5424810  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     ||| ||||| ||||||||    
T  5424809 actttacaatctccttgat 5424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15403053 - 15402371
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |    
T  15403053 acatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaata 15402954  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402953 tctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 15402854  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15402853 ctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtt 15402754  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15402753 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgcca 15402654  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15402653 ttccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaa 15402554  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15402553 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 15402454  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15402453 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15725494 - 15724795
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15725494 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15725395  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  15725394 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaa 15725295  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725294 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 15725195  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15725194 cgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 15725096  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725095 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 15724996  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15724995 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 15724896  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  15724895 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttga 15724796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 26792960 - 26792260
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  26792960 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcg 26792861  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  26792860 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaa 26792761  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26792760 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 26792661  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  26792660 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatata 26792561  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26792560 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaag 26792461  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26792460 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaaccc 26792361  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  26792360 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 26792261  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  26792260 t 26792260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 15338838 - 15339538
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15338838 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccg 15338937  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15338938 ttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 15339037  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15339038 aaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatc 15339137  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15339138 tgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatata 15339237  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15339238 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgag 15339337  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||    
T  15339338 aacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaaccc 15339437  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15339438 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 15339537  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  15339538 t 15339538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16412843 - 16412143
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16412843 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16412744  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16412743 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16412644  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16412643 aaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 16412544  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16412543 tgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatata 16412444  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16412443 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaag 16412344  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| |||    
T  16412343 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaaccc 16412244  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16412243 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16412144  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  16412143 t 16412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498517
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12498098  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12498099 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttc 12498198  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498199 tgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 12498298  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12498299 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 12498398  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12498399 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgca 12498498  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     ||||||||| || |||||    
T  12498499 acttcacaatctctttgat 12498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876360
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14876779  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876778 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 14876679  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14876678 tgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatccca 14876579  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14876578 agttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 14876479  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14876478 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 14876379  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
       ||||||| ||||||||    
T  14876378 atctcacaatctccttgat 14876360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16806787
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||| |  ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttc 16807206  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807205 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 16807106  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807105 tgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 16807006  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16807005 agttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 16806906  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16806905 aatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 16806806  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     | |||| || ||||||||    
T  16806805 acctcacgatctccttgat 16806787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 729
Target Start/End: Original strand, 16371000 - 16371679
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  | |    
T  16371000 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgata 16371099  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16371100 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttc 16371199  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  16371200 ttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 16371299  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16371300 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgcca 16371399  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16371400 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaa 16371499  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16371500 atcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactt 16371599  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16371600 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 17489419 - 17490110
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17489419 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17489518  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17489519 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 17489618  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17489619 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 17489718  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489719 ttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 17489818  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489819 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 17489918  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  17489919 tacacaaactctcaacagatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 17490018  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17490019 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 16691729 - 16692433
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16691729 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccg 16691828  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||  ||||| | || ||||| |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  16691829 ttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16691928  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16691929 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 16692028  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16692029 ttaactttttcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccataca 16692128  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16692129 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaag 16692228  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  16692229 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaaccc 16692328  T
Q  632 aaagcct----cttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 727  Q
    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||    
T  16692329 aaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcc 16692428  T
Q  728 ttgat 732  Q
    |||||    
T  16692429 ttgat 16692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16492742 - 16492051
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16492742 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16492643  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  16492642 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16492543  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16492542 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 16492443  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492442 ttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16492343  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16492342 aagcctcacaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaag 16492243  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||     
T  16492242 aacacaaacccttaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacct 16492143  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16492142 aaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 9522288 - 9522979
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  9522288 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 9522387  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| |||   | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9522388 ttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 9522487  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||     
T  9522488 aaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatt 9522587  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522588 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccataca 9522687  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522688 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaag 9522787  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  9522788 tacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 9522887  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9522888 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Original strand, 15247734 - 15248407
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |    
T  15247734 acatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgata 15247833  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||| ||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  15247834 tctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 15247933  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     |||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  15247934 ttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtt 15248033  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15248034 tgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgcca 15248133  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  15248134 ttccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaa 15248233  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    |||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  15248234 atcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 15248333  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15248334 ttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15209151
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | ||||  | |||||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 15208741  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15208742 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttc 15208841  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15208842 tgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatccca 15208941  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15208942 agttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctc 15209041  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15209042 aacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 15209141  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  15209142 acttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 15227210 - 15227919
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  15227210 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15227309  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  15227310 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 15227409  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  15227410 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttc 15227509  T
Q  314 attttctcttggatc-atctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || ||||||   ||| || ||| |||| |  ||||| |||||||| |  |||||||| || |  || | |||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  15227510 atcttctctcttatcaatttgaccttt-tttgtagtctgctgaactaaatctggtcccaacattacaccttcactcgactcaaaccaacataacggagtt 15227608  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  15227609 ctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggcaggtgactatccc 15227708  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||    
T  15227709 aagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaact 15227808  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  15227809 ccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgc 15227908  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||| ||||    
T  15227909 agcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 13323220 - 13322511
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || || ||||    
T  13323220 acatcatctcttggaataacatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaac 13323121  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |  | ||| ||||| |||||||   | ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  13323120 caatcctatatgccactgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgt 13323021  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13323020 cataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 13322921  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||  | |||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || ||  | || | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  13322920 atcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttc 13322821  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  13322820 tgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtaggtaaactctatcaaaggtaggtgactatccca 13322721  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || | | ||||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13322720 agcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaatcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 13322621  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  13322620 aaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgta 13322521  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  13322520 gcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15953532 - 15952827
Alignment:
Q  18 catctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  15953532 catctctcggaataacatgcgaatgatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 15953433  T
Q  118 tcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcata 217  Q
    |   || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15953432 tttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcata 15953333  T
Q  218 ggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattt 317  Q
    ||| | | ||||| ||| || || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15953332 ggagtaaatctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 15953233  T
Q  318 tctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgca 417  Q
    | |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||    
T  15953232 tttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgca 15953133  T
Q  418 tctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtt 517  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  | || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  15953132 cctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggcaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagct 15953033  T
Q  518 cctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatc 617  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  15953032 ccaccttgctcaagtacacacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacc 15952933  T
Q  618 tcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 717  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||    
T  15952932 tcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaactt 15952833  T
Q  718 cacaat 723  Q
    ||||||    
T  15952832 cacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 13972685 - 13971979
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  13972685 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaa 13972586  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  13972585 ctctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 13972486  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  13972485 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 13972386  T
Q  317 --ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
      |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13972385 cgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttct 13972288  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  13972287 gcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaa 13972188  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13972187 gctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactca 13972088  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  13972087 gcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 13971988  T
Q  715 cttcacaat 723  Q
    |||||||||    
T  13971987 cttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Original strand, 14086237 - 14086943
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  14086237 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaaccca 14086336  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    | | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  14086337 ccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 14086436  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  14086437 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 14086536  T
Q  317 --ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
      |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14086537 cgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttct 14086634  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  14086635 gcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaa 14086734  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14086735 gctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 14086834  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  14086835 acctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 14086934  T
Q  715 cttcacaat 723  Q
    |||||||||    
T  14086935 cttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 18134914 - 18134215
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||    
T  18134914 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 18134815  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  18134814 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagt 18134715  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||  | || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18134714 cataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 18134615  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  |||||| |  ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | |    
T  18134614 atcttctctccgatcattttgactttatctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcc 18134515  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18134514 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 18134415  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  18134414 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactc 18134315  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18134314 aacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 12361107 - 12360401
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  12361107 tcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 12361008  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  |||||    
T  12361007 ctctatatgccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcat 12360908  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    || | | ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  12360907 agaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatc 12360808  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || ||    |||||||  |||||||| |||||  | ||||| |  |||||||| || ||  | || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12360807 ttttcccttatcatcttgactttctctgtagtccgatgaaccaagtctggtcccaatacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgc 12360708  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||     
T  12360707 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagc 12360608  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12360607 tccaccttgctcaagtacacacactttcaataaatcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaac 12360508  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | || |||||||||||||    
T  12360507 ctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagct 12360408  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  12360407 tcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 8759650 - 8758942
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  8759650 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 8759551  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  8759550 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 8759451  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8759450 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 8759351  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8759350 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcc 8759251  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  8759250 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 8759151  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8759150 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 8759051  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8759050 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 8758951  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  8758950 gcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 41177083 - 41177791
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  41177083 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 41177182  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  41177183 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 41177282  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  41177283 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 41177382  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41177383 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcc 41177482  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  41177483 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 41177582  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41177583 agctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 41177682  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  41177683 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 41177782  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  41177783 gcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 422 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564545
Alignment:
Q  422 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 521  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 11564753  T
Q  522 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 621  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11564752 ctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaa 11564653  T
Q  622 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 721  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11564652 cttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcaca 11564553  T
Q  722 atttcctt 729  Q
    || |||||    
T  11564552 atctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 13941585 - 13942291
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  13941585 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 13941684  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  13941685 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 13941784  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  13941785 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 13941884  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  13941885 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcc 13941984  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  13941985 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 13942084  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13942085 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 13942184  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    | |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  13942185 agtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 13942284  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  13942285 gcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 206 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 15016131 - 15015634
Alignment:
Q  206 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 305  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15016131 acaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgag 15016032  T
Q  306 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 405  Q
    |||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| || ||| |||| |||||    
T  15016031 acgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaacacaa 15015932  T
Q  406 cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatga 505  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||||||||| |  ||||||    
T  15015931 tggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagagatga 15015832  T
Q  506 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||            ||||||||||||||    
T  15015831 ctatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccga------------ctgcggatgatatg 15015744  T
Q  606 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 705  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15015743 ccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaac 15015644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11303632
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||||  |||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||    ||||||| ||| || || || || || |||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttc 11304042  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||  || |||| |||  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||     
T  11304041 atcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaatcaaattc-ggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtc 11303943  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  11303942 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccttaccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatccc 11303843  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11303842 aagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaact 11303743  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  11303742 caacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgt 11303643  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  11303642 agcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 443 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126464
Alignment:
Q  443 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  543 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  643 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777516
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |   | ||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| ||||||| | ||| || || || || || || ||||||||  | || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 44777107  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  44777108 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcc 44777207  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  44777208 tgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatccca 44777307  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44777308 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 44777407  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  44777408 agcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgta 44777507  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  44777508 gcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10384235
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || |||||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 10383830  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10383831 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcct 10383930  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||    
T  10383931 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaa 10384030  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  10384031 gctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 10384130  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||    
T  10384131 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacggaacaccatgaag 10384229  T
Q  715 cttcac 720  Q
    ||||||    
T  10384230 cttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47124211
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| ||||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 47123805  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  47123806 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 47123905  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||    
T  47123906 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaa 47124005  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  47124006 gctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 47124105  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||    
T  47124106 acttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaag 47124205  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  47124206 tttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10419907
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | || ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 10420314  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   ||||||   |||||||| || || |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| || |  ||||| |    
T  10420313 atcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcc 10420214  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  10420213 tacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatccca 10420114  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10420113 agctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactc 10420014  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  10420013 aacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgca 10419914  T
Q  714 gcttcac 720  Q
     ||||||    
T  10419913 acttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 16837072 - 16836370
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| |      | || || || ||||    
T  16837072 acatcatctctcggaataagatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaac 16836979  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| | |||||||||||   | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  16836978 caactctatatgtcaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 16836879  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  16836878 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttc 16836779  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || |||||||| || |  ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16836778 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcc 16836679  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| | ||| || || |||||||||||    
T  16836678 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatccca 16836579  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16836578 agctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 16836479  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16836478 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaa 16836379  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  16836378 gcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 11961602 - 11960992
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |||     
T  11961602 acatcatctcttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaat 11961503  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| |||||||||  |||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||  ||    
T  11961502 caactctataagccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgt 11961403  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  11961402 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttc 11961303  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    ||||| |  || || ||||| || |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  11961302 atcttttcccttatcattttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcc 11961203  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11961202 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatccca 11961103  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11961102 agctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 11961003  T
Q  614 aatctcaactt 624  Q
    || ||||||||    
T  11961002 aacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 86 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 12850775 - 12850138
Alignment:
Q  86 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 185  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12850775 tgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttct 12850676  T
Q  186 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 285  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || ||| | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||    
T  12850675 tagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtcatggta 12850576  T
Q  286 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 385  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||   ||||  |  ||||| |  |||||||| ||||| |  |||||||| || || || |||||     
T  12850575 actcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttct 12850476  T
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || ||||    
T  12850475 cccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattgttgttgtacgtga 12850376  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12850375 actctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgacc 12850276  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||     
T  12850275 atctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatcc 12850176  T
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || |||||||| || || |||||||| | |||||||||    
T  12850175 gacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16330224 - 16329520
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  16330224 tcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 16330125  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  16330124 ctctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaa 16330025  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16330024 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatc 16329925  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || |    
T  16329924 ttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctac 16329825  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||     
T  16329824 acctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagc 16329725  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||| ||| |||||    ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  16329724 tccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaac 16329627  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  16329626 ctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagct 16329527  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  16329526 tcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 484 - 729
Target Start/End: Original strand, 15061777 - 15062022
Alignment:
Q  484 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 583  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15061777 gaactcaatcaatggaaaatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactga 15061876  T
Q  584 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 683  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061877 ccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 15061976  T
Q  684 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061977 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 16381491 - 16380788
Alignment:
Q  18 catctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  16381491 catctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaac 16381392  T
Q  118 tcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcata 217  Q
    || ||| |||||||| ||||   | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||     
T  16381391 tctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatc 16381292  T
Q  218 ggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattt 317  Q
    ||| | ||||| ||||| || || || || ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| |    
T  16381291 ggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct---gtcgactctgcgacgctttcatct 16381195  T
Q  318 tctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca---ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    |||||  ||||||||  || || || ||||| |  ||||| |  || |||||  | ||||   | || || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16381194 tctctctgatcatcttgaccttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccca-accataacactctctccggactcaaaccagcacaacggagtcct 16381096  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  16381095 gcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcgatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaa 16380996  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  16380995 gctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactca 16380896  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16380895 atctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtag 16380796  T
Q  715 cttcacaa 722  Q
    ||||||||    
T  16380795 cttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 380 - 720
Target Start/End: Original strand, 28754245 - 28754585
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  28754245 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 28754344  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 579  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  28754345 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 28754444  T
Q  580 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 679  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  28754445 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatct 28754544  T
Q  680 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  28754545 ctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 386 - 723
Target Start/End: Original strand, 17492563 - 17492900
Alignment:
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||    
T  17492563 cctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcgaatgataactattgttgtatgtga 17492662  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  17492663 actctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 17492762  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  17492763 atctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 17492862  T
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||  | | | ||||||||||| | |||||||||    
T  17492863 gaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 413 - 723
Target Start/End: Original strand, 14573889 - 14574199
Alignment:
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14573889 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 14573988  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14573989 aagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaact 14574088  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14574089 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgt 14574188  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    | |||||||||    
T  14574189 aacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 380 - 717
Target Start/End: Original strand, 4678365 - 4678702
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  4678365 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 4678464  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 579  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  4678465 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 4678564  T
Q  580 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 679  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  4678565 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 4678664  T
Q  680 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 717  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4678665 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571710
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttc 14571708  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  14571709 at 14571710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 344 - 615
Target Start/End: Original strand, 13001800 - 13002070
Alignment:
Q  344 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 443  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  13001800 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 13001899  T
Q  444 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 543  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  13001900 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactct 13001998  T
Q  544 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 615  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13001999 catcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgataagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 386 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26009189 - 26008948
Alignment:
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  26009189 cctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 26009090  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26009089 actctctcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 26008990  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 627  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008989 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 8274816 - 8274281
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  8274816 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 8274717  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8274716 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 8274617  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  8274616 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 8274517  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||    
T  8274516 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctct 8274417  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  8274416 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 8274317  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274316 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 569 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16743120 - 16742585
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||    
T  16743120 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcctct 16743021  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16743020 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16742921  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16742920 agcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16742821  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16742820 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16742721  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16742720 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctggg 16742621  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742620 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 710
Target Start/End: Original strand, 15576473 - 15577007
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  15576473 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 15576572  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |   | ||||  || ||||| || |     
T  15576573 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctcgcacaacttccggtccaaacaa 15576672  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  | || ||     
T  15576673 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgcaaactgttg 15576772  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15576773 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 15576872  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15576873 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15576972  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 710  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576973 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689067
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaac 138  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaac 31689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945157
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaac 138  Q
    | |||  ||| ||||| ||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaac 31945157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 503 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  503 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 602  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  603 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 702  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  703 aacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 704
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748916
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||  |  || || | ||| |||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | |||||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacct 18748600  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    || |||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||| |  | || || ||| | ||||    
T  18748601 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaattgttgttgtaactaaact 18748700  T
Q  489 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 588  Q
    | |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  18748701 caatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 18748800  T
Q  589 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 688  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   ||||||     
T  18748801 ggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgac 18748900  T
Q  689 acaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||||| || |||||||    
T  18748901 acaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 466
Target Start/End: Original strand, 17192865 - 17193107
Alignment:
Q  224 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 323  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17192865 actctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 17192964  T
Q  324 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 423  Q
    | ||||||| ||| || || ||| | |  || ||||  || |||| ||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  17192965 gaatcatcttaaccttttccgtactctcttgcacaacttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccg 17193064  T
Q  424 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||    
T  17193065 accatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatga 17193107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6712753 - 6712539
Alignment:
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  6712753 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagt 6712654  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||    
T  6712653 ctcttgtacaacctccggtcctaacaaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 6712554  T
Q  449 attccaatactagaa 463  Q
    ||||| |||||||||    
T  6712553 attccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13975462 - 13975172
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13975462 gtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 13975363  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |  ||||  || || ||||| |     
T  13975362 tatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttccacaacttccggccctaacaa 13975263  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
        || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13975262 aggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 13975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14183179 - 14183007
Alignment:
Q  326 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 425  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||| || || || |||||||  |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||       
T  14183179 atcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgttctacatctcctct 14183080  T
Q  426 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14183079 catacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 14183007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  562 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 661  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  662 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14542915 - 14542883
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcc 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14542915 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcc 14542883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6153052 - 6152978
Alignment:
Q  392 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||    
T  6153052 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaatga 6152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 584 - 678
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  584 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 678  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 595; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 16998581 - 16999283
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16998581 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16998680  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16998681 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16998780  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998781 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16998880  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998881 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16998980  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998981 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16999080  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16999081 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 16999180  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  16999181 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 16999280  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  16999281 tgt 16999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 16981733 - 16982435
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16981733 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16981832  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16981833 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16981932  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981933 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16982032  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982033 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16982132  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982133 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16982232  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16982233 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 16982332  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16982333 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16982432  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  16982433 tgt 16982435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 17063298 - 17064000
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17063298 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 17063397  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17063398 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17063497  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063498 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 17063597  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063598 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 17063697  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063698 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 17063797  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17063798 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 17063897  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17063898 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 17063997  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  17063998 tgt 17064000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 9609717 - 9610419
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9609717 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 9609816  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9609817 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 9609916  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609917 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 9610016  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610017 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 9610116  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610117 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 9610216  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9610217 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 9610316  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  9610317 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 9610416  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  9610417 tgt 9610419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 10868431 - 10869133
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10868431 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 10868530  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10868531 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10868630  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10868631 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatc 10868730  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10868731 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtaca 10868830  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868831 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 10868930  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10868931 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 10869030  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  10869031 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttga 10869130  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  10869131 tgt 10869133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 27217597 - 27218299
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27217597 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27217696  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27217697 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27217796  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27217797 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatc 27217896  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217897 tgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 27217996  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217997 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 27218096  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27218097 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 27218196  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  27218197 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 27218296  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  27218297 tgt 27218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44385731
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44386150  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44386149 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 44386050  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386049 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 44385950  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44385949 agtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactc 44385850  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44385849 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 44385750  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     |||||||||  |||||||    
T  44385749 acttcacaatccccttgat 44385731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22325718 - 22325018
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22325718 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22325619  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22325618 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22325519  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325518 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 22325419  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22325418 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccataca 22325319  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22325318 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaag 22325219  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22325218 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 22325119  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  22325118 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 22325019  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  22325018 t 22325018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 17066959 - 17067658
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17066959 acatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccg 17067055  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17067056 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17067155  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067156 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 17067255  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067256 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 17067355  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067356 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 17067455  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17067456 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 17067555  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17067556 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 17067655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 24261951 - 24262651
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24261951 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24262050  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24262051 ttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24262150  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24262151 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 24262250  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24262251 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 24262350  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262351 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 24262450  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24262451 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 24262550  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24262551 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24262650  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  24262651 t 24262651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 24709614 - 24710314
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24709614 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24709713  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24709714 ttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24709813  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24709814 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 24709913  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709914 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 24710013  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710014 aggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 24710113  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24710114 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 24710213  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24710214 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24710313  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  24710314 t 24710314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 27370850 - 27371550
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27370850 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccg 27370949  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27370950 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27371049  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27371050 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 27371149  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  27371150 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgaccataca 27371249  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371250 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 27371349  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27371350 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 27371449  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27371450 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27371549  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  27371550 t 27371550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21145892 - 21145201
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21145892 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcg 21145793  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21145792 ttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaa 21145693  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21145692 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 21145593  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  21145592 tgaactttctcagtagtttgctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatata 21145493  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21145492 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctccttgctcaag 21145393  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21145392 aacac-----------aaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 21145304  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  21145303 aaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaa 21145204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 23188589 - 23189279
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||    
T  23188589 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcg 23188688  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  23188689 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 23188788  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       
T  23188789 aaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctat 23188888  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23188889 ttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccataca 23188987  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23188988 aagcctcaaaaggtgccattcctaaactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaa 23189087  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23189088 aacacaaactctcaataaatcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagccc 23189187  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23189188 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 729
Target Start/End: Original strand, 24675088 - 24675767
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |    
T  24675088 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 24675187  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675188 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 24675287  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  24675288 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 24675387  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24675388 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgcca 24675487  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  24675488 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaa 24675587  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  24675588 atcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactc 24675687  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24675688 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 24708344 - 24707647
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  24708344 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 24708245  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  24708244 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 24708145  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24708144 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 24708045  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24708044 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatata 24707945  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707944 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 24707845  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  24707844 aacacaaaccctcaataaatcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 24707745  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24707744 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttcctt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325431
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21325847  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21325846 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttc 21325747  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325746 tgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 21325647  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21325646 agttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactc 21325547  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  21325546 aatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgca 21325447  T
Q  714 gcttcacaatttcctt 729  Q
     |||||||||||||||    
T  21325446 acttcacaatttcctt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 569
Target Start/End: Original strand, 16924841 - 16925378
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16924841 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16924940  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16924941 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16925040  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925041 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16925140  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925141 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16925240  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925241 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16925340  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925341 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24878848 - 24878319
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactt 140  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  24878848 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactc 24878749  T
Q  141 tttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24878748 tttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 24878649  T
Q  241 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24878648 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttc 24878549  T
Q  341 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcga 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24878548 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcga 24878449  T
Q  441 aaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 540  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878448 aaggtgtcattccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 24878349  T
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 570  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24878348 cctcaacaaatcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22756630
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22757044  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| |||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22757043 atcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttc 22756946  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  22756945 tacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccattccaatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccga 22756846  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  22756845 agtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactc 22756746  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22756745 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 22756646  T
Q  714 gcttcacaatttcctt 729  Q
     ||||||||| |||||    
T  22756645 acttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 720
Target Start/End: Original strand, 23063675 - 23064346
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |     
T  23063675 tacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagat 23063774  T
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23063775 atctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctcctt 23063874  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  23063875 cttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagt 23063974  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23063975 ttgttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgcc 23064074  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 548  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23064075 attccaatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaaca 23064174  T
Q  549 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    |||| || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23064175 aatcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaact 23064274  T
Q  649 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23064275 tttccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 346 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 41608933 - 41608547
Alignment:
Q  346 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41608933 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggt 41608834  T
Q  446 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 545  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608833 gccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 41608734  T
Q  546 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41608733 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaa 41608634  T
Q  646 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  41608633 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 41608547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 109 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825472
Alignment:
Q  109 taaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctaca 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||  | |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  209 ccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 308  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  309 ccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgg 408  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacgg 24825768  T
Q  409 agttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacta 508  Q
    ||| || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  24825767 agtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgacta 24825668  T
Q  509 tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccg 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24825667 tcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccg 24825568  T
Q  609 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825567 aacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 30211797 - 30211088
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||   ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| |||||||    
T  30211797 acatcatctcttggaatcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaac 30211698  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||  ||| || |||   |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  || ||||| ||||| ||    
T  30211697 ccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggt 30211598  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | |  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30211597 cacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttc 30211498  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| || ||| ||||||||||| || |||| ||| | ||||| ||  || || || |||   |||||| |||| |||||| ||||||    
T  30211497 atcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttc 30211398  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30211397 tgcatctccgaccatacaacgtttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatccca 30211298  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30211297 agttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactc 30211198  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30211197 aaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgta 30211098  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  30211097 gcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Original strand, 45529116 - 45529783
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || ||||   | || ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| |||    
T  45529116 acatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaa 45529215  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||||||  |||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||| |       
T  45529216 tctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtcttc--- 45529312  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
       |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||   |||| || ||| |||| ||||||     
T  45529313 ---aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtc 45529409  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  45529410 tgttgaacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgcca 45529509  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||| ||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  45529510 ttccaatgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaa 45529609  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
     ||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||     
T  45529610 gtcctccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactc 45529709  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45529710 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23277048
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | | ||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 23276638  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  |||||||   |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  23276639 atcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcc 23276738  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23276739 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 23276838  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23276839 agctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 23276938  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  23276939 aaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgca 23277038  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  23277039 gcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 27365956 - 27365250
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  27365956 tcatccctaggaataatatgcgaaggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaa 27365857  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  27365856 ctctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 27365757  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  27365756 aggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 27365657  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27365656 tgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgc 27365557  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  27365556 accttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagc 27365457  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      
T  27365456 tccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagc 27365357  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  27365356 ctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaact 27365257  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  27365256 tcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 23293521 - 23294230
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||    
T  23293521 acatcatatctttgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaac 23293620  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  23293621 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 23293720  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  23293721 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttc 23293820  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  ||||||||  |||| || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||  || || ||||| |    
T  23293821 atcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcc 23293920  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23293921 tcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 23294020  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23294021 agctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaaccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 23294120  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  23294121 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 23294220  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  23294221 gcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 612
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087611
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 23087312  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   ||||  | ||| || ||| |||| ||  ||||||| |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23087313 atcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtctgacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttc 23087412  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| || || || || || |||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  23087413 cgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgataggtgactatccca 23087512  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    || ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  23087513 agctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgataagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 27787304 - 27788012
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  27787304 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 27787403  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  27787404 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 27787503  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  27787504 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 27787603  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||| ||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27787604 atcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcc 27787703  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  27787704 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 27787803  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27787804 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 27787903  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27787904 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 27788003  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  27788004 gcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20833254
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttca 20832848  T
Q  315 ttttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    | || |||   |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  20832849 tcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 20832947  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  20832948 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatccca 20833047  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  20833048 agctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 20833147  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  20833148 aacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaa 20833247  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    | |||||    
T  20833248 gtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 11358754 - 11358057
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  11358754 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11358655  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||    
T  11358654 caactctatatgccactgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgt 11358555  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  11358554 caaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 11358455  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  11358454 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 11358355  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||    
T  11358354 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatccca 11358255  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  11358254 agctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 11358155  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11358154 aacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830927
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| ||||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 31830521  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  31830522 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 31830621  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||    
T  31830622 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaa 31830721  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  31830722 gctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 31830821  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||    
T  31830822 acttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaag 31830921  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  31830922 tttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 12573916 - 12574624
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  12573916 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 12574015  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||||||| ||||   | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  12574016 caactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 12574115  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||  | || || | ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  12574116 catcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 12574215  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| || || || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |    
T  12574216 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcc 12574315  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  12574316 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtccca 12574415  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12574416 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 12574515  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12574516 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 12574615  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  12574616 gcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1064020
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||| |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||| | | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctca 1063614  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  || || |  |||||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| ||    
T  1063615 tcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatctggtcccaacacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcct 1063714  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||    
T  1063715 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaa 1063814  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  1063815 gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 1063914  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  |||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||    
T  1063915 acttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaag 1064014  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  1064015 tttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 23138618 - 23138910
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  23138618 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccg 23138717  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  23138718 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 23138817  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 324  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23138818 aaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23138910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Original strand, 23550408 - 23550700
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  23550408 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccg 23550507  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  23550508 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 23550607  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 324  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23550608 aaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23550700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27377315 - 27377101
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| | |    
T  27377315 acatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgata 27377216  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377215 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 27377116  T
Q  250 ctgaaactcaagatc 264  Q
    |||||||||||||||    
T  27377115 ctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 572 - 734
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923172
Alignment:
Q  572 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  672 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 570 - 734
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925643
Alignment:
Q  570 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  670 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16925643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 386 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 19652557 - 19652223
Alignment:
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |   | ||||    
T  19652557 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgt---atgtga 19652461  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  19652460 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 19652361  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||     
T  19652360 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatcc 19652261  T
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||| ||||| || || |||| || |||||||||    
T  19652260 gacacaatactcgacggtactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 577 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442675
Alignment:
Q  577 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 676  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  677 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttgat 20442675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 565 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876911
Alignment:
Q  565 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  665 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 720
Target Start/End: Original strand, 20828227 - 20828528
Alignment:
Q  419 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  20828227 ctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctc 20828326  T
Q  519 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 618  Q
    | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  20828327 caccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacct 20828426  T
Q  619 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 718  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  20828427 caacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttc 20828526  T
Q  719 ac 720  Q
    ||    
T  20828527 ac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 24653908 - 24654185
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  24653908 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24654007  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||    
T  24654008 caactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgt 24654107  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 291  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  24654108 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 426 - 723
Target Start/End: Original strand, 24948564 - 24948861
Alignment:
Q  426 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 525  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  24948564 catacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttg 24948663  T
Q  526 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 625  Q
    |||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24948664 ctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatc 24948763  T
Q  626 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24948764 gaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 24944930 - 24945136
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  24944930 acatcatctcttggaataacatgcgaaggctccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24945029  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | |   |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24945030 caactctatatgccactgttccaaccctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 24945129  T
Q  214 catagga 220  Q
    |||||||    
T  24945130 catagga 24945136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 711
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276538
Alignment:
Q  190 cttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 289  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  290 ttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctg 389  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |   | || || || |    
T  22276118 ttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccagtcctaacaaggcactctctccgg 22276217  T
Q  390 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 489  Q
    |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| |||||    
T  22276218 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 22276317  T
Q  490 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 589  Q
     |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  |||||     
T  22276318 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatca 22276417  T
Q  590 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 689  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  22276418 gtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gaca 22276516  T
Q  690 caatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  22276517 caatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 542 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  542 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 641  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  642 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 635 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  635 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817291
Alignment:
Q  228 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 327  Q
    |||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  328 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 427  Q
    ||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||  | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23817619 catcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgacca 23817520  T
Q  428 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 527  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      ||||||    | |||||||    
T  23817519 tacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgct 23817420  T
Q  528 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 627  Q
    | | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |     
T  23817419 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 23817320  T
Q  628 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 656  Q
     ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817319 tcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 608 - 723
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  608 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 707  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  708 catgtagcttcacaat 723  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 569 - 723
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12640637 - 12640315
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  12640637 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 12640538  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12640537 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 12640438  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  12640437 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 12640338  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  12640337 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 12640315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 24831905 - 24831370
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  24831905 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttctct 24831806  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24831805 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24831706  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| | || ||     
T  24831705 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactaacatgaaaactgttg 24831606  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24831605 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24831506  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |    
T  24831505 ctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcag 24831406  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831405 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 711
Target Start/End: Original strand, 25128474 - 25128907
Alignment:
Q  278 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 377  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| | |||||| |  |    
T  25128474 tcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaacctccgatcctaacaaaa 25128573  T
Q  378 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 477  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| |||||| | || || ||    
T  25128574 cactttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatacttgaatgaaaactgttgtt 25128673  T
Q  478 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 577  Q
     ||||| ||||| |||||||  | |       ||||| |  | | |||||| | || ||||  ||| || ||||||||||    |||||| ||||||||     
T  25128674 gtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgacccaactgacactttgctccaaaatacaagctcttaataaatcctctaaactctgaatagtcctctct 25128773  T
Q  578 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 677  Q
      ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  25128774 atctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggat 25128873  T
Q  678 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128874 cccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22762239 - 22761752
Alignment:
Q  224 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 323  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22762239 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctctt 22762140  T
Q  324 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 423  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | ||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || |||||    
T  22762139 ggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccg 22762040  T
Q  424 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 523  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||    
T  22762039 accatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 22761940  T
Q  524 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 623  Q
    ||||  | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22761939 tgcttcaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaagagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaact 22761840  T
Q  624 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761839 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24569851
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| | || |||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |  || ||||| |||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaaaacactttctcct 24570174  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
     |||||||||| |||||||| || || || ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  24570173 aactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24570074  T
Q  489 cgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 587  Q
    | |||||||| | |  |||  ||| || |    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||    
T  24570073 caatcaacggtaaac-actcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccat 24569975  T
Q  588 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 687  Q
    | || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  24569974 cggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctga 24569875  T
Q  688 tacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569874 cacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27368448 - 27368394
Alignment:
Q  278 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27368448 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 27368394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24833453 - 24833355
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaa 112  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24833453 acatcatctcttcgaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaa 24833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890829
Alignment:
Q  422 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 23890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 594; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16350998 - 16350293
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagc 126  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16350998 gaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagc 16350899  T
Q  127 caccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16350898 caccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgact 16350799  T
Q  227 ctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgga 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350798 ctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgga 16350699  T
Q  327 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16350698 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 16350599  T
Q  427 atacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 526  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350598 atacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 16350499  T
Q  527 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16350498 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcg 16350399  T
Q  627 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 726  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  16350398 aacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctc 16350299  T
Q  727 cttgat 732  Q
    ||||||    
T  16350298 cttgat 16350293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 51333869 - 51333187
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  51333869 acatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 51333770  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  51333769 tatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctta 51333670  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333669 ttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 51333570  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51333569 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgcca 51333470  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333469 ttccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 51333370  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51333369 atcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaactt 51333270  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  51333269 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 51333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33391423 - 33390723
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33391423 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 33391324  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33391323 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 33391224  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33391223 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 33391124  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391123 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 33391024  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391023 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 33390924  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33390923 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 33390824  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  33390823 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 33390724  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  33390723 t 33390723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 19106332 - 19107032
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||    
T  19106332 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccg 19106431  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19106432 ttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19106531  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19106532 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 19106631  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106632 ttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 19106731  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106732 aagactcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 19106831  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19106832 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 19106931  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  19106932 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 19107031  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  19107032 t 19107032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 21830268 - 21830968
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21830268 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21830367  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21830368 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21830467  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21830468 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatc 21830567  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21830568 tgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatata 21830667  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21830668 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgag 21830767  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21830768 aacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 21830867  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  21830868 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttga 21830967  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  21830968 t 21830968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354202
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 41354582  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  41354581 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttc 41354482  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354481 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 41354382  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41354381 agttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 41354282  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 693  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354281 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 21836915 - 21837615
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21836915 acatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21837014  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21837015 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21837114  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837115 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatc 21837214  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21837215 tgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccataca 21837314  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837315 aagcgtcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 21837414  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21837415 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 21837514  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21837515 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 21837614  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  21837615 t 21837615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17045409 - 17044709
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17045409 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17045310  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  17045309 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaa 17045210  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17045209 aaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 17045110  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045109 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 17045010  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17045009 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaag 17044910  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17044909 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 17044810  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17044809 aaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 17044710  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  17044709 t 17044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 16079027 - 16078350
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  16079027 acatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacca 16078928  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  16078927 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16078828  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||                   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16078827 aaacacgtggtctccttcctg-------------------cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 16078747  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078746 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 16078647  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16078646 aagccttaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaag 16078547  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  16078546 aacacaaactctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagcc 16078447  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| |||||||    
T  16078446 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----accatgtaacctcacaatctccttga 16078351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 50620638 - 50619959
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  50620638 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccacca 50620539  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  50620538 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 50620439  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
T  50620438 aaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatc 50620339  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620338 ttaaccttctcagtagtttattgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 50620239  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50620238 aagcctcaaaaggtgcaattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaag 50620139  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  50620138 tacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 50620039  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620038 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 723
Target Start/End: Original strand, 16369271 - 16369953
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactt 140  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||     
T  16369271 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactc 16369370  T
Q  141 tttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 240  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| || ||    
T  16369371 tttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 16369470  T
Q  241 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttc 340  Q
     |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  || ||     
T  16369471 atctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttt 16369570  T
Q  341 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcga 440  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  16369571 tcaatagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaa 16369670  T
Q  441 aaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 540  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  16369671 aaagtgtcattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaac 16369770  T
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
    ||||||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  16369771 tctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctct 16369870  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369871 tgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 595
Target Start/End: Original strand, 20249815 - 20250378
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  20249815 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 20249914  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20249915 ttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 20250014  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  20250015 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatc 20250114  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250115 ttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 20250214  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20250215 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaag 20250314  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 595  Q
     ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250315 tacataaactctcaacaaatcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 605
Target Start/End: Original strand, 20136761 - 20137316
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||| | |    
T  20136761 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgata 20136860  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20136861 tctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttc 20136960  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  20136961 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtt 20137060  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  20137061 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgcca 20137160  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20137161 ttcctatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaa 20137260  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 605  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137261 atcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgatatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760569
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 19760979  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19760978 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcc 19760879  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760878 tacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatccca 19760779  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19760778 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactt 19760679  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19760678 aacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgta 19760579  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  19760578 gcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 19854261 - 19854966
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || ||||    
T  19854261 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaac 19854360  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  19854361 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 19854460  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  19854461 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttc 19854560  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||  || ||||| |    
T  19854561 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcc 19854660  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  19854661 tgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactc-atcaacggtaggtgactatccca 19854759  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19854760 agctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaatcctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 19854859  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  19854860 aacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 19854959  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  19854960 gcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 32 - 468
Target Start/End: Original strand, 21747500 - 21747935
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  21747500 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccg 21747599  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| | |||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21747600 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21747699  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    | | | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  21747700 acatatgtggtctccttctagaaactcaagatcttt-ctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatc 21747798  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21747799 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcataca 21747898  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 468  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747899 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgata 21747935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 20940475 - 20939770
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  20940475 acatcatctcttggaataacgtgcgaaagatacgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20940376  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  20940375 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20940276  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20940275 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttc 20940176  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| || ||||| |    
T  20940175 atcttttctctgatcatcttgactttctctatagtttgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcc 20940076  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20940075 tatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 20939976  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  20939975 agctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactc 20939876  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
       ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  20939875 ggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgta 20939776  T
Q  714 gcttca 719  Q
    ||||||    
T  20939775 gcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22432817
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||| || || ||||    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  |||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || ||||  ||||| || || || ||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22433229  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  |||||||| |||||| || ||||| |  ||||| |  |  ||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22433228 atcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaattcggtcccaacaccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 22433129  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||| | | || |||||||||||    
T  22433128 tacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatccca 22433029  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22433028 agctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 22432929  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| |    
T  22432928 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgca 22432829  T
Q  714 gcttcacaattt 725  Q
    ||||||||||||    
T  22432828 gcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677733
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     ||||  || ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  215 ataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    | |||| |||| ||||| ||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 37677326  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  37677327 atcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 37677426  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  37677427 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatccca 37677526  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| || || | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  37677527 agctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 37677626  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |    
T  37677627 aacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaa 37677726  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  37677727 gcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20857173 - 20856476
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  20857173 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20857074  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20857073 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 20856974  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || ||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  20856973 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttc 20856874  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||    |||||||  |||||||| |||||||  ||||| |  ||  | || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20856873 atcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtttcatgaaccaattccagccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcc 20856774  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| |||||    
T  20856773 tgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtccca 20856674  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20856673 agctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactc 20856574  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  20856573 aatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 20294359 - 20295065
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  20294359 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20294458  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20294459 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 20294558  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20294559 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 20294658  T
Q  314 attttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || || ||    ||||| |||| ||| ||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||     
T  20294659 atcttttcccttatcattctgacctt-ctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtc 20294757  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  20294758 ctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatccg 20294857  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20294858 aagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaact 20294957  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||     
T  20294958 caacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatga 20295057  T
Q  713 agcttcac 720  Q
    ||||||||    
T  20295058 agcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20836231 - 20835591
Alignment:
Q  86 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 185  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20836231 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttct 20836132  T
Q  186 tt---gacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 282  Q
    |    ||||| || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||| ||||| |||  | || | ||||||||||||    
T  20836131 tcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtcatg 20836032  T
Q  283 ataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctt 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  20836031 ataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacactc 20835932  T
Q  383 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 482  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |    
T  20835931 tctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 20835832  T
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||    
T  20835831 tgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattg 20835732  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  20835731 accgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatcccta 20835632  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20835631 tccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 474 - 723
Target Start/End: Original strand, 21749348 - 21749597
Alignment:
Q  474 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 573  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21749348 tattatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 21749447  T
Q  574 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749448 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 21749547  T
Q  674 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21749548 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19665285 - 19664945
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  19665285 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaa 19665186  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  19665185 ctctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcat 19665086  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| | ||||||| ||| || || ||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  19665085 aggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 19664986  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 357  Q
    ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  19664985 ttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 149 - 653
Target Start/End: Original strand, 41307907 - 41308411
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || |||| |||||| |||||||| |    
T  41307907 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccct 41308006  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || || |  |||||||| |||||    
T  41308007 cttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgtagt 41308106  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     || ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||  |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41308107 ctgatgaaccaaatccagtcccaacaccacactttctcccaactcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 41308206  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 548  Q
    || |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  41308207 ataccaatactcgaatgctaattgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagca 41308306  T
Q  549 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    |||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  41308307 aatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T
Q  649 tttcc 653  Q
     ||||    
T  41308407 cttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 503 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  503 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  603 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 702  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  703 aacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31550593 - 31550136
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||    
T  31550593 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31550494  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | ||||  || ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||    
T  31550493 caactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgt 31550394  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  31550393 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttc 31550294  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| |   |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  31550293 atcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 31550194  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 471  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  31550193 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 31550136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Original strand, 20244147 - 20244437
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  20244147 acatcatctctcggaataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 20244246  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  20244247 caactctataggccactgttccaaccctctctgaaatctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgt 20244346  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 304  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244347 cataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 452 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 24099577 - 24099306
Alignment:
Q  452 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 551  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  24099577 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 24099478  T
Q  552 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 651  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  24099477 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 24099378  T
Q  652 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24099377 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50612810 - 50612602
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  50612810 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccacca 50612711  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  50612710 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 50612611  T
Q  232 aaacacgtg 240  Q
    ||| |||||    
T  50612610 aaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 419 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 19663143 - 19662844
Alignment:
Q  419 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19663143 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 19663044  T
Q  519 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 618  Q
    | ||||| ||||| ||||| | |||||        || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19663043 caccttgttcaagcacacacactctcagtt-----tccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacct 19662949  T
Q  619 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 718  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19662948 caacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttc 19662849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20075468 - 20075170
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  20075468 tcatccctcggaatcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 20075369  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||  ||| ||||| ||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  20075368 ctttatatgccactgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaa 20075269  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 315  Q
    |||| |||| || | ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  20075268 aggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 476 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 31539947 - 31539703
Alignment:
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  31539947 ttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctct 31539848  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  31539847 ccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcgg 31539748  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31539747 atctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 598 - 723
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  598 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 697  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  698 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20831642 - 20831107
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  20831642 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 20831543  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  20831542 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 20831443  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  20831442 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 20831343  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  20831342 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 20831243  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  20831242 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 20831143  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831142 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163378
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaat 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 315
Target Start/End: Original strand, 11382674 - 11382842
Alignment:
Q  147 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 246  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||    
T  11382674 aaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcacc 11382773  T
Q  247 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 315  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11382774 ctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | ||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| |||||  |||||||| | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  215 ataggactgac 225  Q
    | |||| ||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 641 - 711
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477015
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatg 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatg 24477015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 20914319 - 20914854
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  |    
T  20914319 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctccatt 20914418  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | | |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  20914419 tataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggttctaacat 20914518  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  20914519 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatgaaaattgttt 20914618  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      | |||| || | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    || ||| |||||||    
T  20914619 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctaaatagtcctct 20914718  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  20914719 cagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 20914818  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914819 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135520
Alignment:
Q  228 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 327  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||  || ||||| | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||| | || ||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  328 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 427  Q
    ||||| |||||| |  |||||||  || ||||  ||||||||||| |   | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  428 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 464  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaat 22135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||| | | ||| |||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 342  Q
    ||| || |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  562 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 661  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  662 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 350
Target Start/End: Original strand, 46518830 - 46519004
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  46518830 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 46518929  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  46518930 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46519004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 678
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  669 atcttggatc 678  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 591; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 8386362 - 8387064
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8386362 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8386461  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8386462 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8386561  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386562 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 8386661  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386662 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 8386761  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386762 aagcttcgaacggcgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 8386861  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8386862 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 8386961  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  8386962 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8387061  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  8387062 tgt 8387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 18297155 - 18297855
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18297155 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18297254  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18297255 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18297354  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297355 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 18297454  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297455 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 18297554  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297555 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 18297654  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18297655 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 18297754  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18297755 aaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 18297854  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  18297855 t 18297855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778157
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19778574  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19778573 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 19778474  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778473 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 19778374  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19778373 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 19778274  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19778273 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgca 19778174  T
Q  714 gcttcacaatttccttg 730  Q
     ||||||||| ||||||    
T  19778173 acttcacaatctccttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 29039466 - 29038764
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29039466 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29039367  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29039366 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 29039267  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039266 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 29039167  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039166 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 29039067  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039066 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 29038967  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29038966 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 29038867  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  29038866 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 29038767  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  29038766 tgt 29038764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 12476550 - 12477252
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12476550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 12476649  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12476650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12476749  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476750 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 12476849  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476850 tgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 12476949  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476950 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 12477049  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12477050 aacacaaattctcaacaaatcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 12477149  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  12477150 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 12477249  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  12477250 tgt 12477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 732
Target Start/End: Original strand, 27711281 - 27711986
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagc 126  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27711281 gaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagc 27711380  T
Q  127 caccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27711381 caccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgact 27711480  T
Q  227 ctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgga 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711481 ctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgga 27711580  T
Q  327 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27711581 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacc 27711680  T
Q  427 atacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 526  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711681 atacaaagtctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 27711780  T
Q  527 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27711781 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcg 27711880  T
Q  627 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 726  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  27711881 aacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctc 27711980  T
Q  727 cttgat 732  Q
    ||||||    
T  27711981 cttgat 27711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 14304039 - 14303340
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14304039 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 14303940  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14303939 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggg-tcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 14303841  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303840 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 14303741  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14303740 cgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 14303641  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303640 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 14303541  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14303540 aacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 14303441  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  14303440 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttga 14303341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 23955697 - 23956397
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23955697 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 23955796  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23955797 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 23955896  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23955897 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 23955996  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955997 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 23956096  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  23956097 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaag 23956196  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  23956197 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaaccc 23956296  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23956297 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 23956396  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  23956397 t 23956397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 40472990 - 40473690
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40472990 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcg 40473089  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40473090 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40473189  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  40473190 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatt 40473289  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40473290 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 40473389  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473390 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 40473489  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  40473490 aacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaaccc 40473589  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  40473590 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 40473689  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  40473690 t 40473690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 12523626 - 12524328
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  12523626 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccg 12523725  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12523726 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12523825  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12523826 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 12523925  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12523926 ttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 12524025  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524026 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 12524125  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12524126 aacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 12524225  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  12524226 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 12524325  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  12524326 tgt 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8053685 - 8052985
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  8053685 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcg 8053586  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8053585 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8053486  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8053485 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 8053386  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8053385 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccataca 8053286  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8053285 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaag 8053186  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8053185 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 8053086  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  8053085 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8052986  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  8052985 t 8052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 14680517 - 14681219
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14680517 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 14680616  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14680617 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14680716  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  14680717 aaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatc 14680816  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680817 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 14680916  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680917 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 14681016  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14681017 cacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 14681116  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |    
T  14681117 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaa 14681216  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  14681217 tgt 14681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266368
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14266680  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266679 attttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 14266580  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266579 tgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 14266480  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  14266479 agttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgatacgccgaactc 14266380  T
Q  614 aatctcaacttc 625  Q
    ||||||||||||    
T  14266379 aatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 16252507 - 16251810
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16252507 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16252408  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  16252407 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 16252308  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16252307 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatc 16252208  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252207 ttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 16252108  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252107 aagcctcaaaaggtgtcattccaataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 16252008  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16252007 aacacaaacttacaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 16251908  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16251907 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcctt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18227508 - 18226808
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  18227508 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactg 18227409  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18227408 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 18227309  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18227308 aaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 18227209  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227208 ttaactttcttagtagtcttctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 18227109  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227108 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 18227009  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18227008 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacct 18226909  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  18226908 aaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttga 18226809  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  18226808 t 18226808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16354816
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttc 16355226  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16355225 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattc 16355126  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16355125 tccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcaaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatccca 16355026  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16355025 agttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactc 16354926  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16354925 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaa 16354826  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  16354825 acttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 726
Target Start/End: Original strand, 7090383 - 7091076
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  7090383 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 7090482  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| | | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7090483 ttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 7090581  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  7090582 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 7090681  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7090682 ttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatata 7090781  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7090782 aagcctcataaggttccattctaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctaaag 7090881  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  7090882 aacccaaaccctcaacaaatcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacct 7090981  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 726  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090982 aaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14850737
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || |  ||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14851147  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  14851146 atcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttc 14851047  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14851046 tgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatccca 14850947  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14850946 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 14850847  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14850846 aacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 14850747  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  14850746 acttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 221 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 1640298 - 1639793
Alignment:
Q  221 ctgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 320  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  1640298 ctgagtctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatctttt 1640199  T
Q  321 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 420  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1640198 cttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatct 1640099  T
Q  421 ccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 520  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1640098 tcgaccatacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccct 1639999  T
Q  521 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 620  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||    
T  1639998 ccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctca 1639899  T
Q  621 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1639898 acttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 1639799  T
Q  721 aatttc 726  Q
    ||||||    
T  1639798 aatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 355 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147249
Alignment:
Q  355 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 454  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  455 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 554  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 15147424  T
Q  555 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 654  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15147423 ctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcca 15147324  T
Q  655 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147323 aaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 545
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159955
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | |||||||  ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 14159723  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14159724 atcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttc 14159823  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  14159824 tgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatccca 14159923  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctca 545  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14159924 agttccaccttgctcaagtacataaactctca 14159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15003704 - 15002995
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  15003704 acatcatctattggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15003605  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  15003604 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 15003505  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15003504 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15003405  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |    
T  15003404 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcc 15003305  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15003304 tccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 15003205  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15003204 agctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 15003105  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  15003104 aacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgca 15003005  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  15003004 acttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 528
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652754
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14652539  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14652540 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttc 14652639  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  14652640 tgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatccca 14652739  T
Q  514 agttcctccttgctc 528  Q
    ||||| || ||||||    
T  14652740 agttcatctttgctc 14652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246565
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
     |||||  || ||||| ||||||||  | ||    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||  | ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||   | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15246155  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||  ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||| || | || |||||||    
T  15246156 atcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttc 15246255  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || || || || || ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15246256 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtgactgttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatccca 15246355  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15246356 acctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactc 15246455  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  15246456 aacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgta 15246555  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  15246556 acttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 1649617 - 1648908
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || |    
T  1649617 acatcatcccttggaattacatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacc 1649518  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1649517 caactctatatgccacagttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgt 1649418  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||| | ||| || || || || |||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1649417 cataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttc 1649318  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||| ||||  |||||||  ||||| |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || |||||||    
T  1649317 atcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttc 1649218  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1649217 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 1649118  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1649117 agctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 1649018  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  1649017 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaa 1648918  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  1648917 gcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 242 - 723
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706559
Alignment:
Q  242 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 341  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||   || | || |||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  342 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 441  Q
    |  |||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaa 8706277  T
Q  442 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 541  Q
     |||| |||||  ||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |    
T  8706278 tggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaact 8706377  T
Q  542 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 641  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||    
T  8706378 ctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctctt 8706477  T
Q  642 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8706478 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264428
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 3264834  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  3264833 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 3264734  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  3264733 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaa 3264634  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  3264633 gctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 3264534  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  3264533 acttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 3264434  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  3264433 tttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11206865
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| ||||||||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11207271  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  11207270 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 11207171  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || |  ||||||||||||    
T  11207170 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaa 11207071  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11207070 gctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 11206971  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11206970 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 11206871  T
Q  715 cttcac 720  Q
    ||||||    
T  11206870 cttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453171
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 29453577  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  ||  |||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  29453576 tcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgaaccaaatcccgtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 29453477  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  29453476 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaa 29453377  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  29453376 gctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 29453277  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29453276 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 29453177  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  29453176 tttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 222 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15415158 - 15414657
Alignment:
Q  222 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15415158 tgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T
Q  322 ttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 420  Q
        |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15415058 ccttatcaatttgaccttt-tccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacct 15414960  T
Q  421 ccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 520  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||     
T  15414959 ccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggcagatgactatcccaaactcca 15414860  T
Q  521 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 620  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15414859 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctca 15414760  T
Q  621 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  15414759 actttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcac 15414660  T
Q  721 aat 723  Q
    |||    
T  15414659 aat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 723
Target Start/End: Original strand, 33222862 - 33223564
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataag 125  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |    
T  33222862 ggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatg 33222961  T
Q  126 ccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 225  Q
    |||| ||||||||| | |   |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  33222962 ccactgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgac 33223061  T
Q  226 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 325  Q
     |||| ||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||        
T  33223062 cctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttccctt 33223161  T
Q  326 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 425  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||  ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  33223162 atcaacttgactttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgac 33223261  T
Q  426 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 525  Q
    ||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||  | || ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  33223262 catacaatgctttgaatggtgtcataccaatactctattgttattttttgttttatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttg 33223361  T
Q  526 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat-----tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 620  Q
    |||||| ||||| | |||||  ||||| || |  || || ||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  33223362 ctcaagtacacacactctcagtaaatcttccaatgattggatcgtcctctcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctca 33223461  T
Q  621 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  33223462 acttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcac 33223561  T
Q  721 aat 723  Q
    |||    
T  33223562 aat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 627
Target Start/End: Original strand, 16145847 - 16146459
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  16145847 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 16145946  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16145947 ctctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcat 16146046  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| | ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  16146047 aggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 16146146  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || ||    |||| ||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  16146147 ttttcccttatcaccttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctac 16146246  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||     
T  16146247 acctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagc 16146346  T
Q  517 tcctccttgctcaag--aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    ||| |||||||||||   ||||| | ||| |  |||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16146347 tccaccttgctcaagcacacacacactcttagtaaatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 16146446  T
Q  615 atctcaacttcga 627  Q
    | | |||||||||    
T  16146447 accccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Original strand, 20890918 - 20891623
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  || |||||||    
T  20890918 tcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaaccca 20891016  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
      | ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  20891017 tcctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaa 20891116  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  20891117 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatc 20891216  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  |  ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  20891217 ttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaattcggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctac 20891316  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||     
T  20891317 acctccggccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagctattgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagc 20891416  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||     
T  20891417 tccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaac 20891516  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || || ||||| || | ||    
T  20891517 ctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaact 20891616  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  20891617 tcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 531
Target Start/End: Original strand, 15070345 - 15070862
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  15070345 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15070444  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||| |  || ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||  |||| |||||||| ||    
T  15070445 ccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgt 15070544  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15070545 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15070644  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15070645 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttc 15070744  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15070745 tgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 15070844  T
Q  514 agttcctccttgctcaag 531  Q
    || ||| |||||||||||    
T  15070845 agctccaccttgctcaag 15070862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 276
Target Start/End: Original strand, 15364336 - 15364580
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15364336 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15364435  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15364436 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15364535  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgctt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15364536 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgctt 15364580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 44662206 - 44661500
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  44662206 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 44662107  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| ||    
T  44662106 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 44662007  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  44662006 caaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 44661907  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  44661906 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcc 44661807  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg-aagatgactatccc 512  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||| |||| ||||    
T  44661806 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaagacaaga-gactgtccc 44661708  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  44661707 aagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaact 44661608  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||     
T  44661607 caacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatga 44661508  T
Q  713 agcttcac 720  Q
    || |||||    
T  44661507 agtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15150050 - 15149740
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |    
T  15150050 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgata 15149951  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149950 tctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 15149851  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||     
T  15149850 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtc 15149751  T
Q  350 tgctgaacaat 360  Q
    |||||||||||    
T  15149750 tgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 149 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15359295 - 15358721
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||||| |    
T  15359295 atctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccct 15359196  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||    
T  15359195 cttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagt 15359096  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15359095 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 15358996  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 548  Q
    || |||||||  ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |    
T  15358995 ataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagta 15358896  T
Q  549 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    ||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  15358895 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagact 15358796  T
Q  649 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358795 cttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 158 - 723
Target Start/End: Original strand, 27900462 - 27901027
Alignment:
Q  158 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 257  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||    
T  27900462 ggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 27900561  T
Q  258 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 357  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  |||||    
T  27900562 caaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaac 27900661  T
Q  358 aatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaata 457  Q
     |  || ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27900662 caaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaata 27900761  T
Q  458 ctagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcta 557  Q
    || ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  27900762 ctcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctcta 27900861  T
Q  558 gcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaa 657  Q
      || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  27900862 aagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaa 27900961  T
Q  658 tctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27900962 tcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 272 - 723
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15078276
Alignment:
Q  272 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  372 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 471  Q
    | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  15077925 acactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15078024  T
Q  472 attattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 571  Q
     || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||     
T  15078025 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgtt 15078124  T
Q  572 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 671  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15078125 ctcttcgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 15078224  T
Q  672 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15078225 tcggatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 51606521 - 51605998
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  51606521 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 51606422  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  51606421 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 51606322  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  51606321 catcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 51606222  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51606221 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcc 51606122  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  51606121 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 51606022  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacaca 537  Q
    || ||| || || ||||| |||||    
T  51606021 agctccaccctgttcaagcacaca 51605998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 533 - 723
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  533 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 632  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  633 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 380  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 582 - 723
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  582 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 681  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  682 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 42702835 - 42703103
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  42702835 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 42702934  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  42702935 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 42703034  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 282  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  42703035 catcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 42703103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 251 - 669
Target Start/End: Original strand, 13247814 - 13248232
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||    
T  13247814 tgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 13247913  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||    
T  13247914 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccat 13248013  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
     | ||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |  | || |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  13248014 cctaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta-aacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaa 13248112  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    |||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||     
T  13248113 atcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactc 13248212  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    | ||| ||  ||||||||||    
T  13248213 tcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 572 - 723
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  572 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  672 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 14997410 - 14997945
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14997410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14997509  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  14997510 tatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 14997609  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || |  ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || ||     
T  14997610 agcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttg 14997709  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14997710 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14997809  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14997810 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 14997909  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997910 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14927321 - 14927151
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  14927321 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactg 14927222  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgt 202  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927221 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 9290929 - 9291464
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||| | |||| |||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  9290929 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 9291028  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  9291029 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 9291128  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||  |     
T  9291129 agcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgctg 9291228  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    || ||| |||||||    
T  9291229 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctaaatagtcctct 9291328  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  9291329 ccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 9291428  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291429 atcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15293335 - 15293013
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |  |    
T  15293335 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttt 15293236  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15293235 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 15293136  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  15293135 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 15293036  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15293035 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15293013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 55375536 - 55375214
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||||||||| || || |||||||| | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  55375536 gtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 55375437  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  55375436 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaacttctggtcctaacaa 55375337  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || ||     
T  55375336 agcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgtaaactgttg 55375237  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  55375236 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 55375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 16752669 - 16752826
Alignment:
Q  158 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  16752669 ggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 16752768  T
Q  258 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 315  Q
    ||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16752769 caagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15415319 - 15415214
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||| || || ||||    
T  15415319 acattatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaac 15415220  T
Q  114 ccactc 119  Q
    ||||||    
T  15415219 ccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132298
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||| |||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||||| ||||| |  || |||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttctggacctaacaaaacactttcacct 12132375  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  12132374 gactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatga 12132298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 15319515 - 15319640
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||  |||| ||| |||||||| |  || ||||    
T  15319515 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaac 15319614  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaact 139  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||    
T  15319615 ccactctgtatgccactgttccaact 15319640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15359397 - 15359336
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 75  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15359397 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 15359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12342968 - 12342548
Alignment:
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    |||||||||||| ||  || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| | || |||||||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  12342968 cctgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagt 12342869  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     |  || |||| ||| |||||||  |   | ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  12342868 ctcttgcacaacctccggtcctagtaaagcactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgcc 12342769  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 548  Q
    || ||||||||||||||| |  | || || ||||| ||||| |||||||| | |     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  12342768 atcccaatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 12342669  T
Q  549 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    |||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  12342668 aatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 12342569  T
Q  649 tttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
     | ||||||| ||||||||||    
T  12342568 ctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18607892 - 18607823
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagat 101  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18607892 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  69 acacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaa 168  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  169 cttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacca 211  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16445390 - 16445234
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  16445390 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 16445291  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 332  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16445290 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 16445234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  580 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 679  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  680 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 498
Target Start/End: Original strand, 16685557 - 16685669
Alignment:
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    ||||||||| |||| || ||||  ||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |    
T  16685557 cctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaa 16685656  T
Q  486 actcgatcaacgg 498  Q
    |||| ||||||||    
T  16685657 actcaatcaacgg 16685669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  584 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 623  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18550064 - 18549949
Alignment:
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |  |||| || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| |||||||||  |||| || |||||||    
T  18550064 tgctgaacaatctctggtcccaacactgcaatttcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgcca 18549965  T
Q  450 ttccaatactagaatg 465  Q
    | ||||||||||||||    
T  18549964 tcccaatactagaatg 18549949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 589; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 734
Target Start/End: Original strand, 18177699 - 18178383
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18177699 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 18177798  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18177799 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttc 18177898  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  18177899 ctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtt 18177998  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18177999 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgcca 18178098  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18178099 ttccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacag 18178198  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18178199 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaactt 18178298  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18178299 ttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgt 18178383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 8198567 - 8199269
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8198567 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8198666  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8198667 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8198766  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198767 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 8198866  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198867 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 8198966  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198967 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 8199066  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8199067 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 8199166  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  8199167 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 8199266  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  8199267 tgt 8199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 585; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 734
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871636
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10871215  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10871216 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 10871315  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871316 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 10871415  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10871416 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 10871515  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10871516 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgca 10871615  T
Q  714 gcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  10871616 gcttcacaatctctttgatgt 10871636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11237544 - 11236844
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11237544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 11237445  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11237444 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11237345  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11237344 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatc 11237245  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11237244 cgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatata 11237145  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237144 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 11237045  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11237044 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 11236945  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  11236944 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttga 11236845  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  11236844 t 11236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15161388 - 15160688
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15161388 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15161289  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15161288 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15161189  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15161188 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatc 15161089  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15161088 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 15160989  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160988 aagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 15160889  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15160888 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 15160789  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15160788 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 15160689  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  15160688 t 15160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 44791682 - 44790980
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44791682 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 44791583  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44791582 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 44791483  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791482 aaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 44791383  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791382 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 44791283  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791282 aagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 44791183  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44791182 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 44791083  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||    
T  44791082 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttga 44790983  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  44790982 tgt 44790980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 8707544 - 8708244
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8707544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8707643  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8707644 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8707743  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8707744 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 8707843  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707844 tgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 8707943  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707944 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 8708043  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8708044 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaaccc 8708143  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  8708144 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8708243  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  8708244 t 8708244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 18552089 - 18551389
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18552089 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18551990  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18551989 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18551890  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18551889 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 18551790  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551789 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 18551690  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551689 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 18551590  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18551589 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 18551490  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18551489 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 18551390  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  18551389 t 18551389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 14332336 - 14333036
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14332336 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 14332435  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14332436 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14332535  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14332536 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 14332635  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332636 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 14332735  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332736 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 14332835  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14332836 aacacaaattctcaataaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 14332935  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  14332936 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 14333035  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  14333036 t 14333036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 13686002 - 13686703
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaa-cattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccacc 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13686002 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccacc 13686101  T
Q  131 gttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 230  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13686102 gttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 13686201  T
Q  231 aaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat 330  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  13686202 aaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcat 13686301  T
Q  331 ctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  13686302 ctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatat 13686401  T
Q  431 aaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686402 aaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 13686501  T
Q  531 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13686502 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacc 13686601  T
Q  631 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  13686602 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 13686701  T
Q  731 at 732  Q
    ||    
T  13686702 at 13686703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 11553433 - 11552731
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11553433 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccg 11553334  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11553333 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11553234  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11553233 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 11553134  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553133 ttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 11553034  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553033 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 11552934  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11552933 aacacggatcctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 11552834  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  11552833 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaa 11552734  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  11552733 tgt 11552731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 12687440 - 12688142
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12687440 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccg 12687539  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12687540 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaa 12687639  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12687640 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 12687739  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687740 ttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 12687839  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687840 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 12687939  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12687940 cacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 12688039  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |    
T  12688040 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaa 12688139  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  12688140 tgt 12688142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17647 - 16947
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  17647 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17548  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17547 ttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 17448  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17447 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 17348  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17347 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 17248  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17247 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctccttgctcaag 17148  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17147 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacct 17048  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17047 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttga 16948  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  16947 t 16947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 14954559 - 14955261
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14954559 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccg 14954658  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14954659 ttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14954758  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14954759 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 14954858  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954859 ttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 14954958  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954959 aagtctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 14955058  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14955059 cacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 14955158  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||| |    
T  14955159 aaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaa 14955258  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  14955259 tgt 14955261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516520
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttc 23516819  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23516818 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttc 23516719  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516718 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 23516619  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23516618 agtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatgctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgatacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 15154983 - 15154294
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  15154983 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccg 15154884  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15154883 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15154784  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||||    
T  15154783 aaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatc 15154684  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154683 ttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc-----ctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 15154589  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154588 aagcttcataaggtgccatcccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 15154489  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  15154488 tacacaaactctcaacaagtcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 15154389  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 726  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154388 aaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 272 - 732
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596696
Alignment:
Q  272 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtccta 9596335  T
Q  372 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  9596336 agaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgact 9596435  T
Q  472 attattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 571  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596436 attattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 9596535  T
Q  572 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596536 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 9596635  T
Q  672 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9596636 ttggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgat 9596696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 12207127 - 12206418
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  12207127 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 12207028  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||  | ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  12207027 ccactctatatgccactgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgt 12206928  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12206927 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12206828  T
Q  314 attttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || |||||||  |||| | ||| |||| || ||||| |||||||| || || ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  12206827 atcttctcttttatcaatttgaccttt-tctgtagtctgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagta 12206729  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
     |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12206728 ttgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactctatcaacggcaggtgactatccc 12206629  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  12206628 aagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaact 12206529  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||     
T  12206528 caacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgc 12206429  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  12206428 agcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 86 - 723
Target Start/End: Original strand, 15624545 - 15625182
Alignment:
Q  86 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 185  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||     
T  15624545 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatttcc 15624644  T
Q  186 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 285  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  15624645 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgata 15624744  T
Q  286 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 385  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||    
T  15624745 actcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattacactctca 15624844  T
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  15624845 cctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactgttattgtacgtga 15624944  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15624945 actctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgacc 15625044  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15625045 atctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatct 15625144  T
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15625145 gacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102221
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 15102629  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||| |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||  |  || ||||| || | |||||  || |||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  15102628 attttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaacaacactc--tctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcc 15102531  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15102530 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 15102431  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15102430 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 15102331  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| || | ||||||||    
T  15102330 aacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgta 15102231  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  15102230 gcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14263862
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| || || ||||    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14264272  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || ||||  ||||| || ||||| |  |  ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  14264271 atcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcc 14264172  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  14264171 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatccca 14264072  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14264071 agctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatcctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 14263972  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14263971 aaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgca 14263872  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  14263871 acttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 19147133 - 19147842
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19147133 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19147232  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
     |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  19147233 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 19147332  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19147333 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 19147432  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |    
T  19147433 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcc 19147532  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  19147533 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattcca 19147632  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  19147633 agctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactc 19147732  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  19147733 aacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgca 19147832  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  19147833 acttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 20746532 - 20747241
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  20746532 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20746631  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
     |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  20746632 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 20746731  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20746732 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 20746831  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |    
T  20746832 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcc 20746931  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  20746932 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattcca 20747031  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  20747032 agctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactc 20747131  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20747132 aacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgca 20747231  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  20747232 acttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 32 - 603
Target Start/End: Original strand, 15203818 - 15204389
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  15203818 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccg 15203917  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||| | ||||   |||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| |  | ||||||| ||    
T  15203918 ttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaa 15204017  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |    
T  15204018 aaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaac 15204117  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  15204118 ttaaccttctctgtagtttgctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccataca 15204217  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
      || || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15204218 gcgcttcaaatggttccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctccttgctcaag 15204317  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 603  Q
     ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204318 tacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 11388741 - 11388046
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagc 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||    
T  11388741 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 11388642  T
Q  127 caccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 226  Q
    ||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  11388641 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgact 11388542  T
Q  227 ctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgga 326  Q
    ||||| ||||| || |||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |    
T  11388541 ctcaagaacacatgatctcct-cttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctctta 11388443  T
Q  327 tcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacc 426  Q
    ||| || ||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |    
T  11388442 tcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaac 11388343  T
Q  427 atacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgc 526  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  11388342 atacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgc 11388243  T
Q  527 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 626  Q
    ||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  11388242 tcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcg 11388143  T
Q  627 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11388142 aacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 21661885 - 21662591
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  |  ||||||||  | ||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| |||||||    
T  21661885 acatcatctcttggaatcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaac 21661984  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||   ||| || ||||  |||||| ||| | |||||||||| || ||||| ||| |||| || |  |||||||| || |  || ||||| ||||| ||    
T  21661985 ccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggt 21662084  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
     | |||  |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  21662085 aagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttc 21662181  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| || ||| || ||| |||| || |||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||   || |||||||||||||    
T  21662182 atcttttctctaatcaacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttc 21662281  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21662282 tgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatccca 21662381  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21662382 agatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactc 21662481  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21662482 aaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatggaacaccatgta 21662581  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  21662582 acttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 242 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11771881
Alignment:
Q  242 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 341  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  | ||||| ||||||| ||| ||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  342 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 441  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |  ||| |||||||||  ||    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacacaaagccttaaa 11772163  T
Q  442 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 541  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  11772162 tggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaact 11772063  T
Q  542 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 641  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  11772062 ctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctt 11771963  T
Q  642 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11771962 gcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16072606 - 16071912
Alignment:
Q  29 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagcca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||    | ||||    
T  16072606 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgcca 16072507  T
Q  129 ccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 228  Q
    | ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  16072506 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 16072407  T
Q  229 caaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatc 328  Q
    || |||||| || ||||| || |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||    
T  16072406 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 16072307  T
Q  329 atctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccat 428  Q
    ||||  || |||||  |||| ||  |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||| |||  ||||||||||    
T  16072306 atcttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccat 16072207  T
Q  429 acaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 528  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16072206 acaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctc 16072107  T
Q  529 aagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgag 628  Q
    ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  16072106 aagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaa 16072007  T
Q  629 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16072006 cccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 723
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6414142
Alignment:
Q  11 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  111 aacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 210  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||  | |||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  211 agtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcc 310  Q
     ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 6413729  T
Q  311 ttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggag 410  Q
    ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| || ||||| |  ||  | || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  6413730 ttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccagacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggag 6413829  T
Q  411 ttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatc 510  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  6413830 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatc 6413929  T
Q  511 ccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaa 610  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6413930 ccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaa 6414029  T
Q  611 ctcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 710  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  6414030 ctcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacggtacaccat 6414129  T
Q  711 gtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||    
T  6414130 gtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 18054280 - 18053572
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  18054280 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 18054181  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  18054180 caactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 18054081  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18054080 catcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 18053981  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  18053980 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcc 18053881  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  18053880 tgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 18053781  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18053780 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 18053681  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    | |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18053680 agtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgta 18053581  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  18053580 gcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 8212446 - 8211749
Alignment:
Q  23 ctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgat 122  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  |    
T  8212446 ctcggaattacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgt 8212347  T
Q  123 aagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggact 222  Q
    | ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |    
T  8212346 atgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagt 8212247  T
Q  223 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 322  Q
    ||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||     
T  8212246 gaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcc 8212147  T
Q  323 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcc 422  Q
       |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||    
T  8212146 cttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcc 8212047  T
Q  423 gaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcc 522  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||    
T  8212046 gaccatacaaggcttcgaacggcgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccacc 8211947  T
Q  523 ttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaac 622  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8211946 ttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaac 8211847  T
Q  623 ttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8211846 ttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11305884
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11306290  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  11306289 tcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 11306190  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  11306189 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaa 11306090  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11306089 gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 11305990  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11305989 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 11305890  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  11305889 tttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 13021279 - 13021988
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  13021279 acatcatctcttggaatcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 13021378  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||  ||| || ||    
T  13021379 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgt 13021478  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||| |||| ||| || || || || || |||||||| ||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  13021479 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 13021578  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || ||||||||||| |  ||||| |  || |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || |  ||||| |    
T  13021579 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcc 13021678  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||| |||||||    
T  13021679 tgcacctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccataccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatccca 13021778  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13021779 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 13021878  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  13021879 aacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgca 13021978  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  13021979 gcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14286703 - 14285994
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  14286703 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 14286604  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||   | |   ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  14286603 caactctatatgccactgttccaatcctatatgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgt 14286504  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  14286503 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttc 14286404  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || |||||||| || || ||||| |  || ||||| || || || || ||   |||||||||||||||||| ||||| |    
T  14286403 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcc 14286304  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14286303 tgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 14286204  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14286203 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 14286104  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||| || || |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  14286103 aacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 14286004  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  14286003 gcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152929
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 49152523  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  49152524 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 49152623  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  49152624 acacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaa 49152723  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  49152724 gctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactca 49152823  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||    
T  49152824 acttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaag 49152923  T
Q  715 cttcac 720  Q
    ||||||    
T  49152924 cttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16950784 - 16950089
Alignment:
Q  28 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagcc 127  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| |||    
T  16950784 aataacatgcaaatgatccgctacatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgcc 16950685  T
Q  128 accgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactc 227  Q
    || ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  16950684 actgttccaaccctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 16950585  T
Q  228 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 327  Q
    ||| ||| || || || || |||||||||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    ||    
T  16950584 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttat 16950485  T
Q  328 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 427  Q
    |||||  |||||||||||||| || ||||| |  ||  |||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  16950484 catcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacca 16950385  T
Q  428 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 527  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||| |||   ||| |||||||    
T  16950384 tacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactccaccttgct 16950285  T
Q  528 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 627  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16950284 caagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcga 16950185  T
Q  628 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16950184 tcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130503
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||   | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14130094  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || ||||||||  | |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14130095 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcc 14130194  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14130195 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 14130294  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14130295 agctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 14130394  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  14130395 aatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgta 14130494  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  14130495 gcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 13665475 - 13666168
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  13665475 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 13665574  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| ||     ||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  13665575 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 13665669  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || ||| | || |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13665670 cataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13665769  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| |||||||| |||||           | || || |  || || ||||||||||||||||| || |||||      
T  13665770 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtttgatgaac-----------ccaacacaaaactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtca 13665858  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  13665859 tgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 13665958  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13665959 agctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 13666058  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  13666059 aacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgta 13666158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 383 - 723
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040326
Alignment:
Q  383 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14040086 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14040185  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14040186 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14040285  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14040286 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 383 - 723
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350356
Alignment:
Q  383 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14350116 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14350215  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14350216 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14350315  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14350316 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14434321
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||   | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14433912  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || ||||||||  | |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14433913 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcc 14434012  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14434013 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 14434112  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14434113 agctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 14434212  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  14434213 aatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgta 14434312  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  14434313 gcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 23506197 - 23505491
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  23506197 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 23506098  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| | || |||||| |   | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  23506097 caactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 23505998  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23505997 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 23505898  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||   ||||| ||  ||||| || ||||| | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23505897 atcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttc 23505798  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23505797 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 23505698  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23505697 agctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 23505598  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    | |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||    
T  23505597 agtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgta 23505498  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  23505497 gcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 1722 - 1025
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataag 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |    
T  1722 ggaataacatgcgaatgatctgctacatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatg 1623  T
Q  126 ccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 225  Q
    |||  ||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  1622 ccagtgttccaaccctttcttaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaac 1523  T
Q  226 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 325  Q
    | ||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||        
T  1522 tttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttccctt 1423  T
Q  326 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 425  Q
    |||||||  || ||||||||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  1422 atcatcttgaccttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgac 1323  T
Q  426 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 525  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  1322 catacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttg 1223  T
Q  526 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 625  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  1222 ctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctc 1123  T
Q  626 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1122 gatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 23200070 - 23199418
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  23200070 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 23199971  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| | || |||||| |   | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  23199970 caactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 23199871  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23199870 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 23199771  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||   ||||| ||  ||||| || ||||| | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23199770 atcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttc 23199671  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23199670 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 23199571  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23199570 agctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 23199471  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 666  Q
    | |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23199470 agtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 197 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964646
Alignment:
Q  197 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 296  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  297 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 396  Q
     |||||||||||||||||| || |||   |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || || || || || |||||| |    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcata 35964817  T
Q  397 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaac 496  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||     
T  35964816 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 35964717  T
Q  497 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 567  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964716 agaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 12455625 - 12456333
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||    
T  12455625 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 12455723  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | || ||||||||| |||| |||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  12455724 caattctataagccactgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgt 12455823  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12455824 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 12455923  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||| ||  |||||||||||||| |  || || |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  12455924 atcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtctcatgtaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 12456023  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  12456024 tacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatccca 12456123  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  12456124 agctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctc 12456223  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  12456224 aacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgta 12456323  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  12456324 gcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 378
Target Start/End: Original strand, 14037764 - 14038092
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |    
T  14037764 acatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgata 14037863  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14037864 tctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 14037963  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  14037964 ttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtt 14038063  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccac 378  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  14038064 tgttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 378
Target Start/End: Original strand, 14347794 - 14348122
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |    
T  14347794 acatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgata 14347893  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14347894 tctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 14347993  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  14347994 ttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtt 14348093  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccac 378  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  14348094 tgttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 26118799 - 26118226
Alignment:
Q  147 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||    
T  26118799 aaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26118700  T
Q  247 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat--tttctcttggatcatctgaactttctcag 344  Q
     |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||  |||| |   ||||||||||    
T  26118699 ctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaacctgactttctcag 26118602  T
Q  345 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 444  Q
    |||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  26118601 tagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgg 26118502  T
Q  445 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 544  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||    
T  26118501 tgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc 26118402  T
Q  545 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 644  Q
    |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |    
T  26118401 aacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgta 26118302  T
Q  645 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    |||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26118301 aacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 248 - 722
Target Start/End: Original strand, 15340587 - 15341061
Alignment:
Q  248 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 347  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||| ||  || |||||||| |    
T  15340587 tcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttgaccttctcagtcg 15340686  T
Q  348 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 447  Q
    | || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  15340687 tctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgc 15340786  T
Q  448 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 547  Q
    ||| || ||||| ||||| ||  | || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  15340787 catacctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaac 15340886  T
Q  548 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 647  Q
    |||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15340887 aaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaac 15340986  T
Q  648 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 722  Q
    | ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15340987 tcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 13968626 - 13968289
Alignment:
Q  383 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 482  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  13968626 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 13968527  T
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    ||||| | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  13968526 tgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 13968427  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  13968426 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 13968327  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    || || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  13968326 tccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 608 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203242
Alignment:
Q  608 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 707  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  708 catgtagcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 608 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509369
Alignment:
Q  608 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 707  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  708 catgtagcttcacaatttccttgatgt 734  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 611
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457298
Alignment:
Q  253 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 352  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   || | |   |||||||||||||| |      
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctca 12457039  T
Q  353 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 452  Q
    ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  12457040 tgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatac 12457139  T
Q  453 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 552  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| |||||    
T  12457140 caatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatc 12457239  T
Q  553 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 611  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12457240 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 711
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936965
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |   | | |||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacct 14936642  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    || |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  14936643 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 14936742  T
Q  489 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 588  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  14936743 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 14936842  T
Q  589 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 688  Q
     ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  14936843 ggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 14936942  T
Q  689 acaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  14936943 acaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26288363 - 26288063
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||    
T  26288363 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccactacatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26288264  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||| |||  ||||  |||||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||    
T  26288263 caactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgt 26288164  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26288163 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttc 26288065  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  26288064 at 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 4440011 - 4440546
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||    
T  4440011 gtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 4440110  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || || ||||| |     
T  4440111 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggccctaacaa 4440210  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||||||||| || ||||| |||||||   |||| || || |  |||||||||||||| |   ||||||| ||  ||||||||||| | || ||     
T  4440211 agcactttcacctgattcgaaccaacacaacgacattctacaccttcttccatacaaagcctcaagcagtgccataccggtactagaatgaaaactgttg 4440310  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||    
T  4440311 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctct 4440410  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||    
T  4440411 ctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 4440510  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440511 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 7823983 - 7824518
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  7823983 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 7824082  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  7824083 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 7824182  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  7824183 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 7824282  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  7824283 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 7824382  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  7824383 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 7824482  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824483 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 27107961 - 27107426
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  27107961 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 27107862  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  27107861 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 27107762  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  27107761 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 27107662  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  27107661 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 27107562  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27107561 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27107462  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107461 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 711
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364558
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || ||  || |||  || ||||  || |||| ||| |   | ||||| |||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttatttttttgcacaacttccggtcttaacatatcactttctcct 15364235  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
     | |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  15364236 tattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 15364335  T
Q  489 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 588  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  15364336 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 15364435  T
Q  589 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 688  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  15364436 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 15364535  T
Q  689 acaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  15364536 acaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 15340418 - 15340574
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  15340418 acatcatctctccgaataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 15340517  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaact 170  Q
    | |||| ||| |||||||||||||   | ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  15340518 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368473
Alignment:
Q  224 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 323  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  324 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 423  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||||    
T  12368615 ggatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 12368516  T
Q  424 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  12368515 accatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 21674720 - 21674185
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| | |||| ||| | |  | |||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || || || | ||    
T  21674720 gtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcctct 21674621  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |  ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21674620 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21674521  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||  ||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  21674520 agcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 21674421  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacgg--aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 573  Q
    || ||||| || || ||||||||  || ||  | |||| || |  |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||    
T  21674420 ttgtaagtaaattcaatcaacggtaaacatt-cgatcc-aactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcct 21674323  T
Q  574 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 673  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||     
T  21674322 ctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctc 21674223  T
Q  674 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674222 ggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 435
Target Start/End: Original strand, 12193742 - 12193898
Alignment:
Q  279 catgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccac 378  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  || |||| ||  |||||||| |   |    
T  12193742 catgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaaccttcggtcctaacaaagc 12193841  T
Q  379 tctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagc 435  Q
      |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  12193842 attttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagc 12193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 669
Target Start/End: Original strand, 45146842 - 45147131
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  | || || || |    
T  45146842 ctttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatactagaatgcaaactgttgttgt 45146941  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacggaagatgactat-cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccg 578  Q
    |||| ||||| |||||||| | |  | | | ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |    
T  45146942 aagtaaactcaatcaacggtaaac-attctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctg 45147040  T
Q  579 actgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147041 tctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15479465 - 15479340
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || |  |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15479465 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15479366  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaact 139  Q
    | | || ||| ||||| |||||||||    
T  15479365 caattctatacgccacagttccaact 15479340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26118911 - 26118806
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  26118911 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26118812  T
Q  114 ccactc 119  Q
    | ||||    
T  26118811 caactc 26118806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 40790
Alignment:
Q  182 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  | |||||| || || ||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  282 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 381  Q
    |||| ||||| |||| | | || || || ||||||| |||  | ||| | |  || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  |  |    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcccaacactgcaat 41128  T
Q  382 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 481  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||  | || || ||||||    
T  41127 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgttgttataa 41028  T
Q  482 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 581  Q
    || ||||| || || || |  | |  ||||||| |||| ||||| || |  |||||   ||| ||||| || || |  || ||||| || || ||   ||    
T  41027 gtaaactcaattaatgggaagtaagcatcccaacttcccccttgttccaacacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcgatct 40928  T
Q  582 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 681  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  |||||||    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  40927 gaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagtactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctct 40828  T
Q  682 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 719  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40827 atccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 711
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  590 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 689  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  690 caatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 704
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  596 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 695  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  696 tcgaaggaa 704  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  563 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 662  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  663 aagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 13378796 - 13378937
Alignment:
Q  191 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 290  Q
    ||||||||||| || || | ||| |||||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  |  ||||| | ||| |||| ||||| ||    
T  13378796 ttcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgct 13378895  T
Q  291 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 332  Q
    | |||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13378896 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatct 13378937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 380 - 498
Target Start/End: Original strand, 13353438 - 13353556
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || || || || | ||||||||||||||| || ||||||||  |  || |||||||| | || |||||||    
T  13353438 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggtaatagaatgaaaactcttattat 13353537  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    |||| ||||| ||| ||||    
T  13353538 aagtaaactcaatcgacgg 13353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 629 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  629 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 687  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 577; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674090
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17674507  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17674506 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 17674407  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674406 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 17674307  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17674306 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 17674207  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  17674206 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgca 17674107  T
Q  714 gcttcacaatttccttg 730  Q
     ||||||||| ||||||    
T  17674106 acttcacaatctccttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 19112706 - 19113406
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19112706 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 19112805  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19112806 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19112905  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112906 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 19113005  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113006 tgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 19113105  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19113106 aagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaag 19113205  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19113206 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 19113305  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  19113306 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 19113405  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  19113406 t 19113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19484974
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19485354  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  19485353 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttc 19485254  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485253 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 19485154  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19485153 agttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 19485054  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 693  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485053 aatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20018515 - 20017865
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20018515 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20018416  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20018415 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 20018316  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018315 aaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 20018216  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018215 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 20018116  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018115 aggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 20018016  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20018015 aacacaaattctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 20017916  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017915 aaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22120939 - 22120239
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22120939 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 22120840  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22120839 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaa 22120740  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120739 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 22120640  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22120639 cgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 22120540  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120539 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 22120440  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22120439 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaaccc 22120340  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||| || |||||||    
T  22120339 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttga 22120240  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  22120239 t 22120239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30313909 - 30313209
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30313909 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 30313810  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  30313809 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 30313710  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30313709 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatc 30313610  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30313609 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccataca 30313510  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313509 aagcctcaaaaggtgccgttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 30313410  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30313409 aacacaaactctcaactaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 30313310  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  30313309 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 30313210  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  30313209 t 30313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 713
Target Start/End: Original strand, 15533396 - 15534077
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  15533396 acatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 15533495  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  15533496 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaa 15533595  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  15533596 aaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatt 15533695  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533696 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 15533795  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533796 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 15533895  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15533896 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 15533995  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15533996 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 732
Target Start/End: Original strand, 32600178 - 32600860
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |    
T  32600178 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 32600277  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600278 tctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 32600377  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||     
T  32600378 ctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtc 32600477  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32600478 tactgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcca 32600577  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32600578 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaa 32600677  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32600678 atcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 32600777  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32600778 ttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 32600860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22133788 - 22133127
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |    
T  22133788 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22133689  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||   |||||||||    
T  22133688 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttc 22133589  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22133588 ctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtt 22133489  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133488 tgctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcca 22133389  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22133388 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaa 22133289  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22133288 atcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 22133189  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133188 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 22046389 - 22047089
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  22046389 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccg 22046488  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22046489 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaa 22046588  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22046589 aaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatc 22046688  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22046689 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccataca 22046788  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046789 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 22046888  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  22046889 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacct 22046988  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22046989 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 22047088  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  22047089 t 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16408788 - 16408131
Alignment:
Q  54 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  16408788 acttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctg 16408689  T
Q  154 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 253  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  16408688 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgg 16408589  T
Q  254 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 353  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16408588 aacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 16408489  T
Q  354 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 453  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16408488 gaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcc 16408389  T
Q  454 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 553  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408388 aatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcc 16408289  T
Q  554 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16408288 tctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcc 16408189  T
Q  654 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408188 aaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 19977983 - 19978683
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  19977983 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccg 19978082  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  19978083 ttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 19978182  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19978183 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 19978282  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19978283 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatata 19978382  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978383 aagcctccaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 19978482  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||    
T  19978483 tacactaaatctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaaccc 19978582  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19978583 aaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattga 19978682  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  19978683 t 19978683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 22164956 - 22164278
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22164956 acatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccg 22164857  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||    
T  22164856 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaa 22164757  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22164756 aaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatc 22164657  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22164656 ttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtaca 22164557  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164556 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 22164457  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||    
T  22164456 aacacaaactctcaacaaatcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaaccc 22164358  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164357 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21166606
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21167021  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||    
T  21167020 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttc 21166921  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21166920 tgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatccca 21166821  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21166820 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 21166721  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21166720 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgca 21166622  T
Q  714 gcttcacaatttcctt 729  Q
     ||| ||||| |||||    
T  21166621 actttacaatctcctt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 23650057 - 23650748
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23650057 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccg 23650156  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||| | | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23650157 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 23650256  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||    
T  23650257 aaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatc 23650356  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650357 ttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 23650456  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23650457 aagcttcataaggcgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 23650556  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  23650557 tacgcaaactctcaacaagtcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 23650656  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23650657 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21922500 - 21921809
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21922500 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 21922401  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  21922400 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 21922301  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||    
T  21922300 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatc 21922201  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21922200 ttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataga 21922101  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922100 aagcctcataaggtgccattccaatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 21922001  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  21922000 tacacaaactctcaacaaatcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 21921901  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21921900 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 21250958 - 21251648
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21250958 acatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 21251057  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21251058 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21251157  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||    
T  21251158 aaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct-ctctttaatcatc 21251256  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21251257 ttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccataca 21251356  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||| |   |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251357 aagcgtaataaggtgtcatctcaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 21251456  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||     
T  21251457 aacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacct 21251556  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21251557 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21789123 - 21788433
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  21789123 acatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccg 21789024  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    || | ||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21789023 ttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21788924  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21788923 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatc 21788824  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21788823 ttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatac- 21788725  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788724 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 21788625  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||     
T  21788624 aacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacct 21788525  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21788524 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21394630 - 21393939
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  21394630 acatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccg 21394531  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    || | ||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21394530 ttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21394431  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21394430 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatc 21394331  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccga-ccatac 430  Q
    | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21394330 ttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccatac 21394231  T
Q  431 aaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 530  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394230 -aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 21394132  T
Q  531 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 630  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||    
T  21394131 gaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacc 21394032  T
Q  631 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21394031 taaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 292 - 732
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18857293
Alignment:
Q  292 ttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  392 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 491  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18856953 tcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcga 18857052  T
Q  492 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857053 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 18857152  T
Q  592 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 691  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18857153 ctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacaca 18857252  T
Q  692 atgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  18857253 atgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 18857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987903
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||   | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||  ||| ||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 22987498  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||| | || |||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  22987499 atcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttc 22987598  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22987599 tgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataattgttattgtacatgaactctattaatggaagatgactatccca 22987698  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22987699 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgc 22987798  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22987799 aacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgca 22987893  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  22987894 acttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 319 - 732
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040575
Alignment:
Q  319 ctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcat 418  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcat 22040261  T
Q  419 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040262 ctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 22040361  T
Q  519 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 618  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22040362 atccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatct 22040461  T
Q  619 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 718  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  22040462 caatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctc 22040561  T
Q  719 acaatttccttgat 732  Q
    ||||| ||||||||    
T  22040562 acaatctccttgat 22040575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 171 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22378079 - 22377528
Alignment:
Q  171 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22378079 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22377980  T
Q  271 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22377979 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22377880  T
Q  371 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 470  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22377879 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22377781  T
Q  471 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 570  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22377780 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22377681  T
Q  571 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 670  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  671 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 171 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22384254 - 22383703
Alignment:
Q  171 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22384254 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22384155  T
Q  271 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22384154 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22384055  T
Q  371 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 470  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22384054 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22383956  T
Q  471 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 570  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22383955 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22383856  T
Q  571 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 670  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  671 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20396905 - 20396199
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||| |||||||||||||  ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20396905 tcatctcttggaatcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaaccca 20396806  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||||||| |||||  || ||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||  |  | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  20396805 ctcgatacgccactatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcac 20396706  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  20396705 aggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatc 20396606  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || ||| | |||| || ||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  20396605 ttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctac 20396506  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20396505 acctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagt 20396406  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
      | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  20396405 cgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaac 20396306  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    | || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| | ||    
T  20396305 cacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaact 20396206  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  20396205 tcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 26 - 711
Target Start/End: Original strand, 20388109 - 20388794
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataag 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |    
T  20388109 ggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatg 20388208  T
Q  126 ccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 225  Q
     ||| || |||||| | ||  | |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   || ||||    
T  20388209 tcactgtcccaactctctcagatatctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgac 20388308  T
Q  226 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 325  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||       
T  20388309 tctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctctt 20388408  T
Q  326 atca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccga 424  Q
    |||| | ||| |||| |  ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  20388409 atcaatttgacctttttt-gtagtctgatgaactatatctcgtcccaacactacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaa 20388507  T
Q  425 ccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 524  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20388508 ccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatggtaactgttgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccacctt 20388607  T
Q  525 gctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 624  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20388608 gctcaagtacacacactctcaaaaaatcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactt 20388707  T
Q  625 cgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20388708 agaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655634
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||| |  |||  |||| |||| |||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||  || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttc 23655224  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23655225 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttc 23655324  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  23655325 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtccca 23655424  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23655425 ggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactc 23655524  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  23655525 aacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgca 23655624  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  23655625 acttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Original strand, 19851409 - 19852106
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19851409 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19851508  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||    
T  19851509 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19851608  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19851609 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 19851708  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||  ||||| |  ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  19851709 atattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcc 19851808  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19851809 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatacca 19851908  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19851909 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 19852008  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    || ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852009 aacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Original strand, 19857445 - 19858142
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19857445 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19857544  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||    
T  19857545 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19857644  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19857645 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 19857744  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||  ||||| |  ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  19857745 atattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcc 19857844  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19857845 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatacca 19857944  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19857945 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 19858044  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    || ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858045 aacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 1266237 - 1266945
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  1266237 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1266336  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  1266337 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 1266436  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1266437 catcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 1266536  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || |||||||| || || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  1266537 atcttttcccttatcatct-taccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcc 1266635  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  1266636 tgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 1266735  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  1266736 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 1266835  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |    
T  1266836 aatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgca 1266935  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    |||| |||||    
T  1266936 gcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061507
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | || ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| |||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22061917  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || | |  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22061916 atcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 22061817  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22061816 tgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 22061717  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22061716 agctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaatactccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 22061617  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22061616 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgta 22061517  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    | ||||||||    
T  22061516 gtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 31417257 - 31416548
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |||     
T  31417257 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaag 31417158  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  31417157 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 31417058  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    |||| || | ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31417057 cataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 31416958  T
Q  314 a--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 411  Q
    |  ||||| |||  |||||||  |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  31416957 accttttccctt--atcatcttgactttctcagtagtctgatgcactaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagt 31416860  T
Q  412 tctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcc 511  Q
      |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  31416859 catgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcc 31416760  T
Q  512 caagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 611  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31416759 caagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 31416660  T
Q  612 tcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  31416659 tcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtactccatg 31416560  T
Q  712 tagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||    
T  31416559 tagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 254 - 721
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949624
Alignment:
Q  254 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 353  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  354 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 453  Q
     ||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  23949258 -aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattcc 23949356  T
Q  454 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 553  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  23949357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtct 23949456  T
Q  554 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 653  Q
    || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| ||||    
T  23949457 tccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttcc 23949556  T
Q  654 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 721  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23949557 aaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20010683 - 20009974
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  20010683 acatcagctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20010584  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  20010583 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgt 20010484  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20010483 catcggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 20010384  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||| || |||||  |||| || ||||| |  |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  20010383 atcttttctcttatcatctggaccttctctatagtctgatgaactaaatctggtcccaacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcc 20010284  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20010283 tacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 20010184  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20010183 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactc 20010084  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  20010083 acccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgca 20009984  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  20009983 acttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21841124
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || ||||    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
     |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
     |||||| | ||||| | |||||| || ||||| || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttt 21840714  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
T  21840715 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcc 21840814  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  21840815 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatccca 21840914  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||    
T  21840915 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactc 21841014  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21841015 aacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgca 21841114  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  21841115 acttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 29304209 - 29303500
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  29304209 acatcatccctaggaatcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 29304110  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| | | ||  |||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29304109 caactctataagccactgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 29304010  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29304009 cattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttc 29303910  T
Q  314 attttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || || ||    ||||| |||| ||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||     
T  29303909 atcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtc 29303811  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  29303810 ctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatacctatactcgaatgatagttgttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatccc 29303711  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29303710 aagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcatccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 29303611  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  29303610 caacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgt 29303511  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  29303510 agcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565846
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || | || |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 14565440  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  14565441 tcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 14565540  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  14565541 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaa 14565640  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14565641 gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 14565740  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||    
T  14565741 acctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaag 14565840  T
Q  715 cttcac 720  Q
    ||||||    
T  14565841 cttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 31571625 - 31570917
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  31571625 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 31571526  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | | | ||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  31571525 caactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 31571426  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31571425 catcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttc 31571326  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  31571325 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcc 31571226  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  31571225 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactattgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 31571126  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31571125 agctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 31571026  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31571025 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 31570926  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  31570925 gcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679815
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6679409  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  6679410 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 6679509  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||    
T  6679510 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaa 6679609  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  6679610 gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 6679709  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  6679710 acttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 6679809  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  6679810 tttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 803750
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||| | | ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 804156  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || ||    |||| |   ||||||| |||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  804155 tcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcct 804056  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||    
T  804055 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaa 803956  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  803955 gctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactca 803856  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  803855 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 803756  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  803755 tttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 720
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6604362
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||| | | ||  |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6603956  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | || |||   |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6603957 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcct 6604056  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||    
T  6604057 acacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaa 6604156  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  6604157 gctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactca 6604256  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  6604257 acctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaag 6604356  T
Q  715 cttcac 720  Q
     |||||    
T  6604357 tttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Original strand, 12304756 - 12305462
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  12304756 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 12304855  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12304856 caactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgt 12304955  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| || | ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  12304956 caaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 12305055  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||| || || || |    
T  12305056 atcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacagcactctcacccgactcaaaccagcataaaggggtcc 12305155  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||    
T  12305156 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatgctcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatccca 12305255  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  12305256 agctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 12305355  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12305356 aatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaa 12305455  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    |||||||    
T  12305456 gcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 161 - 722
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051569
Alignment:
Q  161 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || || || || || ||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  261 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 360  Q
    |  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| || || || ||||| |     
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaa 22051207  T
Q  361 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatacta 460  Q
     |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  22051208 atctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactc 22051307  T
Q  461 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 560  Q
    ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  22051308 gaatggtaactgttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacg 22051407  T
Q  561 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 660  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  22051408 attggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacct 22051507  T
Q  661 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 722  Q
    ||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22051508 agaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681856
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || ||||    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 21681954  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 411  Q
    || || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21681953 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagt 21681856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 323
Target Start/End: Original strand, 22032048 - 22032339
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||    
T  22032048 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacg 22032147  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    || ||||| ||||| | ||||||||   |||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  22032148 tttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 22032247  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 323  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22032248 aaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 386 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20976062 - 20975725
Alignment:
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20976062 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20975963  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  20975962 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgacc 20975863  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  20975862 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatct 20975763  T
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20975762 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Original strand, 20007848 - 20008263
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  20007848 acatcatatctcggtataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaac 20007947  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||    
T  20007948 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 20008047  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20008048 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttc 20008147  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||      
T  20008148 atcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtca 20008247  T
Q  414 tgcatctccgaccata 429  Q
    |||| |||||||||||    
T  20008248 tgcacctccgaccata 20008263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21325193 - 21324804
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaa-gatgcggcggtaaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||| || || |||    
T  21325193 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaa 21325094  T
Q  113 cccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 212  Q
    || |||| ||| ||||| ||||||||  | |   | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |    
T  21325093 ccaactctatatgccactgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccg 21324994  T
Q  213 tcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcctt 312  Q
    |||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21324993 tcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgtttt 21324894  T
Q  313 cattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagca 402  Q
    ||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  21324893 catcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacaccacactatctcctgactcaaaccagca 21324804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 383 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 16271638 - 16271301
Alignment:
Q  383 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 482  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16271638 tcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16271539  T
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    |||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  16271538 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 16271439  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  16271438 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatcccta 16271339  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16271338 tccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 289
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| || |||||||| | || | ||||  | |||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 289  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 15441215 - 15441420
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||| | |    
T  15441215 acatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgata 15441314  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15441315 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttc 15441414  T
Q  250 ctgaaa 255  Q
     |||||    
T  15441415 ttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 447 - 723
Target Start/End: Original strand, 22371371 - 22371647
Alignment:
Q  447 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 546  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||     
T  22371371 ccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaaatctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcag 22371470  T
Q  547 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 646  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  22371471 caaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaa 22371570  T
Q  647 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  22371571 ctcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 503 - 720
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  503 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 602  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  603 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 702  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  703 aacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16877716 - 16877181
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  16877716 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 16877617  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16877616 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16877517  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16877516 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16877417  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16877416 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16877317  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  16877316 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16877217  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877216 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 711
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315886
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |||||||  || |||||||        |||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaacttccggtcctacccaagaactttcacct 22315563  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  22315564 gactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 22315663  T
Q  489 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 588  Q
    | |||||||| |||     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| |||||||| || |    || ||| |||||||||| ||| |||||    
T  22315664 caatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcttccaaactctaaatagtcctctccgtctgcccatc 22315763  T
Q  589 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 688  Q
      |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| | ||| ||     
T  22315764 actctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaaacctcggatcccgatccgac 22315863  T
Q  689 acaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315864 acaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 21197123 - 21196588
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| || || ||||| | |||| | |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21197123 gtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctct 21197024  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21197023 tatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21196924  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  21196923 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 21196824  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||    
T  21196823 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctct 21196724  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
      | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21196723 atgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcgg 21196624  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196623 attccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |  |||||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||  ||| ||||| || |||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  215 ataggactgact 226  Q
    | |||| |||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||| | | ||  |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 291  Q
    |  ||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| || |||| | | ||  |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 291  Q
    |  ||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 605 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129005
Alignment:
Q  605 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  705 caccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
     |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22129032 taccatgcaacctcacgatctccttgat 22129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 21850958 - 21850423
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  21850958 gtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcctct 21850859  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || ||||| |     
T  21850858 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggccctaacaa 21850759  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  21850758 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaactgttg 21850659  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  21850658 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 21850559  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21850558 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21850459  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850458 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20652954 - 20652635
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | ||||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| ||||| | ||    
T  20652954 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcctct 20652855  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || || | ||| |||||||| |     
T  20652854 tataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaacaa 20652755  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||     
T  20652754 ggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactattg 20652655  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaa 495  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  20652654 ttgtaagtaaactcaatcaa 20652635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 22982596 - 22983128
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||| | || | ||||| |||||| | || || ||  |||||||||||| ||||||||  |  |    
T  22982596 gtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcaccttt 22982695  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || ||| |||  ||    
T  22982696 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggttcta--ac 22982793  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
     |  |  |||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| |  | ||     
T  22982794 aaagcactcacttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaatgaaaattgttg 22982893  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||    | |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  22982894 ttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 22982993  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  22982994 ctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 22983092  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983093 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 380 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 23157428 - 23157098
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||| | || || || |    
T  23157428 ctttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 23157329  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 579  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || ||||||     
T  23157328 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcca-aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgt 23157230  T
Q  580 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 679  Q
    | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||     
T  23157229 cggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcc 23157130  T
Q  680 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157129 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 711
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  562 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 661  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  662 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 725
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  599 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 698  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  699 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 725  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 725
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  599 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 698  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  699 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 725  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 465
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863506
Alignment:
Q  182 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 281  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  282 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 381  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19863422  T
Q  382 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 465  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19863423 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19863506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 465
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868143
Alignment:
Q  182 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 281  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  282 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 381  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19868059  T
Q  382 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 465  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19868060 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19868143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 563; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Original strand, 377 - 1095
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 676  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  677 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttc 776  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  777 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcattccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 876  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  877 agtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactc 976  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  977 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 1076  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
     |||||||||  |||||||    
T  1077 acttcacaatccccttgat 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 559; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 734
Target Start/End: Original strand, 43135 - 43837
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  43135 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccg 43234  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43235 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaa 43334  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43335 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 43434  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43435 ttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatata 43534  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43535 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaag 43634  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43635 aacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaaccc 43734  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  43735 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaa 43834  T
Q  732 tgt 734  Q
    |||    
T  43835 tgt 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 732
Target Start/End: Original strand, 8475 - 9155
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactt 140  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  8475 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactc 8574  T
Q  141 tttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 240  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8575 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 8674  T
Q  241 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttc 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8675 gtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttc 8774  T
Q  341 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcga 440  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8775 tcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcga 8874  T
Q  441 aaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  8875 aaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac------ 8968  T
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8969 -----acaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctct 9063  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  9064 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 9155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 345 - 732
Target Start/End: Original strand, 15241 - 15617
Alignment:
Q  345 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 444  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15241 tagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaagg 15340  T
Q  445 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15341 tgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac---------- 15430  T
Q  545 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 644  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15431 -acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgca 15529  T
Q  645 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15530 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 50854 - 50148
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  50854 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaaccca 50755  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    | | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  50754 ccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 50655  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  50654 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 50555  T
Q  317 --ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
      |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  50554 cgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgactcaaaccaacacaaaggagttct 50457  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  50456 gcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaa 50357  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  50356 gctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactca 50257  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  50256 acctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 50157  T
Q  715 cttcacaat 723  Q
    |||||||||    
T  50156 cttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 217 - 348
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13963
Alignment:
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 106754 - 106226
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||| | || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  106754 gtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 106655  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | ||||||||| |||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  106654 tatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 106555  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| |  || |||||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || ||     
T  106554 agcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatactagaatgaaaactgttg 106455  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    ||||| || |  ||||||  ||||||||||||||| |    ||| || |||||||    
T  106454 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctggatagtcctct 106355  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
     || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  106354 tcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 106255  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106254 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 557; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 601 - 1301
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  601 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccg 700  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  701 ttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 800  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 900  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  901 tgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 1000  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1001 aagcctcgaaaggtgccattccaatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaag 1100  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||    
T  1101 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaaccc 1200  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  1201 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttga 1300  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  1301 t 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 14341 - 15041
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  14341 acatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccg 14440  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14441 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 14540  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14541 aaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 14640  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14641 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccataca 14740  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14741 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 14840  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  14841 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaaccc 14940  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||    
T  14941 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttga 15040  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  15041 t 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 547; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 6918 - 7620
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaaga-tgcggcggtaaacccactcgataagccacc 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6918 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccacc 7017  T
Q  131 gttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 230  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7018 gttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 7117  T
Q  231 aaa-acacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca 329  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7118 aaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatca 7217  T
Q  330 tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccata 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7218 tctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccata 7317  T
Q  430 caaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctca 529  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7318 taaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcg 7417  T
Q  530 agaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagc 629  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  7418 agaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaac 7517  T
Q  630 ccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||    
T  7518 ccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctcctt 7617  T
Q  730 gat 732  Q
    |||    
T  7618 gat 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 7358 - 8047
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  7358 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccg 7457  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7458 ttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 7557  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7558 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 7657  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7658 tgaactttctcagtagtctgttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatata 7757  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7758 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 7857  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7858 aac-----------acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 7946  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  7947 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 509; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 65386 - 66086
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  65386 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccg 65485  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  65486 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaa 65585  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  65586 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 65685  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65686 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 65785  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  65786 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaag 65885  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  65886 aacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaaccc 65985  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  65986 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttga 66085  T
Q  732 t 732  Q
    |    
T  66086 t 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 270 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39466
Alignment:
Q  270 tacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcc 369  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  370 taagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatag 469  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39806 taagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataa 39707  T
Q  470 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 569  Q
    || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706 ctgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcg 39607  T
Q  570 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39606 tcctctccgactga-catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaa 39508  T
Q  670 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39507 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39926
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  214 catagga 220  Q
    || ||||    
T  39932 cacagga 39926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33198
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 33617  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33616 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttc 33517  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33516 tgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatccca 33417  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33416 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 33317  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33316 aatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgca 33217  T
Q  714 gcttcacaatttccttgat 732  Q
       ||||||| ||||||||    
T  33216 atctcacaatctccttgat 33198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 732
Target Start/End: Original strand, 8595 - 9277
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | |    
T  8595 acatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgata 8694  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8695 tctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttc 8794  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  8795 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtc 8894  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8895 tgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgcca 8994  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 9094  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9095 atcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 9194  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  9195 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 483; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4712 - 4030
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | |    
T  4712 acatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgata 4613  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4612 tctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttc 4513  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  4512 ttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtc 4413  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4412 tgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgcca 4313  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312 ttccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 4213  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4212 atcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 4113  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  4112 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278458
Alignment:
Q  16 atcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccc 115  Q
    |||||| ||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  116 actcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  216 taggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 315  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 278872  T
Q  316 tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctg 415  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  278871 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctg 278772  T
Q  416 catctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  278771 catctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaag 278672  T
Q  516 ttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 615  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  278671 ttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaa 278572  T
Q  616 tctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 715  Q
    |||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  278571 tctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaac 278472  T
Q  716 ttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||| |||||    
T  278471 ttcacaatctcctt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 50 - 373
Target Start/End: Original strand, 308658 - 308981
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  308658 acatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 308757  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  308758 tctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 308857  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  308858 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtc 308957  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  308958 tgctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164538
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |||||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 164753  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  164752 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttc 164653  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  164652 tgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatccca 164553  T
Q  514 agttcctccttgctc 528  Q
    ||||| || ||||||    
T  164552 agttcatctttgctc 164538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260979
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  || || ||||    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
      |||| ||| |||||||||| ||   | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 260570  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || |||||||| || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  260571 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcc 260670  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||  || || ||||| |||||    
T  260671 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtccca 260770  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  260771 agctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 260870  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  260871 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgta 260970  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  260971 gcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 6353 - 7044
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||     
T  6353 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccacca 6452  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    | |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  6453 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 6552  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  6553 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatc 6652  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6653 ttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccataca 6752  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6753 aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 6852  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  6853 aacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 6952  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6953 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 413 - 718
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3458
Alignment:
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3153 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 3252  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3253 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaact 3352  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  3353 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgt 3452  T
Q  713 agcttc 718  Q
    | ||||    
T  3453 aacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 173 - 732
Target Start/End: Original strand, 7519 - 8078
Alignment:
Q  173 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 7618  T
Q  273 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 372  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7619 gcttatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaa 7718  T
Q  373 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagcta 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7719 gaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 7818  T
Q  473 ttattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 572  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7819 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttc 7918  T
Q  573 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 672  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7919 tctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 8018  T
Q  673 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8019 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgat 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 732
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8471
Alignment:
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttct 8153  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 gcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 8253  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8254 gttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactca 8353  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8354 atctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaa 8453  T
Q  715 cttcacaatttccttgat 732  Q
    | |||||||  |||||||    
T  8454 cctcacaatcaccttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6695
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6004 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 6103  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    | |||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  6104 tcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaa 6203  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  6204 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatc 6303  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304 ttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 6403  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404 aagcctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 6503  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||     
T  6504 tacacaaactctcaacaagtcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacct 6603  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6604 aaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 37 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 1844 - 1158
Alignment:
Q  37 cgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttcca 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  1844 cgaagaatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttcca 1745  T
Q  137 actttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaaca 236  Q
    ||  ||||  | |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| |    
T  1744 accctttctgatatctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaata 1645  T
Q  237 cgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaac 336  Q
    | || ||| |  |||||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||    
T  1644 catgatcttccacctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgac 1545  T
Q  337 tttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcc 436  Q
    ||||||  |||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||     
T  1544 tttctctctagtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagct 1445  T
Q  437 tcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 536  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1444 tcgaacggtgccattccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacac 1345  T
Q  537 aaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagc 636  Q
    | | |||||  |||||||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1344 acactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagc 1245  T
Q  637 ctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1244 atcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 437
Target Start/End: Original strand, 22819 - 23080
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  22819 gtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 22918  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22919 tatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 23018  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 437  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||||||||||||||    
T  23019 agcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagcct 23080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 63659
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 64075  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  64074 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttc 63975  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  63974 tgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatccca 63875  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  63874 agttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 63775  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  63774 aatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgca 63675  T
Q  714 gcttcacaatttcctt 729  Q
     ||||||||| |||||    
T  63674 acttcacaatctcctt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 728
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6691
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6276  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6277 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttc 6376  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6377 tgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatccca 6476  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  6477 agttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacac 6576  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6577 aatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 6676  T
Q  714 gcttcacaatttcct 728  Q
     ||||||||| ||||    
T  6677 acttcacaatctcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 732
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22548
Alignment:
Q  116 actcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  216 taggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 315  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  316 tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctg 415  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctg 22231  T
Q  416 catctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22232 catctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaag 22331  T
Q  516 ttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 615  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332 ttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaa 22431  T
Q  616 tctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 715  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22432 tttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaac 22531  T
Q  716 ttcacaatttccttgat 732  Q
     ||||||| ||||||||    
T  22532 ctcacaatctccttgat 22548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 725
Target Start/End: Original strand, 657 - 1350
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||     
T  657 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccacca 756  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||  ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  757 ttccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 856  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  857 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatc 956  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  957 ttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacataca 1056  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1057 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttccttcttgctcaag 1156  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||     
T  1157 tacgcaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacct 1256  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 725  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1257 aaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 451
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||| |    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | ||||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttcc 867  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  866 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttc 767  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  766 tgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactggaatgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatccca 667  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  666 agttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaatcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactc 567  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  566 aatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 467  T
Q  714 gcttcacaatttcctt 729  Q
     ||||||||| |||||    
T  466 acttcacaatctcctt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 723
Target Start/End: Original strand, 14037 - 14711
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |     
T  14037 tacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgat 14136  T
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    |||| |||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14137 atctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctcctt 14236  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||||    
T  14237 cttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagt 14336  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14337 ttgctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgcc 14436  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 548  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14437 attccaatactagaatgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaaca 14536  T
Q  549 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  14537 aatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaact 14636  T
Q  649 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14637 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 269 - 732
Target Start/End: Original strand, 17660 - 18122
Alignment:
Q  269 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 368  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtc 17759  T
Q  369 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17760 ctaagaccactctttcacctgactcaa-ccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 17858  T
Q  469 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 568  Q
     |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17859 actattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaatt 17958  T
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17959 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaa 18058  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  18059 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaatctccttgat 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 31373 - 32082
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||| | | ||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 31672  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |  || | ||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||      
T  31673 atcttttctctgatcatcttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatcccaacacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtca 31772  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  31773 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 31872  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| | ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  31873 agctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactc 31972  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31973 aaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgca 32072  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  32073 acttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 655 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  655 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 1018 - 328
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1018 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccg 919  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||| | | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||    
T  918 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaa 819  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  818 aa-cacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatc 720  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  719 ttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccataca 620  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  619 aagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaag 520  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||     
T  519 aacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacct 420  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  419 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Original strand, 5220 - 5893
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |    
T  5220 acataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgata 5319  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5320 tctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttc 5419  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     | ||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  5420 tttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtt 5519  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5520 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgcca 5619  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  5620 ttccgatactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaa 5719  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  5720 gtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactt 5819  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5820 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Original strand, 9342 - 10015
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |    
T  9342 acatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgata 9441  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    |||||||  ||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  9442 tctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttc 9541  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||    
T  9542 ttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtt 9641  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9642 tgttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccc 9741  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||  ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  9742 ttccaatactagaatgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaa 9841  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||     
T  9842 gtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactc 9941  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9942 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Original strand, 229024 - 229715
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| || |||||||    
T  229024 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgccaccg 229123  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  229124 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaa 229223  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  229224 aaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatc 229323  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229324 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 229423  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  229424 aaacctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaag 229523  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||     
T  229524 tacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacct 229623  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  229624 aaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219051
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 219461  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  219460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttc 219361  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |  |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  219360 tgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatccca 219261  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  219260 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactc 219161  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  219160 aacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtc 219061  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  219060 acttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 33176 - 32667
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  33176 gtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 33077  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta--ag 373  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||| ||||  |     
T  33076 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctgggcctaacaa 32977  T
Q  374 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 473  Q
    | ||||||    || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| |||| | || |    
T  32976 agcactct----ccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 32881  T
Q  474 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 573  Q
    | || ||||| ||||| | |||||| | |      |||||  |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |     ||||| |||||    
T  32880 tgttgtaagtaaactcaaccaacggtaaacattcgtcccacctaacaccttgctccaacacacaagatctcaacaaatcttccaaactttgaatagtcct 32781  T
Q  574 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 673  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  32780 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 32681  T
Q  674 ggatctctatctga 687  Q
    ||||| | ||||||    
T  32680 ggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 14713
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttc 15123  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  15122 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttc 15023  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15022 tgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatccca 14923  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  14922 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactc 14823  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  14822 aacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgta 14723  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  14722 gcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 64 - 723
Target Start/End: Original strand, 49506 - 50165
Alignment:
Q  64 ttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggacca 163  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  164 atgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 263  Q
    || ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  264 cttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 363  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  364 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaa 463  Q
      ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 49905  T
Q  464 tgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgact 563  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||    
T  49906 tgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgact 50005  T
Q  564 gaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50006 gaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 50105  T
Q  664 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50106 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 570 - 729
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  570 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  670 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 629 - 729
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  629 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 728  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 729
Target Start/End: Original strand, 180198 - 180877
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  180198 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactg 180297  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    ||| |||| ||||  | |||||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||||||||    
T  180298 ttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaa 180397  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    |||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  180398 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatc 180497  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  180498 ttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatata 180597  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180598 aagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 180697  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     || |||| ||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  180698 tacccaaactctcaacaaatcctctag------------------cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 180779  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  180780 aaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 180877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 445 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 101464 - 101186
Alignment:
Q  445 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 544  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  101464 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctc 101365  T
Q  545 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 644  Q
    |||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  101364 aacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgca 101265  T
Q  645 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  101264 aactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32387
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  33077 acatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 32978  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  32977 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 32878  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  32877 aaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatc 32778  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32777 ttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcataca 32678  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32677 aagcctcaaaagatgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 32578  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||     
T  32577 tacacaaactctcaacaagtcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacct 32478  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32477 aaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 302 - 732
Target Start/End: Original strand, 12738 - 13168
Alignment:
Q  302 tgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagc 401  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaac 12837  T
Q  402 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaag 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  12838 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaag 12937  T
Q  502 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 601  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12938 atgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 13037  T
Q  602 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 701  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 13137  T
Q  702 gaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 732  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13138 gaacaccatgtaacttcacaatctccttgat 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 26062 - 25353
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26062 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25963  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | ||||  | |||||||| |||||||| ||| || | || |  ||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  25962 ccactcgatacgccacggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagt 25863  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  25862 cataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 25763  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25762 atcttttcttggattaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttc 25663  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | ||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25662 tacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatccca 25563  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25562 agttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactc 25463  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25462 aacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgta 25363  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  25362 gcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15549
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | ||||  | || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttc 15139  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15140 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttc 15239  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  15240 tgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatccca 15339  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15340 agttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaagtccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactc 15439  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15440 aacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 15539  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     ||| |||||    
T  15540 actttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 491 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 113353 - 113121
Alignment:
Q  491 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 590  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  113353 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctg 113254  T
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113253 tctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatac 113154  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  113153 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112693
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatc 112283  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  112284 atcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttc 112383  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || || |||| |||| |||||||||||||||| || |||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  112384 tgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcatttcaatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatccca 112483  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  112484 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactc 112583  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  112584 aacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgta 112683  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  112684 gcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203102
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| |||   | |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttc 203512  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   || | || ||| || |  ||||| || |||||||| |  ||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  203511 atattttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatattcggtcccaacactacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttc 203412  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  203411 tgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccattcctatactagaatggtaacttttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatccca 203312  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  203311 agtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 203212  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  203211 aacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgta 203112  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  203111 gcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 723
Target Start/End: Original strand, 117532 - 118240
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    |||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttca 117831  T
Q  315 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
    | ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||  |    
T  117832 tcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtctt 117931  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  117932 acacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaa 118031  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  118032 gctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactca 118131  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  118132 acctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtag 118231  T
Q  715 cttcacaat 723  Q
    |||||||||    
T  118232 cttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 322667 - 323376
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  322667 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 322766  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||  ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  322767 caactctatatgccattgttccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 322866  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  322867 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 322966  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || || || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  322967 atcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcc 323066  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  323067 tgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactggaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 323166  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  323167 agctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactc 323266  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||| |    
T  323267 agcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgca 323366  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  323367 acttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 385782 - 386491
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  385782 acatcatctcacggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 385881  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||    
T  385882 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgt 385981  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    | ||||| ||||||||| ||| |  || ||||| || |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  385982 cgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttc 386081  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   ||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  386082 atcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcc 386181  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  386182 tgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 386281  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  386282 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 386381  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  386382 aacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgca 386481  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  386482 acttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 26858 - 26167
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26858 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 26759  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    || |||   ||||  | |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| | ||||||||    
T  26758 tttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaa 26659  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  26658 aaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatc 26559  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||    
T  26558 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccataca 26459  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26458 aagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaag 26359  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| || || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||     
T  26358 tacacaaactctcaacaagtcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacct 26259  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26258 aaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195338
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttc 195747  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  195746 atcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 195647  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  195646 tgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcggatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 195547  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||||||  |  || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  195546 agctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactc 195448  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  195447 aacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgca 195348  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  195347 gcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 719
Target Start/End: Original strand, 148533 - 149238
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  148533 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 148632  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  148633 ctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 148732  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || || || || |  |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  148733 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttc 148832  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    ||||||   ||||||||  |||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  148833 atcttttcccttatcatcctgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 148932  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  148933 tgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgctgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 149032  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  149033 acctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactc 149132  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||||||||    
T  149133 aactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgta 149232  T
Q  714 gcttca 719  Q
    ||||||    
T  149233 gcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68577
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  214 catagga 220  Q
    |||||||    
T  68583 catagga 68577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 122131 - 121841
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  122131 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 122032  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || ||| |||  || ||||  || | |||||| |     
T  122031 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaacttccgttcctaacaa 121932  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||    
T  121931 aacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatactagaatga 121841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 498
Target Start/End: Original strand, 180151 - 180371
Alignment:
Q  278 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 377  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |  |    
T  180151 tcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtcctaacaaaa 180250  T
Q  378 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 477  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  180251 cactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 180350  T
Q  478 ataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  180351 gtaagtaaactcaatcaacgg 180371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 723
Target Start/End: Original strand, 883 - 1580
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataag 125  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  883 ggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatg 982  T
Q  126 ccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 225  Q
    |||| ||||||| | ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  983 ccactgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 1082  T
Q  226 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 325  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || || || ||||||    
T  1083 tctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttgg 1182  T
Q  326 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 425  Q
    |||  || ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||    
T  1183 atccacttaatcttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaac 1282  T
Q  426 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 525  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  1283 catacaaagcttcgaatggtgccattccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttccacctta 1382  T
Q  526 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 625  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||     
T  1383 ttcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaactta 1482  T
Q  626 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1483 gaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 719
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4699
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 4294  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  4295 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttc 4394  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  4395 tgca-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatccca 4493  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4494 agtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaagtccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactc 4593  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4594 aacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 4693  T
Q  714 gcttca 719  Q
     |||||    
T  4694 acttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 723
Target Start/End: Original strand, 3130 - 3812
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactt 140  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  3130 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 3229  T
Q  141 tttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 240  Q
    |||| || |||||||| | |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||    
T  3230 tttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 3329  T
Q  241 gtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttc 340  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  3330 atctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttc 3429  T
Q  341 tcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcga 440  Q
    ||||||||||| || || || ||||| || ||    || || |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3430 tcagtagtttgttgcacgatttctggccccaaatttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcga 3529  T
Q  441 aaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat 540  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||     
T  3530 atggtgccattccaatactagaatggtaactgttattgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaac 3629  T
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
    ||||||||| || |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  3630 tctcaacaagtctttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctct 3729  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3730 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 711
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1659
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| | |    
T  1004 acatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgata 1103  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    || |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||    
T  1104 tccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttc 1203  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1204 tttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctta-atcgtcttaaccttctcagtagtt 1302  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || ||     ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1303 tgttg-----tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcca 1397  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  1398 ttccaatactagaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaa 1497  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  1498 atcttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 1597  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598 ttccaaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 32 - 600
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1688
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  1120 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 1219  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||    
T  1220 ttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaa 1319  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  1320 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatc 1419  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1420 ttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccataca 1519  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1520 aagcctcataaggtgccatttcaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 1619  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 600  Q
     ||||||| |||||||||||| || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1620 tacacaaactctcaacaaatcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 591 - 723
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 32 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 127524 - 126911
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  127524 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacca 127425  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  127424 ttccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 127325  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  127324 aaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatc 127225  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  127224 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 127125  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 531  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  127124 aagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctccttgctcaag 127025  T
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
     ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || |      
T  127024 tacacaaactctcaacaagtcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgttgaactcaacctcaacttagaacat 126925  T
Q  632 aaagcctcttgcaa 645  Q
    ||||||||||||||    
T  126924 aaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 532 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 50 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 117212 - 116539
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  | |    
T  117212 acatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgata 117113  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| || || |||| |||    
T  117112 tttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttc 117013  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  117012 ttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtt 116913  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    |||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| | | || || |||| ||    
T  116912 tgctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtca 116813  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  116812 ttccaatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaa 116713  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
     ||||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  116712 gtcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 116613  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  116612 ttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 648
Target Start/End: Original strand, 98140 - 98612
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  98140 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcctct 98239  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  98240 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 98339  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||| || ||| |||| || ||||||| |||| | || ||     
T  98340 aacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatactagcatgaaaactgttg 98439  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  98440 ttgaaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 98539  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98540 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 25414 - 24702
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  25414 acatcatcccttggaatcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25315  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |  ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  25314 ccactctatatgccactgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgt 25215  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||| | |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  25214 cacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttc 25115  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   || | || ||| || || ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  25114 atcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttc 25015  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25014 tgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcatccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 24915  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  24914 agtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactc 24815  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  24814 aacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgca 24715  T
Q  714 gcttcacaatttc 726  Q
     || |||||||||    
T  24714 actacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 4)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 128 - 723
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9642
Alignment:
Q  128 accgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactc 227  Q
    |||||||||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  228 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 327  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  328 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 427  Q
     |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctacca 9346  T
Q  428 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 527  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9446  T
Q  528 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 627  Q
    |||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  9447 caagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttaga 9546  T
Q  628 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9547 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 351
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||| | |||| | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  514 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 415  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 339  Q
    | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  414 tatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7049
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||| | |||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||| |||||| || ||||    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaac 7039  T
Q  114 ccactcgata 123  Q
    ||||||||||    
T  7040 ccactcgata 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 331 - 216
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | || || || || |||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  331 ctttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 232  T
Q  480 aagtgaactcgatcaa 495  Q
    |||| ||||| |||||    
T  231 aagtaaactcaatcaa 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 228 - 723
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16327
Alignment:
Q  228 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 327  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  328 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 427  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  428 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 527  Q
     | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16131  T
Q  528 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 627  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16132 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 16231  T
Q  628 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16232 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 388
Target Start/End: Original strand, 15474 - 15829
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  15474 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccg 15572  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| | |||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||    
T  15573 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaa 15672  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||     
T  15673 aaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatt 15772  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15773 ttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16050
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | ||  |||| |||||| |||||| | ||||  | |||| ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||  ||| |||| || ||||| || || |||||||| |||||   |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttc 16460  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16459 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttt 16360  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||   |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  16359 tgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcattgcaatactagaatgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatccca 16260  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  16259 agtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaactt 16160  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16159 aacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 16060  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  16059 acttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 152 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 628
Alignment:
Q  152 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  252 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 351  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  352 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccatt 686  T
Q  452 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 509  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  685 ccaatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 41970
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 42377  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  42376 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 42277  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  42276 tacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 42177  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  42176 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 42077  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  42076 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaa 41977  T
Q  714 gcttcac 720  Q
    | |||||    
T  41976 gtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47033
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 47443  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  47442 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 47343  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||  |    
T  47342 ttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatctta 47243  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47242 agctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 47143  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |    
T  47142 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgca 47043  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  47042 gcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 470 - 719
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2589
Alignment:
Q  470 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 569  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2340 ctattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcg 2439  T
Q  570 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2440 ttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaa 2539  T
Q  670 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 719  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2540 cctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 3838 - 4547
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  3838 acatcatctcttggaataacatgcgaaggaaccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 3937  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  3938 ccactctgtaagccactgttccaacactctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 4037  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||    
T  4038 cataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttc 4137  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4138 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcc 4237  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4238 tgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 4337  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4338 agctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactc 4437  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  4438 aacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgca 4537  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  4538 acttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 52 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 12633
Alignment:
Q  52 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || || ||||||||||||| ||| || ||| |||| | | ||||  | |||    
T  13282 atacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatc 13183  T
Q  152 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 251  Q
    ||||| | || ||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13182 tgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttctt 13083  T
Q  252 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 351  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13082 gaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttg 12983  T
Q  352 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 451  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||  | || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  12982 ctgaagaatttctggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccatt 12883  T
Q  452 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 551  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  12882 ccaatactagaatggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagt 12783  T
Q  552 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 651  Q
    | || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12782 cttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactctt 12683  T
Q  652 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 701  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12682 ccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 11082 - 10425
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||     
T  11082 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 10983  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||    
T  10982 ccactctatatgccactgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgt 10883  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10882 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 10783  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   ||||  ||  | ||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  10782 atcttctctcttatcaattg-gccttctctgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttc 10684  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||| | |||||||  |  ||||||| |||    
T  10683 tgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacactatcaacgacaagtgactattcca 10584  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10583 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactc 10484  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 672  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10483 aatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5225
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  5933 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 5834  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
     ||||| ||| || || || |||||| |||   |||| ||||| | |||| | ||| |||| | ||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  5833 tcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggt 5734  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5733 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttc 5635  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||   |||| || ||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  5634 atcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgtttgttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaacacaacggagttc 5535  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  5534 tgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcattccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaagattactatccca 5435  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5434 agttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaatcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatacgtcgaactc 5335  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5334 aaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgta 5235  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  5234 gcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 91275 - 90566
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  91275 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatttgctacatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 91176  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||| |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  91175 ctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 91076  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    | ||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  91075 cgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 90976  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  90975 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttc 90876  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  90875 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatccca 90776  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  90775 agctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 90676  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||||   |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  90675 aacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgca 90576  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  90575 acttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448515
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
     | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttc 448321  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  448322 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttc 448421  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgact 507  Q
    |||| || |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  448422 tgcaccttcttccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgggaggtgact 448515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 491 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 391066 - 390834
Alignment:
Q  491 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 590  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  391066 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctg 390967  T
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390966 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatac 390867  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  390866 aatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 162094 - 162376
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  162094 acatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 162193  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  162194 ttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaa 162293  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  162294 aaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 413 - 666
Target Start/End: Original strand, 114542 - 114795
Alignment:
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  114542 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 114641  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  114642 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 114741  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 666  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114742 caacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 219
Target Start/End: Original strand, 175361 - 175431
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 219  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  175361 atctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 638 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  638 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 78810 - 78666
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  78810 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 78711  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 320  Q
    | |||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||    
T  78710 tatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttct 78666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10465
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || ||||||||| |     | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 10055  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| || || |||||||    
T  10056 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttc 10155  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10156 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 10255  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10256 agctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 10355  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  10356 aacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgca 10455  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  10456 acttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 19946 - 20655
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19946 acatcatctcttggaataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20045  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  20046 ccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgt 20145  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20146 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttc 20245  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  | ||||||  |||| || ||||| |  || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  20246 atcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaagacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 20345  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20346 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaacttttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 20445  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20446 agctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactc 20545  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20546 aacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgca 20645  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  20646 acttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 12995
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||| | ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13405  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  ||||     
T  13404 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtc 13306  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || |||||||||     
T  13305 ctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcct 13206  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13205 aagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 13106  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  13105 caacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgt 13006  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  13005 agcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 16765
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || || | ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 17175  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  ||||     
T  17174 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtc 17076  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || |||||||||     
T  17075 ctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcct 16976  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16975 aagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 16876  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  16875 caacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgt 16776  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  16775 agcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 693
Target Start/End: Original strand, 27482 - 28161
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||    
T  27482 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 27581  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||    
T  27582 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgt 27681  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27682 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 27781  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  27782 atcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 27881  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  27882 tgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatccca 27981  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27982 agctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 28081  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 693  Q
    |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28082 agcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 787
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||    ||||    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||   || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 1193  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  |||||||  ||||| || ||||| |  |||||||| || |||||  |||| | |||||||||||| || |  ||||| |    
T  1192 atcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcc 1093  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1092 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatccca 993  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  992 agctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactc 893  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  892 aacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgta 793  T
Q  714 gcttca 719  Q
     |||||    
T  792 acttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 569 - 693
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaat 693  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13535
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||   ||||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13945  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  13944 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 13845  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  13844 tgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 13745  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13744 agctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 13645  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  13644 aacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 13545  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  13544 gcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 86 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4587
Alignment:
Q  86 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 185  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  186 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 285  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  286 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 385  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||     
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 4925  T
Q  386 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 485  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || || || || ||||    
T  4924 cttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactgttgttgtatgtga 4825  T
Q  486 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 585  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  4824 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 4725  T
Q  586 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||     
T  4724 atctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatcc 4625  T
Q  686 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4624 gacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 578 - 723
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  578 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  678 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 6670
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  7379 acatcatctcttggaataacttgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 7280  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  7279 ccactctgtaagccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 7180  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| |||||| || ||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7179 cataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 7080  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| ||  || || || |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| |||||  ||||||    
T  7079 atattttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttc 6980  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||  ||| |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6979 tgcacctccgaccatacaatgcttcgaacggtatcataccaatactcgaatggtaattgttgttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 6880  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6879 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactc 6780  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||    
T  6779 aacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgta 6680  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  6679 acttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 338 - 711
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6709
Alignment:
Q  338 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6336 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 6435  T
Q  438 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 537  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436 catagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 6535  T
Q  538 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 637  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||    
T  6536 aaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcc 6635  T
Q  638 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6636 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Original strand, 6254 - 6333
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaa 111  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6254 acatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Original strand, 27192 - 27897
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || ||||    
T  27192 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatccca 27291  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    |||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||    
T  27292 ctctgtatgccacggttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacat 27391  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| | ||||||| ||| || || | ||| || ||||| |||||  |||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||     
T  27392 aggagtaactctcagaaatacatgatatccctcttgaaattcaaggccttc-ctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatc 27490  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || ||  |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  27491 ttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgc 27590  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||     
T  27591 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagc 27690  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  27691 tccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaac 27790  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27791 ctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagct 27890  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  27891 tcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 250 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 4561 - 4085
Alignment:
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||  || |||||||||    
T  4561 ctgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtt 4462  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  4461 tgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgcca 4362  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 549  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  4361 ttccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaa 4262  T
Q  550 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 649  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  4261 atcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 4162  T
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 726  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4161 ttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 435 - 723
Target Start/End: Original strand, 130532 - 130820
Alignment:
Q  435 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  130532 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 130631  T
Q  535 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 634  Q
    ||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  130632 acataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaa 130731  T
Q  635 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130732 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 269 - 723
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59426
Alignment:
Q  269 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 368  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||  |||||||  |  ||||| || ||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccggtc 59071  T
Q  369 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 468  Q
    |||  |||||  | | ||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  59072 ctagtaccacattcttaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggta 59171  T
Q  469 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 568  Q
     || ||||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  59172 actgttattgtacatgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatt 59271  T
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  59272 gtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaa 59371  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||    
T  59372 atcttggatctctatctgatacaatacttgacggaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 573 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  573 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  673 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 435 - 537
Target Start/End: Original strand, 134626 - 134728
Alignment:
Q  435 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  134626 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 134725  T
Q  535 aca 537  Q
    |||    
T  134726 aca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  65 tgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaa 164  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||| |||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  165 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 215  Q
    | ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19081 - 18993
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  19081 acatcatctctcggaataacatgcgagggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37062 - 36974
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 129  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| |||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  37062 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 49547 - 48841
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  49547 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 49448  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  49447 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 49348  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||| |||| |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  49347 aggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 49248  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || |||  ||||||||  ||||| || ||||| |  ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  49247 ttttctctgatcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctac 49148  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||     
T  49147 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagc 49048  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  49047 tccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaac 48948  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48947 ctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagct 48848  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    | |||||    
T  48847 ttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 723
Target Start/End: Original strand, 47091 - 47796
Alignment:
Q  18 catctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  47091 catctctcggaataacatgcgaaggatctgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 47190  T
Q  118 tcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcata 217  Q
    ||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  47191 tctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttata 47290  T
Q  218 ggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattt 317  Q
    ||| | || |||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  47291 ggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatct 47390  T
Q  318 tctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgca 417  Q
    | |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  47391 tttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgca 47490  T
Q  418 tctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtt 517  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  47491 cctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagct 47590  T
Q  518 cctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatc 617  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47591 ccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacc 47690  T
Q  618 tcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 717  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||    
T  47691 tcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaactt 47790  T
Q  718 cacaat 723  Q
    ||||||    
T  47791 cacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 60848
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 61257  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  61256 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 61157  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  61156 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatccca 61057  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  61056 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactc 60958  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  60957 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 60858  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  60857 gcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 51814
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 52223  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  52222 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 52123  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  52122 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatccca 52023  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  52022 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactc 51924  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  51923 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgta 51824  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  51823 gcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67236
Alignment:
Q  47 gctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttcca 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||       
T  67911 gctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttag 67812  T
Q  147 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 246  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || ||    
T  67811 atatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgcc 67712  T
Q  247 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 346  Q
     ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| |||    
T  67711 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgta 67612  T
Q  347 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 446  Q
    || |  ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  67611 gtctcatgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 67512  T
Q  447 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 546  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  67511 ccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa 67412  T
Q  547 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 646  Q
      ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  67411 -taatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 67313  T
Q  647 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67312 ctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 52206 - 51497
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  52206 acatcatctcttggaataacatgcgaatgatcagctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 52107  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||    
T  52106 ccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgt 52007  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  52006 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttc 51907  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| |||||||| ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||      
T  51906 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtca 51807  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51806 tgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 51707  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51706 agctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 51607  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  51606 aaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgta 51507  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  51506 acttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 34017 - 33311
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  34017 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaaccca 33918  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    | | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  33917 ccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 33818  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  33817 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 33718  T
Q  317 --ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 414  Q
      |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33717 cgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttct 33620  T
Q  415 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  33619 gcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaa 33520  T
Q  515 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 614  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33519 gctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 33420  T
Q  615 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 714  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  33419 acctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 33320  T
Q  715 cttcacaat 723  Q
    |||||||||    
T  33319 cttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 40383 - 40918
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  40383 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 40482  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  40483 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 40582  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  40583 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 40682  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  40683 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 40782  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  40783 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 40882  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40883 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18171
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||  | ||  | ||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 18581  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || ||||||     
T  18580 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttt 18481  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18480 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 18381  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||| | ||||| | | | | |||||||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18380 agctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaatcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 18281  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  18280 aacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaa 18181  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  18180 acttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 75  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 26105 - 26814
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| || || ||||    
T  26105 acatcatctctcagaataacttgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 26204  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  26205 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgt 26304  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  26305 cataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttg 26404  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  || | ||| || || ||  |||| || ||||||||||  ||||| |||||      
T  26405 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccgctcccaacactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtct 26504  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||   |    
T  26505 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataaaa 26604  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26605 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactc 26704  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  26705 aacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgca 26804  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  26805 acttcacaat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 723
Target Start/End: Original strand, 26862 - 27196
Alignment:
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  26862 gactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 26961  T
Q  489 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 588  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26962 ctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatc 27061  T
Q  589 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 688  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     
T  27062 tgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgac 27161  T
Q  689 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27162 acaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 39702 - 40410
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 40001  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   || ||||  ||||||||  |||| || ||||| |  || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |    
T  40002 atcttttctcttataatcttgactttctcgttagtctgatgaaccaaatccggtcccaataccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagt-c 40100  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||   || ||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40101 tgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatccca 40200  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40201 agctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactc 40300  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  40301 aacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgta 40400  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  40401 acttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 29112 - 28402
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  |||    
T  29112 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaac 29013  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  29012 ccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgt 28913  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  28912 cacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttc 28813  T
Q  314 attttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 411  Q
    || ||||| |   |||| | ||| |||| ||  |||| || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| ||||    
T  28812 atcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagtctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagt 28714  T
Q  412 tctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcc 511  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28713 tctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcc 28614  T
Q  512 caagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 611  Q
    |||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28613 caagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaac 28514  T
Q  612 tcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  28513 tcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatg 28414  T
Q  712 tagcttcacaat 723  Q
     | |||||||||    
T  28413 caacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 41103 - 40393
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  |||    
T  41103 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaac 41004  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  41003 ccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgt 40904  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  40903 cacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttc 40804  T
Q  314 attttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 411  Q
    || ||||| |   |||| | ||| |||| ||  |||| || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| ||||    
T  40803 atcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagtctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagt 40705  T
Q  412 tctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcc 511  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40704 tctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcc 40605  T
Q  512 caagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 611  Q
    |||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40604 caagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaac 40505  T
Q  612 tcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  40504 tcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatg 40405  T
Q  712 tagcttcacaat 723  Q
     | |||||||||    
T  40404 caacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 6146 - 6856
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||| | |  || ||||    
T  6146 acataatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaac 6245  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | || ||| ||||| ||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  6246 caaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 6345  T
Q  214 cataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcctt 312  Q
    ||||||| | || ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6346 cataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgcttt 6445  T
Q  313 cattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    ||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||  |||||||| |||| || |||||     
T  6446 catcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtc 6545  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  6546 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactattgttgtatgtgaattctatcaatggtaggtgactatccc 6645  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6646 aaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaact 6745  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || | ||||||     
T  6746 caacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgc 6845  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    | |||||||||    
T  6846 aacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 365 - 723
Target Start/End: Original strand, 10 - 368
Alignment:
Q  365 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  465 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 564  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactg 209  T
Q  565 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 664  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  210 aatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaa 309  T
Q  665 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  310 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 22014 - 21305
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  22014 acatcatctctcggaataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 21915  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  21914 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 21815  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || ||||  || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21814 cataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 21715  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || || || |   | ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  21714 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 21615  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21614 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 21515  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  21514 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactc 21415  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||    
T  21414 aacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgta 21315  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  21314 gcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 498
Target Start/End: Original strand, 26006 - 26253
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26006 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26105  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26106 cttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26205  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| || |||||||||||    
T  26206 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcgatcaacgg 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 669
Target Start/End: Original strand, 26288 - 26424
Alignment:
Q  533 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 632  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||    
T  26288 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttccca 26387  T
Q  633 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 669  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26388 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 650 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 10426 - 9782
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  10426 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10327  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  10326 caactctatatgccacagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 10227  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10226 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttc 10127  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||| |||||||||| || ||||| |    
T  10126 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcc 10027  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10026 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 9927  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9926 agctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactc 9827  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 658  Q
    || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  9826 aaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 617 - 723
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 19083 - 19792
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19083 acatcatctcccggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19182  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||    
T  19183 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 19282  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  19283 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 19382  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||   ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || |  ||||||||||||||| | || ||||| |    
T  19383 atcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcc 19482  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  19483 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatccca 19582  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  19583 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactc 19682  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19683 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgta 19782  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  19783 gcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  95 gaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttca 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  195 aagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttg 294  Q
      ||| |||| ||||| |||| | || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  295 tcgactctgcgacgccttcat 315  Q
    || ||| |||||||| |||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 59115 - 59054
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 75  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  59115 acatcatctcttggaatcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatg 59054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 248576 - 249285
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  248576 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 248675  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  248676 caactctataagccacttttccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 248775  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||| ||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  248776 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 248875  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  ||||||| |||||| |  ||||| |  |  ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  248876 atcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagttcggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 248975  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  248976 tacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatccca 249075  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  249076 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 249175  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  249176 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacggtactccatgta 249275  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  249276 gcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 50 - 524
Target Start/End: Original strand, 1 - 475
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||| | |    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||     
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  301 tgctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgcca 400  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 524  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  401 ttccaatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttccacctt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 61 - 770
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  61 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 160  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  161 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgt 260  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  261 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttc 360  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  361 atcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 460  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  461 tacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccatacgaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 560  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  561 agctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcctctccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 660  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||||| || |||||||| |    
T  661 aacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgca 760  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  761 acttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 42746 - 43455
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||    
T  42746 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatccgctagatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaac 42845  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  42846 caactctataagccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 42945  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||| || | ||| || || || || ||||||||||| ||    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  42946 cataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 43045  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  ||||||| |||||| |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  43046 atcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcc 43145  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  43146 tacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 43245  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43246 agctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactc 43345  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    ||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  43346 aaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgta 43445  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  43446 gcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 48668
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||   || ||| | ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||  | ||||||| |||||| || | ||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttc 49077  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| || || |||||||    
T  49076 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtcccaataccacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttc 48977  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48976 tgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 48877  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48876 agctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa-tcctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactc 48778  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  48777 aaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgta 48678  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  48677 acttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57511
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || || || || | ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttc 57861  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  ||  ||||||| || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  57860 atcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcc 57761  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  57760 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatccca 57661  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  57660 agctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactc 57561  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 663  Q
    || ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |||||    
T  57560 aacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactcttccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 491 - 1200
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  491 acatcatctctagaaataacatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 590  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||  | ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||| ||    
T  591 ccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgt 690  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  691 cataggagtaactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttc 790  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  | |   |||| || ||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  791 atctgttttcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcc 890  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  891 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaaaggagccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgca 990  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  991 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactc 1090  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||    
T  1091 aacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgta 1190  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  1191 gcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 656 - 723
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  656 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 710
Target Start/End: Original strand, 37165 - 37861
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||    
T  37165 acatcatctctcagaataacatgtgaaggatccactacatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaac 37264  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  37265 ccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 37364  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||  ||||||| | |||||| || ||||   | ||||||||||   | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  37365 cataggggtgactctaagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 37464  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| || || |    
T  37465 atcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcc 37564  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  37565 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactccatcaacggtagatgactatctca 37664  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  37665 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactg 37764  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 710  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37765 aacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38382 - 38103
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  38382 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 38283  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  38282 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactc-aaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 427  Q
     || |||   |  || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  38182 ctgatgattcaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacca 38103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27545 - 27385
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  27545 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 27446  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 309  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27445 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 27385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 2714 - 3423
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  2714 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcttctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 2813  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||    
T  2814 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgt 2913  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || | ||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  2914 cataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttc 3013  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  |||||||| || || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  3014 atcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcc 3113  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  3114 tgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 3213  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    ||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3214 agcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 3313  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  3314 aacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgca 3413  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
     |||||||||    
T  3414 acttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  599 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 698  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  699 aaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 61 - 723
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5422
Alignment:
Q  61 aagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatgga 160  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||| ||| |||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  161 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 260  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  261 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 360  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||||||||| || ||||| |     
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 5059  T
Q  361 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatacta 460  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  5060 atctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactc 5159  T
Q  461 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 560  Q
    ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||| ||    
T  5160 gaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatcctctaacg 5259  T
Q  561 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 660  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  5260 attgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatct 5359  T
Q  661 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  5360 agaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11560
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || || | ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 11150  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  ||||     
T  11151 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtc 11249  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || |||||||||     
T  11250 ctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcct 11349  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11350 aagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 11449  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  11450 caacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgt 11549  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  11550 agcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 38
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||    
T  742 acatcatctcttggaataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 643  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  642 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 543  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || || | ||| || || || || ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  542 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 443  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  ||||     
T  442 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtc 344  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  343 ctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 244  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||     |   || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  243 aagctccaccttgttcaagcacacacactctc-----agtttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaact 149  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  148 caacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgt 49  T
Q  713 agcttcacaat 723  Q
    |||||||||||    
T  48 agcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 7991 - 7456
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  7991 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 7892  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || | |||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  7891 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 7792  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  7791 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 7692  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  7691 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 7592  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  7591 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 7492  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7491 atctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 374 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 7963
Alignment:
Q  374 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 473  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8311 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgt 8212  T
Q  474 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 573  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8211 tattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 8112  T
Q  574 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 673  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 ctccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatctt 8013  T
Q  674 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8012 ggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 338 - 723
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1937
Alignment:
Q  338 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 437  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 1651  T
Q  438 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 537  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1652 cataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 1751  T
Q  538 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 637  Q
    || |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  1752 aactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 1851  T
Q  638 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  1852 tcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 50 - 514
Target Start/End: Original strand, 16986 - 17450
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | |    
T  16986 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgata 17085  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17086 tctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 17185  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  17186 ttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagtt 17285  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 449  Q
    || ||||  || |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17286 tgttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgcca 17385  T
Q  450 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 514  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17386 ttccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 354 - 603
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46780
Alignment:
Q  354 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  454 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 553  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcc 46730  T
Q  554 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 603  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46731 tctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgata 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 86847 - 86154
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||  || |  |||||||| ||||| |||||||    
T  86847 acatcatctcttagaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaac 86748  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| || ||||  |||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| ||    
T  86747 ccactctatacgcaaccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggt 86648  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || | || ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |    
T  86647 cacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttcc 86548  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| || ||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  86547 atcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttc 86448  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  86447 tgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccattgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatccca 86348  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||     | |||    
T  86347 agttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgata----cacctc 86252  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
        |||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  86251 --cgtcaacttataacccaacgcctcctgcaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 7577 - 6872
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  7577 acatcatctcttggaataacatgcgaag--tccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaac 7480  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || |   |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |    
T  7479 caactctatatgccactgttccaaccttctg--aaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccat 7382  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||| | | || |||| ||| || || || || |||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  7381 catagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttc 7282  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||  ||||||||  |||||||| ||||  || ||||| |  || ||||| || || || |  || |||||| |||||||||| || ||||| |    
T  7281 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagactgatgaaccaaatccggtcccaacacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcc 7182  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7181 tgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatccca 7082  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7081 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgc 6982  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||    
T  6981 agcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgta 6882  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  6881 gcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 17056 - 16350
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  17056 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 16957  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||    
T  16956 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgt 16857  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  16856 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttc 16757  T
Q  314 attttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagtt 412  Q
    || || |||   |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||| ||||||||| || |||||     
T  16756 atcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgacttaaaccagcataaaggagtc 16658  T
Q  413 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 512  Q
    || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||    
T  16657 ctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatccc 16558  T
Q  513 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 612  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16557 aagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaact 16458  T
Q  613 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 712  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||     
T  16457 caacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatga 16358  T
Q  713 agcttcac 720  Q
    ||||||||    
T  16357 agcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Original strand, 43471 - 44177
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| | || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||     
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 43770  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || |||  |||||||| |||||| || ||||| |  ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || |    
T  43771 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctac 43870  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||| |||| | | || |||||||||||||     
T  43871 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagc 43970  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||     
T  43971 tccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaac 44070  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44071 ctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagct 44170  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  44171 tcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 723
Target Start/End: Original strand, 44483 - 45189
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    |||| | || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||     
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 44782  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || |||  |||||||| |||||| || ||||| |  ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || |    
T  44783 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctac 44882  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||| |||| | | || |||||||||||||     
T  44883 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagc 44982  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||     
T  44983 tccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaac 45082  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 716  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45083 ctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagct 45182  T
Q  717 tcacaat 723  Q
    |||||||    
T  45183 tcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 666
Target Start/End: Original strand, 20088 - 20737
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  20088 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 20187  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| |||||  |||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20188 ctctataggccacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 20287  T
Q  217 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 316  Q
    | || | || |||| |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  20288 aagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatc 20387  T
Q  317 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgc 416  Q
    || |||   |||||||  ||||| |  ||||| |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  20388 ttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctac 20487  T
Q  417 atctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagt 516  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||   || ||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||  || || |||||||||||||     
T  20488 acctccgactatacaaagcttcgaacaatgtcatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaagc 20587  T
Q  517 tcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaat 616  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||     
T  20588 tccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgataagccgaactcaac 20687  T
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 666  Q
    ||||||||| | |||||||| |  || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20688 ctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactcttccagaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 36021 - 36220
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  36021 tcatctctcggaaaaacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 36120  T
Q  117 ctcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 216  Q
    ||| ||| |||||  |||||||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36121 ctctataggccacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Original strand, 18812 - 19509
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  18812 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 18911  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  18912 ccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgt 19011  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  19012 cataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttc 19111  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || |  ||||  |||| || ||  || || ||||| || ||||| || | ||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19112 atctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttc 19211  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||    
T  19212 tgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatccca 19311  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19312 agctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactc 19411  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19412 agcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 149 - 711
Target Start/End: Original strand, 23109 - 23671
Alignment:
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 248  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23109 atctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccct 23208  T
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || |||||    
T  23209 cttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagt 23308  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     || ||||| || | ||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||    
T  23309 ctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgcc 23408  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 548  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  23409 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagta 23508  T
Q  549 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 648  Q
    |||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23509 aatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaact 23608  T
Q  649 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23609 cttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 431 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197106
Alignment:
Q  431 aaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 530  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 197305  T
Q  531 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 630  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  197304 gtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacc 197205  T
Q  631 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197204 taaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 498
Target Start/End: Original strand, 21927 - 22045
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| || | || ||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| |  | || ||||    
T  21927 ctttcacctgactcataccaacacaatggcattctacaccccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttat 22026  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22027 aagtaaactcaatcaacgg 22045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 26208 - 25511
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||    
T  26208 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26109  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  |||   | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26108 ccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgt 26009  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  26008 cataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttc 25909  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || ||||| ||||| || || || |  || ||||| |  || || || || ||| ||||||||||||| || ||| |      
T  25908 atcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatggaccaaatccggtcccagcacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattct 25809  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25808 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 25709  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||| | || || | |||||  |||||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25708 agctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 25609  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  25608 aacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 16639 - 16940
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||    
T  16639 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16738  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | || | ||| |||||  |||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16739 caacactatatgccactattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 16838  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||    
T  16839 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttc 16938  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  16939 at 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 723
Target Start/End: Original strand, 26224 - 26933
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  26224 acatcatcccttggaatcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26323  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |  ||| ||||||||| ||||| ||  | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26324 cagctctataagccactgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 26423  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    || |||| |||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  26424 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 26523  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||| |  ||||||||||||||| |  ||||| |  |||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  26524 atcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcc 26623  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  26624 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccatcccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatccca 26723  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  26724 agctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactc 26823  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |  ||||| || |    
T  26824 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgca 26923  T
Q  714 gcttcacaat 723  Q
    ||||||||||    
T  26924 gcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 13124 - 12420
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || |    
T  13124 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagc 13025  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | ||||  || |||||||||||||   | ||  |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  13024 caactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgt 12925  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||| |||    
T  12924 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttc 12825  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || ||    |||||||  || |||||||| || || ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  12824 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcc 12725  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||     || | ||    
T  12724 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtag----gtagcaca 12629  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12628 agctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactc 12529  T
Q  614 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 713  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12528 aacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgta 12429  T
Q  714 gcttcacaa 722  Q
    |||||||||    
T  12428 gcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6256 - 5756
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || || ||||    
T  6256 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcctctacatacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 6158  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  6157 ccactctatatgccacagttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgt 6058  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| |||||| ||  |||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6057 cataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 5958  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||| ||  || || || ||||||||  |||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  5957 atcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgacgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttc 5858  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5857 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccca 5758  T
Q  514 ag 515  Q
    ||    
T  5757 ag 5756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 14594 - 13994
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  14594 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 14495  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14494 caactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14395  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || || || || |||| |||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14394 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14295  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||| ||||||||  ||| ||||  |||| || | ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || ||||| |    
T  14294 atcttttctttgatcatcttgactatctctatagtctgataaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcc 14195  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 513  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  14194 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccca 14095  T
Q  514 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 613  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  14094 agctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaatcctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactc 13995  T
Q  614 a 614  Q
    |    
T  13994 a 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 9039
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  9220 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 9121  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaa 195  Q
    | |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  9120 caactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16790 - 16375
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||   | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16790 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 16691  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||| ||| | | |||||||| |||||| | ||| || | |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  16690 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16591  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 331  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||    
T  16590 aaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatc 16491  T
Q  332 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataca 431  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16490 ttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccataca 16391  T
Q  432 aagcctcgaaaggtgc 447  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16390 aagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 650 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 491 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4727
Alignment:
Q  491 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 590  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctg 4866  T
Q  591 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 tctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 4766  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4765 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 32
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  567 gtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 468  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |     
T  467 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaa 368  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |  | ||     
T  367 agcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatgaaaattgttg 268  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  267 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 168  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  167 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 68  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  67 atctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 165 - 723
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2466
Alignment:
Q  165 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 264  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  265 ttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 362  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||  ||  |||| ||||| ||  |||  |  |    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctctt--atcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaat 2105  T
Q  363 ctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactaga 462  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2106 ctggtcccaacaccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcga 2205  T
Q  463 atgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgac 562  Q
    ||| || || |  || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||     
T  2206 atggtaactgtagttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgat 2305  T
Q  563 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 662  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |    
T  2306 taaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtg 2405  T
Q  663 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  2406 aagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 182 - 723
Target Start/End: Original strand, 1 - 541
Alignment:
Q  182 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 281  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  282 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 381  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T
Q  382 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 481  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||  ||||||| ||||| || || || || ||     
T  201 ttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgtt-ccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtac 299  T
Q  482 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 581  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  300 gtgaactctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgact 399  T
Q  582 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 681  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  400 gaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 499  T
Q  682 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||| |||| | |||||||||    
T  500 atccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 147 - 723
Target Start/End: Original strand, 10865 - 11441
Alignment:
Q  147 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || || | |||||| || || ||    
T  10865 aaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcacc 10964  T
Q  247 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 346  Q
     ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||| |||    
T  10965 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgta 11064  T
Q  347 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 446  Q
    || |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11065 gtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 11164  T
Q  447 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 546  Q
    |||| || ||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11165 ccatacctatactcgaatggtaaatgttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa 11264  T
Q  547 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 646  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11265 caaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 11364  T
Q  647 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11365 ctcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 10787 - 10831
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttc 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10787 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttc 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 482 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3442
Alignment:
Q  482 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 581  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3689 gtgaactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgact 3590  T
Q  582 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 681  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3589 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctct 3490  T
Q  682 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3489 atttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3694
Alignment:
Q  266 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  366 gtcctaagaccactctt 382  Q
    |||||||||||||||||    
T  3710 gtcctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 147 - 723
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5885
Alignment:
Q  147 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  5309 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 5408  T
Q  247 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagt 345  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| || |  |||||||  || ||||||||    
T  5409 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttcctt-atcatcttgaccttctcagt 5507  T
Q  346 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 445  Q
     || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||| |||    
T  5508 cgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggt 5607  T
Q  446 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 545  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | |||||    
T  5608 gccataccattactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctca 5707  T
Q  546 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 645  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  5708 acaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaaccatctttctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaa 5807  T
Q  646 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     || ||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5808 gctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 483 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 19876 - 19636
Alignment:
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19876 tgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactg 19777  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19776 accatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctcta 19677  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19676 tctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Original strand, 16947 - 17142
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactt 140  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||  ||||     
T  16947 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactc 17046  T
Q  141 tttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaaca 236  Q
    ||||| | |||||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17047 tttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 381 - 647
Target Start/End: Original strand, 1 - 267
Alignment:
Q  381 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 480  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 tttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattata 100  T
Q  481 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 580  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||    
T  101 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgac 200  T
Q  581 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 647  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  201 taaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 443 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 18839
Alignment:
Q  443 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactc 19020  T
Q  543 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 642  Q
    |||| || ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||||     
T  19019 tcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctcttt 18920  T
Q  643 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18919 caaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 269 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 2992
Alignment:
Q  269 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 368  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  || | ||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttc 3344  T
Q  369 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 468  Q
    | || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3343 ccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggta 3244  T
Q  469 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 568  Q
     || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || ||     
T  3243 actgttgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatc 3144  T
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  3143 gtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtga 3044  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3043 acctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3487
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 3512  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaac 138  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3511 caactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 206
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||  | |    
T  567 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgata 468  T
Q  150 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  467 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttc 368  T
Q  250 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 349  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  367 ttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtt 268  T
Q  350 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 411  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  267 tgctgtacaatttctggtcccaaaactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 541 - 723
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 266 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5086
Alignment:
Q  266 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 365  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |  ||||| |  || |    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaatccg 5444  T
Q  366 gtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 465  Q
    |||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  5443 gtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatg 5344  T
Q  466 atagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactga 565  Q
     || || || || || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||     
T  5343 gtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattgg 5244  T
Q  566 attgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag 665  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5243 atcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaag 5144  T
Q  666 taaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    | || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5143 tgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 154 - 472
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  154 acatcatctcttgaaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaac 253  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||    
T  254 caactctatatgccacagttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgt 353  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | || |||| ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  354 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 453  T
Q  314 attttctcttggatcatct 332  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  454 atcttctctctgatcatct 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 723
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  638 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 206 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 880
Alignment:
Q  206 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 305  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  306 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 405  Q
    |||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataa 1186  T
Q  406 cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatga 505  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| || || |||    
T  1185 aggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggtaggtga 1086  T
Q  506 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 605  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1085 ctgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataag 986  T
Q  606 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 705  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  985 ccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacggaac 886  T
Q  706 accatg 711  Q
     |||||    
T  885 cccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28231
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||  ||| | |||||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 28229  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  28230 at 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 650 - 729
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 729  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 30
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  307 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccg 208  T
Q  132 ttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa 231  Q
    |||||||  ||||| | |||||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| ||    
T  207 ttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaa 108  T
Q  232 aaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 309  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  107 aaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5345 - 4912
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || ||||    
T  5345 acatcatctctcggaataacatgcgaatgatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 5246  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||   || ||||  ||||||||  | |   | |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||    
T  5245 ccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatatctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgt 5146  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5145 cataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5046  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  || ||||| || || || ||||| |  | |||| | || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  5045 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtctgatgaactaaatatggttccaacaccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcc 4946  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 447  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4945 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 442 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 1887 - 1618
Alignment:
Q  442 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 541  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |    
T  1887 aggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacact 1788  T
Q  542 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 641  Q
    || | ||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||    
T  1787 cttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatctt 1688  T
Q  642 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1687 gcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 441
Target Start/End: Original strand, 3854 - 4281
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||     
T  3854 acatcatctcaaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaa 3953  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  3954 caactatgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 4053  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  4054 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttc 4153  T
Q  314 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    || || |||   |||||||  |||||||| ||||| || | ||| |  || ||||| || || || ||||| | ||||||||||||  | |  ||||| |    
T  4154 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgataaactaaatccggtcccaacactacactttctcttgactcaaaccaatatataggagtcc 4253  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 441  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||    
T  4254 tgcaccttcgaccatacaaagcttcgaa 4281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1512 - 1211
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  1512 acatcatctctcggaataacattcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaac 1413  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | | |   || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  1412 ctattttttatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 1313  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  1312 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttc 1213  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  1212 at 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 494 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 11531 - 11302
Alignment:
Q  494 aacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 593  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11531 aacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtct 11432  T
Q  594 gcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 693  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  11431 gcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaat 11332  T
Q  694 gctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11331 actcgatggaactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 503 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  503 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 602  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  603 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 702  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  703 aacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13561 - 13380
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || | ||| ||||||||  | ||  |     
T  13561 tacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagat 13462  T
Q  149 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 230  Q
    ||||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13461 atctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14349
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||| ||| |  | ||||  || | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaaccttt-cagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14347  T
Q  314 at 315  Q
    ||    
T  14348 at 14349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 521 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  521 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 620  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  621 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 482 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2509
Alignment:
Q  482 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 581  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  2750 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgact 2651  T
Q  582 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 681  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2650 gaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctct 2551  T
Q  682 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2550 atccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 685
Target Start/End: Original strand, 86 - 523
Alignment:
Q  248 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 347  Q
    |||| |||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||    
T  86 tcctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtag 185  T
Q  348 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 447  Q
    | || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  186 tctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgc 285  T
Q  448 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 547  Q
    ||| | |||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |      
T  286 catacaaatactcgaatggtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttact 385  T
Q  548 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 647  Q
    ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  386 aaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaac 485  T
Q  648 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 685  Q
    | ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  486 tcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1091 - 946
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  1091 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 992  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 321  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  991 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctc 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38761
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacc 114  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || | |||||| ||| ||||||| || || |||||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  115 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 214  Q
     |||| ||| ||||| | ||||||| | ||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  215 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 314  Q
    | |||| ||||||||| ||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttca 38930  T
Q  315 t-tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttc 413  Q
    | ||| || |  |||| |   |||||||||||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||      
T  38929 tctttttcct-tatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacgctctcacctgactcaaaccagcataaaggagtct 38831  T
Q  414 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 483  Q
    | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  38830 tacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 387 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 6307 - 5969
Alignment:
Q  387 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaa 486  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  6307 ctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaa 6208  T
Q  487 ctcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 584  Q
    ||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||    
T  6207 ctctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgac 6108  T
Q  585 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 684  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| |||||    
T  6107 catctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatc 6008  T
Q  685 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6007 cgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 1140 - 1385
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  1140 acatcatctctcggaataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1239  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | |   | ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  1240 ccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 1339  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactca 259  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||    
T  1340 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 505 - 723
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  505 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 604  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  605 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  705 caccatgtagcttcacaat 723  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 428 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 5227 - 4945
Alignment:
Q  428 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 527  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||    
T  5227 tacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgct 5128  T
Q  528 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 627  Q
    |||||||||| | |||||  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5127 caagaacacacactctcagtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcga 5028  T
Q  628 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 710  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  5027 acccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4217
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 213  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | |   |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  214 cataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 279  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 569 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 722  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 572 - 723
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  572 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  672 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 723
Target Start/End: Original strand, 41350 - 41589
Alignment:
Q  482 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 581  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  41350 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgact 41449  T
Q  582 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 681  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  41450 gaccatctgtctgcggatgataagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctct 41547  T
Q  682 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41548 attcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 45807 - 45932
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatg-cgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaa 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| || || |||    
T  45807 acatcatctcttgaaataacatggcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaa 45906  T
Q  113 cccactcgataagccaccgttccaac 138  Q
    || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45907 ccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 210  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 531
Target Start/End: Original strand, 136278 - 136390
Alignment:
Q  419 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 518  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  136278 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 136377  T
Q  519 ctccttgctcaag 531  Q
    | |||||||||||    
T  136378 caccttgctcaag 136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 46279 - 46814
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| || | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  46279 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 46378  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  46379 tatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 46478  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  46479 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 46578  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  46579 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 46678  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | |  |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||    
T  46679 ctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcgg 46778  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46779 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 521 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  521 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 620  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  621 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 720  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  721 aat 723  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2208 - 2023
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || |  ||||    
T  2208 acatcatctcttggaataacatgcgaagg-tccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaac 2110  T
Q  114 ccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcac 200  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2109 ccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 23519 - 24054
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || |||||||||||||| || |   | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  23519 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctct 23618  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  23619 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacctccggtcctaacaa 23718  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  23719 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaaatgttg 23818  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  23819 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctct 23918  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  23919 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24018  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24019 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 380 - 711
Target Start/End: Original strand, 7497 - 7828
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 479  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |  | || || |    
T  7497 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaattgttgttgt 7596  T
Q  480 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 579  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| |     
T  7597 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctcggt 7696  T
Q  580 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 679  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  7697 ctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaaacctcggatcc 7796  T
Q  680 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
      ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7797 ggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 605 - 723
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  605 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  705 caccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 605 - 723
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  605 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  705 caccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 14918 - 14383
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||  |||| | || | || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14918 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctct 14819  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  14818 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 14719  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||| | || ||     
T  14718 agcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaactgttg 14619  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||| ||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14618 ttgtaagtaaactcaatcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14519  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| | | | || || ||||||| ||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  14518 ccgtctgcccatcggtctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 14419  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14418 atcacgatctgacacaatactagaaggaataccatg 14383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 33193 - 32953
Alignment:
Q  483 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 582  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  33193 tgaactctatcaacggtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 33094  T
Q  583 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 682  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  33093 accatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatcccta 32994  T
Q  683 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    || ||   ||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  32993 tccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 3284 - 3818
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || | ||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || ||||| | ||    
T  3284 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctct 3383  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  3384 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 3483  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  3484 agcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 3583  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |    | |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||    
T  3584 ttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctct 3683  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  3684 ctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 3782  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3783 atcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 569 - 684
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  669 atcttggatctctatc 684  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26263 - 25959
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26263 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26164  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || ||||  ||| ||||||| |     |||||||| || | |||||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26163 cttgcacaacttctagtcctaacaaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26064  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 550  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |   ||||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||    
T  26063 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaa 25964  T
Q  551 tcctc 555  Q
    |||||    
T  25963 tcctc 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13568
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13033 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 13132  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  13133 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 13232  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      |||| || || || |||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  13233 ggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 13332  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || || || ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  13333 ttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 13432  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    |||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||    
T  13433 ccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcgg 13532  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13533 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 913
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| || || || ||  || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacct 1023  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
     |||||||||| ||||  || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||| | || || || ||||| ||||    
T  1022 aactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatacttgtatgaaaactgttgttgtaagtaaact 923  T
Q  489 cgatcaacgg 498  Q
    | ||||||||    
T  922 caatcaacgg 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 584 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  584 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 683  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  684 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 638 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  638 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3521
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  4056 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcctct 3957  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  | ||||| |     
T  3956 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccaggcctaacaa 3857  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || |  || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  3856 agcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 3757  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  3756 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 3657  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  3656 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 3557  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3556 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 497
Target Start/End: Original strand, 71446 - 71665
Alignment:
Q  278 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 377  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| || |    
T  71446 tcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacacaa 71545  T
Q  378 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 477  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||| | || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  71546 cactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 71645  T
Q  478 ataagtgaactcgatcaacg 497  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  71646 gtaagtaaactcaatcaacg 71665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  596 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 695  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  696 tcgaaggaacaccatg 711  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 332
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13532
Alignment:
Q  197 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 296  Q
    ||||| || |||||||| | |||| | |||||||| || ||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  297 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 332  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatct 13532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 711
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  617 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 466
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14938
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||| || ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |  || |||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaaacactttcacct 14860  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
    ||||||||| | |||||||   | || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||    
T  14861 gactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaagaatga 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 24005 - 24540
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  24005 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 24104  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || || || || ||||| || ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  ||||||||||| |     
T  24105 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagtctcttggacaacttctggtcctaacaa 24204  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || |||| |||||| ||| | |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |  ||||     
T  24205 agcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaattattg 24304  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| | ||| || | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||| || |||||||    
T  24305 ttgtaagtaaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctggatagtcctct 24404  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| || |||||    
T  24405 ccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtgaaccttgg 24504  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24505 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 1530 - 1293
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |    
T  1530 tgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 1431  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || ||||  || |||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||| | |||||||||||||| || |||| |||    
T  1430 cttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtcat 1331  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  1330 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtgaact 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9269
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 28447 - 27912
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | || ||||||||||| || || ||| | || ||||||| ||| ||||| | ||    
T  28447 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcctct 28348  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  28347 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 28248  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||| |||| |  | ||     
T  28247 agcactttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagcatgaaaattgttg 28148  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||| | | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  28147 ttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 28048  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||    
T  28047 ccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcgg 27948  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27947 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 596 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  596 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 695  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  696 tcgaaggaacaccatgtagcttca 719  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 977 - 875
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  977 tcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 878  T
Q  117 ctc 119  Q
    |||    
T  877 ctc 875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3590
Alignment:
Q  224 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 323  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| |    
T  4077 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcct 3978  T
Q  324 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 423  Q
    | ||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||| ||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  3977 gaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtcttaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 3878  T
Q  424 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 523  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| | | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| || | |||    
T  3877 accatacaaagcctcaaacggagccatgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaacttacacct 3778  T
Q  524 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 623  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||| | ||||| |  | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  3777 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgattagtcctttttgtctgcccatctgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaact 3678  T
Q  624 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    | |  || ||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||  | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3677 tagttccgaaagtagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccaacacaatactagaaggaataccatg 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 498
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9434
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| |||||   ||| |||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 388  Q
    ||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||  ||||||| |   | |||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaacttcctgtcctaacaaagcactttcacct 9324  T
Q  389 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 488  Q
    ||||||||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  9325 gactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 9424  T
Q  489 cgatcaacgg 498  Q
      ||||||||    
T  9425 aaatcaacgg 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 711
Target Start/End: Original strand, 14782 - 15316
Alignment:
Q  176 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 275  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14782 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14881  T
Q  276 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 375  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14882 tatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 14981  T
Q  376 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 475  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||| |||||||||| |||| || ||||| ||  | |||||||||||| | || ||     
T  14982 agcactctctccggactcaaacca-cacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaaacctcaaacggtgctatatcgatactagaatgaaaactgttg 15080  T
Q  476 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 575  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | |||   |||||||||||| ||||    |||||| |||||||    
T  15081 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacagacacgctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctct 15180  T
Q  576 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 675  Q
    ||| ||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15181 ccgtctgcccattggtctgaggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaggcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15280  T
Q  676 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||| || ||||||    
T  15281 atcccgatctgacacaatactagaagaaataccatg 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 711
Target Start/End: Original strand, 43738 - 44198
Alignment:
Q  251 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 350  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  43738 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 43837  T
Q  351 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 450  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||  | || |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  43838 cttgcacaacttccggtcctaataaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccat 43937  T
Q  451 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 550  Q
     |  |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |  ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  43938 actgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacacactgctccaaaacacaagctctcaacaaa 44037  T
Q  551 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 650  Q
    || ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  44038 tcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 44137  T
Q  651 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44138 cccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 704
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  562 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 661  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  662 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 704  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 466
Target Start/End: Original strand, 10985 - 11071
Alignment:
Q  380 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 466  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  10985 ctttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatactagaatga 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8999 - 8748
Alignment:
Q  249 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 348  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  8999 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8900  T
Q  349 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 448  Q
     |  || ||||  || |||||||| |   | |||||  | || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  8899 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcttcggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtc 8800  T
Q  449 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 500  Q
    ||||| ||| ||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8799 attccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaatcaacggaa 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 569 - 711
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  569 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 668  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  669 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 541 - 711
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  541 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 640  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  641 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 321  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 321  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 711
Target Start/End: Original strand, 14478 - 14798
Alignment:
Q  392 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 491  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  14478 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 14577  T
Q  492 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 591  Q
    ||||| | | |  |   |||||| |  |  ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| | ||||||   ||| ||||||||    
T  14578 tcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgt 14677  T
Q  592 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc-aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 690  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |||| | ||    
T  14678 cttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacac 14777  T
Q  691 aatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  14778 aatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  189 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 288  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  289 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 321  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 532 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  532 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 631  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  632 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 711  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 1
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 75  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||    
T  62 acatcatctcttggaataacacgcgaaggatctggtacatacttctgcaattgcgacacatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 496
Target Start/End: Original strand, 2897 - 3001
Alignment:
Q  392 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 491  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  2897 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 2996  T
Q  492 tcaac 496  Q
    |||||    
T  2997 tcaac 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 498
Target Start/End: Original strand, 17 - 96
Alignment:
Q  419 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 498  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  17 ctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 650 - 723
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  650 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 723  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University