View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8781_low_1 (Length: 717)

Name: NF8781_low_1
Description: NF8781
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8781_low_1
NF8781_low_1
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (20-703)||(27187269-27187952)
chr6 (20-703)||(27261288-27261971)
chr6 (20-703)||(28292137-28292820)
chr6 (20-703)||(28262962-28263645)
chr6 (20-703)||(28341711-28342394)
chr6 (20-701)||(24312935-24313616)
chr6 (20-701)||(29591687-29592368)
chr6 (20-703)||(1542849-1543532)
chr6 (20-701)||(2874570-2875251)
chr6 (20-701)||(25112385-25113066)
chr6 (20-701)||(16626484-16627165)
chr6 (20-701)||(5838986-5839667)
chr6 (20-698)||(19864520-19865198)
chr6 (20-689)||(25609640-25610309)
chr6 (20-692)||(27331209-27331881)
chr6 (20-692)||(27391949-27392621)
chr6 (20-692)||(16927416-16928088)
chr6 (20-692)||(18407718-18408391)
chr6 (20-680)||(22078478-22079136)
chr6 (20-680)||(16963155-16963815)
chr6 (20-692)||(22762231-22762903)
chr6 (20-692)||(23078302-23078974)
chr6 (20-487)||(12497859-12498326)
chr6 (20-487)||(12510575-12511042)
chr6 (247-696)||(22433929-22434378)
chr6 (20-487)||(12505188-12505655)
chr6 (20-446)||(25765312-25765737)
chr6 (20-692)||(25768024-25768696)
chr6 (400-680)||(17032596-17032876)
chr6 (20-692)||(21471434-21472106)
chr6 (20-692)||(19879131-19879803)
chr6 (55-689)||(15459204-15459838)
chr6 (55-692)||(34645362-34645999)
chr6 (37-696)||(11280277-11280936)
chr6 (66-692)||(17415365-17415991)
chr6 (20-692)||(10468625-10469297)
chr6 (79-692)||(14381243-14381856)
chr6 (20-692)||(21563908-21564580)
chr6 (20-692)||(22796408-22797080)
chr6 (20-691)||(27560394-27561065)
chr6 (130-627)||(1640715-1641212)
chr6 (55-692)||(18794558-18795195)
chr6 (20-689)||(24364245-24364914)
chr6 (116-691)||(28282590-28283165)
chr6 (20-277)||(21833172-21833429)
chr6 (20-505)||(8766111-8766596)
chr6 (20-207)||(17032395-17032582)
chr6 (20-409)||(18197606-18197995)
chr6 (280-692)||(19453513-19453925)
chr6 (20-284)||(14131363-14131627)
chr6 (20-278)||(25750642-25750900)
chr6 (365-692)||(5296982-5297308)
chr6 (37-386)||(11287680-11288029)
chr6 (370-691)||(27559765-27560086)
chr6 (476-692)||(15896383-15896599)
chr6 (118-506)||(18800873-18801261)
chr6 (473-692)||(21569767-21569986)
chr6 (193-293)||(11291818-11291918)
chr6 (145-680)||(16382161-16382696)
chr6 (586-701)||(21836964-21837079)
chr6 (539-692)||(8762709-8762862)
chr6 (601-692)||(20637077-20637168)
chr6 (586-692)||(18197504-18197610)
chr6 (145-680)||(16098008-16098543)
chr6 (145-680)||(23996206-23996741)
chr6 (145-680)||(25742876-25743410)
chr6 (145-467)||(15078365-15078687)
chr6 (20-114)||(22433830-22433924)
chr6 (149-265)||(25750908-25751024)
chr6 (145-680)||(18837696-18838231)
chr6 (158-467)||(21412939-21413248)
chr6 (158-466)||(1648786-1649094)
chr6 (220-680)||(18571684-18572144)
chr6 (630-696)||(22442710-22442776)
chr6 (160-465)||(25655456-25655760)
chr6 (220-435)||(16233242-16233457)
chr6 (20-108)||(18787721-18787809)
chr6 (577-662)||(23027522-23027607)
chr6 (22-98)||(1640634-1640710)
chr6 (388-467)||(1652274-1652353)
chr6 (559-680)||(21927577-21927698)
chr6 (560-680)||(1648602-1648722)
chr6 (490-638)||(14625068-14625216)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (20-703)||(109434-110117)
scaffold0029 (20-692)||(112559-113231)
scaffold0029 (55-692)||(95636-96273)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (20-703)||(18177700-18178383)
chr7 (20-703)||(8198586-8199269)
chr7 (20-703)||(10870953-10871636)
chr7 (20-701)||(11236844-11237525)
chr7 (20-701)||(15160688-15161369)
chr7 (20-703)||(44790980-44791663)
chr7 (20-701)||(8707563-8708244)
chr7 (20-701)||(18551389-18552070)
chr7 (20-701)||(14332355-14333036)
chr7 (20-701)||(13686021-13686703)
chr7 (20-703)||(11552731-11553414)
chr7 (20-703)||(12687459-12688142)
chr7 (20-701)||(16947-17628)
chr7 (20-703)||(14954578-14955261)
chr7 (21-581)||(23516520-23517080)
chr7 (20-695)||(15154294-15154964)
chr7 (241-701)||(9596236-9596696)
chr7 (55-692)||(15624545-15625182)
chr7 (20-692)||(12206418-12207090)
chr7 (20-572)||(15203837-15204389)
chr7 (20-692)||(15102221-15102891)
chr7 (211-692)||(11771881-11772362)
chr7 (31-692)||(21661933-21662591)
chr7 (20-692)||(14263862-14264534)
chr7 (20-692)||(19147170-19147842)
chr7 (20-692)||(20746569-20747241)
chr7 (20-692)||(11388046-11388717)
chr7 (352-692)||(14039986-14040326)
chr7 (352-692)||(14350016-14350356)
chr7 (20-689)||(8211749-8212418)
chr7 (20-692)||(16071912-16072584)
chr7 (20-689)||(11305884-11306553)
chr7 (20-692)||(13021316-13021988)
chr7 (20-692)||(16950089-16950761)
chr7 (20-689)||(49152260-49152929)
chr7 (20-691)||(18053572-18054243)
chr7 (20-692)||(6413470-6414142)
chr7 (20-692)||(14285994-14286666)
chr7 (20-692)||(13665512-13666168)
chr7 (166-536)||(35964646-35965016)
chr7 (20-691)||(14129832-14130503)
chr7 (24-692)||(1025-1693)
chr7 (20-691)||(14433650-14434321)
chr7 (116-689)||(23505491-23506064)
chr7 (20-347)||(14037765-14038092)
chr7 (20-347)||(14347795-14348122)
chr7 (20-692)||(12455662-12456333)
chr7 (116-635)||(23199418-23199937)
chr7 (116-689)||(26118226-26118799)
chr7 (577-703)||(23203242-23203368)
chr7 (577-703)||(23509369-23509495)
chr7 (217-691)||(15340587-15341061)
chr7 (352-689)||(13968289-13968626)
chr7 (158-680)||(14936443-14936965)
chr7 (222-580)||(12456940-12457298)
chr7 (145-680)||(4440011-4440546)
chr7 (145-680)||(7823983-7824518)
chr7 (145-680)||(27107426-27107961)
chr7 (158-680)||(15364036-15364558)
chr7 (193-435)||(12368473-12368715)
chr7 (28-284)||(26288063-26288318)
chr7 (145-680)||(21674185-21674720)
chr7 (248-415)||(12193742-12193909)
chr7 (20-139)||(15340455-15340574)
chr7 (349-638)||(45146842-45147131)
chr7 (151-688)||(40790-41327)
chr7 (559-680)||(17924148-17924269)
chr7 (565-673)||(23641951-23642059)
chr7 (532-654)||(15171642-15171764)
chr7 (160-301)||(13378796-13378937)
chr7 (349-467)||(13353438-13353556)
chr7 (598-656)||(17144936-17144994)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (20-703)||(15589251-15589934)
chr3 (20-692)||(53384888-53385560)
chr3 (20-703)||(20061913-20062596)
chr3 (20-703)||(10005188-10005871)
chr3 (20-703)||(10905798-10906481)
chr3 (20-703)||(48425035-48425718)
chr3 (20-703)||(16635361-16636044)
chr3 (20-703)||(16756444-16757127)
chr3 (20-703)||(43162685-43163368)
chr3 (20-701)||(15348106-15348787)
chr3 (20-703)||(6600335-6601007)
chr3 (20-701)||(13252278-13252959)
chr3 (20-701)||(5424791-5425471)
chr3 (20-701)||(15402371-15403052)
chr3 (20-701)||(15724795-15725475)
chr3 (20-701)||(12497836-12498517)
chr3 (20-701)||(26792260-26792941)
chr3 (20-701)||(15338857-15339538)
chr3 (20-701)||(16412143-16412824)
chr3 (20-701)||(14876360-14877041)
chr3 (20-701)||(16806787-16807468)
chr3 (20-698)||(16371001-16371679)
chr3 (20-692)||(17489438-17490110)
chr3 (20-701)||(16691748-16692433)
chr3 (20-692)||(16492051-16492723)
chr3 (20-692)||(9522307-9522979)
chr3 (20-692)||(15247735-15248407)
chr3 (20-692)||(15208479-15209151)
chr3 (20-692)||(15227247-15227919)
chr3 (55-692)||(13971979-13972616)
chr3 (20-692)||(14086271-14086943)
chr3 (20-692)||(13322511-13323183)
chr3 (391-698)||(11564545-11564852)
chr3 (20-692)||(15952827-15953499)
chr3 (412-692)||(14126464-14126744)
chr3 (175-684)||(15015634-15016131)
chr3 (20-682)||(18134215-18134877)
chr3 (20-692)||(12360401-12361073)
chr3 (20-691)||(8758942-8759613)
chr3 (20-691)||(41177120-41177791)
chr3 (20-689)||(13941622-13942291)
chr3 (454-698)||(15061778-15062022)
chr3 (20-689)||(10383567-10384235)
chr3 (20-692)||(11303632-11304304)
chr3 (55-692)||(12850138-12850775)
chr3 (20-689)||(47123542-47124211)
chr3 (55-689)||(10419907-10420541)
chr3 (116-691)||(16836370-16836945)
chr3 (116-691)||(44776941-44777516)
chr3 (20-593)||(11960992-11961565)
chr3 (20-692)||(16329520-16330190)
chr3 (116-691)||(16380788-16381362)
chr3 (349-689)||(28754245-28754585)
chr3 (355-692)||(17492563-17492900)
chr3 (382-692)||(14573889-14574199)
chr3 (349-686)||(4678365-4678702)
chr3 (22-284)||(14571448-14571710)
chr3 (355-596)||(26008948-26009189)
chr3 (145-680)||(8274281-8274816)
chr3 (313-584)||(13001800-13002070)
chr3 (538-692)||(16828061-16828215)
chr3 (145-680)||(16742585-16743120)
chr3 (145-679)||(15576473-15577007)
chr3 (472-692)||(16338371-16338591)
chr3 (158-673)||(18748401-18748916)
chr3 (193-435)||(17192865-17193107)
chr3 (218-432)||(6712539-6712753)
chr3 (145-435)||(13975172-13975462)
chr3 (531-680)||(6152733-6152882)
chr3 (295-467)||(14183007-14183179)
chr3 (20-107)||(31689067-31689154)
chr3 (20-107)||(31945070-31945157)
chr3 (510-680)||(13967222-13967392)
chr3 (361-435)||(6152978-6153052)
chr3 (553-647)||(17193224-17193318)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (20-701)||(27668294-27668975)
chr5 (20-701)||(19769861-19770542)
chr5 (20-701)||(40708681-40709362)
chr5 (20-703)||(34566395-34567078)
chr5 (20-703)||(27518308-27518991)
chr5 (20-701)||(22332691-22333372)
chr5 (20-703)||(16356403-16357086)
chr5 (20-701)||(41770743-41771424)
chr5 (20-701)||(14999543-15000224)
chr5 (20-701)||(27610255-27610936)
chr5 (20-701)||(27685204-27685885)
chr5 (22-701)||(37291300-37291979)
chr5 (20-680)||(29475898-29476558)
chr5 (20-701)||(22134569-22135250)
chr5 (20-701)||(22348326-22349005)
chr5 (20-698)||(23573643-23574321)
chr5 (20-701)||(18775678-18776352)
chr5 (21-680)||(23516443-23517102)
chr5 (20-673)||(20798661-20799314)
chr5 (20-660)||(23440126-23440766)
chr5 (20-689)||(25423090-25423759)
chr5 (62-692)||(21497850-21498479)
chr5 (20-692)||(20467909-20468581)
chr5 (20-562)||(21984248-21984790)
chr5 (20-692)||(23471130-23471802)
chr5 (20-692)||(26738540-26739190)
chr5 (195-692)||(21339099-21339596)
chr5 (20-689)||(24749370-24750039)
chr5 (20-692)||(22235733-22236405)
chr5 (20-692)||(21563786-21564451)
chr5 (20-692)||(21890572-21891244)
chr5 (20-692)||(22381082-22381754)
chr5 (20-692)||(23079902-23080574)
chr5 (20-689)||(22502562-22503231)
chr5 (20-689)||(14886807-14887476)
chr5 (20-656)||(22461835-22462471)
chr5 (20-689)||(25847958-25848627)
chr5 (20-665)||(37545336-37545982)
chr5 (20-689)||(20342165-20342834)
chr5 (55-692)||(28923581-28924218)
chr5 (55-692)||(20821371-20822008)
chr5 (20-689)||(24798213-24798882)
chr5 (55-692)||(28894755-28895392)
chr5 (116-691)||(17269148-17269722)
chr5 (55-680)||(20773678-20774302)
chr5 (20-582)||(21404737-21405285)
chr5 (250-692)||(21831574-21831998)
chr5 (20-434)||(24735682-24736096)
chr5 (20-326)||(23442472-23442778)
chr5 (454-689)||(24716342-24716577)
chr5 (20-278)||(24737012-24737270)
chr5 (20-224)||(20573422-20573626)
chr5 (460-689)||(24620111-24620340)
chr5 (383-614)||(919-1150)
chr5 (20-197)||(21343666-21343843)
chr5 (412-692)||(28916226-28916506)
chr5 (460-692)||(21496481-21496713)
chr5 (145-680)||(21937013-21937548)
chr5 (578-692)||(21407597-21407711)
chr5 (145-680)||(24581219-24581753)
chr5 (145-680)||(27011092-27011627)
chr5 (145-467)||(11210732-11211054)
chr5 (20-248)||(21662297-21662524)
chr5 (20-248)||(21665758-21665985)
chr5 (532-680)||(25244175-25244323)
chr5 (532-680)||(25308327-25308475)
chr5 (220-435)||(23503526-23503741)
chr5 (532-593)||(16065604-16065665)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (20-703)||(16998600-16999283)
chr2 (20-703)||(16981752-16982435)
chr2 (20-703)||(17063317-17064000)
chr2 (20-703)||(9609736-9610419)
chr2 (20-703)||(10868450-10869133)
chr2 (20-703)||(27217616-27218299)
chr2 (20-701)||(44385731-44386412)
chr2 (20-701)||(22325018-22325699)
chr2 (20-701)||(24709633-24710314)
chr2 (20-703)||(17066978-17067658)
chr2 (20-701)||(24261970-24262651)
chr2 (20-701)||(27370869-27371550)
chr2 (20-703)||(21145201-21145873)
chr2 (20-692)||(23188608-23189279)
chr2 (20-698)||(24675089-24675767)
chr2 (20-698)||(24707647-24708325)
chr2 (20-698)||(21325431-21326109)
chr2 (20-538)||(16924860-16925378)
chr2 (20-698)||(22756630-22757306)
chr2 (20-539)||(24878319-24878838)
chr2 (20-689)||(23063677-23064346)
chr2 (315-701)||(41608547-41608933)
chr2 (78-673)||(24825472-24826067)
chr2 (20-692)||(30211088-30211760)
chr2 (24-692)||(45529121-45529783)
chr2 (20-692)||(27365250-27365922)
chr2 (20-692)||(23293558-23294230)
chr2 (20-692)||(23276376-23277048)
chr2 (20-680)||(11358057-11358717)
chr2 (20-581)||(23087050-23087611)
chr2 (20-689)||(31830258-31830927)
chr2 (20-689)||(20832585-20833254)
chr2 (20-691)||(27787341-27788012)
chr2 (116-691)||(12574049-12574624)
chr2 (20-689)||(1063351-1064020)
chr2 (20-293)||(23138637-23138910)
chr2 (20-293)||(23550427-23550700)
chr2 (20-233)||(27377101-27377314)
chr2 (541-703)||(16923010-16923172)
chr2 (539-703)||(16925479-16925643)
chr2 (546-701)||(20442675-20442830)
chr2 (534-701)||(24876911-24877078)
chr2 (355-692)||(19652223-19652557)
chr2 (20-160)||(41609047-41609187)
chr2 (388-689)||(20828227-20828528)
chr2 (399-692)||(24948568-24948861)
chr2 (159-680)||(22276018-22276538)
chr2 (511-689)||(21125331-21125509)
chr2 (21-260)||(24653946-24654185)
chr2 (604-692)||(23107901-23107989)
chr2 (197-625)||(23817291-23817719)
chr2 (577-692)||(23110892-23111007)
chr2 (538-692)||(24641860-24642014)
chr2 (20-189)||(24944967-24945136)
chr2 (145-467)||(12640315-12640637)
chr2 (145-680)||(24831370-24831905)
chr2 (247-680)||(25128474-25128907)
chr2 (193-680)||(22761752-22762239)
chr2 (158-680)||(24569851-24570373)
chr2 (247-301)||(27368394-27368448)
chr2 (20-81)||(24833355-24833416)
chr2 (391-467)||(23890753-23890829)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (20-701)||(16350293-16350974)
chr1 (20-701)||(51333187-51333868)
chr1 (20-701)||(19106351-19107032)
chr1 (20-701)||(33390723-33391404)
chr1 (20-701)||(21830287-21830968)
chr1 (20-662)||(41354202-41354844)
chr1 (20-701)||(21836934-21837615)
chr1 (20-701)||(17044709-17045390)
chr1 (20-701)||(16078350-16079008)
chr1 (20-680)||(50619959-50620619)
chr1 (20-692)||(16369281-16369953)
chr1 (20-564)||(20249834-20250378)
chr1 (20-574)||(20136762-20137316)
chr1 (20-692)||(19760569-19761241)
chr1 (20-437)||(21747519-21747935)
chr1 (20-689)||(19854298-19854966)
chr1 (20-688)||(20939770-20940438)
chr1 (20-680)||(20856476-20857136)
chr1 (20-689)||(37677063-37677733)
chr1 (55-692)||(20835591-20836231)
chr1 (20-694)||(22432817-22433491)
chr1 (443-692)||(21749348-21749597)
chr1 (20-689)||(20294396-20295065)
chr1 (118-622)||(41307907-41308411)
chr1 (472-692)||(22361947-22362167)
chr1 (20-326)||(19664945-19665251)
chr1 (421-692)||(24099306-24099577)
chr1 (20-209)||(50612602-50612791)
chr1 (20-440)||(31550136-31550556)
chr1 (388-692)||(19662844-19663143)
chr1 (445-689)||(31539703-31539947)
chr1 (567-692)||(20139361-20139486)
chr1 (20-273)||(20244184-20244437)
chr1 (145-680)||(20831107-20831642)
chr1 (20-134)||(21163264-21163378)
chr1 (116-284)||(11382674-11382842)
chr1 (20-284)||(20075170-20075434)
chr1 (610-680)||(20250376-20250446)
chr1 (145-680)||(20914319-20914854)
chr1 (197-433)||(22135520-22135756)
chr1 (20-194)||(20395194-20395368)
chr1 (158-311)||(21202371-21202524)
chr1 (531-680)||(22135272-22135421)
chr1 (655-700)||(41353357-41353402)
chr1 (145-319)||(46518830-46519004)
chr1 (538-647)||(20184683-20184792)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (20-703)||(8386381-8387064)
chr4 (20-701)||(18297174-18297855)
chr4 (20-699)||(19778157-19778836)
chr4 (20-703)||(29038764-29039447)
chr4 (20-703)||(12476569-12477252)
chr4 (20-701)||(27711305-27711986)
chr4 (20-701)||(14303340-14304020)
chr4 (20-701)||(23955716-23956397)
chr4 (20-701)||(40473009-40473690)
chr4 (20-703)||(12523645-12524328)
chr4 (20-701)||(8052985-8053666)
chr4 (20-703)||(14680536-14681219)
chr4 (20-698)||(16251810-16252488)
chr4 (20-594)||(14266368-14266942)
chr4 (20-701)||(18226808-18227489)
chr4 (20-692)||(16354816-16355488)
chr4 (20-695)||(7090402-7091076)
chr4 (20-692)||(14850737-14851409)
chr4 (190-695)||(1639793-1640298)
chr4 (324-698)||(15147249-15147623)
chr4 (20-514)||(14159461-14159955)
chr4 (20-497)||(14652277-14652754)
chr4 (20-692)||(15002995-15003667)
chr4 (211-692)||(8706078-8706559)
chr4 (20-692)||(1648908-1649580)
chr4 (191-692)||(15414657-15415158)
chr4 (20-692)||(15245893-15246565)
chr4 (20-689)||(3264428-3265097)
chr4 (20-689)||(11206865-11207534)
chr4 (20-329)||(15149740-15150049)
chr4 (20-245)||(15364355-15364580)
chr4 (20-689)||(29453171-29453840)
chr4 (20-692)||(33222887-33223564)
chr4 (118-692)||(15358721-15359295)
chr4 (127-692)||(27900462-27901027)
chr4 (20-692)||(20890952-20891623)
chr4 (241-692)||(15077825-15078276)
chr4 (20-689)||(44661500-44662169)
chr4 (20-596)||(16145881-16146459)
chr4 (20-500)||(15070382-15070862)
chr4 (502-692)||(14691353-14691543)
chr4 (186-349)||(16676417-16676580)
chr4 (20-506)||(51605998-51606484)
chr4 (551-692)||(14159970-14160111)
chr4 (220-638)||(13247814-13248232)
chr4 (541-692)||(15319641-15319792)
chr4 (145-680)||(14997410-14997945)
chr4 (145-680)||(9290929-9291464)
chr4 (20-171)||(14927151-14927302)
chr4 (145-467)||(15293013-15293335)
chr4 (145-467)||(55375214-55375536)
chr4 (127-284)||(16752669-16752826)
chr4 (158-435)||(12132298-12132574)
chr4 (20-251)||(42702872-42703103)
chr4 (218-638)||(12342548-12342968)
chr4 (38-180)||(18164332-18164474)
chr4 (20-70)||(18607823-18607873)
chr4 (145-301)||(16445234-16445390)
chr4 (549-689)||(18549694-18549834)
chr4 (20-88)||(15415214-15415282)
chr4 (355-467)||(16685557-16685669)
chr4 (553-592)||(15423974-15424013)
chr4 (319-434)||(18549949-18550064)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (20-701)||(19112725-19113406)
chr8 (20-699)||(17674090-17674769)
chr8 (20-662)||(19484974-19485616)
chr8 (20-651)||(20017865-20018496)
chr8 (20-701)||(22120239-22120920)
chr8 (20-701)||(30313209-30313890)
chr8 (20-682)||(15533415-15534077)
chr8 (20-701)||(32600179-32600860)
chr8 (20-680)||(22133127-22133787)
chr8 (20-701)||(22046408-22047089)
chr8 (23-680)||(16408131-16408788)
chr8 (20-680)||(22164278-22164937)
chr8 (20-701)||(19978002-19978683)
chr8 (28-698)||(21166606-21167275)
chr8 (20-692)||(23650076-23650748)
chr8 (20-692)||(21921809-21922481)
chr8 (20-692)||(21250977-21251648)
chr8 (20-692)||(21788433-21789104)
chr8 (20-692)||(21393939-21394611)
chr8 (261-701)||(18856853-18857293)
chr8 (20-692)||(22987236-22987903)
chr8 (288-701)||(22040162-22040575)
chr8 (140-692)||(22377528-22378079)
chr8 (140-692)||(22383703-22384254)
chr8 (23-692)||(20396199-20396868)
chr8 (20-680)||(20388134-20388794)
chr8 (223-690)||(23949158-23949624)
chr8 (22-680)||(19851448-19852106)
chr8 (22-680)||(19857484-19858142)
chr8 (20-692)||(1266274-1266945)
chr8 (20-692)||(23654962-23655634)
chr8 (20-692)||(31416548-31417220)
chr8 (20-692)||(22061507-22062179)
chr8 (20-692)||(29303500-29304172)
chr8 (20-689)||(14565177-14565846)
chr8 (20-692)||(20009974-20010646)
chr8 (20-689)||(6679146-6679815)
chr8 (20-692)||(21840452-21841124)
chr8 (20-689)||(803750-804419)
chr8 (20-691)||(31570917-31571588)
chr8 (20-689)||(6603693-6604362)
chr8 (20-689)||(12304793-12305462)
chr8 (130-691)||(22051008-22051569)
chr8 (20-292)||(22032067-22032339)
chr8 (355-692)||(20975725-20976062)
chr8 (19-380)||(21681856-21682217)
chr8 (352-689)||(16271301-16271638)
chr8 (20-397)||(20007885-20008262)
chr8 (20-371)||(21324804-21325156)
chr8 (20-258)||(23948924-23949162)
chr8 (20-224)||(15441216-15441420)
chr8 (472-689)||(27355035-27355252)
chr8 (460-692)||(22371415-22371647)
chr8 (145-680)||(16877181-16877716)
chr8 (158-680)||(22315364-22315886)
chr8 (145-680)||(21196588-21197123)
chr8 (20-257)||(16265127-16265364)
chr8 (574-701)||(22129005-22129132)
chr8 (145-680)||(21850423-21850958)
chr8 (145-464)||(20652635-20652954)
chr8 (145-680)||(22982596-22983128)
chr8 (20-260)||(28982392-28982632)
chr8 (20-260)||(28987612-28987852)
chr8 (349-680)||(23157098-23157428)
chr8 (20-195)||(27347261-27347436)
chr8 (655-700)||(19484130-19484175)
chr8 (531-680)||(23900822-23900971)
chr8 (568-694)||(19863639-19863765)
chr8 (568-694)||(19868276-19868402)
chr8 (151-434)||(19863223-19863506)
chr8 (151-434)||(19867860-19868143)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (20-701)||(414-1095)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (20-703)||(43154-43837)
scaffold0028 (20-701)||(8485-9155)
scaffold0028 (314-701)||(15241-15617)
scaffold0028 (55-692)||(50148-50785)
scaffold0028 (186-317)||(13832-13963)
scaffold0028 (145-673)||(106226-106754)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (20-701)||(620-1301)
scaffold0044 (20-701)||(14360-15041)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (20-701)||(6937-7620)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (20-701)||(65405-66086)
scaffold0042 (239-680)||(39466-39906)
scaffold0042 (20-189)||(39926-40095)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (20-701)||(7377-8047)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (20-701)||(33198-33879)
scaffold0109 (20-701)||(8596-9277)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (20-701)||(4030-4711)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (20-698)||(278458-279136)
scaffold0005 (20-342)||(308659-308981)
scaffold0005 (20-497)||(164538-165015)
scaffold0005 (20-691)||(260308-260979)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (20-692)||(6372-7044)
scaffold0403 (382-687)||(3153-3458)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (142-701)||(7519-8078)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (84-701)||(7854-8471)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (20-698)||(63659-64337)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (20-692)||(6023-6695)
scaffold0120 (20-692)||(1158-1830)
scaffold0120 (145-406)||(22819-23080)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (20-697)||(6014-6691)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (85-701)||(21932-22548)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (20-694)||(676-1350)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (20-698)||(451-1128)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (20-692)||(14039-14711)
scaffold0106 (238-701)||(17660-18122)
scaffold0106 (20-692)||(31410-32082)
scaffold0106 (624-692)||(18489-18557)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (20-692)||(328-999)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (28-692)||(5229-5893)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (20-692)||(229043-229715)
scaffold0012 (20-692)||(219051-219723)
scaffold0012 (145-656)||(32667-33176)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (20-692)||(9343-10015)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (33-692)||(49506-50165)
scaffold0081 (539-698)||(19121-19280)
scaffold0081 (598-698)||(34604-34704)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (20-698)||(180217-180877)
scaffold0020 (414-692)||(101186-101464)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (20-692)||(14713-15385)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (20-692)||(32387-33058)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (271-701)||(12738-13168)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (20-692)||(14877-15549)
scaffold0040 (460-692)||(113121-113353)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (20-692)||(26167-26839)
scaffold0011 (20-692)||(195338-196008)
scaffold0011 (20-688)||(148570-149238)
scaffold0011 (20-189)||(68577-68746)
scaffold0011 (145-435)||(121841-122131)
scaffold0011 (247-467)||(180151-180371)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (20-692)||(112021-112693)
scaffold0004 (20-692)||(203102-203774)
scaffold0004 (20-692)||(117568-118240)
scaffold0004 (20-692)||(322704-323376)
scaffold0004 (20-692)||(385819-386491)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (20-692)||(25353-26025)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (20-680)||(1005-1659)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (20-688)||(4032-4699)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (20-692)||(908-1580)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (20-692)||(3140-3812)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (20-692)||(116539-117211)
scaffold0037 (145-617)||(98140-98612)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (20-614)||(126911-127505)
scaffold0022 (501-692)||(80128-80319)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (20-569)||(1139-1688)
scaffold0894 (560-692)||(2914-3046)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (97-692)||(9047-9642)
scaffold0507 (145-308)||(351-514)
scaffold0507 (349-464)||(216-331)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (197-692)||(15832-16327)
scaffold0333 (20-357)||(15493-15829)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (20-692)||(16050-16722)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (20-695)||(24702-25377)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (121-478)||(628-985)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (21-670)||(12633-13282)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (307-680)||(6336-6709)
scaffold0358 (20-80)||(6273-6333)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (20-692)||(5225-5896)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (219-695)||(4085-4561)
scaffold0023 (404-692)||(130532-130820)
scaffold0023 (238-692)||(58972-59426)
scaffold0023 (542-698)||(29008-29163)
scaffold0023 (404-506)||(134626-134728)
scaffold0023 (34-184)||(4567-4717)
scaffold0023 (20-98)||(36974-37052)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (334-692)||(10-368)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (20-641)||(10425-11045)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (20-692)||(3875-4547)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (20-493)||(2-475)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (20-692)||(33311-33983)
scaffold0076 (145-680)||(40383-40918)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (20-692)||(90566-91238)
scaffold0001 (21-476)||(448060-448515)
scaffold0001 (460-692)||(390834-391066)
scaffold0001 (20-283)||(162113-162376)
scaffold0001 (382-635)||(114542-114795)
scaffold0001 (118-188)||(175361-175431)
scaffold0001 (607-692)||(89888-89973)
scaffold0001 (145-289)||(78666-78810)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (20-689)||(41970-42639)
scaffold0010 (20-692)||(47033-47705)
scaffold0010 (439-688)||(2340-2589)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (20-692)||(19983-20655)
scaffold0298 (20-692)||(12995-13667)
scaffold0298 (20-692)||(16765-17437)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (20-662)||(27519-28161)
scaffold0139 (20-688)||(787-1454)
scaffold0139 (538-662)||(34290-34414)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (343-692)||(7963-8311)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (307-692)||(1552-1937)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (20-692)||(6670-7342)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (20-692)||(9798-10465)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (20-692)||(47124-47796)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (20-692)||(51497-52169)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (20-692)||(13535-14207)
scaffold0034 (55-692)||(4587-5224)
scaffold0034 (547-692)||(67897-68042)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (20-483)||(16987-17450)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (30-692)||(4760-5422)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (20-692)||(6183-6856)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-692)||(27226-27897)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (20-692)||(39739-40410)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (20-692)||(26142-26814)
scaffold0192 (358-692)||(26862-27196)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (20-692)||(48841-49513)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (20-692)||(248613-249285)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (20-692)||(28402-29075)
scaffold0064 (20-692)||(40393-41066)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (400-698)||(197106-197404)
scaffold0017 (349-467)||(21927-22045)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (323-572)||(46531-46780)
scaffold0007 (20-682)||(86154-86810)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (20-692)||(18171-18843)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (20-692)||(60848-61519)
scaffold0067 (20-692)||(67236-67907)
scaffold0067 (20-692)||(51814-52485)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (20-627)||(9782-10389)
scaffold0483 (586-692)||(12060-12166)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (21-692)||(42784-43455)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (20-692)||(21305-21977)
scaffold0235 (220-467)||(26006-26253)
scaffold0235 (502-638)||(26288-26424)
scaffold0235 (619-692)||(11091-11164)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (20-692)||(19120-19792)
scaffold0058 (64-284)||(58448-58668)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (20-692)||(528-1200)
scaffold0104 (625-692)||(12582-12649)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (20-679)||(37202-37861)
scaffold0026 (118-396)||(38103-38382)
scaffold0026 (118-278)||(27385-27545)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (20-692)||(98-770)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (20-692)||(2751-3423)
scaffold0035 (568-689)||(12833-12954)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (20-689)||(16350-17019)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (55-416)||(16375-16736)
scaffold0138 (619-692)||(8721-8794)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (20-692)||(48668-49339)
scaffold0053 (20-632)||(57511-58122)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (460-698)||(4727-4965)
scaffold0761 (145-680)||(32-567)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (55-680)||(18884-19509)
scaffold0090 (118-680)||(23109-23671)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (20-692)||(6872-7542)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (20-692)||(38-705)
scaffold0124 (20-692)||(10888-11560)
scaffold0124 (145-680)||(7456-7991)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (134-692)||(1908-2466)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (20-692)||(43505-44177)
scaffold0114 (20-692)||(44517-45189)
scaffold0114 (20-635)||(20122-20737)
scaffold0114 (20-185)||(36055-36220)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (20-692)||(26261-26933)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (454-698)||(3442-3686)
scaffold0375 (235-351)||(3694-3810)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (454-692)||(19636-19874)
scaffold0324 (20-205)||(16957-17142)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (151-692)||(1-541)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (116-692)||(10865-11441)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (20-680)||(25511-26171)
scaffold0113 (20-284)||(16676-16940)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (350-616)||(1-267)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (412-692)||(18839-19119)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (20-691)||(12420-13087)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (116-692)||(5309-5885)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (20-583)||(13994-14557)
scaffold0203 (20-164)||(9039-9183)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (20-484)||(5756-6219)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (20-380)||(206-566)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (510-692)||(25464-25646)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (238-689)||(2992-3443)
scaffold0222 (20-107)||(3487-3574)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (235-692)||(5086-5543)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (20-284)||(27967-28231)
scaffold0198 (619-698)||(24097-24176)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (20-278)||(30-288)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (175-680)||(880-1385)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (463-692)||(11302-11531)
scaffold0149 (472-692)||(6871-7091)
scaffold0149 (20-199)||(13380-13559)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (454-692)||(2509-2747)
[»] scaffold0682 (2 HSPs)
scaffold0682 (20-301)||(191-472)
scaffold0682 (607-692)||(470-555)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (541-692)||(1988-2139)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (217-654)||(86-523)
scaffold1710 (145-290)||(946-1091)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (356-692)||(5969-6307)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (414-679)||(4945-5210)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (454-692)||(41353-41589)
scaffold0126 (20-107)||(45845-45932)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (20-317)||(3891-4188)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (20-404)||(4924-5308)
scaffold0249 (411-680)||(1618-1887)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (20-284)||(1211-1475)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (145-680)||(46279-46814)
scaffold0066 (490-692)||(68225-68427)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (538-691)||(844-997)
scaffold0574 (20-248)||(4217-4445)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (20-452)||(38761-39193)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (20-284)||(14086-14349)
scaffold0266 (490-680)||(9507-9697)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (145-680)||(23519-24054)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (474-692)||(4884-5102)
scaffold0165 (20-228)||(1177-1385)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (349-680)||(7497-7828)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (574-692)||(4425-4543)
scaffold0270 (574-692)||(11555-11673)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (145-680)||(14383-14918)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (145-680)||(3284-3818)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (538-653)||(17877-17992)
scaffold0244 (220-524)||(25959-26263)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (145-680)||(13033-13568)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (454-692)||(32953-33191)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (158-467)||(913-1222)
scaffold0808 (553-680)||(700-827)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (607-692)||(39645-39730)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (145-680)||(3521-4056)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (247-466)||(71446-71665)
scaffold0021 (565-680)||(33059-33174)
scaffold0021 (166-301)||(13397-13532)
scaffold0021 (586-680)||(24529-24623)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (20-179)||(136119-136278)
scaffold0019 (388-500)||(136278-136390)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (20-169)||(2023-2172)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (158-435)||(14661-14938)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (145-680)||(24005-24540)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (220-435)||(1315-1530)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (145-680)||(27912-28447)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (565-688)||(81470-81593)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (193-680)||(3590-4077)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (158-467)||(9125-9434)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (145-680)||(14782-15316)
scaffold0132 (220-680)||(43738-44198)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (531-673)||(11167-11309)
scaffold0305 (349-435)||(10985-11071)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (218-469)||(8748-8999)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (538-680)||(5693-5835)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (510-680)||(18541-18711)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (158-290)||(5879-6011)
scaffold0447 (158-290)||(10493-10625)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (361-680)||(14478-14798)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (158-290)||(8488-8620)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (501-680)||(3565-3744)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (361-465)||(2897-3001)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (388-467)||(17-96)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (619-692)||(2187-2260)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 27187269 - 27187952
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27187269 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27187368  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187369 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27187468  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27187469 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27187568  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  27187569 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 27187668  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187669 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27187768  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27187769 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27187868  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27187869 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27187952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 27261971 - 27261288
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27261971 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27261872  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261871 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27261772  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27261771 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27261672  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  27261671 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 27261572  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261571 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27261472  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27261471 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27261372  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27261371 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27261288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 28292820 - 28292137
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28292820 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 28292721  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292720 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28292621  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28292620 ttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28292521  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  28292520 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28292421  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28292420 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28292321  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28292320 tcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 28292221  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  28292220 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 28292137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 28263645 - 28262962
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28263645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28263546  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263545 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28263446  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28263445 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28263346  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  28263345 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28263246  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28263245 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28263146  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28263145 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 28263046  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28263045 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28262962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 28342394 - 28341711
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28342394 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28342295  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342294 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28342195  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28342194 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28342095  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  28342094 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28341995  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28341994 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28341895  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28341894 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 28341795  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28341794 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 24313616 - 24312935
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24313616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24313517  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24313516 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24313417  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313416 tggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24313317  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  24313316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 24313217  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24313216 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 24313117  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24313116 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 24313017  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24313016 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24312935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 29592368 - 29591687
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29592368 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29592269  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29592268 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29592169  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592168 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29592069  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  29592068 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 29591969  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29591968 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaa 29591869  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29591868 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 29591769  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29591768 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgat 29591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 1543532 - 1542849
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1543532 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 1543433  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543432 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 1543333  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1543332 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 1543233  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  1543232 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 1543133  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543132 tccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 1543033  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1543032 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1542933  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  1542932 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 1542849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 2875251 - 2874570
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2875251 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 2875152  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  2875151 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttct 2875052  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2875051 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 2874952  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  2874951 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 2874852  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874851 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 2874752  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2874751 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 2874652  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  2874651 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgat 2874570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 25112385 - 25113066
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  25112385 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 25112484  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25112485 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 25112584  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25112585 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 25112684  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25112685 gctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 25112784  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25112785 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 25112884  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25112885 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactct 25112984  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25112985 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 25113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16627165 - 16626484
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16627165 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16627066  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16627065 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16626966  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626965 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagttt 16626866  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  16626865 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16626766  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626765 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaa 16626666  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16626665 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16626566  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16626565 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 5839667 - 5838986
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  5839667 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 5839568  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  5839567 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttct 5839468  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |    
T  5839467 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtct 5839368  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  5839367 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 5839268  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5839267 tccaatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaa 5839168  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  5839167 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 5839068  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5839067 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgat 5838986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 19864520 - 19865198
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  19864520 catacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatat 19864619  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19864620 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttct 19864719  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19864720 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 19864819  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  19864820 gctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccat 19864919  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19864920 tccaataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagcccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 19865019  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19865020 tcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 19865119  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19865120 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctcctt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 25610309 - 25609640
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25610309 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25610210  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25610209 ctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 25610110  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25610109 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25610010  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  25610009 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcataaggtgccat 25609910  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25609909 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 25609810  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25609809 tcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 25609710  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25609709 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27331881 - 27331209
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27331881 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27331782  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27331781 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27331682  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27331681 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27331582  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27331581 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 27331482  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  27331481 tccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaag 27331382  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27331381 tcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttt 27331282  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27331281 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27392621 - 27391949
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27392621 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27392522  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27392521 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27392422  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27392421 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27392322  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27392321 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 27392222  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  27392221 tccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaag 27392122  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27392121 tcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttt 27392022  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27392021 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16928088 - 16927416
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16928088 catactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16927989  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16927988 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16927889  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| | ||||| |    
T  16927888 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtct 16927789  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16927788 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 16927689  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16927688 tccaatactagaatgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaa 16927589  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  16927588 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttt 16927489  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16927488 tccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18408391 - 18407718
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  18408391 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 18408292  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  18408291 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttct 18408192  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  18408191 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagttt 18408092  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18408091 gttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 18407992  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctatta-ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18407991 tccaatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaa 18407892  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18407891 atcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactt 18407792  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18407791 ttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22079136 - 22078478
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  22079136 catacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatat 22079037  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22079036 ctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 22078937  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22078936 tgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggttt 22078837  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22078836 gttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 22078737  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| || || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||    
T  22078736 tccaatactagaa--ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaa 22078639  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22078638 tcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttt 22078539  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078538 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 16963815 - 16963155
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  16963815 catactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcgttccaactatttccgatat 16963716  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16963715 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttct 16963616  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||| |    
T  16963615 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtct 16963516  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16963515 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 16963416  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16963415 tccaatactagaatgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaa 16963316  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  16963315 ttctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttt 16963216  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16963215 tccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22762903 - 22762231
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  22762903 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatat 22762804  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  22762803 ctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttct 22762704  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||    
T  22762703 tgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 22762604  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||    
T  22762603 gttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccat 22762504  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22762503 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaa 22762404  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||||    
T  22762403 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttt 22762304  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22762303 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23078302 - 23078974
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  23078302 catacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatat 23078401  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  23078402 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctct 23078501  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23078502 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 23078601  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23078602 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 23078701  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23078702 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 23078801  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| |||||| ||||| |    
T  23078802 tattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactct 23078901  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078902 tcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 487
Target Start/End: Original strand, 12497859 - 12498326
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497859 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497958  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497959 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12498058  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12498059 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12498158  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12498159 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 12498258  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498259 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12511042 - 12510575
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12511042 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12510943  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510942 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12510843  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12510842 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12510743  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12510742 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 12510643  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510642 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 247 - 696
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434378
Alignment:
Q  247 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagacca 22434028  T
Q  347 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 446  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22434029 ctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttatt 22434128  T
Q  447 ataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 546  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  22434129 gtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctcc 22434228  T
Q  547 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 646  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22434229 gactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggat 22434328  T
Q  647 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434329 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 487
Target Start/End: Original strand, 12505188 - 12505655
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12505188 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12505287  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505288 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12505387  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  12505388 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtat 12505487  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  12505488 gatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacat 12505587  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505588 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25765737 - 25765312
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||    
T  25765737 catacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatat 25765638  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||     
T  25765637 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagcg-tgactctcaaaagcacgtggtctccttct 25765539  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  25765538 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtct 25765439  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25765438 gctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 25765339  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattatt 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25765338 tccaatactagaatgataactattatt 25765312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 25768024 - 25768696
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25768024 catacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25768123  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  25768124 ctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25768223  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || ||||| |||||||    
T  25768224 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagttt 25768323  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  25768324 gatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccat 25768423  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || |  || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||    
T  25768424 accaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagcaaa 25768523  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  25768524 tcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactct 25768623  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25768624 tccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 400 - 680
Target Start/End: Original strand, 17032596 - 17032876
Alignment:
Q  400 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17032596 aaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaa 17032695  T
Q  500 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17032696 gaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacc 17032795  T
Q  600 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032796 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 21471434 - 21472106
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  21471434 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 21471533  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  21471534 ctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttct 21471633  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | ||  || ||||| ||||| |    
T  21471634 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtct 21471733  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||  | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || ||||||||    
T  21471734 gatgaaccaaatccggtcccaacactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccat 21471833  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  ||     
T  21471834 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaag 21471933  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  21471934 tcctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 21472033  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21472034 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 19879131 - 19879803
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  19879131 catacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 19879230  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  19879231 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 19879330  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||    
T  19879331 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaacttaaccttttctgtagttt 19879430  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || ||||| || || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| ||| || ||||| ||||||||    
T  19879431 gttgaactatgtctggccccaacatcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccat 19879530  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |    
T  19879531 accaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaataga 19879630  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19879631 tcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 19879730  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  19879731 tccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 55 - 689
Target Start/End: Original strand, 15459204 - 15459838
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  15459204 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 15459303  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15459304 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggta 15459403  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||   |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  15459404 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 15459503  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |    
T  15459504 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttattgtatgtga 15459603  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  15459604 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 15459703  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15459704 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatct 15459803  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15459804 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 34645999 - 34645362
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || | || ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  34645999 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 34645900  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | || || || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  34645899 tagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 34645800  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| |||||     
T  34645799 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttct 34645700  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  34645699 cccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttataagtaa 34645600  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  34645599 attctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 34645500  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34645499 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatct 34645400  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  34645399 gatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 37 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 11280936 - 11280277
Alignment:
Q  37 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 136  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11280936 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11280837  T
Q  137 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttt 236  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||| |||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  11280836 actttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11280737  T
Q  237 tctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggt 336  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  11280736 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11280637  T
Q  337 cctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgat 436  Q
    || || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  11280636 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggt 11280537  T
Q  437 agctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 536  Q
    | ||||| || ||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||  || || ||    
T  11280536 aactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcat 11280437  T
Q  537 tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagta 636  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11280436 tgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtg 11280337  T
Q  637 aatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 696  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||||||||||    
T  11280336 aacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 66 - 692
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415991
Alignment:
Q  66 aagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaa 165  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  166 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  266 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 365  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || |||||  ||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcttctgactcaaa 17415664  T
Q  366 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaac 465  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||| |||  ||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||| ||    
T  17415665 ccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcgac 17415764  T
Q  466 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcg 565  Q
    || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17415765 ggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcg 17415864  T
Q  566 gatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 665  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  17415865 gatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 17415964  T
Q  666 cgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17415965 cgacggtacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10469297 - 10468625
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  10469297 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgaaat 10469198  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  10469197 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10469098  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  10469097 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10468998  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  10468997 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 10468898  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  |||||||||    
T  10468897 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaa 10468798  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  10468797 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactct 10468698  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  10468697 tccaaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 79 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14381856 - 14381243
Alignment:
Q  79 aaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacac 178  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14381856 aaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacac 14381757  T
Q  179 cagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 278  Q
    | ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14381756 ccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgc 14381657  T
Q  279 cttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgga 378  Q
     ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || | ||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||    
T  14381656 tttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacgacactctctcatgactcaaaccagcataaagga 14381557  T
Q  379 gttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactat 478  Q
    || || || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  14381556 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgt 14381457  T
Q  479 cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccga 578  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14381456 cccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctga 14381357  T
Q  579 actcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacca 678  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  14381356 actcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggtactcca 14381257  T
Q  679 tgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||    
T  14381256 tgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21564580 - 21563908
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21564580 catacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccctctcagatat 21564481  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  21564480 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 21564381  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || |   |||| |    
T  21564380 tgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttttttagtct 21564281  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| | |||||| || || ||  ||||    
T  21564280 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccat 21564181  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || |||||  | || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21564180 accaatactcgaatggtaactattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaa 21564081  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  21564080 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 21563981  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  21563980 tccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796408
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     |||||  ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||    ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtct 22796781  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||  || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| | |||||| |  || ||||||||    
T  22796780 gatgaaccaaatccggtcgcaacactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccat 22796681  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  22796680 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 22796581  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  22796580 tcctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactct 22796481  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  22796480 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27561065 - 27560394
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  27561065 catacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 27560966  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  27560965 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctct 27560866  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  27560865 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtct 27560766  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  27560765 cctgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 27560666  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  27560665 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 27560566  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  27560565 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 27560466  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27560465 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 130 - 627
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1641212
Alignment:
Q  130 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 229  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||  ||||||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  230 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaa 328  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| |    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtctgatgaacta 1640913  T
Q  329 tctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatact 428  Q
    | |||||||| || |  || |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  1640914 tatctggtcccaacattacactttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatact 1641013  T
Q  429 agaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagc 528  Q
     ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  1641014 cgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaac 1641113  T
Q  529 gactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 627  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641114 gactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Original strand, 18794558 - 18795195
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18794558 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18794657  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  18794658 tagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgata 18794757  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| || || || || ||||| || || | ||| |||||     
T  18794758 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaacatcacactttct 18794857  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  18794858 cctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaggtaa 18794957  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || ||||||||||| |||||    
T  18794958 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgattgacc 18795057  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| || || |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18795058 atccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatct 18795157  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  18795158 gacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 24364245 - 24364914
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24364245 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 24364344  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  24364345 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 24364444  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  24364445 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 24364544  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || | ||||||    
T  24364545 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcactcgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccat 24364644  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  24364645 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 24364744  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  24364745 tcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 24364844  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  24364845 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 28283165 - 28282590
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  28283165 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 28283066  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  28283065 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 28282966  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||    
T  28282965 gtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 28282866  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  28282865 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 28282766  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  28282765 caagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 28282666  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28282665 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21833429 - 21833172
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  21833429 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 21833330  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  21833329 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttct 21833230  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 277  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833229 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8766596 - 8766111
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  8766596 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 8766497  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||| | | || |||| |||||| || || || |||    
T  8766496 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 8766397  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  8766396 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 8766297  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || |||||  | || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||| ||||| |||||| || || ||||||||    
T  8766296 catgaaccaaatccggtccccacacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccat 8766197  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 505  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8766196 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacac 8766111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 17032395 - 17032582
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17032395 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 17032494  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacg 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17032495 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18197995 - 18197606
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| | ||    
T  18197995 catacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgatat 18197896  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | || ||||| ||| ||| || || | ||| ||     
T  18197895 cttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctct 18197796  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  || ||||||||||| |    
T  18197795 tgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtct 18197696  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaa 409  Q
    | | ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18197695 gttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaa 18197606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 280 - 692
Target Start/End: Original strand, 19453513 - 19453925
Alignment:
Q  280 ttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggag 379  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||    
T  19453513 ttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggag 19453612  T
Q  380 ttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatc 479  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || |  ||||| ||||| || || ||||||||    
T  19453613 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtatgcgaactctatcaatggtaggtgactatc 19453712  T
Q  480 ccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaa 579  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19453713 ccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 19453812  T
Q  580 ctcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 679  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||    
T  19453813 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccat 19453912  T
Q  680 gtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||    
T  19453913 gtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14131627 - 14131363
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  14131627 catacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 14131528  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||    
T  14131527 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcc 14131428  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14131427 tgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Original strand, 25750642 - 25750900
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25750642 catacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25750741  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  25750742 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25750841  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750842 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 365 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5297308 - 5296982
Alignment:
Q  365 accagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaa 464  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || || || |||||    
T  5297308 accagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaa 5297209  T
Q  465 cggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 564  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5297208 cggtaggtgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctga 5297110  T
Q  565 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 664  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  5297109 ggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatac 5297010  T
Q  665 tcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5297009 tcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11288029 - 11287680
Alignment:
Q  37 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 136  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11288029 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11287930  T
Q  137 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttt 236  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  11287929 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11287830  T
Q  237 tctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggt 336  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  11287829 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11287730  T
Q  337 cctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgca 386  Q
    || || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287729 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 370 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27560086 - 27559765
Alignment:
Q  370 cacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaa 469  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| |    
T  27560086 cacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggta 27559987  T
Q  470 gatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 569  Q
    | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27559986 ggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatg 27559887  T
Q  570 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 669  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  27559886 ataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaa 27559787  T
Q  670 ggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27559786 ggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 476 - 692
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  476 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  576 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 675  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  676 ccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 506
Target Start/End: Original strand, 18800873 - 18801261
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |    
T  18800873 atctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccct 18800972  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    | |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  18800973 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 18801072  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |  |||    
T  18801073 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgaggcc 18801172  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 506  Q
    || |||||||| ||||| || || || || ||| | ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  18801173 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctctagtacaca 18801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 473 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  473 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 572  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  573 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 672  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  673 acaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 293
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  193 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  293 g 293  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 16382696 - 16382161
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16382696 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16382597  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16382596 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16382497  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  16382496 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 16382397  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16382396 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16382297  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16382296 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16382197  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382196 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 586 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836964
Alignment:
Q  586 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 685  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  686 tcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgat 21836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  539 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  639 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 601 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  601 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 586 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  586 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 685  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  686 tcacaat 692  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 16098008 - 16098543
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16098008 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 16098107  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16098108 tatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16098207  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  16098208 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatactagaatgaaaattgttg 16098307  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | ||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16098308 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16098407  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
        ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16098408 ttttctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16098507  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098508 atcccgatctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 23996206 - 23996741
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  23996206 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 23996305  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  23996306 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 23996405  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  23996406 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 23996505  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      || |||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  23996506 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 23996605  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |    
T  23996606 ccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcag 23996705  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996706 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 25743410 - 25742876
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || |  | ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  25743410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 25743311  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta-aga 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||| | |    
T  25743310 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctacaaa 25743211  T
Q  344 ccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatt 443  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25743210 gcact--ttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaactgtt 25743113  T
Q  444 attataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctc 543  Q
     || ||||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    ||  || ||||||    
T  25743112 gttgtaagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctagatagtcctc 25743013  T
Q  544 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 643  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||      
T  25743012 tccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaaacctca 25742913  T
Q  644 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742912 gatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15078687 - 15078365
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | | ||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| |||||   ||    
T  15078687 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctcttct 15078588  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  15078587 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 15078488  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  15078487 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 15078388  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15078387 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15078365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 22433830 - 22433924
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttcc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22433830 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcc 22433924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 265
Target Start/End: Original strand, 25750908 - 25751024
Alignment:
Q  149 acttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 248  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25750908 acttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtc 25751007  T
Q  249 atgataactcttttgtc 265  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  25751008 atggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 18838231 - 18837696
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||||| |||| |||| | || | ||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  18838231 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 18838132  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  18838131 tatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtgctaacat 18838032  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | || ||     
T  18838031 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaactgttg 18837932  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  18837931 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 18837832  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  18837831 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcgg 18837732  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837731 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21412939
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||| | |||| ||| ||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    |||  ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||  || ||||   | |||||||| |   | ||||| ||     
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtcctaacaatgcgctttctccg 21413049  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||    
T  21413048 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaactgttattgtaagtaaact 21412949  T
Q  458 cgatcaacgg 467  Q
    | ||||||||    
T  21412948 caatcaacgg 21412939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648786
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccg 1648895  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 1648795  T
Q  458 cgatcaacg 466  Q
    | |||||||    
T  1648794 caatcaacg 1648786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 680
Target Start/End: Original strand, 18571684 - 18572144
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  18571684 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagttt 18571783  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || | ||  ||||||| ||| |   | |||||||||||||||||||| |||||| | || || || |||| ||||| |||||||||||| || | |||    
T  18571784 cttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcat 18571883  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| || ||| | | ||     |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  18571884 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 18571983  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |     || || ||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  18571984 tcctccaaactttggatagtcctctccgttttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaactct 18572083  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  18572084 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactataaggaataccatg 18572144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 630 - 696
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  630 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 465
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655760
Alignment:
Q  160 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 259  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| | |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  260 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctga 359  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  |||| |||||| |   | |||||| ||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttttttcttagtctcttgcacaacttctgatcctaacaaagcactttca-ctga 25655654  T
Q  360 ctcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcg 459  Q
    ||||||||| |||||||   | || || |||||||||| |||| |||||||||||  |||| | |||||||||||| | || || || ||||| |||||     
T  25655655 ctcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatttcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcc 25655754  T
Q  460 atcaac 465  Q
    ||||||    
T  25655755 atcaac 25655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Original strand, 16233242 - 16233457
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || ||||| |    
T  16233242 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || ||||  ||  ||||||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16233342 cttgcacaacttccagtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 16233441  T
Q  420 tccaatactagaatga 435  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  16233442 tccgatactagcatga 16233457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 18787721 - 18787809
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaact 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |  || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18787721 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactgttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 577 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  577 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 662  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 98
Target Start/End: Original strand, 1640634 - 1640710
Alignment:
Q  22 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| |||||    
T  1640634 tacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 467
Target Start/End: Original strand, 1652274 - 1652353
Alignment:
Q  388 ctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1652274 ctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 1652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 559 - 680
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  559 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 658  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  659 caatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 490 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  490 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 589  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  590 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 110117 - 109434
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  110117 catacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 110018  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  110017 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 109918  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109917 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 109818  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  109817 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgt 109718  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  109717 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 109618  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  109617 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttt 109518  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  109517 tccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 112559 - 113231
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  112559 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 112658  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  112659 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 112758  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   ||||  |  || || |  |||||||    
T  112759 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagttt 112858  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  112859 gttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccat 112958  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| |    
T  112959 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacaga 113058  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  113059 tcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 113158  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  113159 tccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 96273 - 95636
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  96273 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 96174  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  96173 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 96074  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| |  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || |||||     
T  96073 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaacacaacactttct 95974  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||  ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || |    
T  95973 cccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 95874  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||    
T  95873 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccgactgacc 95774  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  95773 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatct 95674  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  95673 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 18177700 - 18178383
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18177700 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18177799  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18177800 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcc 18177899  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18177900 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagttt 18177999  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18178000 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 18178099  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18178100 tccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaga 18178199  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18178200 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18178299  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18178300 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgt 18178383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 8198586 - 8199269
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8198586 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8198685  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8198686 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8198785  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198786 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8198885  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  8198886 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 8198985  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198986 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8199085  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8199086 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8199185  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  8199186 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 8199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 10870953 - 10871636
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10870953 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10871052  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871053 ctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10871152  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871153 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10871252  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  10871253 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10871352  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871353 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 10871452  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10871453 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 10871552  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10871553 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10871636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 11237525 - 11236844
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11237525 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 11237426  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11237425 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 11237326  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11237325 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 11237226  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  11237225 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 11237126  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237125 tccaatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 11237026  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11237025 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 11236926  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  11236925 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 11236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15161369 - 15160688
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15161369 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15161270  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15161269 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15161170  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161169 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15161070  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15161069 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15160970  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15160870  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15160869 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15160770  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15160769 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 44791663 - 44790980
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44791663 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44791564  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  44791563 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 44791464  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791463 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44791364  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  44791363 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 44791264  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791263 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 44791164  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44791163 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 44791064  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  44791063 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 44790980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 8707563 - 8708244
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8707563 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8707662  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8707663 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8707762  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707763 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8707862  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  8707863 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 8707962  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707963 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8708062  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8708063 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8708162  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8708163 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8708244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 18552070 - 18551389
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18552070 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18551971  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18551970 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18551871  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551870 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18551771  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  18551770 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 18551671  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551670 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 18551571  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18551570 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18551471  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18551470 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18551389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 14332355 - 14333036
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  14332355 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 14332454  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14332554  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332555 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14332654  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  14332655 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 14332754  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14332755 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 14332854  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14332855 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 14332954  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14332955 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14333036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 13686021 - 13686703
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaa-cattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13686021 catactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 13686120  T
Q  119 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 218  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686121 tttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 13686220  T
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686221 ttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 13686320  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13686321 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcca 13686420  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686421 ttccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 13686520  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13686521 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 13686620  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13686621 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13686703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 11553414 - 11552731
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  11553414 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccgatat 11553315  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553314 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 11553215  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11553214 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 11553115  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11553114 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 11553015  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11553014 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaa 11552915  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11552914 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 11552815  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  11552814 tccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 11552731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 12687459 - 12688142
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  12687459 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 12687558  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12687559 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcc 12687658  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12687659 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12687759 gttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12687858  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12687859 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 12687958  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12687959 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12688058  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  12688059 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 12688142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 16947
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17628 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17529  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17528 ctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17429  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  17428 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17329  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17328 gctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 17229  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17228 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 17129  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  17128 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactct 17029  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17028 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgat 16947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 14954578 - 14955261
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  14954578 catacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 14954677  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954678 cttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14954777  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14954778 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14954877  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  14954878 gctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcat 14954977  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14954978 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaa 14955077  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14955078 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttt 14955177  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||| ||||    
T  14955178 tgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgt 14955261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 23517080 - 23516520
Alignment:
Q  21 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517080 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatc 23516981  T
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516980 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 23516881  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516880 gaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttg 23516781  T
Q  321 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccatt 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  23516780 ctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccatt 23516681  T
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23516680 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaat 23516581  T
Q  521 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 581  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23516580 gctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgatacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 15154964 - 15154294
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  15154964 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 15154865  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15154864 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 15154765  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15154764 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 15154665  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15154664 gttgaacaatctc-----ctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggtgccat 15154570  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  15154569 cccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 15154470  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||    
T  15154469 tcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttt 15154370  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 695  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154369 tccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 241 - 701
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596696
Alignment:
Q  241 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtccta 9596335  T
Q  341 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  9596336 agaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgact 9596435  T
Q  441 attattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 540  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596436 attattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 9596535  T
Q  541 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596536 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 9596635  T
Q  641 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9596636 ttggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgat 9596696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Original strand, 15624545 - 15625182
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||     
T  15624545 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatttcc 15624644  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  15624645 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgata 15624744  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||    
T  15624745 actcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattacactctca 15624844  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||  || || || |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  15624845 cctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactgttattgtacgtga 15624944  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15624945 actctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgacc 15625044  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15625045 atctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatct 15625144  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15625145 gacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12207090 - 12206418
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||  | ||    
T  12207090 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttgcaactctctcagatat 12206991  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  12206990 ctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 12206891  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| |||| || |||||     
T  12206890 tgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttt-tctgtagtc 12206792  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |||||||| || || ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| ||| |||| | || || |||||||    
T  12206791 tgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgcca 12206692  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||    
T  12206691 taccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaa 12206592  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12206591 atcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaactt 12206492  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12206491 ttccaaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 572
Target Start/End: Original strand, 15203837 - 15204389
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||   |||    
T  15203837 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaat 15203936  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15203937 ctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttct 15204036  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  15204037 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagttt 15204136  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||  |||||||| || || || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||| ||  || ||||| ||| ||||    
T  15204137 gctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccatacagcgcttcaaatggttccat 15204236  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15204237 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 15204336  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 572  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204337 tcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15102891 - 15102221
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15102891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 15102792  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||     
T  15102791 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15102692  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15102691 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15102592  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||  |  || ||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  15102591 gatgaatcaaatccggtcccaacaacactctctc--ctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15102494  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15102493 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 15102394  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15102393 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 15102294  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| || | ||||||||||||||||||    
T  15102293 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 211 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11771881
Alignment:
Q  211 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  | ||||| ||||||| ||| ||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  311 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaa 410  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |  |||  |||||||| |||    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacacaaagccttaaa 11772163  T
Q  411 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 510  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  11772162 tggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaact 11772063  T
Q  511 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 610  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  11772062 ctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctt 11771963  T
Q  611 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11771962 gcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 692
Target Start/End: Original strand, 21661933 - 21662591
Alignment:
Q  31 agttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggac 130  Q
    ||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||  |||||| ||| | |||||||||| || |    
T  21661933 agttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggc 21662032  T
Q  131 caatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaag 230  Q
    |||| ||| |||| || |  |||||||| || |  || ||||| ||||| || | |||  |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  21662033 caataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaag 21662129  T
Q  231 atcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatc 330  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||   |||| || ||| || ||| |||| || ||||||||     
T  21662130 atccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagtctgttgaacaatg 21662229  T
Q  331 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactag 430  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  21662230 tctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatgctag 21662329  T
Q  431 aatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 530  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||    
T  21662330 aatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacga 21662429  T
Q  531 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 630  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  21662430 ctgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatcta 21662529  T
Q  631 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21662530 gaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14264534 - 14263862
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  14264534 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctttcagatat 14264435  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  14264434 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14264335  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||  ||||| |    
T  14264334 tgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtct 14264235  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  14264234 gatgaaccaaatacggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14264135  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||    
T  14264134 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaa 14264035  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  14264034 tcctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 14263935  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14263934 tccaaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 19147170 - 19147842
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  19147170 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 19147269  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  19147270 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 19147369  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  19147370 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 19147469  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  19147470 gatgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 19147569  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  19147570 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaa 19147669  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  19147670 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactct 19147769  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  19147770 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 20746569 - 20747241
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20746569 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20746668  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20746669 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20746768  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  20746769 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 20746868  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  20746869 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 20746968  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  20746969 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaa 20747068  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  20747069 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactct 20747168  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20747169 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11388717 - 11388046
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  11388717 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 11388618  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |     
T  11388617 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-ct 11388519  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  11388518 tgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 11388419  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| || || |||| |||    
T  11388418 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacggtgtcat 11388319  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |    
T  11388318 accaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaga 11388219  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  11388218 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactct 11388119  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11388118 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 352 - 692
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040326
Alignment:
Q  352 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 451  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  452 ttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 551  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14040086 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14040185  T
Q  552 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 651  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14040186 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14040285  T
Q  652 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14040286 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 352 - 692
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350356
Alignment:
Q  352 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 451  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  452 ttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 551  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14350116 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14350215  T
Q  552 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 651  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14350216 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14350315  T
Q  652 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14350316 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 8212418 - 8211749
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  8212418 catacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 8212319  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  8212318 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 8212219  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  8212218 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 8212119  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || || |||||    
T  8212118 catgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggcgccat 8212019  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8212018 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 8211919  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  8211918 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttt 8211819  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8211818 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16072584 - 16071912
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||    | ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  16072584 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactgttccaaccctctcagatat 16072485  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  16072484 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 16072385  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || |||||  |||| |    
T  16072384 tgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtct 16072285  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |  |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||| |||  |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  16072284 gacgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 16072185  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  16072184 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 16072085  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  16072084 tcctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 16071985  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16071984 tccaaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 11306553 - 11305884
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11306553 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11306454  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  11306453 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11306354  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  11306353 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 11306254  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  11306253 catgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11306154  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  11306153 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 11306054  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11306053 tcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11305954  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  11305953 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 13021316 - 13021988
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  13021316 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 13021415  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||| |||| ||| || || || || ||     
T  13021416 ctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtct 13021515  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||| ||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||||||  || ||||||||||| |    
T  13021516 tgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtct 13021615  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  13021616 catgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 13021715  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13021716 accaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 13021815  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13021816 tcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttt 13021915  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13021916 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16950761 - 16950089
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  16950761 catacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 16950662  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  16950661 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 16950562  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  16950561 tgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 16950462  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  ||  |||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  16950461 gatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16950362  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16950361 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 16950262  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  16950261 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactct 16950162  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16950161 tccagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 49152260 - 49152929
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  49152260 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 49152359  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  49152360 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 49152459  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  49152460 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 49152559  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  49152560 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 49152659  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  49152660 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 49152759  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  49152760 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 49152859  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49152860 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18054243 - 18053572
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  18054243 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 18054144  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  18054143 ctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 18054044  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  18054043 tgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 18053944  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  18053943 cctgaaccaaatccggtcccaacacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 18053844  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  18053843 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 18053744  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  18053743 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 18053644  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18053643 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 6413470 - 6414142
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  6413470 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 6413569  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||  | |||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  6413570 ctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 6413669  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  6413670 tgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 6413769  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  ||  | || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  6413770 gatgaaccaaatccagacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 6413869  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  6413870 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 6413969  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  6413970 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactct 6414069  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6414070 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14286666 - 14285994
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | |   ||||    
T  14286666 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaat 14286567  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  14286566 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 14286467  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  14286466 tgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 14286367  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  14286366 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 14286267  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  14286266 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaa 14286167  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |    
T  14286166 tcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctct 14286067  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14286066 tccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 13665512 - 13666168
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  13665512 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 13665611  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||     ||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||| | ||     
T  13665612 ctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctct 13665706  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| |||||||    
T  13665707 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagttt 13665806  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||           | || || |  || || ||||||||||||||||| || |||||  |||  |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  13665807 gatgaac-----------ccaacacaaaactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 13665895  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  13665896 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 13665995  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  13665996 tcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctct 13666095  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13666096 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 166 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964646
Alignment:
Q  166 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 265  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  266 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 365  Q
     |||||||||||||||||| || |||   |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || || || || || |||||| |    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcata 35964817  T
Q  366 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaac 465  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||     
T  35964816 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 35964717  T
Q  466 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 536  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964716 agaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 14129832 - 14130503
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14129832 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14129931  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |||    
T  14129932 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14130031  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||  | |    
T  14130032 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatct 14130131  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  14130132 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14130231  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |    
T  14130232 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaga 14130331  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14130332 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactct 14130431  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14130432 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 1693 - 1025
Alignment:
Q  24 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  ||||  ||||||||    
T  1693 cttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctga 1594  T
Q  124 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaa 223  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||| || || || || |||||||    
T  1593 tacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaa 1494  T
Q  224 actcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctg 323  Q
    |||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||||| || ||    
T  1493 actcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatg 1394  T
Q  324 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcca 423  Q
    ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||| |||||| |||||| |  || |||||||| |||    
T  1393 aaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccatacca 1294  T
Q  424 atactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 523  Q
    ||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1293 atactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcct 1194  T
Q  524 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 623  Q
    | |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1193 ccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttcca 1094  T
Q  624 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1093 gaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 14433650 - 14434321
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14433650 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14433749  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |||    
T  14433750 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14433849  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||  | |    
T  14433850 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatct 14433949  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  14433950 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14434049  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |    
T  14434050 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaga 14434149  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14434150 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactct 14434249  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14434250 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 23506064 - 23505491
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23506064 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23505965  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||  ||||| || |||    
T  23505964 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgta 23505865  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||    
T  23505864 gtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 23505765  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  23505764 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaa 23505665  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  23505664 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 23505565  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23505564 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Original strand, 14037765 - 14038092
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14037765 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14037864  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14037865 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14037964  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14037965 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14038064  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 347  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14038065 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Original strand, 14347795 - 14348122
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14347795 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14347894  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14347895 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14347994  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14347995 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14348094  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 347  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14348095 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 12455662 - 12456333
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| | || ||||||||| |||| |||| | ||  ||||    
T  12455662 catacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagccactgttctaactctctctgaaat 12455760  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  12455761 ctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 12455860  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||| ||  |||||||||||||| |    
T  12455861 tgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtct 12455960  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||| |||||| || || ||| ||||    
T  12455961 catgtaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccat 12456060  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||||||     
T  12456061 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaat 12456160  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |    
T  12456161 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattct 12456260  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12456261 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 116 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23199937 - 23199418
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23199937 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23199838  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||  ||||| || |||    
T  23199837 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgta 23199738  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||    
T  23199737 gtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 23199638  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  23199637 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaa 23199538  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  23199537 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 23199438  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagt 635  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  23199437 ctcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 116 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 26118799 - 26118226
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||    
T  26118799 aaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26118700  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat--tttctcttggatcatctgaactttctcag 313  Q
     |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||  |||| |   ||||||||||    
T  26118699 ctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaacctgactttctcag 26118602  T
Q  314 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaagg 413  Q
    |||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||    
T  26118601 tagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgg 26118502  T
Q  414 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 513  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||    
T  26118501 tgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc 26118402  T
Q  514 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 613  Q
    |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |    
T  26118401 aacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgta 26118302  T
Q  614 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26118301 aacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 577 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203242
Alignment:
Q  577 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 676  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  677 catgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 577 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509369
Alignment:
Q  577 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 676  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  677 catgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 691
Target Start/End: Original strand, 15340587 - 15341061
Alignment:
Q  217 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 316  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||| ||  || |||||||| |    
T  15340587 tcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttgaccttctcagtcg 15340686  T
Q  317 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgc 416  Q
    | || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| | || || |||||    
T  15340687 tctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgc 15340786  T
Q  417 cattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 516  Q
    ||| || ||||| ||||| ||  | || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  15340787 catacctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaac 15340886  T
Q  517 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 616  Q
    |||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15340887 aaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaac 15340986  T
Q  617 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    | ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15340987 tcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 352 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 13968626 - 13968289
Alignment:
Q  352 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 451  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  13968626 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 13968527  T
Q  452 ttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 551  Q
    | ||| | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  13968526 tgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 13968427  T
Q  552 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 651  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  13968426 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 13968327  T
Q  652 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    || || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  13968326 tccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 680
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936965
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |   | | |||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacct 14936642  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    || |||||||| |||||||  || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  14936643 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 14936742  T
Q  458 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 557  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  14936743 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 14936842  T
Q  558 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 657  Q
     ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  14936843 ggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 14936942  T
Q  658 acaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  14936943 acaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 222 - 580
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457298
Alignment:
Q  222 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 321  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   || | |   |||||||||||||| |      
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctca 12457039  T
Q  322 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattc 421  Q
    ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | |||||||||| |||||| || || |||||||| |    
T  12457040 tgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatac 12457139  T
Q  422 caatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 521  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| |||||    
T  12457140 caatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatc 12457239  T
Q  522 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 580  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12457240 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 4440011 - 4440546
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||    
T  4440011 gtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 4440110  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || || ||||| |     
T  4440111 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggccctaacaa 4440210  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||||||||| || ||||| |||||||   |||| || || |  |||| |||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||| | || ||     
T  4440211 agcactttcacctgattcgaaccaacacaacgacattctacaccttcttccatacaaagcctcaagcagtgccataccggtactagaatgaaaactgttg 4440310  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||    
T  4440311 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctct 4440410  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||    
T  4440411 ctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 4440510  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440511 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 7823983 - 7824518
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  7823983 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 7824082  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  7824083 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 7824182  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  7824183 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 7824282  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  7824283 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 7824382  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  7824383 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 7824482  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824483 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 27107961 - 27107426
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  27107961 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 27107862  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  27107861 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 27107762  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  27107761 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 27107662  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  27107661 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 27107562  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27107561 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27107462  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107461 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 680
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364558
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || ||  || |||  || ||||  || |||| ||| |   | ||||| |||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttatttttttgcacaacttccggtcttaacatatcactttctcct 15364235  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
     | |||||||| |||||||  || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  15364236 tattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 15364335  T
Q  458 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 557  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  15364336 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 15364435  T
Q  558 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 657  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  15364436 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 15364535  T
Q  658 acaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  15364536 acaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368473
Alignment:
Q  193 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 292  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  293 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 392  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||||    
T  12368615 ggatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 12368516  T
Q  393 accattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12368515 accatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26288318 - 26288063
Alignment:
Q  28 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 127  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||  ||||  |||||||||| |    
T  26288318 cgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacg 26288219  T
Q  128 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 227  Q
     ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||||||| ||    
T  26288218 taccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tc 26288120  T
Q  228 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
     ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26288119 tagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21674720 - 21674185
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| | |||| ||| | |  | |||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || || || | ||    
T  21674720 gtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcctct 21674621  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |  ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21674620 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21674521  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||  ||  | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  21674520 agcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 21674421  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacgg--aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 542  Q
    || ||||| || || ||||||||  || ||  | |||| || |  |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||    
T  21674420 ttgtaagtaaattcaatcaacggtaaacatt-cgatcc-aactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcct 21674323  T
Q  543 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 642  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||     
T  21674322 ctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctc 21674223  T
Q  643 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674222 ggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Original strand, 12193742 - 12193909
Alignment:
Q  248 catgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccac 347  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  || |||| ||  |||||||| |   |    
T  12193742 catgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaaccttcggtcctaacaaagc 12193841  T
Q  348 tctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
      |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12193842 attttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtg 12193909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Original strand, 15340455 - 15340574
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  15340455 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 15340554  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaact 139  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15340555 ctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 638
Target Start/End: Original strand, 45146842 - 45147131
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||| || |||||| || |||| ||| || |||||||||||  | || || || |    
T  45146842 ctttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatactagaatgcaaactgttgttgt 45146941  T
Q  449 aagttaactcgatcaacggaagatgactat-cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccg 547  Q
    |||| ||||| |||||||| | |  | | | ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |    
T  45146942 aagtaaactcaatcaacggtaaac-attctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctg 45147040  T
Q  548 actgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147041 tctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 40790
Alignment:
Q  151 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  | |||||| || || ||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  251 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 350  Q
    |||| ||||| |||| | | || || || ||||||| |||  | ||| | |  || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  |  |    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcccaacactgcaat 41128  T
Q  351 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 450  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||  | || || ||||||    
T  41127 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgttgttataa 41028  T
Q  451 gttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 550  Q
    || ||||| || || || |  | |  ||||||| |||| ||||| || |  |||||   ||| ||||| || || |  || ||||| || || ||   ||    
T  41027 gtaaactcaattaatgggaagtaagcatcccaacttcccccttgttccaacacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcgatct 40928  T
Q  551 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 650  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  |||||||    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  40927 gaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagtactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctct 40828  T
Q  651 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40827 atccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 559 - 680
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  559 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 658  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  659 caatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 673
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  565 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 664  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  665 tcgaaggaa 673  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  532 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 631  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  632 aagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Original strand, 13378796 - 13378937
Alignment:
Q  160 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 259  Q
    ||||||||||| || || | ||| |||||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  |  ||||| | ||| |||| ||||| ||    
T  13378796 ttcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgct 13378895  T
Q  260 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 301  Q
    | |||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13378896 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatct 13378937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 467
Target Start/End: Original strand, 13353438 - 13353556
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || || || || | ||||| |||||||||||| ||||||||  |  || |||||||| | || |||||||    
T  13353438 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggtaatagaatgaaaactcttattat 13353537  T
Q  449 aagttaactcgatcaacgg 467  Q
    |||| ||||| ||| ||||    
T  13353538 aagtaaactcaatcgacgg 13353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  598 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 656  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15589934 - 15589251
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15589934 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15589835  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589834 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15589735  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589734 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15589635  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  15589634 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 15589535  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589534 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 15589435  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589434 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15589335  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15589334 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 15589251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 53385560 - 53384888
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  53385560 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 53385461  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385460 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 53385361  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385360 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 53385261  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  53385260 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 53385161  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385160 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 53385061  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53385060 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 53384961  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53384960 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 20062596 - 20061913
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20062596 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 20062497  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062496 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20062397  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062396 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20062297  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  20062296 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 20062197  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062196 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 20062097  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20062096 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 20061997  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20061996 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 20061913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 10005188 - 10005871
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10005188 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10005287  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005288 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10005387  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005388 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10005487  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  10005488 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10005587  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10005588 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 10005687  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10005688 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttt 10005787  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10005788 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 10905798 - 10906481
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10905798 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10905897  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10905898 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 10905997  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905998 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10906097  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  10906098 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10906197  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10906198 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaa 10906297  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10906298 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 10906397  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10906398 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 48425035 - 48425718
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48425035 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 48425134  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48425135 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 48425234  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425235 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 48425334  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  48425335 gctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttgaacggtgccat 48425434  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425435 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 48425534  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48425535 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 48425634  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  48425635 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 48425718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 16635361 - 16636044
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16635361 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16635460  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16635461 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16635560  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635561 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16635660  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  16635661 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16635760  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635761 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16635860  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16635861 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16635960  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16635961 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 16757127 - 16756444
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16757127 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 16757028  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16757027 atgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 16756928  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16756927 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 16756828  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||    
T  16756827 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccat 16756728  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16756727 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaa 16756628  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16756627 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16756528  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16756527 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 16756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 43162685 - 43163368
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43162685 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 43162784  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  43162785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 43162884  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162885 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 43162984  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  43162985 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 43163084  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163085 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 43163184  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43163185 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 43163284  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  43163285 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 43163368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15348787 - 15348106
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15348787 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15348688  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15348687 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15348588  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348587 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15348488  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  15348487 gctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 15348388  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348387 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15348288  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15348287 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 15348188  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  15348187 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgat 15348106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 6600335 - 6601007
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6600335 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaat 6600434  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600435 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 6600534  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6600535 ttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 6600634  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  6600635 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 6600734  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  6600735 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 6600823  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6600824 tcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 6600923  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6600924 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 6601007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 13252278 - 13252959
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13252278 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 13252377  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252378 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 13252477  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252478 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 13252577  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  13252578 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 13252677  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13252678 tccaatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 13252777  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13252778 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 13252877  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13252878 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13252959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 5425471 - 5424791
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5425471 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 5425372  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5425371 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaag-cacgtggtctccttcc 5425273  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425272 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 5425173  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||    
T  5425172 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccat 5425073  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5425072 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 5424973  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5424972 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 5424873  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  5424872 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgat 5424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15403052 - 15402371
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  15403052 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatat 15402953  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402952 ctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15402853  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15402852 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15402753  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15402752 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccat 15402653  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15402652 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 15402553  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15402552 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15402453  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15402452 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15725475 - 15724795
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15725475 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15725376  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15725375 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcc 15725276  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  15725275 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtct 15725177  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15725176 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15725077  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725076 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15724977  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15724976 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15724877  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  15724876 tccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 15724795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 12497836 - 12498517
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497836 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497935  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12497936 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12498035  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12498036 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12498135  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12498136 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12498235  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498236 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 12498335  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12498336 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 12498435  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  12498436 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgat 12498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 26792941 - 26792260
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  26792941 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 26792842  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26792841 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctccttct 26792742  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792741 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 26792642  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  26792641 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 26792542  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26792541 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 26792442  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26792441 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttt 26792342  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26792341 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 26792260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 15338857 - 15339538
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  15338857 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatat 15338956  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15338957 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15339056  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15339057 taaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15339156  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  15339157 gatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15339256  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15339257 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 15339356  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15339357 tcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15339456  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15339457 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15339538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16412824 - 16412143
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16412824 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16412725  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16412724 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttca 16412625  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412624 tgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagttt 16412525  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  16412524 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcgaaaggtgccat 16412425  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412424 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaa 16412325  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412324 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16412225  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16412224 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 14877041 - 14876360
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14877041 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14876942  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  14876941 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttct 14876842  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  14876841 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtct 14876742  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14876741 gctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14876642  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14876641 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 14876542  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14876541 tcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14876442  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  14876441 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 14876360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16807468 - 16806787
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||    
T  16807468 cataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatat 16807369  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |  ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16807368 ctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16807269  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |    
T  16807268 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtct 16807169  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16807168 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 16807069  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16807068 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16806969  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  16806968 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttt 16806869  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  16806868 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 16806787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 16371001 - 16371679
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  | ||    
T  16371001 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatat 16371100  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||     
T  16371101 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttct 16371200  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16371201 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16371300  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16371301 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 16371400  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16371401 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16371500  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16371501 tcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 16371600  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16371601 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 17489438 - 17490110
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17489438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17489537  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17489538 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17489637  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  17489638 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 17489737  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17489738 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 17489837  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  17489838 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaga 17489937  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  17489938 tcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 17490037  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17490038 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 16691748 - 16692433
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16691748 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatat 16691847  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691848 ttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16691947  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16691948 tgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtct 16692047  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16692048 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 16692147  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16692148 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16692247  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcct----cttgcaaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||    
T  16692248 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaa 16692347  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  16692348 cttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 16692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16492723 - 16492051
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16492723 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16492624  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16492623 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16492524  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16492523 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 16492424  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  16492423 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcat 16492324  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16492323 tccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaa 16492224  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16492223 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 16492124  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16492123 tccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 9522307 - 9522979
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||   | ||    
T  9522307 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatat 9522406  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9522407 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9522506  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  9522507 tgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagttt 9522606  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9522607 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 9522706  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9522707 tccaatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 9522806  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9522807 tcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 9522906  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9522907 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 15247735 - 15248407
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  15247735 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 15247834  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  15247835 ctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15247934  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15247935 tgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15248034  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15248035 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgccat 15248134  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15248135 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaaa 15248234  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15248235 tcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 15248334  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15248335 tccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 15208479 - 15209151
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||  | ||    
T  15208479 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccgttccaattctttctgatat 15208578  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  15208579 ctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15208678  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15208679 tgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15208778  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  15208779 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccat 15208878  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15208879 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaa 15208978  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||| | |    
T  15208979 tcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatct 15209078  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15209079 tccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 15227247 - 15227919
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15227247 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15227346  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  15227347 ctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 15227446  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||   |||| | ||| |||| |  |||||     
T  15227447 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaatttgacctttttt-gtagtc 15227545  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |||||||| |  |||||||| || |  || | |||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||| | || || |||||||    
T  15227546 tgctgaactaaatctggtcccaacattacaccttcactcgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgcca 15227645  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  15227646 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaa 15227745  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  15227746 atcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaactt 15227845  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15227846 ttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13972616 - 13971979
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13972616 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttct 13972517  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13972516 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 13972417  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttt 352  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||    
T  13972416 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacacttt 13972319  T
Q  353 cacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 452  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  13972318 ctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagt 13972219  T
Q  453 taactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 552  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  13972218 aaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactga 13972119  T
Q  553 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 652  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  13972118 ccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 13972019  T
Q  653 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13972018 ctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 14086271 - 14086943
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  14086271 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 14086370  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  14086371 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 14086470  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||    
T  14086471 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagt 14086568  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  14086569 ttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgcc 14086668  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  14086669 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaata 14086768  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
     ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14086769 gatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaact 14086868  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14086869 cttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13323183 - 13322511
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |  | ||| ||||| |||||||   | ||||| ||    
T  13323183 catacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactgttccaatcctctccaatat 13323084  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  13323083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcc 13322984  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  13322983 tgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtct 13322884  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||  | || | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||| || || ||||||||    
T  13322883 gatgaaccaaatccggtcccaacacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccat 13322784  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  |||    
T  13322783 accaatactcgaatggtaattgttgttgtaggtaaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaa 13322684  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| |    
T  13322683 tcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactct 13322584  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13322583 tccagaatctagaagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 391 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564545
Alignment:
Q  391 cgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 11564753  T
Q  491 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 590  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11564752 ctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaa 11564653  T
Q  591 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 690  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11564652 cttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcaca 11564553  T
Q  691 atttcctt 698  Q
    || |||||    
T  11564552 atctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15953499 - 15952827
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15953499 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatat 15953400  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| ||| || || ||||| ||     
T  15953399 ctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctct 15953300  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15953299 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15953200  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  15953199 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15953100  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| |||||  | || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||     
T  15953099 accaatactcgaatggcaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaac 15953000  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15952999 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactct 15952900  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  15952899 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 412 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126464
Alignment:
Q  412 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  512 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  612 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 175 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15016131 - 15015634
Alignment:
Q  175 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 274  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15016131 acaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgag 15016032  T
Q  275 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 374  Q
    |||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| || ||| |||| |||||    
T  15016031 acgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaacacaa 15015932  T
Q  375 cggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatga 474  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| ||||||||||| |  ||||||    
T  15015931 tggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagagatga 15015832  T
Q  475 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 574  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||            ||||||||||||||    
T  15015831 ctatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccga------------ctgcggatgatatg 15015744  T
Q  575 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 674  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15015743 ccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaac 15015644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18134877 - 18134215
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  18134877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 18134778  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | || || |||    
T  18134777 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcc 18134678  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |  ||||| || ||||| |    
T  18134677 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtct 18134578  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  18134577 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 18134478  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  18134477 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 18134378  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |    
T  18134377 tcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactct 18134278  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 682  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18134277 tccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12361073 - 12360401
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||    
T  12361073 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgaaat 12360974  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||| ||| || || || || |||    
T  12360973 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 12360874  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| |||||      
T  12360873 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtcc 12360774  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||  | || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  12360773 gatgaaccaagtctggtcccaatacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 12360674  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||    
T  12360673 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaa 12360574  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  12360573 tcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctct 12360474  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  12360473 tccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 8759613 - 8758942
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  8759613 catacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 8759514  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  8759513 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 8759414  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  8759413 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 8759314  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  8759313 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 8759214  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  8759213 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 8759114  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  8759113 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 8759014  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8759013 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 41177120 - 41177791
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  41177120 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 41177219  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  41177220 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 41177319  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  41177320 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 41177419  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  41177420 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 41177519  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  41177520 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaag 41177619  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  41177620 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 41177719  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41177720 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 13941622 - 13942291
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  13941622 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 13941721  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  13941722 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 13941821  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  13941822 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 13941921  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  13941922 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccat 13942021  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  13942022 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 13942121  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  13942122 tcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 13942221  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13942222 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 454 - 698
Target Start/End: Original strand, 15061778 - 15062022
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15061778 aactcaatcaatggaaaatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactgac 15061877  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061878 catctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 15061977  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061978 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 10383567 - 10384235
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  10383567 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 10383666  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  10383667 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10383766  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  10383767 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  10383867 catgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 10383966  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  10383967 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 10384066  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||    
T  10384067 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatt 10384166  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  10384167 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacggaacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11304304 - 11303632
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  | ||    
T  11304304 catacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaaccctctctgatat 11304205  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||||| ||| || || || || ||     
T  11304204 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctct 11304105  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||  |    
T  11304104 tgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcct 11304005  T
Q  320 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    | |||| |||  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||     
T  11304004 gatgaatcaaattc-ggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcct 11303906  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  11303905 taccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaa 11303806  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||     
T  11303805 atcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactc 11303706  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11303705 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 12850775 - 12850138
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12850775 tgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttct 12850676  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || ||| | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||    
T  12850675 tagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtcatggta 12850576  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||   ||||  |  ||||| |  |||||||| ||||| |  |||||||| || || || |||||     
T  12850575 actcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttct 12850476  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |  || |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || || |    
T  12850475 cccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattgttgttgtacgtga 12850376  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12850375 actctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgacc 12850276  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||     
T  12850275 atctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatcc 12850176  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || |||||||| || || |||||||| | |||||||||    
T  12850175 gacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 47123542 - 47124211
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  47123542 catacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 47123641  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  47123642 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 47123741  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  47123742 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 47123841  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  47123842 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 47123941  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  47123942 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 47124041  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  47124042 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 47124141  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  47124142 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 55 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 10420541 - 10419907
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  10420541 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 10420442  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10420441 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggta 10420342  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||   |||||||| || || |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  10420341 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 10420242  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || || || |    
T  10420241 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtga 10420142  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  10420141 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 10420042  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  10420041 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatct 10419942  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  10419941 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 116 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16836945 - 16836370
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  16836945 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 16836846  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||     
T  16836845 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtc 16836746  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || |  ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||    
T  16836745 gtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 16836646  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || || || || ||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||    
T  16836645 ccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaa 16836546  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  16836545 caaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 16836446  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    || ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16836445 ctcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 691
Target Start/End: Original strand, 44776941 - 44777516
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || || ||    
T  44776941 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcacc 44777040  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     || || ||||||||  | || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  44777041 ctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 44777140  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || | |||||| |  |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || || || || ||||    
T  44777141 gtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtg 44777240  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  44777241 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 44777340  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||    
T  44777341 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaa 44777440  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44777441 ctcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11961565 - 11960992
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| |||||||||  |||||||| | ||  ||||    
T  11961565 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagccactattccaactctctctgaaat 11961466  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  11961465 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11961366  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||    ||||| |  || || ||||| || |    
T  11961365 tgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatcattttgaccttttcagtcgtct 11961266  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  11961265 catgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 11961166  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  11961165 gccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaa 11961066  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 593  Q
    ||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11961065 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16330190 - 16329520
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16330190 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16330091  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16330090 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16329991  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  16329990 tgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 16329891  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  16329890 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 16329791  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    |||||||||    
T  16329790 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaa 16329693  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  16329692 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactct 16329593  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16329592 tccagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 116 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16381362 - 16380788
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||    
T  16381362 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcacc 16381263  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  || || || |||    
T  16381262 atcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct---gtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgta 16381166  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagacca---ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaag 412  Q
    || |  ||||| |  || |||||  | ||||   | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || |    
T  16381165 gtctcatgaaccaaatccggtcccca-accataacactctctccggactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacg 16381067  T
Q  413 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 512  Q
    |||| || || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||    
T  16381066 gtgcgatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactct 16380967  T
Q  513 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 612  Q
    ||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  16380966 caacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgc 16380867  T
Q  613 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16380866 aaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 349 - 689
Target Start/End: Original strand, 28754245 - 28754585
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  28754245 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 28754344  T
Q  449 aagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 548  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  28754345 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 28754444  T
Q  549 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 648  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  28754445 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatct 28754544  T
Q  649 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  28754545 ctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 355 - 692
Target Start/End: Original strand, 17492563 - 17492900
Alignment:
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || |  |||||||| |||||| | |||||||| ||||| || || || |    
T  17492563 cctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcgaatgataactattgttgtatgtga 17492662  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  17492663 actctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 17492762  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  17492763 atctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 17492862  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||  | | | ||||||||||| | |||||||||    
T  17492863 gaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 382 - 692
Target Start/End: Original strand, 14573889 - 14574199
Alignment:
Q  382 ctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatccc 481  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14573889 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 14573988  T
Q  482 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 581  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14573989 aagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaact 14574088  T
Q  582 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 681  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14574089 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgt 14574188  T
Q  682 agcttcacaat 692  Q
    | |||||||||    
T  14574189 aacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 349 - 686
Target Start/End: Original strand, 4678365 - 4678702
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  4678365 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 4678464  T
Q  449 aagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 548  Q
    | || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  4678465 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 4678564  T
Q  549 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 648  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  4678565 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 4678664  T
Q  649 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 686  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4678665 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 14571448 - 14571710
Alignment:
Q  22 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || || ||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  14571448 tacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatct 14571547  T
Q  122 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 221  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  14571548 gataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttg 14571647  T
Q  222 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    |||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14571648 aaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcat 14571710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 355 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 26009189 - 26008948
Alignment:
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  26009189 cctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 26009090  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26009089 actctctcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 26008990  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 596  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008989 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8274816 - 8274281
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  8274816 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 8274717  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8274716 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 8274617  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  8274616 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 8274517  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||    
T  8274516 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctct 8274417  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  8274416 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 8274317  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274316 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 584
Target Start/End: Original strand, 13001800 - 13002070
Alignment:
Q  313 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaag 412  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| |||||| || || |    
T  13001800 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 13001899  T
Q  413 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 512  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  13001900 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactct 13001998  T
Q  513 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 584  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13001999 catcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgataagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 538 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 16743120 - 16742585
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||    
T  16743120 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcctct 16743021  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16743020 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16742921  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16742920 agcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16742821  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16742820 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16742721  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16742720 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctggg 16742621  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742620 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 679
Target Start/End: Original strand, 15576473 - 15577007
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  15576473 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 15576572  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |   | ||||  || ||||| || |     
T  15576573 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctcgcacaacttccggtccaaacaa 15576672  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  | || ||     
T  15576673 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgcaaactgttg 15576772  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15576773 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 15576872  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15576873 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15576972  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576973 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 472 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  472 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 571  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  572 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 671  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  672 aacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 673
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748916
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||  |  || || | ||| |||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | |||||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacct 18748600  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    || |||||||| |||||||  || || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |  | || || ||| | ||||    
T  18748601 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaattgttgttgtaactaaact 18748700  T
Q  458 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 557  Q
    | |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  18748701 caatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 18748800  T
Q  558 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 657  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   ||||||     
T  18748801 ggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgac 18748900  T
Q  658 acaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||| || |||||||    
T  18748901 acaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 435
Target Start/End: Original strand, 17192865 - 17193107
Alignment:
Q  193 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 292  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17192865 actctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 17192964  T
Q  293 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 392  Q
    | ||||||| ||| || || ||| | |  || ||||  || |||| ||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  17192965 gaatcatcttaaccttttccgtactctcttgcacaacttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccg 17193064  T
Q  393 accattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  17193065 accatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatga 17193107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6712753 - 6712539
Alignment:
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  6712753 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagt 6712654  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6712653 ctcttgtacaacctccggtcctaacaaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 6712554  T
Q  418 attccaatactagaa 432  Q
    ||||| |||||||||    
T  6712553 attccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13975462 - 13975172
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13975462 gtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 13975363  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |  ||||  || || ||||| |     
T  13975362 tatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttccacaacttccggccctaacaa 13975263  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
        || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13975262 aggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 13975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  531 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 630  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  631 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14183179 - 14183007
Alignment:
Q  295 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 394  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||| || || || |||||||  |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||       
T  14183179 atcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgttctacatctcctct 14183080  T
Q  395 cattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14183079 catacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 14183007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31689154 - 31689067
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  31689154 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactgttccaac 31689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 31945070 - 31945157
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||    
T  31945070 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaac 31945157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  510 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 609  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  610 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6153052 - 6152978
Alignment:
Q  361 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||||||||||||    
T  6153052 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaatga 6152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 553 - 647
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  553 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 647  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 582; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 27668975 - 27668294
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27668975 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27668876  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668875 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27668776  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668775 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27668676  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27668675 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27668576  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27668575 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 27668476  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27668475 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27668376  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27668375 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27668294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 19769861 - 19770542
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  19769861 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 19769960  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19769961 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19770060  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770061 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19770160  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19770161 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19770260  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770261 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19770360  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19770361 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19770460  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19770461 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19770542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 40708681 - 40709362
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40708681 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 40708780  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40708781 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttct 40708880  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708881 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 40708980  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  40708981 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 40709080  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709081 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 40709180  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40709181 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 40709280  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  40709281 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgat 40709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 34566395 - 34567078
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34566395 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 34566494  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  34566495 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 34566594  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566595 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 34566694  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  34566695 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 34566794  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566795 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 34566894  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34566895 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 34566994  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  34566995 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 34567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 27518308 - 27518991
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27518308 catactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27518407  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27518408 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcc 27518507  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518508 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27518607  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27518608 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27518707  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518708 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27518807  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27518808 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27518907  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27518908 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27518991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 22333372 - 22332691
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22333372 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22333273  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22333272 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 22333173  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  22333172 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtct 22333073  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  22333072 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22332973  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22332972 tccaatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaa 22332873  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22332872 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22332773  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22332772 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 16356403 - 16357086
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16356403 catactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16356502  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16356503 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16356602  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356603 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16356702  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  16356703 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16356802  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356803 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16356902  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16356903 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16357002  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16357003 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16357086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 41770743 - 41771424
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770743 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41770842  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770843 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41770942  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770943 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 41771042  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41771043 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 41771142  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41771143 tccaatactagaatgataactattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 41771242  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41771243 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 41771342  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41771343 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 41771424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15000224 - 14999543
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15000224 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15000125  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15000124 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15000025  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000024 tggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14999925  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  14999924 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagtctcgaaaggtgccat 14999825  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999824 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 14999725  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14999724 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttt 14999625  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14999624 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14999543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 27610255 - 27610936
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27610255 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27610354  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610355 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27610454  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610455 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27610554  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27610555 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27610654  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610655 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27610754  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27610755 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27610854  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27610855 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27610936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 27685885 - 27685204
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27685885 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27685786  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27685785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27685686  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685685 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27685586  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  27685585 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcat 27685486  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685485 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27685386  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27685385 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27685286  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27685285 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 37291979 - 37291300
Alignment:
Q  22 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37291979 tactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatct 37291880  T
Q  122 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 221  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37291879 gatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttg 37291780  T
Q  222 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 321  Q
     |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37291779 gaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgc 37291680  T
Q  322 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  37291679 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 37291580  T
Q  422 caatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 521  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291579 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 37291480  T
Q  522 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 621  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37291479 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 37291380  T
Q  622 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37291379 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 37291300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 29476558 - 29475898
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |     
T  29476558 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatac 29476459  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476458 ctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 29476359  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  29476358 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtct 29476259  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  29476258 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 29476159  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29476158 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaa 29476059  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29476058 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttt 29475959  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475958 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 22134569 - 22135250
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22134569 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 22134668  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22134768  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22134769 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 22134868  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  22134869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22134968  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22134969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaa 22135068  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22135069 ttctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22135168  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22135169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 22348326 - 22349005
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22348326 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactctttccaatat 22348425  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22348426 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22348525  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22348526 cgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 22348623  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  22348624 gctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22348723  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22348724 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaa 22348823  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22348824 tcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22348923  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22348924 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 23573643 - 23574321
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23573643 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23573742  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573743 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23573842  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  23573843 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 23573942  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23573943 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 23574042  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23574043 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 23574142  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23574143 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 23574242  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23574243 tccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 18775678 - 18776352
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||| | ||    
T  18775678 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatat 18775777  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18775778 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcc 18775877  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  18775878 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 18775977  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18775978 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 18776077  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18776078 tcgaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatca-------atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaa 18776170  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  18776171 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactct 18776270  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  18776271 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgat 18776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 680
Target Start/End: Original strand, 23516443 - 23517102
Alignment:
Q  21 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||    
T  23516443 atacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatc 23516542  T
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23516543 taatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 23516642  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||    
T  23516643 gaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttg 23516742  T
Q  321 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccatt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23516743 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccatt 23516842  T
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 520  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23516843 ccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaat 23516942  T
Q  521 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 620  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  23516943 cctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctt 23517042  T
Q  621 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517043 tcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 673
Target Start/End: Original strand, 20798661 - 20799314
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||    
T  20798661 catatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatat 20798760  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20798761 ttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 20798860  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  20798861 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 20798960  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20798961 gctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 20799060  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20799061 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaa 20799160  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  20799161 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttt 20799260  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799261 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 660
Target Start/End: Original strand, 23440126 - 23440766
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23440126 catacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23440225  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23440226 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23440325  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23440326 tgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagttt 23440425  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  23440426 gctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccat 23440525  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23440526 tccaatactagaatgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 23440625  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23440626 tcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 23440725  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 660  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440726 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 25423090 - 25423759
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25423090 catagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25423189  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25423190 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 25423289  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25423290 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25423389  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25423390 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 25423489  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25423490 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 25423589  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  25423590 tcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 25423689  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25423690 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21497850
Alignment:
Q  62 tcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgactt 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  162 caaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttt 261  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||  || || ||||| || |||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  262 tgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgact 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgact 21498180  T
Q  362 caaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgat 461  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||    
T  21498179 caaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacttttattttacgtgaactctat 21498080  T
Q  462 caacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtc 561  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  21498079 caatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatc 21497980  T
Q  562 tgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaa 661  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21497979 tgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaa 21497880  T
Q  662 tgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21497879 tgctcgaa-gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20468581 - 20467909
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||| | | | |||| || ||    
T  20468581 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgccactgtttctattctttctaatat 20468482  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||| | |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20468481 ctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 20468382  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20468381 tgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagttt 20468282  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  20468281 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccat 20468182  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  20468181 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaag 20468082  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20468081 tcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 20467982  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20467981 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 21984790 - 21984248
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||    
T  21984790 catacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatat 21984691  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  21984690 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctct 21984591  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21984590 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21984491  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21984490 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 21984391  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21984390 tccaatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 21984291  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 562  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984290 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23471130 - 23471802
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |     
T  23471130 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatac 23471229  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| || || ||||||||     
T  23471230 ctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 23471329  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  23471330 tgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagttt 23471429  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| | ||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23471430 gttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccat 23471529  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23471530 tccaatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 23471629  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  23471630 tcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactct 23471729  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23471730 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 26739190 - 26738540
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  26739190 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 26739091  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |  || |||| |||     
T  26739090 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttct 26738991  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26738990 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 26738891  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||    
T  26738890 gttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagccttaaattgtgccat 26738791  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||| |||| |||| ||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26738790 tccattactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaa 26738691  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||                 
T  26738690 tcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcc------------- 26738604  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26738603 ---------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 26738540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 195 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339099
Alignment:
Q  195 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 294  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  295 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 394  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 21339397  T
Q  395 cattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 494  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339396 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 21339297  T
Q  495 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 594  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  21339296 ctcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaactta 21339197  T
Q  595 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21339196 gaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 24750039 - 24749370
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24750039 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24749940  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24749939 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24749840  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  24749839 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24749740  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  24749739 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 24749640  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  24749639 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 24749540  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  24749539 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactct 24749440  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24749439 tccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22236405 - 22235733
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22236405 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatat 22236306  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  22236305 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 22236206  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||  |||||||| ||||| |    
T  22236205 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtct 22236106  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || |||||  |||| |||||||||| |||||| || || | ||||||    
T  22236105 gatgaaccaactccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccat 22236006  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || || || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  22236005 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 22235906  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  22235905 tcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactct 22235806  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22235805 tccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21563786
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || | |||| | ||  | ||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||  |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| | ||||||   |||| | ||| |||| || |||||     
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtc 21564153  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    || ||||| || ||| |||| || || || |||       |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||| ||    
T  21564152 tgatgaactatatctagtcccaacactacactt-------actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtca 21564060  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  21564059 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaa 21563960  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  21563959 atcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaactt 21563860  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21563859 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21891244 - 21890572
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21891244 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21891145  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  21891144 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctct 21891045  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  21891044 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 21890945  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||| ||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||  || | |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  21890944 gatgaaccaaatctgttcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21890845  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  21890844 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaa 21890745  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  21890744 tcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 21890645  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21890644 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 22381082 - 22381754
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||  ||||    
T  22381082 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctctgaaat 22381181  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  22381182 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22381281  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |  || ||||||||||| |    
T  22381282 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtct 22381381  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || ||  |||||||    
T  22381382 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccat 22381481  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  22381482 acctatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 22381581  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22381582 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactct 22381681  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381682 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 23080574 - 23079902
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23080574 catacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 23080475  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  23080474 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 23080375  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  23080374 tgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 23080275  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||    
T  23080274 catgcaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccat 23080175  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23080174 accaatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 23080075  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| |    
T  23080074 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactct 23079975  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23079974 tccagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 22502562 - 22503231
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  22502562 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 22502661  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  22502662 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22502761  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  22502762 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 22502861  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  22502862 catgaaccaagtctggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 22502961  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  22502962 gccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 22503061  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  22503062 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactct 22503161  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22503162 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 14887476 - 14886807
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  14887476 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 14887377  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  14887376 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14887277  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  14887276 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 14887177  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||| ||| || || || ||||||||    
T  14887176 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccat 14887077  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14887076 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 14886977  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  14886976 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 14886877  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14886876 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 656
Target Start/End: Original strand, 22461835 - 22462471
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  22461835 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 22461934  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  22461935 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 22462034  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| |||||||    
T  22462035 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagttt 22462134  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || || || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  22462135 catgaaccaattccggccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 22462234  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  22462235 accaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaa 22462334  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  22462335 tcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactct 22462434  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 656  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462435 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 25847958 - 25848627
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  25847958 catacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgccacagttccaactctctctgaaat 25848057  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || || || || |||    
T  25848058 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcc 25848157  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  25848158 tgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 25848256  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  25848257 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 25848356  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  25848357 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaa 25848456  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |     
T  25848457 atcttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattc 25848556  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25848557 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 37545982 - 37545336
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37545982 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctcagaaat 37545883  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca-aaaacacgtggtctccttc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| |||| || || || || ||    
T  37545882 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctc 37545783  T
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   ||||||||||||||     
T  37545782 ctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtc 37545683  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||  ||||||    
T  37545682 tcatgtaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgcca 37545583  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37545582 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaa 37545483  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||    
T  37545482 atcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaatt 37545383  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 665  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545382 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 20342165 - 20342834
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20342165 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20342264  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||| || || || |  |||    
T  20342265 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcc 20342364  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  20342365 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 20342464  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  20342465 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 20342564  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||    
T  20342565 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaa 20342664  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  20342665 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 20342764  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  20342765 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 28924218 - 28923581
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28924218 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28924119  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28924118 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28924019  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  28924018 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttct 28923919  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| || ||  |||||||||  ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || |    
T  28923918 cccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 28923819  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  28923818 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 28923719  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28923718 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatct 28923619  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28923618 gacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Original strand, 20821371 - 20822008
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  20821371 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 20821470  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||    
T  20821471 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggta 20821570  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || |||||     
T  20821571 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttct 20821670  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || ||  |||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || || || |    
T  20821671 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtga 20821770  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
      || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  20821771 gttctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 20821870  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  20821871 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatct 20821970  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20821971 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 24798882 - 24798213
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24798882 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 24798783  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  24798782 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 24798683  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 318  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || ||    ||||| |||| |||||||||||||     
T  24798682 agaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtc 24798584  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  ||  |||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  24798583 tcgtgaaccaaatccagtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 24798484  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24798483 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaa 24798384  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || |||||     
T  24798383 atcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactc 24798284  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24798283 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 28895392 - 28894755
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28895392 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28895293  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28895292 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28895193  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  28895192 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttct 28895093  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| || ||  |||||||||  ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || |    
T  28895092 cccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 28894993  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||    
T  28894992 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgacc 28894893  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28894892 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatct 28894793  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28894792 gacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 17269722 - 17269148
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  17269722 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 17269623  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  17269622 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 17269523  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || | |||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||    
T  17269522 gtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 17269423  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  17269422 ccattcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 17269323  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || |||    
T  17269322 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaa-ttagtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaa 17269224  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17269223 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 55 - 680
Target Start/End: Original strand, 20773678 - 20774302
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  20773678 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 20773777  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20773778 tcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgata 20773877  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || ||  ||||     
T  20773878 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaaaacaacattttct 20773977  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||| ||||| || || |||||  | ||  |||||||||  ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || |    
T  20773978 cccgactcgaaccaacataaaggagtcttacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 20774077  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || | ||||||||||||||||||    
T  20774078 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattgga-tgtcctctccgactgacc 20774176  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  20774177 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtct 20774276  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    || || || ||||| ||||| |||||    
T  20774277 gacactatactcgacggaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 582
Target Start/End: Original strand, 21404737 - 21405285
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||| ||||    
T  21404737 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaat 21404836  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |  ||||| |||  ||| ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| || |||||||      
T  21404837 ctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatgatctccttg- 21404935  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
                   || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  21404936 ---------------ttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 21405020  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaa--gcctcaaaaggtgcc 417  Q
    | |||||||| |||||||| |  | |||  | ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||   || || || ||||||    
T  21405021 gttgaacaatgtctggtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgcc 21405120  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21405121 attccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaaca 21405220  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 582  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21405221 agtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 250 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831574
Alignment:
Q  250 tgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| || |||||||| || ||||| || || || |    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  350 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 449  Q
      ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | || || || || ||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  450 agttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 549  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||                   
T  21831798 cgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactga--------------- 21831714  T
Q  550 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctc 649  Q
       |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21831713 ---ccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctc 21831617  T
Q  650 tatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831616 tatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24736096 - 24735682
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24736096 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24735997  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24735996 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24735897  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  24735896 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24735797  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  24735796 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 24735697  T
Q  420 tccaatactagaatg 434  Q
     |||||||| |||||    
T  24735696 accaatactcgaatg 24735682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23442778 - 23442472
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | |     
T  23442778 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataa 23442679  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||     
T  23442678 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 23442579  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  23442578 tgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 23442479  T
Q  320 gctgaac 326  Q
    | |||||    
T  23442478 gatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 454 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 24716577 - 24716342
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24716577 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 24716478  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  24716477 catctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatc 24716378  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24716377 cgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24737270 - 24737012
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24737270 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24737171  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24737170 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24737071  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 278  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24737070 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgc 24737012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Original strand, 20573422 - 20573626
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  20573422 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 20573521  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  20573522 ctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 20573621  T
Q  220 tgaaa 224  Q
    |||||    
T  20573622 tgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 460 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 24620340 - 24620111
Alignment:
Q  460 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 559  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24620340 atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctg 24620241  T
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||    
T  24620240 tctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacac 24620141  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24620140 aatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 383 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 919
Alignment:
Q  383 tgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatccca 482  Q
    |||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  1150 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccta 1051  T
Q  483 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 582  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1050 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 951  T
Q  583 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 614  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  950 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21343843 - 21343666
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  21343843 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 21343744  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 197  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21343743 cttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 412 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 28916506 - 28916226
Alignment:
Q  412 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 511  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || || || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  |    
T  28916506 ggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacataccc 28916407  T
Q  512 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 611  Q
    | | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||    
T  28916406 ttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttg 28916307  T
Q  612 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28916306 taaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 460 - 692
Target Start/End: Original strand, 21496481 - 21496713
Alignment:
Q  460 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 559  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||||     
T  21496481 atcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatcta 21496580  T
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  21496581 tttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacac 21496680  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  21496681 aatacttgatggaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21937548 - 21937013
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21937548 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 21937449  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  21937448 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 21937349  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  21937348 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 21937249  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  21937248 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 21937149  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21937148 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21937049  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937048 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 578 - 692
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  578 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 677  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  678 atgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 24581219 - 24581753
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || | ||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  24581219 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 24581318  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24581319 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24581418  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  24581419 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 24581518  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24581519 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24581618  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  24581619 ctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24581717  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581718 atcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 27011092 - 27011627
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  27011092 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 27011191  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27011192 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 27011291  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || ||  |||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | || ||     
T  27011292 agcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaactgttg 27011391  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| ||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27011392 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 27011491  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27011492 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27011591  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011592 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 11211054 - 11210732
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  11211054 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcctct 11210955  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  11210954 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 11210855  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||  || || || |||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  11210854 aacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaactattg 11210755  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  11210754 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 11210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21662524 - 21662297
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21662524 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21662425  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| ||||     
T  21662424 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21662326  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 248  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21662325 tgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21665985 - 21665758
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21665985 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21665886  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| ||||     
T  21665885 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21665787  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 248  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21665786 tgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 532 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  532 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 631  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  632 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 532 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  532 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 631  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  632 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Original strand, 23503526 - 23503741
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  23503526 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 23503625  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  || |||||||| |   | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  | |||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  23503626 cttgcaccacttccggtcctaacaaagcactttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagccat 23503725  T
Q  420 tccaatactagaatga 435  Q
     || | ||||||||||    
T  23503726 accgacactagaatga 23503741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  532 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 593  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 580; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 16998600 - 16999283
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16998600 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16998699  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16998700 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16998799  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998800 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16998899  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16998900 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16998999  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999000 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16999099  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16999100 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16999199  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16999200 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 16981752 - 16982435
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16981752 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16981851  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16981852 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16981951  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981952 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16982051  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16982052 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16982151  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982152 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16982251  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16982252 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16982351  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16982352 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16982435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 17063317 - 17064000
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17063317 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17063416  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17063417 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17063516  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063517 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17063616  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  17063617 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17063716  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063717 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17063816  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17063817 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17063916  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17063917 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17064000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 9609736 - 9610419
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9609736 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 9609835  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9609836 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9609935  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609936 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 9610035  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  9610036 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 9610135  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610136 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 9610235  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9610236 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 9610335  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  9610336 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 9610419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 10868450 - 10869133
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10868450 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 10868549  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868550 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10868649  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868650 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10868749  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  10868750 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcgaacggtgccat 10868849  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868850 tccaatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 10868949  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10868950 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 10869049  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10869050 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10869133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 27217616 - 27218299
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27217616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27217715  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217716 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27217815  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27217816 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagttt 27217915  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27217916 gctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27218015  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218016 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27218115  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27218116 tcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27218215  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27218216 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 44386412 - 44385731
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44386412 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44386313  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386312 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 44386213  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386212 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44386113  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  44386112 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 44386013  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386012 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 44385913  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44385912 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 44385813  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  44385812 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 44385731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 22325699 - 22325018
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22325699 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22325600  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325599 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22325500  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325499 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 22325400  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  22325399 gctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 22325300  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22325299 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 22325200  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22325199 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 22325100  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22325099 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22325018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 24709633 - 24710314
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24709633 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24709732  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24709733 ctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24709832  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709833 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24709932  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||    
T  24709933 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcat 24710032  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710033 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 24710132  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24710133 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 24710232  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24710233 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24710314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 17066978 - 17067658
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17066978 catactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccgttccaactctttccaatat 17067074  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17067075 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17067174  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067175 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17067274  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  17067275 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17067374  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067375 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17067474  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17067475 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17067574  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17067575 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 24261970 - 24262651
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24261970 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24262069  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24262070 atgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24262169  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262170 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24262269  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  24262270 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 24262369  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262370 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 24262469  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24262470 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 24262569  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24262570 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24262651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 27370869 - 27371550
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27370869 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27370968  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27370969 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27371068  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371069 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27371168  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  27371169 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27371268  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371269 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27371368  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27371369 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27371468  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27371469 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27371550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 21145873 - 21145201
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21145873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcgttccaactctttccaatat 21145774  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145773 ctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 21145674  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21145673 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 21145574  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  21145573 gctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21145474  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  21145473 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctccttgctcaagaacac-----------aaa 21145385  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21145384 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttt 21145285  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  21145284 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 21145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23188608 - 23189279
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  23188608 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatat 23188707  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23188708 ctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 23188807  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||| ||||||||||| |    
T  23188808 tgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtct 23188907  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23188908 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 23189006  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23189007 tcctaaactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaa 23189106  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189107 tcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 23189206  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23189207 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 24675089 - 24675767
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24675089 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24675188  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24675189 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24675288  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24675289 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24675388  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24675389 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 24675488  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24675489 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaa 24675588  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  24675589 tcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 24675688  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24675689 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 24708325 - 24707647
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24708325 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24708226  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24708225 ctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24708126  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24708125 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24708026  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24708025 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 24707926  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24707925 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaa 24707826  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  24707825 tcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 24707726  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24707725 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttcctt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21326109 - 21325431
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  21326109 catacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 21326010  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21326009 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21325910  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  21325909 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggttt 21325810  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21325809 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccat 21325710  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21325709 tccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 21325610  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21325609 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21325510  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21325509 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttcctt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 538
Target Start/End: Original strand, 16924860 - 16925378
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16924860 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16924959  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16924960 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16925059  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925060 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16925159  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16925160 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16925259  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925260 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16925359  T
Q  520 tcctctagcgactgaattg 538  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16925360 tcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 22757306 - 22756630
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22757306 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22757207  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  22757206 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttct 22757107  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | |    
T  22757106 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatct 22757007  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22757006 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccat 22756909  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  22756908 tccaatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaa 22756809  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  22756808 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactct 22756709  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22756708 tccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24878838 - 24878319
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24878838 catactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24878739  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24878738 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 24878639  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24878638 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagttt 24878539  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  24878538 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcat 24878439  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24878438 tccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 24878339  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgt 539  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24878338 tcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 23063677 - 23064346
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23063677 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagatat 23063776  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||| | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  23063777 ctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttct 23063876  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  23063877 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 23063976  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23063977 gttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 23064076  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23064077 tccaatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 23064176  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23064177 tcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 23064276  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23064277 tccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 315 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 41608933 - 41608547
Alignment:
Q  315 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  41608933 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggt 41608834  T
Q  415 gccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 514  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608833 gccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 41608734  T
Q  515 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41608733 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaa 41608634  T
Q  615 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  41608633 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 41608547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 78 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825472
Alignment:
Q  78 taaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||  | |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  178 ccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 277  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  278 ccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgg 377  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacgg 24825768  T
Q  378 agttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgacta 477  Q
    ||| || || |||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  24825767 agtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgacta 24825668  T
Q  478 tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccg 577  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24825667 tcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccg 24825568  T
Q  578 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825567 aacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 30211760 - 30211088
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||   |||||||||||| ||||    
T  30211760 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaat 30211661  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  || ||||| ||||| |||| | |  ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  30211660 ctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttct 30211561  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  30211560 tgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 30211461  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||| ||| | ||||| ||  || || || |||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||||||    
T  30211460 gttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgtttcgaacggtgccat 30211361  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  30211360 tccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 30211261  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  30211260 tcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactct 30211161  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30211160 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 692
Target Start/End: Original strand, 45529121 - 45529783
Alignment:
Q  24 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 123  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||   | || ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  45529121 cttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaatctga 45529220  T
Q  124 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaa 223  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||| |      ||    
T  45529221 tatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtcttc------aa 45529314  T
Q  224 actcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctg 323  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||   |||| || ||| |||| |||||| || ||    
T  45529315 actcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgttg 45529414  T
Q  324 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcca 423  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||    
T  45529415 aacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattcca 45529514  T
Q  424 atactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 523  Q
    || ||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  45529515 atgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtcct 45529614  T
Q  524 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 623  Q
    | | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  45529615 ccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcca 45529714  T
Q  624 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45529715 aaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27365922 - 27365250
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  27365922 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 27365823  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||     
T  27365822 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctct 27365723  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||    
T  27365722 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagttt 27365623  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| ||| || ||||| ||||||||    
T  27365622 gttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccat 27365523  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |    
T  27365522 accaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaataga 27365423  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27365422 tcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 27365323  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27365322 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23293558 - 23294230
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23293558 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 23293657  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  23293658 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 23293757  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |    
T  23293758 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtct 23293857  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||  || || ||||| ||  | |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  23293858 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23293957  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23293958 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaa 23294057  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
     |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  23294058 ccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctct 23294157  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23294158 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23276376 - 23277048
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  23276376 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 23276475  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |||||||| | | ||||| ||| || || || || |||    
T  23276476 ctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcc 23276575  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   |||||||| ||||| |    
T  23276576 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtct 23276675  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  23276676 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23276775  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| ||||    
T  23276776 accaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaa 23276875  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  23276876 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactct 23276975  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23276976 tccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 11358717 - 11358057
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||  ||||    
T  11358717 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactttctctgaaat 11358618  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  11358617 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11358518  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  11358517 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11358418  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  11358417 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11358318  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  |||||||||    
T  11358317 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaa 11358218  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11358217 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11358118  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11358117 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 581
Target Start/End: Original strand, 23087050 - 23087611
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  23087050 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgccactgttccaactctctcagatat 23087149  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23087150 ctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23087249  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||   ||||  | ||| || ||| |||| |    
T  23087250 tgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtct 23087349  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |  ||||||| |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  23087350 gacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 23087449  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||| | ||||| || || || || || || ||||| |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  23087450 accaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgataggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaa 23087549  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 581  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  23087550 tcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgataagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 31830258 - 31830927
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31830258 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 31830357  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  31830358 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31830457  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  31830458 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 31830557  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  31830558 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 31830657  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  31830658 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 31830757  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31830758 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 31830857  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31830858 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 20832585 - 20833254
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20832585 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20832684  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  20832685 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20832784  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  20832785 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 20832883  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  20832884 tcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 20832983  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20832984 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaa 20833083  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  20833084 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactt 20833183  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20833184 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 27787341 - 27788012
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  27787341 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 27787440  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  27787441 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 27787540  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||  ||||| || ||||| |    
T  27787541 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtct 27787640  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  27787641 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 27787740  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  27787741 tcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 27787840  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  27787841 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 27787940  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27787941 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 691
Target Start/End: Original strand, 12574049 - 12574624
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || | ||| || || || ||    
T  12574049 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcacc 12574148  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     || |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  12574149 ctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 12574248  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || | |||||| |  || ||||| || || || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||    
T  12574249 gtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 12574348  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  12574349 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 12574448  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  12574449 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 12574548  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12574549 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 1063351 - 1064020
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  1063351 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccacagtaccaattctctctgaaat 1063450  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  1063451 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 1063550  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  1063551 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 1063650  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || || |  |||||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  1063651 catgtaccaaatctggtcccaacacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 1063750  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  1063751 accaatacttgaatgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 1063850  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| |    
T  1063851 tcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 1063950  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  1063951 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 293
Target Start/End: Original strand, 23138637 - 23138910
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23138637 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23138736  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||     
T  23138737 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23138836  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 293  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23138837 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23138910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 293
Target Start/End: Original strand, 23550427 - 23550700
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23550427 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23550526  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||     
T  23550527 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23550626  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 293  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23550627 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23550700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27377314 - 27377101
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  27377314 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 27377215  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377214 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27377115  T
Q  220 tgaaactcaagatc 233  Q
    ||||||||||||||    
T  27377114 tgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 541 - 703
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923172
Alignment:
Q  541 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  641 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 539 - 703
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925643
Alignment:
Q  539 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  639 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16925643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 546 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442675
Alignment:
Q  546 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 645  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  646 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttgat 20442675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 534 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876911
Alignment:
Q  534 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  634 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 355 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19652557 - 19652223
Alignment:
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |   | || |    
T  19652557 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgt---atgtga 19652461  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  19652460 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 19652361  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||     
T  19652360 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatcc 19652261  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||| ||||| || || |||| || |||||||||    
T  19652260 gacacaatactcgacggtactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41609187 - 41609047
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41609187 catacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41609088  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41609087 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 388 - 689
Target Start/End: Original strand, 20828227 - 20828528
Alignment:
Q  388 ctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  20828227 ctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctc 20828326  T
Q  488 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 587  Q
    | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  20828327 caccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacct 20828426  T
Q  588 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 687  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  20828427 caacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttc 20828526  T
Q  688 ac 689  Q
    ||    
T  20828527 ac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 399 - 692
Target Start/End: Original strand, 24948568 - 24948861
Alignment:
Q  399 caaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctca 498  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24948568 caaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctca 24948667  T
Q  499 agaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagc 598  Q
    || ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||      
T  24948668 agcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaa 24948767  T
Q  599 ccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24948768 ccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 680
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276538
Alignment:
Q  159 cttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 258  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  259 ttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctg 358  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |   | || || || |    
T  22276118 ttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccagtcctaacaaggcactctctccgg 22276217  T
Q  359 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactc 458  Q
    |||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| |||||    
T  22276218 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 22276317  T
Q  459 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 558  Q
     |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  |||||     
T  22276318 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatca 22276417  T
Q  559 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 658  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  22276418 gtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gaca 22276516  T
Q  659 caatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  22276517 caatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 511 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  511 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 610  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  611 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  21 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||  |  |||||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 260  Q
    ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 604 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  604 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817291
Alignment:
Q  197 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 296  Q
    |||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  297 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 396  Q
    ||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||  | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23817619 catcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgacca 23817520  T
Q  397 ttcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 496  Q
    | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      ||||||    | |||||||    
T  23817519 tacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgct 23817420  T
Q  497 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 596  Q
    | | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |     
T  23817419 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 23817320  T
Q  597 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 625  Q
     ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817319 tcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 577 - 692
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  577 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 676  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  677 catgtagcttcacaat 692  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 538 - 692
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 24944967 - 24945136
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  24944967 catacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaat 24945066  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 189  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24945067 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 24945136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12640637 - 12640315
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  12640637 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 12640538  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12640537 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 12640438  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  12640437 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 12640338  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  12640337 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 12640315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 24831905 - 24831370
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  24831905 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttctct 24831806  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24831805 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24831706  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | || ||     
T  24831705 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactaacatgaaaactgttg 24831606  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24831605 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24831506  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |    
T  24831505 ctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcag 24831406  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831405 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 680
Target Start/End: Original strand, 25128474 - 25128907
Alignment:
Q  247 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 346  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| | |||||| |  |    
T  25128474 tcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaacctccgatcctaacaaaa 25128573  T
Q  347 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 446  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||| | || || ||    
T  25128574 cactttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatacttgaatgaaaactgttgtt 25128673  T
Q  447 ataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 546  Q
     ||||| ||||| |||||||  | |       ||||| |  | | |||||| | || ||||  ||| || ||||||||||    |||||| ||||||||     
T  25128674 gtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgacccaactgacactttgctccaaaatacaagctcttaataaatcctctaaactctgaatagtcctctct 25128773  T
Q  547 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 646  Q
      ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  25128774 atctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggat 25128873  T
Q  647 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128874 cccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22762239 - 22761752
Alignment:
Q  193 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 292  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22762239 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctctt 22762140  T
Q  293 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 392  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | ||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || |||||    
T  22762139 ggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccg 22762040  T
Q  393 accattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 492  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||    
T  22762039 accatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 22761940  T
Q  493 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 592  Q
    ||||  | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22761939 tgcttcaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaagagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaact 22761840  T
Q  593 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761839 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24569851
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| | || |||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |  || ||||| |||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaaaacactttctcct 24570174  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
     |||||||||| |||||||| || || || ||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  24570173 aactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24570074  T
Q  458 cgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 556  Q
    | |||||||| | |  |||  ||| || |    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||    
T  24570073 caatcaacggtaaac-actcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccat 24569975  T
Q  557 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 656  Q
    | || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  24569974 cggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctga 24569875  T
Q  657 tacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
     ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569874 cacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27368448 - 27368394
Alignment:
Q  247 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27368448 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 27368394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24833416 - 24833355
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaa 81  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24833416 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaa 24833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 467
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890829
Alignment:
Q  391 cgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 23890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16350974 - 16350293
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16350974 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16350875  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16350874 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16350775  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350774 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16350675  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16350674 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16350575  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350574 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16350475  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16350474 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16350375  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16350374 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16350293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 51333868 - 51333187
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51333868 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 51333769  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  51333768 atgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 51333669  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333668 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 51333569  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  51333568 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 51333469  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333468 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 51333369  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51333368 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 51333269  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  51333268 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 51333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 19106351 - 19107032
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19106351 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 19106450  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106451 ctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19106550  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19106551 tgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 19106650  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19106651 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagactcaaaaggtgccat 19106750  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19106751 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 19106850  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19106851 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 19106950  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19106951 tccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19107032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 33391404 - 33390723
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33391404 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 33391305  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33391304 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 33391205  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391204 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 33391105  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  33391104 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 33391005  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391004 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 33390905  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33390904 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 33390805  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33390804 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 33390723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 21830287 - 21830968
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21830287 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21830386  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21830387 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21830486  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21830487 tgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagttt 21830586  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  21830587 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21830686  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21830687 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 21830786  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21830787 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 21830886  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  21830887 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 21830968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 41354844 - 41354202
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41354844 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 41354745  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354744 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41354645  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41354644 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 41354545  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41354544 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 41354445  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41354444 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaa 41354345  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  41354344 tcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttt 41354245  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354244 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 21836934 - 21837615
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21836934 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21837033  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21837034 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21837133  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21837134 tggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagttt 21837233  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  21837234 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccat 21837333  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837334 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 21837433  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21837434 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 21837533  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21837534 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 21837615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 17045390 - 17044709
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17045390 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17045291  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17045290 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcc 17045191  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  17045190 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17045091  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17045090 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 17044991  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17044990 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 17044891  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17044890 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 17044791  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17044790 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 17044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16079008 - 16078350
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  16079008 catacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 16078909  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078908 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16078809  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||                   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16078808 tg-------------------cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16078728  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16078727 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccat 16078628  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16078627 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16078528  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  16078527 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactct 16078428  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16078427 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----accatgtaacctcacaatctccttgat 16078350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 50620619 - 50619959
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50620619 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50620520  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||     
T  50620519 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctct 50620420  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  50620419 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 50620320  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  50620319 attgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaat 50620220  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  50620219 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaa 50620120  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  50620119 tcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 50620020  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620019 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 16369281 - 16369953
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  16369281 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactctttctgatat 16369380  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  16369381 ctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 16369480  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  || || ||| ||||||    
T  16369481 tggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagttt 16369580  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  16369581 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaagtgtcat 16369680  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  16369681 tccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 16369780  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |    
T  16369781 tcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaaccct 16369880  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369881 tccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 564
Target Start/End: Original strand, 20249834 - 20250378
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  20249834 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 20249933  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20249934 cttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 20250033  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20250034 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 20250133  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20250134 gttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 20250233  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20250234 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctcaacaaa 20250333  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 564  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250334 tcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 574
Target Start/End: Original strand, 20136762 - 20137316
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||| | ||    
T  20136762 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgatat 20136861  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20136862 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttct 20136961  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20136962 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 20137061  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  20137062 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccat 20137161  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20137162 tcctatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 20137261  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 574  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137262 tcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgatatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19761241 - 19760569
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  19761241 catactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatat 19761142  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  19761141 ctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 19761042  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  19761041 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 19760942  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| || ||| || ||||||| |||    
T  19760941 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcat 19760842  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  19760841 tccaatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaag 19760742  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19760741 tcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactct 19760642  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760641 tctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 21747519 - 21747935
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21747519 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21747618  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||     
T  21747619 ctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttct 21747718  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
     |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21747719 agaaactcaagatcttt-ctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 21747817  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21747818 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcatacaaagcctcataaggtgccat 21747917  T
Q  420 tccaatactagaatgata 437  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21747918 tccaatactagaatgata 21747935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 19854298 - 19854966
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19854298 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19854397  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  19854398 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19854497  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19854498 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19854597  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| || |||||| || ||  |||||||    
T  19854598 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccat 19854697  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||    
T  19854698 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactc-atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaa 19854796  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  19854797 tcctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 19854896  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19854897 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 20940438 - 20939770
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20940438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 20940339  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  20940338 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 20940239  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  ||||||    
T  20940238 tgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagttt 20940139  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  20940138 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 20940039  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
      ||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  20940038 aacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaa 20939939  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |    
T  20939938 tcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactct 20939839  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20939838 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 20857136 - 20856476
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  20857136 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 20857037  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  20857036 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 20856937  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    |||||||  |||||||| |||||||    
T  20856936 tgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagttt 20856837  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  ||  | || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  20856836 catgaaccaattccagccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccat 20856737  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  20856736 accaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaa 20856637  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  20856636 tcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactct 20856537  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  20856536 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 37677063 - 37677733
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37677063 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 37677162  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||| || || || || ||    
T  37677163 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctc 37677262  T
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   ||||||||||||||     
T  37677263 ctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtc 37677362  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  37677363 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 37677462  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||||||||    
T  37677463 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaa 37677562  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||     
T  37677563 atcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactc 37677662  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37677663 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20836231 - 20835591
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20836231 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttct 20836132  T
Q  155 tt---gacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 251  Q
    |    ||||| || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||| ||||| |||  | || | ||||||||||||    
T  20836131 tcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtcatg 20836032  T
Q  252 ataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctt 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  20836031 ataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacactc 20835932  T
Q  352 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 451  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |    
T  20835931 tctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 20835832  T
Q  452 ttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 551  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||    
T  20835831 tgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattg 20835732  T
Q  552 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 651  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  20835731 accgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatcccta 20835632  T
Q  652 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20835631 tccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 22433491 - 22432817
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  22433491 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttgcaaccctctctgaaat 22433392  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||| || || || |||    
T  22433391 ctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcc 22433292  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  22433291 tgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 22433192  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |  ||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||| |||||| || || ||||||||    
T  22433191 catgaaccaaattcggtcccaacaccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccat 22433092  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||    
T  22433091 acctatactcgaatggtaactgttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaa 22432992  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22432991 tcttccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 22432892  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 694  Q
    |||| || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22432891 tccagaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 443 - 692
Target Start/End: Original strand, 21749348 - 21749597
Alignment:
Q  443 tattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 542  Q
    ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21749348 tattatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 21749447  T
Q  543 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749448 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 21749547  T
Q  643 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21749548 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 20294396 - 20295065
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20294396 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20294495  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || ||     
T  20294496 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctct 20294595  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |||| ||| |||||||||     
T  20294596 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgacctt-ctcagtagtc 20294694  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||| ||| || || || |||||||    
T  20294695 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgcca 20294794  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20294795 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaa 20294894  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | |||     
T  20294895 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactc 20294994  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20294995 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 118 - 622
Target Start/End: Original strand, 41307907 - 41308411
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || |||| |||||| |||||||| |    
T  41307907 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccct 41308006  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || || |  |||||||| |||||    
T  41308007 cttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgtagt 41308106  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||  |||| || ||||||| |||||| || || ||||||    
T  41308107 ctgatgaaccaaatccagtcccaacaccacactttctcccaactcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 41308206  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  41308207 ataccaatactcgaatgctaattgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagca 41308306  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    |||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  41308307 aatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T
Q  618 tttcc 622  Q
     ||||    
T  41308407 cttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 472 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  472 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  572 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 671  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  672 aacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19665251 - 19664945
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19665251 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19665152  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  19665151 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19665052  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19665051 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19664952  T
Q  320 gctgaac 326  Q
    | |||||    
T  19664951 gatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 421 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 24099577 - 24099306
Alignment:
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 520  Q
    |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  24099577 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 24099478  T
Q  521 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 620  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  24099477 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 24099378  T
Q  621 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24099377 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50612791 - 50612602
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50612791 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50612692  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 209  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  50612691 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31550556 - 31550136
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31550556 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 31550457  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  31550456 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 31550357  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||| ||||| |    
T  31550356 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtct 31550257  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  31550256 catgaactaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 31550157  T
Q  420 tccaatactagaatgatagct 440  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  31550156 accaatactcgagtgatagct 31550136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 388 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19663143 - 19662844
Alignment:
Q  388 ctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19663143 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 19663044  T
Q  488 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 587  Q
    | ||||| ||||| ||||| | |||||        || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19663043 caccttgttcaagcacacacactctcagtt-----tccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacct 19662949  T
Q  588 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 687  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19662948 caacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttc 19662849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 445 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 31539947 - 31539703
Alignment:
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  31539947 ttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctct 31539848  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  31539847 ccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcgg 31539748  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31539747 atctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 567 - 692
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  567 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 666  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  667 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 20244184 - 20244437
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20244184 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaat 20244283  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  20244284 ctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcc 20244383  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 273  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244384 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 20831642 - 20831107
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  20831642 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 20831543  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  20831542 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 20831443  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  20831442 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 20831343  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  20831342 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 20831243  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  20831242 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 20831143  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831142 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 21163264 - 21163378
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21163264 catacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 21163363  T
Q  120 ctgatatggaccaat 134  Q
    |||||| ||||||||    
T  21163364 ctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 284
Target Start/End: Original strand, 11382674 - 11382842
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||    
T  11382674 aaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcacc 11382773  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11382774 ctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20075434 - 20075170
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||| | ||  ||||    
T  20075434 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttcccactctctctgaaat 20075335  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || || |||    
T  20075334 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcc 20075235  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  20075234 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 610 - 680
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  610 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 20914319 - 20914854
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  |    
T  20914319 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctccatt 20914418  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | | |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  20914419 tataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggttctaacat 20914518  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  20914519 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatgaaaattgttt 20914618  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      | |||| || | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    || ||| |||||||    
T  20914619 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctaaatagtcctct 20914718  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  20914719 cagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 20914818  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914819 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135520
Alignment:
Q  197 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 296  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||  || ||||| | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||| | || ||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  297 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 396  Q
    ||||| |||||| |  |||||||  || ||||  ||||||||||| |   | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  397 ttcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaat 433  Q
    | |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaat 22135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20395368 - 20395194
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || | ||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||| | ||  ||||    
T  20395368 catacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaactctctctgaaat 20395269  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 194  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||    
T  20395268 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||| | | ||| |||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 311  Q
    ||| || |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  531 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 630  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  631 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 655 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 319
Target Start/End: Original strand, 46518830 - 46519004
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  46518830 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 46518929  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  46518930 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46519004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 538 - 647
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  638 atcttggatc 647  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 8386381 - 8387064
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8386381 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8386480  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386481 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8386580  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386581 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8386680  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||    
T  8386681 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggcgccat 8386780  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386781 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8386880  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8386881 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8386980  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8386981 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 8387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 18297174 - 18297855
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18297174 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18297273  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18297274 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18297373  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297374 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18297473  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  18297474 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 18297573  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297574 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 18297673  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18297674 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18297773  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18297774 tccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18297855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 19778836 - 19778157
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19778836 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccaatat 19778737  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19778736 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19778637  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778636 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19778537  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19778536 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19778437  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778436 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19778337  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19778336 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19778237  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19778236 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 29039447 - 29038764
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29039447 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29039348  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29039347 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29039248  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039247 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29039148  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  29039147 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 29039048  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039047 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 29038948  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29038947 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 29038848  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  29038847 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 29038764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 12476569 - 12477252
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12476569 catactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 12476668  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12476669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12476768  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12476769 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagttt 12476868  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  12476869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 12476968  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476969 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 12477068  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12477069 tcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 12477168  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  12477169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 12477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 27711305 - 27711986
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27711305 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27711404  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27711405 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27711504  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711505 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27711604  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  27711605 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcgaacggtgccat 27711704  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711705 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27711804  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27711805 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27711904  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27711905 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 14304020 - 14303340
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14304020 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14303921  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14303920 ctgatacggaccaatgaacttcggg-tcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 14303822  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14303821 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 14303722  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  14303721 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14303622  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303621 tccaatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 14303522  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14303521 tcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14303422  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  14303421 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 14303340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 23955716 - 23956397
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23955716 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 23955815  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23955816 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23955915  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955916 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 23956015  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  23956016 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 23956115  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23956116 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 23956215  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23956216 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 23956315  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23956316 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 23956397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 40473009 - 40473690
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  40473009 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 40473108  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40473109 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 40473208  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40473209 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagttt 40473308  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  40473309 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 40473408  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40473409 tccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 40473508  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40473509 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttt 40473608  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  40473609 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 40473690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 12523645 - 12524328
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12523645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12523744  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12523745 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12523844  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12523845 tgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12523944  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12523945 gctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 12524044  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12524045 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 12524144  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12524145 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12524244  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12524245 tccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 8053666 - 8052985
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  8053666 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtat 8053567  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053566 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8053467  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053466 tgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8053367  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  8053366 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 8053267  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8053266 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaa 8053167  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8053166 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8053067  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8053066 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 14680536 - 14681219
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14680536 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14680635  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14680636 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcc 14680735  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14680736 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14680835  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14680836 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14680935  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14680936 tccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 14681035  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14681036 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14681135  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  14681136 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 14681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16252488 - 16251810
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  16252488 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 16252389  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16252289  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16252288 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 16252189  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16252188 gctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 16252089  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  16252088 tccaataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaa 16251989  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16251988 tcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16251889  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16251888 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcctt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 14266942 - 14266368
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14266942 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14266843  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14266842 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 14266743  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14266742 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagttt 14266643  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  14266642 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14266543  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14266542 tccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 14266443  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14266442 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 18227489 - 18226808
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  18227489 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 18227390  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18227389 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcc 18227290  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  18227289 tgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtct 18227190  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18227189 tctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 18227090  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18227089 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 18226990  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  18226989 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcc 18226890  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18226889 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgat 18226808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16355488 - 16354816
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  16355488 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatat 16355389  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16355388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttct 16355289  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16355288 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16355189  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16355188 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 16355089  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16355088 tcaaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 16354989  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16354988 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 16354889  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16354888 tccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 695
Target Start/End: Original strand, 7090402 - 7091076
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  7090402 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 7090501  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7090502 ctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 7090600  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  7090601 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 7090700  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  7090701 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggttccat 7090800  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  7090801 tctaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaa 7090900  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090901 tcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 7091000  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 695  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7091001 tctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14851409 - 14850737
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  14851409 catacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatat 14851310  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  14851309 ctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 14851210  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  14851209 tgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagttt 14851110  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  14851109 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14851010  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14851009 tccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 14850910  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14850909 tcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 14850810  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14850809 tccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 190 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 1640298 - 1639793
Alignment:
Q  190 ctgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 289  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  1640298 ctgagtctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatctttt 1640199  T
Q  290 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 389  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1640198 cttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatct 1640099  T
Q  390 ccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 489  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1640098 tcgaccatacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccct 1639999  T
Q  490 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 589  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||    
T  1639998 ccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctca 1639899  T
Q  590 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1639898 acttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 1639799  T
Q  690 aatttc 695  Q
    ||||||    
T  1639798 aatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 324 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147249
Alignment:
Q  324 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcca 423  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  424 atactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 15147424  T
Q  524 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 623  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15147423 ctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcca 15147324  T
Q  624 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147323 aaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 514
Target Start/End: Original strand, 14159461 - 14159955
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14159461 catacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatat 14159560  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || |||||| |     
T  14159561 ctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctcct 14159660  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  14159661 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtct 14159760  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14159761 gttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 14159860  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 514  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14159861 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctca 14159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Original strand, 14652277 - 14652754
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14652277 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 14652376  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14652377 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14652476  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14652477 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 14652576  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  14652577 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcat 14652676  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 497  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14652677 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 14652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15003667 - 15002995
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15003667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15003568  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||     
T  15003567 ctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15003468  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15003467 tgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 15003368  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||  ||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  15003367 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 15003268  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||    
T  15003267 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaa 15003168  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  15003167 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 15003068  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15003067 tccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 211 - 692
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706559
Alignment:
Q  211 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 310  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||   || | || |||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  311 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaa 410  Q
    |  |||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaa 8706277  T
Q  411 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 510  Q
     |||| |||||  ||||||||||| || || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |    
T  8706278 tggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaact 8706377  T
Q  511 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 610  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||    
T  8706378 ctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctctt 8706477  T
Q  611 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8706478 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 1649580 - 1648908
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  1649580 catacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacagttccaatcctctctgatat 1649481  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || || |||    
T  1649480 ctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcc 1649381  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| ||||  |||||||  ||||| |    
T  1649380 tgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtct 1649281  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||| |||    
T  1649280 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacat 1649181  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  1649180 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaa 1649081  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  1649080 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 1648981  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1648980 tctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 191 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15415158 - 15414657
Alignment:
Q  191 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15415158 tgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T
Q  291 ttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 389  Q
        |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15415058 ccttatcaatttgaccttt-tccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacct 15414960  T
Q  390 ccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 489  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||     
T  15414959 ccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggcagatgactatcccaaactcca 15414860  T
Q  490 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 589  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15414859 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctca 15414760  T
Q  590 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  15414759 actttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcac 15414660  T
Q  690 aat 692  Q
    |||    
T  15414659 aat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 15245893 - 15246565
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||    ||    
T  15245893 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttat 15245992  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  15245993 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcc 15246092  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||   | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |    
T  15246093 tgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtct 15246192  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  15246193 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15246292  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| |  || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15246293 accaatactcgaatggtgactgttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaa 15246392  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15246393 tcctctaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 15246492  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  15246493 tccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 3265097 - 3264428
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  3265097 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 3264998  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  3264997 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 3264898  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  3264897 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 3264798  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  3264797 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 3264698  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  3264697 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 3264598  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  3264597 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 3264498  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3264497 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 11207534 - 11206865
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11207534 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11207435  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  11207434 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11207335  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  11207334 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11207235  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  11207234 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11207135  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| | ||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||    
T  11207134 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaa 11207035  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11207034 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11206935  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    || | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11206934 tcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15150049 - 15149740
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||    
T  15150049 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgatat 15149950  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15149949 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15149850  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  15149849 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 15149750  T
Q  320 gctgaacaat 329  Q
    ||||||||||    
T  15149749 gctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 15364355 - 15364580
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15364355 catactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15364454  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15364554  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgctt 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15364555 tgaaattcaagatcttttctacgctt 15364580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 29453840 - 29453171
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  29453840 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 29453741  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  29453740 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29453641  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  29453640 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 29453541  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  ||  |||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  29453540 catgaaccaaatcccgtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 29453441  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  29453440 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 29453341  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  29453340 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 29453241  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29453240 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 33222887 - 33223564
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | |   ||||    
T  33222887 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctttgaaat 33222986  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  33222987 ctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 33223086  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| ||  ||||||||||||||||    
T  33223087 tgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagttt 33223186  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| || |  || |||| |||    
T  33223187 catgaaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaatgctttgaatggtgtcat 33223286  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     ||||||||  | || ||  | || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  33223287 accaatactctattgttattttttgttttatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 33223386  T
Q  520 tcctctagcgactgaat-----tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 614  Q
    || || |  || || ||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  33223387 tcttccaatgattggatcgtcctctcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaa 33223486  T
Q  615 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223487 actcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 118 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15359295 - 15358721
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 217  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||||| |    
T  15359295 atctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccct 15359196  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||    
T  15359195 cttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagt 15359096  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  15359095 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 15358996  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||  ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |    
T  15358995 ataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagta 15358896  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    ||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  15358895 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagact 15358796  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358795 cttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 127 - 692
Target Start/End: Original strand, 27900462 - 27901027
Alignment:
Q  127 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 226  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||    
T  27900462 ggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 27900561  T
Q  227 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 326  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  |||||    
T  27900562 caaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaac 27900661  T
Q  327 aatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaata 426  Q
     |  || ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||    
T  27900662 caaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaata 27900761  T
Q  427 ctagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcta 526  Q
    || ||||| || || || || || || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  27900762 ctcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctcta 27900861  T
Q  527 gcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaa 626  Q
      || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  27900862 aagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaa 27900961  T
Q  627 tctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27900962 tcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 20890952 - 20891623
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  || |||||||  | ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20890952 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaacccatcctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 20891050  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  20891051 ctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20891150  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  20891151 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 20891250  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |  ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||| |||||| || || ||||||||    
T  20891251 catgaaccaaattcggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccat 20891350  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  20891351 accaatacttgaatgatagctattgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaa 20891450  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  20891451 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactct 20891550  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || || ||||| || | |||||||||    
T  20891551 tccagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 241 - 692
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15078276
Alignment:
Q  241 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 340  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  341 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 440  Q
    | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  15077925 acactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15078024  T
Q  441 attattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 540  Q
     || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||     
T  15078025 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgtt 15078124  T
Q  541 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 640  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15078125 ctcttcgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 15078224  T
Q  641 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15078225 tcggatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 44662169 - 44661500
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  44662169 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 44662070  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  44662069 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 44661970  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  44661969 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 44661870  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  44661869 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 44661770  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacgg-aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  44661769 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaagacaaga-gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaa 44661671  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||     
T  44661670 atcttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactc 44661571  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  44661570 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 596
Target Start/End: Original strand, 16145881 - 16146459
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16145881 catacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 16145980  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | |||    
T  16145981 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcc 16146080  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||| ||  |||||||| ||||| |    
T  16146081 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtct 16146180  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || || |  ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||| | || || ||||||||    
T  16146181 gatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccat 16146280  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag--aacacaaattctcaaca 517  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| | ||| |  |    
T  16146281 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagta 16146380  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 596  Q
    ||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146381 aatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 500
Target Start/End: Original strand, 15070382 - 15070862
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||||||| | || || ||    
T  15070382 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatat 15070481  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  15070482 ctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 15070581  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  15070582 tgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 15070681  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| || || ||||||||    
T  15070682 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15070781  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 500  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15070782 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaag 15070862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 502 - 692
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  502 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 601  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  602 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  186 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  286 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 349  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 51606484 - 51605998
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  51606484 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 51606385  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  51606384 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 51606285  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  51606284 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 51606185  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  51606184 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 51606085  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 506  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  51606084 tcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacaca 51605998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 551 - 692
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  551 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 650  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  651 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 638
Target Start/End: Original strand, 13247814 - 13248232
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||    
T  13247814 tgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 13247913  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  13247914 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccat 13248013  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
     | ||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |  | || |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  13248014 cctaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta-aacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaa 13248112  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||     
T  13248113 atcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactc 13248212  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    | ||| ||  ||||||||||    
T  13248213 tcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 541 - 692
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  541 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  641 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 14997410 - 14997945
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14997410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14997509  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  14997510 tatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 14997609  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || |  ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | || ||     
T  14997610 agcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttg 14997709  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14997710 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14997809  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14997810 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 14997909  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997910 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 9290929 - 9291464
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||| | |||| |||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  9290929 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 9291028  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  9291029 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 9291128  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||  |     
T  9291129 agcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgctg 9291228  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    || ||| |||||||    
T  9291229 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctaaatagtcctct 9291328  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  9291329 ccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 9291428  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291429 atcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14927302 - 14927151
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  14927302 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactgttccaactctttccgatat 14927203  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgt 171  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927202 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15293335 - 15293013
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |  |    
T  15293335 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttt 15293236  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15293235 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 15293136  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  15293135 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 15293036  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15293035 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15293013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 55375536 - 55375214
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||||||||| || || |||||||| | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  55375536 gtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 55375437  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  55375436 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaacttctggtcctaacaa 55375337  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | || ||     
T  55375336 agcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgtaaactgttg 55375237  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  55375236 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 55375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 284
Target Start/End: Original strand, 16752669 - 16752826
Alignment:
Q  127 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 226  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  16752669 ggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 16752768  T
Q  227 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    ||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16752769 caagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132298
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||| |||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||||| ||||| |  || |||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttctggacctaacaaaacactttcacct 12132375  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  12132374 gactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatga 12132298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 42702872 - 42703103
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  42702872 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 42702971  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  42702972 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 42703071  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 251  Q
    |||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  42703072 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 42703103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 12342968 - 12342548
Alignment:
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    |||||||||||| ||  || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| | || |||||||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  12342968 cctgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagt 12342869  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     |  || |||| ||| |||||||  |   | ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  12342868 ctcttgcacaacctccggtcctagtaaagcactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgcc 12342769  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || ||||||||||||||| |  | || || ||||| ||||| |||||||| | |     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  12342768 atcccaatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 12342669  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    |||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  12342668 aatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 12342569  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
     | ||||||| ||||||||||    
T  12342568 ctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  38 acacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaa 137  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  138 cttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacca 180  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18607873 - 18607823
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagat 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18607873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16445390 - 16445234
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  16445390 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 16445291  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 301  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16445290 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 16445234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  549 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 648  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  649 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15415282 - 15415214
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||| || || ||||||||||    
T  15415282 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 467
Target Start/End: Original strand, 16685557 - 16685669
Alignment:
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    ||||||||| |||| || ||||  ||||| || ||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |    
T  16685557 cctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaa 16685656  T
Q  455 actcgatcaacgg 467  Q
    |||| ||||||||    
T  16685657 actcaatcaacgg 16685669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  553 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 592  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18550064 - 18549949
Alignment:
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |  |||| || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||    
T  18550064 tgctgaacaatctctggtcccaacactgcaatttcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgcca 18549965  T
Q  419 ttccaatactagaatg 434  Q
    | ||||||||||||||    
T  18549964 tcccaatactagaatg 18549949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 562; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 19112725 - 19113406
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  19112725 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 19112824  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19112825 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19112924  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112925 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19113024  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19113025 gctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19113124  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19113125 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19113224  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19113225 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19113324  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19113325 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 17674769 - 17674090
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17674769 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17674670  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17674669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17674570  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674569 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17674470  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  17674469 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17674370  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674369 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17674270  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17674269 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17674170  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17674169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19485616 - 19484974
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19485616 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 19485517  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485516 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19485417  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19485416 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 19485317  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19485316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19485217  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19485216 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaa 19485117  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  19485116 tcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttt 19485017  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485016 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 20018496 - 20017865
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  20018496 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 20018397  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018396 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20018297  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018296 tcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20018197  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  20018196 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 20018097  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018096 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 20017997  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20017996 tcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 20017897  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017896 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 22120920 - 22120239
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22120920 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22120821  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22120820 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22120721  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22120720 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 22120621  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  22120620 gctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22120521  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120520 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 22120421  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22120420 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactct 22120321  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22120320 tccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgat 22120239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 30313890 - 30313209
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  30313890 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 30313791  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313790 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 30313691  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  30313690 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 30313591  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30313590 gctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgt 30313491  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30313490 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaa 30313391  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30313390 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 30313291  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30313290 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 30313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 682
Target Start/End: Original strand, 15533415 - 15534077
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15533415 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15533514  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15533515 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15533614  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |    
T  15533615 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtct 15533714  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533715 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 15533814  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15533815 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 15533914  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15533915 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15534014  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534015 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 32600179 - 32600860
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  32600179 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 32600278  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600279 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 32600378  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  32600379 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 32600478  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32600479 actgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 32600578  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32600579 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 32600678  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32600679 tcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 32600778  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32600779 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 32600860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22133787 - 22133127
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22133787 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22133688  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  22133687 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcc 22133588  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22133587 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22133488  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22133487 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 22133388  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133387 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22133288  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22133287 tcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22133188  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133187 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 22046408 - 22047089
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22046408 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22046507  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046508 ctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22046607  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  22046608 taaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 22046707  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22046708 gctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 22046807  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046808 tccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22046907  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22046908 tcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactct 22047007  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22047008 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 16408788 - 16408131
Alignment:
Q  23 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  16408788 acttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctg 16408689  T
Q  123 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 222  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  16408688 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgg 16408589  T
Q  223 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 322  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16408588 aacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 16408489  T
Q  323 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcc 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16408488 gaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcc 16408389  T
Q  423 aatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 522  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408388 aatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcc 16408289  T
Q  523 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 622  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16408288 tctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcc 16408189  T
Q  623 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408188 aaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22164937 - 22164278
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22164937 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatat 22164838  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  22164837 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcc 22164738  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22164737 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22164638  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22164637 gctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 22164538  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22164537 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22164438  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22164437 tcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22164339  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164338 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 19978002 - 19978683
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19978002 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatat 19978101  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19978102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19978201  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  19978202 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 19978301  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19978302 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccat 19978401  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  19978402 tccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaa 19978501  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  19978502 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactct 19978601  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  19978602 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgat 19978683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21167275 - 21166606
Alignment:
Q  28 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 127  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |    
T  21167275 cgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacg 21167176  T
Q  128 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 227  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21167175 gaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactc 21167076  T
Q  228 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaca 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21167075 aagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaaca 21166976  T
Q  328 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatac 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166975 atctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatac 21166876  T
Q  428 tagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctag 527  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21166875 tagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctag 21166776  T
Q  528 cgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166775 cgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 21166676  T
Q  628 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  21166675 ctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctcctt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23650076 - 23650748
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||    
T  23650076 catacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccgttccaactcttttcgatat 23650175  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  23650176 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 23650275  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23650276 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 23650375  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  23650376 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccat 23650475  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  23650476 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaag 23650575  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23650576 tcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 23650675  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23650676 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21922481 - 21921809
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21922481 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21922382  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21922381 ctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 21922282  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  21922281 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagttt 21922182  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  21922181 gctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatagaaagcctcataaggtgccat 21922082  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21922081 tccaatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 21921982  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21921981 tcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21921882  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21921881 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 21250977 - 21251648
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21250977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 21251076  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  21251077 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 21251176  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21251177 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct-ctctttaatcatcttaaccttctcggtagttt 21251275  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||| |||    
T  21251276 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcat 21251375  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
      |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21251376 ctcaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21251475  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21251476 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21251575  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21251576 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21789104 - 21788433
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21789104 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21789005  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21789004 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21788905  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21788904 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21788805  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  21788804 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatac-aagcctcataaggtgccat 21788706  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21788705 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21788606  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  21788605 tcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttt 21788506  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21788505 tccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21394611 - 21393939
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21394611 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21394512  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21394511 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21394412  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21394411 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21394312  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  21394311 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccatacaagcctcataaggtgccat 21394212  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21394211 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21394112  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  21394111 tcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttt 21394012  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21394011 tccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 261 - 701
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18857293
Alignment:
Q  261 ttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  361 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcga 460  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18856953 tcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcga 18857052  T
Q  461 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857053 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 18857152  T
Q  561 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 660  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18857153 ctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacaca 18857252  T
Q  661 atgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  18857253 atgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 18857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 22987236 - 22987903
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   | ||    
T  22987236 catacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatat 22987335  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  22987336 ctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 22987435  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||||||| ||||||    
T  22987436 tgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagttt 22987535  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| | || |||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  22987536 gttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcat 22987635  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  22987636 tccaatactagaatgataattgttattgtacatgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 22987735  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  22987736 tcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactct 22987835  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22987836 tccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 288 - 701
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040575
Alignment:
Q  288 ctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcat 387  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcat 22040261  T
Q  388 ctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040262 ctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 22040361  T
Q  488 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 587  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22040362 atccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatct 22040461  T
Q  588 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 687  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  22040462 caatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctc 22040561  T
Q  688 acaatttccttgat 701  Q
    ||||| ||||||||    
T  22040562 acaatctccttgat 22040575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 140 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22378079 - 22377528
Alignment:
Q  140 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22378079 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22377980  T
Q  240 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22377979 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22377880  T
Q  340 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 439  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22377879 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22377781  T
Q  440 tattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 539  Q
    |||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22377780 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22377681  T
Q  540 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 639  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  640 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 140 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22384254 - 22383703
Alignment:
Q  140 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22384254 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22384155  T
Q  240 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22384154 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22384055  T
Q  340 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 439  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22384054 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22383956  T
Q  440 tattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 539  Q
    |||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22383955 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22383856  T
Q  540 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 639  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  640 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20396868 - 20396199
Alignment:
Q  23 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 122  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  | |||||    
T  20396868 acttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctg 20396769  T
Q  123 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 222  Q
    |||  ||||||| ||  |  | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20396768 atacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctga 20396669  T
Q  223 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 322  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| || ||| |||||||||||||| |    
T  20396668 aactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgtt 20396569  T
Q  323 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcc 422  Q
    |||| || ||| |||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||    
T  20396568 gaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcc 20396469  T
Q  423 aatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 522  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  20396468 aatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcc 20396369  T
Q  523 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 622  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  20396368 tccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcc 20396269  T
Q  623 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| | |||||||||    
T  20396268 aaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Original strand, 20388134 - 20388794
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| || |||||| | ||  | ||    
T  20388134 catacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagatat 20388233  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || |||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   || ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  20388234 ctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttct 20388333  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| |  |||||     
T  20388334 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgacctttttt-gtagtc 20388432  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    || ||||| || ||| |||| || || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| || || |||||||    
T  20388433 tgatgaactatatctcgtcccaacactacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgcca 20388532  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||| || || || || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  20388533 tgccaatactcgaatggtaactgttgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaa 20388632  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  20388633 atcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaactt 20388732  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20388733 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 223 - 690
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949624
Alignment:
Q  223 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 322  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  323 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcc 422  Q
     ||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  23949258 -aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattcc 23949356  T
Q  423 aatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 522  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  23949357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtct 23949456  T
Q  523 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 622  Q
    || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| ||||    
T  23949457 tccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttcc 23949556  T
Q  623 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 690  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23949557 aaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 680
Target Start/End: Original strand, 19851448 - 19852106
Alignment:
Q  22 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19851448 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19851547  T
Q  122 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 221  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  19851548 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19851647  T
Q  222 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 321  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |      
T  19851648 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaa 19851747  T
Q  322 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattc 421  Q
    ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||| |    
T  19851748 tgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccatac 19851847  T
Q  422 caatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 521  Q
    ||||||||||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19851848 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19851947  T
Q  522 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 621  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19851948 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19852047  T
Q  622 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852048 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 680
Target Start/End: Original strand, 19857484 - 19858142
Alignment:
Q  22 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19857484 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19857583  T
Q  122 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 221  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  19857584 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19857683  T
Q  222 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 321  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |      
T  19857684 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaa 19857783  T
Q  322 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattc 421  Q
    ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||| |    
T  19857784 tgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccatac 19857883  T
Q  422 caatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 521  Q
    ||||||||||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19857884 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19857983  T
Q  522 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 621  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19857984 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19858083  T
Q  622 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858084 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 1266274 - 1266945
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  1266274 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 1266373  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  1266374 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 1266473  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||| | ||| |||||| || |    
T  1266474 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttacctt-ctcagtcgtct 1266572  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| || || ||||||||    
T  1266573 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1266672  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  1266673 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1266772  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  1266773 tcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctct 1266872  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  1266873 tccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 23654962 - 23655634
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |  |||  |||| |||| |||  | ||  | ||    
T  23654962 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatat 23655061  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  || ||||| ||     
T  23655062 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtct 23655161  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  23655162 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 23655261  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  23655262 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23655361  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     | |||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23655362 actaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 23655461  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |    
T  23655462 tcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactct 23655561  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  23655562 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 31417220 - 31416548
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  31417220 catacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 31417121  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| || || || || |||    
T  31417120 ctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31417021  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    |||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||  |||||||  ||||||||||||||    
T  31417020 tgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttccctt--atcatcttgactttctcagtagt 31416923  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || || || |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  31416922 ctgatgcactaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 31416823  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || | |||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31416822 atactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaaca 31416723  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31416722 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaact 31416623  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  31416622 cttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 22062179 - 22061507
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22062179 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgatat 22062080  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  22062079 ttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 22061980  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  22061979 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtct 22061880  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  22061879 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 22061780  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  22061779 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaa 22061680  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    | ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |    
T  22061679 tactccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactct 22061580  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22061579 tccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 29304172 - 29303500
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||  ||||    
T  29304172 catacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaattctctctgaaat 29304073  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  29304072 ctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29303973  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |||| |||||||||||||     
T  29303972 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtc 29303874  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  29303873 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 29303774  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||    
T  29303773 tacctatactcgaatgatagttgttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaa 29303674  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||     
T  29303673 atcatccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactc 29303574  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29303573 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 14565177 - 14565846
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || | || |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  14565177 catacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 14565276  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  14565277 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14565376  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  14565377 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 14565476  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  14565477 cgtgaaccaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 14565576  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14565577 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 14565676  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  14565677 tcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 14565776  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14565777 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20010646 - 20009974
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20010646 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20010547  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20010546 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20010447  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||| || |||||  |||| |    
T  20010446 tgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtct 20010347  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| |||||  || || ||||||||    
T  20010346 gatgaactaaatctggtcccaacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccat 20010247  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  20010246 accaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 20010147  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  20010146 tcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactct 20010047  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20010046 tccaaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 6679146 - 6679815
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  6679146 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 6679245  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  6679246 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6679345  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  6679346 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6679445  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  6679446 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 6679545  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  6679546 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 6679645  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  6679646 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 6679745  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6679746 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 21840452 - 21841124
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21840452 catacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21840551  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||| | ||||| | |||||| || ||||| ||     
T  21840552 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttagaaacacatgatctccctct 21840651  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  21840652 tgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 21840751  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  21840752 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21840851  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || || || |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21840852 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 21840951  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| |    
T  21840952 tcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactct 21841051  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21841052 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 804419 - 803750
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  804419 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 804320  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  804319 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 804220  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   ||||||| |||||| |    
T  804219 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtct 804120  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  804119 cgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 804020  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  804019 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 803920  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  803919 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 803820  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  803819 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 31571588 - 31570917
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  31571588 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 31571489  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  31571488 ctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 31571389  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  31571388 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 31571289  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  31571288 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 31571189  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  31571188 tcctatactcgaatgataactattgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 31571089  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  31571088 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 31570989  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570988 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 6603693 - 6604362
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  6603693 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 6603792  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  6603793 ttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6603892  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  6603893 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6603992  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  6603993 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 6604092  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  6604093 accaatactcgagtgatagctgttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 6604192  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  6604193 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 6604292  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6604293 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Original strand, 12304793 - 12305462
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  12304793 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaat 12304892  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || || |||    
T  12304893 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcc 12304992  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  12304993 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 12305092  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  12305093 catgaaccaagtccggtcccaacacagcactctcacccgactcaaaccagcataaaggggtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 12305192  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  12305193 accaatgctcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 12305292  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| |    
T  12305293 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactct 12305392  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12305393 tccagaacatagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 130 - 691
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051569
Alignment:
Q  130 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || || || || || ||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  230 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 329  Q
    |  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| || || || ||||| |     
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaa 22051207  T
Q  330 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatacta 429  Q
     |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| || |||||     
T  22051208 atctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactc 22051307  T
Q  430 gaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 529  Q
    ||||| || || || || || || ||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  22051308 gaatggtaactgttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacg 22051407  T
Q  530 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 629  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  22051408 attggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacct 22051507  T
Q  630 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    ||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22051508 agaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 292
Target Start/End: Original strand, 22032067 - 22032339
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| ||||| ||||| | ||    
T  22032067 catacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatat 22032166  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||   |||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22032167 ctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcc 22032266  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 292  Q
    | |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22032267 taaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 355 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 20976062 - 20975725
Alignment:
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || |    
T  20976062 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20975963  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  20975962 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgacc 20975863  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  20975862 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatct 20975763  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20975762 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21682217 - 21681856
Alignment:
Q  19 tcatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |    
T  21682217 tcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagata 21682118  T
Q  119 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||    
T  21682117 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 21682018  T
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||     
T  21682017 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 21681918  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 380  Q
    || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21681917 tgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagt 21681856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 352 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 16271638 - 16271301
Alignment:
Q  352 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 451  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16271638 tcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16271539  T
Q  452 ttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 551  Q
    | || || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  16271538 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 16271439  T
Q  552 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 651  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  16271438 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatcccta 16271339  T
Q  652 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16271338 tccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 20007885 - 20008262
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20007885 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 20007984  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20007985 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 20008084  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  20008085 tggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtct 20008184  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccat 397  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  |||| ||||||||||    
T  20008185 gatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcatgcacctccgaccat 20008262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21325156 - 21324804
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaa-gatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   | |    
T  21325156 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctatgata 21325057  T
Q  119 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||    
T  21325056 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 21324957  T
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||     
T  21324956 ctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 21324857  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagca 371  Q
    || ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  21324856 tgatgaaccaaatccggtcccaacaccacactatctcctgactcaaaccagca 21324804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 23948924 - 23949162
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || | ||||  | ||    
T  23948924 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatat 23949023  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23949024 ctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23949123  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 258  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||    
T  23949124 tgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Original strand, 15441216 - 15441420
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15441216 catacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15441315  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15441316 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15441415  T
Q  220 tgaaa 224  Q
    |||||    
T  15441416 tgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 689
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  472 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 571  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  572 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 671  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  672 aacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 460 - 692
Target Start/End: Original strand, 22371415 - 22371647
Alignment:
Q  460 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 559  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  22371415 atcaacggtaggtgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctg 22371514  T
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    | ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||    
T  22371515 tttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacac 22371614  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  22371615 aatactcgatggaagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 16877716 - 16877181
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  16877716 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 16877617  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16877616 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16877517  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16877516 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16877417  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16877416 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16877317  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  16877316 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16877217  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877216 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 680
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315886
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |||||||  || |||||||        |||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaacttccggtcctacccaagaactttcacct 22315563  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| || || | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  22315564 gactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 22315663  T
Q  458 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 557  Q
    | |||||||| |||     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| |||||||| || |    || ||| |||||||||| ||| |||||    
T  22315664 caatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcttccaaactctaaatagtcctctccgtctgcccatc 22315763  T
Q  558 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 657  Q
      |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| | ||| ||     
T  22315764 actctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaaacctcggatcccgatccgac 22315863  T
Q  658 acaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315864 acaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21197123 - 21196588
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| || || ||||| | |||| | |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21197123 gtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctct 21197024  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21197023 tatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21196924  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  21196923 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 21196824  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||    
T  21196823 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctct 21196724  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
      | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21196723 atgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcgg 21196624  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196623 attccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16265364 - 16265127
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  16265364 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 16265265  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16265264 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcc 16265165  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16265164 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 574 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129005
Alignment:
Q  574 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  674 caccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
     |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22129032 taccatgcaacctcacgatctccttgat 22129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21850958 - 21850423
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  21850958 gtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcctct 21850859  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || ||||| |     
T  21850858 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggccctaacaa 21850759  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  21850758 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaactgttg 21850659  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  21850658 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 21850559  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21850558 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21850459  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850458 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 20652954 - 20652635
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | ||||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| ||||| | ||    
T  20652954 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcctct 20652855  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || || | ||| |||||||| |     
T  20652854 tataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaacaa 20652755  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || |||| ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||     
T  20652754 ggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactattg 20652655  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaa 464  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  20652654 ttgtaagtaaactcaatcaa 20652635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 22982596 - 22983128
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||| | || | ||||| |||||| | || || ||  |||||||||||| ||||||||  |  |    
T  22982596 gtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcaccttt 22982695  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || ||| |||  ||    
T  22982696 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggttcta--ac 22982793  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
     |  |  |||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |  | ||     
T  22982794 aaagcactcacttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaatgaaaattgttg 22982893  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||    | |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  22982894 ttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 22982993  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  22982994 ctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 22983092  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983093 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Original strand, 28982392 - 28982632
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28982392 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28982491  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  28982492 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28982591  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 260  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28982592 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Original strand, 28987612 - 28987852
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28987612 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28987711  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  28987712 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28987811  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 260  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28987812 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 349 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 23157428 - 23157098
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| | || || || |    
T  23157428 ctttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 23157329  T
Q  449 aagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 548  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || ||||||     
T  23157328 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcca-aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgt 23157230  T
Q  549 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 648  Q
    | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||     
T  23157229 cggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcc 23157130  T
Q  649 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157129 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 27347261 - 27347436
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |  ||||| |||  ||| ||||| || |||||  | ||  ||||    
T  27347261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaat 27347360  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 195  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  27347361 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 655 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 680
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  531 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 630  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  631 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 694
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  568 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 667  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  668 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 694  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 694
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  568 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 667  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  668 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 694  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 434
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863506
Alignment:
Q  151 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 250  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  251 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 350  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19863422  T
Q  351 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatg 434  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19863423 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19863506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 434
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868143
Alignment:
Q  151 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 250  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  251 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 350  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19868059  T
Q  351 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatg 434  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19868060 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19868143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 546; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 414 - 1095
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  414 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 513  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 613  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 713  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||    
T  714 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcat 813  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  814 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 913  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  914 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1013  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  1014 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 43154 - 43837
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43154 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccgttccaactctttccaatat 43253  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43254 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 43353  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43354 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 43453  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  43454 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatataaagcctcgaaaggtgccat 43553  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554 tccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 43653  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43654 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 43753  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  43754 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 8485 - 9155
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  8485 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactctttccaatat 8584  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8585 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 8684  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8685 taaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 8784  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  8785 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 8884  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  8885 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 8973  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8974 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 9073  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  9074 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 9155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 314 - 701
Target Start/End: Original strand, 15241 - 15617
Alignment:
Q  314 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaagg 413  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  15241 tagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaagg 15340  T
Q  414 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15341 tgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac---------- 15430  T
Q  514 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 613  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15431 -acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgca 15529  T
Q  614 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15530 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 50785 - 50148
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  50785 tgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 50686  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||| |    
T  50685 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgaca 50586  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttt 352  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||    
T  50585 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacacttt 50488  T
Q  353 cacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 452  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  50487 cccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagt 50388  T
Q  453 taactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 552  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||    
T  50387 aaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactga 50288  T
Q  553 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 652  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  50287 ccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 50188  T
Q  653 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  50187 ttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 186 - 317
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13963
Alignment:
Q  186 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 285  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  286 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 106754 - 106226
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||| | || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  106754 gtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 106655  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | ||||||||| |||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  106654 tatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 106555  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| |  || |||||||| |||||||| || || || |||| ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| | || ||     
T  106554 agcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatactagaatgaaaactgttg 106455  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    ||||| || |  ||||||  ||||||||||||||| |    ||| || |||||||    
T  106454 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctggatagtcctct 106355  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
     || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  106354 tcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 106255  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106254 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 620 - 1301
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  620 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 719  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  720 ttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 819  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  820 tgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtct 919  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  920 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 1019  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020 tccaatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 1119  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1120 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1219  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  1220 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 14360 - 15041
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14360 catacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14459  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14460 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcc 14559  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14560 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14659  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14660 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14759  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14760 tccaatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 14859  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14860 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttt 14959  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14960 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgat 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 532; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7620
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaaga-tgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6937 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 7036  T
Q  119 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaa-acacgtggtctcctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7037 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctcctt 7136  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7137 cttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagt 7236  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  7237 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcc 7336  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7337 attccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaaca 7436  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7437 aatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 7536  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  7537 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 65405 - 66086
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  65405 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 65504  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  65505 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 65604  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  65605 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 65704  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  65705 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 65804  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65805 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 65904  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65905 tcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 66004  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  66005 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 239 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39466
Alignment:
Q  239 tacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcc 338  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  339 taagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatag 438  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39806 taagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataa 39707  T
Q  439 ctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 538  Q
    || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706 ctgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcg 39607  T
Q  539 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39606 tcctctccgactga-catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaa 39508  T
Q  639 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39507 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40095 - 39926
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  40095 catacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccgttccaactctttcccatat 39996  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 189  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  39995 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacagga 39926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 496; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 7377 - 8047
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  7377 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatat 7476  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7477 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 7576  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7577 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 7676  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  7677 gttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 7776  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  7777 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 7865  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7866 tcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 7965  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7966 tccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 33879 - 33198
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  33879 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 33780  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33779 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcc 33680  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33679 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 33580  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33579 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 33480  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 33380  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33379 tcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 33280  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  33279 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 33198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Original strand, 8596 - 9277
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  8596 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 8695  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  8696 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 8795  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  8796 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 8895  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8896 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 8995  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 9095  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9096 tcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 9195  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  9196 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4030
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  4711 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 4612  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  4611 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 4512  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4511 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 4412  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4411 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 4312  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 4212  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4211 tcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 4112  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  4111 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 463; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 279136 - 278458
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  279136 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 279037  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  279036 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 278937  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  278936 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 278837  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  278836 gctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 278737  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  278736 tccaatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 278637  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  278636 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactct 278537  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  278536 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Original strand, 308659 - 308981
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  308659 catactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 308758  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  308759 ctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 308858  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  308859 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 308958  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  308959 gctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 165015 - 164538
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  165015 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 164916  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  164915 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 164816  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  164815 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 164716  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  164715 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcat 164616  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 497  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  164615 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 164538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 260308 - 260979
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  || || ||||  |||| ||| |||||||||| ||   | ||  ||||    
T  260308 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaat 260407  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  260408 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 260507  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  260508 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 260607  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  260608 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 260707  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||  || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  260708 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 260807  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  260808 tcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 260907  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  260908 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 6372 - 7044
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  6372 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccaccatcccaactctttccaatat 6471  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6472 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 6571  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6572 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagttt 6671  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6672 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 6771  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6772 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 6871  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6872 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 6971  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6972 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 382 - 687
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3458
Alignment:
Q  382 ctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatccc 481  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3153 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 3252  T
Q  482 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 581  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3253 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaact 3352  T
Q  582 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 681  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  3353 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgt 3452  T
Q  682 agcttc 687  Q
    | ||||    
T  3453 aacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 701
Target Start/End: Original strand, 7519 - 8078
Alignment:
Q  142 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 7618  T
Q  242 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 341  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7619 gcttatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaa 7718  T
Q  342 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagcta 441  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7719 gaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 7818  T
Q  442 ttattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 541  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7819 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttc 7918  T
Q  542 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 641  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7919 tctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 8018  T
Q  642 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8019 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgat 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 701
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8471
Alignment:
Q  84 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  184 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 283  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  284 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 383  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttct 8153  T
Q  384 gcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 483  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 gcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 8253  T
Q  484 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8254 gttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactca 8353  T
Q  584 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 683  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8354 atctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaa 8453  T
Q  684 cttcacaatttccttgat 701  Q
    | |||||||  |||||||    
T  8454 cctcacaatcaccttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 64337 - 63659
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  64337 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 64238  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64237 ctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 64138  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  64137 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 64038  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  64037 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 63938  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  63937 tccaatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 63838  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |    
T  63837 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactct 63738  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  63737 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 6023 - 6695
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  6023 catacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 6122  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6123 ctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 6222  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6223 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 6322  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6323 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccat 6422  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  6423 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 6522  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  6523 tcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttt 6622  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6623 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 1830 - 1158
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  1830 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgatat 1731  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||| |  ||    
T  1730 ctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacc 1631  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||||  |||| |    
T  1630 tgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtct 1531  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  1530 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1431  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  1430 tccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1331  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  1330 tcctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctct 1231  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1230 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 406
Target Start/End: Original strand, 22819 - 23080
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  22819 gtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 22918  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22919 tatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 23018  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcct 406  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||||| ||||||||    
T  23019 agcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagcct 23080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 697
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6691
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||    
T  6014 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccaccattccaactctttctaatat 6113  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  6114 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctct 6213  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6214 tgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 6313  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6314 gctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 6413  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6414 tccaatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaa 6513  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  6514 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 6613  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 697  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6614 tccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 701
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22548
Alignment:
Q  85 actcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  185 taggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  285 tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctg 384  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctg 22231  T
Q  385 catctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22232 catctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaag 22331  T
Q  485 ttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 584  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332 ttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaa 22431  T
Q  585 tctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 684  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22432 tttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaac 22531  T
Q  685 ttcacaatttccttgat 701  Q
     ||||||| ||||||||    
T  22532 ctcacaatctccttgat 22548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 694
Target Start/End: Original strand, 676 - 1350
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| |||||||  ||||| | ||    
T  676 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccaccattccaaccctttccgatat 775  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  776 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 875  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  876 tgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 975  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  976 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccat 1075  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||     
T  1076 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttccttcttgctcaagtacgcaaaccctcaacaag 1175  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  1176 tcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttt 1275  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 694  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1276 tccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 451
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||  | ||    
T  1128 catacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgatattccacctttccatctttttcttatat 1029  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  1028 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttct 930  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  929 tggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 830  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  829 gttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 730  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  729 tccaatactggaatgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaa 630  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  629 tcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttt 530  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  529 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 14039 - 14711
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14039 catacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14138  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || |||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  14139 ctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttct 14238  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||    
T  14239 tgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagttt 14338  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14339 gctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 14438  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14439 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaa 14538  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  14539 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttt 14638  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14639 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 238 - 701
Target Start/End: Original strand, 17660 - 18122
Alignment:
Q  238 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 337  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtc 17759  T
Q  338 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17760 ctaagaccactctttcacctgactcaa-ccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 17858  T
Q  438 gctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 537  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17859 actattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaatt 17958  T
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17959 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaa 18058  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  18059 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaatctccttgat 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 31410 - 32082
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  31410 catacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaacctatcagatat 31509  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||| || | ||| ||     
T  31510 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctct 31609  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||  |||||||    
T  31610 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctatgtagttt 31709  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || | ||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  31710 gatgaaccaaatccgatcccaacacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 31809  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
      ||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  31810 atcaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaa 31909  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  31910 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 32009  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  32010 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 624 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  624 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 328
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | ||    
T  999 catacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatat 900  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||     
T  899 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaaaa-cacgtggtctccttct 801  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  800 tgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 701  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  700 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcat 601  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 501  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  500 tcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 401  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  400 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 692
Target Start/End: Original strand, 5229 - 5893
Alignment:
Q  28 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 127  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||      
T  5229 cgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgataca 5328  T
Q  128 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 227  Q
    ||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  5329 gaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactc 5428  T
Q  228 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaca 327  Q
    ||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  5429 aagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaaca 5528  T
Q  328 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatac 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5529 atctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatac 5628  T
Q  428 tagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctag 527  Q
    | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  5629 tggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcttctag 5728  T
Q  528 cgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 627  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5729 cgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 5828  T
Q  628 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5829 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 229043 - 229715
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  229043 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 229142  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  229143 ctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 229242  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  229243 tgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 229342  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  229343 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaaacctcataaggtgccat 229442  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  229443 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 229542  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  229543 tcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttt 229642  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  229643 tccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 219723 - 219051
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  219723 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 219624  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  219623 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttct 219524  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  219523 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 219424  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  219423 gttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccat 219324  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  219323 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 219224  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  219223 tcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 219124  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  219123 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 33176 - 32667
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  33176 gtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 33077  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta--ag 342  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||| ||||  |     
T  33076 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctgggcctaacaa 32977  T
Q  343 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 442  Q
    | ||||||    || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| | || |    
T  32976 agcactct----ccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 32881  T
Q  443 tattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 542  Q
    | || ||||| ||||| | |||||| | |      |||||  |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |     ||||| |||||    
T  32880 tgttgtaagtaaactcaaccaacggtaaacattcgtcccacctaacaccttgctccaacacacaagatctcaacaaatcttccaaactttgaatagtcct 32781  T
Q  543 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 642  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  32780 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 32681  T
Q  643 ggatctctatctga 656  Q
    ||||| | ||||||    
T  32680 ggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 9343 - 10015
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  9343 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 9442  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||     
T  9443 ctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttct 9542  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  9543 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagttt 9642  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |    
T  9643 gttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccct 9742  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||  ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  9743 tccaatactagaatgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaag 9842  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||| |    
T  9843 tcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactct 9942  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9943 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 692
Target Start/End: Original strand, 49506 - 50165
Alignment:
Q  33 ttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggacca 132  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  133 atgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 232  Q
    || ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  233 cttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 332  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  333 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaa 432  Q
      ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 49905  T
Q  433 tgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgact 532  Q
    ||||| |||||||| || || ||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||    
T  49906 tgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgact 50005  T
Q  533 gaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 632  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50006 gaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 50105  T
Q  633 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50106 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 539 - 698
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  539 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  639 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 598 - 698
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  598 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 697  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  698 t 698  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 180217 - 180877
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| ||||  | ||    
T  180217 catacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactgttctaactctttctgatat 180316  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || || ||     
T  180317 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 180416  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  180417 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 180516  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  180517 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcat 180616  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  180617 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacccaaactctcaacaaa 180716  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||||                  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  180717 tcctctag------------------cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgt 180798  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  180799 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 180877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 414 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 101464 - 101186
Alignment:
Q  414 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 513  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  101464 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctc 101365  T
Q  514 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 613  Q
    |||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  101364 aacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgca 101265  T
Q  614 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  101264 aactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 15385 - 14713
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  15385 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 15286  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||| | || || |||||||||    
T  15285 ctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcc 15186  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  15185 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 15086  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  15085 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccat 14986  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14985 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 14886  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  14885 tcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttt 14786  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14785 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 33058 - 32387
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  33058 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 32959  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  32958 ctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 32859  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32858 taaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagttt 32759  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  32758 gttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccat 32659  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  32658 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 32559  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  32558 tcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactct 32459  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32458 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 271 - 701
Target Start/End: Original strand, 12738 - 13168
Alignment:
Q  271 tgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagc 370  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaac 12837  T
Q  371 acaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  12838 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaag 12937  T
Q  471 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 570  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12938 atgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 13037  T
Q  571 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 670  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 13137  T
Q  671 gaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 701  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13138 gaacaccatgtaacttcacaatctccttgat 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 14877 - 15549
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatat 14976  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||||||||     
T  14977 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttca 15076  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15077 tgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15176  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15177 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccat 15276  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  15277 tccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaag 15376  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15377 tccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 15476  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15477 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 460 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 113353 - 113121
Alignment:
Q  460 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 559  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  113353 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctg 113254  T
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113253 tctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatac 113154  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  113153 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 26839 - 26167
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||  | ||    
T  26839 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgatat 26740  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26739 ctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcc 26640  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  26639 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 26540  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| | | ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||    
T  26539 gttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 26440  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  26439 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 26340  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  26339 tcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 26240  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26239 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 196008 - 195338
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  196008 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgatat 195909  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  195908 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcc 195810  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  195809 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtct 195710  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||    
T  195709 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccat 195610  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| | ||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||    
T  195609 accaatactcggatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaa 195510  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||  |  || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| |    
T  195509 tccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactct 195411  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  195410 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 688
Target Start/End: Original strand, 148570 - 149238
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  148570 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatat 148669  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  148670 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctct 148769  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |  |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||   ||||||||  |||| |    
T  148770 tagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcctgactttctctatagtct 148869  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||  || || || |||||    
T  148870 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccat 148969  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || ||  | || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  148970 accaatactcgaatggtaactgctgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 149069  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| |    
T  149070 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactct 149169  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  149170 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 68746 - 68577
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  68746 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 68647  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 189  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  68646 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 68577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 122131 - 121841
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  122131 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 122032  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || ||| |||  || ||||  || | |||||| |     
T  122031 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaacttccgttcctaacaa 121932  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  121931 aacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatactagaatga 121841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 467
Target Start/End: Original strand, 180151 - 180371
Alignment:
Q  247 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 346  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |  |    
T  180151 tcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtcctaacaaaa 180250  T
Q  347 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 446  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  180251 cactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 180350  T
Q  447 ataagttaactcgatcaacgg 467  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  180351 gtaagtaaactcaatcaacgg 180371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 112021 - 112693
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  112021 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 112120  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  112121 ctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 112220  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| || |||||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  112221 tgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagttt 112320  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||| |||    
T  112321 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcat 112420  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    | |||||||||||||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  112421 ttcaatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 112520  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  112521 tcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 112620  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  112621 tccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 203774 - 203102
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||   | ||    
T  203774 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactcttttagatat 203675  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| | || ||||||| | |||||| |||||||||||     
T  203674 ctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttct 203575  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| |    
T  203574 tgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagcttaaccttttatgtagtct 203475  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| |  ||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  203474 ggtgaacaatattcggtcccaacactacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccat 203375  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||| ||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  203374 tcctatactagaatggtaacttttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 203275  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  203274 tcctctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttt 203175  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  203174 tccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 117568 - 118240
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  117568 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 117667  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  117668 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 117767  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  117768 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtat 117867  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||  | || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  117868 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 117967  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  117968 accaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 118067  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  118068 tcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 118167  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  118168 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 322704 - 323376
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  | ||  | ||    
T  322704 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgatat 322803  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  322804 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 322903  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  322904 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtct 323003  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || || || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||| |||||| || || ||||||||    
T  323004 gatgaaccaaatccggacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccat 323103  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  323104 accaatactggaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 323203  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  323204 tcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactct 323303  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  323304 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 385819 - 386491
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  385819 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 385918  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |  || ||||| ||     
T  385919 ctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctct 386018  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  386019 tgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtct 386118  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |  ||  |||||||    
T  386119 aatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccat 386218  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  386219 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 386318  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  386319 tcctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 386418  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  386419 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 26025 - 25353
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  26025 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacggttccaattctttctgatat 25926  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| || | || |  ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  25925 ctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcc 25826  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||  || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  25825 tgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagttt 25726  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||||| || || ||||||||    
T  25725 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 25626  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  25625 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaag 25526  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  25525 tcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 25426  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25425 tccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1659
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  1005 catactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatat 1104  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||     
T  1105 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttct 1204  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  1205 ttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctta-atcgtcttaaccttctcagtagttt 1303  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||     ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1304 gttg-----tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 1398  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1399 tccaatactagaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaa 1498  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  1499 tcttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 1598  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1599 tccaaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 688
Target Start/End: Original strand, 4032 - 4699
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||  | ||    
T  4032 catacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatat 4131  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  4132 ctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 4231  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4232 taaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 4331  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| || |  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4332 attgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgca-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccat 4430  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  4431 tccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaag 4530  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |    
T  4531 tccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactct 4630  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4631 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 908 - 1580
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  908 catacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatat 1007  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1008 ctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcc 1107  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || || || |||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  1108 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagttt 1207  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| || || ||||||||    
T  1208 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccat 1307  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1308 tccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaa 1407  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  1408 tcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 1507  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1508 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 3140 - 3812
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||    
T  3140 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaatat 3239  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  3240 ctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 3339  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3340 tgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 3439  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | || || || ||||| || ||    || || |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  3440 gttgcacgatttctggccccaaatttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccat 3539  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  3540 tccaatactagaatggtaactgttattgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaag 3639  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  3640 tctttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 3739  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3740 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 117211 - 116539
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  | ||    
T  117211 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatat 117112  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| || || |||| |||     
T  117111 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttct 117012  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  117011 tgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 116912  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||||| || | | ||||| |||| |||    
T  116911 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtcat 116812  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  116811 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaag 116712  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  116711 tcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 116612  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  116611 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 617
Target Start/End: Original strand, 98140 - 98612
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  98140 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcctct 98239  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  98240 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 98339  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||| ||| |||| || ||||||| |||| | || ||     
T  98340 aacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatactagcatgaaaactgttg 98439  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  98440 ttgaaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 98539  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98540 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 127505 - 126911
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  127505 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaactctttctgatat 127406  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  127405 ctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttct 127306  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  127305 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 127206  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  127205 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 127106  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  127105 tccaatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 127006  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 614  Q
    |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  127005 tcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgttgaactcaacctcaacttagaacataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 501 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  501 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 600  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  601 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 569
Target Start/End: Original strand, 1139 - 1688
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  1139 catacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 1238  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1239 ctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttct 1338  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  1339 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 1438  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1439 gttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 1538  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1539 ttcaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 1638  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 569  Q
    || || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1639 tcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 560 - 692
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 97 - 692
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9642
Alignment:
Q  97 accgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactc 196  Q
    |||||||||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  197 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 296  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  297 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 396  Q
     |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctacca 9346  T
Q  397 ttcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9446  T
Q  497 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 596  Q
    |||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  9447 caagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttaga 9546  T
Q  597 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9547 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 351
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||| | |||| | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  514 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 415  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 308  Q
    | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  414 tatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 331 - 216
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | || || || || ||||||  |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  331 ctttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 232  T
Q  449 aagttaactcgatcaa 464  Q
    |||| ||||| |||||    
T  231 aagtaaactcaatcaa 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 197 - 692
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16327
Alignment:
Q  197 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 296  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  297 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 396  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  397 ttcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 496  Q
       ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16131  T
Q  497 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 596  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16132 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 16231  T
Q  597 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16232 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 15493 - 15829
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15493 catacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatat 15591  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  15592 ctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttct 15691  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  15692 tgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 15791  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15792 gttgaacaatctcgagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16722 - 16050
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||| | ||||  | ||    
T  16722 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccaccattccaattctttctgatat 16623  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  ||| |||| || ||||| || || ||||||||     
T  16622 cttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttct 16523  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||   |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16522 tgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 16423  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||   |||| |||||||||||| |||| |||    
T  16422 gttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcat 16323  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  16322 tgcaatactagaatgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaag 16223  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |    
T  16222 tcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactct 16123  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16122 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 25377 - 24702
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  25377 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctttccgatat 25278  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |  ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| |     
T  25277 ctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgct 25178  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||   || | || ||| || || ||||| |    
T  25177 tgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtct 25078  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||| |||    
T  25077 ggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcat 24978  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     | ||||||||||||||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24977 ccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaa 24878  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24877 tcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttt 24778  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  24777 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 121 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 628
Alignment:
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  321 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccatt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccatt 686  T
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactat 478  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  685 ccaatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 12633
Alignment:
Q  21 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || || ||||||||||||| ||| || ||| |||| | | ||||  | |||    
T  13282 atacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatc 13183  T
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    ||||| | || ||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13182 tgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttctt 13083  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 320  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13082 gaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttg 12983  T
Q  321 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccatt 420  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||  | || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||| || ||| || || |||||||||    
T  12982 ctgaagaatttctggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccatt 12883  T
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 520  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  12882 ccaatactagaatggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagt 12783  T
Q  521 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 620  Q
    | || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12782 cttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactctt 12683  T
Q  621 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 670  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12682 ccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 307 - 680
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6709
Alignment:
Q  307 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcct 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6336 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 6435  T
Q  407 caaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 506  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436 catagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 6535  T
Q  507 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 606  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||    
T  6536 aaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcc 6635  T
Q  607 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6636 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 6273 - 6333
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaa 80  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6273 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5896 - 5225
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| || || || |||||| |||   ||||    
T  5896 catacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaat 5797  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| | |||| | ||| |||| | ||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  5796 atgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttct 5697  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   |||| || ||| ||||| || ||||    
T  5696 tgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgttt 5598  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||||| || |||||||  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || || || |||| |||    
T  5597 gttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaacacaacggagttctgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcat 5498  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5497 tccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaagattactatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaa 5398  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |    
T  5397 tcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaaccct 5298  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5297 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 219 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 4561 - 4085
Alignment:
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||  || |||||||||    
T  4561 ctgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtt 4462  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  4461 tgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgcca 4362  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  4361 ttccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaa 4262  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  4261 atcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 4162  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 695  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4161 ttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 404 - 692
Target Start/End: Original strand, 130532 - 130820
Alignment:
Q  404 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  130532 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 130631  T
Q  504 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 603  Q
    ||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  130632 acataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaa 130731  T
Q  604 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130732 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 238 - 692
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59426
Alignment:
Q  238 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 337  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||  |||||||  |  ||||| || ||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccggtc 59071  T
Q  338 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 437  Q
    |||  |||||  | | ||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  59072 ctagtaccacattcttaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggta 59171  T
Q  438 gctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 537  Q
     || ||||| ||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  59172 actgttattgtacatgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatt 59271  T
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  59272 gtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaa 59371  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||    
T  59372 atcttggatctctatctgatacaatacttgacggaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 542 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  542 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  642 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 404 - 506
Target Start/End: Original strand, 134626 - 134728
Alignment:
Q  404 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  134626 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 134725  T
Q  504 aca 506  Q
    |||    
T  134726 aca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  34 tgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaa 133  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||| |||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  134 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 184  Q
    | ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 37052 - 36974
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| |||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  37052 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 334 - 692
Target Start/End: Original strand, 10 - 368
Alignment:
Q  334 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  434 gatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 533  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactg 209  T
Q  534 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 633  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  210 aatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaa 309  T
Q  634 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  310 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 11045 - 10425
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  11045 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactgttccaactttctcagatat 10946  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  10945 ctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 10846  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||  ||  | ||||| ||||| |    
T  10845 tgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatcaattg-gccttctctgtagtct 10747  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  10746 gttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccat 10647  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  10646 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacactatcaacgacaagtgactattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 10547  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  10546 tcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttt 10447  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatct 641  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  10446 tcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 3875 - 4547
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3875 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagatat 3974  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||     
T  3975 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctct 4074  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  4075 tgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 4174  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||    
T  4175 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccat 4274  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     ||||||||  |||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  4275 accaatactcaaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaa 4374  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  4375 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 4474  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4475 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 493
Target Start/End: Original strand, 2 - 475
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||    
T  2 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgatat 101  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |  || ||     
T  102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctct 201  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||| |    
T  202 tgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtct 301  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  302 gctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgccat 401  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 493  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  402 tccaatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttccacctt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33311
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  33983 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 33884  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  33883 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 33784  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||    
T  33783 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagt 33686  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  33685 ttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgcc 33586  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  33585 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaata 33486  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
     ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33485 gatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaact 33386  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33385 cttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 40383 - 40918
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  40383 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 40482  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  40483 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 40582  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  40583 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 40682  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  40683 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 40782  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  40783 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 40882  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40883 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 91238 - 90566
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  91238 catacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 91139  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  91138 ctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 91039  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  91038 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 90939  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  90938 gatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 90839  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  90838 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaa 90739  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||||||||| |    
T  90738 tcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactct 90639  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  90638 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 476
Target Start/End: Original strand, 448060 - 448515
Alignment:
Q  21 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||     
T  448060 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatt 448159  T
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  448160 tgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttctt 448259  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 320  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  448260 gaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 448359  T
Q  321 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccatt 420  Q
     |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  448360 ttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaatggtgccatt 448459  T
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgact 476  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||    
T  448460 ccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgggaggtgact 448515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 460 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 391066 - 390834
Alignment:
Q  460 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 559  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  391066 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctg 390967  T
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390966 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatac 390867  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  390866 aatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 162113 - 162376
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  162113 catacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 162212  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  162213 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttct 162312  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 283  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  162313 tgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 382 - 635
Target Start/End: Original strand, 114542 - 114795
Alignment:
Q  382 ctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatccc 481  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| || || ||  | ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  114542 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 114641  T
Q  482 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 581  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  114642 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 114741  T
Q  582 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 635  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114742 caacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 188
Target Start/End: Original strand, 175361 - 175431
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 188  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  175361 atctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  607 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 78810 - 78666
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  78810 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 78711  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 289  Q
    | |||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||    
T  78710 tatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttct 78666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 42639 - 41970
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  42639 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 42540  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  42539 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 42440  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  42439 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 42340  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  42339 gatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 42240  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  42239 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 42140  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  42139 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactct 42040  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  42039 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 47705 - 47033
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  47705 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 47606  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  47605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 47506  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  47505 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 47406  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  47405 gatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 47306  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  47305 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 47206  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  47205 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactct 47106  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  47105 tccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 439 - 688
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2589
Alignment:
Q  439 ctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 538  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2340 ctattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcg 2439  T
Q  539 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2440 ttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaa 2539  T
Q  639 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2540 cctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 19983 - 20655
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  19983 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatat 20082  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  20083 ctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 20182  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  | ||||||  |||| |    
T  20183 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtct 20282  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||| |||    
T  20283 gatgaaccaaatccggtcccaagacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 20382  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20383 accaatactcgaatggtaacttttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 20482  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  20483 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 20582  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20583 tccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13667 - 12995
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  13667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 13568  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || || |||    
T  13567 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcc 13468  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  13467 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 13368  T
Q  320 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||    
T  13367 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 13269  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  13268 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 13169  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  13168 atcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 13069  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13068 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 17437 - 16765
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  17437 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 17338  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  17337 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 17238  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  17237 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 17138  T
Q  320 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||    
T  17137 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 17039  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  17038 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 16939  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  16938 atcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 16839  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16838 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 662
Target Start/End: Original strand, 27519 - 28161
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27519 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 27618  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  27619 cttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcc 27718  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  27719 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtct 27818  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||||    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||| | || || ||||||||    
T  27819 gatgaaccgaatctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccat 27918  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || || || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  27919 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 28018  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  28019 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactct 28118  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 662  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28119 tccaaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 1454 - 787
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||    ||||| |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1454 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactgttccaaccctctcagatat 1355  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||     
T  1354 ctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctct 1256  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||  ||||| |    
T  1255 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtct 1156  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || |||||  |||| | |||||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| ||||    
T  1155 gatgaactaaatctggtcccaacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccat 1056  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |    
T  1055 accaatactcgaatggtaactattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcaga 956  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  955 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 856  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  855 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 538 - 662
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaat 662  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 343 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 7963
Alignment:
Q  343 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8311 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgt 8212  T
Q  443 tattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 542  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8211 tattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 8112  T
Q  543 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 642  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 ctccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatctt 8013  T
Q  643 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8012 ggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 307 - 692
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1937
Alignment:
Q  307 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcct 406  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 1651  T
Q  407 caaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 506  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1652 cataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 1751  T
Q  507 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 606  Q
    || |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  1752 aactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 1851  T
Q  607 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  1852 tcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 7342 - 6670
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  7342 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactctctcagatat 7243  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || ||||| ||     
T  7242 ctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 7143  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || || || |||||||    
T  7142 tgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttttctgtagttt 7043  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||| || || || |||  |||    
T  7042 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaatgcttcgaacggtatcat 6943  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| ||  | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  6942 accaatactcgaatggtaattgttgttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 6843  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  6842 tcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactct 6743  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6742 tccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 9798 - 10465
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  9798 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 9897  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  9898 ctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 9997  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||| |     | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  9998 tgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 10092  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  10093 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 10192  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||    
T  10193 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaa 10292  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  10293 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactct 10392  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  10393 tccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 47124 - 47796
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  47124 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 47223  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| | || |||| |||||| || ||||| ||     
T  47224 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 47323  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  47324 tgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 47423  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||| |||    
T  47424 gatgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 47523  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  47524 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 47623  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  47624 tcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 47723  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  47724 tccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 52169 - 51497
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  52169 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 52070  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  52069 ctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 51970  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||||    
T  51969 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagttt 51870  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| || |||||| || || |||| |||    
T  51869 gatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcat 51770  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  51769 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaa 51670  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  51669 tcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 51570  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51569 tccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14207 - 13535
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   ||||  | ||    
T  14207 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactgttccaatcctttctgatat 14108  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||     
T  14107 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 14008  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  14007 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 13908  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  13907 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 13808  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     | |||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13807 actaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaa 13708  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  13707 tcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 13608  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13607 tccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 55 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4587
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||     
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 4925  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||  || || |||||||| ||||||||  |||| || || || || || || |    
T  4924 cttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactgttgttgtatgtga 4825  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  4824 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 4725  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||     
T  4724 atctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatcc 4625  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4624 gacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 547 - 692
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  547 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  647 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 483
Target Start/End: Original strand, 16987 - 17450
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  16987 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 17086  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17087 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 17186  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  17187 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagttt 17286  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||  || |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17287 gttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccat 17386  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 483  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||    
T  17387 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 692
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5422
Alignment:
Q  30 aagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatgga 129  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||| ||| |||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  130 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 229  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  230 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 329  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||||||||| || ||||| |     
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 5059  T
Q  330 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatacta 429  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||| |||||| |||||| || || |||||||| ||||||||     
T  5060 atctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactc 5159  T
Q  430 gaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 529  Q
    ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||| ||    
T  5160 gaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatcctctaacg 5259  T
Q  530 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 629  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  5260 attgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatct 5359  T
Q  630 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  5360 agaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 6183 - 6856
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||| | |  || ||||| | || ||| ||||| ||||||| | ||||  ||||    
T  6183 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaat 6282  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||  ||| || ||||| |||||    
T  6283 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttc 6382  T
Q  219 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||     
T  6383 ctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtc 6482  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||    
T  6483 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 6582  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||    
T  6583 taccaatacttgaatggtaactattgttgtatgtgaattctatcaatggtaggtgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaa 6682  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||||     
T  6683 atcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactc 6782  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||||| | |||||||||    
T  6783 ttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 27226 - 27897
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27226 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacggttccaaccctctctgatat 27325  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||| || || | ||| ||     
T  27326 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcagaaatacatgatatccctct 27425  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||| |||||  |||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  27426 tgaaattcaaggccttc-ctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 27524  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| || || ||  |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  27525 gatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 27624  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  27625 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 27724  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  27725 tcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 27824  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27825 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 39739 - 40410
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  39739 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 39838  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  39839 cggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcc 39938  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || ||||  ||||||||  |||| |    
T  39939 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatcttgactttctcgttagtct 40038  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||   || |||    
T  40039 gatgaaccaaatccggtcccaataccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagt-ctgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcat 40137  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40138 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaa 40237  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  40238 tcctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 40337  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40338 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 26142 - 26814
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  26142 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 26241  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||     
T  26242 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 26341  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  26342 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 26441  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || | ||| || || ||  |||| || ||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  26442 gatgaaccaaatccgctcccaacactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 26541  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  26542 accaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataaaaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 26641  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  26642 tcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctct 26741  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  26742 tccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 358 - 692
Target Start/End: Original strand, 26862 - 27196
Alignment:
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||    
T  26862 gactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 26961  T
Q  458 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 557  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26962 ctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatc 27061  T
Q  558 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 657  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     
T  27062 tgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgac 27161  T
Q  658 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27162 acaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 49513 - 48841
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  49513 catacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 49414  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || || || ||     
T  49413 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctct 49314  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  49313 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtct 49214  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  49213 catgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 49114  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  49113 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaa 49014  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  49013 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 48914  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48913 tccagaacctagaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 248613 - 249285
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||    
T  248613 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaat 248712  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  248713 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 248812  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||| ||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||| |||||| |    
T  248813 tgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 248912  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |  ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||| |||||| || || ||||||||    
T  248913 catgaaccaagttcggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccat 249012  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  249013 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 249112  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  249113 tcctccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 249212  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  249213 tccagaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 29075 - 28402
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  29075 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 28976  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  28975 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 28876  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagt 317  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |   |||| | ||| |||| ||  ||||    
T  28875 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagt 28777  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  28776 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 28677  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  28676 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagca 28577  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  28576 aatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagt 28477  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28476 ttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 41066 - 40393
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  41066 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 40967  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  40966 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 40867  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagt 317  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |   |||| | ||| |||| ||  ||||    
T  40866 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagt 40768  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  40767 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 40668  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  40667 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagca 40568  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  40567 aatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagt 40468  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40467 ttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 400 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197106
Alignment:
Q  400 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 197305  T
Q  500 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 599  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  197304 gtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacc 197205  T
Q  600 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197204 taaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 467
Target Start/End: Original strand, 21927 - 22045
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| || | || ||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |  | || ||||    
T  21927 ctttcacctgactcataccaacacaatggcattctacaccccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttat 22026  T
Q  449 aagttaactcgatcaacgg 467  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22027 aagtaaactcaatcaacgg 22045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 323 - 572
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46780
Alignment:
Q  323 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattcc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  423 aatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 522  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcc 46730  T
Q  523 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 572  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46731 tctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgata 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 86810 - 86154
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || |  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||| ||||    
T  86810 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgacccaactctttccgaaat 86711  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| || ||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||| ||||||     
T  86710 ttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttct 86611  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  86610 tgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtct 86511  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | |||| ||| |||||||| |  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || || ||| ||||    
T  86510 gttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccat 86411  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  86410 tgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 86311  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||     | |||    |||||||  | ||||| ||||| |||||||| |    
T  86310 tcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgata----cacctc--cgtcaacttataacccaacgcctcctgcaaactct 86217  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 682  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  86216 tcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18843 - 18171
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||| |||  | ||  | ||    
T  18843 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatat 18744  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  18743 ctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 18644  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  18643 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 18544  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  18543 gatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 18444  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | | | | ||||    
T  18443 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaa 18344  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  18343 tcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 18244  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  18243 tccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 61519 - 60848
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  61519 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 61420  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  61419 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 61320  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  61319 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  61219 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 61120  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  61119 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 61021  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  61020 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 60921  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60920 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 67907 - 67236
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  67907 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 67808  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  67807 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 67708  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  67707 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 67608  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  67607 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 67508  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  67507 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 67409  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  67408 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 67309  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67308 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 52485 - 51814
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  52485 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 52386  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  52385 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 52286  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  52285 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  52185 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 52086  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  52085 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 51987  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  51986 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 51887  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51886 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 9782
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  || |    
T  10389 catacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaact 10290  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  10289 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 10190  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  10189 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 10090  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  10089 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 9990  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||    
T  9989 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaa 9890  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |    
T  9889 tcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactct 9790  T
Q  620 tccaaaat 627  Q
    ||||||||    
T  9789 tccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 586 - 692
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  586 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 685  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  686 tcacaat 692  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43455
Alignment:
Q  21 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||  |||||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  121 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 220  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| || || || || ||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  221 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 320  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||| |||||| |     
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctc 43083  T
Q  321 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccatt 420  Q
     ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||||||||     
T  43084 atgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccata 43183  T
Q  421 ccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 520  Q
    |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  43184 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 43283  T
Q  521 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 620  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  43284 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 43383  T
Q  621 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43384 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 21977 - 21305
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  21977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 21878  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||  || ||     
T  21877 cttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctct 21778  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  21777 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 21678  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |   | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  21677 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21578  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21577 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 21478  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  21477 tcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctct 21378  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  21377 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 467
Target Start/End: Original strand, 26006 - 26253
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26006 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26105  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26106 cttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26205  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacgg 467  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| || |||||||||||    
T  26206 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcgatcaacgg 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 502 - 638
Target Start/End: Original strand, 26288 - 26424
Alignment:
Q  502 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 601  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||    
T  26288 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttccca 26387  T
Q  602 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 638  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26388 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19792
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||   ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |  ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  19420 catgaaccaaatccggtcccaatacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 19519  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  19520 accaatactcgaatgataactgttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 19619  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  19620 tcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 19719  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19720 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  64 gaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttca 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  164 aagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttg 263  Q
      ||| |||| ||||| |||| | || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  264 tcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    || ||| |||||||| |||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 528 - 1200
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  528 catactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 627  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||     
T  628 ttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctct 727  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | |   |||| || ||| || || ||||| |    
T  728 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatcaacttaaccttttctgtagtct 827  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  828 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaaaggagccat 927  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  928 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1027  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  1028 tcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctct 1127  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1128 tcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 625 - 692
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  625 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 679
Target Start/End: Original strand, 37202 - 37861
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  37202 catacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 37301  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| || ||||   |     
T  37302 ctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccct 37401  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||   | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37402 tgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtct 37501  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| || || ||||| ||    
T  37502 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgat 37601  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  37602 accaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactccatcaacggtagatgactatctcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 37701  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  37702 tcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctct 37801  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 679  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37802 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38382 - 38103
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 217  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  38382 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 38283  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  38282 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactc-aaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 396  Q
     || |||   |  || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  38182 ctgatgattcaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacca 38103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27545 - 27385
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 217  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  27545 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 27446  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 278  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27445 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 27385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 98 - 770
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  98 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 197  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  198 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 297  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| |    
T  298 tgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtct 397  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| || || ||||||||    
T  398 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccat 497  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     | |||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  498 acgaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaa 597  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |    
T  598 tcctccaaagattggatcatcctctccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctct 697  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  698 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 2751 - 3423
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  2751 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 2850  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || | ||| ||     
T  2851 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctct 2950  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  |||||||| || || |    
T  2951 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtct 3050  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  3051 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 3150  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  3151 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 3250  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| |    
T  3251 tcctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactct 3350  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3351 tccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 568 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  568 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 667  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  668 aaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 17019 - 16350
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  17019 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16920  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16919 ctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16820  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  16819 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 16721  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||| ||||||||| || ||||| || || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  16720 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgacttaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 16621  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16620 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaa 16521  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||     
T  16520 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactc 16421  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16420 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 55 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16736 - 16375
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||| | ||| || | ||||||||||    
T  16736 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttct 16637  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16636 ttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggta 16537  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||    
T  16536 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctca 16437  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgc 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16436 cctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 619 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 49339 - 48668
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||   || ||| | ||||||||  | ||  | ||    
T  49339 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatat 49240  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||| || | ||| ||     
T  49239 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcagaaacacatgatttccctct 49140  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  49139 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 49040  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||    
T  49039 gatgaaccaaatccagtcccaataccacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccat 48940  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||     
T  48939 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa- 48841  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  48840 tcctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 48741  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  48740 tccaacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 58122 - 57511
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  58122 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 58023  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || | |    
T  58022 ctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttc 57923  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||  ||||||| || |    
T  57922 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtct 57824  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  57823 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 57724  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  57723 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaa 57624  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |    
T  57623 tcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactct 57524  T
Q  620 tccaaaatctaga 632  Q
    |||| || |||||    
T  57523 tccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 460 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4727
Alignment:
Q  460 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 559  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctg 4866  T
Q  560 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 tctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 4766  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4765 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 32
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  567 gtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 468  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |     
T  467 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaa 368  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  | ||     
T  367 agcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatgaaaattgttg 268  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  267 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 168  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  167 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 68  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  67 atctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 680
Target Start/End: Original strand, 18884 - 19509
Alignment:
Q  55 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 154  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18884 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18983  T
Q  155 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 254  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  18984 tagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgata 19083  T
Q  255 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 354  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || ||||| || ||||| || | ||| || || | ||| |||||     
T  19084 gctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttct 19183  T
Q  355 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtta 454  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  19184 cccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 19283  T
Q  455 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 554  Q
    ||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |    
T  19284 actcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatc 19383  T
Q  555 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    |||||||||||     
T  19384 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatcc 19483  T
Q  655 gatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19484 gacacaatactcgacggaacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 118 - 680
Target Start/End: Original strand, 23109 - 23671
Alignment:
Q  118 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 217  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23109 atctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccct 23208  T
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || |||||    
T  23209 cttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagt 23308  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     || ||||| || | ||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  23309 ctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgcc 23408  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 517  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  23409 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagta 23508  T
Q  518 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 617  Q
    |||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23509 aatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaact 23608  T
Q  618 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
     ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23609 cttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 7542 - 6872
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |   ||||    
T  7542 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctg--aaat 7445  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | || |||| ||| || || || || |||    
T  7444 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 7345  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||  |    
T  7344 tgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagact 7245  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |  || |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||    
T  7244 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccat 7145  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  7144 accaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 7045  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  7044 tcctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactct 6945  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  6944 ttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 38
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  705 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 606  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 506  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  505 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 406  T
Q  320 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||    
T  405 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 307  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | || ||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||         
T  306 taccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc----- 212  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |   || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  211 agtttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactc 112  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  111 ttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 10888 - 11560
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  10888 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 10987  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  10988 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 11087  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  11088 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 11187  T
Q  320 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||    
T  11188 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 11286  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 518  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  11287 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 11386  T
Q  519 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 618  Q
    |||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  11387 atcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 11486  T
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11487 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 7991 - 7456
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  7991 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 7892  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || | |||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  7891 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 7792  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  7791 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 7692  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  7691 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 7592  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  7591 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 7492  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7491 atctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 134 - 692
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2466
Alignment:
Q  134 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 233  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  234 ttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 331  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||  ||  |||| ||||| ||  |||  |  |    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctctt--atcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaat 2105  T
Q  332 ctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactaga 431  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  2106 ctggtcccaacaccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcga 2205  T
Q  432 atgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgac 531  Q
    ||| || || |  || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||     
T  2206 atggtaactgtagttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgat 2305  T
Q  532 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 631  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |    
T  2306 taaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtg 2405  T
Q  632 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  2406 aagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 43505 - 44177
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  43505 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 43604  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  43605 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 43704  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  43705 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 43804  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  43805 catgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 43904  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |  ||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43905 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 44004  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  44005 tcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactct 44104  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44105 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 44517 - 45189
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  44517 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 44616  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  44617 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 44716  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  44717 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 44816  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  44817 catgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 44916  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |  ||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  44917 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 45016  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  45017 tcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactct 45116  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45117 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 635
Target Start/End: Original strand, 20122 - 20737
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  20122 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 20221  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || | || |||| |||||| || || || |||    
T  20222 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 20321  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  ||||| |  ||||| |    
T  20322 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtct 20421  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| || |||||| || ||   || |||    
T  20422 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagcttcgaacaatgtcat 20521  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  20522 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 20621  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| |    
T  20622 tcctccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactct 20721  T
Q  620 tccaaaatctagaagt 635  Q
    |||| || ||||||||    
T  20722 tccagaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 36055 - 36220
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  36055 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 36154  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 185  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36155 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 692
Target Start/End: Original strand, 26261 - 26933
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |||||  ||| ||||||||| ||||| ||  | ||  ||||    
T  26261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagccactgttcccaccctctctgaaat 26360  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  26361 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 26460  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |  ||||||||||||||| |    
T  26461 tgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtct 26560  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      ||||| |  |||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| ||| || || || ||| ||||    
T  26561 catgaaccaaatctggtcccaacacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccat 26660  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  26661 cccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaa 26760  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  26761 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 26860  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |  ||||| || |||||||||||    
T  26861 tccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 454 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3442
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3686 aactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgac 3587  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  3586 catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctctatt 3487  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3486 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 235 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3694
Alignment:
Q  235 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  335 gtcctaagaccactctt 351  Q
    |||||||||||||||||    
T  3710 gtcctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 454 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19874 - 19636
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  19874 aactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactgac 19775  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774 catctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatc 19675  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19674 tgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 16957 - 17142
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  16957 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatat 17056  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaaca 205  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17057 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 151 - 692
Target Start/End: Original strand, 1 - 541
Alignment:
Q  151 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 250  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  251 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 350  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T
Q  351 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 450  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || | | ||||  ||||||| ||||| || || || || ||     
T  201 ttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgtt-ccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtac 299  T
Q  451 gttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 550  Q
    || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  300 gtgaactctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgact 399  T
Q  551 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 650  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  400 gaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 499  T
Q  651 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||| |||| | |||||||||    
T  500 atccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 692
Target Start/End: Original strand, 10865 - 11441
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || || | |||||| || || ||    
T  10865 aaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcacc 10964  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 315  Q
     ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||| |||    
T  10965 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgta 11064  T
Q  316 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtg 415  Q
    || |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || ||||    
T  11065 gtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 11164  T
Q  416 ccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 515  Q
    |||| || ||||| ||||| ||  | || || || || ||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11165 ccatacctatactcgaatggtaaatgttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa 11264  T
Q  516 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 615  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11265 caaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 11364  T
Q  616 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    || ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11365 ctcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25511
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  26171 catatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatat 26072  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  26071 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctct 25972  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| ||||| |    
T  25971 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtct 25872  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | || || |  || ||||| |  || || || || ||| ||||||||||||| || ||| |  |||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  25871 gatggaccaaatccggtcccagcacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 25772  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||    
T  25771 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaa 25672  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  25671 tcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctct 25572  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  25571 tccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 16676 - 16940
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| || | ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  16676 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgccactattccaaccctctctgaaat 16775  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16776 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16875  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  16876 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 350 - 616
Target Start/End: Original strand, 1 - 267
Alignment:
Q  350 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 449  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 tttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattata 100  T
Q  450 agttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 549  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||    
T  101 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgac 200  T
Q  550 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 616  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  201 taaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 412 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 18839
Alignment:
Q  412 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactc 19020  T
Q  512 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 611  Q
    |||| || ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||||     
T  19019 tcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctcttt 18920  T
Q  612 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18919 caaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13087 - 12420
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||||  || |||||||||||||   | ||  ||||    
T  13087 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaat 12988  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    || ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  12987 ctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 12888  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  12887 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 12788  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  12787 gatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 12688  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||| || ||     || | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12687 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtag----gtagcacaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaaa 12592  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    ||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  12591 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 12492  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12491 tccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 116 - 692
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5885
Alignment:
Q  116 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  5309 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 5408  T
Q  216 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagt 314  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| || |  |||||||  || ||||||||    
T  5409 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttcctt-atcatcttgaccttctcagt 5507  T
Q  315 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggt 414  Q
     || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||| |  || |||    
T  5508 cgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggt 5607  T
Q  415 gccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 514  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | |||||    
T  5608 gccataccattactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctca 5707  T
Q  515 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 614  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  5708 acaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaaccatctttctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaa 5807  T
Q  615 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     || ||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5808 gctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14557 - 13994
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  14557 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 14458  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  14457 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 14358  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    | |||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  ||| ||||  |||| |    
T  14357 taaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtct 14258  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    | | ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  14257 gataaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14158  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  14157 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaa 14058  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 583  Q
    ||||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14057 tcctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9183 - 9039
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  9183 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 9084  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaa 164  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  9083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 6219 - 5756
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  6219 catacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagatat 6121  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| ||  |||| ||     
T  6120 ctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctct 6021  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||   |||| ||  || || || |||||||    
T  6020 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagttt 5921  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
    |  |||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  5920 gacgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 5821  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 484  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5820 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 5756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 566 - 206
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||  | ||    
T  566 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgatat 467  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||     
T  466 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttct 367  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  366 tgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 267  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 380  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  266 gctgtacaatttctggtcccaaaactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 510 - 692
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  510 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  610 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 238 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 2992
Alignment:
Q  238 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 337  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  || | ||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttc 3344  T
Q  338 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 437  Q
    | || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3343 ccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggta 3244  T
Q  438 gctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 537  Q
     || || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || ||     
T  3243 actgttgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatc 3144  T
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  3143 gtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtga 3044  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3043 acctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3487
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3574 catacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5086
Alignment:
Q  235 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 334  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |  ||||| |  || |    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaatccg 5444  T
Q  335 gtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatg 434  Q
    |||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| |||||    
T  5443 gtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatg 5344  T
Q  435 atagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactga 534  Q
     || || || || || || ||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||     
T  5343 gtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattgg 5244  T
Q  535 attgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag 634  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5243 atcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaag 5144  T
Q  635 taaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    | || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5143 tgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 27967 - 28231
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  27967 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 28066  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || || ||     
T  28067 ctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 28166  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28167 tgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 619 - 698
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 698  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 30
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  288 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatat 189  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  188 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 89  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 278  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  88 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 175 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 880
Alignment:
Q  175 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 274  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  275 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 374  Q
    |||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataa 1186  T
Q  375 cggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatga 474  Q
     ||||| ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| || || |||    
T  1185 aggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggtaggtga 1086  T
Q  475 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 574  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1085 ctgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataag 986  T
Q  575 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 674  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  985 ccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacggaac 886  T
Q  675 accatg 680  Q
     |||||    
T  885 cccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 463 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11531 - 11302
Alignment:
Q  463 aacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 562  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11531 aacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtct 11432  T
Q  563 gcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 662  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  11431 gcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaat 11332  T
Q  663 gctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11331 actcgatggaactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 472 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  472 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 571  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  572 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 671  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  672 aacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13559 - 13380
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  13559 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagatat 13460  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 199  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13459 ctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 454 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2509
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  2747 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 2648  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2647 catctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatc 2548  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2547 cgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 301
Target Start/End: Original strand, 191 - 472
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  191 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaaat 290  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| || |||    
T  291 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcc 390  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 301  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  391 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatct 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  607 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 541 - 692
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  541 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 640  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  641 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 217 - 654
Target Start/End: Original strand, 86 - 523
Alignment:
Q  217 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 316  Q
    |||| |||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||    
T  86 tcctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtag 185  T
Q  317 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgc 416  Q
    | || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||  ||||| || || |||||    
T  186 tctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgc 285  T
Q  417 cattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 516  Q
    ||| | |||||| ||||| || |  || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |      
T  286 catacaaatactcgaatggtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttact 385  T
Q  517 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 616  Q
    ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  386 aaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaac 485  T
Q  617 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 654  Q
    | ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  486 tcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1091 - 946
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  1091 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 992  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 290  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  991 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctc 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 356 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 6307 - 5969
Alignment:
Q  356 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaa 455  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||| |||||| || || | |||||| || ||||| ||||| || || ||||| || || ||    
T  6307 ctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaa 6208  T
Q  456 ctcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||    
T  6207 ctctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgac 6108  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| |||||    
T  6107 catctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatc 6008  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6007 cgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 414 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 5210 - 4945
Alignment:
Q  414 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 513  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||    
T  5210 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagaacacacactctc 5111  T
Q  514 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 613  Q
    |  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5110 agtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgca 5011  T
Q  614 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 679  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  5010 aactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 454 - 692
Target Start/End: Original strand, 41353 - 41589
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||    
T  41353 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgac 41452  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||     
T  41453 catctgtctgcggatgataagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctctatt 41550  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41551 cgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 45845 - 45932
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45845 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 317
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4188
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| | |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactgttccaaccctctcagatat 3990  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  3991 ctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatct 4090  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  4091 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 4924
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||  ||||||||  | |   | ||    
T  5308 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatat 5209  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||     
T  5208 ctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctct 5109  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| || || |    
T  5108 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtct 5009  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagc 404  Q
    | ||||| |  | |||| | || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5008 gatgaactaaatatggttccaacaccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagc 4924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 411 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1887 - 1618
Alignment:
Q  411 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 510  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||  |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |    
T  1887 aggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacact 1788  T
Q  511 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 610  Q
    || | ||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||    
T  1787 cttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatctt 1688  T
Q  611 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1687 gcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1475 - 1211
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| | |   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1475 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccctctctgatat 1376  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  1375 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 1276  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1275 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 46279 - 46814
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| || | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  46279 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 46378  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  46379 tatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 46478  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  46479 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 46578  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  46579 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 46678  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | |  |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||    
T  46679 ctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcgg 46778  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46779 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 490 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  490 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 589  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  590 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 689  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  690 aat 692  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 691  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4217
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  4445 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctttgaaat 4346  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||     
T  4345 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 4246  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 248  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  4245 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39193 - 38761
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || || | |||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| | ||||||| | ||  ||||    
T  39193 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgctccaactctctctgaaat 39094  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  39093 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 38994  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 318  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||| || |  |||| |   ||||||||||||||     
T  38993 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctttttcct-tatcaacctgactttctcagtagtc 38895  T
Q  319 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcca 418  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  38894 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacgctctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 38795  T
Q  419 ttccaatactagaatgatagctattattataagt 452  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  38794 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14349
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| |||||||| ||| |  | ||    
T  14086 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccttt-cagatat 14184  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||  || | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  14185 ctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14284  T
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 284  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14285 tgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 490 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  490 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 589  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  590 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 23519 - 24054
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || |||||||||||||| || |   | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  23519 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctct 23618  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  23619 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacctccggtcctaacaa 23718  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  23719 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaaatgttg 23818  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  23819 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctct 23918  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  23919 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24018  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24019 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 474 - 692
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  474 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 573  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  574 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  674 caccatgtagcttcacaat 692  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1385
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | |   | ||    
T  1177 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatat 1276  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 219  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  1277 ctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 1376  T
Q  220 tgaaactca 228  Q
    |||||||||    
T  1377 tgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 349 - 680
Target Start/End: Original strand, 7497 - 7828
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 448  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | || || |    
T  7497 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaattgttgttgt 7596  T
Q  449 aagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 548  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| |     
T  7597 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctcggt 7696  T
Q  549 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 648  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  7697 ctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaaacctcggatcc 7796  T
Q  649 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
      ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7797 ggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 574 - 692
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  574 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  674 caccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 574 - 692
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  574 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  674 caccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14918 - 14383
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||  |||| | || | || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14918 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctct 14819  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  14818 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 14719  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| | || ||     
T  14718 agcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaactgttg 14619  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||| ||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14618 ttgtaagtaaactcaatcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14519  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| | | | || || ||||||| ||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  14518 ccgtctgcccatcggtctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 14419  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14418 atcacgatctgacacaatactagaaggaataccatg 14383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 3284 - 3818
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || | ||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || ||||| | ||    
T  3284 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctct 3383  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  3384 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 3483  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  3484 agcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 3583  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |    | |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||    
T  3584 ttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctct 3683  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  3684 ctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 3782  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3783 atcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 538 - 653
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  638 atcttggatctctatc 653  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26263 - 25959
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26263 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26164  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || ||||  ||| ||||||| |     |||||||| || | |||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26163 cttgcacaacttctagtcctaacaaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26064  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |   ||||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||    
T  26063 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaa 25964  T
Q  520 tcctc 524  Q
    |||||    
T  25963 tcctc 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13568
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13033 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 13132  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  13133 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 13232  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      |||| || || || |||||||| ||||| || || || || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  13233 ggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 13332  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || || || ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  13333 ttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 13432  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    |||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||    
T  13433 ccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcgg 13532  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13533 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 454 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 33191 - 32953
Alignment:
Q  454 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 553  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||||    
T  33191 aactctatcaacggtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgac 33092  T
Q  554 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 653  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||    
T  33091 catctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatc 32992  T
Q  654 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
     ||   ||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  32991 cgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 913
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| || || || ||  || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacct 1023  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
     |||||||||| ||||  || || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | || || || ||||| ||||    
T  1022 aactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatacttgtatgaaaactgttgttgtaagtaaact 923  T
Q  458 cgatcaacgg 467  Q
    | ||||||||    
T  922 caatcaacgg 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  553 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 652  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  653 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  607 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3521
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  4056 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcctct 3957  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  | ||||| |     
T  3956 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccaggcctaacaa 3857  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || |  || |||||||| ||||| || || || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  3856 agcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 3757  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  3756 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 3657  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  3656 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 3557  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3556 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 466
Target Start/End: Original strand, 71446 - 71665
Alignment:
Q  247 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 346  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| || |    
T  71446 tcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacacaa 71545  T
Q  347 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 446  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||| | || || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  71546 cactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 71645  T
Q  447 ataagttaactcgatcaacg 466  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  71646 gtaagtaaactcaatcaacg 71665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  565 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 664  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  665 tcgaaggaacaccatg 680  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 301
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13532
Alignment:
Q  166 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 265  Q
    ||||| || |||||||| | |||| | |||||||| || ||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  266 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 301  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatct 13532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 680
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  586 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Original strand, 136119 - 136278
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  136119 catacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 136218  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 179  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  136219 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 500
Target Start/End: Original strand, 136278 - 136390
Alignment:
Q  388 ctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 487  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  136278 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 136377  T
Q  488 ctccttgctcaag 500  Q
    | |||||||||||    
T  136378 caccttgctcaag 136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2172 - 2023
Alignment:
Q  20 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  2172 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatat 2073  T
Q  120 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcac 169  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2072 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 435
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14938
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||| || ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |  || |||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaaacactttcacct 14860  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
    ||||||||| | |||||||   | || || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  14861 gactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaagaatga 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 24005 - 24540
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  24005 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 24104  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || || || || ||||| || ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  ||||||||||| |     
T  24105 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagtctcttggacaacttctggtcctaacaa 24204  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || |||| |||||| ||| | |||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |  ||||     
T  24205 agcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaattattg 24304  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| | ||| || | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||| || |||||||    
T  24305 ttgtaagtaaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctggatagtcctct 24404  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| || |||||    
T  24405 ccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtgaaccttgg 24504  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24505 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1530 - 1315
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |    
T  1530 tgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 1431  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || ||||  || |||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| |||| |||    
T  1430 cttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtcat 1331  T
Q  420 tccaatactagaatga 435  Q
    ||| ||||||||||||    
T  1330 tccgatactagaatga 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 28447 - 27912
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | || ||||||||||| || || ||| | || ||||||| ||| ||||| | ||    
T  28447 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcctct 28348  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  28347 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 28248  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || | ||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||| |||| |  | ||     
T  28247 agcactttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagcatgaaaattgttg 28148  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||| | | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  28147 ttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 28048  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||    
T  28047 ccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcgg 27948  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27947 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 565 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  565 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 664  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  665 tcgaaggaacaccatgtagcttca 688  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3590
Alignment:
Q  193 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 292  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| |    
T  4077 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcct 3978  T
Q  293 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 392  Q
    | ||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||| ||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  3977 gaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtcttaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 3878  T
Q  393 accattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 492  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||| | | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| || | |||    
T  3877 accatacaaagcctcaaacggagccatgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaacttacacct 3778  T
Q  493 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 592  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||| | ||||| |  | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  3777 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgattagtcctttttgtctgcccatctgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaact 3678  T
Q  593 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    | |  || ||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||  | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3677 tagttccgaaagtagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccaacacaatactagaaggaataccatg 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 467
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9434
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| |||||   ||| |||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 357  Q
    ||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||  ||||||| |   | |||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaacttcctgtcctaacaaagcactttcacct 9324  T
Q  358 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaact 457  Q
    ||||||||||| ||||||||    || ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  9325 gactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 9424  T
Q  458 cgatcaacgg 467  Q
      ||||||||    
T  9425 aaatcaacgg 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 680
Target Start/End: Original strand, 14782 - 15316
Alignment:
Q  145 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 244  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14782 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14881  T
Q  245 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 344  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14882 tatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 14981  T
Q  345 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 444  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||  | |||||||||||| | || ||     
T  14982 agcactctctccggactcaaacca-cacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaaacctcaaacggtgctatatcgatactagaatgaaaactgttg 15080  T
Q  445 ttataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 544  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | |||   |||||||||||| ||||    |||||| |||||||    
T  15081 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacagacacgctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctct 15180  T
Q  545 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 644  Q
    ||| ||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15181 ccgtctgcccattggtctgaggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaggcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15280  T
Q  645 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||| || ||||||    
T  15281 atcccgatctgacacaatactagaagaaataccatg 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 680
Target Start/End: Original strand, 43738 - 44198
Alignment:
Q  220 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 319  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  43738 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 43837  T
Q  320 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccat 419  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43838 cttgcacaacttccggtcctaataaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccat 43937  T
Q  420 tccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 519  Q
     |  |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |  ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  43938 actgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacacactgctccaaaacacaagctctcaacaaa 44037  T
Q  520 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 619  Q
    || ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  44038 tcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 44137  T
Q  620 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44138 cccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 531 - 673
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  531 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 630  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  631 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 673  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Original strand, 10985 - 11071
Alignment:
Q  349 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatga 435  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  10985 ctttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatactagaatga 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8999 - 8748
Alignment:
Q  218 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 317  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  8999 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8900  T
Q  318 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgcc 417  Q
     |  || ||||  || |||||||| |   | |||||  | || |||||||| |||||||| || || || |||||||||| ||||||||||||  ||| |    
T  8899 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcttcggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtc 8800  T
Q  418 attccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacggaa 469  Q
    ||||| ||| ||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8799 attccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaatcaacggaa 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 538 - 680
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  538 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 637  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  638 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 510 - 680
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  510 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 609  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  610 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 290
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 290  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 290
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 290  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 680
Target Start/End: Original strand, 14478 - 14798
Alignment:
Q  361 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcga 460  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  14478 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 14577  T
Q  461 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 560  Q
    ||||| | | |  |   |||||| |  |  ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| | ||||||   ||| ||||||||    
T  14578 tcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgt 14677  T
Q  561 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc-aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 659  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |||| | ||    
T  14678 cttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacac 14777  T
Q  660 aatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  14778 aatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 290
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  158 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 257  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  258 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 290  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 501 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  501 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 600  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  601 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 680  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 465
Target Start/End: Original strand, 2897 - 3001
Alignment:
Q  361 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcga 460  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  2897 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 2996  T
Q  461 tcaac 465  Q
    |||||    
T  2997 tcaac 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 467
Target Start/End: Original strand, 17 - 96
Alignment:
Q  388 ctccgaccattcaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagttaactcgatcaacgg 467  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  17 ctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 692
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  619 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 692  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University