View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7727_low_1 (Length: 890)

Name: NF7727_low_1
Description: NF7727
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7727_low_1
NF7727_low_1
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (15-873)||(27295375-27296231)
chr2 (23-873)||(12578751-12579597)
chr2 (23-873)||(12572269-12573115)
chr2 (23-873)||(27785653-27786500)
chr2 (23-873)||(27790874-27791721)
chr2 (65-873)||(10685007-10685801)
chr2 (26-873)||(2105536-2106372)
chr2 (559-873)||(19702859-19703173)
chr2 (476-873)||(28970645-28971040)
chr2 (555-873)||(19648922-19649239)
chr2 (480-873)||(15642665-15643057)
chr2 (65-265)||(20260824-20261024)
chr2 (476-863)||(36800921-36801307)
chr2 (476-873)||(14564195-14564591)
chr2 (65-265)||(23090006-23090207)
chr2 (476-873)||(17591908-17592304)
chr2 (65-265)||(23102434-23102635)
chr2 (483-863)||(2385302-2385680)
chr2 (485-863)||(1067473-1067849)
chr2 (65-241)||(6482321-6482499)
chr2 (65-241)||(6485788-6485966)
chr2 (65-241)||(5707014-5707191)
chr2 (65-265)||(9241333-9241534)
chr2 (485-863)||(11359622-11359999)
chr2 (65-241)||(26582675-26582852)
chr2 (483-863)||(31828987-31829367)
chr2 (483-863)||(31834339-31834719)
chr2 (483-863)||(24426221-24426599)
chr2 (476-863)||(24480977-24481363)
chr2 (481-863)||(36983945-36984326)
chr2 (485-863)||(4077797-4078174)
chr2 (65-241)||(23169298-23169475)
chr2 (602-873)||(23291453-23291724)
chr2 (65-241)||(23580555-23580732)
chr2 (65-265)||(23877838-23878040)
chr2 (485-863)||(44090468-44090844)
chr2 (483-691)||(28293096-28293304)
chr2 (65-241)||(200641-200818)
chr2 (483-863)||(22012517-22012895)
chr2 (483-873)||(34427-34815)
chr2 (485-863)||(27037621-27037997)
chr2 (65-223)||(27367600-27367760)
chr2 (65-241)||(43693401-43693578)
chr2 (65-241)||(6744324-6744501)
chr2 (476-863)||(70892-71278)
chr2 (483-691)||(11466446-11466653)
chr2 (476-873)||(4070909-4071306)
chr2 (476-683)||(27272518-27272725)
chr2 (485-863)||(30195892-30196269)
chr2 (485-873)||(32910857-32911245)
chr2 (604-863)||(1062197-1062455)
chr2 (713-873)||(24659399-24659559)
chr2 (483-863)||(20850566-20850944)
chr2 (758-873)||(23333249-23333364)
chr2 (85-265)||(22809901-22810084)
chr2 (749-863)||(27730128-27730241)
chr2 (602-871)||(24652844-24653113)
chr2 (483-691)||(21605141-21605349)
chr2 (602-873)||(25267731-25268002)
chr2 (67-239)||(23263985-23264158)
chr2 (474-873)||(17634304-17634693)
chr2 (602-735)||(20648603-20648736)
chr2 (783-863)||(21605420-21605499)
chr2 (108-265)||(21907291-21907452)
chr2 (108-265)||(21073954-21074114)
chr2 (110-265)||(19703456-19703615)
chr2 (39-265)||(20724011-20724236)
chr2 (39-265)||(23290904-23291129)
chr2 (485-561)||(25365601-25365677)
chr2 (581-872)||(8889346-8889637)
chr2 (602-795)||(25651763-25651957)
chr2 (753-873)||(20913711-20913830)
chr2 (476-624)||(25589826-25589974)
chr2 (602-873)||(23149137-23149409)
chr2 (602-873)||(23560927-23561199)
chr2 (602-873)||(19036010-19036281)
chr2 (475-524)||(21123588-21123637)
chr2 (827-863)||(11466738-11466774)
chr2 (110-265)||(23752836-23752994)
chr2 (475-525)||(24669539-24669589)
chr2 (602-735)||(20724540-20724673)
chr2 (108-149)||(24943419-24943460)
chr2 (598-795)||(25106923-25107120)
chr2 (67-143)||(23269201-23269276)
chr2 (67-143)||(23276070-23276145)
chr2 (604-660)||(27729993-27730049)
chr2 (776-873)||(21120999-21121097)
chr2 (573-684)||(22841463-22841574)
chr2 (476-523)||(25267616-25267663)
chr2 (485-519)||(1062090-1062124)
chr2 (485-519)||(27729885-27729919)
chr2 (776-817)||(7679876-7679917)
chr2 (485-550)||(22841385-22841450)
chr2 (784-873)||(27272825-27272913)
[»] chr4 (103 HSPs)
chr4 (15-873)||(635133-635990)
chr4 (23-873)||(51607324-51608172)
chr4 (23-873)||(42701184-42702032)
chr4 (23-873)||(51601443-51602291)
chr4 (23-873)||(41799322-41800170)
chr4 (26-873)||(53748124-53748966)
chr4 (26-873)||(20940219-20941066)
chr4 (27-873)||(23121559-23122405)
chr4 (26-873)||(43284275-43285113)
chr4 (470-873)||(49051356-49051758)
chr4 (472-873)||(11170619-11171030)
chr4 (476-873)||(899909-900305)
chr4 (473-873)||(37881808-37882207)
chr4 (558-873)||(13454214-13454528)
chr4 (483-863)||(5939247-5939625)
chr4 (476-873)||(33097408-33097804)
chr4 (65-265)||(15533786-15533986)
chr4 (483-873)||(47871802-47872191)
chr4 (476-873)||(46044240-46044637)
chr4 (476-873)||(19127714-19128110)
chr4 (483-863)||(3259373-3259751)
chr4 (479-863)||(45141929-45142312)
chr4 (476-862)||(42220746-42221131)
chr4 (476-863)||(49240226-49240611)
chr4 (664-873)||(23724171-23724380)
chr4 (476-863)||(3266001-3266386)
chr4 (478-873)||(21881910-21882303)
chr4 (28-276)||(14484390-14484642)
chr4 (65-265)||(18212138-18212339)
chr4 (476-863)||(49748940-49749325)
chr4 (476-873)||(54825545-54825942)
chr4 (485-863)||(29454741-29455117)
chr4 (483-863)||(45959124-45959502)
chr4 (476-692)||(16999719-16999935)
chr4 (602-873)||(33221782-33222052)
chr4 (483-873)||(7359570-7359958)
chr4 (485-863)||(29448057-29448433)
chr4 (30-276)||(17000131-17000381)
chr4 (485-863)||(391491-391867)
chr4 (482-863)||(26396009-26396388)
chr4 (479-863)||(20895312-20895694)
chr4 (65-241)||(11847053-11847230)
chr4 (35-238)||(4831090-4831296)
chr4 (35-238)||(4834385-4834591)
chr4 (479-863)||(34772488-34772870)
chr4 (38-276)||(11171222-11171464)
chr4 (479-863)||(20889685-20890067)
chr4 (476-873)||(31665376-31665760)
chr4 (65-241)||(8046897-8047074)
chr4 (478-735)||(30396514-30396772)
chr4 (602-873)||(14555460-14555731)
chr4 (485-863)||(23435361-23435738)
chr4 (476-688)||(2972288-2972500)
chr4 (483-863)||(52500873-52501250)
chr4 (602-873)||(10783661-10783932)
chr4 (476-669)||(42955597-42955790)
chr4 (483-863)||(1584231-1584609)
chr4 (483-863)||(21397139-21397516)
chr4 (483-863)||(44657150-44657527)
chr4 (483-863)||(44663079-44663456)
chr4 (483-863)||(50082542-50082920)
chr4 (602-873)||(10972312-10972583)
chr4 (602-808)||(47870474-47870680)
chr4 (483-863)||(29382146-29382525)
chr4 (536-808)||(11937524-11937796)
chr4 (602-873)||(15547087-15547358)
chr4 (110-265)||(15406955-15407113)
chr4 (483-808)||(39265673-39265996)
chr4 (602-873)||(16485172-16485445)
chr4 (602-735)||(18165801-18165934)
chr4 (812-863)||(13480389-13480439)
chr4 (476-519)||(33221686-33221729)
chr4 (812-873)||(14506941-14507002)
chr4 (485-561)||(14821779-14821855)
chr4 (754-873)||(53904723-53904841)
chr4 (85-265)||(14048218-14048404)
chr4 (108-265)||(14485552-14485713)
chr4 (602-735)||(15318486-15318619)
chr4 (826-863)||(47870442-47870479)
chr4 (827-863)||(11937836-11937872)
chr4 (39-265)||(14062886-14063113)
chr4 (604-846)||(14487124-14487367)
chr4 (575-795)||(15360278-15360498)
chr4 (472-746)||(16228624-16228888)
chr4 (108-265)||(26077686-26077847)
chr4 (555-688)||(1650620-1650753)
chr4 (602-795)||(41528540-41528733)
chr4 (822-873)||(15004518-15004570)
chr4 (598-673)||(14821881-14821956)
chr4 (834-873)||(14822118-14822157)
chr4 (776-819)||(15464427-15464470)
chr4 (838-873)||(16445697-16445732)
chr4 (485-560)||(16485065-16485140)
chr4 (834-873)||(17177105-17177144)
chr4 (775-817)||(12287655-12287697)
chr4 (827-873)||(30239775-30239821)
chr4 (775-817)||(52242716-52242758)
chr4 (65-148)||(13452226-13452307)
chr4 (776-817)||(13845119-13845160)
chr4 (566-647)||(13878283-13878364)
chr4 (776-809)||(15099908-15099941)
chr4 (826-863)||(39265641-39265678)
chr4 (776-817)||(39705788-39705829)
[»] chr1 (98 HSPs)
chr1 (15-873)||(27280142-27280998)
chr1 (26-873)||(3706145-3706980)
chr1 (472-873)||(22434333-22434734)
chr1 (554-873)||(20595490-20595809)
chr1 (536-873)||(954467-954804)
chr1 (473-873)||(24108389-24108788)
chr1 (476-863)||(49328397-49328784)
chr1 (472-873)||(24079963-24080352)
chr1 (485-862)||(20293056-20293431)
chr1 (485-873)||(20299685-20300071)
chr1 (471-873)||(29601644-29602045)
chr1 (476-873)||(36917482-36917878)
chr1 (15-276)||(23066665-23066930)
chr1 (476-873)||(21921163-21921557)
chr1 (485-863)||(20571119-20571495)
chr1 (476-873)||(47484472-47484868)
chr1 (476-863)||(6740884-6741270)
chr1 (483-873)||(21963379-21963768)
chr1 (476-863)||(31534664-31535049)
chr1 (483-863)||(4231563-4231941)
chr1 (483-863)||(28555866-28556245)
chr1 (482-863)||(38907417-38907796)
chr1 (476-863)||(48428219-48428604)
chr1 (65-241)||(20438531-20438709)
chr1 (476-863)||(31563381-31563766)
chr1 (485-691)||(20242953-20243159)
chr1 (483-863)||(17149690-17150069)
chr1 (602-873)||(20941235-20941507)
chr1 (65-241)||(21542056-21542233)
chr1 (476-692)||(23066236-23066452)
chr1 (65-241)||(42095903-42096080)
chr1 (483-863)||(37682449-37682829)
chr1 (483-863)||(20076308-20076691)
chr1 (26-265)||(20242491-20242735)
chr1 (483-863)||(36211414-36211792)
chr1 (485-863)||(39094697-39095075)
chr1 (65-241)||(20045879-20046056)
chr1 (602-873)||(29553826-29554097)
chr1 (482-863)||(39189041-39189422)
chr1 (483-863)||(18026116-18026494)
chr1 (485-863)||(42626573-42626950)
chr1 (65-265)||(19664105-19664306)
chr1 (35-265)||(32650071-32650304)
chr1 (38-265)||(22448244-22448469)
chr1 (536-863)||(18418552-18418878)
chr1 (485-863)||(19045665-19046041)
chr1 (65-265)||(41110814-41111016)
chr1 (483-863)||(20396237-20396615)
chr1 (485-873)||(25091660-25092038)
chr1 (485-863)||(20276616-20276993)
chr1 (776-873)||(43089044-43089141)
chr1 (602-873)||(36615414-36615690)
chr1 (26-164)||(955118-955260)
chr1 (559-873)||(24237786-24238099)
chr1 (536-808)||(52990821-52991092)
chr1 (754-863)||(29150600-29150708)
chr1 (536-808)||(37675810-37676082)
chr1 (598-873)||(24475865-24476141)
chr1 (65-265)||(19778434-19778639)
chr1 (602-873)||(20849554-20849825)
chr1 (776-873)||(23634228-23634324)
chr1 (776-873)||(5381333-5381427)
chr1 (602-871)||(21410056-21410325)
chr1 (39-265)||(29554419-29554645)
chr1 (65-149)||(36614935-36615015)
chr1 (472-525)||(20824078-20824131)
chr1 (178-274)||(955032-955128)
chr1 (753-873)||(23712874-23712993)
chr1 (472-523)||(20837889-20837940)
chr1 (474-561)||(21698507-21698594)
chr1 (474-525)||(21734124-21734175)
chr1 (602-873)||(21744978-21745249)
chr1 (827-863)||(9292417-9292453)
chr1 (474-550)||(21986592-21986668)
chr1 (827-863)||(37676122-37676158)
chr1 (474-561)||(20086161-20086248)
chr1 (474-561)||(30491118-30491205)
chr1 (602-735)||(15316020-15316153)
chr1 (602-795)||(19853549-19853742)
chr1 (602-795)||(19859684-19859877)
chr1 (476-529)||(21410387-21410440)
chr1 (776-817)||(35981187-35981228)
chr1 (485-561)||(5381051-5381127)
chr1 (472-520)||(11140722-11140770)
chr1 (65-149)||(24079551-24079634)
chr1 (65-149)||(24109120-24109203)
chr1 (485-561)||(41312568-41312644)
chr1 (130-265)||(20838142-20838280)
chr1 (602-705)||(41312675-41312778)
chr1 (485-519)||(954791-954825)
chr1 (602-732)||(21986420-21986550)
chr1 (65-149)||(23195571-23195653)
chr1 (775-817)||(28193953-28193995)
chr1 (602-735)||(19336302-19336435)
chr1 (776-817)||(20637431-20637472)
chr1 (776-817)||(21862892-21862933)
chr1 (776-817)||(33681590-33681631)
chr1 (776-817)||(49261704-49261745)
[»] chr3 (142 HSPs)
chr3 (4-873)||(13946414-13947280)
chr3 (4-873)||(13909469-13910335)
chr3 (4-873)||(13939928-13940791)
chr3 (26-873)||(41175438-41176280)
chr3 (26-873)||(41180576-41181418)
chr3 (23-873)||(44775159-44776006)
chr3 (23-873)||(44780343-44781190)
chr3 (26-873)||(4677125-4677967)
chr3 (26-873)||(8742284-8743125)
chr3 (26-873)||(8760454-8761295)
chr3 (26-873)||(12200164-12201006)
chr3 (15-867)||(16837876-16838729)
chr3 (154-867)||(16829353-16830065)
chr3 (472-873)||(14652119-14652520)
chr3 (406-873)||(13202944-13203409)
chr3 (515-873)||(16349020-16349377)
chr3 (470-873)||(12419802-12420204)
chr3 (555-873)||(16382286-16382602)
chr3 (555-873)||(18718526-18718843)
chr3 (476-873)||(30596264-30596660)
chr3 (485-873)||(20376647-20377033)
chr3 (486-873)||(10597059-10597445)
chr3 (555-869)||(12256050-12256363)
chr3 (476-873)||(46070515-46070911)
chr3 (472-873)||(18961305-18961705)
chr3 (485-873)||(54091140-54091527)
chr3 (26-378)||(16382742-16383097)
chr3 (26-316)||(14652640-14652933)
chr3 (476-863)||(11963565-11963951)
chr3 (485-863)||(29551293-29551671)
chr3 (483-863)||(48774033-48774411)
chr3 (476-873)||(11956001-11956397)
chr3 (476-873)||(12724538-12724934)
chr3 (26-265)||(13203514-13203756)
chr3 (80-265)||(12304763-12304949)
chr3 (476-863)||(32387432-32387819)
chr3 (485-863)||(9771335-9771711)
chr3 (485-873)||(18756339-18756716)
chr3 (476-863)||(47121496-47121881)
chr3 (476-863)||(47128864-47129249)
chr3 (476-863)||(50142184-50142569)
chr3 (84-265)||(17157079-17157262)
chr3 (476-873)||(15374993-15375389)
chr3 (485-863)||(16833591-16833966)
chr3 (486-873)||(49163525-49163911)
chr3 (87-265)||(24191783-24191963)
chr3 (65-241)||(9532849-9533027)
chr3 (476-808)||(16331063-16331394)
chr3 (536-860)||(28759278-28759600)
chr3 (65-265)||(41456123-41456325)
chr3 (483-863)||(2498458-2498836)
chr3 (483-863)||(16413698-16414076)
chr3 (483-863)||(3782166-3782546)
chr3 (65-265)||(16802425-16802626)
chr3 (42-276)||(14544155-14544394)
chr3 (65-241)||(8583294-8583471)
chr3 (65-241)||(14084531-14084708)
chr3 (65-241)||(14089932-14090109)
chr3 (534-863)||(38743321-38743648)
chr3 (476-863)||(43723478-43723864)
chr3 (65-241)||(24123203-24123380)
chr3 (35-238)||(34852211-34852417)
chr3 (65-241)||(49399473-49399650)
chr3 (602-873)||(12363900-12364171)
chr3 (65-223)||(13968850-13969010)
chr3 (65-223)||(13974325-13974485)
chr3 (476-863)||(29493905-29494290)
chr3 (535-691)||(14293170-14293326)
chr3 (31-265)||(14292667-14292906)
chr3 (65-220)||(17190836-17190992)
chr3 (485-863)||(53570647-53571024)
chr3 (15-188)||(16830055-16830230)
chr3 (485-863)||(45612014-45612390)
chr3 (536-863)||(21150902-21151227)
chr3 (96-265)||(23174189-23174358)
chr3 (536-863)||(54832625-54832950)
chr3 (476-808)||(50655455-50655787)
chr3 (536-863)||(6927025-6927350)
chr3 (609-873)||(27034255-27034518)
chr3 (500-808)||(9690916-9691223)
chr3 (483-863)||(10768113-10768492)
chr3 (482-863)||(14844578-14844958)
chr3 (752-863)||(51246369-51246479)
chr3 (483-863)||(10410950-10411328)
chr3 (483-863)||(10382297-10382675)
chr3 (602-691)||(14298864-14298953)
chr3 (602-746)||(27029231-27029375)
chr3 (776-863)||(17198437-17198523)
chr3 (776-863)||(53872061-53872147)
chr3 (108-265)||(17199015-17199175)
chr3 (555-689)||(12255605-12255738)
chr3 (65-264)||(12961378-12961580)
chr3 (108-265)||(31690570-31690731)
chr3 (776-873)||(35985389-35985485)
chr3 (753-873)||(14570476-14570595)
chr3 (785-873)||(16410337-16410424)
chr3 (107-240)||(17243680-17243815)
chr3 (791-863)||(51477519-51477590)
chr3 (178-265)||(23173876-23173963)
chr3 (776-873)||(12537109-12537205)
chr3 (776-873)||(13054595-13054691)
chr3 (555-724)||(15954489-15954659)
chr3 (602-770)||(11305251-11305419)
chr3 (826-873)||(16331021-16331068)
chr3 (475-561)||(15011599-15011685)
chr3 (38-265)||(19443448-19443674)
chr3 (826-872)||(24283830-24283876)
chr3 (822-863)||(17197971-17198012)
chr3 (39-149)||(18719227-18719339)
chr3 (485-669)||(24284012-24284186)
chr3 (826-863)||(50655423-50655460)
chr3 (485-525)||(14288757-14288797)
chr3 (35-149)||(23173755-23173869)
chr3 (476-559)||(14570210-14570293)
chr3 (108-239)||(18889009-18889143)
chr3 (476-519)||(28759248-28759291)
chr3 (776-873)||(11889155-11889251)
chr3 (602-688)||(13036547-13036633)
chr3 (474-560)||(16823491-16823577)
chr3 (108-265)||(18900048-18900209)
chr3 (776-817)||(1464931-1464972)
chr3 (176-265)||(12255238-12255326)
chr3 (449-498)||(16348977-16349025)
chr3 (776-873)||(16823189-16823284)
chr3 (602-770)||(2269742-2269910)
chr3 (575-771)||(13692428-13692624)
chr3 (476-548)||(15934650-15934722)
chr3 (474-525)||(17496535-17496586)
chr3 (488-523)||(27029443-27029478)
chr3 (832-863)||(30099767-30099798)
chr3 (602-688)||(12153382-12153468)
chr3 (602-688)||(12274783-12274869)
chr3 (485-519)||(21151214-21151248)
chr3 (65-126)||(11850780-11850840)
chr3 (602-691)||(11964498-11964587)
chr3 (776-817)||(15471504-15471545)
chr3 (476-529)||(15954674-15954727)
chr3 (449-498)||(16382626-16382674)
chr3 (776-817)||(22109777-22109818)
chr3 (776-817)||(22791878-22791919)
chr3 (828-873)||(27029133-27029178)
chr3 (176-265)||(31943556-31943645)
[»] chr8 (106 HSPs)
chr8 (31-873)||(9272553-9273394)
chr8 (23-873)||(18680899-18681745)
chr8 (23-873)||(31567207-31568054)
chr8 (23-873)||(31572428-31573275)
chr8 (15-873)||(1803884-1804718)
chr8 (23-623)||(36799334-36799929)
chr8 (19-873)||(22177538-22178392)
chr8 (26-873)||(22055678-22056523)
chr8 (26-873)||(22050160-22051005)
chr8 (485-873)||(22062957-22063345)
chr8 (535-873)||(22024954-22025292)
chr8 (476-873)||(31411877-31412273)
chr8 (476-873)||(31418059-31418455)
chr8 (483-863)||(14745896-14746274)
chr8 (476-873)||(11391973-11392369)
chr8 (478-873)||(43687757-43688150)
chr8 (476-863)||(9204728-9205113)
chr8 (483-863)||(26485398-26485776)
chr8 (471-873)||(14415941-14416343)
chr8 (483-873)||(16266236-16266624)
chr8 (476-873)||(19296886-19297283)
chr8 (483-863)||(6588443-6588821)
chr8 (483-873)||(12303567-12303955)
chr8 (602-873)||(1264560-1264830)
chr8 (482-863)||(851836-852216)
chr8 (485-863)||(10956063-10956438)
chr8 (482-863)||(27908970-27909350)
chr8 (482-863)||(27955389-27955769)
chr8 (485-863)||(14736198-14736574)
chr8 (485-873)||(29328571-29328957)
chr8 (485-863)||(10947981-10948356)
chr8 (65-241)||(44476236-44476414)
chr8 (65-241)||(44479498-44479676)
chr8 (482-863)||(4520107-4520487)
chr8 (482-863)||(237556-237935)
chr8 (482-863)||(800443-800822)
chr8 (480-873)||(29298446-29298838)
chr8 (482-863)||(214319-214698)
chr8 (482-863)||(727942-728321)
chr8 (482-863)||(807414-807793)
chr8 (38-265)||(22025559-22025791)
chr8 (65-241)||(23825124-23825301)
chr8 (485-863)||(14765965-14766341)
chr8 (485-863)||(16886675-16887051)
chr8 (65-265)||(17053597-17053799)
chr8 (65-241)||(19902928-19903105)
chr8 (65-241)||(23865434-23865611)
chr8 (65-241)||(25409554-25409731)
chr8 (65-265)||(30766925-30767126)
chr8 (485-873)||(27890259-27890645)
chr8 (38-265)||(22063562-22063794)
chr8 (65-265)||(14057583-14057784)
chr8 (476-873)||(25700982-25701377)
chr8 (485-873)||(27902498-27902884)
chr8 (485-873)||(27948917-27949303)
chr8 (639-863)||(29305006-29305229)
chr8 (483-691)||(40143839-40144050)
chr8 (604-873)||(19987570-19987839)
chr8 (483-691)||(27346088-27346294)
chr8 (493-873)||(27896600-27896978)
chr8 (476-863)||(28981094-28981480)
chr8 (476-863)||(28986314-28986700)
chr8 (483-691)||(23117574-23117781)
chr8 (485-849)||(23224139-23224501)
chr8 (485-863)||(3224061-3224437)
chr8 (536-863)||(1051066-1051393)
chr8 (776-873)||(20973400-20973497)
chr8 (485-808)||(19859930-19860255)
chr8 (749-863)||(12913631-12913744)
chr8 (135-265)||(25110911-25111043)
chr8 (39-265)||(41009433-41009658)
chr8 (65-240)||(18609793-18609969)
chr8 (40-265)||(21326822-21327047)
chr8 (775-863)||(23224075-23224162)
chr8 (483-691)||(35541423-35541629)
chr8 (475-873)||(22744115-22744503)
chr8 (110-265)||(21668901-21669059)
chr8 (108-265)||(21282101-21282261)
chr8 (602-873)||(33089406-33089677)
chr8 (65-265)||(21322234-21322439)
chr8 (602-873)||(14594128-14594399)
chr8 (602-735)||(21683205-21683338)
chr8 (602-735)||(21687554-21687687)
chr8 (823-863)||(7003448-7003488)
chr8 (476-873)||(20011493-20011879)
chr8 (39-265)||(10606904-10607136)
chr8 (480-522)||(29305342-29305384)
chr8 (602-873)||(25624041-25624311)
chr8 (827-863)||(27346379-27346415)
chr8 (474-525)||(14594466-14594517)
chr8 (39-147)||(20974118-20974228)
chr8 (475-525)||(20005340-20005390)
chr8 (602-735)||(43112566-43112699)
chr8 (753-873)||(20005088-20005207)
chr8 (602-735)||(20006763-20006896)
chr8 (602-735)||(21689947-21690080)
chr8 (602-647)||(22175666-22175711)
chr8 (824-873)||(40143708-40143757)
chr8 (827-863)||(35541714-35541750)
chr8 (476-551)||(20006648-20006723)
chr8 (472-523)||(21690149-21690200)
chr8 (65-148)||(31412606-31412688)
chr8 (65-148)||(31418788-31418870)
chr8 (776-817)||(5610138-5610179)
chr8 (776-817)||(21286801-21286842)
chr8 (474-523)||(25624379-25624428)
[»] chr5 (106 HSPs)
chr5 (15-873)||(17270647-17271503)
chr5 (15-873)||(17264165-17265021)
chr5 (15-873)||(21677638-21678492)
chr5 (15-873)||(22174964-22175812)
chr5 (65-873)||(9775467-9776278)
chr5 (26-873)||(20937553-20938399)
chr5 (472-873)||(22312204-22312604)
chr5 (476-873)||(18940612-18941008)
chr5 (471-873)||(757674-758076)
chr5 (476-873)||(39608270-39608667)
chr5 (602-873)||(22499948-22500219)
chr5 (485-873)||(27635252-27635629)
chr5 (26-276)||(758216-758468)
chr5 (476-863)||(25420185-25420571)
chr5 (483-873)||(18566913-18567301)
chr5 (26-316)||(22509094-22509386)
chr5 (485-863)||(23544269-23544647)
chr5 (476-873)||(24057959-24058355)
chr5 (65-265)||(37805292-37805492)
chr5 (476-873)||(20990666-20991061)
chr5 (26-276)||(22312793-22313046)
chr5 (483-863)||(33536417-33536795)
chr5 (479-863)||(597594-597975)
chr5 (488-863)||(23075699-23076074)
chr5 (482-863)||(11995462-11995842)
chr5 (485-863)||(20340862-20341238)
chr5 (476-873)||(26650766-26651152)
chr5 (476-873)||(26922351-26922737)
chr5 (485-863)||(20347466-20347842)
chr5 (482-863)||(22247644-22248025)
chr5 (482-863)||(24799788-24800168)
chr5 (65-241)||(19510999-19511177)
chr5 (485-863)||(19508491-19508867)
chr5 (476-863)||(22379847-22380233)
chr5 (483-863)||(22501300-22501678)
chr5 (482-863)||(17938289-17938668)
chr5 (483-691)||(29746172-29746379)
chr5 (476-863)||(5337761-5338137)
chr5 (479-863)||(19799748-19800130)
chr5 (483-863)||(22507881-22508259)
chr5 (476-860)||(38014051-38014434)
chr5 (476-863)||(14614357-14614743)
chr5 (483-863)||(5454812-5455190)
chr5 (476-863)||(16774461-16774835)
chr5 (65-265)||(23527448-23527651)
chr5 (483-863)||(24008375-24008754)
chr5 (65-265)||(22439701-22439902)
chr5 (485-863)||(40010380-40010756)
chr5 (476-873)||(7773044-7773440)
chr5 (485-863)||(15461797-15462172)
chr5 (483-863)||(10686467-10686845)
chr5 (602-873)||(22237249-22237520)
chr5 (476-863)||(1111086-1111471)
chr5 (485-863)||(18894403-18894780)
chr5 (35-238)||(10816743-10816949)
chr5 (65-241)||(21675471-21675648)
chr5 (35-238)||(23538770-23538976)
chr5 (476-738)||(28259406-28259668)
chr5 (485-863)||(43029366-43029743)
chr5 (65-223)||(1857520-1857680)
chr5 (485-863)||(30781392-30781768)
chr5 (482-863)||(37539363-37539743)
chr5 (482-863)||(37546907-37547287)
chr5 (483-863)||(7507419-7507801)
chr5 (483-863)||(25846659-25847036)
chr5 (582-863)||(5581696-5581975)
chr5 (565-873)||(22232096-22232404)
chr5 (65-193)||(23112785-23112914)
chr5 (483-863)||(25853240-25853617)
chr5 (475-873)||(21901237-21901626)
chr5 (476-691)||(14881891-14882106)
chr5 (476-691)||(14888568-14888783)
chr5 (474-873)||(15193377-15193766)
chr5 (776-873)||(19363240-19363336)
chr5 (471-873)||(19801294-19801684)
chr5 (472-561)||(22508857-22508946)
chr5 (776-873)||(23081402-23081499)
chr5 (474-873)||(25013966-25014355)
chr5 (776-873)||(21495569-21495665)
chr5 (602-873)||(17022155-17022427)
chr5 (602-873)||(427718-427989)
chr5 (602-735)||(23561108-23561241)
chr5 (822-873)||(28259322-28259373)
chr5 (475-561)||(21495277-21495363)
chr5 (602-873)||(21889083-21889354)
chr5 (602-647)||(37566508-37566553)
chr5 (602-873)||(20843563-20843834)
chr5 (475-873)||(10035527-10035916)
chr5 (38-265)||(22007896-22008124)
chr5 (64-149)||(19362597-19362678)
chr5 (754-873)||(37575080-37575198)
chr5 (475-565)||(18819319-18819409)
chr5 (65-149)||(19801964-19802044)
chr5 (602-688)||(23443744-23443830)
chr5 (485-518)||(17022502-17022535)
chr5 (475-560)||(21888966-21889051)
chr5 (822-873)||(18819627-18819679)
chr5 (602-673)||(7785719-7785790)
chr5 (35-143)||(22232735-22232844)
chr5 (65-149)||(27635972-27636054)
chr5 (776-817)||(5888675-5888716)
chr5 (598-735)||(18819432-18819569)
chr5 (776-817)||(21498517-21498558)
chr5 (776-817)||(21741043-21741084)
chr5 (555-688)||(21829987-21830120)
chr5 (65-126)||(24751647-24751707)
[»] chr6 (99 HSPs)
chr6 (15-795)||(33681652-33682430)
chr6 (23-873)||(14033100-14033947)
chr6 (26-873)||(23835018-23835860)
chr6 (38-873)||(28359225-28360059)
chr6 (26-873)||(27561909-27562753)
chr6 (65-873)||(28289576-28290384)
chr6 (26-873)||(19726565-19727411)
chr6 (26-873)||(21724129-21724978)
chr6 (26-808)||(1592718-1593491)
chr6 (26-767)||(22906924-22907653)
chr6 (555-873)||(23234305-23234622)
chr6 (470-873)||(26418041-26418443)
chr6 (485-873)||(10470122-10470509)
chr6 (476-873)||(12446590-12446986)
chr6 (65-265)||(12941800-12942000)
chr6 (476-863)||(27767725-27768111)
chr6 (499-800)||(933738-934039)
chr6 (486-873)||(17207132-17207518)
chr6 (476-863)||(16223055-16223441)
chr6 (482-863)||(17310037-17310417)
chr6 (476-863)||(25464207-25464592)
chr6 (483-863)||(8069091-8069469)
chr6 (485-863)||(29926069-29926446)
chr6 (483-863)||(19096185-19096563)
chr6 (84-265)||(21566163-21566346)
chr6 (482-863)||(15331516-15331896)
chr6 (65-265)||(12167237-12167439)
chr6 (476-873)||(13127670-13128055)
chr6 (65-265)||(19286146-19286348)
chr6 (65-241)||(29615199-29615376)
chr6 (476-863)||(10463617-10464004)
chr6 (65-265)||(19877330-19877532)
chr6 (65-265)||(19883106-19883308)
chr6 (65-241)||(25470691-25470868)
chr6 (26-265)||(937658-937900)
chr6 (65-241)||(24562282-24562459)
chr6 (602-873)||(18786601-18786872)
chr6 (65-241)||(34647652-34647829)
chr6 (65-265)||(19786847-19787050)
chr6 (483-863)||(24362940-24363317)
chr6 (65-241)||(23837580-23837758)
chr6 (65-241)||(34640978-34641155)
chr6 (602-873)||(14615661-14615932)
chr6 (536-863)||(24369583-24369908)
chr6 (602-873)||(17414524-17414795)
chr6 (485-873)||(13940806-13941193)
chr6 (483-863)||(25315042-25315421)
chr6 (483-863)||(26202536-26202915)
chr6 (104-238)||(29416468-29416605)
chr6 (483-691)||(94063-94270)
chr6 (602-873)||(21476815-21477086)
chr6 (776-873)||(23020754-23020850)
chr6 (602-873)||(21470314-21470585)
chr6 (483-691)||(29159442-29159648)
chr6 (776-873)||(93904-94000)
chr6 (754-863)||(30799083-30799191)
chr6 (153-265)||(18788448-18788560)
chr6 (153-265)||(18799428-18799540)
chr6 (803-873)||(22907639-22907710)
chr6 (826-873)||(33681625-33681672)
chr6 (776-873)||(17882190-17882286)
chr6 (479-863)||(34133363-34133748)
chr6 (153-265)||(19439792-19439904)
chr6 (39-265)||(19588556-19588781)
chr6 (602-873)||(22797897-22798168)
chr6 (752-863)||(25559319-25559429)
chr6 (38-257)||(8760410-8760633)
chr6 (139-241)||(11289602-11289705)
chr6 (485-873)||(18315356-18315733)
chr6 (776-873)||(23105896-23105992)
chr6 (602-873)||(24721127-24721398)
chr6 (602-770)||(19468352-19468520)
chr6 (38-149)||(14581950-14582056)
chr6 (563-873)||(18138048-18138359)
chr6 (38-265)||(19300643-19300868)
chr6 (602-735)||(19819425-19819558)
chr6 (604-673)||(25773203-25773272)
chr6 (473-525)||(8760144-8760196)
chr6 (110-265)||(19818944-19819102)
chr6 (827-863)||(29159733-29159769)
chr6 (485-559)||(14132719-14132794)
chr6 (474-525)||(23105603-23105654)
chr6 (823-873)||(9185238-9185288)
chr6 (108-265)||(24513801-24513962)
chr6 (38-265)||(8768149-8768370)
chr6 (485-550)||(9185519-9185584)
chr6 (485-518)||(21470207-21470240)
chr6 (485-518)||(21476708-21476741)
chr6 (449-505)||(937421-937476)
chr6 (473-525)||(8767891-8767943)
chr6 (602-770)||(23232895-23233063)
chr6 (483-519)||(24369560-24369596)
chr6 (483-519)||(30799178-30799214)
chr6 (834-873)||(1593495-1593534)
chr6 (65-103)||(11283984-11284022)
chr6 (823-873)||(14132417-14132467)
chr6 (602-688)||(19451803-19451889)
chr6 (65-149)||(23021423-23021503)
chr6 (602-691)||(19588142-19588231)
[»] chr7 (149 HSPs)
chr7 (23-873)||(806370-807216)
chr7 (23-873)||(18055081-18055928)
chr7 (23-873)||(11631312-11632159)
chr7 (23-873)||(18048602-18049449)
chr7 (15-873)||(23200870-23201729)
chr7 (15-873)||(23506997-23507856)
chr7 (26-818)||(20579370-20580157)
chr7 (65-873)||(23665195-23666004)
chr7 (65-873)||(29795730-29796528)
chr7 (65-873)||(29799549-29800347)
chr7 (26-873)||(15722587-15723433)
chr7 (26-767)||(19599801-19600544)
chr7 (488-873)||(17182088-17182471)
chr7 (406-873)||(14135395-14135847)
chr7 (406-873)||(14432367-14432819)
chr7 (406-873)||(14128549-14129001)
chr7 (472-873)||(15339226-15339626)
chr7 (476-873)||(18957794-18958190)
chr7 (488-873)||(37243673-37244057)
chr7 (470-873)||(16951601-16952002)
chr7 (26-284)||(15338785-15339046)
chr7 (483-873)||(2387988-2388376)
chr7 (483-863)||(13963422-13963800)
chr7 (65-265)||(11302852-11303052)
chr7 (26-276)||(35962701-35962955)
chr7 (26-276)||(14431948-14432201)
chr7 (26-276)||(15710956-15711209)
chr7 (476-873)||(15838969-15839367)
chr7 (483-873)||(13453210-13453598)
chr7 (483-863)||(21757667-21758046)
chr7 (486-873)||(16843280-16843666)
chr7 (476-873)||(30271194-30271589)
chr7 (476-873)||(26289145-26289530)
chr7 (476-863)||(1318133-1318519)
chr7 (483-860)||(20019095-20019470)
chr7 (472-873)||(14281030-14281418)
chr7 (476-863)||(26089369-26089755)
chr7 (28-265)||(1612584-1612825)
chr7 (476-863)||(5186662-5187047)
chr7 (476-723)||(35962258-35962505)
chr7 (479-872)||(12454430-12454821)
chr7 (676-873)||(15347205-15347402)
chr7 (65-316)||(14281569-14281822)
chr7 (482-863)||(42058926-42059306)
chr7 (65-241)||(12591635-12591812)
chr7 (485-863)||(37285584-37285960)
chr7 (65-265)||(13006306-13006508)
chr7 (65-241)||(14421354-14421532)
chr7 (65-265)||(16676192-16676393)
chr7 (485-863)||(11879443-11879819)
chr7 (483-863)||(26119790-26120166)
chr7 (479-691)||(49159113-49159323)
chr7 (483-863)||(642923-643301)
chr7 (483-863)||(2439258-2439636)
chr7 (476-863)||(48987339-48987725)
chr7 (602-866)||(3328320-3328584)
chr7 (65-241)||(13123971-13124148)
chr7 (602-873)||(14945245-14945515)
chr7 (602-873)||(15372838-15373108)
chr7 (476-863)||(40684180-40684567)
chr7 (476-860)||(750210-750593)
chr7 (478-808)||(23521369-23521701)
chr7 (495-863)||(12461902-12462268)
chr7 (483-863)||(26113174-26113553)
chr7 (483-863)||(30602280-30602658)
chr7 (65-241)||(4279963-4280140)
chr7 (35-240)||(16109067-16109274)
chr7 (65-241)||(19616295-19616472)
chr7 (483-863)||(2281459-2281839)
chr7 (65-265)||(17650429-17650629)
chr7 (476-863)||(8196618-8197004)
chr7 (485-873)||(13020081-13020469)
chr7 (483-863)||(46174699-46175073)
chr7 (65-241)||(12710900-12711077)
chr7 (65-241)||(13742505-13742682)
chr7 (65-265)||(20328224-20328425)
chr7 (38-265)||(6411792-6412023)
chr7 (483-863)||(11898729-11899107)
chr7 (483-863)||(33405027-33405405)
chr7 (96-265)||(11390302-11390473)
chr7 (138-276)||(14128244-14128383)
chr7 (476-863)||(40922340-40922726)
chr7 (485-691)||(6412241-6412447)
chr7 (96-265)||(11383814-11383985)
chr7 (680-873)||(15085337-15085529)
chr7 (476-632)||(19439676-19439832)
chr7 (96-265)||(18606896-18607067)
chr7 (485-863)||(2025642-2026018)
chr7 (489-863)||(32627783-32628156)
chr7 (602-873)||(15436946-15437216)
chr7 (110-265)||(21232009-21232167)
chr7 (476-863)||(49150954-49151339)
chr7 (476-863)||(49157644-49158029)
chr7 (483-691)||(18436757-18436964)
chr7 (751-863)||(49159405-49159516)
chr7 (39-265)||(11220086-11220311)
chr7 (536-863)||(11340168-11340493)
chr7 (803-873)||(19600530-19600600)
chr7 (449-561)||(15710671-15710782)
chr7 (779-873)||(13026582-13026676)
chr7 (602-735)||(81590-81723)
chr7 (752-873)||(15632003-15632123)
chr7 (475-873)||(19152255-19152644)
chr7 (475-873)||(20751654-20752043)
chr7 (178-265)||(36306034-36306121)
chr7 (781-863)||(12399258-12399339)
chr7 (776-873)||(12695293-12695389)
chr7 (602-872)||(15097341-15097611)
chr7 (776-873)||(19146228-19146324)
chr7 (776-873)||(20745627-20745723)
chr7 (475-561)||(23442600-23442686)
chr7 (476-873)||(45185849-45186236)
chr7 (776-873)||(14287496-14287592)
chr7 (602-735)||(21518685-21518818)
chr7 (602-873)||(46681568-46681839)
chr7 (602-873)||(15142730-15143000)
chr7 (536-660)||(17725958-17726081)
chr7 (474-561)||(12695000-12695087)
chr7 (555-724)||(14169055-14169225)
chr7 (555-724)||(14173302-14173472)
chr7 (475-525)||(19145973-19146023)
chr7 (475-525)||(20745372-20745422)
chr7 (753-873)||(14249910-14250029)
chr7 (555-873)||(12554921-12555239)
chr7 (602-770)||(46348231-46348399)
chr7 (826-873)||(10520536-10520583)
chr7 (573-732)||(12208074-12208233)
chr7 (474-525)||(18009702-18009753)
chr7 (834-873)||(20579337-20579376)
chr7 (602-688)||(13318214-13318300)
chr7 (485-550)||(15690368-15690433)
chr7 (485-550)||(15697961-15698026)
chr7 (602-706)||(16475678-16475782)
chr7 (65-149)||(37244401-37244484)
chr7 (110-265)||(3289754-3289911)
chr7 (602-733)||(12800804-12800935)
chr7 (474-561)||(15142612-15142699)
chr7 (476-523)||(16073684-16073731)
chr7 (834-873)||(23442950-23442989)
chr7 (775-817)||(810650-810692)
chr7 (776-846)||(12255264-12255333)
chr7 (475-561)||(14039072-14039158)
chr7 (475-561)||(14349102-14349188)
chr7 (776-817)||(2279619-2279660)
chr7 (563-647)||(14250135-14250220)
chr7 (776-817)||(16219216-16219257)
chr7 (485-518)||(16668182-16668215)
chr7 (485-518)||(17642552-17642585)
chr7 (776-817)||(22073496-22073537)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (114-872)||(40549-41304)
scaffold0124 (65-265)||(36793-36994)
scaffold0124 (26-110)||(8493-8577)
scaffold0124 (176-267)||(43965-44057)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (26-873)||(13868-14714)
scaffold0239 (100-873)||(6585-7356)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (26-873)||(50341-51189)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (26-872)||(258633-259477)
scaffold0005 (26-873)||(265059-265893)
scaffold0005 (485-561)||(17854-17930)
scaffold0005 (834-873)||(17552-17591)
scaffold0005 (602-673)||(17753-17824)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (26-871)||(41890-42717)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (26-873)||(13967-14814)
scaffold0063 (26-873)||(24168-25015)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (38-873)||(13943-14776)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (535-873)||(14884-15222)
scaffold0348 (26-194)||(15511-15682)
scaffold0348 (108-265)||(2962-3123)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (26-673)||(141285-141930)
scaffold0021 (110-238)||(146611-146742)
scaffold0021 (752-829)||(141958-142035)
[»] scaffold0026 (9 HSPs)
scaffold0026 (562-873)||(62593-62904)
scaffold0026 (19-265)||(63169-63418)
scaffold0026 (65-242)||(12876-13054)
scaffold0026 (38-265)||(124446-124677)
scaffold0026 (776-873)||(36266-36362)
scaffold0026 (475-561)||(35975-36061)
scaffold0026 (776-873)||(143365-143461)
scaffold0026 (475-518)||(143073-143116)
scaffold0026 (476-525)||(124188-124237)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (506-873)||(17913-18279)
scaffold0058 (38-274)||(17447-17688)
[»] scaffold0076 (5 HSPs)
scaffold0076 (602-873)||(51079-51349)
scaffold0076 (485-857)||(435-806)
scaffold0076 (65-241)||(35546-35723)
scaffold0076 (65-223)||(30162-30322)
scaffold0076 (86-265)||(51676-51858)
[»] scaffold0323 (2 HSPs)
scaffold0323 (565-873)||(7739-8046)
scaffold0323 (110-265)||(7293-7451)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (555-873)||(15050-15367)
scaffold0034 (555-873)||(9485-9802)
scaffold0034 (65-265)||(17376-17580)
scaffold0034 (183-265)||(10080-10162)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (471-872)||(668-1067)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (485-873)||(27146-27533)
scaffold0065 (65-227)||(27781-27945)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (483-863)||(19980-20358)
scaffold0103 (483-863)||(23226-23604)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (565-873)||(71579-71886)
scaffold0025 (84-265)||(15432-15615)
scaffold0025 (130-265)||(71154-71291)
scaffold0025 (602-873)||(77247-77518)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (602-873)||(20699-20969)
scaffold0074 (176-265)||(17006-17095)
scaffold0074 (38-79)||(16913-16955)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (602-873)||(5281-5551)
scaffold0574 (38-265)||(5877-6108)
[»] scaffold0301 (3 HSPs)
scaffold0301 (555-873)||(12794-13111)
scaffold0301 (39-153)||(13504-13620)
scaffold0301 (555-688)||(3689-3823)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (485-863)||(101073-101450)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (483-863)||(31945-32323)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (480-863)||(253904-254275)
scaffold0009 (480-873)||(247390-247771)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (471-873)||(2365-2767)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (476-863)||(10120-10505)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (709-873)||(1-165)
scaffold0035 (555-786)||(10924-11154)
scaffold0035 (602-735)||(1060-1193)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (26-265)||(6006-6249)
[»] scaffold0011 (10 HSPs)
scaffold0011 (26-265)||(152320-152562)
scaffold0011 (65-241)||(174561-174738)
scaffold0011 (38-265)||(258469-258696)
scaffold0011 (602-873)||(56154-56425)
scaffold0011 (555-795)||(154612-154852)
scaffold0011 (602-795)||(252412-252605)
scaffold0011 (602-795)||(259018-259211)
scaffold0011 (752-873)||(21039-21161)
scaffold0011 (575-770)||(147445-147640)
scaffold0011 (485-550)||(21354-21419)
[»] scaffold1584 (2 HSPs)
scaffold1584 (558-873)||(805-1119)
scaffold1584 (110-265)||(365-524)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (602-873)||(11-281)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (472-873)||(16259-16660)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (476-863)||(19579-19964)
scaffold0113 (476-863)||(15481-15866)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (476-873)||(64701-65096)
scaffold0068 (754-873)||(51253-51371)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (84-265)||(4275-4458)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (483-873)||(7538-7926)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (65-265)||(4594-4795)
scaffold0077 (476-525)||(23518-23567)
scaffold0077 (476-525)||(17885-17934)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (65-265)||(10234-10435)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (481-863)||(19528-19909)
[»] scaffold0093 (2 HSPs)
scaffold0093 (477-863)||(25014-25398)
scaffold0093 (602-863)||(35806-36066)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (485-860)||(137451-137825)
scaffold0019 (752-873)||(13290-13410)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (483-863)||(1268-1647)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (31-265)||(10305-10543)
scaffold0220 (602-795)||(10887-11080)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (483-873)||(104661-105049)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (483-863)||(428-806)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (42-276)||(47376-47615)
scaffold0067 (42-276)||(62796-63035)
scaffold0067 (42-276)||(56410-56649)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (483-863)||(17826-18204)
scaffold0154 (65-265)||(29748-29948)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (65-241)||(110758-110935)
scaffold0029 (65-127)||(116793-116855)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (602-873)||(171190-171461)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (31-265)||(5112-5350)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (476-863)||(31190-31575)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (483-863)||(11634-12012)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (65-241)||(38401-38578)
scaffold0106 (602-873)||(46138-46409)
scaffold0106 (602-873)||(50411-50682)
scaffold0106 (176-265)||(46732-46822)
scaffold0106 (176-265)||(51005-51095)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (65-241)||(46979-47156)
scaffold0028 (65-241)||(52384-52561)
scaffold0028 (783-873)||(91977-92066)
scaffold0028 (475-524)||(92317-92366)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (480-863)||(160901-161283)
scaffold0003 (483-561)||(80847-80925)
scaffold0003 (485-518)||(98197-98230)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (602-873)||(2658-2928)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (65-241)||(2566-2743)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (602-873)||(44719-44990)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (485-732)||(20028-20275)
scaffold0023 (98-265)||(20493-20664)
scaffold0023 (602-735)||(152868-153001)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (65-241)||(174561-174739)
scaffold0001 (483-691)||(512113-512320)
scaffold0001 (65-241)||(489127-489304)
scaffold0001 (752-873)||(179632-179752)
scaffold0001 (35-265)||(95817-96051)
scaffold0001 (64-149)||(179002-179083)
scaffold0001 (476-795)||(449125-449433)
scaffold0001 (803-873)||(511982-512051)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (65-223)||(9649-9809)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (96-265)||(143-314)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (84-265)||(10217-10400)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (602-873)||(11712-11983)
scaffold0243 (42-265)||(16021-16250)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (480-795)||(41600-41914)
scaffold0060 (824-857)||(41892-41925)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (483-661)||(4247-4424)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (485-873)||(16449-16835)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (483-691)||(25414-25621)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (483-863)||(13782-14160)
[»] scaffold0377 (2 HSPs)
scaffold0377 (488-873)||(7643-8028)
scaffold0377 (488-873)||(3604-3989)
[»] scaffold0214 (2 HSPs)
scaffold0214 (483-691)||(14777-14984)
scaffold0214 (826-863)||(14628-14665)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (476-863)||(50369-50755)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (479-863)||(1638-2022)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (483-863)||(21492-21872)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (776-873)||(3017-3114)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (602-873)||(9195-9466)
scaffold0207 (485-518)||(9087-9120)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (602-873)||(43495-43766)
scaffold0010 (602-873)||(48561-48832)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (22-265)||(4981-5230)
[»] scaffold0192 (4 HSPs)
scaffold0192 (581-873)||(21349-21641)
scaffold0192 (602-741)||(32037-32176)
scaffold0192 (485-518)||(21264-21297)
scaffold0192 (489-523)||(31935-31969)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (713-873)||(45112-45272)
scaffold0102 (602-873)||(30336-30607)
scaffold0102 (488-525)||(38826-38863)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (773-873)||(6152-6252)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (84-223)||(1-132)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (65-193)||(1-131)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (110-265)||(41592-41750)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (156-242)||(1-87)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (575-689)||(14896-15010)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (749-863)||(17932-18045)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (485-873)||(901-1280)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (26-126)||(3617-3718)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (754-863)||(11734-11842)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (65-265)||(8410-8615)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (602-818)||(4495-4711)
scaffold0120 (776-817)||(32459-32500)
scaffold0120 (776-817)||(46505-46546)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (110-265)||(326816-326975)
scaffold0004 (39-265)||(321040-321266)
scaffold0004 (108-239)||(115778-115911)
[»] scaffold0244 (3 HSPs)
scaffold0244 (474-873)||(14010-14400)
scaffold0244 (474-561)||(200-288)
scaffold0244 (776-873)||(494-590)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (108-239)||(102930-103063)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (110-265)||(392-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (110-265)||(16914-17072)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (752-873)||(1150-1269)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (575-771)||(18826-19022)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (555-771)||(9723-9939)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (39-265)||(27840-28065)
scaffold0097 (602-735)||(28369-28502)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (598-873)||(27763-28038)
scaffold0205 (485-529)||(27661-27705)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (476-570)||(73831-73925)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (602-873)||(2343-2614)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (827-873)||(8226-8272)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (776-873)||(13128-13224)
scaffold0180 (602-683)||(12954-13035)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (475-561)||(25844-25930)
[»] scaffold1336 (2 HSPs)
scaffold1336 (776-873)||(134-229)
scaffold1336 (475-523)||(472-520)
[»] scaffold0669 (1 HSPs)
scaffold0669 (485-561)||(1398-1474)
[»] scaffold0661 (1 HSPs)
scaffold0661 (602-873)||(3442-3713)
[»] scaffold1290 (1 HSPs)
scaffold1290 (476-873)||(647-1034)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (475-561)||(26708-26794)
scaffold0201 (598-683)||(26820-26905)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (776-873)||(2300-2396)
scaffold0139 (602-795)||(26406-26599)
scaffold0139 (485-524)||(2640-2679)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (602-873)||(6816-7089)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (752-873)||(18499-18618)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (472-525)||(35187-35240)
scaffold0008 (834-873)||(124306-124345)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (754-873)||(1085-1203)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (555-873)||(4384-4702)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (602-873)||(1905-2175)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (602-873)||(6677-6947)
[»] scaffold0266 (4 HSPs)
scaffold0266 (598-873)||(23518-23793)
scaffold0266 (827-873)||(2667-2713)
scaffold0266 (602-673)||(2443-2513)
scaffold0266 (475-518)||(23406-23449)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (26-79)||(78538-78593)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (474-561)||(5070-5157)
scaffold0326 (602-688)||(4953-5039)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (776-872)||(59833-59928)
scaffold0054 (485-873)||(61395-61773)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (475-550)||(3475-3550)
scaffold0039 (822-873)||(3161-3213)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (475-525)||(8946-8996)
scaffold0462 (825-873)||(8607-8656)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (475-525)||(6496-6546)
scaffold0249 (786-873)||(6160-6246)
[»] scaffold0053 (5 HSPs)
scaffold0053 (753-873)||(72285-72405)
scaffold0053 (753-873)||(46114-46234)
scaffold0053 (475-525)||(46441-46491)
scaffold0053 (475-561)||(72580-72666)
scaffold0053 (485-561)||(62952-63029)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (602-735)||(8975-9108)
[»] scaffold2016 (2 HSPs)
scaffold2016 (485-561)||(543-619)
scaffold2016 (834-873)||(240-279)
[»] scaffold0923 (1 HSPs)
scaffold0923 (602-734)||(353-485)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (486-550)||(6695-6759)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (555-795)||(3354-3594)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (475-518)||(4880-4923)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (602-673)||(5789-5860)
scaffold0253 (485-561)||(5682-5758)
[»] scaffold0069 (3 HSPs)
scaffold0069 (602-796)||(35048-35243)
scaffold0069 (485-549)||(29700-29764)
scaffold0069 (485-550)||(34941-35006)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (791-873)||(230-311)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (475-561)||(41339-41425)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (176-265)||(55975-56065)
[»] scaffold0049 (4 HSPs)
scaffold0049 (475-561)||(42615-42701)
scaffold0049 (475-561)||(53310-53396)
scaffold0049 (834-873)||(42313-42352)
scaffold0049 (834-873)||(53008-53047)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (776-873)||(13975-14071)
[»] scaffold0947 (1 HSPs)
scaffold0947 (602-795)||(3627-3820)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (472-525)||(18904-18957)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (602-735)||(16953-17086)
scaffold0078 (776-817)||(11108-11149)
[»] scaffold0461 (4 HSPs)
scaffold0461 (176-267)||(1027-1119)
scaffold0461 (176-267)||(7963-8055)
scaffold0461 (108-164)||(1157-1215)
scaffold0461 (108-164)||(8093-8151)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (108-164)||(2081-2139)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (474-561)||(45914-46001)
scaffold0108 (776-873)||(3791-3887)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (96-149)||(3412-3466)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (110-152)||(370441-370483)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (602-735)||(69-202)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (110-265)||(881-1041)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (776-817)||(3513-3554)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (776-817)||(1223-1264)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (776-817)||(528-569)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (776-817)||(7557-7598)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (485-550)||(3188-3253)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (776-817)||(13785-13826)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (776-817)||(7193-7234)
scaffold0333 (776-817)||(14573-14614)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (776-817)||(13520-13561)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (602-735)||(2222-2355)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (602-683)||(22314-22395)
scaffold0091 (602-683)||(26511-26592)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 701; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 701; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 27296231 - 27295375
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296231 aacaacatatgcaacccatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 27296132  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27296131 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaag 27296032  T
Q  214 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296031 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatctaa-catatacata-tatatgattcaccatccaatttac 27295934  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27295933 aacatttaagtgaattttaattaaatacaacatacatt-cagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatccagggaaa-tatatatcaacatac 27295836  T
Q  414 aagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27295835 aagccatgcttaattcaacaatataaaccatccaaacaacaacagaaatcaaaccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 27295736  T
Q  513 tggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcac 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27295735 tggcgagctcaggaaatcaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcac 27295636  T
Q  613 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacgg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  27295635 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcctctaggcacatgaaactacccaagatacgg 27295536  T
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 812  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27295535 cttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 27295436  T
Q  813 gcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27295435 gcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 27295375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 606; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 12578751 - 12579597
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578751 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 12578850  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578851 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 12578950  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  12578951 tgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaac-gtta 12579048  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || ||| ||||||||| |||||||| || |||||  |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||| || ||||||  |||||| |||||    
T  12579049 ag-gaa-tttaattaagtacaacattca-ttcagtcagcatccattcgtcaaaaccaaccaaaacatcca-agaaagtacatatcagtatacaatccatg 12579144  T
Q  422 c-ttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12579145 caataattcaacaaattaaaccatccaaacaacaacagaaatca-accaaccaaaaactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 12579243  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12579244 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 12579343  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12579344 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 12579443  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12579444 caacattttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagca 12579543  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12579544 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 12579597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 12572269 - 12573115
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572269 atacaacttatcaccactccgctaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 12572368  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572369 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 12572468  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  12572469 tgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaac-gtta 12572566  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || ||| ||||||||| |||||||| || |||||  |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||| || ||||||  |||||| |||||    
T  12572567 ag-gaa-tttaattaagtacaacattca-ttcagtcagcatccattcgtcaaaaccaaccaaaacatcca-agaaagtacatatcagtatacaatccatg 12572662  T
Q  422 c-ttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12572663 caataattcaacaaattaaaccatccaaacaacaacagaaatca-accaaccaaaaactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 12572761  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12572762 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 12572861  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12572862 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 12572961  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12572962 caacattttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagca 12573061  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12573062 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 12573115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 27785653 - 27786500
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785653 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 27785752  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785753 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 27785852  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  27785853 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 27785950  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27785951 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 27786047  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27786048 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatca-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 27786146  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27786147 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 27786246  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27786247 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 27786346  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27786347 caactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagta 27786446  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27786447 atgactactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 27786500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 27790874 - 27791721
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790874 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 27790973  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790974 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 27791073  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  27791074 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 27791171  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27791172 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 27791268  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27791269 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatca-accaactaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 27791367  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27791368 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 27791467  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27791468 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 27791567  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27791568 caactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagta 27791667  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27791668 atgactactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 27791721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 10685801 - 10685007
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10685801 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 10685703  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctaca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10685702 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctaca 10685603  T
Q  263 taccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcat 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  10685602 taccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-aagggagttt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcat 10685507  T
Q  363 ctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaata 456  Q
    | ||||||||    ||||||    ||| ||||||| ||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||  |    
T  10685506 ccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacagca 10685412  T
Q  457 gaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggagg 556  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||         
T  10685411 gaagtcaaaccaacaaaattctgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaataaggtactcgccatggcgagtt----- 10685317  T
Q  557 cgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaa 656  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685316 ------cgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaa 10685223  T
Q  657 acttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactc 756  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10685222 acttgctccagtcttcttaaaaatcatctaggcacatgaaactacccaaaatacggcttgtaacaacatttttaaaatccagattttcacaaggctactc 10685123  T
Q  757 gccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacg 856  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10685122 gctatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgctatggcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtac- 10685024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 2105536 - 2106372
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2105536 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 2105635  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  2105636 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 2105735  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  2105736 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgtg-tatatgactcaccactccaatttacaacattc 2105834  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcca 419  Q
    | ||  |  ||||||||||| | |||||||  |||| | |||| |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  2105835 atgtataacttaattaaataaagcatacatc-cagccaacatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcca 2105930  T
Q  420 tgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcaga-ccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |  | |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2105931 tgcttaat-catcaagataaatcaaccata-aacaacagaaaaccaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgtgagcacatctgctcgctatggcg 2106027  T
Q  518 agctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    |||||||| || |||   |||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||    
T  2106028 agctcaggaaa-cagaacactcgccatggcgagtt-----------cgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaa 2106115  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctta 716  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2106116 tcatcaattctaagctccctaatcatctgtttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggctta 2106215  T
Q  717 aaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcga 816  Q
     ||||| | || |||||||||| ||| | ||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  2106216 taacaatacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgcgatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcga 2106315  T
Q  817 gcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2106316 gcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtttt 2106372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 559 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 19703173 - 19702859
Alignment:
Q  559 aactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaac 658  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  19703173 aactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaactttaattttaagctccctattcatctttttaatctaaaac 19703074  T
Q  659 ttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgc 758  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  19703073 ttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaacccagaatttctcaagggtactcgc 19702974  T
Q  759 catggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggg 858  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19702973 cgcggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggg 19702874  T
Q  859 cagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||    
T  19702873 cagaatgcaggtttt 19702859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 28971040 - 28970645
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  28971040 actgggcaactcgcctcgcgagcatatctgctcgctatggcgaactcaggaaacgggttactcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgaacaga 28970941  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacct-caattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    || | | |||||| ||||    ||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  28970940 aaaaggctgctctcgggagttttgacatttt-ctcacttaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctc 28970842  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||  || |||||||||| || | ||  | ||||||||| |||||||||| ||    
T  28970841 taaaatcatttaggtacactaaactaaccaatttacggcttataacaaca-attgaaaatccagaattcctcacaggtactcgccacggcgagttgtctc 28970743  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28970742 actcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaatgcaggtttt 28970645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 19649239 - 19648922
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||    
T  19649239 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctttcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatttttttaatcta 19649140  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| ||  | |||    
T  19649139 aaacttgctccagttctctctaaaatcacctaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacgatttgaaaatccagaatttctcacaggtac 19649040  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19649039 tcgccacggcgagttgtctcactcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgctaggcgagcgatgaacttctgta 19648941  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19648940 cgggtagaatgcaggtttt 19648922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 480 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15643057 - 15642665
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||    
T  15643057 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaat 15642959  T
Q  579 atggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaa 678  Q
    | |||||||| | ||    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||    
T  15642958 aaggtgctctcgagagttttgacatttttctcactcaaaattcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgcttcagtcctctttaaa 15642859  T
Q  679 atcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    ||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || | ||||||| |||||||||     |||    
T  15642858 atcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgaactgggttgctcgccacggcgagttggtctgctc 15642759  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15642758 gcgaggcgagctatgaagttggtcactcgccatggcgagtaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 15642665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 20260824 - 20261024
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20260824 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 20260922  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  20260923 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 20261022  T
Q  264 ac 265  Q
    ||    
T  20261023 ac 20261024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 36800921 - 36801307
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  36800921 actgggtagctcgcctcgcgagctcaactgctcgctatggcgagctc-gcaaaactggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 36801019  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||| || || || |    | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36801020 aaatatggggcgctcggaagtttttacatttttcttactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcctctt 36801119  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || | ||||||| |||||||||        
T  36801120 taaaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttcaactgggttgctcgccagggcgagttggtct 36801219  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36801220 tctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 36801307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 14564195 - 14564591
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||        
T  14564195 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccacggcgagttcaaggcgaactcgagacgagtga 14564293  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  14564294 aaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccttattcatctttttaacttaaaacttgcttcagtcatcat 14564393  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     || ||||| |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||        
T  14564394 taatatcatttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccaaggcgagttggtct 14564493  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14564494 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaaag-ctactcgcgaggcgagcgataaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 14564591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23090207 - 23090006
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23090207 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23090109  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    || ||||||||  |||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23090108 gaataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23090009  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  23090008 tac 23090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17592304 - 17591908
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||    
T  17592304 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-ga 17592206  T
Q  576 aatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    || || ||||||||  |||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  17592205 aaaataggtgctctcaggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctctctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcat 17592106  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||| | |||| |||| |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||        
T  17592105 taaaatcgtttaggcacactaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtct 17592006  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  || ||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17592005 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatagcaagc-acagctgctcgcgaggcaagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 17591908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23102635 - 23102434
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23102635 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23102537  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23102536 gaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttttaggcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23102437  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  23102436 tac 23102434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 2385680 - 2385302
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  2385680 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 2385581  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  2385580 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatca 2385482  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  2385481 tccaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaactttttaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcg 2385383  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385382 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 2385302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 1067473 - 1067849
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  |||     
T  1067473 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacgaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcaggta 1067572  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||||||    
T  1067573 ctctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatctttattatcatc 1067671  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||  ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  1067672 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaatttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggattgctcgcgag 1067770  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067771 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 1067849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 6482321 - 6482499
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6482321 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6482420  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6482421 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6482499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 6485788 - 6485966
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6485788 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6485887  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6485888 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6485966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5707191 - 5707014
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  5707191 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 5707092  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5707091 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 5707014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 9241333 - 9241534
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9241333 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 9241431  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  ||||| |  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  9241432 gaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagttcttccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 9241531  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  9241532 tac 9241534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 11359999 - 11359622
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  |||     
T  11359999 ctcgcctcgcgagcgcatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcaggta 11359900  T
Q  585 ctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  |||||    
T  11359899 ctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcctctttattatcat 11359801  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  11359800 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 11359701  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11359700 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11359622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 26582675 - 26582852
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  26582675 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 26582773  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26582774 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 26582852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 31828987 - 31829367
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  31828987 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacggaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattag 31829086  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  ||    
T  31829087 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcctctttattat 31829185  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  31829186 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 31829284  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31829285 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 31829367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 31834339 - 31834719
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  31834339 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacggaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattag 31834438  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  ||    
T  31834439 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcctctttattat 31834537  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  31834538 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 31834636  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834637 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 31834719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24426599 - 24426221
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||| |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||     |||  ||    
T  24426599 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaattacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgataattagg 24426500  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||||     
T  24426499 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctagtcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatct 24426401  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     || |||    
T  24426400 tccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgcttgcg 24426302  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426301 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 24426221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24481363 - 24480977
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    || |||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  24481363 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagcttgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaaa 24481264  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  24481263 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcat 24481165  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| ||||||||||||||||||| |     
T  24481164 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttggac 24481066  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481065 tgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 24480977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 481 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 36984326 - 36983945
Alignment:
Q  481 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||      
T  36984326 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatta 36984227  T
Q  581 ggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  |    
T  36984226 ggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcctctttatta 36984128  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    ||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   |||    
T  36984127 tcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccgggcttactcgccatggcgagttggactgctc 36984029  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36984028 gcgaggcaagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaa 36983945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 4077797 - 4078174
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaac-agaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||   | ||||  |||    
T  4077797 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaaatcaggt 4077896  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||||||    
T  4077897 gctctcgggaaaaatgccatttt-cttactcaaatccaaattctaagttccctactcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcgttaaaatcat 4077995  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  4077996 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 4078095  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4078096 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 4078174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23169475 - 23169298
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23169475 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23169377  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23169376 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23169298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 23291453 - 23291724
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  23291453 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 23291552  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    |||   ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| ||  | ||||| |||||||||||||  |  |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  23291553 ccattttacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacaggtactcaccatggcgagttggtttgctcgcggggcgagctatgaagttgct 23291652  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23291653 cactcgctaaggcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 23291724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23580732 - 23580555
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23580732 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23580634  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23580633 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23580555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 23877838 - 23878040
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  23877838 atgcatgtggtaccatatttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcatcaggacataagtcttcaccgctcaacaccgcttt 23877937  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  23877938 gaacaactagtgttccaccgctttgaactacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 23878037  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  23878038 tac 23878040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 44090844 - 44090468
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  | ||    
T  44090844 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagatg 44090745  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||   ||| || || | |||||||||    
T  44090744 ctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttttaccattcatcattaaaatcatc 44090646  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||  ||| ||||||| | ||||| | |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  44090645 taggtaccataaaccatccccaaaacatcttataacaatttttcaaaaatc-acattttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 44090547  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44090546 gcgagcgatgaagttgctcacttgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 44090468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 28293096 - 28293304
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||   |||| || |    
T  28293096 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagt-gaaaaatag 28293194  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  28293195 gtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactaaaacctcaattataagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccattcatcattaaaatc 28293294  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||||||||||    
T  28293295 atctaggtac 28293304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 200641 - 200818
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  200641 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 200739  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  200740 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 200818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22012895 - 22012517
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  22012895 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaacacttactcgccatagcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 22012796  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  22012795 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatca 22012697  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
      |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||     |  | ||||||||||||||||| |   |||||||    
T  22012696 cataggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagtttttgtttggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcga 22012597  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||   |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  22012596 ggcgagccatgatattgttcactcg-ggaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaa 22012517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 34427 - 34815
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  34427 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcaaaaaatcactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 34526  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | || ||||    
T  34527 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattaatatca 34625  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   || | | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| |   ||| | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  34626 tctaggtaccttaatccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-tttttatttggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcg 34724  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||    
T  34725 aggcgagccatgatattgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaaaacaggtttt 34815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 27037621 - 27037997
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |||    
T  27037621 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 27037719  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | || |||||    
T  27037720 gctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattaatatcat 27037818  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  27037819 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 27037918  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27037919 gcgagtgttgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 27037997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27367760 - 27367600
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  27367760 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 27367662  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27367661 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 27367600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 43693401 - 43693578
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  43693401 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 43693499  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  43693500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 43693578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6744501 - 6744324
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  6744501 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 6744403  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  ||| |||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  6744402 tgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 6744324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 71278 - 70892
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  71278 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 71179  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  71178 aatcaggtactctcgggaaaaagtgaca-ttttctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcat 71080  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     || ||| |||| ||||    ||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| ||||||||||||||||||| |     
T  71079 taatatcctctaagtaccttcaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttggac 70981  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70980 tgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgtgcgatgaacttctgtacgggcagaa 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 11466446 - 11466653
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  11466446 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgcttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 11466544  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| |||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  11466545 gtgctcttgggaatta-gacattattctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatc 11466643  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||| ||||||    
T  11466644 atccaggtac 11466653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 4071306 - 4070909
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  4071306 actgagtagctcgcctcgcgagcacgtctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 4071207  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||   | | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  4071206 aaacagctactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcat 4071108  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatttta-aaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgta 772  Q
     || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| | |||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |    
T  4071107 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcagaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttgga 4071009  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
       |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4071008 ctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaaagctggttt 4070910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 476 - 683
Target Start/End: Original strand, 27272518 - 27272725
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||    
T  27272518 actgggtagctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccattgcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-ga 27272616  T
Q  576 aatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    || || |||||||| |||||   ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  27272617 aaaataggtgctctcgggaattttgacatttttctcactcagacctcaattttaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcat 27272716  T
Q  675 aaaaatcat 683  Q
     ||||||||    
T  27272717 taaaatcat 27272725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30196269 - 30195892
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||     
T  30196269 ctcgcctcgcgagctcatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggta 30196170  T
Q  585 ctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||| | ||| || || | ||||||||    
T  30196169 ctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctgttcatctttttaatccaaaactttcaccattcatcattaaaatcat 30196071  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    | ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     |||||||    
T  30196070 ccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 30195972  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30195971 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 30195892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 32911245 - 32910857
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| ||||    
T  32911245 ctcgcctctcgagcacatctgctcgctatggcgaactcataaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggtg 32911146  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| | |||| ||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||  ||||||||     
T  32911145 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagtttcctattcatctttttaatctgaaaattgttccagacctctctaaaatcatt 32911046  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||| |||  |||||| ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | |||  ||  || ||||||||| |||||||||     || ||||||    
T  32911045 taggcacataaaactatccatattacagcttataacaacacttcaaaaatcatgttttcaactgggttactcgccacggcgagttggtctgcttgcgagg 32910946  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  32910945 cgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtatgggcagaaaacaggtttt 32910857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 604 - 863
Target Start/End: Original strand, 1062197 - 1062455
Alignment:
Q  604 ttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccc 703  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  |||||||||||||   |||| | ||    
T  1062197 ttttctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatctttattatcatctaggtaccttaaaccatcc 1062296  T
Q  704 aaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttc 802  Q
      || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  1062297 ccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggattgctcacgaggcgagctatgaagttgctc 1062395  T
Q  803 actcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| |  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1062396 actcgccatagcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 1062455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 713 - 873
Target Start/End: Original strand, 24659399 - 24659559
Alignment:
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 812  Q
    |||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24659399 cttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagccatgaagttgctcactcgctaag 24659498  T
Q  813 gcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24659499 gcgagcatagactgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgtaggtttt 24659559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 20850566 - 20850944
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||    
T  20850566 agctcgcctcgcgagcacatttgctcgccacggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcagg 20850665  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || |||    
T  20850666 tactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatc 20850764  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| |||||| || |||||  |  ||| | ||||||||||||||||| |   |||||    
T  20850765 atctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaat-cacatttt-tctgggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgc 20850862  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850863 gaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20850944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 758 - 873
Target Start/End: Original strand, 23333249 - 23333364
Alignment:
Q  758 ccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 857  Q
    |||||||||||||  |  |||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23333249 ccatggcgagttggtttgctcgctgggcgagttatgaagttgctcactcgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 23333348  T
Q  858 gcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||    
T  23333349 gcagaatgcaggtttt 23333364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 22809901 - 22810084
Alignment:
Q  85 cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacc 181  Q
    |||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  22809901 cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 22810000  T
Q  182 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22810001 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22810084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 27730128 - 27730241
Alignment:
Q  749 ggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaact 848  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  27730128 ggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcacttgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaact 27730226  T
Q  849 tctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||    
T  27730227 tctgtacgggcagaa 27730241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 602 - 871
Target Start/End: Original strand, 24652844 - 24653113
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||    || |||||  |||||||| |||| ||   ||||||     
T  24652844 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtctaagacctctctaaaatcatataggcacttaaaactat 24652943  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||  |||  || ||||||||| |    
T  24652944 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcagggcccgccatgaagttgct 24653043  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24653044 cactcgctaaggcgagaacagactactcgcgaggccagcgatgaacttttgtacgggcagaatgcaggtt 24653113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 21605141 - 21605349
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  21605141 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 21605240  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||  | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||| || || | || |||    
T  21605241 tactctcgggaaaaagtgacatttccc-cactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacccaaaactttcaccattcatcattaatatc 21605339  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||||||||||    
T  21605340 atctaggtac 21605349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 25267731 - 25268002
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  25267731 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 25267830  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    | ||||||| ||||| ||||||| || |||||||  || | |||| ||||   | ||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||    
T  25267831 caaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatga-tctcac-aggcacttgctcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagtt 25267928  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||  ||||||| |   |||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25267929 gctcactcgc-gaggcgag-acgagctactcgccggggcaagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 25268002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Original strand, 23263985 - 23264158
Alignment:
Q  67 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttga 164  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||| || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  23263985 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 23264083  T
Q  165 gtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 239  Q
      |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  23264084 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 23264158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 474 - 873
Target Start/End: Original strand, 17634304 - 17634693
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca 573  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  ||||||||  ||||           
T  17634304 atactgggtaactcgcctcgcgagtgcatctgcttgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaa--cgag------- 17634394  T
Q  574 gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
      || | |||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||  ||||||||||    
T  17634395 --aaaaaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatttaaaaattgtcccagtcctct 17634492  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
      |||| |||| ||| || | |||||| ||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||     ||||||||||||||||| ||     
T  17634493 ctaaaaacatccaggcactcaaaactaaccaaattacaccttataacaacaatttaaaaatcatgatctctcactcacttactcgccatggcgagtggtt 17634592  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 869  Q
       |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||  | ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  17634593 ctgctcgcgaggcgagctatgaagattgctcactcgc-gaggcgagacaa--gttactcgctggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcataatgcagg 17634689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 20648603 - 20648736
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  20648603 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatcttttaaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 20648702  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  20648703 ccaagatacagcttataacaacaattcaaaaatc 20648736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 783 - 863
Target Start/End: Original strand, 21605420 - 21605499
Alignment:
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21605420 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 21605499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 21907291 - 21907452
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcca 204  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || |||||    
T  21907291 tcgaatggttaaaacattcttttcaggacataagtcctcaccgcaaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 21907390  T
Q  205 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  21907391 gggccgaagccctcccacttttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 21907452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21074114 - 21073954
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| |  | ||||||    
T  21074114 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 21074015  T
Q  206 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21074014 ggccgaagccctcccgcttttatggttatgcaattgaatccacttgtgtatatctacatac 21073954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19703615 - 19703456
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||| || | || ||||||     
T  19703615 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagg 19703516  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  19703515 gccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatctacatac 19703456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 20724011 - 20724236
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  20724011 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 20724104  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    || |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||| ||||| || || || ||||    
T  20724105 atgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttat 20724204  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  20724205 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 20724236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 23290904 - 23291129
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 137  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23290904 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcgtttcaggaca 23290997  T
Q  138 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  | |||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||    
T  23290998 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccacttttgtgcttat 23291097  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23291098 gcaactaactccacttgtgtatatctacatac 23291129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 25365677 - 25365601
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  25365677 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 25365601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 8889637 - 8889346
Alignment:
Q  581 ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    |||||||| |||||   ||| |||||||||||| || | ||| |  ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||  |||||    
T  8889637 ggtgctctcgggaattttgacatttttctcactaaatcttcattcttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctctctaaaat 8889538  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    ||| |||| || | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  || | |||| ||||   | ||||||||||||||| ||    ||    
T  8889537 catttaggcactcaaaactaaccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatga-tctcac-aggcacttgctcgccatggcgagtggttctgct 8889440  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  8889439 cgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgtcggggcgagcgatgaacatcagtacgtgcagaatgtaggttt 8889346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 25651763 - 25651957
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||  |||| |||| ||| || | |||| |     
T  25651763 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattagtccagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaaccat 25651862  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||||  |||| || | ||||||| ||||||||||  ||||| ||||   | ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  25651863 ccaacttacgtctaataacaacaatttaaaaatcatgatttctcactcaggtactcgctatggcgagttgttctgctcgcgaggcgagcgatgaa 25651957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20913830 - 20913711
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | | |||||||| | |||||||||||||| ||     
T  20913830 actcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgcga-ggcgagaca-gactactcgccggggcgagcgatgaacatca 20913733  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20913732 gtacgggcagaatgcaggtttt 20913711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 25589974 - 25589826
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   | | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  25589974 actgggtaacttgtctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaacgggttgctcgccagggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 25589875  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaat 624  Q
    |||| |||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25589874 aataaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaat 25589826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 23149137 - 23149409
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  | ||||||||  |||| |||| ||| || | ||| ||     
T  23149137 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtcctagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaattat 23149236  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttg 799  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| | ||||     ||||||||||||||||| || |  ||| |||| ||||| |||||| |||    
T  23149237 ccaatttacaccttataacaacaatttgaaaatcatgatctctcactcacttactcgccatggcgagtggttttgctcacgagacgagctatgaagattg 23149336  T
Q  800 ttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg-cgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||| | ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23149337 ctcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcgggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 23149409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 23560927 - 23561199
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  | ||||||||  |||| |||| ||| || | ||| ||     
T  23560927 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtcctagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaattat 23561026  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttg 799  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| | ||||     ||||||||||||||||| || |  ||| |||| ||||| |||||| |||    
T  23561027 ccaatttacaccttataacaacaatttgaaaatcatgatctctcactcacttactcgccatggcgagtggttttgctcacgagacgagctatgaagattg 23561126  T
Q  800 ttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg-cgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||| | ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23561127 ctcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcgggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 23561199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 19036010 - 19036281
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  19036010 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 19036109  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
     |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||  ||| | |||      | |  |||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||| ||      
T  19036110 tcaaaatacagcttataacaacaatctaaaaatcatgatctctcagtcacttgcctgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaaattac 19036209  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg-cgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19036210 tcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcgggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 19036281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 475 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21123637 - 21123588
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcag 524  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21123637 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcag 21123588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 11466738 - 11466774
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11466738 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11466774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 23752836 - 23752994
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || ||||||     
T  23752836 gaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagg 23752934  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||  ||| |||||||| || || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23752935 gccagagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 23752994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24669589 - 24669539
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24669589 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcaaactcagg 24669539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 20724540 - 20724673
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||   ||||||     
T  20724540 atttttctcagtaaaacctcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtacttaaaactat 20724639  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    |||   ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  20724640 ccattttacagcttataacaacatttcaaaaatc 20724673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 149
Target Start/End: Original strand, 24943419 - 24943460
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24943419 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcacc 24943460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 25107120 - 25106923
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaa 697  Q
    |||||||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| ||  | ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   |||    
T  25107120 tgatatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatatgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaa 25107021  T
Q  698 ctacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
     || ||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  25107020 ttatccatattacggcttataacaacaatgcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 25106923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 23269201 - 23269276
Alignment:
Q  67 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 143  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23269201 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 23276070 - 23276145
Alignment:
Q  67 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtc 143  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23276070 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23276145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 660
Target Start/End: Original strand, 27729993 - 27730049
Alignment:
Q  604 ttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaactt 660  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27729993 ttttctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactt 27730049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21121097 - 21120999
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||    |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21121097 ctcgcgaggcgagccatgaagattgctcactcgcga-ggcgagagcaggctactcgccggggcgagtgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 21120999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 684
Target Start/End: Original strand, 22841463 - 22841574
Alignment:
Q  573 agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctc 672  Q
    ||||| |||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||  |||||||||    
T  22841463 agaaaaatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctc 22841562  T
Q  673 ttaaaaatcatc 684  Q
    |  |||||||||    
T  22841563 tctaaaatcatc 22841574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 523
Target Start/End: Original strand, 25267616 - 25267663
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25267616 actgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgagctca 25267663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 519
Target Start/End: Original strand, 1062090 - 1062124
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1062090 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 1062124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 519
Target Start/End: Original strand, 27729885 - 27729919
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27729885 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 27729919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 7679876 - 7679917
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7679876 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 7679917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 22841385 - 22841450
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||    
T  22841385 ctcgcctcgcgagtgcatctactcgctatggcgaactcaagaaatgagctactcgctatggcgagt 22841450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 784 - 873
Target Start/End: Original strand, 27272825 - 27272913
Alignment:
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||  |||  | ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  27272825 gcgagccatgatgttgttcactcg-tgaggcgagacatgaatgctctcgaggcgagcgatgaacatcagtacgagcagaaagcaggtttt 27272913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 698; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 698; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 635990 - 635133
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635990 aacaacatatgcaacccatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 635891  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  635890 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaag 635791  T
Q  214 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  635790 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-tatatgattcaccatccaatttac 635692  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  635691 aacatttaagtgaattttaattaaatacaacatacatt-cagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatccagggaaa-tatatatcaacatac 635594  T
Q  414 aagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 512  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635593 aagccatgcttagttcaacaagataaaccatccaaacaacaacagaa-tcaaaccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 635495  T
Q  513 tggcgagctcagggaa-tcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctca 611  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  635494 tggcgagctcaggaaaatcaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctca 635395  T
Q  612 ctcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacg 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  635394 ctcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcctctaggtacatgaaactacccaagatacg 635295  T
Q  712 gcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaa 811  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635294 gtttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaa 635195  T
Q  812 ggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  635194 ggcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaaaatgcaggtttt 635133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 51608172 - 51607324
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608172 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 51608073  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608072 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 51607973  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  51607972 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgta-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 51607875  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51607874 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcaacatacaagccatg 51607778  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51607777 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 51607679  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaac 618  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51607678 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaaatgacatttttctcactcaaac 51607579  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51607578 ctcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttata 51607479  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51607478 acaactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagt 51607379  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51607378 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 51607324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 42701184 - 42702032
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701184 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 42701283  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701284 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 42701383  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  42701384 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgta-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 42701481  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42701482 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 42701578  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42701579 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggaagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 42701677  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaac 618  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42701678 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaaatgacatttttctcactcaaac 42701777  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42701778 ctcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttata 42701877  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42701878 acaactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagt 42701977  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701978 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 42702032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 51602291 - 51601443
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602291 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 51602192  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602191 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 51602092  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  51602091 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgta-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 51601994  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51601993 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 51601897  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51601896 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 51601798  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaac 618  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51601797 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaaatgacatttttctcactcaaac 51601698  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51601697 ctcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttata 51601598  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  51601597 acaactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagt 51601498  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51601497 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 51601443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 41800170 - 41799322
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800170 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 41800071  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800070 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 41799971  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| | |||| |    
T  41799970 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgta-tatatgattcaccaaccaacttataccttt-a 41799873  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41799872 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 41799776  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41799775 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 41799677  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaac 618  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41799676 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaaatgacatttttctcactcaaac 41799577  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41799576 cttaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttata 41799477  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41799476 acaactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagt 41799377  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41799376 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggacagaatgcaggtttt 41799322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 53748966 - 53748124
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748966 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 53748867  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748866 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 53748767  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||     
T  53748766 tatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-aagg 53748669  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||  |||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  53748668 gaattt-aattatatacaacacacat--cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaag-catccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 53748574  T
Q  424 taattcaacaaataaatcat-ccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    ||||||||||||  |  ||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53748573 taattcaacaaaatacacattccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 53748475  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53748474 agaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatacggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 53748375  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53748374 attctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacaaaactacccaaaatacggcttataacaa 53748275  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53748274 ctttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggtgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagtaatg 53748175  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748174 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 53748124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 20940219 - 20941066
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20940219 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagca 20940317  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||    
T  20940318 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaagctctccca 20940417  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccat-ccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||  |  ||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  20940418 ctgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatatatgtg-tatatgactcaccattccaatttacaatgttc 20940516  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    |  | |   ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    ||| || ||||   ||| ||| | ||| |||  ||||    
T  20940517 atttaacacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcatcacaaccaatttagaacacccag---aaaaataaaccaatataatagcc 20940612  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||||| || ||| | || ||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940613 atgcttaat-catcaagacaattcaaccat-caacaacagaaatcaaaccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 20940710  T
Q  518 agctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaa 617  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    ||| |||||||||||| ||     
T  20940711 agctcaggaaataagattctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacagaaaagtggtgctctcggaagttttgacatttttctcactaaat 20940810  T
Q  618 cctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaa 717  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  20940811 catcaattctaagctccctaatcatccttttaacctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcatctagatacataaaactacccaaaacacggcttat 20940910  T
Q  718 aacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20940911 aacaacactttagaaatccagattttcacaagggtactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgctatggcgag 20941010  T
Q  818 caatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941011 cataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 20941066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 873
Target Start/End: Original strand, 23121559 - 23122405
Alignment:
Q  27 aactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23121559 aactcatcaccactccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcat 23121657  T
Q  125 tc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23121658 tcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagccgaagctctccca 23121757  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||  ||     
T  23121758 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctattcatatatat-gtatatgaatcaccactccaatttacaatattc 23121856  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||  |  ||||||||   ||| ||| | ||||||| ||| |    
T  23121857 atgtataacttaattaaataaaagcataca-tccagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagtc 23121952  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||   |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23121953 atgcttaa-tcaacaagataaatcaacc-atcaacaacagaaatcaatacaac-aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatatgctcgcgatggcg 23122049  T
Q  518 agctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaa 617  Q
    || ||||| ||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||||||  |||    ||| |||||||||||| ||     
T  23122050 agttcaggaaaaagggcactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgagtcgaacagaaaaaggctgctctcaggagttttgacatttttctcactaaat 23122149  T
Q  618 cctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaa 717  Q
    ||||| |||||||  ||||  |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||  || | |||| | | | | | |  ||||     
T  23122150 cctcatttctaagtcccctgttcatctttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcatttagacactcaaaaccatctacatttcatcttat 23122249  T
Q  718 aacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23122250 aacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgctatggcgag 23122349  T
Q  818 caatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122350 caaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 23122405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 43285113 - 43284275
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || |||| ||||||||||| ||    
T  43285113 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctctcctctgtagaatggttaaatca 43285015  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | || | ||||||||||||||||||||    
T  43285014 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagccgaagctctccca 43284915  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    || ||||| |||||||||| | || ||   |||||||||||||| | | ||||||  |||||| ||  || |||| |||||| ||||| || |||| ||     
T  43284914 cttttatgcttatgcaactgacccactcttgtatatctacatacaacctaacctatgcatatatatg-tacatgactcaccactccaaatttcaacattc 43284816  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacca-tccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||||| |||| |||||| | |||| | ||||| |  || ||||||||  || | ||| | ||| |||  ||||    
T  43284815 atgtataacttaattaaataaaagcatacatt-cagccagcatcaactcattataaccaatttaaaacatccagaaaaga-atacaccaatataatagcc 43284718  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||||| || ||| | | |||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43284717 atgcttaat-catcaagacagatcaaccat-caacaacagaaatcaatccaacaaaatactgtgcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 43284620  T
Q  518 agctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaa 617  Q
    |||| ||| ||  |   |||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||     
T  43284619 agcttaggaaacaaaacactcgccatggcgagtt-----------cgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaat 43284531  T
Q  618 cctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaa 717  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||     
T  43284530 catcaattctaagttccatattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactactcaaaatacagcttat 43284431  T
Q  718 aacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||   ||||||    
T  43284430 aacaacacttcaaaaatccagttttcctcaccggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagtttctcactcgccttggcgag 43284331  T
Q  818 caatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43284330 caaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 43284275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 470 - 873
Target Start/End: Original strand, 49051356 - 49051758
Alignment:
Q  470 caaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggc 568  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  49051356 caaaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg-aaccgggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggc 49051454  T
Q  569 gaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagt 668  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49051455 gaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagt 49051554  T
Q  669 cctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagt 768  Q
    |||||  |||||||| ||||||||  |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||||||    
T  49051555 cctctctaaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaacacagcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacggcgagt 49051654  T
Q  769 tgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcag 868  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051655 tgtctcactcgcgaggcgagtcatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgatcgatgaacttctgtacgggcagaatgcag 49051753  T
Q  869 gtttt 873  Q
    |||||    
T  49051754 gtttt 49051758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 11171030 - 11170619
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttg-----------gaggcgaa 560  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || | ||||||||||||||||            ||||||||    
T  11171030 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagaaaacgagttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaa 11170931  T
Q  561 ctcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaactt 660  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  11170930 ctcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaactt 11170831  T
Q  661 gctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgcca 760  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||  | |||||||||    
T  11170830 gctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactaaccaaattacggtttataacaacattttaaaaatccagttttcctcacaggtactcgcca 11170731  T
Q  761 tggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 860  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170730 tggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 11170632  T
Q  861 gaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||    
T  11170631 gaatgcaggtttt 11170619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 899909 - 900305
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |      
T  899909 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcga 900007  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||||| |||||||| ||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  900008 aaataaggtgctctcgggagttttgatatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcctctc 900107  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||  | |||   |  || ||||||||| ||||||||||       
T  900108 taaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcttataacaacaatttgaaaatcatgttttaatctgggttactcgccacggcgagttgttct 900207  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  900208 gctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaacgcaggtttt 900305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 473 - 873
Target Start/End: Original strand, 37881808 - 37882207
Alignment:
Q  473 aatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaac 572  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37881808 aatactgggcagctcgcctcgcaagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaac 37881907  T
Q  573 agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctc 672  Q
      |||||||||||||| ||||    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37881908 gaaaatatggtgctctcgggagtttttacatttttctcactcaaacttcaattctaagcttcctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctc 37882007  T
Q  673 ttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
    |  ||| |||| ||||||||  |||||| ||||| |||  |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||||| ||     
T  37882008 tctaaattcatttaggtacattaaactaaccaaagtacatcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacggcgagtggtt 37882107  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
       |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37882108 ctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggtgaacca-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggttt 37882206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 558 - 873
Target Start/End: Original strand, 13454214 - 13454528
Alignment:
Q  558 gaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaa 657  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  13454214 gaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctctggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaa 13454313  T
Q  658 cttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcg 757  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  | ||||||    
T  13454314 cttgctccagtcctctctaaaatcatttaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacaggtactcg 13454413  T
Q  758 ccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 857  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13454414 ccacggtgagttgtctcactcgcggggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 13454512  T
Q  858 gcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| |||||    
T  13454513 gcagaatgcaagtttt 13454528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 5939247 - 5939625
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  5939247 agctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaacacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 5939346  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  5939347 tgctctcgggaaaaatgaaatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatca 5939445  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || || ||||| |||||||||| ||||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||     |||||||    
T  5939446 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacagcttataacaacatttcaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcga 5939545  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5939546 ggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-atcgctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 5939625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 33097408 - 33097804
Alignment:
Q  476 actgggtagct-cgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca 573  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||       
T  33097408 actgggtagcttcgcctcgcgagcacatcagctcgctatggcgagctc-gcaaaacaggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtg 33097506  T
Q  574 gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
     |||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33097507 aaaatatggggctctcgggagttttgacatttttctcactc-aacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcctct 33097605  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
    | | ||||||  ||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || |||||||||||||||||||       
T  33097606 ttataatcattaaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttcaactgggttactcgccatggcgagttggtc 33097705  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33097706 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 33097804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 15533786 - 15533986
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533786 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 15533884  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  15533885 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 15533984  T
Q  264 ac 265  Q
    ||    
T  15533985 ac 15533986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 47872191 - 47871802
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||   ||    
T  47872191 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgcttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaagtagg 47872092  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  47872091 tgctctcgggagttttgatatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatca 47871992  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    | ||||||||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||   |  || |||||||||||||||||||     |||||||    
T  47871991 tttaggtacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaattcaaaaatcaagttttaatctgggttactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 47871892  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47871891 ggcgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 47871802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 46044637 - 46044240
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  46044637 actgggcaactcgcctcgcgagcacatttgctcgctatggcgaactcacaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 46044538  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||||||||||||||||     
T  46044537 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcgtctttttaatctaaaatttgctccagtcctcttt 46044438  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||  ||  |  ||||||||| |||||||||         
T  46044437 aaaatcatttaggtacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttaaaaatcaagttttatactggattactcgccacggcgagttggtctg 46044338  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  46044337 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcaccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtatgggcagaaaacaggtttt 46044240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 19128110 - 19127714
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |    
T  19128110 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggc-aagtg 19128013  T
Q  575 aaatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||  | |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  19128012 aaaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattttaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatca 19127913  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
    | |||||||| |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || ||||||||| ||||||||| ||    
T  19127912 ttaaaatcatttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttg-at 19127814  T
Q  774 ca-ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19127813 ctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacaa-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggttt 19127715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3259751 - 3259373
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  ||    
T  3259751 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcagg 3259652  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    | |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  3259651 tactctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaaccccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatca 3259553  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  3259552 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 3259453  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259452 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 3259373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 45142312 - 45141929
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||   ||||     
T  45142312 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggtgagttcacaaaactggctgctcgccatggcgagttcaatgcgaactcgaggcgagt-gaaaa 45142214  T
Q  579 at-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  45142213 ataggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaa 45142114  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    | || |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     |    
T  45142113 agtcgtctaggtacctaaaaccatccctaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgc 45142015  T
Q  777 tcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45142014 tcgcgagacgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 45141929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 862
Target Start/End: Original strand, 42220746 - 42221131
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |      
T  42220746 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagcga 42220844  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||||| |||||||| ||||    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||     
T  42220845 aaataaggtgctctcgggagttttgacatttt-ctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctc 42220943  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||||||||||||| ||   |||||| ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | |||  ||  || ||||||||| |||||||||        
T  42220944 taaaatcatctaggcacctaaaactatccatattacagcttataacaacacttcaaaaatcatgttttcaactgggttactcgccacggcgagttggtct 42221043  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaga 862  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42221044 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaga 42221131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 49240611 - 49240226
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  49240611 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 49240512  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || |     
T  49240511 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcatt 49240413  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||  || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  49240412 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaattaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 49240313  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49240312 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 49240226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 664 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23724380 - 23724171
Alignment:
Q  664 ccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatgg 763  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||    
T  23724380 ccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggcttataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatgg 23724281  T
Q  764 cgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23724280 cgagttttctctctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaa 23724181  T
Q  864 tgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||    
T  23724180 tgcagatttt 23724171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3266386 - 3266001
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  3266386 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 3266287  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||     
T  3266286 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcttt 3266188  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |      
T  3266187 attatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggact 3266089  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266088 gctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 3266001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 478 - 873
Target Start/End: Original strand, 21881910 - 21882303
Alignment:
Q  478 tgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaa 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||    
T  21881910 tgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggtgagttcacaaaataggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaa 21882008  T
Q  578 tat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaa 676  Q
     || |||||||| ||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |    
T  21882009 aataggtgctctcgggagttttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctctcaattcatctttttaatctaaaacttgctcgagtcatcttta 21882107  T
Q  677 aaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || | ||| ||||||| |||||     |    
T  21882108 aaatcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgaactgggttgctcaccatggcaagttggtctgc 21882207  T
Q  777 tcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21882208 tcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgcgt-ggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 21882303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 14484390 - 14484642
Alignment:
Q  28 actcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14484390 actcatcaccactccactaagactccactaacaacacccatacatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacatt 14484488  T
Q  126 c-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14484489 cattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac 14484588  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    | ||||| |||||||||| | || |||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  14484589 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtgtatctacatacaacccaaccta 14484642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 18212138 - 18212339
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18212138 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 18212236  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  18212237 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 18212336  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  18212337 tac 18212339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 49749325 - 49748940
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  49749325 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 49749226  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || |     
T  49749225 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcacccaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcatt 49749127  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||  || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  49749126 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaattaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 49749027  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749026 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 49748940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 54825942 - 54825545
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||   |  ||    
T  54825942 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgagggcgagtga 54825843  T
Q  576 aatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    || || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  54825842 aaaataggtgctctcgggaattatgacatttttctcactcagacctcaagtctaagctccctattcatctttttaacctaaaatttgctccagtcatcat 54825743  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| || | |||  |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||||  ||||||| || ||||||       
T  54825742 taaaatcatttatgcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccacggtgagttggtc 54825644  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54825643 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 54825545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29455117 - 29454741
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  |||     
T  29455117 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtaactcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcaggta 29455018  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||||    
T  29455017 ctctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcctctttattatcatc 29454919  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  29454918 taggtaccttaaaccaaccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgagg 29454819  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29454818 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 29454741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 45959502 - 45959124
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  45959502 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatgacgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 45959404  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |  |||    
T  45959403 gtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattattatc 45959305  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     |||||    
T  45959304 atctaggtacctcaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgc 45959206  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45959205 gaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 45959124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 476 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16999935 - 16999719
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  16999935 actgggcaactcgcctcgcgagcacacctgctcgctatggcgagttcagaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacgaa 16999836  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||      
T  16999835 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctaatcatctttttaatctaaaacttgcttcagtcctctct 16999736  T
Q  676 aaaatcatctaggtaca 692  Q
    |||||||||||||||||    
T  16999735 aaaatcatctaggtaca 16999719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 33221782 - 33222052
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |  ||||||     
T  33221782 atttttcccactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcatttaggtatattaaactat 33221881  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||  || ||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||     |||||||||||||| ||||||||| |    
T  33221882 ccccaaaacatcttataacaacaatttaaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgct 33221981  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33221982 cactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 33222052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 7359570 - 7359958
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  7359570 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaacacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 7359669  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| || | ||  |||    
T  7359670 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctagaacttgttccagtcttcattaatgtca 7359768  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || || ||||| ||||||||||  |||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||     |||||||    
T  7359769 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacagcttataacaacatttcgaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcga 7359868  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||    
T  7359869 ggcgagccatgatattgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaaaacaggtttt 7359958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29448433 - 29448057
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  |||     
T  29448433 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcaggta 29448334  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||||    
T  29448333 ctctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcctctttattatcatc 29448235  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  29448234 taggtaccttaaaccaaccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgagg 29448135  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448134 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 29448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17000381 - 17000131
Alignment:
Q  30 tcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||||||||| |||||     
T  17000381 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagtcctcaccgctgtaaaatggttaaaacattca 17000283  T
Q  127 tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 224  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||     
T  17000282 ttttcaggacataagttctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctctcactt 17000183  T
Q  225 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17000182 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 17000131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 391491 - 391867
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||     
T  391491 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggta 391590  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||||    
T  391591 ctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctactcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatcatc 391689  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| |||   |||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  391690 taggtactttaaaccatccccaaaacgtcttataacaacttttcaaaaatcaagttttatcatg-ggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 391788  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391789 gcgatctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 391867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 26396009 - 26396388
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  26396009 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 26396107  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    || |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  26396108 gtactctcgggaaaaagtgacatttc-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 26396206  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  26396207 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc-aggttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcg 26396305  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26396306 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 26396388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Original strand, 20895312 - 20895694
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||     
T  20895312 gggtagctcgcctcgcgagcacaactgctcgctatggcgagttcacataactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaa 20895410  T
Q  579 atgg-tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    || | |||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  20895411 atagatgctctcgggaattttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcatcaa 20895509  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||| ||||||||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||     ||    
T  20895510 aatcatttaggtacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaattgaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtctgct 20895609  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20895610 cgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcacaagctgttcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgagcagaa 20895694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 11847053 - 11847230
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  11847053 atgcatgtggtaccataaa-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 11847151  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11847152 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 11847230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4831296 - 4831090
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  4831296 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttca 4831198  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4831197 ggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatga 4831098  T
Q  231 ttatgcaa 238  Q
    ||||||||    
T  4831097 ttatgcaa 4831090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4834591 - 4834385
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  4834591 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttca 4834493  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4834492 ggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatga 4834393  T
Q  231 ttatgcaa 238  Q
    ||||||||    
T  4834392 ttatgcaa 4834385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Original strand, 34772488 - 34772870
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||     
T  34772488 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggctgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgagacgagt-gaaaa 34772586  T
Q  579 at-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  34772587 ataggtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaa 34772685  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    |||||| || | |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||| ||| |||| |   ||| | ||||||| |||||||||     |    
T  34772686 aatcatttatgcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaaca-tttcaaaattcaggttttgatctggcttgctcgccacggcgagttggtctgc 34772784  T
Q  777 tcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34772785 tcgcgaggcgagtgttgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 34772870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11171464 - 11171222
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| || |||||| |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |  |||||    
T  11171464 actccactaagactcctctaataacaaccatgcatgtagtaccataa-tcagggtcgtagccctcaccgccgtagaatggttaaagcattcattttcagg 11171366  T
Q  135 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11171365 acataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgttt 11171266  T
Q  233 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    |||||||| | || |||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  11171265 atgcaactgacccacttgtgtatatatacataccactcaaccta 11171222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Original strand, 20889685 - 20890067
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||     
T  20889685 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaa 20889783  T
Q  579 at-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    || |||| ||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  20889784 ataggtgttctcgggaattttgacatttt-ctcactcaaacctcaattttaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaa 20889882  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||| ||||||||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||     ||    
T  20889883 aatcatttaggtacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaattgaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtctgct 20889982  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20889983 cgcgacgcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcacaagctgttcaggaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20890067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 31665376 - 31665760
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  || ||||||||||||||||||  ||||||       | |||   |    
T  31665376 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaacaagctactcgccatggcgagttcaaggcga-------gtgaa---a 31665465  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||| |||||||| |||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |     
T  31665466 aata-ggtgctctcgggaatt-tgacatttttttcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcatt 31665563  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||   |||| || |||| || ||||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||       
T  31665564 aaaatcatttaggtacattaaaccatccccaaaata--tcttataataacaattgaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtc 31665661  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31665662 tgctcgcgaggcgagccatgaagttgctccctcgc-gaggccagcacaagctgcttgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 31665760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8047074 - 8046897
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | | ||||| ||||    
T  8047074 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcactgctccacaccgcttt 8046975  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  8046974 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgccacta 8046897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 735
Target Start/End: Original strand, 30396514 - 30396772
Alignment:
Q  478 tgggtagct-cgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  30396514 tgggtagcttcgcctcgcgagaacatctgctcgctatggcgagct-agcaaaacaggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 30396612  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  30396613 aatatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcgaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctcttt 30396712  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    | |||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  30396713 ataatcatttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttaaaaatc 30396772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14555731 - 14555460
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  |||||||||| || ||   ||||||     
T  14555731 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatcttggcacttaaaactat 14555632  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | ||||||||| |||||||| | |  |||||||||||||| || |||||| |    
T  14555631 ccatattacaccttataacaacaatctgaaaatccaggttttctcacaggtactcgccacggcgagttatcttgctcgcgaggcgagctataaagttgct 14555532  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14555531 cactcgctaaggcgagtacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 14555460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23435738 - 23435361
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||     
T  23435738 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggta 23435639  T
Q  585 ctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  |||||    
T  23435638 ctctcgggaaaaagtgaca-ttttctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcctctttattatcat 23435540  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      || ||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  23435539 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggttactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 23435440  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23435439 gcgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 23435361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 476 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 2972500 - 2972288
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||    
T  2972500 actgggtagctcgcctcgcgaacacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgag-ag 2972403  T
Q  575 aaatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||  | |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  2972402 aaaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaaatctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatca 2972303  T
Q  674 taaaaatcatctagg 688  Q
    | |||||||| ||||    
T  2972302 ttaaaatcatttagg 2972288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 52500873 - 52501250
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |     
T  52500873 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcaga 52500971  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  52500972 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatca 52501070  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   || |  | ||||||||||||||||| |   |||||||    
T  52501071 tctaggtaccataaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattcaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcga 52501170  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52501171 ggcgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 52501250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 10783932 - 10783661
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||   |||||||||  ||||||||||| | || | ||||||     
T  10783932 atttttctcactaaaacttcaattttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatctaagcactcaaaactat 10783833  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    || |  |    |||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  10783832 cctacttgtaccttataacaacaattcaaaaagtcagattttctcacaggtactcgccatggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagctatgaagttgct 10783733  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  10783732 cactcgctatggtgagctcaggctactcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcaaaatgcaggtttt 10783661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 476 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 42955790 - 42955597
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || | |||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   |    
T  42955790 actgggtcactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcaccaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaacttgaggcgagt-g 42955692  T
Q  575 aaatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    ||| || |||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42955691 aaaaataggtgctctcgggaatt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtc 42955597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 1584231 - 1584609
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||   |    
T  1584231 agctcgcctcgcgagcccatctgctcgctatggcgagttcacaaaatcactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattatg 1584330  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || || |    
T  1584331 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatta 1584429  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   ||   | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| |   ||| | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  1584430 tctaggtaccttaattcatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-tttttatttggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcg 1584528  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1584529 aggcgagccatgatattgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaa 1584609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 21397139 - 21397516
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  21397139 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 21397238  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||| || || | |||||||    
T  21397239 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaagacttccaccattcatcattaaaatca 21397337  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| |||| |||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     ||||||    
T  21397338 tccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaac-ttttcaaaatcaag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcg 21397435  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21397436 aggcgagctatggagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcaatgaacttctgtacgggcagaa 21397516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 44657527 - 44657150
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  44657527 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 44657429  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  44657428 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatca 44657330  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | ||||||||||||||||| |   |||| |    
T  44657329 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgtg 44657231  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44657230 aggcgagtgatgatgttgcttactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 44657150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 44663456 - 44663079
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  44663456 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 44663358  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  44663357 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatca 44663259  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||| |||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  44663258 tctagataccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcg 44663160  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44663159 aggcgagtgatgatgttgctcactcac-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 44663079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 50082542 - 50082920
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  50082542 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 50082641  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| || |||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| || | ||| || || | |  ||||    
T  50082642 tgctctcgg-aaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttagcctaaaaattccaccattcatcattagtatca 50082739  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||  ||  |||| | |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  50082740 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 50082839  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| | |||| | | ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50082840 aggcgagctatgaagttgcttactcaccatggcgagcacag-ctactcgcgatgcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 50082920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 10972583 - 10972312
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||   |||||||||  ||||||||||| | || | ||||||     
T  10972583 atttttctcactaaaacttcaattttaagctccctattcatcttttaaatctgaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatctaagcactcaaaactat 10972484  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    || |  |    |||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |   || |||||||||| ||||||||| |    
T  10972483 cctacttgtaccttataacaacaattcaaaaagtcagattttctcacaggtactcgccatggcgagttgtcttgatcacgaggcgagctatgaagttgat 10972384  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| || || |   |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||    
T  10972383 cactcgctatggagaactcaggctactcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggaaaaatgcaggtttt 10972312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 602 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 47870680 - 47870474
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||   |||| |     
T  47870680 atttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatcttttgaacctaaaacttgctacagtcatcattaaaatcatctaggtaccttaaaccat 47870581  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||| | |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||     
T  47870580 ccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttaatctggcttgctcgccatggtgagttggtctgctcgcgaggcgagcgatgaagttgc 47870482  T
Q  801 tcactcgc 808  Q
    ||||||||    
T  47870481 tcactcgc 47870474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29382525 - 29382146
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | ||  ||    
T  29382525 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaacatcagg 29382427  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || |||    
T  29382426 tgctctcgggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatc 29382328  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  || | |||||| ||| |||||  ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||| |   |||||    
T  29382327 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatctgataacaacttttcaaaaaatcaagttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgc 29382228  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29382227 gaggcgagtgatgatgttgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 29382146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 536 - 808
Target Start/End: Original strand, 11937524 - 11937796
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11937524 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctcc 11937622  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaa 732  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |  || || || | || |||||||||||||   ||||  | ||||||  ||  |||| |||||| ||| ||||    
T  11937623 ctattcatctttttaacctaaaacttccatcattcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccgttcccaaa--acatcttataacaacttttcaaaa 11937720  T
Q  733 atccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    ||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11937721 atcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc 11937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 15547087 - 15547358
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||   |||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  15547087 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcacagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 15547186  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||  ||||| ||||      |||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||    
T  15547187 ccaaattacagcttataacaacaattcaaaaatcttgatttctcactctctaactcgccatggcgagtggttttgctagcgaggcgagccatgaagttgt 15547286  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15547287 tcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgccggggcgagcgatgaatgtatgtacgggcagaatgcaggtttt 15547358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 15406955 - 15407113
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  15406955 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 15407054  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||||| | || | |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  15407055 gccgaagctctctcgctttcatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 15407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 483 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 39265996 - 39265673
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||   |||||  ||    
T  39265996 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtggaaatcagg 39265897  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | || ||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||||    
T  39265896 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccatttctaaattccctcttcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatca 39265798  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||  | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||| || | ||| |   |||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  39265797 tctaggtaccttaaatcatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaat-cacaattttatctggctactcgccatggcgagttggactgctcgcga 39265699  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||    
T  39265698 ggcgaatgatgatgttgttcactcgc 39265673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 16485172 - 16485445
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  16485172 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 16485271  T
Q  702 ccaaaa--tacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-tt 798  Q
    ||||||  |||  |||| ||||||| | | ||||||||| || ||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||| ||    
T  16485272 ccaaaaattacatcttataacaacaatctgaaaatccaggttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttt 16485371  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  16485372 gctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaatgcaggtttt 16485445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 18165934 - 18165801
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  18165934 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgacccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 18165835  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  18165834 ccaaaatacggcttataacaacaattcaaaaatc 18165801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 812 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 13480439 - 13480389
Alignment:
Q  812 ggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13480439 ggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 13480389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 519
Target Start/End: Original strand, 33221686 - 33221729
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33221686 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 33221729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 873
Target Start/End: Original strand, 14506941 - 14507002
Alignment:
Q  812 ggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14506941 ggcgagcaaaggccactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtaagggcaaaatgcaggtttt 14507002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Original strand, 14821779 - 14821855
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  14821779 ctcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 14821855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 754 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 53904841 - 53904723
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctg 852  Q
    ||||||||||||||| ||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |   ||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  53904841 ctcgccatggcgagtggttctgctcgcaaggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgag-acgagctactcgccggggcgagcgatgaacatcag 53904744  T
Q  853 tacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53904743 tacgggcagaatgcaggtttt 53904723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 14048218 - 14048404
Alignment:
Q  85 cagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactcca 179  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  ||||    
T  14048218 cagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttcca 14048317  T
Q  180 ccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    || ||||||||||| | || |||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  14048318 ccgctttgaacgacaaggcgttccagggccaaagccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 14048404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 14485552 - 14485713
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | |  ||||    
T  14485552 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttcc 14485651  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14485652 agggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 14485713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 15318486 - 15318619
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| || | ||||||     
T  15318486 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatctaggcactcaaaactaa 15318585  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||    
T  15318586 ccaacttacatcttataacaacaatttgaaaatc 15318619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 826 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 47870479 - 47870442
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47870479 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 47870442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 11937836 - 11937872
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937836 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11937872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 14062886 - 14063113
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| | |    |||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  14062886 ctccactaagactcctctacaaa----tgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcaggac 14062980  T
Q  137 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 233  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||  ||| ||||| || || || |||    
T  14062981 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttgtgctta 14063080  T
Q  234 tgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  14063081 tgcaactaactccacttgtgtatacctacatac 14063113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 846
Target Start/End: Original strand, 14487124 - 14487367
Alignment:
Q  604 ttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccc 703  Q
    |||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || | | |||  ||||||||||  ||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  14487124 ttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgagaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcacctaaaactatcc 14487223  T
Q  704 aaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgtt 801  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || ||||||| || ||| | || | | | ||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||  ||| |    
T  14487224 aaattacagcttataacaacaattcaaaaatcaagttttac-cacgaccaactcgccatggcgagtggtgctgctcgcgaggcgagctatgaacattgct 14487322  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaa 846  Q
    ||||||||| ||||||||  || | ||||| ||||||||||||||    
T  14487323 cactcgctatggcgagcacaggttgctcgctaggcgagcgatgaa 14487367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 15360498 - 15360278
Alignment:
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||     
T  15360498 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagacctctc 15360399  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||||||||||| | || | |||||| |||   |||  |||| ||||||| || ||||| |  ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |     
T  15360398 taaaatcatctaagcactcaaaactatccatcttacaccttataacaacaattcaaaaagcatgattttctcacaggtactcgccatggcgagttgtctt 15360299  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
     |||||| ||||||| |||||    
T  15360298 gctcgcggggcgagctatgaa 15360278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 16228888 - 16228624
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa 571  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||   | |||||||  ||||||||  ||||||||||             
T  16228888 aaatactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgccatggcgagctcaggcaaaaggttactcgctgtggcgagtacgaggcgaact--------- 16228798  T
Q  572 cagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcct 671  Q
     |||||   |||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || |||  ||  ||||||||    
T  16228797 -agaaaaggggtgctctcgggagttttgacatttttctcactgaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaactgtcccagtcct 16228699  T
Q  672 cttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcac 746  Q
    ||  ||||||||||||| ||   |||||| ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  |||||||||    
T  16228698 ctctaaaatcatctaggcacttaaaactatccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgattttcac 16228624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26077847 - 26077686
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || || |    
T  26077847 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtttc 26077748  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || | | || |||| ||||||||||||||    
T  26077747 agagccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatac 26077686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 1650753 - 1650620
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||    ||| |||||||||||  |||| ||| || |||| |||||| |||||||||||| |||    
T  1650753 ggcgagctcaaggcgaacagaaaaggggtgctctcgggagttttgacatttttctcacgaaaacttcatttttaagttccctattcatcttttaaatcta 1650654  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    ||| |||| |||| |||||  |||||||| ||||    
T  1650653 aaaattgcaccaggcctctctaaaatcatttagg 1650620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 41528733 - 41528540
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||| ||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||   |||||||    
T  41528733 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatcattttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtacttaaaactac 41528634  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||| ||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  41528633 ccatattacaacttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgacatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 41528540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 822 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15004570 - 15004518
Alignment:
Q  822 ggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15004570 ggctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 15004518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 673
Target Start/End: Original strand, 14821881 - 14821956
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  14821881 tgacatttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 14821956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Original strand, 14822118 - 14822157
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14822118 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 14822157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 776 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 15464470 - 15464427
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  15464470 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgagca 15464427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 838 - 873
Target Start/End: Original strand, 16445697 - 16445732
Alignment:
Q  838 agcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16445697 agcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagatttt 16445732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 560
Target Start/End: Original strand, 16485065 - 16485140
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaa 560  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  16485065 ctcgcctcgcgggtgcatctgctcgctatggcgagctcaggcaaaaggttactcgccttggcgagtacgaggcgaa 16485140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Original strand, 17177105 - 17177144
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17177105 ggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 17177144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 775 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 12287697 - 12287655
Alignment:
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12287697 actcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 12287655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 827 - 873
Target Start/End: Original strand, 30239775 - 30239821
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  30239775 ctcgcgaggcgagcgatgaatatcagtacaggcagaatgcaggtttt 30239821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 775 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 52242758 - 52242716
Alignment:
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  52242758 actcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 52242716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 13452226 - 13452307
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 148  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13452226 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcac 13452307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 13845119 - 13845160
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13845119 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 13845160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 647
Target Start/End: Original strand, 13878283 - 13878364
Alignment:
Q  566 ggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatctttt 647  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  13878283 ggcgagcagaaaaatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcctcatttttaagctccctaatcctctttt 13878364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 809
Target Start/End: Original strand, 15099908 - 15099941
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 809  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15099908 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgct 15099941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 826 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 39265678 - 39265641
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39265678 actcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 39265641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 39705829 - 39705788
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  39705829 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 39705788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 697; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 697; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Original strand, 27280142 - 27280998
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280142 aacaacatatgcaacccatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 27280241  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27280242 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaag 27280341  T
Q  214 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27280342 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatctaa-catatacata-tatatgattcaccatccaatttac 27280439  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27280440 aacatttaagtgaattttaattaaatacaacatacatt-cagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatccagggaaa-tatatatcaacatac 27280537  T
Q  414 aagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280538 aagccatgcttaattcaacaatataaaccatccaaacaacaacagaaatcaaaccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 27280637  T
Q  513 tggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcac 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27280638 tggcgagctcaggaaatcaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcac 27280737  T
Q  613 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacgg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  27280738 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcctctaggcacatgaaactacccaagatacgg 27280837  T
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 812  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280838 cttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatccctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 27280937  T
Q  813 gcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280938 gcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 27280998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 3706980 - 3706145
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3706980 caactcatcaccgctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 3706882  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  3706881 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 3706782  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||  ||     
T  3706781 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaacctatgcatatatatg-tatatgactcaccactccaatttacaatattc 3706683  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacca-tccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||||  |||| | |||| |||||| ||||||| |  || ||||||||   ||| ||| | ||||||| |||||    
T  3706682 atgtataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccaacatccattcattacaaccaatttaaaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcc 3706587  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706586 atgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaacagaaatcaatccaacaaa-tattgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 3706490  T
Q  518 agctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaa 617  Q
    || ||||| ||   || |||||||||||||||||           ||||||||||||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| ||     
T  3706489 agttcaggaaaaagggcactcgccatggcgagtt-----------cgaggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaat 3706401  T
Q  618 cctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaa 717  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  3706400 cctcatttccaagttccctattcatctttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacgacttat 3706301  T
Q  718 aacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||| ||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3706300 aacgacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctaactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgctatggcgag 3706201  T
Q  818 caatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706200 caaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 3706145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22434734 - 22434333
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgag-gcga 570  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  22434734 aaatactggccagctcgcctcgcgagcacttctgctcgctatggcgagctcaggaaacaagacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaaagcga 22434635  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
    ||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  22434634 acgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattttaagctccctattcatctttttaatctaaaacttactccagtcc 22434535  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  22434534 tctctaaaatcatctaggtacataaaactatccaaaatgcggcttataacaacactttaaaaatccagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttg 22434435  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434434 tctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaat-gctactcgcgtggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 22434336  T
Q  871 ttt 873  Q
    |||    
T  22434335 ttt 22434333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 554 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20595809 - 20595490
Alignment:
Q  554 aggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacct 653  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||| | ||||||||| ||||||||| || ||    
T  20595809 aggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaatttttagctccctattcatctttttaatct 20595710  T
Q  654 aaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta 753  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | ||    
T  20595709 aaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggcttataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggta 20595610  T
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595609 ctcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 20595510  T
Q  854 acgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20595509 acgggcagaatgcaggtttt 20595490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 536 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 954804 - 954467
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  954804 ctcgctatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaatgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccc 954705  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  954704 tattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaattacggcttataacaacactttaaaaatc 954605  T
Q  736 cagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg 835  Q
    ||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||| |||||||    
T  954604 cagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctacccgcgagg 954505  T
Q  836 cgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  954504 cgagcgatgaacctctgtacgggcagaatgcaagtttt 954467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 473 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 24108788 - 24108389
Alignment:
Q  473 aatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaac 572  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||   | | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24108788 aatactgggcaactagcctcgcgagcacatctactcgctatgacgaactcagagaacgggttgctcgccatggtgagttcaaggcgaactcgaggcgaac 24108689  T
Q  573 agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctc 672  Q
      |||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24108688 gaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattaatctttttaatctaaaacttgctccagtcctc 24108589  T
Q  673 ttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
    |  |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||||| ||     
T  24108588 tctaaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacggcgagtggtt 24108489  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
       ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24108488 ctgctcgccaggcgaaccatgaagttgctcactcgccttagcgaacaa-ggctactcgcgaggcgaacgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 24108390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 49328397 - 49328784
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||        
T  49328397 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggctgctcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggtgagtga 49328495  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  49328496 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgccccagtcctctt 49328595  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttc-acaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || ||||| || ||| | ||||| | |||||||||       
T  49328596 taaaatcatttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagtttttcaactaggttgctcgcaacggcgagttggtc 49328695  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49328696 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 49328784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Original strand, 24079963 - 24080352
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa 571  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | | |||||||||||||           ||||||||||||    
T  24079963 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggttgctcgccatggcga-----------actcgaggcgaa 24080051  T
Q  572 cagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcct 671  Q
    |  |||||||||||||| || |    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24080052 cgaaaatatggtgctctcggtagttttgacatttttcccactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcct 24080151  T
Q  672 cttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
    ||  |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||   ||  | ||||||| | ||||||| ||    
T  24080152 ctctaaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacagcttataacaacaatttgaaaatccagaattcgtcacaggtactcgctacggcgagtggt 24080251  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
        |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24080252 tctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgatcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaatgcaggtt 24080350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 485 - 862
Target Start/End: Original strand, 20293056 - 20293431
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  20293056 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcatggcgaactcgaggcgagtgaaaattaggtg 20293155  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || | || ||||||    
T  20293156 ctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttcccgtcatcattaatatcatc 20293254  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || || ||||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  20293255 taggtaccttaaaccatccccaaaacagcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgagg 20293354  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaga 862  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20293355 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaga 20293431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 20299685 - 20300071
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  20299685 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcatggcgaactcgaggcgagtgaaaattaggtg 20299784  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || | || ||||||    
T  20299785 ctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttcccgtcatcattaatatcatc 20299883  T
Q  685 taggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||   ||||  | |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  20299884 taggtaccttaaaccatccccaaaata--gcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 20299981  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20299982 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaagttctgtacgggcagaaaacaggtttt 20300071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 471 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 29602045 - 29601644
Alignment:
Q  471 aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcg 569  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  29602045 aaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacttctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcg 29601947  T
Q  570 aacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    |    |||   || ||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29601946 agtgaaaagtaggcgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtc 29601847  T
Q  670 ctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagtt 769  Q
     || | |||||||| |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || |||||| |||||||||||    
T  29601846 atcattaaaatcatttaggcacattaaaccatccctaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgacatggcgagtt 29601747  T
Q  770 gtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 869  Q
    |     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29601746 ggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcac-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacagg 29601648  T
Q  870 tttt 873  Q
    ||||    
T  29601647 tttt 29601644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 36917482 - 36917878
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  36917482 actgggtagctcgcctcacgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 36917580  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  36917581 aaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcat 36917680  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||        
T  36917681 taaaatcatttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtct 36917780  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  36917781 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcaccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaaaacaggtttt 36917878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23066930 - 23066665
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaa 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||| | ||||||| |||    
T  23066930 aacaactcatgcaactcatcaccactccactaagacaactctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggatcgtagccctctccgctgtagaa 23066832  T
Q  113 tggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagcc 209  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  23066831 tggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagcc 23066732  T
Q  210 gaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23066731 gaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23066665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 21921163 - 21921557
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||   || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  21921163 actgggtagctcgcctcgcgagcacttctgctcgctatgacgagttcacaaaa-cagattactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 21921261  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  21921262 aaagtaggtgctctcgggaattttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcat 21921361  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||      || |||||||||||||||||||        
T  21921362 gaaaatcatttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatttgggttactcgccatggcgagttggtct 21921461  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     ||  |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21921462 gct--cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acggctactcgcgaggcgagcaatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 21921557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 20571119 - 20571495
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||   |||    
T  20571119 ctcgcctcgcgggcacatctactcgctatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaatgaaaatcatgtg 20571218  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||||    
T  20571219 ctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatcatc 20571317  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  20571318 taggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgagg 20571417  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20571418 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctttacgggcagaa 20571495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 47484472 - 47484868
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||  | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  47484472 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaataggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 47484571  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||  ||||||| | ||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||      
T  47484572 aataaagtgctctcgagagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgttccagtcctctct 47484671  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||| ||||||  | |||   |  || ||||||||| ||||| |||         
T  47484672 aaaatcatttaggtacattaaactaaccaatatacatcttataacaacaatttgaaaatcatgttttaatctgggttactcgccacggcgatttggtctg 47484771  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47484772 ctcgcggggcgacccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 47484868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 6740884 - 6741270
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  6740884 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 6740983  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  6740984 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcat 6741082  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |      
T  6741083 taaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggact 6741182  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741183 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 6741270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 21963379 - 21963768
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||  || | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||   |||| || |    
T  21963379 agctcgcctcgcgagcgcatctgctcgctatggcgagttcctaaaactagctgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgatgcgagt-gaaaaatag 21963477  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  21963478 gtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaaccccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatc 21963577  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||| | ||||||| |||||||||     |||||    
T  21963578 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccacggcgagttggtctgctcgc 21963676  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  21963677 gaggcgagccatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaaaccaggtttt 21963768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31535049 - 31534664
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  31535049 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 31534950  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||     
T  31534949 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacataaaacttccaccattcatcttt 31534851  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |      
T  31534850 attatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggact 31534752  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31534751 gctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 31534664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 4231563 - 4231941
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||| | ||    
T  4231563 agctcaccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcg-agtgaaaaaagg 4231661  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||    
T  4231662 tgatctcggg-aaaatgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccactcatcattaaaatca 4231760  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaac-attttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc-actcgc 780  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||   ||| |||||| |||| ||||||| || |||  ||  |  | ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  4231761 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacattttataacaacaatttaaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttg-atctgctcgc 4231859  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4231860 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacaggcagaa 4231941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 28556245 - 28555866
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  28556245 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 28556146  T
Q  583 tgctct-ggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || | ||| || || | ||||||    
T  28556145 tgctctcggggaaaaatgccatttt-ctcactcaaaactcatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaaattccaccattcatcattaaaatc 28556047  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  28556046 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 28555947  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555946 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 28555866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 38907796 - 38907417
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  | |||||||| ||||||    ||||  |    
T  38907796 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaagcgaactcaaggcgagtgaaaatcag 38907697  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    || |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  |||    
T  38907696 gtactctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcctctttattatc 38907598  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  38907597 atctaggtaccttaaaccaaccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 38907498  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38907497 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgag-aacagctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaa 38907417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 48428219 - 48428604
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  48428219 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 48428318  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||     
T  48428319 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatcttattaacctaaaacttccaccattcatcttt 48428417  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |  ||| |||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |      
T  48428418 attatcctctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggact 48428516  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428517 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 48428604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20438709 - 20438531
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20438709 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20438610  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20438609 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 20438531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31563766 - 31563381
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  31563766 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 31563667  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||     
T  31563666 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacataaaacttccaccattcatcttt 31563568  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||     |||| |||||||||||||||||| |      
T  31563567 attatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatgtgggcttactcgccatggcgagttggact 31563469  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31563468 gctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagtgatgaacttctgtacgggcagaa 31563381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 485 - 691
Target Start/End: Original strand, 20242953 - 20243159
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20242953 ctcgcctcgcgagtactcctactcgctatggcgaactcaaggaaaggggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtg 20243052  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20243053 ctctcgggagttttgacatttttcgcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatc 20243152  T
Q  685 taggtac 691  Q
    |||||||    
T  20243153 taggtac 20243159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 17149690 - 17150069
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  17149690 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaatcactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 17149789  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || | || |||    
T  17149790 tgctctcgggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctaaaacttgttctagtcttcattaatatc 17149888  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||    ||| |||    
T  17149889 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctacttgcg 17149988  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| |  || |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17149989 aggcgagtgtggatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 17150069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20941507 - 20941235
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  20941507 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctcaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 20941408  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacatttt-aaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| | | |||||||||| ||||| ||  | ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||     
T  20941407 ccatattacaccttataacaacaatctgaaaaatccaggttttctcacaggtactcgccacggcgagttgtcttactcgcgagacgagctatgaagttgc 20941308  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20941307 tcactcgctaaggcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacggtcagaatgcaggtttt 20941235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 21542056 - 21542233
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21542056 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21542154  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21542155 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21542233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 476 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 23066452 - 23066236
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  23066452 actgggcaactcgcctcgcgagcatacctgctcgctatggcgagttcagaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacgaa 23066353  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  23066352 aatatggtgctctcgggagttttgaaatttttctcacttaaacttcaattctaaacaccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctct 23066253  T
Q  676 aaaatcatctaggtaca 692  Q
    |||||||||||||||||    
T  23066252 aaaatcatctaggtaca 23066236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42096080 - 42095903
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  42096080 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 42095982  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  42095981 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 42095903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 37682449 - 37682829
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||   ||     || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  37682449 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttcaccaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 37682548  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    || |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||    
T  37682549 gtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatat 37682647  T
Q  681 catctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    |||||||||||   ||||  | ||||||| |   |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||    
T  37682648 catctaggtaccttaaaccgttcccaaaacat--cttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctc 37682745  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682746 gcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgcga-ggcgaggtatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 37682829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 20076691 - 20076308
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||  |  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  ||    
T  20076691 agctcgcctcgcgatcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactacttactcgtcatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaatattagg 20076592  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| || | |||||||    
T  20076591 tgctctcggaagaaatgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttctagtcatcattaaaatca 20076492  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc-actcg-- 779  Q
    | |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||   || |  | |||||| |||||||||| |||  ||||      
T  20076491 tttaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaagttttgttcaggctttctcgccgtggcgagttg-atctgctcgcg 20076393  T
Q  780 --cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20076392 atcgaggcgaacgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20076308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 20242491 - 20242735
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||  |||||||| ||||| |||| |||    
T  20242491 caactcaccaccactccactaagacttctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaaggccgaagccctaaccgctgtagaatgattaaggca 20242589  T
Q  124 ttctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcc 219  Q
    |||   |  ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  20242590 ttcattttccaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcc 20242689  T
Q  220 cactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| ||||| |||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20242690 cacttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatac 20242735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 36211792 - 36211414
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  36211792 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggtgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 36211693  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||| ||| ||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  36211692 tgctctcggggaaagtgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatca 36211594  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||  ||| |||||||  | |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  36211593 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaatttttcaaaaatcacgttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 36211494  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36211493 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 36211414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 39094697 - 39095075
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||     
T  39094697 ctcgcctcgcgagctcatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggta 39094796  T
Q  585 ctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  |||||    
T  39094797 ctctcgggaaaaagtgaca-ttttctcactcaaactccaattctaagctccctgttcatctttttaacctaaaactttcaccattcctctttattatcat 39094895  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  || ||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  39094896 ctaggtaccttaaaccatccctaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggttactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 39094995  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct-gtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39094996 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctcgtacgggcagaa 39095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20046056 - 20045879
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20046056 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20045957  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  20045956 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccgct-tgatgtttatgaaacta 20045879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 29554097 - 29553826
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||| ||||| || | ||| || |||| ||| || ||||||||| || |||||| |||   ||| |||||  |||| |||||||| || | ||||||     
T  29554097 atttttttcactaaatcttcatttttaagttccatattcatctttttaatctaaaaattgtctcagacctctctaaaaacatctaggcactccaaactat 29553998  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  29553997 ccaaattacaccttataacaacaatctgaaaatccagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttgtcttgctcacgaggcgagctatgaagttgct 29553898  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29553897 cactcgctaaggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacggacagaatgcaggtttt 29553826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 39189422 - 39189041
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  39189422 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 39189323  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    |||| || |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  39189322 gtgcactcgggaaaaagtgacatttt-ctcactccaactccaattctaagttccctattcatctttttaacgtaaaacttccaccattcatctttattat 39189224  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||  ||  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  39189223 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaaatcaagttttatctgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 39189124  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189123 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 39189041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18026494 - 18026116
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  ||    
T  18026494 agctcacctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaacattagg 18026395  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| | ||| || || | |||||||    
T  18026394 tgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaatccaaaactttcaccattcatcattaaaatca 18026296  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  18026295 tccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcg 18026197  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18026196 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 18026116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 42626573 - 42626950
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |||    
T  42626573 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 42626671  T
Q  584 gctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  42626672 gctctcgggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaaccttaatactaagctccctattcttctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatca 42626770  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||   ||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     ||||||    
T  42626771 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacattttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcg 42626869  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626870 aggagagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgttcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 42626950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19664306 - 19664105
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  19664306 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 19664208  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19664207 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 19664108  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  19664107 tac 19664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 265
Target Start/End: Original strand, 32650071 - 32650304
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcag 133  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32650071 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttttcag 32650169  T
Q  134 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 231  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32650170 gacataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgat 32650269  T
Q  232 tatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  32650270 tatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 32650304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22448469 - 22448244
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  22448469 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacagg 22448371  T
Q  135 acataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    |||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  22448370 acataagtcct--------caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttctacttttatgcttat 22448279  T
Q  235 gcaactaat----ccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| ||||    || |||| ||||||||||||||    
T  22448278 gcaattaattgacccacttgtgtatatctacatac 22448244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Original strand, 18418552 - 18418878
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||    
T  18418552 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttcc 18418650  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaat 734  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||  ||| ||||||    
T  18418651 ctgttcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaatttttcaaaaat 18418750  T
Q  735 ccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgag 834  Q
    |   |||||  | ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| ||||||||    
T  18418751 cacaattttatctaggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgag 18418849  T
Q  835 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18418850 gggagcgatgaacttctgtacgggcagaa 18418878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19046041 - 19045665
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |||    
T  19046041 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcgcaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 19045943  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | || |||||    
T  19045942 gctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattaatatcat 19045844  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  ||||  ||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||  |   |||||||    
T  19045843 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttatgacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggttttttcgcgag 19045744  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  19045743 gcgagtgttgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggtagaa 19045665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 41110814 - 41111016
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41110814 atgcatgtgataccataattcagggtcatgacccacaccattgtcgaatggttaaagcattctcagcatgacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41110913  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||   ||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  41110914 gaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 41111013  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  41111014 tac 41111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 20396615 - 20396237
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  ||    
T  20396615 agctcgcctcgcgagcacatctgttcgccatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactctaggcgagtgaaaattagg 20396516  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |  || || || | |||||||    
T  20396515 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctaatcattcttttaacctaaaactttcatcattcatcattaaaatca 20396417  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagtt-gtatcactcgc 780  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||| ||||  |||||    
T  20396416 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggtat-gctcgc 20396319  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396318 ggggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20396237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 25092038 - 25091660
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||| |||||||||  |||||||||           ||||| | ||||    
T  25092038 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaaggaatgggctactcgctatggcgagtacgaggcgaac----------gagaaaaagggtg 25091949  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  |||| ||||    
T  25091948 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttgagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgttccagtcctctctaaaaacatc 25091849  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagatt-ttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     ||| || | |||||| ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||    |||||||||||||||||| || |  ||||||||    
T  25091848 caggcactcaaaactatccaacttacaccttataacaacaatttgaaaatccagattcctcactcacctactcgccatggcgagtggttttgctcgcgag 25091749  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||  ||||||| |||  ||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25091748 gcgagctatgaagttgcttactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgcgggggcgagcaatgaagatctgtacgggcagaatgcaggtttt 25091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 20276993 - 20276616
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggagg-cgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||  |||    
T  20276993 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaagggcgaactcgaggcgagtggaaatcaggt 20276894  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| || ||||||   ||||| | |||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  |||||    
T  20276893 gctctcggaaaaaataccatttt-cacactcagaactcatttctatgttccctaatcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatcat 20276795  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||   |||||  |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  20276794 ctaggtactttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcacaattttatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 20276695  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20276694 gcgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 20276616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 43089044 - 43089141
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43089044 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 43089141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 36615414 - 36615690
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| | ||||||     
T  36615414 atttttctcactaaaacttcaattctaagctctctattcatctttttaatctaaaacttgctccagacctctctaaaatcatataggtacccaaaactat 36615513  T
Q  702 ccaa--aatacggcttaaaacaacattttaaaaa------tccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatg 793  Q
    ||    |||||  |||| ||||||| || |||||      ||  | |||  ||  || ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| |||    
T  36615514 cctcctaatac--cttataacaacaattcaaaaaaaaaaatcatgttttatactgggttactcgccacggcgagttgttctgctcgcgaggcgagccatg 36615611  T
Q  794 aagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  ||||||||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36615612 aagtttctcactcgccttggcgaataa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 36615690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 955260 - 955118
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctcta--aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  955260 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagca 955162  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 164  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  955161 ttcattttcaggacataagccctcaccactaaacaccactttga 955118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 559 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 24238099 - 24237786
Alignment:
Q  559 aactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaac 658  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || |||     
T  24238099 aactcgaggcgagcgaaaataaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaa 24238000  T
Q  659 ttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgc 758  Q
    |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   |||||| ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | |||  ||  || |||||||    
T  24237999 ttgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacctaaaactatccatattacagcttataacaacacttcaaaaatcatgttttcaactgggttactcgc 24237900  T
Q  759 catggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggg 858  Q
    || | |||||||     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24237899 cacgacgagttggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgcgt-ggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggg 24237801  T
Q  859 cagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  ||||||||    
T  24237800 cagaaaacaggtttt 24237786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 536 - 808
Target Start/End: Original strand, 52990821 - 52991092
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52990821 ctcgccatggctagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctcc 52990918  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaacta-cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaa 733  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||| || |||| || | || |||||||||||||   |||| | ||| |||| |  |||| ||||||| ||| ||||    
T  52990919 ctattcatcttattaacctaaaacttgttcaagtcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaat-catcttataacaacaatttgaaaa 52991017  T
Q  734 tccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    || || |||  ||  || | |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52991018 tcaagttttcaactgggttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc 52991092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 754 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29150708 - 29150600
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29150708 ctcgccatggcgagttggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgataaacttctgt 29150610  T
Q  854 acgggcagaa 863  Q
    ||||||||||    
T  29150609 acgggcagaa 29150600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 536 - 808
Target Start/End: Original strand, 37675810 - 37676082
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  37675810 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctcc 37675908  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaa 732  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |  || || || | || |||||||||||||   ||||  | ||||||  ||  |||| |||||| ||| ||||    
T  37675909 ctattcatctttttaacctaaaacttccatcattcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccgttcccaaa--acatcttataacaacttttcaaaa 37676006  T
Q  733 atccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    ||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37676007 atcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc 37676082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 873
Target Start/End: Original strand, 24475865 - 24476141
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaa 697  Q
    |||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | |||    
T  24475865 tgatatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatcaaggcactcaaaa 24475964  T
Q  698 ctacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag 796  Q
    ||| ||||  |||  |||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||||     ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||    
T  24475965 ctatccaacttacaccttataacaacaatttgaaaatcaagatctctcactcacttactcgccatggcgagtggttttgctcgcgaggcgagctatgaag 24476064  T
Q  797 -ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttc-tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     | | ||||||||  ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24476065 atggctcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgcggggcgagcgatgaatatcatgtacgggcagaatgcaggtttt 24476141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778434
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccac 159  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  19778639 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 19778541  T
Q  160 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 258  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19778540 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 19778441  T
Q  259 tacatac 265  Q
    |||||||    
T  19778440 tacatac 19778434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 20849554 - 20849825
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  |||| ||| |||| || | ||||||     
T  20849554 atttttctcactaaatcttcacttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgttccagtcctctctaaaagcatttaggcactcaaaactaa 20849653  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||| | |||      | ||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  20849654 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcaggcacttgctcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgt 20849753  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  | ||| | | | ||||||||| | |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  20849754 tcactcgc-gacgcg-ggactagctactcgctggggcgagcgatgaatatcagaacgggcagaatgcaggtttt 20849825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 23634228 - 23634324
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  23634228 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgcga-ggcgagacagggctactcgcggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgtaggtttt 23634324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 5381333 - 5381427
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  5381333 ctcgcggggcgagctatgaagttgttcactcg---aggcgagacaaggctactcgcggggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgtaggtttt 5381427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 21410325 - 21410056
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||| || |  |||||     
T  21410325 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaattatttaggcactcagaactaa 21410226  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||| | |||| |||   | ||||| || |||||| ||    |||||||||||||| ||||||||    
T  21410225 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatgatct-caca-ggcacttgctcgctatagcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagtt 21410128  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
    | |||||||| ||| ||||  ||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21410127 gctcactcgcgaag-cgagacatg-ctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtt 21410056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29554645 - 29554419
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  29554645 ctccactaagactcctcta----ccaatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 29554551  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||| ||||| || || || ||||    
T  29554550 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttat 29554451  T
Q  235 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  29554450 gcaactgactccacttgtgtatatctacatac 29554419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Original strand, 36614935 - 36615015
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36614935 atgcatgtggtaccaaaa--cagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 36615015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20824131 - 20824078
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20824131 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 20824078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955032
Alignment:
Q  178 caccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 274  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccacttttatgctcatgctactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 955032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Original strand, 23712874 - 23712993
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctg 852  Q
    |||||||||||||||| ||    |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||  | || |||||||| | |||||||||||| || |    
T  23712874 actcgccatggcgagtggttctgctcgagaggcgagccatgaagttgctcacgcgcga-ggcgagacagggttactcgcgggacgagcgatgaacatcag 23712972  T
Q  853 tacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23712973 tacgggcagaatgcaggtttt 23712993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20837940 - 20837889
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20837940 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactca 20837889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Original strand, 21698507 - 21698594
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21698507 atactgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactcaaggaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 21698594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21734175 - 21734124
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21734175 atactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 21734124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21745249 - 21744978
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||||||| || ||||||||| || |||||| |||  | ||||||||  |||| |||| ||| || | ||||||     
T  21745249 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccatattcatctttttaatctaaaaattgtccaagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaactat 21745150  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgt 800  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||| || || ||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||| |||     
T  21745149 ccaaattacaccttataacaacaatttaaaaatcaaggttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagctatgaagattgc 21745050  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |||  | ||||||| | |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  21745049 tcactcgc-gaggcgagacaa--gttactcgcaggggcgagtgatgaaggtctgtacaggcagaatgcaggtttt 21744978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 9292417 - 9292453
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9292417 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 9292453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 21986668 - 21986592
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||    
T  21986668 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatagcgagctcaggaaatgggttacttgccatggcgagt 21986592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 37676122 - 37676158
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37676122 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 37676158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 20086248 - 20086161
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||  | ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  20086248 atactgggcaactcgcctcgcaagtacatctactcgctatggcgaactcaaggaatgggttactcgctatggcgagtacgaggcgaac 20086161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 30491205 - 30491118
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||  | |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  30491205 atactgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactcaaggaatgggttactcgtcgtggcgagtacgaggcgaac 30491118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 15316153 - 15316020
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || | | ||||     
T  15316153 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaagactat 15316054  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  15316053 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatc 15316020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 19853549 - 19853742
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  19853549 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacctaaaactat 19853648  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||| ||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  19853649 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtacttgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 19853742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 19859684 - 19859877
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| ||   |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  19859684 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattttcccagacctctctaaaatcatctaggcacctaaaactat 19859783  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  19859784 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 19859877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 21410440 - 21410387
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaat 529  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21410440 actgggaaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgagctcaaggaat 21410387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 35981228 - 35981187
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35981228 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgctatggcgag 35981187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Original strand, 5381051 - 5381127
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  5381051 ctcgtctcgcgagcacatctactcgctatggcgaactcatgaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 5381127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11140770 - 11140722
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagc 520  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11140770 aaatactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagc 11140722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Original strand, 24079551 - 24079634
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24079551 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24079634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24109203 - 24109120
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24109203 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24109120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Original strand, 41312568 - 41312644
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  41312568 ctcgcctcgcgagtgcatctgctctctatggcgagctcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 41312644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20838280 - 20838142
Alignment:
Q  130 tcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac-tgtt 226  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | |  |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | ||||| | | ||    
T  20838280 tcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaatgttccaccactttgaacgacaaggcattccagggcagaatccctcccgcttatt 20838181  T
Q  227 atgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  20838180 atgcttatgcaactaacccacttgtgtatatccacatac 20838142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 705
Target Start/End: Original strand, 41312675 - 41312778
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||| ||| || | ||||||     
T  41312675 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatcaaggcactcaaaactaa 41312774  T
Q  702 ccaa 705  Q
    ||||    
T  41312775 ccaa 41312778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 954825 - 954791
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  954825 ctcgcctcgcgagcacacctgctcgctatggcgag 954791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 21986550 - 21986420
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | ||||||     
T  21986550 atttttctcactaaatcttcacttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaactaa 21986451  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaa 732  Q
    | ||| |||  |||| ||||||| |||||||    
T  21986450 caaaattacaccttataacaacaatttaaaa 21986420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23195653 - 23195571
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23195653 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 23195571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 775 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 28193995 - 28193953
Alignment:
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28193995 actcgtgaggcgagcgatgaagttgctcactcgctatggcgag 28193953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 19336302 - 19336435
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||   ||||||||||  ||||||||| ||| || | ||||||     
T  19336302 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattatcccagtcctctctaaaatcatccaggcactcaaaactaa 19336401  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||| ||   |||| ||||||| | ||||||||    
T  19336402 ccaaattataccttataacaacaatctaaaaatc 19336435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 20637431 - 20637472
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20637431 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 20637472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 21862933 - 21862892
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21862933 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 21862892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 33681590 - 33681631
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  33681590 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 33681631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 49261704 - 49261745
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  49261704 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgcttactcgctatggcgag 49261745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 686; Significance: 0; HSPs: 142)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 686; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 873
Target Start/End: Original strand, 13946414 - 13947280
Alignment:
Q  4 taatcctctcaaacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 103  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946414 taatcctctcaa-caacaaatgcaacctatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 13946512  T
Q  104 gctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946513 gctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcc 13946612  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13946613 agagccgaaactctcccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcacca 13946711  T
Q  304 tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatat 403  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13946712 tccaatttacaac-ttcaaggaaattttaattaaatacaacatacatttcagccagcatctattcatcataaccatccaagacatccagg--aaatatat 13946808  T
Q  404 atcaacatacaagccatgcttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaac--aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13946809 atcaacatacaagccatgcttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaaaaaactgggcagctcgcctcgcgagcaca 13946908  T
Q  502 tctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgat 601  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13946909 tctgctcgctatggcgagctcagaaaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgct 13947008  T
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | | |||||||||||||||    |||||    
T  13947009 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctctaggcatccttataatcatctaggtacatagtactac 13947108  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947109 ccaaattacggcttataacaacattttaaaaatccagattttcccaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 13947208  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13947209 cactcgctatggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacaggcagaatgcagatttt 13947280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 678; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 873
Target Start/End: Original strand, 13909469 - 13910335
Alignment:
Q  4 taatcctctcaaacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 103  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909469 taatcctctcaa-caacaaatccaacctatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 13909567  T
Q  104 gctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909568 gctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcc 13909667  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13909668 agagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcacca 13909766  T
Q  304 tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatat 403  Q
    ||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13909767 tccaatttaaaac-ttcaaggaaattttaattaaatacaacatacatttcagccagcatctattcatcataaccatccaagacatccagg--aaatatat 13909863  T
Q  404 atcaacatacaagccatgcttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaac--aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcaca 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  13909864 atcaacatacaagccatgcttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaaaaaactgggcagctcgcctcgcaagcaca 13909963  T
Q  502 tctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgat 601  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13909964 tctgctcgctatggtgagctcagaaaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgct 13910063  T
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | | |||||||||||||||    |||||    
T  13910064 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctctaggcatccttataatcatctaggtacatagtactac 13910163  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13910164 ccaaattacggcttataacaacattttaaaaatccagattttcccaaggctactcgccatggcgagttgtatccctcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 13910263  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13910264 cactcgctatggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagatttt 13910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 873
Target Start/End: Original strand, 13939928 - 13940791
Alignment:
Q  4 taatcctctcaaacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 103  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13939928 taatcctctcaa-caacaaatgcaacctatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 13940026  T
Q  104 gctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940027 gctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcc 13940126  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  13940127 agagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacct----atatacataatatatgattcacca 13940221  T
Q  304 tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatat 403  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13940222 tccaatttacaac-ttcaaggaaattttaattaaatacaacatacatttcagccagcatctattcatcataaccatccaagacatccagg--aaatatat 13940318  T
Q  404 atcaacatacaagccatgcttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaac---aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcac 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13940319 atcaacatacaagacatgcttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaaaaaaactgggcagctcgcctcgcgagcac 13940418  T
Q  501 atctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatga 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  13940419 atctgctcgctatggcgagctcagaaaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacataaatatggtgctctcgggaaaaatgc 13940518  T
Q  601 tatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaacta 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || | | |||||||||||||||    ||||    
T  13940519 tatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctataggcatccttataatcatctaggtacatagtacta 13940618  T
Q  701 cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940619 cccaaattacggcttataacaacattttaaaaatccagattttcccaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 13940718  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13940719 tcactcgctatggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagatttt 13940791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 41175438 - 41176280
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175438 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 41175537  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175538 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 41175637  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||     
T  41175638 tatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-aagg 41175735  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||  |||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  41175736 gaattt-aattatatacaacacacat--cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaag-catccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 41175830  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41175831 taattcaacaaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 41175929  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41175930 agaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 41176029  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  41176030 attctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaagctacccaaattacggcttataacaa 41176129  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41176130 ctttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagtaatg 41176229  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41176230 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 41176280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 41180576 - 41181418
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180576 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 41180675  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180676 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 41180775  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||     
T  41180776 tatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-aagg 41180873  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||  |||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  41180874 gaattt-aattatatacaacacacat--cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaag-catccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 41180968  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41180969 taattcaacaaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 41181067  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41181068 agaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 41181167  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  41181168 attctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaagctacccaaattacggcttataacaa 41181267  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41181268 ctttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagtaatg 41181367  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41181368 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 41181418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 44775159 - 44776006
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775159 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 44775258  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775259 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 44775358  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  44775359 tgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 44775456  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44775457 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaacgaaaacatccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 44775553  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44775554 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 44775652  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44775653 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 44775752  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44775753 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacaaaactacccaaaatacggcttataa 44775852  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44775853 caactttttcaaaatccagatttttacaaggctactcgccatggcgagctgattcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgaaca 44775952  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44775953 atggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcagttttt 44776006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 44780343 - 44781190
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780343 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 44780442  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780443 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 44780542  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  44780543 tgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 44780640  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44780641 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaacgaaaacatccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 44780737  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44780738 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 44780836  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44780837 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 44780936  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44780937 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacaaaactacccaaaatacggcttataa 44781036  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44781037 caactttttcaaaatccagatttttacaaggctactcgccatggcgagctgattcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgaaca 44781136  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44781137 atggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcagttttt 44781190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 4677125 - 4677967
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677125 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 4677224  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677225 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 4677324  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||     
T  4677325 tatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-aagg 4677422  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||   |||  |||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  4677423 gaattt-aattatatacaacatacac--cagtcagcatccattcatcaaaaccaactaag-catctagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 4677517  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4677518 taattcaacaaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 4677616  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4677617 agaaaaacgggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 4677716  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4677717 attctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataacaa 4677816  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4677817 ttttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgctatggcgagcaatg 4677916  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4677917 gctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtttt 4677967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 8743125 - 8742284
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743125 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 8743026  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743025 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 8742926  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||     
T  8742925 tatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacata-tatatgattcaccaatcaacttacaccttt-aagg 8742828  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||   |||  | |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  8742827 gaatcttaattatatacaacacacac--cagtcaacatccattcatcaaaaccaactaag-catccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 8742732  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| |||| | |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8742731 taattcaacaaaatacacaatccaaacaacaacagaattaa--ccaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 8742634  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8742633 aggaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 8742534  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8742533 attctaagctccctaatcatcttttgaacttaaaacttgctctagtcctc-taagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataacaa 8742435  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8742434 ctttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatggagttgttcactcgctatggcgagcaatg 8742335  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8742334 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggtttt 8742284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 8761295 - 8760454
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761295 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 8761196  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761195 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 8761096  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||     
T  8761095 tatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacata-tatatgattcaccaatcaacttacaccttt-aagg 8760998  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||   |||  | |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  8760997 gaatcttaattatatacaacacacac--cagtcaacatccattcatcaaaaccaactaag-catccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 8760902  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| |||| | |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8760901 taattcaacaaaatacacaatccaaacaacaacagaattaa--ccaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 8760804  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8760803 aggaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 8760704  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8760703 attctaagctccctaatcatcttttgaacttaaaacttgctctagtcctc-taagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataacaa 8760605  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8760604 ctttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatggagttgttcactcgctatggcgagcaatg 8760505  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8760504 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggtttt 8760454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 12200164 - 12201006
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12200164 caacccatcaccactccactaagactcctgtaaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 12200262  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||    
T  12200263 ctcatcaggacataagttctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagctgaagctctcccactg 12200362  T
Q  225 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaag 323  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||     
T  12200363 ttatgcttatgcaacttacccacttgagtatatctacataccaaccaacctaagcatatacgta-tatatgactcaccactccaatttacaacattcaaa 12200461  T
Q  324 tgaattttaattaaatacaac-atacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgc 422  Q
    | ||  ||||||||||| ||  ||||||  |||| |||||  ||||||||||||||    |||||||||| ||||   || | |||||||||||||||||    
T  12200462 taaaacttaattaaataaaaatatacatc-cagccagcattcattcatcacaaccaaagtagacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgc 12200557  T
Q  423 ttaattcaacaaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||  || | ||||| ||| ||  |||||| | |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12200558 ttaatcaaaaagataaaacattcat-caacaacacaaatcaaaccaacaaaa-actgggcatctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 12200655  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||    
T  12200656 agggaacaaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaatctggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactaaatcatca 12200755  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||  |||||||  | |||||||||  |||| |||| |||||    
T  12200756 attctaagctccctaatcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaattattaaggtacataatactacccaacttacgacttataacaa 12200855  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||  |    
T  12200856 cattctaaaaatccaaattttcacaagggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccacgaagttgctcactcgctatggcgagcatag 12200955  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12200956 gctactcgcgaggatagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 12201006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 16838729 - 16837876
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaa 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||| |||    
T  16838729 aacaactcatgcaactcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaa 16838632  T
Q  113 tggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccg 210  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  16838631 tggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccg 16838532  T
Q  211 aagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataa-tatatgattcacca-tccaa 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||  |||| || |||||| |||||    
T  16838531 aagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaacctatgcatatatttatgtatacgactcaccactccaa 16838432  T
Q  309 tttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatca 407  Q
    |||||||  || | ||  |  ||||||||||| | |||||||  |||| | || | |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| ||||    
T  16838431 tttacaatgttcatgtataacttaattaaataaagcatacatc-cagccaacacccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacatca 16838336  T
Q  408 acatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgc 506  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16838335 acataaaagccatgctta-ttcaaccagataaatcaaccat-caacaacagaaatcaatccaacaaaattctgggcagctcacctcacgagcacatctgc 16838238  T
Q  507 tcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttt 606  Q
    ||| |||||| |||||| | ||   || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||    
T  16838237 tcgttatggcaagctcaagaaacagggcactcgccatggcgagttcgagccgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggagttttgacatttt 16838138  T
Q  607 tctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaa 706  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16838137 tctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatccttttaatctacaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaa 16838038  T
Q  707 atacggcttaaaacaaca-ttttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcact 805  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||      ||||||| |||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16838037 atacggcttataacaacactttaaaaaatccggattttcactcactaactcgccttggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcact 16837938  T
Q  806 cgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgca 867  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16837937 cgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgca 16837876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 154 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829353
Alignment:
Q  154 caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagt 253  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagt 16829966  T
Q  254 atatctacataccaaccaacctaaacatatacataa-tatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatt 351  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||  |||| || |||||| ||||||||||||  || | ||  |  ||||||||||| | |||||||     
T  16829965 atatctacatacaatccaacctatgcatatatttatgtatacgactcaccactccaatttacaatgttcatgtataacttaattaaataaagcatacatc 16829866  T
Q  352 tcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaac 449  Q
     |||| | || | |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| |||  |    
T  16829865 -cagccaacacccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacatcaacataaaagccatgctta-ttcaaccagataaatcaaccat-c 16829772  T
Q  450 aacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgag 549  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||   || |||||||||||||||    
T  16829771 aacaacagaaatcaatccaacaaaattctgggcagctcacctcacgagcacatctgctcgttatggcaagctcaagaaacagggcactcgccatggcgag 16829672  T
Q  550 ttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaa 649  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  16829671 ttcgagccgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatcctttta 16829572  T
Q  650 acctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaaca-ttttaaaaatccagattttcacaa 748  Q
    | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||      
T  16829571 atctacaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggcttataacaacactttaaaaaatccggattttcactc 16829472  T
Q  749 ggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaact 848  Q
        ||||||| |||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16829471 actaactcgccttggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaact 16829372  T
Q  849 tctgtacgggcagaatgca 867  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16829371 tctgtacgggcagaatgca 16829353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14652520 - 14652119
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa 571  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14652520 aaataccgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagcttaggaaacatgacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaa 14652421  T
Q  572 cagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcct 671  Q
    |  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14652420 cgaaaatatggtgctctagggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatcttttaaatctaaaacttgctccaatcct 14652321  T
Q  672 cttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||    
T  14652320 ctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggcttataacaacactttaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgt 14652221  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14652220 ctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctacttgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtt 14652121  T
Q  872 tt 873  Q
    ||    
T  14652120 tt 14652119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 406 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 13203409 - 13202944
Alignment:
Q  406 caacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatct 504  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||  || ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13203409 caacataaaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccatcca-caacagaaaacaatccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatct 13203312  T
Q  505 gctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatt 604  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||    ||  |||    
T  13203311 gctcgctatggcgagcttaggaactaaggcacttgccatggcgagttcgaggcgaacttgaggcgaacaggaacatggttctctcgggagttttggcatt 13203212  T
Q  605 tttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccca 704  Q
    || |||||| || | |||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  13203211 tt-ctcactaaatcatcaattctaagctccctattcacccttttaatctaaaacttgctgcaatcctctctaaagtcatctaggtacataaaactaccca 13203113  T
Q  705 aaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcac 804  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13203112 aaatacggcttgtaacaacacttcaaaaatcgagattttctcaagggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcac 13203013  T
Q  805 tcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13203012 tcgccttggcgatcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 13202944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 515 - 873
Target Start/End: Original strand, 16349020 - 16349377
Alignment:
Q  515 gcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca-gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcact 613  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    ||| ||||||||||||    
T  16349020 gcgagctcaggaaataaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacaagaaaaatggtgctctcgggagtt-tgacatttttctcact 16349118  T
Q  614 caaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggc 713  Q
     || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |    
T  16349119 aaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatataaaacttgctccagtcatcattaaaatcatctaggtacataaaactacccaaattacgac 16349218  T
Q  714 ttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaagg 813  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||    
T  16349219 ttgtaacaacatttcaaaaatccagattttctcaaggttactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttgg 16349318  T
Q  814 cgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16349319 cgagcaa-ggctactcgcgaggcgacgaatgaacttctgtacgggcagaatgcaagtttt 16349377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 470 - 873
Target Start/End: Original strand, 12419802 - 12420204
Alignment:
Q  470 caaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcg 569  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   | | ||||||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  12419802 caaaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaacgggttgctcgccatgacgagttcaagacgaactcgaggcg 12419901  T
Q  570 aacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    |||  ||||||||||| || ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12419902 aacgaaaatatggtgcactcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtc 12420001  T
Q  670 ctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagtt 769  Q
    ||||  |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||| || | ||  | ||||||||| |||||||     
T  12420002 ctctctaaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacaacttataacaacaatttgaaaatccagaattcctcacaggtactcgccacggcgagtc 12420101  T
Q  770 gtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 869  Q
    ||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420102 gttctgctcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 12420200  T
Q  870 tttt 873  Q
    ||||    
T  12420201 tttt 12420204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16382602 - 16382286
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  16382602 ggcgaactcgaggcgaacagaaaaatggtgctctcgggagtt-tgacatttttctcacgaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatcta 16382504  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  16382503 aaacttgctccagtcatcattaaaatcatctagctacataaaactacccaaattacgacttgtaacaacatttcaaaaatccatattttctcaaggttac 16382404  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||| ||||    
T  16382403 tcgccatggcgagttgtctcactcgcgagtcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctacttgcgaggcgacgaatgaacttttgta 16382305  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16382304 cgggcagaatgcaggtttt 16382286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18718843 - 18718526
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  18718843 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcatctttttaatcta 18718744  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||| || || |||    
T  18718743 aaacttgctccagtcctctctaaaattatccaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaataatttgaaaacccagaatttctcacgggtac 18718644  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18718643 tcgccacggtgagttgtctcactcgcggggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 18718545  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18718544 cgggcagaatgcaggtttt 18718526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 30596660 - 30596264
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        
T  30596660 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggtttctcgccacggcgagttcgaggcgaactcgaggcgagtga 30596562  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||| | ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||     
T  30596561 aaatatggtgctatcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgcttcagtcctctc 30596462  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || ||||||||| |||||||||        
T  30596461 taaaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttaaactgggttactcgccacggcgagttggtct 30596362  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30596361 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 30596264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20377033 - 20376647
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||   | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||     
T  20377033 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaacatgttacttgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgcaaataaggta 20376934  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  20376933 ctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcatgaaaatcatt 20376834  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||| |||  |||||| ||  || ||  |||  ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || |||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  20376833 taggcacattaaactatccccaaaacatctt-taacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccatggcgagttggtctactcgcgagg 20376735  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20376734 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 20376647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 486 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 10597445 - 10597059
Alignment:
Q  486 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgc 585  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | || | ||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||| | | |||    
T  10597445 tcgcctcgcaagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttatttgccatggagagttcaaggagaactcaaggcgaacagaaaaaggctgc 10597346  T
Q  586 tctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatct 685  Q
    ||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||     
T  10597345 tctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctctagtcctctctaaaatcatcc 10597246  T
Q  686 aggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggc 785  Q
    ||| || | |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||| ||  | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  10597245 aggcactcaaaactaaccaaactacagcttataacaacaatttgaaaacccagaatttctcacaggtactcgccacgacgagttgtctcactcgcgaggc 10597146  T
Q  786 gagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||   ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10597145 gagctatgaagttgctcacttgccttggcgaacaa-ggctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtatgggcagaatgcaggtttt 10597059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 555 - 869
Target Start/End: Original strand, 12256050 - 12256363
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  12256050 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttaaattctaagctccctattcatctttttaatcta 12256149  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||  ||| || || |||    
T  12256150 aaacttgctccagtcctctctaaaatcatccaggtgcacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaacccagaaattctcacgggtac 12256249  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||   | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256250 tcgccacggcgagttgtctcactcgcggggcgagctatgaagttgctcactcgccttgacgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 12256348  T
Q  855 cgggcagaatgcagg 869  Q
    |||||||||||||||    
T  12256349 cgggcagaatgcagg 12256363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 46070911 - 46070515
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||        
T  46070911 actgggtagctcgcctcacgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggttactcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 46070813  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |    
T  46070812 aaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaaccccaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcat 46070713  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || ||||||||||| |||||||        
T  46070712 taaaatcatttaggcacattaaactatccacaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccatgacgagttggtct 46070613  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46070612 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 46070515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Original strand, 18961305 - 18961705
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa 571  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||     
T  18961305 aaatactggacaactcgcctcgcaagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggtgaactcgaggcgag 18961404  T
Q  572 cagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcct 671  Q
    |   ||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18961405 cgagaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcct 18961504  T
Q  672 cttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
    ||  |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||  | || ||||||| ||| ||||||  | |||  ||  || ||||||||| ||||||||||    
T  18961505 ctctaaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcatataacaacaatttgaaaatcatgttttatactgggttactcgccacggcgagttgt 18961604  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
        |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18961605 tctgctcgtgaggcgagccatgaagttactcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacctctgtacgggcagaaagcaggtt 18961703  T
Q  872 tt 873  Q
    ||    
T  18961704 tt 18961705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 54091527 - 54091140
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  54091527 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 54091429  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  54091428 actctcgggagttttgacatttttttcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcattaaaatcat 54091329  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||| ||| ||||||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||     ||||||||    
T  54091328 ttaggtacattaaactatcctcaaaacatcttataaccacaatttaaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtctgctcgcgag 54091229  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54091228 gcgagctatgaagttgctcactcgccttggtgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 54091140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16383097 - 16382742
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16383097 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 16382999  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  16382998 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 16382899  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||| ||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| || | ||||||||  ||| || |   ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  16382898 ctgtaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacacacaacccaacctatgcatttata-cgtatatgactcaccactccaatttacaactttc 16382800  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacca 378  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  16382799 atgtataacttaattaaataaaagcataca-tccagccagcatccattcatcacaacca 16382742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14652933 - 14652640
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14652933 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 14652835  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  14652834 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 14652735  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaac 316  Q
    || ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14652734 ctattatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgt-gtatatgactcaccactccaatttacaac 14652640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 11963951 - 11963565
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  11963951 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcgcaaaacaagttactcgcaatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 11963852  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  11963851 aatatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctcttt 11963752  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    | |||||| || | |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||   |  || ||||||||| | |||||||         
T  11963751 ataatcatttaaggacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttaaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacgacgagttggtctg 11963652  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963651 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11963565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 29551293 - 29551671
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   || |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||     
T  29551293 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaa-caggatgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaaaataagga 29551391  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  29551392 actctcgggagttttgaaatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcat 29551491  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || ||||||||| |||||||||     ||||||||    
T  29551492 ttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgaactgggttactcgccaaggcgagttggtctgctcgcgag 29551591  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29551592 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 29551671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 48774411 - 48774033
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||| | |    
T  48774411 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactacatgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaatttag 48774313  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  48774312 gtgctctcgggaaaa-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatcttttaaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatc 48774214  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatc-actcg 779  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || ||||  | |||| | ||||||||||||||||| |||  ||||    
T  48774213 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttg-atctgctcg 48774116  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48774115 cgaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatggatgctcgcgaggcaagcgatgaacttctgtacgggcagaa 48774033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 11956397 - 11956001
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||  || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  11956397 actgggtaggtcgcctcgcgagcacatatgctcgctatggcgagctcgcaaaacaagttactcgcaatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 11956298  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  11956297 aatatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctcttt 11956198  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
    | |||||  |||| |||  ||||||  |||||||||   |||| ||||||| |||||||||| || |||   |  || ||||||||| |||||||||       
T  11956197 ataatcacttaggcacattaaactatccccaaaata--tcttataacaacaatttaaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtc 11956100  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11956099 tgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcacttgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 11956001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 12724934 - 12724538
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  12724934 actgggaagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcgcaaaataggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 12724835  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||| |||||||  || |    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |     
T  12724834 aataaggtgctcccggaagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcatt 12724735  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| |||| || || ||||||| || |||   |  || |||||||||||||||||||         
T  12724734 aaaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacagcaattcaaaaatcaagttttgatctgggttactcgccatggcgagttggtctg 12724635  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12724634 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcaatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 12724538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13203756 - 13203514
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  13203756 caacttatcaccgctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataaa-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagca 13203658  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  13203657 ttcattttcaggacctaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 13203558  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13203557 ctgttatgcttatgcaactaacccacttgagtatatctacatac 13203514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 265
Target Start/End: Original strand, 12304763 - 12304949
Alignment:
Q  80 aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactcc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12304763 aaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctcc 12304862  T
Q  179 accactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  | | || ||||||||||||||    
T  12304863 accactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgactcacctgtgtatatctacatac 12304949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 32387819 - 32387432
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||        
T  32387819 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccacagcgagttcgaggcgaactcgaggcgagtga 32387721  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||||||||||||||  | |    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  32387720 aaatatggtgctctcagaagttttgacatttttctcactcaaacttcgattctaagctccttattcatctttttaatctaaaacttgccccagtcctctt 32387621  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||||| |  || | ||||||| |||||||||       
T  32387620 taaaatcatttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagtttttcaactgggttgctcgccacggcgagttggtc 32387521  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32387520 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 32387432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9771711 - 9771335
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  9771711 ctcgcctcgcgagcacatctactcgcgatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattaggtg 9771612  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||||    
T  9771611 ctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatcatc 9771513  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg-tatcactcgcgag 783  Q
    | |||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9771512 tgggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtatg-ctcgcgag 9771414  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9771413 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 9771335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18756716 - 18756339
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | | |||||||||| ||||           || ||||||||  ||||||||||    
T  18756716 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggttgctcgccatggtgagt-----------tcaaggcgaacgaaaatatggtg 18756628  T
Q  585 ctctgggga-aaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| ||||     ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18756627 ctctcgggagtttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcat 18756528  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||      |||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  18756527 ttaggtacattaaactaaccaaaatacagcttataacaacaatttgaaaatccagaatctcacttactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgag 18756428  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||   ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18756427 gcgagccatgaagttgctcacttgcgttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgatcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 18756339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 47121496 - 47121881
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  47121496 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 47121595  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | ||| || || |     
T  47121596 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagcttcctattaatctttttaacctaaaactttcaccaatcatcatt 47121694  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  47121695 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 47121794  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47121795 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 47121881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 47128864 - 47129249
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  47128864 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 47128963  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | ||| || || |     
T  47128964 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagcttcctattaatctttttaacctaaaactttcaccaatcatcatt 47129062  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  47129063 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 47129162  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129163 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 47129249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 50142569 - 50142184
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  50142569 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 50142470  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || |     
T  50142469 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcatt 50142371  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||  || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  50142370 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaattaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 50142271  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142270 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 50142184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Original strand, 17157079 - 17157262
Alignment:
Q  84 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  17157079 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 17157178  T
Q  182 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17157179 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 17157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 15374993 - 15375389
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||        
T  15374993 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcacaatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 15375091  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  15375092 aaagtaggtgctctcgggaattttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcat 15375191  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  | || ||||||| ||| |||||||||| ||||||      |||||||||||||||| ||       
T  15375192 taaaatcatttaggcacattaaactatccctaaaacatcctataacaacaatttgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttct 15375291  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||   |||| |||||||||||||  |||| ||  |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  15375292 actcgcgaggcgaaacatgatgttgttcactcgc-gaggcaagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 15375389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 16833591 - 16833966
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  16833591 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 16833689  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  16833690 actctcgggaatt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgcttcagtcatcattaaaatcat 16833788  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaac-attttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
     ||||  ||  |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||||| |||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||     |||||||    
T  16833789 ttagg--cattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaattttgaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcga 16833886  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16833887 ggcgagctatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgcgcagaa 16833966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 486 - 873
Target Start/End: Original strand, 49163525 - 49163911
Alignment:
Q  486 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   || |||||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    ||||| ||||    
T  49163525 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaacacacaaaa-caggttgctcgccatggcaagttcaaggcgaattcgaggcgagtgaaaataaggtg 49163623  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  49163624 ctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattttaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatt 49163723  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||  | || ||||||| ||| ||||||  | |||   |  || ||||||||| |||||||||     || ||||||    
T  49163724 taggtacattaaactaaccaaaatacatcatataacaacaatttgaaaatcatgttttaatctgggttactcgccacggcgagttggtctgctagcgagg 49163823  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49163824 cgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcataagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 49163911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 265
Target Start/End: Original strand, 24191783 - 24191963
Alignment:
Q  87 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccact 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||    
T  24191783 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgct 24191882  T
Q  185 ttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24191883 ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 24191963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 9532849 - 9533027
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9532849 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccacttt 9532948  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9532949 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 9533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 476 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 16331394 - 16331063
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga-acag 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |     
T  16331394 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaacaaggtactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 16331295  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||||| |||||||| |||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16331294 aaata-ggtgctctcgggaattttgaca-ttttctcactcaaacctcaattctaagctccctatacatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcat 16331197  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||        
T  16331196 taaaatcatttaggtacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaattgaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtct 16331097  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16331096 gctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc 16331063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 536 - 860
Target Start/End: Original strand, 28759278 - 28759600
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  28759278 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccc 28759376  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||  |||||||||||| | ||| || || | ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||     
T  28759377 tattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcattaaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatt 28759476  T
Q  736 cagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg 835  Q
     || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| |||||||||    
T  28759477 aagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgagg 28759575  T
Q  836 cgagcgatgaacttctgtacgggca 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28759576 cgagcgatgaacttctgtacgggca 28759600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41456325 - 41456123
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41456325 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41456226  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  41456225 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactatcccacctgtgtatatctaca 41456126  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  41456125 tac 41456123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 2498836 - 2498458
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  ||    
T  2498836 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaattagg 2498737  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  2498736 tgctctcgggaaaaatgccattttta-cactcaaaactcaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccactcatcattaaaatca 2498638  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  2498637 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgttctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 2498538  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2498537 ggcgagctatgatgttgctcactcgccgtggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 2498458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16414076 - 16413698
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  16414076 agctcgcctcgcgaacacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 16413977  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |  || || || | |||||||    
T  16413976 tgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttagcctaaaactttcatcattcatcattaaaatca 16413878  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||||||||||| || |||   |  || |||||||||||||||||||     |||||||    
T  16413877 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaactttttaaaaatcaagttttgatctgggttactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 16413778  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413777 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 16413698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3782546 - 3782166
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  3782546 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacggaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattag 3782447  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  ||    
T  3782446 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcctctttattat 3782348  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  3782347 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 3782249  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782248 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 3782166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16802626 - 16802425
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  16802626 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcatcaccgctcaacaccgcttt 16802528  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  || ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  16802527 gaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 16802428  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  16802427 tac 16802425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14544394 - 14544155
Alignment:
Q  42 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggaca 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  14544394 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 14544296  T
Q  138 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 235  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14544295 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 14544196  T
Q  236 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14544195 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8583471 - 8583294
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  8583471 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 8583373  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8583372 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 8583294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 14084531 - 14084708
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14084531 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14084629  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14084630 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14084708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 14089932 - 14090109
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14089932 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14090030  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14090031 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14090109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 534 - 863
Target Start/End: Original strand, 38743321 - 38743648
Alignment:
Q  534 tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctc 633  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  38743321 tacttgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagatgctctcgggaaaaatgatatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttc 38743419  T
Q  634 cctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaa 733  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||    
T  38743420 cctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttgaaaaa 38743519  T
Q  734 tccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc-actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcg 832  Q
    || || |||  ||  |  | ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||| |    
T  38743520 tcaagttttgaactggcttgctcgccacggcgagttg-atctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgtg 38743617  T
Q  833 aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38743618 aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 38743648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 43723864 - 43723478
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  43723864 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 43723765  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  43723764 aatcaggtactctcgggaaaaagtgaca-ttttctcactcaaactccaattctaagctctctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcat 43723666  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| |||| |||||  |  ||||  |  ||| ||||||||||||||||||| |     
T  43723665 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaac-ttttcaaaatttaagttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggac 43723567  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43723566 tgctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 43723478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24123380 - 24123203
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24123380 atgcacgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24123282  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24123281 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24123203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34852417 - 34852211
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  34852417 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttca 34852319  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  34852318 ggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatga 34852219  T
Q  231 ttatgcaa 238  Q
    ||||||||    
T  34852218 ttatgcaa 34852211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 49399473 - 49399650
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  49399473 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 49399571  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  49399572 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 49399650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 12363900 - 12364171
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||||| || || | ||| || |||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  12363900 atttttctccctaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaacctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 12363999  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||  | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||| |    
T  12364000 ccttattacaccttataacaacaatctgaaaatccaggttttctcataggtactcgccacggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagttatgaagttgct 12364099  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12364100 cacttgctaaggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 12364171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13969010 - 13968850
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13969010 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13968912  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13968911 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13968850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13974485 - 13974325
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13974485 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13974387  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13974386 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13974325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 29493905 - 29494290
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  29493905 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 29494004  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  29494005 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctcc-tattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatctt 29494102  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |  |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||| |  || ||||  |  |||| ||||||||||||||||||       
T  29494103 tattatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaatttaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttgggc 29494201  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29494202 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 29494290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 535 - 691
Target Start/End: Original strand, 14293170 - 14293326
Alignment:
Q  535 actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  14293170 actcgccatggcgagttcgaggctaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcaattctaagctcc 14293269  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtac 691  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14293270 ctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtac 14293326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 14292667 - 14292906
Alignment:
Q  31 catcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-- 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||      
T  14292667 catcaccactccactaagactcctctaacaacatccatacatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T
Q  127 tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 224  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  14292766 tttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 14292865  T
Q  225 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||  ||| |||||||||    
T  14292866 ttatgcttatgcaactgacccacttgtatatttctacatac 14292906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 17190836 - 17190992
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc--actacaccacttt 162  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||    
T  17190836 atgcatgtggtaccaaat-tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgatcaacaccgcttt 17190934  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  17190935 gaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 53571024 - 53570647
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||     
T  53571024 ctcgcctcgcgagctcatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggta 53570925  T
Q  585 ctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||| | ||| || || | ||||||||    
T  53570924 ctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctgttcatctttttaatccaaaactttcaccattcatcattaaaatcat 53570826  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    | ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     |||||||    
T  53570825 ccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 53570727  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53570726 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 53570647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16830230 - 16830055
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaa 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||| |||    
T  16830230 aacaactcatgcaactcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaa 16830133  T
Q  113 tggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttga 188  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16830132 tggttaaagcattcatttccaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttga 16830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 45612014 - 45612390
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    | ||    |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  |||     
T  45612014 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaataacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcaggta 45612113  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||||    
T  45612114 ctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctactcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatcatc 45612212  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      ||||||||||||||| |||||| |   || ||||||    
T  45612213 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggtgagttggactgcttgcgagg 45612312  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45612313 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 45612390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 21151227 - 21150902
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  21151227 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccc 21151129  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||| | ||||||| || | ||| || || | || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||    
T  21151128 tattcatctttttagcctaaaagttccaccattcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc 21151029  T
Q  736 cagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg 835  Q
     || |||      || ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||    
T  21151028 aagttttattatgggttactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggtgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgagg 21150930  T
Q  836 cgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21150929 cgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 21150902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 265
Target Start/End: Original strand, 23174189 - 23174358
Alignment:
Q  96 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||     
T  23174189 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattttt-tcaggacataagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgaca 23174287  T
Q  195 aagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23174288 aggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23174358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 54832950 - 54832625
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  54832950 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatctcatttctaagttccc 54832852  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||| || | ||||||| | ||| || || | ||||||||| ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||    
T  54832851 tattcatctttttaatccaaaactttcaccattcatcattaaaatcatccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc 54832752  T
Q  736 cagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgag 834  Q
     || |||| | | || ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||  | || ||||||||    
T  54832751 aag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgtcatggcgagcacag-ctgctcgcgag 54832654  T
Q  835 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54832653 gcgagcgatgaacttctgtatgggcagaa 54832625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 476 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 50655787 - 50655455
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  50655787 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacaccagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaaa 50655688  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  50655687 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaaactctctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcat 50655589  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| ||||||||||||||||||| |     
T  50655588 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttggac 50655490  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
      ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  50655489 tgctcgcgaggcgagtgatgaagtggctcactcgc 50655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 6927350 - 6927025
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  6927350 ctcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtgctctcgggaaaaatgtcatttt-cacactcaaagctcatttctaagttccc 6927252  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||| || ||||||||| | ||| || |||| |  |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||     
T  6927251 tattcatctttttaagctaaaacttccaccattcatctttattatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaat- 6927153  T
Q  736 cagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgag 834  Q
    || ||||| | |  ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  |  ||||||||||||    
T  6927152 cacatttttatctgggctactcgccatggtgagttggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccctggcgag-tacagctactcgcgag 6927054  T
Q  835 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6927053 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 6927025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 609 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 27034518 - 27034255
Alignment:
Q  609 tcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaat 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||  |||||| ||  ||     
T  27034518 tcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctcaagtcatcattaaaatcatttagatacattaaactatccccaaa 27034419  T
Q  709 acggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    ||  |||| |||||||  || |||||||||| ||||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  27034418 acatcttataacaacaaattgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagacatgatgttgctcactcgc 27034319  T
Q  809 taaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||  | || |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  27034318 -gaggcgagacagggattttcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 27034255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 500 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 9691223 - 9690916
Alignment:
Q  500 catctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaat 598  Q
    |||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||   |||||||| ||||    |    
T  9691223 catctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaagtaggtgctctcgggagtttt 9691125  T
Q  599 gatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaac 698  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||  ||||    
T  9691124 gacatttttctcactcaaactt-aattctaatctccctattcatctttttaacataaaacttgctccagtcatcattaaaatcatttaggtacattaaac 9691026  T
Q  699 tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    || ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||  |||| |||    
T  9691025 tatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagacatgatgtt 9690926  T
Q  799 gttcactcgc 808  Q
    | ||||||||    
T  9690925 gctcactcgc 9690916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 10768113 - 10768492
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    | ||  ||    
T  10768113 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagatcacaaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaacatcagg 10768212  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| || | ||| || || | || |||    
T  10768213 tgctctcgggaaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttagcctaaaaattccaccattcatcattaatatc 10768311  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    | ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| | ||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  10768312 acctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcagaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 10768411  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10768412 aggcgagttatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 10768492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14844958 - 14844578
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||       ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  14844958 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaatcctagctcaccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 14844859  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||| || || | |||||    
T  14844858 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctgaaacttccaccattcatcattaaaat 14844760  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| | |||||  |  || | |||||| ||||||||||||||  ||||    
T  14844759 catctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc-acattttgcctgggtttactcgcgatggcgagttgtattgctcg 14844661  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  14844660 cgaggcgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggacagaa 14844578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 863
Target Start/End: Original strand, 51246369 - 51246479
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51246369 tactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 51246467  T
Q  852 gtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||    
T  51246468 gtacgggcagaa 51246479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 10410950 - 10411328
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||| ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||    
T  10410950 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttcacagaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcagg 10411049  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||| || || | || |||    
T  10411050 tactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacccaaaacttccaccattcatcattaatatc 10411148  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||| |||   || | |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| | |||||  |  ||||  ||||||||||||||||| |   ||| |    
T  10411149 atctagataccttaatccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc-acattttt-ctgggcttgctcgccatggcgagttggactgctcac 10411246  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||   | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10411247 gaggcgagtgatgaagttgctcactcgcga-ggcgaagcacgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 10411328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 10382297 - 10382675
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||| ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||    
T  10382297 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttcacagaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcagg 10382396  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||| || || | || |||    
T  10382397 tactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacccaaaacttccaccattcatcattaatatc 10382495  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||| |||   || | |  |  || ||  |||| |||||| ||| |||||| || |||||     |  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  10382496 atctagataccttaatccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaat-cacatttttctgggattgctcgccatggcgagttggactgctcgcg 10382594  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||   | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10382595 aggcgagtgatgaagttgctcactcgcgaa-gcgaagcacgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 10382675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 691
Target Start/End: Original strand, 14298864 - 14298953
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtac 691  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14298864 atttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtac 14298953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 27029375 - 27029231
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||  ||||||     
T  27029375 atttttgtcactcaaacctcaattctaagctccttattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcatttagatacattaaactat 27029276  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcac 746  Q
    ||  || ||  |||| |||||||  || |||||||||| ||||||    
T  27029275 ccccaaaacatcttataacaacaaattgaaaatccagaatttcac 27029231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 776 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 17198523 - 17198437
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17198523 ctcgcgaggcgagctatgaagttgttcactcgccttggcgaacaa-ggctactcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 17198437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 776 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 53872147 - 53872061
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53872147 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 53872061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17199175 - 17199015
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 205  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  17199175 tcgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 17199076  T
Q  206 agccgaagctctcccactgt-tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  | || |||| ||||||||||||||    
T  17199075 agccgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatac 17199015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 555 - 689
Target Start/End: Original strand, 12255605 - 12255738
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| || ||     
T  12255605 ggcgaactcaaggcgaatgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttaaattctaagctccctattcatctttttaatct- 12255703  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggt 689  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12255704 aaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggt 12255738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961378
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccact 160  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||  |||| ||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgct 12961482  T
Q  161 ttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatcta 260  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| || || || ||||  |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  12961481 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagcccttccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 12961382  T
Q  261 cata 264  Q
    ||||    
T  12961381 cata 12961378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31690731 - 31690570
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| |||| |  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || ||||    
T  31690731 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttaaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcc 31690632  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  31690631 agagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 31690570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 35985389 - 35985485
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35985389 ctcgcggggcgagctatgaagttgttcactcgcga-ggtgagacaaggctacttgcggggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 35985485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Original strand, 14570476 - 14570595
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctg 852  Q
    |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||    ||||||||| | || ||||||||||| || |    
T  14570476 actcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgcga-ggcgagactaggctactcgtggggtgagcgatgaacatcag 14570574  T
Q  853 tacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14570575 tacgggcagaatgcaggtttt 14570595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 785 - 873
Target Start/End: Original strand, 16410337 - 16410424
Alignment:
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16410337 cgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgacgaatgaacttctgtacgggcagaatgcaagtttt 16410424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17243815 - 17243680
Alignment:
Q  107 gtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 204  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| |  | ||| |    
T  17243815 gtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttcta 17243716  T
Q  205 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 240  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  17243715 gggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 17243680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 791 - 863
Target Start/End: Original strand, 51477519 - 51477590
Alignment:
Q  791 atgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51477519 atgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 51477590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 265
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173963
Alignment:
Q  178 caccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23173963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 12537205 - 12537109
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | | ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12537205 ctcgggaggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgag-actagctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 12537109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 13054595 - 13054691
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg-cgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13054595 ctcgcggggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcgggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 13054691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 15954659 - 15954489
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaac-agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacct 653  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  15954659 ggcgaactcaaggcgaatgagaaaaatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatct 15954560  T
Q  654 aaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaaca 724  Q
    |||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || | |||||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  15954559 aaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaaaactaaccaatatacaccttataacaaca 15954489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 11305419 - 11305251
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  11305419 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccaggcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 11305320  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    ||| |||||  |||| ||||||| || ||||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  11305319 ccataatacaacttataacaacaattcaaaaatcaagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttg 11305251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 826 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16331068 - 16331021
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16331068 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 16331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15011685 - 15011599
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||  | ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15011685 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactccagaaatgggttactcgctatggcgagtaagaggcgaac 15011599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Original strand, 19443448 - 19443674
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcagga 135  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||  ||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||    
T  19443448 actccactaagactcctcta------catgcatgtggtaccataa--cagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcagga 19443539  T
Q  136 cataagtcctcaccact--acaccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctc-ccactgttatgtt 231  Q
    ||| |||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || |||||| || ||||| ||| || || ||||| |    
T  19443540 catgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaatgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctcaccgcttttatgct 19443639  T
Q  232 tatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  19443640 tatgcaactgactccgcttgtgtatatctacatac 19443674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 826 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 24283876 - 24283830
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24283876 actcgcgaggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggttt 24283830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 822 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 17198012 - 17197971
Alignment:
Q  822 ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17198012 ggctactcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 17197971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18719339 - 18719227
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcagga 135  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  18719339 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcagga 18719241  T
Q  136 cataagtcctcacc 149  Q
    ||| ||||||||||    
T  18719240 catgagtcctcacc 18719227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24284186 - 24284012
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||           ||||| | ||||    
T  24284186 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgtcgaactcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac----------gagaaaaagggtg 24284097  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  24284096 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgccccagtc 24284012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 826 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 50655460 - 50655423
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50655460 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 50655423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14288797 - 14288757
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14288797 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 14288757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Original strand, 23173755 - 23173869
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  23173755 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggt-gtaaccctcacctctgtcgaatggttaaagcattctttttca 23173852  T
Q  133 ggacataagtcctcacc 149  Q
    |||||||||||||||||    
T  23173853 ggacataagtcctcacc 23173869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 559
Target Start/End: Original strand, 14570210 - 14570293
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcga 559  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  | ||||||| |||||||||  |||||||    
T  14570210 actgggcaactcgcttcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctccaagaatgggttactcgctatggcgagtacgaggcga 14570293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 18889009 - 18889143
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaa-ctagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||   |||  |||||| ||||||||||| | || |||||    
T  18889009 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcatcactgaacaccgctttgaacaataaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcca 18889108  T
Q  205 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 239  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || ||||||    
T  18889109 gggccgaagccctcccgcttttatgcttgtgcaac 18889143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 519
Target Start/End: Original strand, 28759248 - 28759291
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28759248 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 28759291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 11889155 - 11889251
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||| || |||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  11889155 ctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgc-gaggcgag-actagctactcgccggggcgagcgatgaatgtcagcacgggcagaatgcagatttt 11889251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 13036633 - 13036547
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| ||||    
T  13036633 atttttctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttagg 13036547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16823577 - 16823491
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaa 560  Q
    |||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  16823577 atactgggcaactcgcctcgtgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaagaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaa 16823491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 18900048 - 18900209
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 204  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||  |||  |||  ||||||  |||||||||| | || |||||    
T  18900048 tcgaatggttaaagcatttttttcaggacataagtcctcacctctaaacatcgctttgaacaacaaagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttcca 18900147  T
Q  205 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||    
T  18900148 gggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatac 18900209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 1464972 - 1464931
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1464972 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgctatggcgag 1464931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Original strand, 12255238 - 12255326
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  12255238 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgct-ttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 12255326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 498
Target Start/End: Original strand, 16348977 - 16349025
Alignment:
Q  449 caacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagc 498  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16348977 caacaacagaaatca-accaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagc 16349025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16823284 - 16823189
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| || |  ||||||||||  ||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16823284 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcaag-acaggctactcgccgggcgagcaatgaacatcagtatgggcagaatgcaggtttt 16823189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 2269910 - 2269742
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||   ||||||     
T  2269910 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtacttaaaactat 2269811  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    |||   ||| ||||  ||||||| || ||||||| || || || ||  | |||||||||||||||||||    
T  2269810 ccattttacagcttttaacaacaattcaaaaatcaagtttctctcacaggtactcgccatggcgagttg 2269742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 575 - 771
Target Start/End: Original strand, 13692428 - 13692624
Alignment:
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||     
T  13692428 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagacctctc 13692527  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
     ||||||||||| | || | |||||| |||   |||  |||| ||||||| || ||||| |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  13692528 taaaatcatctaagcactcaaaactatccatcttacaccttataacaacaattcaaaaaacatgattttctcacaggtactcgccatggcgagttgt 13692624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 15934722 - 15934650
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcga 548  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  15934722 actgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactcaaggaatgggttactcgccgtggcga 15934650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 525
Target Start/End: Original strand, 17496535 - 17496586
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17496535 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcactatggcgagctcagg 17496586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 27029478 - 27029443
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27029478 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttca 27029443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30099798 - 30099767
Alignment:
Q  832 gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30099798 gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 30099767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Original strand, 12153382 - 12153468
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||  |||||||||||||    
T  12153382 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatctagg 12153468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Original strand, 12274783 - 12274869
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  12274783 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccatattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctagg 12274869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 21151248 - 21151214
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21151248 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 21151214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11850840 - 11850780
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 126  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11850840 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 11850780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 11964587 - 11964498
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtac 691  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11964587 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctcaaaaatcatctaggtac 11964498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 15471504 - 15471545
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15471504 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 15471545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 15954727 - 15954674
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaat 529  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  15954727 actgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactcaaggaat 15954674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16382674 - 16382626
Alignment:
Q  449 caacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagc 498  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16382674 caacaacagaaatca-accaacaaaatactgggcagcccgcctcgcgagc 16382626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 22109818 - 22109777
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22109818 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 22109777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 22791878 - 22791919
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22791878 ctcgcgaggcgagcaatgaagttgctcactcgctatggcgag 22791919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 828 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 27029178 - 27029133
Alignment:
Q  828 tcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  27029178 tcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 27029133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Original strand, 31943556 - 31943645
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| |||||||| || | || ||||||||||||||| ||| | || | ||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  31943556 tccaccgctttgaacaacaaggcgttccagagccgaagccctctcgctttcatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 31943645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 639; Significance: 0; HSPs: 106)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 9273394 - 9272553
Alignment:
Q  31 catcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273394 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 9273295  T
Q  131 caggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273294 cagaacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 9273195  T
Q  230 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagtgaatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  9273194 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-tatatgattcaccatccaacttacaacatttaagtaaatt 9273096  T
Q  330 tt-aattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaatt 428  Q
    || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273095 tttaattaaatacaacatacatt-cagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatctagggaaa-tatatatcaacatacaagccatgcttaatt 9272998  T
Q  429 caacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggga 527  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9272997 caacaagataaaccatccaa-caacaacagaa-tcaaaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagctcaggaa 9272900  T
Q  528 a-tcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattc 626  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9272899 aatcaggcactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcaggaaaaatgatatttttttcactcaaacctcaattc 9272800  T
Q  627 taagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatt 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | | |||||||||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9272799 taagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctctaggcatccttataatcatctaggtacatagtactacccaaattacggcttataacaacatt 9272700  T
Q  727 ttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggcta 826  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9272699 ttaaaaatccagattttcccaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggcta 9272600  T
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9272599 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 9272553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18681745 - 18680899
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681745 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 18681646  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681645 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 18681546  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  18681545 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 18681448  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18681447 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacatccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 18681351  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18681350 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 18681252  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18681251 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaa-tgacatttttctcactcaaacc 18681153  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18681152 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 18681053  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18681052 caactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagta 18680953  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18680952 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 18680899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 31568054 - 31567207
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31568054 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 31567955  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31567954 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 31567855  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  31567854 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctatataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 31567757  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31567756 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcaacatacaagccatg 31567660  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31567659 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 31567561  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31567560 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaacgacatttttctcactcaaacc 31567461  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31567460 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacgcgaaactacccaaaatacggcttataa 31567361  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31567360 caactttttcaaaatccagattttcacaaggatactcgccatggcgagctgtatcactcgcggggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagta 31567261  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31567260 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggtttt 31567207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 31573275 - 31572428
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573275 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 31573176  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573175 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 31573076  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  31573075 tgttatgttaatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 31572978  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31572977 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacgtccagggaaa-tatatatcaacatacaagccatg 31572881  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31572880 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 31572782  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31572781 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 31572682  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31572681 tcaattctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacgcgaaactacccaaaatacggcttataa 31572582  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31572581 catctttttcaaaatccagattttcacaaggatactcgccatggcgagctgtatcactcgcggggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagta 31572482  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31572481 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggtttt 31572428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 1804718 - 1803884
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804718 aacaacaaatgcaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 1804619  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804618 gttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 1804519  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |    
T  1804518 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccattcaacttgc 1804420  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    |||  |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  1804419 aac-attaaggaaattttaattaaatacaacattca-ttcaatcagcatctattcatcacaaccaaccaatacatcca-ggaaaatatatatcagcacac 1804323  T
Q  414 aagccatgc-ttaattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgct 511  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||                  
T  1804322 aagccatgcaataattcaacaaaataaaccatccaaacaacaacagcaatca-accaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgag-------------- 1804238  T
Q  512 atggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctca 611  Q
            |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1804237 --------ctcaggaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctca 1804146  T
Q  612 ctcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacg 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1804145 ctcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccacaatacg 1804046  T
Q  712 gcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaa 811  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1804045 gcttataacaacattttcaaaatctagatttttacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttggtcactcgctat 1803946  T
Q  812 ggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803945 ggcgagcaatgactactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 1803884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 623
Target Start/End: Original strand, 36799334 - 36799929
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799334 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 36799433  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799434 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 36799533  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  36799534 tgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaac-gtta 36799631  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || ||| ||||||||| |||||||| || |||||  |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||  |||| || ||||||  |||||| |||||    
T  36799632 ag-gaa-tttaattaagtacaacattca-ttcagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacatcca-agaaagtacatatcagtatacaatccatg 36799727  T
Q  422 c-ttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36799728 caataattcaacaaattaaaccatccaaacaacgacagaaatca-accaaccaaa-actgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 36799825  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36799826 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 36799925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 873
Target Start/End: Original strand, 22177538 - 22178392
Alignment:
Q  19 acacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggt 116  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  22177538 acacatgccactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggt 22177636  T
Q  117 taaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  22177637 taaagcattcattttcaggacataagtcttcaccactaacaccactttgagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagc 22177736  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttac 313  Q
    ||||||||| || || |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22177737 tctcccacttttttgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaaccaaacctatgcatatatatg-tatatgactcaccactccaaattac 22177835  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacat 411  Q
    ||| || | ||     ||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||| | |||||||    ||| |||||||  |||   || | ||  ||    
T  22177836 aacattcatgtatgacttaattaaataaaagcatacattccagcgagcatcaattctttacaaccaatttagaacatccagataaa---tacaccattat 22177932  T
Q  412 acaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 510  Q
    |  ||||||||||||| || ||| |||||||| |||  |||||| | ||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22177933 aatagccatgcttaat-catcaagataaatcaaccat-caacaacataaatcaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgcgagcacatgtgctcgc 22178029  T
Q  511 tatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttct 609  Q
    ||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||    
T  22178030 tatggcgagctcagaaaa-caggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggagctctcgggagttttgacatttttct 22178128  T
Q  610 cactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaata 709  Q
    |||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||| |||||||||||    
T  22178129 cactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcatttaggtactgaaaagtacccaaaata 22178228  T
Q  710 cggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 809  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  22178229 cggcttataacaacactttaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgcc 22178328  T
Q  810 aaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178329 tttgcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 22178392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 22055678 - 22056523
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22055678 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 22055776  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  22055777 ttcattttcaggacctaaatcctcaccactaacaccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 22055876  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||  |||| ||  ||||| |||||||||| |  ||     
T  22055877 ctgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctacatac-aaccaacctatgcataaatatg-tataggacacaccactccaatttaccatattc 22055974  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcca 419  Q
    | ||  |  |||||||| || |||||||||  |||| |||||  ||||||  ||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  22055975 aggtataacttaattaattaaaacatacatc-cagccagcatacattcattgcaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcca 22056070  T
Q  420 tgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||   | |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22056071 tgcttaa-tcaacaagataaatcaacc-gtccacaacagaaatcaatccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 22056168  T
Q  519 gctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaac 618  Q
    |||| || ||  ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    ||| |||||||||| | || |    
T  22056169 gctccggaaacaagacactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgttctcgggagttttgacatttttctcattaaatc 22056268  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||| || | ||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  22056269 atcaattctaagttccctattcatcttttttatctaaaaattacaccagtcctctctaaaatcatttaggtacataaaactacccaaaatgcggcttata 22056368  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||    
T  22056369 acaacacttcaaaaatccagtttttctcaaaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagc 22056468  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22056469 aaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttccgtacgggcagaatgcaggtttt 22056523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 22050160 - 22051005
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22050160 caactcatcaccattccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 22050258  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  22050259 ttcattttcaggacctaagtcctcaccactaacaccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctccca 22050358  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||  |||| ||  ||||| |||||||||| |  ||     
T  22050359 ctgttatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctacatac-aaccaacctatgcataaatatg-tataggacacaccactccaatttaccatattc 22050456  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcca 419  Q
    | ||  |  |||||||| || |||||||||  |||| |||||  ||| ||  ||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  22050457 aggtataacttaattaattaaaacatacatc-cagccagcatacattgattgcaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcca 22050552  T
Q  420 tgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22050553 tgcttaat-caacaagataaatcaaccatcca-caacagaaatcaatccaacaaaatactgggcagctcgcctcgtgagcacatctgctcgctatggcga 22050650  T
Q  519 gctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaac 618  Q
    |||| || ||  ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || |    
T  22050651 gctccggaaacaagacactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatc 22050750  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  22050751 atcaattctaagttccctattcatctttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcttttaggtacataaaactacccaaaatgcggcttata 22050850  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    |||||| || | |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  22050851 acaacacttcagaaatccagtttttctcaaaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcaaggcgagccatgaagttgctcactcgctttggcgagc 22050950  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050951 aaaggctactcgctaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 22051005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22063345 - 22062957
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||| | ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22063345 ctcgcctcgcgagtactcctactcgctatggcgaactcaagaaaaggggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtg 22063246  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  22063245 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattataagctccctattcatctttttaatccaaaacttgctctagtcctctctaaaatcatc 22063146  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22063145 taggtacataaaactaaccaaattacggcttataacaacactttgaaaatccagtttttctcacatgtactcaccatggcgagttgtctcactcgcgagg 22063046  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22063045 cgagccatgaagttgctcactcgctatggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaaaatgcaggtttt 22062957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 535 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22025292 - 22024954
Alignment:
Q  535 actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    ||| | |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22025292 actcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgataatatggtgctctcgggagttttgacaattttctcactaaatcatcaattctaagctcc 22025193  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaat 734  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  22025192 ctattcatctttttaatccaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacttaaaactaaccaaattacggcttataacaacactttggaaat 22025093  T
Q  735 ccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgag 834  Q
    |||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  22025092 ccagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgctatggcgagcaaaggctactcacgag 22024993  T
Q  835 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22024992 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 22024954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 31412273 - 31411877
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||   |    
T  31412273 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgagttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggtgaatgaa 31412174  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||      
T  31412173 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctctagtcctctct 31412074  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| || | ||  | ||||||||| ||||||| ||        
T  31412073 aaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacagcttataacagcaatttaaaaatccagaattcctcacaggtactcgccacggcgagtggttctg 31411974  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31411973 ctcgctaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggttactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 31411877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 31418455 - 31418059
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||  |    
T  31418455 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgtgttactcgacatggcgaactcgaggcgaactcgaggcgaacgaa 31418356  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||      
T  31418355 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctctagtcctctct 31418256  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| || | ||  | |||||||||   ||||| ||        
T  31418255 aaaatcatgtaggtacattaaactaaccaaaatacagcttataacaacaatttgaaaatccagaattcctcataggtactcgccacaacgagtggttctg 31418156  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31418155 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggatactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaatgcagatttt 31418059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14746274 - 14745896
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  14746274 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaacacttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 14746175  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  14746174 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatca 14746076  T
Q  683 tctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||   ||||  | |||||||||   |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||    
T  14746075 tctaggtaccttaaaccatccccaaaata--tcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgc 14745978  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745977 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggccagcgatgaacttctgtacgggcagaa 14745896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 11392369 - 11391973
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  11392369 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 11392271  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||      
T  11392270 aaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattataagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccagtcatcac 11392171  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||| |||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||      || ||||||||| |||||||||        
T  11392170 taaattcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttaaaaatccagttttgatttgggttactcgccacggcgagttggtct 11392071  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11392070 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 11391973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 478 - 873
Target Start/End: Original strand, 43687757 - 43688150
Alignment:
Q  478 tgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaa 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||     |    
T  43687757 tgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-cagattactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaga 43687855  T
Q  577 atatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaa 676  Q
    |||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| || | |    
T  43687856 atatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttactctaaaacttgctccagtcatcatca 43687955  T
Q  677 aaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    ||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| || |||||||  | |||  ||  || | ||||||| |||||||||     |    
T  43687956 aaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaattcaaaaatcacg-tttcaactgggttgctcgccacggcgagttggtctgc 43688054  T
Q  777 tcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43688055 tcgcgaggcgagccatgaagttactcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaagctggtttt 43688150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9205113 - 9204728
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  9205113 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 9205014  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || |     
T  9205013 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcatt 9204915  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||  || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  9204914 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaattaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 9204815  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9204814 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 9204728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26485776 - 26485398
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  26485776 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaatcacaagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 26485677  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| || | |  ||||    
T  26485676 tgctctcggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgtttcagtcttcattattatca 26485578  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  26485577 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 26485478  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26485477 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-gactactcgcgaggcgagcaatgaacttctgtacgggcagaa 26485398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 471 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14416343 - 14415941
Alignment:
Q  471 aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14416343 aaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgttttctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcga 14416244  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
        |||   |||||||| || |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  14416243 gtgaaaagtaggtgctctcggtagttttgatatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctcaagtca 14416144  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaac-attttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagtt 769  Q
    || | |||||||| ||||||||  |||||| ||   | ||  |||| |||||| |||| |||||||||| |||   |  || |||||||||  |||||||    
T  14416143 tcattaaaatcatttaggtacattaaactatcccctaaacatcttataacaacaatttaaaaaatccagttttgatctgggttactcgccacagcgagtt 14416044  T
Q  770 gtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 869  Q
    |     |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14416043 ggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcacttgccatggcgag-aaaggccattcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacagg 14415945  T
Q  870 tttt 873  Q
    ||||    
T  14415944 tttt 14415941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16266624 - 16266236
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   |||| || |    
T  16266624 agctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaacttgaggcgagt-gaaaaatag 16266526  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  16266525 gtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactccaacttctatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 16266427  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| ||  ||   |  ||||| ||||||||||||||||     ||||||    
T  16266426 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagtgttgatctgggctaatcgccatggcgagttggtctgctcgcg 16266327  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16266326 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcaaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 16266236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 19296886 - 19297283
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||   |  ||    
T  19296886 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgagggcgagtga 19296985  T
Q  576 aatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    || || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  19296986 aaaataggtgctctcgggaattatgacatttttctcactcagacctcaagtctaagctccctattcatctttttaacctaaaatttgctccagtcatcat 19297085  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| || | |||  |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||||  ||||||| || ||||||       
T  19297086 taaaatcatttatgcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccacggtgagttggtc 19297184  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19297185 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 19297283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 6588443 - 6588821
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||   |||| || |    
T  6588443 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagt-gaaaaatag 6588541  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  6588542 gtgctctcgggaaaaataacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 6588640  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     |||||    
T  6588641 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgc 6588739  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588740 gaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 6588821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 12303567 - 12303955
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||  | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  12303567 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacgaaaccacttgctcgccatggcgagctcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 12303665  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||    
T  12303666 gtggtctcgggaaaaaagacatttt-ctcactcaaacctcgatatcaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatc 12303764  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||||  ||||||| |||||||||     ||||     
T  12303765 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccacggcgagttggtctgctcgt 12303863  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12303864 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaaag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 12303955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 1264560 - 1264830
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  1264560 atttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgcaccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactat 1264659  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| ||| |  |||| ||||||| | ||||||||  | ||| | ||  | ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  1264660 ccataattcatcttataacaacaatctaaaaatcatgttttgctcacaggtactcgccacggcgagtggtcttactcgcgaggcgagacatgaagttgtt 1264759  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1264760 cactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatacaggtttt 1264830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 851836 - 852216
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  851836 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 851935  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  851936 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccttattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattat 852034  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  852035 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 852133  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  852134 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 852216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 10956438 - 10956063
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||  ||||    
T  10956438 ctcgcctcgcgagcacaactactcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaatgaaaatcaggtg 10956339  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||||     
T  10956338 ctctcgggaaaaatgacattt--ctcacttaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatcatt 10956241  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| ||| || ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  10956240 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacgacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgagg 10956141  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10956140 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaa 10956063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27909350 - 27908970
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||     || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||      
T  27909350 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcaccaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatca 27909251  T
Q  581 ggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||    
T  27909250 ggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaa 27909152  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    ||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| |||| |||||| || |||   |  ||||||| |||||||||||||| |   ||||    
T  27909151 tcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaac-ttttcaaaatcaagttttaatctgggctacttgccatggcgagttggactgctcg 27909053  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909052 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 27908970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27955769 - 27955389
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||     || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||      
T  27955769 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcaccaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatca 27955670  T
Q  581 ggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||    
T  27955669 ggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaa 27955571  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    ||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| |||| |||||| || |||   |  ||||||| |||||||||||||| |   ||||    
T  27955570 tcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaac-ttttcaaaatcaagttttaatctgggctacttgccatggcgagttggactgctcg 27955472  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27955471 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 27955389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14736574 - 14736198
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  14736574 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtg 14736475  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| || | || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||||    
T  14736474 ctctggggaaaaatgccatttt-ctcactccaatcccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcgtcattaatatcatc 14736376  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  14736375 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcgagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgagg 14736276  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14736275 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 14736198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 29328571 - 29328957
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    ||||| |||    
T  29328571 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagtgaaaataaggt 29328669  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  29328670 actctcgggagtt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgcttcagtcatcattaaaatcat 29328768  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||      |||||||||| ||||||||    || |||||    
T  29328769 ttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatgacgagttgttctgcttgcgag 29328868  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||    
T  29328869 gcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaagtcaggtttt 29328957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 10948356 - 10947981
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||  ||||    
T  10948356 ctcgcctcgcgagcacaactactcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaatgaaaatcaggtg 10948257  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||||     
T  10948256 ctctcgggaaaaatgacattt--ctcactcaaatcctaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatcatt 10948159  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| ||| || ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  10948158 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacgacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgagg 10948059  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10948058 cgagctatgaagttgctcactcgccatggtgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaa 10947981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 44476236 - 44476414
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44476236 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44476335  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44476336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44476414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 44479498 - 44479676
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44479498 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44479597  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44479598 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44479676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 4520487 - 4520107
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  4520487 tagctcgcctcgcgagcacatcagctcgccatggtgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 4520388  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    || |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||| || || | |||||    
T  4520387 gtactctcgggaaaaagtgacatttc-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaagacttccaccattcatcattaaaat 4520289  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  4520288 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgc 4520189  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520188 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 4520107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 237935 - 237556
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  237935 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 237836  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  237835 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccttattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattat 237737  T
Q  681 catctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||||||||   |||| |  ||||||| |    ||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||    
T  237736 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacat---ttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactgct 237641  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237640 cgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 800443 - 800822
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  800443 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 800542  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  800543 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccttattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattat 800641  T
Q  681 catctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||||||||   |||| |  ||||||| |    ||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||    
T  800642 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacat---ttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactgct 800737  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800738 cgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 800822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 480 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 29298838 - 29298446
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |  || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||    
T  29298838 ggtagctcgcctcgcgagcacatcttctcgcgatggtgagctc-gcaaaacaggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaatgaaaat 29298740  T
Q  579 atggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaa 678  Q
    |||| ||||| ||||    |||  |||| |||||| |||| ||| || |  | |||||  ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  29298739 atggggctctcgggagttttgaccttttactcactaaaacttcatttttgtgttccctgttcatctttttaatctaaaacttactccactcctctctaaa 29298640  T
Q  679 atcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    ||||| ||||||||  |||| | || ||| |   |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || ||||||| |  |||||||||    |||    
T  29298639 atcatttaggtacattaaaccatcccaaaaatatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttatactgggttactcgcgacagcgagttgttctgctc 29298540  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29298539 gcgagccgagccatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 29298446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 214319 - 214698
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  214319 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 214418  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  214419 gtgctctcgtgaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccttattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattat 214517  T
Q  681 catctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||||||||   |||| |  ||||||| |    ||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||    
T  214518 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacat---ttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactgct 214613  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214614 cgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 214698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 727942 - 728321
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  727942 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 728041  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  728042 gtgctctcgtgaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccttattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattat 728140  T
Q  681 catctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||||||||   |||| |  ||||||| |    ||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||    
T  728141 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacat---ttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactgct 728236  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  728237 cgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 728321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 807793 - 807414
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |    
T  807793 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcag 807694  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  807693 gtgctctcgtgaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccttattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattat 807595  T
Q  681 catctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||||||||   |||| |  ||||||| |    ||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||    
T  807594 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacat---ttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactgct 807499  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807498 cgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 807414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22025791 - 22025559
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcag 133  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||    
T  22025791 actcctctaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcag 22025693  T
Q  134 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 231  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22025692 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgct 22025593  T
Q  232 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  22025592 tatgcaactgacccacttgtctatatctacatac 22025559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 23825124 - 23825301
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  23825124 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23825222  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23825223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 23825301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 14765965 - 14766341
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    |||   |||     
T  14765965 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaaacaggta 14766064  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||| ||    
T  14766065 ctctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatcctc 14766163  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  14766164 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttggactactcgcgag 14766262  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14766263 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 14766341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16887051 - 16886675
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  16887051 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtg 16886952  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||||    
T  16886951 ctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatcttttgaacctaaaactttcaccattcatcattaatatcatc 16886853  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| |   || | |||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  16886852 taggtaccataaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttaatgtgggtgactcgccatggcgagttggactgctcgcgag 16886754  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16886753 gcgagttatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 16886675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 17053597 - 17053799
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17053597 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgccgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 17053696  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  17053697 gaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 17053796  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  17053797 tac 17053799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19903105 - 19902928
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19903105 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19903006  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  19903005 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccact-tgatatttatgcaacta 19902928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 23865434 - 23865611
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23865434 atgcatgtggtaccataatccagggccatgacccacaccgctgtcaaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccgctccacaccgcttt 23865533  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23865534 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 23865611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 25409554 - 25409731
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  25409554 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcatcaccgctccacaccgcttt 25409652  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25409653 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 25409731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30767126 - 30766925
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30767126 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcataaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30767028  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctac 261  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||  | || ||||||||||    
T  30767027 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactactcaacctgtgtatatctac 30766929  T
Q  262 atac 265  Q
    ||||    
T  30766928 atac 30766925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 27890259 - 27890645
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  27890259 ctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 27890357  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  27890358 actctcgggagttttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatcgt 27890456  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||||| |   || ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||       |||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  27890457 ttaggcacattaaactatcaccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatctagaatttcattcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgag 27890556  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  27890557 gcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 27890645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22063794 - 22063562
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcag 133  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||    
T  22063794 actcctctaagactcctctaacaacacccatgcatttagtaccataa-tcagggtcgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcag 22063696  T
Q  134 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 231  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22063695 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccggagccgaagctctcccacttttatgct 22063596  T
Q  232 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22063595 tatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22063562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14057784 - 14057583
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  14057784 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 14057686  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  14057685 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatttaca 14057586  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  14057585 tac 14057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 25701377 - 25700982
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||   | |  | | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  25701377 actgggtagctcgcctcgtgagctcatctgctcgctatggcgagttcacaaagttggttgctcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 25701278  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||   |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| || |     
T  25701277 aagtaggtgctctcgggaatt-tgacatttttctcgctcaaacctcaattttaagctccctagtcatatttttaacctaaaacttgctcgagtcatcatt 25701179  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| || ||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||         
T  25701178 aaaatcatttaggtacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaagatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtctg 25701079  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||  |||  | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||    
T  25701078 ctcgcgaggcgagccatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacaccagtacgggcagaaaacaggtttt 25700982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 27902498 - 27902884
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  27902498 ctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 27902596  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| |||     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  27902597 actctcgggtgttttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatcgt 27902695  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||||| |   || ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||       |||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  27902696 ttaggcacattaaactatcaccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatctagaatttcattcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgag 27902795  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  27902796 gcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 27902884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 27948917 - 27949303
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  27948917 ctcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 27949015  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| |||     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||| |    
T  27949016 actctcgggtgttttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatcgt 27949114  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||||| |   || ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||       |||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  27949115 ttaggcacattaaactatcaccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatctagaatttcattcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgag 27949214  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  27949215 gcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 27949303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 639 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29305229 - 29305006
Alignment:
Q  639 tcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccag 738  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||  |||| | || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  29305229 tcatctttttaatctaaaacttactccactcctctctaaaatcatttaggtacattaaaccatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaag 29305130  T
Q  739 attttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcga 838  Q
     |||  ||  || ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29305129 ttttgtactgggttactcgccacggcgagttgttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcga 29305031  T
Q  839 gcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29305030 gcgatgaacttctgtacgggcagaa 29305006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 40144050 - 40143839
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac----tcgaggcgaacagaaat 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||    ||||    
T  40144050 agctcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaacgaactcgaggcgagtgaaaat 40143951  T
Q  579 atggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaa 678  Q
      |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| || | ||     
T  40143950 taggtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctagaacttgttccagtcatcattaat 40143852  T
Q  679 atcatctaggtac 691  Q
    |||||||||||||    
T  40143851 atcatctaggtac 40143839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 604 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 19987839 - 19987570
Alignment:
Q  604 ttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccc 703  Q
    |||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||| ||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   |||||| ||    
T  19987839 ttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcaactttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactatcc 19987740  T
Q  704 aaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttca 803  Q
    | | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19987739 atattacaccttataacaacaatatgaaaatccaggttttctcacaggtactcgccacggcgacttgtcttgctcgcgaggcgagctatgaagttgctca 19987640  T
Q  804 ctcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19987639 ctcgctaaggcgagcacaggctactcacgagacgagcgatgaacttctgtacgggcagcatgcatgtttt 19987570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 27346088 - 27346294
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  27346088 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgtgttcaca-aaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 27346185  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  27346186 gtgctctcgggaaaaatgacatttc-ctcactcaaacctcaatactaagctccccattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 27346284  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||||||||||    
T  27346285 atctaggtac 27346294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 493 - 873
Target Start/End: Original strand, 27896600 - 27896978
Alignment:
Q  493 gcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| ||| |||| ||    
T  27896600 gcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggtactctcgg 27896698  T
Q  592 gaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtac 691  Q
    |     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||| ||    
T  27896699 gtgttttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatcgtttaggcac 27896797  T
Q  692 acgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcga 791  Q
    |  |||||| |   || ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||       |||||||||||||||| ||    |||||||||||||  |    
T  27896798 attaaactatcaccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatctagaatttcattcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagaca 27896897  T
Q  792 tgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| |||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  27896898 tgatgttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 27896978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 28981094 - 28981480
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||     || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  28981094 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccgtggcgagttcacggaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 28981193  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||    
T  28981194 aaatcaggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatct 28981292  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttg 770  Q
    | |  |||||||||||||   ||||  | |||||||||   ||| | ||||| ||| ||||||| || ||||  |  ||| |||||||||||||||||||    
T  28981293 ttattatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaata--tctt-atacaacttttcaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttg 28981388  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |   |||||||||||||   ||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28981389 gactgctcgcgaggcgagtagtgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 28981480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 28986314 - 28986700
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||     || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  28986314 actgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccgtggcgagttcacggaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 28986413  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||    
T  28986414 aaatcaggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatct 28986512  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttg 770  Q
    | |  |||||||||||||   ||||  | |||||||||   ||| | ||||| ||| ||||||| || ||||  |  ||| |||||||||||||||||||    
T  28986513 ttattatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaata--tctt-atacaacttttcaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttg 28986608  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |   |||||||||||||   ||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28986609 gactgctcgcgaggcgagtagtgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 28986700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 23117574 - 23117781
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  23117574 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcataaaatcactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 23117673  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | |  ||||    
T  23117674 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactccaacttctatactaagctccctattcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattattatca 23117772  T
Q  683 tctaggtac 691  Q
    |||||||||    
T  23117773 tctaggtac 23117781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 485 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 23224501 - 23224139
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |  ||    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||  || |    
T  23224501 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaagacactagctcgccaaggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagggg 23224402  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||| || || |   |||||||    
T  23224401 ctctcgggaaaaatgccatttt-ctcattcaaatcccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaaccttcaccattcatcattttaatcatc 23224303  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  23224302 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgagg 23224203  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaactt 849  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23224202 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaactt 23224139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3224437 - 3224061
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||   |||| || |||    
T  3224437 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaacaacttgctcgccatggcgagttcaatgcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 3224339  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||| || | || |||||    
T  3224338 gctctcggaaaaaatgacatttt-ctcactccaacttctatactaagctccctaatcatctttttatcctgaaaattgttccagtcttcattaatatcat 3224240  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  3224239 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 3224140  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||| | ||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3224139 gcgagtgttgatgttgttcaatcgcga-ggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 3224061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Original strand, 1051066 - 1051393
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||    
T  1051066 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaaaaatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcacacaaactccaattctaagttcc 1051164  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatttta-aaaa 733  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| | ||||    
T  1051165 ctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcagaaaa 1051264  T
Q  734 tccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcg 832  Q
    || || ||||  |  |||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||| |||    
T  1051265 tcaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttgggctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctacttgcg 1051362  T
Q  833 aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1051363 aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 1051393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20973497 - 20973400
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20973497 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgctatggggagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttgtgtacgggcagaatgcaggtttt 20973400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 485 - 808
Target Start/End: Original strand, 19859930 - 19860255
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||   ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  19859930 ctcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaacacaggaaaaagggtcactcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgaacagaaaaagggt 19860029  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||||  |||    | | |||||||||||  || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  |||||| |||  ||||||||    
T  19860030 gctctctggagtgttaacatttttctcacaaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctcaaatttgtcccagtcttctctaaaatcat 19860129  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
     |||| || | |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||      ||||||||||||||||| || |  |||||||    
T  19860130 ataggcacccaaaactaaccaaattacagcttataacaacatttcaaaaatcaggatctctcaggcacttactcgccatggcgagtggttttgctcgcga 19860229  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19860230 ggcgagccatgaagttgttcactcgc 19860255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12913744 - 12913631
Alignment:
Q  749 ggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaact 848  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||     
T  12913744 ggctactcgccatggcgagttggattgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgaacgatgaacc 12913646  T
Q  849 tctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||    
T  12913645 tctgtacgggcagaa 12913631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Original strand, 25110911 - 25111043
Alignment:
Q  135 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25110911 acataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 25111010  T
Q  233 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25111011 atgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 25111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41009658 - 41009433
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  41009658 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 41009565  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  41009564 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 41009465  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  41009464 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 41009433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 240
Target Start/End: Original strand, 18609793 - 18609969
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18609793 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 18609891  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 240  Q
    ||  |||||||  |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  18609892 gaacaactagtgttccaccgctttcaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 18609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21327047 - 21326822
Alignment:
Q  40 tccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggac 136  Q
    |||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  21327047 tccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggac 21326954  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| ||||| || ||||| || | ||||||||    
T  21326953 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttat 21326854  T
Q  235 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21326853 gcaactaaatccacttgtgtatatctacatac 21326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 775 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23224162 - 23224075
Alignment:
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224162 actcgcgaggcgagcgatgaacttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 23224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 35541423 - 35541629
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||    
T  35541423 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcaca-aaccactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggaaatcagg 35541521  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| || | ||| || || | || ||||    
T  35541522 tgctctcgggaaaaatg-tcattttctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttagcctaaaaattccaccattcatcattaatatca 35541620  T
Q  683 tctaggtac 691  Q
    |||||||||    
T  35541621 tctaggtac 35541629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 475 - 873
Target Start/End: Original strand, 22744115 - 22744503
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||           ||    
T  22744115 tactgggcaactcgcctcacgagcacatctgctcgctatggcgagctcaagaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaacg----------ag 22744204  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||| | |||||||| ||||    ||| |||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||     
T  22744205 aaaaagggtgctctcgggagttttgacatttttctcaataaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctctc 22744304  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||| |||| ||| || | |||||| | ||| |||  |||| ||||||| |||| |||||  ||| | ||||      |||||||||||||||| ||      
T  22744305 taaaaacatccaggcactcaaaactaacgaaattacaccttataacaacaatttagaaatcatgatctctcactctctaactcgccatggcgagtggttc 22744404  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22744405 tgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcattcgc-aaggcgaggca-ggctactcgccggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggttt 22744502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 21668901 - 21669059
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  21668901 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21669000  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |  | |||| |||||| |||||||    
T  21669001 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgactcacttgtgtatatatacatac 21669059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 21282101 - 21282261
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||| |||  |||| ||||||  ||| |||  ||||||  |||||||||| | |  |||||    
T  21282101 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcgtcaccgctatacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttcca 21282200  T
Q  205 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21282201 gagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 21282261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 33089406 - 33089677
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| ||   || |||     
T  33089406 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatccaggcacttaaagctaa 33089505  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgt 800  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||| || |||||||      |||||||||||||||| ||     ||||||||| ||| |||||| |||     
T  33089506 ccaaattacaccttataacaacaatttaaaaatcaaggttttcactcactaactcgccatggcgagtggttctgttcgcgaggcaagccatgaagattgc 33089605  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33089606 tcactcgc-aaggcgag-acaggctactcgccggggcaagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 33089677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322234
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccac 159  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  |||| |    
T  21322439 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21322341  T
Q  160 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 258  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| || |||||  | ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21322340 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 21322241  T
Q  259 tacatac 265  Q
    |||||||    
T  21322240 tacatac 21322234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14594399 - 14594128
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  14594399 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 14594300  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || | |||| ||||   | ||||| ||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||    
T  14594299 ccaaaatacggcttataacaacaattcaaaaatcacga-tctcac-aggcacatgctcgctatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagtt 14594202  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||  || | |||| |||||||||||||||    
T  14594201 gctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaatctcagcacggacagaatgcaggtttt 14594128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 21683338 - 21683205
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  21683338 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 21683239  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| || |||||||    
T  21683238 ccaaaatgcagcttataacaacaattcaaaaatc 21683205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 21687687 - 21687554
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  21687687 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 21687588  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| || |||||||    
T  21687587 ccaaaatgcagcttataacaacaattcaaaaatc 21687554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 823 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 7003488 - 7003448
Alignment:
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7003488 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 7003448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20011879 - 20011493
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   | |||||||| ||||||||  | ||||||  ||||             
T  20011879 actgggcaactcgcctcccgagcacatctgcttgctatggcgaactcagggaaagtgttactcgccgtggcgagtacggggcgaa--cgag--------- 20011791  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    || | |||||||| ||||    |||  ||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||      
T  20011790 aaaaaggtgctctcgggagttttgacgtttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgacccagtcctctct 20011691  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |||| |||| ||| || | |||||| ||||  |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||     ||||||| ||||||||| ||       
T  20011690 aaaaacatccaggcactcaaaactatccaacttacaccttataacaacaatttaaaaatcatgatctctcactcacttactcgctatggcgagtggttct 20011591  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |   ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  20011590 gctcgcgaggcgagctatgaagttgttaactcgc-gaggcgag-ataagctactcgctgagacgagcgatgaaggtctgtacgggcagaaagcaggtttt 20011493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 10606904 - 10607136
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagga 135  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||    
T  10606904 ctccactaagacccttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcagga 10607002  T
Q  136 cataagtcctcaccact--acaccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | ||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||  ||| ||||| || ||||| ||    
T  10607003 cataagtcctcaccgctaaacaccgcgttgaacaacaaggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgctt 10607102  T
Q  233 atgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  10607103 atgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 10607136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 29305384 - 29305342
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29305384 ggtagctcgcctcgcgagcacatcttctcgctatggcgagctc 29305342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 25624311 - 25624041
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||||| || |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||  ||| || | ||||||     
T  25624311 atttttctccctaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacattcaggcactcaaaactaa 25624212  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgt 800  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| ||||||| || || || ||||      ||||||||| | |||| ||    |||||||||||||| || ||| ||||    
T  25624211 ccaaattacaccttataacaacaatttaaaa-tcaaggttctcactcactaactcgccatagtgagtggttctgctcgcgaggcgagccataaagattgt 25624113  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25624112 tcactcgcga-ggcgagata-ggctactcgtcggggcgagcgatgaatatctgtacgggcagaatgcaggtttt 25624041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 27346379 - 27346415
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27346379 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 27346415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14594517 - 14594466
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14594517 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcagg 14594466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20974228 - 20974118
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagga 135  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||    
T  20974228 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcagga 20974130  T
Q  136 cataagtcctca 147  Q
    ||||||||||||    
T  20974129 cataagtcctca 20974118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20005390 - 20005340
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20005390 tactgggcaacttgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcaagctcagg 20005340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 43112566 - 43112699
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacct-aaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaacta 700  Q
    |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||  ||||||||||  | || |||||||| || | |||| |    
T  43112566 atttttcttactaaatcctcatttctaagctccctaatcctctttttgatctaaaaacttg-accagtcctctccataaacatctaggcactcaaaacca 43112664  T
Q  701 cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
     |||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43112665 tccaacatacgacctaaaacaacattttaaaaatc 43112699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20005207 - 20005088
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    |||||||||||||||| ||    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  | |||||||||| | || ||||||||||| ||     
T  20005207 actcgccatggcgagtggttctgctcgcgaagcgagccatgaagttgctcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgccggggtgagcgatgaacatca 20005110  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20005109 gtacgggcagaatgcaagtttt 20005088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 20006763 - 20006896
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  20006763 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactat 20006862  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||  | |||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  20006863 ccttattacaccttataacaacaatttaaaaatc 20006896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 21690080 - 21689947
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  21690080 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 21689981  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  21689980 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatc 21689947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 22175711 - 22175666
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatctttt 647  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175711 atttttctcactaaatcttcaattctaagctccctaatcatctttt 22175666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 824 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 40143757 - 40143708
Alignment:
Q  824 ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40143757 ctacacgcgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 40143708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 35541714 - 35541750
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35541714 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgagcagaa 35541750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 551
Target Start/End: Original strand, 20006648 - 20006723
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagtt 551  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| |  | |||||||| |||||||||    
T  20006648 actgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactcaaggatttggttactcgccgtggcgagtt 20006723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 21690200 - 21690149
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21690200 aaatactgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactca 21690149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31412688 - 31412606
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 148  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31412688 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcac 31412606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31418870 - 31418788
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac 148  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31418870 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcac 31418788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 5610179 - 5610138
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5610179 ctcgcgaggcgagcaatgaagttgctcactcgctatggcgag 5610138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 21286801 - 21286842
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21286801 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 21286842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25624428 - 25624379
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25624428 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatttgctcgctatggcgagctca 25624379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 637; Significance: 0; HSPs: 106)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17271503 - 17270647
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17271503 aacaacatatgcaacccatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatg 17271404  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  17271403 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaag 17271304  T
Q  214 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17271303 ctctcccactgtgatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatctaa-catatactta-tatatgattcaccatccaatttac 17271206  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17271205 aacatttaagtgaattttaattaaatacaacatacatt-cagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatccagggaaa-tatatatcaacatac 17271108  T
Q  414 aagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17271107 aagccatgcttaattcaacaatataaatcatccaaacaacaacagaaatcaaaccaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 17271008  T
Q  513 tggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcac 612  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17271007 tggcgagctcaggaaatcaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcac 17270908  T
Q  613 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacgg 712  Q
    | || |  | ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||| |||||    
T  17270907 taaatcaaccattctaagctccctagttaactttttaacctaaaacttgctccagtcatccttataatcatctaggtacatagtactacccaaattacgg 17270808  T
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 812  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17270807 cttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccacggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 17270708  T
Q  813 gcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17270707 gcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 17270647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17265021 - 17264165
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17265021 aacaacatatgcaacccatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 17264922  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  17264921 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaag 17264822  T
Q  214 ctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17264821 ctctcccactgtgatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatctaa-catatactta-tatatgattcaccatccaatttac 17264724  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17264723 aacatttaagtgaattttaattaaatacaacatacatt-cagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatccagggaaa-tatatatcaacatac 17264626  T
Q  414 aagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17264625 aagccatgcttaattcaacaatataaatcatccaaacaacaacagaaatcaaaccaacaaaatacttggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 17264526  T
Q  513 tggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcac 612  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17264525 tgtcgagctcaggaaatcaggtactcgccatggcgagttcgaggcgaactctaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcac 17264426  T
Q  613 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacgg 712  Q
    | || |  | ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||| |||||    
T  17264425 taaatcaaccattctaagctccctagttaactttttaacctaaaacttgctccagtcatccttataatcatctaggtacatagtactacccaaattacgg 17264326  T
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 812  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17264325 cttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccacggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 17264226  T
Q  813 gcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17264225 gcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 17264165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 603; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21678492 - 21677638
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678492 aacaacaaatgcaacttatcaccactccactaagactcctctaat-acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 21678394  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678393 gttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 21678294  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  21678293 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttac 21678195  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    |||  ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21678194 aac-gttaag-gaa-tttaattaaatacaacattca-ttcagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacatccaggg-aaatatatatcagcatac 21678100  T
Q  414 aagccatgc-ttaattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaac-aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 510  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21678099 aagccatgcaataattcaacaaaataaaccacccagacaacaacagaaatca-acaaacaaaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgc 21678001  T
Q  511 tatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctc 610  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21678000 tatggcgagctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctc 21677901  T
Q  611 actcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatac 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677900 actcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatac 21677801  T
Q  711 ggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgcta 810  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677800 ggcttataacaacatttccaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgcta 21677701  T
Q  811 aggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677700 tggcgagcaatggctactcgcggggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 21677638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Original strand, 22174964 - 22175812
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174964 aacaacatatgcaacccatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 22175063  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22175064 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctaaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaag 22175163  T
Q  214 ctctcccactgttatg-tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaattta 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22175164 ctctcccactgttatgttttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaactta 22175261  T
Q  313 caacttttaagtgaa-ttttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaa-atatatatcaaca 410  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22175262 caacgtttaagtaaatttttaattaaatacaacataca-ttcagtcagcatctattcatcacaaccaaccaggacatccaggaaaatatacatatcaaca 22175360  T
Q  411 tacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcg 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22175361 tacaagtcatgcttaattcaacaatataaaccatccaaacaacaacagaagtca-accaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcg 22175459  T
Q  510 ctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttct 609  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22175460 ctatggcgagctcaggaaatcaggtactcgccatggcgagt-----------tcgaggcgaacaggaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttct 22175548  T
Q  610 cactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaata 709  Q
    |||| || |  | ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||| ||    
T  22175549 cactaaatcaaccattctaagctcccaagttatctttttaacctaaaacttgctccagtcatccttataatcatctaggtacatagtactacccaaatta 22175648  T
Q  710 cggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 809  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175649 cggcttataacaacattttaaaaatccagattttcacaagggtactcgccatggtgagttgtctcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 22175748  T
Q  810 aaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22175749 atggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagatttt 22175812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 873
Target Start/End: Original strand, 9775467 - 9776278
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9775467 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 9775565  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  9775566 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 9775665  T
Q  264 accaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaac-atacatttcagctagca 361  Q
    || | || |||||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||| || | || ||  |||||||| || ||  ||||||  |||| ||||    
T  9775666 acaatcccacctaagcatatatgta-tatatgactcaccactccaatttacaacattcatgtaaaacttaattaattaaaagtatacatc-cagccagca 9775763  T
Q  362 tctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaat 455  Q
    || ||||||||    ||||||    ||| ||||||| ||||   || | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||  ||||||     
T  9775764 tccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgcttaat-caacaaggtaaatcaaccat-caacaac 9775858  T
Q  456 agaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggag 555  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  9775859 agaagtcaaaccaacaaaattctgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaataaggtactcgccatggcgagttcgag 9775958  T
Q  556 gcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775959 gcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 9776058  T
Q  656 aacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatttt--aaaaatccagattttcacaaggcta 753  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9776059 aacttgctccagtcatccttataatcatctaggtacatagtactacccaaattacggcttataacaacattttaaaaaaatccagattttcacaaggcta 9776158  T
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9776159 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgctatggcgagcataggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 9776258  T
Q  854 acgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9776259 acgggcagaatgcaggtttt 9776278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 20937553 - 20938399
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20937553 caactcatcaccaccccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagca 20937651  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||| |  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  20937652 ttcattttcaagacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagccgaagctctccc 20937751  T
Q  221 actgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttt 319  Q
    ||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||| ||||||| | ||    
T  20937752 acttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatatg-tatatgactcaccactccgatttacatcatt 20937850  T
Q  320 taagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagc 417  Q
    || ||  |  ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| ||||    
T  20937851 tatgtataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagc 20937946  T
Q  418 catgcttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 516  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| |    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20937947 catgcttaat-catcaaaataaatcaactgt-caacaacagaaatcaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 20938043  T
Q  517 gagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactca 615  Q
    ||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||    ||| |||||||||||| |    
T  20938044 gagctcag--aaacaggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgagacgaacgaaaatatggtgttctcgggagttttgacatttttctcactaa 20938141  T
Q  616 aacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctt 715  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20938142 atcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggctt 20938241  T
Q  716 aaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcg 815  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||    
T  20938242 ataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcg 20938341  T
Q  816 agcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20938342 agcaaaggctactctcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 20938399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22312604 - 22312204
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22312604 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctactgcctatggcgagctcagaaaa-caggacactcgccatggcga-ttccaggcgaactcgaggcga 22312507  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22312506 acaaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaattcaacaattctaagctccctattcatcttttaaatctaaaacttgctccagtcc 22312407  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    | |  ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||    
T  22312406 tgtctaaaattatctaggtacataaaactacccacaatacggcttataacaacactttaaaaattcagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttg 22312307  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22312306 tctcactcgcgaggtgagccatgaagtttctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 22312207  T
Q  871 ttt 873  Q
    |||    
T  22312206 ttt 22312204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18941008 - 18940612
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    |    
T  18941008 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcgaactcacaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcaagtgaa 18940909  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||| |||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  18940908 aataaggtgctcttgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagccctctct 18940809  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||| || |||  ||  || ||||||||| ||||||||||        
T  18940808 aaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcttataacaacattttgaaaatcaagttttaaactgggttactcgccacggcgagttgttctg 18940709  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18940708 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcaaaaaacaggtttt 18940612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 471 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 758076 - 757674
Alignment:
Q  471 aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  758076 aaaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaagggaactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcga 757977  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
    ||||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| || ||||||  | |||||| |||| |||||||    
T  757976 acagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcctcatttctaagtttcctattcttctttttgatctaaaaattgcaccagtcc 757877  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    |||  | |||||| |||  || | |||||| | | | | |  |||| ||||||| || |||||||||| ||| |  |  | |||||||||||||| |||     
T  757876 tctctagaatcatttagacactcaaaactatctatatttcaccttataacaacacttcaaaaatccagttttcctaacaggtactcgccatggcgggtta 757777  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  757776 tctcactcgcgcggcgagccatgaagttgctcactcaccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggt 757677  T
Q  871 ttt 873  Q
    |||    
T  757676 ttt 757674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 39608667 - 39608270
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  39608667 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 39608568  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||      
T  39608567 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctctagtcctctct 39608468  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||  ||  || ||||||||| |||||||||         
T  39608467 aaaatcatttaggtacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttaaaaatcaagttttatactgggttactcgccacggcgagttggtctg 39608368  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  39608367 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacagacagaaaacaggtttt 39608270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22500219 - 22499948
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||| |||| | ||| |||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  22500219 atttttctcactaaatcctcatttccaagttccccattcaactttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactac 22500120  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22500119 ccaaaatacggcttataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgct 22500020  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22500019 cactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtttt 22499948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 27635629 - 27635252
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg-t 583  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||           || ||||||||||||| | || |    
T  27635629 ctcgcctcgcgaacatatctgctcgctatggcgaactcaggaaacgggttactcgccgtggcgagt-----------tcaaggcgaacagaaaaaaggct 27635541  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  27635540 gctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaatttgctccagtcctctctaaaatcat 27635441  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||| | | |||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27635440 ttaggtacactaaactaaccaatttacggcttataacaacaatctgaaaatccagaattcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgag 27635341  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27635340 gcgagccatgaagttgctcactcaccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaatgcaggtttt 27635252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 758468 - 758216
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  758468 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 758370  T
Q  124 ttctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  758369 ttcatttcaggacgtaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac 758270  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  758269 tgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 25420185 - 25420571
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   || |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |     
T  25420185 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaaatcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaa 25420283  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25420284 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcgtctttttaatctaaaacttgctccagtcctctt 25420383  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||| ||| |||| |||  |||||| |||||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || ||||||||| |||||||||        
T  25420384 taaaaccatttaggcacattaaactatccaaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtct 25420483  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25420484 gctcgcgaggcgagttatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 25420571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 18566913 - 18567301
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  18566913 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 18567012  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  18567013 tgctctcgagaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatca 18567111  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      ||||||||||||||||||||||     ||| |||    
T  18567112 tctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatttgggctactcgccatggcgagttggtctgctcacga 18567211  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18567212 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 18567301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22509386 - 22509094
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacac-ccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcat 124  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22509386 caactcatcaccactcaactaagactcctctaacaacaccatgcatgtggtaccaaaa-tcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcat 22509288  T
Q  125 tc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  22509287 tcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccac 22509188  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaac 316  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22509187 tgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatatatgt-gtatatgactcaccactccaatttacaac 22509094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23544647 - 23544269
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||   | | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23544647 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgaagtcataaaacgggttgctcgccatggcaagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaaaatatggtg 23544548  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  23544547 ctctcgggagttttaaaatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatt 23544448  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  | |||   |  || ||||||||| | |||||||     |||||||||    
T  23544447 taggtacgttaaactaaccaaaatacatcttataacaacaatttaaaaatcatgttttaatctgggttactcgccacgacgagttggtctgctcgcgagg 23544348  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23544347 cgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 23544269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 24057959 - 24058355
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||  | | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  | |    
T  24057959 actgggcaactcgcctcgcgagcacatttgctcgctatggcgaactcataaaataggctgctcgccatggcgagttcaaggcgaacttgaggcgagtaaa 24058058  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||||||||||||     
T  24058059 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcgtctttttagtctaaaacttgctccagtcctcttt 24058158  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || ||||||||| |||||||||         
T  24058159 aaaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtgtg 24058258  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24058259 ctcgggaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaacacaggtttt 24058355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37805492 - 37805292
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37805492 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 37805394  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  37805393 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 37805294  T
Q  264 ac 265  Q
    ||    
T  37805293 ac 37805292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 20990666 - 20991061
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  20990666 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaataggttactcgtcatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 20990765  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||| |||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |     
T  20990766 aata-ggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcatt 20990864  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||      |||||||||||||||| ||        
T  20990865 aaaatcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttatagcaacaatttgaaaatccagtttttcactcactaactcgccatggcgagtggttctg 20990964  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||||||||  |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  20990965 ctcgcgaggcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgagacatgaatactcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaattcaggtttt 20991061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22313046 - 22312793
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22313046 caactcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 22312948  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  22312947 ttcattttcaggacataagtcctcaccactgacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctccca 22312848  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    || ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22312847 cttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22312793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 33536417 - 33536795
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  33536417 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgacgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 33536516  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  33536517 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaaaatca 33536615  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatc-actcgc 780  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||| |||||| |||  |||||    
T  33536616 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggtgagttg-atctgctcgc 33536713  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33536714 gaggggagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatggatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 33536795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Original strand, 597594 - 597975
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaa 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || | || | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    |||    
T  597594 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcac--aaactggctgctcgccatggcgagttcaaggtgaactcgaggcgagtgaaaa 597691  T
Q  578 tatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||    
T  597692 ttaggtgctctcgggaaaaaagacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcattattaa 597790  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    ||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||  || ||||  | |||| | |||||||||||||||||    ||    
T  597791 aatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaattaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctac 597889  T
Q  777 tcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597890 tcgcgaggcgagcgatgaagtcgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 597975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 488 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23076074 - 23075699
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  23076074 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcataaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaaaataaggtgctc 23075975  T
Q  588 tggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctag 687  Q
    | ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23075974 tcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcattcag 23075875  T
Q  688 gtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcga 787  Q
    | |||  ||| || || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || |||||||||  | ||||||     ||||||||||||    
T  23075874 gcacattaaattatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttcaactgggttactcgccacagagagttggtctgctcgcgaggcga 23075775  T
Q  788 gcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    || ||||||||| | ||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23075774 gctatgaagttgcttactcgccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 23075699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 11995462 - 11995842
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  11995462 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 11995561  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  11995562 gtgctctcgggaaaaagtgacattttcc-cactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 11995660  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  11995661 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgc 11995760  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995761 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11995842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 20340862 - 20341238
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |||    
T  20340862 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 20340960  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | || |||||    
T  20340961 gctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactccaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattaatatcat 20341059  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  20341060 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 20341159  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20341160 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20341238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 26650766 - 26651152
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  26650766 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc-gcaaaacaggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 26650864  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  26650865 aaatatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcgt 26650964  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| || |          ||||||||| || |||||||  | |||  ||  || | ||||||| |||||||||        
T  26650965 taaaatcatttaggcacattaaactatccca----------aaaacaacaattcaaaaatcatgttttcaactgggttgctcgccacggcgagttggtct 26651054  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26651055 gctcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 26651152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 26922351 - 26922737
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  26922351 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc-gcaaaacaggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 26922449  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  26922450 aaatatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcgt 26922549  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| || |          ||||||||| || |||||||  | |||  ||  || | ||||||| |||||||||        
T  26922550 taaaatcatttaggcacattaaactatccca----------aaaacaacaattcaaaaatcatgttttcaactgggttgctcgccacggcgagttggtct 26922639  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26922640 gctcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 26922737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 20347466 - 20347842
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||  |  | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||   |||| || |||    
T  20347466 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgcgttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 20347564  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | || |||||    
T  20347565 gctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactccaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattaatatcat 20347663  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  20347664 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 20347763  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347764 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20347842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22248025 - 22247644
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  22248025 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacagaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 22247926  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    || |||| |||||||| ||| ||||  | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  22247925 gtactctcgggaaaaagtgacatttccc-cactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 22247827  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||  ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22247826 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaaatcaggttttaatctgggctactcgccatggcgagttggatcgctcg 22247727  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247726 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 22247644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24800168 - 24799788
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  24800168 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 24800069  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    |||| || |||||||| ||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  24800068 gtgcactcgggaaaaagtgacatttt-ctcactccaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccaatcatcattaaaat 24799970  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| ||  ||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  24799969 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagtgttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgc 24799870  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24799869 gaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 24799788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 19510999 - 19511177
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19510999 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19511098  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19511099 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 19511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 19508491 - 19508867
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    ||||  ||||    
T  19508491 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaacttgaggcaagtgaaaatcaggtg 19508590  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||||    
T  19508591 ctctcgggaaagatgacatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatcatc 19508689  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||| |||||||     |||||||||    
T  19508690 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatgacgagttggtctgctcgcgagg 19508789  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508790 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctacccgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 19508867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 22379847 - 22380233
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  22379847 actgggtagctcgcctcacgagcacatctgctcgctacggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 22379945  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||    
T  22379946 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaacttgttccagtcctttt 22380045  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
      ||||||| |||| |||  |||| | || ||| ||  | || ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || ||||||||| |||||||||        
T  22380046 ttaaatcatttaggcacattaaaccatcccaaaaacatcctataacaacaatttgaaaatcaagttttgaactgggttactcgccacggcgagttggtct 22380145  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22380146 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaa 22380233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 22501300 - 22501678
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  22501300 agctcgcctcgtgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 22501398  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  22501399 gtgctctcggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 22501497  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||| || || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     |||||    
T  22501498 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaagtcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgc 22501596  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501597 gaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 22501678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 17938668 - 17938289
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  17938668 tagctcgcctcgcgagcacatcagctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 17938569  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    || |||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||| || || | ||||||    
T  17938568 gtactctcgggaaaagtgacatttc-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaagacttccaccattcatcattaaaatc 17938470  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  17938469 atctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgcg 17938370  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938369 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 17938289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 29746379 - 29746172
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||  ||    
T  29746379 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactacatgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaatgaaaattagg 29746280  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| || | |||||||    
T  29746279 tgctctcgggaaaa-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgtttcagtcatcattaaaatca 29746181  T
Q  683 tctaggtac 691  Q
    |||||||||    
T  29746180 tctaggtac 29746172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5338137 - 5337761
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || |||||  |||||||||||||||| |||||||       | |||       
T  5338137 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcgaggcga-------gtgaa--- 5338049  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
     |||||| |||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  5338048 -aatatgatgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgccccagtcctctt 5337950  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttc-acaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| || |||| ||| |||||| || ||||| ||  || | ||||||| |||||||||       
T  5337949 taaaatcatttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataaaaacaatttgaaaatcaagtttttcaactgggttgctcgccacggcgagttggtc 5337850  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5337849 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttagcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 5337761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19800130 - 19799748
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||   ||||     
T  19800130 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgactgctcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagt-gaaaa 19800032  T
Q  579 atgg-tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| || | ||    
T  19800031 atagatgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatcctaagctccctattcatccttttaccctaaaacttgctccagtcatcattaa 19799933  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    |||||| |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || ||||  | |||| | ||||||| | |||||||     |    
T  19799932 aatcatttaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccacgacgagttggtctgc 19799834  T
Q  777 tcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19799833 tcgcgaggcgagctatgaagttgctcacttgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagtgatgaacttctgtacgggcagaa 19799748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 22507881 - 22508259
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  22507881 agctcgccttgcgagcacatctgctcgttatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 22507979  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  22507980 gttctctcggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 22508078  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     |||||    
T  22508079 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgc 22508177  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22508178 gaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 22508259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 476 - 860
Target Start/End: Original strand, 38014051 - 38014434
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  38014051 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaaa 38014150  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  38014151 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcgccattcatcat 38014249  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| ||||||||||||||||||| |     
T  38014250 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttggac 38014348  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 860  Q
      ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38014349 tgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 38014434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14614743 - 14614357
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  14614743 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 14614644  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  14614643 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatatt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcgtcat 14614545  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtat 773  Q
     || ||| |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | ||||| |||||||||||||||||| |     
T  14614544 taatatcctctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttggac 14614446  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14614445 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 14614357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 5454812 - 5455190
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  5454812 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 5454911  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| || ||| |||  ||||| |||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||||    
T  5454912 tgctctcggaaaacatgcaatttt-ctcactcaaatcccaattctaagtttcctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatca 5455010  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  5455011 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcga 5455110  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5455111 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 5455190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16774835 - 16774461
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||   | | ||||||||||||||||  ||||||       | ||| ||     
T  16774835 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggtgagctcacgaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcga-------gtgaaaagt 16774743  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |    |||||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || || |     
T  16774742 a----ggtgctcttgggaattttgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgctccattcatcatt 16774648  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| || | |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||         
T  16774647 aaaatcatttatgcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttaaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtctg 16774548  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16774547 ctcgcgaggtgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctacttgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 16774461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 23527448 - 23527651
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23527448 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 23527547  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcaactaatccccttgagtatatctac 261  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || | || ||||||||||    
T  23527548 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctac 23527647  T
Q  262 atac 265  Q
    ||||    
T  23527648 atac 23527651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 24008375 - 24008754
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  24008375 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgctatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 24008474  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||   |  |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |  ||||    
T  24008475 tgctctcgggaaaaaatgtcattttctcactcaaatcccatttctaagttctctaatcatcttttaaacctaaaacttccaccattcatctttattatca 24008574  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||   |||||  |  ||||||||||| |||||||||| |   |||||||    
T  24008575 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcacaattttatctgggctactcgccttggcgagttggactgctcgcga 24008674  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24008675 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaa 24008754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22439902 - 22439701
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  22439902 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 22439804  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  | |||| ||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  22439803 gaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 22439704  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  22439703 tac 22439701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 40010756 - 40010380
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  40010756 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtg 40010657  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||||    
T  40010656 ctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattataagttccctattcatcttttgaacctaaaactttcaccattcatcattaatatcatc 40010558  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  40010557 taggtaccataaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgagg 40010458  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40010457 cgagctatgaagttgctcactcgacatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 40010380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 7773440 - 7773044
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||        
T  7773440 actgggtagctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 7773342  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| || |    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |    
T  7773341 aaagtaggtgctctcggaagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccatgttcatctttttatcctaaaacttgctccagtcatcat 7773242  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||      |||||||||||||||| ||       
T  7773241 taaaatcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaattcagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttct 7773142  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||  |||| |||| ||||||||  |||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||    
T  7773141 gctcgcgaggcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcaagacatgaatactcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacagccagaattcaggtttt 7773044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 15461797 - 15462172
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    ||||  || |    
T  15461797 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaa-cagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgaaaatcaggag 15461895  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| || |||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||||    
T  15461896 ctctcggaaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctactcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatcatc 15461994  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  15461995 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgagg 15462094  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462095 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 15462172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 10686467 - 10686845
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  10686467 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 10686566  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  10686567 tgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatctcatttctaagttccttattcatctttttaaactaaaacttccaccattcatcattaatatca 10686665  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    | |||||||   |||| | ||  || || ||||| |||||| ||| ||||||| | | ||| | |  ||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  10686666 tttaggtaccttaaaccatccccaaaacagcttataacaacttttcaaaaatc-acactttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcg 10686764  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10686765 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaa 10686845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22237520 - 22237249
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| ||   |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  22237520 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattatcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 22237421  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
     || | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | |||||||||  ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  22237420 gcatattacaccttataacaacaatatgaaaatccaggttttctcacaggtactcgccacagcgagttgtcttgctcacgaggcgagctatgaagttgct 22237321  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237320 cactcgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 22237249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 1111471 - 1111086
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  1111471 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 1111372  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  1111371 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattaatctttttaacctaaaactttcaccattcatctt 1111273  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |  |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| ||||||  ||| |||||  |  ||||  |  |||| ||||||||||||||||||       
T  1111272 tattatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaac--tttcaaaatttaagttttgtctgggcttactcgccatggcgagttgggc 1111175  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111174 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 1111086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18894780 - 18894403
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa--cagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||   || ||||  ||    
T  18894780 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtgca-aaatcagg 18894682  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||| || || | || |||     
T  18894681 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcgaactccaatcctaagctccctattcatctttttaaccctaaactttcaccattcatcattaatatcc 18894583  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  18894582 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcga 18894483  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18894482 ggcgagctatgaagttgctcactcgctatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 18894403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 10816743 - 10816949
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  |||| | |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  10816743 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagtgtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttca 10816841  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10816842 ggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatga 10816941  T
Q  231 ttatgcaa 238  Q
    ||||||||    
T  10816942 ttatgcaa 10816949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21675648 - 21675471
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21675648 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21675550  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21675549 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21675471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 23538770 - 23538976
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |  |||    
T  23538770 acgactccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagtatggttaaagcattcattttca 23538868  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  23538869 ggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagccgaagctctctcacttttatga 23538968  T
Q  231 ttatgcaa 238  Q
    ||||||||    
T  23538969 ttatgcaa 23538976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 28259668 - 28259406
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |   || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |      
T  28259668 actgggtagctcgcctcacgagcacatctactcgctatggcgagtttacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcga 28259570  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||||| ||| |||| || |    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  28259569 aaataaggtactctcggaagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaaactccctattcacctttttaacctaaaacttgctccagtcatcat 28259470  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccag 738  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28259469 taaaatcatttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccag 28259406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 43029366 - 43029743
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  ||||    
T  43029366 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaacattaggtg 43029465  T
Q  585 ctctggggaaaa-atgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||| ||||||| |||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| | ||| || || | || |||||    
T  43029466 ctctcgggaaaagatgtcatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaaactaaaacttccaccattcatcattaatatcat 43029564  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  43029565 ataggtaccttaaaccatccccaaaacttcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 43029664  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029665 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 43029743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1857680 - 1857520
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  1857680 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 1857582  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  1857581 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 1857520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 30781392 - 30781768
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   || ||    || |||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||||    
T  30781392 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggctagttcacaaaaacactagcttgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtg 30781491  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||||||    
T  30781492 ctctcggggaaaatgacatttt-ctcactcaaatcccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatcatc 30781590  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||   |||||  |  |||||||||||||||||||||| |   ||| |||||    
T  30781591 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcacaattttatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcacgagg 30781690  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30781691 cgagtgatgatgttgttcacttgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 30781768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 37539743 - 37539363
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||      ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||   |    
T  37539743 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaattcctatctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaaacgg 37539644  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  37539643 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 37539545  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  37539544 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgc 37539445  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||  |||  | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  37539444 gaggcgagtaatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcaatgaacatcagtacgggcagaa 37539363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 37547287 - 37546907
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||      ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||   |    
T  37547287 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaattcctatctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaaacgg 37547188  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  37547187 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 37547089  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  37547088 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgc 37546989  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||  |||  | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  37546988 gaggcgagtaatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcaatgaacatcagtacgggcagaa 37546907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 7507801 - 7507419
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||     || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  7507801 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggtgagttcacggaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattag 7507702  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| |  ||    
T  7507701 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcctctttattat 7507603  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc--tactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||   ||| |||||| ||| |||||  ||  ||||  |  ||   ||||||||||||||||||| |   |||    
T  7507602 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacactttataacaacttttcaaaaaatcaagttttatcttgggcttactcgccatggcgagttggactgctc 7507503  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507502 gcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 7507419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 25846659 - 25847036
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  ||    
T  25846659 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaacatcagg 25846757  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  25846758 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatctcaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatca 25846856  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  25846857 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcg 25846955  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25846956 aggcgagtgatgatgttgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 25847036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 582 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5581975 - 5581696
Alignment:
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||||    
T  5581975 gtgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctactcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatc 5581877  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  5581876 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 5581777  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5581776 aggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggtgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtatgggcagaa 5581696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 565 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22232404 - 22232096
Alignment:
Q  565 aggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctc 664  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||       
T  22232404 aggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtct 22232305  T
Q  665 cagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggc 764  Q
    ||  |||||  ||||||||||||| ||   |||||| ||| | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | |||||||||  ||    
T  22232304 caaacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactatccatattacaccttataacaacaatctgaaaatccaggttttctcacaggtactcgccacagc 22232205  T
Q  765 gagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaat 864  Q
    ||||||  |  |||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232204 gagttggcttgctcgcgaggcgagctaaaaagttgctcactagctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaat 22232105  T
Q  865 gcaggtttt 873  Q
    |||||||||    
T  22232104 gcaggtttt 22232096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23112914 - 23112785
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 163  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23112914 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccgctttg 23112816  T
Q  164 agtaac-tagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    |  ||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  23112815 aacaacatagtgttccaccgctttgaacgac 23112785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 25853240 - 25853617
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  ||    
T  25853240 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaacatcagg 25853338  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  25853339 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatca 25853437  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | ||||||||||||||||| |   |||||     
T  25853438 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgca 25853536  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25853537 aggcgagtgatgatgttgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 25853617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21901626 - 21901237
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||  |||||||||           ||    
T  21901626 tactgggcaactcgcctcgcgagtgcatttgctcgctatggcgagctcaggaaaacggttactcgccatggcgagtacgaggcgaaca----------ag 21901537  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||| | |||||||| ||||    ||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||     
T  21901536 aaaaagggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctc 21901437  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| |||| || | |||||| ||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||     |||| |||||||||||| ||      
T  21901436 taaaatcatttaggcactcaaaactaaccaaattacaccttataacaacaatttaaaaatcatgatctctcactcacttactagccatggcgagtggttc 21901337  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
      ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21901336 tgctcacgaggcgagccatgaagattgctcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgccggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtt 21901239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 476 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14882106 - 14881891
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  14882106 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcataaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 14882007  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||   | |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  14882006 aaacagatgctctcgggaaaaagtgacattttcc-cactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctt 14881908  T
Q  675 aaaaatcatctaggtac 691  Q
     ||||||||||||||||    
T  14881907 taaaatcatctaggtac 14881891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 476 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14888783 - 14888568
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  14888783 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcataaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 14888684  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||   | |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  14888683 aaacagatgctctcgggaaaaagtgacattttcc-cactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctt 14888585  T
Q  675 aaaaatcatctaggtac 691  Q
     ||||||||||||||||    
T  14888584 taaaatcatctaggtac 14888568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 474 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15193766 - 15193377
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca 573  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||  | |||||||| ||||||||  |||||||||           |    
T  15193766 atactgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgaactcaaggaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaacg----------a 15193677  T
Q  574 gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||| ||| |||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||| | ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  15193676 gaaaaatgatgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccccattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 15193577  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
      ||||||||  |||||| | |||||| ||||| ||   |||| ||||||| | | ||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||| ||     
T  15193576 ctaaaatcattcaggtactcaaaactaaccaaattataccttataacaacaatctgaaaatcatgatctctcactctctaactcgccatggcgagtggtt 15193477  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
       |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15193476 ctgctcgcgaggcgagccatgaggttgttcactcgcga-ggcgagacaaggctactcgcggggcgagcgatgaatgtcagtacgggcagaatgcaggttt 15193378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 19363240 - 19363336
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19363240 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctctctcgcga-ggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 19363336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 19801684 - 19801294
Alignment:
Q  471 aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcg 569  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||  |||||||||||||||           ||||||||    
T  19801684 aaaaaactgggcaactcgccttgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcagaaaa-caggttgctcgccatggcgagt-----------tcgaggcg 19801597  T
Q  570 aacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    |||  |||||||||||| | ||||    ||| |||||||||||| || | ||| ||  | | |||||||||||||||| || || ||| |||  |||| |    
T  19801596 aacgaaaatatggtgctttcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcattttaaggttccctaatcatctttttaatctgaaaattgtcccagac 19801497  T
Q  670 ctcttaaaaatcatctaggtacacgaaacta--cccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgag 767  Q
     |||| |||||||||||||||| | ||||||  | |  |||||  |||| ||||||| || |||||||  | |||  ||  || |||||||||   ||||    
T  19801496 atctttaaaatcatctaggtactcaaaactatcctcctaatac--cttataacaacaattcaaaaatcatgttttatactgggttactcgccacaacgag 19801399  T
Q  768 ttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgca 867  Q
    ||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19801398 ttgttctgctcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagtgatgaacttctgtacgggcagaatgca 19801300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22508946 - 22508857
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22508946 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagcttaggaaaaagggcactcgccatggcgagttcgaggcgaac 22508857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23081499 - 23081402
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23081499 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacatgctactcgcgacgcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 23081402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 873
Target Start/End: Original strand, 25013966 - 25014355
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca 573  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||           |    
T  25013966 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgttatggcgagctcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaacg----------a 25014055  T
Q  574 gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||| | || ||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  25014056 gaaaaagggggctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagcttcctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 25014155  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
      |||| |||| ||  || | |||||| ||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||     || |||||||||||||| ||     
T  25014156 ctaaaaacatccagacactcaaaactaaccaaattacaccttataacaacaatttaaaaatcatgatctctcactcacttattcgccatggcgagtggtt 25014255  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  25014256 ctgctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcagatt 25014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 21495569 - 21495665
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21495569 ctcgcggggcgagctatgaagttgttcgctcgcga-ggcgagacaaggctactcgcggggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 21495665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17022427 - 17022155
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| || | ||||||     
T  17022427 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttattctaaaagttgtcccagtcctctctaaaaacatctaggcactcaaaactat 17022328  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||| |||||| | || | | ||     ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  17022327 ccaacttacatcttataacaacaatttgaaaatcaaaatctctaactcacttactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagctatgaagttgt 17022228  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttc-tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |  |||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  17022227 tcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgcagaagcgagcgatgaagatcttgtacgggcagaatgcaggtttt 17022155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 427718 - 427989
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||     
T  427718 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgttccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaaaactat 427817  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    |||   |||  |||| ||||||| || |||||||  ||| | |||      | |||||| |||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  427818 ccatcttacaccttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcaggcacatcctcgccgtggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgt 427917  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||| ||| | | |||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  427918 tcactcgc-gaggtgag-actagctacttgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 427989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 23561241 - 23561108
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  23561241 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccatattcatctttttaacctaaaaattgtcccattcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 23561142  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  23561141 ccaaaatacggcttataacaacaattcaaaaatc 23561108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 28259373 - 28259322
Alignment:
Q  822 ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28259373 ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 28259322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 21495277 - 21495363
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21495277 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 21495363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 21889083 - 21889354
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||  ||| || | ||||||     
T  21889083 atttttctcactaaatccgcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcattaaggcactcaaaactaa 21889182  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgt 800  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| | | ||||||  | || ||||      |||||||||||||||| ||    |||| ||||||||| |||||| |||     
T  21889183 ccaaattacaccttataacaacaatctgaaaatcacggttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgtgaggcgagctatgaagattgc 21889282  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21889283 tcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgtcggggcgagcgatgaacatcggtacgggcagaatgcaggtttt 21889354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 647
Target Start/End: Original strand, 37566508 - 37566553
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatctttt 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37566508 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttt 37566553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 20843563 - 20843834
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  20843563 atttttctcactaaatcatcatttttaagctcgctattcatctttttaatctaaaatttgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 20843662  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||  || | |||| ||||   | ||||||||||||| | ||    |||||||| || || ||||||||    
T  20843663 ccaaagtacaccttataacaacaatctaaaaatcatga-tctcac-aggcacttgctcgccatggcgattggttctgctcgcgagacgggctatgaagtt 20843760  T
Q  799 gttcactcgctaaggcga-gcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||  |||||| ||||  |||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20843761 gttcactcgc-gaggcgaggcaa--gctattcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 20843834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 873
Target Start/End: Original strand, 10035527 - 10035916
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||| || |  |||||||||           ||    
T  10035527 tactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaaggttactcgccgtggtgactacgaggcgaac----------gag 10035616  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgata-tttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||| | |||||||| ||||    ||| | ||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||   |||||||||    
T  10035617 aaaaagggtgctctcgggagttttgacattttttttcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcacagtcctct 10035716  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
      ||||||||  ||| || | |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||     ||||||||||||||||| |      
T  10035717 ctaaaatcattcaggcactcaaaactaaccaaaatacaccttataacaacaatttaaaaatcacgatctctcactcacttactcgccatggcgagtggct 10035816  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  10035817 ctgctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggggagcgaagaaggtctgtacgggcagaatgcaggt 10035913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22008124 - 22007896
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc--tcatcagg 134  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||||||||  |  |||||    
T  22008124 actccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttttcagg 22008031  T
Q  135 acataagtcctcaccactacac--cactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac-tgttatgt 230  Q
    || |||||||||||| ||| ||  | ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||| | |||||     
T  22008030 acctaagtcctcaccgctaaacatcgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatga 22007931  T
Q  231 ttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22007930 ttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 19362597 - 19362678
Alignment:
Q  64 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19362597 catgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 19362678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 754 - 873
Target Start/End: Original strand, 37575080 - 37575198
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| |||  |||||||||| || | ||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  37575080 ctcgccatggcgagttggtcttctcgcgaggcgagccatgctgttgttcactagcga-ggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagt 37575178  T
Q  854 acgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  37575179 acgggcagaaaacaggtttt 37575198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 565
Target Start/End: Original strand, 18819319 - 18819409
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcga 565  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  18819319 tactgggcaactcgcctcgcaagctcatctgctcgctatggcgaactcaggaaaatcgttactcgtcgtggcgagtacgaggcgaactcga 18819409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19802044 - 19801964
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19802044 atgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 19801964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 23443830 - 23443744
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  23443830 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctagg 23443744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17022535 - 17022502
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17022535 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 17022502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 560
Target Start/End: Original strand, 21888966 - 21889051
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaa 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||   | |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21888966 tactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagcttaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaa 21889051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 822 - 873
Target Start/End: Original strand, 18819627 - 18819679
Alignment:
Q  822 ggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18819627 ggctactcgctggggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 18819679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 673
Target Start/End: Original strand, 7785719 - 7785790
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||    
T  7785719 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttgatctaaaaattggtccagtcctct 7785790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22232844 - 22232735
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattctcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | | |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||| |||||||   |||    
T  22232844 acgactccactaagactcctctacaatactcatgcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttatagcattcatttca 22232746  T
Q  133 ggacataagtc 143  Q
    |||||||||||    
T  22232745 ggacataagtc 22232735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27636054 - 27635972
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27636054 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 27635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 5888716 - 5888675
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5888716 ctcgcgaggcgagcgatgaatttgctcactcgctatggcgag 5888675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 735
Target Start/End: Original strand, 18819432 - 18819569
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaa 697  Q
    ||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   | |||||||  |||| |||| ||| || | |||    
T  18819432 tgacatttttctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcggtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaa 18819531  T
Q  698 ctacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||| | ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  18819532 ctaactaaattacaccttataacaacaatttaaaaatc 18819569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 21498558 - 21498517
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21498558 ctcgcgaggcgagcgatgaagttaatcactcgctatggcgag 21498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 21741084 - 21741043
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21741084 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgag 21741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 688
Target Start/End: Original strand, 21829987 - 21830120
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || ||     
T  21829987 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctg 21830086  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    ||| |||  |||| | |||  |||||||||||||    
T  21830087 aaaattgtcccagacttctctaaaatcatctagg 21830120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24751707 - 24751647
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 126  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751707 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 615; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 33682430 - 33681652
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33682430 aacaacaaatgcaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 33682331  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33682330 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagc 33682231  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttaca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33682230 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttaca 33682131  T
Q  315 acttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacataca 414  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  33682130 acttt-aagggaattttaattaagtacaacgtacatt-cagtcagcatccattcatcacaaccaaccaaagcatccagggaag-tatatatcagcataca 33682034  T
Q  415 agccatgct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 512  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33682033 agccatgcaataattcaaccaaataaaccatccaaacaacaacagaaatca-accaacaaaatactgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcta 33681935  T
Q  513 tggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcac 612  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33681934 tggcgagctcagaaaatcaagtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgctatttttctcac 33681835  T
Q  613 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacgg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33681834 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttagaaatcatctaggcacatgaaactacccaaaatacgg 33681735  T
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681734 cttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 33681652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 606; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Original strand, 14033100 - 14033947
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033100 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 14033199  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033200 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 14033299  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  14033300 tgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 14033397  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14033398 agggaattt-aattaaatacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacatccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 14033494  T
Q  422 ct-taattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14033495 caataattcaaccaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 14033593  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14033594 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 14033693  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14033694 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacgtgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 14033793  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14033794 caacatttacaaaaaccagattttaacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagca 14033893  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14033894 atggctactcgcgaggcgagcgatgaactactgtacgggcagaatgcaggtttt 14033947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 23835018 - 23835860
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835018 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 23835117  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835118 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 23835217  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  | || |||| |||     
T  23835218 tatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacata-tatatgattcaccaatcaaccttcatcttt-aagg 23835315  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||  |||  | |||| |||||||| ||||| | ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  23835316 aaattttaattatatacaacacacat--cagtcaacatccattcatca-aaccaactaaagcatccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 23835411  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23835412 taattcaacaaaatacaccatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 23835510  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23835511 aggaaa-caggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 23835609  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23835610 attctaagctccctaatcatcttttgaacttaaaacttgctttagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataacaa 23835709  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatg 822  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23835710 ctttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagcaatg 23835809  T
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23835810 gctactcgtgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggtttt 23835860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 28360059 - 28359225
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28360059 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 28359960  T
Q  138 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28359959 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 28359860  T
Q  238 actaatccccttga-gtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgattcaccatccaatttacaacttttaagtgaattttaatt 335  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||| |||||||| ||    
T  28359859 actaatccccttgttgtatatctacataccaacccacctagacatatatatatatatatgtttcaccaaccaacttacaacgtt-aag-gaattttattt 28359762  T
Q  336 aaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatat-atcaacatacaagccatgct-taattcaac- 432  Q
    ||||||||||| || | |||  |||||| ||||||   |||||  ||| ||||||| | ||| || || |||| ||||||||||||||  |||||||||     
T  28359761 aaatacaacattcaat-cagtcagcatccattcattgtaaccaatcaa-acatccaagtaaa-tacattatcagcatacaagccatgcaataattcaacc 28359665  T
Q  433 aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcag 532  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||||| | || ||| || ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  28359664 aaataaaccattcagacaacatcagaaattaaac-aaccaattactgggcagctcgcctcgcgagctcctctgctcgctatggcgagctcagaaaaatag 28359566  T
Q  533 gtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagct 632  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  28359565 ttactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtactctcgggaaaaatgacatttttctcactaaatcctcatttctaagct 28359466  T
Q  633 ccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaa 732  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  28359465 ccctgatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataacaacgttttcaaa 28359366  T
Q  733 atccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcg 832  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28359365 atccagatttttacaaggctactcgccatggcgagctgattcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagcaatggctactcgcg 28359266  T
Q  833 aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28359265 aggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggtttt 28359225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 27562753 - 27561909
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562753 caacttatcaccactccactaaaactcctctaa-cacccatgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 27562655  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27562654 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccgctgt 27562555  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||     
T  27562554 tatgttaatgcaactaatccccattgagtatatctacatactacccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaacgtt-aag- 27562458  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||||      
T  27562457 gaattttaattaaacacaacattcatt-cagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacatccaaggaga-tacttatcatcatacaagccatgcaa 27562360  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||  | | || | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27562359 taattcaacaaaatataccattcaaacaacaacagaaaata-atcagccagatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgagctc 27562261  T
Q  523 agggaat-caggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctc 621  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  27562260 aggaaagacagttactcgccatggcgagttggatgcgaactcgaggcgaacagaaaaagggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaactcc 27562161  T
Q  622 aattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaaca 721  Q
    ||| ||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27562160 aatcctaagttctctattcatccttttaacctaaaacttccaccattcatcactaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataaca 27562061  T
Q  722 acattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaat 821  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27562060 acatttcaaaaattcagatttttacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagtaat 27561961  T
Q  822 ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27561960 ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 27561909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 28290384 - 28289576
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28290384 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacatcactttg 28290286  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  28290285 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 28290186  T
Q  264 accaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagca 361  Q
    || | || |||||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||| || | || ||  ||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  28290185 acaatcccacctaagcatatatgta-tatatgactcaccactccaatttacaacattcatgtaaaacttaattaaataaaagcatacatc-cagctagca 28290088  T
Q  362 tctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaat 455  Q
    || ||||||||    ||||||    ||| ||||||| ||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||   |||||     
T  28290087 tccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccatt-aacaac 28289993  T
Q  456 agaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggag 555  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28289992 agaagtcaaaccaacaaaattctgggcagctcgcctcgcgagcacatctactcgctatggcgagctcgggaaataaggtactcgccatggcgagttcgag 28289893  T
Q  556 gcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 655  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||     || ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289892 gcgaactcgaggcgaacagaaaagtggtgctctcgggagtttcgacatttt-ctcactaaatcatcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 28289794  T
Q  656 aacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctact 755  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28289793 aacttgctccagtcctctttaaaatcatctagatacataaaactacccaaaatacggcttataacaacattttaaaaattcagattttcacaagggtact 28289694  T
Q  756 cgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtac 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289693 cgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgctatggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtac 28289594  T
Q  856 gggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28289593 gggcagaatgcaggtttt 28289576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 19726565 - 19727411
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19726565 caactcatcaccactccaccaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 19726663  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  19726664 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctccca 19726763  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    || ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  19726764 cttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacctaacctatgcatatatatg-tatatgactcaccactccaatttacaacattc 19726862  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| |||||    
T  19726863 atgtataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcc 19726958  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19726959 atgcttaat-catcaagataaatcaaccat-caacaacagaaatcaatccaacaag-tactgggcaactcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 19727055  T
Q  518 agctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||    
T  19727056 agctcaggaaa-caggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaa 19727154  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctta 716  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19727155 tcatcaatcctaagctccctattcatcttttgaatctaaaacttgctctagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggctta 19727254  T
Q  717 aaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcga 816  Q
     ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  19727255 taacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggggagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcga 19727354  T
Q  817 gcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19727355 gcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggacagaatgcaggtttt 19727411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21724978 - 21724129
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  21724978 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatacatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagca 21724880  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||    
T  21724879 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtactccaccactttgatctattaggcgttccagagccgaagctctccca 21724780  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| || ||||||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  21724779 ctgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaacctatgcatatatgtg-tatatgactcaccactccaatttacaactttc 21724681  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaac-atacatttcagctagcatctattcatca--caacca-tccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaag 416  Q
    ||||  |  ||||||||||| ||  ||||||  |||| |||||| ||||||    |||||| |  || ||||||||  |||  ||| | ||||||| |||    
T  21724680 aagtataacttaattaaataaaagtatacatc-cagccagcatccattcatttttcaaccaatttaaaacatccag--aaataatacaccaacataaaag 21724584  T
Q  417 ccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 515  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21724583 ccatgcttaat-cgacaagataaatcaaccat-caacaacagaaatcaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 21724487  T
Q  516 cgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactca 615  Q
    |||||||||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||     ||| |||||||||||| |    
T  21724486 cgagctcaggaaaaagggcactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaaaaggctgctctcgggtgttttgacatttttctcactaa 21724387  T
Q  616 aacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctt 715  Q
    | ||||| ||| ||| |||||| ||| |||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21724386 atcctcatttccaagttccctattcaactttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggctt 21724287  T
Q  716 aaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcg 815  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||    
T  21724286 ataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcg 21724187  T
Q  816 agcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21724186 agcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtttt 21724129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 808
Target Start/End: Original strand, 1592718 - 1593491
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1592718 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacctatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagca 1592816  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  1592817 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagccgaagctctccca 1592916  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| || ||||||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  1592917 ctgttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaacctatgcatatatgtg-tatatgactcaccactccaatttacaactttc 1593015  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattca--tcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaag 416  Q
    ||||  |  ||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||| |||||  |  ||||| ||  || |||||||  ||||  ||| | ||||||| |||    
T  1593016 aagtataacttaattaaataaaagtataca-tccagccagcatccattcatttttcaaccaatttaaaacatcca--gaaataatacaccaacataaaag 1593112  T
Q  417 ccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 515  Q
     ||||||||| || |||| |||||||| || | |||||| ||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593113 tcatgcttaa-tcgacaagataaatcaacc-atcaacaacagaaatcaatccaac-aaatactgggaaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatgg 1593209  T
Q  516 cgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactca 615  Q
    |||||||||| ||   || ||||||||||||||||           |||||||||||||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| |    
T  1593210 cgagctcaggaaaaagggcactcgccatggcgagt-----------tcgaggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaa 1593298  T
Q  616 aacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctt 715  Q
    | ||||| ||| ||| || ||| ||| |||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1593299 atcctcatttccaagttcactattcaactttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcatctaggtacattaaactacccaaaatacggctt 1593398  T
Q  716 aaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1593399 ataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc 1593491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 767
Target Start/End: Original strand, 22906924 - 22907653
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22906924 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgtatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 22907022  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  22907023 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 22907122  T
Q  221 actgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttt 319  Q
    ||||||||| ||||||| || | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| |||||  |||||| ||    
T  22907123 actgttatgcttatgcagctgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccaaaatacaacatt 22907221  T
Q  320 taagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
     | ||     ||||||||||  | |||||||| |||| |||||| |||||| | |||| ||  |  ||||||||   ||| ||| | ||  |||  ||||    
T  22907222 catgtatgacttaattaaatgaagcatacattccagccagcatcaattcattataaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccattataatagcc 22907318  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || | |||||| |  ||||| | |||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907319 atgcttaa-tcatcaagataaatcaacc-atcaacaaca-taatca-atcaaacaaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatatgctcgctatggcg 22907414  T
Q  518 agctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    ||||||   || ||||  ||||||||||||||||           |||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||    
T  22907415 agctca-aaaaacaggacactcgccatggcgagt-----------tcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaa 22907502  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctta 716  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  22907503 tcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctcttaaatcatctaggtacataaaactacccaaattacggctta 22907602  T
Q  717 aaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgag 767  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||    
T  22907603 taacaacactttaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgag 22907653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23234622 - 23234305
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  23234622 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacatcaattctaagctccctattcatctttttaatcta 23234523  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  |||||    
T  23234522 aaacttgctccagtcctctctaaaatcatttaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacagctac 23234423  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23234422 tcgccacggcgagttgtctcactcgcgaggcaagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-gactactcgcgaggcgagcgatgaacatctgta 23234324  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23234323 cgggcagaatgcaggtttt 23234305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 470 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 26418443 - 26418041
Alignment:
Q  470 caaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcg 569  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||   | | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26418443 caaaatattgggcaactcgcctcgcaagcacatctactcgctatggcgaactcaggaaacgggttgctcgccatggtgagttcaaggcgaactcgaggcg 26418344  T
Q  570 aacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    |||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26418343 aacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattttaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtc 26418244  T
Q  670 ctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagtt 769  Q
    ||||  |||||||  ||||||||  |||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||      ||||||||||| ||||     
T  26418243 ctctctaaaatcaattaggtacattaaactaacgaaaatacagcttataacaacaatttgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatggtgagtg 26418144  T
Q  770 gtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 869  Q
    ||    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26418143 gttctgctcgcgagacgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcagg 26418045  T
Q  870 tttt 873  Q
    ||||    
T  26418044 tttt 26418041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 10470509 - 10470122
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  10470509 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 10470411  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  10470410 actctcgggagttttgacattttcctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcat 10470311  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || |||||||||||||||||||     ||||||||    
T  10470310 ttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 10470211  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10470210 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcac-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 10470122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 12446986 - 12446590
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||  | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  12446986 actgggtaacttgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaataggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 12446887  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
     |||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  12446886 tatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctcttt 12446787  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||| | ||| |||||| || |||  ||  || |||||||||||||||||||         
T  12446786 aaaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaataatttgaaaatcaagttttatactgggttactcgccatggcgagttggcctg 12446687  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12446686 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-gcctactcgtgaggtgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 12446590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 12941800 - 12942000
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12941800 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 12941898  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  12941899 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 12941998  T
Q  264 ac 265  Q
    ||    
T  12941999 ac 12942000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 27767725 - 27768111
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  27767725 actgggtagctcgcctcgcgggcacatttgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 27767823  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |    
T  27767824 aaagtaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaatttaaaacttgctccagtcatcat 27767923  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||   |  || ||||||||| |||||||||        
T  27767924 taaaatcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttaaaaatccagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtct 27768023  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27768024 gctcgtgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacaggcagaa 27768111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 499 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 934039 - 933738
Alignment:
Q  499 acatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||   ||| ||||||||||  |||        
T  934039 acatctgctcgctatggcgagctcaggaaa-caggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcaaagcgaatgaaaacatggtgctctcaggagttt 933941  T
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaa 697  Q
    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  933940 tgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaa 933841  T
Q  698 ctacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagt 797  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  933840 ctaaccaaaatacggcttataacaacacttcaaaaatccaattttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagt 933741  T
Q  798 tgt 800  Q
    |||    
T  933740 tgt 933738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 486 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17207518 - 17207132
Alignment:
Q  486 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   || |||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| ||||    
T  17207518 tcgcctcgcgagcacacctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctctccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagagaaaataaggtg 17207420  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17207419 ctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcatt 17207320  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || |||||||||  ||||||||     |||||||||    
T  17207319 taggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacagcgagttggtctgctcgcgagg 17207220  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17207219 cgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 17207132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16223441 - 16223055
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  16223441 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 16223342  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  16223341 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcat 16223243  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |      
T  16223242 taaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggact 16223143  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223142 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 16223055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 17310037 - 17310417
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || | | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||      
T  17310037 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaac-gctagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatca 17310135  T
Q  581 ggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || | ||||    
T  17310136 ggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcattaaaa 17310234  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    ||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  17310235 tcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc-aggttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctc 17310333  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17310334 gcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 17310417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 25464207 - 25464592
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  25464207 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 25464306  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||     
T  25464307 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcttt 25464405  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |      
T  25464406 attatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggact 25464504  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25464505 gctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 25464592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 8069469 - 8069091
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  8069469 agcttgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 8069370  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  8069369 tgctctcgggaaaaatgacattta-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatca 8069271  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
     ||||||||   |||| | ||  || ||  ||||  ||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  8069270 cctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttattacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 8069171  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8069170 ggcaagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcaaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaa 8069091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 29926069 - 29926446
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||    
T  29926069 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaaaataaggt 29926167  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29926168 actctcgggagttttgacatttctctcattcaaacctcaattataagctccttattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcat 29926267  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
     |||| ||   |||||| || ||| ||  |||| ||||||| || |||||| ||  |||||| | ||  | |||| ||||||||||||     |||||||    
T  29926268 ttaggcaccttaaactatcccaaaaacatcttataacaacaattcaaaaat-catgttttcaaatggattgctcgtcatggcgagttggtctgctcgcga 29926366  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29926367 ggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaa 29926446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19096563 - 19096185
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  19096563 agctcacctcgcgagcacatccgctcgctatggcgagttcacaaaatcactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 19096464  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  19096463 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcgtcattaaaatca 19096365  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||||    
T  19096364 tccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggactgctcgcg 19096266  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096265 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 19096185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21566346 - 21566163
Alignment:
Q  84 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 181  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  21566346 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcatgacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 21566247  T
Q  182 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21566246 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 21566163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 15331896 - 15331516
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  15331896 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 15331797  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    |  |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  15331796 gcactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 15331698  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttca-caaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15331697 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc-aggttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcg 15331599  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15331598 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 15331516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 12167237 - 12167439
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12167237 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12167336  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  12167337 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 12167436  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  12167437 tac 12167439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 13128055 - 13127670
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   || |||| ||||||||| ||||||||  ||||||       | ||| ||    
T  13128055 actgggtagctcgcctcgcgagcacttctgctcgctatggcgagttca-caaaacaggttactcgccacggcgagttcaaggcga-------gtgaaaag 13127964  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
     |    |||||||| ||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  13127963 ta----ggtgctcttgggagttttgacatttttctcgctcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctcctgtcatcat 13127868  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||   |  || ||||||||||||| |||||        
T  13127867 taaaatcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgatctgggttactcgccatggctagttggtct 13127768  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13127767 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcact-tcttctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 13127670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 19286146 - 19286348
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19286146 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19286245  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19286246 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19286345  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  19286346 tac 19286348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29615376 - 29615199
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  29615376 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 29615278  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29615277 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 29615199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 10464004 - 10463617
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  10464004 actgggtagctcgcctcgcgagcatatctgctcgctatggcgagttcacaaaataggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 10463905  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    || | ||||||||  | |    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |     
T  10463904 aagaaggtgctctctgtagtt-tgacatttttctcactcaaaccttaattctaagctccctattcatctttttaccctaaaacttgctccagtcatcatt 10463806  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaac-attttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||  || ||  |||| |||||| |||  ||||||| || |||  ||  || | ||||||| | |||||||        
T  10463805 aaaatcatttaggtacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaattcaaaaaatcaagttttcaactgggttgctcgccacgtcgagttggtct 10463706  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggct-actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  10463705 gctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctaacttgcgaggtgatcgatgaacttctgtacggtcagaa 10463617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 19877330 - 19877532
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19877330 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19877429  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19877430 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19877529  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  19877530 tac 19877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 19883106 - 19883308
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19883106 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19883205  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19883206 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19883305  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  19883306 tac 19883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25470868 - 25470691
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  25470868 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgcttt 25470769  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25470768 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 25470691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 937900 - 937658
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| | || |  ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  937900 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcatgaccttagccctcacctctgtagaatggttaaagca 937802  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  937801 ttcattttcaggacataagtcctcacctctaacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctccca 937702  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||  |||| |||||||| | | || || | ||||||||||||||    
T  937701 cttctatgcttatgcaattgacccactcgtgtatatctacatac 937658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 24562282 - 24562459
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24562282 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24562380  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24562381 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24562459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 18786601 - 18786872
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  18786601 atttttctcactaaaacttcaattttaagctccctattcatctttttaatttgaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactaa 18786700  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | ||   |||| |||||||  | |||||  ||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  18786701 ccagattataccttataacaacaactcaaaaagtcaggttttctcacaggtactcgccatggcgagttgtcttgctcgcgaggcaagctatgaagttgct 18786800  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  18786801 cactcgctaaggcgagttatggctactcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgagcagaatgcaggtttt 18786872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34647829 - 34647652
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34647829 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34647730  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34647729 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34647652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19787050 - 19786847
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19787050 atgcatgtggtaccataattcagggccattacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19786951  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcaactaatccccttgagtatatctac 261  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || | || ||||||||||    
T  19786950 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctac 19786851  T
Q  262 atac 265  Q
    ||||    
T  19786850 atac 19786847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 24362940 - 24363317
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    ||||  ||    
T  24362940 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaa-cactagctcgccatggcgagttcaagacgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 24363038  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  24363039 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatca 24363137  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||| |||||||||||| |   |||||||    
T  24363138 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgacatggcgagttggactgctcgcga 24363237  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24363238 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagtttctcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaa 24363317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 23837580 - 23837758
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  23837580 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagttctcaccgctccacaccgcttt 23837679  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  ||||||  |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23837680 gaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatggaacta 23837758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34641155 - 34640978
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34641155 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34641056  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34641055 gaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34640978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14615932 - 14615661
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| ||   |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  14615932 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattatcccagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 14615833  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    | ||  |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||  |  |||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  14615832 caaatttacaccttataacaacaatatgaaaatccagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttggcttgctcgtgaggcaagctatgaagttgct 14615733  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14615732 cactcgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaatgcaggtttt 14615661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Original strand, 24369583 - 24369908
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    ||||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  24369583 ctcgccatggcgagttcaagacgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccc 24369681  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||    
T  24369682 tattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc 24369781  T
Q  736 cagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg 835  Q
     || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  | |||||||||||    
T  24369782 aagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttactcgcgagg 24369880  T
Q  836 cgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24369881 tgagcgatgaacttctatacgggcagaa 24369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 17414524 - 17414795
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||| || || || ||| |||   |||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  17414524 atttttctcactaaaacttcaattttaagctccttattcatctctttaatctgaaaattgtcacagtcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactaa 17414623  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||   |||| |||||||  | |||||  ||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  17414624 ccaaattataccttataacaacaactcaaaaagtcaggttttctcacaggtactctccatggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagctatgaagttgct 17414723  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17414724 cactcgctatggcgagctaagtctactcgcgaggcgagcgatgaacagcagtacgggcagaatgcaggtttt 17414795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 13940806 - 13941193
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || | | |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  13940806 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaaaccgattgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 13940905  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||    ||| ||||| |||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||    
T  13940906 gctctcgggagttttgacatttt-ctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcat 13941004  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||| ||   |||||| ||| | ||| ||||| ||||||| || ||||||   | |||  ||  || | ||||  |||||||||||     ||||||||    
T  13941005 ctaggcacctaaaactatccatattacagcttataacaacacttcaaaaattatgttttcaactgggttgctcgttatggcgagttggtctgctcgcgag 13941104  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13941105 gcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 13941193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 25315421 - 25315042
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  25315421 agctcgcctcgcgtgcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 25315322  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||||    
T  25315321 tactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatc 25315223  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||| ||||||   |||  | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  25315222 atccaggtaccttaaatcatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 25315123  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25315122 aggcgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 25315042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26202915 - 26202536
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  26202915 agctcgcctcgcgtgcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 26202816  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | ||||||    
T  26202815 tactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatc 26202717  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||| ||||||   |||  | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  26202716 atccaggtaccttaaatcatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 26202617  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26202616 aggcgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 26202536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29416605 - 29416468
Alignment:
Q  104 gctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcat 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |       
T  29416605 gctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgc 29416506  T
Q  201 tccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29416505 tccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 29416468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 94270 - 94063
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  94270 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttctcaaaactgcttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 94172  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||| | |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||| |    
T  94171 gtgctatcgggaatt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccatattcatctttttaacctaaaacttgcttcagtcatcattaaaacc 94073  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||||||||||    
T  94072 atctaggtac 94063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 21476815 - 21477086
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||     
T  21476815 atttttctcactaaaacttcaattttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatctaggtactcaaaactat 21476914  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaac-aacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||  |||  |||| ||| || |||| ||||||| ||||| |  |     ||||||||||||||||| ||    |||||||||  ||| ||||||||||    
T  21476915 ccaacttacaccttataacaaaaatttgaaaaatcaagattcttgctcacttactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggtaagctatgaagttgt 21477014  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||  | |  | |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21477015 tcactcgc-aaggcgagacaagcattctcgcggggcgagtgatgaagatctgtacgggcagaatgcaggtttt 21477086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23020850 - 23020754
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23020850 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 23020754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 21470314 - 21470585
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||   |||| ||||  |||| ||||||||||| | ||||||     
T  21470314 attttcctcactaaaacttcaattttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtctcagttctctctaaaaacatctaggtactcaaaactat 21470413  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaac-attttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||  |||  |||| |||||| |||| ||||||| |||||||  |     |||||||||||| |||| |     |||||||||||||| ||||||||||    
T  21470414 ccaacttaccccttataacaacaatttgaaaaatcaagatttttgctcacttactcgccatggtgagtggctctgctcgcgaggcgagctatgaagttgt 21470513  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  |||||||  | |  | |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  21470514 tcactcgc-gaggcgagacaagcattctcgcggggcgagcgatgaagatttgtacgggcagaatgcaggtttt 21470585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 29159442 - 29159648
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |  ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  29159442 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaagacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 29159541  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||| |||||| |  |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  29159542 tgctctcggg-aaaatg-tcattttctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatca 29159639  T
Q  683 tctaggtac 691  Q
    || ||||||    
T  29159640 tccaggtac 29159648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 94000 - 93904
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  94000 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgtcatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 93904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 754 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30799191 - 30799083
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30799191 ctcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgtcatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgt 30799093  T
Q  854 acgggcagaa 863  Q
    ||||||||||    
T  30799092 acgggcagaa 30799083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Original strand, 18788448 - 18788560
Alignment:
Q  153 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 252  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  18788448 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 18788547  T
Q  253 tatatctacatac 265  Q
    |||||||||||||    
T  18788548 tatatctacatac 18788560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Original strand, 18799428 - 18799540
Alignment:
Q  153 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 252  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  18799428 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 18799527  T
Q  253 tatatctacatac 265  Q
    |||||||||||||    
T  18799528 tatatctacatac 18799540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 803 - 873
Target Start/End: Original strand, 22907639 - 22907710
Alignment:
Q  803 actcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaac-ttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22907639 actcgccatggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactttctgtaggggcagaatgcaggtttt 22907710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 826 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 33681672 - 33681625
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681672 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 33681625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17882286 - 17882190
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  17882286 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgcga-ggcgagcacaatctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaaaacaggtttt 17882190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 34133748 - 34133363
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggga-atcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaa 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | ||    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||    |||    
T  34133748 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttcacggacaacactagctcgccacggcgagttcaaggcgaactagaggcgagtgaaaa 34133649  T
Q  578 tatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
       |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  || | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |     
T  34133648 ctaggtgctctcgggaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccattcctaagtttcctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttat 34133550  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaa--tccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||  || || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |      
T  34133549 tatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggact 34133451  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||   ||| ||| ||||||||| | ||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34133450 gctcgcgaggcgagtagtgatgttattcactcgcga-ggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 34133363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Original strand, 19439792 - 19439904
Alignment:
Q  153 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 252  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| | || |||| |    
T  19439792 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgacccacttgtg 19439891  T
Q  253 tatatctacatac 265  Q
    |||||||||||||    
T  19439892 tatatctacatac 19439904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19588781 - 19588556
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |  ||| |||    
T  19588781 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaatccctcaccgctaattgaatggttaaagtattcattttcatgac 19588688  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||  | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  19588687 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 19588588  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  19588587 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 19588556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 22798168 - 22797897
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||  ||||||||| ||| || | ||||||     
T  22798168 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatcgaggcactcaaaactaa 22798069  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||| ||   |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||      |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||| |||||||||     
T  22798068 ccaaattataccttataacaacaatttaaaaatcttgatctctcactctctaactcgccatggctagtggttctactcgcgaggcgagccatgaagttgc 22797969  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22797968 tcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgataaacatcaatacgggcagaatgcaggtttt 22797897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 25559429 - 25559319
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||  |     
T  25559429 tactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagtaatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgagtactcgcgaggcgagcgatgaacacca 25559331  T
Q  852 gtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||    
T  25559330 gtacgggcagaa 25559319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8760633 - 8760410
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagg 134  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||||| |||   ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8760633 actccactaagactcctctacaatactcatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgaagccctcaccacttatcgaatggttaaagcattctttttcagg 8760535  T
Q  135 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    |||| |||||||||| |||  |||| ||||||   ||||||  ||||||||||||||| || | || |||||| || ||||| ||||  || ||||| ||    
T  8760534 acatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacgactagtgttccaccactttgaacaacaaggcgttccagggcagaagccctccagcttttatgctt 8760435  T
Q  233 atgcaactaatccccttgagtatat 257  Q
    |||||||| | || |||| ||||||    
T  8760434 atgcaactgacccacttgtgtatat 8760410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289602
Alignment:
Q  139 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 236  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgc 11289607  T
Q  237 aacta 241  Q
    |||||    
T  11289606 aacta 11289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18315733 - 18315356
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||| ||||||||||  |||||||  ||||         || | |||    
T  18315733 ctcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaagggtcactcgctatggcgagttcaaggcgaa--cgag---------aaaaaggt 18315645  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||| || || ||| |||   |||||||||  ||||||||    
T  18315644 gctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattttaagctccctatccatctttttaatctgaaaattgtctcagtcctctctaaaatcat 18315545  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||| | || | |||||| ||||  ||   |||| ||||||| ||  ||||||  |||| ||||      |||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  18315544 ctaagcactcaaaactatccaacttataccttataacaacaattggaaaatcatgattctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgag 18315445  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18315444 gcaagctatgaagttgctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgtcggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 18315356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 23105896 - 23105992
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  23105896 ctcgcgtggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagacaaggctactcgcggggcgagtgatgaacatcagtatgagcagaatgcaggtttt 23105992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 24721127 - 24721398
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||     
T  24721127 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccttattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaaaactat 24721226  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    |||   |||  |||| ||||||| || |||||||  ||| | |||| |||   | ||||| ||||||||| ||    |||||||||| ||| ||||||||    
T  24721227 ccatcttacaccttataacaacaattcaaaaatcatgatct-caca-ggcacttgctcgctatggcgagtggttctgctcgcgaggctagccatgaagtt 24721324  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| | |||||| | | ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24721325 gttcactcgcga-ggcgag-actagctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgagcagaatgcaggtttt 24721398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 770
Target Start/End: Original strand, 19468352 - 19468520
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||  ||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  19468352 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatccttttaatctaaaaattgcctcagccctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 19468451  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  19468452 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttg 19468520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14582056 - 14581950
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcagga 135  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||    
T  14582056 actccactaagactcctctata-----atgcatgtggtaccataa--cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcagga 14581964  T
Q  136 cataagtcctcacc 149  Q
    ||| ||||||||||    
T  14581963 catgagtcctcacc 14581950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 873
Target Start/End: Original strand, 18138048 - 18138359
Alignment:
Q  563 cgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgc 662  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||| |||| || |||||| |||     
T  18138048 cgaggcgagcaagaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatttttttaatctaaaaattgg 18138147  T
Q  663 tccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagatt-ttcacaaggctactcgccat 761  Q
     |||| |||||  |||| | |||||| || | |||| | ||||  |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||   |||     ||||||||||    
T  18138148 cccagccctctctaaaaacgtctaggcactcaaaaccatccaacttacatcttataacaacattttaaaaatcatgcttccccactcacttactcgccat 18138247  T
Q  762 ggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacggg 858  Q
    ||||||| || |  |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  18138248 ggcgagtagtcttgctcgtgaggcgagctatgaagattgctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgctgaggcgagcgatgaaggtctgtacgga 18138344  T
Q  859 cagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||    
T  18138345 cagaatgcaggtttt 18138359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19300868 - 19300643
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctc--atcagga 135  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| |  ||||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||    
T  19300868 actccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccata--tcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcttttatcagga 19300776  T
Q  136 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctc-ccactgttatgttt 232  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| ||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||| || || ||||| ||    
T  19300775 catgagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccactttgaacgacaaagcgttccaagaccgaagccctcaccgcttttatgctt 19300676  T
Q  233 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| | | || |||  ||||||||||||||    
T  19300675 atgcaattgacccacttatgtatatctacatac 19300643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 19819425 - 19819558
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||   |||||||    
T  19819425 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtacttaaaactac 19819524  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    |||   ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19819525 ccattttacagcttaaaacaacacttcaaaaatc 19819558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 673
Target Start/End: Original strand, 25773203 - 25773272
Alignment:
Q  604 ttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  25773203 ttttctcactaaaacttcaattttaagctccctaatcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 25773272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8760196 - 8760144
Alignment:
Q  473 aatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8760196 aatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcaaactcagg 8760144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 19818944 - 19819102
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  19818944 gaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccacctctttgaacgacaaggcattccagg 19819043  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| ||| ||||| || || || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  19819044 gccggagc-ctcccgcttttgtgcttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 19819102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 863
Target Start/End: Original strand, 29159733 - 29159769
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159733 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 29159769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14132794 - 14132719
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcga 559  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14132794 ctcgccccgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaagaaaaggggttactcgccatggcgagtaggaggcga 14132719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 525
Target Start/End: Original strand, 23105603 - 23105654
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23105603 atactgggcaactcgcctcgcgagtaaatctgctcgctatggcgagctcagg 23105654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 823 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 9185288 - 9185238
Alignment:
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9185288 gctactcgcggggcgagcgatgaagatctgtacgggcagagtgcaggtttt 9185238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24513962 - 24513801
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||  |||  |||  |||||| |||| |||||| | || |||||    
T  24513962 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttaaacgacaaggcgttcca 24513863  T
Q  205 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    | |||||| | ||||| || ||||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||    
T  24513862 gggccgaaaccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatac 24513801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8768370 - 8768149
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagg 134  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||  |  ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8768370 actccactaagactcctctacaatactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccaattatcgaatggttaaagcattctttttcagg 8768272  T
Q  135 acataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    |||| | |||||||| ||        ||||  |||||||  ||||||| |||||||||| | || |||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||    
T  8768271 acatgaatcctcaccgct--------ttgaacaactagtgttccaccattttgaacgacaaggcgttccagggcagaagccctccagcttttatgcttat 8768180  T
Q  235 gcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  8768179 gcaactgacccacttgtgtatatctacatac 8768149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9185584 - 9185519
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||  | ||||||| |||||||||    
T  9185584 ctcgcctcgcgagtacatctgctcgctatggcgaactcaagaaatgggttactcgctatggcgagt 9185519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Original strand, 21470207 - 21470240
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470207 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21470240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Original strand, 21476708 - 21476741
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21476708 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21476741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 937476 - 937421
Alignment:
Q  449 caacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctg 505  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  937476 caacaacagaaatcaatccaacaaa-tactgggcagctcgcctcgcgagcacatctg 937421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8767943 - 8767891
Alignment:
Q  473 aatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8767943 aatactgggcaactcgcctcgcgaacacatctgctcgctatggcaaactcagg 8767891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 23233063 - 23232895
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| || ||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||| ||||||||||||| ||   ||||||     
T  23233063 atttttctcactaaatcttcatttttaagttctctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctttaaaatcatctaggcacttaaaactat 23232964  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  23232963 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacaggtactcgccatggcgagttg 23232895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 483 - 519
Target Start/End: Original strand, 24369560 - 24369596
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24369560 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 24369596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 483 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 30799214 - 30799178
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30799214 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgag 30799178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Original strand, 1593495 - 1593534
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1593495 ggcgagcgatgaactcctgtacgggtagaatgcaggtttt 1593534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11284022 - 11283984
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 103  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11284022 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacacc 11283984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 823 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14132467 - 14132417
Alignment:
Q  823 gctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  14132467 gctactcgcgaggcgagcgatcaatctctgtacgggcagagcgcaggtttt 14132417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Original strand, 19451803 - 19451889
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||  |||||||||||||    
T  19451803 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagccctctctaaaatcatctagg 19451889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23021503 - 23021423
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23021503 atgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaattc--atcaggacataagtcctcacc 23021423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 19588231 - 19588142
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtac 691  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19588231 atttttctcactaaaaccacatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtac 19588142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 606; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 606; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 807216 - 806370
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807216 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 807117  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807116 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 807017  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  807016 tgttatgtttatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaac-gtta 806919  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || ||| ||||||||| |||||||| || |||||  |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||  |||| || ||||||  |||||| |||||    
T  806918 ag-gaa-tttaattaagtacaacattca-ttcagtcagcatccattcatcaaaaccaaccaaaacatcca-agaaagtacatatcagtatacaatccatg 806823  T
Q  422 c-ttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  806822 caataattcatcaaattaaaccatccaaacaacaacagaaatca-accaaccaaaaactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 806724  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  806723 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctcttgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 806624  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  806623 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataa 806524  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  806523 caacattttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagca 806424  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  806423 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 806370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18055928 - 18055081
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055928 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 18055829  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055828 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 18055729  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  18055728 tgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 18055631  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||  |||  | |||| |||||||| ||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18055630 agggaattttaattatatacaacacacat--cagtcaacatccattcatcaaaaccaactaaagcatctagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 18055534  T
Q  422 ct-taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18055533 caataattcaacaaaatacaccatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagcgtatctgctcgctatggcgag 18055435  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18055434 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctcttgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 18055335  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18055334 gcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggcacacgaaactacccaaaatactgcttataa 18055235  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18055234 caactttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagca 18055135  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18055134 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacggacagaatgcaggtttt 18055081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 11632159 - 11631312
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632159 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 11632060  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632059 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 11631960  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  11631959 tgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttac-accttta 11631862  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||||| ||| |||||||| |||  ||||  |||||| |||||||| ||||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11631861 agggaattttatttatatacaacacaca--tcagtcagcatccattcatcaaaaccagctaaagcatccaggg-aaatatatatcagcatacaagccatg 11631765  T
Q  422 c-ttaattcaac-aaataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11631764 caataattcaacaaaatacaccatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgag 11631666  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11631665 ctca-gaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaaagacatttttctcactcaaacc 11631567  T
Q  620 tcaattctaagct-ccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11631566 tcaattctaagctcccccaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttata 11631467  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11631466 acaactttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttccctcgctatggcgagc 11631367  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11631366 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcagttttt 11631312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18049449 - 18048602
Alignment:
Q  23 atacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 122  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049449 atacaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagc 18049350  T
Q  123 attctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049349 attctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 18049250  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  18049249 tgttatgtttatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacaccttt-a 18049152  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatg 421  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||  |||  | |||| |||||||| ||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18049151 agggaattttaattatatacaacacacat--cagtcaacatccattcatcaaaaccaactaaagcatctagggaaa-tatatatcagcatacaagccatg 18049055  T
Q  422 ct-taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgag 519  Q
    |  |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  18049054 caataattcaacaaaatacaccatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgtgagcgtatctgctcgctatggcgag 18048956  T
Q  520 ctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacc 619  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18048955 ctcagaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctcttgggaaaaatgacatttttctcactcaaacc 18048856  T
Q  620 tcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaa 719  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18048855 gcaattctaagctccctaatcatcttttaaacttaaaacttgctctagtcctcttaaaaatcatctaggcacacgaaactacccaaaatactgcttataa 18048756  T
Q  720 caacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagca 819  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18048755 caactttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagca 18048656  T
Q  820 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18048655 atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacggacagaatgcaggtttt 18048602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23201729 - 23200870
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201729 aacaacaaatgcaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 23201630  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201629 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 23201530  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23201529 tctctcacttttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttac 23201430  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  23201429 aacatt-aagggaattttaattaaataagacatacatt-cagtccacatctaatcatcacaaccaaccaggacatccagggaaag-atatatcagcatac 23201333  T
Q  414 aagccatgct-taattcaac-aaataaatcatccaaa-caacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 510  Q
    || ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201332 aaaccatgcaataattcaacgaaataaaccatccaaaacaacaacagaaatca-accaacaaaatactggacagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 23201234  T
Q  511 tatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctc 610  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  23201233 tatggcgagctcagaaaatcaagtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgatactctcgggaaaaatgacatttttctc 23201134  T
Q  611 actcaaacctcaattctaagctccctaatcatctttta-aacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaata 709  Q
    ||| || |  | ||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||  ||    
T  23201133 actaaatcaaccattctaagctccctatttattttttttaacctaaaacttgctccagtcatcctgataatcatctaggtacatagtactacccaagtta 23201034  T
Q  710 cggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 809  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201033 tggcttataacaacactttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 23200934  T
Q  810 aaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200933 atggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 23200870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23507856 - 23506997
Alignment:
Q  15 aacaacacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 114  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507856 aacaacaaatgcaacttatcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatg 23507757  T
Q  115 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507756 gttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 23507657  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgattcaccatccaatttac 313  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23507656 tctctcacttttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttac 23507557  T
Q  314 aacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatac 413  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  23507556 aacatt-aagggaattttaattaaataagacatacatt-cagtccacatctaatcatcacaaccaaccaggacatccagggaaag-atatatcagcatac 23507460  T
Q  414 aagccatgct-taattcaac-aaataaatcatccaaa-caacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 510  Q
    || ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507459 aaaccatgcaataattcaacgaaataaaccatccaaaacaacaacagaaatca-accaacaaaatactggacagctcgcctcgcgagcacatctgctcgc 23507361  T
Q  511 tatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctc 610  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  23507360 tatggcgagctcagaaaatcaagtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgatactctcgggaaaaatgacatttttctc 23507261  T
Q  611 actcaaacctcaattctaagctccctaatcatctttta-aacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaata 709  Q
    ||| || |  | ||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||  ||    
T  23507260 actaaatcaaccattctaagctccctatttattttttttaacctaaaacttgctccagtcatcctgataatcatctaggtacatagtactacccaagtta 23507161  T
Q  710 cggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 809  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507160 tggcttataacaacactttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 23507061  T
Q  810 aaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507060 atggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 23506997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 20580157 - 20579370
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20580157 caacttatcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 20580058  T
Q  126 ctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20580057 ctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 20579958  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttttaagt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||     
T  20579957 tatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacata-tatatgattcaccaaccaacttacacctttaaag- 20579860  T
Q  325 gaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgct- 423  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||  |||  |||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  20579859 gaattt-aattatatacaacacacat--cagtcagcatccattcatcaaaaccaactaag-catccagggaaa-tatatatcagcatacaagccatgcaa 20579765  T
Q  424 taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc 522  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20579764 taattcaacaaaatacacaatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcgctatggcgagctc 20579666  T
Q  523 agggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctca 622  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20579665 agaaaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctca 20579566  T
Q  623 attctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20579565 attctaagctccctaatcatcttttacacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttataacaa 20579466  T
Q  723 cattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20579465 ctttttcaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgagc 20579370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 23666004 - 23665195
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23666004 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 23665906  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  23665905 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 23665806  T
Q  264 accaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaac-atacatttcagctagca 361  Q
    || | || |||||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||| || | || ||  |||||||| || ||  ||||||  |||| ||||    
T  23665805 acaatcccacctaagcatatatgta-tatatgactcaccactccaatttacaacattcatgtaaaacttaattaattaaaagtatacatc-cagccagca 23665708  T
Q  362 tctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaat 455  Q
    || ||||||||    ||||||    ||| ||||||| ||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||     
T  23665707 tccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaac 23665613  T
Q  456 agaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggag 555  Q
    |||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  23665612 agaagtcaaaccaacgaaattctgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaataaggtactcgccatggcgagttcggg 23665513  T
Q  556 gcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 655  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665512 gcgaactcgaggcgaacataaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 23665413  T
Q  656 aacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctact 755  Q
    ||||| |||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665412 aacttactccagtcatccttataatcatctaggtacatagtactacccaaattacggcttataacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctact 23665313  T
Q  756 cgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtac 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23665312 cgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctatggcgaacataggctactcgcgagacgagcgatgaacttctgtac 23665213  T
Q  856 gggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23665212 gggcagaatgcaggtttt 23665195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 873
Target Start/End: Original strand, 29795730 - 29796528
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29795730 atgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29795828  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29795829 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 29795928  T
Q  264 accaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagca 361  Q
    || | || |||||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||| || | || ||  ||||||||||| || |||||||  |||| ||||    
T  29795929 acaatcccacctaagcatatatgta-tatatgactcaccactccaatttacaacattcatgtaaaacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagca 29796026  T
Q  362 tctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaat 455  Q
    || ||||||||    ||||||    ||| ||||||| ||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||     
T  29796027 tccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaac 29796121  T
Q  456 agaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggag 555  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||        
T  29796122 agaagtcaaaccaacaaaattctgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaataaggtactcgccatggcgagtt---- 29796217  T
Q  556 gcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 655  Q
           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29796218 -------cgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 29796310  T
Q  656 aacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatttt-aaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29796311 aacttgc-ccagtcctcttagaaatcatctaggtacatgaaactacccaaaatatggcttataacaacatttttaaaaatccaaattttcacaaggctac 29796409  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29796410 tcgccatggcgagttgtatccctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgctatggcgagtaatggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgta 29796509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 873
Target Start/End: Original strand, 29799549 - 29800347
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29799549 atgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29799647  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29799648 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 29799747  T
Q  264 accaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagca 361  Q
    || | || |||||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||| || | || ||  ||||||||||| || |||||||  |||| ||||    
T  29799748 acaatcccacctaagcatatatgta-tatatgactcaccactccaatttacaacattcatgtaaaacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagca 29799845  T
Q  362 tctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaat 455  Q
    || ||||||||    ||||||    ||| ||||||| ||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||     
T  29799846 tccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccagagaaa---tacaccaacatacaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaac 29799940  T
Q  456 agaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggag 555  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||        
T  29799941 agaagtcaaaccaacaaaattctgggcagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaataaggtactcgccatggcgagtt---- 29800036  T
Q  556 gcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 655  Q
           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800037 -------cgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaa 29800129  T
Q  656 aacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatttt-aaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29800130 aacttgc-ccagtcctcttagaaatcatctaggtacatgaaactacccaaaatatggcttataacaacatttttaaaaatccaaattttcacaaggctac 29800228  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29800229 tcgccatggcgagttgtatccctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgctatggcgagtaatggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgta 29800328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15723433 - 15722587
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15723433 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 15723335  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  15723334 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 15723235  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  15723234 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgtg-tatatgactcaccactccaatttacaacattc 15723136  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| |||||    
T  15723135 atgtataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcc 15723040  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||  |||||| ||||| ||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723039 atgcttaat-catcaagataaatcaaccat-caacaacagaaaccaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 15722943  T
Q  518 agctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaa 617  Q
    |||||||| ||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||     
T  15722942 agctcaggaaacagggcactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaat 15722843  T
Q  618 cctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaa 717  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  15722842 catcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggcttat 15722743  T
Q  718 aacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||    
T  15722742 aacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgag 15722643  T
Q  818 caatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15722642 caaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 15722587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 767
Target Start/End: Original strand, 19599801 - 19600544
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19599801 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccacgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 19599899  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  19599900 tttattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 19599999  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    || ||||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |      
T  19600000 ctattatgcttatacaactgacccacttgtgtatatctacatacaaccaaacctatgcatatatata-tatatgactcaccactccaaattacaacatac 19600098  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatca----caaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacataca 414  Q
    || |  |  ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| ||||||||    ||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||| ||| |    
T  19600099 aaatataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcatcaatcacaaccaaattagaacatccag---aaaaatacaccaatataaa 19600194  T
Q  415 agccatgcttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctat 513  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| || | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19600195 agccatgcttaat-catcaaaataaatcaaccga-caacaacagaaatcaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctat 19600291  T
Q  514 ggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcac 612  Q
    |||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    ||| |||||||||||    
T  19600292 ggcgagctcag--aaacaggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaataaggtgctctcgggagttttgacatttttctcac 19600389  T
Q  613 tcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacgg 712  Q
    | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  19600390 taaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatccaaaacttgctccagttctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatgcgg 19600489  T
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgag 767  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||| | ||  | ||||||||||||||||    
T  19600490 cttataacaacacttcaaaaattcagttttcctcacaggtactcgccatggcgag 19600544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 488 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17182471 - 17182088
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctc 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17182471 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagaaaacggtttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctc 17182372  T
Q  588 tggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctag 687  Q
    | ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17182371 tcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctccaaaatcatctag 17182272  T
Q  688 gtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcga 787  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  17182271 gtacatgaaactaaccaaattacagcttataacaacactttaaaaatccagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcattcgcga-gcga 17182173  T
Q  788 gcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17182172 gccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 17182088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 406 - 873
Target Start/End: Original strand, 14135395 - 14135847
Alignment:
Q  406 caacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatct 504  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||| |||||  |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14135395 caacataaaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaacagaaaataatccaacaaa-tattgggcagctcgcctcgcgagcatatct 14135491  T
Q  505 gctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatt 604  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||  |||||||||||||||||       ||    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||    
T  14135492 gctcgctatggcgagctccggaaacaagacactcgccatggcgagtt-------aa----aggcgaacagaaatatggtgctctcgggaatt-tgacatt 14135579  T
Q  605 tttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccca 704  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14135580 tttctcactaaataatcaattctaagttccctaatcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcatctaggtacataaaactaccca 14135679  T
Q  705 aaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcac 804  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  14135680 aaatacggcttgtaacaacacttcaaaaatccatattttctcaagggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggaaagccatgaagttgctcac 14135779  T
Q  805 tcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14135780 tcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaatgcaggtttt 14135847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 406 - 873
Target Start/End: Original strand, 14432367 - 14432819
Alignment:
Q  406 caacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatct 504  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||| |||||  |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14432367 caacataaaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaacagaaaataatccaacaaa-tattgggcagctcgcctcgcgagcatatct 14432463  T
Q  505 gctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatt 604  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||  |||||||||||||||||       ||    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||    
T  14432464 gctcgctatggcgagctccggaaacaagacactcgccatggcgagtt-------aa----aggcgaacagaaatatggtgctctcgggaatt-tgacatt 14432551  T
Q  605 tttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccca 704  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14432552 tttctcactaaataatcaattctaagttccctaatcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcatctaggtacataaaactaccca 14432651  T
Q  705 aaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcac 804  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  14432652 aaatacggcttgtaacaacacttcaaaaatccatattttctcaagggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggaaagccatgaagttgctcac 14432751  T
Q  805 tcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14432752 tcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaatgcaggtttt 14432819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 406 - 873
Target Start/End: Original strand, 14128549 - 14129001
Alignment:
Q  406 caacatacaagccatgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatct 504  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||| |||||  |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14128549 caacataaaagccatgcttaat-caacaagataaatcaaccat-caacaacagaaaataatccaacaaa-tattgggcagctcgcctcgcgagcatatct 14128645  T
Q  505 gctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatt 604  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||  |||||||||||||||||       ||    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||    
T  14128646 gctcgctatggcgagctccggaaacaagacactcgccatggcgagtt-------aa----aggcgaacagaaatatggtgctctcgggaatt-tgacatt 14128733  T
Q  605 tttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactaccca 704  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14128734 tttctcactaaataatcaattctaagttccctaatcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcatctaggtacataaaactaccca 14128833  T
Q  705 aaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcac 804  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  14128834 aaatacggcttgtaacaacacttcaaaaatccatattttctcaagggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggttagccatgaagttgctcac 14128933  T
Q  805 tcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14128934 tcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtattggtagaatgcaggtttt 14129001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Original strand, 15339226 - 15339626
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa 571  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||   || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15339226 aaatactggacaactcgcgtcgcgagcacatctactcgctatggagagctcagcaaaaagggcactcgccatggcgagttcgaggcaaactcgaggcgaa 15339325  T
Q  572 cagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcct 671  Q
    |||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||| ||| |||||  |  ||||| |||| ||||||||    
T  15339326 cagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcctcatttccaagttccctattcaactttttgatttaaaaattgcaccagtcct 15339425  T
Q  672 cttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||| |    
T  15339426 ctctaaaatcatctaggtacataaaactacctaaaatacggcttaaaacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagtt-t 15339524  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339525 ctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 15339624  T
Q  872 tt 873  Q
    ||    
T  15339625 tt 15339626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 18958190 - 18957794
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||   | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  18958190 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggtgaactcagaaaacgggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacgaa 18958091  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||  ||||    ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  18958090 aatatggtgctcccgggagttttgacatttttcttactaaaacttcaattctaagctccatattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctct 18957991  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||      ||| |||||||||||| ||        
T  18957990 aaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaacacagcttataacaacaatttgaaaatccagaatctcactcactaacttgccatggcgagtggttctg 18957891  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18957890 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgggcgatgaacttctgtacgggaagaatgcaggtttt 18957794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 488 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 37244057 - 37243673
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37244057 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatgttgctc 37243958  T
Q  588 tggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctag 687  Q
    | ||||    ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  37243957 tcgggagttttgacatttttctcactaaaatttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaaccatttag 37243858  T
Q  688 gtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcga 787  Q
    |||||  |||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||| || | ||  | ||||||||| || |||| ||    ||||||||||||    
T  37243857 gtacattaaactaaccacaatacagcttataacaacaatttgtaaatccagaattcctcacaggtactcgccacggtgagtggttctgctcgcgaggcga 37243758  T
Q  788 gcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37243757 gccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgtgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaatgcaggtttt 37243673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 470 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16952002 - 16951601
Alignment:
Q  470 caaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcg 569  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || | ||   | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16952002 caaaatactaggcaactcgcctcgcgaccacatttgctcgctatggcgaacacatgaaacgggttactcgccatggcgagttcagggcgaactcgaggcg 16951903  T
Q  570 aacagaaatatgg-tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagt 668  Q
    |||| ||| | || |||||| ||      ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16951902 aacaaaaaaaaggctgctctcggcgttt-tgacatttt-ctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagt 16951805  T
Q  669 cctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagt 768  Q
    |||||  |||||||| ||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||    
T  16951804 cctctctaaaatcatttaggtacatttaactaaccaaaatacagcttataacaacaatttgaaaatccagaattcctcacaggtactcgccatggcgagt 16951705  T
Q  769 tgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcag 868  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16951704 tgtctcactcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctttacgggcagaatgcag 16951606  T
Q  869 gtttt 873  Q
    |||||    
T  16951605 gtttt 16951601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 284
Target Start/End: Original strand, 15338785 - 15339046
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15338785 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 15338883  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  15338884 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 15338983  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 284  Q
    |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15338984 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 15339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 2388376 - 2387988
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  2388376 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 2388277  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  2388276 tgctctcgggaaaaatgatatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctactcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatca 2388178  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc-actcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||  ||  |  | ||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  2388177 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttgaaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccacggcgagttg-atctgctcgcg 2388079  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2388078 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-atagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 2387988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 13963800 - 13963422
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  13963800 agctcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggcgagttcacaaaatcactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 13963701  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  13963700 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctaaaacttgttccagtcttcattaatatca 13963602  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  13963601 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcga 13963502  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13963501 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 13963422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 11302852 - 11303052
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11302852 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 11302950  T
Q  164 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  11302951 agcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 11303050  T
Q  264 ac 265  Q
    ||    
T  11303051 ac 11303052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35962955 - 35962701
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35962955 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 35962857  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  35962856 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 35962757  T
Q  221 actgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  35962756 acttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 35962701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Original strand, 14431948 - 14432201
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14431948 caactcatcaccactccactaagacccctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 14432046  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  14432047 ttcattttcaggacctaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctccca 14432146  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14432147 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14432201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15711209 - 15710956
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  15711209 caactcttcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatca 15711111  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||    
T  15711110 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctccca 15711011  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15711010 ctgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15710956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 15838969 - 15839367
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        
T  15838969 actgggtaactcgcctcacgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaa-caggttgctcgccacggcgagttcgaggcgaactcgaggcgagtga 15839067  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  15839068 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgccccggtcctctt 15839167  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttc-acaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |||||||| |||| |||  |||||| ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || ||||| ||  || | ||||||| |||||||||       
T  15839168 taaaatcatttaggcacattaaactatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagtttttcaactgggttgctcgccacggcgagttggtc 15839267  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15839268 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagggatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 15839367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 13453598 - 13453210
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  13453598 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 13453499  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  13453498 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatca 13453400  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||  |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||| |||     |||||||    
T  13453399 tctaggtaccttaaatcattctcaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgatttggtctgctcgcga 13453300  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13453299 ggcgagctatgaagttgctcactcgtcatggcgagcaa-ggctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 13453210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 21757667 - 21758046
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  21757667 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 21757766  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| || | || | |    
T  21757767 tgctctcgggaaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgttccagtcatcattaatacc 21757865  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  21757866 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcg 21757965  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757966 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 21758046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 486 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16843666 - 16843280
Alignment:
Q  486 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||      
T  16843666 tcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcgagct-agcaaaacaggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatatggga 16843568  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| |     
T  16843567 ctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctttataatcgtt 16843468  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || ||||||||| |||||||||     |||||||||    
T  16843467 taggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacggcgagttggtctgctcgcgagg 16843368  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16843367 cgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 16843280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 30271589 - 30271194
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||         
T  30271589 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttactcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgag 30271490  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||     
T  30271489 aatatggggctcttgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatatttttaccctaaaacttgctccagttctcttt 30271390  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||   |  || |||||||||||||||||||         
T  30271389 aaaatcatttaggcacattaaactatcccaaa-acatcttataacaacaattcaaaaatcaagttttgatctgggttactcgccatggcgagttggtctg 30271291  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  30271290 ctcgtgaggcgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggtagaaaacaggtttt 30271194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 26289530 - 26289145
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | | ||||||||||||||||           | ||||||||  |    
T  26289530 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggtttctcgccatggcgagtt-----------caaggcgaacgaa 26289442  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  26289441 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttcccactcaaacttcaattctaagcttcctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctct 26289342  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||| || | ||  | ||||||||| ||||||| ||        
T  26289341 aaaatcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcttataacaacaatttgaaaatccagaattcctcacaggtactcgccacggcgagtggttctg 26289242  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||   ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26289241 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctccctcgccttggcgaacaa-ggctacttgcgaggtgagcgatgaacttctgtacggacagaatgcaggtttt 26289145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 1318133 - 1318519
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  1318133 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 1318232  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || |    
T  1318233 aatcaggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcat 1318331  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |      
T  1318332 taaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggact 1318431  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1318432 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 1318519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 483 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 20019470 - 20019095
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  20019470 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccattgcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 20019371  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || ||||    
T  20019370 tgctctcgtgaaaaatgat-tttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatca 20019272  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| | |||||||||||||||||     ||||||    
T  20019271 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcg 20019173  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 860  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019172 aggcgagcgaagaagttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 20019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14281418 - 14281030
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||           |||||||||||    
T  14281418 aaatactgggcaactcgcctcacgagcacatttgctcgctatggcgagctcagaaaa-caggacactcgccatggcga-----------actcgaggcga 14281331  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
    ||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14281330 acgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcattaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcc 14281231  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || |||| |||| |||||||||    
T  14281230 tctccaaaatcatttaggtacattaaactacccaaaatacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttatac-gggttactagccacggcgagttg 14281132  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
         |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  14281131 gtctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcacgaggcgagcgataaacttctgtacgggcagaaaacaggt 14281033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26089755 - 26089369
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  26089755 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 26089656  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || |    
T  26089655 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcat 26089557  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |      
T  26089556 taaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggact 26089457  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089456 gctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 26089369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 1612584 - 1612825
Alignment:
Q  28 actcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcatt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1612584 actcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcatt 1612682  T
Q  126 c-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  1612683 cattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 1612782  T
Q  224 gttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||| |||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  1612783 tttatgcttatccaactgactccacttgtgtatatctacatac 1612825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5187047 - 5186662
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  5187047 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 5186948  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| || || |     
T  5186947 aattaggtgctctcgggaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttctaacctaaaacttccaccattcatcatt 5186849  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||  || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||      
T  5186848 aaaatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaattaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattg 5186749  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5186748 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagttgctcgcgtggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 5186662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 476 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 35962505 - 35962258
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  35962505 actgggcaactcgcctcgcgagcatacctgctcgctatggcgagttcagaaaacgggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgaacgaa 35962406  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    ||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  35962405 aatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctct 35962306  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaac 723  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35962305 aaaatcatctaggtacataaaactacccaaattacggcttataacaac 35962258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 479 - 872
Target Start/End: Original strand, 12454430 - 12454821
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaa 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||    |||    
T  12454430 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc-gcaaaacaggctactttccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaa 12454528  T
Q  578 tatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    ||||| ||||| |||||   ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||| || | ||    
T  12454529 tatggggctctcgggaattttgacatttt-cacactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacttaaaacttgttctagtcatcattaa 12454627  T
Q  678 aatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcact 777  Q
    |||||| |||| |||  ||| || || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || |||||||||||||||||||     ||    
T  12454628 aatcatttaggcacattaaattatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttaatctgggttactcgccatggcgagttggtctgct 12454727  T
Q  778 cgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  12454728 cgcgaggcgagctatgaagttgctcacttgccttggcgagcaa-ggctactagcgaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaaaacaggttt 12454821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 676 - 873
Target Start/End: Original strand, 15347205 - 15347402
Alignment:
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| |||    
T  15347205 aaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacagcttataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctca 15347304  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15347305 ctcacgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacaggcagaatgcaggtttt 15347402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281569
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactt 14281724  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctac 261  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  14281723 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 14281624  T
Q  262 ataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaac 316  Q
    |||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14281623 atacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccaaattacaac 14281569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 482 - 863
Target Start/End: Original strand, 42058926 - 42059306
Alignment:
Q  482 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  42058926 tagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 42059025  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    || |||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||    
T  42059026 gtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcacctaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaaaat 42059124  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  42059125 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggattgctcgc 42059224  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42059225 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagtgatgaacttctgtacgggcagaa 42059306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12591812 - 12591635
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12591812 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12591713  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12591712 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 12591635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 37285584 - 37285960
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-ggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||   ||  |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |||    
T  37285584 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatgtcgagttcacaaaactacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaataggt 37285682  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | |  |||||    
T  37285683 gctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactccaacttctatactaagctccctaatcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattattatcat 37285781  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||||||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  37285782 ctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaactttttaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcgag 37285881  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    || ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37285882 gcaagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaa 37285960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 13006306 - 13006508
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13006306 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13006405  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  13006406 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 13006505  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  13006506 tac 13006508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 14421354 - 14421532
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  14421354 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 14421453  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  ||||||   |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14421454 gaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 14421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 16676192 - 16676393
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  16676192 atgcatgtggtaccatat-taaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 16676290  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||  |||||||||||    
T  16676291 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 16676390  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  16676391 tac 16676393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Original strand, 11879443 - 11879819
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||     
T  11879443 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggta 11879542  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||||    
T  11879543 ctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctactcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatcatc 11879641  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||||||||||| |    ||||||||    
T  11879642 taggtaccttaaaccatccctaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatggcgagttggactgttcgcgagg 11879741  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11879742 cgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11879819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26120166 - 26119790
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  26120166 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 26120067  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| |||||||   ||   ||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||||    
T  26120066 tgctctcgggaaaagccat---tttctcactcaaatcccaattataagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatca 26119970  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  26119969 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcga 26119870  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26119869 ggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 26119790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 479 - 691
Target Start/End: Original strand, 49159113 - 49159323
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaa 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || | || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||    
T  49159113 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcac--aaactggctgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaa 49159210  T
Q  578 tatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaa 677  Q
    |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||    
T  49159211 ttaggtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcattattaa 49159309  T
Q  678 aatcatctaggtac 691  Q
    ||||||||||||||    
T  49159310 aatcatctaggtac 49159323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 642923 - 643301
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   || ||  ||    
T  642923 agctcgcttcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtggacattagg 643022  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  643023 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatccccattctaagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaatatca 643121  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  643122 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcg 643220  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  643221 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 643301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 2439258 - 2439636
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  ||    
T  2439258 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaacatcagg 2439357  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| | || ||||    
T  2439358 tgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctatgcatctttttaacctaaaactttcaccattcctcattaatatca 2439456  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || | |||||||||||||||||| |   ||||||    
T  2439457 tctaggtactttaaaccatccccaaaacgtcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggttactcgccatggcgagttggactgctcgcg 2439555  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2439556 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 2439636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 48987725 - 48987339
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  48987725 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctactcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 48987626  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  48987625 aattaggtgctctcgggaaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctt 48987527  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |     
T  48987526 tattatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggac 48987428  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48987427 tgctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaa 48987339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 602 - 866
Target Start/End: Original strand, 3328320 - 3328584
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||  ||||| ||||||||| || || ||| |||   |||||||||  |||||||||||||||| | |||||      
T  3328320 atttttctcactaaatcttcatttttaagtaccctattcatctttttaatctgaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatctaggtactcaaaactga 3328419  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3328420 ccaaattacggcttataacaacaatctgaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacggcgagttgtcttactcgcgaggcgagctatgaagttgct 3328519  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgc 866  Q
    |||||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3328520 cactcgccttggcgagcataggctactcgctaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgc 3328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13124148 - 13123971
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13124148 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13124049  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13124048 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 13123971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14945515 - 14945245
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||  || | ||||||     
T  14945515 atttttctcactaaaacttcaattctaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgcaccagtcctctataaaatcatttagaaactcaaaactat 14945416  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | | |  |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  14945415 ccatatttcatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgctcacaggtactcgccacggcgagttgttttgctcgcgaggcaagccatgaagttgct 14945316  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14945315 cactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgacgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 14945245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15373108 - 15372838
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||  || | ||||||     
T  15373108 atttttctcactaaaacttcaattctaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgcaccagtcctctataaaatcatttagaaactcaaaactat 15373009  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | | |  |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  15373008 ccatatttcatcttataacaacaatttgaaaatccagttttgctcacaggtactcgccacggcgagttgttttgctcgcgaggcaagccatgaagttgct 15372909  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15372908 cactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgaagaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 15372838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 40684567 - 40684180
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  40684567 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcaccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 40684468  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa--tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||  |||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||    
T  40684467 aattaggtgctctcgggaaaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatct 40684369  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgta 772  Q
    | |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |    
T  40684368 ttattatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttgga 40684270  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
       ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684269 ctgctcgcaaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 40684180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 476 - 860
Target Start/End: Original strand, 750210 - 750593
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    | ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  750210 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctactcgccatggcgagttcacaagaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 750309  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  750310 aattaggtgctctcgggaaaaaatgctatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctt 750408  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |  |||||||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| |  ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |     
T  750409 tattatcatctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaac-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggac 750507  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 860  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  750508 tgctcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 750593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 478 - 808
Target Start/End: Original strand, 23521369 - 23521701
Alignment:
Q  478 tgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaa 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  23521369 tgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctc-gcaaaacaggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaa 23521467  T
Q  577 atatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaa 676  Q
    |||||| ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||| || | |    
T  23521468 atatggggctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttctttagtcatcatta 23521567  T
Q  677 aaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcac 776  Q
    ||||||| |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||  ||  || | ||||||| |||||||||     |    
T  23521568 aaatcatttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaattcaaaaatcaagttttcaactgggttgctcgccacggcgagttgctctgc 23521667  T
Q  777 tcg--cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23521668 tcgaacgaggcgagctatgaagttgttcactcgc 23521701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 495 - 863
Target Start/End: Original strand, 12461902 - 12462268
Alignment:
Q  495 gagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctgggga 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||    
T  12461902 gagcacatctgctcgctatggcgagctc-gcaaaacaggctactcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatatggggctctcggga 12462000  T
Q  594 aaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacac 693  Q
    |   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||| || |||| || | |||||||| |||| |||     
T  12462001 attttgacatttt-cacactcaaacctcaattctaagcttcatattcatctttttaacttaaaacttgttctagtcatcattaaaatcatttaggcacat 12462099  T
Q  694 gaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatg 793  Q
     |||||| || ||| |   |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || |||||||||||| ||||||     |||| ||||||||| |||    
T  12462100 taaactatcccaaaaatatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttaatctgggttactcgccatggtgagttggtctgctcgtgaggcgagctatg 12462199  T
Q  794 aagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12462200 aagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaa 12462268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26113553 - 26113174
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||     || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  26113553 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaaacactagctcgccatggcgacttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcag 26113454  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  |||    
T  26113453 gtgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatcccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatc 26113355  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||| ||||||||||||| |   || |||    
T  26113354 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcaccatggcgagttggactgcttgcg 26113255  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113254 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 26113174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30602658 - 30602280
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |     
T  30602658 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaga 30602559  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| || |||| |  ||||    
T  30602558 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatcttttaaacttaaaactttcaccattcatctttatcatca 30602460  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || |||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  30602459 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttaatatgggctactcgccatggcgagttggactgctcgcg 30602361  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    || |||||  |||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602360 agacgagctgtgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 30602280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 4279963 - 4280140
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  4279963 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4280061  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  4280062 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 4280140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16109274 - 16109067
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatca 132  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  16109274 acgactccattaagactcctcaataatgcgcatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttca 16109176  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  16109175 ggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgct 16109076  T
Q  232 tatgcaact 240  Q
    |||||||||    
T  16109075 tatgcaact 16109067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 19616295 - 19616472
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  19616295 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 19616393  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  19616394 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 19616472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 2281459 - 2281839
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  2281459 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacggaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattag 2281558  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    ||    
T  2281559 gtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcctcttttttat 2281657  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||     |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  2281658 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatttgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 2281756  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281757 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 2281839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 17650429 - 17650629
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17650429 atgcatgtggtaccatattt-aggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 17650527  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||  |||||||||||    
T  17650528 gaacaactagtgttccaccgc-ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 17650626  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  17650627 tac 17650629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 8197004 - 8196618
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |    
T  8197004 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaa 8196905  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    ||   ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||    
T  8196904 aaacaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatctt 8196806  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtat 773  Q
     |  |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||  |  || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |     
T  8196805 tactatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaattttaag-ttttgtctgggcttactcgccatggcgagttgcac 8196707  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196706 tgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 8196618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 13020081 - 13020469
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  13020081 ctcgcctcgcgagcacatttgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgagtaagaatatggt 13020179  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    | ||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| | |||| ||||||||| || || ||| ||| ||||  |||||  ||||||||    
T  13020180 gttctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagtttcctattcatctttttaatctgaaaattgttccaaacctctctaaaatcat 13020279  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    ||||| |||  |||||| ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | |||  || ||| ||||||||| |||||||||     || |||||    
T  13020280 ctaggcacataaaactatccatattacagcttataacaacacttcaaaaatcatgttttcaactaggttactcgccacggcgagttggtctgctagcgag 13020379  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  13020380 gcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctactagcgaggcgagcgatgaacctctgtacgggcagaaaacaggtttt 13020469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 46174699 - 46175073
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  46174699 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgcttgctcgccctggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 46174797  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || || | ||||||    
T  46174798 gtgctctcgggaatt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaactttctccactcatcattaaaatc 46174896  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    || |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||| | ||||||| |||||||||     |||||    
T  46174897 atttaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccacggcgagttggtctgctcgc 46174995  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46174996 gaggcgagctatgaagttg----ctcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 46175073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12711077 - 12710900
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12711077 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12710978  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  12710977 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccact-tgatatttatgcaacta 12710900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 13742505 - 13742682
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13742505 atgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13742604  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13742605 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccact-tgatgtttatgcaacta 13742682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20328425 - 20328224
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  20328425 atgcatgtggtaccatata-caggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 20328327  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  20328326 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 20328227  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  20328226 tac 20328224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Original strand, 6411792 - 6412023
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcagg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||    
T  6411792 actccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcattttcagg 6411890  T
Q  135 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||  ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  6411891 acataagtcctcaccgctatacactgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgctt 6411990  T
Q  233 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6411991 atgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 6412023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 11899107 - 11898729
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  11899107 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 11899008  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| | ||| || || | |||||||    
T  11899007 tgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatcccatttctaagttccctattcatctttttaatccaaaactttcaccattcatcattaaaatca 11898909  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  11898908 tccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagttggtctgctcgcg 11898810  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11898809 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcacgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11898729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 33405027 - 33405405
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     ||||  ||    
T  33405027 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgtgtgaaaatcagg 33405126  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  33405127 tgctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatcccatttataagttccctattcatctttttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatca 33405225  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaagg-ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    || ||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||| | | || |||||||||||||||||| |     ||||||    
T  33405226 tccaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgatatgggctactcgccatggcgagtcggtctgctcgcg 33405324  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33405325 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 33405405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11390473 - 11390302
Alignment:
Q  96 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  11390473 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 11390374  T
Q  194 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11390373 aaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 276
Target Start/End: Original strand, 14128244 - 14128383
Alignment:
Q  138 taagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14128244 taagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgc 14128343  T
Q  237 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14128344 aactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14128383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 40922726 - 40922340
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  40922726 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcgcaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaaa 40922627  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||| | ||| || || |    
T  40922626 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaaactctctattcatctttttaatctaaaactttcaccattcatcat 40922528  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgt 771  Q
     || |||||||||||||   ||||  | |||||||||   |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| ||||||||||||||||||      
T  40922527 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaata--tcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttag 40922431  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922430 actgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 40922340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 485 - 691
Target Start/End: Original strand, 6412241 - 6412447
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||   |  |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  6412241 ctcgcctcgcgagtacttctactcgctatggcgaactcaaggaaagggtcactcgccacggcgagttcaaggcgaacttgaggcgaacagaaaaaagctg 6412340  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    ||||  |||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  6412341 ctctcaggagttttgacatttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaaccatc 6412440  T
Q  685 taggtac 691  Q
    |||||||    
T  6412441 taggtac 6412447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11383985 - 11383814
Alignment:
Q  96 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||    
T  11383985 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacttaagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaacaac 11383886  T
Q  194 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11383885 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 680 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15085529 - 15085337
Alignment:
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||      |||||||||||||||| ||    | ||    
T  15085529 tcatttaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttctgcacg 15085430  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15085429 cgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttgccgaacaa-ggctactcgcaaggcgagcgatgaacttctgtacggacagaatgcaggtttt 15085337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 476 - 632
Target Start/End: Original strand, 19439676 - 19439832
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  19439676 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgatctcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgagtga 19439774  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagct 632  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19439775 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagct 19439832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 265
Target Start/End: Original strand, 18606896 - 18607067
Alignment:
Q  96 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||    
T  18606896 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcagaacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaaccac 18606995  T
Q  194 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     | || |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  18606996 aaggcgttccagagtcgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 18607067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 2026018 - 2025642
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    ||||  ||||    
T  2026018 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagtgaaaatcaggtg 2025919  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| | ||| ||||||| |  || |||    
T  2025918 ctctcgggaaaaatgtcatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaatctaaaactttcaccattcctctttattattatc 2025820  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      || ||||||||||||||||||| |    ||||||||    
T  2025819 taggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggttactcgccatggcgagttggactgttcgcgagg 2025720  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  2025719 cgagtgatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaa 2025642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 489 - 863
Target Start/End: Original strand, 32627783 - 32628156
Alignment:
Q  489 cctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa--cagaaatatggtgct 586  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||   |||||| |||||||||  |||||||||||||||||   || ||||  ||||||    
T  32627783 cctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacagtagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgca-aaatcaggtgct 32627881  T
Q  587 ctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatcta 686  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||| || |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||  || || | |||||||||||    
T  32627882 ctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcgaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccacccatcatcattaaaatcatcta 32627980  T
Q  687 ggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcg 786  Q
    |||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||||| ||||||| |   || ||||||||    
T  32627981 ggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccatgacgagttggactgcttgcgaggcg 32628080  T
Q  787 agcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    || ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32628081 agtgatgatgttgttcactcgcga-ggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 32628156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15437216 - 15436946
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  | |||| |||  |||||||| ||||||| | ||||||     
T  15437216 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcctagtcatctctaaaatcatttaggtactcaaaactaa 15437117  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| | | |||||| |  || ||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |    
T  15437116 ccaaattacatcttataacaacaatctgaaaatcaaagttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgct 15437017  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||  | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15437016 cactcgctg-ggcgagacaggactactcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 15436946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21232167 - 21232009
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  21232167 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21232068  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  21232067 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 21232009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 49150954 - 49151339
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||   | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  49150954 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaac--gctagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 49151051  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||   |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||    
T  49151052 aaaacaggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatct 49151150  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgta 772  Q
    | ||||||||||| ||||   |||| || |  || ||  |||| |||||| ||| |||||| || |||||     ||| ||||||||||||||||||| |    
T  49151151 ttaaaatcatctaagtaccttaaaccactcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaat-cacattttgtttgggcttactcgccatggcgagttgga 49151249  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
       ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  49151250 ctgctcgcgaggcgagtggtgacattgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacgtcagtacggccagaa 49151339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 49157644 - 49158029
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||   | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  49157644 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaac--gctagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 49157741  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||   |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||    
T  49157742 aaaacaggtgctctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatct 49157840  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgta 772  Q
    | ||||||||||| ||||   |||| || |  || ||  |||| |||||| ||| |||||| || |||||     ||| ||||||||||||||||||| |    
T  49157841 ttaaaatcatctaagtaccttaaaccactcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaat-cacattttgtttgggcttactcgccatggcgagttgga 49157939  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
       ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  49157940 ctgctcgcgaggcgagtggtgacattgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacgtcagtacggccagaa 49158029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18436964 - 18436757
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    ||||  ||    
T  18436964 agctcgcctcgcgagcacaactgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaattcgaggcgagtgaaaatcagg 18436865  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || | || ||||    
T  18436864 tgctctcgggaaaaatgacatttt-cacactcaaacttctatactaagctccctattcatctttttaacctgaaaattgttccagtcttcattaatatca 18436766  T
Q  683 tctaggtac 691  Q
    |||||||||    
T  18436765 tctaggtac 18436757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 751 - 863
Target Start/End: Original strand, 49159405 - 49159516
Alignment:
Q  751 ctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttc 850  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  49159405 ctactcgccatggcgagttggtctactcgcgaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-aaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttc 49159503  T
Q  851 tgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||    
T  49159504 tgtacgggcagaa 49159516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11220311 - 11220086
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  11220311 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggac 11220218  T
Q  137 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  11220217 ataagtcctcaccgcttaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttct 11220118  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  11220117 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 11220086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 536 - 863
Target Start/End: Original strand, 11340168 - 11340493
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  11340168 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaacatcaggtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccc 11340266  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    || ||||||||| |||||| ||||| | ||| |  || | || |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| |||||||    
T  11340267 tattcatctttttaacctagaactttcaccatttatcattaatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatc 11340366  T
Q  736 cagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgag 834  Q
     || ||||  | |||||  ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||  |||  | ||||||||    
T  11340367 aag-ttttatccaggcttgctcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagtgatgatgttgctcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgag 11340464  T
Q  835 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  11340465 gcgagcgatgaacatcagtacgagcagaa 11340493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 803 - 873
Target Start/End: Original strand, 19600530 - 19600600
Alignment:
Q  803 actcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19600530 actcgccatggcgagcaaaggctactcgcgtggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 19600600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 15710782 - 15710671
Alignment:
Q  449 caacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcga 548  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||    
T  15710782 caacaacagaaatcaatccaacaaa-tactgggcaactcaactcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaagggcactcgccatggcga 15710684  T
Q  549 gttggaggcgaac 561  Q
    ||| |||||||||    
T  15710683 gttcgaggcgaac 15710671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 779 - 873
Target Start/End: Original strand, 13026582 - 13026676
Alignment:
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  13026582 gcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacctctgtacgggcagaaaacaggtttt 13026676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 81723 - 81590
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||     
T  81723 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaatttgtctcagtcctctataaaatcatctaggcactcgaaactaa 81624  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  81623 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatc 81590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Original strand, 15632003 - 15632123
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  15632003 tacttgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagc-acagctactcgcgaggcgagcgatgaatatca 15632101  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  15632102 gtacgggcagaaaacaggtttt 15632123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 475 - 873
Target Start/End: Original strand, 19152255 - 19152644
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca 573  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||| ||||||||  |||||||||           |    
T  19152255 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac----------ga 19152344  T
Q  574 gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||| | |||||||| ||||    ||| ||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  19152345 gaaaaagggtgctctcgggatttttgacatttttctcactagaacttcatttttaaactccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 19152444  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
      |||| |||  ||| || | |||||| ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| | ||||     ||||| | ||||||||| ||     
T  19152445 ctaaaaacattcaggcactcaaaactatccaatttacaccttataacaacaatttgaaaatcatgatctctcactcacttactccctatggcgagtggtt 19152544  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19152545 ctgctcgcgatgcgagctatgaagttgttcactcgc-gaggcgggacaaggctactcgcagggcgagcgatgaatgtcagtacgggcagaatgcaggttt 19152643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 475 - 873
Target Start/End: Original strand, 20751654 - 20752043
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaaca 573  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||| ||||||||  |||||||||           |    
T  20751654 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac----------ga 20751743  T
Q  574 gaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||| | |||||||| ||||    ||| ||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  20751744 gaaaaagggtgctctcgggatttttgacatttttctcactagaacttcatttttaaactccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 20751843  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgta 772  Q
      |||| |||  ||| || | |||||| ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| | ||||     ||||| | ||||||||| ||     
T  20751844 ctaaaaacattcaggcactcaaaactatccaatttacaccttataacaacaatttgaaaatcatgatctctcactcacttactccctatggcgagtggtt 20751943  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
       ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20751944 ctgctcgcgatgcgagctatgaagttgttcactcgc-gaggcgggacaaggctactcgcagggcgagcgatgaatgtcagtacgggcagaatgcaggttt 20752042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306034
Alignment:
Q  178 caccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 36306034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 781 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12399339 - 12399258
Alignment:
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399339 gaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcaagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 12399258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 12695293 - 12695389
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12695293 ctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgtcggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 12695389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 15097611 - 15097341
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || || |||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  15097611 atttttctcactaaatcttcatttttaggctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 15097512  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  || | |||| ||||   | ||||||||||||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||    
T  15097511 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatga-tctcac-aggcacttgctcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggtgagccatgaagtt 15097414  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    | ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  15097413 gctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcaatgaacatcagcacgggcagaatgcaggttt 15097341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 19146228 - 19146324
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  19146228 ctcgcgaggcgagctatgaagttgttcactcgc-gaggcgagacaaggctactcgcggggtgagcgatgaatgtcagtacaggcagaatgcaggtttt 19146324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 20745627 - 20745723
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  20745627 ctcgcgaggcgagctatgaagttgttcactcgc-gaggcgagacaaggctactcgcggggtgagcgatgaatgtcagtacaggcagaatgcaggtttt 20745723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 23442600 - 23442686
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  23442600 tactgggaaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcatgaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 23442686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Original strand, 45185849 - 45186236
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||           |||    
T  45185849 actgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac----------gaga 45185938  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    || ||||| |||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||| ||| ||  ||||| |||  ||| ||||||      
T  45185939 aaaatggttctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatccttttaatttaaaaattgtcccaatcctctct 45186038  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||| ||||  |||| ||||||| | | |||||| || || ||||      |||||||||||||||| ||        
T  45186039 aaaatcatctaggcactcaaaactaaccaatatacaccttataacaacaatctgaaaatcaaggttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctg 45186138  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||  || |||| |||  |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  45186139 ctcgcgaggcgggctatgaagattgctcactcgc-gagacgagacaa--gctactcgtcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaatgcaggttt 45186235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14287592 - 14287496
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  14287592 ctcgctaggcgagccatgaagttgctcactcgcgt-ggcgagcacaagctactcacgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaaaacaggtttt 14287496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 21518818 - 21518685
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | |||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||| |||   |||||||||| |||| |||||||| || | |||| |     
T  21518818 atttttctcactaaatcttcaattttaagctcactaaacatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctcttcaaaaacatctaggcactcaaaaccat 21518719  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21518718 ccaacttacgccttataacaacattttaaaaatc 21518685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 46681839 - 46681568
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||| ||| || |||||| |||   |||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  46681839 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccatattcatcattttaatctaaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 46681740  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||| | |||      | |||||||||| |||| ||    |||||||||||||| |||||||||     
T  46681739 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcaggcacttgctcgccatggtgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgc 46681640  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |   |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46681639 tcactcgc-gaggcgag-acgagctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 46681568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 15142730 - 15143000
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  |||| |||||| | || | ||||||     
T  15142730 atttttctcactaaaacttcaattttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatctaagcactcaaaactat 15142829  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
     |||  ||   |||| ||||||| | | |||||  ||||| ||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |    
T  15142830 acaacttataacttataacaacaatctgaaaattaagattctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgct 15142929  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||| | ||||||  | |||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15142930 ccctcgcga-ggcgagaca-ggctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcagatttt 15143000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 17726081 - 17725958
Alignment:
Q  536 ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccc 635  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  17726081 ctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcaggtgctctcgggaaaaatgcca-ttttctcactcaaatcccatttctaagttccc 17725983  T
Q  636 taatcatcttttaaacctaaaactt 660  Q
    || ||||||||| || | |||||||    
T  17725982 tattcatctttttaatccaaaactt 17725958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Original strand, 12695000 - 12695087
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  12695000 atactgggaaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 12695087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 14169225 - 14169055
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaa-tatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacct 653  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| ||  |||||||||| ||||||||| || ||    
T  14169225 ggcgaactcaaggcgaactgaaaatagggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcattttgaagctccctattcatctttttaatct 14169126  T
Q  654 aaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaaca 724  Q
    |||| |||  ||||||||||  |||||||| |||  || | |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14169125 aaaatttgtcccagtcctctctaaaatcatttagccactcaaaactatccataatacggcttataacaaca 14169055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 14173472 - 14173302
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaa-tatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacct 653  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| ||  |||||||||| ||||||||| || ||    
T  14173472 ggcgaactcaaggcgaactgaaaatagggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcattttgaagctccctattcatctttttaatct 14173373  T
Q  654 aaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaaca 724  Q
    |||| |||  ||||||||||  |||||||| |||  || | |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14173372 aaaatttgtcccagtcctctctaaaatcatttagccactcaaaactatccataatacggcttataacaaca 14173302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Original strand, 19145973 - 19146023
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19145973 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 19146023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Original strand, 20745372 - 20745422
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20745372 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 20745422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14250029 - 14249910
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  14250029 actcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccgtgaagattgctcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcggggcgagcgatgaatgtct 14249932  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14249931 gtacgggcagaatgcatgtttt 14249910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Original strand, 12554921 - 12555239
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| || ||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||| ||| ||||||| | || |||    
T  12554921 ggcgaacgcaaggcgaactgaaatagggcgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctctctattcatcttattaatcta 12555020  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggcta 753  Q
    ||| |||  | ||||||||  ||||||||||| | || | |||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||   |||      ||    
T  12555021 aaaattgtcctagtcctctctaaaatcatctatgcactcaaaactaaccaaattacagcttataacaaaatttcaaaaatcatgatcactcagtcacata 12555120  T
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctg 852  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | | |||||||| || ||| |||||||||  || |    
T  12555121 ctcgccatggcgagtggttttgctcgcgaggcaagccatgaagttgttcacttgc-gaggcgag-actagctactcgtcggggcaagcgatgaatgtcag 12555218  T
Q  853 tacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  12555219 tacgggcagaatgaaggtttt 12555239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 46348399 - 46348231
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  46348399 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccaggcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 46348300  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  46348299 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttg 46348231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 826 - 873
Target Start/End: Original strand, 10520536 - 10520583
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  10520536 actcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcataatgcaggtttt 10520583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 573 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 12208233 - 12208074
Alignment:
Q  573 agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctc 672  Q
    ||||| |||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  12208233 agaaaaatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctgaaaattgccccagtcctc 12208134  T
Q  673 ttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaa 732  Q
    |  |||| |||| ||| || | |||| | ||||  |||| |||| ||||||| |||||||    
T  12208133 tctaaaaacatccaggcactcaaaaccatccaacttacgtcttataacaacaatttaaaa 12208074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 525
Target Start/End: Original strand, 18009702 - 18009753
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18009702 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcagg 18009753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 20579376 - 20579337
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20579376 ggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtttt 20579337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Original strand, 13318214 - 13318300
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  13318214 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatcattttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctagg 13318300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 15690368 - 15690433
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||    
T  15690368 ctcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgaactcaagaaatgagttactcgctatggcgagt 15690433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 15697961 - 15698026
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||    
T  15697961 ctcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgaactcaagaaatgagttactcgctatggcgagt 15698026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16475782 - 16475678
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||| ||||| ||| || | ||||||     
T  16475782 atttttctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaattcatccaggcactcaaaactaa 16475683  T
Q  702 ccaaa 706  Q
    |||||    
T  16475682 ccaaa 16475678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37244484 - 37244401
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37244484 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 37244401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3289911 - 3289754
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagag 207  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| |||  || ||| ||||||||||| | || |||||| |    
T  3289911 gaatggttaaagcattcat-tcaggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccaggg 3289813  T
Q  208 ccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||   || ||||| || ||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  3289812 ccagggccctcccgcttttatgattatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 3289754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12800935 - 12800804
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||  |||| |||| ||| || | ||||||     
T  12800935 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccaggcctctctaaaaacatccaggcactcaaaactaa 12800836  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaa 733  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  12800835 ccaaattacaccttataacaacaatttaaaaa 12800804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Original strand, 15142612 - 15142699
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  15142612 atactgggaaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgttatggcgaactcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 15142699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 16073731 - 16073684
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16073731 actgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactca 16073684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Original strand, 23442950 - 23442989
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23442950 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 23442989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 775 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 810692 - 810650
Alignment:
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  810692 actcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 810650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 776 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 12255333 - 12255264
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaa 846  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||||    
T  12255333 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctacggcgag-aatcatcactcgggaggcgagcgatgaa 12255264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 14039072 - 14039158
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  | |||  | ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  14039072 tactgggcaactcgtctcgcgagcacatctgctcgatatggcgaactccagaaatgggttactcgctatggcgagtacgaggcgaac 14039158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 14349102 - 14349188
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  | |||  | ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  14349102 tactgggcaactcgtctcgcgagcacatctgctcgatatggcgaactccagaaatgggttactcgctatggcgagtacgaggcgaac 14349188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 2279660 - 2279619
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  2279660 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 2279619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 14250220 - 14250135
Alignment:
Q  563 cgaggcgaac-agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatctttt 647  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  14250220 cgaggcgaacgagaaaaatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttt 14250135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 16219257 - 16219216
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16219257 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 16219216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16668215 - 16668182
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16668215 ctcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggcga 16668182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17642585 - 17642552
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17642585 ctcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggcga 17642552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 22073496 - 22073537
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22073496 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 22073537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 496; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 114 - 872
Target Start/End: Original strand, 40549 - 41304
Alignment:
Q  114 ggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40549 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccgaag 40648  T
Q  214 ctctcccactgttatgttta-tgcaactaatcccctt-gagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcaccatccaattt 311  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||    
T  40649 ctcttccactgttatgtttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacata-tatatgattcaccaatcaactt 40747  T
Q  312 acaacttttaagtgaattttaattaaatacaacatacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacat 411  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||  |||  | |||| |||||||| ||||| | ||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  40748 acatcttt-aaggaaattttaattatatacaacacacat--cagtcaacatccattcatca-aaccaactaaagcatccagggaaa-tatatatcagcat 40842  T
Q  412 acaagccatgct-taattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcg 509  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40843 acaagccatgcaataattcaacaaaatacaccatccaaacaacaacagaaatta-accaaccaaatactgggcagctcgcctcgcgagctcatctactcg 40941  T
Q  510 ctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttct 609  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40942 ctatggcgagctcagggaaacaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctcgggaaaaatgacatttttct 41041  T
Q  610 cactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaata 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41042 cactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttgaacttaaaacttgctctagtcctcttaagaatcatctaggtacacgaaactacccaaaata 41141  T
Q  710 cggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 809  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142 cggcttataacaactttttcaaaatccagatttttacaaggttactcgccatggcgagctgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgct 41241  T
Q  810 aaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41242 atggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttcagtacgggcagaatgcaggttt 41304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36994 - 36793
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  36994 atgcatgtggtaccataa-tcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 36896  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  36895 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 36796  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  36795 tac 36793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8577 - 8493
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577 caacttatcaccactccactaagactcctctaaacccccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44057 - 43965
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatacca 267  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44057 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgctttaatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 43965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14714 - 13868
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14714 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 14616  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  14615 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 14516  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    || ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||     
T  14515 cttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatatg-tatatgactcaccactccaatttacaacattc 14417  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| |||||    
T  14416 atgtataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcc 14321  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||  |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14320 atgcttaat-catcaagataaatcaaccat-caacaacagaaatcaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 14224  T
Q  518 agctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||    
T  14223 agctcaggaaa-caggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaa 14125  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctta 716  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14124 tcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacccaaaatacggctta 14025  T
Q  717 aaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcga 816  Q
     ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  14024 taacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcga 13925  T
Q  817 gcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13924 gcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 13868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 100 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 6585
Alignment:
Q  100 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaag 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagg 7257  T
Q  198 cattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgat 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  |  |||||||     
T  7256 cgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatccaactgtcccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgtg-tatatgac 7158  T
Q  298 tcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccaggg 394  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||  |  ||||||| ||| || |||||||  |||| | |||| |||||| |||||||    ||| |||||||      
T  7157 tcaccactccaatttacaacattcatgtataacttaattagataaaagcatacatc-cagccaacatccattcattacaaccaatttagaacatccag-- 7061  T
Q  395 aaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaacaaa-taaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcg 493  Q
     ||| ||| | ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| |||  |||||| | ||| ||  |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7060 -aaaaatacaccaacataaaagccatgcttaat-catcaaaataaatcaaccat-caacaacataaaccaatccaacaaa-tactgggcaactcgcctcg 6965  T
Q  494 cgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctgggg 592  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6964 cgagcacatctgcttgctatggcgagctcaggaaa-caggacacttgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcggg 6866  T
Q  593 aaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtaca 692  Q
    |    ||  |||||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  || | |||||  ||||||||||||| ||     
T  6865 agttttgtcatttttctcactaaaccatcaattctaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtccctgacctctctaaaatcatctaggcact 6766  T
Q  693 cgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgat 792  Q
      |||||| |||   ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6765 taaaactatccattttacagcttataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccat 6666  T
Q  793 gaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||  ||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6665 gaagtttctcactcgccttggcgagcaaagtctactcgcgaggcgagcgatgaactcttgtacgggcagaatgcaggtttt 6585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 51189 - 50341
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51189 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 51091  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||    
T  51090 ttcgttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccgaagctctccca 50991  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    || ||||| |||||||||| | |  |||| |||||||||||||  | | |||||| ||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||     
T  50990 cttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacataaaacctaacctatacatatatatg-tatatgacccaccactccaattcacaacattc 50892  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaaccatccaaga-catccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||    ||| |||||||   ||| ||| | ||||||| |||||    
T  50891 atgtataacttaattaaataaaagcatacatc-cagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcc 50796  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaa-tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 516  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50795 atgcttaat-caacaagataaatcaaccatt-aacaacagaaatcaatccaacaaaaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 50698  T
Q  517 gagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactca 615  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |    
T  50697 gagctcaggaaa-caggacactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaa 50599  T
Q  616 aacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctt 715  Q
    | | |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50598 atcatcaattataagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcattcaggtacataaaactacccaaaatacggctt 50499  T
Q  716 aaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcg 815  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||    
T  50498 ataacaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaacttgctcactcgccttggcg 50399  T
Q  816 agcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398 agcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 50341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 872
Target Start/End: Original strand, 258633 - 259477
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  258633 caactcatcaccactccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagca 258731  T
Q  124 ttctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    |||   ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  258732 ttcatttcatgacatatgtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac 258831  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  258832 tgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaacctatgcatatatgt-gtatatgactcaccactccaatttacaacattca 258930  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcca 419  Q
    |||  |  ||||||||||| || |||||| | |||| |||||| |||||| | |||| ||  |  |||||||   |||| ||| | ||||||| ||||||    
T  258931 agtataacttaattaaataaaagcataca-tccagccagcatccattcattaaaaccaatatagaacatcca---aaaaaatacaccaacataaaagcca 259026  T
Q  420 tgcttaattcaaca-aataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| || || | | |||| ||||  ||  ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  259027 tgcttaa-tcatcaggacaaaccaacc-atctacaacagaatccaatccaac-aaatattgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 259123  T
Q  519 gctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaac 618  Q
    ||||||| ||   || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    ||| |||||||||||| || |    
T  259124 gctcaggaaaaagggcactcgccatggcgagttcgaggtgaactcgaggcgaacagaaaaatgctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatc 259223  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||||||  | |||||| |||| | ||||||||  |||||||| |||  || | |||||| | | | | |  |||| |    
T  259224 ctcatttccaagttccctattcatctttttgatctaaaaattgcactagtcctctctaaaatcatttagacactcaaaactatctatatttcatcttata 259323  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||    
T  259324 acaacacttcaaaaatccagtttttctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcacttgcgaggtgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagc 259423  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  259424 aaaggctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggttt 259477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 265059 - 265893
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  265059 caactcatcaccactccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagca 265157  T
Q  124 ttctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    |||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  265158 ttcatttcatgacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac 265257  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  265258 tgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaacctatgcatatatgt-gtatatgactcaccactccaatttacaacattca 265356  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcca 419  Q
    |||  |  ||||||||||| || |||||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||  |  ||||||||   ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  265357 agtataacttaattaaataaaagcataca-tccagccagcatccattcattacaaccaatatagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcca 265452  T
Q  420 tgcttaattcaaca-aataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||| ||| ||  | ||| || || | | |||| ||||  ||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  265453 tgcttaa-tcatcaggacaaaccaacc-atctacaacagaatccaatccaac-aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 265549  T
Q  519 gctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaac 618  Q
    ||||||| ||   || ||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    ||| |||||||||||| || |    
T  265550 gctcaggaaaaagggcactcgccatggcgagt-----------tcgaggcgaacagaaaaatgctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatc 265638  T
Q  619 ctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaa 718  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||  || | |||||| | | | | |  |||| |    
T  265639 ctcatttccaagttccctattcatcttttagatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcatttagacactcaaaactatctatatttcatcttata 265738  T
Q  719 acaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagc 818  Q
    |||||| || |||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||| |||    
T  265739 acaacacttcaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggtgagctatgaagttgctcactcgccttggcaagc 265838  T
Q  819 aatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  265839 aaaggttactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgggcagaatgcaggtttt 265893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 17930 - 17854
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  17930 ctcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 17854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 17591 - 17552
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17591 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 17552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17824 - 17753
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||    
T  17824 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctct 17753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 871
Target Start/End: Original strand, 41890 - 42717
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41890 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 41988  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  41989 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctccca 42088  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    || ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| ||  |||| || |||||| ||||| ||||||  ||     
T  42089 cttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacctaacctatgcatatatat-gtataagactcaccactccaaattacaaaattc 42187  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||  |  ||||||||||| || |||||| | |||| |||||| |||||| | |||| ||  |  ||||||||  |||| ||| | ||||||| ||| |    
T  42188 atgtataacttaattaaataaaagcataca-tccagccagcatccattcattataaccaatttagaacatccagaaaaaaaatacaccaacataaaagtc 42286  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || | || ||| ||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42287 atgcttaa-tcatcaagataaatcaacc-atcatcaacagaaatcaatccaac-aaatactgggcaactcgcctctcgagcacatcttctcgctatggcg 42383  T
Q  518 agctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    ||||||   |  ||||  ||||||||||||||||           |||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| ||    
T  42384 agctca-aaacacaggacactcgccatggcgagt-----------tcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaa 42471  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctta 716  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||      ||   |||||||||||||    
T  42472 tcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtaca------ta---aaaatacggctta 42562  T
Q  717 aaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcga 816  Q
     ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  42563 taacaacacttaaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccaaggtgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcga 42662  T
Q  817 gcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 871  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42663 aaaaaggctactcgcggggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtt 42717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 13967 - 14814
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||| |||| | || ||||||||||||||    
T  13967 caactcatcaccactccactaagactccgctaacaacacccatgcatgtggtatcgaaa-tcaggaccgtagccctcacctcggtagaatggttaaagca 14065  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  14066 ttcattttcaggacataagtcctcgccactaacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctccca 14165  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||  ||||||| ||| || ||||| ||||||| |      
T  14166 cttctatgtttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaacctaacctatacatatatat-gtatatgactcaacattccaacttacaacatcc 14264  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatca-caaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||     ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||| || | || | ||  || ||||||||   ||| ||| | ||| |||  | ||    
T  14265 atgtatgacttaattaaataaaagcatac-tttcagccagcatcaatttattatcaccaatttaaaacatccag---aaaaatacaccaatataataacc 14360  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatag-aaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 516  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || | |||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14361 atgcttaa-tcatcaagataaatcaacc-atcaacaacagaaaatcaatccaacaaaatactgggcagctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggc 14458  T
Q  517 gagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    |||||| |  ||  ||  ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||  |    
T  14459 gagctccgaaaacaagacactcgccatagcgagatcgagacgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggaattttgacatttttctcactaga 14558  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggctta 716  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||  |||| | || ||| ||  |||     
T  14559 tcctcaattctaagctctctattcatctttttaatctaaaacttgctctagtcctctttaaaatcatttaggcacattaaaccatcccaaaaacatcttg 14658  T
Q  717 aaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcga 816  Q
     ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || ||||||||| |||||||||     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  14659 taacaacaatttgaaaatcaagttttaaactgggttactcgccacggcgagttggtctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcga 14758  T
Q  817 gcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759 gcaa-ggctactcgcgtggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 873
Target Start/End: Original strand, 24168 - 25015
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  24168 caactcatcaccactccactaagactccgctaacaacacccatgcatctggtaccataa-tcaggaccgtagccctcacctctgtagaatggttaaagca 24266  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||    
T  24267 ttcattttcaggacataagtcctcgccactaacaccactttgaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctcttcca 24366  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttt 320  Q
    ||  |||| |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||  ||||||| ||| || ||||| ||||||| |      
T  24367 cttctatgcttatgcaactaaccgccttgtgtatatccacatacaacctaacctatacatatatat-gtatatgactcaacattccaacttacaacatcc 24465  T
Q  321 aagtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatca-caaccatccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcc 418  Q
    | ||     ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||| || | || | ||  || ||||||||   ||| ||| | ||| |||  | ||    
T  24466 atgtatgacttaattaaataaaagcatac-tttcagccagcatcaattaattatcaccaatttaaaacatccag---aaaaatacaccaatataataacc 24561  T
Q  419 atgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatag-aaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggc 516  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| || | |||||| || ||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24562 atgcttaa-tcatcaagataaatcaacc-atcaacaacagaaaatcaatccaacaaaatactaggcagctcacctcgcgagcacatctgctcgctatggc 24659  T
Q  517 gagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaa 616  Q
    |||||| |  ||  ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||  |    
T  24660 gagctccgaaaacaagacactcgccatggcgagctcgaggcgaactcgaggcgaacaaaaatatggtgctctcgggaattttgacatttttctcactaga 24759  T
Q  617 acctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaacta-cccaaaatacggctt 715  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||| | |||||||| |  |||    
T  24760 tcctcaattctaagctccatattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcatataggcacattaaaccatcccaaaat-catctt 24858  T
Q  716 aaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcg 815  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||  ||  ||  || ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||    
T  24859 ataacaacaatttgaaaatcaagtcttaaactgggttactcgccacggcgagttgttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcg 24958  T
Q  816 agcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24959 agcaa-ggctactcgcgtggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 25015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 38 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 14776 - 13943
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagga 135  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |  ||||| ||||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||   ||||||    
T  14776 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtatcatat-tcaggaccgtagccatcatcgctgtagaatggttaaaacattcatttcagga 14678  T
Q  136 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14677 cataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactgttatgcttat 14578  T
Q  235 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaacttttaagtgaattttaa 333  Q
     ||||| |  | |||  |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||| || || |  |  ||||    
T  14577 tcaactgactcacttatgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgt-ttatatgactcaccactccaatttacaacattcaaatataacttaa 14479  T
Q  334 ttaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagccatgcttaattcaa 431  Q
    ||||||| || |||||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||  |  ||||||||   ||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||     
T  14478 ttaaataaaagcataca-tccagccagcatccattcattacaaccaatttagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagtcatgcttaa-tcat 14384  T
Q  432 caa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcagaccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatc 530  Q
    ||| ||||| || || |   ||||||||| |||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  14383 caagataaaccaacc-atttacaatagaattcaatccaac-aaatactgggcaactcgcctcgcaagcacatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaa 14286  T
Q  531 aggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaag 630  Q
     || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | | |||||| || |    |||||||||||||||| || ||||| | | |||    
T  14285 gggcactcgccatggcgagttcaaggtgaactcgaggcgaacagaaaaaggctgctctcggaagttttgatatttttctcactaaatcctcattcccaag 14186  T
Q  631 ctccctaatcatc-ttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacatttta 729  Q
     |||||| ||||| |||| | |  |||| |||  ||||||||||  |||||||| |||  || | ||||||   | | | |  |||| ||||||| || |    
T  14185 ttccctattcatctttttgatcgaaaaatttggaccagtcctctctaaaatcatttagacactcaaaactatatatatttcatcttataacaacacttca 14086  T
Q  730 aaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactc 829  Q
    ||||||||| ||| | ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  14085 aaaatccagttttcctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgctaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactc 13987  T
Q  830 gcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13986 acgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcataatgcaggtttt 13943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 179; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 535 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15222 - 14884
Alignment:
Q  535 actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctcc 634  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||    
T  15222 actcgccatggcgagttcgaggcgaactcgagacgaacaaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagttcc 15123  T
Q  635 ctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaat 734  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||| || ||||||    
T  15122 ctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactacctaaaatacggcttataagaacacttcaaaaat 15023  T
Q  735 ccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgag 834  Q
    |||| ||| | ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||||||||    
T  15022 ccagttttccccaccagtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagtttttcacttgccttggcgagcaaaggctactcgcgag 14923  T
Q  835 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14922 gcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15682 - 15511
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  15682 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagca 15584  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgact 194  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15583 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgact 15511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 2962 - 3123
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||  | || ||||    
T  2962 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcatcaccgctaaacacctctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttcc 3061  T
Q  204 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  3062 agagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 673
Target Start/End: Original strand, 141285 - 141930
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  141285 caactcatctccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 141383  T
Q  124 ttctcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccac 222  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  141384 ttcatttcaggacgtaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccac 141483  T
Q  223 tgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgattcacca-tccaatttacaactttta 321  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  141484 tgttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaacattca 141582  T
Q  322 agtgaattttaattaaatacaa-catacatttcagctagcatctattcatcacaacc-atccaagacatccagggaaaatatatatcaacatacaagcca 419  Q
    | |  |  ||||||||||| || |||||| |  ||| |||||| |||||| |||||| ||  |  ||||||||   ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  141583 aatataacttaattaaataaaagcataca-tcaagccagcatccattcattacaaccaatatagaacatccag---aaaaatacaccaacataaaagcca 141678  T
Q  420 tgcttaattcaacaa-ataaatcatccaaacaacaatagaaatcaga-ccaacaaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcg 517  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| || || | | |||| || |||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  141679 tgcttaa-tcatcaagataaaccaacc-atctacaacag-aatccgatccaac-aaatactgggcaactcgcctcgcgagtacatctgctcgctatggcg 141774  T
Q  518 agctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaa 617  Q
    |||||||| ||   || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| ||     
T  141775 agctcaggaaaaagggcactcgccatggcgagttcgagccgaactcaaggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaat 141874  T
Q  618 cctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||| ||  | |||||| |||| ||||||||||    
T  141875 cctcatttccaagttccctattcatctctttgatctaaaaattgcaccagtcctct 141930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 146611 - 146742
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactaca--ccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  146611 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 146710  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa 238  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  146711 gacgaagctctcccacttttatgattatgcaa 146742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 752 - 829
Target Start/End: Original strand, 141958 - 142035
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactc 829  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  141958 tactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactc 142035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 9)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 562 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 62904 - 62593
Alignment:
Q  562 tcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttg 661  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  62904 tcgaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttg 62805  T
Q  662 ctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccat 761  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||||    
T  62804 ctccagtcctctctaaaatcatttaggtacattaaactacccaaaatacggcttataacaacactttaaaaatccagttttcctcacaggtactcgccat 62705  T
Q  762 ggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcag 861  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62704 ggcgagttatctcactcgcgaggcgagacatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgagcag 62605  T
Q  862 aatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||    
T  62604 aatgcaggtttt 62593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 63418 - 63169
Alignment:
Q  19 acacatacaactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggt 116  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  63418 acacatgccactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggt 63320  T
Q  117 taaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  63319 taaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagccgaagc 63220  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  63219 tctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 63169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12876
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||    
T  13054 atgcatgtggtaccataa-tcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgcttt 12956  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa 242  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  12955 gaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactaa 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 124677 - 124446
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagg 134  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  124677 actccactaagactcctctacaatactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcagg 124579  T
Q  135 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    |||| |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  124578 acatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcagaagccctcccgcttttatgctt 124479  T
Q  233 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  124478 atgcaactgacccacttgtttatatctacatac 124446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 36266 - 36362
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgagg-cgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36266 ctcgcggggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcgggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 36362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 35975 - 36061
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  35975 tactgggcaactcacctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 36061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 143365 - 143461
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  143365 ctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgcga-ggcgagacaa--gctactcactgaggcgagcgatgaaggtctgtacgagcagaatgcaggtttt 143461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 518
Target Start/End: Original strand, 143073 - 143116
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143073 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 143116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 124237 - 124188
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  124237 actgggcaactcgcctcgccagcacatctgctcgctatggcaaactcagg 124188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 506 - 873
Target Start/End: Original strand, 17913 - 18279
Alignment:
Q  506 ctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatattt 605  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    ||| ||||    
T  17913 ctcgctatggcgaactcaaggaaaggggcactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgacattt 18012  T
Q  606 ttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaa 705  Q
    ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18013 ttctctctaaatcttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctttctaaaatcatctaggtacacaaaactaaccaa 18112  T
Q  706 aatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcact 805  Q
    | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  18113 attacggcttataacaacaatttgaaaaaccaaaatttctcacaggtactcgccatggcgagttgtctcactcgcgaggcgagccatgaagttgctccct 18212  T
Q  806 cgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||   ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18213 cgccttggcaaac-atggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctatacgggcagaatgcaagtttt 18279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 17447 - 17688
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacaccc---atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcag 133  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || || ||||||   ||| || |||||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  17447 actccactaagactcttctaatcaaccctcatgcatgtggtaccataa-tcggggccgaagccctcatcgctgtagaatggttaaagcattcattttcag 17545  T
Q  134 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 231  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  17546 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctttcccgcttttatgct 17645  T
Q  232 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 274  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  17646 tatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 17688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 51349 - 51079
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||     
T  51349 atttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactaa 51250  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |    
T  51249 ccaaattacggcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacgggtactcgccacggcgagttgtctcactcgcgaggcgagctataaagttgct 51150  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51149 cactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 51079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 485 - 857
Target Start/End: Original strand, 435 - 806
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | ||| |||    
T  435 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaagataaggt 533  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  534 gctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagcaccctattcatcttattaatctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcat 633  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || |||||||||||| ||||||  |  ||||||||    
T  634 ttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgaactgggttactcgccatggtgagttggtttgctcgcgag 733  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 857  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  734 gcgagctatgaagtttctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaactcctgtacgg 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35723 - 35546
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  35723 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 35625  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  35624 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 35546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30322 - 30162
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30322 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30224  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  30223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51858 - 51676
Alignment:
Q  86 agggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacca 182  Q
    ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  ||||||     
T  51858 agggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaacaactactgttccaccg 51759  T
Q  183 ctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  51758 ctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 51676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 565 - 873
Target Start/End: Original strand, 7739 - 8046
Alignment:
Q  565 aggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctc 664  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||    ||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  7739 aggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgatattttcctcactaaatctacaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctc 7838  T
Q  665 cagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggc 764  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||    
T  7839 cagttctctctaaaatcatctaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacgatttaaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacggc 7938  T
Q  765 gagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaat 864  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7939 gagttgtctcactcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgataaacttctgtacgggcagaat 8037  T
Q  865 gcaggtttt 873  Q
    |||||||||    
T  8038 gcaggtttt 8046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 7293 - 7451
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| || |||||  |||||| || |||||||| | || |||||||    
T  7293 gaatggttaaagcattcattttcaggatataagtccttaccactaaacaccgctttgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccaga 7392  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  7393 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 15367 - 15050
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||    
T  15367 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcggaagttttgatatttttctcactagaacttcaattttaagctccctattcatctttttaatcta 15268  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  | |||    
T  15267 aaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcacaggtac 15168  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167 tcgccacggcgagttgtctcactcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcaaacaa-ggctcctcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 15069  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  15068 tgggtagaatgcaggtttt 15050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 9802 - 9485
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  9802 ggcgaactcaaggcgaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgatatttttctcagtagaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatcta 9703  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||| ||  | |||    
T  9702 aaacttgctcaaatcctctctaaaatcatctaggtacataaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaattcagaatttctcacaggtac 9603  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| |   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9602 tcgccacggcgagttgtctcactcttgaggctagctatgaagttgctcactctccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 9504  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     ||||||||||||||||||    
T  9503 agggcagaatgcaggtttt 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17580 - 17376
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccact 160  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| ||    
T  17580 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaaacattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgct 17482  T
Q  161 ttgagtaactag-tactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatct 259  Q
    ||||  ||| |  |  |||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| | || |||| ||||||||    
T  17481 ttgaacaacaaaatgttccacagctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgtaactgacccacttgtgtatatct 17382  T
Q  260 acatac 265  Q
    ||||||    
T  17381 acatac 17376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10162 - 10080
Alignment:
Q  183 ctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  10162 ctttgaacgacaaggcgttccagggctgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 10080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 471 - 872
Target Start/End: Original strand, 668 - 1067
Alignment:
Q  471 aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   | | |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  668 aaaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcatgaaacgggttgctcgacatggctagttcaaggcgaactcgaggcga 767  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
    ||  ||||||||| || | ||||    ||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  768 acgaaaatatggttctttcgggagttttgacatttt-ctcactaaaacttcaattccaagctccctattaatctttttaatctaaaacttgctccagtcc 866  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    |||  |||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||  |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||  | ||||||||| || ||||||    
T  867 tctctaaaatcatttaggtacattaaactaaccacaatacaccttataacaacaatttgaaaatccagaatttctcataggtactcgccacggggagttg 966  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  967 tctcacttgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcaaggcaagtgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 27533 - 27146
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | | ||    
T  27533 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaacgggttactcgccatggcgagtttgaggtaaactcgaggcgaacagaaaaaggctg 27434  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||| |||||  ||||||||     
T  27433 ctcttgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgcaccagccctctctaaaatcatt 27334  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||  || | ||| || ||| ||| |  |||| ||||||| | ||||||||||| ||| | ||  | |||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  27333 tagacactcaaaattatccataattcatcttataacaacaatctaaaaatccagttttactcacaggtactcgccacagcgagttgttttactcgcgagg 27234  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27233 cgaggcatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 27146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27781
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcatc-aggacataagtcctcaccacta-caccactt 161  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||| |||| |||    
T  27945 atgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgctaacaccgctt 27847  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtta 227  Q
    |||  |||| ||  |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27846 tgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctcccgctgtta 27781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20358
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  19980 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 20078  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  20079 gtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 20177  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || | ||||||||||||||||||    ||||||    
T  20178 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttcaactgggttgctcgccatggcgagttgttctgctcgcg 20277  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20278 aggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 20358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23604 - 23226
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  23604 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 23506  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| || | || |||    
T  23505 gtgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaatactaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgttacagtcatcattaatatc 23407  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || | ||||||||||||||||||    ||||||    
T  23406 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttcaactgggttgctcgccatggcgagttgttctgctcgcg 23307  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23306 aggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 23226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 565 - 873
Target Start/End: Original strand, 71579 - 71886
Alignment:
Q  565 aggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctc 664  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  71579 aggcgaacagaaaaaggctgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcaactttttaatctaaaacttgctc 71678  T
Q  665 cagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggc 764  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| | ||| |||| || ||  |||||||| |||    
T  71679 cagtcctctctaaaatcatctaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaattgaaaaacctagaatttctcacgggcactcgccacggc 71778  T
Q  765 gagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaat 864  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71779 gagttgtctcactcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggttactcgcgacgcgagcgatgaacttctgtacgggcagaat 71877  T
Q  865 gcaggtttt 873  Q
    |||||||||    
T  71878 gcaggtttt 71886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15615 - 15432
Alignment:
Q  84 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 181  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  15615 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 15516  T
Q  182 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15515 gctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttgtgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 15432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 265
Target Start/End: Original strand, 71154 - 71291
Alignment:
Q  130 tcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtta 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||    
T  71154 tcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgctttta 71253  T
Q  228 tgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    || |||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  71254 tgcttatgcaactgacacacttgtgtatatctacatac 71291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 77247 - 77518
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| ||| ||||||| || ||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  77247 atttttctcactaaatcttcatttcgaagctccatattcatctttttaatctaaaaattgtcccaatcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 77346  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    | |||||||  |||| ||||||| || |||||||  ||| | |||      | ||||| ||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||     
T  77347 caaaaatacaacttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcaggcacttgctcgctatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgc 77446  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactc-gcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |||  |||||||  || |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  77447 tcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcaccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcataatgcaggtttt 77518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 20699 - 20969
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  20699 atttttctcactaaatcttcaattctaagctccctattcatccttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctagctacacaaaactaa 20798  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  20799 ccaaattacagcttataacaacaatttaaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacagcgagttgtctcactcgcgaggcgagctatgaaattgct 20898  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20899 cactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaagcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 20969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Original strand, 17006 - 17095
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  17006 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagcgccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 79
Target Start/End: Original strand, 16913 - 16955
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtacca 79  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913 actccactaagactcctctacaacactcatgcatgtggtacca 16955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 5551 - 5281
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||     
T  5551 atttttctcactaaatcttcaattctaaactccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacacataactaa 5452  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||| || | ||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  5451 ccaaattacggcttataacaacaatctgaaaatccagaattccccacaggtactcgccacggcgagttgtctcactcgcggggtgagctatgaagttgct 5352  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351 cactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 5281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5877
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgct-gtcgaatggttaaagcattc-tcatcagg 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |  |||||    
T  6108 actccactaagactcctctacaacactcatacatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagaattcattttcagg 6010  T
Q  135 acataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 233  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||||| | | || |||||| |||| ||| ||||| || || || |||    
T  6009 acataagtcctcatcgctaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacggcaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgctta 5910  T
Q  234 tgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||    
T  5909 tgcaactgactccacttgtgtatatcttcatac 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 13111 - 12794
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |    ||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||| || ||||||||| || ||     
T  13111 ggcgaactcaaggcgaacaaaaatatggtgctctcggaagttttgacatttttctcactaaaacctcatttttaagttccgtattcatctttttaatctg 13012  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||| |||  |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||| || || |||    
T  13011 aaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacaacaatttgaaaacccagaatttctcacggttac 12912  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgta 854  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12911 tcgccacgacgagttgtctcactcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctata 12813  T
Q  855 cgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || ||||||||||||||||    
T  12812 cgagcagaatgcaggtttt 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13620 - 13504
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagga 135  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||    
T  13620 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcagga 13522  T
Q  136 cataagtcctcaccacta 153  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13521 cataagtcctcaccacta 13504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 555 - 688
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3823
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaac-agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacct 653  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||    ||| |||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  3689 ggcgaactcaaggcgaacgagaaaaagggtgctctcgggagttttgacatttgtctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatct 3788  T
Q  654 aaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
     ||| |||   |||||||||  |||||||||||||    
T  3789 gaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatctagg 3823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 485 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 101450 - 101073
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  || || |||    
T  101450 ctcgcctcgcgagcacatctactcgctatgacgagctcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaaattaaggt 101352  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  101351 actctcgggagttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcat 101252  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  | |||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||  || |||  ||  || ||||||||| |||||||||     ||||||||    
T  101251 ttaggcacattatactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaattaagttttgaactgggttactcgccacggcgagttggtctgctcgcgag 101152  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  101151 gcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcaagcgatgaacttttgtgcgggcagaa 101073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 31945 - 32323
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  31945 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgcttgctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 32043  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || | ||||||    
T  32044 gtgctctcgg-aaaaatgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagacatcattaaaatc 32142  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||| | |||||||||||||||||     |||||    
T  32143 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgc 32241  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32242 gaggcgagcgatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcacaagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 32323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 480 - 863
Target Start/End: Original strand, 253904 - 254275
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaata 579  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  | | |||||||||||||           || |||||||| |  |||||    
T  253904 ggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaatgggttgctcgccatggcga-----------acacgaggcgagcgaaaata 253992  T
Q  580 tggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    ||||||||| || |    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  253993 tggtgctctcggaagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaa 254092  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || |||||||||  ||||||||| |  ||||    
T  254093 tcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttaaactgggttactcgccacagcgagttgttttgctcg 254192  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  254193 cgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaa 254275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 480 - 873
Target Start/End: Original strand, 247390 - 247771
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaata 579  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  | | |||||||||||||           || |||||||| |  |||||    
T  247390 ggtaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagaaaatgggttgctcgccatggcga-----------acacgaggcgagcgaaaata 247478  T
Q  580 tggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    ||||||||| || |    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  247479 tggtgctctcggaagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaa 247578  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  || |||||||||  ||||||||| |  ||||    
T  247579 tcatttaggtacattaaactaaccaaaatacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttaaactgggttactcgccacagcgagttgttttgctcg 247678  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  247679 cgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcccgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaaaacaggtttt 247771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 471 - 873
Target Start/End: Original strand, 2365 - 2767
Alignment:
Q  471 aaaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcg 569  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2365 aaaaaactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcg 2463  T
Q  570 aacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtc 669  Q
    |    |||   |||||||| || |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2464 agtgaaaagtaggtgctctcggaagttttgatatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctcaagtc 2563  T
Q  670 ctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaac-attttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagt 768  Q
     || | |||||||| ||||||||  |||||| ||   | ||  |||| |||||| |||| |||||||||| |||   |  || |||||||||  ||||||    
T  2564 atcattaaaatcatttaggtacattaaactatcccctaaacatcttataacaacaatttaaaaaatccagttttgatctgggttactcgccacagcgagt 2663  T
Q  769 tgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcag 868  Q
    ||     |||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2664 tggtctgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcacttgccatggcgag-aaaggccattcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacag 2762  T
Q  869 gtttt 873  Q
    |||||    
T  2763 gtttt 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 10120 - 10505
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  10120 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 10218  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||   |||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  10219 aaagtaggtgctctcgggagtt-tgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcat 10317  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| | || |||  | || | || ||| ||  |||| ||||||| || ||||||| || |||  ||  || | |||||||||||||||||        
T  10318 taaaatcatttgggcacattataccatcccaaaaacatcttataacaacaattcaaaaatcaagttttcaactgggttgctcgccatggcgagttggtct 10417  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10418 gctcgcgaggcgagctatgaacttgctcactcgccttggcgagc-acggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 10505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 709 - 873
Target Start/End: Original strand, 1 - 165
Alignment:
Q  709 acggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgc 808  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 acggcttataacaacattttcaaaatccagatttttacaatgctactcgccacggcgagctatatccctcgcgaggcgagcgatgaagttgttccctcgc 100  T
Q  809 taaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tatggcgagtaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 786
Target Start/End: Original strand, 10924 - 11154
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||    ||| | |||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||    
T  10924 ggcgaactcaaggcgaatgaaaatatggtgctctcgggagttttgaca-ttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatcta 11022  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||| |||  |||| |||||  ||||||||||| | || | |||||| |||   |||  |||| ||||||| || |||||||  ||||||| ||  | |||    
T  11023 aaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaagcactcaaaactatccatcttacaccttataacaacaattcaaaaatcatgattttcccacaggtac 11122  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcg 786  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  11123 tcgccatggtgagttgtcttgctcgcgaggcg 11154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 1060 - 1193
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||  |||  ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||     
T  1060 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaagattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaaaactaa 1159  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| || |||||||    
T  1160 ccatattacatcttataacaacaattcaaaaatc 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6249 - 6006
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6249 caactcatcaccattccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 6151  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccc 220  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  6150 ttcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccc 6051  T
Q  221 actgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||    
T  6050 acttttatgcttatgtaactaacccacttatgtatatctacatac 6006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 10)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 152320 - 152562
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| || | |||| ||||||||||||||    
T  152320 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacaaccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaacactgtagaatggttaaagca 152418  T
Q  124 ttc-tcatcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctccca 221  Q
     || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  152419 atcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctccca 152518  T
Q  222 ctgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  152519 cttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 152562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 174738 - 174561
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  174738 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 174640  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  174639 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Original strand, 258469 - 258696
Alignment:
Q  38 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcat-cagga 135  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  258469 actccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccatat-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttcagga 258562  T
Q  136 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 232  Q
    |||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || |||||| || | ||| |||||||| || || ||    
T  258563 cataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcaggagccctcccacttttgtgctt 258662  T
Q  233 atgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  258663 atgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 258696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 56425 - 56154
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||  ||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  56425 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcattcttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 56326  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagtt 798  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  || | |||| ||||   | ||| ||||||||||| ||    ||||||||| |||| ||||||||    
T  56325 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatga-tctcac-aggcacttgctcaccatggcgagtggttctgctcgcgaggtgagccatgaagtt 56228  T
Q  799 gttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||  ||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  56227 gttcactcgc-gaggcgag-actagctactcgcgggggcgagcgatgaatgtcagcacgggcataatgcaggtttt 56154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 555 - 795
Target Start/End: Original strand, 154612 - 154852
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || ||     
T  154612 ggcgaactcaaggcgaatgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctg 154711  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||| |||   ||| |||||  ||||||||||||| ||   |||||| |||   ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| ||| | |||    
T  154712 aaaattgtctcagacctctctaaaatcatctaggcacttaaaactatccatggtacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcaaaggtac 154811  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  154812 tcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 154852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 252412 - 252605
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||| ||| ||   ||||||     
T  252412 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatccaggcacctaaaactat 252511  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||    
T  252512 ccacattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagcgatgaa 252605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 259018 - 259211
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||| ||| ||   ||||||     
T  259018 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatccaggcacctaaaactat 259117  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||    
T  259118 ccacattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagcgatgaa 259211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 21161 - 21039
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaactt 849  Q
    ||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||  |    
T  21161 tactcgctatggctagtggtcttactcgcgaggcgagcgatgaagattgctcactcgc-gaggcgag-aagagctactcgcggaggcgagcgatgaagat 21064  T
Q  850 c-tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  21063 cttgtacgggcagaatgcagttttt 21039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 575 - 770
Target Start/End: Original strand, 147445 - 147640
Alignment:
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||     
T  147445 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctc 147544  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
     ||||||||||||| ||   |||||| |||   ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  147545 taaaatcatctaggcacttaaaactatccatgttacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcatgggtactcgccatggtgagttg 147640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 21419 - 21354
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||  || ||||||| |||||||||    
T  21419 ctcgcctcccgagtacatctgctcgctatggcgaactcaagaaaggagttactcgctatggcgagt 21354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 558 - 873
Target Start/End: Original strand, 805 - 1119
Alignment:
Q  558 gaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaa 657  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  805 gaactcaaggcaaacgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaa 904  T
Q  658 cttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcg 757  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    ||| |||||||| | |||| ||  | || |||    
T  905 cttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacacaaaactaaccaaattacggcttataacagtgatttgaaaatccaaaatttctcacaggtaatcg 1004  T
Q  758 ccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 857  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||   ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1005 ccacggcgtgttgtttcactcgcgaggcaagctatgaagttgctccctcgccttggcgaacaa-ggctactcgctaggcgagcgatgaacttatgtacgg 1103  T
Q  858 gcagaatgcaggtttt 873  Q
    | |||||||| |||||    
T  1104 gtagaatgcaagtttt 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 365 - 524
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattctcat-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccag 205  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  365 gaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 464  T
Q  206 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||| |||| ||||| || ||||  |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  465 ggccaaagccctcccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 11 - 281
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||||     
T  11 atttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatttaggtgcattaaactaa 110  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||||||   |||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||   | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  111 ccaaaatatatcttataacaacaatttgaaaatcaagtttttaactgagttactcgccacggcgagttgttctactcgcgaggcgagccatgaagttgct 210  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  211 cactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 472 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 16660 - 16259
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |   ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16660 aaatactaggcaactcgtctcgcgagcacatctgctcaccatggcgagctcaggcgaaagggtcactcgccgtggcgagttcaaggcgaactcaaggcga 16561  T
Q  571 acagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcc 670  Q
    ||||||| | | |||||| ||||    ||| |||| ||||||| || | ||| || |||| |||||| || |||||| || || ||| |||  |||| ||    
T  16560 acagaaaaaggctgctcttgggagttttgacatttctctcactaaatcttcatttttaagttccctattcttctttttaatctgaaaattgtcccagacc 16461  T
Q  671 tcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttg 770  Q
    |||  ||||||||||||||||   |||||| ||| | || |||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||||||||    
T  16460 tctctaaaatcatctaggtacttaaaactatccatattatggcttataacaagaatttgaaaatccagaatttctcacaggtactcgccacggcgagttg 16361  T
Q  771 tatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16360 tctcactcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggaaagaatgcaggt 16262  T
Q  871 ttt 873  Q
    |||    
T  16261 ttt 16259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 19579 - 19964
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  || | |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |    
T  19579 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcgagttc-gcaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-g 19676  T
Q  575 aaatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||| || |||||||| |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  19677 aaaaataggtgctctcgggaattatgacatttt-ctcacttaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatca 19775  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgta 772  Q
    | |||||||| ||||||||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| || |||||| ||  |||| |   ||| | |||||||||||||||||      
T  19776 ttaaaatcatttaggtacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaattgaaaaat-catgttttgatctggcttgctcgccatggcgagttggt 19874  T
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875 ttgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcaccagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 19964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 15481 - 15866
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |  || | |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||   |    
T  15481 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgcccgcgatggcgagttc-gcaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggtgagt-g 15578  T
Q  575 aaatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    ||| || |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  15579 aaaaataggtgctctcgggaattatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatca 15677  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
    | |||||||| ||||||||  |||  | ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||  ||  |  | |||||||||||||||||       
T  15678 ttaaaatcatttaggtacattaaatcatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgaactggcttgctcgccatggcgagttggtc 15777  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15778 tgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcaccagctgctcgcgaggcgagcgatgaaattctgtacgggcagaa 15866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 65096 - 64701
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||    
T  65096 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-ga 64998  T
Q  576 aatat-ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    || || |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  64997 aaaataggtgctctcgggagtt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcat 64899  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatc 774  Q
     |||||||| ||||||||  |||| ||||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || | |  ||  |  | |||||||||||||||||        
T  64898 taaaatcatttaggtacattaaaccacccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttctgaactggcttgctcgccatggcgagttggtct 64799  T
Q  775 actcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  64798 gctcgcgaggcgagccatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaaaacaggtttt 64701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 754 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 51371 - 51253
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  51371 ctcgccatggcgagttggtctgctcgcgaggcgagccatgatgttgttcactcgcga-ggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagt 51273  T
Q  854 acgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  51272 acgggcagaaaacaggtttt 51253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4275
Alignment:
Q  84 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||  || ||||  ||||||    
T  4458 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctgtgaacaattagtgttccacc 4359  T
Q  182 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4358 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaatccacttgtgtatatctacatac 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 7538 - 7926
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    ||||  ||    
T  7538 agctcgccttgtgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcggactcgaggcgagtgaaaattagg 7637  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||| || | || |  |    
T  7638 tgctctcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccatattcatctttttaacctaaaacttgttctagtcatcattaataaaa 7736  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca-ctcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| |  |  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  ||||||||||||||||||||||  ||| || | |    
T  7737 tctaggtaccttaaaccattcccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttgatctgggctactcgccatggcgagttg-gtcagctagag 7835  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7836 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgagcagaaaacaggtttt 7926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4594
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  4795 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4697  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  4696 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 4597  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  4596 tac 4594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23567 - 23518
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23567 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17934 - 17885
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17934 actgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggtgaactcagg 17885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10435 - 10234
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  10435 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 10337  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||  |||||||||||    
T  10336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttatgtatatctaca 10237  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  10236 tac 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 481 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19909 - 19528
Alignment:
Q  481 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaata 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   || |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||     ||||    
T  19909 gtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctttggcgaactcacaaaa-caggttgctcgccatggcgagtttaaggcgaactcgaggcgagtgataata 19811  T
Q  580 tggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
    ||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||    
T  19810 tggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaacttgttccagtcctttttaaaa 19711  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||| |||| |||  |||| | || ||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||  | |||  ||  || |||||||||||||||||||     ||||    
T  19710 tcatttaggcacattaaaccatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcatgttttcaactgggttactcgccatggcgagttggtctgctcg 19611  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19610 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccttggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacatttgtacgggcagaa 19528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 863
Target Start/End: Original strand, 25014 - 25398
Alignment:
Q  477 ctgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaa 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | | |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||  | ||    
T  25014 ctgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactggttgctcgccatagcgagttcaaggcgaactcaaggcgagtaaaa 25113  T
Q  577 atatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaa 676  Q
    |   ||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |    
T  25114 aataggtactctcgggaatt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcatta 25212  T
Q  677 aaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||| |||||| |  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||| |   ||| | ||||||||||| |||||         
T  25213 aaatcatttaggtatattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccatggcaagttggtctg 25311  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25312 ctcgtgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtacgggcagaa 25398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 602 - 863
Target Start/End: Original strand, 35806 - 36066
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| |  |||| |     
T  35806 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcatttaggtatattaaaccat 35905  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||| |   ||| | ||||||||||| |||||     |||| ||||||||| |||||||||     
T  35906 ccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgccatggcaagttggtctgctcgtgaggcgagccatgaagttgc 36004  T
Q  801 tcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36005 tcactcgc-gaggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaa 36066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 860
Target Start/End: Original strand, 137451 - 137825
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||   | | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  137451 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcataaaacgggttgctctccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagcgaaaataaggtg 137550  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  137551 ctctagggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttcatctaaaacttgctccagtcctctttaaaatcatt 137650  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgagg 784  Q
    |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || |||   |  || |||||||||  || |||||     |||| ||||    
T  137651 taggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagttttgatctgggttactcgccacagctagttggtctgctcgtgagg 137750  T
Q  785 cgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggca 860  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  137751 cgagctatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcaaggcgagcgatgaacttatgtacgggca 137825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Original strand, 13290 - 13410
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttc 850  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  |     
T  13290 tactcgccatggcgagtggttctgctcacgaggcgagccatgaagttgttcactcgc-gaggcgagcca-ggctactcgccggggcgagcgatgaatatt 13387  T
Q  851 tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| |||||||||| |||||||    
T  13388 tgtatgggcagaatgtaggtttt 13410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1647
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||     | ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||   |||| || |    
T  1268 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaactgcctgctcgccatggcgagttcaaggagaactcgaggtgagt-gaaaaatag 1366  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  1367 gtgctctcgggaaaaatgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccattcatcattaaaatc 1466  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    ||||||||||   |||||| ||  || ||  |||| ||||| |||| ||||||| || |||   || |  | |||||||||||||||||     |||| |    
T  1467 atctaggtaccttaaactatccccaaaacatcttataacaatatttcaaaaatcaagttttattcaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgtg 1566  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||  |||  | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  1567 aggcgagtgttgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcaatacgggcagaa 1647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10543
Alignment:
Q  31 catcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-t 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10305 catcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 10403  T
Q  128 catcaggacataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
      |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| |    
T  10404 tttcaggacataagtcctcatcactaaacatcactttgagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttt 10503  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| |||||||||| | |  || | ||||||||||||||    
T  10504 tatgattatgcaactgaccgactcgtgtatatctacatac 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11080
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||     
T  10887 atttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatcaaaaacttgctccagtcctctctaaaatcatctaggtacataaaactaa 10986  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||||  ||||||||| ||||||| || |||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  10987 ccaagttacggcttataacaacacttcaaaaatcatgtttttctcacgggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 483 - 873
Target Start/End: Original strand, 104661 - 105049
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  104661 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 104760  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || ||||    
T  104761 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaatccaaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatca 104859  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggcta-ctcgccatggcgagttgtatcactcgcg 781  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||||  |||||||||||||||||     ||||||    
T  104860 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttgtccaggcttgctcgccatggcgagttggtctgctcgcg 104958  T
Q  782 aggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  104959 aggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 105049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 806 - 428
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||     | |||||| |||||||||  |||||||| |||||| |   |||| || |    
T  806 agctcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcgagttcacaaaactgcttgctcgccgtggcgagttcaaggcgaacacgaggctagt-gaaaaatag 708  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  707 gtgctctcgggaaaa-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaatttgctccagtcatcattaaaatc 609  T
Q  682 atctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactcgc 780  Q
    ||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||||||| ||||||| || |||| |   ||| | ||||| |||||||||||     |||||    
T  608 atctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacatttcaaaaatcaag-ttttgatctggcttgctcgcaatggcgagttggtctgctcgc 510  T
Q  781 gaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  509 gaggcgagcgatgaagtcgctcactcgc-gaggcgagcacaagctgttcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47615 - 47376
Alignment:
Q  42 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggaca 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  47615 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 47517  T
Q  138 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 235  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  47516 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatg 47417  T
Q  236 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47416 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 63035 - 62796
Alignment:
Q  42 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggaca 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  63035 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 62937  T
Q  138 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 235  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  62936 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatg 62837  T
Q  236 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  62836 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 62796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 56649 - 56410
Alignment:
Q  42 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat-caggaca 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  56649 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 56551  T
Q  138 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 235  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  56550 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaatctctcccacttttatgcttatg 56451  T
Q  236 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 276  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  56450 caactgaccctcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 56410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18204 - 17826
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  18204 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaatcagg 18105  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||||    
T  18104 tgctctcgggaaaaatgccatttt-ctcactcaaattccaattctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatctttattatca 18006  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||   |  |||||||||||||||||||| | |   |||||||    
T  18005 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttaatctgggctactcgccatggcgagtgggactgctcgcga 17906  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17905 ggcgagctatgaagttgctcactcgtcatggcgagcacag-ctactcgtgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 17826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29948
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  29748 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccacttt 29846  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 262  Q
    ||  ||| |||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  29847 gaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 29945  T
Q  263 tac 265  Q
    |||    
T  29946 tac 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 110758 - 110935
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  110758 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcatt 110857  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  110858 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Original strand, 116793 - 116855
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 127  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  116793 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattct 116855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 171461 - 171190
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || || | |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  |||| |||||||| || | ||||||     
T  171461 atttttctcactaaatcttcatttttaggttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaaacatctaggcactcaaaactat 171362  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| | | ||||| ||| ||||| ||  |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||| |    
T  171361 ccaaattacaccttataacaacaatctgaaaattcagtttttctcacagggactcgccatggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagatatgaagttgct 171262  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  171261 cactcgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 171190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 5112 - 5350
Alignment:
Q  31 catcacgactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-t 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5112 catcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatt-agggccaaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5210  T
Q  128 catcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 225  Q
      |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |    
T  5211 tttcaggacataagtcctcaccgctatacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttt 5310  T
Q  226 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5311 tatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 31190 - 31575
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacag 574  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||        
T  31190 actgggtagctcgc-tcgcgagcacatctgctcgatatggcgagctc-gcaaaacagtttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtga 31287  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||| ||||| ||||    ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  31288 aaatatggggctctcgggagttttgaca-ttttctcactcaaacctcgattctaagatccctattcatctttttaatctaaaacttgctccgatcctctt 31386  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagatttt-cacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
     | |||||  |||| |||  |||||| || ||| ||  |||| ||||||| ||| |||||| || ||||  ||  || | ||||||| |||||||||       
T  31387 tataatcacttaggcacattaaactatcccaaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagtttttgaactgggttgctcgccacggcgagttggtc 31486  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
      |||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31487 tgctcgcgaggcgagtcatgaagttgctcactcgc-gtggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacgggcagaa 31575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11634
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  12012 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 11913  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| | ||| || || | |||||||    
T  11912 tgctctcgggaaaaa-gccatttttctcactcaaactccaattctaagttccctattcatcttcttaacctaaaactttcaccattcatcattaaaatca 11814  T
Q  683 tctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcga 782  Q
    |||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || |||      |||||||||||| | ||||||| |   |||||||    
T  11813 tctaggtaccttaaaccatccccaaaacatcttataacaacttttcaaaaatcaagttttattatgggctactcgccacgacgagttggactgctcgcga 11714  T
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11713 ggcgagctatgaagttgctcactcaccatggcgagc-acagctgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 11634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 38401 - 38578
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  38401 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 38499  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  38500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 38578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 46409 - 46138
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  46409 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcactttaaactat 46310  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||  ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |    
T  46309 ccatattacaccttataacaacaatatgaaaatccaggttttgtcacaggtactcgccagggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagctatgaagctgct 46210  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46209 cgctcgctaaggcgagcacaggcttctcgccaggcgagcgatgaacttctgtacgggcataatgcaggtttt 46138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 50682 - 50411
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  50682 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcactttaaactat 50583  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| | | ||||||||| ||||  ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || |    
T  50582 ccatattacaccttataacaacaatatgaaaatccaggttttgtcacaggtactcgccagggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagctatgaagctgct 50483  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50482 cgctcgctaaggcgagcacaggcttctcgccaggcgagcgatgaacttctgtacgggcataatgcaggtttt 50411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46822 - 46732
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||| || || || |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  46822 tccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccatagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 46732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51095 - 51005
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||| || || || |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  51095 tccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccatagccctcccgcttttgtgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 51005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47156 - 46979
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  47156 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 47058  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  47057 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 46979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52561 - 52384
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  52561 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 52463  T
Q  162 tgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  52462 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 52384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 783 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 92066 - 91977
Alignment:
Q  783 ggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  92066 ggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagacaaggctactcgcggggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 91977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 92366 - 92317
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcag 524  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  92366 tactgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcag 92317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 480 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 161283 - 160901
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||     
T  161283 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgcgatggcgagttcacaaaa-caggttactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaag 161185  T
Q  579 atggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaa 678  Q
      |||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  161184 taggtgctctcgggatttttgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatcttttcaacctaaaacttgctccagtcatcaataaa 161085  T
Q  679 atcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    ||||| |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||      |||||||||||||||| ||    ||     
T  161084 atcatttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatccagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctt 160985  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||   |||  | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  160984 gcgaggcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgaaacatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaa 160901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 80925 - 80847
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  80925 agctcgcctcgcaagcacatctgctcgctatggcgaattcaggaaatgggttactcgtcgtggcgagtacgaggcgaac 80847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 98230 - 98197
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  98230 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctattgcga 98197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 2658 - 2928
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||     
T  2658 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctaatcatctttttaatctaaaaattgctccagtcctctccaaagtcatctaggtactcaaaactaa 2757  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||| ||| | | | ||||||||||| ||||||||| |    
T  2758 ccaaattatggcttataacaacaatttgaaaatccaggtttcctcactggtactcgccacggcgagatgtcttatttgcgaggcgagccatgaagttgct 2857  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||| |||||||||    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  2858 ctctcgccaaggcgagctcatgctactcgcgaggcgagcaatgaatgtctgtacggg-agaatgcaggtttt 2928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 2566 - 2743
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  2566 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 2664  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  2665 gaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactttgatgcttatgcaacta 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 44719 - 44990
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||     
T  44719 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctaatcatccttttaatctaaaaattgctccagtcctctccaaaatcatctaggtactcaaaactaa 44818  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| || |||||| | ||||| | | ||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||||  | |  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  44819 ccaaattatggcttatagcaacaatctgaaaatccaggtttcctcactggtactcgccacggcgagtcttcttgctcgcgaggcgagccatgaagttgct 44918  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  44919 ctctcgccaaggcgagctcatgctactcgcgaggcgagcgatgaatgtctatacgggcagaatgcaggtttt 44990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 485 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 20275 - 20028
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||| ||||   || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  20275 ctcgcctcgcgagtactcctactcgctatggcgaactcaaggaaaggggcactcgccaaggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacgaaaataaggtg 20176  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  20175 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcatcaattctaagctccctattcatctttttaatccaaaacttgcttcagtcctctctaaaatcatc 20076  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaa 732  Q
    |||||||   |||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  20075 taggtacttaaaactatccaatttacggcttataacaacatttcaaaa 20028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20664 - 20493
Alignment:
Q  98 cacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20664 cacaccactgtagaatgattaaagcattcatttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgac 20565  T
Q  194 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  20564 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 153001 - 152868
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||| ||| || |||| |||| || || ||| |||   ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||     
T  153001 atttttctcactaaaacctcatttttaagttccttattcatatttttaatctgaaaattgtcacagacctctctaaaatcatctaggtacacaaaactaa 152902  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  152901 ccaaattacggcttataacaacaattcaaaaatc 152868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 174739 - 174561
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  174739 atgcatgtggtaccataattcttggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 174640  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
     |  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  174639 taacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 512320 - 512113
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  512320 agctctcctcgcgagcacatctgcttgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 512221  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatca 682  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| || | || ||||    
T  512220 tgctctcgggaaaaatgtt-tttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgtttcagtcatcattaatatca 512122  T
Q  683 tctaggtac 691  Q
    |||||||||    
T  512121 tctaggtac 512113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Original strand, 489127 - 489304
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  489127 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaacactgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 489226  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 241  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  489227 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 489304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Original strand, 179632 - 179752
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    ||||||||| ||||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  179632 tactcgccacggcgagttgttctgctcatgaggcgagccatgaagttgctctctcgcga-ggcgagcacaagctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 179730  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  179731 gtacgggcagaatgcaggtttt 179752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 265
Target Start/End: Original strand, 95817 - 96051
Alignment:
Q  35 acgactccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||| |  |||| |||||||  |  ||||||||||||||||   |||    
T  95817 acgactccactaagactcctcaacaatgcacatgcatgtggtaccatat-tcagggcagaaaccctcaccgctaattaaatggttaaagcattcat-tca 95914  T
Q  133 ggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 229  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||||||| | || ||| || ||| |||| |||||||| |||||    
T  95915 ggacataagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttcaagggccaaagccctcccacttttatg 96014  T
Q  230 tttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  96015 cttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 96051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 179002 - 179083
Alignment:
Q  64 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  179002 catgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 179083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 449433 - 449125
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaa-cag 574  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||           | ||||||||| |||||||  ||    
T  449433 actgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgagttcaaggaatgggttactcgcc-----------gtggcgaactcaaggcgaatgag 449345  T
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct- 673  Q
    ||| | |||||||| ||||    ||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||     
T  449344 aaa-aaggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctc 449246  T
Q  674 taaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtat 773  Q
    ||||||| ||  ||| || | |||||| ||||  ||   |||| ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |    
T  449245 taaaaat-attcaggcactcaaaactatccaacttataccttataacaacaatttgaaaaatcagattttctcacaggtactcgccatggcgagttgtct 449147  T
Q  774 cactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
      |||||||| ||||| |||||    
T  449146 tgctcgcgagacgagctatgaa 449125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 803 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 512051 - 511982
Alignment:
Q  803 actcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  512051 actcgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcaagcaataaacttctgtacgggcagaaaacaggtttt 511982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9809 - 9649
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9809 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaataggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 9710  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9709 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 143
Alignment:
Q  96 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  314 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 215  T
Q  194 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  214 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 265
Target Start/End: Original strand, 10217 - 10400
Alignment:
Q  84 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  || |||    
T  10217 tcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctacc 10316  T
Q  182 actttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||    
T  10317 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcgactaacccatttgtgtatatccacatac 10400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 11983 - 11712
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | |||||| || |||||||| ||||||| | || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||  ||   ||||||     
T  11983 atttttctcactaaatcttcaattttaggctccctattcatcttcttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctagacacttaaaactat 11884  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||  | |||||  | || |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  11883 ccaaattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttcttacgggtactcgccatggcgagttggtttgctcgcggggcgagctatgaagttgct 11784  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11783 cactcgctaaggcgagcacaggcaactcgcgaggcgagcgatgaacttttgtatgggcagaatgcaggtttt 11712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16250 - 16021
Alignment:
Q  42 cactaagactcctctaaaca--cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcatcaggacat 138  Q
    |||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  16250 cactaagactcctctacaaatgctcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattcttttcaggacat 16152  T
Q  139 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 235  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||| ||||  || || || |||||    
T  16151 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcctgcttttgtgcttatg 16052  T
Q  236 caact-aatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16051 caactgactccacttgtgtatatctacatac 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 480 - 795
Target Start/End: Original strand, 41600 - 41914
Alignment:
Q  480 ggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaata 579  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||   | | ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    |||||    
T  41600 ggtaactcgcctcgcgagcacaactgctcgctattgcgaactcacaaaacgggttgctcaccagggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaata 41699  T
Q  580 tggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaa 679  Q
     |||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41700 aggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctccagtcctctctaaaa 41799  T
Q  680 tcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||   |||| ||||| | ||| |||||| || |||  ||  || ||||||||| | ||||||||   |||||    
T  41800 tcatttaggtacattaaactaaccaaaatatatcttataacaa-aatttgaaaatcaagttttaaactgggttactcgccacgacgagttgttctactcg 41898  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||||||||||||||||    
T  41899 cgaggcgagcgatgaa 41914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 824 - 857
Target Start/End: Original strand, 41892 - 41925
Alignment:
Q  824 ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgg 857  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41892 ctactcgcgaggcgagcgatgaacttatgtacgg 41925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 483 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 4424 - 4247
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||  ||    
T  4424 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattagg 4325  T
Q  583 tgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttg 661  Q
    |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4324 tgctttcgggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttg 4247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 16449 - 16835
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  16449 ctcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcgagctcacaaaa-caggctactcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaataaggt 16547  T
Q  584 gctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
     || | ||||    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16548 actatcgggagtt-tgacatttttctcactcaaacctcaattccaagctccctattcatgtttttaacctaaaacttgctccagtcatcattaaaatcat 16646  T
Q  684 ctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     |||| |||  |||| | ||  || ||  |||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||      |||||||||||||||| ||    ||||| ||    
T  16647 ttaggcacattaaaccatccccaaaacatcttataacaacaatttgaaaatcaagaatttcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcaag 16746  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  ||||||   |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||    
T  16747 gcgagacatgatgttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatactcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacggccagaatctaggtttt 16835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Original strand, 25414 - 25621
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||   |||| || |    
T  25414 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagttcacaaaaccacttactcgccatggcgagttcaaggcaaactcgaggcgagt-gaaaaatag 25512  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    || ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||    
T  25513 gttctctcaggaaaaatgacatttt-ctcactcaaacctcaattctaaactccctattcatctttttaacctaaaacttgttccagtcatcattaatatc 25611  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||||||||||    
T  25612 atctaggtac 25621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Original strand, 13782 - 14160
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatgg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||   || ||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||  ||    
T  13782 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttcacaaaaacactagctcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgagtggaaatcagg 13881  T
Q  583 tgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || || | || |||    
T  13882 tactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcattaatatc 13980  T
Q  682 atctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatcactc 778  Q
    ||||||||||   ||||  | ||||||  ||  |||| |||||| ||| |||||| || |||||  |  ||| | ||||||||||||||||| |   |||    
T  13981 atctaggtaccttaaacctttcccaaa--acatcttataacaacttttcaaaaat-cacatttt-tctgggcttgctcgccatggcgagttggactgctc 14076  T
Q  779 gcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14077 gcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 14160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 488 - 873
Target Start/End: Original strand, 7643 - 8028
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgct 586  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||   ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  7643 gcctcgcgagtacttctactcgctatggcgaactcaaggaaaaggggcactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaaaagactgct 7742  T
Q  587 ctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatcta 686  Q
    || ||||    ||  |||||||||||| || ||||| ||  ||| |||||| |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  7743 ctcgggagttttgtcatttttctcactaaatcctcattttcaagttccctattcatctttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcattta 7842  T
Q  687 ggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcg 786  Q
    |  || | ||||||   | | | |  |||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||||||     |||||||||||    
T  7843 gacactcaaaactatttatatttcatcttataacaacacttcaaaaatccagttttgctcataggtactcgccacggcgagttggtctgctcgcgaggcg 7942  T
Q  787 agcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||| ||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  7943 agctatgaagttgttaactcgccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacaggcagaaaacaggtttt 8028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 488 - 873
Target Start/End: Original strand, 3604 - 3989
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgct 586  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||   ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  3604 gcctcgcgagtacttctactcgctatggcgaactcaaggaaaaggggcactcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcgaacagaaaaagactgct 3703  T
Q  587 ctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatcta 686  Q
    || ||||    ||  |||||||||||| || ||||| ||  ||| |||||| |||||||||  | |||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  3704 ctcgggagttttgtcatttttctcactaaatcctcattttcaagttccctattcatctttttgatctaaaaattgcaccagtcctctctaaaatcattta 3803  T
Q  687 ggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcg 786  Q
    |  || | ||||||   | | | |  |||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||||||     |||||||||||    
T  3804 gacactcaaaactatttatatttcatcttataacaacacttcaaaaatccagttttgctcataggtactcgccacggcgagttggtctgctcgcgaggcg 3903  T
Q  787 agcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | | |||||||| || ||| ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  3904 aactatgaagttattaactagccttggcgaacaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacaggcagaaaacaggtttt 3989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 483 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14984 - 14777
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatat-g 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| || |    
T  14984 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcaagttcacaaaattgcttgctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagt-gaaaaatag 14886  T
Q  582 gtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatc 681  Q
    ||||||| | |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  14885 gtgctctcgagaatt-tgacatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctattcatctttttaacctaaaacttgctccattcatcattaaaatc 14787  T
Q  682 atctaggtac 691  Q
    ||||||||||    
T  14786 atctaggtac 14777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 826 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14665 - 14628
Alignment:
Q  826 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665 actcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 14628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 476 - 863
Target Start/End: Original strand, 50369 - 50755
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    || ||    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |    
T  50369 actgagtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggcgagttcgcaaaaacactagctcgccatggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtaaa 50468  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||| | ||| || || |    
T  50469 aatcaggtactctcgggaaaaagtgacatttt-ctcactcaaactccaattctaaactctctattcatctttttaatctaaaactttcaccattcatcat 50567  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaac--tacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgt 771  Q
     || |||||||||||||   ||||  | |||||||||   |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  | |||| ||||||||||||||||||      
T  50568 taatatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaata--tcttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatccaggcttactcgccatggcgagttag 50664  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||   |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50665 actgctcgcgaggcgagtgatgaagttgctcactcgc-gaggcgaagcatgaatgctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 50755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 479 - 863
Target Start/End: Original strand, 1638 - 2022
Alignment:
Q  479 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcaggga-atcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaa 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| | ||    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    |||    
T  1638 gggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgccacggcgagttcacggacaacactagctcgccacggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaa 1737  T
Q  578 tatggtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaa 676  Q
    |  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |    
T  1738 ttaggtgctctcgggaaaaagtgatatttt-ctcactcaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcatcttta 1836  T
Q  677 aaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc-tactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
      |||||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||| | || ||||  |  ||| ||||||||||||||||||| |       
T  1837 ttatcatctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaaacaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggactg 1935  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1936 ctcgcgaggcgagtaatgatgttgttcactcgc-gaggcgagacatgagtactcgcgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaa 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 483 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 21872 - 21492
Alignment:
Q  483 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggta-ctcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||     || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||||  |    
T  21872 agctcgcctcgcgagcacatctgctcgccatggtgagttcacggaaaacactagctcgccgtggcgagttcaaggcgaactcgaggcgagtgaaaattag 21773  T
Q  582 gtgctctggggaaaaa-tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| |||||  || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || |||| |  ||    
T  21772 gtgctctcgggacaaagtgacatttt-ctcacccaaactccatttctaagttccctattcatctttttaacctaaaacttccaccattcttctttattat 21674  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggct-actcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||||||||||   |||| | ||  || ||  |||| |||||| ||| ||||||| || ||||  |  |||| |||||||||||||||||| |   ||||    
T  21673 catctaggtaccttaaaccatccccaaaacaccttataacaacttttcaaaaatcaag-ttttatctgggcttactcgccatggcgagttggactgctcg 21575  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21574 cgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacag-ctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacggacagaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 78; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 3017 - 3114
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3017 ctcgtgaggcgagctatgaagttgctcactcgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 3114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9466
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | ||||||     
T  9195 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctccaaaaacatccaggcactcaaaactat 9294  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattt-tcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9295 ccaacttacaccttataacaacaatttaaaaatccagattcctcactcacctactcgccatggcgagtggtttggctcgcgaggcgagctatgaagttgt 9394  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactcgcgaggcgagcgatgaac-ttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| |||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9395 tcactcgc-aaggcgagacaa--gctactcgtggggcgagcgatgaacatcctgtacgggcagaatgcaggtttt 9466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Original strand, 9087 - 9120
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9087 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 9120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 43766 - 43495
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| | |||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||| ||||||||| ||   ||||||     
T  43766 atttttctcactaaaacttcatttttaagtttcctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaattcatctaggcacttaaaactat 43667  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| | |  |||||||| ||||| ||  | |||||||||  ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  43666 ccatattacaccttataacaacaatctgtaaatccaggttttctcacagttactcgccacagcgagttgtcttgctcacgaggcgagctatgaagttgct 43567  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43566 cacttgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagtgatgaacttctgtacgagcagaatgcaggtttt 43495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 48832 - 48561
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| | |||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||| ||||||||| ||   ||||||     
T  48832 atttttctcactaaaacttcatttttaagtttcctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaattcatctaggcacttaaaactat 48733  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||| | |||  |||| ||||||| | |  |||||||| ||||| ||  | |||||||||  ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  48732 ccatattacaccttataacaacaatctgtaaatccaggttttctcacagttactcgccacagcgagttgtcttgctcacgaggcgagctatgaagttgct 48633  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48632 cacttgctaaggcgagcacaggctactcgcgaggcgagtgatgaacttctgtacgagcagaatgcaggtttt 48561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5230 - 4981
Alignment:
Q  22 catacaactcatcacgactccactaagactcctctaaacaccc---atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggtta 118  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||    
T  5230 catacaacacaccactactccactaagattcctctaatcaaccctcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggtta 5132  T
Q  119 aagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagc 214  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5131 aagcattcattttcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaagc 5032  T
Q  215 tctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5031 cctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 4981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 581 - 873
Target Start/End: Original strand, 21349 - 21641
Alignment:
Q  581 ggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaat 680  Q
    |||||||| |||||   ||| |||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  21349 ggtgctctcgggaattttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccatattcatctttttaatctaaaaattgttccagtcctctctaaaat 21448  T
Q  681 catctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagatt-ttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcg 779  Q
    |||  ||| || | |||||| ||||  |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||    ||||||||||||| |||| || |  ||||    
T  21449 cattcaggcactcaaaactatccaacttacaccttataacaacaatttaaaaatccagattcctcactcacctactcgccatggtgagtggttttgctcg 21548  T
Q  780 cgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21549 cgaggtgagctatgaagttgttcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgctggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 21641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 741
Target Start/End: Original strand, 32037 - 32176
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | ||||||     
T  32037 atttttctcactaaatcttcattttcaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgttccagtcctctctaaaatcatacaggcactcaaaactat 32136  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagatt 741  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32137 ccaacttacaccttataacaacaatttaaaaatccagatt 32176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 518
Target Start/End: Original strand, 21264 - 21297
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21264 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 21297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 523
Target Start/End: Original strand, 31935 - 31969
Alignment:
Q  489 cctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31935 cctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactca 31969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 713 - 873
Target Start/End: Original strand, 45112 - 45272
Alignment:
Q  713 cttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaag 812  Q
    |||| ||||||| || |||||  ||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  45112 cttataacaacaattcaaaaagtcagattttctcacaggtactcaccatggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgctatg 45211  T
Q  813 gcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  45212 gcgagctctggttactcgcgaggcgagcgatgaatatcagtatgggcagaatgcaggtttt 45272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 30336 - 30607
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||     
T  30336 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaaaactaa 30435  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||| | |||      | ||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||     
T  30436 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcagtcacttgctcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgc 30535  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || |||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30536 tccctcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 30607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 488 - 525
Target Start/End: Original strand, 38826 - 38863
Alignment:
Q  488 gcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38826 gcctcacgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 38863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 773 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 6252 - 6152
Alignment:
Q  773 tcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6252 tcactcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgccttggcgagcaaaggctactcgcgaggcgagtgatgaacttttgtacgggcagaatgcaggttt 6153  T
Q  873 t 873  Q
    |    
T  6152 t 6152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 223
Target Start/End: Original strand, 1 - 132
Alignment:
Q  84 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccac 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        |||| ||||||  |||||||  ||||||||    
T  1 tcaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcct--------caccgctttgaacaactagtgttccaccac 92  T
Q  184 tttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccact 223  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  93 tttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 1
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 162  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  131 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 32  T
Q  163 gagtaactagtactccaccactttgaacgac 193  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  31 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41750 - 41592
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||| |||||| | || |||||||    
T  41750 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccaga 41651  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  41650 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 1 - 87
Alignment:
Q  156 ccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa 242  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1 ccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 689
Target Start/End: Original strand, 14896 - 15010
Alignment:
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  14896 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactcaaacttcaattctaagctccctattcatctttttaatctaaaacttgctctagtcctctc 14995  T
Q  675 aaaaatcatctaggt 689  Q
     ||||||||||||||    
T  14996 taaaatcatctaggt 15010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18045 - 17932
Alignment:
Q  749 ggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaact 848  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  18045 ggctactcgccatggcgagttggactgctcgcgaggcgagctatgaagttgctcactcgccatggcgagcacaa-ctactcgcgaggcgagcgatgaact 17947  T
Q  849 tctgtacgggcagaa 863  Q
    |||||||||||||||    
T  17946 tctgtacgggcagaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Original strand, 901 - 1280
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||  |||||||||           ||||| | ||||    
T  901 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaagaaatgagttactcgctatggcgagtacgaggcgaac----------gagaaaaagggtg 990  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| ||||    
T  991 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatc 1090  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
     ||| || | |||||| ||||  |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||     ||||||| ||||||||| || |  ||||||||    
T  1091 caggcactcaaaactaaccaacttacatcttataacaacaatttaaaaatcatgatctctcactcacttactcgctatggcgagtggttttgctcgcgag 1190  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaa-cttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| | ||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  1191 gcgagctatgaagttgttcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgcgggggcaagtgatgaagatcctgtacgggcagaatgcaggtttt 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 3617 - 3718
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctcta--aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3617 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagca 3715  T
Q  124 ttc 126  Q
    |||    
T  3716 ttc 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 754 - 863
Target Start/End: Original strand, 11734 - 11842
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 853  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| | || || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11734 ctcgccatggcgagttggtctgctcgcgaggcgagcgatgaagtggctcccttgccatggcgagcaa-ggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgt 11832  T
Q  854 acgggcagaa 863  Q
    ||||||||||    
T  11833 acgggcagaa 11842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8615
Alignment:
Q  65 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcat--caggacataagtcctcaccacta--caccac 159  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  8410 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 8508  T
Q  160 tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 258  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  8509 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 8608  T
Q  259 tacatac 265  Q
    |||||||    
T  8609 tacatac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4495
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||     
T  4711 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtactcaaaactaa 4612  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | | ||||||||| ||| | ||  | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  4611 ccaaattatggcttataacaacaatctgaaaatccaggtttcctcattggtactcgccacggcgagttgtcttgctcgcgaggcgagccatgaagttgct 4512  T
Q  802 cactcgctaaggcgagc 818  Q
    |  |||| |||||||||    
T  4511 ctttcgccaaggcgagc 4495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 32500 - 32459
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32500 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 32459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 46505 - 46546
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  46505 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 46546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 326816 - 326975
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| ||     
T  326816 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagg 326915  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  326916 gccgaagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccccttgtgtatatctacatac 326975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 321040 - 321266
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| | |    |||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  321040 ctccactaagactcctctacaaa----tgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 321134  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||| | || || ||||    
T  321135 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccatttttgtgcttat 321234  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  321235 gcaacaaactccccttgtgtatatctacatac 321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 115778 - 115911
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  ||  |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  115778 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 115877  T
Q  206 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 239  Q
     | |||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  115878 ggtcgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 474 - 873
Target Start/End: Original strand, 14010 - 14400
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaac 572  Q
    |||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||  |||||||||               
T  14010 atactgggcaacttgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaaaggctactcgccgtggcgagtacgaggcgaacg---------- 14099  T
Q  573 agaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctc 672  Q
    ||||| |  ||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||||||||    
T  14100 agaaaaaaagtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctc 14199  T
Q  673 ttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
    |  ||||||||  ||| |||| |||||| ||||| |||  |||| ||||||| || |||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||| ||    
T  14200 tctaaaatcattcaggcacacaaaactaaccaaattacaccttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcactctctaactcgccatggcgagtggt 14299  T
Q  772 atcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggt 870  Q
        |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  14300 tctgctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgag-acaggctacttgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggt 14397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Original strand, 200 - 288
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  200 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgcaatggcgagctcaggaaaaaaggctactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 494 - 590
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||| || ||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  494 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggcgag-acaggctactcgccggggcgagcaatgaacatcagtatgggcaaaatgcaggtttt 590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 103063 - 102930
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| |  | ||||||    
T  103063 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccag 102964  T
Q  206 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 239  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  102963 ggccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaac 102930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 392
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||  |||||||  ||||||  |||||||||| | || |||||||    
T  550 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcgctaaactccgctttgaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccaga 451  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  450 gccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17072 - 16914
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattc-tcatcaggacataagtcctcaccactacaccac--tttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccaga 206  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||  |||||||  |||||  ||||||||||| | || |||||||    
T  17072 gaatggttaaagcattcattttcaggacataaggcctcaccgctaaactccgttttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccaga 16973  T
Q  207 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  16972 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 1269 - 1150
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| || |||||||||||||  |||    
T  1269 tactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcacggggcgagcgatgaatgtct 1172  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  1171 gcacgggcagaatgcaggtttt 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 771
Target Start/End: Original strand, 18826 - 19022
Alignment:
Q  575 aaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctt 674  Q
    |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||| | ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||     
T  18826 aaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccccattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctc 18925  T
Q  675 aaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgt 771  Q
     |||||||| |||| || | |||||| ||||| |||  ||||  |||||| || |||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18926 taaaatcatttaggcactcaaaactaaccaaattacatcttattacaacaattcaaaaatcatgattttctcacgggtactcgccatggcgagttgt 19022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 555 - 771
Target Start/End: Original strand, 9723 - 9939
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||  |||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||    
T  9723 ggcgaactcaaggcgaatgaaaatatggtgctctcaggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatcta 9822  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | |||||| ||||| |||  |||| ||||||| || |||||||  ||||||  || || |||    
T  9823 aaaattgtcccagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaaccaaattacatcttataacaacaattcaaaaatcatgattttttcacgggtac 9922  T
Q  755 tcgccatggcgagttgt 771  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9923 tcgccatggagagttgt 9939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 27840 - 28065
Alignment:
Q  39 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcatcaggac 136  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  27840 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 27933  T
Q  137 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 234  Q
    || |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27934 atgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 28033  T
Q  235 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  28034 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 28065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 28369 - 28502
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||| |||||| ||||||||| || || ||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||   ||||||     
T  28369 atttttctcagtaaaacctcatttttaagttccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggtacttaaaactat 28468  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    |||   ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  28469 ccattttacagcttataacaacatttcaaaaatc 28502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 873
Target Start/End: Original strand, 27763 - 28038
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaa 697  Q
    |||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||   |||||||||  |||||||| |||| || | |||    
T  27763 tgatatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatcttttaaatataaaaaatgtcacagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaa 27862  T
Q  698 ctacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc---tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatga 794  Q
    ||| ||||||| | ||||| ||||||| || |||||||  || | |||| ||||   | ||||||||||||||| ||    |||||||||| ||| ||||    
T  27863 ctaaccaaaatgcagcttataacaacaattcaaaaatcatga-tctcac-aggcacttgctcgccatggcgagtcgttctgctcgcgaggcaagccatga 27960  T
Q  795 agttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27961 agttgctcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaacataagtacgggcagaatgcaggtttt 28038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 529
Target Start/End: Original strand, 27661 - 27705
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaat 529  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27661 ctcgcctcgcgagtacatctactcgctatggcgagctcaaggaat 27705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 73925 - 73831
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcagg-tactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcga 570  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  73925 actgggtaactcgcctcgcgagcacatctgcttgctatggcgaactca-caaaacaggttgctcgccatggcgagttcgaggcgaactcgaggcga 73831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 2614 - 2343
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||     
T  2614 atttttctcactaaatcttcattttaaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcactcaaaactaa 2515  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| | || |||||||  ||| | |||      | |||||||||||||||  |    |||||||||||||| ||||||||||    
T  2514 ccaaattacagcttataacaaaaattcaaaaatcatgatctctcaggcacttgctcgccatggcgagtgattctgctcgcgaggcgagccatgaagttgt 2415  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    || |||| | ||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2414 tccctcg-tgaggcgagacaa--gctattcgccgaggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggtttt 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 827 - 873
Target Start/End: Original strand, 8226 - 8272
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8226 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 13128 - 13224
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13128 ctcgcgaggcgagctatgaagttgttcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgccggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 13224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 683
Target Start/End: Original strand, 12954 - 13035
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||  ||||||||    
T  12954 atttttctcactaaatcctcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccaatcctctctaaaatcat 13035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 25844 - 25930
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  25844 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 25930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 229 - 134
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |   |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  229 ctcgcgagacgagctatgaagttgttcactcgcga-ggcgag-acgagctactcgcggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 520 - 472
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctca 523  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  520 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactca 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0669 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0669
Description:

Target: scaffold0669; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 1474 - 1398
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1474 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggcaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0661
Description:

Target: scaffold0661; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 3713 - 3442
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  3713 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagccctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 3614  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgt 800  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||| | |||      | ||||||||||||||| ||    |||| ||||||||| |||||||||     
T  3613 ccaaaatacagcttataacaacaattcaaaaatcatgatctctcagtcacttgctcgccatggcgagtggttgtgctcgtgaggcgagccatgaagttgc 3514  T
Q  801 tcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||  ||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  3513 tcactcgc-gaggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtatgggcagaatgtaggtttt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 1034 - 647
Alignment:
Q  476 actgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacaga 575  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||           |||    
T  1034 actgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac----------gaga 945  T
Q  576 aatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctctta 675  Q
    || ||||| |||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||| ||| ||  ||||| |||  ||| ||||||      
T  944 aaaatggttctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatccttttaatttaaaaattgtcccaatcctctct 845  T
Q  676 aaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatca 775  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||| ||||  |||| ||||||| | | |||||| || || ||||      |||||||||||||||| ||        
T  844 aaaatcatctaggcactcaaaactaaccaatatacaccttataacaacaatctgaaaatcaaggttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctg 745  T
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||  || |||| |||  |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  744 ctcgcgaggcgggctatgaagattgctcactcgc-gagacgagacaa--gctactcgtcgaggcgagcgatgaatatcagtacgggcagaatgcaggttt 648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Original strand, 26708 - 26794
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  26708 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaggaaaaaggttactcgccttggcgagtacgaggcgaac 26794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 683
Target Start/End: Original strand, 26820 - 26905
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  |||||| |||  ||||||||    
T  26820 tgatatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcttctctaaaatcat 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 2396 - 2300
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  2396 ctcgcaaggcgagccatgaagttgttcactcgc-aacgcgagaca-ggctactcgctgaggcgagcgatgaatgtctgtacgagcagaatgcaggtttt 2300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Original strand, 26406 - 26599
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||  ||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  26406 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagatctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 26505  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||  | ||||| ||  | |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  26506 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatcatgtttttctcacaggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcgaggcgagctatgaa 26599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 485 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2679 - 2640
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcag 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2679 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcag 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 7089 - 6816
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||||||| |||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| |||||| | ||||||     
T  7089 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccgtaatcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatccaggtactcaaaactat 6990  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttg 799  Q
    ||||  |||  |||| ||||||||| ||||||||  ||| | ||||     ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||| |||    
T  6989 ccaacttacaccttataacaacattctaaaaatcatgatctctcactcacttactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagctatgaagattg 6890  T
Q  800 ttcactcgctaaggcga-gcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaa-cttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     ||||||||  |||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  6889 ctcactcgc-gaggcgacgcaa--gctactcgcgggggcgagcgatgaatctcttgtacgggcagaatgcagttttt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Original strand, 18499 - 18618
Alignment:
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttct 851  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||| | || |||| |||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  18499 tactcgccatggcgagtggttctgctcgtggggtgagccatgaagttgttcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgcggggcgagcgatgaatgtct 18596  T
Q  852 gtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  18597 gtatgggcagaatgcaggtttt 18618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Original strand, 35187 - 35240
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35187 aaatactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 35240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 124345 - 124306
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  124345 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 124306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 754 - 873
Target Start/End: Original strand, 1085 - 1203
Alignment:
Q  754 ctcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctg 852  Q
    ||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| | | |||||||| ||||| ||| ||||||| || |    
T  1085 ctcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgttcactcgc-gagacgag-actagctactcgccgaggagagtgatgaacatcag 1182  T
Q  853 tacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1183 tacgggcagaatgcaggtttt 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 555 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 4702 - 4384
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| ||  |     
T  4702 ggcgaactcaaggcgaactgaaatagggtgctctcaggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatatg 4603  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggc--- 751  Q
    ||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| ||   |||||| ||| | |||  |||| ||||||| || |||||||  ||| | |||| |||       
T  4602 aaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactatccatattacaacttataacaacaattcaaaaatcatgatct-caca-ggcact 4505  T
Q  752 tactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttc 850  Q
    |  |||||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  4504 tgttcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgggctatgaagttgttcactcgc-gaggcgag-actagctactcgtcggggcgagcgatgaacatc 4407  T
Q  851 tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
     | |||| |||||||||||||||    
T  4406 agcacggacagaatgcaggtttt 4384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2175
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| || | ||||||     
T  1905 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatctaggcactcaaaactat 2004  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
    ||||  ||   |||| ||||||| | | |||||| || || ||||      |||||||||||||||| ||    || ||||||||||| ||||||||| |    
T  2005 ccaacttataacttataacaacaatctgaaaatcaaggttctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgcttgcgaggcgagccatgaagttgct 2104  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| | ||||||  | |||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  2105 cactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtatgggcagaatgcaggtttt 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 873
Target Start/End: Original strand, 6677 - 6947
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||   |||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  6677 atttttctcactaaaacttcagttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtctcagtcctctctaaaatcatttaggcactcaaaactaa 6776  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaagttgtt 801  Q
     |||||||| ||||| ||||||| | | |||||| || || ||||      |||||||| ||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |    
T  6777 acaaaatacagcttataacaacaatctgaaaatcaaggttctcactccctaactcgccacggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagttgct 6876  T
Q  802 cactcgctaaggcgagcaatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| ||  |||||||  || |||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||    
T  6877 cactggc-gaggcgagacat-gctactcgccggggcgagcgatgaacattagtacgggtagaaaacaggtttt 6947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 598 - 873
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23793
Alignment:
Q  598 tgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaa 697  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | |||    
T  23518 tgatatttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatatgaaacttgtcccagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaa 23617  T
Q  698 ctacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag- 796  Q
    ||| ||||  ||   |||| ||||||| | | |||||| ||||| ||||      |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||     
T  23618 ctatccaacttataccttataacaacaatatgaaaatcaagattctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagg 23717  T
Q  797 ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||| ||||| || | ||||||  |    | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23718 ttgctcacttgcga-ggcgagacaaacattctcgcggggcgagcgatgaagatctgtacgggcagaatgcaggtttt 23793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 873
Target Start/End: Original strand, 2667 - 2713
Alignment:
Q  827 ctcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2667 ctcgcggggcgagcgatgaagatctgtacgggcagaatgcaggtttt 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 673
Target Start/End: Original strand, 2443 - 2513
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  2443 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaacttg-tccagtcctct 2513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 518
Target Start/End: Original strand, 23406 - 23449
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23406 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcactatggcga 23449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 78593 - 78538
Alignment:
Q  26 caactcatcacgactccactaagactcctcta--aacacccatgcatgtggtacca 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  78593 caactcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca 78538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 5157 - 5070
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  5157 atactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaaggttactcgccgtggcgagtatgaggcgaac 5070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 5039 - 4953
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctagg 688  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  5039 atttttctcactaaatcttcatttttaagctctctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctagg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 59928 - 59833
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggttt 872  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  59928 ctcgcgaggcgagccatgaagttgctcactcgcga-ggcgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacgggcagaatgcaggttt 59833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 61773 - 61395
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtg 584  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||| || ||||||||  |||| ||||           ||||| | ||||    
T  61773 ctcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcaggaaaaaggttactcaccgtggcgagtacgaggtgaac----------gagaaaaagggtg 61684  T
Q  585 ctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatc 684  Q
    |||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||     
T  61683 ctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatt 61584  T
Q  685 taggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgag 783  Q
    |||  || | |||||| ||||| ||   |||| ||||||| | | ||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||| ||    ||||||||    
T  61583 tagacactcaaaactaaccaaattataccttataacaacaatctgaaaatcatgatctctcactcactaactcgccatggcgagtggttctgctcgcgag 61484  T
Q  784 gcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag-caatggctactcg-cgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||| |||  |||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  61483 gcgagccatgaagttgctcactcgc-gaggtgagacaa--gctactcgccggggcgagcgatgaacatcagtacggccagaatgcaggtttt 61395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 3550 - 3475
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| ||||||||    
T  3550 tactgggcaactcgcctcgcgagctcatctgctcgctatggcgaactcaggaaatgggttactcgccgtggcgagt 3475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 822 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 3213 - 3161
Alignment:
Q  822 ggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3213 ggctactcgccggggcgagcgatgaaggtctgtacgggcagaatgcaggtttt 3161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8996 - 8946
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8996 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 8946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 825 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8607
Alignment:
Q  825 tactcgcg-aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  8656 tactcgcggaggcgagcgatgaatgtttgtacgggcagaatgcaggtttt 8607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 6546 - 6496
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6546 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcagg 6496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 786 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 6246 - 6160
Alignment:
Q  786 gagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | ||||||  | |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6246 gagctatgaagttgttcacgcgcga-ggcgagacaaggctactcgcggagcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgccggtttt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 72405 - 72285
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttc 850  Q
    |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||  | |||||||||| | |||||||||||||  ||    
T  72405 actcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagattgatcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgccggggcgagcgatgaatgtc 72308  T
Q  851 tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  72307 tgtacgggcagaatgcaggtttt 72285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 753 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 46234 - 46114
Alignment:
Q  753 actcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag-ttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgc-gaggcgagcgatgaacttc 850  Q
    |||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||  | |||||||||| | |||||||||||||  ||    
T  46234 actcgccatggcgagtggttctgctcgcgaggcgagccatgaagattgatcactcgcga-ggcgagaca-ggctactcgccggggcgagcgatgaatgtc 46137  T
Q  851 tgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  46136 tgtacgggcagaatgcatgtttt 46114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 46491 - 46441
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46491 tactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgctatggcgagctcagg 46441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 72666 - 72580
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||  |||||||||    
T  72666 tactgggcaactcgcatcgcgagtgaatctgctcgctatggcgagctcaagaaaaaggttactcgccatggcgagtacgaggcgaac 72580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 63029 - 62952
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggt-actcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  63029 ctcgcctcgcgagtacttctactcgctatggcgaactcaaggaaaaggggcactcgccatggcgagttcgaggcgaac 62952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 8975 - 9108
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||  ||||||||||  ||| |||| || | || | ||||||     
T  8975 atttttctcactaaaacttcatttttaagctccctattcatccttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaagtcatttaagcactcaaaactaa 9074  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  9075 ctaaaatacggcttataacaacaattcaaaaatc 9108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2016 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold2016
Description:

Target: scaffold2016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 543
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  619 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgaacttatgaaatgggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 279 - 240
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  279 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0923 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0923
Description:

Target: scaffold0923; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 734
Target Start/End: Original strand, 353 - 485
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||||     
T  353 atttttctcactaaatcttcacttttaagctctctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctgtaaaatcatttaggcactcaaaactat 452  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaat 734  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  453 ccaaattacagcttataacaacaattcaaaaat 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 6759 - 6695
Alignment:
Q  486 tcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||    
T  6759 tcgcctcgcgagcagatctgctcgctatggcgaactcaagaaatgagttactcgcgatggcgagt 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 795
Target Start/End: Original strand, 3354 - 3594
Alignment:
Q  555 ggcgaactcgaggcgaacagaaatatggtgctctggggaaaaatgatatttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaaccta 654  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||    
T  3354 ggcgaactcaaggcgaatgaaaatatggtgctctcgggagttttgacatttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatcta 3453  T
Q  655 aaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactacccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctac 754  Q
    ||| |||  |||| |||||  ||||||||||| | || | |||||| |||   |||  | || ||||||| || |||||||  ||||||| ||  | |||    
T  3454 aaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaagcactcaaaactatccatcttacaccatataacaacaattcaaaaatcatgattttctcacaggtac 3553  T
Q  755 tcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    | ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  3554 ttgccatggcgagttgtcttgctcgcggggcgagctatgaa 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 518
Target Start/End: Original strand, 4880 - 4923
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 518  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4880 tactgggcaactcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcga 4923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 673
Target Start/End: Original strand, 5789 - 5860
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctct 673  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  5789 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatcttttgaatctaaaaattgttccagtcctct 5860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 561
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5758
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||  | ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5682 ctcgcctcgcgagtacatctgctcgctatggcaaactcaagaaatgggttactcgctatggcgagtacgaggcgaac 5758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 796
Target Start/End: Original strand, 35048 - 35243
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | ||||||     
T  35048 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctaatcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaactat 35147  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagat-tttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaag 796  Q
    ||||  |||| |||| ||||||| ||| ||||||  ||| | ||||     ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  35148 ccaacttacgtcttataacaacaatttgaaaatcatgatctctcactcacttactcgctatggcgagtggttttgctcgcgaggcgagcgatgaag 35243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 549
Target Start/End: Original strand, 29700 - 29764
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgag 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||  || ||||||| ||||||||    
T  29700 ctcgcctcgcgagaacatctgctcgctatggcgaactcaagaaaggagttactcgctatggcgag 29764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 34941 - 35006
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||  || ||||||| |||||||||    
T  34941 ctcgcctcgcgagtacatcggctcgctatggcgaactcaagaaaggagttactcgctatggcgagt 35006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 791 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 230
Alignment:
Q  791 atgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcgaggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  311 atgaagttgctcactcac-aaggcgagacaaggctactcgcggggcgagcgatgaatgtcagtacgggcagaatgcagatttt 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 41425 - 41339
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  41425 tactgggcaactcgcctcacgagctcttctgctcgctatggcgaactcaggaaaacggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 41339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Original strand, 55975 - 56065
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 265  Q
    |||||| ||||||||||| | || |||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  55975 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgtttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 56065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 42701 - 42615
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  42701 tactgggcaactcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcaagaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 42615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 53396 - 53310
Alignment:
Q  475 tactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  53396 tactgggcaactcgccttgcgagcacatctgctcgctatggcgaactcatgaaaaaggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 53310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 42352 - 42313
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42352 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 42313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 834 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 53047 - 53008
Alignment:
Q  834 ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  53047 ggcgagcgatgaatgtctgtacgggcagaatgcaggtttt 53008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 13975 - 14071
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcga-ggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  13975 ctcgcgaagcgagcgatgaagttaatcactcgc-gaggcgagaaat-gctactcgcgagggcgagcgatgaatttcagctcgggcagaatgcagatttt 14071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0947 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0947
Description:

Target: scaffold0947; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 3820 - 3627
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| |||||| ||||||||| || |||||| |||  |||| |||||  ||||||||||||| ||    ||||||    
T  3820 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagacctctctaaaatcatctaggcacttataactac 3721  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatccagattttcacaaggctactcgccatggcgagttgtatcactcgcgaggcgagcgatgaa 795  Q
    ||| | ||| ||||| || |||| || |||||||  | ||||| ||  | |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||| |||||    
T  3720 ccatattacagcttataataacaattcaaaaatcatgtttttctcacaggtactcgccatggcgagttggcttgctcgcggggcgagctatgaa 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Original strand, 18904 - 18957
Alignment:
Q  472 aaatactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagg 525  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18904 aaatactgggcaactcgcctcgcgagtgcatctgctcgccatggcgagctcagg 18957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 17086 - 16953
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||     
T  17086 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctgaaaattgtcccagtcctctctaaaatcatctaggcacttaaaactat 16987  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  16986 ccatattacagcttataacaacaattcaaaaatc 16953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 11108 - 11149
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  11108 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 11149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1119 - 1027
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatacca 267  Q
    |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  1119 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8055 - 7963
Alignment:
Q  176 tccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatacca 267  Q
    |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  8055 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1215 - 1157
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 164  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  1215 tcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttga 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 8093
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 164  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  8151 tcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttga 8093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 2081 - 2139
Alignment:
Q  108 tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 164  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  2081 tcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccactttga 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 561
Target Start/End: Original strand, 45914 - 46001
Alignment:
Q  474 atactgggtagctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagttggaggcgaac 561  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| |||||  | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45914 atactgggcaactcgcctcgcgagtacatctactcgctatggtaaactcaaggaataggttactcgccgtggcgagtacgaggcgaac 46001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 776 - 873
Target Start/End: Original strand, 3791 - 3887
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgagcaatggctactcgcg-aggcgagcgatgaacttctgtacgggcagaatgcaggtttt 873  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||    
T  3791 ctcgcgaggcgagcgatgaacttcatcactcg-tgaggcgag-aattgctgctcgcggaggcgagcgatgaatgtcagttcgggcagaatgcagatttt 3887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3466 - 3412
Alignment:
Q  96 cccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcacc 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3466 cccacaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttaggacataagtcctcacc 3412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 152
Target Start/End: Original strand, 370441 - 370483
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccact 152  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  370441 gaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccact 370483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Original strand, 69 - 202
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | ||||||     
T  69 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaaacatccaggcactcaaaactat 168  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||  |||  |||| ||||||| ||| ||||||    
T  169 ccaacttacatcttataacaacaatttgaaaatc 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 881 - 1041
Alignment:
Q  110 gaatggttaaagcattctc--atcaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaacgactaagcattccag 205  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  881 gaatggttaaagcattcttttatcaagacatgcgtcctcaccactaacaccgctttgaacaacatagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 980  T
Q  206 agccgaagctctc-ccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 265  Q
      |||| || ||| || || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  981 gaccgaggcactcaccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 3513 - 3554
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  3513 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 3554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 1264 - 1223
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  1264 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 569 - 528
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  569 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 7598 - 7557
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7598 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 7557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 3188 - 3253
Alignment:
Q  485 ctcgcctcgcgagcacatctgctcgctatggcgagctcagggaatcaggtactcgccatggcgagt 550  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| |||||||||    
T  3188 ctcgcctcgcgagtgcatttgctcgctatggcgaactcaagaaatgagctactcgctatggcgagt 3253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 13785 - 13826
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13785 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 13826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 7193 - 7234
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7193 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 7234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 14573 - 14614
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14573 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 14614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 776 - 817
Target Start/End: Original strand, 13520 - 13561
Alignment:
Q  776 ctcgcgaggcgagcgatgaagttgttcactcgctaaggcgag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  13520 ctcgcgaggcgagcgatgaagttcatcactcgctatggcgag 13561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 2355 - 2222
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcatctaggtacacgaaactac 701  Q
    |||||||||||| || | ||| || |||| ||||||| |||| ||| || |||||| |||  ||||||||||  |||| |||| ||| || | |||| |     
T  2355 atttttctcactaaatcttcatttttaagttccctaaacatcattttaatctaaaaattggcccagtcctctctaaaaacatccaggcactctaaaccat 2256  T
Q  702 ccaaaatacggcttaaaacaacattttaaaaatc 735  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2255 ccaacttacgtcttataacaacattttaaaaatc 2222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22395 - 22314
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  22395 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcat 22314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26592 - 26511
Alignment:
Q  602 atttttctcactcaaacctcaattctaagctccctaatcatcttttaaacctaaaacttgctccagtcctcttaaaaatcat 683  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  26592 atttttctcactaaatcttcatttttaagctccctattcatctttttaatctaaaaattgtcccagtcctctctaaaatcat 26511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University