View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6059_low_1 (Length: 736)

Name: NF6059_low_1
Description: NF6059
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6059_low_1
NF6059_low_1
[»] chr3 (184 HSPs)
chr3 (21-712)||(53917653-53918352)
chr3 (120-712)||(53915485-53916077)
chr3 (120-712)||(1313087-1313677)
chr3 (120-708)||(51943047-51943634)
chr3 (120-712)||(25533112-25533710)
chr3 (120-706)||(746427-747019)
chr3 (120-705)||(457955-458545)
chr3 (120-705)||(455578-456168)
chr3 (120-712)||(4103885-4104478)
chr3 (120-706)||(10621525-10622122)
chr3 (120-712)||(27635647-27636207)
chr3 (120-712)||(42991958-42992538)
chr3 (368-712)||(1626672-1627016)
chr3 (366-712)||(4308270-4308616)
chr3 (369-712)||(10956016-10956359)
chr3 (369-711)||(10958313-10958655)
chr3 (120-536)||(41848809-41849244)
chr3 (368-712)||(43423452-43423796)
chr3 (365-712)||(45882860-45883208)
chr3 (347-712)||(24979611-24979976)
chr3 (366-712)||(51726996-51727341)
chr3 (367-712)||(11170327-11170672)
chr3 (353-712)||(3314593-3314953)
chr3 (367-712)||(18099159-18099504)
chr3 (368-712)||(28101991-28102335)
chr3 (353-712)||(28761416-28761776)
chr3 (367-712)||(18096889-18097235)
chr3 (369-712)||(43421404-43421747)
chr3 (353-712)||(880440-880800)
chr3 (367-712)||(3859451-3859795)
chr3 (365-712)||(18162585-18162931)
chr3 (366-712)||(43228213-43228559)
chr3 (408-712)||(38890004-38890308)
chr3 (327-660)||(6561694-6562028)
chr3 (365-712)||(48361660-48362006)
chr3 (368-710)||(5926755-5927097)
chr3 (366-712)||(27101170-27101520)
chr3 (408-712)||(42990268-42990572)
chr3 (366-709)||(43226008-43226350)
chr3 (408-712)||(9604596-9604899)
chr3 (408-712)||(30005805-30006109)
chr3 (365-712)||(32264027-32264379)
chr3 (368-712)||(53468442-53468788)
chr3 (365-712)||(12267964-12268302)
chr3 (367-712)||(5191576-5191919)
chr3 (367-712)||(22114294-22114639)
chr3 (368-712)||(36011751-36012095)
chr3 (366-712)||(39715392-39715733)
chr3 (368-712)||(10084378-10084726)
chr3 (368-706)||(47148890-47149233)
chr3 (369-712)||(51674755-51675087)
chr3 (448-712)||(1321483-1321747)
chr3 (408-706)||(25388870-25389167)
chr3 (365-712)||(26720469-26720815)
chr3 (353-693)||(889781-890119)
chr3 (120-396)||(42989957-42990234)
chr3 (367-706)||(6063441-6063782)
chr3 (367-706)||(6065791-6066131)
chr3 (365-712)||(15780781-15781147)
chr3 (367-712)||(5522616-5522949)
chr3 (367-705)||(50493922-50494260)
chr3 (368-711)||(54691564-54691906)
chr3 (347-712)||(23633363-23633721)
chr3 (365-706)||(10191305-10191649)
chr3 (366-693)||(35917952-35918284)
chr3 (457-712)||(6484372-6484628)
chr3 (347-712)||(32218999-32219353)
chr3 (408-705)||(38210334-38210631)
chr3 (443-706)||(28413027-28413290)
chr3 (354-703)||(53591105-53591442)
chr3 (466-712)||(7606577-7606822)
chr3 (464-712)||(4666534-4666782)
chr3 (408-665)||(29956650-29956907)
chr3 (353-708)||(31151256-31151609)
chr3 (495-712)||(25688149-25688367)
chr3 (368-599)||(28100143-28100374)
chr3 (367-609)||(35777344-35777587)
chr3 (347-691)||(53597144-53597485)
chr3 (368-656)||(54884081-54884367)
chr3 (492-712)||(6231849-6232068)
chr3 (451-708)||(17795269-17795523)
chr3 (451-708)||(19103709-19103963)
chr3 (355-626)||(23636938-23637205)
chr3 (521-712)||(5886276-5886466)
chr3 (521-712)||(5899749-5899939)
chr3 (508-712)||(11168165-11168369)
chr3 (368-604)||(28180948-28181182)
chr3 (451-691)||(13420195-13420432)
chr3 (451-706)||(25635391-25635644)
chr3 (451-706)||(561769-562024)
chr3 (571-712)||(47701660-47701801)
chr3 (522-712)||(3306839-3307028)
chr3 (374-706)||(36871295-36871624)
chr3 (368-592)||(28137415-28137628)
chr3 (365-706)||(1673896-1674227)
chr3 (367-512)||(11163073-11163218)
chr3 (550-706)||(24181486-24181644)
chr3 (506-704)||(1620457-1620657)
chr3 (365-548)||(24177200-24177380)
chr3 (369-497)||(6231374-6231502)
chr3 (587-706)||(25634030-25634150)
chr3 (368-498)||(47701798-47701928)
chr3 (628-712)||(41849243-41849327)
chr3 (506-706)||(14634435-14634638)
chr3 (488-638)||(4560355-4560497)
chr3 (369-487)||(3306724-3306842)
chr3 (637-712)||(35919104-35919179)
chr3 (533-679)||(11007545-11007683)
chr3 (120-188)||(6561618-6561686)
chr3 (443-673)||(13419883-13420110)
chr3 (506-709)||(29913949-29914152)
chr3 (649-712)||(53894046-53894109)
chr3 (506-709)||(47878165-47878370)
chr3 (506-679)||(10094100-10094273)
chr3 (125-198)||(53974124-53974197)
chr3 (198-281)||(11066346-11066429)
chr3 (506-679)||(11079500-11079674)
chr3 (365-439)||(1321362-1321436)
chr3 (506-709)||(10896988-10897193)
chr3 (506-679)||(10100117-10100290)
chr3 (506-679)||(10200980-10201153)
chr3 (524-709)||(10595028-10595213)
chr3 (125-198)||(11072644-11072717)
chr3 (198-270)||(54287487-54287559)
chr3 (506-679)||(7768632-7768806)
chr3 (525-707)||(27420731-27420915)
chr3 (203-265)||(53974011-53974074)
chr3 (506-679)||(54193209-54193383)
chr3 (520-709)||(4535613-4535803)
chr3 (506-709)||(10612772-10612977)
chr3 (506-679)||(6303293-6303466)
chr3 (506-679)||(10208026-10208199)
chr3 (506-679)||(27544256-27544429)
chr3 (524-709)||(27761980-27762165)
chr3 (506-583)||(16462186-16462264)
chr3 (506-583)||(22626105-22626183)
chr3 (506-583)||(47883003-47883081)
chr3 (529-679)||(13893470-13893621)
chr3 (649-700)||(48438221-48438272)
chr3 (649-703)||(1736334-1736388)
chr3 (125-198)||(11066255-11066329)
chr3 (195-265)||(11072731-11072801)
chr3 (649-703)||(16264354-16264408)
chr3 (649-703)||(18552912-18552966)
chr3 (451-548)||(25633930-25634024)
chr3 (649-703)||(25795785-25795839)
chr3 (659-709)||(30236249-30236299)
chr3 (649-703)||(30709819-30709873)
chr3 (649-703)||(32143325-32143379)
chr3 (525-679)||(10949285-10949438)
chr3 (347-439)||(1618917-1619012)
chr3 (506-679)||(5858529-5858701)
chr3 (521-583)||(11066668-11066731)
chr3 (588-709)||(15823641-15823763)
chr3 (520-583)||(16996874-16996936)
chr3 (665-712)||(42992607-42992654)
chr3 (506-679)||(54188492-54188665)
chr3 (147-198)||(54287576-54287627)
chr3 (649-703)||(1417519-1417573)
chr3 (366-432)||(6484307-6484373)
chr3 (649-703)||(8370515-8370569)
chr3 (649-703)||(27974981-27975035)
chr3 (649-703)||(27986475-27986529)
chr3 (659-709)||(46173481-46173531)
chr3 (348-457)||(4560509-4560618)
chr3 (654-703)||(21711227-21711276)
chr3 (638-679)||(48390327-48390368)
chr3 (506-559)||(20031462-20031517)
chr3 (520-583)||(26763037-26763101)
chr3 (641-693)||(28181185-28181236)
chr3 (659-703)||(40913417-40913461)
chr3 (659-703)||(44331669-44331713)
chr3 (659-703)||(51398938-51398982)
chr3 (120-155)||(27000088-27000123)
chr3 (537-681)||(46966671-46966816)
chr3 (649-703)||(26298992-26299046)
chr3 (649-703)||(33386695-33386749)
chr3 (649-703)||(37466295-37466349)
chr3 (506-581)||(38002852-38002928)
chr3 (367-416)||(6719396-6719445)
chr3 (520-569)||(7418063-7418112)
chr3 (650-703)||(24695194-24695247)
chr3 (619-679)||(31021185-31021244)
chr3 (588-638)||(42297725-42297777)
[»] chr5 (129 HSPs)
chr5 (120-712)||(18511203-18511797)
chr5 (120-712)||(18509309-18509902)
chr5 (120-712)||(25803712-25804312)
chr5 (120-712)||(26097426-26098019)
chr5 (120-712)||(27912224-27912824)
chr5 (120-712)||(18468703-18469297)
chr5 (123-712)||(18596334-18596934)
chr5 (120-712)||(27910140-27910738)
chr5 (135-712)||(10586549-10587120)
chr5 (120-706)||(15551930-15552527)
chr5 (203-712)||(18466461-18466972)
chr5 (120-563)||(26098391-26098836)
chr5 (248-712)||(40221340-40221811)
chr5 (365-712)||(21947968-21948314)
chr5 (365-712)||(25921464-25921811)
chr5 (366-712)||(39854426-39854771)
chr5 (366-711)||(10529091-10529436)
chr5 (365-712)||(2818326-2818674)
chr5 (368-712)||(25904047-25904391)
chr5 (353-712)||(31472603-31472963)
chr5 (368-712)||(17072827-17073172)
chr5 (365-712)||(4236570-4236916)
chr5 (368-712)||(24126800-24127144)
chr5 (365-712)||(36402319-36402666)
chr5 (371-712)||(10474314-10474655)
chr5 (368-712)||(2174863-2175206)
chr5 (367-712)||(38882048-38882393)
chr5 (368-712)||(1189598-1189949)
chr5 (348-712)||(6756419-6756780)
chr5 (366-709)||(37705774-37706117)
chr5 (365-712)||(16776098-16776445)
chr5 (408-712)||(6745053-6745356)
chr5 (367-706)||(31179368-31179707)
chr5 (367-706)||(31545023-31545362)
chr5 (368-712)||(695833-696166)
chr5 (366-712)||(17818483-17818826)
chr5 (408-712)||(16092190-16092495)
chr5 (367-706)||(31542678-31543016)
chr5 (408-712)||(34479409-34479714)
chr5 (376-712)||(2954368-2954704)
chr5 (446-712)||(658347-658610)
chr5 (365-712)||(12555914-12556261)
chr5 (120-396)||(3373348-3373625)
chr5 (408-708)||(34477048-34477349)
chr5 (368-712)||(39397984-39398327)
chr5 (367-712)||(31465980-31466314)
chr5 (366-712)||(6747246-6747592)
chr5 (408-712)||(21684443-21684746)
chr5 (375-712)||(21288715-21289049)
chr5 (368-638)||(34530731-34531001)
chr5 (329-706)||(6661181-6661555)
chr5 (502-712)||(20505834-20506042)
chr5 (491-712)||(41585735-41585956)
chr5 (481-712)||(2723959-2724181)
chr5 (503-712)||(39798126-39798335)
chr5 (368-582)||(20042994-20043208)
chr5 (491-712)||(4410090-4410310)
chr5 (120-298)||(21288534-21288713)
chr5 (521-710)||(10749797-10749986)
chr5 (368-586)||(20044954-20045172)
chr5 (368-712)||(36208524-36208864)
chr5 (369-712)||(9020167-9020508)
chr5 (521-710)||(10757274-10757462)
chr5 (521-706)||(38960129-38960313)
chr5 (521-712)||(15354566-15354756)
chr5 (521-712)||(23665141-23665331)
chr5 (521-712)||(23793256-23793446)
chr5 (521-706)||(3373134-3373319)
chr5 (521-712)||(15356842-15357032)
chr5 (423-692)||(17413176-17413442)
chr5 (122-267)||(17415748-17415893)
chr5 (411-712)||(20053834-20054125)
chr5 (527-712)||(23741850-23742034)
chr5 (327-464)||(41585945-41586082)
chr5 (524-679)||(15143565-15143722)
chr5 (365-506)||(20507659-20507800)
chr5 (550-639)||(42770936-42771025)
chr5 (524-679)||(4897828-4897985)
chr5 (612-711)||(26098280-26098380)
chr5 (423-666)||(2144599-2144841)
chr5 (203-411)||(15143270-15143475)
chr5 (520-706)||(15445263-15445454)
chr5 (347-592)||(42770697-42770934)
chr5 (120-219)||(6661929-6662028)
chr5 (423-583)||(4754158-4754312)
chr5 (521-707)||(23667416-23667601)
chr5 (120-194)||(40221287-40221361)
chr5 (423-578)||(29748351-29748502)
chr5 (506-709)||(22672817-22673022)
chr5 (506-679)||(1170794-1170967)
chr5 (506-679)||(10627347-10627523)
chr5 (475-697)||(15224769-15224997)
chr5 (366-463)||(4409999-4410100)
chr5 (640-712)||(20043206-20043278)
chr5 (521-638)||(34033632-34033752)
chr5 (506-679)||(35385477-35385651)
chr5 (506-705)||(2297999-2298200)
chr5 (119-169)||(15143224-15143274)
chr5 (125-198)||(5779144-5779217)
chr5 (120-169)||(18466416-18466465)
chr5 (526-709)||(25445501-25445684)
chr5 (520-634)||(13295834-13295948)
chr5 (506-583)||(31782578-31782656)
chr5 (506-679)||(1240411-1240585)
chr5 (368-435)||(2723911-2723978)
chr5 (506-679)||(17841274-17841448)
chr5 (506-710)||(26406459-26406672)
chr5 (521-583)||(32520534-32520597)
chr5 (506-709)||(25452478-25452683)
chr5 (506-709)||(28786387-28786592)
chr5 (594-654)||(20045210-20045271)
chr5 (638-709)||(42238376-42238448)
chr5 (524-583)||(11962554-11962612)
chr5 (506-556)||(16093438-16093489)
chr5 (423-651)||(35430171-35430408)
chr5 (649-703)||(9353371-9353425)
chr5 (649-703)||(28832263-28832317)
chr5 (649-703)||(36932389-36932443)
chr5 (654-703)||(17004004-17004053)
chr5 (365-416)||(2144878-2144930)
chr5 (659-703)||(8565946-8565990)
chr5 (659-703)||(19806487-19806531)
chr5 (220-268)||(32520268-32520316)
chr5 (659-703)||(32636948-32636992)
chr5 (227-307)||(6661575-6661648)
chr5 (649-703)||(10281755-10281809)
chr5 (649-703)||(11917011-11917065)
chr5 (649-703)||(15464536-15464590)
chr5 (658-703)||(31300644-31300689)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (120-712)||(11464-12056)
[»] chr1 (154 HSPs)
chr1 (120-712)||(17324629-17325222)
chr1 (120-712)||(47905961-47906558)
chr1 (120-712)||(31735514-31736110)
chr1 (120-712)||(28998246-28998839)
chr1 (120-712)||(29003962-29004555)
chr1 (120-712)||(24325352-24325951)
chr1 (120-712)||(39931767-39932362)
chr1 (120-712)||(15294827-15295434)
chr1 (119-712)||(2949225-2949811)
chr1 (120-706)||(9459416-9460008)
chr1 (120-706)||(9463243-9463835)
chr1 (120-712)||(27336933-27337527)
chr1 (120-712)||(27339124-27339725)
chr1 (142-667)||(21948226-21948756)
chr1 (237-712)||(2510318-2510801)
chr1 (340-712)||(6995693-6996065)
chr1 (227-712)||(46431699-46432207)
chr1 (367-712)||(10399821-10400166)
chr1 (365-712)||(13215022-13215374)
chr1 (365-712)||(38925474-38925818)
chr1 (367-712)||(51749982-51750327)
chr1 (351-712)||(50078813-50079175)
chr1 (353-712)||(11457468-11457827)
chr1 (366-712)||(12302498-12302849)
chr1 (365-712)||(15823487-15823834)
chr1 (347-712)||(39462443-39462807)
chr1 (365-708)||(41646861-41647204)
chr1 (365-712)||(16428594-16428942)
chr1 (353-712)||(50076665-50077024)
chr1 (368-711)||(50307540-50307884)
chr1 (367-712)||(13761780-13762124)
chr1 (347-712)||(14097962-14098327)
chr1 (365-712)||(28840619-28840967)
chr1 (367-712)||(6822958-6823302)
chr1 (368-712)||(2617460-2617804)
chr1 (369-712)||(18307054-18307397)
chr1 (366-711)||(9241079-9241425)
chr1 (368-710)||(18839531-18839874)
chr1 (342-712)||(20302378-20302746)
chr1 (365-708)||(28842434-28842778)
chr1 (369-712)||(25251267-25251611)
chr1 (327-650)||(48665074-48665404)
chr1 (365-712)||(28207061-28207406)
chr1 (368-712)||(50248563-50248909)
chr1 (365-712)||(3579610-3579958)
chr1 (368-712)||(17186120-17186465)
chr1 (368-712)||(31489859-31490200)
chr1 (353-712)||(40133864-40134233)
chr1 (367-711)||(20291400-20291743)
chr1 (367-705)||(16226110-16226448)
chr1 (408-712)||(25127856-25128161)
chr1 (367-712)||(51752308-51752651)
chr1 (394-712)||(4131368-4131692)
chr1 (366-711)||(6756469-6756815)
chr1 (399-712)||(31425008-31425325)
chr1 (365-701)||(47451589-47451919)
chr1 (368-709)||(17324009-17324349)
chr1 (369-712)||(17318838-17319175)
chr1 (347-712)||(31422853-31423232)
chr1 (367-705)||(47179652-47179993)
chr1 (347-706)||(42922157-42922514)
chr1 (368-712)||(14183583-14183923)
chr1 (367-705)||(47177301-47177642)
chr1 (120-313)||(48664857-48665050)
chr1 (347-706)||(8347270-8347627)
chr1 (491-712)||(25248544-25248766)
chr1 (470-712)||(16432440-16432684)
chr1 (120-307)||(4131690-4131877)
chr1 (348-677)||(18800600-18800925)
chr1 (355-709)||(49495206-49495549)
chr1 (504-712)||(6115095-6115304)
chr1 (521-712)||(16429054-16429246)
chr1 (365-679)||(15669419-15669731)
chr1 (123-305)||(45693834-45694016)
chr1 (367-623)||(6823827-6824091)
chr1 (131-300)||(6115532-6115701)
chr1 (521-712)||(51757628-51757818)
chr1 (491-705)||(16231630-16231843)
chr1 (521-706)||(23785936-23786121)
chr1 (249-705)||(26520119-26520580)
chr1 (347-706)||(8349049-8349407)
chr1 (119-303)||(6997218-6997395)
chr1 (374-706)||(13125455-13125787)
chr1 (565-712)||(23816027-23816174)
chr1 (153-313)||(6996067-6996221)
chr1 (365-706)||(27916438-27916780)
chr1 (365-693)||(30790412-30790734)
chr1 (506-706)||(30738625-30738830)
chr1 (120-230)||(46432521-46432631)
chr1 (122-268)||(16561138-16561284)
chr1 (506-706)||(26613237-26613440)
chr1 (503-706)||(16561545-16561751)
chr1 (596-706)||(15916562-15916674)
chr1 (506-681)||(155788-155963)
chr1 (195-281)||(11693580-11693666)
chr1 (629-712)||(13358778-13358861)
chr1 (447-638)||(28279292-28279480)
chr1 (510-677)||(43104245-43104414)
chr1 (506-709)||(21353342-21353545)
chr1 (125-281)||(13785662-13785835)
chr1 (369-464)||(25248755-25248850)
chr1 (254-316)||(6115479-6115541)
chr1 (198-281)||(14352759-14352842)
chr1 (521-669)||(14353063-14353210)
chr1 (367-463)||(16231544-16231640)
chr1 (125-244)||(32260746-32260882)
chr1 (520-583)||(14997039-14997101)
chr1 (506-709)||(2401215-2401420)
chr1 (506-709)||(4144677-4144882)
chr1 (611-706)||(13127685-13127782)
chr1 (374-568)||(26332699-26332885)
chr1 (521-581)||(26332613-26332673)
chr1 (506-679)||(9526449-9526623)
chr1 (506-706)||(46783126-46783331)
chr1 (506-679)||(2232580-2232747)
chr1 (198-281)||(10115572-10115653)
chr1 (374-499)||(13127837-13127959)
chr1 (651-703)||(13598402-13598454)
chr1 (506-583)||(25134054-25134132)
chr1 (521-616)||(49959145-49959241)
chr1 (506-679)||(2393308-2393481)
chr1 (347-418)||(16431024-16431095)
chr1 (365-408)||(43104100-43104143)
chr1 (506-678)||(9521698-9521871)
chr1 (160-198)||(10115517-10115555)
chr1 (649-703)||(16124555-16124609)
chr1 (649-703)||(19072932-19072986)
chr1 (649-703)||(19120822-19120876)
chr1 (649-703)||(26644936-26644990)
chr1 (649-703)||(32889443-32889497)
chr1 (649-703)||(47098863-47098917)
chr1 (649-703)||(47703975-47704029)
chr1 (190-235)||(13112046-13112091)
chr1 (659-703)||(834167-834211)
chr1 (659-703)||(28220226-28220270)
chr1 (659-703)||(28265554-28265598)
chr1 (639-703)||(37069774-37069838)
chr1 (659-703)||(40122196-40122240)
chr1 (659-703)||(49918474-49918518)
chr1 (659-703)||(50167175-50167219)
chr1 (530-569)||(3091240-3091279)
chr1 (649-700)||(3281715-3281766)
chr1 (125-192)||(11693686-11693753)
chr1 (677-712)||(13447266-13447301)
chr1 (424-463)||(16432405-16432444)
chr1 (368-439)||(26613503-26613577)
chr1 (649-700)||(29651818-29651869)
chr1 (521-583)||(37990773-37990836)
chr1 (120-154)||(6997388-6997422)
chr1 (649-703)||(9476265-9476319)
chr1 (649-703)||(21536608-21536662)
chr1 (661-703)||(45644354-45644396)
chr1 (653-703)||(47102884-47102934)
chr1 (328-417)||(16561373-16561461)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (120-712)||(78888-79482)
[»] chr2 (134 HSPs)
chr2 (120-712)||(42923500-42924089)
chr2 (120-712)||(23452228-23452824)
chr2 (120-712)||(42452454-42453044)
chr2 (120-705)||(35215584-35216179)
chr2 (120-705)||(35217961-35218560)
chr2 (368-712)||(19007560-19007904)
chr2 (365-712)||(40032044-40032396)
chr2 (365-712)||(42064432-42064779)
chr2 (369-712)||(19502002-19502345)
chr2 (365-712)||(22287327-22287674)
chr2 (366-712)||(45279975-45280322)
chr2 (365-712)||(21520684-21521033)
chr2 (367-712)||(19504337-19504681)
chr2 (367-712)||(27104718-27105061)
chr2 (353-712)||(28196542-28196899)
chr2 (353-712)||(17849022-17849381)
chr2 (369-712)||(6264139-6264479)
chr2 (367-712)||(13910036-13910380)
chr2 (365-712)||(6258808-6259153)
chr2 (368-712)||(11739550-11739895)
chr2 (353-712)||(17848350-17848704)
chr2 (368-712)||(14837193-14837532)
chr2 (365-712)||(43623571-43623906)
chr2 (371-712)||(3022086-3022436)
chr2 (353-680)||(45239000-45239331)
chr2 (367-712)||(24162214-24162548)
chr2 (353-707)||(31732772-31733115)
chr2 (369-626)||(15539552-15539809)
chr2 (376-712)||(34979568-34979906)
chr2 (368-712)||(44289058-44289403)
chr2 (368-706)||(11578104-11578439)
chr2 (498-712)||(5375337-5375550)
chr2 (366-708)||(22874060-22874391)
chr2 (365-712)||(18800304-18800640)
chr2 (355-706)||(20146604-20146955)
chr2 (120-565)||(27583477-27583902)
chr2 (458-712)||(28459181-28459435)
chr2 (365-706)||(17897242-17897580)
chr2 (521-712)||(36558855-36559046)
chr2 (521-712)||(36561132-36561323)
chr2 (565-712)||(22407445-22407592)
chr2 (521-705)||(45332179-45332363)
chr2 (365-705)||(35107217-35107553)
chr2 (125-316)||(28568556-28568740)
chr2 (347-706)||(37962938-37963283)
chr2 (368-545)||(22163106-22163282)
chr2 (365-518)||(22407594-22407747)
chr2 (504-706)||(40699429-40699634)
chr2 (584-712)||(22707742-22707872)
chr2 (408-605)||(38020162-38020349)
chr2 (476-633)||(27136195-27136351)
chr2 (520-652)||(20589762-20589896)
chr2 (583-712)||(23870951-23871080)
chr2 (574-700)||(7462950-7463077)
chr2 (614-712)||(22163013-22163111)
chr2 (423-638)||(43139355-43139564)
chr2 (120-244)||(27136368-27136500)
chr2 (365-679)||(35028496-35028807)
chr2 (122-316)||(34575528-34575696)
chr2 (125-281)||(15693583-15693755)
chr2 (366-503)||(5377629-5377770)
chr2 (521-638)||(15693975-15694094)
chr2 (506-679)||(17921754-17921927)
chr2 (506-709)||(17943520-17943723)
chr2 (544-706)||(13828338-13828503)
chr2 (491-590)||(38414194-38414291)
chr2 (506-709)||(27517633-27517838)
chr2 (506-679)||(39686966-39687139)
chr2 (506-669)||(33603977-33604143)
chr2 (520-705)||(2740940-2741124)
chr2 (125-188)||(28568346-28568409)
chr2 (506-679)||(39680028-39680201)
chr2 (520-679)||(2736204-2736361)
chr2 (506-583)||(28458949-28459028)
chr2 (203-266)||(39286979-39287042)
chr2 (521-708)||(10942505-10942695)
chr2 (521-708)||(10948374-10948564)
chr2 (524-706)||(12781218-12781400)
chr2 (506-709)||(20054759-20054964)
chr2 (506-632)||(30720684-30720811)
chr2 (125-198)||(41303549-41303623)
chr2 (506-679)||(17462419-17462592)
chr2 (521-581)||(26345677-26345738)
chr2 (369-462)||(38020064-38020157)
chr2 (365-439)||(12342673-12342748)
chr2 (347-463)||(20146987-20147104)
chr2 (196-281)||(7502638-7502723)
chr2 (506-709)||(30478977-30479182)
chr2 (521-581)||(7502991-7503052)
chr2 (347-416)||(40699209-40699278)
chr2 (506-583)||(22712637-22712715)
chr2 (506-583)||(22717346-22717424)
chr2 (506-583)||(45567392-45567470)
chr2 (203-274)||(41304806-41304876)
chr2 (649-703)||(14699046-14699100)
chr2 (203-273)||(41303457-41303527)
chr2 (659-703)||(17057369-17057413)
chr2 (659-703)||(17085352-17085396)
chr2 (506-583)||(17932617-17932695)
chr2 (649-703)||(8390189-8390243)
chr2 (649-703)||(13569332-13569386)
chr2 (649-703)||(20522224-20522278)
chr2 (530-583)||(27248021-27248075)
chr2 (524-679)||(37170778-37170931)
chr2 (649-703)||(39482935-39482989)
chr2 (656-709)||(1345587-1345640)
chr2 (656-709)||(2838076-2838129)
chr2 (659-703)||(723744-723788)
chr2 (659-703)||(11067429-11067473)
chr2 (506-559)||(20050166-20050221)
chr2 (659-703)||(33162450-33162494)
chr2 (659-703)||(34139770-34139814)
chr2 (506-559)||(38190980-38191035)
chr2 (659-703)||(39284960-39285004)
chr2 (128-179)||(7502582-7502633)
chr2 (660-703)||(11151591-11151634)
chr2 (521-583)||(34575230-34575292)
chr2 (129-193)||(39286892-39286952)
chr2 (527-581)||(41303155-41303210)
chr2 (506-581)||(45158291-45158369)
chr2 (649-703)||(8040064-8040118)
chr2 (649-703)||(10445483-10445537)
chr2 (649-703)||(28259216-28259270)
chr2 (649-703)||(31056048-31056102)
chr2 (506-557)||(33674551-33674604)
chr2 (649-703)||(34682373-34682427)
chr2 (618-679)||(39287262-39287324)
chr2 (125-198)||(41304898-41304964)
chr2 (679-712)||(15539520-15539553)
chr2 (638-679)||(33670992-33671033)
chr2 (654-706)||(34575133-34575186)
chr2 (423-499)||(41304596-41304668)
chr2 (654-703)||(42039713-42039762)
chr2 (638-679)||(45679838-45679879)
[»] chr7 (143 HSPs)
chr7 (120-712)||(21989858-21990448)
chr7 (120-712)||(20299160-20299758)
chr7 (120-712)||(42330988-42331588)
chr7 (120-712)||(38393688-38394284)
chr7 (120-712)||(37412116-37412711)
chr7 (120-712)||(7470013-7470616)
chr7 (120-712)||(20625739-20626336)
chr7 (120-712)||(20629630-20630227)
chr7 (120-712)||(20642049-20642646)
chr7 (120-712)||(18345242-18345839)
chr7 (184-712)||(13099465-13099996)
chr7 (120-712)||(7471971-7472569)
chr7 (120-712)||(3035420-3036022)
chr7 (120-644)||(11756930-11757460)
chr7 (120-712)||(28487254-28487851)
chr7 (120-706)||(31155908-31156495)
chr7 (120-712)||(1849670-1850279)
chr7 (120-712)||(28485266-28485863)
chr7 (120-706)||(7351649-7352241)
chr7 (120-691)||(7349285-7349862)
chr7 (123-712)||(24258166-24258766)
chr7 (219-712)||(20297163-20297660)
chr7 (203-712)||(43253508-43254027)
chr7 (327-712)||(443508-443894)
chr7 (353-712)||(20137100-20137459)
chr7 (368-712)||(44724533-44724877)
chr7 (353-712)||(4295925-4296286)
chr7 (365-709)||(27306224-27306567)
chr7 (353-711)||(11355197-11355555)
chr7 (367-712)||(40836734-40837078)
chr7 (365-712)||(31435037-31435385)
chr7 (120-464)||(7092413-7092763)
chr7 (368-693)||(21679981-21680306)
chr7 (366-712)||(48457601-48457951)
chr7 (353-712)||(9680753-9681118)
chr7 (365-712)||(35580-35927)
chr7 (365-712)||(44515-44862)
chr7 (367-712)||(1049287-1049631)
chr7 (365-712)||(3878522-3878875)
chr7 (368-712)||(24748548-24748893)
chr7 (368-712)||(39145977-39146322)
chr7 (120-464)||(7094661-7095010)
chr7 (368-709)||(21678020-21678361)
chr7 (368-712)||(42223110-42223456)
chr7 (369-712)||(9679009-9679357)
chr7 (393-712)||(21592134-21592453)
chr7 (120-416)||(1606176-1606472)
chr7 (367-712)||(25542484-25542826)
chr7 (413-712)||(40946327-40946626)
chr7 (368-684)||(27832651-27832969)
chr7 (120-416)||(38395991-38396288)
chr7 (408-712)||(1046916-1047219)
chr7 (368-650)||(25276095-25276378)
chr7 (120-384)||(21470614-21470878)
chr7 (355-663)||(22828672-22828981)
chr7 (347-706)||(7188476-7188833)
chr7 (484-712)||(7092204-7092431)
chr7 (370-693)||(24817362-24817682)
chr7 (120-315)||(47865333-47865528)
chr7 (347-670)||(20091580-20091897)
chr7 (484-712)||(7094451-7094678)
chr7 (120-436)||(3677002-3677301)
chr7 (367-638)||(22251611-22251878)
chr7 (365-607)||(26804524-26804765)
chr7 (443-706)||(24813494-24813755)
chr7 (492-712)||(38396713-38396932)
chr7 (521-706)||(2935375-2935560)
chr7 (521-712)||(22108174-22108364)
chr7 (521-712)||(40549934-40550124)
chr7 (521-706)||(9027191-9027375)
chr7 (521-712)||(22137185-22137375)
chr7 (369-706)||(24465503-24465829)
chr7 (521-712)||(40552212-40552402)
chr7 (120-263)||(443331-443474)
chr7 (521-706)||(1606487-1606671)
chr7 (568-712)||(22393876-22394021)
chr7 (365-706)||(6332177-6332514)
chr7 (365-532)||(18567564-18567731)
chr7 (547-709)||(26295580-26295743)
chr7 (423-706)||(11081521-11081803)
chr7 (506-706)||(16297018-16297222)
chr7 (120-281)||(40281824-40281987)
chr7 (423-707)||(6048884-6049167)
chr7 (365-561)||(22392424-22392608)
chr7 (544-638)||(6348912-6349006)
chr7 (530-708)||(6067193-6067373)
chr7 (506-709)||(25351336-25351539)
chr7 (506-709)||(25410113-25410318)
chr7 (565-691)||(6046644-6046772)
chr7 (651-712)||(11759364-11759425)
chr7 (451-706)||(13290470-13290723)
chr7 (506-709)||(25357030-25357233)
chr7 (520-679)||(2120898-2121056)
chr7 (529-675)||(40281411-40281552)
chr7 (506-679)||(3320076-3320249)
chr7 (506-679)||(3324824-3324997)
chr7 (125-178)||(20297108-20297161)
chr7 (506-679)||(25405376-25405549)
chr7 (125-281)||(10690684-10690845)
chr7 (506-679)||(7069763-7069936)
chr7 (506-679)||(7074770-7074943)
chr7 (348-491)||(30906264-30906405)
chr7 (484-562)||(12310157-12310234)
chr7 (506-583)||(21369625-21369703)
chr7 (506-679)||(30246953-30247127)
chr7 (506-679)||(42006646-42006820)
chr7 (195-281)||(12310442-12310528)
chr7 (506-679)||(15541021-15541194)
chr7 (475-583)||(11084438-11084544)
chr7 (506-679)||(8378529-8378703)
chr7 (649-703)||(9190047-9190101)
chr7 (649-703)||(20284093-20284147)
chr7 (666-712)||(26804762-26804808)
chr7 (123-169)||(43254023-43254069)
chr7 (506-709)||(44512520-44512724)
chr7 (414-475)||(38396316-38396377)
chr7 (659-703)||(12097867-12097911)
chr7 (638-709)||(34546874-34546946)
chr7 (374-499)||(6348778-6348903)
chr7 (525-583)||(26210651-26210710)
chr7 (649-703)||(2580394-2580448)
chr7 (132-198)||(12310542-12310608)
chr7 (649-703)||(21983288-21983342)
chr7 (649-703)||(35960820-35960874)
chr7 (524-679)||(44010775-44010929)
chr7 (649-703)||(46516349-46516403)
chr7 (650-703)||(4796707-4796760)
chr7 (598-662)||(22280379-22280444)
chr7 (506-572)||(44143997-44144065)
chr7 (638-709)||(2075231-2075303)
chr7 (638-709)||(7464513-7464585)
chr7 (659-703)||(27347941-27347985)
chr7 (659-703)||(36146408-36146452)
chr7 (659-703)||(41317434-41317478)
chr7 (659-702)||(4253529-4253572)
chr7 (524-559)||(34547007-34547042)
chr7 (649-703)||(2647735-2647789)
chr7 (649-703)||(9185204-9185258)
chr7 (649-703)||(28617264-28617318)
chr7 (649-703)||(29159807-29159861)
chr7 (649-703)||(33332489-33332543)
chr7 (287-316)||(443461-443490)
chr7 (521-562)||(8260584-8260625)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (120-709)||(51714-52307)
scaffold0005 (366-712)||(183632-183976)
scaffold0005 (120-186)||(50164-50230)
scaffold0005 (638-709)||(50235-50308)
scaffold0005 (195-237)||(170076-170118)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (120-709)||(14787423-14788016)
chr4 (120-699)||(56030194-56030770)
chr4 (120-712)||(24347964-24348560)
chr4 (120-712)||(17662236-17662821)
chr4 (120-706)||(22132389-22132982)
chr4 (120-705)||(44599836-44600423)
chr4 (120-706)||(22134615-22135214)
chr4 (120-506)||(5100748-5101133)
chr4 (222-710)||(19322547-19323035)
chr4 (365-712)||(22800853-22801200)
chr4 (365-712)||(22802725-22803072)
chr4 (365-712)||(48486314-48486661)
chr4 (365-708)||(24878984-24879328)
chr4 (366-712)||(40637070-40637416)
chr4 (365-708)||(24880446-24880790)
chr4 (365-712)||(40091406-40091753)
chr4 (365-712)||(47274722-47275067)
chr4 (353-712)||(19095865-19096225)
chr4 (365-712)||(24888791-24889138)
chr4 (366-712)||(14633316-14633660)
chr4 (353-712)||(38928168-38928528)
chr4 (369-712)||(33415479-33415821)
chr4 (355-712)||(12395836-12396193)
chr4 (366-712)||(36378288-36378635)
chr4 (355-712)||(12400798-12401155)
chr4 (367-712)||(37089363-37089710)
chr4 (365-712)||(5198415-5198762)
chr4 (243-711)||(53404998-53405474)
chr4 (366-712)||(47868397-47868743)
chr4 (366-712)||(8631410-8631760)
chr4 (365-712)||(619439-619785)
chr4 (365-712)||(22044382-22044728)
chr4 (365-712)||(22046677-22047023)
chr4 (367-712)||(11434952-11435296)
chr4 (369-712)||(37313056-37313400)
chr4 (365-712)||(9148246-9148594)
chr4 (131-712)||(30136331-30136892)
chr4 (365-712)||(36919575-36919925)
chr4 (365-712)||(36921484-36921833)
chr4 (365-712)||(51015241-51015587)
chr4 (327-706)||(18709161-18709547)
chr4 (366-712)||(2484864-2485210)
chr4 (366-712)||(6764835-6765186)
chr4 (367-706)||(16934140-16934479)
chr4 (367-712)||(11006228-11006577)
chr4 (367-712)||(18847150-18847494)
chr4 (365-712)||(38409194-38409546)
chr4 (367-712)||(7941316-7941665)
chr4 (366-712)||(16453305-16453652)
chr4 (372-706)||(41997494-41997828)
chr4 (367-706)||(16931786-16932125)
chr4 (365-712)||(31849590-31849937)
chr4 (408-712)||(11008559-11008861)
chr4 (370-706)||(9176471-9176807)
chr4 (327-693)||(47210762-47211122)
chr4 (367-706)||(9174143-9174482)
chr4 (369-683)||(13543953-13544272)
chr4 (442-712)||(26085968-26086237)
chr4 (353-706)||(18537470-18537821)
chr4 (446-712)||(36380425-36380692)
chr4 (408-705)||(22780371-22780668)
chr4 (408-705)||(22782736-22783033)
chr4 (368-706)||(18409344-18409681)
chr4 (365-644)||(5637524-5637807)
chr4 (353-706)||(18534828-18535179)
chr4 (483-709)||(16455354-16455581)
chr4 (365-644)||(3824629-3824911)
chr4 (365-706)||(8756247-8756588)
chr4 (521-712)||(13547305-13547496)
chr4 (453-712)||(27499128-27499384)
chr4 (120-693)||(10112631-10113194)
chr4 (450-706)||(38890221-38890476)
chr4 (368-598)||(3937314-3937543)
chr4 (521-712)||(2891442-2891634)
chr4 (347-626)||(52942536-52942802)
chr4 (347-696)||(15032554-15032892)
chr4 (547-712)||(4215483-4215648)
chr4 (120-669)||(9022065-9022605)
chr4 (368-588)||(6132871-6133090)
chr4 (565-712)||(5635467-5635614)
chr4 (369-706)||(28453686-28454020)
chr4 (120-265)||(47211158-47211303)
chr4 (505-706)||(12102221-12102425)
chr4 (565-712)||(11437558-11437704)
chr4 (374-706)||(9863712-9864049)
chr4 (124-316)||(38890517-38890692)
chr4 (571-712)||(5101130-5101270)
chr4 (347-706)||(16185831-16186193)
chr4 (369-662)||(40998990-40999281)
chr4 (368-531)||(38270158-38270321)
chr4 (521-703)||(3982175-3982361)
chr4 (353-531)||(24446756-24446929)
chr4 (505-666)||(31983564-31983727)
chr4 (423-691)||(47150904-47151168)
chr4 (123-269)||(9863507-9863650)
chr4 (347-706)||(25357614-25357979)
chr4 (618-712)||(47563009-47563103)
chr4 (368-487)||(2891314-2891434)
chr4 (592-710)||(49088791-49088911)
chr4 (120-216)||(19322413-19322510)
chr4 (590-666)||(24446678-24446754)
chr4 (638-709)||(14789422-14789495)
chr4 (195-281)||(54929094-54929180)
chr4 (125-281)||(38209098-38209259)
chr4 (520-712)||(5336771-5336965)
chr4 (120-186)||(14789500-14789566)
chr4 (520-706)||(26557737-26557922)
chr4 (451-679)||(36769406-36769636)
chr4 (506-679)||(7050282-7050456)
chr4 (195-274)||(10979676-10979755)
chr4 (506-709)||(8529250-8529455)
chr4 (506-673)||(4570077-4570245)
chr4 (506-679)||(11853532-11853705)
chr4 (506-706)||(16489332-16489533)
chr4 (521-668)||(54906738-54906888)
chr4 (506-679)||(31300407-31300580)
chr4 (506-709)||(4884857-4885062)
chr4 (638-712)||(6133105-6133179)
chr4 (451-709)||(36771323-36771584)
chr4 (506-708)||(15312299-15312503)
chr4 (506-583)||(55822248-55822326)
chr4 (524-679)||(4556085-4556238)
chr4 (506-679)||(15831124-15831298)
chr4 (520-666)||(16638826-16638973)
chr4 (649-703)||(5269230-5269284)
chr4 (131-193)||(5516771-5516833)
chr4 (506-709)||(16688934-16689139)
chr4 (506-709)||(18586949-18587154)
chr4 (524-709)||(15316961-15317145)
chr4 (588-706)||(3578668-3578786)
chr4 (524-673)||(4558314-4558462)
chr4 (506-583)||(25699732-25699810)
chr4 (664-712)||(52942479-52942527)
chr4 (649-703)||(5143263-5143317)
chr4 (649-703)||(10047383-10047437)
chr4 (450-706)||(10114412-10114654)
chr4 (521-583)||(29609591-29609653)
chr4 (555-593)||(38270120-38270158)
chr4 (649-703)||(39245998-39246052)
chr4 (527-582)||(3760105-3760161)
chr4 (475-577)||(38208809-38208911)
chr4 (661-712)||(3937265-3937316)
chr4 (198-257)||(29609838-29609897)
chr4 (524-583)||(47566496-47566554)
chr4 (506-581)||(5516367-5516444)
chr4 (368-439)||(12102088-12102161)
chr4 (129-198)||(29609914-29609983)
chr4 (649-702)||(36315268-36315321)
chr4 (649-702)||(36329477-36329530)
chr4 (588-652)||(54928699-54928764)
chr4 (659-703)||(12739550-12739594)
chr4 (659-703)||(26175636-26175680)
chr4 (649-697)||(34495862-34495910)
chr4 (659-703)||(36463389-36463433)
chr4 (659-703)||(48893638-48893682)
chr4 (651-703)||(54867188-54867239)
chr4 (506-562)||(4874620-4874678)
chr4 (529-706)||(22295316-22295502)
chr4 (366-413)||(36380370-36380417)
chr4 (649-703)||(5396710-5396764)
chr4 (195-237)||(14647172-14647214)
chr4 (649-703)||(38152478-38152532)
chr4 (649-702)||(6743454-6743507)
chr4 (649-709)||(25613950-25614011)
chr4 (368-416)||(52043716-52043765)
[»] chr8 (112 HSPs)
chr8 (120-711)||(41384498-41385087)
chr8 (120-712)||(15808967-15809562)
chr8 (120-712)||(41382424-41383006)
chr8 (120-712)||(3873755-3874354)
chr8 (120-712)||(28283212-28283808)
chr8 (120-712)||(43529876-43530459)
chr8 (120-711)||(608475-609077)
chr8 (327-712)||(32339264-32339653)
chr8 (353-712)||(14419181-14419541)
chr8 (368-712)||(27106888-27107232)
chr8 (353-712)||(30480494-30480853)
chr8 (365-712)||(15072707-15073055)
chr8 (365-712)||(14807748-14808105)
chr8 (347-712)||(27910994-27911357)
chr8 (347-712)||(27957413-27957776)
chr8 (366-712)||(1225164-1225511)
chr8 (365-712)||(28251558-28251905)
chr8 (353-710)||(13858477-13858834)
chr8 (365-712)||(15067978-15068325)
chr8 (365-712)||(27829294-27829640)
chr8 (365-712)||(4424015-4424362)
chr8 (365-712)||(27826983-27827329)
chr8 (368-712)||(25952521-25952865)
chr8 (369-708)||(36865538-36865877)
chr8 (408-712)||(22684644-22684951)
chr8 (327-706)||(24873178-24873563)
chr8 (367-712)||(18810707-18811051)
chr8 (368-711)||(5372168-5372512)
chr8 (367-706)||(44720842-44721181)
chr8 (347-711)||(15185706-15186066)
chr8 (424-706)||(43079658-43079940)
chr8 (367-712)||(18812892-18813225)
chr8 (408-706)||(43082013-43082311)
chr8 (368-712)||(33541401-33541723)
chr8 (368-614)||(14477276-14477522)
chr8 (368-706)||(21482322-21482649)
chr8 (458-712)||(15956051-15956302)
chr8 (347-706)||(31162192-31162551)
chr8 (396-693)||(21480542-21480828)
chr8 (399-709)||(3005624-3005931)
chr8 (120-273)||(32339099-32339252)
chr8 (353-563)||(5622878-5623088)
chr8 (266-465)||(181434-181634)
chr8 (366-545)||(26775199-26775378)
chr8 (503-706)||(31035252-31035459)
chr8 (120-232)||(3265635-3265747)
chr8 (491-668)||(181622-181799)
chr8 (574-706)||(2468126-2468259)
chr8 (506-706)||(31578273-31578476)
chr8 (353-531)||(35872555-35872728)
chr8 (423-635)||(31573794-31574001)
chr8 (506-679)||(17847661-17847830)
chr8 (506-706)||(6376124-6376328)
chr8 (456-586)||(37214317-37214438)
chr8 (365-468)||(3886153-3886256)
chr8 (365-479)||(12517248-12517364)
chr8 (590-666)||(35872477-35872553)
chr8 (365-548)||(2468261-2468436)
chr8 (506-679)||(28327891-28328064)
chr8 (369-540)||(31035068-31035238)
chr8 (648-712)||(37214255-37214319)
chr8 (521-669)||(3895973-3896124)
chr8 (506-619)||(13985163-13985278)
chr8 (506-679)||(16757293-16757466)
chr8 (506-669)||(33838956-33839120)
chr8 (506-709)||(9021101-9021306)
chr8 (506-709)||(17799418-17799623)
chr8 (588-704)||(16833769-16833886)
chr8 (506-679)||(28332614-28332787)
chr8 (637-712)||(14477519-14477595)
chr8 (195-281)||(11701364-11701447)
chr8 (506-709)||(23179555-23179760)
chr8 (506-679)||(25684626-25684799)
chr8 (506-705)||(4812486-4812686)
chr8 (506-583)||(16752643-16752721)
chr8 (506-583)||(28895485-28895563)
chr8 (506-583)||(30423195-30423274)
chr8 (125-196)||(13986304-13986374)
chr8 (506-679)||(29554810-29554984)
chr8 (506-679)||(33032637-33032811)
chr8 (649-703)||(19752433-19752487)
chr8 (506-583)||(590777-590855)
chr8 (399-455)||(37214458-37214514)
chr8 (348-403)||(6375969-6376024)
chr8 (198-269)||(13986214-13986285)
chr8 (656-703)||(19175800-19175847)
chr8 (125-196)||(30679186-30679256)
chr8 (649-703)||(4696635-4696689)
chr8 (649-703)||(9765858-9765912)
chr8 (659-709)||(10930193-10930243)
chr8 (611-664)||(14419732-14419786)
chr8 (649-703)||(26403269-26403323)
chr8 (649-703)||(31071268-31071322)
chr8 (659-703)||(1345371-1345415)
chr8 (659-703)||(15212910-15212954)
chr8 (659-703)||(27811402-27811446)
chr8 (659-703)||(33352274-33352318)
chr8 (659-703)||(40321204-40321248)
chr8 (520-583)||(2267144-2267206)
chr8 (524-583)||(3276347-3276405)
chr8 (659-702)||(4733830-4733873)
chr8 (366-421)||(14419779-14419834)
chr8 (347-398)||(17847508-17847558)
chr8 (649-703)||(5702522-5702576)
chr8 (649-703)||(7412345-7412399)
chr8 (521-582)||(13985933-13985995)
chr8 (520-562)||(15949533-15949575)
chr8 (506-557)||(21033853-21033906)
chr8 (649-703)||(23799616-23799670)
chr8 (506-558)||(11701102-11701155)
chr8 (638-679)||(28890881-28890922)
chr8 (659-700)||(40221869-40221910)
[»] chr6 (113 HSPs)
chr6 (120-712)||(30034594-30035191)
chr6 (120-712)||(30966928-30967524)
chr6 (120-712)||(2628877-2629474)
chr6 (120-703)||(12195515-12196099)
chr6 (120-712)||(19704558-19705160)
chr6 (120-706)||(26932559-26933153)
chr6 (368-712)||(13057173-13057518)
chr6 (365-712)||(9019902-9020249)
chr6 (120-706)||(17011784-17012358)
chr6 (367-712)||(11983020-11983365)
chr6 (368-712)||(13039733-13040078)
chr6 (353-712)||(3390343-3390703)
chr6 (370-712)||(3631930-3632271)
chr6 (347-711)||(15532674-15533036)
chr6 (365-712)||(14507167-14507513)
chr6 (366-712)||(28241312-28241658)
chr6 (375-712)||(14458758-14459093)
chr6 (123-497)||(17852275-17852650)
chr6 (366-712)||(1230240-1230586)
chr6 (347-712)||(15541131-15541495)
chr6 (368-712)||(3629856-3630199)
chr6 (408-712)||(4816222-4816526)
chr6 (365-708)||(32279973-32280316)
chr6 (368-712)||(25477253-25477605)
chr6 (366-712)||(30728815-30729165)
chr6 (365-660)||(15530166-15530460)
chr6 (368-693)||(3233740-3234065)
chr6 (367-708)||(20915351-20915694)
chr6 (368-705)||(24338446-24338783)
chr6 (366-712)||(26064958-26065304)
chr6 (366-712)||(26084927-26085273)
chr6 (120-391)||(18317756-18318028)
chr6 (120-706)||(22857949-22858531)
chr6 (120-316)||(5275727-5275923)
chr6 (368-712)||(12161549-12161889)
chr6 (365-679)||(3027876-3028188)
chr6 (400-706)||(15719665-15719961)
chr6 (521-711)||(1069710-1069901)
chr6 (368-638)||(22490618-22490889)
chr6 (367-597)||(19227514-19227744)
chr6 (368-708)||(14466312-14466643)
chr6 (488-706)||(5273213-5273431)
chr6 (365-706)||(16455421-16455762)
chr6 (476-706)||(15367121-15367349)
chr6 (521-706)||(26066121-26066306)
chr6 (521-706)||(33308989-33309173)
chr6 (505-712)||(12186062-12186271)
chr6 (521-712)||(29754700-29754891)
chr6 (521-706)||(26068392-26068577)
chr6 (521-706)||(33311258-33311442)
chr6 (368-706)||(19696420-19696759)
chr6 (565-706)||(15346523-15346664)
chr6 (365-514)||(1072066-1072215)
chr6 (120-281)||(20526551-20526708)
chr6 (368-513)||(32447505-32447651)
chr6 (504-706)||(26945258-26945463)
chr6 (365-488)||(8995455-8995578)
chr6 (450-664)||(20526871-20527081)
chr6 (507-706)||(28037722-28037927)
chr6 (375-513)||(13870612-13870749)
chr6 (520-678)||(12911471-12911630)
chr6 (506-706)||(25078554-25078755)
chr6 (621-712)||(10584227-10584319)
chr6 (520-678)||(12937219-12937377)
chr6 (564-679)||(30445698-30445815)
chr6 (584-706)||(25465587-25465710)
chr6 (195-281)||(30445318-30445404)
chr6 (353-534)||(15346355-15346524)
chr6 (529-706)||(11262596-11262777)
chr6 (506-679)||(13878710-13878883)
chr6 (506-679)||(16785902-16786075)
chr6 (506-709)||(17694846-17695050)
chr6 (521-634)||(7542452-7542566)
chr6 (524-679)||(22351877-22352031)
chr6 (368-481)||(10584105-10584213)
chr6 (506-679)||(13883458-13883631)
chr6 (506-709)||(13467461-13467662)
chr6 (137-198)||(30445243-30445304)
chr6 (521-581)||(11138439-11138499)
chr6 (506-583)||(26887345-26887423)
chr6 (588-683)||(28078215-28078310)
chr6 (125-198)||(30443022-30443097)
chr6 (506-583)||(31248835-31248913)
chr6 (506-583)||(35201447-35201525)
chr6 (195-281)||(30443111-30443195)
chr6 (529-583)||(5165936-5165989)
chr6 (506-581)||(19701985-19702061)
chr6 (649-703)||(31936591-31936645)
chr6 (506-583)||(3577636-3577713)
chr6 (477-582)||(6843217-6843325)
chr6 (506-583)||(17036038-17036116)
chr6 (638-709)||(25941785-25941857)
chr6 (594-651)||(3833481-3833540)
chr6 (366-439)||(12186331-12186406)
chr6 (649-703)||(5757517-5757571)
chr6 (649-703)||(10077204-10077258)
chr6 (649-703)||(31979517-31979571)
chr6 (528-709)||(12166140-12166321)
chr6 (638-706)||(30443537-30443606)
chr6 (527-676)||(25465927-25466075)
chr6 (659-703)||(26954286-26954330)
chr6 (659-703)||(33211185-33211229)
chr6 (365-439)||(25466434-25466508)
chr6 (649-703)||(5572280-5572334)
chr6 (649-703)||(21356040-21356094)
chr6 (649-703)||(22709022-22709076)
chr6 (524-709)||(26643179-26643362)
chr6 (524-709)||(26749145-26749328)
chr6 (342-396)||(28038012-28038066)
chr6 (443-499)||(4595049-4595102)
chr6 (353-398)||(15367000-15367045)
chr6 (638-679)||(17038350-17038391)
chr6 (527-583)||(25941650-25941704)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (120-667)||(1740-2293)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (365-712)||(3947-4292)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (366-712)||(41474-41820)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (365-712)||(69283-69633)
scaffold0025 (365-523)||(73203-73365)
scaffold0025 (482-530)||(73160-73208)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (408-709)||(14376-14677)
scaffold0131 (365-709)||(14969-15313)
scaffold0131 (506-548)||(31124-31168)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (353-712)||(79797-80156)
scaffold0004 (506-583)||(188363-188441)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (367-706)||(6151-6490)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (367-704)||(2832-3168)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (353-712)||(85169-85528)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (408-706)||(34-332)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (347-706)||(15817-16174)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (408-712)||(29164-29467)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (258-706)||(1638-2080)
scaffold0468 (120-230)||(2070-2180)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (482-712)||(1444-1673)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (369-706)||(16646-16981)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (327-691)||(4727-5089)
scaffold0133 (121-263)||(4552-4694)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (368-595)||(35593-35819)
scaffold0011 (638-712)||(35817-35891)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (521-712)||(22222-22412)
scaffold0140 (521-712)||(24497-24687)
scaffold0140 (649-703)||(8458-8512)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (120-209)||(1-90)
scaffold1674 (669-712)||(1442-1485)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (366-536)||(993-1168)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (519-697)||(57433-57615)
scaffold0008 (198-268)||(57836-57905)
scaffold0008 (125-196)||(57926-57995)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (649-712)||(4670-4733)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (506-679)||(16308-16482)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (506-583)||(224802-224880)
scaffold0006 (651-703)||(5687-5739)
scaffold0006 (649-703)||(2496-2550)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (510-709)||(16980-17181)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (659-703)||(20415-20459)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (649-703)||(44000-44054)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (638-679)||(3095-3136)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 184)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 53918352 - 53917653
Alignment:
Q  21 aggcatcgactatactctgcaagatttcgtagacataaattagagagcaccatgacaaggagatattaagagacatcaacaccattctacaaagtctgat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  53918352 aggcatcgactatactctgcaagatttcgtagacataaattagagagcaccatgagaaggagatattaagagacatcaacaccattctacagagtttgat 53918253  T
Q  121 a--------gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttat 212  Q
    |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53918252 attgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttat 53918153  T
Q  213 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53918152 ggacaataaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaa 53918053  T
Q  313 ggagnnnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagat 412  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53918052 ggagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagat 53917953  T
Q  413 agagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
     ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917952 ggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 53917853  T
Q  513 atcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917852 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 53917753  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53917752 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 53917653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 53916077 - 53915485
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53916077 tagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 53915978  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  53915977 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 53915878  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  53915877 aaaaaacgtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggg 53915778  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga 519  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||     
T  53915777 gctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgt 53915678  T
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915677 gaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 53915578  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53915577 ttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttg 53915485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 1313087 - 1313677
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1313087 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaat 1313186  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  1313187 aaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 1313286  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  1313287 aaaaaa-gtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggg 1313385  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga 519  Q
    ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1313386 gctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 1313484  T
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1313485 gaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 1313584  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1313585 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1313677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 708
Target Start/End: Original strand, 51943047 - 51943634
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51943047 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 51943146  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       
T  51943147 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaaggagaaa 51943246  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  51943247 gaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggt 51943346  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga 519  Q
    ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  51943347 gctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 51943446  T
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||    
T  51943447 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctctt 51943545  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51943546 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 51943634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 25533112 - 25533710
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25533112 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaat 25533211  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  25533212 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 25533311  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-------- 411  Q
           |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||            
T  25533312 aaaac--gtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagaga 25533409  T
Q  412 tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 511  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25533410 tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgatt 25533509  T
Q  512 catcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 611  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533510 caccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 25533609  T
Q  612 tatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25533610 tttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattctttt 25533709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Original strand, 746427 - 747019
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  746427 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 746526  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  746527 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 746626  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  746627 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 746726  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  746727 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattca 746826  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
     ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746827 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 746926  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  746927 ttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 747019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 705
Target Start/End: Original strand, 457955 - 458545
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  457955 tagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtggacaat 458054  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  458055 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 458154  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----tag 414  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    |||    
T  458155 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatag 458254  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  458255 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcac 458354  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  458355 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 458454  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  458455 tctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 705
Target Start/End: Original strand, 455578 - 456168
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  455578 tagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtggacaat 455677  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  455678 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 455777  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----tag 414  Q
            |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    |||    
T  455778 aaaaaaacgtatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatag 455877  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  455878 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcac 455977  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  455978 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 456077  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  456078 tctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 4104478 - 4103885
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4104478 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatggacaat 4104379  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  4104378 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 4104279  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    |||||||    
T  4104278 aaaaaaacgtatc---agtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatag 4104182  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4104181 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 4104082  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4104081 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 4103982  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4103981 ctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 4103885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 10622122 - 10621525
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10622122 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatggacaat 10622023  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  10622022 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 10621923  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-------- 411  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||            
T  10621922 aaaaac-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagaga 10621824  T
Q  412 ----tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
        ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10621623 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 10621525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 27636207 - 27635647
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27636207 tagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 27636108  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27636107 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag--a 27636010  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttata-cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27636009 aaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatattttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagaggg 27635910  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||                 
T  27635909 ggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt----ggg------------- 27635827  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  27635826 --aaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 27635741  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27635740 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 27635647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 42991958 - 42992538
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42991958 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 42992057  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  42992058 aaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 42992157  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagataga 415  Q
           |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||  ||    ||||||||    
T  42992158 aaaaaacgtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagataga 42992257  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  42992258 gggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacc 42992357  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||               ||||||||||||| ||||||| ||    
T  42992358 ttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttc 42992441  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42992442 tcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttg 42992538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626672
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcc 1626717  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626716 cagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 1626672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 4308616 - 4308270
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  4308616 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4308517  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4308516 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 4308270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956016
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccacc 10956060  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10956059 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 10956016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 369 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958313
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 10958356  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10958355 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10958313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 120 - 536
Target Start/End: Original strand, 41848809 - 41849244
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41848809 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 41848908  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag--- 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       
T  41848909 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaagagaaa 41849008  T
Q  317 ------nnnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttg-- 408  Q
                    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||      
T  41849009 aaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgag 41849108  T
Q  409 --------agatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttt 500  Q
            |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849109 agagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttt 41849208  T
Q  501 gagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt 536  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  41849209 gagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423452
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccct 43423497  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43423496 gagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 43423452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 45882860 - 45883208
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  45882860 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 45882959  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45882960 atagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 45883059  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45883060 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 45883159  T
Q  665 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45883160 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 45883208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Original strand, 24979611 - 24979976
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24979611 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaac 24979709  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24979710 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttg 24979809  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtga 645  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24979810 gttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtga 24979909  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24979910 aacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 24979976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 51727341 - 51726996
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |    
T  51727341 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgta 51727242  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  51727241 tagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 51726996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170672
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11170426  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  11170427 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctggga 11170526  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11170527 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 11170626  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11170627 ccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttg 11170672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 3314593 - 3314953
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  3314593 aatttatgagggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaa 3314692  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3314693 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaca 3314792  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3314793 ggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacgga 3314892  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3314893 gggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3314953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 18099504 - 18099159
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18099504 acttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaa-cttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 18099407  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18099406 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 18099307  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18099306 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 18099207  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18099206 ccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 18099159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101991
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||  | ||| || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccc 28102036  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28102035 aaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttg 28101991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28761776 - 28761416
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28761776 aatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaa 28761677  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28761676 actagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttaca 28761578  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28761577 ggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgga 28761478  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  28761477 ggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttg 28761416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 18097235 - 18096889
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18097235 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaa-cttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 18097137  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18097136 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 18097037  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18097036 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctc 18096937  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18096936 ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttg 18096889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421404
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccc 43421448  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43421447 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 43421404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 880800 - 880440
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  880800 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaa 880701  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  880700 actagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttac 880601  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgga 651  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  880600 ggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatgga 880501  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  880500 gggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttg 880440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859795
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3859550  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3859551 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  3859651 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctccc 3859749  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3859750 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3859795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 18162585 - 18162931
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatca-gagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18162585 atacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 18162682  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162683 tatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 18162782  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162783 ggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 18162882  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||    
T  18162883 tcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttg 18162931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 43228213 - 43228559
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  43228213 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgta 43228312  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  43228313 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttg 43228559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890308
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38890204 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 38890303  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  38890304 ttttg 38890308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 327 - 660
Target Start/End: Original strand, 6561694 - 6562028
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaa 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  6561694 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa 6561792  T
Q  427 caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacac 526  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  6561793 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 6561892  T
Q  527 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaa 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6561893 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaa 6561992  T
Q  626 agttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     || |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  6561993 ggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 48362006 - 48361660
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48362006 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 48361908  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  48361907 atagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgg 48361808  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48361807 ggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctc 48361708  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48361707 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 48361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926755
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||     
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccg 5926798  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5926797 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 27101520 - 27101170
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatc----ttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||     | ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27101520 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27101421  T
Q  462 tgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27101420 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttg 27101170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990572
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 42990567  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  42990568 ttttg 42990572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 366 - 709
Target Start/End: Original strand, 43226008 - 43226350
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| |    
T  43226008 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgta 43226106  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  43226107 tagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604596
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9604700 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattc 9604601  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  9604600 ttttg 9604596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006109
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30006104  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  30006105 ttttg 30006109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 32264379 - 32264027
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaat----cttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||    
T  32264379 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagt 32264280  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  32264279 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 32264180  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgc 658  Q
     ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32264179 ctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 32264080  T
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  32264079 tctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttg 32264027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468442
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccc 53468490  T
Q  667 ccag--actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53468489 ccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 53468442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12268302 - 12267964
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaa-ctagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12268302 atacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttg 12268203  T
Q  464 aatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268202 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 12268103  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12268102 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctc 12268014  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12268013 tcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 12267964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5191919
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 5191675  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  5191676 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5191775  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    
T  5191776 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-cc 5191873  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5191874 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 5191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114294
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 22114540  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22114539 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 22114440  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  22114439 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctccc 22114340  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22114339 ccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 22114294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012095
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |      
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttctt 36012050  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36012051 cagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttg 36012095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 39715392 - 39715733
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |    
T  39715392 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-gctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgta 39715490  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39715491 tagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||  ||||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcc 39715686  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39715687 cccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttg 39715733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 10084726 - 10084378
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||    ||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10084726 cttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttg 10084627  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  10084626 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctg 10084527  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10084526 ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 10084427  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10084426 ccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttg 10084378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 368 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148890
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgag----atagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||    |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaa-caaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctct 47148935  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47148934 ctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674755
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||         
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttg----- 51674993  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
          || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  51674992 ------tccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccc 51674799  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51674798 ataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 51674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 448 - 712
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321747
Alignment:
Q  448 acaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttgg 547  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  548 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 647  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  648 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1321747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 408 - 706
Target Start/End: Original strand, 25388870 - 25389167
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25388870 gagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 25388969  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25388970 gattcaccttggaaa-cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaaccc 25389068  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25389069 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 25389167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 26720469 - 26720815
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  26720469 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 26720568  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||     
T  26720569 atagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgg 26720667  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  26720668 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctc 26720767  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26720768 ccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttg 26720815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 353 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 890119 - 889781
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  890119 aatttatgagggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aa 890022  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  890021 cctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 889922  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgga 651  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  889921 gggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgga 889823  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  889822 gggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 120 - 396
Target Start/End: Original strand, 42989957 - 42990234
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  42989957 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggacaat 42990056  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  42990057 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 42990156  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatca 396  Q
           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990157 aaaaaaatgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063441
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6063683  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063682 atagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6063583  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  6063582 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 6063484  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  6063483 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatt 6063441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065791
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag-ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6066032  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6066031 tagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 6065932  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  6065931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctc 6065833  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  6065832 ccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatt 6065791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 15780781 - 15781147
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15780781 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 15780880  T
Q  465 atagagtt-----------tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 553  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15780881 atagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgg 15780980  T
Q  554 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 648  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||    
T  15780981 gaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaac 15781080  T
Q  649 ggaggg---ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15781081 gaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 15781147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522616
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||       
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg--- 5522853  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
            |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  5522852 --------tctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5522761  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5522760 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 5522662  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5522661 gcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 5522616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 367 - 705
Target Start/End: Original strand, 50493922 - 50494260
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  50493922 actttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 50494021  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  50494022 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattggg 50494121  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  50494122 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 50494220  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50494221 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 368 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691564
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||  | |    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
     |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  54691607 tagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattctttt 54691564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Original strand, 23633363 - 23633721
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  23633363 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaac 23633461  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| | |  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23633462 aagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttaccgggaaa--cactattaggattgagtctcttg 23633556  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23633557 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtga 23633655  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  23633656 aaaggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttg 23633721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 10191649 - 10191305
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagataga----gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| |||    ||| |||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  10191649 atacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggt 10191550  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  10191549 ttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagagg 10191450  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10191449 ctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 10191351  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10191350 tctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 366 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 35918284 - 35917952
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  35918284 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 35918185  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35918184 tagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  560 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 659  Q
    | || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  660 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  35917984 ctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaact 35917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 457 - 712
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484628
Alignment:
Q  457 gggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 555  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  556 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 655  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  656 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6484628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Original strand, 32218999 - 32219353
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||    
T  32218999 gttccaaattt-taagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaac 32219097  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    |||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32219098 aacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttg 32219186  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtga 645  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32219187 gttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtga 32219286  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32219287 aacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 32219353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 408 - 705
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210631
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  38210534 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 443 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 28413290 - 28413027
Alignment:
Q  443 caacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattga-gtc 541  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  28413290 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtc 28413191  T
Q  542 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 641  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  28413190 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatata 28413092  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413091 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatt 28413027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 354 - 703
Target Start/End: Original strand, 53591105 - 53591442
Alignment:
Q  354 atttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaa 453  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53591105 atttatgaggaatgcttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaa 53591204  T
Q  454 ctagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 553  Q
    |||||||||           |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  53591205 ctagggttt-----------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacga 53591293  T
Q  554 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagg 653  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  53591294 gaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagg 53591393  T
Q  654 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53591394 gatgctctct-ccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 466 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606577
Alignment:
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 7606577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 464 - 712
Target Start/End: Original strand, 4666534 - 4666782
Alignment:
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4666534 aatagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattg 4666633  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4666634 agactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc 4666733  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4666734 t---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttg 4666782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 408 - 665
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 353 - 708
Target Start/End: Original strand, 31151256 - 31151609
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaaca 450  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||| |    
T  31151256 aatttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaaga 31151354  T
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31151355 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 31151451  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca-tcatatagtgaaacg 649  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||    
T  31151452 cgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacg 31151549  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  31151550 gagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattct 31151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 495 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688149
Alignment:
Q  495 gggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactta 594  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  595 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  694 aggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |||||| || ||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttg 25688149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 368 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 367 - 609
Target Start/End: Original strand, 35777344 - 35777587
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  35777344 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 35777443  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35777444 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 35777543  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777544 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 691
Target Start/End: Original strand, 53597144 - 53597485
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| || | ||||    
T  53597144 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg-gatgaaacaagggtttataa-gtcaac 53597241  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  53597242 aagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 53597338  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    || | | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  53597339 gtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 53597438  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 691  Q
    || |||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  53597439 aatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 368 - 656
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884367
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaac 54884278  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggct 656  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  54884279 tttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 492 - 712
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232068
Alignment:
Q  492 ctagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac 591  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  592 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  691 actaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttg 6232068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 451 - 708
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795523
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||| || || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattct 17795523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 451 - 708
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103963
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||| || || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattct 19103963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 355 - 626
Target Start/End: Original strand, 23636938 - 23637205
Alignment:
Q  355 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaac 454  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  23636938 tttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaac 23637036  T
Q  455 tagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 554  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  23637037 tagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatggg 23637133  T
Q  555 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 626  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23637134 aagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 5886276 - 5886466
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  5886276 aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttgtc-tt 5886374  T
Q  621 tgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5886375 tgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 5886466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 5899749 - 5899939
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5899749 aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 5899847  T
Q  621 tgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5899848 tgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 5899939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 508 - 712
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168369
Alignment:
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  11168365 ttttg 11168369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 368 - 604
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 604  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 451 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420195
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaa 691  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  13420236 gagagctgctctct-caccagactaggtcagttttggaccgaa 13420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 451 - 706
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | ||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 451 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561769
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  650 gagggctgctctctccc-ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 571 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701660
Alignment:
Q  571 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  671 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttg 47701660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 522 - 712
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307028
Alignment:
Q  522 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  622 gtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttg 3307028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 374 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871295
Alignment:
Q  374 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagttt 473  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| || | |  || ||| ||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggaggggg-gctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  474 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggg 573  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T
Q  574 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 671  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36871429 tagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaga 36871331  T
Q  672 ctaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  36871330 ctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 368 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagact 592  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Original strand, 1673896 - 1674227
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||  ||||| |    |||| |||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||    
T  1673896 atacttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagtctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttg 1673994  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1673995 tatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattg 1674091  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||        |  || |||||| |||||||||||    
T  1674092 ggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac--------ttttggaacggatggctgctctct 1674183  T
Q  664 cccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1674184 ccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 367 - 512
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11163172  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163173 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 550 - 706
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181644
Alignment:
Q  550 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 648  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| | ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctcttt-gtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  703 aa 704  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Original strand, 24177200 - 24177380
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  24177200 atacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttaga-tgtcaacaagaaaactagggtttg 24177298  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggt 548  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177299 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 369 - 497
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactaggg 497  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 587 - 706
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  587 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 685  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  686 accgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 368 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 498  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 628 - 712
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849327
Alignment:
Q  628 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 41849327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634435
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||  |  |||||||||| | | || ||||||||||||| ||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaactaggtaaaca 14634439  T
Q  703 aatt 706  Q
    ||||    
T  14634438 aatt 14634435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 488 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560355
Alignment:
Q  488 aacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 638  Q
       |||    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 487
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  469 agtttgtctcttgggaaca 487  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 637 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919104
Alignment:
Q  637 atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 35919104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 533 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007545
Alignment:
Q  533 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 632  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  633 catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 188
Target Start/End: Original strand, 6561618 - 6561686
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatat 188  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561618 tagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat 6561686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 673
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420110
Alignment:
Q  443 caacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtct 542  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  543 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac-ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-ta 639  Q
    |||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| ||  || ||| | ||| |||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13419978 cttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatta 13420076  T
Q  640 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 673  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||||||||    
T  13420077 tagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29913949
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 29914054  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||    
T  29914053 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 29913958  T
Q  701 caaattctt 709  Q
    |||||||||    
T  29913957 caaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 649 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894046
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 53894046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878165
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 47878272  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| |||     
T  47878271 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggta 47878176  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  47878175 aacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094100
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 10094175  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10094174 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974124
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaattatattttgtgct 53974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 281
Target Start/End: Original strand, 11066346 - 11066429
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11066346 tgaaaatacatttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 11079500 - 11079674
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| || ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  11079500 ttgattcatcttgaacaaaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 11079598  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11079599 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 439
Target Start/End: Original strand, 1321362 - 1321436
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1321362 atacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1321436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897193
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 10897086  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  10897087 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 10897182  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  10897183 aacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100117
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaa 10100192  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10100191 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10200980
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 10201055  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10201054 actcat---tatctc-tttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595028
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   ||||||| ||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctc-tttg 10595119  T
Q  623 taaagttactca--tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||  |||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  10595118 taaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072717
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11072717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 54287559 - 54287487
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttga 270  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  54287559 tgaaaatatatttatggataataaatacatttttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768806
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   | ||||  |||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 7768731  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |  || ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  7768732 cttttaatat-acctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtca 7768806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 707
Target Start/End: Original strand, 27420731 - 27420915
Alignment:
Q  525 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||||| |||  ||||  ||||    
T  27420731 actattagaactcagtctcttggtcacgggaagagattcgaggttttcggtataattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaatct--tttg 27420828  T
Q  623 taaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||  || | |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27420829 taaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattc 27420915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53974074 - 53974011
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatg-aagaacgatttgatgcaaatatat 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  53974074 atatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaggaagatttgatgcaaatatat 53974011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193383
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54193307  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  || |  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54193308 actca---atatctc-tttgtaaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 54193383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Original strand, 4535613 - 4535803
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   |||||||     
T  4535613 aaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc- 4535707  T
Q  619 tttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc-cccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4535708 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4535803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 10612977 - 10612772
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||| ||    
T  10612977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttata 10612879  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  10612878 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 10612783  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  10612782 aacaaattctt 10612772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303466
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| |    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaa 6303391  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6303392 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208026
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 10208101  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10208100 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544429
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtg-gaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 27544354  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27544355 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtca 27544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761980
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27762071  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||| |||||||  | ||||| ||||||| |||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27762070 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 27761980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462264
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626105
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883003
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 679
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893621
Alignment:
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 627  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctc-tttgtaaag 13893566  T
Q  628 ttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
      ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  13893567 aaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagagtaggtca 13893621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 48438272 - 48438221
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  48438272 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 1736334 - 1736388
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1736334 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 11066255 - 11066329
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttact-aaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  11066255 tgactcataatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaaagataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11066329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 265  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 16264408 - 16264354
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16264408 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 18552912 - 18552966
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18552912 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 548
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggt 548  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |  | |||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 25795839 - 25795785
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25795839 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 659 - 709
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236299
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 30709819 - 30709873
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30709819 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 32143379 - 32143325
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32143379 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949285
Alignment:
Q  525 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg-gaacttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgt 10949344  T
Q  624 aaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||  ||||  |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10949343 aaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10949285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1619012 - 1618917
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt--gagatagagggagct-aaaacaagggtttagaa 439  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1619012 gttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaa 1618917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858701
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 5858625  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5858626 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 521 - 583
Target Start/End: Original strand, 11066668 - 11066731
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11066668 aaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 588 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823641
Alignment:
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttgg 685  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||| || ||| || |||||| ||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctc-tttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgg 15823665  T
Q  686 accgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  15823664 accgaattgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 520 - 583
Target Start/End: Original strand, 16996874 - 16996936
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16996874 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 665 - 712
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992654
Alignment:
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttg 42992654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188665
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54188590  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54188591 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtca 54188665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54287627 - 54287576
Alignment:
Q  147 agaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  54287627 agaagattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttcgtgct 54287576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 1417519 - 1417573
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1417519 ggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 432
Target Start/End: Original strand, 6484307 - 6484373
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaaggg 432  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6484307 tacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 8370515 - 8370569
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8370515 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 27974981 - 27975035
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27974981 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 27986475 - 27986529
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27986475 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 659 - 709
Target Start/End: Original strand, 46173481 - 46173531
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46173481 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaacaatttctt 46173531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4560618 - 4560509
Alignment:
Q  348 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaaca 447  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| ||||||| |||||||  || |||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |  ||||    
T  4560618 ttccaattttacgagggatactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaaca 4560519  T
Q  448 acaaaactag 457  Q
    ||||||||||    
T  4560518 acaaaactag 4560509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 654 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 21711276 - 21711227
Alignment:
Q  654 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21711276 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 638 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390327
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 48390327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031462
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20031462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 520 - 583
Target Start/End: Original strand, 26763037 - 26763101
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26763037 aaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaagaaattcgagacttcgggtagaattagg 26763101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 641 - 693
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181236
Alignment:
Q  641 agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggactgaact 28181236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 155
Target Start/End: Original strand, 27000088 - 27000123
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattg 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27000088 tagtatgactgaaaatttgatggatggagaatattg 27000123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966671
Alignment:
Q  537 gagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 634  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctc-tttgtaaagaaactca 46966718  T
Q  635 tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 681  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  46966717 tcattatagtggaacagagagctgccctct-ccccagagtaggtcaat 46966671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 26299046 - 26298992
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  26299046 ggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 33386695 - 33386749
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  33386695 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 37466349 - 37466295
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  37466349 ggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 581
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002928
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 6719445 - 6719396
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||    
T  6719445 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 569
Target Start/End: Original strand, 7418063 - 7418112
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 569  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7418063 aaaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 650 - 703
Target Start/End: Original strand, 24695194 - 24695247
Alignment:
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24695194 gagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 31021244 - 31021185
Alignment:
Q  619 tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31021244 tttgtaaagttactcatcattatattg-aacggagggctgctctc-accccagactaggtca 31021185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 42297777 - 42297725
Alignment:
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctctt--ttgtaaagttactcatcat 638  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42297777 agactgattcttgtaaccctttgatatctttttgttgtaaagttactcatcat 42297725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 18511797 - 18511203
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18511797 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18511698  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18511697 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18511598  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagg 417  Q
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  ||||||    
T  18511597 aaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagg 18511498  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18511497 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18511398  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18511397 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc 18511298  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511297 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 18511203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 18509902 - 18509309
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18509902 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18509803  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18509802 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18509703  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagg 417  Q
           |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  ||||||    
T  18509702 aaaaaacgtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagg 18509603  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18509602 g-gctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18509504  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  18509503 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatcta 18509404  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509403 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttg 18509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 25803712 - 25804312
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25803712 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 25803811  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  25803812 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 25803911  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt---------gag 410  Q
           |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          |||    
T  25803912 aaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagagagagagag 25804011  T
Q  411 atagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 510  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804012 atagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 25804111  T
Q  511 tcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 610  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804112 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 25804211  T
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25804212 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttt 25804310  T
Q  711 tg 712  Q
    ||    
T  25804311 tg 25804312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 26097426 - 26098019
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26097426 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatggacaat 26097525  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaa--agggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagn 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26097526 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagg 26097625  T
Q  318 nnnnnnnn-tgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26097626 aaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagag 26097725  T
Q  417 ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatct 516  Q
    || ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26097726 ggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacct 26097825  T
Q  517 tgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 616  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26097826 tg-gaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatct 26097924  T
Q  617 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097925 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttg 26098019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 27912224 - 27912824
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27912224 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 27912323  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27912324 aaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 27912423  T
Q  320 nnnnnnt--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ 411  Q
             |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||          
T  27912424 aaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagaga 27912523  T
Q  412 tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 511  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  27912524 tagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgatt 27912623  T
Q  512 catcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 611  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912624 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 27912723  T
Q  612 tatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27912724 tttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 27912823  T
Q  712 g 712  Q
    |    
T  27912824 g 27912824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 18468703 - 18469297
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18468703 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18468802  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18468803 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18468902  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----taga 415  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||  ||||||    ||||    
T  18468903 ataaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagataga 18469002  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18469003 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacc 18469102  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18469103 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttc 18469202  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18469203 tcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttg 18469297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 123 - 712
Target Start/End: Original strand, 18596334 - 18596934
Alignment:
Q  123 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18596334 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaataaa 18596433  T
Q  223 tata-----------tttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 311  Q
    ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18596434 tataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattctatcactga 18596533  T
Q  312 aggagnnnnnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgag 410  Q
    |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18596534 aggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttggg 18596633  T
Q  411 atagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 510  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  18596634 atagagggggctgaaacaagggtataaa--gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgat 18596731  T
Q  511 tcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 610  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18596732 tcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattg 18596831  T
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18596832 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattctt 18596931  T
Q  710 ttg 712  Q
    |||    
T  18596932 ttg 18596934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 27910140 - 27910738
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27910140 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 27910239  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27910240 aaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 27910339  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag-- 416  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||| ||||      
T  27910340 aaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagat 27910439  T
Q  417 ----ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
        || ||| |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27910440 agcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 27910538  T
Q  513 atcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
    | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910539 accttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 27910638  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27910639 ttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 27910738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 712
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10587120
Alignment:
Q  135 tttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgta 234  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  235 ccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt-gtatctt 333  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatctt 10586748  T
Q  334 cagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----tagagggagctaaaacaa 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||    ||||||| ||| ||||||    
T  10586749 cagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggg-gctgaaacaa 10586847  T
Q  430 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctctt-gggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacacta 528  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  10586848 gggtttagaatggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 10586936  T
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 628  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  10586937 ttaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgt 10587035  T
Q  629 tactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10587036 tactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 10587120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Original strand, 15551930 - 15552527
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15551930 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatggacaat 15552029  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  15552030 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 15552129  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------- 411  Q
            |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||           
T  15552130 aaaaaaacgtatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagag 15552229  T
Q  412 ---tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 508  Q
       |||||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15552230 agatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 15552329  T
Q  509 attcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552330 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 15552429  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  15552430 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15552527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 203 - 712
Target Start/End: Original strand, 18466461 - 18466972
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466461 atatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattc 18466560  T
Q  303 tttcactgaaggagnnnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaa 402  Q
    ||||||| ||||||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  18466561 tttcactaaaggagaaaaaaaa--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgtatcaggctaa 18466658  T
Q  403 atctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 498  Q
    |  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  18466659 actttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggtt 18466758  T
Q  499 ttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 598  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466759 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 18466858  T
Q  599 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtc 698  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466859 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 18466958  T
Q  699 aacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||    
T  18466959 aacaaattcttttg 18466972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 120 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 26098836 - 26098391
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26098836 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 26098737  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||       
T  26098736 aaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaaaattctttcattgaaggagaaa 26098637  T
Q  320 nnnnnnt--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagg 417  Q
             ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26098636 taaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagg 26098537  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26098536 gggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 26098437  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26098436 gacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 248 - 712
Target Start/End: Original strand, 40221340 - 40221811
Alignment:
Q  248 gatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt--------gtatcttcagtgt 339  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                  |||||||||||||    
T  40221340 gatttgtttcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggagaaggaaaaaacaaaaaacgtatcttcagtgt 40221439  T
Q  340 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaa 439  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40221440 gatatccgttctaaatttatgagtta--cttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 40221537  T
Q  440 tgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgag 539  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40221538 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 40221637  T
Q  540 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40221638 tctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 40221737  T
Q  639 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40221738 atagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttg 40221811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 21947968 - 21948314
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21947968 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagaggg-gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 21948066  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||     
T  21948067 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 21948166  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948167 gactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 21948266  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21948267 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttg 21948314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 25921811 - 25921464
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25921811 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 25921712  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  25921711 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 25921612  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25921611 gactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctc 25921512  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25921511 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 25921464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 39854426 - 39854771
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  39854426 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 39854524  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  39854525 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 39854771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 366 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 10529436 - 10529091
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  |    
T  10529436 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttta 10529337  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10529336 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2818674 - 2818326
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||     
T  2818674 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgt 2818575  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt-gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  2818574 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctg 2818475  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2818474 ggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctct 2818375  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2818374 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 2818326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904391
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 25904346  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25904347 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttg 25904391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31472963 - 31472603
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31472963 aatttatgagggatgcttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 31472864  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31472863 actagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 31472764  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31472763 ggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgga 31472664  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472663 gggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 31472603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073172
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17073126  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17073127 ccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 4236570 - 4236916
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  4236570 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4236669  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4236670 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 4236769  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4236770 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 4236869  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4236870 ccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttg 4236916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127144
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24127099  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24127100 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 24127144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 36402666 - 36402319
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||     
T  36402666 atacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgt 36402567  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  36402566 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattgg 36402467  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36402466 aactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctc 36402367  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36402366 ccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttg 36402319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 371 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474314
Alignment:
Q  371 ttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagag 470  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  471 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttt 570  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  571 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 670  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccat 10474356  T
Q  671 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474355 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 10474314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 2174863 - 2175206
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  2174863 cttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2174962  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  2174963 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2175062  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2175063 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 2175161  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2175162 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2175206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882393
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag-ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38882147  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  38882148 tagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 38882247  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38882248 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 38882346  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38882347 tccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 38882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189598
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgaga----tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    ||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  662 ctcc-cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1189598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 348 - 712
Target Start/End: Original strand, 6756419 - 6756780
Alignment:
Q  348 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaaca 447  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||    
T  6756419 ttccaaattt-taagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaaca 6756517  T
Q  448 acaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttgg 547  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6756518 acaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttgg 6756617  T
Q  548 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  6756618 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaa 6756715  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  6756716 ac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttg 6756780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 366 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 37706117 - 37705774
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |    
T  37706117 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgta 37706018  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  37706017 tagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcc 37705818  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705817 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 16776098 - 16776445
Alignment:
Q  365 atacttttactataaa-tatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  16776098 atacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttg 16776197  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16776198 tatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 16776297  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  16776298 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatct 16776396  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16776397 cccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 16776445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745356
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 6745351  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  6745352 ttttg 6745356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179368
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31179507 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31179409  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31179408 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545362
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31545122  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31545123 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattggg 31545222  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31545223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31545321  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31545322 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31545362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696166
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
              ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 696120  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  696121 ccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttg 696166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 17818826 - 17818483
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  17818826 tacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagaggg-gctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 17818728  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818727 tagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgag 17818628  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||    
T  17818627 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcc 17818530  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17818529 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17818483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092190
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaatt 16092196  T
Q  707 cttttg 712  Q
    ||||||    
T  16092195 cttttg 16092190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31543016
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31542777  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31542778 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31542877  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31542878 actttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31542975  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31542976 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31543016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479409
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 605  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  606 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34479514 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34479416  T
Q  706 tcttttg 712  Q
    |||||||    
T  34479415 tcttttg 34479409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 376 - 712
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954704
Alignment:
Q  376 ataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgt 475  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||  ||||||||||||    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  476 ctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 574  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  575 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacta 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  675 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2954704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 446 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658347
Alignment:
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 645  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 658347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12556261 - 12555914
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12556261 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgt 12556162  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  12556161 atagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg- 12556063  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    || ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||    
T  12556062 gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatct 12555963  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  12555962 cccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttg 12555914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 120 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3373625 - 3373348
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3373625 tagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 3373526  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  3373525 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagaaa 3373426  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatca 396  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3373425 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 3373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 408 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477048
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 605  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  606 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34477149 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34477051  T
Q  706 tct 708  Q
    |||    
T  34477050 tct 34477048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397984
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | | | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagaggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  468 gagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccc 39398030  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39398029 acagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttg 39397984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31465980
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| | || ||| |||||| |||||| ||    ||| |||||||||||||||| ||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtat 31466215  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31466214 agagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 31466115  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||    
T  31466114 ctttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcaccc 31466026  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31466025 ccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 31465980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 6747246 - 6747592
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt--gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||      ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  6747246 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttg 6747345  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     ||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747346 tataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctct 6747543  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6747544 ctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6747592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684443
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21684546 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 21684448  T
Q  708 ttttg 712  Q
     ||||    
T  21684447 gtttg 21684443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 375 - 712
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289049
Alignment:
Q  375 tataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttg 474  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  475 tctcttgggaacaaacactagggtt------tgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttgaaaa-cactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||        ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21289005  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21289006 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttg 21289049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 368 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530731
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 638  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 329 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 6661555 - 6661181
Alignment:
Q  329 atcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaaca 428  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | | |||||    
T  6661555 atcttcagtgttatatccgtttcaaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaaca 6661457  T
Q  429 agggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacacta 528  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||| | ||  ||||||||    
T  6661456 agggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacacta 6661361  T
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6661360 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 6661261  T
Q  629 tactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | ||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||    
T  6661260 tgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 502 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505834
Alignment:
Q  502 agggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 601  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  602 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 701  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  702 aaattcttttg 712  Q
    |||||||||||    
T  20505844 aaattcttttg 20505834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 491 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585735
Alignment:
Q  491 actagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  591 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 690  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  691 actaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttg 41585735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 481 - 712
Target Start/End: Original strand, 2723959 - 2724181
Alignment:
Q  481 gggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatt 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  2723959 gggagcaaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaatt 2724049  T
Q  581 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 680  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724050 aggcgggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 2724149  T
Q  681 tttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2724150 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2724181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 503 - 712
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798335
Alignment:
Q  503 gggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 602  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  703 aattcttttg 712  Q
    ||||||||||    
T  39798326 aattcttttg 39798335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 368 - 582
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  568 tttgggtagaattag 582  Q
    ||||| |||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 491 - 712
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410310
Alignment:
Q  491 actagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 590  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  591 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 690  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  691 actaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttg 4410310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 298
Target Start/End: Original strand, 21288534 - 21288713
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21288534 tagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 21288633  T
Q  220 aaatatatttt-tgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288634 aaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 521 - 710
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749986
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 10749895  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 368 - 586
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgg 586  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208864
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |      
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttttag- 36208620  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||| || |||||  |    | | |||||||||   |  |||||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  567 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |     
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-tt 36208816  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36208817 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttg 36208864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020508
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||| |||||| ||||||||| ||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaac-acaaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||       
T  9020265 agagtt--gctcttggcaacaaacactagggttgaa--gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcc 9020460  T
Q  666 cccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||| | ||||||   ||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  9020461 tccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttg 9020508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 521 - 710
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757462
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttctt 10757372  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10757373 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960129
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 38960215  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  38960214 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 38960129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354566
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15354658  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15354657 t-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 15354566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665331
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23665239  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23665240 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 23665331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793256
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23793348  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23793347 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 23793256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373134
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 3373221  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 3373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356842
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15356934  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15356933 t-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 15356842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 423 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 17413442 - 17413176
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
    ||||||||||||||||| | || ||  ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| ||||  ||    
T  17413442 aaaacaagggtttagaagg-cagcactaaaactatggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaa 17413349  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17413348 acactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 17413249  T
Q  622 gtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaac 692  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  122 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  222 atatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattt 267  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 411 - 712
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054125
Alignment:
Q  411 atagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 510  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaagg-caacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  511 tcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 610  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |     |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 527 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741850
Alignment:
Q  527 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 625  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaa 23741937  T
Q  626 agttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 23741850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 327 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 41586082 - 41585945
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaa 426  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  41586082 gtatcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaa 41585983  T
Q  427 caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41585982 caagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttga 41585945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Original strand, 15143565 - 15143722
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15143565 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 15143664  T
Q  623 taaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  15143665 taaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20507800 - 20507659
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||     
T  20507800 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgt 20507701  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggt 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507700 atagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 550 - 639
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  550 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897985
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  623 taaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtca 4897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 612 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098280
Alignment:
Q  612 tatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  711 t 711  Q
    |    
T  26098280 t 26098280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2144841 - 2144599
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaa-acactagggtttgagggttgattcatcttgaa- 520  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  | |||||||| |||| |     
T  2144841 aaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggag 2144748  T
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-cattgatatctc 617  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  2144747 aaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctc 2144648  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2144647 -tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 411
Target Start/End: Original strand, 15143270 - 15143475
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattc 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  15143270 atatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattc 15143362  T
Q  303 tttcactgaaggag----nnnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga 398  Q
    ||||||||||| ||              |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  15143363 tttcactgaagaaggggaaaaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttacaaatttatgagttata-tttctctataaatatagaccttgtatcaga 15143461  T
Q  399 -gtaaatcttgaga 411  Q
     ||||| |||||||    
T  15143462 tgtaaaccttgaga 15143475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 15445454 - 15445263
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||     ||  |||||||||||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||||||    
T  15445454 aaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatc 15445355  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15445354 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 592
Target Start/End: Original strand, 42770697 - 42770934
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaa 445  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| | |||    
T  42770697 gttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaagg-caa 42770794  T
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    || ||||| |||| |||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||| | ||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  42770795 ca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctctt 42770887  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 592  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770888 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6662028 - 6661929
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6662028 tagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaat 6661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 423 - 583
Target Start/End: Original strand, 4754158 - 4754312
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
    |||||||||||||| || | |||||  || |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  4754158 aaaacaagggtttaaaa-gccaacacaaacactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaa 4754251  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754252 acactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 521 - 707
Target Start/End: Original strand, 23667416 - 23667601
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  23667416 aaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctctt 23667514  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    | |||| || |||||||| ||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  23667515 t-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 194
Target Start/End: Original strand, 40221287 - 40221361
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttg 194  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40221287 tagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 40221361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Original strand, 29748351 - 29748502
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa-a 521  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||| ||   ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||| | |    
T  29748351 aaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggaga 29748444  T
Q  522 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaa 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29748445 aacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22673022
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 22672915  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  22672916 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 22673011  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  22673012 aacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170967
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 1170892  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1170893 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 1170967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627523
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 10627445  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||   ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  10627446 accc-tgaatatctc-tttgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtca 10627523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 475 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224769
Alignment:
Q  475 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgg 572  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  573 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt---actcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||| |||||||   | ||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||   |||||||| |||| || ||| |   |||||||||| |||    
T  15224899 gtaaaattaggtttgaagactaatttttgtaaccatttgataattcttttgtaaacttacgactcatcattataatggaacagttagctgctctctgccc 15224800  T
Q  668 cagactaggtcaat-ttggaccgaactaggt 697  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  15224799 cagactaggtcagtattgaaccgaactaggt 15224769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 463
Target Start/End: Original strand, 4409999 - 4410100
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4409999 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4410098  T
Q  462 tg 463  Q
    ||    
T  4410099 tg 4410100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 640 - 712
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043278
Alignment:
Q  640 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttg 20043278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 521 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 34033752 - 34033632
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccatt-gatatctc 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||| ||   | |||||| || | ||||||| || ||||||||    
T  34033752 aaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctc 34033653  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcat 638  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34033652 ttttgtaaagttactcatcat 34033632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385477
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 35385553  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35385552 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 35385477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2297999
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 2298102  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || |||   |||||| ||| |||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  2298101 actcat---tatctc-tttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggta 2298006  T
Q  699 aacaaat 705  Q
    |||||||    
T  2298005 aacaaat 2297999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 169
Target Start/End: Original strand, 15143224 - 15143274
Alignment:
Q  119 atagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatata 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15143224 atagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779144
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 5779144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 169
Target Start/End: Original strand, 18466416 - 18466465
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatata 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18466416 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 709
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445684
Alignment:
Q  526 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 624  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   ||||||| ||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-tttgta 25445595  T
Q  625 aagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 634
Target Start/End: Original strand, 13295834 - 13295948
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||| |||| |  ||    
T  13295834 aaaacacttttaggattgagtctcttgatcacatgaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaccctttgaaa--tc 13295931  T
Q  618 ttttgtaaagttactca 634  Q
    |||||||||||||||||    
T  13295932 ttttgtaaagttactca 13295948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782578
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240585
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 1240509  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  1240510 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 435
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723978
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggttt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagcaaacactagggttt 2723978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841274
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  |||| |||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 17841350  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17841349 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 17841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 26406672 - 26406459
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  26406672 ttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgta 26406574  T
Q  603 accc-----attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaactag 695  Q
    | ||     ||  ||||||||||   ||||  | |||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||  || |||||||||||    
T  26406573 atcctcaatatcaatatctctttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacgaagagctgctctctcctccagagtaggttaacattagaccgaactag 26406474  T
Q  696 gtcaacaaattcttt 710  Q
    || ||||||||||||    
T  26406473 gtaaacaaattcttt 26406459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 521 - 583
Target Start/End: Original strand, 32520534 - 32520597
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 583  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32520534 aaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452683
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtt 25452576  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||| |||     
T  25452577 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggta 25452672  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  25452673 aacaaattctt 25452683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786592
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||| |||||||||   | ||| | |||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgta 28786485  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  28786486 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 28786581  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  28786582 aacaaattctt 28786592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 654
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045271
Alignment:
Q  594 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggaggg 654  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggaggg 20045271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238448
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093438
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 556  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 16093438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 423 - 651
Target Start/End: Original strand, 35430171 - 35430408
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttg---------agggttgattca 513  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||||||||||         |   ||||||||    
T  35430171 aaaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttg--tacagttt-tctcttggcaataaacactagggtttggattgaatcaccattgattca 35430266  T
Q  514 tctt-gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa-cccatt 609  Q
     ||| || |||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| | | |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  |  ||    
T  35430267 ccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattctttt 35430366  T
Q  610 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35430367 gatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 35430408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 9353371 - 9353425
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9353371 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 28832317 - 28832263
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  28832317 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 36932389 - 36932443
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  36932389 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 654 - 703
Target Start/End: Original strand, 17004004 - 17004053
Alignment:
Q  654 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  17004004 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2144930 - 2144878
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2144930 atacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 2144878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 8565990 - 8565946
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8565990 tctctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 8565946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 268
Target Start/End: Original strand, 32520268 - 32520316
Alignment:
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatatttt 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  32520268 aaatatatttttgtaccgtacgaagaaaaatttgatgcaaacatatttt 32520316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6661648 - 6661575
Alignment:
Q  227 tttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 307  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  6661648 tttttgtactgaatgaaggaagatttgaagtaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttca 6661575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 10281809 - 10281755
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10281809 ggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 11917011 - 11917065
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11917011 ggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15464590 - 15464536
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  15464590 ggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 658 - 703
Target Start/End: Original strand, 31300644 - 31300689
Alignment:
Q  658 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31300644 ctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12056 - 11464
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12056 tagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 11957  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  11956 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 11857  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  11856 aaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg 11757  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga 519  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  11756 gctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgg 11657  T
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11656 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctctt 11557  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11556 ttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttg 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 154)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 17325222 - 17324629
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  17325222 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatggacaat 17325123  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  17325122 aaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 17325023  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17325022 aaaaaaacgtatcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacaggg 17324923  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17324922 ggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 17324823  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17324822 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 17324723  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17324722 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17324629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 47905961 - 47906558
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47905961 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 47906060  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  47906061 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 47906160  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  47906161 aaaaaa-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 47906259  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47906260 gagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattca 47906359  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47906360 ccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 47906459  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47906460 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 47906558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31736110 - 31735514
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31736110 tagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 31736011  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31736010 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 31735911  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttga----gataga 415  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||    ||||||    
T  31735910 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagataga 31735811  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31735810 gggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 31735711  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31735710 ttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttc 31735611  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31735610 tcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 31735514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28998839 - 28998246
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28998839 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 28998740  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28998739 aaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 28998640  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  28998639 aaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagagga 28998540  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28998539 ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttg 28998440  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28998439 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 28998340  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28998339 tttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28998246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 29004555 - 29003962
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29004555 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 29004456  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  29004455 aaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 29004356  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  29004355 aaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagagga 29004256  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29004255 ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttg 29004156  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  29004155 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 29004056  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29004055 tttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 29003962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 24325352 - 24325951
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24325352 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 24325451  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  24325452 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 24325551  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-------- 411  Q
          |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||            
T  24325552 aaaaaatgtatctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagaga 24325651  T
Q  412 tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 511  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24325652 tagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgatt 24325750  T
Q  512 catcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 611  Q
    || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325751 caccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 24325850  T
Q  612 tatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24325851 tttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattctttt 24325950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 39931767 - 39932362
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39931767 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 39931866  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||       
T  39931867 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaaggagaaa 39931966  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt--gagatagagg 417  Q
           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||  |||  ||  ||||||||||    
T  39931967 aaaaaacgtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagg 39932066  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  39932067 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaacctt 39932166  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39932167 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctc 39932266  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc-tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39932267 ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttg 39932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15295434 - 15294827
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15295434 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 15295335  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  15295334 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 15295235  T
Q  320 nnnnnn-tgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| |    
T  15295234 aaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagag 15295135  T
Q  419 ag--------------ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagg 504  Q
    ||              || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  15295134 agagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagg 15295035  T
Q  505 gttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 604  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15295034 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaac 15294935  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 704  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15294934 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15294835  T
Q  705 ttcttttg 712  Q
    ||||||||    
T  15294834 ttcttttg 15294827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 119 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2949811 - 2949225
Alignment:
Q  119 atagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2949811 atagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaa 2949712  T
Q  219 taaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnn 318  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  2949711 taaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaagagaaa 2949612  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  2949611 aaaaaaacgtatctt------ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagaggg 2949518  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2949517 ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttg 2949418  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  2949417 ggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 2949318  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2949317 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2949225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 9460008 - 9459416
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9460008 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 9459909  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  9459908 aaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 9459809  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  9459808 aaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 9459709  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459708 gagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattca 9459609  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459608 ccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgat 9459509  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9459508 ttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9459416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 9463835 - 9463243
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9463835 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 9463736  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  9463735 aaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 9463636  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  9463635 aaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 9463536  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463535 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattca 9463436  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
     ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9463435 ccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgat 9463336  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9463335 ttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9463243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 27337527 - 27336933
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27337527 tagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 27337428  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        
T  27337427 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaggaaaaa 27337328  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----taga 415  Q
           ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||    ||||    
T  27337327 aaaaaacgtatcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagataga 27337228  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27337227 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 27337129  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27337128 ttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 27337029  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27337028 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 27336933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 27339725 - 27339124
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatat----ttatgga 215  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||    
T  27339725 tagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatatttatgga 27339626  T
Q  216 caataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339625 caataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 27339526  T
Q  316 gnnnnnnnnnt--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-- 411  Q
                 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||      
T  27339525 aaaaaaaaagaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagaga 27339426  T
Q  412 --tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttga 509  Q
      ||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27339425 gatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttga 27339326  T
Q  510 ttcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 609  Q
    |||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27339325 ttcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccatt 27339226  T
Q  610 gatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339225 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 27339127  T
Q  710 ttg 712  Q
    |||    
T  27339126 ttg 27339124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21948756 - 21948226
Alignment:
Q  142 gatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatg 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21948756 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 21948657  T
Q  242 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt--gtatcttcagtgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||    
T  21948656 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaaaaacgtatcttcagtgt 21948557  T
Q  340 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggttt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||    ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21948556 ggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 21948457  T
Q  436 agaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggat 535  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21948456 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-gaaacactattaggat 21948358  T
Q  536 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 635  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21948357 tgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 21948258  T
Q  636 catatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21948257 catatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 237 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510318
Alignment:
Q  237 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt-----gtatc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||     
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagggaaagaaaaaaaacgtatt 2510702  T
Q  332 ttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaac 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||||| ||| ||||    
T  2510701 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaac 2510602  T
Q  428 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacact 527  Q
    ||||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||    
T  2510601 aagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacact 2510502  T
Q  528 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 627  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2510501 attaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaag 2510403  T
Q  628 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2510402 ttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2510318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 340 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 6996065 - 6995693
Alignment:
Q  340 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaa 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  6996065 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaa 6995966  T
Q  440 tgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgag 539  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  6995965 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 6995866  T
Q  540 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 639  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6995865 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcata 6995766  T
Q  640 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995765 tagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 6995693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 227 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46431699
Alignment:
Q  227 tttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaa 46432108  T
Q  327 -gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag----- 420  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||| |||| |||         
T  46432107 cgtatcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagaga 46432008  T
Q  421 ----------------ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagg 504  Q
                    || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  46432007 gagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 46431908  T
Q  505 gttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 604  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431907 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 46431808  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct--cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46431807 ccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 46431709  T
Q  703 aattcttttg 712  Q
    ||||||||||    
T  46431708 aattcttttg 46431699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 10400166 - 10399821
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10400166 actttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 10400067  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10400066 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 10399967  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10399966 ctttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 10399867  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10399866 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 10399821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 13215022 - 13215374
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  13215022 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 13215121  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13215122 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 13215221  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgct 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13215222 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgct 13215321  T
Q  660 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13215322 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttg 13215374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 38925818 - 38925474
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||     
T  38925818 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 38925719  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925718 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 38925619  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||     
T  38925618 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctct- 38925522  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38925521 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttg 38925474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750327
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51750081  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  51750082 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 51750181  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  51750182 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 51750281  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51750282 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 51750327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 351 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 50079175 - 50078813
Alignment:
Q  351 caaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaaca 450  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  50079175 caaatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaaca 50079076  T
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50079075 aaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggtta 50078976  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||     
T  50078975 cgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaaca 50078876  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  50078875 gatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttg 50078813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 11457827 - 11457468
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11457827 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaa 11457728  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457727 actagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacg 11457628  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggag 652  Q
     |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11457627 cgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggat 11457528  T
Q  653 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11457527 gtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 11457468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12302849 - 12302498
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgaga----tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12302849 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggt 12302750  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302749 ttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 12302498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 15823487 - 15823834
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  15823487 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 15823586  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15823587 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctga 15823686  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15823687 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 15823786  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15823787 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttg 15823834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Original strand, 39462443 - 39462807
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||| |||||| |||||||||   |||     
T  39462443 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaa 39462541  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462542 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 39462641  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39462642 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaa 39462741  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39462742 acggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 39462807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 365 - 708
Target Start/End: Original strand, 41646861 - 41647204
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  41646861 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 41646960  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  41646961 atagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgc 41647060  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647061 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 41647160  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41647161 catcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 41647204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 16428594 - 16428942
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||||||| ||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  16428594 atacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 16428693  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16428694 atagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 16428793  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16428794 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctct 16428893  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16428894 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttg 16428942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 50077024 - 50076665
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50077024 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaa 50076925  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076924 actagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 50076825  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50076824 ggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 50076725  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50076724 tgactgctctct-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 50076665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 368 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307540
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||| | || ||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  468 gagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 50307585  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307584 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 50307540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762124
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtat 13761879  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  13761880 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtga 13761979  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13761980 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctccc 13762078  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13762079 ccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttg 13762124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 14098327 - 14097962
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||||  || |||||| |||||| || | ||||    
T  14098327 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaac 14098229  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14098228 tacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 14098129  T
Q  547 gttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtg 644  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14098128 gttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtg 14098030  T
Q  645 aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14098029 aaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 14097962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 28840619 - 28840967
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  28840619 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggttt 28840718  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28840719 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 28840818  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28840819 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 28840917  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28840918 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28840967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823302
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6823057  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  6823058 agagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 6823156  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6823157 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 6823256  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6823257 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6823302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617804
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccct 2617759  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  2617760 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttg 2617804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307397
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccc 18307352  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18307353 cagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttg 18307397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 366 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 9241425 - 9241079
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag-ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  9241425 tacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 9241327  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9241326 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattctttt 9241079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 710
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839874
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttccc 18839830  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18839831 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 18839874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 342 - 712
Target Start/End: Original strand, 20302378 - 20302746
Alignment:
Q  342 tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatg 441  Q
    |||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  20302378 tatttgttccaaattt-taagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 20302476  T
Q  442 acaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtc 541  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  20302477 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20302576  T
Q  542 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 641  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  20302577 tcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagata 20302675  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20302676 gtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 20302746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 365 - 708
Target Start/End: Original strand, 28842434 - 28842778
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28842434 atacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28842533  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  28842534 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggct 28842633  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  28842634 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctc 28842732  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28842733 tcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattct 28842778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251267
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 25251267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 327 - 650
Target Start/End: Original strand, 48665074 - 48665404
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagc----- 421  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |          
T  48665074 gtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggaggggg 48665173  T
Q  422 -taaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa 520  Q
     | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  48665174 ttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag 48665273  T
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665274 aaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 48665373  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgg 650  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48665374 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28207406 - 28207061
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28207406 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 28207307  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  28207306 gtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattgg 28207207  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    | |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28207206 ggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctc 28207109  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28207108 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28207061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248563
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||  |||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctctcc 665  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcc 50248610  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  50248609 cctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttg 50248563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 3579958 - 3579610
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag--ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  3579958 atacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggttt 3579859  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3579858 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagatt 3579759  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  3579758 ggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctc 3579660  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3579659 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3579610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186120
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctccc 17186166  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  17186165 ccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttg 17186120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490200
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccc 31490155  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31490156 cagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttg 31490200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 40133864 - 40134233
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga---------gctaaaacaagggtttagaatgac 443  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||          ||| ||||||||||||||||||||    
T  40133864 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgac 40133963  T
Q  444 aacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctc 543  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  40133964 aacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctc 40134063  T
Q  544 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatag 642  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40134064 ttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 40134163  T
Q  643 tgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40134164 tgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttg 40134233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 367 - 711
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291743
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctccc 20291698  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20291699 ccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 20291743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 367 - 705
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226448
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16226209  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16226210 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 16226309  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16226310 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 16226408  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16226409 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128161
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25128056 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaatt 25128155  T
Q  707 cttttg 712  Q
    ||||||    
T  25128156 cttttg 25128161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752651
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| ||| ||    
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtat 51752407  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  51752408 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 51752506  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  51752507 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctccc 51752605  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51752606 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 51752651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 394 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131368
Alignment:
Q  394 tcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaaca 491  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  492 ctagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac 591  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  592 ttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 686  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  687 ccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||||| |||||||||||||||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttg 4131368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 366 - 711
Target Start/End: Original strand, 6756469 - 6756815
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  6756469 tacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6756568  T
Q  466 tagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||     
T  6756569 tagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgg 6756666  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  6756667 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctct 6756766  T
Q  664 -cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6756767 ccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattctttt 6756815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 399 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31425325 - 31425008
Alignment:
Q  399 gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactaggg 497  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  31425325 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactaggg 31425226  T
Q  498 tttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactta 594  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31425225 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggctta 31425126  T
Q  595 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31425125 ttcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaact 31425027  T
Q  694 aggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||    
T  31425026 gggtcaacaaattcttttg 31425008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 365 - 701
Target Start/End: Original strand, 47451589 - 47451919
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  47451589 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgt 47451688  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47451689 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-----agtgt-ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 47451782  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  47451783 ggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctc 47451882  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 701  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47451883 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 709
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324349
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||  | |||  |||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccc 17324306  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324307 catgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319175
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccc 17319130  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17319131 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17319175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31423232 - 31422853
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  31423232 gttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 31423133  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaac-aaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31423132 aacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctctt 31423033  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tata--- 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||       
T  31423032 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 31422933  T
Q  642 ---------gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
             ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31422932 aaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttg 31422853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 367 - 705
Target Start/End: Original strand, 47179652 - 47179993
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47179652 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 47179751  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47179752 gtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 47179851  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47179852 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47179950  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  47179951 ct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Original strand, 42922157 - 42922514
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| |||||||||||| | ||||    
T  42922157 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 42922255  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42922256 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 42922352  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  42922353 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtgg 42922452  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  42922453 aacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183583
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 14183630  T
Q  667 ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  14183629 ccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttg 14183583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 367 - 705
Target Start/End: Original strand, 47177301 - 47177642
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47177301 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 47177400  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  47177401 gtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagat 47177500  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47177501 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47177599  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    || |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  47177600 ct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 120 - 313
Target Start/End: Original strand, 48664857 - 48665050
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48664857 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 48664956  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48664957 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 48665050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 8347627 - 8347270
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaa 445  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |||    
T  8347627 gttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaa 8347530  T
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  8347529 caagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctctt 8347433  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtg 644  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8347432 gatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtg 8347333  T
Q  645 aaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||    
T  8347332 gaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaacaaatt 8347270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 491 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248544
Alignment:
Q  491 actagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  591 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  690 aactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttg 25248544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 470 - 712
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432684
Alignment:
Q  470 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 569  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactt 16432539  T
Q  570 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16432540 tgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctccccc 16432639  T
Q  669 -agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432640 aagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 16432684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 120 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4131877 - 4131690
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggac-aa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4131877 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatggacaaa 4131778  T
Q  219 taaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4131777 taaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 348 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18800925 - 18800600
Alignment:
Q  348 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaaca 447  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||| ||||||||| | |||||    
T  18800925 ttccaattttatgagg-atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaaca 18800828  T
Q  448 acaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttgg 547  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18800827 agaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctagg 18800731  T
Q  548 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaa 646  Q
    | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18800730 tcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaa 18800631  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggt 677  Q
     |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18800630 gcggagaactgctctctcccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 355 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 49495549 - 49495206
Alignment:
Q  355 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaac 454  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||        |  ||||    
T  49495549 tttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataa--------atcaaac 49495458  T
Q  455 tagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 554  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||     
T  49495457 tagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggt 49495362  T
Q  555 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagg 653  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49495361 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagg 49495262  T
Q  654 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  49495261 gcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 504 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115095
Alignment:
Q  504 ggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  604 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  703 aattcttttg 712  Q
    |||| |||||    
T  6115104 aattattttg 6115095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 16429054 - 16429246
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16429054 aaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 16429153  T
Q  621 tgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16429154 tgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttg 16429246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 365 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 15669731 - 15669419
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| | | | || || ||||| ||||||||    
T  15669731 atacttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttgggagg-cagca-caaaagtagggttt 15669634  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15669633 gtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 15669537  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  15669536 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctct 15669437  T
Q  662 ctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15669436 ctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45694016 - 45693834
Alignment:
Q  123 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaa 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45694016 tatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatggacaataaa 45693917  T
Q  223 tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45693916 tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 367 - 623
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824091
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag-ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6823926  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaaga 558  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||       |||||||||||||    
T  6823927 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaaga 6824026  T
Q  559 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 623  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6824027 gattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6115701 - 6115532
Alignment:
Q  131 aaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115701 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 6115602  T
Q  231 tgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatat 300  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6115601 tgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 51757628 - 51757818
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||    
T  51757628 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctc-tt 51757726  T
Q  621 tgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757727 tgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 51757818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 491 - 705
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231843
Alignment:
Q  491 actagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 589  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  590 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 689  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  690 aactaggtcaacaaat 705  Q
    |||| |||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786121
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 23786034  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 249 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 26520580 - 26520119
Alignment:
Q  249 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnn-------tgtatcttcagtgtgg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||                |||||||||||||||     
T  26520580 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaacaaaagaaatgtatcttcagtgtga 26520481  T
Q  342 tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagataga-gggagct-aaaacaagggtttagaa 439  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  26520480 tattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa 26520382  T
Q  440 tgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgag 539  Q
     | |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  26520381 -gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-agattga-ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 26520286  T
Q  540 tctcttg------gttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 632  Q
    |||||||      || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||    
T  26520285 tctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgct 26520194  T
Q  633 catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
     || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||  |||||||| |||| ||| |||||||    
T  26520193 tataattatagtggaacggagggttgctctttcccccaaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaat 26520119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 8349407 - 8349049
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaa 445  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||| || ||| | ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||    
T  8349407 gttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaa 8349309  T
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    ||| |||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |  |    
T  8349308 caagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgat 8349212  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtg 644  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8349211 ggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtg 8349112  T
Q  645 aaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     ||  ||||| || ||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  8349111 gaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt 8349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 303
Target Start/End: Original strand, 6997218 - 6997395
Alignment:
Q  119 atagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6997218 atagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatata-ttatggacaa 6997316  T
Q  219 taaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattct 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6997317 taaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattct 6997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 374 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125455
Alignment:
Q  374 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga-atagagtt 472  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  473 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 572  Q
    || |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||  |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  573 gtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 670  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| |||||      
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccctt 13125492  T
Q  671 actaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||    
T  13125491 actaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 565 - 712
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816174
Alignment:
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 23816174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  153 ttgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 252  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  253 gatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 313  Q
    |||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaag 6996221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Original strand, 27916438 - 27916780
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagcta--aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||   ||||| | || |||| |  |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  27916438 atacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtt 27916536  T
Q  462 tgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  27916537 tg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagat 27916631  T
Q  562 tgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatatctcttttgtaaagttactcatc-atatagtgaaacggagggctg 657  Q
    || |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27916632 tgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctg 27916730  T
Q  658 ctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||    
T  27916731 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 365 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 30790734 - 30790412
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  |  ||||||||||||     
T  30790734 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa--acaaacaataaactagggttt- 30790638  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| | ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  30790637 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 30790544  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||    
T  30790543 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 30790444  T
Q  662 ctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 693  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30790443 ct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 30790412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738625
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca---tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  701 caaatt 706  Q
    ||||||    
T  30738630 caaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46432631 - 46432521
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46432631 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 46432532  T
Q  220 aaatatatttt 230  Q
    |||||||||||    
T  46432531 aaatatatttt 46432521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 268
Target Start/End: Original strand, 16561138 - 16561284
Alignment:
Q  122 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataa 221  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16561138 gtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttattgacaataa 16561237  T
Q  222 atatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatatttt 268  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||    
T  16561238 atatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613237
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  703 aatt 706  Q
    ||||    
T  26613240 aatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 503 - 706
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  503 gggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 601  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  602 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 699  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  700 acaaatt 706  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 596 - 706
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  596 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaact 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  694 aggtcaacaaatt 706  Q
     ||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 681
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 681  Q
    |  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 629 - 712
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358861
Alignment:
Q  629 tactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 13358861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 447 - 638
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279480
Alignment:
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |  | |||||||  |||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttg--tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 638  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 510 - 677
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104414
Alignment:
Q  510 ttcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttatt-cttgtaaccca 607  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc-ctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353342
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaac--actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 21353447  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||    
T  21353446 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaa 21353351  T
Q  701 caaattctt 709  Q
    |||||||||    
T  21353350 caaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785662
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttg-----------------tgctgaacatata 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||                 ||||||| |||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaagatttgtttcaaatatattttgtgtttctagaatattgttgctgaaaatata 13785736  T
Q  208 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785735 tttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248755
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttga 25248755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6115541 - 6115479
Alignment:
Q  254 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115541 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 281
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 521 - 669
Target Start/End: Original strand, 14353063 - 14353210
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||| |  ||||    
T  14353063 aaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaaccctttgaaa--tctt 14353159  T
Q  620 ttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 669  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||  ||||||||||||    
T  14353160 ttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaagagccactctctccccca 14353210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 463
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231640
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttg 16231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 244
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260882
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttg-----------------tgctgaacatata 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||                 ||||||| |||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaagaattgtttaaaatatattttgtgttttcagaagattgttgctgaaaatata 32260845  T
Q  208 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32260846 tttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 32260882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 583
Target Start/End: Original strand, 14997039 - 14997101
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14997039 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401215
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 2401322  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  2401321 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 2401226  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  2401225 aacaaattctt 2401215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144677
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | ||| | |||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgta 4144784  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || || | |||||   |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||| |||     
T  4144783 actcaat-atatc---tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggta 4144688  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  4144687 aacaaattctt 4144677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 611 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127685
Alignment:
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 26332885 - 26332699
Alignment:
Q  374 ctataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtt 472  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||     ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  26332885 ctataaatacagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagaggata--aaaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaaatagggtttg--tagagtt 26332792  T
Q  473 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  26332791 tg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgagact 26332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 521 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 26332673 - 26332613
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332673 aaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526623
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 9526547  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttact--catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||   |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9526548 actca---atatctc-tttgtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 9526623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Original strand, 46783126 - 46783331
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga-ctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 601  Q
    |||||||| |||||| ||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  46783126 ttgattcaccttgaacaaagcactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 46783225  T
Q  602 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtca 699  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | ||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| | | |    
T  46783226 aaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataa 46783324  T
Q  700 acaaatt 706  Q
    |||||||    
T  46783325 acaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232747
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 2232678  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||||    | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2232679 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2232747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 281
Target Start/End: Original strand, 10115572 - 10115653
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10115572 tgaaaatatatttatggacaataaatat--ttttatcccgtatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaacggaatatt 10115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127837
Alignment:
Q  374 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagttt 473  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggg-gttgaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  474 gtctcttgggaacaaacactagggtt 499  Q
      || |||| ||||||||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 13598454 - 13598402
Alignment:
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13598454 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134132
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 616
Target Start/End: Original strand, 49959145 - 49959241
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 616  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  49959145 aaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaaccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393308
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| ||||||||||||||    | ||||| |||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattagatttgaagactgattcttgta 2393383  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2393382 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 2393308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 418
Target Start/End: Original strand, 16431024 - 16431095
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16431024 gttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagaggg 16431095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 408
Target Start/End: Original strand, 43104100 - 43104143
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43104100 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttg 43104143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 678
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521871
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 9521796  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttact--catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 678  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||   |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9521797 actca---atatctc-tttgtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtc 9521871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 10115517 - 10115555
Alignment:
Q  160 taaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10115517 taaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 10115555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 16124555 - 16124609
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  16124555 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 19072986 - 19072932
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19072986 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 19120876 - 19120822
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19120876 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 26644936 - 26644990
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26644936 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 32889497 - 32889443
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  32889497 ggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 47098863 - 47098917
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47098863 ggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 47703975 - 47704029
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47703975 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13112091 - 13112046
Alignment:
Q  190 ttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtac 235  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13112091 ttttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgtac 13112046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  639 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 40122240 - 40122196
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40122240 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 40122196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 49918474 - 49918518
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49918474 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 49918518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 50167219 - 50167175
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50167219 tctctcccccagattagctcaagttggaccgaactaggtcaacaa 50167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 3091279 - 3091240
Alignment:
Q  530 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 569  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3091279 taggattgagtctcttggtaacaggaagagattgagactt 3091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 3281766 - 3281715
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  3281766 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693686
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaaattttgttttaaatatattt 11693686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447266
Alignment:
Q  677 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 13447266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 463
Target Start/End: Original strand, 16432405 - 16432444
Alignment:
Q  424 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16432405 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 16432444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26613577 - 26613503
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt--gagatagagggagct-aaaacaagggtttagaa 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26613577 cttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 29651869 - 29651818
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  29651869 ggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 583
Target Start/End: Original strand, 37990773 - 37990836
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  37990773 aaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattagg 37990836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6997422 - 6997388
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatt 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6997422 tagtatgactcaaaatatgatggatggagaatatt 6997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 9476319 - 9476265
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9476319 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 21536608 - 21536662
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  21536608 ggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 661 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 653 - 703
Target Start/End: Original strand, 47102884 - 47102934
Alignment:
Q  653 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47102884 ggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 417
Target Start/End: Original strand, 16561373 - 16561461
Alignment:
Q  328 tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagg 417  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||||| |||||    
T  16561373 tatcttcagcgtgatatccgtttcaaatttatgagttata-tttctctataaatataaaccttatatcagatgaaaccttgagagagagg 16561461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 78888 - 79482
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||    
T  78888 tagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatggataat 78987  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  78988 aaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa 79087  T
Q  320 nnnnnn--tgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagg 417  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79088 aaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagg 79187  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  79188 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt 79287  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79288 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 79387  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  79388 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttg 79482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 42924089 - 42923500
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42924089 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 42923990  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  42923989 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaac 42923890  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagg 417  Q
           ||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  42923889 aaataa-gtatcttcag----gtgttcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagagg 42923795  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42923794 aggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 42923695  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42923694 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc 42923595  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42923594 ttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 42923500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 23452824 - 23452228
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23452824 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaatttatggacaat 23452725  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  23452724 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 23452625  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagataga 415  Q
           ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    |||| |||    
T  23452624 aaaaaaagtaccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacaga 23452525  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23452524 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 23452425  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23452424 ttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttc 23452325  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23452324 tcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 23452228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 42452454 - 42453044
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42452454 tagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 42452553  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  42452554 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 42452653  T
Q  320 nnnnnn-tgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
           ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||    
T  42452654 aaaaaaatgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagaggg 42452753  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  42452754 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttg 42452851  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42452852 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 42452951  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42452952 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 42453044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 35216179 - 35215584
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35216179 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 35216080  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  35216079 aaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggagaaa 35215980  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-------- 411  Q
          || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||            
T  35215979 aaaaaatgaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagaga 35215880  T
Q  412 --tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttga 509  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35215879 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttga 35215780  T
Q  510 ttcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 608  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  35215779 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcat 35215680  T
Q  609 tgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35215679 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 35218560 - 35217961
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35218560 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 35218461  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  35218460 aaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 35218361  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-------- 411  Q
           | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||            
T  35218360 aaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagagagagaga 35218261  T
Q  412 ------tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggg 505  Q
          ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  35218260 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtggg 35218161  T
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35218160 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 35218061  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 704  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  35218060 ccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 35217962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007904
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 19007859  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007860 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 19007904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 40032396 - 40032044
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  40032396 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 40032297  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||      
T  40032296 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttag 40032197  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgct 659  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  40032196 gactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgct 40032097  T
Q  660 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40032096 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40032044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 42064432 - 42064779
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  42064432 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 42064531  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42064532 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 42064631  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42064632 gactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 42064730  T
Q  665 ccccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42064731 ccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 42064779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19502002
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctccccc 19502046  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502045 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 19502002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22287674 - 22287327
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22287674 atacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22287575  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22287574 atagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattga 22287475  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22287474 cacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctc 22287375  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22287374 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 22287327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 45280322 - 45279975
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatga-caacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  45280322 tactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 45280223  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  45280222 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttg 45279975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 21521033 - 21520684
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||  |||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  21521033 atacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggctt 21520934  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  21520933 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct 21520834  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21520833 aggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctc 21520734  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21520733 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttg 21520684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504337
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19504582  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  19504581 agagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctggga 19504483  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19504482 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctccc 19504383  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19504382 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 19504337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27105061
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 27104817  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  27104818 agagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 27104916  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27104917 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 27105015  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27105016 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 27105061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 28196542 - 28196899
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  28196542 aatttatgagggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa 28196641  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28196642 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatg 28196741  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggag 652  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |     
T  28196742 ggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaat 28196841  T
Q  653 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28196842 ggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28196899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 17849022 - 17849381
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  17849022 aatttatgagggatgcttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaa 17849121  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||| ||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17849122 actagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacg 17849221  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  17849222 gtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg- 17849320  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  17849321 gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttg 17849381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264139
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    ||||||| ||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6264139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13910036
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13910281  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  13910280 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaa 13910181  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  13910180 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctccc 13910082  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13910081 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 13910036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 6259153 - 6258808
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||  | | ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||     
T  6259153 atacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgt 6259054  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  6259053 atagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattgg 6258956  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6258955 ggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct 6258856  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6258855 -ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6258808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739550
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 11739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 17848350 - 17848704
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| |||||  |||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17848350 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcag--taatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaa 17848447  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848448 actagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 17848547  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgga 651  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848548 gggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgga 17848643  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17848644 tgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttg 17848704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837532
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagac 14837386  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttg 14837532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 43623906 - 43623571
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||| | | |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  43623906 atacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 43623807  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||||            |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  43623806 atagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43623719  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43623718 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 43623619  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623618 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 43623571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 371 - 712
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022436
Alignment:
Q  371 ttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagag 470  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  471 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttt 570  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  571 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca----------tatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||          |||| |||||| || ||||||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3022436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 353 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 45239331 - 45239000
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaaca 447  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||    ||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| |    
T  45239331 aatttatgagggatgcttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaa 45239232  T
Q  448 acaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttgg 547  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45239231 acaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 45239133  T
Q  548 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 647  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239132 ttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 45239033  T
Q  648 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239032 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162214
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 24162449  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |          || ||    
T  24162448 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tggga 24162359  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  24162358 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctccc 24162260  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24162259 ccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttg 24162214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 353 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 31733115 - 31732772
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31733115 aatttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 31733016  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||        
T  31733015 actagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt---- 31732920  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
            ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31732919 --------ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacgga 31732828  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  31732827 ggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 369 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539552
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 376 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979568
Alignment:
Q  376 ataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgt 475  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  476 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggta 575  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  576 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct-ctcccccagact 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||||| |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  674 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 34979568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289058
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| || ||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    || ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttccc 44289104  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44289103 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 44289058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 368 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578104
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    || ||| |||||||| |||||||  ||||||| |  |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttccc 11578145  T
Q  667 ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11578144 ccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 498 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375337
Alignment:
Q  498 tttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 597  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  598 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  698 caacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttg 5375337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 366 - 708
Target Start/End: Original strand, 22874060 - 22874391
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||        |  ||||||||||||| |    
T  22874060 tacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa--------atcaaactagggtttgta 22874151  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22874152 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgag 22874247  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22874248 gctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctc 22874347  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22874348 cctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattct 22874391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 18800640 - 18800304
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||        |  || ||||||||||     
T  18800640 atacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaa--------atcaagctagggtttgt 18800549  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  18800548 atagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgg 18800453  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18800452 ggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct 18800353  T
Q  664 cccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |||||||| ||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18800352 -ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttg 18800304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 355 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 20146955 - 20146604
Alignment:
Q  355 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct--aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||   || ||| |  ||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  20146955 tttatgagggatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaa 20146857  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  20146856 actagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacg 20146760  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20146759 ggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 20146660  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  20146659 gggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27583902 - 27583477
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27583902 tagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatgaacaat 27583803  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27583802 aaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 27583710  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagg 417  Q
           ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||     
T  27583709 aaagaaatgtatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatatagatcttgtatcagatgtaaatctttaggtagaga 27583611  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    |    ||||||||||||| ||        ||  ||||||  |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||   ||  ||||||| |||    
T  27583610 gtctgaaaacaagggtttgga--------aaataaacta-cgtttg--tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggtt--gggagtgattcacctt 27583525  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27583524 ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 458 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459181
Alignment:
Q  458 ggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 557  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  558 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggct 656  Q
    || ||| | |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  657 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttg 28459181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 17897580 - 17897242
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |    | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  17897580 atacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagtctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttg 17897482  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||    
T  17897481 tatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattg 17897386  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  17897385 agattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctc 17897286  T
Q  663 tcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  17897285 t-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558855
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36558948  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 36558855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561132
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36561225  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 36561132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 565 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407445
Alignment:
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 22407493  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22407492 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 22407445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 521 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332179
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-t 45332265  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 365 - 705
Target Start/End: Original strand, 35107217 - 35107553
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaac-aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  ||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  35107217 atacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttg 35107314  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||    || ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107315 tatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 35107408  T
Q  564 agactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || || ||    
T  35107409 tgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttc 35107507  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  35107508 tctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 125 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568556
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaata 224  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  225 tatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 316  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcatatattctttcaccgaaggag 28568556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 37963283 - 37962938
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||           
T  37963283 gttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa------- 37963191  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
     |  |||||||||||||  || |||||| ||||||  ||||||||| | ||||   | ||||||||  |||  |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  37963190 -atcaaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttg 37963096  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    || ||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37963095 gtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat---ttttttgtaaagttattcatcattatagtga 37962999  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| | || ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37962998 aacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 368 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 365 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22407747 - 22407594
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22407747 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22407648  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22407647 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 22407594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 504 - 706
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  504 ggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  701 caaatt 706  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 584 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707742
Alignment:
Q  584 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc--tctcccccagactaggtcaat 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  682 ttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttg 22707742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 408 - 605
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020349
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 605  Q
    |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||          | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggtattggg----------ggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 476 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 27136351 - 27136195
Alignment:
Q  476 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggta 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||    
T  27136351 ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagta 27136254  T
Q  576 gaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc 633  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27136253 gaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 520 - 652
Target Start/End: Original strand, 20589762 - 20589896
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20589762 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggag 652  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 583 - 712
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871080
Alignment:
Q  583 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  683 tggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttg 23871080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 574 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  574 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  674 aggtcaa-tttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 614 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163013
Alignment:
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 22163013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 423 - 638
Target Start/End: Original strand, 43139355 - 43139564
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||    
T  43139355 aaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaa 43139448  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 621  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||    
T  43139449 acattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-ttt 43139547  T
Q  622 gtaaagttactcatcat 638  Q
    |||||||||||||||||    
T  43139548 gtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27136500 - 27136368
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctga--------acatatattta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||        | |||||||||    
T  27136500 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatatattta 27136401  T
Q  212 tggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27136400 tggaaaataaatatatttttgtaccgtatgaag 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 365 - 679
Target Start/End: Original strand, 35028496 - 35028807
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||||| |    ||||  ||||||||||||  |||||| |||| | |||||||    
T  35028496 atacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagagccggaaaaacagggtttagaatc-caacaataaaatttgggtttg 35028594  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  35028595 --tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattg 35028689  T
Q  564 agactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    | |||||||||||||||| |   | | ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||    
T  35028690 acactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctct 35028789  T
Q  662 ctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||||  |||||||||    
T  35028790 ctcccccttactaggtca 35028807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575528
Alignment:
Q  122 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||                   ||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctga-------------------aa 34575616  T
Q  222 atatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 316  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575615 atatatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 34575528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 281
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693755
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct-----------------gaacatata 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||                 ||| |||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa-gatttgtttcaaatatattttgtgcttccaaaaacttgttgctgaaaatata 15693681  T
Q  208 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15693682 tttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 366 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5377770 - 5377629
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||  ||    |||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  5377770 tactttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtt 5377671  T
Q  462 tgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgag 503  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5377670 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 521 - 638
Target Start/End: Original strand, 15693975 - 15694094
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  15693975 aaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctct 15694074  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcat 638  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15694075 tttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921927
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||     | ||| ||||||| |    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgca 17921853  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||| |||||   |||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17921854 accctttgat---tctttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctct-acccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943723
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17943618  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  17943619 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaa 17943714  T
Q  701 caaattctt 709  Q
    |||||||||    
T  17943715 caaattctt 17943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 544 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828338
Alignment:
Q  544 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tata 641  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt-tggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| ||| |   ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatt 13828338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 491 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  491 actagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 590  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517633
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 27517740  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  27517739 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggta 27517644  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  27517643 aacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687139
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 39687064  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39687065 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 669
Target Start/End: Original strand, 33603977 - 33604143
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||   | ||||| |||||| ||    
T  33603977 ttgattcaccttgaacaaaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttcta 33604076  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 669  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  33604077 accttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 705
Target Start/End: Original strand, 2740940 - 2741124
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   ||||||     
T  2740940 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctc- 2741034  T
Q  619 tttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2741035 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2741124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 188
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568409
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatat 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatat 28568409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680201
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||| |    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaa 39680126  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39680127 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 679
Target Start/End: Original strand, 2736204 - 2736361
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   ||||||     
T  2736204 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc- 2736298  T
Q  619 tttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2736299 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458949
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 266
Target Start/End: Original strand, 39286979 - 39287042
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatatt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  39286979 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaagatttgatgcaaatatatt 39287042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 521 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 10942695 - 10942505
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||| ||  |   ||     
T  10942695 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttt--tgaatcc 10942598  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| |||| || |||| | ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10942597 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattct 10942505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 521 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 10948564 - 10948374
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||| ||  |   ||     
T  10948564 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttt--tgaatcc 10948467  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| |||| || |||| | ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10948466 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattct 10948374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781218
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||   || | || ||||||| ||| ||   |||||||||| |    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctcttt-g 12781306  T
Q  623 taaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  12781305 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 12781218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054759
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 20054866  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  20054865 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 20054770  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  20054769 aacaaattctt 20054759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720684
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttact 632  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  30720711 accctttgaaa--tcttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303549
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaa-tataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 41303549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462592
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 17462517  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || | |   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17462518 actcct---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17462592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 521 - 581
Target Start/End: Original strand, 26345677 - 26345738
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26345677 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 462
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| || ||||||||||| | |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12342748 - 12342673
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaac-aagggtttagaa 439  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  12342748 atacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20147104 - 20146987
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct--aaaacaagggtttagaatgaca 444  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || ||| |  |||||||||||| |||| | ||    
T  20147104 gttccaattttatgaggaatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagatagagagtttgaaaacaagggttaagaa-gtca 20147006  T
Q  445 acaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  20147005 acaagaaaactagggtttg 20146987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  196 gctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga-agaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaa-gatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479182
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 30479075  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  30479076 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 30479171  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  30479172 aacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 581
Target Start/End: Original strand, 7502991 - 7503052
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7502991 aaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 416
Target Start/End: Original strand, 40699209 - 40699278
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  40699209 gttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712637
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717346
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567470
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41304876 - 41304806
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagg 274  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41304876 atatatttatggatagtaaatatatttttgtaca-tatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 14699046 - 14699100
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14699046 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41303527 - 41303457
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||| ||||    
T  41303527 atatatttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932695
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 8390189 - 8390243
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8390189 ggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 13569386 - 13569332
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13569386 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 20522278 - 20522224
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20522278 ggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  530 taggattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 583  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170778
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   ||||||| ||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc-tttg 37170837  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37170836 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 39482989 - 39482935
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39482989 ggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 656 - 709
Target Start/End: Original strand, 1345587 - 1345640
Alignment:
Q  656 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1345587 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 1345640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 656 - 709
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838129
Alignment:
Q  656 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 2838129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050166
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 33162494 - 33162450
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 559
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191035
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 38191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Original strand, 7502582 - 7502633
Alignment:
Q  128 ctcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgt 179  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  7502582 ctcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctcaaagtataaaagatttgt 7502633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 660 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  660 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 34575292 - 34575230
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 583  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34575292 aaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Original strand, 39286892 - 39286952
Alignment:
Q  129 tcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatctttt 193  Q
    |||||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39286892 tcaaaatttgatggatg----agattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatttt 39286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 41303210 - 41303155
Alignment:
Q  527 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41303210 tattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 581
Target Start/End: Original strand, 45158291 - 45158369
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 581  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  45158291 ttgattcatcttgcacaaaacactgttaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 45158369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 8040118 - 8040064
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  8040118 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 10445483 - 10445537
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  10445483 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 28259216 - 28259270
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  28259216 ggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 31056102 - 31056048
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31056102 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 33674604 - 33674551
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 557  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674604 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 34682373 - 34682427
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  34682373 ggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 679
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287324
Alignment:
Q  618 ttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtca 39287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41304964 - 41304898
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||     |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  41304964 tgactcaaaatttgatggatgaagaagatt-----taaaaatataaaagatttg--tcaaatatattttgtgct 41304898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539520
Alignment:
Q  679 aatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 15539520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 34575186 - 34575133
Alignment:
Q  654 gctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||    
T  34575186 gctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaatt 34575133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 41304668 - 41304596
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 499  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  41304668 aaaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttg--taaagttt-tctattggcaacaaacattagggtt 41304596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 703
Target Start/End: Original strand, 42039713 - 42039762
Alignment:
Q  654 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  42039713 gctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 42039762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 679
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679879
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 45679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 143)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 21989858 - 21990448
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||    
T  21989858 tagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatggacaat 21989955  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  21989956 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa 21990055  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21990056 aaaaaaacgtatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagaggg 21990155  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21990156 -gctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 21990254  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21990255 agaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctct 21990354  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21990355 tttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 21990448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 20299160 - 20299758
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20299160 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20299259  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20299260 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 20299359  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagataga 415  Q
           ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||    
T  20299360 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga 20299459  T
Q  416 gggagctaaaacaa-gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg-tttgagggttgattca 513  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20299460 gggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattca 20299559  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20299560 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 20299659  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20299660 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 20299758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 42331588 - 42330988
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42331588 tagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 42331489  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  42331488 aagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 42331389  T
Q  320 nnnnnnt------gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagata 413  Q
                 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||    
T  42331388 gaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagata 42331289  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331288 gagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattca 42331189  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 611  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331188 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 42331089  T
Q  612 tatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42331088 tatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 42330989  T
Q  712 g 712  Q
    |    
T  42330988 g 42330988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 38393688 - 38394284
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38393688 tagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatggacaat 38393787  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  38393788 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggtgaaa 38393887  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagataga 415  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||    
T  38393888 aaataacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga 38393987  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38393988 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 38394087  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38394088 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 38394187  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38394188 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 38394284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 37412711 - 37412116
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37412711 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 37412612  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       
T  37412611 aaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaaggagaaa 37412512  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  37412511 aaaaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggg 37412412  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctc-ttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37412411 gctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 37412312  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc- 617  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37412311 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 37412212  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  37412211 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttg 37412116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 7470616 - 7470013
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7470616 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 7470517  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  7470516 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 7470417  T
Q  320 nnnnnnt-------gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----g 408  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||    |    
T  7470416 agaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagag 7470317  T
Q  409 agatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 508  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7470316 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 7470217  T
Q  509 attcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 608  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470216 attcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 7470117  T
Q  609 tgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7470116 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 7470017  T
Q  709 tttg 712  Q
    ||||    
T  7470016 tttg 7470013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 20625739 - 20626336
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20625739 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20625838  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  20625839 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20625938  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||    |||||||    
T  20625939 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatag 20626038  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20626039 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 20626138  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20626139 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgattt 20626238  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20626239 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 20626336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 20629630 - 20630227
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20629630 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20629729  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  20629730 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20629829  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||    |||||||    
T  20629830 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatag 20629929  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20629930 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 20630029  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20630030 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgattt 20630129  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20630130 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 20630227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 20642049 - 20642646
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20642049 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20642148  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  20642149 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20642248  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||    |||||||    
T  20642249 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatag 20642348  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20642349 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 20642448  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20642449 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgattt 20642548  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20642549 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 20642646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 18345242 - 18345839
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  18345242 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattgacaat 18345341  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18345342 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18345441  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgag----atag 414  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||  |||||    ||||    
T  18345442 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatag 18345541  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  18345542 agggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcac 18345641  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18345642 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 18345741  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18345742 ctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttg 18345839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 184 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 13099996 - 13099465
Alignment:
Q  184 aatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattat 283  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13099996 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 13099897  T
Q  284 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaata 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099896 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaata 13099797  T
Q  383 tagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgg 482  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13099796 tagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttg 13099697  T
Q  483 gaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 582  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13099696 gaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 13099597  T
Q  583 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 680  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099596 gcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 13099497  T
Q  681 tttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13099496 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 13099465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 7472569 - 7471971
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7472569 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 7472470  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  7472469 aaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 7472370  T
Q  320 nnnnnnt--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagata 413  Q
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||    ||||||    
T  7472369 aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagata 7472270  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7472269 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 7472170  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7472169 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatt 7472070  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7472069 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 7471971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 3035420 - 3036022
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3035420 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 3035519  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3035520 aaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 3035619  T
Q  320 nnnnnnt---gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----t 412  Q
              ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||    |    
T  3035620 gaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagat 3035719  T
Q  413 agagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3035720 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 3035819  T
Q  513 atcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga---gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 609  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3035820 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 3035919  T
Q  610 gatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3035920 gatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3036019  T
Q  710 ttg 712  Q
    |||    
T  3036020 ttg 3036022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 644
Target Start/End: Original strand, 11756930 - 11757460
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11756930 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 11757029  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  11757030 aaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 11757129  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagataga 415  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||    
T  11757130 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga 11757229  T
Q  416 gggagctaaaacaa-gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg-tttgagggttgattca 513  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11757230 gggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattca 11757329  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11757330 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 11757429  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 644  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11757430 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 28487254 - 28487851
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28487254 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 28487353  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28487354 aaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 28487453  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||  ||    |||||||    
T  28487454 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatag 28487553  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||     
T  28487554 agggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcac 28487653  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28487654 ctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 28487753  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28487754 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttg 28487851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31156495 - 31155908
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31156495 tagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 31156396  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31156395 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 31156296  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||  |||||||||||||    
T  31156295 aaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagaggg 31156196  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  31156195 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttg 31156096  T
Q  519 aaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156095 ggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 31155996  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     ||||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31155995 -tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 1849670 - 1850279
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1849670 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 1849769  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  1849770 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggagaaa 1849869  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------- 411  Q
            | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||  ||||||           
T  1849870 aaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagag 1849969  T
Q  412 ---------tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttga 502  Q
             ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1849970 agagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgt 1850069  T
Q  503 gggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 602  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850070 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgta 1850169  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1850170 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 1850269  T
Q  703 aattcttttg 712  Q
    ||||||||||    
T  1850270 aattcttttg 1850279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 28485266 - 28485863
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28485266 tagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 28485365  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  28485366 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggaggaa 28485465  T
Q  320 nnnnnnt--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----ta 413  Q
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||    ||    
T  28485466 aaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagata 28485565  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    || || | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28485566 gaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattca 28485665  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
     |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  28485666 cctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatt 28485765  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28485766 tctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28485863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 7352241 - 7351649
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7352241 tagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 7352142  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||       
T  7352141 aaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatgagaaa 7352042  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  7352041 aaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 7351942  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7351941 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattca 7351842  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
     ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351841 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 7351742  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  7351741 ttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 7351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7349862 - 7349285
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7349862 tagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 7349763  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||       
T  7349762 aaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatgagaaa 7349663  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  7349662 aaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 7349563  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7349562 gagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattca 7349463  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
     ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349462 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 7349363  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 691  Q
     |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349362 ttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 123 - 712
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258766
Alignment:
Q  123 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  223 tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnn 322  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacgatt-gatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggagaaaaaa 24258364  T
Q  323 nnn------tgtatcttcagtgtgg--tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatag 414  Q
             |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||    
T  24258365 ataaagaaatgtatcttcagtgtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatag 24258463  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  24258464 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcac 24258563  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24258564 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatat 24258663  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatca----tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac-aaattctt 709  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  24258664 ctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattctt 24258763  T
Q  710 ttg 712  Q
    |||    
T  24258764 ttg 24258766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 712
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297660
Alignment:
Q  219 taaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnn 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||  ||    |||||||    
T  20297263 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatag 20297362  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20297363 agggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcac 20297462  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20297463 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgattt 20297562  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20297563 ctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttg 20297660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 203 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 43254027 - 43253508
Alignment:
Q  203 atatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254027 atatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattc 43253928  T
Q  303 tttcactgaaggagnnnnnnnnnt---gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagag 399  Q
    ||||||||||||||             |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  43253927 tttcactgaaggagaaaaaataagaaagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc 43253828  T
Q  400 taaatcttgagatagagggag--------ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaaca 491  Q
    ||||  |||||| |||| |||        || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43253827 taaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 43253728  T
Q  492 ctagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac 591  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43253727 ctagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagac 43253629  T
Q  592 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 691  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43253628 ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaa 43253529  T
Q  692 ctaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  43253528 ctgggtcaataaattcttttg 43253508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 327 - 712
Target Start/End: Original strand, 443508 - 443894
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaa 426  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  443508 gtatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaa 443607  T
Q  427 caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacac 526  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  443608 caatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 443707  T
Q  527 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 626  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  443708 tattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataac 443807  T
Q  627 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  443808 gttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 443894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 20137459 - 20137100
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20137459 aatttatgagggattcttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 20137360  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20137359 actagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacg 20137260  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20137259 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgga 20137160  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20137159 gggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 20137100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724877
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 44724832  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44724833 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 44724877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 4296286 - 4295925
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagacctt-gaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaa 451  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296286 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaa 4296187  T
Q  452 aactagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296186 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 4296087  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgg 650  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4296086 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacag 4295987  T
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4295986 agggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttg 4295925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 365 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 27306567 - 27306224
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  27306567 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttta 27306468  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  27306467 -tagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27306369  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27306368 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 27306269  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27306268 ccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 27306224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 353 - 711
Target Start/End: Original strand, 11355197 - 11355555
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11355197 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 11355296  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11355297 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaca 11355396  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggag 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||    
T  11355397 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagag 11355496  T
Q  653 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11355497 agctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 11355555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836734
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40836979  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40836978 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 40836879  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40836878 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 40836780  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40836779 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40836734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31435385 - 31435037
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  31435385 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 31435286  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  31435285 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 31435186  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31435185 aactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 31435086  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31435085 cccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttg 31435037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 120 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7092763 - 7092413
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7092763 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatggacaat 7092664  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga-gnn 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  7092663 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa 7092564  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    ||||| |    
T  7092563 aaaaaattgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatgg 7092464  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa-actagggtttga 464  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092463 agggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttga 7092413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 368 - 693
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680306
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccc 21680280  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  21680281 cagactaggtgaatttggaccgaact 21680306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 48457601 - 48457951
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48457601 tactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 48457700  T
Q  462 tgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48457701 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 48457951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 9680753 - 9681118
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgaga----tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaaca 447  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    ||||||| | | |||||||||||||||| | |||||    
T  9680753 aatttatgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaaca 9680852  T
Q  448 acaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9680853 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 9680952  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680953 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 9681052  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  9681053 atggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttg 9681118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 35580 - 35927
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  35580 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 35679  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  35680 gtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 35779  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  35780 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctc 35879  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  35880 ccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttg 35927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 44515 - 44862
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  44515 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 44614  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  44615 gtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgg 44714  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  44715 gactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctc 44814  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44815 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 44862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049287
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1049532  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  1049531 agagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 1049432  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  1049431 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 1049333  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1049332 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1049287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 3878522 - 3878875
Alignment:
Q  365 atacttttactataaat----atagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg 458  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3878522 atacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagg 3878621  T
Q  459 gtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 558  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878622 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 3878721  T
Q  559 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 658  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3878722 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 3878821  T
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3878822 tctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3878875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748893
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcct 24748847  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24748848 ccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttg 24748893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145977
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttcc 39146023  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39146022 ctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttg 39145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 120 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7095010 - 7094661
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7095010 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 7094911  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga-gnn 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |      
T  7094910 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggaggaa 7094811  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    |||||||    
T  7094810 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatag 7094711  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  7094710 agggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttga 7094661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 368 - 709
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678361
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccc 21678319  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21678320 tagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattctt 21678361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223456
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagg-gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  467 agagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
     |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcc 42223409  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  42223410 cccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttg 42223456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679357
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  464 aatagagtttgtctc-ttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 9679307  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9679308 tttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttg 9679357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 393 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 21592453 - 21592134
Alignment:
Q  393 atcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacac 492  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21592453 atcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 21592354  T
Q  493 tagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 592  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21592353 tagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 21592254  T
Q  593 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 692  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21592253 tattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 21592154  T
Q  693 taggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  21592153 tgggtcaacaaattcttttg 21592134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 120 - 416
Target Start/End: Original strand, 1606176 - 1606472
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1606176 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 1606275  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  1606276 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 1606375  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
           | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||    
T  1606376 aaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542826
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg-gctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 25542582  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  25542583 agagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaag-actattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 25542681  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25542682 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccc 25542780  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25542781 ctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 25542826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 413 - 712
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946626
Alignment:
Q  413 agagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  513 atcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40946626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 368 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832651
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag-ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||| ||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcc 27832670  T
Q  666 cccagactaggtcaatttg 684  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27832669 cccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 120 - 416
Target Start/End: Original strand, 38395991 - 38396288
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38395991 tagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgtacaat 38396090  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  38396091 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 38396190  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
            |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||    
T  38396191 aaaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattttgagagagag 38396288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046916
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1047019 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1046921  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  1046920 ttttg 1046916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 368 - 650
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276378
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgg 650  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 25276378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 120 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21470878 - 21470614
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21470878 tagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 21470779  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  21470778 aaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 21470679  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 384  Q
           |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470678 aaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 21470614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 355 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22828981 - 22828672
Alignment:
Q  355 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaac 454  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  22828981 tttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaac 22828882  T
Q  455 tagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 554  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22828881 taaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatggg 22828782  T
Q  555 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagg 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22828781 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagg 22828682  T
Q  654 gctgctctct 663  Q
    ||||||||||    
T  22828681 gctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Original strand, 7188476 - 7188833
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  7188476 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaac 7188574  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    || |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7188575 aataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7188671  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  7188672 gtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtgg 7188771  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7188772 aacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 484 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092204
Alignment:
Q  484 aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  584 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaattt 7092233  T
Q  684 ggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 7092204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 370 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817362
Alignment:
Q  370 tttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagaggg-gctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T
Q  668 cagactaggtca-atttggaccgaact 693  Q
    || |||||||||  |||||||||||||    
T  24817388 catactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 120 - 315
Target Start/End: Original strand, 47865333 - 47865528
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47865333 tagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 47865432  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865433 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 47865528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 347 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 20091897 - 20091580
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaa 445  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||    
T  20091897 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaa 20091799  T
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| | |||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  20091798 c-acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctctt 20091703  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  20091702 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgg 20091605  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccag 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20091604 aacggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 484 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094451
Alignment:
Q  484 aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  584 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  684 ggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttg 7094451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 120 - 436
Target Start/End: Original strand, 3677002 - 3677301
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                      
T  3677002 tagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaa------------------ 3677083  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag--- 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3677084 -aatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaga 3677182  T
Q  317 nnnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  3677183 aaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagatagag 3677282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 367 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251611
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatcat 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 365 - 607
Target Start/End: Original strand, 26804524 - 26804765
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  26804524 atacttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 26804619  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactag---ggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26804620 atagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 26804719  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804720 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 443 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813494
Alignment:
Q  443 caacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtct 542  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  543 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tata 641  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 492 - 712
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396932
Alignment:
Q  492 ctagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac 591  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  592 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 691  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  692 ctaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttg 38396932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935560
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 2935473  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108364
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22108272  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22108273 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 22108364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550124
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40550032  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40550033 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 40550124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027191
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 9027277  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9027276 t-gtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137375
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22137283  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22137284 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 22137375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 369 - 706
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465829
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||        |  ||||||||||||| |||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa--------atcaaactagggtttgtata 24465594  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||  || ||||||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552402
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40552310  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40552311 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 40552402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 263
Target Start/End: Original strand, 443331 - 443474
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  443331 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 443430  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatat 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  443431 aaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606671
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 1606585  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  1606586 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 568 - 712
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394021
Alignment:
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttg 22394021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Original strand, 6332177 - 6332514
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagcta-aaacaagggtttagaatgaca-acaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||||||||    
T  6332177 atacttttactataaatataaaacttgtatcagagtaac-cttgagagagagggggctggaaacaagggtttataa--acatacaacaga-ctagggttt 6332272  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
      |||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  6332273 --atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagatt 6332367  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||    
T  6332368 gagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttc 6332467  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  6332468 tctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 365 - 532
Target Start/End: Original strand, 18567564 - 18567731
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  18567564 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 18567663  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattag 532  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  18567664 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 547 - 709
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295743
Alignment:
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 423 - 706
Target Start/End: Original strand, 11081521 - 11081803
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||  ||    
T  11081521 aaaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaa 11081614  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctctt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  11081615 acactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctctt 11081714  T
Q  620 ttgtaaagttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     ||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11081715 gtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  605 cc-attgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac 701  Q
    ||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  702 aaatt 706  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40281987 - 40281824
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaata--ttgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  40281987 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggaaa 40281888  T
Q  218 ataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||    
T  40281887 ataaatatatttttgtaccgtatgaaagaatatttgatacggatatatttttaaaaggaatatt 40281824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 423 - 707
Target Start/End: Original strand, 6048884 - 6049167
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa-a 521  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||| ||   ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| |    
T  6048884 aaaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaaga 6048977  T
Q  522 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||| | ||    
T  6048978 aacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-cctt 6049076  T
Q  621 tgtaaagttactcatc---atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||  ||||||||    
T  6049077 tgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaattc 6049167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 561
Target Start/End: Original strand, 22392424 - 22392608
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||        |  |||||||||||||     
T  22392424 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataa--------atcaaactagggtttgt 22392515  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22392516 atagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 544 - 638
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  544 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 638  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 530 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067193
Alignment:
Q  530 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 628  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   || |||| |||||||||| ||  ||||||||||||   ||||     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  629 tactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
     |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattct 6067193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351539
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25351434  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||    
T  25351435 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 25351530  T
Q  701 caaattctt 709  Q
    |||||||||    
T  25351531 caaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410318
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25410211  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  25410212 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 25410307  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  25410308 aacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 691
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046772
Alignment:
Q  565 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctc 6046742  T
Q  663 tcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 691  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6046743 tcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 712
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759425
Alignment:
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 11759425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13290723 - 13290470
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-gaaaaacactattaggattgagtctcttggtt 549  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  |  ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||     
T  13290723 aaactagggtttg--tagagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtc 13290629  T
Q  550 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaa 647  Q
    || |||||| |||   ||| ||||||||||||||   || || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  13290628 acaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagcggaa 13290530  T
Q  648 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | ||| ||| | ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13290529 cagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357233
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25357128  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| | || || | || |||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||    
T  25357129 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 25357224  T
Q  701 caaattctt 709  Q
    |||||||||    
T  25357225 caaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 679
Target Start/End: Original strand, 2120898 - 2121056
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   |||||||     
T  2120898 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc- 2120992  T
Q  619 tttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2120993 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 40281552 - 40281411
Alignment:
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 627  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||       |||||||||    
T  40281552 ttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttga-------tttgtaaag 40281460  T
Q  628 ttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactag 675  Q
    |||||||||  | | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40281459 ttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactag 40281411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320076
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 3320151  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3320150 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324824
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 3324899  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3324898 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297161
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 20297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405549
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 25405474  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25405475 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 281
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690845
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatat------ttatggacaa 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    | | ||      ||||| ||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag-tatgtttcaaatatattttgtgctttcaaaaaattgttgcttatgtacaa 10690782  T
Q  219 taaatatatttttgtaccgtatga-agaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10690783 taaatatatttttgtaccatgtgacagaa-tatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 10690845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069936
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 7069861  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7069862 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074943
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 7074868  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7074869 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 30906405 - 30906264
Alignment:
Q  348 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    |||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||  ||||     
T  30906405 ttccaattttatgatggatacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaa--acaaa 30906308  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaaca 491  Q
     |  ||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30906307 taacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 484 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  484 aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369703
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247127
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||  |||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgta 30247051  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30247052 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtca 30247127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006820
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||| |||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgta 42006744  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42006745 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtca 42006820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    |||||||  |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541021
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| |    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaa 15541096  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15541095 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtca 15541021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 475 - 583
Target Start/End: Original strand, 11084438 - 11084544
Alignment:
Q  475 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 574  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||    
T  11084438 tctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggt 11084535  T
Q  575 agaattagg 583  Q
    | |||||||    
T  11084536 aaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378529
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 8378605  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8378604 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtca 8378529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 9190047 - 9190101
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9190047 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 20284147 - 20284093
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20284147 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 712
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804808
Alignment:
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 26804808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  123 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatata 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512520
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 44512626  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   || ||||||||| |||     
T  44512625 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactgggta 44512531  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  44512530 aacaaattctt 44512520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 475
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgt 475  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546874
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 499
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  374 ctataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagag-ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagt 471  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| || ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  472 ttgtctcttgggaacaaacactagggtt 499  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 525 - 583
Target Start/End: Original strand, 26210651 - 26210710
Alignment:
Q  525 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  26210651 actattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 2580448 - 2580394
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  2580448 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12310608 - 12310542
Alignment:
Q  132 aaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12310608 aaatttaatggatgaagaagattgttgctactgatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 12310542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 21983342 - 21983288
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21983342 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 35960874 - 35960820
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960874 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 44010929 - 44010775
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||  || ||||| | ||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  44010929 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggactt-gtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 44010835  T
Q  623 taaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44010834 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 46516349 - 46516403
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  46516349 ggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 650 - 703
Target Start/End: Original strand, 4796707 - 4796760
Alignment:
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4796707 gagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22280444 - 22280379
Alignment:
Q  598 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  22280444 ttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtgaaacagaaagctgctctc 22280379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143997
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 572  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Original strand, 2075231 - 2075303
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  2075231 tatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 7464585 - 7464513
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  7464585 tatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 36146452 - 36146408
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36146452 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 36146408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4253572 - 4253529
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4253572 tctctcccacagagtaggtcaatttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34547007
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 34547007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 2647735 - 2647789
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| | |||||||||    
T  2647735 ggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 9185204 - 9185258
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  9185204 ggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 28617264 - 28617318
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  28617264 ggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 29159861 - 29159807
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29159861 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 33332489 - 33332543
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || || |||||| |||||||||    
T  33332489 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 316
Target Start/End: Original strand, 443461 - 443490
Alignment:
Q  287 tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443461 tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 521 - 562
Target Start/End: Original strand, 8260584 - 8260625
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8260584 aaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagatt 8260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 709
Target Start/End: Original strand, 51714 - 52307
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51714 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatggacaat 51813  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  51814 aaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 51913  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagg 417  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||  ||||||    
T  51914 aaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagg 52013  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  52014 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt 52113  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  52114 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 52213  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52214 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 183976 - 183632
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  183976 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaagg-gctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 183878  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  183877 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 183779  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 183632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 186
Target Start/End: Original strand, 50164 - 50230
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50164 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 50230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctct--ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170118
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccg 237  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgtaccg 170118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 14788016 - 14787423
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14788016 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatggacaat 14787917  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  14787916 aaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 14787817  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagg 417  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||  ||||||    
T  14787816 aaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagg 14787717  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14787716 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt 14787617  T
Q  518 gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  14787616 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 14787517  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14787516 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 699
Target Start/End: Original strand, 56030194 - 56030770
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56030194 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 56030293  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  56030294 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaaggagaaa 56030393  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  56030394 aaaaaaagtatcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggg 56030493  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga 519  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  56030494 gctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 56030593  T
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||    
T  56030594 gaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttctt 56030693  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 699  Q
    |||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56030694 ttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 24347964 - 24348560
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24347964 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatggacaat 24348062  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  24348063 aaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 24348162  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----tag 414  Q
            ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||  ||||||    |||    
T  24348163 aaaaaaaagtatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatag 24348262  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24348263 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 24348362  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24348363 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgattt 24348462  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24348463 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 24348560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 17662821 - 17662236
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17662821 tagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 17662722  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  17662721 aaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 17662622  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----taga 415  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    ||||    
T  17662621 aaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagataga 17662522  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||           |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17662521 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg-----------tctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacc 17662433  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17662432 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 17662333  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17662332 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17662236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 22132982 - 22132389
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22132982 tagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 22132883  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  22132882 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 22132783  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||| |||| ||    
T  22132782 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagaga 22132683  T
Q  420 gcta---------aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 510  Q
    | ||         |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22132682 gatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgat 22132584  T
Q  511 tcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 610  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132583 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 22132484  T
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    || |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132483 atttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 44600423 - 44599836
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44600423 tagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 44600324  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  44600323 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa 44600224  T
Q  320 nnnnnnt--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagg 417  Q
             | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||  ||||||||||||    
T  44600223 aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagg 44600124  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 517  Q
    | ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44600123 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 44600024  T
Q  518 gaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 616  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  44600023 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct 44599924  T
Q  617 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    | ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  44599923 c-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 22135214 - 22134615
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22135214 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 22135115  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  22135114 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaaggagaaa 22135015  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag-- 416  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||  |||||| ||||      
T  22135014 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagagag 22134915  T
Q  417 -------------ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgag 503  Q
                 || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  22134914 agagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-caaacaaacactagggtttgtg 22134816  T
Q  504 ggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 603  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134815 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 22134716  T
Q  604 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22134715 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22134618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 120 - 506
Target Start/End: Original strand, 5100748 - 5101133
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5100748 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaac 5100847  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  5100848 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 5100947  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  5100948 aaaaac-gtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagagggg 5101046  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggt 506  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5101047 actgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 222 - 710
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19323035
Alignment:
Q  222 atatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnn 321  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  322 nnnn---tgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
           |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatgagttatattcat-ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 19322745  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     | | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  19322746 ggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttg 19322841  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19322842 ggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctct 19322941  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19322942 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattcttt 19323035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22801200 - 22800853
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22801200 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgt 22801101  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  22801100 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctga 22801001  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22801000 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 22800901  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22800900 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 22800853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22803072 - 22802725
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22803072 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 22802973  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22802972 atagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22802873  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  22802872 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctc 22802773  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22802772 ccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttg 22802725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 48486314 - 48486661
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  48486314 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 48486413  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48486414 atagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 48486513  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48486514 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 48486613  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  48486614 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttg 48486661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 365 - 708
Target Start/End: Original strand, 24878984 - 24879328
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24878984 atacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 24879083  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879084 atagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 24879183  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879184 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctct 24879283  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24879284 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24879328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 40637070 - 40637416
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  40637070 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40637169  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637170 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40637416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 365 - 708
Target Start/End: Original strand, 24880446 - 24880790
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  24880446 atacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 24880545  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880546 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 24880645  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880646 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 24880745  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24880746 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24880790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 40091753 - 40091406
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  40091753 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgt 40091654  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  40091653 ttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 40091554  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40091553 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 40091454  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40091453 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40091406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 47274722 - 47275067
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  47274722 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 47274821  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  47274822 ata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgg 47274920  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47274921 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct- 47275019  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47275020 ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttg 47275067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 19095865 - 19096225
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19095865 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 19095964  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19095965 attagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttac 19096064  T
Q  552 gggaagagattgaga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgg 650  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19096065 gggaagagatt-agagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacgg 19096163  T
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19096164 agagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttg 19096225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 24888791 - 24889138
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  24888791 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgt 24888890  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  24888891 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactag 24888990  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24888991 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctc 24889090  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24889091 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 24889138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 14633316 - 14633660
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  14633316 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaagg-gctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 14633414  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14633415 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 14633513  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 14633660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 38928528 - 38928168
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  38928528 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaa 38928429  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928428 actagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 38928329  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgga 651  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38928328 gggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacgga 38928229  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38928228 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 38928168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415479
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33415721 agtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctc 33415523  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33415522 aggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttg 33415479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 355 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12396193 - 12395836
Alignment:
Q  355 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaac 454  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12396193 tttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaac 12396094  T
Q  455 tagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396093 tagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 12395994  T
Q  555 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 654  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12395993 aagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgggggg 12395894  T
Q  655 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12395893 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttg 12395836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 36378288 - 36378635
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  36378288 tacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 36378387  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  36378388 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttg 36378635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 355 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12401155 - 12400798
Alignment:
Q  355 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaac 454  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |  ||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  12401155 tttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaac 12401056  T
Q  455 tagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12401055 tagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 12400956  T
Q  555 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 654  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12400955 aagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgggggg 12400856  T
Q  655 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12400855 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttg 12400798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089363
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa-cttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 37089612  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  37089611 gtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggct 37089512  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37089511 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 37089413  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37089412 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 37089363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 5198415 - 5198762
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||     
T  5198415 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgt 5198514  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5198515 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgg 5198614  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  5198615 ggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 5198714  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5198715 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttg 5198762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 243 - 711
Target Start/End: Original strand, 53404998 - 53405474
Alignment:
Q  243 agaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt--gtatcttcagtgtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            |||| |||||||||    
T  53404998 agaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaaaaaaaaaacgtattttcagtgtg 53405097  T
Q  341 gtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggttta 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53405098 gtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggg-gctgaaacaagggttta 53405196  T
Q  437 gaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt 536  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  53405197 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt 53405295  T
Q  537 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 630  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  53405296 gagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgata 53405395  T
Q  631 ctcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53405396 ctcatcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctttt 53405474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 47868397 - 47868743
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||| | ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  47868397 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47868496  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47868497 tagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttg 47868743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 8631760 - 8631410
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 461  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8631760 tactttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 8631661  T
Q  462 tgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8631660 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 8631410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 619785 - 619439
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  619785 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgc 619686  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||     
T  619685 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgg 619586  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  619585 gtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctc 619486  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  619485 cccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttg 619439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22044728 - 22044382
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22044728 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22044629  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22044628 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22044529  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22044528 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 22044430  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22044429 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 22044382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22047023 - 22046677
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22047023 atacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22046924  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22046923 atagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22046824  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22046823 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 22046725  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22046724 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 22046677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435296
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11435051  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |  ||    
T  11435052 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctagga 11435151  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11435152 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 11435250  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11435251 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 11435296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 369 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313056
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttg 37313056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 9148246 - 9148594
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  9148246 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattt 9148345  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9148346 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 9148445  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9148446 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 9148544  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9148545 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 9148594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 712
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136892
Alignment:
Q  131 aaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaatatatttt 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  231 tgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nnnnnnnnntgta 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||           |||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaaaaaaaaaacgta 30136530  T
Q  330 tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaaca 428  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||       |||||    
T  30136531 tcttcagtgtgatattcgttctaaatttattagttata-tttctctataaatatatacctagtatcaaatgtaaatcttgagatagag-------aaaca 30136622  T
Q  429 agggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacacta 528  Q
    | ||||| | | | ||||           |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  30136623 aaggtttggga-ggcaac-----------ggtttgtatagagttt-actcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacacta 30136707  T
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 628  Q
     || ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  30136708 ctatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagt 30136807  T
Q  629 tactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  30136808 taatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttg 30136892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 36919925 - 36919575
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttga--gatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36919925 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 36919826  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36919825 ggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 36919726  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  36919725 tgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctct 36919626  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36919625 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 36919575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 36921833 - 36921484
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||| | | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36921833 atacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 36921735  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 561  Q
    | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36921734 gtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 36921635  T
Q  562 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36921634 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 36921535  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36921534 ctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 36921484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 51015241 - 51015587
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  51015241 atacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 51015340  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  51015341 atagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 51015440  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  51015441 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctc 51015539  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51015540 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 51015587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 327 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 18709547 - 18709161
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--------tagaggg 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||        |||||||    
T  18709547 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagaggg 18709448  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  18709447 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttg 18709348  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18709347 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 18709249  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18709248 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 18709161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2485210 - 2484864
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagataga-gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  2485210 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 2485111  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  2485110 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2484912  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  2484911 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttg 2484864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 6764835 - 6765186
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  6764835 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6764934  T
Q  466 tagagtttgtctcttg-----ggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    |||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6764935 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6765186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934140
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16934380  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934379 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16934280  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16934279 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 16934181  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  16934180 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16934140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 11006577 - 11006228
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||      ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11006577 acttttactataaatatagaccttgtatcagacta--ttttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 11006480  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11006479 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 11006380  T
Q  560 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 659  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11006379 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgct 11006281  T
Q  660 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11006280 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttg 11006228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847494
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18847249  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18847250 agagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggg 18847349  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  18847350 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-c 18847447  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18847448 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 18847494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 38409194 - 38409546
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||      ||||||| ||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||||    
T  38409194 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagg 38409293  T
Q  459 gtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 558  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409294 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 38409393  T
Q  559 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 658  Q
    |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38409394 ggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 38409492  T
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38409493 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 38409546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 7941316 - 7941665
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatc--ttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  7941316 acttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 7941415  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaa--cactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  7941416 atagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct 7941515  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  7941516 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 7941615  T
Q  663 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7941616 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 7941665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 16453305 - 16453652
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |    
T  16453305 tacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 16453404  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16453405 caaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  16453605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttg 16453652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 372 - 706
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  372 tactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagt 471  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  472 ttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttg 571  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  572 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccag 670  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccag 41997792  T
Q  671 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  41997793 actaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931786
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16932026  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932025 agagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16931926  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16931925 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 16931827  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  16931826 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16931786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 31849937 - 31849590
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  31849937 atacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 31849838  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttt-gagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  31849837 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctg 31849738  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31849737 agactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 31849639  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31849638 cccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttg 31849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008559
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||   ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008661 attgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 11008565  T
Q  707 cttttg 712  Q
    ||||||    
T  11008564 cttttg 11008559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 370 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176471
Alignment:
Q  370 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaataga 469  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaa 9176708  T
Q  470 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  569 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 9176509  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  9176508 agactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatt 9176471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 327 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 47211122 - 47210762
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------tagagggag 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||||||| |    
T  47211122 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagaggggg 47211023  T
Q  421 ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa 520  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            |||      
T  47211022 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttggg 47210935  T
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47210934 aaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 47210835  T
Q  621 tgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47210834 tgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 9174482 - 9174143
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  9174482 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 9174383  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174382 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgag 9174283  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |    
T  9174282 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgc 9174184  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9174183 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 9174143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 369 - 683
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||    ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  464 aatagagtttgtctc-ttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 13544251  T
Q  663 tcccccagactaggtcaattt 683  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  13544252 tttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 442 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 26086237 - 26085968
Alignment:
Q  442 acaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtc 541  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  26086237 acaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 26086138  T
Q  542 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 641  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  26086137 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatata 26086039  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26086038 gtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttg 26085968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 353 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 18537821 - 18537470
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaa 451  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||||    
T  18537821 aatttatgagtgatgcttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaa 18537723  T
Q  452 aactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18537722 a-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcac 18537627  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgg 650  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18537626 gggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 18537527  T
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  18537526 agggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 446 - 712
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380692
Alignment:
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtg 644  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  645 aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttg 36380692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 408 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780371
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22780468 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 408 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782736
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  22782833 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 368 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||   |||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagag-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccc 18409384  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  18409383 tcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 365 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 5637807 - 5637524
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5637807 atacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 5637708  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5637707 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 5637608  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 644  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5637607 ctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 353 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 18535179 - 18534828
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaa 451  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  | ||||||||    
T  18535179 aatttatgagggatgcttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaa 18535081  T
Q  452 aactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18535080 a-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcac 18534985  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgg 650  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||    
T  18534984 gagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacgg 18534885  T
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  18534884 aggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 483 - 709
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  483 gaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattag 582  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  583 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 681  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  682 ttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 365 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 3824911 - 3824629
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt-----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||     ||||||||||| ||| |||||  |||||||||   |||||||||||||||||    
T  3824911 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 3824814  T
Q  460 tttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 559  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3824813 tttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagag 3824714  T
Q  560 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 644  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3824713 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 8756588 - 8756247
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||    
T  8756588 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttg 8756490  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaagagatt 562  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8756489 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagatt 8756393  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  8756392 gagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctct 8756293  T
Q  662 ctcccccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||| ||||||||||||   |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8756292 ctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547496
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  621 tgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttg 13547496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 453 - 712
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499384
Alignment:
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttg 27499384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 693
Target Start/End: Original strand, 10112631 - 10113194
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10112631 tagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatggacaat 10112726  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||||       
T  10112727 aaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaata-------tttgatgcaaatattatttcactaaaggagaaa 10112818  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttata-cttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagag 416  Q
           ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||    
T  10112819 aaaaaaatgtatcttcagcgtgaaatccgttccaaatttatgagttatatttttttttataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagag 10112918  T
Q  417 ggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| |    
T  10112919 ggagttgaaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcacc 10113012  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagagattgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgat 612  Q
    ||   ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   |||||    
T  10113013 ttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgat 10113112  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 693  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  10113113 atctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaact 10113194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 450 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  450 aaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtt 549  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  550 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaac 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 368 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||    
T  3937543 cttttactataaatatagactttta-tcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattct 598  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 2891442 - 2891634
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2891442 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatatctcttt 2891541  T
Q  621 tgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2891542 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2891634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 347 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 52942802 - 52942536
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaat--cagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgaca 444  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||    
T  52942802 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagaggg-gctgaaacaagggtttagaaaggca 52942705  T
Q  445 acaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctct 544  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52942704 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 52942605  T
Q  545 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 626  Q
    ||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942604 tggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 347 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 15032892 - 15032554
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  15032892 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaac 15032794  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||          ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15032793 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttg 15032706  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    |  ||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  15032705 gacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgg 15032606  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactagg 696  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15032605 aacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagg 15032554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 547 - 712
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215648
Alignment:
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 4215648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 669
Target Start/End: Original strand, 9022065 - 9022605
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  9022065 tagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatg-acaat 9022163  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg-agnn 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||| |       
T  9022164 aaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactaaaggaataa 9022256  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga---taga 415  Q
           ||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||  ||    |||||   ||||    
T  9022257 aaaaaaatgtatcttcaacgtgatatccattccaaatttatgtgttata-tttctctataaatataaaccttgtatcagatgaa--gatgagagtgtaga 9022353  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    | |    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||| |   |||||||| ||||||||||| ||||   || |||||||| |    
T  9022354 gagtcagaaaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcacc 9022447  T
Q  516 tt-gaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattga 611  Q
    || || ||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  | |||||    
T  9022448 ttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattga 9022547  T
Q  612 tatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 669  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  9022548 tatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 368 - 588
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  ||||||||||||  ||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  568 tttgggtagaattaggcggga 588  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 565 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635467
Alignment:
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 5635467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 369 - 706
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454020
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||| |    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |      
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagtctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca-- 28453782  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |  | |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28453783 gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggac 28453879  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
     |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||    
T  28453880 cttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctccc 28453979  T
Q  667 ccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  28453980 ccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47211303 - 47211158
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47211303 tagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatggacaat 47211204  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211203 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 505 - 706
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  505 gttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaa 603  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  604 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaac 701  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  702 aaatt 706  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 565 - 712
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437704
Alignment:
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 11437704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 706
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864049
Alignment:
Q  374 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatag-agggagct--aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaa-ctagggtttgaataga 469  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  470 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 569  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  570 tgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca----tatagtgaaacggagggctgctctct- 663  Q
    ||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  9863906 tgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 9864004  T
Q  664 -cccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  9864005 ccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38890692 - 38890517
Alignment:
Q  124 atgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||    
T  38890692 atgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat------------------atttatggacaataaat 38890611  T
Q  224 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 316  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38890610 atatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggag 38890517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 571 - 712
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101270
Alignment:
Q  571 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 670  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  671 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 5101270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16186193 - 16185831
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaa-caagggtttagaatgacaa 445  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||    
T  16186193 gttccaattttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaaca-aa 16186095  T
Q  446 caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttga---gggttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagt 540  Q
    ||||||| |||||||||  | |||| || |||||  |    | |||||| |||| |    |  |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16186094 caacaaa-ctagggttt--agagagatt-tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagt 16185999  T
Q  541 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 638  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  16185998 ctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-tttgtaaagttactcatcatt 16185900  T
Q  639 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16185899 atagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 369 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40998990
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatag 468  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||| |    ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagtctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtatag 40999183  T
Q  469 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 568  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| || |||  |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40999182 agtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagact 40999086  T
Q  569 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    |||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  40999085 ttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 368 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactatta 531  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 521 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 3982361 - 3982175
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  3982361 aaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctct 3982262  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||    
T  3982261 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaa 3982175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 353 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24446929 - 24446756
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||     |    
T  24446929 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----a 24446835  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactatta 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24446834 actagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 505 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  505 gttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 603  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  604 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 423 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 47151168 - 47150904
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||| ||||  ||    
T  47151168 aaaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaactaaggttt--atagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaa 47151076  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 621  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47151075 acactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 47150976  T
Q  622 gtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 691  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||  | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47150975 ctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaa 47150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 269
Target Start/End: Original strand, 9863507 - 9863650
Alignment:
Q  123 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaataaa 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9863507 tatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatgaacaataaa 9863606  T
Q  223 tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttg 269  Q
    |||||||||||   | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9863607 tatatttttgt---gcatgaaggaagatttgatgcaaatatattttg 9863650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Original strand, 25357614 - 25357979
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag-----ct-aaaacaagggtttagaat 440  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||     || |||||||||||||||||     
T  25357614 gttccaattttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaa 25357713  T
Q  441 gacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt-tgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgag 539  Q
     | ||||||||| |||||||||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||   |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  25357714 ca-aacaacaaa-ctagggttt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggttgtga---ttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 25357805  T
Q  540 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactca 634  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||    |||||| |   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25357806 tctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactca 25357905  T
Q  635 tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  25357906 tcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatt 25357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 618 - 712
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563103
Alignment:
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 47563103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 368 - 487
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttg-aatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaaca 487  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 592 - 710
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  592 ttattcttgtaacccattgatatct-cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc-cagactaggtcaatttggaccg 689  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  690 aactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 216
Target Start/End: Original strand, 19322413 - 19322510
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgtta-ctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19322413 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatggac 19322510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 590 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  590 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctc--ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209098
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct----gaacatatatttatggaca-at 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||| || | ||  || | | ||    
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgcttcaagaagat-tgttgttgaaaatat 38209161  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat-tttgaaagggaatatt 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38209160 aaatatatttttgtactgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatatttgaaaaggaatatt 38209098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336771
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | ||||||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctct 5336867  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||   ||||  | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||   | ||||||||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttg 5336771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14789566 - 14789500
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789566 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 14789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 520 - 706
Target Start/End: Original strand, 26557737 - 26557922
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||   || | || ||||||    ||  ||||||||||    
T  26557737 aaaacactattaggatatagtctcatggtcacgggaaaagattcaagactttgggtggaattaggtttgaaaactaattctt----ccttttgatatctc 26557832  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26557833 ttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 679
Target Start/End: Original strand, 36769406 - 36769636
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttga---gggttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |    |  |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  36769406 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttctt 36769503  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-ata 641  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||    
T  36769504 ggtcacgggaagaggctgagactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattata 36769598  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36769599 gtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050282
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 7050358  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7050357 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 274
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagg 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529455
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 8529348  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  8529349 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 8529444  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  8529445 aacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 673
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570245
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 4570175  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 673  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570176 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact 4570245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853705
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 11853630  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11853631 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489533
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 16489430  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat---catatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||||    |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   || |||||||||||||     
T  16489431 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactaggta 16489525  T
Q  699 aacaaatt 706  Q
    ||||||||    
T  16489526 aacaaatt 16489533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 521 - 668
Target Start/End: Original strand, 54906738 - 54906888
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  54906738 aaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctc- 54906836  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    ||||||||||||||||  |  |||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  54906837 tttgtaaagttactcaaaagttataatggaacggaaagctgctctctccccc 54906888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300580
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 31300505  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300506 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4885062
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||   || |||| |||||||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt-gggtataatcaggtttgaagactgattcttgta 4884955  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||||||| |||||   ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  4884956 actca---atatctcttt-gtaaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 4885051  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  4885052 aacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 638 - 712
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133179
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttg 6133179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 451 - 709
Target Start/End: Original strand, 36771323 - 36771584
Alignment:
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttt-gagggtt--gattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||  |||  |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  36771323 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctctt 36771420  T
Q  546 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tata 641  Q
    ||| | ||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||    
T  36771421 ggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattata 36771515  T
Q  642 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  36771516 gtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 36771584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 708
Target Start/End: Original strand, 15312299 - 15312503
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||   || ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  15312299 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 15312397  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  15312398 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggta 15312493  T
Q  699 aacaaattct 708  Q
    ||||||||||    
T  15312494 aacaaattct 15312503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822326
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556085
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 4556144  T
Q  623 taaagttactcat---catatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||  ||||||     ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4556143 taaag-aactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4556085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831298
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||   || |||| ||||||| |    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gcgtagaattaggtttgaagactgattcttgga 15831222  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15831223 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 666
Target Start/End: Original strand, 16638826 - 16638973
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||| |  |||||||     
T  16638826 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctc- 16638922  T
Q  619 tttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16638923 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccc 16638973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 5269230 - 5269284
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5269230 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516771
Alignment:
Q  131 aaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatctttt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaatgaattgtttcaaatatatttt 5516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16688934
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 16689041  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||   || ||||||||| |||     
T  16689040 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggta 16688945  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  16688944 aacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587154
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | |||||  |||||||     
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgtt 18587047  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  18587048 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 18587143  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  18587144 aacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 709
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317145
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 15317055  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15317056 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 15317145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 588 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttgg 685  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| || | || |    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattag 3578689  T
Q  686 accgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  3578688 accgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 673
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558462
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 4558408  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagact 673  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4558409 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact 4558462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699810
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 664 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942479
Alignment:
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttg 52942479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 5143317 - 5143263
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5143317 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 10047437 - 10047383
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10047437 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 706
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114654
Alignment:
Q  450 aaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtt 549  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10114412 aaaactagggtttg--tagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtc 10114506  T
Q  550 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaa 647  Q
    |||  |||||||||||        |||||||| |    | |||| |||| |||||||   | |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||  ||    
T  10114507 acgataagagattgag--------tagaattatgtttaaagactaattcatgtaacc---ttatatctcttt-gtaaattaactcatcattatagttgaa 10114594  T
Q  648 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  10114595 cgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatt 10114654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 29609653 - 29609591
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29609653 aaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  555 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 39246052 - 39245998
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39246052 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 582
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  527 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag-actttgggtagaattag 582  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208809
Alignment:
Q  475 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgg 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||| |    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagattcgagactttag 38208814  T
Q  573 gtaga 577  Q
    |||||    
T  38208813 gtaga 38208809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 661 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937265
Alignment:
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttg 3937265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29609897 - 29609838
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgc 257  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29609897 tgaaaatatatttatgaagagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgc 29609838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 583
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 5516444 - 5516367
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 581  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5516444 ttgattcatcttggagaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaatta 5516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 439
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102161
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagataga-gggagct-aaaacaagggtttagaa 439  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaa 12102161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609914
Alignment:
Q  129 tcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaagtattcttgatttttttcaaatatattttgtgct 29609914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 702
Target Start/End: Original strand, 36315268 - 36315321
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36315268 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 702
Target Start/End: Original strand, 36329477 - 36329530
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36329477 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 54928764 - 54928699
Alignment:
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggag 652  Q
    ||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  54928764 agactgattcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaacggag 54928699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 649 - 697
Target Start/End: Original strand, 34495862 - 34495910
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  34495862 ggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaactaggt 34495910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 651 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 4874678 - 4874620
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttga--aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874678 ttgattcaccttgatcaaaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Original strand, 22295316 - 22295502
Alignment:
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattga------tatctctttt 621  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||   || ||||||||| |||||||| ||||      |     ||||    
T  22295316 ttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaaccctttgagtagaattaggatttt 22295415  T
Q  622 gtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||   |||||||||||||| |||||| || | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22295416 gtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 22295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 413
Target Start/End: Original strand, 36380370 - 36380417
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagata 413  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  36380370 tacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 5396710 - 5396764
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5396710 ggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647172
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccg 237  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgtaccg 14647172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 38152478 - 38152532
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  38152478 ggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 702
Target Start/End: Original strand, 6743454 - 6743507
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  6743454 ggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 25614011 - 25613950
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25614011 ggagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 25613950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 52043765 - 52043716
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  52043765 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 52043716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 112)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 711
Target Start/End: Original strand, 41384498 - 41385087
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  41384498 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatggacaat 41384597  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||        
T  41384598 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaatattctttcattgaaggaaaaa 41384696  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  41384697 aaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagaggg- 41384795  T
Q  420 gctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga 519  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  41384796 gctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgg 41384895  T
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||||||    
T  41384896 gaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctctt 41384995  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41384996 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 41385087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 15808967 - 15809562
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15808967 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaat 15809066  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  15809067 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 15809166  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagataga 415  Q
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    |||||| |    
T  15809167 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaa 15809266  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15809267 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 15809365  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15809366 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 15809465  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15809466 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 15809562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 41382424 - 41383006
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  41382424 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatggacaat 41382523  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||       
T  41382524 aaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatgagaaa 41382623  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41382624 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatgg 41382723  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         
T  41382724 ggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttca----- 41382818  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  41382819 ------cctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 41382912  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382913 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 41383006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 3873755 - 3874354
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3873755 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 3873854  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaa-cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnn 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3873855 aaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa 3873954  T
Q  319 nnnnnnntg--tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagat 412  Q
               ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||  ||    |||||    
T  3873955 aaaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagat 3874054  T
Q  413 agagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3874055 agcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 3874154  T
Q  513 atcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874155 accttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 3874254  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3874255 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3874354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28283808 - 28283212
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28283808 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 28283709  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28283708 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 28283609  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------ta 413  Q
           |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||    
T  28283608 aaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagata 28283509  T
Q  414 gagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283508 gagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 28283409  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
      |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||     
T  28283408 cattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatt 28283309  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28283308 tctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28283212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 43529876 - 43530459
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43529876 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 43529975  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||       
T  43529976 aaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaaggagaaa 43530075  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----taga 415  Q
           |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    ||||    
T  43530076 aaaaaaagtatcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagataga 43530175  T
Q  416 gggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatc 515  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||   |||||||             |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  43530176 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcacc 43530262  T
Q  516 ttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 615  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  43530263 ttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttc 43530362  T
Q  616 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43530363 tcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 43530459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 711
Target Start/End: Original strand, 608475 - 609077
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  608475 tagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 608574  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  608575 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 608674  T
Q  320 nnnnnntg----tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga---- 411  Q
           |    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||  ||||||        
T  608675 aaaaaaagaacgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatgagttata-tttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagaga 608773  T
Q  412 ----tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
        ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 608973  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  608974 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 609073  T
Q  708 tttt 711  Q
    ||||    
T  609074 tttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 327 - 712
Target Start/End: Original strand, 32339264 - 32339653
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagct 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    ||||||||||| |||    
T  32339264 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggct 32339363  T
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  32339364 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaa 32339463  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339464 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32339563  T
Q  623 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32339564 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttg 32339653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 14419541 - 14419181
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  14419541 aatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaa 14419442  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14419441 actagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacg 14419342  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14419341 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacaga 14419242  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14419241 tggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 14419181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106888
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctc 27106933  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  27106932 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttg 27106888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 30480853 - 30480494
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30480853 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 30480754  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30480753 actaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 30480654  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggag 652  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  30480653 ggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggat 30480554  T
Q  653 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30480553 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 30480494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 15072707 - 15073055
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||     
T  15072707 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgt 15072806  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gattg 563  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  15072807 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttg 15072906  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15072907 ggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctct 15073006  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15073007 cccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttg 15073055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 14807748 - 14808105
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  14807748 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 14807847  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  14807848 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14807947  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctg------- 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||           
T  14807948 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 14808047  T
Q  658 ---ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14808048 cccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 14808105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Original strand, 27910994 - 27911357
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  27910994 gttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagg-caac 27911092  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911093 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27911192  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27911193 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaa 27911292  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27911293 acggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttg 27911357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Original strand, 27957413 - 27957776
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||    
T  27957413 gttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagg-caac 27957511  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957512 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27957611  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27957612 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaa 27957711  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27957712 acggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttg 27957776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 1225164 - 1225511
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1225164 tacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 1225263  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1225264 aagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 1225511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28251905 - 28251558
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28251905 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 28251806  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  28251805 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28251706  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28251705 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 28251606  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28251605 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28251558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 353 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13858834 - 13858477
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13858834 aatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 13858735  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13858734 actagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacg 13858635  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13858634 ggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacaga 13858536  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13858535 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 15067978 - 15068325
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  15067978 atacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgt 15068077  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  15068078 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttga 15068177  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15068178 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctc 15068277  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  15068278 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttg 15068325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 27829294 - 27829640
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  27829294 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 27829393  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  27829394 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27829493  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27829494 gaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27829592  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27829593 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 27829640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 4424015 - 4424362
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  4424015 atacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4424114  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4424115 atagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 4424214  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  4424215 agctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 4424314  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4424315 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 4424362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 27826983 - 27827329
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  27826983 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 27827082  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  27827083 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg 27827182  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27827183 gaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27827281  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27827282 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 27827329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952865
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| | |||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 25952819  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952820 ccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 25952865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 369 - 708
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865877
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||  ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  667 cc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattct 36865877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684644
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc- 606  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  607 --attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 704  Q
      |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22684652  T
Q  705 ttcttttg 712  Q
    ||||||||    
T  22684651 ttcttttg 22684644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 327 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 24873563 - 24873178
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga------tagagggag 420  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||      ||||||| |    
T  24873563 gtatcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagaggggg 24873464  T
Q  421 ctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaa 520  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||       
T  24873463 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttgg 24873364  T
Q  521 aaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  24873363 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-t 24873265  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  24873264 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 18810707 - 18811051
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  18810707 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18810806  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  18810807 agagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctggga 18810906  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18810907 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 18811005  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18811006 ccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttg 18811051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 368 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372168
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagaggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 665  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccc 5372214  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  5372213 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattatttt 5372168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721181
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| ||    
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtat 44720941  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttga-aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  44720942 agagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 44721041  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  44721042 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcc 44721140  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44721141 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 44721181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 347 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 15186066 - 15185706
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||   || |||||||||||||||| || ||     
T  15186066 gttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaat 15185967  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagt--ctct 544  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  15185966 aacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctct 15185867  T
Q  545 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagt 643  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15185866 tggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagt 15185774  T
Q  644 gaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15185773 gaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 15185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 424 - 706
Target Start/End: Original strand, 43079658 - 43079940
Alignment:
Q  424 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaa 523  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  43079658 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43079757  T
Q  524 cactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43079758 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 43079856  T
Q  623 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43079857 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43079940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Original strand, 18812892 - 18813225
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  | ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||             
T  18812892 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag--------- 18812982  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||    
T  18812983 --agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtga 18813080  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18813081 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 18813179  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813180 ccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 18813225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 408 - 706
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082311
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  43082213 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43082311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541401
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||| ||||||||||||                      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccc 33541446  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  33541445 cagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttg 33541401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 368 - 614
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 368 - 706
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||        |  ||||||||||||| |||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaa--------atcaaactagggtttgtata 21482413  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccc 21482609  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21482610 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 458 - 712
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956302
Alignment:
Q  458 ggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 557  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  558 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggct 656  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  657 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttg 15956302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Original strand, 31162192 - 31162551
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaa-caagggtttagaatgacaa 445  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  31162192 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa--acaa 31162289  T
Q  446 -caacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctct 544  Q
     |||||||  ||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31162290 gcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 31162385  T
Q  545 tggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagt 643  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31162386 tggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagt 31162485  T
Q  644 gaaacggagggctgctctct--cccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  31162486 ggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 396 - 693
Target Start/End: Original strand, 21480542 - 21480828
Alignment:
Q  396 agagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 495  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||        |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21480542 agagtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaa--------atcaaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactag 21480632  T
Q  496 ggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 595  Q
    | ||   ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21480633 gttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttat 21480729  T
Q  596 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21480730 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaact 21480828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 399 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005624
Alignment:
Q  399 gtaaatcttgagatagagggagcta-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg 497  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaa--acaaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaataggg 3005835  T
Q  498 tttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 597  Q
    || ||   ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005834 ttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 3005738  T
Q  598 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactag 695  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |    
T  3005737 ttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgg 3005638  T
Q  696 gtcaacaaattctt 709  Q
    || |||||||||||    
T  3005637 gtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 273
Target Start/End: Original strand, 32339099 - 32339252
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32339099 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 32339198  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339199 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 353 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 5623088 - 5622878
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5623088 aatttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 5622989  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  5622988 actagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacg 5622889  T
Q  553 ggaagagattg 563  Q
    |||||||||||    
T  5622888 ggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 465
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181634
Alignment:
Q  266 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagtt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagtt 181533  T
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  181534 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttga 181633  T
Q  465 a 465  Q
    |    
T  181634 a 181634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 366 - 545
Target Start/End: Original strand, 26775199 - 26775378
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  26775199 tacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgta 26775298  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctctt 545  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26775299 tatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 503 - 706
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  503 gggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 601  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  602 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac--taggtcaat-ttggaccgaactaggt 697  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  698 caacaaatt 706  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3265747 - 3265635
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3265747 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 3265648  T
Q  220 aaatatatttttg 232  Q
    |||||||| ||||    
T  3265647 aaatatatgtttg 3265635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 491 - 668
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181799
Alignment:
Q  491 actagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 587  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctccccc 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 574 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  574 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac 672  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  673 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  703 aatt 706  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 353 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 35872728 - 35872555
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||     |    
T  35872728 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----a 35872634  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactatta 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35872633 actagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 423 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 31574001 - 31573794
Alignment:
Q  423 aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa 522  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||| ||||  ||    
T  31574001 aaaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttg--tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaa 31573908  T
Q  523 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 621  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31573907 acactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctctttt 31573808  T
Q  622 gtaaagttactcat 635  Q
    ||||||||||||||    
T  31573807 gtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    | || ||||||||||||||||||    | ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376328
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  || ||    
T  6376224 accttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaa 6376322  T
Q  701 caaatt 706  Q
    ||||||    
T  6376323 caaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 456 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  456 agggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 555  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||         ||||||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  556 agagattgagactttgggtagaattaggcgg 586  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 365 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3886256 - 3886153
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  3886256 atacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 3886157  T
Q  465 atag 468  Q
    ||||    
T  3886156 atag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 365 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12517364 - 12517248
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12517364 atacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 12517265  T
Q  463 gaatagagtttgtctct 479  Q
    | |||||||||||||||    
T  12517264 gtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 590 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  590 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 365 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2468436 - 2468261
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg- 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||        ||  |||||| ||||||     
T  2468436 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga--------aatcaaactacggtttgt 2468345  T
Q  464 ---aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggt 548  Q
        |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468344 atatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28328064
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 28327989  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28327990 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 540
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035238
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||  ||||| |    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagtctgaaaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgta 31035166  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagt 540  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   || |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  31035167 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 648 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214255
Alignment:
Q  648 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 37214255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 521 - 669
Target Start/End: Original strand, 3895973 - 3896124
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactta-ttcttgtaacccat-tgatatctct 618  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||   || | ||| |||||||||| | | ||||||||||    
T  3895973 aaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctct 3896072  T
Q  619 tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 669  Q
    ||||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3896073 tttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctccccca 3896124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985163
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 603  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 13985179  T
Q  604 cccattgatatctctt 619  Q
    ||| |||  |||||||    
T  13985178 ccctttggaatctctt 13985163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757293
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 16757368  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16757367 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33838956
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 33839023  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 669  Q
    |||| |||  |  ||||||||||||||||| |  |  ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  33839022 accctttggaa--tcttttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctccccca 33838956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021101
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 9021208  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  9021207 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 9021112  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  9021111 aacaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799418
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||   | ||||| |||||| ||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttata 17799525  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  17799524 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 17799429  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  17799428 aacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 704
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833886
Alignment:
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 686  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |     
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  687 ccgaactaggtcaacaaa 704  Q
     |||||| ||| ||||||    
T  16833869 acgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332787
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 28332712  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28332713 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtca 28332787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 637 - 712
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477595
Alignment:
Q  637 atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact-aggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttg 14477595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtatg--gaa-gaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179555
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || |||||||   || |||| |||||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgta 23179662  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||     
T  23179661 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 23179566  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  23179565 aacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 25684626 - 25684799
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  25684626 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 25684724  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25684725 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25684799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812486
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 4812588  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtca 699  Q
    || |||   |||||| |||||||||  | ||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| |    
T  4812587 actcat---tatctc-tttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaa 4812492  T
Q  700 acaaat 705  Q
    ||||||    
T  4812491 acaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752643
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895563
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423274
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986304
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtg 196  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatat-aaagatttgttttaaatatattttgtg 13986304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554810
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| |    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttgga 29554886  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29554885 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032811
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 33032735  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| || |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  33032736 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtca 33032811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 19752433 - 19752487
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19752433 ggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590855
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214458
Alignment:
Q  399 gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaact 455  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 37214458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 403
Target Start/End: Original strand, 6375969 - 6376024
Alignment:
Q  348 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaa 403  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6375969 ttccaattttatgcgggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaa 6376024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13986285 - 13986214
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttg 269  Q
    |||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  13986285 tgaaaatatatttatggatagttaataaatttttgtaccgcatgaaagaagatttgatgcaaatatattttg 13986214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 656 - 703
Target Start/End: Original strand, 19175800 - 19175847
Alignment:
Q  656 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19175800 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679186
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaata-tgttggtaaaaataaaaaagatttgttttagatatattttgtg 30679186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 4696635 - 4696689
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  4696635 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 9765858 - 9765912
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9765858 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 659 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930193
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 664
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419786
Alignment:
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 26403269 - 26403323
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26403269 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 31071268 - 31071322
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071268 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 1345415 - 1345371
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1345415 tctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaacaa 1345371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 2267206 - 2267144
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  2267206 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 583
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 702
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733873
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14419834 - 14419779
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagc 421  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14419834 tacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagagagagc 14419779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 17847508 - 17847558
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga 398  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17847508 gttccaaattt-tgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaga 17847558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 5702522 - 5702576
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5702522 ggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 7412399 - 7412345
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7412399 ggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 521 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 13985995 - 13985933
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattag 582  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  13985995 aaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 520 - 562
Target Start/End: Original strand, 15949533 - 15949575
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  15949533 aaaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagatt 15949575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 557
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21033906
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 557  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 21033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 23799616 - 23799670
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  23799616 ggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 558  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 679
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890922
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 28890922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 659 - 700
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 30035191 - 30034594
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  30035191 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatagacaat 30035092  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  30035091 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggagaaa 30034992  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatag 414  Q
            ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||    |||||||    
T  30034991 ataaaaacgtatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatag 30034892  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30034891 agggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 30034792  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30034791 cttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 30034692  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30034691 ctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 30034594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Original strand, 30966928 - 30967524
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30966928 tagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 30967027  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30967028 aaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 30967127  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga----tag 414  Q
            | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||  ||||||    |||    
T  30967128 aaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagagagatag 30967226  T
Q  415 agggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30967227 agggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 30967326  T
Q  515 cttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 614  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30967327 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgattt 30967426  T
Q  615 ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30967427 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 30967524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 2629474 - 2628877
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2629474 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 2629375  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  2629374 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa 2629275  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag-- 416  Q
            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||  |||||| ||||      
T  2629274 aaaaaaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagat 2629175  T
Q  417 ---ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
       || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2629174 agaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattca 2629075  T
Q  514 tcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 613  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||     
T  2629074 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatt 2628975  T
Q  614 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2628974 tctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttg 2628877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 12196099 - 12195515
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12196099 tagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaat 12196000  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  12195999 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 12195900  T
Q  320 nnnnnnt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggg 418  Q
            | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||    
T  12195899 aaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 12195800  T
Q  419 agctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12195799 ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg 12195700  T
Q  519 aaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 617  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12195699 ggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 12195600  T
Q  618 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
     ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12195599 -tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 19705160 - 19704558
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19705160 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 19705061  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  19705060 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 19704961  T
Q  320 nnnnnnt---gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagag 416  Q
              ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||    
T  19704960 aaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 19704862  T
Q  417 ------ggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 510  Q
          || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19704861 atggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgat 19704762  T
Q  511 tcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 609  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704761 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 19704662  T
Q  610 gatatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19704661 gatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattat 19704562  T
Q  709 tttg 712  Q
    ||||    
T  19704561 tttg 19704558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 26933153 - 26932559
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26933153 tagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatggacaat 26933054  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  26933053 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 26932954  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga-------- 411  Q
           | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||  ||||||            
T  26932953 aaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagaga 26932854  T
Q  412 tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 511  Q
    ||||||| | | ||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  26932853 tagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgatt 26932754  T
Q  512 catcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 610  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932753 caccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 26932654  T
Q  611 atatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    || |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932653 atttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 26932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057518
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccc 13057472  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13057473 ccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttg 13057518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 9019902 - 9020249
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  9019902 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 9020001  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  9020002 atagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgg 9020101  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9020102 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctc 9020201  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9020202 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 9020249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Original strand, 17011784 - 17012358
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17011784 tagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaag-tttgttttaaatat--tttgtgtagaaaatatatttatggacaat 17011880  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |        
T  17011881 aaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaaaaaaaa 17011980  T
Q  320 nnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagaggga 419  Q
           |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||     
T  17011981 ac-----gtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagagggg 17012074  T
Q  420 gctaaa-acaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttg 518  Q
     || || | ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||     
T  17012075 tctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttc 17012169  T
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17012170 tgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 17012269  T
Q  619 tttgtaaagttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||  || | |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  17012270 tttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 17012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 367 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983020
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11983266  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  11983265 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 11983166  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11983165 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 11983066  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11983065 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 11983020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040078
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 13040032  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13040033 ctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttg 13040078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 3390343 - 3390703
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3390343 aatttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 3390442  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3390443 actagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaca 3390542  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3390543 gaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacgga 3390642  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  3390643 gggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttg 3390703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 370 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631930
Alignment:
Q  370 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaataga 469  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  470 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 569  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  570 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccc 668  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--ccc 3631974  T
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3631973 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3631930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 347 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 15533036 - 15532674
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||    
T  15533036 gttccaaattt-taagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaac 15532938  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15532937 aacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 15532838  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    || | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532837 gtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 15532738  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15532737 acggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 14507513 - 14507167
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  14507513 atacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 14507414  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  14507413 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14507314  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14507313 gactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 14507215  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14507214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 14507167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 28241658 - 28241312
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  28241658 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 28241559  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  28241558 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28241312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 375 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458758
Alignment:
Q  375 tataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttg 474  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  475 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggt 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  575 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacta 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  675 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 14458758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 123 - 497
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852650
Alignment:
Q  123 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgt--tactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaata 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat--tttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  221 aatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga---aggagn 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||     
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaaagagaaga 17852471  T
Q  318 nnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagg 417  Q
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17852472 aaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagg 17852570  T
Q  418 gagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg 497  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852571 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1230586 - 1230240
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| | | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  1230586 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1230487  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  || |    
T  1230486 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1230240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 347 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15541495 - 15541131
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||     
T  15541495 gttccaaattt-taagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaa 15541397  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15541396 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttg 15541297  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 646  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15541296 gtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaa 15541197  T
Q  647 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15541196 acagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttg 15541131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629856
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccc 3629901  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3629900 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 3629856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816222
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4816326 ttgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 4816227  T
Q  708 ttttg 712  Q
    |||||    
T  4816226 ttttg 4816222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 365 - 708
Target Start/End: Original strand, 32279973 - 32280316
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||     
T  32279973 atacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagaggg-gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgt 32280071  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32280072 atagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 32280171  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  32280172 gacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctct 32280271  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32280272 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattct 32280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477605
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-------agttactcatca-tatagtgaaacggagggctgct 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgct 25477552  T
Q  660 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25477553 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttg 25477605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728815
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgta 30729066  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |    
T  30729065 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggg 30728966  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  30728965 gctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctct 30728866  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30728865 ctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttg 30728815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 365 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 15530460 - 15530166
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  15530460 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 15530361  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530360 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 15530261  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15530260 ggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 368 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233740
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  468 gagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctccc 3233767  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaact 693  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3233766 ccacactaggtcaattttgaccgaact 3233740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 367 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 20915694 - 20915351
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaat--cttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||     ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||     
T  20915694 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgt 20915595  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915594 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattg 20915495  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 663  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  20915494 ggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 20915396  T
Q  664 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20915395 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 368 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338446
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactaggg-tttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
     ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcc 24338486  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 705  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24338485 cccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 26064958 - 26065304
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttg-----agatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||     |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26064958 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26065057  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26065058 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26065154  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  26065155 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26065253  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26065254 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttg 26065304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Original strand, 26084927 - 26085273
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttg-----agatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||     |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26084927 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26085026  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26085027 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26085123  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  26085124 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26085222  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26085223 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttg 26085273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 120 - 391
Target Start/End: Original strand, 18317756 - 18318028
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18317756 tagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18317855  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  18317856 aaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18317955  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttg 391  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18317956 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagaccttg 18318028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 120 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 22858531 - 22857949
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22858531 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatggacaat 22858432  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag--n 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  22858431 aaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 22858340  T
Q  318 nnnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagata 413  Q
             |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||  || |  |    ||||||    
T  22858339 aaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatataaaccttgtatcagatgaatttgtgagagagata 22858241  T
Q  414 gagggagc--taaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 511  Q
    ||| || |   ||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  22858240 gagagaaccagaaaacaagggtttagaa-gctaacacaaaaactagggtttg--tagaattt-tctcttggtaacaaacactaggg-ttga-gattgatt 22858147  T
Q  512 catcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-att 609  Q
    || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||||  ||    
T  22858146 caccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaaccctttt 22858047  T
Q  610 gatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  22858046 gatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 120 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5275923 - 5275727
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5275923 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 5275824  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275823 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 5275727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 368 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161549
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaaggg-gctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
    ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccc 12161594  T
Q  668 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     | ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  12161593 taaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttg 12161549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 365 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 3028188 - 3027876
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3028188 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaagg-caaca-caaaactagggtttg 3028091  T
Q  464 aatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 563  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3028090 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattg 3027994  T
Q  564 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  3027993 agactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctt 3027894  T
Q  663 t-cccccagactaggtca 679  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3027893 tccccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 400 - 706
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15719961
Alignment:
Q  400 taaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 499  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||        |  ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa--------atcaaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  500 tgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 599  Q
       | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  600 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggt 15719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 521 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 1069901 - 1069710
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069901 aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 1069802  T
Q  621 tgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctttt 711  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  1069801 tgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattctttt 1069710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 368 - 638
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490889
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggttta-gaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 638  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 367 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19227645  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19227644 agagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 19227545  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227544 ctttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 368 - 708
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466643
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||| | | | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggttt-gagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
     |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcc 14466600  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattct 708  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14466601 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattct 14466643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 488 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  488 aacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  587 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  687 ccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 365 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16455762 - 16455421
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgaga--tagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 462  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||  ||||| |    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  16455762 atacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagtctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggttt 16455664  T
Q  463 gaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 562  Q
    | | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  16455663 gtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagatt 16455567  T
Q  563 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16455566 gggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctct 16455467  T
Q  662 ctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  16455466 ctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 476 - 706
Target Start/End: Original strand, 15367121 - 15367349
Alignment:
Q  476 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggta 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15367121 ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggta 15367217  T
Q  576 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc-ccccagacta 674  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15367218 aaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagacta 15367317  T
Q  675 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15367318 ggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066121
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26066208  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26066121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309173
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 33309087  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  33309088 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33309173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 505 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186062
Alignment:
Q  505 gttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 603  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  604 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  703 aattcttttg 712  Q
    |||| |||||    
T  12186071 aattattttg 12186062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754700
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 29754793  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 29754700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068392
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26068479  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 521 - 706
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311442
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 33311356  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  33311357 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33311442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 368 - 706
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696759
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggag--ct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||     
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |   |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattga 19696614  T
Q  565 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 662  Q
    |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||  |||||||||    
T  19696615 gactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctc 19696714  T
Q  663 tcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19696715 tctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 706
Target Start/End: Original strand, 15346523 - 15346664
Alignment:
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15346523 gactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctc 15346622  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15346623 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1072215 - 1072066
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||     
T  1072215 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgt 1072116  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcat 514  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1072115 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattcat 1072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 281
Target Start/End: Original strand, 20526551 - 20526708
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     |    
T  20526551 tagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg-----t 20526645  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatata-ttttgaaagggaatatt 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526646 acatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 368 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447505
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactag-ggtttgagggttgattca 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattca 32447505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 504 - 706
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  504 ggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  701 caaatt 706  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 365 - 488
Target Start/End: Original strand, 8995455 - 8995578
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  8995455 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 8995554  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaa 488  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  8995555 atagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 664
Target Start/End: Original strand, 20526871 - 20527081
Alignment:
Q  450 aaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtt 549  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20526871 aaaactaggggttg--tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtc 20526965  T
Q  550 acgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaa 647  Q
    ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  20526966 acaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaa 20527064  T
Q  648 cggagggctgctctctc 664  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20527065 cggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 507 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  507 tgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 605  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  606 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaa---acggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 700  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || ||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  701 caaatt 706  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 375 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870612
Alignment:
Q  375 tataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttg 474  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagaggg-gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  475 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 513  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattca 13870612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 12911630 - 12911471
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || ||||||||    
T  12911630 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 678  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12911530 tt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 506 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078554
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 604  Q
    |||||||| ||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  605 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| |||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  703 aatt 706  Q
    ||||    
T  25078557 aatt 25078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 621 - 712
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584319
Alignment:
Q  621 tgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttg 10584319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 12937377 - 12937219
Alignment:
Q  520 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || ||||||||    
T  12937377 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  619 tttgtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 678  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12937277 tt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 564 - 679
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445815
Alignment:
Q  564 agactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 661  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  662 ctcccccagactaggtca 679  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 584 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465587
Alignment:
Q  584 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat- 681  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  682 ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Original strand, 30445318 - 30445404
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445318 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 534
Target Start/End: Original strand, 15346355 - 15346524
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||          ||    
T  15346355 aatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaat--------tcaa 15346446  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattagga 534  Q
    ||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  15346447 actagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 529 - 706
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262777
Alignment:
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccca---ttgatatctcttttgta 624  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||   || |||| |||||| |||||     ||||||||||||| |||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctcttt-gta 11262693  T
Q  625 aagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||  ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  11262694 aagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatt 11262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878883
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 13878808  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13878809 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16786075
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 16786000  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16786001 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16786075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694846
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 17694952  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttact-catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtca 699  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||| |    
T  17694951 actca---atatctc-tttgtaaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 17694856  T
Q  700 acaaattctt 709  Q
    ||||||||||    
T  17694855 acaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 521 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 7542566 - 7542452
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||     
T  7542566 aaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc- 7542468  T
Q  619 tttgtaaagttactca 634  Q
    ||||||||||||||||    
T  7542467 tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351877
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||   ||||||| ||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc-tttg 22351937  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22351936 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtca 22351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 481
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584213
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||     |||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||| |||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  468 gagtttgtctcttg 481  Q
    ||||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883631
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 13883556  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactca-tca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    |  |||   |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13883557 attcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467461
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 13467565  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtc 698  Q
    || ||   |||||   |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  13467564 actca---atatc---tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatgattagaccgaactaggta 13467472  T
Q  699 aacaaattctt 709  Q
    |||||||||||    
T  13467471 aacaaattctt 13467461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 198
Target Start/End: Original strand, 30445243 - 30445304
Alignment:
Q  137 tgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30445243 tgatggatgaagaatattgttgctagaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgct 30445304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 521 - 581
Target Start/End: Original strand, 11138439 - 11138499
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 581  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  11138439 aaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887345
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 588 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078215
Alignment:
Q  588 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 683  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    | | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattt 28078215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 198
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443097
Alignment:
Q  125 tgactcaaaattt--gatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgct 198  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataagagatttgtttcaaatatattttttgct 30443097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248835
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201447
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Original strand, 30443111 - 30443195
Alignment:
Q  195 tgctgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  30443111 tgctgaaaatatatttatggacaa--aatatatgtttgtaccgtataaaggaagatttgatgcaaatgtatttttaaaagaaatatt 30443195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  529 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19701985
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 31936645 - 31936591
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31936645 ggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577636
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 582
Target Start/End: Original strand, 6843217 - 6843325
Alignment:
Q  477 tcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaa-acactattaggattgagtctcttggtta---cgggaagagatt-gagactttg 571  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |   | |||||||||| |||||||||    
T  6843217 tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtctcttggtcacagcaggaagagattcgagactttg 6843314  T
Q  572 ggtagaattag 582  Q
    |||||||||||    
T  6843315 ggtagaattag 6843325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036116
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 709
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941857
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 594 - 651
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833540
Alignment:
Q  594 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt-actcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacgga 3833540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12186406 - 12186331
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaa 439  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12186406 tacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa 12186331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 5757517 - 5757571
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5757517 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 10077204 - 10077258
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  10077204 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 31979571 - 31979517
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31979571 ggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 528 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166140
Alignment:
Q  528 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   ||||||| ||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattca---atatctc-tttgtaaa 12166227  T
Q  627 gttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  12166226 gaaactcatatcattatagtgaagcagagagctgctatctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 12166140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 638 - 706
Target Start/End: Original strand, 30443537 - 30443606
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30443537 tatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 30443606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 527 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 25466075 - 25465927
Alignment:
Q  527 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 625  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||    
T  25466075 tattaggattgagtctcttaatcacggaaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-gtaa 25465981  T
Q  626 agttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactagg 676  Q
    ||  ||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25465980 agaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactagg 25465927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 26954330 - 26954286
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26954330 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 26954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25466508 - 25466434
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaa 439  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  25466508 atacttttactataaatatagatcttttgtcagagtaaaccttgaggtagagag-gctgaaaacaagggtttagaa 25466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 5572280 - 5572334
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  5572280 ggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 21356094 - 21356040
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21356094 ggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 22709076 - 22709022
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22709076 ggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 709
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643362
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 26643273  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  26643274 taaagaaactcatatcattatagttgaacggagagctg--ctctcccccagaccaggtcatctttacaccgaactgggtaaacaaattctt 26643362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 709
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749328
Alignment:
Q  524 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || ||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 26749239  T
Q  623 taaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||  ||||  |||| ||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  26749240 taaagaaactcatatcattatagttgaacggagagctg--ctctcccccagaccaggtcatctttacaccgaactgggtaaacaaattctt 26749328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28038066 - 28038012
Alignment:
Q  342 tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatca 396  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28038066 tatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatca 28038012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 499
Target Start/End: Original strand, 4595049 - 4595102
Alignment:
Q  443 caacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtt 499  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  4595049 caacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 398
Target Start/End: Original strand, 15367000 - 15367045
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga 398  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15367000 aatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcaga 15367045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 679
Target Start/End: Original strand, 17038350 - 17038391
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17038350 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtca 17038391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 583
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  527 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 120 - 667
Target Start/End: Original strand, 1740 - 2293
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1740 tagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 1839  T
Q  220 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag-nn 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  1840 aaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 1939  T
Q  319 nnnnnnntgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttg------agat 412  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||  |||      ||||    
T  1940 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagat 2039  T
Q  413 agagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 512  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2040 atagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattc 2138  T
Q  513 atcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 612  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2139 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaat 2238  T
Q  613 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 667  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2239 ttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Original strand, 3947 - 4292
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  3947 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4046  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  4047 ata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgg 4145  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4146 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct- 4244  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4245 ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttg 4292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 366 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 41820 - 41474
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  41820 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41721  T
Q  466 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  41720 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 41474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 365 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 69633 - 69283
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  69633 atacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 69534  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 560  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  69533 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 69434  T
Q  561 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 660  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  69433 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 69335  T
Q  661 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  69334 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 69283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 73365 - 73203
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatctt----gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 460  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| || |||  ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  73365 atacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggt 73266  T
Q  461 ttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaa 523  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  73265 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  482 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactatt 530  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 408 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14376
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14477 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 14378  T
Q  708 tt 709  Q
    ||    
T  14377 tt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 365 - 709
Target Start/End: Original strand, 14969 - 15313
Alignment:
Q  365 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  14969 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggttttt 15068  T
Q  465 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 564  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15069 ataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattca 15168  T
Q  565 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 664  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15169 gactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctc 15268  T
Q  665 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 709  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15269 ccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattctt 15313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 548
Target Start/End: Original strand, 31124 - 31168
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggt 548  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 79797 - 80156
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  79797 aatttatgagggattcttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaa 79896  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttggg-aacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttac 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79897 actagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttac 79996  T
Q  552 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacgga 651  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  79997 gggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgga 80095  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  80096 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttg 80156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188363
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 367 - 706
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6490
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtat 6250  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgag 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6251 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  566 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  6351 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcc 6449  T
Q  666 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  6450 cccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatt 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 367 - 704
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3168
Alignment:
Q  367 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaat 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2931  T
Q  467 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||    
T  2932 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttgga 3031  T
Q  567 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  3032 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccc 3130  T
Q  667 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 704  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3131 cgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 353 - 712
Target Start/End: Original strand, 85169 - 85528
Alignment:
Q  353 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 452  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  85169 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaag-aggagaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaa 85267  T
Q  453 actagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  85268 actagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacg 85367  T
Q  553 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacgga 651  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  85368 agaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 85467  T
Q  652 gggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  85468 tgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttg 85528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 408 - 706
Target Start/End: Original strand, 34 - 332
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 606  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  234 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 347 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16174 - 15817
Alignment:
Q  347 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaac 446  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| |||||||||||| | ||||    
T  16174 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 16076  T
Q  447 aacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttg 546  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16075 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 15979  T
Q  547 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 645  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  15978 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtgg 15879  T
Q  646 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  15878 aacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 408 - 712
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29467
Alignment:
Q  408 gagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  508 gattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 607  Q
    |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  608 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 707  Q
    ||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29364 ttgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 29462  T
Q  708 ttttg 712  Q
     ||||    
T  29463 gtttg 29467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 258 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1638
Alignment:
Q  258 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnntg------tatcttcagtgtggtattcgttcc 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |      ||||||||| ||| ||| | ||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaaggaaacctatcttcagcgtgatatccattcc 1981  T
Q  352 aaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaaca 450  Q
    ||||||| |||||| | ||   || ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||| |    
T  1980 aaatttacgagttacattt---ctctaaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaga 1885  T
Q  451 aaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtta 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||||    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  1884 aaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtca 1796  T
Q  551 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacg 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1795 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 1696  T
Q  650 gagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  1695 tagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2180 - 2070
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2180 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 2081  T
Q  220 aaatatatttt 230  Q
    |||||||||||    
T  2080 aaatatatttt 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 482 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1444
Alignment:
Q  482 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaatta 581  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  582 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  682 ttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 369 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16646
Alignment:
Q  369 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagac 16787  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 666  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||| |  ||||||||    
T  16786 tttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctccc 16687  T
Q  667 ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatt 706  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16686 ccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 327 - 691
Target Start/End: Original strand, 4727 - 5089
Alignment:
Q  327 gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagct-aaa 425  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || |||    
T  4727 gtatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaa 4825  T
Q  426 acaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaaca 525  Q
    | |||| |||||||  | | ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||  | |||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||  |||||    
T  4826 aaaaggatttagaagta-agcaacaaa-ctagggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaaca 4920  T
Q  526 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgta 624  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4921 ctattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgta 5020  T
Q  625 aagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 691  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5021 aagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaa 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 263
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4694
Alignment:
Q  121 agtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatttatggacaata 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4552 agtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatttatggacaata 4651  T
Q  221 aatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatat 263  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4652 tatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 368 - 595
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  368 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaata 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |  | ||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggc-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  468 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 567  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  568 tttgggtagaattaggcgggagacttat 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 638 - 712
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35891
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttg 35891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22412
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 22320  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22321 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 22412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 521 - 712
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24687
Alignment:
Q  521 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 24595  T
Q  620 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24596 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttg 24687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 8458 - 8512
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8458 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 90 - 1
Alignment:
Q  120 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtgctgaacatatatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  90 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1442
Alignment:
Q  669 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 366 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 993
Alignment:
Q  366 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggagctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  1168 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1069  T
Q  466 tagagtttgtctc-----ttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgaaaaacactattaggatt 536  Q
    |||||||||||||     || ||||||||||||| | || |||||||||| || ||||  ||| ||| ||||||||    
T  1068 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 519 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 57615 - 57433
Alignment:
Q  519 aaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatct 616  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||||||   || ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  57615 aaaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatct 57516  T
Q  617 cttttgtaaagttactca-tcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggt 697  Q
     ||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  57515 attttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaactaggt 57433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  198 tgaacatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatatttt 268  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaa-aatttgatgcaaatatatttt 57836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 57995 - 57926
Alignment:
Q  125 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttactaaaaatataaaagatttgtttcaaatatcttttgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  57995 tgactcaaaatttgatggatgatgaat--tgtttctaaaagtataaaagatttgttttatatattttttgtg 57926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 649 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4670
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttg 4670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16482
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 602  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgga 16406  T
Q  603 acccattgatatctcttttgtaaagttactc--atca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16407 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 16482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 583
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224880
Alignment:
Q  506 ttgattcatcttgaa--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 583  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5687
Alignment:
Q  651 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5739 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 2550 - 2496
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  2550 ggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 17181 - 16980
Alignment:
Q  510 ttcatcttgaaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccc 606  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |  ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| |||      
T  17181 ttcatcttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactt 17083  T
Q  607 attgatatctcttttgtaaagttactcat--cat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaaca 702  Q
    |||   |||||||| ||||||  ||||||  ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||||    
T  17082 att---atctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaaca 16987  T
Q  703 aattctt 709  Q
    |||||||    
T  16986 aattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 659 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  659 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 649 - 703
Target Start/End: Original strand, 44000 - 44054
Alignment:
Q  649 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 703  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  44000 ggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 638 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3095
Alignment:
Q  638 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 679  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University