View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5532-Insertion-1 (Length: 845)

Name: NF5532-Insertion-1
Description: NF5532
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5532-Insertion-1
NF5532-Insertion-1
[»] chr8 (196 HSPs)
chr8 (8-845)||(41590000-41590834)
chr8 (222-761)||(37967414-37967955)
chr8 (225-707)||(43622667-43623153)
chr8 (222-758)||(44265330-44265867)
chr8 (242-761)||(6590145-6590665)
chr8 (223-762)||(8784456-8784996)
chr8 (222-760)||(25101834-25102371)
chr8 (223-756)||(38706316-38706850)
chr8 (223-761)||(5250263-5250803)
chr8 (268-760)||(36470743-36471236)
chr8 (216-764)||(33322409-33322958)
chr8 (223-762)||(5695793-5696325)
chr8 (398-763)||(17498543-17498907)
chr8 (251-761)||(27875347-27875861)
chr8 (256-761)||(28015532-28016042)
chr8 (284-760)||(35862921-35863397)
chr8 (318-760)||(24451364-24451806)
chr8 (264-668)||(6018011-6018414)
chr8 (321-760)||(21135204-21135642)
chr8 (317-760)||(41281270-41281711)
chr8 (317-761)||(18839886-18840330)
chr8 (320-753)||(35369077-35369510)
chr8 (398-761)||(9252524-9252888)
chr8 (225-763)||(17842342-17842881)
chr8 (432-760)||(13323634-13323963)
chr8 (410-761)||(21159841-21160194)
chr8 (258-643)||(42499288-42499674)
chr8 (327-760)||(37706702-37707134)
chr8 (222-734)||(30658323-30658822)
chr8 (322-758)||(36063409-36063834)
chr8 (462-759)||(6413383-6413681)
chr8 (319-760)||(39336873-39337301)
chr8 (242-632)||(30968670-30969062)
chr8 (398-624)||(17062414-17062639)
chr8 (398-624)||(17585719-17585944)
chr8 (330-563)||(23483421-23483654)
chr8 (239-655)||(5765605-5766025)
chr8 (344-760)||(16472873-16473279)
chr8 (344-760)||(16477444-16477850)
chr8 (401-762)||(43988207-43988567)
chr8 (235-762)||(28755059-28755589)
chr8 (321-577)||(18304638-18304896)
chr8 (399-753)||(44894464-44894816)
chr8 (554-762)||(14121950-14122159)
chr8 (235-723)||(36018027-36018521)
chr8 (344-733)||(32514039-32514429)
chr8 (434-753)||(32244484-32244803)
chr8 (224-512)||(43936391-43936679)
chr8 (399-753)||(3865578-3865934)
chr8 (399-753)||(32243566-32243920)
chr8 (574-760)||(39337745-39337931)
chr8 (399-714)||(6243403-6243715)
chr8 (220-439)||(36126455-36126679)
chr8 (434-753)||(3866478-3866798)
chr8 (606-759)||(13323066-13323219)
chr8 (610-759)||(21136206-21136355)
chr8 (606-759)||(24452360-24452513)
chr8 (588-760)||(35369930-35370102)
chr8 (606-759)||(35863921-35864074)
chr8 (606-759)||(37706018-37706171)
chr8 (626-774)||(1680835-1680983)
chr8 (219-385)||(2827065-2827232)
chr8 (222-385)||(31185724-31185890)
chr8 (327-658)||(42024231-42024559)
chr8 (627-761)||(14121810-14121945)
chr8 (492-602)||(2826919-2827029)
chr8 (560-758)||(28701866-28702063)
chr8 (606-752)||(36062694-36062840)
chr8 (226-385)||(12469454-12469615)
chr8 (621-760)||(1737439-1737578)
chr8 (223-386)||(17062151-17062311)
chr8 (223-386)||(17586047-17586207)
chr8 (221-307)||(6590144-6590230)
chr8 (212-292)||(10409467-10409547)
chr8 (223-306)||(547337-547420)
chr8 (610-753)||(44893744-44893886)
chr8 (344-479)||(10410010-10410145)
chr8 (676-762)||(37967870-37967956)
chr8 (673-759)||(42950208-42950294)
chr8 (427-512)||(6244252-6244337)
chr8 (222-307)||(8784457-8784542)
chr8 (680-761)||(10409477-10409558)
chr8 (606-759)||(41280369-41280522)
chr8 (612-757)||(44803330-44803474)
chr8 (221-305)||(21159719-21159803)
chr8 (567-753)||(30133748-30133933)
chr8 (676-771)||(33322867-33322962)
chr8 (222-300)||(43988488-43988566)
chr8 (679-760)||(547339-547420)
chr8 (220-292)||(1680846-1680918)
chr8 (624-736)||(18304893-18305003)
chr8 (224-308)||(30806214-30806298)
chr8 (683-763)||(31185812-31185892)
chr8 (220-300)||(37967412-37967492)
chr8 (679-766)||(2827147-2827234)
chr8 (224-307)||(6413598-6413681)
chr8 (676-762)||(6590600-6590686)
chr8 (676-758)||(17842799-17842881)
chr8 (222-300)||(33322412-33322490)
chr8 (588-658)||(41255319-41255389)
chr8 (679-761)||(41590212-41590294)
chr8 (222-292)||(41590680-41590750)
chr8 (231-292)||(3866736-3866797)
chr8 (606-699)||(16478432-16478525)
chr8 (223-300)||(24451364-24451441)
chr8 (222-303)||(28755507-28755588)
chr8 (231-292)||(44893745-44893806)
chr8 (231-292)||(44894754-44894815)
chr8 (544-632)||(10409789-10409876)
chr8 (224-300)||(12469306-12469382)
chr8 (220-292)||(21160124-21160196)
chr8 (690-753)||(6244392-6244455)
chr8 (691-766)||(30658318-30658393)
chr8 (225-288)||(44265330-44265393)
chr8 (521-753)||(2821164-2821386)
chr8 (221-307)||(5250718-5250804)
chr8 (242-292)||(6244393-6244443)
chr8 (221-307)||(14121809-14121895)
chr8 (544-622)||(28694963-28695041)
chr8 (221-291)||(28701540-28701610)
chr8 (225-291)||(28701997-28702063)
chr8 (691-761)||(36126607-36126677)
chr8 (533-582)||(2209252-2209301)
chr8 (679-760)||(5250263-5250344)
chr8 (679-760)||(8784915-8784996)
chr8 (222-307)||(17498820-17498905)
chr8 (247-304)||(18304947-18305003)
chr8 (418-503)||(28701739-28701824)
chr8 (231-292)||(30133871-30133932)
chr8 (223-291)||(41281643-41281711)
chr8 (222-290)||(14122090-14122158)
chr8 (226-298)||(17498435-17498507)
chr8 (223-307)||(36471152-36471236)
chr8 (224-292)||(42950226-42950294)
chr8 (680-759)||(12469306-12469385)
chr8 (619-757)||(40304870-40305008)
chr8 (612-755)||(44802362-44802501)
chr8 (231-285)||(3865579-3865633)
chr8 (226-300)||(5696247-5696320)
chr8 (679-757)||(21159724-21159802)
chr8 (242-300)||(30658771-30658829)
chr8 (516-602)||(36909729-36909815)
chr8 (223-292)||(39337862-39337931)
chr8 (676-762)||(44265782-44265868)
chr8 (679-760)||(17062151-17062232)
chr8 (679-760)||(17586126-17586207)
chr8 (213-290)||(25102305-25102381)
chr8 (223-291)||(39336873-39336941)
chr8 (669-770)||(42499682-42499783)
chr8 (226-299)||(44803401-44803474)
chr8 (224-292)||(13323066-13323134)
chr8 (433-509)||(19182943-19183019)
chr8 (223-287)||(21135204-21135268)
chr8 (225-292)||(36063767-36063834)
chr8 (231-307)||(38706770-38706846)
chr8 (732-771)||(9135772-9135811)
chr8 (432-503)||(11385602-11385673)
chr8 (209-292)||(16472859-16472941)
chr8 (209-292)||(16477430-16477512)
chr8 (679-766)||(25101829-25101916)
chr8 (260-307)||(27000697-27000744)
chr8 (220-291)||(27875792-27875863)
chr8 (220-291)||(28015973-28016044)
chr8 (221-292)||(31185625-31185696)
chr8 (438-537)||(34050586-34050685)
chr8 (350-385)||(36610803-36610838)
chr8 (681-760)||(38706316-38706395)
chr8 (732-763)||(41926079-41926110)
chr8 (245-300)||(42499696-42499751)
chr8 (676-759)||(43936391-43936474)
chr8 (433-512)||(44090484-44090563)
chr8 (433-503)||(2061009-2061079)
chr8 (729-771)||(2414886-2414928)
chr8 (433-503)||(7637046-7637116)
chr8 (732-766)||(7921248-7921282)
chr8 (732-770)||(12179760-12179798)
chr8 (732-770)||(12424188-12424226)
chr8 (223-292)||(13323894-13323963)
chr8 (732-766)||(27751176-27751210)
chr8 (433-503)||(28174241-28174311)
chr8 (433-491)||(30839040-30839098)
chr8 (444-478)||(32099160-32099194)
chr8 (258-292)||(32513952-32513986)
chr8 (223-292)||(35862921-35862990)
chr8 (261-299)||(36018028-36018066)
chr8 (433-503)||(36765630-36765700)
chr8 (729-762)||(12667023-12667056)
chr8 (224-292)||(21136287-21136355)
chr8 (422-479)||(28695098-28695155)
chr8 (729-766)||(31829220-31829257)
chr8 (231-292)||(32243567-32243628)
chr8 (243-292)||(32244741-32244790)
chr8 (221-254)||(32988951-32988984)
chr8 (433-653)||(35209551-35209771)
chr8 (439-480)||(39311466-39311507)
chr8 (226-291)||(40304870-40304935)
[»] chr3 (171 HSPs)
chr3 (220-762)||(53517656-53518199)
chr3 (222-760)||(45419659-45420195)
chr3 (223-761)||(29348157-29348692)
chr3 (222-760)||(44808713-44809250)
chr3 (221-761)||(38173783-38174324)
chr3 (223-736)||(40762476-40762989)
chr3 (220-762)||(27492194-27492737)
chr3 (223-759)||(23917212-23917739)
chr3 (350-760)||(25249897-25250306)
chr3 (223-762)||(11045282-11045823)
chr3 (398-761)||(21749446-21749810)
chr3 (401-757)||(53396980-53397338)
chr3 (344-638)||(23883387-23883681)
chr3 (344-760)||(37178823-37179240)
chr3 (398-760)||(32146884-32147240)
chr3 (317-759)||(45235314-45235758)
chr3 (317-760)||(50615054-50615484)
chr3 (233-659)||(11293783-11294202)
chr3 (223-762)||(46294931-46295474)
chr3 (317-760)||(117417-117847)
chr3 (344-760)||(19669582-19669998)
chr3 (264-761)||(39562461-39562964)
chr3 (344-760)||(44557576-44557982)
chr3 (401-757)||(53439209-53439551)
chr3 (414-759)||(19601432-19601777)
chr3 (222-619)||(45406698-45407081)
chr3 (212-759)||(54268718-54269256)
chr3 (221-761)||(34995420-34995952)
chr3 (317-760)||(32942870-32943311)
chr3 (434-753)||(33475359-33475677)
chr3 (434-753)||(44555806-44556125)
chr3 (399-753)||(52701050-52701404)
chr3 (427-753)||(41927919-41928244)
chr3 (533-761)||(53377205-53377433)
chr3 (399-753)||(8575953-8576309)
chr3 (573-760)||(50614428-50614615)
chr3 (553-758)||(37481261-37481467)
chr3 (225-494)||(23920953-23921220)
chr3 (456-668)||(28685280-28685487)
chr3 (573-760)||(44555245-44555433)
chr3 (573-760)||(116806-116993)
chr3 (220-478)||(53377430-53377689)
chr3 (521-763)||(15772039-15772280)
chr3 (401-753)||(31990956-31991308)
chr3 (606-758)||(32943870-32944021)
chr3 (402-537)||(9018125-9018260)
chr3 (399-602)||(25232695-25232900)
chr3 (399-636)||(33476241-33476478)
chr3 (606-760)||(45234599-45234753)
chr3 (606-754)||(37179827-37179975)
chr3 (621-760)||(54185590-54185729)
chr3 (419-612)||(44287839-44288028)
chr3 (545-653)||(3173707-3173815)
chr3 (606-757)||(27867960-27868110)
chr3 (399-753)||(41927160-41927501)
chr3 (588-753)||(52701901-52702066)
chr3 (606-759)||(1430162-1430315)
chr3 (606-758)||(32147859-32148011)
chr3 (419-604)||(26268642-26268826)
chr3 (596-760)||(25250271-25250435)
chr3 (399-494)||(44556687-44556782)
chr3 (488-605)||(45387449-45387566)
chr3 (220-307)||(34995418-34995505)
chr3 (221-291)||(29348156-29348226)
chr3 (679-761)||(53377605-53377687)
chr3 (222-304)||(53518116-53518198)
chr3 (222-307)||(11045283-11045368)
chr3 (223-308)||(14525123-14525208)
chr3 (564-753)||(25233079-25233267)
chr3 (223-307)||(44809166-44809250)
chr3 (680-760)||(45387321-45387401)
chr3 (679-761)||(3173809-3173891)
chr3 (571-753)||(8575193-8575374)
chr3 (221-306)||(3173807-3173892)
chr3 (679-760)||(40762476-40762557)
chr3 (220-292)||(38173781-38173853)
chr3 (221-304)||(39562882-39562965)
chr3 (679-762)||(45419658-45419741)
chr3 (589-754)||(41786332-41786486)
chr3 (222-304)||(46294932-46295014)
chr3 (231-292)||(8576247-8576308)
chr3 (679-760)||(14525127-14525208)
chr3 (219-292)||(23917207-23917280)
chr3 (231-292)||(31990957-31991018)
chr3 (226-299)||(33225673-33225746)
chr3 (231-292)||(41928182-41928243)
chr3 (224-292)||(19601432-19601500)
chr3 (612-757)||(33226683-33226829)
chr3 (679-763)||(44808711-44808795)
chr3 (231-290)||(31991994-31992053)
chr3 (221-287)||(3173644-3173710)
chr3 (691-761)||(34995881-34995951)
chr3 (679-757)||(38174241-38174319)
chr3 (231-285)||(44556953-44557007)
chr3 (231-292)||(8575194-8575255)
chr3 (609-742)||(16056211-16056343)
chr3 (679-760)||(29348611-29348692)
chr3 (684-757)||(33225673-33225746)
chr3 (231-292)||(52701051-52701112)
chr3 (231-292)||(52702004-52702065)
chr3 (223-292)||(54185660-54185729)
chr3 (682-762)||(15771776-15771856)
chr3 (221-289)||(21749445-21749513)
chr3 (697-757)||(23883683-23883743)
chr3 (645-753)||(25353255-25353363)
chr3 (226-306)||(28260538-28260618)
chr3 (222-380)||(15771777-15771936)
chr3 (698-753)||(44556953-44557008)
chr3 (231-306)||(45420113-45420187)
chr3 (226-308)||(19601886-19601968)
chr3 (679-760)||(23917657-23917739)
chr3 (226-292)||(33226763-33226829)
chr3 (223-292)||(37178823-37178892)
chr3 (433-503)||(40126920-40126990)
chr3 (223-292)||(44555245-44555315)
chr3 (223-292)||(44557913-44557982)
chr3 (223-292)||(45234599-45234668)
chr3 (223-292)||(50615415-50615484)
chr3 (679-761)||(53517658-53517740)
chr3 (224-292)||(1430247-1430315)
chr3 (613-662)||(14525053-14525102)
chr3 (231-292)||(25233205-25233266)
chr3 (231-292)||(33475360-33475421)
chr3 (344-381)||(40325824-40325861)
chr3 (231-292)||(44555807-44555868)
chr3 (224-292)||(45235690-45235758)
chr3 (691-760)||(46295405-46295474)
chr3 (560-622)||(46529628-46529692)
chr3 (433-653)||(47198987-47199207)
chr3 (226-286)||(23883683-23883743)
chr3 (223-307)||(25250351-25250435)
chr3 (427-503)||(28055288-28055364)
chr3 (427-503)||(28065713-28065789)
chr3 (433-509)||(32799933-32800008)
chr3 (225-292)||(37481400-37481467)
chr3 (433-509)||(50133553-50133629)
chr3 (732-772)||(54184787-54184827)
chr3 (683-738)||(31991984-31992039)
chr3 (433-512)||(34226052-34226131)
chr3 (212-255)||(39340998-39341041)
chr3 (261-304)||(41786412-41786455)
chr3 (433-512)||(53658005-53658084)
chr3 (433-503)||(869446-869516)
chr3 (433-503)||(3078374-3078444)
chr3 (433-503)||(4994099-4994169)
chr3 (226-383)||(9018280-9018438)
chr3 (433-503)||(10182262-10182332)
chr3 (433-503)||(15490791-15490861)
chr3 (433-503)||(16128533-16128603)
chr3 (732-762)||(16301297-16301327)
chr3 (216-282)||(20078206-20078272)
chr3 (222-292)||(27492195-27492265)
chr3 (433-503)||(30778788-30778858)
chr3 (223-292)||(32146884-32146953)
chr3 (433-503)||(36777869-36777939)
chr3 (347-385)||(40630699-40630737)
chr3 (433-503)||(43660412-43660482)
chr3 (231-292)||(45387329-45387390)
chr3 (433-503)||(45454337-45454407)
chr3 (433-503)||(50362393-50362463)
chr3 (433-503)||(53328515-53328585)
chr3 (226-292)||(53396980-53397046)
chr3 (327-385)||(53963597-53963655)
chr3 (676-757)||(9018357-9018438)
chr3 (245-298)||(16056286-16056339)
chr3 (729-762)||(28769646-28769679)
chr3 (571-636)||(31991904-31991968)
chr3 (433-482)||(44665062-44665111)
chr3 (438-503)||(45344060-45344125)
chr3 (732-761)||(48381471-48381500)
chr3 (445-478)||(48586264-48586297)
[»] chr5 (173 HSPs)
chr5 (231-762)||(40158145-40158676)
chr5 (224-758)||(37102918-37103450)
chr5 (225-760)||(10463621-10464154)
chr5 (222-762)||(621501-622041)
chr5 (222-761)||(8404268-8404812)
chr5 (221-760)||(17742216-17742749)
chr5 (223-762)||(8313090-8313628)
chr5 (226-763)||(27335509-27336045)
chr5 (222-760)||(42877489-42878022)
chr5 (317-762)||(8336722-8337167)
chr5 (265-761)||(27307701-27308197)
chr5 (222-707)||(34785124-34785607)
chr5 (317-758)||(24636908-24637350)
chr5 (245-761)||(1683061-1683577)
chr5 (226-760)||(4425903-4426439)
chr5 (219-659)||(4462739-4463183)
chr5 (221-760)||(2003834-2004372)
chr5 (281-758)||(41138909-41139387)
chr5 (344-760)||(13919945-13920361)
chr5 (219-761)||(4461834-4462364)
chr5 (245-761)||(41192873-41193391)
chr5 (318-758)||(8217982-8218410)
chr5 (471-756)||(22023191-22023476)
chr5 (222-762)||(30393960-30394503)
chr5 (318-760)||(43440844-43441273)
chr5 (220-572)||(34009992-34010345)
chr5 (319-759)||(34526913-34527341)
chr5 (231-770)||(2004895-2005437)
chr5 (221-760)||(10674524-10675063)
chr5 (224-655)||(31211174-31211609)
chr5 (224-508)||(9687407-9687693)
chr5 (268-707)||(18261100-18261535)
chr5 (434-753)||(40272346-40272665)
chr5 (317-550)||(38693436-38693669)
chr5 (221-527)||(28456624-28456928)
chr5 (550-759)||(9687706-9687916)
chr5 (399-753)||(19332351-19332704)
chr5 (398-761)||(3548398-3548758)
chr5 (231-481)||(9924402-9924645)
chr5 (221-603)||(42852775-42853142)
chr5 (399-753)||(43210678-43211034)
chr5 (399-753)||(2262845-2263197)
chr5 (218-481)||(21837100-21837364)
chr5 (525-758)||(16965904-16966141)
chr5 (222-759)||(36875743-36876274)
chr5 (398-758)||(22166925-22167287)
chr5 (573-760)||(26865114-26865301)
chr5 (217-451)||(22022966-22023201)
chr5 (555-760)||(26865888-26866091)
chr5 (213-763)||(30698546-30699097)
chr5 (588-760)||(38693677-38693849)
chr5 (546-762)||(6365413-6365622)
chr5 (601-761)||(28456468-28456626)
chr5 (606-759)||(38691864-38692017)
chr5 (221-614)||(37446433-37446823)
chr5 (606-760)||(13920909-13921063)
chr5 (317-478)||(26865676-26865837)
chr5 (588-753)||(3407131-3407295)
chr5 (577-758)||(8217400-8217575)
chr5 (224-615)||(14049632-14050001)
chr5 (521-621)||(9924280-9924380)
chr5 (592-763)||(27280060-27280231)
chr5 (238-479)||(27280319-27280558)
chr5 (555-704)||(37812609-37812757)
chr5 (607-752)||(43538478-43538623)
chr5 (683-759)||(21837026-21837102)
chr5 (221-300)||(32510492-32510571)
chr5 (437-636)||(43209899-43210097)
chr5 (606-724)||(41139902-41140020)
chr5 (610-755)||(43440134-43440280)
chr5 (218-299)||(8404735-8404816)
chr5 (588-753)||(19333200-19333364)
chr5 (691-767)||(30394433-30394509)
chr5 (676-759)||(18950983-18951066)
chr5 (221-307)||(28456467-28456553)
chr5 (223-300)||(17742216-17742293)
chr5 (623-760)||(30403394-30403531)
chr5 (609-760)||(34527365-34527514)
chr5 (231-304)||(42645223-42645296)
chr5 (223-300)||(42877945-42878022)
chr5 (231-292)||(43210972-43211033)
chr5 (231-307)||(22023396-22023472)
chr5 (216-307)||(4462279-4462370)
chr5 (691-766)||(4463110-4463185)
chr5 (414-579)||(28616093-28616260)
chr5 (221-307)||(1683492-1683578)
chr5 (694-760)||(4462456-4462522)
chr5 (223-289)||(4462456-4462522)
chr5 (676-762)||(8404267-8404353)
chr5 (588-714)||(37812996-37813121)
chr5 (222-292)||(40158146-40158216)
chr5 (231-292)||(3407233-3407294)
chr5 (427-512)||(9168631-9168716)
chr5 (222-307)||(30699010-30699095)
chr5 (344-437)||(18950866-18950959)
chr5 (231-291)||(19332352-19332412)
chr5 (680-760)||(28237291-28237371)
chr5 (398-478)||(30733975-30734055)
chr5 (220-307)||(41193306-41193393)
chr5 (222-308)||(22166746-22166832)
chr5 (213-307)||(27307692-27307786)
chr5 (219-304)||(2004901-2004986)
chr5 (223-292)||(10674524-10674593)
chr5 (676-761)||(17742663-17742748)
chr5 (224-301)||(21837026-21837103)
chr5 (222-303)||(27335511-27335592)
chr5 (676-761)||(32510485-32510570)
chr5 (556-636)||(32537608-32537688)
chr5 (231-288)||(37812173-37812230)
chr5 (223-307)||(2003834-2003918)
chr5 (679-775)||(4461823-4461919)
chr5 (224-292)||(9687848-9687916)
chr5 (692-772)||(34010274-34010354)
chr5 (566-737)||(42645113-42645281)
chr5 (679-761)||(2004286-2004371)
chr5 (433-512)||(18404393-18404471)
chr5 (217-292)||(28237302-28237377)
chr5 (678-761)||(42853058-42853141)
chr5 (222-292)||(621970-622040)
chr5 (433-503)||(24334047-24334117)
chr5 (695-753)||(37812172-37812230)
chr5 (231-292)||(2263135-2263196)
chr5 (222-307)||(8313091-8313176)
chr5 (231-292)||(19333302-19333363)
chr5 (223-292)||(24636815-24636883)
chr5 (222-307)||(27280062-27280147)
chr5 (223-307)||(4425903-4425987)
chr5 (433-509)||(5597738-5597814)
chr5 (258-458)||(6365207-6365408)
chr5 (679-759)||(9687407-9687487)
chr5 (225-308)||(22167203-22167287)
chr5 (692-760)||(30698556-30698624)
chr5 (231-291)||(30733839-30733899)
chr5 (224-300)||(36875743-36875819)
chr5 (676-763)||(42877487-42877572)
chr5 (693-760)||(8313561-8313628)
chr5 (691-762)||(36876204-36876275)
chr5 (225-292)||(37102918-37102984)
chr5 (231-305)||(43538478-43538552)
chr5 (223-292)||(13919945-13920014)
chr5 (222-304)||(30393961-30394043)
chr5 (681-763)||(34785122-34785204)
chr5 (223-292)||(38693780-38693849)
chr5 (225-290)||(16966076-16966141)
chr5 (224-304)||(18950986-18951066)
chr5 (223-300)||(30403454-30403531)
chr5 (231-292)||(40272347-40272408)
chr5 (673-753)||(2005358-2005438)
chr5 (225-292)||(8218343-8218410)
chr5 (222-290)||(8336723-8336791)
chr5 (223-307)||(10463621-10463705)
chr5 (235-307)||(30734155-30734227)
chr5 (679-762)||(621500-621583)
chr5 (433-512)||(7572982-7573061)
chr5 (679-761)||(28456847-28456927)
chr5 (691-754)||(40158615-40158678)
chr5 (225-292)||(42852620-42852687)
chr5 (350-388)||(2263040-2263078)
chr5 (350-388)||(3548592-3548630)
chr5 (433-503)||(4123230-4123300)
chr5 (729-759)||(5459047-5459077)
chr5 (433-503)||(6450173-6450243)
chr5 (692-758)||(10464088-10464154)
chr5 (223-292)||(13920994-13921063)
chr5 (433-503)||(14711615-14711685)
chr5 (327-385)||(22671465-22671523)
chr5 (344-386)||(28616022-28616064)
chr5 (679-737)||(30734158-30734216)
chr5 (433-503)||(41906894-41906964)
chr5 (433-503)||(42992523-42992593)
chr5 (689-762)||(22166745-22166818)
chr5 (438-503)||(27432463-27432528)
chr5 (433-478)||(31124775-31124820)
[»] chr1 (162 HSPs)
chr1 (212-767)||(19791114-19791670)
chr1 (224-758)||(30719362-30719899)
chr1 (226-761)||(35530668-35531204)
chr1 (224-759)||(26805367-26805904)
chr1 (350-760)||(13501087-13501496)
chr1 (246-759)||(26020298-26020812)
chr1 (223-754)||(52493416-52493949)
chr1 (223-760)||(43504657-43505187)
chr1 (350-761)||(51561350-51561762)
chr1 (317-760)||(36367860-36368303)
chr1 (317-760)||(33708915-33709358)
chr1 (409-761)||(28700834-28701188)
chr1 (317-758)||(11999601-12000043)
chr1 (398-757)||(47008698-47009040)
chr1 (224-563)||(46517047-46517388)
chr1 (317-760)||(12368213-12368643)
chr1 (221-761)||(31400100-31400640)
chr1 (317-714)||(46596746-46597142)
chr1 (317-659)||(30982352-30982694)
chr1 (226-722)||(10041119-10041613)
chr1 (317-757)||(21090938-21091374)
chr1 (221-762)||(33707242-33707784)
chr1 (317-760)||(36248216-36248649)
chr1 (418-753)||(49767575-49767910)
chr1 (399-753)||(12251420-12251769)
chr1 (317-760)||(15053528-15053944)
chr1 (418-753)||(11396921-11397256)
chr1 (542-768)||(21794285-21794510)
chr1 (567-760)||(2058959-2059151)
chr1 (399-753)||(25351845-25352197)
chr1 (399-753)||(12897143-12897496)
chr1 (221-468)||(21794508-21794755)
chr1 (222-759)||(35188064-35188587)
chr1 (344-550)||(39681885-39682093)
chr1 (398-759)||(7565230-7565590)
chr1 (401-760)||(31024109-31024468)
chr1 (434-753)||(27550683-27551001)
chr1 (555-759)||(37986902-37987106)
chr1 (573-760)||(12367585-12367772)
chr1 (427-751)||(52881487-52881803)
chr1 (257-503)||(2059485-2059732)
chr1 (574-760)||(36249086-36249272)
chr1 (588-759)||(29231885-29232056)
chr1 (573-760)||(37986091-37986278)
chr1 (560-761)||(48410002-48410202)
chr1 (399-753)||(52882360-52882703)
chr1 (573-760)||(15054418-15054605)
chr1 (542-753)||(48218046-48218256)
chr1 (221-512)||(48410275-48410566)
chr1 (434-753)||(49768495-49768810)
chr1 (322-472)||(37986719-37986869)
chr1 (606-759)||(36362360-36362513)
chr1 (556-772)||(13083314-13083529)
chr1 (606-758)||(33708203-33708355)
chr1 (606-758)||(46596037-46596189)
chr1 (565-737)||(51841222-51841393)
chr1 (222-481)||(5430438-5430698)
chr1 (588-761)||(51561220-51561393)
chr1 (225-353)||(47008553-47008682)
chr1 (399-753)||(27551561-27551901)
chr1 (676-759)||(29231208-29231291)
chr1 (245-367)||(28701190-28701314)
chr1 (606-759)||(30981631-30981784)
chr1 (588-762)||(13501453-13501627)
chr1 (571-753)||(51840106-51840287)
chr1 (588-753)||(25352688-25352852)
chr1 (521-763)||(42971835-42972070)
chr1 (220-449)||(42972161-42972387)
chr1 (689-761)||(46517416-46517488)
chr1 (596-753)||(51338351-51338507)
chr1 (565-753)||(51339817-51340003)
chr1 (218-292)||(28700830-28700904)
chr1 (588-753)||(52010595-52010759)
chr1 (685-760)||(41331942-41332017)
chr1 (418-602)||(52009903-52010087)
chr1 (676-770)||(26805356-26805450)
chr1 (676-761)||(21794669-21794754)
chr1 (231-292)||(25351846-25351907)
chr1 (221-298)||(46517412-46517489)
chr1 (231-292)||(52882641-52882702)
chr1 (676-760)||(533942-534025)
chr1 (678-762)||(30742660-30742744)
chr1 (218-302)||(31400096-31400180)
chr1 (232-292)||(52881487-52881547)
chr1 (677-763)||(5430436-5430522)
chr1 (224-307)||(26020730-26020812)
chr1 (689-760)||(30982698-30982769)
chr1 (222-292)||(19791120-19791190)
chr1 (679-761)||(28701255-28701337)
chr1 (676-762)||(35531123-35531209)
chr1 (226-292)||(47008974-47009040)
chr1 (231-292)||(25352790-25352851)
chr1 (231-292)||(27550684-27550745)
chr1 (223-307)||(31024384-31024468)
chr1 (223-288)||(43504657-43504722)
chr1 (231-292)||(48218194-48218255)
chr1 (221-290)||(48410001-48410070)
chr1 (231-292)||(49767576-49767637)
chr1 (231-292)||(51841347-51841408)
chr1 (231-292)||(52010697-52010758)
chr1 (244-457)||(20357120-20357333)
chr1 (244-457)||(20562622-20562835)
chr1 (235-307)||(21794304-21794376)
chr1 (224-292)||(26805836-26805904)
chr1 (222-298)||(30742667-30742743)
chr1 (220-307)||(51561677-51561764)
chr1 (222-300)||(13083325-13083403)
chr1 (679-757)||(48410483-48410561)
chr1 (223-292)||(2058959-2059028)
chr1 (231-292)||(11396922-11396983)
chr1 (231-292)||(12897434-12897495)
chr1 (222-307)||(13501541-13501626)
chr1 (226-291)||(21090938-21091003)
chr1 (691-760)||(26020275-26020344)
chr1 (231-292)||(27551839-27551900)
chr1 (676-761)||(33707243-33707328)
chr1 (692-761)||(42972316-42972385)
chr1 (231-292)||(51338352-51338413)
chr1 (521-653)||(6216553-6216686)
chr1 (223-307)||(13501087-13501171)
chr1 (224-292)||(29231208-29231276)
chr1 (321-381)||(29231368-29231428)
chr1 (221-300)||(35530667-35530746)
chr1 (679-758)||(47008553-47008632)
chr1 (327-385)||(10896222-10896280)
chr1 (231-285)||(12251714-12251768)
chr1 (223-292)||(12367585-12367654)
chr1 (223-292)||(12368574-12368643)
chr1 (223-292)||(36249203-36249272)
chr1 (223-292)||(36368234-36368303)
chr1 (221-307)||(51561219-51561305)
chr1 (231-292)||(51840107-51840168)
chr1 (231-292)||(12896835-12896896)
chr1 (557-622)||(26207482-26207547)
chr1 (223-292)||(41331948-41332017)
chr1 (433-653)||(47632647-47632867)
chr1 (231-292)||(51339941-51340002)
chr1 (433-509)||(31861617-31861693)
chr1 (225-292)||(33708203-33708270)
chr1 (350-385)||(2207178-2207213)
chr1 (732-767)||(3369003-3369038)
chr1 (433-512)||(4647208-4647287)
chr1 (433-480)||(8760021-8760068)
chr1 (433-512)||(17964138-17964217)
chr1 (350-385)||(28254389-28254424)
chr1 (673-764)||(35188499-35188590)
chr1 (231-278)||(49768762-49768809)
chr1 (437-503)||(4486969-4487035)
chr1 (676-757)||(10041119-10041201)
chr1 (433-503)||(10383083-10383153)
chr1 (433-503)||(14421305-14421375)
chr1 (222-288)||(21091667-21091733)
chr1 (729-763)||(33752865-33752899)
chr1 (433-503)||(34076052-34076122)
chr1 (223-292)||(36248216-36248284)
chr1 (223-292)||(37986091-37986160)
chr1 (351-385)||(41102833-41102867)
chr1 (327-385)||(46184916-46184974)
chr1 (433-503)||(48624258-48624328)
chr1 (433-503)||(48723560-48723630)
chr1 (223-291)||(15054537-15054605)
chr1 (223-291)||(33709290-33709358)
[»] chr2 (163 HSPs)
chr2 (222-758)||(33831998-33832534)
chr2 (224-761)||(31435919-31436456)
chr2 (218-762)||(41120622-41121164)
chr2 (224-714)||(7439149-7439639)
chr2 (223-736)||(10357223-10357736)
chr2 (222-767)||(31771191-31771738)
chr2 (225-757)||(44286563-44287092)
chr2 (221-755)||(30784076-30784595)
chr2 (221-655)||(42274172-42274609)
chr2 (224-762)||(25100465-25101001)
chr2 (317-759)||(3043331-3043773)
chr2 (462-704)||(35498525-35498768)
chr2 (222-760)||(40364760-40365295)
chr2 (344-760)||(43932731-43933147)
chr2 (223-659)||(8737703-8738124)
chr2 (396-709)||(25665973-25666284)
chr2 (318-760)||(42487639-42488081)
chr2 (398-760)||(36512026-36512387)
chr2 (346-760)||(44492765-44493180)
chr2 (222-702)||(37592761-37593229)
chr2 (404-758)||(6457152-6457505)
chr2 (398-761)||(34073623-34073979)
chr2 (221-758)||(14200837-14201378)
chr2 (317-760)||(20721199-20721630)
chr2 (231-512)||(13371878-13372160)
chr2 (319-760)||(21439804-21440232)
chr2 (224-631)||(44879594-44879995)
chr2 (397-760)||(33000912-33001274)
chr2 (318-758)||(20719833-20720265)
chr2 (224-421)||(35498773-35498970)
chr2 (226-758)||(8392212-8392738)
chr2 (528-760)||(20719212-20719444)
chr2 (418-584)||(29809401-29809567)
chr2 (434-753)||(9111458-9111777)
chr2 (427-753)||(32318105-32318432)
chr2 (401-753)||(32318997-32319350)
chr2 (554-771)||(4327815-4328028)
chr2 (317-483)||(18672350-18672516)
chr2 (568-760)||(20701138-20701330)
chr2 (399-753)||(3117864-3118216)
chr2 (560-753)||(7654925-7655118)
chr2 (350-757)||(13027445-13027855)
chr2 (577-760)||(23787773-23787956)
chr2 (346-512)||(33031181-33031346)
chr2 (562-709)||(33031019-33031165)
chr2 (224-386)||(29809130-29809293)
chr2 (422-753)||(32319595-32319927)
chr2 (223-370)||(6458413-6458561)
chr2 (588-760)||(21439178-21439350)
chr2 (606-758)||(43932025-43932179)
chr2 (589-754)||(18672147-18672312)
chr2 (603-751)||(13372177-13372324)
chr2 (350-620)||(23496580-23496852)
chr2 (606-759)||(42486936-42487089)
chr2 (606-758)||(3105677-3105829)
chr2 (673-758)||(1373524-1373609)
chr2 (211-362)||(25666283-25666435)
chr2 (221-300)||(33031358-33031437)
chr2 (347-621)||(19058643-19058917)
chr2 (606-759)||(20720809-20720960)
chr2 (222-300)||(41120623-41120701)
chr2 (676-760)||(3104875-3104959)
chr2 (231-481)||(36881181-36881427)
chr2 (530-753)||(9111859-9112081)
chr2 (679-766)||(33831993-33832080)
chr2 (571-753)||(3118731-3118912)
chr2 (606-755)||(18673071-18673219)
chr2 (569-702)||(24951153-24951285)
chr2 (213-306)||(31771188-31771281)
chr2 (223-292)||(40365226-40365295)
chr2 (606-759)||(44493759-44493912)
chr2 (224-307)||(4327933-4328016)
chr2 (678-760)||(33030903-33030985)
chr2 (235-292)||(3118850-3118907)
chr2 (222-307)||(25100466-25100551)
chr2 (224-308)||(30749427-30749511)
chr2 (231-292)||(30982511-30982572)
chr2 (223-300)||(33030903-33030980)
chr2 (676-761)||(41121075-41121160)
chr2 (226-307)||(44287011-44287092)
chr2 (213-292)||(31435910-31435989)
chr2 (212-470)||(10287303-10287553)
chr2 (587-761)||(14200838-14201011)
chr2 (676-758)||(23787505-23787586)
chr2 (679-753)||(30982510-30982584)
chr2 (679-753)||(30982723-30982796)
chr2 (231-292)||(3117865-3117926)
chr2 (225-306)||(6457152-6457233)
chr2 (676-768)||(10357652-10357745)
chr2 (226-307)||(13027774-13027855)
chr2 (676-761)||(19176643-19176728)
chr2 (231-292)||(32318106-32318167)
chr2 (235-298)||(8738619-8738682)
chr2 (221-300)||(19176642-19176721)
chr2 (212-307)||(34073894-34073989)
chr2 (217-292)||(35498446-35498521)
chr2 (691-762)||(37592760-37592831)
chr2 (679-761)||(25666342-25666424)
chr2 (225-290)||(8392673-8392738)
chr2 (231-292)||(9111459-9111520)
chr2 (679-760)||(13371870-13371951)
chr2 (231-292)||(30982735-30982795)
chr2 (711-764)||(35498448-35498501)
chr2 (225-306)||(36511902-36511983)
chr2 (681-762)||(40364759-40364840)
chr2 (676-761)||(42274173-42274257)
chr2 (224-292)||(3043705-3043773)
chr2 (220-303)||(13372254-13372334)
chr2 (679-759)||(35498890-35498970)
chr2 (223-307)||(36512304-36512387)
chr2 (566-637)||(13027440-13027510)
chr2 (225-300)||(14201303-14201378)
chr2 (218-292)||(20719375-20719449)
chr2 (225-308)||(44610645-44610728)
chr2 (404-498)||(18917347-18917436)
chr2 (223-292)||(42488012-42488081)
chr2 (443-481)||(44612880-44612918)
chr2 (438-479)||(6244514-6244555)
chr2 (220-297)||(7654851-7654928)
chr2 (679-760)||(8737703-8737783)
chr2 (231-292)||(9112019-9112080)
chr2 (223-292)||(21440163-21440232)
chr2 (231-292)||(32319288-32319349)
chr2 (676-761)||(33031351-33031436)
chr2 (438-503)||(35516308-35516373)
chr2 (225-292)||(1373542-1373609)
chr2 (231-291)||(7655058-7655117)
chr2 (728-764)||(8794799-8794835)
chr2 (225-292)||(20719833-20719900)
chr2 (691-759)||(30749427-30749495)
chr2 (224-292)||(42486936-42487004)
chr2 (433-512)||(3854935-3855014)
chr2 (324-379)||(13890675-13890730)
chr2 (324-379)||(14030800-14030855)
chr2 (350-385)||(17615428-17615463)
chr2 (261-304)||(18672179-18672222)
chr2 (433-512)||(20973273-20973352)
chr2 (438-481)||(22982379-22982422)
chr2 (732-771)||(34131308-34131347)
chr2 (679-758)||(44610645-44610724)
chr2 (327-385)||(2430771-2430829)
chr2 (223-292)||(3104875-3104944)
chr2 (689-759)||(8738623-8738693)
chr2 (433-479)||(9737488-9737534)
chr2 (433-503)||(12620372-12620442)
chr2 (433-503)||(13803324-13803394)
chr2 (433-503)||(14542151-14542221)
chr2 (433-503)||(16709177-16709247)
chr2 (327-385)||(20505455-20505513)
chr2 (732-766)||(20579904-20579938)
chr2 (223-292)||(20721561-20721630)
chr2 (223-292)||(21439178-21439247)
chr2 (444-478)||(31653755-31653789)
chr2 (433-503)||(37850357-37850427)
chr2 (223-292)||(43933078-43933147)
chr2 (427-481)||(44300566-44300620)
chr2 (223-292)||(44492765-44492834)
chr2 (728-769)||(1026361-1026402)
chr2 (218-251)||(2431508-2431541)
chr2 (442-499)||(4656788-4656844)
chr2 (259-292)||(10357234-10357267)
chr2 (223-292)||(33001205-33001274)
chr2 (433-502)||(45301262-45301331)
[»] chr7 (161 HSPs)
chr7 (317-761)||(6588568-6589012)
chr7 (221-762)||(7238449-7238992)
chr7 (214-774)||(43597350-43597910)
chr7 (222-762)||(47791717-47792267)
chr7 (222-764)||(22378332-22378875)
chr7 (226-763)||(14990426-14990962)
chr7 (226-763)||(15420037-15420573)
chr7 (242-761)||(18058887-18059403)
chr7 (224-761)||(38158830-38159371)
chr7 (260-701)||(4926313-4926758)
chr7 (224-760)||(1961779-1962317)
chr7 (281-757)||(46044225-46044702)
chr7 (339-760)||(35482051-35482469)
chr7 (219-758)||(4899736-4900274)
chr7 (398-760)||(46330681-46331043)
chr7 (236-766)||(43574115-43574645)
chr7 (222-763)||(10620394-10620924)
chr7 (222-766)||(11396833-11397370)
chr7 (222-602)||(27727099-27727485)
chr7 (224-559)||(6330978-6331315)
chr7 (449-771)||(21109448-21109772)
chr7 (224-761)||(38598848-38599389)
chr7 (317-760)||(38198944-38199373)
chr7 (317-703)||(44167764-44168135)
chr7 (236-758)||(1544364-1544886)
chr7 (224-762)||(44080838-44081366)
chr7 (318-759)||(29155933-29156378)
chr7 (317-760)||(43083825-43084251)
chr7 (319-760)||(3495540-3495966)
chr7 (516-758)||(4883782-4884025)
chr7 (346-655)||(15652795-15653100)
chr7 (399-753)||(8832597-8832952)
chr7 (525-760)||(45958836-45959071)
chr7 (399-753)||(12621625-12621979)
chr7 (398-572)||(36019813-36019988)
chr7 (418-759)||(1260023-1260363)
chr7 (560-758)||(33624672-33624869)
chr7 (588-761)||(27727999-27728172)
chr7 (399-753)||(37107568-37107922)
chr7 (399-753)||(8081698-8082048)
chr7 (223-577)||(37539849-37540206)
chr7 (418-753)||(1065580-1065915)
chr7 (317-478)||(33624951-33625110)
chr7 (588-760)||(3496424-3496596)
chr7 (588-760)||(38199809-38199981)
chr7 (434-659)||(1066490-1066715)
chr7 (607-759)||(44167024-44167176)
chr7 (606-758)||(15131588-15131740)
chr7 (216-769)||(28924371-28924920)
chr7 (344-659)||(47139733-47140051)
chr7 (222-640)||(9633042-9633461)
chr7 (557-759)||(36020005-36020198)
chr7 (557-753)||(38593164-38593358)
chr7 (606-758)||(46331626-46331778)
chr7 (599-757)||(43083212-43083370)
chr7 (606-759)||(45957988-45958141)
chr7 (606-758)||(33625666-33625817)
chr7 (573-759)||(37537369-37537553)
chr7 (588-753)||(38595236-38595400)
chr7 (606-758)||(46043546-46043699)
chr7 (401-633)||(42974161-42974394)
chr7 (317-478)||(15130874-15131027)
chr7 (588-753)||(40304433-40304597)
chr7 (434-719)||(37108485-37108770)
chr7 (222-300)||(6589292-6589370)
chr7 (612-757)||(12908565-12908709)
chr7 (516-635)||(16080937-16081055)
chr7 (676-762)||(47792182-47792268)
chr7 (222-307)||(27728087-27728172)
chr7 (588-753)||(40303988-40304151)
chr7 (222-306)||(14990876-14990960)
chr7 (222-306)||(15420487-15420571)
chr7 (223-307)||(35482385-35482469)
chr7 (221-304)||(38598847-38598930)
chr7 (226-307)||(12932885-12932967)
chr7 (213-307)||(22378788-22378881)
chr7 (222-307)||(7238906-7238991)
chr7 (231-292)||(8832598-8832659)
chr7 (588-753)||(8833446-8833609)
chr7 (226-307)||(12908565-12908646)
chr7 (588-753)||(18798829-18798993)
chr7 (399-512)||(38594643-38594756)
chr7 (231-292)||(38595338-38595399)
chr7 (231-292)||(40304535-40304596)
chr7 (231-292)||(42974627-42974688)
chr7 (423-703)||(17018437-17018717)
chr7 (221-305)||(18058886-18058970)
chr7 (224-307)||(1260023-1260106)
chr7 (221-292)||(6588567-6588638)
chr7 (222-512)||(10463170-10463458)
chr7 (591-706)||(15130647-15130762)
chr7 (222-300)||(35481965-35482043)
chr7 (521-659)||(41571449-41571585)
chr7 (317-436)||(45958696-45958815)
chr7 (618-758)||(6330838-6330978)
chr7 (231-292)||(8081699-8081760)
chr7 (219-292)||(11397295-11397368)
chr7 (684-757)||(12932894-12932967)
chr7 (231-292)||(18798830-18798891)
chr7 (222-307)||(21109677-21109762)
chr7 (231-292)||(37107569-37107630)
chr7 (679-759)||(6331235-6331315)
chr7 (691-763)||(10463168-10463240)
chr7 (681-753)||(42974617-42974689)
chr7 (691-762)||(27727098-27727169)
chr7 (226-301)||(43083212-43083287)
chr7 (225-307)||(4883943-4884025)
chr7 (679-765)||(10620390-10620476)
chr7 (213-307)||(10620837-10620931)
chr7 (224-278)||(15492886-15492940)
chr7 (222-300)||(15652675-15652752)
chr7 (679-753)||(25270502-25270576)
chr7 (220-290)||(38158828-38158898)
chr7 (222-300)||(44080839-44080917)
chr7 (242-300)||(47791736-47791794)
chr7 (242-307)||(4900192-4900257)
chr7 (231-292)||(12621917-12621978)
chr7 (684-757)||(15654422-15654495)
chr7 (231-292)||(38593165-38593225)
chr7 (222-307)||(43574120-43574205)
chr7 (678-762)||(6589287-6589371)
chr7 (673-761)||(43597358-43597446)
chr7 (225-292)||(1544819-1544886)
chr7 (221-292)||(15654429-15654500)
chr7 (676-767)||(22378326-22378417)
chr7 (344-382)||(16080776-16080814)
chr7 (679-761)||(28924832-28924914)
chr7 (223-292)||(46330681-46330750)
chr7 (588-653)||(8082540-8082604)
chr7 (231-292)||(40303989-40304050)
chr7 (222-307)||(43597812-43597897)
chr7 (225-292)||(33624672-33624739)
chr7 (224-292)||(37537369-37537437)
chr7 (261-292)||(1961817-1961848)
chr7 (432-479)||(2510732-2510778)
chr7 (225-300)||(6330838-6330913)
chr7 (433-512)||(33772380-33772458)
chr7 (350-385)||(36039520-36039555)
chr7 (692-759)||(38159304-38159371)
chr7 (731-766)||(44064676-44064711)
chr7 (209-292)||(45959002-45959085)
chr7 (226-292)||(46044636-46044702)
chr7 (223-292)||(3496527-3496596)
chr7 (679-761)||(7238450-7238532)
chr7 (231-289)||(8833551-8833608)
chr7 (433-503)||(9900532-9900602)
chr7 (433-503)||(11620082-11620152)
chr7 (225-290)||(15131675-15131740)
chr7 (705-759)||(15492886-15492940)
chr7 (680-762)||(15652674-15652755)
chr7 (433-503)||(17920637-17920707)
chr7 (433-503)||(23023517-23023587)
chr7 (732-762)||(26760835-26760865)
chr7 (225-290)||(33625752-33625817)
chr7 (223-292)||(38198944-38199013)
chr7 (223-292)||(38199912-38199981)
chr7 (433-503)||(39035838-39035908)
chr7 (350-388)||(47139986-47140024)
chr7 (732-773)||(18682982-18683023)
chr7 (271-300)||(36019716-36019745)
chr7 (224-292)||(44167024-44167092)
[»] chr6 (122 HSPs)
chr6 (245-757)||(30660664-30661176)
chr6 (215-714)||(5974175-5974676)
chr6 (215-708)||(8709770-8710267)
chr6 (224-761)||(15720938-15721479)
chr6 (222-761)||(26356409-26356952)
chr6 (222-721)||(10915223-10915727)
chr6 (222-759)||(1820868-1821398)
chr6 (222-659)||(17697263-17697698)
chr6 (221-762)||(20510372-20510888)
chr6 (264-763)||(22731913-22732413)
chr6 (221-762)||(843983-844532)
chr6 (226-763)||(30492601-30493126)
chr6 (226-761)||(861235-861774)
chr6 (226-738)||(29691790-29692302)
chr6 (258-763)||(33518277-33518773)
chr6 (224-659)||(5087068-5087502)
chr6 (223-763)||(938723-939256)
chr6 (418-762)||(2087319-2087661)
chr6 (317-760)||(5079476-5079920)
chr6 (317-763)||(14256121-14256561)
chr6 (224-761)||(33744537-33745077)
chr6 (344-760)||(18502989-18503392)
chr6 (317-595)||(12481801-12482080)
chr6 (409-702)||(28476253-28476549)
chr6 (401-761)||(11400122-11400483)
chr6 (399-753)||(3914474-3914826)
chr6 (399-735)||(21108119-21108455)
chr6 (432-753)||(288888-289207)
chr6 (221-537)||(20977467-20977786)
chr6 (231-760)||(3375170-3375701)
chr6 (428-753)||(289438-289765)
chr6 (317-503)||(17245719-17245905)
chr6 (516-760)||(20898149-20898393)
chr6 (558-760)||(17244422-17244624)
chr6 (244-482)||(20897707-20897948)
chr6 (588-757)||(17246322-17246491)
chr6 (217-387)||(16736521-16736692)
chr6 (322-537)||(20977101-20977317)
chr6 (319-478)||(34046550-34046710)
chr6 (607-758)||(3335427-3335578)
chr6 (579-760)||(5078880-5079061)
chr6 (317-472)||(30353096-30353252)
chr6 (571-753)||(3913148-3913329)
chr6 (606-759)||(22972047-22972200)
chr6 (606-759)||(23816198-23816351)
chr6 (220-475)||(24958757-24959012)
chr6 (624-760)||(22971778-22971914)
chr6 (624-760)||(23816484-23816620)
chr6 (676-759)||(8231087-8231170)
chr6 (231-308)||(28476102-28476179)
chr6 (222-300)||(22732334-22732411)
chr6 (215-307)||(11400398-11400490)
chr6 (222-305)||(30492603-30492686)
chr6 (691-770)||(33744526-33744605)
chr6 (221-307)||(861689-861775)
chr6 (222-292)||(14256489-14256559)
chr6 (222-292)||(20510373-20510443)
chr6 (222-307)||(2087320-2087405)
chr6 (231-292)||(3913149-3913210)
chr6 (673-762)||(17697262-17697351)
chr6 (684-757)||(18804125-18804198)
chr6 (678-762)||(1821315-1821399)
chr6 (680-767)||(12482121-12482208)
chr6 (398-501)||(30916752-30916855)
chr6 (246-363)||(2937258-2937376)
chr6 (679-753)||(5086753-5086827)
chr6 (681-763)||(30661119-30661201)
chr6 (231-292)||(5086765-5086826)
chr6 (226-299)||(18804125-18804198)
chr6 (684-760)||(939180-939256)
chr6 (691-762)||(861230-861301)
chr6 (256-307)||(2087680-2087731)
chr6 (231-290)||(3914766-3914825)
chr6 (679-762)||(10915645-10915728)
chr6 (220-307)||(15721394-15721481)
chr6 (213-304)||(33744995-33745086)
chr6 (222-308)||(938725-938811)
chr6 (679-761)||(5974182-5974264)
chr6 (679-761)||(8710178-8710260)
chr6 (222-300)||(12482124-12482202)
chr6 (221-290)||(26356408-26356477)
chr6 (702-766)||(5974694-5974758)
chr6 (702-766)||(8709683-8709747)
chr6 (691-759)||(15720938-15721006)
chr6 (222-302)||(16465259-16465339)
chr6 (521-585)||(17467658-17467722)
chr6 (225-304)||(3335499-3335578)
chr6 (695-758)||(16465413-16465476)
chr6 (682-757)||(29691790-29691865)
chr6 (691-762)||(30493060-30493131)
chr6 (225-292)||(33518701-33518768)
chr6 (223-292)||(5079851-5079920)
chr6 (223-281)||(5974694-5974752)
chr6 (223-281)||(8709689-8709747)
chr6 (223-292)||(18503323-18503392)
chr6 (691-761)||(20510817-20510887)
chr6 (221-291)||(30660659-30660729)
chr6 (225-283)||(30917201-30917259)
chr6 (231-292)||(288889-288949)
chr6 (222-307)||(843984-844069)
chr6 (676-761)||(24958759-24958843)
chr6 (244-292)||(1820887-1820935)
chr6 (691-759)||(5087068-5087136)
chr6 (678-738)||(20897708-20897768)
chr6 (223-291)||(20898325-20898393)
chr6 (691-762)||(16465258-16465329)
chr6 (681-720)||(16465382-16465421)
chr6 (679-761)||(16736526-16736608)
chr6 (732-762)||(3566685-3566715)
chr6 (221-279)||(4408901-4408959)
chr6 (433-503)||(12783434-12783504)
chr6 (433-503)||(13400310-13400380)
chr6 (427-481)||(22007146-22007200)
chr6 (223-292)||(22971778-22971847)
chr6 (223-292)||(23816551-23816620)
chr6 (691-753)||(28083288-28083350)
chr6 (732-766)||(32400917-32400951)
chr6 (221-298)||(2958607-2958684)
chr6 (242-291)||(3375191-3375240)
chr6 (224-292)||(8231087-8231155)
chr6 (248-289)||(21108414-21108455)
chr6 (601-657)||(25839635-25839692)
[»] chr4 (184 HSPs)
chr4 (221-759)||(33177294-33177832)
chr4 (222-757)||(47309319-47309855)
chr4 (221-763)||(22067977-22068520)
chr4 (224-759)||(51395489-51396025)
chr4 (222-765)||(53323651-53324196)
chr4 (226-766)||(28448268-28448806)
chr4 (262-757)||(30331192-30331690)
chr4 (350-760)||(19522593-19523004)
chr4 (224-762)||(7490576-7491110)
chr4 (317-760)||(31316423-31316865)
chr4 (222-761)||(4849974-4850516)
chr4 (317-758)||(10321579-10322020)
chr4 (417-759)||(38114282-38114624)
chr4 (318-759)||(33689264-33689705)
chr4 (321-762)||(53423537-53423975)
chr4 (224-770)||(10085358-10085902)
chr4 (317-760)||(25421949-25422391)
chr4 (223-762)||(47379053-47379591)
chr4 (245-636)||(55938074-55938467)
chr4 (329-761)||(3873134-3873585)
chr4 (319-760)||(53571514-53571942)
chr4 (221-608)||(1870140-1870527)
chr4 (398-655)||(51875994-51876254)
chr4 (404-659)||(20177933-20178187)
chr4 (354-659)||(43937984-43938291)
chr4 (317-760)||(11670001-11670431)
chr4 (322-757)||(44209470-44209892)
chr4 (432-658)||(13718060-13718287)
chr4 (222-761)||(48082324-48082866)
chr4 (317-762)||(23473448-23473895)
chr4 (398-760)||(35060877-35061237)
chr4 (399-761)||(44289558-44289921)
chr4 (231-569)||(47463437-47463776)
chr4 (223-466)||(7617293-7617537)
chr4 (399-753)||(34513070-34513423)
chr4 (242-762)||(38499168-38499689)
chr4 (222-760)||(52947636-52948174)
chr4 (344-597)||(42972731-42972983)
chr4 (399-753)||(28163777-28164128)
chr4 (566-761)||(7617535-7617730)
chr4 (399-753)||(44451975-44452328)
chr4 (403-751)||(48219943-48220290)
chr4 (436-659)||(37329471-37329695)
chr4 (225-464)||(3862366-3862606)
chr4 (225-464)||(3871123-3871363)
chr4 (573-760)||(11670860-11671047)
chr4 (398-706)||(35821061-35821356)
chr4 (574-760)||(53569036-53569224)
chr4 (588-757)||(31470847-31471016)
chr4 (606-758)||(25422943-25423095)
chr4 (573-760)||(53570890-53571078)
chr4 (588-763)||(19522961-19523136)
chr4 (236-386)||(38114125-38114276)
chr4 (222-640)||(13603785-13604204)
chr4 (246-386)||(13717892-13718033)
chr4 (606-758)||(25243861-25244013)
chr4 (619-761)||(47463297-47463438)
chr4 (235-503)||(20650391-20650660)
chr4 (606-759)||(44208758-44208911)
chr4 (606-759)||(31317815-31317968)
chr4 (588-753)||(48738397-48738561)
chr4 (221-308)||(3872918-3873005)
chr4 (226-762)||(55282986-55283525)
chr4 (223-388)||(20177721-20177887)
chr4 (223-306)||(52948091-52948174)
chr4 (609-759)||(10322579-10322729)
chr4 (418-639)||(35351735-35351958)
chr4 (434-597)||(44452893-44453056)
chr4 (224-386)||(45557895-45558058)
chr4 (221-307)||(4849973-4850059)
chr4 (679-753)||(13508756-13508830)
chr4 (630-759)||(33688558-33688688)
chr4 (219-307)||(7617645-7617733)
chr4 (224-300)||(14579065-14579141)
chr4 (212-304)||(44289548-44289640)
chr4 (680-771)||(20650727-20650818)
chr4 (222-308)||(44290001-44290088)
chr4 (679-761)||(3872919-3873001)
chr4 (525-707)||(6817979-6818158)
chr4 (588-734)||(28163139-28163284)
chr4 (678-760)||(37329726-37329808)
chr4 (221-307)||(47463296-47463382)
chr4 (521-635)||(47939752-47939865)
chr4 (567-657)||(50824407-50824497)
chr4 (676-766)||(55938405-55938495)
chr4 (231-292)||(13508757-13508818)
chr4 (222-305)||(7499080-7499163)
chr4 (676-759)||(14579058-14579141)
chr4 (224-307)||(38114541-38114624)
chr4 (224-291)||(51395958-51396025)
chr4 (222-292)||(7490577-7490647)
chr4 (588-714)||(34512466-34512591)
chr4 (242-307)||(10085387-10085452)
chr4 (222-307)||(19523049-19523134)
chr4 (679-760)||(47379053-47379134)
chr4 (231-292)||(48738398-48738459)
chr4 (222-290)||(43938286-43938354)
chr4 (683-763)||(48082788-48082868)
chr4 (221-308)||(6589100-6589187)
chr4 (222-300)||(20650730-20650808)
chr4 (684-759)||(27392496-27392571)
chr4 (691-769)||(44290017-44290096)
chr4 (223-292)||(11670001-11670070)
chr4 (679-761)||(22068437-22068519)
chr4 (679-757)||(28448268-28448346)
chr4 (222-308)||(42916229-42916315)
chr4 (222-300)||(47379512-47379590)
chr4 (222-307)||(22067979-22068064)
chr4 (231-292)||(28164067-28164127)
chr4 (224-289)||(28448734-28448799)
chr4 (224-304)||(33689625-33689705)
chr4 (222-307)||(38499169-38499254)
chr4 (693-770)||(43938286-43938363)
chr4 (223-300)||(48219764-48219840)
chr4 (679-759)||(10085822-10085902)
chr4 (691-759)||(45557990-45558058)
chr4 (679-758)||(3862366-3862444)
chr4 (679-758)||(3871123-3871201)
chr4 (221-288)||(3873519-3873586)
chr4 (681-756)||(23473360-23473435)
chr4 (679-762)||(47309773-47309856)
chr4 (221-304)||(48082323-48082406)
chr4 (691-762)||(52947635-52947706)
chr4 (433-503)||(25768018-25768088)
chr4 (679-761)||(33177295-33177377)
chr4 (679-757)||(38499627-38499705)
chr4 (433-503)||(39269794-39269864)
chr4 (433-503)||(42642996-42643066)
chr4 (226-292)||(42973027-42973093)
chr4 (223-292)||(53570890-53570959)
chr4 (223-292)||(53571873-53571942)
chr4 (223-292)||(11670978-11671047)
chr4 (433-653)||(19320816-19321036)
chr4 (433-653)||(28756200-28756420)
chr4 (433-653)||(29445521-29445741)
chr4 (226-300)||(30331614-30331690)
chr4 (606-655)||(35055111-35055160)
chr4 (246-307)||(35821030-35821091)
chr4 (231-292)||(44451976-44452037)
chr4 (223-292)||(53569036-53569105)
chr4 (426-478)||(4821856-4821908)
chr4 (679-771)||(7617282-7617374)
chr4 (433-509)||(8949651-8949727)
chr4 (673-757)||(42973009-42973093)
chr4 (676-760)||(48219764-48219847)
chr4 (679-759)||(51395489-51395569)
chr4 (433-512)||(10386696-10386775)
chr4 (225-299)||(25243939-25244013)
chr4 (223-289)||(25421949-25422015)
chr4 (224-299)||(27392496-27392571)
chr4 (350-385)||(39656730-39656765)
chr4 (225-288)||(51875879-51875942)
chr4 (433-503)||(343953-344023)
chr4 (433-503)||(6203205-6203275)
chr4 (691-761)||(6589116-6589186)
chr4 (433-503)||(11152343-11152413)
chr4 (694-760)||(15562811-15562877)
chr4 (433-503)||(22515697-22515767)
chr4 (222-292)||(23473824-23473894)
chr4 (433-503)||(23708873-23708943)
chr4 (433-503)||(24281869-24281939)
chr4 (350-388)||(28163969-28164007)
chr4 (433-503)||(31312181-31312251)
chr4 (226-292)||(31470847-31470913)
chr4 (231-289)||(34513364-34513422)
chr4 (433-503)||(35015463-35015533)
chr4 (433-503)||(38698827-38698897)
chr4 (327-385)||(40943754-40943812)
chr4 (433-503)||(42931154-42931224)
chr4 (246-292)||(48220230-48220276)
chr4 (433-503)||(52788856-52788925)
chr4 (433-503)||(53237972-53238042)
chr4 (681-738)||(1870446-1870503)
chr4 (225-298)||(6818136-6818209)
chr4 (222-251)||(8837868-8837897)
chr4 (433-478)||(18428999-18429044)
chr4 (214-251)||(23454340-23454377)
chr4 (212-277)||(26487777-26487842)
chr4 (226-279)||(42972666-42972719)
chr4 (258-307)||(43937904-43937953)
chr4 (242-307)||(47309335-47309400)
chr4 (729-762)||(51459067-51459100)
chr4 (344-385)||(52788433-52788474)
chr4 (679-764)||(55283447-55283532)
[»] scaffold0445 (3 HSPs)
scaffold0445 (222-761)||(5791-6332)
scaffold0445 (679-763)||(5789-5873)
scaffold0445 (221-307)||(6248-6333)
[»] scaffold1191 (3 HSPs)
scaffold1191 (223-760)||(551-1087)
scaffold1191 (679-760)||(1007-1087)
scaffold1191 (223-292)||(551-620)
[»] scaffold0514 (3 HSPs)
scaffold0514 (242-759)||(6075-6587)
scaffold0514 (224-292)||(6519-6587)
scaffold0514 (676-762)||(6054-6140)
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (226-761)||(17255-17791)
scaffold0036 (221-308)||(17705-17792)
scaffold0036 (679-757)||(17255-17333)
[»] scaffold1190 (3 HSPs)
scaffold1190 (245-759)||(99-603)
scaffold1190 (676-762)||(75-161)
scaffold1190 (224-292)||(535-603)
[»] scaffold0707 (2 HSPs)
scaffold0707 (258-763)||(6821-7317)
scaffold0707 (225-292)||(7245-7312)
[»] scaffold1160 (4 HSPs)
scaffold1160 (317-754)||(1045-1484)
scaffold1160 (217-298)||(1532-1613)
scaffold1160 (680-761)||(1528-1608)
scaffold1160 (231-292)||(1047-1108)
[»] scaffold0651 (2 HSPs)
scaffold0651 (317-760)||(6833-7275)
scaffold0651 (606-759)||(5702-5855)
[»] scaffold0148 (3 HSPs)
scaffold0148 (327-757)||(35160-35588)
scaffold0148 (577-760)||(38609-38792)
scaffold0148 (226-292)||(35160-35226)
[»] scaffold0562 (4 HSPs)
scaffold0562 (329-761)||(3953-4404)
scaffold0562 (221-308)||(3737-3824)
scaffold0562 (679-761)||(3738-3820)
scaffold0562 (221-288)||(4338-4405)
[»] scaffold0627 (2 HSPs)
scaffold0627 (260-759)||(6816-7314)
scaffold0627 (224-291)||(6816-6883)
[»] scaffold0097 (7 HSPs)
scaffold0097 (317-760)||(25027-25458)
scaffold0097 (318-758)||(23671-24103)
scaffold0097 (528-760)||(23050-23282)
scaffold0097 (606-759)||(24647-24798)
scaffold0097 (218-292)||(23213-23287)
scaffold0097 (225-292)||(23671-23738)
scaffold0097 (223-292)||(25389-25458)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (317-757)||(239982-240409)
scaffold0003 (573-724)||(239410-239561)
scaffold0003 (684-761)||(120631-120708)
[»] scaffold0640 (3 HSPs)
scaffold0640 (220-761)||(3763-4307)
scaffold0640 (683-761)||(3765-3843)
scaffold0640 (221-304)||(4225-4308)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (220-543)||(157901-158223)
scaffold0001 (679-761)||(157903-157984)
[»] scaffold0385 (4 HSPs)
scaffold0385 (319-760)||(9932-10363)
scaffold0385 (574-760)||(9309-9491)
scaffold0385 (223-285)||(9309-9371)
scaffold0385 (223-292)||(10294-10363)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (553-774)||(6072-6293)
scaffold0199 (220-292)||(6083-6155)
[»] scaffold0571 (3 HSPs)
scaffold0571 (221-481)||(8613-8873)
scaffold0571 (496-708)||(8362-8575)
scaffold0571 (679-757)||(8791-8868)
[»] scaffold0024 (3 HSPs)
scaffold0024 (222-573)||(47725-48077)
scaffold0024 (679-762)||(47724-47807)
scaffold0024 (230-307)||(32845-32922)
[»] scaffold0093 (3 HSPs)
scaffold0093 (556-760)||(48967-49169)
scaffold0093 (226-302)||(19972-20048)
scaffold0093 (683-757)||(19974-20048)
[»] scaffold0125 (4 HSPs)
scaffold0125 (317-481)||(21720-21884)
scaffold0125 (683-761)||(21882-21960)
scaffold0125 (220-301)||(21881-21962)
scaffold0125 (218-271)||(21628-21681)
[»] scaffold0734 (4 HSPs)
scaffold0734 (461-761)||(3260-3562)
scaffold0734 (224-458)||(2727-2962)
scaffold0734 (212-304)||(3480-3572)
scaffold0734 (691-769)||(2717-2795)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (418-750)||(283308-283640)
scaffold0005 (510-733)||(282842-283064)
scaffold0005 (224-300)||(238234-238310)
scaffold0005 (676-759)||(238234-238317)
[»] scaffold0287 (2 HSPs)
scaffold0287 (624-760)||(1-137)
scaffold0287 (223-292)||(68-137)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (401-479)||(52512-52590)
scaffold0051 (522-640)||(52347-52464)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (212-300)||(123476-123563)
scaffold0014 (676-762)||(123469-123554)
scaffold0014 (404-479)||(123242-123317)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (220-301)||(5927-6007)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (683-759)||(27063-27139)
scaffold0112 (224-302)||(27063-27141)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (219-308)||(628-716)
[»] scaffold1037 (1 HSPs)
scaffold1037 (350-385)||(599-634)
[»] scaffold1031 (1 HSPs)
scaffold1031 (350-385)||(717-752)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (433-512)||(9345-9424)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (225-308)||(134207-134290)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (350-385)||(235026-235061)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (433-503)||(6899-6969)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (214-251)||(3368-3405)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (433-478)||(43015-43060)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 678; Significance: 0; HSPs: 196)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 678; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 845
Target Start/End: Original strand, 41590000 - 41590834
Alignment:
Q  8 aatatttccttctccctcaacataaattaagattaaaccttcaatttgatctctaagctattaatctctctccaatttagtctctaaaatatagaaatgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  41590000 aatatttccttctccctcaacataaattaagattaaaccttcaatttgatctctaagctattaatctctctccaatttagtctctaaaattta--aatgt 41590097  T
Q  108 aacaattcgttcttaaaatattctcaatccatcatgttgattcatgaactttgtaatatatttctatagagggacacctgatggattgacaatagttgag 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41590098 aataattcgttcttaaaatattctcaatccatcatgttgattcatgaactttgtaatatatttctacagagggacacctgatggattgacaatagtcgag 41590197  T
Q  208 cgactatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41590198 ggataatttattatagggttaattatgtttttggtccctataaaattgagaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtcccta 41590297  T
Q  308 cnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagttta 407  Q
    |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  41590298 caaaaaaaattacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaatttttttatgacaagttta 41590397  T
Q  408 taacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaattta 507  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41590398 taacactatgaaaggttcatt-actaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaattta 41590496  T
Q  508 acaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactca 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41590497 acaaattctggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaagctca 41590596  T
Q  608 agagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 707  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590597 agagtttaagcacaaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgattgaaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 41590696  T
Q  708 ggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatttctatattctcggccaaataggagagagaatcgtag 807  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590697 ggactaaacttaaaaggtcccaattttataggaactaaaaacatatttaaccctttattatatttctatattctcggccaaataggagagagaatcgtag 41590796  T
Q  808 tttagagactgaattgaatattagatccataacttaac 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590797 tttagagactgaattgaatattagatccataacttaac 41590834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 222 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 37967955 - 37967414
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||        |||||    
T  37967955 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattaggaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtccttacaaaaaatattact 37967856  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnn-atgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |        | |||||||||| ||||||||||||    
T  37967855 tctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaatcatccttaaactcttaaagttttgaacgattttttttaagacaagtttagaacactatgaaa 37967756  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatg-acaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  37967755 ggttcatttaccaaaatttagatatttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatatgga 37967656  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  37967655 cgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcggaggaagttttagtaatgttctttacacgtctgcgaaaaattgtttaaaagctcaagagtttatgca 37967556  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  37967555 taaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgaatgcataattttttattaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaagactaaactta 37967456  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37967455 aaagatctcaattttatagggacgaaaaacatatttaaccct 37967414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 225 - 707
Target Start/End: Original strand, 43622667 - 43623153
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttct 324  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||        ||||||||    
T  43622667 gttaattatatttttggtccctataaaattgataacttctaagttgagttcttacttaattttagtaggttttttagtccttacaaaaaaaattacttct 43622766  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  43622767 aattttagttcttgttacgacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggtg 43622866  T
Q  425 catttact-aaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaa-caaattgtggaag 521  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  43622867 catttacttaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaaacaaattatggacg 43622966  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622967 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgaagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 43623066  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaat-actgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 707  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43623067 aattaaacaaatttgaattgaggagagattaataaatgagtgcaaaattttattttaaggactaagagaactattaaaattaagtaa 43623153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 222 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 44265867 - 44265330
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||         ||||    
T  44265867 agggttaaatatgttttttgtccttataaaattggaaacttctaagtttagtctttacttaattttaataagttttttagtccttacaaaagaaaattac 44265768  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| ||||||||||||    
T  44265767 ttctaattttactccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttcgagacaagtttagaacactatgaaa 44265668  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||| | |||||| | ||||     
T  44265667 ggttcatttgctaaaatttagaattttttaacatgaaaagaattaaatatgagttttttaaaacgccaaaaattaaagataaaatcaacaaaatctggac 44265568  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44265567 ttagaaatcaaattttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacat 44265468  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||    
T  44265467 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgagtgcggaaatttttattaaggactaaaagaactaataaaattaagtaaagactaaatttaa 44265368  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  44265367 aaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaac 44265330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 242 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 6590665 - 6590145
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgtt 340  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  6590665 tccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaagaaaattacttctaattttagtccttgtt 6590566  T
Q  341 acgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta 440  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6590565 acaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaccatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta 6590466  T
Q  441 gaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcg 539  Q
    || |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| | || |||| | ||| ||||| |||||||| | ||    ||||||||||||||||||    
T  6590465 gattttttttaacatgaaaaaaattaaatatgatttttttaaaacgagaaaaataaaatataaaattaacaaaatctgagcctagaaatcaaattttgcg 6590366  T
Q  540 acaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaat 639  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6590365 acaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 6590266  T
Q  640 tgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttataga 739  Q
    |||||| ||||||||| ||| || | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||     
T  6590265 tgagga-ggactaatagtgagtgcataaatttttattagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagg 6590167  T
Q  740 gactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  6590166 gaccaaaaacatatttaaccct 6590145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 223 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 8784996 - 8784456
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||    
T  8784996 gggttaaatatgtttttggtccctctaaaattaggaatttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaagttact 8784897  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||          | ||||||| |||||||| ||||    
T  8784896 tctaattttagttcttgttacaacaaagtttgtttaattatccgtaaactctcaaattttcgaacaatttttttgacataagtttagaacactataaaag 8784797  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||| |||| ||| | || | |    
T  8784796 gttcatttactaaaatttaaaattttttaacataaaaagaattaaatatgaattttttaaaacggctgaagttaaagataaaattaataaaatctgaacg 8784697  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8784696 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcagcaaaaacttgtttaaaaactcaagagtttaagcata 8784597  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8784596 aattaaacaaatttgaattgaggagggactagtactgagtaccgaaattctttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaa 8784497  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  8784496 atatctgaattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 8784456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 222 - 760
Target Start/End: Original strand, 25101834 - 25102371
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| ||| |||||| | | ||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         ||||    
T  25101834 agggttaaatatatttttggttcttataaaatagagacctttcaagtttaatccttacttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaagaattac 25101933  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||         |||||||||| ||||||||||||    
T  25101934 ttctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaa 25102033  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||     
T  25102034 ggttcacttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttcaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggac 25102133  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25102134 gtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcgagagtttaaacat 25102233  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |    
T  25102234 aaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagt-gcagatttttttttaaggactaaaagaaccattaaaattaagtaaagactaaacttga 25102332  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || | ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25102333 aa-gaccccattttatagggatcaaaaacatatttaaccc 25102371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 223 - 756
Target Start/End: Original strand, 38706316 - 38706850
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |   |||         |||||    
T  38706316 gggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggatcttttaagtttaatcattacttatttttaataggttttttagtttttacaaaaaaaaattact 38706415  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |         |||||||||| |||| ||||||||    
T  38706416 tctaattttagaccctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaacacttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaag 38706515  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  38706516 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacg 38706615  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38706616 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgcacaagcacttttagtaacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacata 38706715  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||    
T  38706716 aattaaacaaatttgaattgatgagggactaatactgagtgcaaaaattttttttagggactaaaataactattaaaattaaataaagactaaacttgaa 38706815  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    |  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38706816 agatccctattttatagggaccaaaaacatattta 38706850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 223 - 761
Target Start/End: Original strand, 5250263 - 5250803
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||    
T  5250263 gggttaaatatgtttttggtccttataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctataaaaaaaaattact 5250362  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         ||||| || | ||| ||  |||||    
T  5250363 tctaattttagtccctcttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaattcagaacgctgcgaaag 5250462  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaa-gttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||| | |  |     
T  5250463 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctaaac 5250562  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5250563 gtagaaatcaaattttgcgacaatttttggcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacat 5250662  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  5250663 aaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgaatgcagaatttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaaataaggactaaacttga 5250762  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    || |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5250763 aaggtctttattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 5250803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 268 - 760
Target Start/End: Original strand, 36470743 - 36471236
Alignment:
Q  268 tttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatcctt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36470743 tttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaattacttctaattttaggccctgttacaacaaagtttgtttaattatcctt 36470842  T
Q  367 aaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaa 466  Q
    ||||| || ||||||||||| |       | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36470843 aaactcttcaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattag 36470942  T
Q  467 atatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagt 566  Q
    ||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||    
T  36470943 atatgaattttttaaaacagcgaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttacataggaacttttggt 36471042  T
Q  567 aatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaa 666  Q
    || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| || | |    
T  36471043 aacgttcttaatacatctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgatgaaggactaatactgaatgcaga 36471142  T
Q  667 aatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  || | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36471143 aattttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagatctctattttatagggaccaaaatcatatttaaccc 36471236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 216 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 33322958 - 33322409
Alignment:
Q  216 tattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnn 315  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||           
T  33322958 tattaaagggtaaaatatgtttttggtctctataaaattggaaacttctaagtttagtccttatttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaa 33322859  T
Q  316 n-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacact 414  Q
      |||||| |||||||||| | |||||    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |       |  ||||||||| ||||||    
T  33322858 aattacttttaattttagttcctgttatagtaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaaattttgaacgattttttcaatacaagtttagaacact 33322759  T
Q  415 atgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaatt 514  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  33322758 atgaaaggttcatttaccaaaatttagatttttttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaat 33322659  T
Q  515 gtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttt 614  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  33322658 ctagacgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgtttgaaaactcatgagttt 33322559  T
Q  615 aagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||   |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33322558 aagtataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaaaaaaaaattaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaa 33322459  T
Q  715 gcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttta 764  Q
     ||||||| ||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  33322458 acttaaaaggtctcaattttatagaaatcaaaaagatatttaacccttta 33322409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 223 - 762
Target Start/End: Original strand, 5695793 - 5696325
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||          |||||    
T  5695793 gggttaaatatgtttttggtccctataaaa-------cttttaagtttaatccttacttaattttaatagggtttttagtccttaaaaaagaaaattact 5695885  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| |||||||||||||    
T  5695886 tctaattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgattttttcgagacaagtttaaaacactatgaaag 5695985  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | || ||     
T  5695986 gttcatttactaaaatttagaattttttaatatgagatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctg-aac 5696084  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5696085 taaaaatcaaattttgtgacaattttttgcagaggaactttcaataatgatcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactgaagagtttaatcata 5696184  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatt-tattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||||   ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  5696185 aattaaacaaatttgaattgaggagggactaatacttagtgcaaaaattgttttttagaaactaaaaaaacaattataattaagtaaggactaaacttaa 5696284  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||  || ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  5696285 aa-atctcaattttatagggatcaaaaacatatttaatcctt 5696325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 398 - 763
Target Start/End: Original strand, 17498543 - 17498907
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17498543 gacaagtttagaacactataaaagattcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 17498642  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||    
T  17498643 gataaaattaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaattttctttatatgtctgcaaaaaattgtt 17498742  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |   ||||| ||||| |||||||||  |||||||     
T  17498743 caaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatacagagt-gcgtaattttttttagggactaaaaatactattag 17498841  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17498842 aattaagtaaggactaaacttaaaaagtcacaattttatagagaacaaaaacatatttaacccttt 17498907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 251 - 761
Target Start/End: Original strand, 27875347 - 27875861
Alignment:
Q  251 aattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaattttagtccttgttacgacaaa 348  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||          ||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  27875347 aattgggaacttctaagtgtaatccttacttaattttaatagattttttagtccccacaaaaaaaaaattacttctaattttagtccctcttacaacaaa 27875446  T
Q  349 gtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 448  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||| || |         |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875447 gtttgtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaattttt 27875546  T
Q  449 taacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttt 548  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27875547 taacattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattttt 27875646  T
Q  549 tgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaggg 648  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27875647 tgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattgaggatgg 27875746  T
Q  649 actaatactgattgga-aaaatttattttaaggact-aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaa 746  Q
    ||||||||||| || | ||  ||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||  |||    
T  27875747 actaatactgagtgcagaattttttttttaagaactaaaaaaaattattaaaattaactaatgactaaacttgaaaggtcccaattttatagggataaaa 27875846  T
Q  747 aacatatttaaccct 761  Q
    || |||| |||||||    
T  27875847 aaaatatctaaccct 27875861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 256 - 761
Target Start/End: Original strand, 28015532 - 28016042
Alignment:
Q  256 ggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagttt 352  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||           ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  28015532 ggaacttctaagtgtaatccttacttaattttaatagattttttagtccccacaaaaaaaaaaattacttctaattttagtccctcttacaacaaagttt 28015631  T
Q  353 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaac 452  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||| || |         |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28015632 gtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaac 28015731  T
Q  453 atgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgta 552  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28015732 attaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattttttgca 28015831  T
Q  553 gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggacta 652  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28015832 gaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattgaggatggacta 28015931  T
Q  653 atactgattgga-aaaatttattttaaggact-aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaaca 750  Q
    ||||||| || | ||  ||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  28015932 atactgagtgcagaattttttttttaagaactaaaaaaaattattaaaattaactaatgactaaacttgaaaggtcccaattttatagggataaaaaaaa 28016031  T
Q  751 tatttaaccct 761  Q
    ||| |||||||    
T  28016032 tatctaaccct 28016042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 284 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 35863397 - 35862921
Alignment:
Q  284 ttttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttg 383  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35863397 ttttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaattacttctaatattagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttg 35863298  T
Q  384 aacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaga 483  Q
    |||||         |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  35863297 aacaatatttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaa 35863198  T
Q  484 tgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtc 583  Q
      | ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35863197 ctataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaacaattttttgcggagaatcttttagtaatgttcttaacacgtc 35863098  T
Q  584 tgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggact 683  Q
    | | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || ||||||||    
T  35863097 tacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggact 35862998  T
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35862997 aaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacgtatttaaccc 35862921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 318 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 24451806 - 24451364
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |         |||||||||| |||||||||    
T  24451806 tacttctaattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaattattcttaaactcttaaaattttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatg 24451707  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||    
T  24451706 aaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctg 24451607  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24451606 gacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacacaaaattgttaaaaaacttaagagtttaag 24451507  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| | || | |   || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24451506 cataaattaaacaaatttgaattgagcatagactaatactaagtgcatagtatttttgtaagaactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaact 24451407  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24451406 taaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 24451364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 264 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6018414 - 6018011
Alignment:
Q  264 taagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatc 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||         | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||     
T  6018414 taagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctaaaaaaaatatcacttctaattttagtccta-ttacaacaaagtttgtttaattatt 6018316  T
Q  364 cttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaat 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6018315 cttaaacttttaaatttttgaacaatttttatgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttataattttttaacatgaaacaaat 6018216  T
Q  464 taaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaactttt 563  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||  ||||||| | || | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6018215 taaatatgaatttattaaaacaacaaaagataaagataaaactaacaaaatctgaacgtaaaaattaaattttgcgacaattttttgcagaggaactttt 6018116  T
Q  564 agtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgg 663  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||     
T  6018115 agtaatgtttttaacatgtctgcaaaaaactgttcaaaaactcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattgaagagggactaatactgagtga 6018016  T
Q  664 aaaaa 668  Q
    |||||    
T  6018015 aaaaa 6018011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 321 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 21135642 - 21135204
Alignment:
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         ||||| |||| |||| |||||||    
T  21135642 ttctaattttagtccctgccaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacattatgaaa 21135543  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||     
T  21135542 ggttcaattactaaaatttagaattttttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggac 21135443  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  21135442 atataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacat 21135343  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  || | ||  || || |||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21135342 aaattaaacaaatttgaattgagcagaaactaatactg-gtgcataatatttttgtaaggactaaaacaattatgaaaattaagtaaggactaaacttaa 21135244  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21135243 aatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 21135204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 41281270 - 41281711
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| ||||||||    
T  41281270 ttacttctaaatttagtccttgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttttagacaagtttagaacactat 41281369  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  |||  || | |    
T  41281370 gaaaggttcaattactaaagtttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaatgaaatct 41281469  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  41281470 ggatatataaatcaaattttgcgataattttttgctgaggaacttttagtaatgttcttaagacgtctac-aaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaa 41281567  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| || | ||  || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |    
T  41281568 acataaattaaacaaatttaaattgaacagagactaatattgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggattaaac 41281667  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41281668 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 41281711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 317 - 761
Target Start/End: Original strand, 18839886 - 18840330
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |         || | ||||| ||||||||    
T  18839886 ttacttctaattttagtccatgttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttcgaacgattttttttggatatgtttagaacactat 18839985  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||  ||| ||| | |    
T  18839986 gaaaggttcatctactaaaacttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaagagttaaagataaaagtaataaaatct 18840085  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18840086 ggacatagaaatcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttctagtaatgttcttaacacatgtacaaaaaattgttcaaaaacttgagagtttaa 18840185  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |  |  | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |    
T  18840186 gtataaattaaacaaatttgaattgagcaggaactaatactgagtacatcatttttttgtagggactaaaagaactattaaaattaagtaaagacttaac 18840285  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    || ||| ||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18840286 tttaaaagtttcaattttatagggactaaaactatatttaaccct 18840330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 320 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 35369510 - 35369077
Alignment:
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |         || ||||||| |||||||||||    
T  35369510 cttctaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaa 35369411  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||    
T  35369410 aggttcaattgctaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttgga 35369311  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
      || |||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  35369310 catataaatcaaattttgcaataattttttgcggagtaacttttagtaatgttgttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttgaagca 35369211  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35369210 taaattaaacaaatttgaattgagcagagactactactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactta 35369111  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35369110 aaatgcatcaattttatagggactaaaaacatat 35369077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 398 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 9252888 - 9252524
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  || | |  ||||||||||    
T  9252888 gacaaatttaaaatactatgaaaggttcgttaacgaaaatttaaatttttttaacataaaacaaattaaatataaattttgaaa-acggtaaaagttaaa 9252790  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9252789 gataaaattaacaaaatctggaagtagaaatcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 9252690  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaa--atttattttaaggactaaaagaactatt 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||   ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  9252689 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaacactgagtgcataattttttttttttgggactaaaagaactatt 9252590  T
Q  696 aaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9252589 aaaattaagtaaggactaaacataaaatatttcaattttatagggactaaaaaaatatttaaccct 9252524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 225 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 17842881 - 17842342
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---ttact 321  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||           ||| |    
T  17842881 gttaaatatgtttttggtccctataaaattgaaaacttttaagtttagtccttacttaattttaatagtatttttagtccttacaaaaaaaaaaattatt 17842782  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||| ||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |         |||| ||||| |||||||| |||     
T  17842781 tctatttttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttccaaacgattttttgg-gacatgtttagaacactataaaaa 17842683  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| | |||| |    
T  17842682 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacg 17842583  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||  || | |||| |||||||||| |||||| || | | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  17842582 tagaaatcaaaatttgcga-tattttttgctgatgtacttctagtaatgtttttaacatgtatacaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagtata 17842484  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  |    
T  17842483 aattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcataatttttttgtagagactaaaagaactattaaaattatgtaaggactaaactttga 17842384  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17842383 aggtctcaattttatagggactaaaaatatatttaacccttt 17842342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 432 - 760
Target Start/End: Original strand, 13323634 - 13323963
Alignment:
Q  432 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| ||| | || |  || |||||||    
T  13323634 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaa 13323733  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaactttt-agtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 630  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13323734 attttgcgataattttttgtggaggaactttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaca 13323833  T
Q  631 aatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaa 730  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||    
T  13323834 aatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaa 13323933  T
Q  731 ttttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13323934 ttttataaggactaaaaacatatttaaccc 13323963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 410 - 761
Target Start/End: Original strand, 21159841 - 21160194
Alignment:
Q  410 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21159841 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaatatgaaacggattaaatataaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaagttaa 21159940  T
Q  509 caaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaa 608  Q
    |||| | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  21159941 caaaatctagatgtagaaatcaaattgtgcgacaactttttgcggatgaacttttagtgatgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaa 21160040  T
Q  609 gagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 707  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || | ||||   |  |||  |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21160041 aagtataagcataaattaaacaaatttgaattgatgagggactaatactggatgcagaaaaaaaaaattagagactaaaagaactattaaaactaaataa 21160140  T
Q  708 ggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21160141 ggattaaacttaaaatgtcccaattttatagggacaaaaaacatatttaaccct 21160194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 258 - 643
Target Start/End: Original strand, 42499288 - 42499674
Alignment:
Q  258 aacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtt 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||          ||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  42499288 aacttctaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagaccttacaaaaaaaaaattacttcaagttttagttcttgttacaataaagtttgtt 42499387  T
Q  356 taattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatg 455  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42499388 taattattcttaaactcttaaatttttgaacgattttttga-gacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacata 42499486  T
Q  456 aaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagag 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |||| | | | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |     
T  42499487 aaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagatacaattaaaacaatatggacgtaaaaattaaattttgcgacaattttttgcatat 42499586  T
Q  556 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 643  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  42499587 aagcttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaatagtttatgcataaattaaacaaaattgaattgag 42499674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 327 - 760
Target Start/End: Original strand, 37706702 - 37707134
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttca 426  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37706702 ttttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttta-gacaagattagaacactatgaaaggttca 37706800  T
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaa 526  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  | | ||| | || |  || ||    
T  37706801 attattaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtgataaaatctgaacatataa 37706900  T
Q  527 atcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatta 626  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37706901 atcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttctcaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacataagagtttaagcataaatta 37707000  T
Q  627 aacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtc 726  Q
     |||||||| ||| ||| || ||| |||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| |    
T  37707001 cacaaattttaatcgagcagagaccaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaataactattaaaatttagcaaggactaaacttaaaatgcc 37707100  T
Q  727 ccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||| ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  37707101 tcaaatttatagggattaaaaatatatttaaccc 37707134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 222 - 734
Target Start/End: Original strand, 30658323 - 30658822
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt---aatccctacnnnnnnnnt- 317  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   | ||  |||              
T  30658323 agggtcaaatatgtttttggtccctataaaattgtgaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagatttttttttagtctttacaaaaaaaaaa 30658422  T
Q  318 -tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |       | |||||||||| ||||||||    
T  30658423 atacttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaattatttttttaagacaagtttagaacactat 30658522  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    ||||                |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  30658523 gaaa----------------tttagatttttttaacatgaaacaaattaattatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 30658606  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgaca-attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30658607 ggacgtagaaatcaaattttgcaacattttttttgaagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagag-tta 30658705  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | | | ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||     
T  30658706 agcat-aattaaacaaatttgaattgaggagagattaatactgagt-gcataatttttttgaagaactaaaaaaactattaaaattaagtaagaattaaa 30658803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 758
Target Start/End: Original strand, 36063409 - 36063834
Alignment:
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||| ||||||||    
T  36063409 tctaattttagttcctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaag 36063508  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||             || ||| | ||||      
T  36063509 gttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagt-------------aataaaatctggaca 36063595  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc--gaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  36063596 tataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaaattgttaaaaaacttaagaatttaaaca 36063695  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36063696 taaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggacaaaaacagctattaaaattaagtaaggactaaactta 36063795  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36063796 aaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 36063834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 462 - 759
Target Start/End: Original strand, 6413383 - 6413681
Alignment:
Q  462 attaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaactt 561  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6413383 attaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtaggaatcaaattttgcgacaattttttgaagaggaactt 6413482  T
Q  562 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgatt 661  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  6413483 ttagtgatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggagagactaatactgagt 6413582  T
Q  662 gga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    | | ||  ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||| || ||||||  ||| | ||| ||||||||||    
T  6413583 gtagaattttttttttagggattaaaaaaactattaaaattaagtaagaaataaacttaaaaggtcctaactttataaggaccataaatatatttaacc 6413681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 319 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 39337301 - 39336873
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| ||||||||||    
T  39337301 acttctaattttagtccatactaagacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaatcttttgagacaagtttagaacactatga 39337202  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  | | ||||||||||||||  ||| ||| | |||    
T  39337201 aaggttcaattaataaaatttaaatttttttaacattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaatagaagttaaagataaaagtaataaaatatgg 39337102  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    |  || ||||||||||||||| |             |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  39337101 acatataaatcaaattttgcggc-------------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaga 39337015  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    
T  39337014 ataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatattgaatgcatagtatttttctaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaactt 39336915  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39336914 aaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 39336873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 30969062 - 30968670
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgtta 341  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||        |||||| |||||||||||| | |||    
T  30969062 tccctataaaattgaaaacttctaagttcagtacttacttaattttaatagtttttttagtccctacaaaaaaatttacttataattttagtccctctta 30968963  T
Q  342 cgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttag 441  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||           |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30968962 aaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacggttttttttagacaagtttagaacaatatgaaatgttcgtttactaaaatttag 30968863  T
Q  442 aattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaattt-aacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcga 540  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    |||||| | || | |||||||||| |||||||||    
T  30968862 aattttttaatatgtaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaaagcaacaaaatctgaatgtagaaatcatattttgcga 30968763  T
Q  541 caattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaa-aattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30968762 taattttttgtagagaaacttttagtaatgttataaacacgtatgcaaaataattgtttaaaaacttaagagtttatgcataaattaaacaaa 30968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 398 - 624
Target Start/End: Original strand, 17062414 - 17062639
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17062414 gacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaaa 17062513  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    ||  || |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||    
T  17062514 gacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgacaa-tttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgtt 17062612  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17062613 caaaaactcaaaagtttaagcataaat 17062639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 398 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 17585944 - 17585719
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17585944 gacaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaaa 17585845  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    ||  || |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||    
T  17585844 gacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgacaat-ttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgtt 17585746  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17585745 caaaaactcaaaagtttaagcataaat 17585719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 330 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 23483654 - 23483421
Alignment:
Q  330 tagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcattt 429  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23483654 tagtccatgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcattt 23483555  T
Q  430 actaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatc 529  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||    
T  23483554 attaaaatttagagttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaattgcaaaagttaaagatcaaattaaccaaatgtggacgtagaaatc 23483455  T
Q  530 aaattttgcgacaattttttgtagaggaactttt 563  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23483454 aaattttacgataattttttgtagaagaactttt 23483421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 239 - 655
Target Start/End: Original strand, 5765605 - 5766025
Alignment:
Q  239 tgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntta-cttctaattttagtcctt 337  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||| ||| |||||||||||| |    
T  5765605 tgatccctataaaattgcgaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctataaaaaaaattaacttataattttagtccct 5765704  T
Q  338 gttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaat 437  Q
    | ||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765705 gctaaaataaattttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 5765804  T
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaa-ttt 535  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||| ||| | |||| |||||||||||| |||    
T  5765805 ctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttt 5765904  T
Q  536 tgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg--cgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaat 633  Q
    ||||| | ||||||  | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5765905 tgcgatatttttttcga-aggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaaattgttgaaaaacttcagagtttaagcataaattaaacaaat 5766003  T
Q  634 ttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||  |||||| | |||||||||    
T  5766004 ttggattgagtaaggactaata 5766025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 16473279 - 16472873
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta-ga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  16473279 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttattt 16473180  T
Q  443 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |    
T  16473179 tttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgata 16473081  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16473080 attttttgcagaggaacttttaataa---tcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16472990  T
Q  643 ggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | |  ||||||| |||| || | |   || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||| ||||||| |||    
T  16472989 gcatagactaattctgagtgcatagtatttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaacgcctcaa-tttatagggac 16472891  T
Q  743 taaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16472890 taaaaacatatttaaccc 16472873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 16477850 - 16477444
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta-ga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  16477850 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttattt 16477751  T
Q  443 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |    
T  16477750 tttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgata 16477652  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16477651 attttttgcagaggaacttttaataa---tcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16477561  T
Q  643 ggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | |  ||||||| |||| || | |   || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||| ||||||| |||    
T  16477560 gcatagactaattctgagtgcatagtatttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaacgcctcaa-tttatagggac 16477462  T
Q  743 taaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16477461 taaaaacatatttaaccc 16477444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 401 - 762
Target Start/End: Original strand, 43988207 - 43988567
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  43988207 aagtttagaacactatgaaaggtttatatactaaaatttagaattttttaacataaaatgagttaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagat 43988306  T
Q  501 aaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttca 599  Q
    |||  |||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||   ||| ||| | |||||     
T  43988307 aaaagtaacaaaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcgataatattttgtggaggagctattagtaacgttctaaacac--atgcaaaataatgttcg 43988404  T
Q  600 aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaat-ttattttaaggactaaaagaactattaaa 698  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||   | || || ||  |||||||| | ||||||||    
T  43988405 aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattgagtagggactaatactgagtgcaattttgtttttatagagactaaaaaacctattaaa 43988503  T
Q  699 attaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||   | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43988504 attaagtaaggactaaacttagaagacctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 43988567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 762
Target Start/End: Original strand, 28755059 - 28755589
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaattttag 332  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||| ||||||||          |||||| |||||||||    
T  28755059 tttttggtccctataaaattgcgatcttctaagtttagtctttgcttaattttaatagtctttttgatccctacaaaaaaaaaattacttataattttag 28755158  T
Q  333 tccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttact 432  Q
    ||| || ||  | ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28755159 tccctgctaaaataaattttgcttaattattgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttact 28755258  T
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||| ||| | || | |||||||||||    
T  28755259 aaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaa 28755358  T
Q  532 a-ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 630  Q
    | ||||||||  |||||||   ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28755359 atttttgcga-tatttttttcggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagaatttaagcataaattaaaca 28755457  T
Q  631 aatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaa 730  Q
    |||||  |||||| | |||||||||   | || | || ||| || ||| || ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||| |||    
T  28755458 aatttggattgagtaaggactaatatgaagtgcagaatttttttgtaaagattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttacaaggtcgcaa 28755557  T
Q  731 ttttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||| ||| |||  |||||||| |||||||||    
T  28755558 ttttgtagggaccgaaaacataattaaccctt 28755589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 321 - 577
Target Start/End: Original strand, 18304638 - 18304896
Alignment:
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat--gacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |        |  |||| ||||| ||||||||||    
T  18304638 ttctaatattagtccctcttacaacaaagtttgattaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttttaagacatgtttagaacactatga 18304737  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||| | |||    
T  18304738 aaggttcattttccaaaatttagatttttgtaacttcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaatttaaagataaaatcaacaaaatttgg 18304837  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaa 577  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18304838 acgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaa 18304896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 44894464 - 44894816
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| | | |||||  ||| ||     
T  44894464 acaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcttgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaa--gtttaaa 44894561  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||| | |||||||  | |||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  44894562 ataattgtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44894661  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||| ||||||||    
T  44894662 caaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaagcactattaa 44894760  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44894761 aattaagtaagggctaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 44894816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 554 - 762
Target Start/End: Original strand, 14121950 - 14122159
Alignment:
Q  554 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaa 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14121950 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaa 14122049  T
Q  654 tactgattggaaaaattta-ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacata 752  Q
    || ||| || | |  |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||   ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14122050 tagtgagtgcagatttttatttttagggactgaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaacata 14122149  T
Q  753 tttaaccctt 762  Q
    ||||||||||    
T  14122150 tttaaccctt 14122159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 36018521 - 36018027
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---ttacttctaatttta 331  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||           | |||| ||||||||    
T  36018521 tttttggtccctataaaatttggaatttttaagtttaatccttaattaattttaatagcatttttaatccctacaaaaaaatcaatcacttgtaatttta 36018422  T
Q  332 gtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttac 431  Q
    |||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||         |||||||||  |||||||| |||||||||||||     
T  36018421 gtccctgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttcttaacaatttttttgagacaagttttgaacactataaaaggttcatttat 36018322  T
Q  432 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatca 530  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |  | ||||||| ||||||||  |||| ||| | || | ||||||||||    
T  36018321 taaaatctagatttttttaacatgaaataaataaaatatgtatttttttaaaccaaaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatgaatgtagaaatca 36018222  T
Q  531 aa-ttttgcgacaat-tttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaa 628  Q
    || |||||||| ||| ||||||  ||| |||||||| ||  |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  36018221 aatttttgcgataatgtttttgcggagaaacttttaatagcgttcttaacacgtct-aaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaatgaaa 36018123  T
Q  629 caaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggact-aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||  |||||    ||| ||||| ||| |  | |||||| |  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36018122 caaatttggattgaattaggaataatattgagtttagaaatttttaatagggactaaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaat 36018027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 344 - 733
Target Start/End: Original strand, 32514039 - 32514429
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| |||  ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  32514039 acaaagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattattttgagacaagtttagaacgttacaaaaggttcgtttactaaaatttagat 32514138  T
Q  444 tttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgac 541  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  | | || ||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||| || |||||||  ||     
T  32514139 tttttttaacatgaaatgaattaaatataaatttttgtaaaggaaaaaagttaaagataaaagtaacaaaattctggacgtagatataaaattttcagat 32514238  T
Q  542 aattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattg 641  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || || ||||||||||| | |||| |||||||| |||     
T  32514239 aattttttgcagatgaactattagtaatgttcttaacacttctgtaaaaaattgtttaaaatcttaaaagtttaagcat-agttaagcaaatttagattt 32514337  T
Q  642 aggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattt 733  Q
    ||||| |||||| ||| | || | |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||    
T  32514338 aggagagactaaaactaagtgcagaaattttttatagggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaatttagaaggtcccaattt 32514429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Original strand, 32244484 - 32244803
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| || |||||  ||||||| || |||| | | |||| |||    
T  32244484 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttagtagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcataaataaaa 32244583  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  32244584 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 32244682  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||||||| |  | ||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  32244683 tttaaatttactaaggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaaataaggactaaacttaaaaggtcccaatt 32244782  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| | | ||||||||||    
T  32244783 ttatagggtcaaaaaacatat 32244803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 224 - 512
Target Start/End: Original strand, 43936391 - 43936679
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| ||| |||||| | || |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||         ||||||    
T  43936391 ggttaaatatatttttggttccaataaaattgggaacttctaagtttaatccttgcttaattttaataggtcttttagtccttacaaaaaaaaattactt 43936490  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||  ||| |||||||||     
T  43936491 ctaattttagtccc-gttacaaaaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagttttgaacgctatgaaaga 43936589  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    || |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43936590 tttatttaccaaaatttaattttttttaacatgaaacgaattaaaaataaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaa 43936679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3865934 - 3865578
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  3865934 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaactttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 3865835  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | || ||| |||||||| || ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  3865834 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttggagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 3865735  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactat--t 695  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||| || | || | | || || |||||||||  |||||  |    
T  3865734 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaatttgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattat 3865636  T
Q  696 aaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | |||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3865635 ataattaattaaggaataaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3865578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 32243920 - 32243566
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| | |||||| | | |||||||||| ||     
T  32243920 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttataattttttaacatgaaataatttaaatataattttttttaaaagacaaaagttcaaa 32243821  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  ||| |||  | | || | || ||| |||||||| || ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  32243820 ataaaagtaaaaaaaatctagacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 32243721  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  |||||||     
T  32243720 caaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagcagagactaaaactgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattat 32243622  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  32243621 aattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggacctaaaacatat 32243566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 574 - 760
Target Start/End: Original strand, 39337745 - 39337931
Alignment:
Q  574 ttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttat 673  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | || | |   || |    
T  39337745 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaatactaagtgcatagtatttt 39337844  T
Q  674 tttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39337845 tgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 39337931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 399 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 6243715 - 6243403
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaa-tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||||| ||    
T  6243715 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttttaaaagataaaagttcaa 6243616  T
Q  498 gataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
     |||||  |||| ||| | |||| | |||||| |||||||| || |||||||||  || |||||||| ||||||||  |||||| | ||| |||| ||||    
T  6243615 aataaaagtaacaaaaatatggatgcagaaattaaattttgagataattttttgcggatgaacttttcgtaatgttactaacacttgtgcaaaaatttgt 6243516  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | ||  || || || |||||||||| ||||||     
T  6243515 tc-aaaatttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataa--tttttatatggactaaaagcactatt- 6243421  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaa 714  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  6243420 aaattaagtaaggactaa 6243403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36126679 - 36126455
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac----nnnnnnn 315  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  36126679 atagggttaaatatgtgtttggtccctataaaattgagaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttaatacctacaaaaaaaaaaa 36126580  T
Q  316 nttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaa-tttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacact 414  Q
     ||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |       | |||||||||| ||||||    
T  36126579 attacttctaattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaactatccttaaactattaaattttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacact 36126480  T
Q  415 atgaaaggttcatttactaaaattt 439  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  36126479 ataaaaggttcatttactaaaattt 36126455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Original strand, 3866478 - 3866798
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||  ||||||| || || |   |||||| |||    
T  3866478 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctgaacacagaaataaaa 3866577  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagag-tttaagcataaattaaacaa 631  Q
    ||||| || ||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||    
T  3866578 ttttgagataattttttgcatatgaacttttcgtaatattcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaattttaaaaggtttaagcataa-ttaaacaa 3866676  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaat 731  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || || | |||||||  ||||||| |||||||||||| | || |||||||  ||| |||    
T  3866677 atttaaatttagtagggactaaaactgagtgcataatttttttatatgaactaaaaacactattataattaagtaaggacaaaacttaaaagatcctaat 3866776  T
Q  732 tttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||| ||| ||||||||||    
T  3866777 tttatagggaccaaaaacatat 3866798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 13323219 - 13323066
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || | | | || || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13323219 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactaagtgcatagaatttttgttaggactaaaacaactattaaaattaagt 13323120  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13323119 aaggactaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 13323066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 610 - 759
Target Start/End: Original strand, 21136206 - 21136355
Alignment:
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21136206 agtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagg 21136305  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
     |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21136306 actaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 21136355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 24452360 - 24452513
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24452360 caagagtttatgcataaattgaacaaatttgaattgagtagggactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagt 24452459  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24452460 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 24452513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 588 - 760
Target Start/End: Original strand, 35369930 - 35370102
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| | || | |   || || | ||||||||||    
T  35369930 aaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagattaatactaaatgcatagtatttttgtgaggactaaaa 35370029  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35370030 caactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgtttcgattttatagggactaaaaacatatttaaccc 35370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 35863921 - 35864074
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35863921 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggattgatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 35864020  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| ||||  |||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  35864021 aaggactaaatttaaaatgcctcaattttacatggactaaaaacatatttaacc 35864074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 37706171 - 37706018
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || | |   ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37706171 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagtagaaactaatactgagtgcatagtatttctgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 37706072  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  37706071 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacaaggactaaaaacatatttaacc 37706018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 626 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 1680983 - 1680835
Alignment:
Q  626 aaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgt 725  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| || | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  1680983 aaacatatttgaattgagtagggactaatattgagtgcataaactttttttagggactcaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaagaggt 1680884  T
Q  726 cccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatttct 774  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | || |||||||    
T  1680883 cccaattttttagggaccaaaaacatatttaaccctattttttatttct 1680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2827232 - 2827065
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||         |    
T  2827232 tatagggttaaatatgtttttggtccctataaaatttgaagcttttaagtttagtccttacttaattttaatagtctttttagtccctacaaaaaaaagt 2827133  T
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||| |||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  2827132 tacttataattttagtctctgctaagacaatgtttgtttaattatcctcaaactcttaattttttgaa 2827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31185890 - 31185724
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac---nnnnnnnntt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||    
T  31185890 agggttaaatatgtttttgatccctataaaattgcgaccttataagtttagtccttacttaattttaatagtttttttaattcctacaaaaaaaaaattt 31185791  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||| |||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31185790 acttataattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 31185724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 658
Target Start/End: Original strand, 42024231 - 42024559
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttca 426  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||| ||  ||| |||      
T  42024231 ttttagtccctgctaaaacaaagtttctctaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttta--gacaagtttagaacattaccaaaagtttg 42024328  T
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtaga 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||  |||||||  | | || |||||    
T  42024329 tttactaaaatttagaattttataccatgaaatgggttaaatatgaatttttttgaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctcgacgtaga 42024428  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatt 625  Q
    ||| |||||||| ||   ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  | || | |||||  || ||||    
T  42024429 aataaaattttgagatt-tttcttgcagatgaaattttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgtttaaaatattaaaaatttaaatat-aatt 42024526  T
Q  626 aaacaaatttaaattgaggagggactaatactg 658  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  42024527 aaacaaatttagatttagtagggactaaaactg 42024559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 627 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 14121945 - 14121810
Alignment:
Q  627 aacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaagg-actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgt 725  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||    
T  14121945 aacaaatttgaattgaggagggactaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggt 14121846  T
Q  726 cccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  14121845 ccctattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 14121810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 492 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 2827029 - 2826919
Alignment:
Q  492 gttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaa 591  Q
    ||||||||||||  ||||||| | || |  |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2827029 gttaaagataaaagtaacaaaatctgaatatagaaatcaaattttgcgatgattttttgtggatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaa 2826930  T
Q  592 attgttcaaaa 602  Q
    |||||||||||    
T  2826929 attgttcaaaa 2826919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 560 - 758
Target Start/End: Original strand, 28701866 - 28702063
Alignment:
Q  560 ttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| || ||||||||| | |||    
T  28701866 ttttagtaatattcttaacacttctacaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaaaaaaattagatttagtagggactaaaattga 28701964  T
Q  660 ttggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||| |||  ||| || ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  28701965 ttgcaaattttttttatagagactaaatgaattattaaaattaagtaaggactaaacataaaagatctcaattttatagggatcaaaaatatatttaac 28702063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 36062840 - 36062694
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| | || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36062840 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcatggactaatacttagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaatttagt 36062741  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacata 752  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||    
T  36062740 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacatggactaaaaacata 36062694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12469615 - 12469454
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatcctt-acttaattttaataggttttttaa-tccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||| | | | ||         ||||||     
T  12469615 ttaaatatgtttttggtccctataaaattaggaacttctaagtttagtcttttacttaattttaatagatttttttagttcttaaaaaaaaaattacttt 12469516  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12469515 taattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcctaaatttttgaa 12469454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 621 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 1737578 - 1737439
Alignment:
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | || | |   || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  1737578 aaattaaacaaatttgaattgagtaaggactaatacttagtgcatagtatttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaa 1737479  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1737478 aatgtctcaatttgataggaactaaaaacatatttaaccc 1737439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 386
Target Start/End: Original strand, 17062151 - 17062311
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttact 321  Q
    ||||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||         |||||    
T  17062151 gggttaaatatatttttggtcgctataaaattgggaacttctaagtttaatccgtacttaattttagtaggtcttttagtccctacaaaaaagaattact 17062250  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac 386  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  17062251 tctaattttagttcccgttacaacaaagtttgtttaactatc----aacttttaaatttttgaac 17062311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17586207 - 17586047
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttact 321  Q
    ||||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||         |||||    
T  17586207 gggttaaatatatttttggtcgctataaaattgggaacttctaagtttaatccgtacttaattttagtaggtcttttagtccctacaaaaaagaattact 17586108  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac 386  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||    
T  17586107 tctaattttagttcccgttacaacaaagtttgtttaactatc----aacttttaaatttttgaac 17586047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 6590144 - 6590230
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  6590144 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 6590230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 292
Target Start/End: Original strand, 10409467 - 10409547
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10409467 tatttattttagggttaaatatgtttttggtccctgtaaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 10409547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 547420 - 547337
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  547420 gggttaaatatgtttttggtctctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccct 547337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 44893886 - 44893744
Alignment:
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44893886 agtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtaaggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaagg 44893788  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44893787 actaaatttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 44893744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10410145 - 10410010
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||| |       | || ||||||| |||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  10410145 acaaagtttctctaattatccttagagtcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttaaaacattacaaaagattcatttaccaaaatttagaa 10410046  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10410045 ttttttaacatgaaatgaattaaatatgattttttt 10410010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Original strand, 37967870 - 37967956
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37967870 taaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcctaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 37967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 759
Target Start/End: Original strand, 42950208 - 42950294
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42950208 ttttagggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaagtaacaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 42950294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 512
Target Start/End: Original strand, 6244252 - 6244337
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||||||    
T  6244252 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaa 6244337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 8784457 - 8784542
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8784457 agggttaaatatgtttttgatccctataaaattcagatattttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 8784542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 680 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 10409558 - 10409477
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  10409558 gactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaaccct 10409477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 41280522 - 41280369
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||  | || | |   || || || ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41280522 caagagtttaagtataaattgaacaaatttgaattgggcagggactaataccaagtgcatactatttttgtacggactaaaacaactattaaaattaact 41280423  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||  | |||||||| | |||||||||    
T  41280422 aaggactaagcttaaaatgcctcaattttaccgggactaaaaccgtatttaacc 41280369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 612 - 757
Target Start/End: Original strand, 44803330 - 44803474
Alignment:
Q  612 tttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcc 711  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||| |||| ||| |||| |||||| |  || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44803330 tttaagcataaattaaacaaattgga-ttgactaaggacaaatattgagtggagaaatttttcatagggacaaaaaaaactattaaaattaagtaaggac 44803428  T
Q  712 taagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||| |||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44803429 taaacttagaaggtctcaattttacagggactaaaaacatatttaa 44803474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 305
Target Start/End: Original strand, 21159719 - 21159803
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccc 305  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21159719 taggattaaatatatttttggtccctataaaattgagaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccc 21159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 567 - 753
Target Start/End: Original strand, 30133748 - 30133933
Alignment:
Q  567 aatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaa 666  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||| || || | |||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | |    
T  30133748 aatgttcttaacacttctccaaaatattattcaaaatcttaaaaatttaagtataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaa-attgagtgcata 30133845  T
Q  667 aatttattt-taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | ||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30133846 attttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaaatctcaattttatagggaccaaaaacatat 30133933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 676 - 771
Target Start/End: Original strand, 33322867 - 33322962
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33322867 taaggactaaaaaacctattaaaattaaataaggactaaacttagaagtttccaattttatagagaccaaaaacatattttaccctttaatatatt 33322962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43988566 - 43988488
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988566 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgaggtcttctaagtttagtccttacttaattttaataggtttttta 43988488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 547339 - 547420
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  547339 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagagaccaaaaacatatttaaccc 547420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 1680846 - 1680918
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1680846 atagggttaaatatgtttttggtccctaaaaaattgggacctcttaagtttagtccttacttaattttaatag 1680918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 624 - 736
Target Start/End: Original strand, 18304893 - 18305003
Alignment:
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||     
T  18304893 ttaaacaaatttaaattgaagagagactaatactgagt-gcataattttttttaaggattaaaa-aactattaaatttaagtaaggattaaacttaaaag 18304990  T
Q  724 gtcccaattttat 736  Q
     ||||||||||||    
T  18304991 atcccaattttat 18305003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Original strand, 30806214 - 30806298
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30806214 ggttaaatatatttttggttcctataaaattggaaacttttaagtttagtatttacttaattttaatagtttttttaatccctac 30806298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 683 - 763
Target Start/End: Original strand, 31185812 - 31185892
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  31185812 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttataaggtcgcaattttatagggatcaaaaacatatttaacccttt 31185892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 37967412 - 37967492
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  37967412 atagggttaaatatgtttttcgtccctataaaattgagatcttttaagtttagtctttacttaattttaatagttttttta 37967492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 766
Target Start/End: Original strand, 2827147 - 2827234
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2827147 ggactaaaaagactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagcttcaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctatatt 2827234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6413681 - 6413598
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| ||| ||| || ||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6413681 ggttaaatatatttatggtccttataaagttaggaccttttaagtttatttcttacttaattttaatagtttttttaatcccta 6413598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Original strand, 6590600 - 6590686
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  6590600 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggacaaaaaatatatttacccctt 6590686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 758
Target Start/End: Original strand, 17842799 - 17842881
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17842799 taaggactaaaaatactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttttcaattttatagggaccaaaaacatatttaac 17842881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 33322412 - 33322490
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33322412 agggttaaatatctttttgatttctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttta 33322490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 588 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 41255389 - 41255319
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  41255389 aaaaattgttcaaaaactcaagagattaaacactaattaaacaaatttgaattgagtatggactaatactg 41255319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 41590294 - 41590212
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  41590294 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaaaaacataattaaccct 41590212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41590750 - 41590680
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41590750 agggttaaatatgtttttagttcctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 41590680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3866797 - 3866736
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  3866797 tatgtttttggtccctataaaattaggatcttttaagttttgtccttacttaattataatag 3866736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 699
Target Start/End: Original strand, 16478432 - 16478525
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaa 699  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||    
T  16478432 caagagtttaagcataaattgaacaaatttcaattgagcagggaccaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaa 16478525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 24451364 - 24451441
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24451364 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttta 24451441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28755588 - 28755507
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatc 303  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28755588 agggttaattatgttttcggtccctacaaaattgcgaccttgtaagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaatc 28755507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 44893745 - 44893806
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44893745 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaaatttagtccttacttaattttaatag 44893806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44894815 - 44894754
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44894815 tatgtttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttagcccttacttaattttaatag 44894754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 544 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 10409876 - 10409789
Alignment:
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||    
T  10409876 ttttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacttccgcaagaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaa 10409789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Original strand, 12469306 - 12469382
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  12469306 ggttaaatatgtttttgatctctataaaattgagattttttaagtttaattcttacttgattttaatagttttttta 12469382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21160196 - 21160124
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21160196 atagggttaaatatgttttttgtccctataaaattgggacattttaagtttaatccttatttagttttaatag 21160124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 753
Target Start/End: Original strand, 6244392 - 6244455
Alignment:
Q  690 actattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  6244392 actattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaatatat 6244455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 30658393 - 30658318
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30658393 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcacaattttatagggaccaaaaacatatttgaccctttatt 30658318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 44265330 - 44265393
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  44265330 gttaaatatgtttttgatccctataaaattgggaccttttaaatttagtctttacttaatttta 44265393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 753
Target Start/End: Original strand, 2821164 - 2821386
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| | ||||       ||||| | || ||||||| |||    
T  2821164 gtagaaatcaaattttgaactaattttttgtggaggaatttttagtaattttcttaacacttctacaaaaa-------aaaaaattaaaagtttaaacat 2821256  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||| |||||||||||  ||| || | ||||||| ||||| |   ||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  2821257 aaa-taaacaaatttggatttagaaaggactaaaactgagtatgaaatttttttatagggactaaaa-aactattaaaattaagtatgaactaaacttaa 2821354  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    || || || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  2821355 aaggttcc-attttatagtgacaaaaaacatat 2821386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5250804 - 5250718
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  5250804 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaataaagacctttcaagtttagtccttatttaattttaatggttcttttagtcccta 5250718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6244443 - 6244393
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6244443 tccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 6244393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 14121809 - 14121895
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  14121809 tagggttaaatatgtttttggttcctataaaatagggacctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 14121895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 28695041 - 28694963
Alignment:
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||   | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28695041 ttttttgtgaaggaacttttagtaatgctcttaatacacgtacaaaaaattgttcaaaaactctagagtttaagcataa 28694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 291
Target Start/End: Original strand, 28701540 - 28701610
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  28701540 tagggttaaatatgtttttgatctctataaaatttggaatttctgaatttaatccttatttaattttaata 28701610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28702063 - 28701997
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28702063 gttaaatatatttttgatccctataaaattgagatcttttatgtttagtccttacttaattttaata 28701997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 761
Target Start/End: Original strand, 36126607 - 36126677
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  36126607 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaaacacatatttaaccct 36126677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 533 - 582
Target Start/End: Original strand, 2209252 - 2209301
Alignment:
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgt 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2209252 ttttgcgacaattttttttagaaaaacttttagtaatgttcttaacacgt 2209301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 5250344 - 5250263
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  5250344 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttataaggaccaaaaacatatttaaccc 5250263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 8784915 - 8784996
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8784915 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattcctaattttagagggaccaaaaacatatttaaccc 8784996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17498905 - 17498820
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  17498905 agggttaaatatgtttttgttctctataaaattgtgactttttaagtttagtccttacttaattctaatagtatttttagtcccta 17498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18305003 - 18304947
Alignment:
Q  247 ataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18305003 ataaaattgggatcttttaagtttaatccttacttaaatttaata-gttttttaatcc 18304947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 503
Target Start/End: Original strand, 28701739 - 28701824
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | | ||| |||||| ||||||||    
T  28701739 aaaggtttgtttactaaaatttggaatttattaacatgaaatgaattaaatataaatatttttaaaagactaaagtttaagataaa 28701824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30133932 - 30133871
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30133932 tatgtttttggtccctataaaattgagattttttaagtttagtccttacttaattttaatag 30133871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41281711 - 41281643
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41281711 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaata 41281643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14122158 - 14122090
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14122158 agggttaaatatgtttttggtccctataaaataggggtctttcaagtttagtccttacttaattttaat 14122090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Original strand, 17498435 - 17498507
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17498435 ttaaatatgttattgatccctataaaattggaaatttataagtttagtccttacttaatcttaatagattttt 17498507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36471236 - 36471152
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||   || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  36471236 gggttaaatatgattttggtccctataaaatagagatctttcaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 36471152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42950294 - 42950226
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42950294 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattgttactttttaagtttagtccttacttaattttaatag 42950226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 12469385 - 12469306
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||   ||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12469385 gactaaaaaaactattaaaatcaagtaagaattaaacttaaaaaatctcaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 12469306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 619 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 40305008 - 40304870
Alignment:
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaact-attaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||| ||| || | |||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| ||    
T  40305008 ataaattaaacaaattgga-ttgagtaaggactaatattgaatgcagaaattttttatagggactaaaaaaaattattaaaattaagtaaggactaaact 40304910  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    || || ||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40304909 tagaaggtctcaagtttataaggaccaaaaacatatttaa 40304870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 44802501 - 44802362
Alignment:
Q  612 tttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggact-aaaagaactattaaaattaagtaaggc 710  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||  | ||||||||| ||| || | |||||| |  || ||||| |||| ||||||||||||    |||||     
T  44802501 tttaagcataaattaaacaaattgga-ttgactaaggactaatattgagtgcagaaatttttcgtagggactgaaaaaaactattaaaat----taagga 44802407  T
Q  711 ctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattt 755  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44802406 ctaaacttagaatgtctcaattttatagggactaaaaacatattt 44802362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 3865579 - 3865633
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  3865579 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttattccttaattaatt 3865633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5696320 - 5696247
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  5696320 ttaaatatgtttttgatccctataaaatt-gagatttttaagtttagtccttacttaattataattgttttttta 5696247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 21159802 - 21159724
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21159802 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatagggaccaaaaatatatttaa 21159724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30658829 - 30658771
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  30658829 tccctacaaaattgggaccttttaaatttaattcttacttaattttaatagttttttta 30658771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 36909815 - 36909729
Alignment:
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaa 602  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  36909815 tggaggtagaaatcaaattttaagataattttttgcggagaaactttaaataacgttcttaacacatctgcaaaaaaatgttcaaaa 36909729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39337931 - 39337862
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39337931 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 39337862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Original strand, 44265782 - 44265868
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||| |||| ||  | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  44265782 taaggactaaaaaacttattaaaattaagtaaagactaaacttagaagtttccaattttataaggacaaaaaacatatttaaccctt 44265868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 17062232 - 17062151
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  17062232 ggactaaaagacctactaaaattaagtacggattaaacttagaagttcccaattttatagcgaccaaaaatatatttaaccc 17062151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 17586126 - 17586207
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||| ||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  17586126 ggactaaaagacctactaaaattaagtacggattaaacttagaagttcccaattttatagcgaccaaaaatatatttaaccc 17586207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25102381 - 25102305
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  25102381 atttatttttgggttaaatatgtttttgatccctataaaa-tggggtctttcaagtttagtctttacttaattttaat 25102305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Original strand, 39336873 - 39336941
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39336873 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaata 39336941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 669 - 770
Target Start/End: Original strand, 42499682 - 42499783
Alignment:
Q  669 tttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattat 768  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |   ||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||    
T  42499682 ttttttttaacgactaaaaaaactattaatattaagtaaggactaaatttaaaagtttataattttatagatacaaaaaacatatttaagcgttttttat 42499781  T
Q  769 at 770  Q
    ||    
T  42499782 at 42499783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44803474 - 44803401
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  44803474 ttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgagaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagttttttt 44803401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 13323066 - 13323134
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13323066 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 13323134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 19182943 - 19183019
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |  |||| || ||||||||| ||||    
T  19182943 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaagacgtaaaaaattcaagataaatctaac 19183019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 287
Target Start/End: Original strand, 21135204 - 21135268
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttt 287  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21135204 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaatttt 21135268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36063834 - 36063767
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36063834 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 36063767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38706846 - 38706770
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  38706846 tatgtttttggtccctataaaatagggatctttcaagtttagtctttatttaattttaatagttattttagtcccta 38706770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 732 - 771
Target Start/End: Original strand, 9135772 - 9135811
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9135772 tttatagggactaaaaacatatttaaccctttattttatt 9135811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11385673 - 11385602
Alignment:
Q  432 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  11385673 taaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaa 11385602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 16472859 - 16472941
Alignment:
Q  209 gactatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||| | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16472859 gacttttttttattgggttaaatatgtttttagtccctataaattgaggcg-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 16472941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Original strand, 16477430 - 16477512
Alignment:
Q  209 gactatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||| | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16477430 gacttttttttattgggttaaatatgtttttagtccctataaattgaggcg-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 16477512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 25101916 - 25101829
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| | ||||||||   || ||||| |||||||||||||||||    
T  25101916 ggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtctctattttataagaaccaaaaatatatttaaccctttatt 25101829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Original strand, 27000697 - 27000744
Alignment:
Q  260 cttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  27000697 cttttaagtttagtccttacttaattttaatatcttttttagtcccta 27000744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27875863 - 27875792
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  27875863 atagggttagatattttttttatccctataaaattgggacctttcaagtttagtcattagttaattttaata 27875792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28016044 - 28015973
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  28016044 atagggttagatattttttttatccctataaaattgggacctttcaagtttagtcattagttaattttaata 28015973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Original strand, 31185625 - 31185696
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31185625 tagggttaattatgttttcggtctctacaaaattgcgatcttgtaagtttactccttatttaattttaatag 31185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 537
Target Start/End: Original strand, 34050586 - 34050685
Alignment:
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttg 537  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  ||||||| | ||||  || |||| ||||||||    
T  34050586 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaatttggacctaaaaataaaattttg 34050685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Original strand, 36610803 - 36610838
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36610803 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 36610838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 38706395 - 38706316
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| |||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38706395 actaaaaaacctattaaaaataagtaatgattaaacttaaaagatccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 38706316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 732 - 763
Target Start/End: Original strand, 41926079 - 41926110
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41926079 tttatagagactaaaaacatatttaacccttt 41926110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42499751 - 42499696
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42499751 ctataaaattataaacttttaaatttagtccttacttaatattaatagttttttta 42499696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 43936474 - 43936391
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  43936474 taaggactaaaagacctattaaaattaagcaaggattaaacttagaagttcccaattttattggaaccaaaaatatatttaacc 43936391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 44090484 - 44090563
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  44090484 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 44090563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2061079 - 2061009
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  2061079 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 2061009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 729 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 2414928 - 2414886
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2414928 aattttatagggactaaaaccatatttaaccctatattatatt 2414886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 7637046 - 7637116
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  7637046 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaa 7637116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 766
Target Start/End: Original strand, 7921248 - 7921282
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7921248 tttatagggactaaaaacatatttaaccctttatt 7921282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 770
Target Start/End: Original strand, 12179760 - 12179798
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12179760 tttatagagaccaaaaacatatttaacccttttttatat 12179798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 770
Target Start/End: Original strand, 12424188 - 12424226
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12424188 tttatagagaccaaaaacatatttaacccttttttatat 12424226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13323963 - 13323894
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13323963 gggttaaatatgtttttagtccttataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 13323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 27751210 - 27751176
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27751210 tttatagagactaaaaacatagttaaccctttatt 27751176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 28174241 - 28174311
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  28174241 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 28174311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 491
Target Start/End: Original strand, 30839040 - 30839098
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaa 491  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  30839040 aaaaattataattttttaacatgaaattaattaaacatgaattttttaaaatgtcaaaa 30839098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32099194 - 32099160
Alignment:
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32099194 ttttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttt 32099160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 292
Target Start/End: Original strand, 32513952 - 32513986
Alignment:
Q  258 aacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32513952 aacttctaagtttaatccttacttaattttaatag 32513986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 35862921 - 35862990
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35862921 gggttaaatacgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 35862990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 299
Target Start/End: Original strand, 36018028 - 36018066
Alignment:
Q  261 ttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36018028 ttttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttt 36018066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 36765700 - 36765630
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  36765700 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaacttcaagataaa 36765630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 762
Target Start/End: Original strand, 12667023 - 12667056
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12667023 aattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 12667056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21136355 - 21136287
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21136355 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 21136287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28695155 - 28695098
Alignment:
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  28695155 gttcatttactaaaattttaaattgtttaagatgagatgaattaaataagaatttttt 28695098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 31829257 - 31829220
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31829257 aattttataaagaccaaaaacatatttaaccctttatt 31829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 32243567 - 32243628
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32243567 tatgttttaggtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattataatag 32243628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32244790 - 32244741
Alignment:
Q  243 ccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  32244790 ccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttatttaattataatag 32244741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32988984 - 32988951
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaatt 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32988984 tagggttaaatatgtttttgatccctataaaatt 32988951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Original strand, 35209551 - 35209771
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||   |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||| ||| | ||||  || |||| ||    
T  35209551 aaaaattagaattttttaacaggtaatgaattaaatatattttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 35209650  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaa 631  Q
    |||||| |  ||||| |||| | |||||||||  ||||||| | |||| || ||  ||||||  || ||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  35209651 attttgagctaatttattgtggcggaactttttataatgttttaaacaagtatgtaaaaaatcattaaaaaacttaaaattttaagcat-aattaaacaa 35209749  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaa 653  Q
    |||| |||| |  |||||||||    
T  35209750 attttaatttaacagggactaa 35209771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 480
Target Start/End: Original strand, 39311466 - 39311507
Alignment:
Q  439 tagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta 480  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39311466 tagaattttttaacaaaaaatgaattaaatatgaatttttta 39311507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Original strand, 40304870 - 40304935
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| ||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40304870 ttaaatatgtttttggtccttataaacttgagaccttctaagtttagtccttacttaattttaata 40304935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 171)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 220 - 762
Target Start/End: Original strand, 53517656 - 53518199
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnt-t 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||          |    
T  53517656 atagggttaattatgtttttggtccctataaaattgagaacttttaagtttaatccttatttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaaat 53517755  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||    
T  53517756 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttatgataagtttataacactatga 53517855  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53517856 aaggttcatttactaaaatttagaaatttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaagacaaaagttaaagataaatttaacaaattctgg 53517955  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53517956 acgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagc 53518055  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  53518056 ataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggattaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaactt 53518155  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53518156 aaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 53518199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 222 - 760
Target Start/End: Original strand, 45419659 - 45420195
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||    
T  45419659 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctgagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaattac 45419758  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||| |||||||    
T  45419759 ttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacattatgaaa 45419858  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||| | ||||     
T  45419859 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaatataaaattaacaaaatctggac 45419958  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419959 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 45420058  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||    
T  45420059 aaa--aaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaattttttttaagggactaaaagaactattaaaattaagtaagaac-aaacttaa 45420155  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  45420156 aaggtcccaattttatagggaccaaaaacatattgaaccc 45420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 223 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 29348692 - 29348157
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |         |||||    
T  29348692 gggttaaatatgttcttagtccctataaaattacgaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctgcaaaagaaaattact 29348593  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |       | ||||| ||||||||||||||||||    
T  29348592 tctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatatttaaactcttaaatttttgaacgattttttta-gacaaatttataacactatgaaag 29348494  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  29348493 gttcatttactaaaatttagaattttttaacataaaacgaactaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacg 29348394  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29348393 taaaaatcaaattttgcgacaattttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaaactca--agtttaagcata 29348296  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  | | ||  ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29348295 aattaaacaaatttgaattgaagagggactaattctgggt-gcaattttttttttaggaactaaaagaattattaaaattaagtaaggactaaacttaaa 29348197  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29348196 aggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 29348157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 222 - 760
Target Start/End: Original strand, 44808713 - 44809250
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |         ||||    
T  44808713 agggttaaatatgtttttaatccctataaaattacgaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccatgcaaaagaaaattac 44808812  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatgaa 419  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |        | |||| |||||||||||||||||    
T  44808813 ttctaattttagttcatgttacaacaaagtttgttcaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaggtttataacactatgaa 44808912  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||    
T  44808913 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacataaaatgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattttga 44809012  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44809013 cgtaaaaatcaaattttgcgacaactttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacgtgtgcaaaaaattgtttaaaaactccagagtttaagca 44809112  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44809113 taaattaaacaaatttgaattgaggagggactaattttg---ggtgcaattttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaactta 44809209  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44809210 aaaggttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 44809250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 221 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 38174324 - 38173783
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         |||    
T  38174324 taggattaaatatgtttttggttcctataaaatagggaccttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccatacaaaaaaaaatta 38174225  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |          ||||||||| |||||||||||    
T  38174224 cttctaattttagtccctgttataacaaagtttatttaattatctttaaactcttaaattattgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaa 38174125  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||| |||||||| | | ||    
T  38174124 aggttcatatactaaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctaga 38174025  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38174024 cgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtataggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaaca 38173925  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  38173924 taaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatattgagtgcagaaaatttgtttaggaactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttg 38173825  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||  | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38173824 aaagtttcctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 38173783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 223 - 736
Target Start/End: Original strand, 40762476 - 40762989
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttactt 322  Q
    ||||||| ||| |||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||    
T  40762476 gggttaaatatatttttagtccttataaaattgggaatttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctagaaaaaaaattactt 40762575  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |          ||||||||| |||||||||||||     
T  40762576 ctaattttaatccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgattttttttaaacaagtttagaacactatgaaaga 40762675  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||| | | || ||    
T  40762676 ttcaattactaaaatctagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagatgaaattaacaaaatcttgacgt 40762775  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40762776 agaaatcaaattttacgataatattttgtagaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctatcaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 40762875  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaa 722  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||   |  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  40762876 attaaacaaatttgaattgaagagggactaatactgagtgcagaaaaaaaaattaaggactaaaagaattattaaaatttagtaagaactaaacttaaaa 40762975  T
Q  723 tgtcccaattttat 736  Q
     |||||||||||||    
T  40762976 ggtcccaattttat 40762989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 220 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27492737 - 27492194
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt- 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||        ||     
T  27492737 atagggttaaatatgtttttgatccctataaaattgagaacttctaagtttagtcctcaattaattttaatagcttttttattccctacaaaaaaaattt 27492638  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    |||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||    
T  27492637 acttataattttagtccatgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcccaaatttttgaacgatatttttgagacaagtttagaacactatga 27492538  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat-aaatttaacaaattgtg 517  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||  ||||||| | ||    
T  27492537 aatgttcatttattaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatttg 27492438  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||  |||| |||||     
T  27492437 gatgtagaaatcaaattttgcgataattttttgcggagaaacttttagtaatgttttaaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaacctaagaatttaaa 27492338  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga--ttggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |   | ||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  27492337 cataaattaaacaaatttgaattgagtagggactaatcctcaacgtagaaaaa---aaattaaggactaaaagaactattaaaattaaataaaaactaaa 27492241  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27492240 cttaaaagatcccaattttatatagattaaaaacatatttaaccctt 27492194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 223 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 23917739 - 23917212
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa-tccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||          ||     
T  23917739 gggttaaatatttttttggtccctataaaattgagaatttctaagtttagtccttacttaattttaataggtttttttagtccccacaaaaaaaaa-aca 23917641  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         ||||| |||| || ||||||||||    
T  23917640 tctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaaatttagaatactatgaaag 23917541  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||| ||||   |||     |||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||| | | |||| |    
T  23917540 gttcattaactatttttt-----tttttaacatgaaacgaat---ataggaatttcttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacacaatttggacg 23917449  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23917448 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagagaaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 23917349  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    ||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||| | | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23917348 aattaaacaaacttgaattgaggaggatctaatagtgagt-gcagaattttttgtaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaa 23917250  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23917249 agatctcaattttatagagaccaaaaacatatttaacc 23917212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 350 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 25250306 - 25249897
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 449  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250306 tttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 25250207  T
Q  450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250206 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 25250109  T
Q  550 gtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaggga 649  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25250108 gcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaagagtttaaatataaattaaacaaatttgaattgaggaggga 25250009  T
Q  650 ctaatactgattggaaaaattta-ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaa 748  Q
    |||||| ||| || | |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||   ||| ||||||||| ||| |||||    
T  25250008 ctaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaaagaaccattaaaattaattaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggacaaaaaa 25249909  T
Q  749 catatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||    
T  25249908 catatttaaccc 25249897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 223 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 11045823 - 11045282
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnt--tac 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||||| | |||||||           |||    
T  11045823 gggttaaatatgtttttgatccctataaaattgggaacttctaagtttagttcttactta-ttttaataagtttttaagtccctacaaaaaaaaaaatac 11045725  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| | |||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| || | |  ||||    
T  11045724 ttctaattttagtccctattacaatcaagtttgtt-aattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatagtgagaaa 11045626  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||| | ||||     
T  11045625 ggttcatttactaaaatttagaattttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaattaacaaaatctggac 11045526  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtc-tgcg-aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| | || | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11045525 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagcaattttcttaatacgacgtgtgcaaagaatgttcaaaaactcaagagtttaagc 11045426  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| || | || | |||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||    
T  11045425 ataaattaaacaaaattgaattaaggaatgactaattctaagtgcagaaaaatcttttagggactaaaagaactattcaaattaagtaaggattaaactt 11045326  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  11045325 aaaaggtcccaattttatagggacctaaaacatatttaaccctt 11045282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 398 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 21749810 - 21749446
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21749810 gacaagtttagaatactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaatatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 21749711  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  21749710 gataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttaagacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgttcgtaaaaaattgtt 21749611  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaa-aagaactatta 696  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | || ||| |||||| |||||| |  |||| |||    
T  21749610 caaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattgaggagagactaatactgagtgcagaatttttttttaaagactaacataaactttta 21749511  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  21749510 aaattaagtaaggactgaacttaaaaggtcccaattttatagggaccataaacatatttgaccct 21749446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 401 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 53397338 - 53396980
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaa--catgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  53397338 aagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaaaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaag 53397239  T
Q  499 ataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttc 598  Q
    ||| |  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  53397238 atagaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataaatttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgacaaaaaattgtta 53397139  T
Q  599 aaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaa 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | ||  || || |||||||||||| ||||||||||    
T  53397138 aaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaa 53397039  T
Q  699 attaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53397038 attaagtaaggactaaacttataatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 53396980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 344 - 638
Target Start/End: Original strand, 23883387 - 23883681
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||         |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23883387 acaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttagaacaattttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaatatttacaa 23883486  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||    
T  23883487 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtaacaa 23883586  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaa 638  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23883587 ttttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaatttaaa 23883681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 37179240 - 37178823
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37179240 acaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaaattttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaa 37179141  T
Q  444 tttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |    
T  37179140 tttttttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaatgtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgata 37179041  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37179040 attttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 37178941  T
Q  643 ggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | || |||||||| ||| || | ||  || || |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  37178940 gcagagactaatattgagtgcataatatttttgtaagaactataacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattgtatagggat 37178841  T
Q  743 taaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37178840 taaaaacatatttaaccc 37178823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 398 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 32147240 - 32146884
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  32147240 gacaagtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaa 32147141  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||   ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32147140 gataagagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtt 32147041  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| || | ||  || || ||||      || |||||||||    
T  32147040 aaaaaacttaagagtttaagcataaattagacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcataatatttttgtaag------aacaactattaa 32146947  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32146946 aattaagtaatgactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 32146884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 317 - 759
Target Start/End: Original strand, 45235314 - 45235758
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||           |||||||||| |||||| |    
T  45235314 ttacttctaaatttagtccatgctaaaacaaagtttgtttaattatccataaactcttaaattttttaacggttttattgagacaagtttagaacacttt 45235413  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtt-aaagataaatttaacaaattg 515  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| || ||||||| |  |||  || |     
T  45235414 gaaaggttcaattactaaaatttagaatattttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaattttaaagatacaagtaattaaatc 45235513  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaa-ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttt 614  Q
    ||||  || |||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45235514 tggacatataaataaaattttgcgataaattttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaacttaagagttt 45235613  T
Q  615 aagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg-gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggccta 713  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45235614 aagcataaattaaacaaatttgaattgagcagcgactaatactgagtgcgtagtattt-ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggacta 45235712  T
Q  714 agcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45235713 aacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 45235758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 50615054 - 50615484
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  50615054 ttacttataattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattttccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactat 50615153  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  50615154 gaaaggttcaattaaaaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 50615253  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||             | ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50615254 ggacatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 50615340  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| || |     || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  50615341 gaataaattaaacaaatttgaattgagcagagaataatattgaatgcattgtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaac 50615440  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50615441 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 50615484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 233 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 11294202 - 11293783
Alignment:
Q  233 tgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttag 332  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||| ||||||||||||    
T  11294202 tgtttttggtctctataaaattgagaacttctaagtttaatctttacttaattttaataggttttttactcccta-aaaaaaaattatttctaattttag 11294104  T
Q  333 tccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttact 432  Q
    ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |          ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11294103 tccctagtacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgacttcttttacacaagtttagaacactatgaaaagttcatttact 11294004  T
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtt-aaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| | |||||| | ||||  ||||||| ||    
T  11294003 aaaatttagaattttttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggtaaaagttaaaagataaaataaacaaaatctggacttagaaataaa 11293904  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaaca---cgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaa 628  Q
    ||||||| ||||||||||| |          ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11293903 attttgcaacaattttttgca----------taggaatgttcttaacacgtcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcatagattaaa 11293814  T
Q  629 caaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    || |||| ||||||  | |||||||||||||    
T  11293813 cagatttgaattgaataaggactaatactga 11293783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 223 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 46295474 - 46294931
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttac 320  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||    
T  46295474 gggttaaatatatttttggtccctataaaattgtgaccttctaagtttaatccttacttaattttaatagcttttttaatccctacaaaaaaaaatttac 46295375  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    || |||||||||||| |  ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| ||||||||||||    
T  46295374 ttataattttagtccctcctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaa 46295275  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaa-gttaaagataaatttaacaaat-tgtgg 518  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |  |||||||  | |||    
T  46295274 ggttcatttactaaaatctataattttttaacattaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgg 46295175  T
Q  519 aagtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    | |||||||||||||||| |||| | ||||||   ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  46295174 acgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttgaaaaacttaagagtttaag 46295076  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||| || | || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  46295075 cataaattaaacaaatttggattgagtaaggactaatattgaatgcagaatttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaact 46294976  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || ||  || ||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||    
T  46294975 tacaagatcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccctt 46294931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 117417 - 117847
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| ||||||||    
T  117417 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactat 117516  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  117517 gaaaggttcaattaataaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaaaatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 117616  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||             | |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  117617 ggacatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 117703  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  117704 gaataaattaaacaaatttgaattgagcatagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaac 117803  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  117804 ttaaaatgcctcaattttatagaaactaaaaacatatttaaccc 117847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 19669998 - 19669582
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19669998 acaaaatttatttaattattcttgaactcttaaatttttgaacgattttttta-gacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaa 19669900  T
Q  444 tttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||| | |    
T  19669899 tttttttaacatgaaacgaattaaatacgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaata 19669800  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaac-tcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattg 641  Q
    | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19669799 actttttgcggaggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 19669700  T
Q  642 aggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagaga 741  Q
    || || |||||||||||| || | |   || || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| | ||    
T  19669699 agcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaagga-ttaaacaactattaaaattaagtaaggactaaaattaaaatgcctcaattttatgggga 19669601  T
Q  742 ctaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19669600 cttaaaacatatttaaccc 19669582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 264 - 761
Target Start/End: Original strand, 39562461 - 39562964
Alignment:
Q  264 taagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-----ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaa 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||             |||||| |||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||    
T  39562461 taagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctacaaaaaaaaaaaatttacttataattttagtccctgctaaaataaattttgcttaa 39562560  T
Q  359 ttatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaa 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39562561 ttatccttaaactcttaaattttttaacaattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 39562660  T
Q  459 cgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagagg 556  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||   ||||    
T  39562661 taaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataactaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gagg 39562759  T
Q  557 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatac 656  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||||||||     
T  39562760 accttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattcagtaaggactaatat 39562859  T
Q  657 tgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    ||| || | |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||| || ||| ||||||| | | |||  |||||||| |||    
T  39562860 tgagtgcagaaattttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggattaaacttacaaggtcacaattttgttgggaccgaaaacataatta 39562959  T
Q  757 accct 761  Q
    |||||    
T  39562960 accct 39562964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Original strand, 44557576 - 44557982
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||       
T  44557576 acaaagtttgtttaattatccttaatctcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaatt 44557675  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || ||||||||||||||         
T  44557676 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgc----- 44557770  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaa---gagtttaagcataaattaaacaaatttaaatt 640  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||   ||   ||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44557771 --------agcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaaaaaaaaaagagtttaggaataaattaaacaaatttgaatt 44557862  T
Q  641 gaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagag 740  Q
    ||| || |||||||| ||| || | ||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  44557863 gagcagagactaatattgaatgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataggg 44557962  T
Q  741 actaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44557963 actaaaaacatatttaaccc 44557982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 401 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 53439551 - 53439209
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  53439551 aagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaa-tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagat 53439453  T
Q  501 aaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaa 600  Q
    |||  ||| ||| | ||||  || |||| ||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||    
T  53439452 aaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcg-------------gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgaaaaaaaattgttaaa 53439366  T
Q  601 aaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaat 700  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | ||  || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  53439365 aaacgtaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaaat 53439266  T
Q  701 taagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53439265 taagtaagtactaaacttataatgtctcaattttataggaactaaaaacatatttaa 53439209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 414 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 19601777 - 19601432
Alignment:
Q  414 tatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaa 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  19601777 tatgaaaggttcatttgctaaaatttagaattttttaacacgaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaagttcaagataaaagtaacaaaa 19601678  T
Q  513 ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagt 612  Q
     | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |||| ||||||  ||||||    
T  19601677 atctggatgtagaaattaaattttgcgataattttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtttgcaaaagaatgttaaaaaacataagagt 19601578  T
Q  613 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || | || ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |    
T  19601577 ttaaacat-aattaaacaaatttgaattgagtaggtactaataccgagtgcataatttttttataaggactaaaatatctattaaaattaagtaatgatt 19601479  T
Q  713 aagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    || |||| || ||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  19601478 aaacttagaaggtctcaattttatagggatcagaaacatatttaacc 19601432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 45407081 - 45406698
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||        |||||    
T  45407081 agggttaaatatgttttttgtccctataaa-ttggaaacttctaagtttagtccttacgtaattttaatagcttttttactccctacaaaaaaaattact 45406983  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | |||||||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | || ||||||| |||||||||||||    
T  45406982 tataattttagtccatgctaaaacaaa-tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttataagaaaagtttagaacactatgaaag 45406884  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaaga-taaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||     
T  45406883 gttcatttactaaaatttagaattttctaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagattaaaagtaacaaaatctggat 45406784  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
    ||| |||||||||||||||             ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45406783 gtaaaaatcaaattttgcg-------------gagaaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagca 45406698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 759
Target Start/End: Original strand, 54268718 - 54269256
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnn 311  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||   || || |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  54268718 tattaattaaaggtttaaatatgtttttggtccctataaaattgaaaatttataagtttagtttttacttaattttaatagcttttttaatccctacaaa 54268817  T
Q  312 nnnnntt-acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataa 410  Q
         || || | |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||   | ||||| ||    
T  54268818 aaatatttacatgtaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac--------gattttatgtttagaa 54268909  T
Q  411 cactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaaca 510  Q
    || | | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | | |||||||  | ||||||||   ||||    
T  54268910 catt-tcaaaagatcatttcctaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaacgacaaaaaatcaagataaaagcaaca 54269008  T
Q  511 aattgt-ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 609  Q
    ||   | |||  |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  54269009 aaaaattggacttagaaatcaaattttgagataattttttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaag 54269108  T
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||| ||| ||||| || | || |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  54269109 agtttaagcat-aattaaccaaatttgaatttagtagggattaaaactgagtgcataatttttgtttaaggactaaaaatactattaaaattaagtaaga 54269207  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
     |||| |||||||   | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  54269208 actaa-cttaaaaaaactcaattttatagggatcaaaaacatatttaacc 54269256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 221 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 34995952 - 34995420
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||    
T  34995952 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacatctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctacaaaaaaaattac 34995853  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatga-caagtttataacactatgaa 419  Q
     | |||||||||||| || ||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |          | ||  |||| |||| ||| ||    
T  34995852 atataattttagtccctgctaaaactaaatttgtttaattatccttaaactattaaattttagaacgatttttttggaaacacttttagaacattataaa 34995753  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||  | ||||  | ||||    
T  34995752 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgagatgaattaaatatgattttttttaaatgacaaaatttcaagataaaagtcacaagct-tgga 34995654  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     ||||||||||| |||||    ||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||        |||||    
T  34995653 cgtagaaatcaatttttgaactaatttttcgtggagcaacttttagtaatgttttgaacacgtctataaaaaattgttcaaaaactc--------aagca 34995562  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattt-taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    | ||||||||| |||| |||| || |||||| || | ||| || | || ||| ||| || |||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  34995561 t-aattaaacagatttgaatttagaagggaccaaaagtgagtgtagaattttttttatagggactagaaaacctattaaaattaagtaaggactaatctt 34995463  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34995462 aaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 34995420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 32943311 - 32942870
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||  ||||||||    
T  32943311 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagttttgaacactat 32943212  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |  |||||||| |    |||| | || | ||       
T  32943211 gaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaatattaaaagaattaaatatgaatttttgaa-acaacaaaagtaa----taaaatcaagacat--- 32943120  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
          | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32943119 ------ataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 32943026  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattt-----------taaggactaaaagaactattaaaattaag 704  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | || | |  |||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32943025 gcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactaagtgcatagtatttcttttagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaag 32942926  T
Q  705 taaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||| |||| || |||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32942925 taaggactaaactcaaaatgcctcaattatatagggacaaaaaacatatttaaccc 32942870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 33475677 - 33475359
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||  ||||||| || |||| |||||||| |||    
T  33475677 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaa 33475578  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  33475577 ttttgtgataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 33475479  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||||||| |  | ||||||| ||||| | | | ||||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  33475478 tttaaatttactaaggactaaaactgagt-gcataattttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaatt 33475380  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  33475379 ttatagggacaaaaaacatat 33475359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 44556125 - 44555806
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || ||||| |||||||| || |||| | |||||| |||    
T  44556125 aaatttagaattttttattatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaattaacaaaattctggacgcagaaataaaa 44556026  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  44556025 ttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 44555927  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||    
T  44555926 tttaaatttagtagggactaaaactgaatgcataattgttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttgaaagatcccaatt 44555827  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  44555826 ttatagagaccaaaaacatat 44555806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 52701404 - 52701050
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  52701404 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaggacaaaagttcaaa 52701305  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||||||  | | || | | |||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  52701304 ataaaagtaacaaaaatctagacgcataaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgtaaaaaattgtt 52701205  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||||    
T  52701204 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtaggtactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattaa 52701106  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52701105 aattaagtaaagactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 52701050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 753
Target Start/End: Original strand, 41927919 - 41928244
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtaga 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||  |||||||  | |||| | |||    
T  41927919 tttactaaaatttagaactttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaaa--gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcaga 41928016  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttctt-aacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |    
T  41928017 aataaaattttgatataattttttgcatatgaacttttcgtaatgttctttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-t 41928115  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  41928116 taaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaagg 41928215  T
Q  725 tcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41928216 tcccaattttatagggaccaaaaacatat 41928244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 533 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 53377433 - 53377205
Alignment:
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttctt--aacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 630  Q
    |||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53377433 ttttgcgataatttttcgcgaaggaacttttattaatgttcttttaacacgtctgcaaacaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaca 53377334  T
Q  631 aatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaa 730  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||   |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||    
T  53377333 aatttgaaatgagtagggactaatactgaatggagaaa--aaaattaagaagtaaaagaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgttacaa 53377236  T
Q  731 ttttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53377235 ctttatagggactaaaaacatatttaaccct 53377205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 8575953 - 8576309
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta-agatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||||||| |||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||    
T  8575953 acaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaaagacaaaagttcaa 8576052  T
Q  498 gataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaa-tgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 595  Q
     |||||  |||||||  | | ||   |||||| |||||||| || ||||||||| | | ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  8576053 aataaaagtaacaaaaatctagacacagaaataaaattttgagataattttttgcatatgaacttttcctaaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattg 8576152  T
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatt 695  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||    
T  8576153 ttcaaaatcttaaaagtttaaacataa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactatt 8576251  T
Q  696 aaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  8576252 aaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggagcaaaaacatat 8576309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 50614615 - 50614428
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || | ||  ||     
T  50614615 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaatactgagtgtataatattt 50614516  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50614515 ttgtaaggattaaaacaactattaaaattaaataaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagagactaaaaatatatttaaccc 50614428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 553 - 758
Target Start/End: Original strand, 37481261 - 37481467
Alignment:
Q  553 gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaac-tcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggact 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37481261 gaggaacttttagtaatgttcttaacacatctataaaaaattgttaaaaaacattaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaagagagact 37481360  T
Q  652 aatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacat 751  Q
    ||| |||| || |  |  || || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  37481361 aattctgagtgcatgatatttttgtaagcactaaaacaactattaaaattaaataaggattaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacat 37481460  T
Q  752 atttaac 758  Q
    |||||||    
T  37481461 atttaac 37481467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 494
Target Start/End: Original strand, 23920953 - 23921220
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttct 324  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||   || || |||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||        ||| || |    
T  23920953 gttaaatatgtttttgattcatataaaattcaaaatttctaagtttagttattacttaattctaataaattttttagtccctacaaaaaaaattattttt 23921052  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | || |||||||||||||||||||||| |    
T  23921053 aattttagtctctgttatagcaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttta-gataagtttataacactatgaaaggct 23921151  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtt 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23921152 cattttctaaaatttagaattttttaacatgaaa-gaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 23921220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 456 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28685487 - 28685280
Alignment:
Q  456 aaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagag 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||| ||| | ||||  || |||| ||||||||     |||||||   |||    
T  28685487 aaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaataaaatttggacatataaattaaattttg-----attttttacggag 28685393  T
Q  556 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||    
T  28685392 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcacatttaaattgatgagaaactaata 28685293  T
Q  656 ctgattggaaaaa 668  Q
    |||| || |||||    
T  28685292 ctgagtgcaaaaa 28685280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 44555433 - 44555245
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || | |   ||     
T  44555433 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaatactgagtgcatagtattt 44555334  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc-ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44555333 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 44555245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 116993 - 116806
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || | |   ||     
T  116993 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaatattgagtgcatagtattt 116894  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  116893 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctccattttatagggactaaaaacatatttaaccc 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 53377689 - 53377430
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tt 318  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          ||    
T  53377689 atagggttaaatatgtttttagtccctataaaattaggaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtccctataaaaaataatt 53377590  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatg 417  Q
    |||| |||||||| |||||| ||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| ||||| |        | ||||| |||| |||||| ||    
T  53377589 acttataattttaatccttgctaaaa-aaagtttgttttattatcattaaacttttggatttatgaacgatttttttttagacaaatttagaacactctg 53377491  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53377490 aaaggttcatttactaaaatttagaattttctaacatggaacgaattaaatatgaattttt 53377430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 521 - 763
Target Start/End: Original strand, 15772039 - 15772280
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  15772039 gtagaaatcaaattttgagataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtttaaaaacttaagattttaagcat 15772138  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || | | |||| || || ||||||||   |||| |||| |||||||||| |||| ||||     
T  15772139 -aattaaacaaatttgaatttaggagggactaaaactgagtgcatatattttttatagggactaaacatactaataaagttaagtaaggactaaacttag 15772237  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    || ||||   ||||||||   | |||||||||| |||||||||    
T  15772238 aaagtccagtttttataggtgcgaaaaacatatgtaacccttt 15772280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 401 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 31991308 - 31990956
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat 500  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | | |||||||||| || ||    
T  31991308 aagtttagaacattacaaaaggtttgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaataagaatttttttaaaagacaaaagttcaaaat 31991209  T
Q  501 aaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttca 599  Q
    |||  |||| ||| | |||| | |||||| |||||||| || || |||||| | |  ||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  31991208 aaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattttgagataagtttttgcaaataaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgttca 31991109  T
Q  600 aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaa 699  Q
    ||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| | || || || | || ||| || || |||| ||||  ||||||||||    
T  31991108 aaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaatttagatttattagggactgaaacagagtgcataatttttttatatggaccaaaatcactattaaaa 31991010  T
Q  700 ttaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||| |  ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31991009 ttaagtaaagattaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 31990956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 32943870 - 32944021
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || | | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32943870 caagagtttaagcataaattgaacaaattcgaattgagcagggactaatactgagtgcatagattt-ttataaggactaaaacaactattaaaattaagt 32943968  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32943969 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 32944021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 402 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 9018260 - 9018125
Alignment:
Q  402 agtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagata 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9018260 agtttataacactgtgaaaggttcatttacaaaaatttagaattttttaacatgaaataaattcaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagata 9018161  T
Q  502 aatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttg 537  Q
    || | |  ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  9018160 aaataacaaaaatatggaagtaaaaatcaaattttg 9018125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 25232900 - 25232695
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa-ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||    
T  25232900 acaagtttagaacattagaaaaggttcgtttactaaaatttagaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa 25232801  T
Q  498 gataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
     |||||  |||||||  | |||| | | |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25232800 aataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaattttgagataattttttgtagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgt 25232701  T
Q  597 tcaaaa 602  Q
    ||||||    
T  25232700 tcaaaa 25232695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 399 - 636
Target Start/End: Original strand, 33476241 - 33476478
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | | |||||||||| ||     
T  33476241 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 33476340  T
Q  499 at-aaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    || ||| | || ||| | |||| | |  ||| |||||||| || ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  33476341 ataaaagtaaaaaaaatctggacgcatgaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacctgtgcaaaaaattgtt 33476440  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattta 636  Q
    ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33476441 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattta 33476478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 45234753 - 45234599
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| | || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45234753 caagaatttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagtgactaatacttagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 45234654  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45234653 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 45234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 754
Target Start/End: Original strand, 37179827 - 37179975
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37179827 caagagtttaagcttaaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 37179926  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||    
T  37179927 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttgcagggactaaaaacatatt 37179975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 621 - 760
Target Start/End: Original strand, 54185590 - 54185729
Alignment:
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54185590 aaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaatgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaa 54185689  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54185690 aatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 54185729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 419 - 612
Target Start/End: Original strand, 44287839 - 44288028
Alignment:
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtg 517  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| || ||| ||||||||  |||| |||   ||    
T  44287839 aaggttcatttgctaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttttaaacgacgaaggtttaagataaaagtaacaaaaaattg 44287938  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagt 612  Q
    || |||||| |||||      || |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  44287939 gacgtagaattcaaa-----agataattttgtatggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtcaaaagttgttcaaaaacttaagagt 44288028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 545 - 653
Target Start/End: Original strand, 3173707 - 3173815
Alignment:
Q  545 tttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgagg 644  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  3173707 tttttgcagagaaacttatagtaatgttcttaacgcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagaatttaatcataaattaaacaaatttgaattaagg 3173806  T
Q  645 agggactaa 653  Q
    |||||||||    
T  3173807 agggactaa 3173815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 27868110 - 27867960
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |    | || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27868110 caagagtttaagc-taaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtaattttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 27868012  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    || | |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27868011 aatgactaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaacatatttaa 27867960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 41927501 - 41927160
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  41927501 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 41927402  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | ||||||             || |||||| |||  ||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  41927401 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaat-------------aaatttttgcagataaactttttgtgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 41927315  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || ||   ||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || ||||||| |  |||| ||     
T  41927314 caaaatcttaactatttaaacat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaagaacactaatat 41927216  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41927215 aattaaataaggactatacttaaaatgtcccaattttatagggaccaaaaacatat 41927160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 52701901 - 52702066
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattt-taaggactaaa 686  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| ||| || ||||||||    
T  52701901 aaaaattgttcaaaatcttaagagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataattttttttatatggactaaa 52701999  T
Q  687 agaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52702000 aacactattaaaattaagtaaggactaaactaaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 52702066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 1430162 - 1430315
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1430162 caagagttaaagcataaattgaataaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtatttttgaaaggactaaaacaactattaaaattaagt 1430261  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||  ||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1430262 aaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 1430315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 32147859 - 32148011
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32147859 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggaataaaacaactattaaaattaagt 32147958  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||   ||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  32147959 aagaattaaacttaaaatgcctcaattttacggggactaaaaacatatttaac 32148011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 419 - 604
Target Start/End: Original strand, 26268642 - 26268826
Alignment:
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtg 517  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||  ||| |||  | ||    
T  26268642 aaggttcatttactaaattttttttttttttaacataagatgaattaaatatgaattttttaac--gacaaaagttcaagataaaagtaataaaaatatg 26268739  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaac 604  Q
    |  ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  26268740 ggcgtagaaatcaaattttgagctaattttttgcagagaaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaattgttcgaaaac 26268826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 596 - 760
Target Start/End: Original strand, 25250271 - 25250435
Alignment:
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttat-tttaaggactaaaagaactat 694  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |  ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  25250271 ttcaaaaatttaagagtttaaggataatttaa-caaatttgaattgaggagggactaatagtgagtgcagatttttatatttagggactaaaagaaccat 25250369  T
Q  695 taaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||| |||||||||| ||||  || |||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25250370 taaagttaagtaaggactaaagttgaaagatccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 25250435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 399 - 494
Target Start/End: Original strand, 44556687 - 44556782
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtt 494  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  44556687 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtt 44556782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 45387566 - 45387449
Alignment:
Q  488 aaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcg 587  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45387566 aaaagtaaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcgtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctaca 45387467  T
Q  588 aaaaattgttcaaaaact 605  Q
    |||||||||| |||||||    
T  45387466 aaaaattgttaaaaaact 45387449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 307
Target Start/End: Original strand, 34995418 - 34995505
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34995418 atagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagattagtccttacttaattttaataggttttctagtcccta 34995505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 291
Target Start/End: Original strand, 29348156 - 29348226
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29348156 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaata 29348226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 53377605 - 53377687
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53377605 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcctaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 53377687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 53518198 - 53518116
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  53518198 agggttaaatatgtttttagtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttaatcc 53518116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 11045283 - 11045368
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  11045283 agggttaaatatgttttaggtccctataaaattgggaccttttaagtttaatccttacttaatttgaatagttcttttagtcccta 11045368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14525208 - 14525123
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14525208 gggttaaatatgtttttcgtccctataaatttgggaatttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctac 14525123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 564 - 753
Target Start/End: Original strand, 25233079 - 25233267
Alignment:
Q  564 agtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgg 663  Q
    ||||||||||||||||| |  |  ||||||| ||||||| || || ||||||| || || |||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||     
T  25233079 agtaatgttcttaacactttggaaaaaaattattcaaaatcttaaaagtttaaacacaa-ttaagcaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgc 25233177  T
Q  664 aaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
      || ||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25233178 ttaatttttttacatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttacaattttatagagaccaaaaacatat 25233267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44809250 - 44809166
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  44809250 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattggaaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 44809166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 45387401 - 45387321
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45387401 gactaaaacatctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatattcaaccc 45387321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 3173809 - 3173891
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  3173809 ggactaaaagaactgttaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcccaattgtatagggaccaaagacatatttaaccct 3173891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 8575374 - 8575193
Alignment:
Q  571 ttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatt 670  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||||||| || || | ||||||||||  ||||||| ||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||    
T  8575374 ttcttaacacttgtgcaaaaaattattcaaaatcttaaaactttaagcatag-ttaaacacatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataattt 8575276  T
Q  671 tattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | || |  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8575275 ttttatttggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagattccaattttatagggacaaaaaacatat 8575193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3173892 - 3173807
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  3173892 tagggttaaatatgtctttggtccctatacaattgggaccttttaagtttaatccttacttaattttaacagttcttttagtccct 3173807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 40762557 - 40762476
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  40762557 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattcccaattttataaggactaaaaatatatttaaccc 40762476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 38173781 - 38173853
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38173781 atagggttaaatatgtttttggtccctataaaataggaaactttcaagtttagtccttacttaattttaatag 38173853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39562965 - 39562882
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39562965 tagggttaattatgttttcggtcccaacaaaattgtgaccttgtaagtttaatccttatttaattttaatagcttttttaatcc 39562882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 45419741 - 45419658
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45419741 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaactcagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 45419658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 589 - 754
Target Start/End: Original strand, 41786332 - 41786486
Alignment:
Q  589 aaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaag 688  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |           || |||||| |||||     
T  41786332 aaaattgttaaaaaacttaagggtttatgtataaattaaacaaatttgaatggagcagagactaatactgagtt----------ttgtaaggattaaaac 41786421  T
Q  689 aactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41786422 aactattaaaattaagtaaagattaaacttaaaatgcctcaattttatag-gactaaaaacatatt 41786486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Original strand, 46294932 - 46295014
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  46294932 agggttaattatgttttcggtccctacaaaattgcgatcttgtaagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaatcc 46295014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8576308 - 8576247
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8576308 tatgtttttgctccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 8576247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 14525127 - 14525208
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14525127 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattcccaaatttatagggacgaaaaacatatttaaccc 14525208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Original strand, 23917207 - 23917280
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23917207 tatatggttaaatatgtttttggtctctataaaattgagatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 23917280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 31990957 - 31991018
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31990957 tatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagtttaatctttacttaattttaatag 31991018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Original strand, 33225673 - 33225746
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33225673 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgagatcttctaagtttagtccttacttaattttaatagttttttt 33225746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41928243 - 41928182
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41928243 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 41928182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 19601432 - 19601500
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19601432 ggttaaatatgtttctgatccctataaaattgagaccttctaagtttaatcattacttaattttaatag 19601500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 757
Target Start/End: Original strand, 33226683 - 33226829
Alignment:
Q  612 tttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaa--ctattaaaattaagtaagg 709  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||| ||| || | |||||| |  || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  33226683 tttatgcataaattaaacaaattgga-ttgagtaaggactaatattgagtgcagaaatttttcatagggactaaaataaaactattaaaattaagtaaga 33226781  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
     |||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33226782 actaaacttagaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 33226829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 44808795 - 44808711
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44808795 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttatagggattaaaaacatatttaacccttt 44808711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31992053 - 31991994
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31992053 tatgttttttattcctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattttaat 31991994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Original strand, 3173644 - 3173710
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttt 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3173644 tagggttaaatatgtttttgatcctattaaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaatttt 3173710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 761
Target Start/End: Original strand, 34995881 - 34995951
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34995881 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagatgttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 34995951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Original strand, 38174241 - 38174319
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  38174241 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttataggaaccaaaaacatatttaa 38174319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44557007 - 44556953
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44557007 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaatt 44556953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 8575194 - 8575255
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8575194 tatgttttttgtccctataaaattggaatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 8575255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 742
Target Start/End: Original strand, 16056211 - 16056343
Alignment:
Q  609 gagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaag 708  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||  |||||||| ||| | || | |||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||     
T  16056211 gagtttaagtataatttaa-caaatttcaatttagatgggactaaaactaagtgaataaattttttataaagacttaaaaaactattaaaattaagtaaa 16056309  T
Q  709 gcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | |||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  16056310 gactaaacttaaaatattctaattttatagagac 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 29348611 - 29348692
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29348611 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttatagggactaagaacatatttaaccc 29348692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 684 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 33225746 - 33225673
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33225746 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagatctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 33225673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 52701051 - 52701112
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52701051 tatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagtttagtctttacttaattttaatag 52701112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52702065 - 52702004
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52702065 tatgtttttggtccctataaaattgggacttttttagtttagtccttacttaattttaatag 52702004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 54185729 - 54185660
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54185729 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 54185660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15771856 - 15771776
Alignment:
Q  682 ctaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  15771856 ctaaaatagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagtttccaattttatggaggccaataacatatttaaccctt 15771776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 289
Target Start/End: Original strand, 21749445 - 21749513
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    |||||| || ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21749445 tagggtcaaatatgtttatggtccctataaaattgggaccttttaagttcagtccttacttaattttaa 21749513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 757
Target Start/End: Original strand, 23883683 - 23883743
Alignment:
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23883683 aaattaagtaaggactaaacttgaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 23883743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 753
Target Start/End: Original strand, 25353255 - 25353363
Alignment:
Q  645 agggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagacta 744  Q
    ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  25353255 agggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaagaactatacttaaaaggttccaattttatagggacta 25353354  T
Q  745 aaaacatat 753  Q
    |||||||||    
T  25353355 aaaacatat 25353363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28260618 - 28260538
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28260618 ttaaatatgtttttggtccttataaaatttggatattttaaatataattcttacttaattttaatagtttttttagtccct 28260538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 380
Target Start/End: Original strand, 15771777 - 15771936
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttac 320  Q
    |||||||| |||||| |||  | | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||         ||||    
T  15771777 agggttaaatatgttattggcctccataaaattggaaacttttaagtttagtccttacttaattttaatagctattttagaccctacaaaaaatatttac 15771876  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaattt 380  Q
     | ||||| |||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15771877 atgtaattctagtccctgctaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttatattt 15771936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 753
Target Start/End: Original strand, 44556953 - 44557008
Alignment:
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44556953 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 44557008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45420187 - 45420113
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  45420187 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagttt-gttcttacttaattttaatagttcttttagtccct 45420113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19601968 - 19601886
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | || || ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  19601968 ttaaatatgtttttggtccatataaaattggaaatttctaagtttaatcttcacttaaatttaatagcttttttagtccctac 19601886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 23917657 - 23917739
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaac-tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  23917657 ggactaaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaattctcaattttatagggaccaaaaaaatatttaaccc 23917739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33226829 - 33226763
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33226829 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaccttctaagtttagttcttacttaattttaatag 33226763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 37178823 - 37178892
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37178823 gggttaaatatgtttttaatccctatacaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 37178892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40126990 - 40126920
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  40126990 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaa 40126920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 44555245 - 44555315
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44555245 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggcattttaaagtttagtccttacttaattttaatag 44555315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44557982 - 44557913
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44557982 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 44557913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 45234599 - 45234668
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45234599 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 45234668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50615484 - 50615415
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50615484 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 50615415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 53517740 - 53517658
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  53517740 ggactaaaaaacctattaaaattaaataaggattaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaaaaacataattaaccct 53517658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1430315 - 1430247
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1430315 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 1430247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 613 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 14525102 - 14525053
Alignment:
Q  613 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  14525102 ttaagcataaattaaacaaatttgaattgaagagggaccaatactaattg 14525053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25233266 - 25233205
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| || ||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25233266 tatgtttttggtctctataaaattgtaaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 25233205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 33475360 - 33475421
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33475360 tatgttttttgtccctataaaattggaaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 33475421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40325861 - 40325824
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttt 381  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40325861 acaaaatttgtttaattatccttaaacttttaaatttt 40325824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 44555807 - 44555868
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44555807 tatgtttttggtctctataaaattgggatctttcaagtttagtccttacttaattataatag 44555868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45235758 - 45235690
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45235758 ggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 45235690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 760
Target Start/End: Original strand, 46295405 - 46295474
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  46295405 ctattaaaattaagtaaggattaaacttagaaggtcacaattttatagggaccaaaaatatatttaaccc 46295474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 46529692 - 46529628
Alignment:
Q  560 ttttagtaatgttcttaacac--gtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  46529692 ttttagtaatgttcttaacacatgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataa 46529628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Original strand, 47198987 - 47199207
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||| ||| | ||||  || |||| ||    
T  47198987 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggatctaaaaataaa 47199086  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaa 631  Q
    |||||| |  ||||| |||| | ||||| |||  ||||||| | |||| || ||  ||||||| || ||||| | || | ||||||||| ||||||||||    
T  47199087 attttgagctaatttattgtggcggaaccttttataatgttttaaacaagtatgtaaaaaattattaaaaaatttaaaattttaagcat-aattaaacaa 47199185  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaa 653  Q
    |||| |||| |  |||||||||    
T  47199186 attttaatttaacagggactaa 47199207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23883743 - 23883683
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattt 286  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23883743 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgggacttttcaagtttagtccttacttaattt 23883683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25250435 - 25250351
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||    
T  25250435 gggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggatctttcaactttagtccttacttaactttaatggttcttttagtcccta 25250351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28055364 - 28055288
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  28055364 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 28055288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28065789 - 28065713
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  28065789 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 28065713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32800008 - 32799933
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| |||||||| |||||    
T  32800008 aaaatttagaattttttaatatggaatgaattaagtatgaatttttgaa-atttcaaaagtttaagataaaattaac 32799933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37481467 - 37481400
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37481467 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttaatccttatttaattttaatag 37481400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 50133629 - 50133553
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||| ||||    
T  50133629 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaatctaac 50133553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 732 - 772
Target Start/End: Original strand, 54184787 - 54184827
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatattt 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54184787 tttatagggactaaaaacatatttaaccctttattttattt 54184827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 738
Target Start/End: Original strand, 31991984 - 31992039
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatag 738  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31991984 taaaagcacgattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatag 31992039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34226131 - 34226052
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  34226131 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 34226052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39341041 - 39340998
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaatta 255  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39341041 tatttattttagggttaaatatgtttttaatccctataaaatta 39340998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41786455 - 41786412
Alignment:
Q  261 ttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41786455 ttttaagtttaatctttacttaattttaatagttgttttaatcc 41786412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 53658005 - 53658084
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  53658005 aaaaattagaattttttaacatttaacgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 53658084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 869446 - 869516
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  869446 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 869516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 3078374 - 3078444
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  3078374 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 3078444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 4994099 - 4994169
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  4994099 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatgtttttaaaacgccaaaaattaaagataaa 4994169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9018438 - 9018280
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttacttct 324  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||    || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||          ||||| |    
T  9018438 ttaaatatgtttttggtccttataaaatggataatttttaagtttagtccttacttaattttaatacattttttagtccttacaaaaaaaaaatacttat 9018339  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttg 383  Q
    ||||||||||  || ||  ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9018338 aattttagtctctgctaaaacaatatttgtttaattatacttaaactcttaaatttttg 9018280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10182332 - 10182262
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  10182332 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 10182262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15490861 - 15490791
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  15490861 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaa 15490791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 16128533 - 16128603
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||  |||| || ||||||||    
T  16128533 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgcaaaaaattcaagataaa 16128603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 762
Target Start/End: Original strand, 16301297 - 16301327
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16301297 tttatagagactaaaaacatatttaaccctt 16301327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20078272 - 20078206
Alignment:
Q  216 tattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttactta 282  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  20078272 tattttagggttaaatatatttttgtttcctataaaattgagaatttctaagtttaatccttactta 20078206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 27492195 - 27492265
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  27492195 agggttaaatatgtttttaatctatataaaattgggatcttttaagtttagtttttatttaattttaatag 27492265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30778858 - 30778788
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  30778858 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 30778788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 32146884 - 32146953
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32146884 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtcattacttaattttaatag 32146953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 36777869 - 36777939
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  36777869 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 36777939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40630737 - 40630699
Alignment:
Q  347 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40630737 aagtttgtttaattatctttaaacttttagatttttgaa 40630699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 43660412 - 43660482
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  43660412 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 43660482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 45387329 - 45387390
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45387329 tatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 45387390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 45454337 - 45454407
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  45454337 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 45454407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 50362393 - 50362463
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  50362393 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 50362463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 53328515 - 53328585
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  53328515 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 53328585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Original strand, 53396980 - 53397046
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||  ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53396980 ttaaatatgtttttagtccctataaaattgagacattataagtttagtccttacttaattttaatag 53397046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Original strand, 53963597 - 53963655
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53963597 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaa 53963655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 757
Target Start/End: Original strand, 9018357 - 9018438
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||  |  | ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  9018357 taaggactaaaaaatgtattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattatccattttataaggaccaaaaacatatttaa 9018438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16056339 - 16056286
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16056339 ctataaaattagaatattttaagtttagtctttacttaattttaatagtttttt 16056286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 762
Target Start/End: Original strand, 28769646 - 28769679
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28769646 aattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 28769679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 636
Target Start/End: Original strand, 31991904 - 31991968
Alignment:
Q  571 ttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattta 636  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31991904 ttcttaacacttgtgcaaaatattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattta 31991968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 482
Target Start/End: Original strand, 44665062 - 44665111
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaag 482  Q
    |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  44665062 aaaaattagaatttttaaacatataatgaattaaatatgaattttttaag 44665111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 45344125 - 45344060
Alignment:
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||  | | |||||||| ||||||||    
T  45344125 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttataacgccaaaagttcaagataaa 45344060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 732 - 761
Target Start/End: Original strand, 48381471 - 48381500
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48381471 tttatagagactaaaaacatatttaaccct 48381500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 48586297 - 48586264
Alignment:
Q  445 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48586297 tttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttt 48586264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 231 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 40158676 - 40158145
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattt 329  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||| ||||    
T  40158676 tatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttagttaattttaataggttttttactccctacaaaaaaaaattacttcttattt 40158577  T
Q  330 tagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcattt 429  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40158576 tagtccttgttacgagaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataac-ctatgaaaggttcattt 40158478  T
Q  430 actaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatc 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||    
T  40158477 actaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattatggacgtagatatc 40158378  T
Q  530 aaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaac 629  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40158377 aaattttgcgaaatttttttgtagaggaactttttgtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaac 40158278  T
Q  630 aaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtccca 729  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  40158277 aaatttaaattgaggagtgactaatactgattggaaaaatttactttaagaactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtccca 40158178  T
Q  730 attttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40158177 attttatagggactaaaaacatatttaaccctt 40158145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 224 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 37103450 - 37102918
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||    
T  37103450 ggttaaatatgtttttgattcctataaaattggaaacttctaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaactacttc 37103351  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||    
T  37103350 taattttagtccttgttacaacaaagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggt 37103251  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagta 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||    
T  37103250 tcatttactaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgta 37103151  T
Q  524 gaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa 623  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37103150 gaaattaaattttgagataattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattattcaaaaattcaagagtttatgcataaa 37103051  T
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| | | | | | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||     
T  37103050 ttaaacaaatttgaattgagaagagactaatactaagt-gcagatttttttttaaagactaaaataactataaaaattaagtaaggattaaacttgaaag 37102952  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  37102951 gtcccaattttataga-atcaaaaacatatttaac 37102918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 225 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 10464154 - 10463621
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttc 323  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||  |||         |||||||    
T  10464154 gttaaatatgtttttggtccccataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaataaaaattttagtct-tacaaaaaagaattacttc 10464056  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||    
T  10464055 taattttagtccctattacaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggt 10463956  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagta 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||    
T  10463955 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgta 10463856  T
Q  524 gaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10463855 gaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaa 10463756  T
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||     
T  10463755 ttaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtg--cagtttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaa 10463658  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
      ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10463657 acccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 10463621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 222 - 762
Target Start/End: Original strand, 621501 - 622041
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||        |||||    
T  621501 agggttaaatatgttttttatccctataaaattgggaacttccaagtttagtccttaattaattttaataaattttttagtccctacaaaaaaagttact 621600  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |         ||||  |||| |||||||| ||||    
T  621601 tctaattttagtctctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttagaacgatttttatgagacagatttagaacactataaaag 621700  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  621701 gttcatttactagaatttacaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggatg 621800  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  621801 tagaaatcacattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgccaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcata 621900  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||  || | |||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||    
T  621901 aattaaagaaatttgaactgaggagggactaaaactggatgcagaaaaaaaatttatggactaaaagaactattaaaattaagtaagtattaaacttgaa 622000  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  622001 aggtcccaattttatagagaccagaaacatatttaaccctt 622041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 222 - 761
Target Start/End: Original strand, 8404268 - 8404812
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||    
T  8404268 agggttaaatatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaaaattac 8404367  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||||||  |||    
T  8404368 ttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactaaaaaa 8404467  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||| | || |    
T  8404468 ggttcatttaccaaaatttagattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatttgaa 8404567  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8404568 cttaaaaatcaaattttgcgacaactttttgcagatgaatttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagca 8404667  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggact-aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||   |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||| |    
T  8404668 taaattaaacaaacttgaattgaggagggactaatactgagtgtaggaaaaaaaaaattaaggactaaaaaaaactattaaaattaagtaaagattaaac 8404767  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||| ||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  8404768 ttaaaaggtctcaattttataggaatcaaaaacatatttaaccct 8404812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 221 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 17742749 - 17742216
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tt 318  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||          ||    
T  17742749 tagggttaaatatgtttttggttcctataaaattgggaacttctaagtttagtctttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaaaaatt 17742650  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | || ||||||| ||||||||||    
T  17742649 acttctaattttagtccccgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatga 17742550  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt-aagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  17742549 aaggttcatttaccaaaacttagatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctg 17742450  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||          
T  17742449 gacgtagaaatcaaattttgcgacaatattttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaatcgtttaaaaactcaagag------ 17742356  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
      |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  17742355 --taaattaaacaaatttgaattgaagagggactaatactgagt-gcagaattttttttaaggaataaaaaaactattaaaattaagtaagaactaaact 17742259  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17742258 taaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 17742216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 223 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 8313628 - 8313090
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||         |||||    
T  8313628 gggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaattgattttttaatccctacaaataagaattact 8313529  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         | |||||||| |||||||||||||    
T  8313528 tctaattttagtccctattataagaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaag 8313429  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |    
T  8313428 gttcatttactaaaattcagaattttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacaaaatatggacg 8313330  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8313329 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataagaacttttaataatgttcttaacacgtatgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacata 8313230  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  8313229 aattaaacaaatttgaattgagaagggactaatactgaat-gcagatttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaa 8313131  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |   | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  8313130 agacctctattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 8313090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 226 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 27336045 - 27335509
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttcta 325  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | | |||        |||||| ||    
T  27336045 ttaaatatgttttttatgcttataaaattgagaacttctaagtttaatccttatttaattttaacaggtattttagttcttacaaaaaaa-ttactttta 27335947  T
Q  326 attttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttc 425  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||       | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27335946 attttagttcctgttacaacaaagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttc 27335847  T
Q  426 atttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtaga 525  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||| |    
T  27335846 atttaccaaaatttatatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatatgggcgtaaa 27335747  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatt 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27335746 aatcaaattttgcgacaattttttacagaggaacttttagtaatgttcttaacacatatgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaatt 27335647  T
Q  626 aaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgt 725  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||| || | | || || ||||| ||||| |||||||||| |||  |||| ||||||| ||    
T  27335646 aaacaaatttgaattgaggagggactaatattgagtgcagaaaattctgtaaaagattaaaaaaactaataaaattaaggaagaactaaacttaaaaggt 27335547  T
Q  726 cccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27335546 ccgaaatttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 27335509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 222 - 760
Target Start/End: Original strand, 42877489 - 42878022
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | || ||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||        |||||    
T  42877489 agggttaaatatgtttttggtcccaataaaattggaaaatt--aagtttagtcattacttaattttaatagattttttagtccttacaaaaaaaattact 42877586  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |       | |||||||||| ||  | |||||||    
T  42877587 tctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaggatatttttaagacaagtttagaatgccatgaaag 42877686  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |    
T  42877687 gttcatttaccaaaatttaattttttttaagatgaaacgaattaaatatgaatttttaaa-acgacaaaagataaagataaaattaacaaaatctggacg 42877785  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42877786 tagaaataaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctac-aaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatg 42877884  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42877885 aattaaacaaatttgaattgaggagggactaatattgagttcaaaaa-aaaatttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaa 42877983  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42877984 aggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 42878022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 317 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 8337167 - 8336722
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |       | |||||||||| ||||||||    
T  8337167 ttacttttaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgattttttga-gacaagtttagaacactat 8337069  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  8337068 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaactgcaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 8336969  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8336968 agacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 8336869  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||  ||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||     
T  8336868 acataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaattttttttttatagactaaaagaatcattaaaattaaataaggactaaa 8336769  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||| | ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8336768 cttaaaaggcccctattttataaggaccaaaaacatatttaaccctt 8336722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 265 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 27308197 - 27307701
Alignment:
Q  265 aagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||          ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27308197 aagtttaatccttacttaattttaatagattttttagttcctataaaaaagaattacttctaattttagtccttattacaacaaagtttgtttaattatc 27308098  T
Q  364 cttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaat 463  Q
    |||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27308097 cttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaaaactatgaaagattcatttaccacaatttagaattttttaacatgaaacaaat 27307998  T
Q  464 taaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaactttt 563  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||     
T  27307997 taaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcatagaaactttc 27307898  T
Q  564 agtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgg 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  27307897 agtaatgtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggaggaactaatactgagt-g 27307799  T
Q  664 aaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
     | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27307798 cagatttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggcccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 27307701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 222 - 707
Target Start/End: Original strand, 34785124 - 34785607
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |         ||||    
T  34785124 agggttaaatatgttcttagtccctataaaattacgaactactaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagttcctgcaaaagaaaattac 34785223  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  34785224 ttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaattttttaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaa 34785323  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||     
T  34785324 ggttcatttactaaaatttaaatttttttaacataaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggac 34785423  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34785424 gtaaaaatcaaattttgcgacaattttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacgtctg-aaaaaattgtacaaaaactcaaaagtttaagcat 34785522  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 707  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  | | ||   || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34785523 aaattaaacaaatttgaattgaggaggaaataattttaagtg--caatttttttttagagactaaaagaactattaaaattaagtaa 34785607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 758
Target Start/End: Original strand, 24636908 - 24637350
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacacta 415  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        | |||||| ||| |||||||    
T  24636908 ttacttctaatattagtccctcctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacacta 24637007  T
Q  416 tgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |     
T  24637008 tgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatc 24637107  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24637108 tggaagtagaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttta 24637207  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||   || | |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||     
T  24637208 agcataaattaatcaaatttgaattgagtagggattaatactaggtgcataaattttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaa 24637307  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
     |||||| ||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  24637308 attaaaaggtctccattttataaggactaaaatcatatttaac 24637350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 245 - 761
Target Start/End: Original strand, 1683061 - 1683577
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaattttagtccttgttac 342  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||          ||||||||||||||||||| |  ||     
T  1683061 ctataaaattgggaactactaagtttagtccttatttagttttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaaattacttctaattttagtccctactaa 1683160  T
Q  343 gacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 442  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1683161 aataaagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatttctttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttaga 1683260  T
Q  443 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  1683261 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaataaaatatggacgtataaatcaaattttgtgaca 1683360  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  1683361 attttttgcataggagcttttagtaatgttgttaacatgtctgcaaaaaattatccaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattat 1683460  T
Q  643 ggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | |||||||| |||||| || | ||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||  || ||||||||||  ||     
T  1683461 gtagggactactactgagtgcagaa--tttttttagggactaaaagaactattgaaattaagtaagaattaaacttaaaagatctcaattttataaggat 1683558  T
Q  743 taaaaacatatttaaccct 761  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1683559 caaaaacatatttaaccct 1683577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 226 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 4426439 - 4425903
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnt-tacttct 324  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||          ||||| |    
T  4426439 ttaaatatgtttttgattcctacaaaatagagatctttcaagtttaatccttacttaattttaatggttcttttagtccctacaaaaaagaaatactttt 4426340  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         || ||||||| ||||||||||||  ||    
T  4426339 aattttagtccttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaatatt 4426240  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtag 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || | | || |||     
T  4426239 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaatttaactaaatctagacgtaa 4426140  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  4426139 aaattaaattttgcaacaattttgcgcataggaacttttagtaatgttcttaagacgtatgtaaaaaattattcaaaaactcagaagtttaaacataaat 4426040  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| || | |   ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||     
T  4426039 taaacaaaattgaattgaagagggactaatactgagtgcagatttttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaag 4425940  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4425939 atccctattttatagggacgaaaaacatatttaaccc 4425903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 219 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 4463183 - 4462739
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct----acnnnnnn 314  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    |           
T  4463183 tatagggttaaatatgtttttagtccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggtttttcagtcccttacaaaaaaaaa 4463084  T
Q  315 nnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacact 414  Q
      | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| |  |||    
T  4463083 aatcacttctaattttagtccctcgtacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgattttttcgagacaagtttagagtact 4462984  T
Q  415 atgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaatt 514  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4462983 atgaaagattcattgactaaaatttagaatttgttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaat 4462884  T
Q  515 gtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttt 614  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  4462883 caggatgtagaaatcaaattttgcaacaattttttgtagagggactattaataatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaactcaagagtta 4462784  T
Q  615 aagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4462783 aagcataaatgaaacaaatttgaattgaggagggactaatactga 4462739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 221 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 2004372 - 2003834
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaact---tttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn- 316  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||             
T  2004372 tagggataaatatgtttttggtccctataaaattgggaactaattttaagtttagtccttacttaattttaataggtgttttagtccctacacaaaaaaa 2004273  T
Q  317 ---ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacac 413  Q
       |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |   || |             | |||||||| |||||    
T  2004272 aaattacgtctaattttagtccctgctacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttatacgattta--------tttgaggcaagtttagaacac 2004181  T
Q  414 tatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat 513  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||     
T  2004180 tatgaaaggttcattttctacaatttagaattgttaaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaagttaacaaaa 2004081  T
Q  514 tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtt 613  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  2004080 tctggacataaaaatcaaattttgcgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtacgcaaaaagttgttcaaaaactcaagagtt 2003981  T
Q  614 taagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggccta 713  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||  || |||||   |  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||    
T  2003980 taagcataaattaaacaaatttgaattgaaaagtgactaatactgtatgcaaaaaaaaaaattagggactaaaaaaactattaaaattaaataagatcta 2003881  T
Q  714 agcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | ||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||    
T  2003880 aacttaaaaggtcccaattttataggaaccaaaaaaataattaaccc 2003834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 281 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 41139387 - 41138909
Alignment:
Q  281 taattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaattt 380  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||  || ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41139387 taattttagtaggttttttagtccctacaacaaaaattacttctaattttagtctatgctaaaaaaaaatttgtttaattatccttaaacttttaaattt 41139288  T
Q  381 ttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaa-catgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    |||||| |         |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||     
T  41139287 ttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattgtgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttatcatgaaatgaattaaatatgaatttttg 41139188  T
Q  480 aagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaaca 579  Q
    || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41139187 aaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaaca 41139088  T
Q  580 cgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaag 679  Q
     |||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || ||||    
T  41139087 tgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagattaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaag 41138988  T
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41138987 gactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 41138909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 13920361 - 13919945
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13920361 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattattaaaatttagaa 13920262  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| ||    
T  13920261 ttttttaacatgaaattaattaaatatgaatatttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataa 13920162  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 643  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13920161 ttttttgcggaggaacttttattaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaa 13920062  T
Q  644 gagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact 743  Q
     || |||||||||||  || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13920061 cagagactaatactgggtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggact 13919962  T
Q  744 aaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||||    
T  13919961 aaaaacatatttaaccc 13919945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 219 - 761
Target Start/End: Original strand, 4461834 - 4462364
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||        ||    
T  4461834 tatagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctatgtttagtccttacttaatattaatagcttttttagtccctacaaaaaaaatt 4461933  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    |||| |||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | ||||||||||  ||||||| |    
T  4461934 acttataattttagtccctgctaaaacgaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttga-gacaagtttaatacactataa 4462032  T
Q  419 aa-ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||                |||||| | ||    
T  4462033 aaaggttcatttactaaaatttagaactttctaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaagc--------------aacaaaatctg 4462118  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct--gcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    || ||||||||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4462119 gatgtagaaatctaattttacgataagtttttgcggaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagttta 4462218  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||   || | |||   |  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  4462219 agcataaattaaacacatttgaattgagtagggactaatactcggtgtagaaaaaaaaattagggattaaaagaactattaaaattaattaaggactaaa 4462318  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4462319 cttaaatggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 4462364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 245 - 761
Target Start/End: Original strand, 41192873 - 41193391
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacg 343  Q
    |||||||||| ||||||| | | | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||||| ||| ||||||     
T  41192873 ctataaaattgggaacttctgaatataattcttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaattacttctaattttaatccctgttaca 41192972  T
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||  ||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |         |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41192973 acaatttttttttaactatccttaagctcttaaacttttgaactatttttgttagacaagtttagaacactatcaaaggttcatttacaaaaatttagaa 41193072  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  41193073 ttttttaacataaaacgaattgaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaactaaatctggacgtagaattcaaattttgcgataa 41193172  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaa-ttgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41193173 ttttttgcagaggaacttttagcaacattcttaacacggctgtaaaaaagttgttcaaaaaatcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41193272  T
Q  643 ggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagaga 741  Q
    || | |||||||| ||| || | ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  41193273 gg-gagactaatattgagtgcataattttttttttagggactaaaagaactattaaaattaaataacgaataaacttgaaatatcccaattttataggga 41193371  T
Q  742 ctaaaaacatatttaaccct 761  Q
      ||||||||||||||||||    
T  41193372 tcaaaaacatatttaaccct 41193391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 318 - 758
Target Start/End: Original strand, 8217982 - 8218410
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||||||  || ||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |         || ||||||| |||||||||    
T  8217982 tacttctaattttagtctctgctaaaataaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatg 8218081  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||             || ||| | ||    
T  8218082 aaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagt-------------aataaaatctg 8218168  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8218169 gacatataaatcaaattttgcaataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaag 8218268  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |  |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  8218269 cataaattaaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtattttttgtaaggactaaaaccactattaaaattaagtaaggactaaac 8218368  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8218369 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 8218410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 471 - 756
Target Start/End: Original strand, 22023191 - 22023476
Alignment:
Q  471 gaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatg 570  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22023191 gaattttttaaaacgaaaaaagttaaagctaaaattaacaaaattcggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttaccgaggaacttttagtaatg 22023290  T
Q  571 ttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatt 670  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  | | |||||    
T  22023291 ttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatggactaatattgagcgcataaatt 22023390  T
Q  671 tattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22023391 ttttctagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatattta 22023476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 222 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 30394503 - 30393960
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---tt 318  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||    
T  30394503 agggttaaatatgtttttggtctctataaaattgcgacattctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctacacaaaaaaaaatt 30394404  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    |||| |||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |          ||||||||||||||||||||    
T  30394403 acttataattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaacttttttaacgattctttttatacaagtttataacactatga 30394304  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtg 517  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||||||  | ||    
T  30394303 a-ggttcatttgctaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatg 30394205  T
Q  518 gaagtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    || |||||||||||||||| |||| | ||||||   ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30394204 gacgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaa 30394106  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||| || | |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  30394105 gcataaattaaacaaatttggattgagtaaggactaatattgagtgcagaaattttttgtaaggattaaaaaaactattaaaattaaataaggactaaac 30394006  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||    
T  30394005 ttacaaggtcgcaattttgtagagaccgaaaatataattaaccctt 30393960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 318 - 760
Target Start/End: Original strand, 43440844 - 43441273
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |         || ||||||| |||||||||    
T  43440844 tacttctaattttagtccatgctaaaacaaagtttgtttgattatccttaaattcttaaatttttgaatgatttttttgagataagtttagaacactatg 43440943  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||             || ||| | ||    
T  43440944 aaaggttcaattactaaaatttataattttttaacatgaaacgaattcaatatgaatttttgaaaacgataaaagt-------------aataaaatatg 43441030  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43441031 gacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaag 43441130  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || | |   || || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |    
T  43441131 cataaattaaacaaatttgaattgagcaaagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaagactaaaacaactattaaaattaagaaaggactaaaat 43441230  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43441231 taaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 43441273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 220 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 34010345 - 34009992
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tt 318  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||         ||    
T  34010345 atagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttgcttaattttaatatggttttaagtccctacaaaaaaaaatt 34010246  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| || |||| ||    
T  34010245 acttttaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtactatttttttgagacaagtttagaatactaaga 34010146  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||| | ||     
T  34010145 aaggttcattaactaaaatttagaattttttaccataaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtttaagataaaattaacaaaatctga 34010046  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgtt 572  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34010045 acgtagaaatcaaattttgcgtcaattttttggagaggaacttttagtaatgtt 34009992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 319 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 34527341 - 34526913
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||    
T  34527341 acttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatga 34527242  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | ||    
T  34527241 aaggttcaattaataaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatg 34527142  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || |||||||||||||||             | ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  34527141 gacatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaacaacttaagagtataag 34527055  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34527054 aataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaact 34526955  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34526954 taaaatggctcaattttataaggactaaaaacatatttaacc 34526913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 231 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 2005437 - 2004895
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaatt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||| |||||    
T  2005437 tatgtttttggtccctataaaattgtgaccttctaagtttagtcgttacttaattttaatagcttttttaatccctaaaaaaaaaaaattacttataatt 2005338  T
Q  329 ttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatt 428  Q
    ||||||| || ||  | ||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |          ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2005337 ttagtccctgctaaaataatttttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaaagattctttttatacaagattataacactatgaaaggttcatt 2005238  T
Q  429 tactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaa 527  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  ||| |||  | |||| |||||||    
T  2005237 tactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaagaaaaatatggacgtagaaa 2005138  T
Q  528 tcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatta 626  Q
    ||||||||| |||| | ||||||   ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2005137 tcaaatttttgcgatatttttttcg-gaggacctttaaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaatta 2005039  T
Q  627 aacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtc 726  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||| ||| || | |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||  |||| |||| ||  ||    
T  2005038 aacaaatttggattgagtaaggactaatattgagtgcagaaattttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataagaactaaacttacaagatc 2004939  T
Q  727 ccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
     ||||||| ||| |||  |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  2004938 gcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccctatatgatat 2004895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 221 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 10675063 - 10674524
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntta- 319  Q
    ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| | ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||      
T  10675063 tagggttaaatatgttgcttgtccctataaaatttgaaacttctaaatttagttcttacttaattttaatagcttttttaatccctataaaaataatttg 10674964  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    | | || ||||||||| |  ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |         |||||||||| ||||| |  ||    
T  10674963 catgtagttttagtccctactaaaacaaagtttctctaattatccttaaacttttaaatctttaaacgatttttttgagacaagtttagaacaccacaaa 10674864  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaat-tttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtg 517  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||  |||||||  | ||    
T  10674863 aggttcgtttactaaaatttagaatttattaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaaat-accaaagttcaagataaaagtaacaaaaatatg 10674765  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    || |||||||  |||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10674764 gacgtagaaacaaaattttgagatgattttttgtatatgaacttttagtaatgtttttaacacttttgtaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaag 10674665  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  10674664 cataa-ttatacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcaaattttt-ttataaggactaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaact 10674567  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10674566 tataaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 10674524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 224 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 31211609 - 31211174
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttact 321  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||| |||  | || ||||||||||||||| ||||||| || ||||          |||||    
T  31211609 ggttaaatatgtttttggtcattataaaattgagaacttttaaatttggttctaacttaattttaatagtttttttagtcactacaaataaaaaattact 31211510  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatga-caagtttataacactatgaaa 420  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        | | |||||||| |||| |||||||    
T  31211509 tctaattttagtccctcttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttaaacaagtttagaacaatatgaaa 31211410  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |  ||| ||| |  |||     
T  31211409 ggtttatttacaaaaatttagatttttttaatatgaaacgaattcaataggagttttttaaaacagcaaaagttaaagatataagtaataaaatcgggac 31211310  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc-gaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  31211309 gtagaaatcaaattttgcaataattttatgcagaggaacttttagtaatgttcttaactaatctacaaaaaaattgttcaaaaacttaagaatttaagta 31211210  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  31211209 taaattaaacaaatttaaattgaatagggagtaata 31211174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 224 - 508
Target Start/End: Original strand, 9687407 - 9687693
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||    
T  9687407 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattggcaacttctaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaattactt 9687506  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
      ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |          | ||||||| |||||||| |||||    
T  9687507 tgaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaatcgatttttttgatataagtttagaacactataaaagg 9687606  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatg-acaaaagttaaagataaatttaa 508  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||    
T  9687607 ttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaaagttaaagataaaattaa 9687693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 268 - 707
Target Start/End: Original strand, 18261100 - 18261535
Alignment:
Q  268 tttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatcctta 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||         |||||| |||||||||||| || ||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  18261100 tttaatccttacttaaatttaatagcttttttagttccta-aaaaaaaattacttataattttagtccctgctaaagcaaagtttgttaaattatactta 18261198  T
Q  368 aacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaa 467  Q
     |||||||||||||| | |||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  18261199 cacttttaaattttttagcaatttaatgtaaacaagtttataacactatgaaaggtccatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaactaat 18261298  T
Q  468 tatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgt--agaggaactttta 564  Q
    | |   |||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  18261299 ttt---ttttttaa-acgacaaaagttcaagataaaactaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttttgcagaggaactttta 18261394  T
Q  565 gtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga 664  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| | ||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| || |    
T  18261395 gtaatgttcttaacacgtttgtaaaagaatgtttgaaaacttaagaatttaagcat-aattaaacaaatttgaattgagaaaggattaatactgagtgca 18261493  T
Q  665 aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 707  Q
     || ||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18261494 gaatttttttgtaaggactaaaa-aattattataattaagtaa 18261535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40272665 - 40272346
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||  ||||||| || |||| | |||||| |||    
T  40272665 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaa 40272566  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  40272565 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 40272467  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||||||| |  | ||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  40272466 tttaaatttactaaggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaatttaaaaggtcccaatt 40272367  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  40272366 ttatagggacaaaaaacatat 40272346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 317 - 550
Target Start/End: Original strand, 38693436 - 38693669
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| || |||||    
T  38693436 ttacttctaatattagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactat 38693535  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  38693536 gaaaggttcaattactaaaatttataattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatct 38693635  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttg 550  Q
    |||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  38693636 ggacatataaatcaaattttgcgataattttttg 38693669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 221 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 28456928 - 28456624
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||    
T  28456928 tagggttaaatatgtttttaatc--tataaaattgggaatttctaaatttattccttacttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaaacatta 28456831  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| || ||||||||    
T  28456830 cttctaattttagtcaatgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttgtgagacaagtttagaatactatgaa 28456731  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  28456730 aagttcattaactaaaatttacttttttttaacatgaaactaattaaatatgaattttttaa-acgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgga 28456632  T
Q  520 agtagaaa 527  Q
     |||||||    
T  28456631 cgtagaaa 28456624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 550 - 759
Target Start/End: Original strand, 9687706 - 9687916
Alignment:
Q  550 gtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaggga 649  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9687706 gtagatgatcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggaggga 9687805  T
Q  650 ctaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaa 748  Q
    |||||||||| || | ||||   |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||     
T  9687806 ctaatactgagtgcagaaaaaaaaaattaggaactaaaagaactattaaaattaagtaagtattaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaat 9687905  T
Q  749 catatttaacc 759  Q
    |||||||||||    
T  9687906 catatttaacc 9687916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 19332704 - 19332351
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  19332704 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaagttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 19332605  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  ||| |||  | |||| | |||||| |||||||| || ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| | | | ||||||| ||    
T  19332604 ataaaagtaaaaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttcgagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtacaaaaaattatt 19332505  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||  | ||||||    
T  19332504 caaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaa-attgagtgcataatttttttatatggactaaaaacattattaa 19332407  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19332406 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 19332351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 398 - 761
Target Start/End: Original strand, 3548398 - 3548758
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  3548398 gacaaatttagaacattatgaaaggttcatttactaaaattta-aattatttaatgtgaaatgaattaaatatgaattttttaa-atgccaaaagttcaa 3548495  T
Q  498 gataaatttaa-caaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
    ||||||  ||| |||||| ||    ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | || ||||||    
T  3548496 gataaaagtaaccaaattttgtgcatagaaattaaattttgagataatttcttgtcgaggaatttttaataatgttcttgacacttctacaaataattgt 3548595  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || |||||| | ||| | | ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  3548596 tcaaaaagttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattttaatttaatagagactaaaattgaat-gcaattttttttataaggactaaaagaactatta 3548693  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |  ||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  3548694 aaattaagcaagggctaaacttagagggtctcaatattatagggaccaaaaaaatatttaaccct 3548758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 9924645 - 9924402
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt-aatccctacnnnnnnnn-ttacttctaatt 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          |||||| |||||    
T  9924645 tatgtttttggtccctataaaattaggaacttctaagtttaatccttacttaattttaataggtttttttaatccctaaaaaaaagaattacttataatt 9924546  T
Q  329 ttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaa---tttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttc 425  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||  |            |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9924545 ttagtccctgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaatttttaaacgattttttta------------gacaagtttagaacactatgaaaggttc 9924458  T
Q  426 atttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9924457 atttactaaaatttagaattttttaaaatgaaacaaattaaatatgaaatttttaa 9924402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 221 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 42853142 - 42852775
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||        ||||    
T  42853142 tagggttaaatatgtttttgatccctgtaaaattgagatcttttaggtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtcc-tacaaaaaaa-ttac 42853045  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    || ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||           || ||||||| |||| |||||||    
T  42853044 ttataattttagtccttgctaaaagaaagtttgtttaattattcttaaattcttgaatttttgaacgttttttatgagataagtttagaacaatatgaaa 42852945  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||  ||||||| | ||||     
T  42852944 gattcatttactaaaatttaaaatttttcaacgtgaaacgaatttaaaatgaattttttaaaacgactaaagttaaaaataaaagtaacaaaatctggac 42852845  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaa 603  Q
    |||||||||||||||||||             || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42852844 gtagaaatcaaattttgcg-------------gaagaacttttagtaacgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaa 42852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 43210678 - 43211034
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt-taagatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  43210678 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttctaaga-gacaaaagttcaa 43210776  T
Q  498 gataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
     |||||  |||| ||| | |||| | |||||| |||||||| || ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||| | | | |||||||||    
T  43210777 aataaaagtaacaaaaatctggacgaagaaataaaattttgagataattttttgcataagaacttttcttaatgttcttaacacttgtacaaaaaattgt 43210876  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaa---cta 693  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||  || | | | | ||||| || || |||||||||  |   |||    
T  43210877 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaacctaagt-gtataattttttatatggactaaaaacacgtcta 43210974  T
Q  694 ttaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43210975 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatat 43211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 2262845 - 2263197
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| | | |||||||||| ||     
T  2262845 acaagtttagaacattataaaaacttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 2262944  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||||||  | || | | | |||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  2262945 ataaaagtaacaaaaatctgtacgcataaataaaattttgagataattttttgcagatgaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 2263044  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    |||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| ||   ||  || || || |||||||||  ||||||||    
T  2263045 caaaattttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcgtaa--tttttatatggactaaaaacactattaa 2263141  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||| | |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2263142 aattaagtaaagactaaacttaagagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 2263197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 218 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 21837364 - 21837100
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccc-tacnnnnnnnn 316  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||   |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||            
T  21837364 ttatagggttaaatatgtttttggtccctatagaatatagaacttctaaatttagtccttacttaattttaatagctttttttagcccctacaaaaaaaa 21837265  T
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||| || |||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||||||| ||||||||    
T  21837264 ttatttataattttagtccatgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaatgattttttcgatacaagtttagaacactat 21837165  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21837164 aaaaggttcatttactaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatatgaatttcttaa 21837100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 525 - 758
Target Start/End: Original strand, 16965904 - 16966141
Alignment:
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| |||||||    
T  16965904 aaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaatattgttaaaaaacgtaagactttaaacataaat 16966003  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaact------attaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||   | |||| ||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||| |||    
T  16966004 taaacaaatttaaattgaacaggtactaatattgagtg--catattttttttagggactaaaagaactattaaaattaaaattaagtaaggactaaactt 16966101  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16966102 aaaatatttcaattttatagggattaaaaacatatttaac 16966141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 36876274 - 36875743
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-ac 320  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||| | |||||||        || ||    
T  36876274 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattggaaacttctaagtttagttcttacttaattttaatagcattttgagtccctacaaaaaatatttac 36876175  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
     | |||||||||||| || || ||| || ||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||  |       | |||||||||  |||| ||| |||    
T  36876174 atgtaattttagtccctgctaagaccaaatttgtgttattatcctcaaactcttaaattttttaatgattttttta-gacaagtttggaacattattaaa 36876076  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtgga 519  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||    | |||| || ||| ||||  |||||||| | ||||    
T  36876075 ggtttatttactaaaattcagaattttttaacatgaaataaattaaatataatctttttaaac--aaaaaaatttaagttaaaagtaacaaatatttgga 36875978  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc-gaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
     ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36875977 tgta-aaatcaaattttgagatgattttttgtggtggaacttttagtagtgttcttaacacatctgcaaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaacc 36875879  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    |     ||||||||||| |||| |  | ||||||| | ||| || |||| ||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  36875878 a-----taaacaaatttgaatttactatggactaaaattgagtgcaaaagttttttataaggactaaaaagcctattaaaattaagtgaggattaacctt 36875784  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    | || |||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  36875783 agaaagtcataatttaatagggaccaaaaacatatttaacc 36875743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 398 - 758
Target Start/End: Original strand, 22166925 - 22167287
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaa-ttttttaagatgacaaaagttaa 496  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||| | |||| |||| || |    
T  22166925 gacaaatttagaacactacgaaaggttcatttagtaaaatttagaattttttaacaagaaatgagtttaatatgaattttttttaaatgaaaaaatttca 22167024  T
Q  497 agataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 595  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||  | ||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22167025 agataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttgaaataattttttacggatgaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaattg 22167124  T
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggact-aaaagaactat 694  Q
    ||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |  ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || ||| | |||| ||||||    
T  22167125 ttcaaaagcataagagtttaaacat-aattaaacaaatctggatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttgtagggattaaaaaaaactat 22167223  T
Q  695 taaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  || |||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  22167224 taaaattaagtaaggactaaaatttgaaggtcctaattttatatggaccaaaaatatatttaac 22167287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 26865301 - 26865114
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||| |   ||     
T  26865301 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggaatgacaaatactgagtggatagtattt 26865202  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26865201 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgactcacttttatagggactaaaaacatatttaaccc 26865114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 217 - 451
Target Start/End: Original strand, 22022966 - 22023201
Alignment:
Q  217 attatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn 316  Q
    |||||||| |||| ||| |||||  | ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||            
T  22022966 attataggattaaatatatttttcgttcctataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggctttttagtcactacaaaaaaaa 22023065  T
Q  317 -ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacacta 415  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||| |    
T  22023066 attatttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacacca 22023165  T
Q  416 tgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaa 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22023166 tgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaa 22023201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 555 - 760
Target Start/End: Original strand, 26865888 - 26866091
Alignment:
Q  555 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaat 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||     
T  26865888 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaa- 26865986  T
Q  655 actgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    | ||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26865987 attgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagcaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggact-aaaacatatt 26866085  T
Q  755 taaccc 760  Q
    ||||||    
T  26866086 taaccc 26866091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 763
Target Start/End: Original strand, 30698546 - 30699097
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnn 312  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||        
T  30698546 attttttattgggttaaatatgtttttggtccctataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttaattttaataacatttttagtccctacaaaa 30698645  T
Q  313 nnnn--ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataa 410  Q
          |||| | |||||||||||||| | |  || || ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |         |||| ||||| ||    
T  30698646 ataaaattacatgtaattttagtccttctaaaaactaaatttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgattttttggagacatgtttagaa 30698745  T
Q  411 cactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaaca 510  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||   ||  |    
T  30698746 cattataaaatgttcatttactaaaaaatataattttttaacaggagaagaattaaatatgaattttttaa-acgacaaaaattcaagaaaagagtagta 30698844  T
Q  511 aat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 609  Q
    ||  | || | ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | || | | ||| |||||| ||||| |||||    
T  30698845 aaaatctgaacgtagaaatcaaattttgagttaatattttgtagagggactttccgtaatgttcttaataggtgtacaaaagattgtttaaaaattcaag 30698944  T
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||  ||| || | ||||||| ||| | || ||||   | ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  30698945 aatttaagcat-aattaaacaaatttggattaagaatggactaaaactaaatgcaaaatgattttttagggattaaaaaagctattaaaattaagtaagg 30699043  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
      |||  |||||| |  |||||||||||  ||   |||||||||||||||||||    
T  30699044 attaaatttaaaaggctccaattttataaggatataaaacatatttaacccttt 30699097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 588 - 760
Target Start/End: Original strand, 38693677 - 38693849
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || ||||||||||||    
T  38693677 aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatatgaattgagcagagactaatattgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaa 38693776  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38693777 caactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38693849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 546 - 762
Target Start/End: Original strand, 6365413 - 6365622
Alignment:
Q  546 ttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgagga 645  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6365413 ttttgcagaggaacttttactaatgttcttaacgcatctgcgaaaaat-gttcaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagta 6365511  T
Q  646 gggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact 743  Q
     ||||||||||  | ||  ||||||      ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||| ||||    
T  6365512 tggactaatac-aagtgcagaaaaa------ttagggactaaaagaactact-aaattaagtaaggactaaacttaaagggttccaattttatagggact 6365603  T
Q  744 aaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  6365604 aaaaagatatttaaccctt 6365622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 601 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28456626 - 28456468
Alignment:
Q  601 aaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaat 700  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | |||   |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28456626 aaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggaatgactaatactgagtgtagaaaa--attttagggactaaaataactattaaaat 28456529  T
Q  701 taagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||  | |||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28456528 taagtattgactaaacttaaaaggtcctaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 28456468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 38692017 - 38691864
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38692017 caagggtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgaatgcatagtatttttataaggactaaaacaactattaaaattaagt 38691918  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  38691917 aaggactaaacttaaaatgtctcaattttacaggaactaaaaacatatttaacc 38691864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 37446823 - 37446433
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tt 318  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  | |            ||    
T  37446823 tagggttaaatatgtttttgacccttttaaaattgtgaacttttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttttagtctttttaaaagaaattt 37446724  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    | || |||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |       |  ||||||||| |||  ||| |    
T  37446723 aattataattttagtccctattaaagcaaagtttgtttaattatccttgaactcttaaattgttgaaagattttttaaa-acaagtttagaaccatataa 37446625  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||     | ||    
T  37446624 atggttcacttactaaaatttagaatttttttaatgtgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaa-----tctg 37446530  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttt 614  Q
     | | |||||||||||||||| | ||   ||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37446529 tatgcagaaatcaaattttgcaataaaactttgcgaaggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaacttaagagttt 37446433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 760
Target Start/End: Original strand, 13920909 - 13921063
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||| || | ||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13920909 caagagtttaaggataaattgaacaaatttgaattgagtaggaattaatactgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 13921008  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13921009 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaaccc 13921063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 317 - 478
Target Start/End: Original strand, 26865676 - 26865837
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |         |||||||||| ||||||||    
T  26865676 ttacttataattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaagctcttaaatttttgaatgaatttttttagacaagtttagaacactat 26865775  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26865776 gaaaggtccaattaataaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 26865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 3407131 - 3407295
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  3407131 aaaaattgttcaaaatgttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 3407229  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3407230 gcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3407295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 577 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 8217575 - 8217400
Alignment:
Q  577 acacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttatttt 676  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |    ||||||    
T  8217575 acacgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgaatgcata---gtatttt 8217479  T
Q  677 aaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
        ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8217478 ---tactaaaacaactattaaaattaagcaaggactaaacttaaaatgcctcgatttaatagggactaaaaacatatttaac 8217400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 615
Target Start/End: Original strand, 14049632 - 14050001
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa-tccctacnnnnnnnnttactt 322  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | |||||        |||| |    
T  14049632 ggttaaatatgtttttggatcctataaaattgaaaatttttaagtttaattcttacttaattttaatagttttttttagttcctacaaaaaaa-ttacat 14049730  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
     |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |       |  ||| ||||| |||| || |||| |    
T  14049731 ataattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgattttcttaatacacgtttagaacattacgaaaag 14049830  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||       |||              |||| ||    
T  14049831 ttcatttactaatatttaaaattttttaacatcaaatgaattaaatataaatttttttaaacgacaaaa-------ata--------------tggacgt 14049909  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14049910 agaaatcaaattttgagataattttt-gtggagaaacttttagtaatgttcttaacatgtgttccaaaaattgttcaaaaacttaagagttta 14050001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 521 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 9924380 - 9924280
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9924380 gtagaattcaaattttgtgacaatattttgcagaggaactttaagtaatgttcttaacaagtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacat 9924281  T
Q  621 a 621  Q
    |    
T  9924280 a 9924280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 592 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 27280231 - 27280060
Alignment:
Q  592 attgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattt-taaggactaaaagaa 690  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||  ||| ||| || ||||||||| |     
T  27280231 attgttcaaaaacttaatagtttaagcataa-ttaatcaaatttaaatttagtagggattaaaactgattgcaaatttttttttatagggactaaaaaac 27280133  T
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27280132 ctattaaaattaagggaggactaaactttaaatatcttaattttatagagaccaaaaaaatatttaacccttt 27280060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27280558 - 27280319
Alignment:
Q  238 ttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-acttctaattttagtcct 336  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||||||        || || | |||||||||| |     
T  27280558 ttgatccctataaaattggaaacttctaagtttagtccttatttaattttaatagcatttttagtccctacaaaaaatattgacatgtaattttagtacc 27280459  T
Q  337 tgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaa 436  Q
    || ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||            |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27280458 tgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaa---ttttttttagacaagtttagaacattattaaaggttcatttactaaaa 27280362  T
Q  437 tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  27280361 ttcggaattttttgacatgaaatgaattaaatatatatttttt 27280319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 555 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 37812757 - 37812609
Alignment:
Q  555 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaat 654  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||     
T  37812757 ggaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaa 37812659  T
Q  655 actgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaag 704  Q
    | ||| || | || ||| || || |||||||||| |||||||||||||||    
T  37812658 attgagtgcataatttttttatatggactaaaagcactattaaaattaag 37812609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 43538623 - 43538478
Alignment:
Q  607 aagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagta 706  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || | ||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43538623 aagagttttaacataaattaaacaaatttgaattgagtagaaactaatactgagtgtagaaagttttattggggactaaaagaactattaaaattaagta 43538524  T
Q  707 aggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacata 752  Q
    |    ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  43538523 ataattaaacttaaaatgttccaattttatagggaccaaaaacata 43538478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 683 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 21837102 - 21837026
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21837102 taaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 21837026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32510571 - 32510492
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32510571 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatttggaacttctatgtttaatccttacttaattttaatagttttttta 32510492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 437 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 43210097 - 43209899
Alignment:
Q  437 tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaatttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | | ||||||||||  | | ||| | |  ||| | |||| | |||||| |||||||    
T  43210097 tttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcgaaaaaaagtaagaaaaatctggacgaagaaataaaatttt 43209998  T
Q  537 gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattta 636  Q
    | || ||||||||| | | |||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  43209997 gagataattttttgcataagaacttttggtaatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagttcaagcat-aattaaacagattta 43209899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 606 - 724
Target Start/End: Original strand, 41139902 - 41140020
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  41139902 caagagtttaatcataaattgaacaaatttaaattgagcagggactaatactgagtgcatagtatttttataaggactaaagcaactattaaaattaagg 41140001  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  41140002 aaggactaaacttaaaatg 41140020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 43440280 - 43440134
Alignment:
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaag-aactattaaaattaagtaag 708  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | ||  || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43440280 agtttaaacataaattgaacaaatttgaattgagcagagactaatagtgagtgcataatattcttgtaaggactaaaaacaactattaaaattaagtaag 43440181  T
Q  709 gcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattt 755  Q
    | |||| ||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||    
T  43440180 gactaaacttaaaatgcctcaatttttcagggactaaaaacatattt 43440134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8404816 - 8404735
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8404816 ttatagggttaaatatgtttttgattcctataaaattgagaccttttaagtttaatctttacttaattttaatagttttttt 8404735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 19333200 - 19333364
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || || |||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||| ||||    
T  19333200 aaaaattgttcaaaatcttaaaaggttaaccataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggacaaaaa 19333298  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19333299 gcactataaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatat 19333364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 691 - 767
Target Start/End: Original strand, 30394433 - 30394509
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatta 767  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30394433 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaatgtcgcaattttatagagaccaaaaacatatttaacccttgatta 30394509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 676 - 759
Target Start/End: Original strand, 18950983 - 18951066
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18950983 taaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 18951066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 28456467 - 28456553
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  28456467 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattaggaccttttaagtttagtcaatacttaattttaatagttattttagtcccta 28456553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 17742216 - 17742293
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  17742216 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagttcttacttaattttaatagttttttta 17742293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 623 - 760
Target Start/End: Original strand, 30403394 - 30403531
Alignment:
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| || | |||||| || || || |||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||    
T  30403394 attaaacaaatttaaattgaataaggactaatattgaatgtataaattttttatagggtctaaaaaaactattataattaagtaagaactaaactgaaaa 30403493  T
Q  723 tgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  30403494 ggtcgcaattttacagggaccaaaaacatatttaaccc 30403531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 609 - 760
Target Start/End: Original strand, 34527365 - 34527514
Alignment:
Q  609 gagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggacta--atactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagta 706  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34527365 gagtttaaacataaattaaacaaatttaaattgagcaaggactataatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagta 34527464  T
Q  707 aggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||   ||| ||||||||| | ||||    ||| |||||||||||||||||||||    
T  34527465 agcagtaaacttaaaatgcctcaat----tagggactaaaaacatatttaaccc 34527514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42645296 - 42645223
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42645296 tatgttttttatccttataaaatttggatcttttaagtttaatccttacttaattttaatagtgtttttaatcc 42645223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42878022 - 42877945
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42878022 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttta 42877945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43211033 - 43210972
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43211033 tatgtttttgatccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 43210972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22023472 - 22023396
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  22023472 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 22023396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4462370 - 4462279
Alignment:
Q  216 tattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4462370 tattctagggttaaatatgtttttagtccctataaaattgggaccatttaagtttagtccttaattaattttaatagttcttttaatcccta 4462279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 691 - 766
Target Start/End: Original strand, 4463110 - 4463185
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4463110 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccctatatt 4463185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 579
Target Start/End: Original strand, 28616093 - 28616260
Alignment:
Q  414 tatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaa-ttttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aa 511  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||| || || |||||  || | ||    
T  28616093 tatgaaaggttcatttactagagttaagatttttttaaaatgaaataaattaaatatgaattttttttaaatgacaaaacttcaacataaaagtagcaaa 28616192  T
Q  512 attgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaaca 579  Q
    | |  | | ||||||||||||||||| ||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28616193 aatcagaacgtagaaatcaaattttgagatgattttttgtgaagaaacttttagtaatgttcttaaca 28616260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1683578 - 1683492
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  1683578 tagggttaaatatgtttttgatccttataaaattgagatcttttaagtttaattcttacttaatttcaatagttcttttagtcccta 1683492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 694 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 4462522 - 4462456
Alignment:
Q  694 ttaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4462522 ttaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 4462456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 4462456 - 4462522
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4462456 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaa 4462522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 8404353 - 8404267
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  8404353 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcctaattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 8404267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 714
Target Start/End: Original strand, 37812996 - 37813121
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  37812996 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 37813094  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  37813095 gcactattaaaaataagtaaggactaa 37813121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 40158146 - 40158216
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40158146 agggttaaatatgtttttagtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 40158216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3407294 - 3407233
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3407294 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 3407233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 512
Target Start/End: Original strand, 9168631 - 9168716
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||||||    
T  9168631 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatttgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaa 9168716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30699095 - 30699010
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30699095 agggttaaatatgttttatatccttataaaattggagccttttaaatttaatccttacttaattttaatagcttttttaatcccta 30699010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 437
Target Start/End: Original strand, 18950866 - 18950959
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaat 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18950866 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaat 18950959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 291
Target Start/End: Original strand, 19332352 - 19332412
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19332352 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaata 19332412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 680 - 760
Target Start/End: Original strand, 28237291 - 28237371
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28237291 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatccctattttattgagaccaaaaacatatttaaccc 28237371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 398 - 478
Target Start/End: Original strand, 30733975 - 30734055
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30733975 gacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatagaattttttaacatgacaagaattaaatatgaattttt 30734055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41193393 - 41193306
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  41193393 atagggttaaatatgtttttgatccctataaaattgggatatttcaagtttattcgttatttaattttaatagttcttttagtcccta 41193306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 22166746 - 22166832
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22166746 aggggtaaatatgtttttggtccctataaaatccggaagctttaagtttagtccttactaaattttaatagttttattaatccctac 22166832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Original strand, 27307692 - 27307786
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  27307692 atttattttagggttaaatatgtttttggtccctataaaataggggcctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 27307786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Original strand, 2004901 - 2004986
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || ||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2004901 tatagggttaattatgttttcggtccctacaaaattgcgatcttgtaagtttagttcttatttaattttaatagcttttttaatcc 2004986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 10674524 - 10674593
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  10674524 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttataagtttagtctttacttaattttaatag 10674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Original strand, 17742663 - 17742748
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  17742663 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaagactaaacttagaagttcccaattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 17742748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 301
Target Start/End: Original strand, 21837026 - 21837103
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa 301  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21837026 ggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttaa 21837103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 303
Target Start/End: Original strand, 27335511 - 27335592
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatc 303  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  27335511 agggttaaatatgtttttggtccctataaatttcggaccttttaagtttagttcttccttaattttattagtttttttaatc 27335592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Original strand, 32510485 - 32510570
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | || ||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32510485 taaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacatagaagttccaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 32510570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 636
Target Start/End: Original strand, 32537608 - 32537688
Alignment:
Q  556 gaacttttagtaatgttctt-aacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattta 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32537608 gaacttttagtaatgttctttaacacttttgcaaaacattgttcaaaatctcaaaagtttaagcat-aattaaacaaattta 32537688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 37812173 - 37812230
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37812173 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaatttta 37812230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 2003834 - 2003918
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2003834 gggttaattatttttttggttcctataaaattgggaccttttaagtttagatcttatttaattttaatagtttttttagtcccta 2003918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 4461919 - 4461823
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatttcta 775  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| | || ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4461919 ggactaaaaaagctattaatattaagtaaggactaaacatagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctatattctatatcta 4461823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9687916 - 9687848
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9687916 ggttaaatatgattttggtccctataaaattggaaccttttaagtttaatacttacttaattttaatag 9687848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 692 - 772
Target Start/End: Original strand, 34010274 - 34010354
Alignment:
Q  692 tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatattt 772  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34010274 tattaaaattaagcaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctattttatattt 34010354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 566 - 737
Target Start/End: Original strand, 42645113 - 42645281
Alignment:
Q  566 taatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaa 665  Q
    |||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| || |     
T  42645113 taatgttcttaatatttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttaatagggactaaaactgagtgcat 42645211  T
Q  666 aaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttata 737  Q
    ||  || || || ||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||    
T  42645212 aa--tttttatatggattaaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatccaaattttata 42645281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 2004286 - 2004371
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat---gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2004286 ggactaaaacacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaattagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttatccct 2004371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18404471 - 18404393
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  18404471 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaatgccaaaaattaaagataaaactaacaaa 18404393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28237377 - 28237302
Alignment:
Q  217 attatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28237377 attattgggttaaatatgtttttggtctcaataaaatagggatctttcaagtttaatccttacttaattttaatag 28237302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 761
Target Start/End: Original strand, 42853058 - 42853141
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  42853058 aggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacctaaaagatctcaattttacagggatcaaaaacatatttaaccct 42853141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 622040 - 621970
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  622040 agggttaaatatgtttctggtctctataaaattgggacctttcaagtttaatacttacttaattttaatag 621970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24334117 - 24334047
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  24334117 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 24334047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 37812230 - 37812172
Alignment:
Q  695 taaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37812230 taaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 37812172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2263196 - 2263135
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2263196 tatgtttttggtccctataaaattgggatctcttaagtttagtctttacttaattttaatag 2263135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 8313091 - 8313176
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  8313091 agggttaaatatgtttttgatccctataaaatagaggtctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 8313176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19333363 - 19333302
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19333363 tatgtttttggtccctgtaaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaatttttatag 19333302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 24636815 - 24636883
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24636815 gggttaattatgttttgg-tccttataaaattggaaacttctaagtttgatccttacttaattttaatag 24636883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 27280062 - 27280147
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27280062 agggttaaatatttttttggtctctataaaattaagatatttaaagtttagtcctcccttaattttaataggttttttagtcccta 27280147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 4425903 - 4425987
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  4425903 gggttaaatatgtttttcgtccctataaaatagggatctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 4425987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 5597738 - 5597814
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | |||||||| |||||||| |||||    
T  5597738 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaattaac 5597814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 458
Target Start/End: Original strand, 6365207 - 6365408
Alignment:
Q  258 aacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgttt 356  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||         |||||| |||||||| |||||  |   ||||||||||| |    
T  6365207 aacttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagttcctacaaaaaaaaattacttataattttaatccttactgaaacaaagtttgtat 6365306  T
Q  357 aattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatga 456  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||  |       | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||  || |||||| ||||||||    
T  6365307 aattatccttaaactcttgaatttgttaaagatttatttaagacaagtttagaaaactatgaaatgttcatttactagaacctataattttataacatga 6365406  T
Q  457 aa 458  Q
    ||    
T  6365407 aa 6365408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 9687487 - 9687407
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9687487 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttgccaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 9687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22167287 - 22167203
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag-gttttttaatccctac 308  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22167287 gttaaatatatttttggtccatataaaattaggaccttcaaattttagtccttacttaattttaatagttttttttaatccctac 22167203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 30698624 - 30698556
Alignment:
Q  692 tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30698624 tattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 30698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 291
Target Start/End: Original strand, 30733839 - 30733899
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  30733839 tatgtttttggtccctataaaattggaaacttctaagtttagtcgttacttaattttaata 30733899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Original strand, 36875743 - 36875819
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36875743 ggttaaatatgtttttggtccctattaaattatgactttctaaggttaatcctcacttaattttaataggcttttta 36875819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 42877572 - 42877487
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||  | | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  42877572 taaggactaaaaaatctattaaaattaagtaatgactaaacttaa--ttttccaattttattgggaccaaaaacatatttaacccttt 42877487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 693 - 760
Target Start/End: Original strand, 8313561 - 8313628
Alignment:
Q  693 attaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8313561 attaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 8313628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Original strand, 36876204 - 36876275
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||| ||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36876204 ctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagtttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 36876275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 37102918 - 37102984
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37102918 gttaaatatgtttttgattc-tataaaattgggacctttcaagtttaatccttacttaatttttatag 37102984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 305
Target Start/End: Original strand, 43538478 - 43538552
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaac-ttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccc 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  43538478 tatgtttttggtccctataaaatt-ggaacattttaagtttaattattacttaattttaatagttcttttagtccc 43538552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 13919945 - 13920014
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13919945 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 13920014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Original strand, 30393961 - 30394043
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||||||| |||| | || ||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30393961 agggttaattatattttcggtctctacaaaattgcgaccttgtaagtttagtccttatttaattttaatagtttttttaatcc 30394043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 681 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 34785204 - 34785122
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||  |  ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34785204 actaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagtagttcgtaattttatagggactaagaacatatttaacccttt 34785122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38693849 - 38693780
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38693849 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 38693780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16966141 - 16966076
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16966141 gttaaatatgtttttaatccctataaaattgaaatattttaagtttagtccttacttaattttaat 16966076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18951066 - 18950986
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18951066 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatagttgttttaatcc 18950986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30403531 - 30403454
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  30403531 gggttaaatatgtttttggtccctgtaaaattgcgaccttttcagtttagttcttacttaattataatagttttttta 30403454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 40272347 - 40272408
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  40272347 tatgttttttgtccctataaaattgggaccttttaaatttagtccttacttaattataatag 40272408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 673 - 753
Target Start/End: Original strand, 2005358 - 2005438
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2005358 ttttagggattaaaaaagctattaaaattaagtaacgactaaacttagaaggtcacaattttatagggaccaaaaacatat 2005438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8218410 - 8218343
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8218410 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 8218343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Original strand, 8336723 - 8336791
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8336723 agggttaaatatgtttttggtccttataaaataggggccttttaagtttagtccttatttaattttaat 8336791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 10463621 - 10463705
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  10463621 gggttaaatatgtttttggtccctataaaataggggtttttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 10463705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30734227 - 30734155
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30734227 ttttttatccttataaaattggggccttttaaatttagtcctgacttaattttaatagtttttttagtcccta 30734155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 621583 - 621500
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||| |||  ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  621583 ggactaaaaaatttattaaaattaattaaggactaaacttggaagttcccaattttatagggataaaaaacatatttaaccctt 621500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 7572982 - 7573061
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  7572982 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 7573061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 28456847 - 28456927
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||  ||| ||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  28456847 ggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggaataaatttagaaattcccaattttat--agattaaaaacatatttaaccct 28456927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 754
Target Start/End: Original strand, 40158615 - 40158678
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40158615 ctattaaaattaactaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatt 40158678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 42852620 - 42852687
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  42852620 gttaaatatgttttttatccttataaaatttggacattttaaatttaatccttatttaatttcaatag 42852687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2263078 - 2263040
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaa 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2263078 tttgtttaattatgcttaaacttttaaaattttgaacaa 2263040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3548630 - 3548592
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3548630 tttgtttaattatgcttaaacttttaactttttgaacaa 3548592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4123300 - 4123230
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  4123300 aaaaattagaattttttaacatgtaatcaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaa 4123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 729 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 5459077 - 5459047
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5459077 aattttatagagactaaaaacatatttaacc 5459047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6450243 - 6450173
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  6450243 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 6450173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 692 - 758
Target Start/End: Original strand, 10464088 - 10464154
Alignment:
Q  692 tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10464088 tattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatggggaccaaaaacatatttaac 10464154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13921063 - 13920994
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13921063 gggttaaatatgtttttagtccctttaaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 13920994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14711685 - 14711615
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  14711685 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaa 14711615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22671523 - 22671465
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22671523 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaa 22671465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 386
Target Start/End: Original strand, 28616022 - 28616064
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac 386  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28616022 acaaagtttgttttattatccttaaactcttaaatctttgaac 28616064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 737
Target Start/End: Original strand, 30734158 - 30734216
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttata 737  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||||||||||    
T  30734158 ggactaaaaaaactattaaaattaagtcaggactaaatttaaaaggccccaattttata 30734216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41906964 - 41906894
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  41906964 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 41906894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 42992593 - 42992523
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  42992593 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaa 42992523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22166818 - 22166745
Alignment:
Q  689 aactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||   |||  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22166818 aactattaaaatttagtaaggactaaacttaaagcttccggattttatagggaccaaaaacatatttacccctt 22166745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 503
Target Start/End: Original strand, 27432463 - 27432528
Alignment:
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  27432463 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 27432528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31124820 - 31124775
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  31124820 aaaatttagaattttttaacaaaacacaaattaaatatgaattttt 31124775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 162)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 212 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 19791670 - 19791114
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnn 311  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||       
T  19791670 tatttattcaaggattaattatgtttttggtccctataaaattgagaacttctaaatttagtccttatttaatttttataggttatttagtccctacaaa 19791571  T
Q  312 nnnnn--ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttata 409  Q
           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |       ||| ||||||||||    
T  19791570 aaaaaaattacttctaagtttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatg-caagtttata 19791472  T
Q  410 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19791471 acactatgaaatgttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttataacgacaaaagttaaagataaaattaac 19791372  T
Q  510 aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 609  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19791371 aaattttggaggtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 19791272  T
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19791271 agtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgattgaaaatatttattttaaagactaaaagaactattaaaattaagtaagg 19791172  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatta 767  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  19791171 actaaacttaaaaggtcccaattttataggaaataaaaacatatttaaccctttatta 19791114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 224 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 30719899 - 30719362
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||         ||||||    
T  30719899 ggttaaatatgattttgatccctataaaatagggacctttcaagttcaatccttatttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaagaattactt 30719800  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||    
T  30719799 ctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagg 30719700  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  30719699 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgt 30719600  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtc-tgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30719599 agaaatcaaattttgcgacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacata 30719500  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||| |    
T  30719499 aattaaacaaatttgaattgaggagagactaatactgagtgcagacttttttttttaaggactaaaagaaccattaaaattaaattaggactaaacttga 30719400  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||   ||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  30719399 aaaacccctatattatagggaccaaaaacatatttaac 30719362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 226 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 35531204 - 35530668
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttc 323  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||           |||||||    
T  35531204 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataagttttttagtccttagaaaaaaaaaattacttc 35531105  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  35531104 taattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttaa-gacaaatttagaacactatgaaatgt 35531006  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  35531005 tcatttaccaaaatttagattttttttaacaagaaacgaattaaatataatttttttaaaatgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgt 35530906  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35530905 agaaatcaaattttgcaacatttttttgcaggggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaagattgtttaaaagctcaagagtttaagcataa 35530806  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaa 722  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  35530805 attaaacaaatttgaattgatgatggactaatactgagt-gcagaattttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaa 35530707  T
Q  723 tgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
     ||||||||||  |||  ||  |||||||||||||||||    
T  35530706 ggtcccaatttcgtaggaacctaaaacatatttaaccct 35530668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 224 - 759
Target Start/End: Original strand, 26805367 - 26805904
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||    
T  26805367 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttaatccttacaaaaaagaattactt 26805466  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| ||||||| |||| |    
T  26805467 ctaattttaatccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactatttttttaagacaagtttagaacactaagaaatg 26805566  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaatttt-ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | || | |    
T  26805567 ttcatttaccaaaatttatattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacg 26805666  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    || ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  26805667 taaaaatcaaattttgtgaattttttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcat- 26805765  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | ||||   |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  26805766 aattaaacaaatttgaattgaagagggactaatactgagtgcagaaaaaaaaaattaaggactaaaaatactattaaaattaagtaagaactaaacttaa 26805865  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    || |||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26805866 aaggtctgaattttatagggataaaaaacatatttaacc 26805904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 350 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 13501496 - 13501087
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13501496 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacact--gaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 13501399  T
Q  450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13501398 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 13501299  T
Q  550 gtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaggga 649  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13501298 gcataggaacttttagtaatgttattaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggaggga 13501199  T
Q  650 ctaatactgattggaaaaatttattt-taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaa 748  Q
    |||||| ||| || |||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||   ||| ||||||||| ||| |||||    
T  13501198 ctaatagtgagtgcaaatttttatttctagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaagacccctattttatagggaccaaaaa 13501099  T
Q  749 catatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||    
T  13501098 catatttaaccc 13501087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 246 - 759
Target Start/End: Original strand, 26020298 - 26020812
Alignment:
Q  246 tataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgac 345  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||         ||  ||||||||||||||  |||||| ||    
T  26020298 tataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttgtagtccctataattttttttttttctaattttagtctctgttacaac 26020397  T
Q  346 aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 445  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020398 aaagtttgtttaattatcattaaactcttgaatttttgaacgatttttttgtgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 26020497  T
Q  446 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatt 545  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  26020498 ttttaacattaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaatttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaatt 26020597  T
Q  546 ttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgagga 645  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26020598 ttatgtagaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagattttaagcataaattaaacaaatttgaattaagga 26020697  T
Q  646 gggactaatactgatt--ggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact 743  Q
     ||||||||||||| |    || ||   |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||| ||| ||      
T  26020698 aggactaatactgagtacacaagaaaaaaaattagggactaaaagaactattcaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtcctaattttgtag-gatc 26020796  T
Q  744 aaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||| ||||||||||    
T  26020797 aaaaatatatttaacc 26020812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 223 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 52493949 - 52493416
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-act 321  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    ||  |||        || |||    
T  52493949 gggttaattatgtttttggtccttataaaattggaaacttctaagtttgatccttacttaattttaatagtttttgccgtcgttacaaaaatcatttact 52493850  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    |||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        | |||||| ||| ||||||||||||    
T  52493849 tctaatattagtccctcctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaa 52493750  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||| ||| | |||||    
T  52493749 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaa 52493650  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  52493649 gtagaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcat 52493550  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||   || | |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||    
T  52493549 aaattaatcaaatttgaattgagtagggattaatactaggtgcataaattttttgtagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggattaaaattaa 52493450  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    || ||| | ||||||||  |||||||| ||||||    
T  52493449 aaggtctccattttataaggactaaaatcatatt 52493416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 223 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 43505187 - 43504657
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||         |||||    
T  43505187 gggttaaatatgtttctggtccttataaaattggaaatttttaagtttgatccttacttaattttaataggttttttagtctctacaaaaaagaattact 43505088  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||||||| |||||||||||||    
T  43505087 tcaaattttagtccttcttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactgttttttttagacaagtttagaacactatgaaag 43504988  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||       |||||||| | |||| |    
T  43504987 gttcatttactaaaatttggaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttagaacgacaaaagttaaa-------ttaacaaaatctggacg 43504895  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    || |||||||||||  | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43504894 taaaaatcaaattta-caacaactttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttctgttaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcata 43504796  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  43504795 aattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaaattatttttatggactaaaaaaacttataaaattaagtaaggattaaacttaaa 43504696  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |  | | |||||||||   || |||||||||||||||||    
T  43504695 agattctaattttataagaaccaaaaacatatttaaccc 43504657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 350 - 761
Target Start/End: Original strand, 51561350 - 51561762
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 449  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561350 tttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 51561449  T
Q  450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaaaataaaataaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 51561549  T
Q  550 gtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaggga 649  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51561550 gcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaagtaaacaaatttgaattgaggaggga 51561649  T
Q  650 ctaatactgattggaaaaattta-ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaa 748  Q
    |||||| ||| || | |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||   ||  ||||||||| |||||||||    
T  51561650 ctaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaaagaaccattaaaattaattaaggactaaacttgaaagacccttattttatagggactaaaaa 51561749  T
Q  749 catatttaaccct 761  Q
    |||| ||||||||    
T  51561750 cataattaaccct 51561762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 36367860 - 36368303
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  36367860 ttacttctaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatttttaaactcataaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 36367959  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||  ||| ||| | |    
T  36367960 gaaaggtttaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaatttaaagataaaagtaataaaatct 36368059  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36368060 ggacatataaattaaattttgcgataattttttgcggagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 36368159  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36368160 gcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaac 36368259  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36368260 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 36368303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 33708915 - 33709358
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  33708915 ttacttctaattttagtcccttctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 33709014  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  33709015 gaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaatatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaattt 33709114  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
     ||  || |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  33709115 agacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaatcttaagagtttaa 33709214  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| || || | |   || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |    
T  33709215 gtataaattaaacaaatttgaattgagctgagactaataccgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaac 33709314  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33709315 ttaaaatgcctcaattttatagcggttaaaaacatatttaaccc 33709358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 409 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28701188 - 28700834
Alignment:
Q  409 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaa 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28701188 aacactatgagaggttcatttactaaaatttagaactttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaa 28701089  T
Q  509 caaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc-gaaaaattgttcaaaaactca 607  Q
    |||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  28701088 caaaatctggacgtggaaatcaaattttgctacaatttttcgcagaggaacttttagtaatattcttaacacatttgcaaaaaaattgttcaaaaactca 28700989  T
Q  608 agagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaa-aatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagta 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||  || ||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28700988 agagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggagtgactaattttgggtgcaaatatttttttttatggaccaaaagaactattaaaatttagta 28700889  T
Q  707 aggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||| ||||  ||||||  ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  28700888 aggactaaaattaaaagttcccaatttaatagggatcaaaaacatatttaaccct 28700834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 317 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 12000043 - 11999601
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |         |||| ||||| ||||||||    
T  12000043 ttacttctaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgattattttgagacatgtttagaacactat 11999944  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||  ||  ||| | |    
T  11999943 gaaatgttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaaattaaagataaaagtactaaaatct 11999844  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||  | | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11999843 ggacatataaatcaaattttgaaatatttttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaa 11999744  T
Q  617 gcataaattaaacaaattt-aaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||     
T  11999743 gcataaattaaacaaatttgaaattgagcagagactaatacttagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattacgtaaggactaaa 11999644  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11999643 cttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 11999601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 398 - 757
Target Start/End: Original strand, 47008698 - 47009040
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47008698 gacaagtttagaacactatgaaaggtttatttactaaaatttagaattttt-aacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 47008796  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47008797 gataaaattaacaaaatgtggacgtagaaattaaattttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 47008896  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    |||||||||||||||           ||||||| |||| |||||||||||||||||     | || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47008897 caaaaactcaagagt-----------ttaaacatatttgaattgaggagggactaa-----agtgcagaaatttttttttaggactaaaagaactattaa 47008980  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    || ||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  47008981 aagtaagtaaggacaaaacttaaaaggtcctaattttatagggaccaaaaacatatttaa 47009040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 224 - 563
Target Start/End: Original strand, 46517047 - 46517388
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttact 321  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||          |||||    
T  46517047 ggttaaatatgtttttggtccctataagattagcaacttctaagtttaatccttacttaattttaatagatattttagtccctacaaaaaaaaaattact 46517146  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |         |||||||||| |||||||||||||    
T  46517147 tcgaattttagtccatcttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgatcgatttttttgggacaagtttagaacactatgaaag 46517246  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  46517247 gttcatttactaaaatttagacttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacg 46517346  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaactttt 563  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  46517347 tagaaatcaaattatgtgacaattttttgtagaggacctttt 46517388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 12368213 - 12368643
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  12368213 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactat 12368312  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  12368313 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgtattaaatattaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 12368412  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    | |  || |||||||||||||||             | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12368413 gaacatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 12368499  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12368500 gaataaattaaacaaatttgaactgagcagagactaatattgaatgtatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaac 12368599  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12368600 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 12368643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 221 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 31400640 - 31400100
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||    
T  31400640 tagggttaaatatgttttggttcc-tataaaattgcgatcttctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctacaaaaaaaaatac 31400542  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    || |||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |          ||||||||| ||||||||||||    
T  31400541 ttataattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaatattttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaa 31400442  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtgga 519  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||||||  | ||||    
T  31400441 ggttcatttactaaaatctataattttttatcatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgga 31400342  T
Q  520 agtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||||   ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  31400341 cgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaaac 31400243  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || | |||||| || |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  31400242 ataaattaaacaaatttgaattgagtaaggactaatattgagtgcataaattttttgtaagaattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaactt 31400143  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | || ||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||    
T  31400142 acaaggtcgcaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 31400100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 317 - 714
Target Start/End: Original strand, 46596746 - 46597142
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||           |||||||||| |||||| |    
T  46596746 ttacttctaattttagtctatgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacggttttttttagacaagtttagaacactgt 46596845  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||||  |    
T  46596846 gaaaggttcaattattaaaatttagatttttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaatc-t 46596944  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  ||  ||  ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46596945 ggacatatcaactaaattttgcgataattttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 46597044  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||| |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46597045 gcataaattaaacaaatttgaattgagctgagactaatactgaatggatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaa 46597142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 317 - 659
Target Start/End: Original strand, 30982352 - 30982694
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |         |||||||||| |||| |||    
T  30982352 ttacttcaaatattagtccctgctaaaacaaagtttgtttaaatatccttaaaatcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacaatat 30982451  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  30982452 gaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaagcgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatct 30982551  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || ||||||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30982552 ggacatataaatcaaattttgtgataatttttagcggaggaacttttagtaaagttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 30982651  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  30982652 gcataaattaaacaaatttgaattgagtatagactaatactga 30982694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 226 - 722
Target Start/End: Original strand, 10041119 - 10041613
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttcta 325  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||          |||| ||||    
T  10041119 ttaaatatgtttttggtccttataaagttgagaacttctaagtttagtccttacttaattttaatatgtttttttagtccttacatgaaaattacatcta 10041218  T
Q  326 attttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttc 425  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |       | || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  10041219 attttagtccctgttacattaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttttaagaaaagtttagaacaccatgaaaggttc 10041318  T
Q  426 atttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtaga 525  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||| ||| | || | |||||    
T  10041319 atttaccaaaatttaaatttttttaacattatacgaattaaatataaattttctaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtaga 10041418  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatt 625  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||  ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10041419 aattaaattttgcgacaatttttcgaagaggaacttttagtaatgtgtttaacacacctataaaaaattgtttaaaaactcaagaatttaaacataaatt 10041518  T
Q  626 aaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaa 722  Q
    |||||||||| || | |||| ||| ||||| | | || | || ||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  10041519 aaacaaatttgaa-taaggaaggagtaatattaagtgtagaatttttttgtaaggactaaaa-aactattaaaatttagtaagcactaaacttaaaa 10041613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 317 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 21091374 - 21090938
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||| |    
T  21091374 ttacttataattttagtccctgctaagacaatgtttgtttgattatcctcaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactgt 21091275  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||| ||  ||| ||| | |    
T  21091274 gaaaggttcatttattaaaatttataattttttaacgcgaaatgaattaaatatgaatttttaaa-acatcaaaagttaaagattaaagtaataaaatct 21091176  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    | |  || ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  21091175 gaacatataaatcaaattttgagataatttattgtggatgaactttatgtaatgttcgtaacacgtctacaaaaaattgtttaaaa-cttaagagtttaa 21091077  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||||  || ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  21091076 acataaactaaacaaatttgaattgagtagggactaatattgagtgcaaaatctt-ttttagggattaaaagaa-tattaaaattaagtaaggactaaac 21090979  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21090978 ttaaaattttccaattttataaggaccaaaaacatatttaa 21090938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 221 - 762
Target Start/End: Original strand, 33707242 - 33707784
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-a 319  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||         || |    
T  33707242 tagggttaaatatgtttttggttcctataaaattgaaaacttttaagtttaatccttacttaattttaatagttttttcagtccttagaaaaaatattta 33707341  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaattt-ttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    | | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||    |||||            |||||||||| |||| ||  |    
T  33707342 catgtaattttagtccatgttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactctaaaaaaaattgaaagtattttctgagacaagtttaaaacattacaa 33707441  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | | || ||||||| ||||||||   ||||||   | |    
T  33707442 aagtttcatttactaaaatttaaatttttttaatatgaaatgtattaaatataaattttttcaaacgataaaagttcaagataaaagcaacaaaaatttg 33707541  T
Q  519 aa-gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  33707542 aacgtagaaatcaaattttgagataattttttgcgaaggaacttttagtaatgttctcaacacgtctgcaaaagattgttcaaaaaattaagagtttaag 33707641  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
     || ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| || | | |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33707642 aat-aattaaacaaatttaaatttagtagggactaaaagtgagtgcatacattttttatagggactaaaa-aactattaaaattaagtaaggactaaact 33707739  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
     | |||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33707740 cagaatgttacaattttatagagaaaaaaaacaaatttaaccctt 33707784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 36248649 - 36248216
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| ||||||||    
T  36248649 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttaaaacactat 36248550  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatt----taacaaa 512  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||    ||| |||    
T  36248549 gaaaggttcaattaataaaatttaaaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaattaaagtaataaa 36248450  T
Q  513 ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagt 612  Q
     | ||||  || |||||||||||||||||             ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  36248449 atatggacatataaatcaaattttgcgac-------------ggaacttttagtaatattcttaacatgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagt 36248363  T
Q  613 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| || | |   || || |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  36248362 ttaagaataaattaaacaaatttgaattgagcatagactaatattgaatgcatagtatttttgtaagaaccaaaacaactattaaaattaagtaaggact 36248263  T
Q  713 aagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36248262 aaacttaaaatgcctcaattttatagggact-aaaacatatttaaccc 36248216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 49767910 - 49767575
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgt 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||| ||| | |    
T  49767910 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaaatct 49767811  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    ||| | |||||| || ||||| || ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  49767810 ggacgcagaaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaa 49767711  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||| | || | | || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |    
T  49767710 gcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaacagattgcataattgttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaac 49767612  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49767611 ttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 49767575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 12251420 - 12251769
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||     
T  12251420 acaagtttataacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaa 12251519  T
Q  499 ataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  ||||||| || |||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  12251520 ataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 12251619  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  |||         
T  12251620 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtacggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacact----- 12251713  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12251714 aattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagagaccaaaaacatat 12251769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 15053944 - 15053528
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||         |||||||||| ||||||||    
T  15053944 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaa--------tttttgaacaaattttttgagacaagtttagaacactat 15053853  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  15053852 gaaaggctcaatcaataaaatttagaatgttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 15053753  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || ||||||||||||| | |             |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15053752 ggacatataaatcaaattttgtggc-------------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 15053666  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| || |      | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  15053665 gaataaattaaacaaatttgaattgagcagaaactaatattgagtgca------ttttgtaaggacaaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaac 15053572  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15053571 tgaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 15053528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 11397256 - 11396921
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgt 516  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||  || |||||  |||||||  | |    
T  11397256 aaaggttcgtttactaaattttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtgcaaaataaaagtaacaaaaatat 11397157  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    ||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  11397156 ggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaa 11397057  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  11397056 gcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaac 11396958  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  11396957 ttaaaaggtctcaattgtatagggaccaaaaacatat 11396921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 542 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 21794510 - 21794285
Alignment:
Q  542 aattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattg 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  21794510 aattttttgtagaggaacttttattaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatca 21794411  T
Q  642 aggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagaga 741  Q
    ||||  |||||||||| | || | |||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| | ||    
T  21794410 aggaatgactaatactaagtgcagaaaaatcttttagggattaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggccccaattttatcggga 21794311  T
Q  742 ctaaaaacatatttaaccctttattat 768  Q
    | ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  21794310 ccaaaaatatatctaa-cctttattat 21794285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 567 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 2059151 - 2058959
Alignment:
Q  567 aatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaa 666  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| | | |     
T  2059151 aatgtgcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattcaagagggactaatgctgagt-gcag 2059053  T
Q  667 aatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2059052 aatattttttagggactaaaagtactattaaaattaaataaggactaaacttaaaaggtcccaatttcatagggactaaaaacatatttaaccc 2058959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25352197 - 25351845
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  25352197 acaagtttaaaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaa 25352098  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||||||  | |||| | | |||| |||||  | || ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  25352097 ataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaatt--gagataattttttggagatgaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgtt 25352000  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || |  | | | || || |||||||||| ||||||||    
T  25351999 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgaatgcatgattgttttatatggactaaaagcactattaa 25351901  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25351900 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggatcaaaaacatat 25351845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 12897143 - 12897496
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||     
T  12897143 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcaaa 12897242  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||    
T  12897243 ataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaat-aaaatttgagataattttttggagatgaactttacgtaatgttcttaacacttgtgcaaaagattatt 12897341  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||||    
T  12897342 caaaatcttaaaagtttaagc-ttaattaaacaaatttagatttaatagggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaattactattaa 12897440  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||    
T  12897441 aattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccgaaaacatat 12897496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 221 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21794755 - 21794508
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||        ||||    
T  21794755 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttataagtttagtccttacttaattttaataggtttttaagtccttacaaaaaaaattac 21794656  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| || | || ||||    
T  21794655 ttctaatattagtccctattacaacaaagtttgcttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgaattttttgagacaagtttagaatattaagaaa 21794556  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaat 468  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21794555 ggttcattaactaaaatttagaattttttaccataaaacgaattaaat 21794508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 222 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 35188587 - 35188064
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||         |||||    
T  35188587 agggttaaatatgtttttggtccctataaaatcgagaacttataagtttaatccttacttaattttagtagcttttttaatcccta-aaaaaaaattact 35188489  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | |||||||||||| || ||  ||||||||||||||| | |||||||     ||||||||| ||| |         |||||||||| ||| || ||||||    
T  35188488 tataattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaactgtccttaa-----taaattttttaacgatttttttgagacaagtttaaaactctctgaaag 35188394  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaa 520  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||  | |  |     
T  35188393 attcatatactaaaatatagaattttttaacatgaaataaattaaatatattttttttaa-acaacaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatataaat 35188295  T
Q  521 gtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaac-tcaagagtttaagc 618  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||| |||         ||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |    
T  35188294 gtagaaatcaaatttttgcgatatttttttgctgaggaacttttaataag--------cacgtttgcgaaaaattgttgaaaaaaattaagagtttaaac 35188203  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||| | | | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||    
T  35188202 ataaattaaacaaatttagattgagtaaggactaatgttgagt-gcagaattttttataaggactaaaaaaactattaaaattaagtaattactaa-ctt 35188105  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  35188104 taaaagtcgcaattttataaggataaaaaacatatttaacc 35188064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 344 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 39682093 - 39681885
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||       | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682093 acaaaatttgtttaattatccttaaactcttaagtttatgaacaatttttttaagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 39681994  T
Q  444 tt-ttttaacatg-aaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgac 541  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  39681993 tttttttaacatgaaaacggattaaataggatttttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgat 39681894  T
Q  542 aattttttg 550  Q
    |||||||||    
T  39681893 aattttttg 39681885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 398 - 759
Target Start/End: Original strand, 7565230 - 7565590
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | || ||||||| ||    
T  7565230 gacaagtttagaacattacgaaaggtacatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaatttaatatgaatttttttaaacgagaaaagttcaa 7565329  T
Q  498 gataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||  |||||||||||||||| || ||||||||   || ||| ||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||||    
T  7565330 gataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttgagataattttttacggatgaatttttattaatgtttttaacacgtctacaagaaattgt 7565429  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    |||||| |  |||| ||||| ||| || |||||||||||  ||| || ||||||||| | ||| || | | ||||  | || ||| ||||| ||||||||    
T  7565430 tcaaaagcataagaatttaaacat-aactaaacaaatttggatttagtagggactaaaattgagtgcatagattttctatagggattaaaaaaactatta 7565528  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||| || |  ||| | | |||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7565529 aaattaagcaaagaataaacattaaaaatctcaattttatag-gaccaaaaacatatttaacc 7565590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 401 - 760
Target Start/End: Original strand, 31024109 - 31024468
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaaga 499  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| | | || ||||||| ||||    
T  31024109 aagtttagaacactacgaaaggttcatttactaaaatctaggatttttttaacatgaaatgtatttaatatgaatttttttaaacgaaaaaagttcaaga 31024208  T
Q  500 taaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttc 598  Q
    |||| ||||||||  | || |  |||||||||||||||  || ||||| ||   || ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||    
T  31024209 taaaattaacaaaaatatgaacatagaaatcaaattttaagataatttgttacggatgaacttttagtaatggtcttaacacgtctacaagaaattgttc 31024308  T
Q  599 aaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaa 698  Q
    ||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||  ||| || | ||||||| | ||| | | | ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  31024309 aaaaacataagagtttaaacat-aattgaacaaatttggatttagtatggactaaaattgagt-gcataattttttttagggattaaaaaaactattaaa 31024406  T
Q  699 attaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||| |||| | |  || |||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||    
T  31024407 attaagtaaggactaaacattgaaagtcccaatttgataaggatcaaaaacatatttaaccc 31024468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 27551001 - 27550683
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||  ||||||| || |||| | |||||| |||    
T  27551001 aaatttagaattttctaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaa 27550902  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  27550901 ttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagtat-aattaaacaaa 27550803  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||| ||| || | ||||||| ||||| | | | ||||| || || || ||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||    
T  27550802 tttagatttagtatggactaaaactgagt-gcataattttttatatgggctaaaaatactattataattaagtaaggactaaacttaaaaaatcctaatt 27550704  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  27550703 ttatagggaccaaaaacatat 27550683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 555 - 759
Target Start/End: Original strand, 37986902 - 37987106
Alignment:
Q  555 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaat 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  37986902 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaat 37987001  T
Q  655 actgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    | | | || | |   || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  37987002 attaaatgcatagtatttttgcaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatt 37987101  T
Q  755 taacc 759  Q
    |||||    
T  37987102 taacc 37987106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 12367772 - 12367585
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| || | |   ||     
T  12367772 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaatcctgagtgcatagtattt 12367673  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12367672 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 12367585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 52881803 - 52881487
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtaga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||||||  | |||| || ||    
T  52881803 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgtcga 52881704  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatt 625  Q
    ||| |||||||| || | ||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| || |       |||||| || |    
T  52881703 aataaaattttgagatacttttg-gtaaatgaacttttcgtaatgttcttaacacttatgcaaaaaattgttgaaaatctaa-------aagcat-aact 52881613  T
Q  626 aaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgt 725  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  52881612 aaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataatttttttatatagactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggt 52881513  T
Q  726 cccaattttatagagactaaaaacat 751  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  52881512 cccaattttatagggaccaaaaacat 52881487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2059732 - 2059485
Alignment:
Q  257 gaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttg 353  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||           ||| ||||||||||||  | |||||  ||||| ||||    
T  2059732 gaacttctaagtttaatctttacttaattttaataggatttttagtccctacaaaaacaaaaattatttctaattttagatcctgttaaaacaaaatttg 2059633  T
Q  354 tttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaca 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2059632 tttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttta-gataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaatttgttaaca 2059534  T
Q  454 tgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  2059533 tgaaacaaattaaatatgaatattttaaaacga-aaaagttaaagataaa 2059485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 574 - 760
Target Start/End: Original strand, 36249086 - 36249272
Alignment:
Q  574 ttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttat 673  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || | |   || |    
T  36249086 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatcgagcaaggactaatactgagtgcatagtatttt 36249185  T
Q  674 tttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36249186 tgtaaggactacaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 36249272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 588 - 759
Target Start/End: Original strand, 29231885 - 29232056
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| || | ||  || || ||||||||||||    
T  29231885 aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaacaaggactaatactgagtgcataatatttttgtaaggactaaaa 29231984  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29231985 caacaattaaaattaagtaagggctaaacttaaaatgtctcaattttacagggactaaaaatatatttaacc 29232056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 37986278 - 37986091
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || | |   ||     
T  37986278 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaataatgagtgcatagtattt 37986179  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37986178 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactgaaaacatatttaaccc 37986091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 560 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 48410202 - 48410002
Alignment:
Q  560 ttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaaga-gtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactg 658  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  48410202 ttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttatatttagtagggactaaaactg 48410104  T
Q  659 attggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    | || ||   ||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48410103 agtgcaatttttt-ttatagggactaaaagcaccattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatgtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaac 48410005  T
Q  759 cct 761  Q
    |||    
T  48410004 cct 48410002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 52882360 - 52882703
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||| || ||     
T  52882360 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaattaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaatttcaaa 52882459  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | |||||| |||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||  |||| |||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  52882460 ataaaagtaacaaaaatctggaggcagaaataaaattttgagataatttgttggagatgaacttttcttaatattcttaacacttgtgcaaaaaattatt 52882559  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
     ||||         ||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| || | ||  || || || ||||||||   ||||||||    
T  52882560 gaaaa---------tttaatcat-aattaaacaaatttaaattttgtagggactaaaactgagtgcataa--tttttatatggactaaatacactattaa 52882647  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52882648 aattaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttatagggacaaaaaacatat 52882703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Original strand, 15054418 - 15054605
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| || | |   ||     
T  15054418 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattgagcaaggactaatactgagtgcatagtattt 15054517  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||| |||| || || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15054518 ttgtaagaactagaacaattattaaaattaaataaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagagattaaaaacatatttaaccc 15054605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 542 - 753
Target Start/End: Original strand, 48218046 - 48218256
Alignment:
Q  542 aattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattg 641  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  48218046 aattttttgcagatgaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatctttaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagattt 48218144  T
Q  642 aggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagaga 741  Q
    || ||||||||| | ||| |||| |  ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||| ||    
T  48218145 agtagggactaaaattgaatggatagtttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttttaggga 48218244  T
Q  742 ctaaaaacatat 753  Q
    | ||||||||||    
T  48218245 ccaaaaacatat 48218256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 48410566 - 48410275
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta-cnnnnnnnntta 319  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          |||    
T  48410566 taggattaaatatgtttttggtccctataaaatttgaaacttttaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttagtccctataaaaataattta 48410467  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    | | || |||||||| || |||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||| || | ||  ||    
T  48410466 catgtagttttagtcattattaaaacaaagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacagtctttttgagacaagtttaaaaaattacaaa 48410367  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  48410366 aggttcggtcactaaaatttagaattttttaacatgaaatggattaaatat-aatttttttaaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaa 48410275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Original strand, 49768495 - 49768810
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||  ||| ||| || |||| |||||||| |||    
T  49768495 aaatttagaattttttattatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaataaaattctggacgtagaaataaaa 49768594  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| | | | |||||   ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  49768595 ttttgagataattttttgcaaatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtccaaaaaaaatttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 49768693  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  |||||||    ||| ||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  49768694 tttagatttagtagggactaaaactgactgcataatttttttatatggactaaaaacactatta----taattaaggactaaacttaaaagatcccaatt 49768789  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  49768790 ttatagggaccaaaaacatat 49768810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 322 - 472
Target Start/End: Original strand, 37986719 - 37986869
Alignment:
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||    
T  37986719 tctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaag 37986818  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatga 472  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37986819 gttcaattaataaaatttagaattgtttaacatgaaacgaattaaatatga 37986869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 36362513 - 36362360
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36362513 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactactaaaattaagt 36362414  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  36362413 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacggggactaaaaacatatttaacc 36362360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 556 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 13083529 - 13083314
Alignment:
Q  556 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |  ||||||||| |    
T  13083529 gaacttttagtaatgttcttaacacatctgaaaaaagttgttcaaaaacttgagagtataagcat-aattaaacaagtttgaatttactagggactaaaa 13083431  T
Q  656 ctgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattt 755  Q
    |||| || | || ||| |  ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||  || |||| |||||||| | ||  ||||||||||||    
T  13083430 ctgagtgcagaagtttttaatagagactaaaaaaactattaaaattaagtgaggactaaactttgaaagtcctaattttatggcgatcaaaaacatattt 13083331  T
Q  756 aaccctttattatattt 772  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13083330 aaccctttattttattt 13083314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 33708355 - 33708203
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33708355 caagagtttaagcataaattgaacaattttgaattgagcagggactaatactgagtgtatagtatttttgtaaagactaaaacaactattaaaattaagt 33708256  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||  ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33708255 aaggattaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 33708203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 46596189 - 46596037
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || | |   || || |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  46596189 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagtatggactaatactgagtgcatagtatttttgtaagaactaaaacaattattaaaattaagt 46596090  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46596089 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 46596037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 565 - 737
Target Start/End: Original strand, 51841222 - 51841393
Alignment:
Q  565 gtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga 664  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || |    
T  51841222 gtaatgttcttaactcttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagcagggactaaaactgagtgca 51841320  T
Q  665 aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttata 737  Q
     || ||| || || | |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  51841321 taatttttttatatgaactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttata 51841393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 481
Target Start/End: Original strand, 5430438 - 5430698
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-ac 320  Q
    |||||||| ||| |||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |        || ||    
T  5430438 agggttaaatatatttttagtctctataaaattggagacttttaagtttaattcttacttaattttaataatttttttagtccttgcaaaaaatatttac 5430537  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
       ||||||||| || || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         | ||||||||||||||| ||  |||    
T  5430538 acgtaattttagcccctgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaacttgtaaatttttgaacggtttttctaagacaagtttataacattacaaaa 5430637  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5430638 gattcatttactgaaatttagaattttttaacataaaatgaattaaatatgatttttttaa 5430698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 588 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 51561393 - 51561220
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttat-tttaaggactaaa 686  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |  ||||| |||| ||||||||    
T  51561393 aaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaaggataatttaa-caaatttgaattgaggagggactaatagtgagtgcatatttttatatttagggactaaa 51561295  T
Q  687 agaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51561294 agaaccattaaaattaagcaaggactaaagttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 51561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 353
Target Start/End: Original strand, 47008553 - 47008682
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttacttc 323  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||    
T  47008553 gttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagttcaatccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaagaattacttc 47008652  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttg 353  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  47008653 taattttagtccatgttacaacaaagtttg 47008682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 27551561 - 27551901
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  27551561 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttttacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 27551660  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||||||  | |||| | |  ||| |||||||| || ||              |||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  27551661 ataaaagtaacaaaaatctggacgcacgaataaaattttgagataa--------------acttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 27551746  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||| ||| || | ||||||| | ||| || | || | | || || |||||||||  |||||||     
T  27551747 caaaatcttaaaagtttaagcataatttaa-caaatttagatttagtatggactaaaattgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattat 27551845  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27551846 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 27551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 676 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 29231291 - 29231208
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29231291 taaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 29231208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28701314 - 28701190
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct--acnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttac 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |         ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28701314 ctataaaattacgaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctgcaaaaaataaattacttctaattttagtccctgttac 28701215  T
Q  343 gacaaagtttgtttaattatcctta 367  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  28701214 aacaaagtttgtttaactatcctta 28701190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 30981784 - 30981631
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||   || | |   || || |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30981784 caagagtttaagcataaattgatcaaatttgaattgagcagagactaatactacgtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagt 30981685  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30981684 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 30981631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 588 - 762
Target Start/End: Original strand, 13501453 - 13501627
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaagg-actaaa 686  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |  |||||||| ||| ||||||    
T  13501453 aaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataa-ttaaacaaatttgaattgaggagggattaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaa 13501551  T
Q  687 agaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |  ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  13501552 aaaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtacttattttatatggaccaaaaaaatatttaaccctt 13501627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 51840287 - 51840106
Alignment:
Q  571 ttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatt 670  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| || | || |     
T  51840287 ttcttaacacttgtgcaaaagattgttcaaaatcttaaaagtttaagtataa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaactgagtgcataattg 51840189  T
Q  671 tattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | || || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51840188 ttttatatggactaaaatcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtttcaattttatagggaccaaaaacatat 51840106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 25352688 - 25352852
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||| | | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  25352688 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttaatagggactgaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 25352786  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25352787 gcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagctcacaattttatagggaccaaaaacatat 25352852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 521 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 42972070 - 42971835
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||    
T  42972070 gtagaaattaaattttgagctaatttttt-tggatgaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaagatttttctaaaacttaagagtttaaacat 42971972  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    || ||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||  | |||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||  |    |||| |||||    
T  42971971 aa-ttaaacagatttgaatttagaagggactaaaactgagagcaaaaattt-ttacacggactaaaaaaactattaaaattaaaga----ctaaacttaa 42971878  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    || ||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||    
T  42971877 aaagtctcaattttacagggatcaaaaatatatttaacccttt 42971835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42972387 - 42972161
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntta 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||        |||    
T  42972387 atagggttaattatgtttttggtccctataaaattgagaacttttaagtttagtccttacttaattttaatatatttttt-attcctacaaaaaaaatta 42972289  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    | |  |||||||||| ||| ||  || |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         ||||  |||| || | ||| ||    
T  42972288 catgcaattttagtctttgctaaaacta--tttttttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttcggagacacttttagaagattataaa 42972191  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaatttttt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42972190 aggttcatttactaaaatttagaatttttt 42972161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 689 - 761
Target Start/End: Original strand, 46517416 - 46517488
Alignment:
Q  689 aactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  46517416 aactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtcccaattttatagggacgaaaaacatatttaaccct 46517488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 51338507 - 51338351
Alignment:
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatt 695  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  ||||||    
T  51338507 ttcaaaatcttaaaagtttaagtataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactatt 51338409  T
Q  696 aaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51338408 aaaattaagtaaggactaaacttaaaatattccaattttatagggaccaaaaacatat 51338351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 753
Target Start/End: Original strand, 51339817 - 51340003
Alignment:
Q  565 gtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga 664  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||| | ||| || |    
T  51339817 gtaatgttcttaacacttgtgcaaaagattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagagactaaaattgagtgca 51339915  T
Q  665 aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
     || ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  51339916 taatttt-ttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatttcaattttataaggaccaaaaacatat 51340003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 292
Target Start/End: Original strand, 28700830 - 28700904
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  28700830 ttatagggttaaatatgtttttgatccctattaaattgggaacttttaattttagtccttactaaattttaatag 28700904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 52010595 - 52010759
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| |||| || || | ||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  52010595 aaaaattgtttaaaatcttaaaaatttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 52010693  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
      |||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52010694 acactattgaaattaagtaaggaataaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 52010759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 685 - 760
Target Start/End: Original strand, 41331942 - 41332017
Alignment:
Q  685 aaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  41331942 aaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttataggaactaaaaatatatttaaccc 41332017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 418 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 52010087 - 52009903
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | || ||||||| || |||||  |||| ||| | |    
T  52010087 aaaggttcatttactaaaatttagaaatatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagaaaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatct 52009988  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttc-ttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaa 602  Q
     || ||| |||| |||  ||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||    
T  52009987 cgatgtaaaaataaaa--ttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttctttaacacatgcgcaaaaaattgttcaaaa 52009903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 26805450 - 26805356
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26805450 taaggattaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccattttttatat 26805356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Original strand, 21794669 - 21794754
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21794669 taaggacttaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttataagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 21794754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 25351846 - 25351907
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25351846 tatgtttttgatccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 25351907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46517489 - 46517412
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  46517489 tagggttaaatatgtttttcgtccctataaaattgggacattttaagtttagtccttacttaattttaatagtttttt 46517412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52882702 - 52882641
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52882702 tatgttttttgtccctataaaattgggatcttttaagtttaatccttacttaattttaatag 52882641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 676 - 760
Target Start/End: Original strand, 533942 - 534025
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  533942 taaggactaaaataactattaaaattaagtaagggttaaacttaaaatgcctcaattttata-tgattaaaaacatatttaaccc 534025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 678 - 762
Target Start/End: Original strand, 30742660 - 30742744
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30742660 aggacttaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttagaaactctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 30742744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Original strand, 31400096 - 31400180
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31400096 ttatagggttaattatgttttcggtccctacaaaattgcgaccttgtaagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaat 31400180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 292
Target Start/End: Original strand, 52881487 - 52881547
Alignment:
Q  232 atgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52881487 atgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 52881547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 5430522 - 5430436
Alignment:
Q  677 aaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtc-ccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||   ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5430522 aaggactaaaaaaattattaaaattaagtaagaattaaacttaaaa-gtctccaattttatagagactaaaaatatatttaacccttt 5430436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26020812 - 26020730
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  26020812 ggttaaatatatttttgatcc-tacaaaattaggaccttttaagtttaatccttacttaatttgaatagttcttttagtcccta 26020730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 760
Target Start/End: Original strand, 30982698 - 30982769
Alignment:
Q  689 aactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  30982698 aactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaatttatttaaccc 30982769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 19791120 - 19791190
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19791120 agggttaaatatgtttttatttcctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 19791190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 28701255 - 28701337
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28701255 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcgtaattttatagagtctaagaacatatttaaccct 28701337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Original strand, 35531123 - 35531209
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  35531123 taaggactaaaaaacttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaatcctt 35531209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47009040 - 47008974
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47009040 ttaaatatgtttttggtccctataaaattaggaccttttaagttttgtccttacttacttttaatag 47008974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25352851 - 25352790
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25352851 tatgtttttggtccctataaaattgtgagcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 25352790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 27550684 - 27550745
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27550684 tatgtttttggtccctataaaattaggattttttaagtttagtccttacttaattataatag 27550745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31024468 - 31024384
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaa-gtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31024468 gggttaaatatgtttttgatccttatcaaattggga-ctttcaatgtttagtccttacttaattttaatagtttttttaatcccta 31024384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 288
Target Start/End: Original strand, 43504657 - 43504722
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504657 gggttaaatatgtttttggttcttataaaattagaatcttttaagtttaatccttacttaatttta 43504722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48218255 - 48218194
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48218255 tatgtttttggtccctaaaaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 48218194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Original strand, 48410001 - 48410070
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48410001 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggacattttaagttttgtccttacttaattttaat 48410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 49767576 - 49767637
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49767576 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 49767637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51841408 - 51841347
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51841408 tatgtttttgatccttataaaattggaaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 51841347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 52010758 - 52010697
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  52010758 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttattccttacttaatttcaatag 52010697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20357333 - 20357120
Alignment:
Q  244 cctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacg 343  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||         |||| | |||||||||||| || ||      
T  20357333 cctataaaattgagaacttctatgtttatttcttacttaattttaatagtttttttagtccctataaaaaaaattacatgtaattttagtccctgctaaa 20357234  T
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    || || | |||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||       |  ||  ||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20357233 actaaatctgtttaattatcttcaaaatcttaaatttttgaaaaaaaattcaaacacgtgtttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaa 20357134  T
Q  444 ttttttaacatgaa 457  Q
    ||||||||||||||    
T  20357133 ttttttaacatgaa 20357120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 457
Target Start/End: Original strand, 20562622 - 20562835
Alignment:
Q  244 cctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacg 343  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||         |||| | |||||||||||| || ||      
T  20562622 cctataaaattgagaacttctatgtttatttcttacttaattttaatagtttttttagtccctataaaaaaaattacatgtaattttagtccctgctaaa 20562721  T
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    || || | |||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||       |  ||  ||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20562722 actaaatctgtttaattatcttcaaaatcttaaatttttgaaaaaaaattcaaacacgtgtttagaacattataaaaggtttatttaataaaatttagaa 20562821  T
Q  444 ttttttaacatgaa 457  Q
    ||||||||||||||    
T  20562822 ttttttaacatgaa 20562835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 307
Target Start/End: Original strand, 21794304 - 21794376
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21794304 tttttggtcccgataaaattggggccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttaatcccta 21794376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26805904 - 26805836
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26805904 ggttaaatatgttttttatccctataaaattcagaccttttaagtttagttcttacttaattttaatag 26805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30742743 - 30742667
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30742743 agggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagagtttctaagtttaatccttacttaattttaatagtttttt 30742667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51561764 - 51561677
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  51561764 atagggttaattatgtttttagtccctataaaataagggtctttcaagtttagtccttaattaattttaatggttcttttagtcccta 51561677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 13083325 - 13083403
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13083325 agggttaaatatgtttttgatcgccataaaattaggactttcaaagtttagtcctcacttaattttaatagttttttta 13083403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Original strand, 48410483 - 48410561
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48410483 ggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagtttcaaattttatagggaccaaaaacatatttaa 48410561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 2058959 - 2059028
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2058959 gggttaaatatgtttttagtccctatgaaattgggaccttttaagtttagtccttatttaattttaatag 2059028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 11396922 - 11396983
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11396922 tatgtttttggtccctatacaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 11396983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12897495 - 12897434
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12897495 tatgttttcggtccctataaaattggaaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 12897434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13501626 - 13501541
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13501626 agggttaaatatttttttggtccatataaaataagtacctttcaagtttagtccttacttaattttaatggtttttttagtcccta 13501541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Original strand, 21090938 - 21091003
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21090938 ttaaatatgtttttggtccttataaaattggaaaattttaagtttagtccttacttaattttaata 21091003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 691 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 26020344 - 26020275
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26020344 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttataaaaactaaaaacatatttaaccc 26020275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27551900 - 27551839
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27551900 tatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 27551839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 33707328 - 33707243
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |  |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  33707328 taaggactgaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagttttcaattttataggaaccaaaaacatatttaaccct 33707243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 692 - 761
Target Start/End: Original strand, 42972316 - 42972385
Alignment:
Q  692 tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  42972316 tattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaaaaacataattaaccct 42972385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 51338352 - 51338413
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51338352 tatgtttttggtccctataaaattggaatattttaagtttagtccttacttaattttaatag 51338413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 653
Target Start/End: Original strand, 6216553 - 6216686
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgta--gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaa-aaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |   |||||   ||||||||||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||  ||||||||||     
T  6216553 gtagaaatcaaattttgagataattttttttgcggaggattgtttagtaatgttcttaacaagtttgcaaacaaattg-tcaaaaacctaagagtttaac 6216651  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaa 653  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  6216652 cat-aattaaacaaatttaaatttagtagagactaa 6216686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 13501087 - 13501171
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  13501087 gggttaaatatgtttttggtccctataaaataggggtctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 13501171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 29231208 - 29231276
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29231208 ggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 29231276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29231428 - 29231368
Alignment:
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttt 381  Q
    ||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29231428 ttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttt 29231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 35530667 - 35530746
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||  ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  35530667 tagggttaaatatgttttaggttcctacgaaattgggaccttttaagtttagtcattacttaattttaatagttttttta 35530746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 47008632 - 47008553
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  | | |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47008632 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattgaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaac 47008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10896280 - 10896222
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10896280 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 10896222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12251768 - 12251714
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatt 285  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12251768 tatgtttttggtctctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaatt 12251714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 12367585 - 12367654
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12367585 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 12367654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12368643 - 12368574
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12368643 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 12368574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36249272 - 36249203
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36249272 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 36249203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36368303 - 36368234
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36368303 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 36368234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 51561219 - 51561305
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  51561219 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggacctttcaactttagtccttgcttaattttaatggttcttttagtcccta 51561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 51840107 - 51840168
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaac-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51840107 tatgtttttggtccctataaaatt-gaaacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 51840168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 12896835 - 12896896
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12896835 tatgtatttgatccccataaaattggcagcatttaagtttaattcttacttaattttaatag 12896896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 557 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 26207547 - 26207482
Alignment:
Q  557 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  26207547 aacttttagtaatgttcttaacatgtttcgaaaaaattgttctaaaacttaagagtctaagcataa 26207482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41332017 - 41331948
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||| |||||  | |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41332017 gggttaaatatatttttagttcctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 41331948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Original strand, 47632647 - 47632867
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||  || |||| ||    
T  47632647 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaa 47632746  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaa 631  Q
    |||||| |  ||||| |||| | ||||| |||  ||||||| | |||| || ||  ||||||  || ||||| | || | ||||||||| ||||||||||    
T  47632747 attttgagctaatttattgtggcggaaccttttataatgttttaaacaagtatgtaaaaaatcattaaaaaatttaaaattttaagcat-aattaaacaa 47632845  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaa 653  Q
    |||| |||| |  |||||||||    
T  47632846 attttaatttaacagggactaa 47632867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 51340002 - 51339941
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||| |||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51340002 tatgtttttggtccttataaaattgaaatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 51339941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 31861617 - 31861693
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || |||||||| |||||    
T  31861617 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaac 31861693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 33708203 - 33708270
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33708203 gttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 33708270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Original strand, 2207178 - 2207213
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2207178 tttgtttaattatacttaaacttttaaatttttgaa 2207213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 732 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 3369038 - 3369003
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttatta 767  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3369038 tttatagagacaaaaaacatatttaaccctttatta 3369003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4647287 - 4647208
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  4647287 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 4647208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8760068 - 8760021
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta 480  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  8760068 aaaatttagaattttttaacaaaacatgaattaaatatgaatttttta 8760021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17964217 - 17964138
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  17964217 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 17964138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28254424 - 28254389
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28254424 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 28254389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 35188499 - 35188590
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttta 764  Q
    ||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||  ||| |||| ||  || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35188499 ttttagggattaaaaaagctactaaaattaagtaaggattaaacttataagttctcgattttatagggaccaaaaacatatttaacccttta 35188590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49768809 - 49768762
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatcctta 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  49768809 tatgtttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttagtcctta 49768762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4487035 - 4486969
Alignment:
Q  437 tttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  4487035 tttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaatttaagataaa 4486969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 676 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 10041201 - 10041119
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaac-tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  10041201 taaggactaaaaaaacatattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaactttataaggaccaaaaacatatttaa 10041119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 10383083 - 10383153
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  10383083 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 10383153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14421375 - 14421305
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  14421375 aaaaattagaattttttaacatgtaaggaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaa 14421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21091733 - 21091667
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  21091733 agggttaaacatgtttttggtccatatgaaatttggaacttctaagtttagttcttacttaatttta 21091667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 729 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 33752899 - 33752865
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33752899 aattttatagggactaaaaacatatttaacccttt 33752865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 34076052 - 34076122
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  34076052 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 34076122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 36248216 - 36248284
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36248216 gggttaaatatgttttag-tccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 36248284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 37986091 - 37986160
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37986091 gggttaaatatgttttcagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 37986160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41102867 - 41102833
Alignment:
Q  351 ttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41102867 ttgtttaattttccttaaacttttaaatttttgaa 41102833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 46184974 - 46184916
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46184974 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatacttaaacttctaaatttttgaa 46184916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 48624258 - 48624328
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  48624258 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 48624328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 48723630 - 48723560
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  48723630 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 48723560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15054605 - 15054537
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15054605 gggttaaatatgtttttaatctctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttatttaattttaata 15054537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33709358 - 33709290
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33709358 gggttaaatatgtttttaaccgctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaata 33709290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 163)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 222 - 758
Target Start/End: Original strand, 33831998 - 33832534
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||    
T  33831998 agggttaattatgtttttggtctctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccatacaaaaaaaaattac 33832097  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |       |||||||||||||||||||||||||    
T  33832098 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtctgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaa 33832197  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||     
T  33832198 ggttcatttactaaaatttagaattttttaa-atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagtataagataaaattaacaaattctggac 33832296  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33832297 gtacaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 33832396  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||    
T  33832397 aaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgattggaaaattttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagcgaagactaaacttaa 33832496  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  33832497 atggtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaac 33832534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 31436456 - 31435919
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttact 321  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||           |||||    
T  31436456 ggttaattatgtttttggtccaaataaaattgggaactct-aagtttaatccttacttaattttaataggttttttggtccctataaaaaaaaaattact 31436358  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  31436357 tctaattttagtccttgttatgacaaagtttgtttaattatccttaaacacttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaag 31436258  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |    
T  31436257 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa-atgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctgaacg 31436159  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31436158 tagaaatcaaattttgcaacaattttttgtagatgaacttttagtattgttcttagtacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 31436059  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  31436058 aattaaacaaatttaaatgaatgagggactgatactgattggaaaaatttatattaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaa 31435959  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31435958 aggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 31435919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 218 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 41121164 - 41120622
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn- 316  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||             
T  41121164 ttatagggttaaatatgtttttggtccctataaagttgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaaaa 41121065  T
Q  317 --ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacact 414  Q
      ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||  ||| || | ||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| ||||||    
T  41121064 aattacttctagttttagtccctattacaacaaagttgttttcataacccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacact 41120965  T
Q  415 atgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaatt 514  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  41120964 atgaaaagttcatttaccaaaatttagacttttttaacatgaaacgaattaaataagaattttttaa-acggcaaaaattaaagataaaattaacaaaat 41120866  T
Q  515 gtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttt 614  Q
     |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  41120865 atggacgtagaaatcaaatttcacgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagttt 41120766  T
Q  615 aagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  |    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41120765 aagcataaattaaacaaatttgaattgaagagggactaatactgagtgcga----tttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaa 41120670  T
Q  715 gcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  41120669 acttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 41120622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 224 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 7439639 - 7439149
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||    
T  7439639 ggttaaatttgtttttggtccctataaaattggaaacttataagtttaatccttacttaatttaaataggttttttaatccctacaaaaaataattactt 7439540  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| ||||||||||||||    
T  7439539 ctaattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagg 7439440  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  7439439 ttcatttagtaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgt 7439340  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7439339 agaaattaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttgacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaacacaagagtttaagcataa 7439240  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||| ||||||| | || | |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  7439239 attaaaaaaaattgaattgaggtggga-taatactaaatgcagaaattttttttagagactaaaataactattaaaattatgtaaggactaa 7439149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 223 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 10357736 - 10357223
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttac 320  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||           ||||    
T  10357736 gggttaaatatgttttttgtccctataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttgattttaatagattttttagtccttataaaaaaaaaattac 10357637  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||    
T  10357636 ttctaattttaatccctattacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaa 10357537  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||| | |||      
T  10357536 ggttcatttactaaaatttagaattttttaaccttaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgggc 10357437  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357436 gtagaaatcaaatttttcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 10357337  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  10357336 aaattaaacaaatttgaatcgaggagggactaatactgaat-gcataattttttttagagactaaaagaactattaaaattaagtaaagattaaacttaa 10357238  T
Q  721 aatgtcccaattttat 736  Q
    || ||| |||||||||    
T  10357237 aa-gtctcaattttat 10357223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 222 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 31771738 - 31771191
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tta 319  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||          |||    
T  31771738 agggttaaatatgttttcggtccctataaaacgaggaacttctaagtttagtcctta-ttaattttaatagtttttttagtccatacaaaaaaaaattta 31771640  T
Q  320 cttctaattttagtcct-tgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |          ||||||||| ||||||||||    
T  31771639 cttctaattttagtcccctgttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgacacaagtttagaacactatga 31771540  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||| ||| | |||    
T  31771539 aagtttcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctgg 31771440  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31771439 atgtagaaattaaattttgcaataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttatgc 31771340  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |  | |||  |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31771339 atcaattaaacaaatttgaattgagcagggactaataccgagtgcatgatttttatgcagggactaaaataactattaaaattaagtaaggactaagctt 31771240  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatta 767  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31771239 aaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctatatta 31771191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 225 - 757
Target Start/End: Original strand, 44286563 - 44287092
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttct 324  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |    
T  44286563 gttaaatatgtttttgatccttataaaattaggaacttttaagtttagttcttaattaattttaataggttttttaatccctacaaaaaaa-ttacttat 44286661  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |         ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  44286662 aattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaagatt 44286761  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtag 524  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||||||| | || | ||||    
T  44286762 catttactaaaatttacaattttttaacatgaaacgaatta----tgaattttttaaaacgccaaaacttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtag 44286857  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag---cata 621  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  44286858 aaatcaaatttagcgacaattttttttaaatgaacttttagtaatgtgcttaacacgtccgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagtattata 44286957  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||   |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  44286958 aattaaacaaatttgaattgaggagggactaaaactgcatgtaggaaaa---aaattagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttg 44287054  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44287055 aaagtccccaattttatagggaccaaaaacatatttaa 44287092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 221 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30784595 - 30784076
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  30784595 tagggttaaatatgtttttggtccctataaattgag-aacttttaagttcagtctttacttaattttaataggttttttaatccctacaaaaaaaaaatc 30784497  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||         |||||||||| |||||           
T  30784496 ttctaattttagtccatgttacaacaaagtttgtttaattatcctaaaattcttaaatttt-gaacaatatttttgagacaagtttagaacac------- 30784405  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  30784404 -gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaata-tggac 30784307  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30784306 gtagaaatcaaattttgcgacaattatttgcagatgagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttctaaaacttaagagtttaagcat 30784207  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |    
T  30784206 aaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcaaaa--gaaaattatgaactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaagat-a 30784110  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatattt 755  Q
    || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  30784109 aaggtcccaattttat-gggaccaaaaacatattt 30784076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 221 - 655
Target Start/End: Original strand, 42274172 - 42274609
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---- 316  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||                
T  42274172 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattaggaacttctaagtttagtccttacttaattt-aataggttttttagtccttacaaaaaaaaaaaa 42274270  T
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||| |||    
T  42274271 ttacttctagttttagtcccagttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacattat 42274370  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  42274371 gaaaggttcatttaccaaaatttagatttttttaatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 42274470  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  42274471 agacatagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaatttgtttgaaaactcatgagtttaa 42274570  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42274571 gcataaattaaacaaatttgaattgaggagagactaata 42274609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 224 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25101001 - 25100465
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |||         ||||||    
T  25101001 ggttaaatatgtttttggtccct-taaaatttgaaatttttaagtttaattcttacttaattttta-aggttttttagtccttacaaacaagaattactt 25100904  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| ||||||||||||||    
T  25100903 ctaatttcagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttga-gacaagtttagaacactatgaaagg 25100805  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaa-catgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||| |||||||||||||   |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||| |||| |||||||| | || | |    
T  25100804 ttcacttactaaaatttaatttttttttagcatgaaacgaaataaatatgaatcttttaaaacggcaaaagttaaagctaaaattaacaaaatctgaacg 25100705  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| || |  |||    
T  25100704 taaaaatcaaatttagcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaatattgttcaaaaacttaagagatt-acaata 25100606  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  25100605 aattaaacaaatttgaattgaagagagactaatactgagtgcataaattttttttagggactaaaatagctattaaaattaagtaaggactagacttgaa 25100506  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25100505 aggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 25100465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 759
Target Start/End: Original strand, 3043331 - 3043773
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |         |||||||||| |||| |||    
T  3043331 ttacttctaattttagttcctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcataaattttttaacgaattttttgagacaagtttagaacaatat 3043430  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  3043431 gaaaggttcatttactaaaattcagaatattttaacataaaactaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattt 3043530  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3043531 ggacgtagaaatcaaattttgccacaattttttgcagagtagcttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaataattcaagagtttaa 3043630  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||   ||    |  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |    
T  3043631 gcataaattaaacaaatttgaattgaggagagactaatacttagtgcggaagaaaaaattaggaactaaaagaactattaaaattaaataagaattaaac 3043730  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||  ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  3043731 ttaaaagatcccaattttataggaaccaaaaatatatttaacc 3043773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 462 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 35498768 - 35498525
Alignment:
Q  462 attaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaactt 561  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35498768 attaaatatgaatttttaaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaatttcgcgacaattttttgtagagaaactt 35498669  T
Q  562 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgatt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35498668 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaacaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagaagggactaatactgatt 35498569  T
Q  662 gga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaag 704  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35498568 ggaaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaag 35498525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 222 - 760
Target Start/End: Original strand, 40364760 - 40365295
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |          |||||    
T  40364760 agggttaaatatgcttttggtccctataaaattggaaacttttaggtttagtccttacttaattttaataggttttttagtacttg-aaaaaaaattact 40364858  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||| ||| || ||  | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| ||||||||  |||    
T  40364859 tctaattttaatccatgctaaaataaagtttgtttaactatcctcaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactattgaag 40364958  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |    
T  40364959 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacg 40365058  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagag-tttaagcat 620  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||| || |||||||||| | ||||| |||    
T  40365059 tataaatcaaattttgtgacaattttttgccgatgaacttttagtaatgttcttaacatataagcaaaaaattg-tccaaaactcaagggttttaaacat 40365157  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| || | ||  || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  40365158 aaattaaacaaatttaaattgagtatgaactaatattgagtgcataa--ttttttttgggacgaaaagaactattaaaattaagtaaggagtaaacttaa 40365255  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  40365256 aagatccaaattttatagggatcaaaaatatatttaaccc 40365295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Original strand, 43932731 - 43933147
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         || ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43932731 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagagaagtttagaacaatatgaaaggttcaattattaaaatttagaa 43932830  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| |||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| ||    
T  43932831 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtgaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataa 43932930  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 643  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43932931 ttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgag 43933030  T
Q  644 gagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact 743  Q
     |   |||||||| || || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  43933031 caaaaactaataccgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggact 43933130  T
Q  744 aaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43933131 aaaaatatatttaaccc 43933147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 223 - 659
Target Start/End: Original strand, 8737703 - 8738124
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttactt 322  Q
    ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||                  
T  8737703 gggttaaataagtttttggtcc-tataaaattgggaacttctaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctac-------------- 8737787  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||           || ||||||| ||||||||||||||    
T  8737788 -taattttagtcattgttacaacaaagtttatttaattatccttaaaatcttaaatttttgaacggttttttttagaaaagtttagaacactatgaaagg 8737886  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  8737887 ttcgtttactaaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgt 8737986  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaa-ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8737987 agaaatcaaattttgcgacaatttttttgcagagaaacttttcgtaatgtttttaacacgtctgtataaaattgttcaaaaactcaagaatttaagcata 8738086  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  8738087 aattaaacaaatttgaatcgagaagggactaatgctga 8738124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 396 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 25666284 - 25665973
Alignment:
Q  396 atgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtta 495  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||    
T  25666284 atgacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaattttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaatta 25666185  T
Q  496 aagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 595  Q
    ||  |||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  25666184 aaagtaaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttcgcataggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgtaaaaaattg 25666085  T
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatt 695  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25666084 ttcaaaaactcaagagtttaaatataaattaaataaatttgaattgaggagggactaatactgagtg--tagattttttttaaggactaaaagaaccatt 25665987  T
Q  696 aaaattaagtaagg 709  Q
    ||||||||||||||    
T  25665986 aaaattaagtaagg 25665973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 318 - 760
Target Start/End: Original strand, 42487639 - 42488081
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| ||| |||||    
T  42487639 tacttctaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttgattatctttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacgctatg 42487738  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaatttt-ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  42487739 aaaggttcaattactaaaatttaaattttttttaacatgaaatgaattcaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 42487838  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  42487839 ggacatataaatcaaattttgcgattattttttgcagaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaa 42487937  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  42487938 gcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaac 42488037  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42488038 ttaaaatgcctcaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 42488081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 398 - 760
Target Start/End: Original strand, 36512026 - 36512387
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||    
T  36512026 gacaagtttagaacactatgaaatgtttattttctaaaatttagaattttgtaacataaaacaaattaaatatggattttttaaaacgacaaatgttaaa 36512125  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgt-ctgcgaaaaattgt 596  Q
    |||||| |||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  36512126 gataaaattaataaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttacagagaaacttttagtaatattcttaacacgtcctgcaaaaaattgt 36512225  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||  | | | ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36512226 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattagaatttaggaggaactaattctgggt-gcacaattttttttagggactaaaagaactgtta 36512324  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36512325 aaattaaataaagactaaacttaaaaggt-ccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 36512387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 346 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 44493180 - 44492765
Alignment:
Q  346 aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  44493180 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttattgagataagtttagaactctatgaaaggttcaattactaaaatttataata 44493081  T
Q  446 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaa-gttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaat 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |||    
T  44493080 ttttaacatcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgaaaaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataat 44492981  T
Q  545 tttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgagg 644  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||     
T  44492980 tttttgcagggaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttcaacataacttaaacaaatttgaattgagc 44492881  T
Q  645 agggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagacta 744  Q
    |  |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  44492880 aaagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggacta 44492781  T
Q  745 aaaacatatttaaccc 760  Q
    ||| ||||||||||||    
T  44492780 aaaccatatttaaccc 44492765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 222 - 702
Target Start/End: Original strand, 37592761 - 37593229
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct---acnnnnnnnntt 318  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    |         ||    
T  37592761 agggttaaatatgtttctggtctctataaaattgaaaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggtttttttagcccctgcaaaaaaaaaatt 37592860  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaag---tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacacta 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |             ||||| |||| ||||| |    
T  37592861 acttctaattttagtcctagttacatcaaagacgtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttta-------------gacaaatttagaacacca 37592947  T
Q  416 tgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  37592948 tgaaaagttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacggattaaatatgaattt---aaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatt 37593044  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    || | ||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  37593045 tgaacgtaaaagtcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacagctgcaaaaaattgttcaaaaactcaggaattta 37593144  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaatta 702  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || | | | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37593145 agcataaattaaacaaatttgaattga-gaaggactaataccgagt-gcagaattttttttagggactaaaacaactattaaaatta 37593229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 404 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 6457505 - 6457152
Alignment:
Q  404 tttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataa 502  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6457505 tttagaacactatgaaaggttcatttactaaaacttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataa 6457406  T
Q  503 atttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaa 602  Q
    | |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||   ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  6457405 aattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgaattttttttgcagaggagcttttattaatgttctcaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaa 6457306  T
Q  603 actcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgatt---ggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaa 699  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |   |||||||   |    | |||||||||||||||||||||    
T  6457305 actcaagagtttaaccataaattaaacaaatttgaattgagga---actaatactgagtgcaggaaaaa--aaaaccagggactaaaagaactattaaaa 6457211  T
Q  700 ttaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  6457210 ttaagtaagaactaaacttaaaaggtccaaattttataggggccaaaaacatatttaac 6457152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 398 - 761
Target Start/End: Original strand, 34073623 - 34073979
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  34073623 gacaagtttagaacactaagaaagattcatttaataaaatttagaattttctaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaactacaaaagttaaa 34073722  T
Q  498 gat-aaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
    ||| |||  ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  34073723 gataaaaagtaacaaaatatggatgtagaaattaaattttgcgataattttttatggaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgt 34073822  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    | |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||   |  ||| ||||||||||||||||||    
T  34073823 tgaaaaa--caagagtttaggcataaa-taaacaaatttaaattgagtaggaactaatactca---gaaaaa--aaaattagggactaaaagaactatta 34073914  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34073915 aaattaagtaaggactaaatttaaaaggttccaattttatagggactaaaaatatatttaaccct 34073979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 221 - 758
Target Start/End: Original strand, 14200837 - 14201378
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-a 319  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||        || |    
T  14200837 tagggttaaatatgtatttggtccctataaaattgacatcttttaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttagtccctacaaaaaatattta 14200936  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |   |||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||| ||| |||| ||  ||    
T  14200937 caggtaattttagtctctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttctgagacaagcttagaacattacaaa 14201036  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta-agatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt-g 517  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||   || |||   | |    
T  14201037 aggttcatttaataaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatggattttttttaaatgacaaaagttcaagataaaagcaaaaaaaaattg 14201136  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgta--gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  14201137 gacgtagaaatcaaattttgagataattttttttacggatgaacttttagtaatgttcttaacacggctacaaaaaattattcacaaacttaagagttta 14201236  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||| ||| | || | |||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||     
T  14201237 agcataa-ttaaacaaatttgaatttagtatggactaaaactaagtgcataaattttttataaagactaaaaaacctattaaaattaagcaaggactaaa 14201335  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
     ||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14201336 attagaaagtcctgattttatagggactaaaaacatatttaac 14201378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 20721199 - 20721630
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  20721199 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactat 20721298  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  20721299 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 20721398  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || ||||||||             |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20721399 ggacatataaatcaaa-------------ttttgtggcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 20721485  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata-ctgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||  | | || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  20721486 gaataaattaaacaaatttgaattgagcagagattaatatttaaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaa 20721585  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20721586 cttaaaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 20721630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 512
Target Start/End: Original strand, 13371878 - 13372160
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattt 329  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         |||||||||||||    
T  13371878 tatgtttttggtccctataaaattggaaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccatacaaaaaagaattacttctaattt 13371977  T
Q  330 tagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcattt 429  Q
    |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13371978 tagtccctgtaacactaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcattt 13372077  T
Q  430 actaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13372078 actaaaatttagaaatttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaataaacaaa 13372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 319 - 760
Target Start/End: Original strand, 21439804 - 21440232
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| ||||||||||    
T  21439804 acttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatga 21439903  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |||    
T  21439904 aaggttcaattaataaaatttaaatttttttaacttgaaacgaattaaatataaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgg 21440003  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    |  || ||||||||||||  | |             |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  21440004 acatataaatcaaattttatggc-------------ggaacttttagtaatgttcttaacacgattacaaaaaattgtttaaaaacttaagagtttaaga 21440090  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | || | ||  || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  21440091 ataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatattaaatgcataatatttttgtaagaactaaaataactattaaaattaagtaaggattaaactt 21440190  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21440191 aaaatgtcacaattttataaagactaaaaacatatttaaccc 21440232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 224 - 631
Target Start/End: Original strand, 44879594 - 44879995
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-actt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||        || ||||    
T  44879594 ggttaaatatgtttttggtccgtataaaattgaaaactgttaagtttaatccatacttaattttagtatgttttttagtccttacaaaaaaaatttactt 44879693  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
     |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |       | ||||| |||| |||||||||||| |    
T  44879694 ataattttaatccatgttacaacaaagtttgtttaactatctctaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaaatttagaacactatgaaaag 44879793  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||  |    
T  44879794 ttcatttaacaaaatttagatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttt------caaaagttagagataaagttaagaaaatctggacat 44879887  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44879888 a-aaatcaaattttgcgacaaatttttgcacataaacttttagtaatgatcttaacacatctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataa 44879986  T
Q  623 attaaacaa 631  Q
    |||||||||    
T  44879987 attaaacaa 44879995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 760
Target Start/End: Original strand, 33000912 - 33001274
Alignment:
Q  397 tgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtta 495  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  33000912 tgacaagtttagaacaatatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtta 33001011  T
Q  496 aagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 595  Q
    |||| |||  ||  ||||  ||||  || || ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33001012 aagagaaaagtattaaatc-tggacatataa-tcaaattttgcgataattttttgcggagtaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattg 33001109  T
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt-aaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaacta 693  Q
    || ||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| || | || |||| || |||||||||||| |||||    
T  33001110 ttaaaaaacttaagagttt--gtataaattaaagaaatttgaaattgaacaaggactaatactgagtgcataatattttttgtaaggactaaaataacta 33001207  T
Q  694 ttaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33001208 ttaaaattaagtaaggaatgaacttaaaaagcctcaattttatagggactaaaaacatagttaaccc 33001274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 318 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 20720265 - 20719833
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||        
T  20720265 tacttctaattttagtcccttctaaaacaaagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac---- 20720170  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||    
T  20720169 ---ggttcaattactaaaatttagaattttttaatttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctg 20720073  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcga-caattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
     |  || ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||    ||||||    
T  20720072 aacatataaatcaaattttgcgattatttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagttta 20719976  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |  | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||     
T  20719975 agcataaattaaacaaatttgaattgagtagagactaatactaagttcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaa 20719876  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20719875 cttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaac 20719833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 224 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35498970 - 35498773
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||    
T  35498970 ggttaattatgtttttgatccctataaaattgagaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaattacttc 35498871  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  35498870 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaag 35498773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 226 - 758
Target Start/End: Original strand, 8392212 - 8392738
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttacttct 324  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||         |||||| |    
T  8392212 ttaaatatctttttgatccctataagattgagaacttctaagtataatcattacttaattttaatagtttttttaatccctacaaaaaaaatttacttat 8392311  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaag-tttataacactatgaaaggt 423  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||          |||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  8392312 aattttagtccctgctaaaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaacttttcaaca----------gacaagttttagaacaatataaaaggt 8392401  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaa-caaattgtggaagt 522  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  | | ||||||||||  |||||||  ||| |||| |||  |  |    
T  8392402 tcatttaataaaatctagaattttttaacgtgaaataaattaaatatgaatttttgtaaacgacaaaagtttcagataaaagtaaccaaaatgtacacat 8392501  T
Q  523 agaaatcaa-attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    |||||||||  ||||  || | | |||| | ||| |||||||| |||  |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8392502 agaaatcaattttttatgatattcttttatggagaaacttttaataacattcttaacacgtttgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcata 8392601  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||| ||||| |||  | | | |||| || |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  8392602 aattaaacaaatttggattgagtaaggaataatattgaaagtagatattttttattgggactaaaacaaccattaaaattaagtaaggactaaatttaga 8392701  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8392702 aggtcccaattttatagggaccaaaaacatatttaac 8392738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 528 - 760
Target Start/End: Original strand, 20719212 - 20719444
Alignment:
Q  528 tcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaa 627  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20719212 tcaaattttgcgatagttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaa 20719311  T
Q  628 acaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcc 727  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  20719312 acaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcct 20719411  T
Q  728 caattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20719412 caattttatagggactaaaaacatatttaaccc 20719444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 584
Target Start/End: Original strand, 29809401 - 29809567
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| | ||    
T  29809401 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaaggaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatttg 29809500  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct 584  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29809501 gatgtagaaatcagattttgcgataattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacaagtct 29809567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 434 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 9111777 - 9111458
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||  ||||||| ||  ||| | | |||| |||    
T  9111777 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattcgggatgcaaaaataaaa 9111678  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||| || || ||||||||||||| |||||||||    
T  9111677 ttttgagataattttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaagttgttctaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaa 9111579  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatt 732  Q
    |||||||| |  | ||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  9111578 tttaaatttactaaggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaatt 9111479  T
Q  733 ttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  9111478 ttatagggacaaaaaacatat 9111458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 32318432 - 32318105
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtaga 525  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||  |||||||  | |||| | |||    
T  32318432 tttaataaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaga 32318333  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaa-ttgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    ||| |||||||| || |||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |    
T  32318332 aataaaattttgagataatcatttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-t 32318234  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||      
T  32318233 taaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaga 32318134  T
Q  725 tcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32318133 tcccaattttatagggaccaaaaacatat 32318105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 753
Target Start/End: Original strand, 32318997 - 32319350
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaaga 499  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |    
T  32318997 aagtttagaacattactaaaggttcatttactaaattttagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaa 32319096  T
Q  500 taaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttc 598  Q
    ||||  |||||||  | |||| | || ||| || ||||| || ||||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  32319097 taaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttc 32319196  T
Q  599 aaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaa 698  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||  ||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  ||||||| |    
T  32319197 aaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagaaactaaaactgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattata 32319295  T
Q  699 attaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32319296 attaagtaagaactaaacttaaaaggtcccaattttatagggacaaaaaacatat 32319350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 554 - 771
Target Start/End: Original strand, 4327815 - 4328028
Alignment:
Q  554 aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaa 653  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  4327815 aggaatttttagtaatgttctaaatacgtctgc---aaattgttcaaaagcttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattaagtagggactaa 4327911  T
Q  654 tactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||| | || |||||   |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4327912 tactcaatg-aaaaagaaaaattagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggactaaaaacatat 4328010  T
Q  754 ttaaccctttattatatt 771  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  4328011 ttaaccattttttatatt 4328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 317 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18672516 - 18672350
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  18672516 ttacttctaattttagtcactgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 18672417  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaga 483  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18672416 gaaaggttcaattactaaaatttataattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaga 18672350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 568 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 20701330 - 20701138
Alignment:
Q  568 atgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaa 667  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |     
T  20701330 atgttcttaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatag 20701231  T
Q  668 atttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
      || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20701230 tatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagcactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaatcatatttaaccc 20701138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3118216 - 3117864
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  3118216 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaa-tttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 3118118  T
Q  499 at-aaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    || ||| | || ||| | | || | |||||| |||||||| ||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | ||| | || |||||    
T  3118117 ataaaagtaaaaaaaatctagacgcagaaataaaattttgagattattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacatttgtgcaataatttgtt 3118018  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || || |||||| || || || | || ||| || || | |||||||| ||||||||    
T  3118017 caaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaatttagatttagtagagactaaaacagagtgcataacttt-ttatatgaactaaaagcactattaa 3117920  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3117919 aattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggaccaaaaacatat 3117864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 560 - 753
Target Start/End: Original strand, 7654925 - 7655118
Alignment:
Q  560 ttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7654925 ttttagtaatgttcttaatatgtttgcaaaaaactattcaaaaactcaagagtttaaccataaattaaacaaatttaaattgagaagggactaatattga 7655024  T
Q  660 ttg-gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
     || | ||  ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7655025 gtgcggaattttttttttagggactaatagaattattaaaattaagtaagaactaaacttaaaa-gtcccaattttatagggacaaaaaacatat 7655118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 757
Target Start/End: Original strand, 13027445 - 13027855
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat-tttt 448  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| | | | ||||    
T  13027445 tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttcggagacacgtttagaacattataaaaggttcgtttactaaaattgaaattctttt 13027544  T
Q  449 taacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttt 548  Q
    |||||||| | ||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||| | |||| ||| | ||||||||||| |    |||||    
T  13027545 taacatgagatgaattaagtataaaaattttaa-atgacaaaagtttaagataaaataacaaaaatttggacgtaaagatcaaattttgtgctttttttt 13027643  T
Q  549 tgta------gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    | |       ||||||||| |||||||||||||||||  | |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  13027644 tttttttttggaggaacttatagtaatgttcttaacaaatgtataaaaaattgttcaaaaacttaagtgtttaagcataa-ttaaacaaatttagattta 13027742  T
Q  643 ggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | | ||||||| || || || ||   ||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13027743 gaaaggactaaaacagagtgcaat--ttttttatagggactaaaaaaacaattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggac 13027840  T
Q  743 taaaaacatatttaa 757  Q
     ||||||||||||||    
T  13027841 caaaaacatatttaa 13027855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 577 - 760
Target Start/End: Original strand, 23787773 - 23787956
Alignment:
Q  577 acacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttatttt 676  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |    
T  23787773 acacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagggactaatactgaatgcatagtatttttgt 23787872  T
Q  677 aaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     || ||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23787873 gagaactaaaacaaatattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgaatcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 23787956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 346 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33031346 - 33031181
Alignment:
Q  346 aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |       | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  33031346 aaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactataaaaggttcatttaccaaaatttagattt 33031247  T
Q  446 ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  33031246 ttttaacatgaaacgaatt-aatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaa 33031181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 562 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 33031165 - 33031019
Alignment:
Q  562 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgatt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  33031165 ttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatttaggagggactaatactgagt 33031066  T
Q  662 g--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    |  ||||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33031065 gcagaaaaa---aagttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaagg 33031019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 386
Target Start/End: Original strand, 29809130 - 29809293
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||    
T  29809130 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaatgactaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccatacagaaaagaattactt 29809229  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac 386  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29809230 ctaattttagtccatgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttggaac 29809293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 753
Target Start/End: Original strand, 32319595 - 32319927
Alignment:
Q  422 gttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtgga 519  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| | | |  ||||||| || |||||  |||||||  | ||||    
T  32319595 gttcgtttactaaaatttataatttttttaacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagtgaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctgga 32319694  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     | || ||| |||||||| || ||||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |  || ||||||| ||    
T  32319695 cgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcataaaagtttaaaca 32319794  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| ||   || | | || || |||||||||  ||||||| |||||||||||  | || ||||    
T  32319795 taa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaactgagtgcgtaattgttttatatggactaaaatcactattataattaagtaagaacaaaactta 32319893  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32319894 aaatgtcccaattttatagagacaaaaaacatat 32319927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6458561 - 6458413
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttact 321  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||          ||||    
T  6458561 gggttaaatatgtttttgatccttataaatttgggaacttctaagtttaattcttacttaattttaataggttttttagtccctacaagaaaaaaatact 6458462  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaac 370  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6458461 tctaattttagtccatgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaac 6458413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 588 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 21439350 - 21439178
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| || || | |   || || |||| |||||||    
T  21439350 aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattgagtcaggactaataccgaatgcatagtatttttgtaagtactaaaa 21439251  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21439250 caactattaaaattaagtaaggactaaacttacaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 21439178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 43932179 - 43932025
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaa--aatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaa 703  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || | |  | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43932179 caagagtttaagcataaattgaacaaattggaattgagtagggactaatactgagtgcatagtatttttttttaaggaccaaaacaactattaaaattaa 43932080  T
Q  704 gtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43932079 gtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 43932025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 589 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 18672312 - 18672147
Alignment:
Q  589 aaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaag 688  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||| |||||     
T  18672312 aaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagcatttttgtaaggattaaaac 18672213  T
Q  689 aactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||||    
T  18672212 aactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttacaaggactaaaaacatatt 18672147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 603 - 751
Target Start/End: Original strand, 13372177 - 13372324
Alignment:
Q  603 actcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaatta 702  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13372177 actcaaaagtttaagcataaattaaacaaattttaattgaggagggactaatactgagtgcagaaatattttttagagattaaaagaactattaaaatta 13372276  T
Q  703 agtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacat 751  Q
    ||||| | |||| ||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  13372277 agtaa-gactaaacttgaaaggtccaaattttatagggaccaaaaacat 13372324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 350 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 23496852 - 23496580
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||         |||| |||   |||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  23496852 tttgttttattatccttaaacttttgaattttttaacaattttttggagacacgttatgaacattataaaatgttcatttactaaaatatataatttttt 23496753  T
Q  450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttt 548  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||   |  |||||||    
T  23496752 aacatgagatgaattaaatttgaatttttttaaacgacaaaagtttaagacaaagataacaaaaatgtggaagtataaatcaaatttcaagctaattttt 23496653  T
Q  549 tgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcg-aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||  ||| ||||||| ||||||||   || |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23496652 tgcggagaaacttttggtaatgtttccaatacgtctacgaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcat 23496580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 42487089 - 42486936
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg-gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaag 704  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||| || | |  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42487089 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgaactgggactaatactgagtgcgtagtattt-ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaag 42486991  T
Q  705 taaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||| |||| ||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42486990 taaggactaaacttaaaatgccttaattttacagggactaaaaacatatttaacc 42486936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 3105677 - 3105829
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaa-atttattttaaggactaaaagaactattaaaattaag 704  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || | |  |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3105677 caagaatttaagcataaattgaactaatttaaattgagcagggactaataccgagtgcatagtatttatgt-aagtactaaaacaactattaaaattaag 3105775  T
Q  705 taaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3105776 taaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 3105829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 673 - 758
Target Start/End: Original strand, 1373524 - 1373609
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1373524 ttttaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 1373609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25666435 - 25666283
Alignment:
Q  211 ctatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-n 309  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  25666435 ctattttttttagggttaaatatgtttttggtccctgtaaaatagggaccttttaagtttaatccttatttaattttaatagattttttagtccctacaa 25666336  T
Q  310 nnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattat 362  Q
           ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  25666335 aaaagaattacttctaattttagtctctattacaacaaagtttgtttaattat 25666283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33031437 - 33031358
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33031437 tagggttaaatatgtttttgatacctataaaattaggaacttctaagtttagtcattacttaattttaataggtttttta 33031358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 621
Target Start/End: Original strand, 19058643 - 19058917
Alignment:
Q  347 aagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||         ||||  | || |||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  19058643 aagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacaatttttagtagacacatctagaacattataaaagatccatttattaaaatttagaattt 19058742  T
Q  447 tttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatt 545  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||| || | | |||||| ||| ||||||||  |||||||  | | |  ||| ||||||||||||| |  ||||    
T  19058743 tttaacatgagattaactaaatatgaatttgtttaaacgacaaa-gtttaagataaaagtaacaaaaatctagttgtaaaaatcaaattttgagctaatt 19058841  T
Q  546 ttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    |||||  ||| |  ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19058842 ttttgcggagaattttttaataatgtttttaacacatctacgaaaaattgtttaaacacttaagagtttaagcata 19058917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 20720809 - 20720960
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  |  | |  || |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20720809 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtg--actagtatttgtaaggactaaaacaactattaaaattaaat 20720906  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| |||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20720907 aaggactaaacttaaaatgcttcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 20720960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 41120623 - 41120701
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41120623 agggttaaatatgtttttgatccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttta 41120701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 676 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 3104959 - 3104875
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3104959 taaggactaaaataactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 3104875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 36881427 - 36881181
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaatttt 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||| |||| ||||||    ||||||||||||||||||    ||||        ||||||||||||||    
T  36881427 tatgttttttatccctataaaattgaaaacttctaaatttagtcctta----attttaataggttttttagcttctacaaaaaaaattacttctaatttt 36881332  T
Q  331 agtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcattta 430  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||  |        ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |    
T  36881331 agtctctgttacaacaaaatttatttaattatccttaaactctaaaaattttgaatgatttttttttgacaagtttagaacgctatgaaaggttcaataa 36881232  T
Q  431 ctaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  36881231 ctaaaatttaattttttttaacataaaatgaattaaatgtgaatgttttaa 36881181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 530 - 753
Target Start/End: Original strand, 9111859 - 9112081
Alignment:
Q  530 aaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaac 629  Q
    |||||||| || ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| |||| ||||| |||  || || ||||||||||||| ||||||    
T  9111859 aaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaacttgttaaaagtcttaaaagtttaagcataa-ttaaac 9111957  T
Q  630 aaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtccca 729  Q
    ||||||| ||| || || |||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||    
T  9111958 aaatttagatttagcagagactaaaactgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtctca 9112057  T
Q  730 attttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||| |||  |||||||||    
T  9112058 attttatagggacctaaaacatat 9112081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 679 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 33832080 - 33831993
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33832080 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagagaccaaaaacataattaaccctttatt 33831993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 753
Target Start/End: Original strand, 3118731 - 3118912
Alignment:
Q  571 ttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatt 670  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  | || | |||| |||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||    
T  3118731 ttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaattttaaaactttatgcatag-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataattt 3118829  T
Q  671 tattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | || || |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  3118830 ttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaagatat 3118912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 606 - 755
Target Start/End: Original strand, 18673071 - 18673219
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  | | |   || || ||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  18673071 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagatactaatactgaacgcatagtatttttgtaaggactaaaactactattaaaattaaat 18673170  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattt 755  Q
    |||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||    
T  18673171 aaggactaaacttaaaatgcctcatttttaca-agactaaaaacatattt 18673219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 569 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24951285 - 24951153
Alignment:
Q  569 tgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaa 668  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  || ||||     
T  24951285 tgttcttaacacgtctccaaaagaatgttcgaaaacttgagagtttaagcataa-ttaaacaaatttgaattgtgtagggactaaaactgggtgcaaaat 24951187  T
Q  669 tttattttaaggactaaaagaactattaaaatta 702  Q
    ||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24951186 tttgttatatggactaaaaaaactattaaaatta 24951153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 31771188 - 31771281
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  31771188 atttaatatagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagcttagtccttacttaattttaatagttattttagtccct 31771281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40365295 - 40365226
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40365295 gggttaaatatatttttgatccctataaaatttggatcttttaagtttactccttacttaattttaatag 40365226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 44493759 - 44493912
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||  || | |   || |  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44493759 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagagattaatactgggtgcatagtattttggtaaggaataaaacaactattaaaattaagt 44493858  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||  | | ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  44493859 aaggattgaacttaaaatgcctcaattttacatggactaaaaacatatttaacc 44493912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4328016 - 4327933
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4328016 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtcccta 4327933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 678 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 33030985 - 33030903
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33030985 aggactaaaaaaactattaaaattaaataaagactaaacttaaaagatcccaattttatagagatcaaaaacatatttaaccc 33030903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3118907 - 3118850
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3118907 tttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttaatccttacttaattttaatag 3118850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 25100466 - 25100551
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25100466 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggacctttcaagtctagtccttacttaattttaatagctattttagtcccta 25100551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Original strand, 30749427 - 30749511
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaactttt-aagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30749427 ggttaaatatgtttttagtccttataaaat-aggaacctttcaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaattcctac 30749511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 30982511 - 30982572
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30982511 tatgtttttggtccctataaaattgagaccttttaagtttaatccttacttaattttaatag 30982572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 33030903 - 33030980
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  33030903 gggttaaatatgtttttgatctctataaaattgggatcttttaagtttagtctttatttaattttaatagttttttta 33030980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Original strand, 41121075 - 41121160
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41121075 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaactttatagggaccaaaaacatatttaaccct 41121160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44287092 - 44287011
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  44287092 ttaaatatgtttttggtccctataaaattggggactttcaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 44287011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 292
Target Start/End: Original strand, 31435910 - 31435989
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31435910 atttataatagggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagaccttttaagtttagtctttacttaattttaatag 31435989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10287553 - 10287303
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaa-tccttacttaattttaataggttttttaatccctacnn 310  Q
    |||||||  ||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||      
T  10287553 tatttatattagggttgaatatgtttttgaccactataaaattcggaagttttaagtttaattttttacttaattttaata-gttttttagtccctac-a 10287456  T
Q  311 nnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataa 410  Q
          |||||| ||||| |||||| ||      |||| | ||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||| |       | |||||||||||||    
T  10287455 aaaagattacttataattatagtccctg------caaattatgtatagttatcctcaaatttttaaattttttaacgatttttataagacaagtttataa 10287362  T
Q  411 cactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatat 470  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10287361 cactacaaaagattcatttactaaaacttag-actttttaacatgaaatgaatttaatat 10287303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 587 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 14201011 - 14200838
Alignment:
Q  587 gaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaa 686  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||   || || || |||||| | |   || ||| |||| || || ||||||||    
T  14201011 gaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggataa-ttaaacaaactttgttttagcagagactaaaattacctgtaaatattttttgtagggactaaa 14200913  T
Q  687 agaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  14200912 aaagctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatgtcaattttatagggaccaaatacatatttaaccct 14200838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 23787586 - 23787505
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23787586 taaggactaaaacaactactaaaat-aagtaaggacgaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 23787505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 30982584 - 30982510
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30982584 ggactaaaagcactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 30982510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 753
Target Start/End: Original strand, 30982723 - 30982796
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30982723 ggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 30982796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 3117865 - 3117926
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3117865 tatgtttttggtccctataaaattgagatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 3117926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 6457152 - 6457233
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6457152 gttaaatatgtttttggcccctataaaatttggaccttttaagtttagttcttacttaattttaatagttcttttagtccct 6457233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 768
Target Start/End: Original strand, 10357652 - 10357745
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc-tttattat 768  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10357652 taaggactaaaaaatctattaaaatcaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggacaaaaaacatatttaacccatttattat 10357745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13027855 - 13027774
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13027855 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaattgtttttttagtcccta 13027774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 19176728 - 19176643
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19176728 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaataactaaacttaagaattcccaattctatagggactaaaaacatatttaaccct 19176643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 32318106 - 32318167
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32318106 tatgtttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattataatag 32318167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8738682 - 8738619
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8738682 tttttggtccctataaaattgggacctttcaagtttaatctttacttaattttaatagtttttt 8738619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 19176642 - 19176721
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19176642 tagggttaaatatgtttttagtccctatagaattgggaattcttaagtttagttattacttaattttaataggtttttta 19176721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34073989 - 34073894
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  34073989 tattaattttagggttaaatatatttttagtccctataaaattggaaccttttaaatttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 34073894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Original strand, 35498446 - 35498521
Alignment:
Q  217 attatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35498446 attaaagggttaaatatgtttttagttcctataaaattgggaccttttaagtttagtctttacttaattttaatag 35498521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 37592831 - 37592760
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  37592831 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttttcaattttatagagaccagaaacatatttaaccctt 37592760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 25666342 - 25666424
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  25666342 ggactaaaaaatctattaaaattaaataaggattaaacttaaaaggtccctattttacagggaccaaaaacatatttaaccct 25666424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8392738 - 8392673
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8392738 gttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttctaaatttagtccttacttaattttaat 8392673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 9111459 - 9111520
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9111459 tatgttttttgtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 9111520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 13371951 - 13371870
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  13371951 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagtttccaattttatagggaccaaaaacatatataaccc 13371870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 30982795 - 30982735
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30982795 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttt-aagtttagtccttacttaattttaatag 30982735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 711 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 35498501 - 35498448
Alignment:
Q  711 ctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttta 764  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35498501 ctaaacttaaaaggtcccaattttataggaactaaaaacatatttaacccttta 35498448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 36511902 - 36511983
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    ||||| |||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36511902 gttaaatatgttcttagtccttataaaattacaaacttttaagtttggtccttgcttaattttaataggttttttagtccct 36511983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 681 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 40364840 - 40364759
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | |||||  | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  40364840 actaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacctaaaagtttccaattttatagggaccaaaagcatatttaaccctt 40364759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 42274257 - 42274173
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||| ||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42274257 taaggactaaaaaacctattaaa-ttaagtaaggactaaacttagaagttcctaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 42274173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3043773 - 3043705
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3043773 ggttaaatatatttttggttcctataaaattgggatcttttaagtttaattcttatttaattttaatag 3043705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13372334 - 13372254
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatc 303  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13372334 atagggttaa--atgtttttggtccctataaaatttggacctttcaagtttagt-cttacttaattttaatagttcttttaatc 13372254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 759
Target Start/End: Original strand, 35498890 - 35498970
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  35498890 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggatcaaaaacataattaacc 35498970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36512387 - 36512304
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||||| || | ||||| ||||||    
T  36512387 gggttaaatatgtttttggtccctataaaatt-ggaccttttaagtttagtctttatttaattttaacagttcttttagtcccta 36512304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 566 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 13027510 - 13027440
Alignment:
Q  566 taatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaa 637  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13027510 taatgttctaaacgtgtctccgaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggat-aattaaacaaatttaa 13027440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14201378 - 14201303
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14201378 gttaaatatgtttttagtccctataaaatcaggactttctaattttagtccttgcttaattttaataggtttttta 14201303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20719449 - 20719375
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20719449 ttattgggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 20719375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 44610645 - 44610728
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  44610645 gttaaatatgtttctggtccctaaaaaattgggaccttctaagtttattcctaacttaattttaatagttttttttgtccctac 44610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18917436 - 18917347
Alignment:
Q  404 tttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||    
T  18917436 tttagaacactatgaaaggttcatttgctaattttt-----tttttaacatgaaacaaattaaatatgattttttttaaatgagaaaatttaaag 18917347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42488081 - 42488012
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42488081 gggttaaatatgtttttagtctctataaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 42488012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 481
Target Start/End: Original strand, 44612880 - 44612918
Alignment:
Q  443 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44612880 attttttaacatgagacgaattaaatatgaattttttaa 44612918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6244555 - 6244514
Alignment:
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6244555 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatatgaatttttt 6244514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 297
Target Start/End: Original strand, 7654851 - 7654928
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttt 297  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  7654851 ataggattaaatatgtttctgatgcttataaaattaaaaacttataagtttagttcttacttaattttaatcggtttt 7654928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 8737783 - 8737703
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  8737783 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttcccaattttatag-gaccaaaaacttatttaaccc 8737703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9112080 - 9112019
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9112080 tatgttttaggtccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 9112019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21440232 - 21440163
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21440232 gggttaaatatgtttttagtctttataaaattgtgacattttaagtttaatccttacttaattttaatag 21440163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32319349 - 32319288
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  32319349 tatgttttttgtccctataaaattgggaccttttaagtttagttcttacttaattataatag 32319288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Original strand, 33031351 - 33031436
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  33031351 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaatgactaaacttagaagttcctaattttataggtatcaaaaacatatttaaccct 33031436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 503
Target Start/End: Original strand, 35516308 - 35516373
Alignment:
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  35516308 ttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaa 35516373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1373609 - 1373542
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1373609 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 1373542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7655117 - 7655058
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7655117 tatgttttttgtccctataaaattggga-cttttaagtttagttcttacttaattttaata 7655058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 728 - 764
Target Start/End: Original strand, 8794799 - 8794835
Alignment:
Q  728 caattttatagagactaaaaacatatttaacccttta 764  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8794799 caattttatagggactaaaaacatatttaacccttta 8794835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 20719833 - 20719900
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20719833 gttaaatatgtttttagtccctttaaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 20719900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 691 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 30749495 - 30749427
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30749495 ctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggttcctattttataaggactaaaaacatatttaacc 30749427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 42486936 - 42487004
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42486936 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattaaggcattttaagtttagtccttacttaattttaatag 42487004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3855014 - 3854935
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  3855014 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaaactaacaaa 3854935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 13890675 - 13890730
Alignment:
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatt 379  Q
    ||||||||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13890675 taattttagtccccattaagactaaatttgtttaattatccttaaacttttaaatt 13890730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 14030800 - 14030855
Alignment:
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatt 379  Q
    ||||||||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030800 taattttagtccccattaagactaaatttgtttaattatccttaaacttttaaatt 14030855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17615463 - 17615428
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17615463 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 17615428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 304
Target Start/End: Original strand, 18672179 - 18672222
Alignment:
Q  261 ttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18672179 ttttaagtttagtccttacttaattttaatagttgttttaatcc 18672222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20973352 - 20973273
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  20973352 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 20973273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22982422 - 22982379
Alignment:
Q  438 ttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22982422 ttagaatttttcaacatgaaatgaactaaatatgaattttttaa 22982379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 732 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 34131347 - 34131308
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34131347 tttatagagaccaaaaacatatttaaccctttaatatatt 34131308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 44610724 - 44610645
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||| || ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  44610724 ggacaaaaaaaactattaaaattaagttaggaataaacttagaaggtcccaattttttagggaccagaaacatatttaac 44610645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Original strand, 2430771 - 2430829
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2430771 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaa 2430829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 3104875 - 3104944
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3104875 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagttcttacttaattttaatag 3104944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 759
Target Start/End: Original strand, 8738623 - 8738693
Alignment:
Q  689 aactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  8738623 aactattaaaattaagtaaagattaaacttgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaatatttttaacc 8738693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 9737488 - 9737534
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9737488 aaaacttagaattttttaacatgtaatgaattaaatataaatttttt 9737534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12620442 - 12620372
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  12620442 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 12620372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13803394 - 13803324
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  13803394 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 13803324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 14542151 - 14542221
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  14542151 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 14542221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16709247 - 16709177
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  16709247 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaatttaagataaa 16709177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Original strand, 20505455 - 20505513
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20505455 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaa 20505513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 766
Target Start/End: Original strand, 20579904 - 20579938
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20579904 tttatagagactaaaaacatatttaactctttatt 20579938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20721630 - 20721561
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20721630 gggttaaatatgtttttagcccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 20721561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 21439178 - 21439247
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21439178 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttgtaagtttagtccttacttaattttaatag 21439247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31653789 - 31653755
Alignment:
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31653789 ttttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttt 31653755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 37850427 - 37850357
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  37850427 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacggcaaaaatttaagataaa 37850357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43933147 - 43933078
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43933147 gggttaaatatatttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 43933078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 481
Target Start/End: Original strand, 44300566 - 44300620
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  44300566 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaa 44300620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 44492765 - 44492834
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44492765 gggttaaatatggttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 44492834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 1026402 - 1026361
Alignment:
Q  728 caattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattata 769  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1026402 caattttataaaaaccaaaaacatatttaaccctttattata 1026361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2431541 - 2431508
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaa 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2431541 ttatagggttaattaagtttttgatccctataaa 2431508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 4656844 - 4656788
Alignment:
Q  442 aattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaaga 499  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  4656844 aattttttaacatgaaatgaataaaatatg-atattttaagatgataaaagttcaaga 4656788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 292
Target Start/End: Original strand, 10357234 - 10357267
Alignment:
Q  259 acttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10357234 acttttaagtttaatctttacttaattttaatag 10357267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33001274 - 33001205
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33001274 gggttaactatgtttttagtccctataaaattgaggctttttaagttcattccttacttaattttaatag 33001205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 502
Target Start/End: Original strand, 45301262 - 45301331
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataa 502  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || |||||||    
T  45301262 aaaaattagaaatttttaacatgaaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataa 45301331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 6589012 - 6588568
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||     
T  6589012 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactag 6588913  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6588912 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattct 6588813  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588812 ggacgtagaaatcaaattttgcaacaattttttggagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 6588713  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  6588712 acataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaac 6588613  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6588612 ttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 6588568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 221 - 762
Target Start/End: Original strand, 7238449 - 7238992
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||         |||    
T  7238449 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatttgcaacttctaagtttaatccttatttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaaaatta 7238548  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |         |||||||||| |||| ||||||    
T  7238549 cttcgaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacattatgaa 7238648  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||    
T  7238649 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaagtttaaagataaaattaacaaaatctgga 7238748  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7238749 cgtagaaatcaaattatgcgacaattttttgtagaggaccttttaataatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaacctcaagagtttaagca 7238848  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||   |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  7238849 taaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaaaaaaaaaattagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaactt 7238948  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||  | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  7238949 aaaagattccaattttataggaaccaaaaacatatttaaccctt 7238992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 214 - 774
Target Start/End: Original strand, 43597350 - 43597910
Alignment:
Q  214 tttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnn 313  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||          
T  43597350 tttattttagggttaaatatgtttttgatccctataaaatagggacctttcaagtttaatctttacttaattttaatagattttttagtccctaaaaaaa 43597449  T
Q  314 nnn-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataaca 412  Q
        ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| ||||    
T  43597450 agaattacttctaattttagtccttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttattttagacaagtttagaaca 43597549  T
Q  413 ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  43597550 ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaa 43597649  T
Q  513 ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagt 612  Q
     | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43597650 atctggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagt 43597749  T
Q  613 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | | | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43597750 ttaaacataaattaaacaaatttgaattgacgagggattaatactaagt-gcataattttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggact 43597848  T
Q  713 aagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatttct 774  Q
    |  ||| ||| | ||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43597849 agacttgaaaggccccgattttttagggatcaaaaacatatttaaccctttattctatttct 43597910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 222 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47792267 - 47791717
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tta 319  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||          |||    
T  47792267 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaaaaatta 47792168  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgac-------aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataaca 412  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       | |||||||||| ||||    
T  47792167 cttctaattttagtacctgttacaacttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatgtttttaagacaagtttagaaca 47792068  T
Q  413 ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47792067 ctatgaaaggttcatctaccaaaatttagatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaa 47791968  T
Q  513 ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagt 612  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47791967 atctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagt 47791868  T
Q  613 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaa---aatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47791867 ttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagatttttttttttttaaggactaaaaaaactattaaaattaagtaagg 47791768  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
     || | ||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  47791767 actgaacttaaaaggtcccaattttatagggac--cgaacatatttaaccctt 47791717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 222 - 764
Target Start/End: Original strand, 22378332 - 22378875
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||         ||||    
T  22378332 agggttaaatatttttttggtccttataaaataaggatctttcaagtttaatccttacttaattttaatagattttttagtccttacaaaaaagaattac 22378431  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||| ||||    
T  22378432 ttctaattttaatccttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactacgaaa 22378531  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||     
T  22378532 ggtacatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggac 22378631  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22378632 gtagaaatcaaattttgcgacatttttttgcataggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaactgttcaaaaactcaatagtttaagtat 22378731  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  22378732 aaattaaacaaatttaaattgaggagagactaatactgagtgcagaattttttttttagggattaaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttg 22378831  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttta 764  Q
    |||   | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22378832 aaagacctctattttatagggac-aaaaacatatttaacccttta 22378875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 226 - 763
Target Start/End: Original strand, 14990426 - 14990962
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttct 324  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||         ||||||||    
T  14990426 ttaaatatgtttttgatccttataaaattgataatttttaagtttagtccttatttaattttaataggttttatagtccctacaaaataaaattacttct 14990525  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |         || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14990526 aattttagtccttgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggtt 14990625  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtag 524  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||    
T  14990626 catt-actaaaatttataattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaagg-caaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtag 14990723  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14990724 aaatcaaattttacgataattttttgcagaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaat 14990823  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||| |||||| || | |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| || |    
T  14990824 taaacaaatttgaagtaaggaaggactattactgagtgcataaattcttttaagggactaaaagaactattaaaattaggtaaggattaaacttagaagg 14990923  T
Q  725 tcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14990924 tcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 14990962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 226 - 763
Target Start/End: Original strand, 15420037 - 15420573
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttct 324  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||         ||||||||    
T  15420037 ttaaatatgtttttgatccttataaaattgataatttttaagtttagtccttatttaattttaataggttttatagtccctacaaaataaaattacttct 15420136  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |         || ||||||| ||||||||||||||||    
T  15420137 aattttagtccttgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggtt 15420236  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtag 524  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||    
T  15420237 catt-actaaaatttataattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaagg-caaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtag 15420334  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15420335 aaatcaaattttacgataattttttgcagaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaat 15420434  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||| |||||| || | |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| || |    
T  15420435 taaacaaatttgaagtaaggaaggactattactgagtgcataaattcttttaagggactaaaagaactattaaaattaggtaaggattaaacttagaagg 15420534  T
Q  725 tcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15420535 tcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 15420573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 242 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 18059403 - 18058887
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgtta 341  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||        ||||||||||||||||||| |||||    
T  18059403 tccctataaaattggaaacttctaagtttagtccatacttaattttaataggttttctagtctctacaaaaaaaattacttctaattttagtccctgtta 18059304  T
Q  342 cgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttag 441  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059303 caacaaa-tttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttg--gacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttag 18059207  T
Q  442 aattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgac 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| | |  |  || |||||||||||||||||    
T  18059206 aattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaattaacaaaatctaaacataaaaatcaaattttgcgac 18059107  T
Q  542 aattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattg 641  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18059106 aattttttgcagaggaacctttagtaactttcttaacacgtctgcaaaaatttgttcgaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 18059007  T
Q  642 aggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagaga 741  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||  | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||  ||  |||||||||| ||    
T  18059006 aggagagactaatactgattgtagaaaaattttgtggggactaaaagaactattaaaattaagtaagcactgaacttaaaagatcttaattttataggga 18058907  T
Q  742 ctaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  18058906 ccaaaaacatatttaaccct 18058887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 224 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 38159371 - 38158830
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||| |||         ||||||    
T  38159371 ggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggatttttcaagtttaatccttacttaattttaataaaatatttagtccttacaaaaaagaattactt 38159272  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||    
T  38159271 ctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttacactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagg 38159172  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  38159171 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa-ttaacaaaatctggaggt 38159073  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-cgaaaaattgttcaaaaactcaagag----tttaag 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    |||||     
T  38159072 agaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagttaatttaaa 38158973  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |   ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  38158972 cataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatattgagt-gcagttttttttttagggactaaaagaatcattaaaattaagtaaggactaaact 38158874  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | ||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38158873 tgaaaggcccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 38158830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 260 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 4926758 - 4926313
Alignment:
Q  260 cttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaa 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||          ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4926758 cttttaaatttaatccttacttaattttaataggttttttagtccatataaaaaaaaattacttctaattttagtctctgttacaacaaagtttgtttaa 4926659  T
Q  359 ttatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaa 458  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |         || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926658 ttatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaa 4926559  T
Q  459 cgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttg--tag-ag 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  4926558 cgaattaaatatgaattttttaaaacggcacaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcatagtag 4926459  T
Q  556 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4926458 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaata 4926359  T
Q  656 ctgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaatt 701  Q
    |||| || | |  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4926358 ctgagtgcagagttttttttttgggactaaaagaactattaaaatt 4926313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 224 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 1962317 - 1961779
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||    
T  1962317 ggttaaatatgtttttcgtctctataaaattgagaacttttaagtttaattattatttaattttaataggttttttaattcctacaaaaaagaattactt 1962218  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         ||||||| || ||||||||||||||    
T  1962217 ctaattttagtcgttattacaacaaagttcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatatttttgagacaagtatagaacactatgaaagg 1962118  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta-agatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  1962117 tcaatttattaaaatttagaattttttaacatgaaacgaatgaaatatgtattttttttaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacg 1962018  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1962017 tagaaattaaattttgcgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttctaaacacgtctgtgaaaaattgttcaaaaactcaaaaatttaagcata 1961918  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || | || ||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  1961917 aatgaaacaaatttgaattgaggagggactgatactaaatgcagaatttttttttagacacttaaagaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaa 1961818  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |  | |||||||||||   || ||||| |||||||||||    
T  1961817 aaattccaattttataagaacgaaaaatatatttaaccc 1961779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 757
Target Start/End: Original strand, 46044225 - 46044702
Alignment:
Q  281 taattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaattt 380  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  46044225 taattttagtaggttttttagtccctacaaaaaaaattacttctaattttagtccctgctaaaacaaagtttttttaattatccttaaactcttaaattt 46044324  T
Q  381 ttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta 480  Q
    |||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46044325 ttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaa 46044424  T
Q  481 agatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcga-caattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaaca 579  Q
    | |||| ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |||| |||||||||||  ||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  46044425 aaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcgataaattttttacagatgaacatttagtaatgtttttaaca 46044524  T
Q  580 cgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaag 679  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| || |  |  || || ||||    
T  46044525 cgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcattaattaaacaaatttaaactgaacagagactaatactgagtgcatgatatttttataag 46044624  T
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46044625 gactgaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 46044702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 339 - 760
Target Start/End: Original strand, 35482051 - 35482469
Alignment:
Q  339 ttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35482051 ttacaacaaagtttgtttaattatctttaaactgttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatt 35482150  T
Q  439 tagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgc 538  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||      
T  35482151 tagaatttttt--cattaaatgaattaaatatgaattttttaa-acgctaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttag 35482247  T
Q  539 gacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaa 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  35482248 gacaattttttgcagaggaacttttaataattttcttaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaatagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 35482347  T
Q  639 ttgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatag 738  Q
    ||||| | ||||||||||||| || | |||   |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  35482348 ttgagaaaggactaatactgagtgcagaaaaaaaaattagggattaaaagaactattaaaattaagtaatgactaaatttaaaatatcctaattttatag 35482447  T
Q  739 agactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  35482448 ggaccaaaaacatatttaaccc 35482469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 219 - 758
Target Start/End: Original strand, 4899736 - 4900274
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt 318  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||    
T  4899736 tatagggttaaataggtttttgatccctataaaattgataacttctacgtttaatccttacttaattttaatagtttttttaatccctatataaaaaatt 4899835  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    | |   ||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |         ||||| |||||||||||||||    
T  4899836 agtgacaattttagtacctgttaaaacaaagtttatttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttataacactatga 4899935  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat-aaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||  ||||||| | ||    
T  4899936 aaggttcatttactaaaatttagaa-tttctaacatgaaacaaattaaatatgaattttttcaaaccgcaaaacttaaagataaaaagtaacaaaatctg 4900034  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4900035 gatgtagaaatcaaattttgcgataatttttcgcgaaggaacttttattaatgttctaaacaagtctgcaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaag 4900133  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | || | |||   |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||    
T  4900134 tataaattaaacaaatttgaattgagtagggactaatattcagtgcagaaaaaaaaattagggactaaaagacctattaaaattaagtatggattaaact 4900233  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  4900234 taaaaggtctcaattttacagggactaaatatatatttaac 4900274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 398 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 46331043 - 46330681
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  46331043 gacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgtaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaa 46330944  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    ||||||  ||| ||| | | ||  || |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  46330943 gataaaagtaataaaatctcgacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacgcgtctacaaaaaattgtt 46330844  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||    
T  46330843 aaaaaacttgagagtttaagcataaattaaacatatttgaattgagtagagactaatattgagtgcatagtatttttataaggactaaaacaactattaa 46330744  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46330743 aattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 46330681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 236 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 43574645 - 43574115
Alignment:
Q  236 ttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-acttctaattttagtc 334  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||        || |||| |||||||| ||    
T  43574645 ttttggtccctgtaaaatttggaacttttaagtttagtccttacttaattttaatatgttttt--agtcctacaaaaaaaatttacttataattttaatc 43574548  T
Q  335 cttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaa 434  Q
    | || ||  ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |        ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  43574547 cctgctaaaacaaattttgtttaattattcttaaactctaaaatgtttgaacgatttttttgtgacaagtttagaacactataaaatgttcatttattaa 43574448  T
Q  435 aatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatt-taacaaattgtggaagtagaaatcaaat 533  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||| | | || |||||||||||||    
T  43574447 aatttagaattttctaacttgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaaagtaataaaatttagatgtagaaatcaaat 43574348  T
Q  534 tttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaat 633  Q
    ||||||| |||||||||   || ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43574347 tttgcgataattttttgcgaagtaacttatagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaat 43574248  T
Q  634 ttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattt 733  Q
    || ||||||| | ||||||||||| | || | |||   |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||| ||| ||| ||    
T  43574247 ttgaattgagcatggactaatactcagtgcagaaaaaaaaaatagggactaaaagaactattaaaactaagtaaggattatacttaaaaggtctcaactt 43574148  T
Q  734 tatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43574147 tatagggactaaaaacatatttaaccctgtatt 43574115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 222 - 763
Target Start/End: Original strand, 10620394 - 10620924
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||    
T  10620394 agggttaaatatctttttggtccctataaaattgaaaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccgtacaaaaaataattac 10620493  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||  ||||||||||||    
T  10620494 ttctaattttagtccttgctaaaataaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttcattaagacaagttttgaacactatgaaa 10620593  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||     
T  10620594 agttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaacaaaatatggac 10620693  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaa-ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
    ||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||| ||| | ||||||||||||||            
T  10620694 gtataaatcaaattttgtaacaatttttttgcagagaagcttttagtaatgttcttaacatgtatacaaaatattatccaaaaactcaagag-------- 10620785  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
       ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| || | ||  || ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||  ||| |||     
T  10620786 ---attaaacaaatttgaattgtgtagggactactactgagtgcagaa--tttttttagggactacaaaaactattaaaattaaataaggattaaacttc 10620880  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  10620881 aaatatcacaattttataaggaccaaaaacatatttaacccttt 10620924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 222 - 766
Target Start/End: Original strand, 11396833 - 11397370
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||        |||||    
T  11396833 agggttaaatatatttttgatccttataaaattggaaatttctaagtttagtccttacttaatttaaatagtctttttaatccctacaaaaaaaattact 11396932  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||| |||||||||||| |||| |    
T  11396933 tataattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttgtgtaagacaggtttataacactgtgaatg 11397032  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaa-catgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||  |  |     
T  11397033 gatcatttactaaaatttagaatttttttagcgtgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgtcaaaagttaaagataaaagtaacaaatc-taaac 11397131  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  11397132 atagaaatcaaattttccgatatttttttacaaaggaacttttagcaatgtttttaacacgtatgcaaaagattgttcaaaaacttaagagtttgaacat 11397231  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || | ||  || ||||| ||||     |||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  11397232 aaattaaacaaatttgaattgtgtagggaataatactgagtgcataa--tttttttagggac-----gaactatttaaattaagtaaggactaaacttaa 11397324  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    || ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||    
T  11397325 aaggtcccaattttattggcaccaaaaacatatttaaccctatatt 11397370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 222 - 602
Target Start/End: Original strand, 27727099 - 27727485
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tta 319  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||          |||    
T  27727099 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttactccttacttaattttaataggtttttaagtccctacaaaaaaaaaatta 27727198  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| || |||| |||    
T  27727199 cttctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatactaagaa 27727298  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaatttttt--aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa-tttaacaaattgt 516  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  27727299 aggttcattaacttaaatttagaattttttttaccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaatttaacaaaatct 27727398  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc-gaaaaattgttcaaaa 602  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  27727399 ggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaatttttagtaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaaattgttcaaaa 27727485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 224 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6331315 - 6330978
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||         ||||||    
T  6331315 ggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaatagattttttagtcccaacaaaaaagaattactt 6331216  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||    
T  6331215 ctaattttagtccttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaagg 6331116  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||      
T  6331115 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaaatctggaca 6331016  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaac 559  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  6331015 tagaaatcaaattttacgacaattttttgcataggaac 6330978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 449 - 771
Target Start/End: Original strand, 21109448 - 21109772
Alignment:
Q  449 taacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatt-taacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatttt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||| | | || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21109448 taacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaaagtaacaaaatctcgatgtagaaatcaaattttgctataatttt 21109547  T
Q  548 ttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagg 647  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  21109548 ttgcagaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttgaattgagtagg 21109647  T
Q  648 gactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaa 746  Q
    |||||||||| | || | ||||   |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  21109648 gactaatactcagtgcagaaaagaaaaattagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacaaggactaaa 21109747  T
Q  747 aacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  21109748 aacatatttaacccttttttatatt 21109772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 224 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 38599389 - 38598848
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---ttac 320  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||    
T  38599389 ggttaaatatgtttttgattcctataaaattacgaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccccacaaaaaaaaaaattac 38599290  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    || |||||||||||  || ||  | ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| ||||||||||||    
T  38599289 ttataattttagtcactgctaaaataaattttgcttaattatctttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaa 38599190  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtgga 519  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |  |||||||  | ||||    
T  38599189 gattcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaattttaagatataagtaacaaaaatatgga 38599090  T
Q  520 agtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
     |||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38599089 cgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-tggaggaccatttaataacgttcttaacacgtctgtgaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagc 38598991  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||| || | |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  38598990 ataaattaaacaaatttggattgagtaaggactaatattgagtgcagaaattttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaactt 38598891  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | || |||  |||||| ||| |||  |||||||| ||||||||    
T  38598890 acaaggtcgtaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 38598848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 38199373 - 38198944
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| || |||||    
T  38199373 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtt-gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaatactat 38199275  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||| |||||||||||  ||| ||| | |    
T  38199274 gaaaggttcaatcaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaaaaaaaattaaagataaaagtaataaaatat 38199175  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||             | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38199174 ggacatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 38199088  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  38199087 gaataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaac 38198988  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38198987 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38198944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 703
Target Start/End: Original strand, 44167764 - 44168135
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||    
T  44167764 ttacttctaattttagtcactgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttataacactat 44167863  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||             || ||| | |    
T  44167864 gaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagt-------------aataaaatct 44167950  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44167951 ggacatataaatcaaattttacgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctac--aaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 44168048  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaa 703  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || | ||  || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44168049 gcataaattaaacaaatttgaattgagcaaagactaatactgagtgcataacatttttctaaggactaaaacaactattaaaattaa 44168135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 758
Target Start/End: Original strand, 1544364 - 1544886
Alignment:
Q  236 ttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaattttagt 333  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||          ||||||  ||||||| |    
T  1544364 ttttggtccttataaaattagaaacttctaagtttagtccttacttaattttaatag--tttttagtccatacaaaataaaaattacttagaattttaat 1544461  T
Q  334 ccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttacta 433  Q
    ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         | |||||||| ||||||||||||   |||||| |||    
T  1544462 ccttgctaaaacaaattttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatatttttgagtcaagtttagaacactatgaaaaactcatttgcta 1544561  T
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaat 533  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  1544562 agattttgaattttttaacttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagatgaaagtaacaaaatcgggatgtagaaatcaaat 1544661  T
Q  534 tttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaat 633  Q
    ||| ||| ||  ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  1544662 tttacgataagcttttgtgaagtaacttttaataatgttcttaacacgtatg-gaaaaattgttcaacaactttaaagtttaagcataaatcaaacaaat 1544760  T
Q  634 ttaaattgaggagggactaatactgatt---ggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaa 730  Q
    || ||||||  ||||| ||||||| | |   |||||||   |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  1544761 ttgaattgactagggattaatactaagtgcaggaaaaa--aaaaataaggactaaaagaactattaaaattacgtaaggactaaacttataagatcccaa 1544858  T
Q  731 ttttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  1544859 ttttacagggatcaaaatcatatttaac 1544886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 224 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 44081366 - 44080838
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||  |          ||||||     
T  44081366 ggttaaatatgtttctggtccctataaaattgggaacttctaagtttaatttttatttaattttaatagcttttttagtcaat----------ttactta 44081277  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | |         ||||| |||| || ||||||||||||    
T  44081276 taattttagtccttgttaatacaaagtttgtttaattatacttaaattcttaaatttttgagcgaatttttttagacaaatttagaatactatgaaaggt 44081177  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagt 522  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||  |||| ||| | |||| ||    
T  44081176 tcatttactaaaatttaaaatttttaaaattgaaattaattaaatatgaattttttaaaacgactaaacatcaagataaaagtaacaaaaatatggacgt 44081077  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||   ||||  |||||| |||||||||||||| |    
T  44081076 agaaattaaattttgcgatcattttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtttgcaaaagcatgtttgaaaacttaagagtttaagcat-a 44080978  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaa 722  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | || | |||  | || ||  | |||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  44080977 attaaacaagtttgaattgagtagggactaatactaagtgcagaaaaattttatagaggctaaaaaaattattaaaattaaataaggactaaacttagaa 44080878  T
Q  723 tgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44080877 ggtctcaattttatagggattaaaaacatatttaaccctt 44080838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 318 - 759
Target Start/End: Original strand, 29155933 - 29156378
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat- 416  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||          ||||||||| |||| |||     
T  29155933 tacttctaattttagtccctattagaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttatgaacaattttttttaaacaagtttagaacattata 29156032  T
Q  417 ---gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat 513  Q
       | | |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||   || | |     
T  29156033 tatggacggtttatttacaaaaatttagaattttttaatttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagctaaaagcaatagaa 29156132  T
Q  514 tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtt 613  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  29156133 tctggacatagaaatcaaattttgcgataattttttgtggaggacctttta-taatgttcataacatgtctacaagaaattgttcaaaaacttaagagtt 29156231  T
Q  614 taagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttatt-ttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||||| || |||  ||| ||  |||| ||||||||||| |||| ||||| |||| | ||    
T  29156232 taagcataaattatataaatttgaattgagccgagactaatactgagtgcaaattttttttagtaagaactaaaagaaccattataattatgtaaagact 29156331  T
Q  713 aagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29156332 aaacttaaaaggtctcaattttatagggacttaaaacatatttaacc 29156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 43083825 - 43084251
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  43083825 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactat 43083924  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |  |  |||| ||||||||||  ||| ||| | |    
T  43083925 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaaaaaattaaatatgaatttttgaaaacaattaaagataaagataaaagtaataaaatat 43084024  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    | || || ||||||||||||||| |             || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43084025 gaaaatataaatcaaattttgcggc-------------ggtacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 43084111  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||    ||||| |||| |    
T  43084112 gaataaattaaacaaatttgaattgagtagagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaat----taaggactaaac 43084207  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43084208 ttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaaccc 43084251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 3495966 - 3495540
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         | |||||||| ||||||||||    
T  3495966 acttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgaggcaagtttaaaacactatga 3495867  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |||    
T  3495866 aagattcaattaataaaatttaaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgg 3495767  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    |  || ||||||||||||| | |             |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||||||     
T  3495766 acatataaatcaaattttgtggc-------------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaaga 3495680  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3495679 ataaattaaacaaatttgaattgatcagggactaatattgaatgcatattatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaagttt 3495580  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||| | |||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  3495579 aaaatgcctcaattttataggaact--aaacatatttaaccc 3495540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 516 - 758
Target Start/End: Original strand, 4883782 - 4884025
Alignment:
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4883782 tggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacgtttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaagagttta 4883881  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4883882 aacataaattaaacaaatttaaattgaggaggaactaatactgagtgtagaattttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaa 4883981  T
Q  715 gcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
     ||| ||| ||||| |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  4883982 acttgaaaggtccctattttataggaatcaaaaacatatttaac 4884025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 346 - 655
Target Start/End: Original strand, 15652795 - 15653100
Alignment:
Q  346 aaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         || | ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15652795 aaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttttgagatacgtttagaacaatatgaaaggtttatttattaaaatttagattt 15652894  T
Q  446 tttt--aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||      |||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  15652895 ttttttaatatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaaagtaa------caaaatttggacgtagaaatcaaattttacgataa 15652988  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 643  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15652989 ttttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattaag 15653088  T
Q  644 gagggactaata 655  Q
     |||||||||||    
T  15653089 tagggactaata 15653100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 8832952 - 8832597
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  8832952 acaagtttagaacattacaaaaggttcatttactaaaatttagacctatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaa 8832853  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaat-gttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
    |||||  |||||||  | |||| | |||||| |||||||| || |||| || | ||| |||||||| ||||| |||||| |||| | ||| |||||||||    
T  8832852 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattattcggagatgaacttttcgtaatagttcttgacacttgtgcaaaaaattgt 8832753  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    | |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||| |||||||||||||    
T  8832752 taaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggaccaaaagaactatta 8832654  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8832653 aaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 8832597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 525 - 760
Target Start/End: Original strand, 45958836 - 45959071
Alignment:
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc-gaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa 623  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  45958836 aaatcaaattttgaaataattttttgcggaggaacttttagtaatgttattaacacgtctacaaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaagcagaaa 45958934  T
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  45958935 ttaaacaaatttgaattgaacagagactaatactgagtgcatattatttttctaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggaataaacttaaaat 45959034  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45959035 gccccaattttatatagactaaaaacatatttaaccc 45959071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 12621625 - 12621979
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||| |||||| ||     
T  12621625 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttaaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacgaaagttcaaa 12621724  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | || ||| |||||||| || ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  12621725 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgctaaaaattgtt 12621824  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || | | || || |||||||||  |||||||     
T  12621825 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcacaattgttttatatggactaaaaatactattat 12621923  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  12621924 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaaatttatagggaccaaaaacatat 12621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 398 - 572
Target Start/End: Original strand, 36019813 - 36019988
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  36019813 gacaagtttataacattatgaaatgttcatttactaaaatttagaactttttaacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaa 36019912  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa-ttttttgtagaggaacttttagtaatgtt 572  Q
    |||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  36019913 gataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttttgcatagaaacttttagtaatgtt 36019988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 1260363 - 1260023
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||| ||||||||    |||||   |     
T  1260363 aaagattcatttattaaaatttagaattttttaatataaaatgaattaa-tatgactttttttaaacaacaaaagttcaagataaaagccacaaaaattt 1260265  T
Q  518 gaag-tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||| || |||||||    
T  1260264 gaacatagaaattaaatttagagataattttttgtggaggaacttttagcaatgtttttaacacgtcttcaaaaaattgcttaaaaacttaaaagtttaa 1260165  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||| || | |||||| || || ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  1260164 acataa-ttaaacaattttgaatttagtagggactaaaactgaatgcataaattttttatagggactaaaaaaacaattaaaattaagcaaggactaaac 1260066  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1260065 ttaaaatatcccaattttatagggaacaaaaacatatttaacc 1260023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 560 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 33624869 - 33624672
Alignment:
Q  560 ttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  33624869 ttttagtaatgttcttaacacgtctac-aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaacagagactaatattga 33624771  T
Q  660 ttggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
     || |     || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33624770 gtgcatggtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 33624672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 588 - 761
Target Start/End: Original strand, 27727999 - 27728172
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | || | |||  | ||||| |||||||||    
T  27727999 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattaaggaaggactaatactaagtgcagaaaaatcttttagggactaaaa 27728098  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  27728099 gaactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaacgtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccct 27728172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 37107922 - 37107568
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||     
T  37107922 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttcaacatgaaataaattaaatataaattttttaaaaagacaaaagttcaaa 37107823  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||   ||||||  | |||| | || ||| |||||||  || ||||||||| ||   || |||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  37107822 ataaaagcaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttaagataattttttgcagttaaaattttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 37107723  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  |||||||     
T  37107722 caaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaagcaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgtataattgttttatatggactaaaaacactattat 37107624  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37107623 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 37107568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 8082048 - 8081698
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||  ||| ||     
T  8082048 acaagtttagaacattacaaaatgttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaa--gtttaaa 8081951  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||| | |||||||  | |||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  8081950 ataattgtaacaaaaatatggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 8081851  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | ||  || |||||     |||||| ||||||||    
T  8081850 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataa--tttttttatattttaaaagcactattaa 8081754  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  8081753 aattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttataggtaccaaaaacatat 8081698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 223 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 37540206 - 37539849
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-act 321  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||        || ||     
T  37540206 gggttaaatatatttttggtccatataaaattgaaaacttataagtttagtccttacttaattttaatagtctttttaatccatacaaaaaatatttaca 37540107  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         || |  |||| |||| |   ||||    
T  37540106 tgtaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttccgagatatatttagaacatttcaaaag 37540007  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatt-ttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtgga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||   ||| |||   | ||    
T  37540006 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagataaaagcaacaaaaaattaga 37539907  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaa 577  Q
      | |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37539906 cttggaaatcaaattttgagataattttttacagaggaacttttagtaatgttcttaa 37539849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 418 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 1065915 - 1065580
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgt 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||| ||| | |    
T  1065915 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatct 1065816  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
     || |||| ||| |||||||| || ||||||||| |||  |||||||  | |||||||||| || | | | ||||| | ||||||| || || ||||||     
T  1065815 agacgtaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaatacttgtacaaaaaaatattcaaaatcttaaaagtttag 1065716  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || | | || || |||||||||  || |||| |||||| ||||| |||| |    
T  1065715 gcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataattgttttatatggactaaaaacacaattataattaattaaggactaaac 1065617  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  1065616 ttaaaatgtcccaattttataggaaccaaaaacatat 1065580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 317 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 33625110 - 33624951
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |        || ||||||||| ||||||||    
T  33625110 ttacttctaattttagtccttgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttagag-attttttttat-acaagtttagaacactat 33625013  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33625012 gaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 33624951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 588 - 760
Target Start/End: Original strand, 3496424 - 3496596
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |   || || ||||||||||||    
T  3496424 aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcatgaattaaacaaatttaaattgagtaaggactaatacttagtgcatagtatttttgtaaggactaaaa 3496523  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||||||||||||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3496524 caactattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 3496596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 588 - 760
Target Start/End: Original strand, 38199809 - 38199981
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| | || | |   || || ||||||||||||    
T  38199809 aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgatcaaggactaatactaagtgtatagtatttttgtaaggactaaaa 38199908  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38199909 caactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaatatatttaaccc 38199981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 434 - 659
Target Start/End: Original strand, 1066490 - 1066715
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||  ||||||| || |||| |||||||| |||    
T  1066490 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaa 1066589  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaa 632  Q
    ||||| ||  |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  1066590 ttttgagatcattttttgcatatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaa 1066688  T
Q  633 tttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    |||| ||| || ||||||||| |||||    
T  1066689 tttagatttagtagggactaaaactga 1066715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 607 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 44167176 - 44167024
Alignment:
Q  607 aagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagta 706  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44167176 aagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagta 44167077  T
Q  707 aggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44167076 aggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 44167024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 15131588 - 15131740
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |     || || |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15131588 caagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaggaactaatactgagtgcatggtatttttgtaaggactaaaacaacgattaaaattaagt 15131687  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15131688 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 15131740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 216 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 28924920 - 28924371
Alignment:
Q  216 tattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac--nnnnn 313  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||           
T  28924920 tattttagggttaaatatatttttgatccctataaaattgggaacttctaagtttaatccttacttaattttaatagcttttttagtccctacaaaaaga 28924821  T
Q  314 nnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacac 413  Q
       |||| | ||||||||||||||||    || || |||||||||||||| || || | ||||| |||||||| |         |||| ||||| ||||     
T  28924820 aaattacatgtaattttagtccttgtataaactaaatttgtttaattatctttgaattcttaaagttttgaacgattttttggagacatgtttaaaacat 28924721  T
Q  414 tatgaaaggttcatttact--aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaa-ttttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac- 509  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||   ||| |||||||||| |||||| | | |||||||||| |||| ||   ||||     
T  28924720 tataaaatgttcatttactaaaaaaaatataattttttaacaaga---gaa-taaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagaaaagagtaaca 28924625  T
Q  510 aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 609  Q
    ||| | |||| ||||||||||||  ||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || | | |||||||||| | ||  | | |    
T  28924624 aaaatctggacgtagaaatcaaa--ttgagataatattttgcagaggaactttta-taatgttcttaaaaagtttacaaaaaattgtttataagtttacg 28924528  T
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||| ||| | |||| ||   | || || |||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  28924527 aatttaagcat-aattaaacaaatttagattaagaagagactaaaactaaatggagaatggttttatagggac-aaaaaaactattaaaattaagtaatg 28924430  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattata 769  Q
     ||||  |||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  28924429 actaaatttaaaaagtctcaa-tttatagggattaaaaacatatttaaccttctattata 28924371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 344 - 659
Target Start/End: Original strand, 47139733 - 47140051
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttag-a 442  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |         |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  47139733 acaaattttgtttaattatccttaaacatttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacattatgcaaggttcatttactaaaatttagta 47139832  T
Q  443 attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
     |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |  | |||||  |||||||   | | | ||||||| |||||||| || |    
T  47139833 ttttttttatatgaaatgaattaaatatgaattgttttaaatgacagaaggtcgaaataaaaataacaaaaatttgta-tagaaattaaattttgagata 47139931  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgt-ctgc----gaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaa 637  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| || |     |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47139932 attttttgt-gaataacttttagcaatgttcttaacacgtacttctacaaaaaaattgttcaaaaagttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttaa 47140029  T
Q  638 attgaggagggactaatactga 659  Q
    ||| || ||||||||| |||||    
T  47140030 atttagtagggactaaaactga 47140051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 640
Target Start/End: Original strand, 9633042 - 9633461
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tta 319  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||  |||||||| || ||||||||||||||||   |||||| |||||||          |||    
T  9633042 agggttaaatatgtttttgtttcctataaaattaaaaactaataagtttagtctttacttaattttaataacatttttagtccctacaaaaaaatattta 9633141  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttg-aacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    | | |||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |         ||||||||||||||| ||| |    
T  9633142 catgtaattttaatccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataa 9633241  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtg 517  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||| | | || |    |||||| ||||  |||||||  | ||    
T  9633242 aaggttcatttactaaaattcataattttt-aacttgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttg 9633340  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || |||||| |||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9633341 gatataaaaatcacattttgagataaatttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaag 9633439  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaatt 640  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  9633440 cat-aattaaacaaatttgaatt 9633461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 557 - 759
Target Start/End: Original strand, 36020005 - 36020198
Alignment:
Q  557 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatac 656  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36020005 aacttttagtaatgttcttgacacatttgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagtataaattaaacaaatttaaattgagga--gactaatac 36020102  T
Q  657 tgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    ||| || | |||       || | |||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  36020103 tgagtgcagaaa-------taggaactaaaagaactattaaaatcaaaaaaggactaaacttaaaaagtcacaattttatatagatcaaaatcatattta 36020195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 557 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 38593358 - 38593164
Alignment:
Q  557 aacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatac 656  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |     
T  38593358 aacttttcgtaatgttcttaacacttttgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaat 38593260  T
Q  657 tgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||| || | || ||| || || ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38593259 tgagtgcataatttttttatatggactcaaaacactattaaaattaagtaaggactaaactt-aaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 38593164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 46331626 - 46331778
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46331626 caagagtttaagcataacttgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaataactattaaaattaagt 46331725  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    || | |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46331726 aaagactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 46331778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 599 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 43083370 - 43083212
Alignment:
Q  599 aaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaa 698  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || | |   || || |||||  ||||| ||||||||||    
T  43083370 aaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattgagtaaggactaatagtgagtgtatagtatttttgtaagggttaaaacaactattaaa 43083271  T
Q  699 attaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43083270 attaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatagggattaaaaacatatttaa 43083212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 45958141 - 45957988
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45958141 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagagactaatattgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 45958042  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||  |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45958041 aagcactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 45957988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 33625666 - 33625817
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  | |   || || |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33625666 caagagtttaatcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactgagtacatagtatt-ttgtaaggactaaaacaacgattaaaattaagt 33625764  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33625765 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 33625817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 573 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 37537553 - 37537369
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||| ||| ||||| | | |  ||||     
T  37537553 cttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-aattaaccaaatttgaatttagtagggattaaaactgagt-gcatgatttt 37537456  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||  || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  37537455 ttttaaggactaaaaatactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaaatctcaattttataaggaccaaaaacatatttaacc 37537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 38595236 - 38595400
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  38595236 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 38595334  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38595335 gcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaattcccaattttatagggaccaaaaacatat 38595400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 46043699 - 46043546
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaa-ttaag 704  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  46043699 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagtagagactaatattgagtgtatagtatttttgtaaggactaaaacaacgattaaaaattaag 46043600  T
Q  705 taaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46043599 taaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 46043546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 633
Target Start/End: Original strand, 42974161 - 42974394
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta-agatgacaaaagttaaaga 499  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  | | ||||||||||  | |    
T  42974161 aagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttaacatggaataaattaaatatgatttttttttaaaagacaaaagtttgaaa 42974260  T
Q  500 taaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttc 598  Q
    ||||  |||||||  | |||| | |||||| |||||||| || || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||     
T  42974261 taaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataagtttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgttt 42974360  T
Q  599 aaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaat 633  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  42974361 aaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaat 42974394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15131027 - 15130874
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||               |||||||||| ||||||||    
T  15131027 ttacttctaattttagtccttgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaacttttgaacgttt--------ttttttagacaagtttagaacactat 15130936  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  15130935 gaaaggttcaattactaaaatttagaatttttaaatattaaacgaattaaatatgaattttt 15130874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 40304433 - 40304597
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||| ||||| || | || ||| ||  | |||||||||    
T  40304433 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagattcagtagcgactaaaactgagtgcataatttttttaaatggactaaaa 40304531  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
      |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40304532 acactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 40304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 719
Target Start/End: Original strand, 37108485 - 37108770
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagat-gacaaaagttaaagataaatttaacaaa-ttgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| |||||||   || |||||||||| || |||||  ||||||| || |||| | | |||| ||    
T  37108485 aaatttagaattttttattatgaaataaattaactatggattttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacggaaaaataaa 37108584  T
Q  532 atttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 630  Q
    ||||| | || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||    
T  37108585 atttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgc--aaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaagca 37108681  T
Q  631 aatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  37108682 aatttagatttagtagggactaaaactgagtgtataattgttttatatggactaaaaacactattataattatgtaaggactaaactta 37108770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6589370 - 6589292
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6589370 agggttaattatgtttttggtccatataaaattgagaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggtttttta 6589292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 612 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12908709 - 12908565
Alignment:
Q  612 tttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcc 711  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||| | ||||||||| ||| || | |||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12908709 tttaagcataaattaagcaaattgga-ttgagtaaggactaatattgagtgcataaattgtttatagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggac 12908611  T
Q  712 taagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12908610 taaacttagaaggtctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12908565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 516 - 635
Target Start/End: Original strand, 16080937 - 16081055
Alignment:
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    |||| |||||||||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || | | || |||||||| |||||| |||||||||    
T  16080937 tggatgtagaaatcaaaatttgagatacttttttgcagaggaacttttagtaatatttttaacatgtatacaaataattgttcgaaaacttaagagttta 16081036  T
Q  616 agcataaattaaacaaattt 635  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  16081037 agcat-aattaaacaaattt 16081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Original strand, 47792182 - 47792268
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47792182 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 47792268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27728172 - 27728087
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  27728172 agggttaaatatatttttggtccctataaaattgggacgttttaagtttaatccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 27728087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 40304151 - 40303988
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |  |||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||    
T  40304151 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacatga-ttaaacaaatttagatttagtaatgactaaaactgagtgcataatttt-ttatatggactaaaa 40304054  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
      |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  40304053 acactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtcataattttattgagaccaaaaacatat 40303988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14990960 - 14990876
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  14990960 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttctaagtttaatccttacctaattttaatagttcttttagtccct 14990876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15420571 - 15420487
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  15420571 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaccttctaagtttaatccttacctaattttaatagttcttttagtccct 15420487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35482469 - 35482385
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35482469 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattaggatattttaaatttagtcattacttaattttaatagttcttttaatcccta 35482385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Original strand, 38598847 - 38598930
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38598847 tagggttaattatgttttcggtccctacaaaattacgaccttgtaagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaatcc 38598930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12932967 - 12932885
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggt-tttttaatcccta 307  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12932967 ttaaatatgtttttggtccctataaaattaagaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagttctttttaatcccta 12932885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22378881 - 22378788
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||   |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22378881 atttattaaagggttaaatatgtttttg-tccctataaaatagaggtctttcaagtttaatccttacttaattttaatagttcttttaatcccta 22378788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7238991 - 7238906
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7238991 agggttaaatatgtttttggttcctataaaattggaatcttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 7238906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 8832598 - 8832659
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8832598 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 8832659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Original strand, 8833446 - 8833609
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  8833446 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 8833544  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | ||| |||||||||||||| | ||||  |||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8833545 gcactgttaaaattaagtaaagactaaatttaaaa-gatccaattttatagggaccaaaaacatat 8833609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Original strand, 12908565 - 12908646
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12908565 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtcccta 12908646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 18798993 - 18798829
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||| | || | || ||| || || ||| |||||    
T  18798993 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacataa-ttaaacaaatttagatttagtagggattaaaactaagtgcataatttttttatatggaataaaa 18798895  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
      ||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18798894 acactattaaaattaagtaaggattaaacttataaggtctcaattttatagggaccaaaaacatat 18798829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 399 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38594756 - 38594643
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  38594756 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatcaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 38594657  T
Q  499 ataaatttaacaaa 512  Q
    |||||  |||||||    
T  38594656 ataaaagtaacaaa 38594643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38595399 - 38595338
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38595399 tatgtttttggtccctataaaattgggaatttttaagtttagtccttacttaattttaatag 38595338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 40304596 - 40304535
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40304596 tatgtttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 40304535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42974688 - 42974627
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42974688 tatgttttttatccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 42974627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 703
Target Start/End: Original strand, 17018437 - 17018717
Alignment:
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||  ||| || | | ||||||||| | || || |||||||| |  |||  |    
T  17018437 ttcatttacttaaatttataatttcttaacatcaatctaattaaatatgaaagtttaaaaacgccaaaagttagatatcaaattaacaaaatccggacat 17018536  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
      |||| ||| ||| ||||||||||||  |    |||||||| ||||||||||| ||| | ||  |||||   || |||||||||||| ||||| |||||    
T  17018537 ttaaataaaagtttacgacaattttttcaaacataacttttaataatgttcttagcacatatgtcaaaaaccatttaaaaactcaagactttaatcataa 17018636  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaa 703  Q
    ||||||||||| | |||||||   ||||||||||| | || | || ||| || || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17018637 attaaacaaatattaattgagaccggactaatacttagtgaataatttttttatagggactaaaataactattaaacttaa 17018717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 305
Target Start/End: Original strand, 18058886 - 18058970
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccc 305  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  18058886 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaattaagatcttttaagttcagtgcttacttaattttaatagttcttttagtccc 18058970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Original strand, 1260023 - 1260106
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  1260023 ggttaaatatgtttttgttccctataaaattgggatattttaagtttagtccttgcttaattttaattgtttttttagtcccta 1260106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Original strand, 6588567 - 6588638
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6588567 tagggttaaatatgtttttagtccctataaaattgggaccttttaagtttagttcttacttaattttaatag 6588638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 512
Target Start/End: Original strand, 10463170 - 10463458
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-ac 320  Q
    |||||||| |||||||||  || || ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||         || ||    
T  10463170 agggttaaatatgtttttagtctctgtaaaatttgaaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagctttttcagtccctataaaaataatttac 10463269  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
     | || ||||||||  | |||  ||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||| ||  |||    
T  10463270 atgtagttttagtcactattaaaacaaagtttctctgattatc-ttaaactcttaaatttttgaacgatctttttgagacaagtttaaaacattacaaaa 10463368  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||  |||||||    
T  10463369 ggttcgtttaccaa--tttagaattttttaaaatgaaattaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaaatttaagataaaagtaacaaa 10463458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 15130762 - 15130647
Alignment:
Q  591 aattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaa 690  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||  || |     || || |||||||||||| ||    
T  15130762 aattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaccaaatttaaattgaactgagactaatactgggtgcatggtatttttgtaaggactaaaacaa 15130663  T
Q  691 ctattaaaattaagta 706  Q
    ||||||||||||||||    
T  15130662 ctattaaaattaagta 15130647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 35481965 - 35482043
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35481965 agggttatatatgtttttggtccctataaaattaggaacttctgagttcagtccttatttaattttaatagctttttta 35482043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 521 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 41571585 - 41571449
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||   ||||||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  41571585 gtagaaatcaaattttgagctaattatttggagaggaacttt-actaatgttcttaatatgtctaaaaaaaattgttcaagaacttaaaagtgtaagcat 41571487  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
     |||| ||||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  41571486 -aattcaacaaatttgaatttagtagggactaaaactga 41571449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Original strand, 45958696 - 45958815
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||||||||||   || ||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  45958696 ttacttctaattttagtttctgctaaaacaaagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 45958795  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaa 436  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  45958796 gaaaggttcaattactaaaa 45958815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 6330978 - 6330838
Alignment:
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || | || ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||    
T  6330978 cataaattaaacaaatttgaattgaagagagactaatactgagtgcataatttttttttaggaactaaaaaaaccattaaaattacgtaaggactaaact 6330879  T
Q  718 taaaatgtccca-attttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    | ||| |||| | ||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  6330878 tgaaa-gtccgatattttatagggatcaaaaatatatttaac 6330838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 8081699 - 8081760
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8081699 tatgtttttggtacctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 8081760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11397368 - 11397295
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11397368 tatagggttaaatatgtttttggtgccaataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaatttaaatag 11397295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 684 - 757
Target Start/End: Original strand, 12932894 - 12932967
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12932894 aaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcttaattttatagggaccaaaaacatatttaa 12932967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 18798830 - 18798891
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18798830 tatgtttttggtccctataaaattgagaccttataagtttaatccttacttaattttaatag 18798891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21109762 - 21109677
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21109762 agggttaaatatgtttttagtccttgtaaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 21109677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 37107569 - 37107630
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37107569 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 37107630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 759
Target Start/End: Original strand, 6331235 - 6331315
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6331235 ggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 6331315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 10463240 - 10463168
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10463240 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttcaaattttacagagactaaaaacatatttaacccttt 10463168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 681 - 753
Target Start/End: Original strand, 42974617 - 42974689
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  42974617 actaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggataaaaaacatat 42974689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27727169 - 27727098
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27727169 ctattaaaattaagtaaggagtaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 27727098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 301
Target Start/End: Original strand, 43083212 - 43083287
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa 301  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43083212 ttaaatatgtttttaatccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatagttgttttaa 43083287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4884025 - 4883943
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  4884025 gttaaatatgtttttgattcctataaaatagggacctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 4883943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 10620476 - 10620390
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttat 765  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10620476 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttttcaattttatagggaccaaaaagatatttaaccctttat 10620390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10620931 - 10620837
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  10620931 atttataaaagggttaaatatgtttttggtccttataaaattgtgatatttgaagtttaatccttatttaattttaatagtttttgtagtcccta 10620837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15492940 - 15492886
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatcctta 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  15492940 ggttaaatatgtttttgatccctataaaattgggaccttttaagtttagtcctta 15492886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 15652675 - 15652752
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  15652675 agggttaaatatgtttttgatcc-tataaaattgtaaacttttaagtttagtcctaacttaatttgaatagttttttta 15652752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25270576 - 25270502
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  25270576 ggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatttcaattttatagggtctaaaaacatat 25270502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 290
Target Start/End: Original strand, 38158828 - 38158898
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38158828 atagggttaaatatgtttttggtccctataaaataggggcctttcaagtttagtccttacttaattttaat 38158898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Original strand, 44080839 - 44080917
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  44080839 agggttaaatatgtttttaatccctataaaattgagaccttctaagtttagtccttatttaattttaataattttttta 44080917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 300
Target Start/End: Original strand, 47791736 - 47791794
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47791736 tccctataaaattgggaccttttaagttcagtccttacttaattttaatagttttttta 47791794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4900257 - 4900192
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4900257 tccctgtaaaattgagaccttttaagtttaatccatacttaattttaataggtcttttagtcccta 4900192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12621978 - 12621917
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12621978 tatgtttttggtccctataaatttgggaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 12621917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 684 - 757
Target Start/End: Original strand, 15654422 - 15654495
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15654422 aaaagaactattaaaattaagtatggaataaacttaaaaggtccctattttataaggaccaaaaacatatttaa 15654495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 38593165 - 38593225
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38593165 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttt-aagtttagtccttacttaattttaatag 38593225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 43574120 - 43574205
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  43574120 agggttaaatatgtttttagtccctataaagttgagaccttttaagtataatccttacttagttttaatagttcttttagtcccta 43574205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 762
Target Start/End: Original strand, 6589287 - 6589371
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  6589287 aggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatatggaccaaaaacataattaaccctt 6589371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 43597446 - 43597358
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  43597446 ttttagggactaaaaaatctattaaaattaagtaaagattaaacttgaaaggtccctattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 43597358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1544886 - 1544819
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1544886 gttaaatatgattttgatccctgtaaaattgggatcttataagtttagtccttacgtaattttaatag 1544819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15654500 - 15654429
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15654500 taggattaaatatgtttttggtccttataaaatagggaccttttaagtttattccatacttaattttaatag 15654429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 676 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22378417 - 22378326
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatta 767  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||  ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22378417 taaggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaagatccttattttataaggaccaaaaaaatatttaaccctttatta 22378326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 16080776 - 16080814
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaattttt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16080776 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaattttt 16080814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 28924832 - 28924914
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  28924832 ggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttcccaattttatagggatcaaaaatatatttaaccct 28924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 46330681 - 46330750
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46330681 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 46330750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 653
Target Start/End: Original strand, 8082540 - 8082604
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaa 653  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  8082540 aaaaattgttcaaaatctcaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtatggactaa 8082604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 40303989 - 40304050
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40303989 tatgtttttggtctcaataaaattatgacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 40304050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43597897 - 43597812
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||  |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  43597897 agggttaaatatgtttttgatccctaaaaaatcggggcctttcaagtctagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 43597812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 33624672 - 33624739
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33624672 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 33624739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 37537369 - 37537437
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37537369 ggttaaatatgtttttggtccttataaaattgagattttttaagttcagtccttacttaattttaatag 37537437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 292
Target Start/End: Original strand, 1961817 - 1961848
Alignment:
Q  261 ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1961817 ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 1961848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2510778 - 2510732
Alignment:
Q  432 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  2510778 taaaatttagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttt 2510732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Original strand, 6330838 - 6330913
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6330838 gttaaatatatttttgatccctataaaatatcggactttcaagtttagtccttacgtaattttaatggttttttta 6330913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 33772380 - 33772458
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||  |||||||    
T  33772380 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatat-aatttttttaaatgccaaaaattcaagataaacctaacaaa 33772458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Original strand, 36039520 - 36039555
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36039520 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 36039555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 759
Target Start/End: Original strand, 38159304 - 38159371
Alignment:
Q  692 tattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38159304 tattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaaatccctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 38159371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 731 - 766
Target Start/End: Original strand, 44064676 - 44064711
Alignment:
Q  731 ttttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44064676 ttttatagagactaaaaacatatttgaccctttatt 44064711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45959085 - 45959002
Alignment:
Q  209 gactatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45959085 gacttttttttattgggttaaatatgtttttagtctatataaaattggggcattttaagtttattccttacttaattttaatag 45959002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 46044702 - 46044636
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46044702 ttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggta-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 46044636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3496596 - 3496527
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3496596 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggta-ttttaagttttgtccttacttaattttaatag 3496527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 7238532 - 7238450
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7238532 ggactaaaaaacctattaaaattaaataaggattaaacttagaagttgcaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 7238450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8833608 - 8833551
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  8833608 tatgtttttggtccctataaaatt-ggatcttttaaatttagtctttacttaattttaa 8833551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 9900532 - 9900602
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  9900532 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 9900602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11620152 - 11620082
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  11620152 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 11620082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15131740 - 15131675
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15131740 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaat 15131675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 705 - 759
Target Start/End: Original strand, 15492886 - 15492940
Alignment:
Q  705 taaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15492886 taaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggatcaaaaacatatttaacc 15492940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 15652755 - 15652674
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15652755 gactaaaaaaactattcaaattaagttaggactaaacttaaaagtttacaattttatag-gatcaaaaacatatttaaccctt 15652674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 17920637 - 17920707
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  17920637 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataattttttttaaatgtcaaaaattcaagataaa 17920707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 23023517 - 23023587
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  23023517 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 23023587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 762
Target Start/End: Original strand, 26760835 - 26760865
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26760835 tttatagagactaaaaacatatttaaccctt 26760865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33625817 - 33625752
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33625817 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaat 33625752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 38198944 - 38199013
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38198944 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagttcttacttaattttaatag 38199013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38199981 - 38199912
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38199981 gggttaaatatatttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 38199912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 39035838 - 39035908
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  39035838 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 39035908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 47140024 - 47139986
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  47140024 tttgtttaattatgcttaaacttttaactttttgaacaa 47139986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 732 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18683023 - 18682982
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatttc 773  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18683023 tttatagggactaaaaacatatttaacccttcaatatatttc 18682982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 300
Target Start/End: Original strand, 36019716 - 36019745
Alignment:
Q  271 aatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019716 aatccttacttaattttaataggtttttta 36019745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 44167024 - 44167092
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44167024 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 44167092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 122)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 245 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 30661176 - 30660664
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacga 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |        ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30661176 ctataaaattacgaacttttaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagttcctgcaaaaaaaattacttctaattttagtccctgttacaa 30661077  T
Q  345 caaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 444  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30661076 caaattttgtttaattatacttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaat 30660977  T
Q  445 tttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt-aagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30660976 tttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgacaa 30660877  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 643  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660876 ttttttgcagatgaacttttagtaatattcttaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 30660777  T
Q  644 gagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact 743  Q
    ||| ||||||| |||  | | ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  30660776 gagagactaattctgggt-gtaaatttttttttagggactaaaagaattattaaaattaagcaaggactaaacttaaaaagtctcaattttatagggacc 30660678  T
Q  744 aaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||||||||    
T  30660677 aaaaacatatttaa 30660664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 215 - 714
Target Start/End: Original strand, 5974175 - 5974676
Alignment:
Q  215 ttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnn 314  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||          
T  5974175 ttattttagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaacttctaagtttagttcttacttaattttaataggttttttagtccgtacaaaaaa 5974274  T
Q  315 nn--ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataaca 412  Q
        ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |         |||||||||| || |    
T  5974275 aaaattacttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttcagacaagtttagaata 5974374  T
Q  413 ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  5974375 ctatgaaaggttcattaactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaa 5974474  T
Q  513 ttgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagt 612  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5974475 atttggatgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagt 5974574  T
Q  613 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||   |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  5974575 ttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaaggactaatactgagtgcagaaaaaaaaattagggactaaaagaattattaaaattaagtaaggact 5974674  T
Q  713 aa 714  Q
    ||    
T  5974675 aa 5974676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 215 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 8710267 - 8709770
Alignment:
Q  215 ttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnn 314  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||          
T  8710267 ttattttagggctaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttctaagtttagttcttacttaattttaataggttttttagtccctacaacaaa 8710168  T
Q  315 nn-----ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttata 409  Q
           ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |       | |||||||||| |    
T  8710167 aaaaaaattacttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttaagacaagtttaga 8710068  T
Q  410 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||    
T  8710067 atactatgaaaggttcattaactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaac 8709968  T
Q  510 aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 609  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8709967 aaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttc-aaaactcaag 8709869  T
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaag 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||   |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8709868 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgactgcagaaaaaaaaattagggactaaaagaaatattaaaattaagtaag 8709770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 224 - 761
Target Start/End: Original strand, 15720938 - 15721479
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||         ||||||    
T  15720938 ggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaatagatttttaagtccctacaaaaaagaattactt 15721037  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatga--caagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        |||  |||||||| ||||||||||||    
T  15721038 ctaattttagtccttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttgagacaagtttagaacactatgaaa 15721137  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaatttt-ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  15721138 ggttcatttactaaattttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgga 15721237  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15721238 cgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaaagtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaaca 15721337  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  15721338 taaattaaacaaatttgaattgaggagggattaatactgagtgcagaattttcttttagggactaaaaaaaccattaaaattaagtaaggactaaacttg 15721437  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||   ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15721438 aaagacccctattttatagggaccaaaaacatattttaccct 15721479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 222 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 26356952 - 26356409
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttt-aataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||         |||    
T  26356952 agggttaaatatgtttttgatccctataaaat-aggatattttaagtttaatccttacttaatttttaataagttttttagtctctacaaaaaagaatta 26356854  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||    
T  26356853 cttctaattttagtccctgttacagcaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaa 26356754  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  26356753 aggttcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgga 26356654  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg---cgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||  ||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356653 cgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgcgtgtaaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 26356554  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  26356553 acataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaaaatttgtttacggactaaaagaacaattaaaattaagtaaggactaaac 26356454  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    || ||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26356453 ttgaaaggtccctaatttatagggaccaaaaacatatttaaccct 26356409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 222 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 10915727 - 10915223
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnt---- 317  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||                 
T  10915727 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattggcaacttctaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctactaaaaaaaaaaaa 10915628  T
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |         |||||||||| |||||||||    
T  10915627 tacttcgaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacactatg 10915528  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||| | ||    
T  10915527 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaatgttaaagataaaattaacaaaatatg 10915428  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgc--gaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10915427 gacgtagaaatcaaattatgcgacaattttttgtaaaggaccttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 10915328  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggccta 713  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10915327 agcataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaaaaa---aaattagagactaaaagaactattaaaattaagtaagaacta 10915231  T
Q  714 agcttaaa 721  Q
    | ||||||    
T  10915230 aacttaaa 10915223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 222 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 1821398 - 1820868
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||         || |    
T  1821398 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaaattctgagtttagtccttatttaattttaataggttttttagtcc-tacaaaaaaaagtatt 1821300  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         ||||||||||||||| ||||||||    
T  1821299 tctaatgttagttcctattacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttataacattatgaaag 1821200  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |  ||||| | |||| |    
T  1821199 gttcatttactaaaatttagaattttttaacattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaat--acaaaatttggacg 1821102  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821101 tagaaatcaaattttgtgacaactttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 1821002  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaagg-actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  1821001 aa--aaacaaatttgaattgaggagggactaatactga-tgcagaaattt-ttttaaggaactaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaacttaa 1820906  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  1820905 aaggtcccaattttatag-gaccaaaaatatatttaacc 1820868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 222 - 659
Target Start/End: Original strand, 17697263 - 17697698
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||         |||||    
T  17697263 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaacttttaagtttagtccttgcttaattttaataggttttttagtcccta--aaaaaatttact 17697360  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |         || ||||||| |||||||||||||    
T  17697361 tctaattttagtctttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgattttttttagaaaagtttagaacactatgaaag 17697460  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  17697461 gttcatttactaaaatttagaatttattaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacg 17697560  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17697561 tagaaatcaaattttacgacaattttatgaaaaggagctttttgtaatgttcttaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaaactcacgagtttaagcata 17697660  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  17697661 aattaaacaaatttgacttaaggagggactaatactga 17697698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 221 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20510888 - 20510372
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||    
T  20510888 tagggttaaatatgtttttgttccctataaaattggaaacttctaatcttagtccttacttaattttaataggttttt-agtccctacaaaaaaaattac 20510790  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||               ||||| |||| ||||||||||||    
T  20510789 ttctagttttagtccctgttacaataaagtttgtttaattatctttaaaaccttaaattttt-----------ttgagacaaatttagaacactatgaaa 20510701  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||     
T  20510700 ggttcattaactaaaatttagaattttttaacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggac 20510601  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||||||    
T  20510600 gtagaaattaaattttacgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacatctg------------caaaaactcaagagtttaagcat 20510513  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  20510512 aaaataaacaaatttgaattgaggagggactaatattgagt-gcagaattttttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggagtaaacttaa 20510414  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  20510413 aagatcccaattttatagggaccaaacacatatttaaccctt 20510372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 264 - 763
Target Start/End: Original strand, 22731913 - 22732413
Alignment:
Q  264 taagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22731913 taagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaatattacttctaattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattat 22732012  T
Q  363 ccttaaacttttaaat-ttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttt-ttaacatgaaacg 460  Q
     |||||||| |||||  |||||||| |       | |||||||||| |||||| | | | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22732013 tcttaaactcttaaaaattttgaacgaattttttaagacaagtttagaacactgtaatatgttcatttaccaaaatttagattttttttaacatgaaacg 22732112  T
Q  461 aattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaact 560  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22732113 aattaaatatgaattttttaaaacgacaaatgttaaagataaaattaacaaagtctggccgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaact 22732212  T
Q  561 tttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgat 660  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22732213 tttagtaatgttcttaatacgtatg-taaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatagtttaaacaaatttgaattgaggagggactaatattgag 22732311  T
Q  661 tggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || | |||   | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22732312 tgcataaaaaaaatttatggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttgtagggac-aaaaacatatttaaccc 22732410  T
Q  761 ttt 763  Q
    |||    
T  22732411 ttt 22732413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 221 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 844532 - 843983
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatcctt--acttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-- 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||              
T  844532 tagggttaaatatgtttttgatccctataaaatagggaacttctaagtttagtccttttatttaattttaatagcatttttagtccctacaaaaaaaaaa 844433  T
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  844432 ttactcataattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 844333  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat-aaatttaacaaattg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||| |     
T  844332 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatc 844233  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  844232 tgaatgtagaaatcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaagttgttcaaaaacttaagagttta 844133  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgatt---ggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    | |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |   | |||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  844132 aacataaattaagcaagtttgaattgagtagggactaatactcactgcagaaaaaaaaaatattagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggact 844033  T
Q  713 aagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || ||| ||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  844032 aaacttgaaaggtcgcacttttatatggactaaaaacatatttaaccctt 843983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 226 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 30493126 - 30492601
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttct 324  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||         |||  |||    
T  30493126 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgggaacttttaagtttattctttacttaattttaataggttttttactccatacaaaaaaaaattatctct 30493027  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    ||||||||||  |  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30493026 aattttagtctctactacaactaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaagggtt 30492927  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtag 524  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||    
T  30492926 catttactaaaatttataattttttaacatgaaacgagttaaatataatttttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtag 30492827  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  30492826 aaat-aaattttgcgacaatttttagcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg------------aaaaaactcaagagtttaagcataaat 30492740  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||| || | |  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  30492739 taaacagatttgaattgagtaaggacttatactgaatgcagattttttttttcgggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaag 30492640  T
Q  725 tcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30492639 tcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 30492601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 226 - 761
Target Start/End: Original strand, 861235 - 861774
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttc 323  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||           |||||      
T  861235 ttaaatatgtttttaatccctataaaatagggaacttttaagtttagtccttacttaattttaatagcatttttagtctctataaaaaaaaaattactca 861334  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| || ||  |||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |         || ||||||  |||||||||||||||    
T  861335 taattttagtccctgctaaaacaaaacttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagaaaagttttgaacactatgaaaggt 861434  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat-aaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||    
T  861435 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgt 861534  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttt-aagcata 621  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  861535 agaaatcaaattttgcgataattttttgccgaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaagcata 861634  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | || | |||   |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  861635 aattaagcatatttgaattgagtagggactaatactcactgcagaaaaaaaaattagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaa 861734  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  861735 aggtcacaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 861774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 226 - 738
Target Start/End: Original strand, 29691790 - 29692302
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttcta 325  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |        |||||||||    
T  29691790 ttaaatatgtttttggtctctataaaattgagaacttataagtttagtccttacataattttaataggttttttaggccctccaaaaaaaattacttcta 29691889  T
Q  326 attttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttc 425  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  29691890 attttagtccctactacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggttc 29691989  T
Q  426 atttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtaga 525  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |  ||||||| | |||| || ||    
T  29691990 atttactaaaatttagaatttattaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaacaaaatatggacgttga 29692089  T
Q  526 aatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatt 625  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29692090 aatcaaattttgtgagaattttttgcagaggaactttttgtaatatgtttaacacgtctacaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaatt 29692189  T
Q  626 aaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgt 725  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||||||||||  | | ||| || | |||  | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||    
T  29692190 aaacaaatttgaattgcgcagagactaatactgagggcagaaaattttattagaggctaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaaggt 29692289  T
Q  726 cccaattttatag 738  Q
      |||||||||||    
T  29692290 ttcaattttatag 29692302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 258 - 763
Target Start/End: Original strand, 33518277 - 33518773
Alignment:
Q  258 aacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgttta 357  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||        |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  33518277 aacttttaaatttagtccttacttgattttaataggttttatagtccttacaaaaaaaattacttctaattttagtccttgttacaaca--gtttattta 33518374  T
Q  358 attatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaa 457  Q
    ||||||||||||       |||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  33518375 attatccttaaa-------atttttgaacgatttgattgagacaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaa 33518466  T
Q  458 acgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagagga 557  Q
    | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  33518467 atgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatga 33518566  T
Q  558 acttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatact 657  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||     
T  33518567 acttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaatggaggagagactaatacc 33518666  T
Q  658 gattggaaaaatttattttaagg-actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    |  || | || ||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33518667 gggtgcataattttttttttaggaactaacataactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaagatcccaattttatagagactaaaaacatattta 33518766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 224 - 659
Target Start/End: Original strand, 5087068 - 5087502
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||         ||| ||     
T  5087068 ggttaaatatgtttttggttcctataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttactaccta-aaaaaaaattatttt 5087166  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||           |||||||||| |||||||||||| ||    
T  5087167 taattttagtccctactacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaactttttgaacggttgtttttagacaagtttagaacactatgaaatgt 5087266  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagta 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | || | |||    
T  5087267 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgta 5087366  T
Q  524 gaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa 623  Q
     |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5087367 aaaattaatttttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaagtcaagagtttaagcataaa 5087466  T
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  5087467 ttaaacatatttgaattgagtaggaaataatactga 5087502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 223 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 939256 - 938723
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttactt 322  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |   |          ||||||    
T  939256 gggttaaatatgtttttggtccatataaaattgagaacttttaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttttttttt-------tttttactt 939164  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
     ||| |||||||  || |   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |         |||| ||||| |||||| |||||||    
T  939163 ataagtttagtctctgctgaaacaaagtttgtttaattatcctcaaactcctaaattttcgaacgatttttttgagacatgtttagaacactttgaaagg 939064  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||   |||||| | |||| ||    
T  939063 ttcatttactaaaatttaaatttttttaacatgaaatgaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttaaagataaaagcaacaaagtctggacgt 938964  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  938963 agaattcaaattttgcgataatttattgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 938864  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaa 722  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || | |||||| || || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||     
T  938863 attaaacaaatttgaattgggtagggactaatactgagtgcacaaattttttgtagggactaaaagaactattaaaattaaaaaagcactaaacttaaag 938764  T
Q  723 tgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
     ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  938763 ggtcccaattttatagggatcaaaatcatatttaacccttt 938723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 418 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 2087661 - 2087319
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  2087661 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgagccgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctg 2087562  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2087561 gacgtagaaatcaaattttatgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacatgtctgtaaaaatttgttcaaaaact-aagagtttaag 2087463  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  2087462 cataaattaaacaaatttgaattgaggaaggactaatactgagt-gcataattttttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaact 2087364  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  2087363 tgaaaggtcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccctt 2087319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 5079476 - 5079920
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacacta 415  Q
    ||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| |          |||||||||| |||||||    
T  5079476 ttacttctaattttagttcctgctaaaacaaagtttgttaaattatccttaaagtcttaaatttttaaacgattttttttgagacaagtttagaacacta 5079575  T
Q  416 tgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| |     
T  5079576 tgaaaggttcaattactaaaatttaattttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatc 5079675  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||||  || |||||||||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5079676 tggacatataaatcaaattttgcaataactttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttta 5079775  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||     
T  5079776 agcataaattaaacaaatttgaattgagaagggactaatactaagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaa 5079875  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5079876 cttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaaccc 5079920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 317 - 763
Target Start/End: Original strand, 14256121 - 14256561
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |   || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||||  |   ||||||||    
T  14256121 ttacttctaattttagtccataaaacaaaaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacaattttttg-tgacaaactcgaaacactat 14256219  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |||      |||| | |    
T  14256220 gaaaggttcatttactaaaatttagaatttattaacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaaagtaa------caaaattt 14256313  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt-caaaaactcaagagttta 615  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14256314 ggacgttgaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctaccaaaaattgttaaaaaaactcaagagttta 14256413  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||  | | ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14256414 agcataaattaaataaatttgaattgagtaggaactaatactgagagcagaaaattttattagagactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaa 14256513  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    |||||||  |  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  14256514 cttaaaagctttcaattttatagggaccaaaaacataattaacccttt 14256561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 224 - 761
Target Start/End: Original strand, 33744537 - 33745077
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttact 321  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||    
T  33744537 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattgcgaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctacaaaaaaaaaattact 33744636  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | |||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| |||||||||||||    
T  33744637 tataattttagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttatacaagtttagaacactatgaaag 33744736  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagata-aatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || | |  ||| | ||||     
T  33744737 gttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaataaaaatatggac 33744836  T
Q  521 gtagaaatcaaa-ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||   ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33744837 gtagaaatcaaatttttgcga-tatttttttcggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaacattgttgaaaaacttaagagtttaagca 33744935  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | | || | || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||| | |||| ||||    
T  33744936 taaattaaacaaatttggattgagtaaggactaatattaagtgcagaatttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaagactaaactta 33745035  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
     || ||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||    
T  33745036 caaggtcgcaattttgtagggacggaaaacataattaaccct 33745077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 344 - 760
Target Start/End: Original strand, 18502989 - 18503392
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |     
T  18502989 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaaat 18503088  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || ||||||||||||||| |      
T  18503089 ttttttaacctgaaacgaattacatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc-- 18503186  T
Q  544 ttttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgag 643  Q
               |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  18503187 -----------ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaagaaatttgaattgag 18503275  T
Q  644 gagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact 743  Q
     || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18503276 cagagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggact 18503375  T
Q  744 aaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||||    
T  18503376 aaaaacatatttaaccc 18503392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 317 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 12482080 - 12481801
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  12482080 ttacttctaattttagtccctattacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactat 12481981  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||| |||||| | || | |||||||||||||| |||||||| |     
T  12481980 gaaaggttcatttgctaaaatttagaatttttttaacataaaataaattaaatataaatattttaaaacgaaagaagttaaagataaaattaacaaaatc 12481881  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 595  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12481880 aggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagcggaatttttagtattgtgcttaacacgtctgcaaaaaattg 12481801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 409 - 702
Target Start/End: Original strand, 28476253 - 28476549
Alignment:
Q  409 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |  |||    
T  28476253 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttattaacatgaaaagaattaaatataaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaa 28476352  T
Q  509 caaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gcgaaaaattgttcaaaaactca 607  Q
    |||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||| |  |||| || |||  | |||||||||| |||||||||    
T  28476353 caaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgacaatttttt-cagagaaacatttagtaatatgtttaatacatctaccaaaaaattgttgaaaaactca 28476451  T
Q  608 agagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggact-aaaagaactattaaaatta 702  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||| ||||||  || |||| ||||||| |||||||||||    
T  28476452 aaagtttaaacataaattaaacaaatttaaattgagcagagactaatactgaatgcagaaaattttattaaaaagactaaaaagaattattaaaatta 28476549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 761
Target Start/End: Original strand, 11400122 - 11400483
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat 500  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||| | ||    
T  11400122 aagtttagaacactataaaacattcatttactaaaattaacaattttctaacatgaaactaattaaatataaattttttaaaacgccaaaagttacatat 11400221  T
Q  501 aaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaa 600  Q
    ||| |||||||| | ||||  |  |||| ||| ||| ||||||||||||  |    || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||   || ||    
T  11400222 aaaattaacaaaatctggacatttaaataaaagtttacgacaattttttcaaagataatttttagtaatgttcttagcacgtatgtaaaaaaccatttaa 11400321  T
Q  601 aa-actcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaa 699  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| || || ||||||||| |||||||||||    
T  11400322 aaaactcaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcataatttttttatagggactaaaataactattaaaa 11400421  T
Q  700 ttaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||| |||| ||| |||  ||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  11400422 ttaagtaaggactaaacttgaaagatccaaattttataggaataaaaaacatatttaaccct 11400483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 3914474 - 3914826
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | | |||||||||| ||     
T  3914474 acaagtttagaacattacaaaaagttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattagatatgaaattttttaaaagacaaaagttcaaa 3914573  T
Q  499 ataaatttaaca-aattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  ||||| || | | || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  3914574 ataaaactaacagaaatctagacgtagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacattttgtaatgttcttaacacttgtgc-aaaaattatt 3914672  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||| || |||||    
T  3914673 caaaatcttaaaagtttaaacataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataatttt-ttatatggactaaaagcacaattaa 3914770  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3914771 aattaagtaaggactaaacttaaaaagtcccaattttatagggaccaaaaacatat 3914826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 399 - 735
Target Start/End: Original strand, 21108119 - 21108455
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  21108119 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttataattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 21108218  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | |||||| |||||||| || | ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  21108219 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagatatttttttggagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 21108318  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||| ||| ||||    
T  21108319 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaagcactgttaa 21108417  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatttta 735  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  21108418 aattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaatttta 21108455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 432 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 289207 - 288888
Alignment:
Q  432 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatca 530  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||  |||||||  | |||| | |||||| |    
T  289207 taaaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatggattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataa 289109  T
Q  531 aattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 630  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  289108 aattttgagataattttttgcagatgaagttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaagcat-aattaaaca 289010  T
Q  631 aatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaa 730  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||    
T  289009 aatttagatttagtagggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaa-gacacaa 288911  T
Q  731 ttttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||| ||| ||||||||||    
T  288910 ttttatagggaccaaaaacatat 288888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20977786 - 20977467
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaa-tccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tt 318  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||         ||    
T  20977786 tagggttaaatatgtttttggtccttataatattgagaacttttaagttttagtctttacttaattataataggttttttagtccctacaaaaaaaaatt 20977687  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||    
T  20977686 acttctaattttagtccctgctaaagcaaagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatattttttagacaagtttagaacactatga 20977587  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag-ataaatttaacaaattgtg 517  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||    
T  20977586 aaggttcatttactaatatttaaaaaaatttaacatgaaaagaattaaatgtgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctg 20977487  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttg 537  Q
    || |||||||||||||||||    
T  20977486 gacgtagaaatcaaattttg 20977467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 3375701 - 3375170
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-acttctaattt 329  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||        || || | || |||    
T  3375701 tatgtttttggtcc-tataaaatttgaaacttttaagtttagtcattatttaattttaatagcttttttagttcctacaaaaatactttacatgtagttt 3375603  T
Q  330 tagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcattt 429  Q
    |||||| |  |   ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||| ||  ||| | || | |    
T  3375602 tagtccctactgaaacaaagtttctctaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattacaaaatgctcgtat 3375503  T
Q  430 actaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaat 528  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| ||| | ||| | || | ||||||||    
T  3375502 actaaaatttggaattttttaacataaaatgaattaaatatgaatatttttaaacgacaaaagttcaagataaaattatcaaaaatctgaacgtagaaat 3375403  T
Q  529 caaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaa 628  Q
     |||||||| || ||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||| || || | |||||| || |||||||    
T  3375402 aaaattttgagataattttttgcaggtgaaatttaagtaatgttcttaacacttttacaaaaaatccttcaaaatcttaaaattttaagtat-aattaaa 3375304  T
Q  629 caaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtccc 728  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| || | ||||||  | || |||||||||  | |||||||||||||| |||  ||| |||||||  || |    
T  3375303 caaatttagatttagtagggactaatactgagtgcataaattttctatagggactaaaaacattattaaaattaagtgaggattaaacttaaaaaatctc 3375204  T
Q  729 aattttatagagacta--aaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  3375203 aattttatagggacaaataaaacatatttaaccc 3375170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 428 - 753
Target Start/End: Original strand, 289438 - 289765
Alignment:
Q  428 ttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat--tgtggaagtag 524  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||||||   | |||| ||||    
T  289438 ttactaaaaattagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaaatctggacgtag 289537  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||| |||||||  || ||||||||| |||  |||||||  | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  289538 aaataaaattttaagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aat 289636  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  ||||||| ||||||||||   |||| ||||||| |    
T  289637 taaacaaatttagatttagtagggactaaaactgaatgcataattattttatatggactaaaaacactattataattaagtaaaaactaaacttaaaagg 289736  T
Q  725 tcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  289737 tcccaattttataaggacaaaaaacatat 289765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 317 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17245905 - 17245719
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  17245905 ttacttctaattttaatccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactat 17245806  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||    
T  17245805 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaaataaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaa 17245719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 516 - 760
Target Start/End: Original strand, 20898149 - 20898393
Alignment:
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||   |||||| |||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20898149 tggacgtagaaatcaaattttgtgattttttttttcggaggaagttttagtaatgttcttaagaagtcttaaaaaaattgttcaaaaacttaagagttta 20898248  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||  | | || ||| || || | | | |||||| ||||||||||||| || | ||||     
T  20898249 agcataaattaaaaaaatttgaattgagcatgaactaatactgagcgcataatttttttgtaggaaatgaaagaattattaaaattaaggaaagactaaa 20898348  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20898349 cttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 20898393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 558 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 17244624 - 17244422
Alignment:
Q  558 acttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatact 657  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |    
T  17244624 acttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacatatttgaattgagcagagactaatatt 17244525  T
Q  658 gattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
     | || | |   || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  17244524 taatgcatagtatttttgtaacgactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttataaggactaaaaacatattgaa 17244425  T
Q  758 ccc 760  Q
    |||    
T  17244424 ccc 17244422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 482
Target Start/End: Original strand, 20897707 - 20897948
Alignment:
Q  244 cctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttctaattttagtccttgtta 341  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||          |||||| |||||||||||| |  ||    
T  20897707 cctataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtcc-tacaaaaaaaaaattacttttaattttagtccctacta 20897805  T
Q  342 cgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta 440  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20897806 aaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattattttttagacaagtttaagacgctatgaaaggttcatttactaaaattta 20897905  T
Q  441 gaa-ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaag 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20897906 gaatttttttaacatgaaacgaattaaacatgaattttttaag 20897948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 588 - 757
Target Start/End: Original strand, 17246322 - 17246491
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || || | ||  || || |||||||||||     
T  17246322 aaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaataccgagtgcataatatttttgtaaggactaaag 17246421  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17246422 caactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 17246491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 387
Target Start/End: Original strand, 16736521 - 16736692
Alignment:
Q  217 attatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnn 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  16736521 attatagggttaaatatgtttttgaatcctataaaatagggaccttttatgtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaaaaaga 16736620  T
Q  316 nttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaaca 387  Q
     |||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16736621 attacttctaattttaggccctgttaaaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaaca 16736692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 322 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20977317 - 20977101
Alignment:
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||||||||||||    
T  20977317 tctaattttagtccctgctaaagcaaagtttgtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgattgttttaagacaagtttagaacactatgaaag 20977218  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag-ataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||| |||| ||||| ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||| | | ||     
T  20977217 gttcattttctaatatttaaaaacaattaacatgaaaagaagtaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctagac 20977118  T
Q  521 gtagaaatcaaattttg 537  Q
    |||||||||||||||||    
T  20977117 gtagaaatcaaattttg 20977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 34046710 - 34046550
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||    
T  34046710 acttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatga 34046611  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaatt-ttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34046610 aaggttcaattaataaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttt 34046550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 607 - 758
Target Start/End: Original strand, 3335427 - 3335578
Alignment:
Q  607 aagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagta 706  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |   || || | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3335427 aagagtttaagcataaataaaataaatttgaattgagcagggactaatactgaatgcatagtatttttgtgaggattaaaacaactattaaaattaagta 3335526  T
Q  707 aggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3335527 aggactaaacttaaaatgtctcgattttatagggactaaaaacatatttaac 3335578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 579 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 5079061 - 5078880
Alignment:
Q  579 acgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaa 678  Q
    |||||| | |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| |  | |   || || |||    
T  5079061 acgtctacaaaaaattgttaaaaacttaaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattcagcagagactaatactgaatacatagtatttttataa 5078962  T
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5078961 gtactaaaacaactattaaaattaagtatggactaaacttaaaatgcttcgattttatagggactaaaaacatatttaaccc 5078880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 472
Target Start/End: Original strand, 30353096 - 30353252
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |       | |||||||||| |||| |||    
T  30353096 ttacttataattttagtccctattacatcaaagtttatttaattatctttaaacacttaaatttttgaacgattttttta-gacaagtttagaacattat 30353194  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttaga--attttttaacatgaaacgaattaaatatga 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30353195 gaaaggttcacttactaaaatttagagttttttttaacatgaaacgaattaaatatga 30353252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 3913329 - 3913148
Alignment:
Q  571 ttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatt 670  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| | ||| || | || ||    
T  3913329 ttcttaacatttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaaatttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtatggactaaaattgagtgcataattt 3913231  T
Q  671 tattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | || || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3913230 ttttatatggactaaaaacactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatcccaattttatagggaccaaaaacatat 3913148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 22972047 - 22972200
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| || || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22972047 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcatagactaataccgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 22972146  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| ||||  |||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  22972147 aaggactaaaattaaaatgcctcaattttacggggactaaaaacatatataacc 22972200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 23816351 - 23816198
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| || || | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23816351 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcatagactaataccgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagt 23816252  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| ||||  |||||||| | ||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  23816251 aaggactaaaattaaaatgcctcaattttacggggactaaaaacatatataacc 23816198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 475
Target Start/End: Original strand, 24958757 - 24959012
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntta 319  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| | ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||        |||    
T  24958757 atagggttaaatatgtttatggtccttgtaaaatcggtaacttttaagtttagtccttacttaattttaatag-ttttttagtccttacaaaaaaaatta 24958855  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    ||| | ||  || ||| || ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |         ||||||||| |||||||| |||    
T  24958856 cttattatcataatccctgctaaaacaaattttgtttaattatctttaaactcttaaattttt-aacgattttttttagacaagtttgtaacactacgaa 24958954  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaa--ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatt 475  Q
    || || ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24958955 agatttatttactaaaatttagaattttttttaacctgaaatgaattaaatatgaatt 24959012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 22971914 - 22971778
Alignment:
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || | |   || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22971914 ttaaacaaatttgaattgagcaaagactaatactgagtgcatagtatttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaat 22971815  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22971814 gcctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 22971778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 760
Target Start/End: Original strand, 23816484 - 23816620
Alignment:
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || | |   || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23816484 ttaaacaaatttgaattgagcaaagactaatactgagtgcatagtatttttgtaagaactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaat 23816583  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23816584 gcctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 23816620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 676 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 8231170 - 8231087
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8231170 taaggactaaaacaactattaaaataaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaacc 8231087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 308
Target Start/End: Original strand, 28476102 - 28476179
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28476102 tatgtttttggtccctataaaattaagaacttataagtttagtccttacataattttaataggttttttagtccctac 28476179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22732411 - 22732334
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22732411 agggttaaatatgtttttg-tccctacaaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaataggtttttta 22732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11400490 - 11400398
Alignment:
Q  215 ttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11400490 ttattttagggttaaatatgttttttattcctataaaatttggatctttcaagtttagtccttacttaattttaatagttattttagtcccta 11400398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 305
Target Start/End: Original strand, 30492603 - 30492686
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccc 305  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  30492603 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggactttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtccc 30492686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 691 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 33744605 - 33744526
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33744605 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcgcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccttttataatat 33744526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 861775 - 861689
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  861775 tagggttaaatatgtttttagtccctataaaattgtgaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 861689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14256559 - 14256489
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14256559 agggttaattatgtttttggtccctataaaattgaaagcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 14256489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 20510373 - 20510443
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20510373 agggttaaatatgtgtttggtccctataaaattgggatcttttaagtttactccttacttaattttaatag 20510443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 2087320 - 2087405
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2087320 agggttaaatatatttttggtccctataaaattgggacctttcaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 2087405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 3913149 - 3913210
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3913149 tatgtttttggtccctataaaattgggatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 3913210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 17697351 - 17697262
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17697351 ttttagggactaaaaaacctattaaaattaagcaaggactaaacttaaaagttctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 17697262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 684 - 757
Target Start/End: Original strand, 18804125 - 18804198
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18804125 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatatctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 18804198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 678 - 762
Target Start/End: Original strand, 1821315 - 1821399
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1821315 aggactaaaaaacctattaaaattaaataaggactaaactcagaatttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 1821399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 680 - 767
Target Start/End: Original strand, 12482121 - 12482208
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatta 767  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||  |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12482121 gactaaaagacctattaaaattaagtaaggaataaacttaaaagttttctactttatagggactaaaaacatatttaaccctttatta 12482208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 501
Target Start/End: Original strand, 30916752 - 30916855
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||    
T  30916752 gacacgtttataatactacaaaaggttcatttattaaaatttaaaattttataacataagatgaattaaatataaatttttttaaacgaaaaaagttaaa 30916851  T
Q  498 gata 501  Q
    ||||    
T  30916852 gata 30916855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2937376 - 2937258
Alignment:
Q  246 tataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacga 344  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||          |||||||||| |||| |||||||||| |    
T  2937376 tataaaattgggaacttctaaatttagttcttacttaattttaataagttttttaatctctaaacaaaaagattacttctaagtttaatccttgttacaa 2937277  T
Q  345 caaagtttgtttaattatc 363  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2937276 caaagtttgtttaattatc 2937258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 753
Target Start/End: Original strand, 5086753 - 5086827
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5086753 ggactaaaaacactattataattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 5086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 681 - 763
Target Start/End: Original strand, 30661119 - 30661201
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30661119 actaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttcgtaattttatagagactatgaacatatttaacccttt 30661201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5086826 - 5086765
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5086826 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattataatag 5086765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18804198 - 18804125
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18804198 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgagatattttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttt 18804125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 684 - 760
Target Start/End: Original strand, 939180 - 939256
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  939180 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttctcaattttatatggaccaaaaacatatttaaccc 939256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 861301 - 861230
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  861301 ctattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttccctattttatagggattaaaaacatatttaaacctt 861230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2087731 - 2087680
Alignment:
Q  256 ggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2087731 ggaacttctaagtttaatccttgcttaattttaataggttttttagtcccta 2087680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3914825 - 3914766
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3914825 tatgtttttggtccctataaaattgggactttttaagtttagtccttacttaattttaat 3914766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 762
Target Start/End: Original strand, 10915645 - 10915728
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||| ||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10915645 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttagaagttgccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 10915728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15721481 - 15721394
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  15721481 atagggtaaaatatgtttttggtccctataaaataggggtctttcaagtttagtccttacttaattttaatggtttttttagtcccta 15721394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33745086 - 33744995
Alignment:
Q  213 atttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||  || ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33745086 atttataatagggttaattatgttttccgtccctacaaaattgcgaccttgtaagtttagtctttatttaattttaatagcttttttaatcc 33744995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 938725 - 938811
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||  ||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  938725 agggttaaatatgattttgatccctataaaattgggaccctttaagtttagtgcttttttaattttaatagttcttttagtccctac 938811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 5974264 - 5974182
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5974264 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagttctcaattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 5974182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 8710178 - 8710260
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  8710178 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaagaactaaacttagaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttagccct 8710260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12482202 - 12482124
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12482202 agggttaaatatgtttttagtccctataaagtagaaaacttttaagtttattccttacttaattttaataggtctttta 12482124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Original strand, 26356408 - 26356477
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26356408 tagggttaaatatgtttttggtccctataaattagggacctttcaagtttagtccttacttaattttaat 26356477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 766
Target Start/End: Original strand, 5974694 - 5974758
Alignment:
Q  702 aagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5974694 aagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaacccattatt 5974758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 8709747 - 8709683
Alignment:
Q  702 aagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8709747 aagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttacagggaccaaaaacatatttaacccattatt 8709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 15721006 - 15720938
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15721006 ctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 15720938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 302
Target Start/End: Original strand, 16465259 - 16465339
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaat 302  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16465259 agggttaaatatttttttggtctctataaaattgaaaacttttaaatttagtacttacttaattttaatagcttttttaat 16465339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 585
Target Start/End: Original strand, 17467658 - 17467722
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg 585  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17467658 gtagaaaccaaattttgagataattttttgcagagaaacttttagtaacgtttttaacacgtctg 17467722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3335578 - 3335499
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3335578 gttaaatatgtttttagtccctataaaatcgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatagttgttttaatcc 3335499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 695 - 758
Target Start/End: Original strand, 16465413 - 16465476
Alignment:
Q  695 taaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16465413 taaacttaagtaaggactaaacttaaaaggtctcaattttatagggactaaaaatatatttaac 16465476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 682 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 29691865 - 29691790
Alignment:
Q  682 ctaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29691865 ctaaaaaacctattaaaattatgtaaggactaaacttataagttctcaattttatagagaccaaaaacatatttaa 29691790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Original strand, 30493060 - 30493131
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  30493060 ctattaaaattaagtaaagaataaacttaaaagttcccaattttatagggaccaaaaacatatttaatcctt 30493131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 33518768 - 33518701
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33518768 gttaaatatgtttttagtctctataaaattgggatcttttaagtttagtcattacttaattttaatag 33518701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5079920 - 5079851
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079920 gggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 5079851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5974752 - 5974694
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttactt 281  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  5974752 gggttaaatatgtttttggtccctgtaaaattgggaccttttaagtttagtccttactt 5974694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 281
Target Start/End: Original strand, 8709689 - 8709747
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttactt 281  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  8709689 gggttaaatatgtttttggtccctgtaaaattgggaccttttaagtttagtccttactt 8709747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18503392 - 18503323
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18503392 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 18503323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 761
Target Start/End: Original strand, 20510817 - 20510887
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  20510817 ctattaaaattaagtaaggactaagattagaagtttccaattttatagggaacaaaaacatatttaaccct 20510887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 291
Target Start/End: Original strand, 30660659 - 30660729
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30660659 taggattaaatatgtttttggtccctataaaattgagactttttaagtttagtccttgcttaattttaata 30660729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30917259 - 30917201
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaa 283  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  30917259 gttaactatgttttttatccctataaaatttggaccttttaaatttaatctttacttaa 30917201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 288889 - 288949
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  288889 tatgtttttggtccctataaaattgtgt-cttttaagtttagtccttacttaattttaatag 288949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 843984 - 844069
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  843984 agggttaaatatgtttttagtccatataaaagtgcgacctttcaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 844069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 24958843 - 24958759
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | || |||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  24958843 taaggactaaaa-aactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagttaccgattttacaaggaccataaacatatttaaccct 24958759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 292
Target Start/End: Original strand, 1820887 - 1820935
Alignment:
Q  244 cctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1820887 cctataaaattgggaccttttaagtttagttcttacttaattttaatag 1820935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 691 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 5087136 - 5087068
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  5087136 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttataggaaccaaaaacatatttaacc 5087068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 678 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 20897768 - 20897708
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatag 738  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  20897768 aggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatag 20897708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20898393 - 20898325
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20898393 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagaccttttaagtttagtctttccttaattttaata 20898325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16465329 - 16465258
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||  |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16465329 ctattaaaattaagtaagtactaaatttaaaagttttcaattttatagagaccaaaaaaatatttaaccctt 16465258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 720
Target Start/End: Original strand, 16465382 - 16465421
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16465382 actaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaa 16465421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 16736608 - 16736526
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagact-aaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  16736608 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacataaaaggtccctattttatag-gattcaaaaacatatttaaccct 16736526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 3566715 - 3566685
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3566715 tttatagagactaaaaacatatttaaccctt 3566685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Original strand, 4408901 - 4408959
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttac 279  Q
    |||||||| ||||||||||  || || ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4408901 tagggttatttatgtttttagtctctgtaaaattacaaacttttaagtttaatccttac 4408959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 12783434 - 12783504
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  12783434 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataacttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 12783504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13400380 - 13400310
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  13400380 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 13400310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 481
Target Start/End: Original strand, 22007146 - 22007200
Alignment:
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  22007146 tttattaaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaa 22007200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 22971778 - 22971847
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22971778 gggttaaatatgtttttagttcctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 22971847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23816620 - 23816551
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23816620 gggttaaatatgtttttagttcctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 23816551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 753
Target Start/End: Original strand, 28083288 - 28083350
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  28083288 ctattataattaagtaaggactatacttaaaatgtctcaattttatagggaccaaaaatatat 28083350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 766
Target Start/End: Original strand, 32400917 - 32400951
Alignment:
Q  732 tttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32400917 tttatagggactaaaaacatatttaaccctttatt 32400951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 298
Target Start/End: Original strand, 2958607 - 2958684
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    |||| |||| ||| |||||  ||||||||||| |   |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2958607 taggattaaatatatttttactccctataaaaatgaaaacttttaagtttagttcttacttaattttaatagtttttt 2958684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 291
Target Start/End: Original strand, 3375191 - 3375240
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3375191 tccctataaaattgagattttttaagtttaatcctcacttaattttaata 3375240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Original strand, 8231087 - 8231155
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8231087 ggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttactttattttaatag 8231155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21108455 - 21108414
Alignment:
Q  248 taaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21108455 taaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaa 21108414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 657
Target Start/End: Original strand, 25839635 - 25839692
Alignment:
Q  601 aaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt-aaattgaggagggactaatact 657  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  25839635 aaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaaattgtgcaggaactaatact 25839692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 184)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 221 - 759
Target Start/End: Original strand, 33177294 - 33177832
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||    
T  33177294 tagggttaaatatgtttttgatccctataaaatagggacctttcaagtttaatccatacttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaagaatta 33177393  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| || ||||||||    
T  33177394 cttctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaa 33177493  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  33177494 aagttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaacgttaaagataaaattaacaaaatctgga 33177593  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33177594 cgtagaaatcaaattttgagacaattttttgcataggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaaca 33177693  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  33177694 taaattaaacaaatttaaattgaggagggaataatactgagt-gcataattttttttaggaactaaaaaaaccattaaaattaaataaggactaaattta 33177792  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||    || ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33177793 aaaaactcctattttatagggaccaaaaacatatttaacc 33177832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 222 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 47309855 - 47309319
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||         ||||    
T  47309855 agggttaaatatatttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaatatattttttagtccctacaaaaaagaattac 47309756  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| |||||| |||||    
T  47309755 ttctaattttagtccttattgcaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactgtgaaa 47309656  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | | ||     
T  47309655 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgac 47309556  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47309555 gtataaatcaaattttgctacaattttttgcataggaacttttattaatgttcttaacatgtctgtaaataattgttcaaaaactcaagagtttaaacat 47309456  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  47309455 aaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaaattttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttga 47309356  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||   ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  47309355 aagacccttattttatagggacaaaatacatatttaa 47309319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 221 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 22068520 - 22067977
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tt 318  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||          ||    
T  22068520 tagggttaaatatgtttctggtccctataaaattggaaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaaaaaatt 22068421  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         || | ||||| ||||||||||    
T  22068420 acttcaaattttagtcccttttaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagatatgtttagaacactatga 22068321  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||| |  ||    
T  22068320 aaggttcattttctaaaatttagatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagattaaattaacaaaattggg 22068221  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  22068220 acgtaaaagtcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcagaaaactattcaaaaactcaagagtttaaac 22068121  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22068120 ataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatattaagtgtagaaattt-ttttagggactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaactt 22068022  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    | || ||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22068021 ataaggtatcaattttatagggaccaaaaatatatttaacccttt 22067977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 224 - 759
Target Start/End: Original strand, 51395489 - 51396025
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||    
T  51395489 ggttaaatatgtttttggttcctataaaatagggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataagttttttagtccctacaaaaaaaattacttc 51395588  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||  | |    
T  51395589 taattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagttta-aacactatgagtgat 51395687  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaatttt-ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||    
T  51395688 tcatttactaaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatatttcaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgt 51395787  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51395788 agtaattaaattttgcgacaatattttgtacaggaacttttagtaatgtgtttaacacgtctgcaagaaattattcaaaaactcatgagtttaagcataa 51395887  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaagg-actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |  ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  51395888 attaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagatttttttttttaggaactaaaagaattattaaaattaaataaggactaaacttaaa 51395987  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51395988 aggtcccaattttatagggattaaaaacatatttaacc 51396025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 222 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 53324196 - 53323651
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||||| ||| |||         ||||    
T  53324196 agggtaaaatatgtttttggtccctataaaatagggatctttcaagtttaatctttacttaattttaataaaaattttagtccttacaaaaaagaattac 53324097  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||    
T  53324096 ttctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaa 53323997  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||     
T  53323996 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggac 53323897  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg-cgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53323896 gtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaaca 53323797  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||     
T  53323796 taaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaattttttttaagggattaaaagaaccattaaatttaagtaaggactaaacttg 53323697  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttat 765  Q
    ||| ||||| ||   |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  53323696 aaaggtccctataaaatagggaccaaaaatatatttaacccattat 53323651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 226 - 766
Target Start/End: Original strand, 28448268 - 28448806
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttc 323  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||    
T  28448268 ttaaatatgtttttggaccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccctaccaaaaaaaaattacttc 28448367  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| |||||||||||||||    
T  28448368 taattttagtccctcttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggt 28448467  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagta 523  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||      | |||    
T  28448468 tcatttactaaaatttacaattttttaacatgaaacaaattgaatatgaatttttcaaaacgacaaaacttaaagataaaattaacaaa------acgta 28448561  T
Q  524 gaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28448562 gaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttctcaacacgt-tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa 28448660  T
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaacta-ttaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||   |  ||||||   |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |    
T  28448661 ttaaacaaatttgaatttaggagggactaaaactggacgcagaaaaaaaaaaattaaggactaaaaaaactatttaaaattaagtaaggactaaacttga 28448760  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28448761 aaggtcccaattttatagggacaaaaaacatatttaaccttttatt 28448806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 262 - 757
Target Start/End: Original strand, 30331192 - 30331690
Alignment:
Q  262 tttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaatt 360  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||         ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30331192 tttaagtttaatctttatttaactttaatagtttttttagtccctacaaaaaagaattacttctaaaattagtccctgttacaacaaagtttgtttaatt 30331291  T
Q  361 atccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacg 460  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30331292 attcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacataaaacg 30331391  T
Q  461 aattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaact 560  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30331392 aattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaact 30331491  T
Q  561 tttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgat 660  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  30331492 tttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgag 30331591  T
Q  661 tggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatttt--atagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    || | |||   | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  30331592 tgtagaaaaaaaatttaaagactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactgaacttaaaaggtccctattttaaatagggaccaaaaacatatttaa 30331690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 350 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 19523004 - 19522593
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 449  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19523004 tttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt 19522905  T
Q  450 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 549  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19522904 aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 19522805  T
Q  550 gtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggaggga 649  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19522804 gcataggactttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggaggga 19522705  T
Q  650 ctaatactgattggaaaaattta-ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaa 748  Q
    |||||| ||| || | |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||   | | ||||||||| ||| |||||    
T  19522704 ctaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaaacctctattttatagggaccaaaaa 19522605  T
Q  749 catatttaaccc 760  Q
    ||||||||||||    
T  19522604 catatttaaccc 19522593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 224 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 7491110 - 7490576
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||        ||||||     
T  7491110 ggttaaatatgtttttagtccctataaaattaagaatttcaaagtttattctttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaaaaa-ttacttt 7491012  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaa-tttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||         |||||||||| |||||||| |||||    
T  7491011 taattttagtccctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacaactttttttagacaagtttagaacactataaaagg 7490912  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagt 522  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  7490911 ttcaattactaaagtttagatttttttaagatgaaacgaattaaatatgaatattttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgt 7490812  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     |||||| ||| |||||    
T  7490811 agaaatcaaaatatgcgtcaattttttgcagaggaa-ttttagtaatgtgcttaacacgtctgtgaaaaattgttcaaa-----aagagtgtaaacataa 7490718  T
Q  623 attaaaca---aatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  7490717 attaaacaaataatttgaatcgaggagggactaatattgagtgtagaaattt-ttttaggaactaaaagaactattaaaattaagtaaggataaaactta 7490619  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||   ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7490618 aagaatccaaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 7490576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 31316865 - 31316423
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  31316865 ttacttctaattttagtcct-gctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 31316767  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||  ||| ||| |     
T  31316766 gaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatt 31316667  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31316666 tggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagttta 31316567  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||| || |     || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  31316566 agcataaattaaacaaatttaaactaaacagagactaatactgagtgcatggtatttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaa 31316467  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31316466 cttaaaatgcctcaattttatag-gactaaaaacatatttaaccc 31316423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 222 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 4850516 - 4849974
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa-tccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||         |||    
T  4850516 agggttatatatgtttttgatccctctaaaattaggtacttctaagtttcgtccttacttaattttaatagttttttttagtccttacaaaaataaatta 4850417  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    ||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |         ||||  |||| |||| ||||||    
T  4850416 cttataattttagttcttgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttgaatttttgaacgattttattgagacacatttagaacaatatgaa 4850317  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||   | ||    
T  4850316 agattcatttagtaatatttagaatttttcaacatgaaacgaatttaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaataacaaaacttaga 4850217  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagca 619  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4850216 cgtagaaatcaaattttgcgataattttttgcggagaaatttttagtaacattcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagca 4850117  T
Q  620 taaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattgga-aaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||| || | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||    
T  4850116 taaattaaacatatttgaattgaatagggactaatattgagtgcataaatttttttttagggactaaaagaactatttaaattaagcaaggattaaactt 4850017  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  4850016 aaaaggtctcaattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 4849974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 10322020 - 10321579
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          ||||||||| |||||| |    
T  10322020 ttacttctaattttagtccctgctaaaaaaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgacacaagtttagaacactgt 10321921  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  10321920 gaaaggttcaattactaaaatttagaatattttatcatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatct 10321821  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10321820 ggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggagggacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 10321721  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  10321720 gtataaattaaacaaattttaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattgagtaaggactaaac 10321621  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10321620 ttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 10321579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 417 - 759
Target Start/End: Original strand, 38114282 - 38114624
Alignment:
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  38114282 gaaatgttcatttactaaaatttaaaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 38114381  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38114382 ggacatataaatcaaattttgtgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttaaaaaactcaagagtttaa 38114481  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |    
T  38114482 acataaattaaacaaatttgaattgaggagggactaatactgagtgcagaatttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaatgattaaac 38114581  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    || ||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38114582 ttgaaaggtccttattttatagggaccaaaaacatatttaacc 38114624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 318 - 759
Target Start/End: Original strand, 33689264 - 33689705
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |         |||||||||| | |||||||    
T  33689264 tacttctaattttaatccctgctaaaacaaagtttgtttaattattcttaaattcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagagcactatg 33689363  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||    
T  33689364 aaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctg 33689463  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || ||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33689464 gacatataaaccaaattttgcgataattttttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaag 33689563  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  33689564 cataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggattaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaact 33689663  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33689664 taaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 33689705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 321 - 762
Target Start/End: Original strand, 53423537 - 53423975
Alignment:
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||  || ||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||       | |||||||||| ||||||||||||    
T  53423537 ttctaattttagtctctgctaaaataaagtttgtttaactatccttaaactcttaaattttttaacaattcttttaagacaagtttagaacactatgaaa 53423636  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaatttttt--aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||  ||||||| | |||    
T  53423637 ggttcatttactaaaatttagaattttttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttatagataaaagtaacaaaatatgg 53423736  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    | ||   || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  53423737 acgtgtgaaacaaattttgcgacaattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctgcaaaaaattgtccaaaaactcaagagttt-agt 53423835  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||    | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |    
T  53423836 ataaattaaacaaatttgaattgagtaaggactaatactgagtgcaaa----ttttctaagggctaaaataactattaaaattaagtaagaactaaacat 53423931  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  53423932 aaaatatctcaattttatagagaccaaaaacatatttaaacctt 53423975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 224 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10085902 - 10085358
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttc 323  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||         |||||     
T  10085902 ggttaaatatgtttttggtccttataaaattgggaactttaaagtttagtccttacataattttaatagcttttttagtccctacaaaaaaaaatactta 10085803  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||| || ||  ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| |||| ||||||||||||  |    
T  10085802 taattttagtccctgctaaaacaatttttttttaattatccttaaactcttaaatttttgaacggtttttttgtgacaaatttagaacactatgaaatct 10085703  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatt-taacaaattgtggaagt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||| |  |||  |    
T  10085702 tcatttactaaaatttagaattttt-aacatgaaacaaattaaat-taaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatcaggatat 10085605  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10085604 agaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattattcacaaacttaagagttttagcataa 10085505  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgatt---ggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctta 719  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | | |   ||||||    |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10085504 attaaacaaatttgaattgagtatgcactaatattcagtacaggaaaa----aaattagggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaactta 10085409  T
Q  720 aaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  10085408 aaaggtctcaattttatagggactaaaatcatatataaccctttcttatat 10085358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 25422391 - 25421949
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |         |||||||||| ||||||||    
T  25422391 ttacttttatttttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 25422292  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||  ||| ||||  |    
T  25422291 caaaggttcaattactaaaatttagaattttttaacataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaatgttaaagataaaagtaaaaaatc-t 25422193  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  25422192 ggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggatgatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaatgttaaaaaacttaagagtttaa 25422093  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | || | |    | || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |    
T  25422092 acataaattaaacaaatttgaattgagaagagactaatactaagtgcatagtacttttgtaaggactgaaacaactgttaaaattaagtaaggactaaac 25421993  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25421992 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 25421949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 223 - 762
Target Start/End: Original strand, 47379053 - 47379591
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||||    
T  47379053 gggttaaatatgtttctggtccctataaaactgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtccctaccaaaaaaaattact 47379152  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | |||||||||||| || ||  || |||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||| | |         |||||||||| || ||||||||||    
T  47379153 tataattttagtccatgctaatacgaagtttgtttaattatacttaaactctaaa--ttttgagcgaatattttgagacaagtttagaatactatgaaag 47379250  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||  |||| ||| | ||||     
T  47379251 gttcatttactaaaatttagaatttttaaaaatgaaatgaattaaatatgtattttttaaaatgacaaaacgtcaagataaaagtaacaaaaatatggac 47379350  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   | ||| |||||| |||||| |||||||    
T  47379351 gtagaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtctgcaaaagcattttcgaaaacttaagagtataagcat 47379450  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
     |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||   || | |||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  47379451 -aattaaacaaatttgaattgagtaatgactaatactacgtgcagaaattttttataggggctaaaaaaactattaaaattaagtaagggctaaacttag 47379549  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  47379550 aaggtcccgattttattgggaccaaaaacatatttaaccctt 47379591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 245 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 55938467 - 55938074
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn---ttacttctaattttagtccttgtta 341  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||           |||||| |||||||||||| | |||    
T  55938467 ctataaaattacgaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagattttttagtccttacaaaaaaaaaaattacttataattttagtccctatta 55938368  T
Q  342 cgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttag 441  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          | ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||    
T  55938367 caacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgaaataagtttagaacactacgaaaggt-cgtttactagaatttag 55938269  T
Q  442 aattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgac 541  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||||    
T  55938268 aattttttaacataaaacgaattaaatctgaattttttaaaacaacaaatgttaaagataaaattaacaaaatctgcacgtagaaatcaaattttgcgac 55938169  T
Q  542 aattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattta 636  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55938168 aatttttcacagaggtacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattta 55938074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 329 - 761
Target Start/End: Original strand, 3873134 - 3873585
Alignment:
Q  329 ttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatt 428  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3873134 ttagtccttgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatt 3873233  T
Q  429 tactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaat 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||   || | ||||||||    
T  3873234 tactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaat 3873333  T
Q  529 caaattttgcgacaattttttg--tag-------------------aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||                   |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  3873334 caaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactca 3873433  T
Q  608 agagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3873434 agagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggagagactaatactgagtgcagaaaaa---aaattagggactaaaagaacta-taaaattaagt 3873529  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||   |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3873530 aaaaactaaacttaaaaggtccatattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 3873585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 319 - 760
Target Start/End: Original strand, 53571514 - 53571942
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||||    
T  53571514 acttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatga 53571613  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||  ||| ||| | ||     
T  53571614 aaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgt 53571713  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
    |  || |||||||||||||||             | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  53571714 acatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaga 53571800  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  53571801 ataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaactt 53571900  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53571901 aaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 53571942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 221 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1870527 - 1870140
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tta 319  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||         |||    
T  1870527 tagggttaaatatttgattgatccctataaaattgggaacttttatgtttagtccttacttaattttaataggttttttagtacctacaaaaaaaaatta 1870428  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
     ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||||||| ||    
T  1870427 tttctaattttagtccctgctaaaataaagtttgtttaactatccttaaactattaaatttttgaacgattttttaa-gacaagtttagaacactataaa 1870329  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgga 519  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||    
T  1870328 atgttcatttactaaaatttagaattttttaacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatgga 1870229  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaa 608  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||    
T  1870228 cgtataaatcaaattttgtgacaattttttgccgagaaacttttagtaatgtttttaacatgtctacaaaaaattgtcgaaaaactcaa 1870140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 398 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 51876254 - 51875994
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga--attttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagtta 495  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  51876254 gacaagtttataacaatgtgaaatgttcatttattaaaatttagacaagtttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagtta 51876155  T
Q  496 aa-gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaatt 594  Q
    || |||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  51876154 aaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgtgataattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctctaaaaaatt 51876055  T
Q  595 gttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51876054 gttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggaataata 51875994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 404 - 659
Target Start/End: Original strand, 20177933 - 20178187
Alignment:
Q  404 tttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20177933 tttagaacaatatggaaggttcatttactaaaattta-aattttttaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 20178031  T
Q  504 tttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaa 603  Q
      ||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||    
T  20178032 agtaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacatgtatgtaaaaaattgttcaataa 20178131  T
Q  604 ctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  20178132 cccaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatggattaatactga 20178187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 354 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 43938291 - 43937984
Alignment:
Q  354 tttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aac 452  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |         |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43938291 tttaattatcctttaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagcttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaac 43938192  T
Q  453 atgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaatttttt-gt 551  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| | || || |||| |||| ||| |||||||| | || | ||| |||| |||||||||||||||||||| |     
T  43938191 atgaaacgaattaaatatgaaaattttaaaacgaaaatagttcaagaaaaaattaacaaaatctgaacgtataaataaaattttgcgacaatttttttgc 43938092  T
Q  552 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggact 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43938091 agaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggatggact 43937992  T
Q  652 aatactga 659  Q
     |||||||    
T  43937991 gatactga 43937984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 11670431 - 11670001
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |         |||||||||| |||||||     
T  11670431 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactac 11670332  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  11670331 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 11670232  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || |||||||||||||||             | |||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  11670231 ggacatataaatcaaattttgcg-------------gcggaacttttaataatgttcctaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaa 11670145  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11670144 gaataaattaaacaaatttgaattgagcagatactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaac 11670045  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11670044 ttaaaatgcctcaattttatagggattaaaaacatatttaaccc 11670001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 757
Target Start/End: Original strand, 44209470 - 44209892
Alignment:
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||    
T  44209470 tctaattttagtccttgcgaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaag 44209569  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| || | || ||||||             || ||| | ||||      
T  44209570 attcaattactaaaatttagaatcttttaacacgaaaagaattaaatatgtatttttgaaaaggataaaagt-------------aataaaatctggaca 44209656  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  44209657 tataaatcaaattttgcgataattttttgcgtacgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaaacata 44209756  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44209757 aattaaacaaatttgaattgagtagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggaataaaactgctattaaaattaagtaaggactaaacttaaa 44209856  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44209857 atgcctcaattttatagagactaaaaacatatttaa 44209892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 432 - 658
Target Start/End: Original strand, 13718060 - 13718287
Alignment:
Q  432 taaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||    
T  13718060 taaaatttagagttttttaacatgaaacgcattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagatcaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaa 13718159  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 630  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13718160 attttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtctggaaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaaca 13718259  T
Q  631 aatttaaattgaggagggactaatactg 658  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13718260 aatttaaattgaggaaggactaatactg 13718287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 222 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 48082866 - 48082324
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tta 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||          |||    
T  48082866 agggttaattatgtttttggtccctataaaattgcgaccttctaagttaagtccttacttaattttaatagctcttttaatccctacaagaaaaaattta 48082767  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaa 419  Q
    ||| |||||||||||  || ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| |||||||||||    
T  48082766 cttataattttagtctctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaa 48082667  T
Q  420 aggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtgg 518  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  |||||||  | |||    
T  48082666 cggttcatttacaaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttataaaacgacaaaagtttaagatataaataacaaaaatatgg 48082567  T
Q  519 aagtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    | |||||||||||||||| |||| | ||||||   || || |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48082566 acgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaag 48082468  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagct 717  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| ||| || | |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  48082467 cataaattaaacaaatttggattgagtaagaactaatattgagtgcataaattttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaact 48082368  T
Q  718 taaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    || ||  || ||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||    
T  48082367 tacaagatcacaattttgtagagaccgaaaatataattaaccct 48082324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 317 - 762
Target Start/End: Original strand, 23473448 - 23473895
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |         || ||||||| |||||| |    
T  23473448 ttacttttaattttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatcggtaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactgt 23473547  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | | ||||| ||||||||| |  ||| ||| | |    
T  23473548 gaaaggttcatt-actaaaatttaaaattttttaacatgaaacaaattaaatatgagtttttaaatacgtcaaaaattaaagatataagtaataaaatct 23473646  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaa-ttgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    |||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  23473647 ggacataagaatcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttttggtaacgttcttgacacgtctacaaaaaaattattcaaaaacttaagacttta 23473746  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattt---taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct 712  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| || |    ||| |||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23473747 agcataaattaaacaaatttgcattgagcatagactaatactgaatgtatgtttttttttttgtagggact-aaagaactattaaaattaagtaaggact 23473845  T
Q  713 aagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23473846 aaacttcaaaagtctcgattttatagggactaaaaacatatttaaccctt 23473895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 398 - 760
Target Start/End: Original strand, 35060877 - 35061237
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaa 497  Q
    |||||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||||||    
T  35060877 gacaagtttagagcactttgaaatattcaattactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgattttttgaaaacgataaaagttaaa 35060976  T
Q  498 gataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
     |||||  ||| ||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35060977 aataaaagtaataaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtt 35061076  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
     |||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || | |   || || |||||||||||| |||||||||    
T  35061077 -aaaatcttaagagttttagaataaattaaacaaatttgaattgagcagatactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaa 35061175  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||| | | | || ||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35061176 aattaagtcacgaccaaactt-aaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 35061237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 399 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 44289921 - 44289558
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  44289921 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaag 44289822  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
    ||| |  |||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||   || || |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  44289821 atataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgt 44289723  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||| || | |||||| || |||||| ||||| | ||||||    
T  44289722 tgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattgagtaaggactaatattgagtgcagaaattttttgtaaggattaaaaaagctatta 44289623  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| ||  || ||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||    
T  44289622 aaattaaataaggactaaacttacaagatcacaattttgtagggaccgaaaacataattaaccct 44289558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 47463776 - 47463437
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaatttt 330  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  47463776 tatgtttttggtccttataaaattgggaacttccgagtttagtccttacttaattttaataggttttttaatccctt-aaaaaaaattacttctaatttt 47463678  T
Q  331 agtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataaca---ctatgaaaggttcat 427  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |       | |||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  47463677 agtttttgttacaacaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgattttttga-gacaagtttagaacaacactatgaaaggttcat 47463579  T
Q  428 ttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaa 527  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  47463578 ttactaaaatttaattttttttaacattaaacaaattaaatatgaattttttaaaacagtaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaa 47463479  T
Q  528 tcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaat 569  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47463478 tcaaattttgtgataattttttgcagaggaacttttagtaat 47463437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 223 - 466
Target Start/End: Original strand, 7617293 - 7617537
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttact 321  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||||    
T  7617293 gggttaaatatgtttttgatccatataaaatagagatatttcaagtttaatccttacttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaagaattact 7617392  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||| |||| ||||||||    
T  7617393 tctaattttagtccttattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaag 7617492  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617493 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaa 7617537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 34513070 - 34513423
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  34513070 acaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa- 34513168  T
Q  499 ataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||||||  | |||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  34513169 ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgtt 34513268  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||| ||| ||||    
T  34513269 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaagcacttttaa 34513367  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34513368 aattaagtacggactaaacttaaaaggttccaattttatagggacaaaaaacatat 34513423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 242 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 38499689 - 38499168
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-acttctaattttagtccttgtt 340  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||         || || | |  ||||||||| | ||    
T  38499689 tccctataaaatttggaacttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtccctataaaaataatttacatgttgttttagtccctatt 38499590  T
Q  341 acgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta 440  Q
    |  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  ||| |          |||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  38499589 aaaacaaagtttctctaattatccttaaactattaaatcttaaaacgattttttttaaacaagtttataatattacaaaaggttcgtttactaaaattta 38499490  T
Q  441 gaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcg 539  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||  |||| ||||||||  ||| ||| | ||||  ||||||| |||||||| |    
T  38499489 aattttttttaacatgaaatgaattaaatatgaatatttttaaaagacatgagttcaagataaaagtaaaaaaatctggacatagaaataaaattttgag 38499390  T
Q  540 acaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaat 639  Q
    |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  | || | ||||| |||  |||||||||||||| ||    
T  38499389 attattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaacgttaaaaatttaaacat-gattaaacaaatttagat 38499291  T
Q  640 tgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttataga 739  Q
    | || ||||||||| ||| | || | ||||||  | || |||||||||  |||||||||||||| ||| | |||| |||||||  || ||||||| |||     
T  38499290 ttagtagggactaaaactaagtgcataaattttgtatagggactaaaaatactattaaaattaaataaagactaaacttaaaagatcacaattttttagg 38499191  T
Q  740 gactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  38499190 gattaaaaacatatttaaccctt 38499168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 222 - 760
Target Start/End: Original strand, 52947636 - 52948174
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttact 321  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||     
T  52947636 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattggaaacatctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatcccta-taaaaaaattaca 52947734  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac-aannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    | |||||||||||| || ||  |  || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |          ||||  |||| |||| ||| |||    
T  52947735 tataattttagtccctgctaaaattaaatttatttaattatccttaaactgttaaattttagaacgatttttttggagacacttttagaacattataaaa 52947834  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaa-ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtgg 518  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  | || ||| | |||    
T  52947835 agttcatttactaaaatttagaatttttttaacatgagataaattaaatatgaattttttaa-atgacaaaatttcaagataaaagtcacaaaagtttgg 52947933  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagc 618  Q
      ||||||||||| |||||    ||||||| |  ||| |||||||||||||||| | ||||| | |   |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  52947934 tcgtagaaatcaatttttgaactaatttttcggggagcaacttttagtaatgttttgaacacatatataaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaaac 52948033  T
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    || |||||||||||||| |||| || |||||  || | ||| || | || ||| ||  | ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  52948034 at-aattaaacaaatttgaatttagaagggatcaaaagtgagtgtagaatttttttacagggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaatctt 52948132  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52948133 aaaagatcttaattttatagggaccaaaaacatatttaaccc 52948174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 344 - 597
Target Start/End: Original strand, 42972731 - 42972983
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |       | ||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||   | |     
T  42972731 acaaagtttgtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacgagtttagaatactatgaaaggttcatttatcaaaaaaaa-at 42972829  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttt-ttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  42972830 ttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttgttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgaca 42972929  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42972930 attttttgcagtggaac-tttagcaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtt 42972983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Original strand, 28163777 - 28164128
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  28163777 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattatttagcatgaaataaatttaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaa 28163876  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||||| |||||| |||  ||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  28163877 ataaaagtaacaaaaatctggaagcagaaataaaa--ttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacac-tgtgcaaaaaattgtt 28163973  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattt-taaggactaaaagaactatta 696  Q
    |||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | ||| || | || ||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  28163974 caaaattttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagattaaatagggactaaaattgagtgcataattttttttatatggactaaaagcactatta 28164072  T
Q  697 aaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28164073 aaattaagttaggactaaacttaaaa-gtcccaattttatagggaccaaaaacatat 28164128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 566 - 761
Target Start/End: Original strand, 7617535 - 7617730
Alignment:
Q  566 taatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaa 665  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |     
T  7617535 taatgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaagagtgactaatactgagtgaat 7617634  T
Q  666 aaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  7617635 aaatttattttagggattaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggcccatattttatagggatcaaaaatatatttaaccct 7617730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 399 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 44452328 - 44451975
Alignment:
Q  399 acaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaag 498  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||     
T  44452328 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaa 44452229  T
Q  499 ataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
    |||||  |||| ||| | |||| | || ||| |||||||| || || |||||| |||  ||||||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  44452228 ataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataa-tttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgtt 44452130  T
Q  598 caaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| || | || | | || || |||||||||  |||||||     
T  44452129 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttagatttagtaaggactaaaactgagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattat 44452031  T
Q  698 aattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44452030 aattaagtaaggactaaacttataaggtcacaattttatagggaccaaaaacatat 44451975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 403 - 751
Target Start/End: Original strand, 48219943 - 48220290
Alignment:
Q  403 gtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataa 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| || || ||||    
T  48219943 gtttagaacattatgaaaggttcatttgttaaaatttagaattttttaacaagaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaa-ttcaatataa 48220041  T
Q  503 atttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaa 601  Q
    |  |||| ||| | |||| |||||||| ||||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||| |||    
T  48220042 aagtaacaaaaatttggatgtagaaattaaattttacaataattttttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacatatctgcaaaagaatgttaaaa 48220141  T
Q  602 aactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaatt 701  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   | ||||| |||||||    ||   ||| || |||  ||||||| | |||||||||||    
T  48220142 aacataagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattggatatggactgatactgagcacaatttttttttataaaaactaaaatatctattaaaatt 48220240  T
Q  702 aagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacat 751  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  48220241 aagtaaggactaaacttaaaaagtcccaattttataaggactataaacat 48220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 436 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 37329695 - 37329471
Alignment:
Q  436 atttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtaga--aatcaaat 533  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || |  ||| ||||    
T  37329695 atttataattttttaaaatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatatatataaattaaat 37329596  T
Q  534 tttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaat 633  Q
    ||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37329595 tttgcaataattttttgcggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaat 37329496  T
Q  634 ttaaattgaggagggactaatactga 659  Q
    || ||||||  | |||||||||||||    
T  37329495 ttgaattgaaca-ggactaatactga 37329471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 3862366 - 3862606
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttc 323  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||||||    
T  3862366 gttaaatatgttttttgtccttataaaatagagaccttttaagtttaatccttacttaattttaatag-ttttttagtccctacaaaaaagaattacttc 3862464  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          |||||||||| ||  | ||||||||    
T  3862465 taattttagtccctgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaagg 3862564  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaatt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3862565 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaatt 3862606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 225 - 464
Target Start/End: Original strand, 3871123 - 3871363
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttc 323  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||||||    
T  3871123 gttaaatatgttttttgtccttataaaatagagaccttttaagtttaatccttacttaattttaatag-ttttttagtccctacaaaaaagaattacttc 3871221  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatgaaagg 422  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          |||||||||| ||  | ||||||||    
T  3871222 taattttagtccctgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaagg 3871321  T
Q  423 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaatt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3871322 ttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaatt 3871363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Original strand, 11670860 - 11671047
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || | |   ||     
T  11670860 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaagactaatactgagtgcatagtattt 11670959  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11670960 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgccttaattttatagggactaaaaacaaatttaaccc 11671047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 398 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 35821356 - 35821061
Alignment:
Q  398 gacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaa 496  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  35821356 gacaagtttagaacatcatgaaaggttcatatactagaatttacaatttttttaacatgaaacttattgaatatgaattttataaaacgacaaaacttaa 35821257  T
Q  497 agataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgt 596  Q
    | ||||| |||| ||| | |||| ||||  ||  ||||||          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35821256 aaataaaattaataaaatctggacgtagcgat--aatttt----------tttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgt 35821169  T
Q  597 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactatta 696  Q
    || |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||   |  ||| ||||||||| ||||||||    
T  35821168 tc-aaaatttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaactgaggagggactaaaactga-tgcataaaaaaaaattagggactaaaaaaactatta 35821071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 574 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 53569224 - 53569036
Alignment:
Q  574 ttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaa-attt 671  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || | |  ||||    
T  53569224 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaagactaatactgagtgcatagtattt 53569125  T
Q  672 attttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  53569124 tttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttataggaactaaaaacatatttaaccc 53569036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 588 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 31471016 - 31470847
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || | |   || || ||||||||||||    
T  31471016 aaaaattgttaaaaaacttacgagtttaaaaataaattaaacaaatttgaattgagcagggactaatattgaatgtatagtatttttgtaaggactaaaa 31470917  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31470916 caactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaatgtctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 31470847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 25422943 - 25423095
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || | |   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25422943 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagtagggactagtactgagtgcatagtatttttttaaggactaaaacaactattaaaattaagt 25423042  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25423043 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaac 25423095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 573 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 53571078 - 53570890
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattt 671  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || || | |   ||    
T  53571078 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagcaaggactaataaagagtgcatagtatt 53570979  T
Q  672 attttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53570978 tttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 53570890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 588 - 763
Target Start/End: Original strand, 19522961 - 19523136
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaagg-actaaa 686  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || | |  |||||||| ||| ||||||    
T  19522961 aaaaatcgttcaaaaatttaagagtttaagaataa-ttaaacaaatttgaattgaggaggggctaatagtgagtgcagatttttatttttagggactaaa 19523059  T
Q  687 agaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19523060 agaaccattaaaattaagtaaggactaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 19523136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 386
Target Start/End: Original strand, 38114125 - 38114276
Alignment:
Q  236 ttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtc 334  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||         ||||||||||||||||||    
T  38114125 ttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagttcatacaaaaaagaattacttctaattttagtc 38114224  T
Q  335 cttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac 386  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38114225 cctgttacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 38114276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13604204 - 13603785
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--tta 319  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||  |||||||| || ||||||||||||||||   |||||| |||||||          |||    
T  13604204 agggttaaatatgtttttgtttcctataaaattaaaaactaataagtttagtctttacttaattttaataacatttttagtccctacaaaaaaatattta 13604105  T
Q  320 cttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttg-aacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
    | | |||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |         ||||||||||||||| ||| |    
T  13604104 catgtaattttaatccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataa 13604005  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtg 517  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||| | | || |    |||||| ||||  |||||||  | ||    
T  13604004 aaggttcatttactaaaattcataattttt-aacttgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttg 13603906  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaag 617  Q
    ||  || |||||| |||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13603905 gatataaaaatcacattttgagataaatttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaag 13603807  T
Q  618 cataaattaaacaaatttaaatt 640  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  13603806 cat-aattaaacaaatttgaatt 13603785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 386
Target Start/End: Original strand, 13717892 - 13718033
Alignment:
Q  246 tataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-acttctaattttagtccttgttacga 344  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||        || ||||||||||||||||| |||||| |    
T  13717892 tataaaattgggaacttctaaatttaatccttacttaattttaatacgttatttaatccctacaaaaaagatttacttctaattttagtccatgttacaa 13717991  T
Q  345 caaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac 386  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13717992 aaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 13718033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 758
Target Start/End: Original strand, 25243861 - 25244013
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || ||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  25243861 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggacaaaaaaaactaataaaattaagt 25243960  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25243961 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaac 25244013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 47463438 - 47463297
Alignment:
Q  619 ataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  47463438 ataaattaaataaatttgaattgaggagggactaatactgaatgcataatttt-ttttagggactaaaagaactattaaaattaaataaggactaaactt 47463340  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  47463339 aaaatgtcttaattttatagggatcaaaaacatattaaaccct 47463297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 235 - 503
Target Start/End: Original strand, 20650391 - 20650660
Alignment:
Q  235 tttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagt 333  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||         |||| | ||||||||||    
T  20650391 ttttggatccctataaaatttggaacttttaagtttagtcctcactttattttaatagcttttttagtccctacaaaaacaaattacatgtaattttagt 20650490  T
Q  334 ccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttacta 433  Q
    || |  ||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||| | | |         |||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||    
T  20650491 ccctactaaaacaaagtttgtttaattatctttaaaatcttaaaagttttagcgattttcttgggacaagtttggaacatcacgaaagattcatttacta 20650590  T
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatt-ttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  20650591 aaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatatgaattattttaata-gacaaaagttcaagataaa 20650660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 44208911 - 44208758
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || | ||  || || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44208911 caagagtttaatcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactgatattgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaaaataagt 44208812  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44208811 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 44208758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 31317815 - 31317968
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || | |   || || ||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  31317815 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactaagtgcatagtatttttgtaaggacaaaaacaacgattagaattaagt 31317914  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31317915 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttttagggactaaaaacatatttaacc 31317968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 48738561 - 48738397
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  48738561 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 48738463  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48738462 gcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggaccaaaaacatat 48738397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Original strand, 3872918 - 3873005
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3872918 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggaccttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctac 3873005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 55283525 - 55282986
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttacttc 323  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||||| |||||||          | || |     
T  55283525 ttaaatatgtttttggtccgtataaaattggaaacttctaagtttagtctttacttaattttaataatatttttagtccctacaaaaataaaataacatg 55283426  T
Q  324 taattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggt 423  Q
    |||||||||||||| | |  || || ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |         |||| ||||| |||| ||| ||| ||    
T  55283425 taattttagtccttctaaaaactaaatttgtttaattattcttgaattcttaaatttttgaacgatttttaggagacatgtttagaacattataaaatgt 55283326  T
Q  424 tcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagt 522  Q
    |||||| ||||||  |||| |||||||| | || | || |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||   |||||||  | || | ||    
T  55283325 tcatttgctaaaaaatagatttttttaataggagaagatttaaatatgatttttttaa-acgacaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctgaacgt 55283227  T
Q  523 agaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataa 622  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | || | | ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |    
T  55283226 agaaatcaaattttgagttaatattttgtagagggacttttcgtaatgttcttaataggtgtacaaaagattgtttaaaaattcaagaatttaagcat-a 55283128  T
Q  623 attaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaa--aattaagtaaggcctaagcttaa 720  Q
    |||||||||||||  ||| || |  |||||| ||| | || ||||   | || || ||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||  ||||    
T  55283127 attaaacaaatttggattaagaatagactaaaactaaatgcaaaatgattttatagggactaaaaaagctattaaataattaagtaaggactaaatttaa 55283028  T
Q  721 aatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    || | | ||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||    
T  55283027 aaggcctcaattttataaggataaaaaatatatttaaccctt 55282986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 388
Target Start/End: Original strand, 20177721 - 20177887
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttac 320  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| | ||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||          ||||    
T  20177721 gggttaaatatgtttttagtccttataaaattggaaacttctaagat-aacccttacttaattttaataggttttttagtccctacaaacaaaaaattac 20177819  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaa 388  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20177820 ttctaattttagtcactgttacaacaaaatttgtttaattattcttaatctcttaaatttttgaacaa 20177887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52948174 - 52948091
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccct 306  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52948174 gggttaaatatgtttttggtccctataaaattaagatcttttaagattagtccttacttaattttaataggttttttagtccct 52948091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 609 - 759
Target Start/End: Original strand, 10322579 - 10322729
Alignment:
Q  609 gagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaag 708  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || | |    | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10322579 gagtttaatcataaattgaacaaattagaattgagcagggactaatactgagtgcatagtagttttgtaaggactaaaacaactattataattaagtaag 10322678  T
Q  709 gcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    | |||| | ||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10322679 gactaaacgtaaaatacctcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 10322729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 639
Target Start/End: Original strand, 35351735 - 35351958
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttt-taacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaa-attg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||  || ||| | |     
T  35351735 aaaggttcatttactaaaatttaaaatttttgtaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttcatcaacaaaagttcaagataaaagtatcaatactt 35351834  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcga-aaaattgttcaaaaactcaagagttt 614  Q
    |  | |||||||||||||| || ||  ||||||||  || ||||||||  ||||||| ||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35351835 tatacgtagaaatcaaattatgagatgattttttgcggatgaacttttgttaatgtttttaacacctccacaagaaagttgttcaaaaactcaggagttt 35351934  T
Q  615 aagcataaattaaacaaatttaaat 639  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  35351935 aaacat-aattaaacaaatttaaat 35351958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 434 - 597
Target Start/End: Original strand, 44452893 - 44453056
Alignment:
Q  434 aaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaaa 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||  || | ||||| |||| | |||||  |||    
T  44452893 aaatttagaattttttaatatgaaataaattaaatatgaattttttaata-gacaaaagttcaaaataaaagtagcaaaattctggacgcagaaaaaaaa 44452991  T
Q  533 ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgtt 597  Q
      ||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  44452992 aattgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44453056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 45558058 - 45557895
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac-nnnnnnnnttactt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||         |||||     
T  45558058 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattgggagtttttaagtttaaaccctacttaattttaataggt-ttttagtccatacaaaaaagaattacta 45557960  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaact-tttaaatttttgaac 386  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45557959 ctaattttagtgcttgttactacagcatttgtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaac 45557895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 4849973 - 4850059
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  4849973 tagggttaaatatgtttttgatccctataaaattgagaccttttaagtttaatccttgcttaatttaaatagttcttttagtcccta 4850059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 679 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 13508830 - 13508756
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatat 753  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13508830 ggactaaaagcactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggaccaaaaacatat 13508756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 630 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 33688688 - 33688558
Alignment:
Q  630 aaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcct-aagcttaaaatgtccc 728  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||| | |    
T  33688688 aaatttgaattgagcagggactaatactgagtgcataatatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaaccttaaaatgcctc 33688589  T
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  33688588 aattttacagggactaaaaacgtatttaacc 33688558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7617733 - 7617645
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  7617733 tatagggttaaatatatttttgatccctataaaatatgggccttttaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttaatcccta 7617645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14579141 - 14579065
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14579141 ggttaaatatgtttttgatctctataaaattgggtacttctaagtttagtccttacttaattttaatagctttttta 14579065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Original strand, 44289548 - 44289640
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44289548 tattaattatagggttaattatgttttcggtccctacaaaattgtgatcttgtaagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaatcc 44289640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 771
Target Start/End: Original strand, 20650727 - 20650818
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20650727 gactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtttcaattttatagggtacaaaaacatatttaacccttgattttatt 20650818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44290088 - 44290001
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttt-taagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  || | || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44290088 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgcgacccttctaagtttagtccttacttaattttaatagcttttttaatccctac 44290001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 3873001 - 3872919
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3873001 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 3872919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 525 - 707
Target Start/End: Original strand, 6817979 - 6818158
Alignment:
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| | | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||    
T  6817979 aaatcaaattttgag-caattttttgcggaggaactttaatttatgttcttaaaacgtatacaaaaaattgttcaaaaatgtaagagtttaaacat-aat 6818076  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaa 707  Q
    |||||||||||  ||| |  ||||||||| ||||| || ||||| ||  | || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6818077 taaacaaattttgatttataagggactaaaactgactgcaaaaactttatataggaactaaaa-aactattaaaattaagtaa 6818158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 28163284 - 28163139
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| | | | ||| || | || ||| || || |||||||||    
T  28163284 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggattgaaattgagtgcataatttttttatatggactaaaa 28163186  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaatttt 734  Q
      ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  28163185 acactattaaaattaagcaaggactaaacttaaaaggtcccaatttt 28163139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 678 - 760
Target Start/End: Original strand, 37329726 - 37329808
Alignment:
Q  678 aggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37329726 aggactaaaacaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaatgcctcgattttataggtactaaaaacatatttaaccc 37329808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 47463296 - 47463382
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  47463296 tagggtttaatatgtttttgatccctataaaattaagacattttaagtttagtccttatttaattttaatagttcttttagtcccta 47463382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 521 - 635
Target Start/End: Original strand, 47939752 - 47939865
Alignment:
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||   || |||||||||||    
T  47939752 gtagaaatcaaattttgagataattttttgcggaaaaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgcttaaaaagctaaaagtttaagcat 47939851  T
Q  621 aaattaaacaaattt 635  Q
     ||||||||||||||    
T  47939852 -aattaaacaaattt 47939865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 567 - 657
Target Start/End: Original strand, 50824407 - 50824497
Alignment:
Q  567 aatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatact 657  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  50824407 aatgttcttaacacgtctgaaaaatattgttcaaaaacttaagctattaagcataaattaaacaaatttgaattgggtaaggactaatact 50824497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 766
Target Start/End: Original strand, 55938405 - 55938495
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttatt 766  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  55938405 taaggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcgtaattttatagagactaagaatatatttaaccctttatt 55938495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 13508757 - 13508818
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13508757 tatgtttttggtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaattttaatag 13508818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7499163 - 7499080
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccc 305  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7499163 agggtgaaatatgtttttggtccttataaaattgagaacttctaagtttattctttacttaattttaataggttttttagtccc 7499080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 759
Target Start/End: Original strand, 14579058 - 14579141
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14579058 taaggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtacccaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 14579141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38114624 - 38114541
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  38114624 ggttaaatatgtttttggtccctataaaataaggacctttcaagtttaatcattacttaattttaatggttcttttagtcccta 38114541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 51396025 - 51395958
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51396025 ggttaaatatgtttttaatccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttatttaattttaata 51395958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 7490577 - 7490647
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7490577 agggttaaatatgtttttggtccctataaaatttggattctttaagttttatccttacttaattttaatag 7490647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 588 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 34512591 - 34512466
Alignment:
Q  588 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaa 687  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | | | || | || ||| || || |||||||||    
T  34512591 aaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa-ttaaacaaatttagatttagtagggactaaaattaagtgcataatttttttatatggactaaaa 34512493  T
Q  688 gaactattaaaattaagtaaggcctaa 714  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  34512492 gcactgttaaaattaagtaaggactaa 34512466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 307
Target Start/End: Original strand, 10085387 - 10085452
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10085387 tccctataaaattgagaccttttaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttagtcccta 10085452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19523134 - 19523049
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  19523134 agggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 19523049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 47379134 - 47379053
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  47379134 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccagttttatagggaccagaaacatatttaaccc 47379053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 48738398 - 48738459
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48738398 tatgtttttggtccctataaaattgagatcttttaagtttagtccttacttaattttaatag 48738459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43938354 - 43938286
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaat 290  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43938354 agggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaacttctaagtttagtccttacttaactttaat 43938286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 683 - 763
Target Start/End: Original strand, 48082788 - 48082868
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  48082788 taaaagagctattaaaattaagtaaggacttaacttagaaggtcgcaattttatagggaccaaaaacataattaacccttt 48082868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6589187 - 6589100
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  6589187 tagggttaaatatgtttttggtcccgacaaaattgggatcctctaagtttagtccttacttaattttaatagctttttcagtccctac 6589100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20650808 - 20650730
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaac-ttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20650808 agggttaaatatgtttttgtaccctataaaatt-gaaacattttaagtttagtccttacttaattttaatagttttttta 20650730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 684 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 27392571 - 27392496
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27392571 aaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaactaaaaaaatcttaattttatatagactaaaaacatatttaacc 27392496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 769
Target Start/End: Original strand, 44290017 - 44290096
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg-tcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattata 769  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44290017 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagggtcgcaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttaattata 44290096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 11670001 - 11670070
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11670001 gggttaaatatgtttttaatccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 11670070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Original strand, 22068437 - 22068519
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  22068437 ggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtttccaattttatagggaccagaaacatatttaaccct 22068519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28448346 - 28448268
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  28448346 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggtccaaaaacatatttaa 28448268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Original strand, 42916229 - 42916315
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||   |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  42916229 agggttaaatatatttttgatatgtataaaattcagaagttttaaatttaatccttacttaattttaatatcttttttagtccctac 42916315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47379590 - 47379512
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47379590 agggttaaatatgtttttggtcccaataaaatcgggaccttctaagtttagcccttacttaattttaatagttttttta 47379512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 22067979 - 22068064
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  22067979 agggttaaatatatttttggtccctataaaattgataccttataagtttagtccttacttaattttaatagttcttttagtcccta 22068064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28164127 - 28164067
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28164127 tatgtttttggtccctataaaattggga-cttttaagtttagtcctaacttaattttaatag 28164067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28448799 - 28448734
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28448799 ggttaaatatgttttttgtccctataaaattgggacctttcaagtttagtccttacttaattttaa 28448734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33689705 - 33689625
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33689705 ggttaaatatgtttttagtccctgtaaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatagttgttttaatcc 33689625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 38499169 - 38499254
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  38499169 agggttaaatatgtttttaatccctaaaaaattgtgatcttttaagtttagtctttatttaattttaatagtatttttagtcccta 38499254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 693 - 770
Target Start/End: Original strand, 43938286 - 43938363
Alignment:
Q  693 attaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatat 770  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43938286 attaaagttaagtaaggactaaacttagaagttctcaattttatagggaccaaaaacatatttaacccttaattatat 43938363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 300
Target Start/End: Original strand, 48219764 - 48219840
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  48219764 gggttaagtatgtttt-gattcctataaaattgggaatttttaagtttagtcctcacttaaatttaatagctttttta 48219840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 759
Target Start/End: Original strand, 10085822 - 10085902
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||| |||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10085822 ggactaaaaaagctattaaaattatgtaaggactaaactttaaagttcccaattttataaggaccaaaaacatatttaacc 10085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 691 - 759
Target Start/End: Original strand, 45557990 - 45558058
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45557990 ctattaaaattaagtagggtttaaacttaaaaactcccaattttatagggaccaaaaacatatttaacc 45558058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 3862444 - 3862366
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  3862444 ggactaaaa-aactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctctattttataaggacaaaaaacatatttaac 3862366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 3871201 - 3871123
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  3871201 ggactaaaa-aactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtctctattttataaggacaaaaaacatatttaac 3871123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3873586 - 3873519
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3873586 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatatggaccttttaagtttagtttttacttaatttta 3873519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 681 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 23473435 - 23473360
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||   |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23473435 actaaaaaaattattaaaattaaataaatactaaacttaaaagttcccaattttataaagactaaaaacatattta 23473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 762
Target Start/End: Original strand, 47309773 - 47309856
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  47309773 ggactaaaaaatatattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaatatatttaaccctt 47309856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Original strand, 48082323 - 48082406
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48082323 tagggttaattatattttcggtctctacaaaattgtgatcttgtaagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaatcc 48082406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 52947706 - 52947635
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |   | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52947706 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagatgtttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 52947635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 25768018 - 25768088
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  25768018 aaaaattagaattttttaacatgtaacgaattaaatataatttttttaatacgccaaaaattcaagataaa 25768088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 33177377 - 33177295
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  33177377 ggactaaaaaatctattaaaattaagtatggattaaacttgaaaggtccctattttatagggatcaaaaacatatttaaccct 33177295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Original strand, 38499627 - 38499705
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  38499627 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttccaaattttatagggaccacaaatatatttaa 38499705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39269864 - 39269794
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  39269864 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattatatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 39269794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 42642996 - 42643066
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  42642996 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaatgccaaaaattcaagataaa 42643066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42973093 - 42973027
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42973093 ttaaatatatttttgatccctataaaattggtattttttaagtttggtccttacttaattttaatag 42973027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 53570890 - 53570959
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53570890 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 53570959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53571942 - 53571873
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53571942 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 53571873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11671047 - 11670978
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11671047 gggttaaatttgtttttagtccctataaaattaaggcattttaagtttagtccttacttaattttaatag 11670978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Original strand, 19320816 - 19321036
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||| ||| | ||||  || |||| ||    
T  19320816 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 19320915  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaa 631  Q
    |||||| |  ||||| |||| | ||||| |||  ||||||| | |||| || ||  ||||||| || ||||| | || | ||||||||| ||||||||||    
T  19320916 attttgagctaatttattgtggcggaacgttttataatgttttaaacaagtatgtaaaaaattattaaaaaatttaaaattttaagcat-aattaaacaa 19321014  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaa 653  Q
    |||| |||| |  |||||||||    
T  19321015 attttaatttaacagggactaa 19321036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 28756420 - 28756200
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||| ||| | ||||  || |||| ||    
T  28756420 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaa 28756321  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaa 631  Q
    |||||| |  ||||| |||| | ||||| |||  ||||||| | |||| || ||  ||||||| || ||||| | || | ||||||||| ||||||||||    
T  28756320 attttgagctaatttattgtggcggaaccttttataatgttttaaacaagtatgtaaaaaattattaaaaaatttaaaattttaagcat-aattaaacaa 28756222  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaa 653  Q
    |||| |||| |  |||||||||    
T  28756221 attttaatttaacagggactaa 28756200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 29445741 - 29445521
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgtggaagtagaaatcaa 531  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||| ||| | ||||  ||||||| ||    
T  29445741 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctagaaataaa 29445642  T
Q  532 attttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaa 631  Q
    |||||| |  ||||| |||| | ||||| |||  ||||||| | |||| || ||  ||||||  || ||||| | || | ||||||||| ||||||||||    
T  29445641 attttgagctaatttattgtggcggaaccttttataatgttttaaacaagtgtgtaaaaaatcattaaaaaatttaaaattttaagcat-aattaaacaa 29445543  T
Q  632 atttaaattgaggagggactaa 653  Q
    |||| |||| |  |||||||||    
T  29445542 attttaatttaacagggactaa 29445521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30331690 - 30331614
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctat--aaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||| |||||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30331690 ttaaatatgtttttggtccctatttaaaatagggaccttttaagttcagtccttacttaattttaatagttttttta 30331614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 35055160 - 35055111
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  35055160 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgaacagggactaata 35055111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Original strand, 35821030 - 35821091
Alignment:
Q  246 tataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35821030 tataaaattgggatctttcaagtttaattcatacttaattttaatagtttttttagtcccta 35821091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 44451976 - 44452037
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44451976 tatgtttttggtccctataaaattgtgaccttataagtttagtccttacttaattataatag 44452037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 53569036 - 53569105
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  | |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53569036 gggttaaatatgtttttagttcctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 53569105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 478
Target Start/End: Original strand, 4821856 - 4821908
Alignment:
Q  426 atttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  4821856 atttactaaaatttagaattttttaacgtgcaataaattaaatataaattttt 4821908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 7617374 - 7617282
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattatatt 771  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || | ||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7617374 ggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaatatctctattttatatggatcaaaaacatatttaacccattaatatatt 7617282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8949727 - 8949651
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac 509  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || |||||||| |||||    
T  8949727 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaac 8949651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 673 - 757
Target Start/End: Original strand, 42973009 - 42973093
Alignment:
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||  | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  42973009 ttttaaagactaaacaaactattaaaattaagtaaggaccaaacttaaaaaataccaattttatagggatcaaaaatatatttaa 42973093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 48219847 - 48219764
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  48219847 taaggactaaaaaagctattaaatttaagtgaggactaaacttaaaaattcccaattttatag-gaatcaaaacatacttaaccc 48219764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 51395569 - 51395489
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  51395569 ggactaaaaaacttattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttccctattttataggaaccaaaaacatatttaacc 51395489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 10386696 - 10386775
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  10386696 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatatcatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 10386775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25244013 - 25243939
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25244013 gttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttattagttttttt 25243939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 25421949 - 25422015
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421949 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaa 25422015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 27392496 - 27392571
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttt 299  Q
    |||||| |||||||||  ||  |||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27392496 ggttaaatatgtttttagtctatataaaattaagatttttttagtttagtccttacttaattttaatagttttttt 27392571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 39656765 - 39656730
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39656765 tttgtttaattatccttaaacttctaaatttttgaa 39656730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Original strand, 51875879 - 51875942
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  51875879 gttaaatatgtctttgatccctataaaattggaatctttcaagtttagttcttacttaatttta 51875942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 344023 - 343953
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  344023 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 343953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6203275 - 6203205
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  6203275 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaatttcaagataaa 6203205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 691 - 761
Target Start/End: Original strand, 6589116 - 6589186
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |   |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  6589116 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaggatcccaattttgtcgggaccaaaaacatatttaaccct 6589186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11152413 - 11152343
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  11152413 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 11152343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 694 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 15562877 - 15562811
Alignment:
Q  694 ttaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15562877 ttaaaattaagtaaggactaaacataaaatacctcaattttatacggactaaaaaaatatttaaccc 15562811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22515767 - 22515697
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  22515767 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 22515697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23473894 - 23473824
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||   ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23473894 agggttaaatatgtttttagtccctataaaatcgagacttttgaagtttagtccttacttaattttaatag 23473824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 23708873 - 23708943
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  23708873 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaa 23708943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 24281869 - 24281939
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  24281869 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 24281939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28164007 - 28163969
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaa 388  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28164007 tttgtttaattatgcttaaacttttaaaattttgaacaa 28163969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31312251 - 31312181
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  31312251 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 31312181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Original strand, 31470847 - 31470913
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31470847 ttaaatatgtttttagtccctataaaattgagacattttaagtttagtcattacttaattttaatag 31470913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34513422 - 34513364
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaa 289  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  34513422 tatgttttttgtccctataaaattggaaccttttaagtttagtccgtacttaattttaa 34513364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 35015533 - 35015463
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  35015533 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 35015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 38698827 - 38698897
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  38698827 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaa 38698897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40943812 - 40943754
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    |||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40943812 ttttagtccttgttaaattaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaa 40943754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 42931154 - 42931224
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  42931154 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaa 42931224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48220276 - 48220230
Alignment:
Q  246 tataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48220276 tataaaattgggactttttaagtttagtccttacttaattttaatag 48220230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 52788856 - 52788925
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  52788856 aaaaattataattttttaacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgtcaaaagttcaagataaa 52788925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 53237972 - 53238042
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  53237972 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgtcaaaaattcaagataaa 53238042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 681 - 738
Target Start/End: Original strand, 1870446 - 1870503
Alignment:
Q  681 actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatag 738  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||    
T  1870446 actaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacataaaagttcccaattttatag 1870503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6818209 - 6818136
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||||  |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6818209 gttaaataagtttttgattcctgtaaaattgaggccttttaactttaatcattacttaattttaatagtttttt 6818136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8837897 - 8837868
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8837897 agggttaattatgtttttgatccctataaa 8837868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18429044 - 18428999
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  18429044 aaaatttagaattttttaacaaaacacaaattaaatatgaattttt 18428999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 251
Target Start/End: Original strand, 23454340 - 23454377
Alignment:
Q  214 tttattatagggttaattatgtttttgatccctataaa 251  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23454340 tttattctagggttaaatatgtttttgatccctataaa 23454377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 277
Target Start/End: Original strand, 26487777 - 26487842
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatcctt 277  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| | ||||||||||    
T  26487777 tattttttatagggttaaatatgtttttggtccctataaatatatcaacttttcattttaatcctt 26487842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Original strand, 42972666 - 42972719
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttac 279  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  42972666 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgaaaacttttaagtttagtccttac 42972719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Original strand, 43937904 - 43937953
Alignment:
Q  258 aacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  43937904 aacttttaagtttaatctttaattaattttaataatttttttagtcccta 43937953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 307
Target Start/End: Original strand, 47309335 - 47309400
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  47309335 tccctataaaataagggtctttcaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 47309400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 762
Target Start/End: Original strand, 51459067 - 51459100
Alignment:
Q  729 aattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51459067 aattttatagtgactaaaaacatatttaaccctt 51459100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 385
Target Start/End: Original strand, 52788433 - 52788474
Alignment:
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52788433 acaaaatttgtttaattatgcttaaacttctaaatttttgaa 52788474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 764
Target Start/End: Original strand, 55283447 - 55283532
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttta 764  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| | |||| |||| ||  | |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  55283447 ggactaaaaatattattaaaattaagtaaagactaaacttagaagtttccaattttatacggaccaaaaacatatttaatccttta 55283532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 222 - 761
Target Start/End: Original strand, 5791 - 6332
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttac 320  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         ||||    
T  5791 agggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggacctttcaagtttaatccttacttaattttaatagattttttagtccctacaaaaaagaattac 5890  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |         |||||||||  ||||||||||||    
T  5891 ttctaattttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttgattttttgaacgatttttttgagacaagtttggaacactatgaaa 5990  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||| | || |     
T  5991 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaac 6090  T
Q  521 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6091 gtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcatagtaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacat 6190  T
Q  621 aaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagctt 718  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  6191 aaattaaacaaatttgaatcgaggagggactaatactgagtgcagattttttttttttagggactaaaagaaccattaaaattaagtaaggactaaactt 6290  T
Q  719 aaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||| | ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||    
T  6291 aaaaggcccctattttgtag-ggccaaaaacatatttaaccct 6332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 679 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 5873 - 5789
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacccttt 763  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5873 ggactaaaaaatctattaaaattaagtaaggattaaacttgaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaacccttt 5789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 6248
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  6333 tagggttaaatatgtttttgg-ccctacaaaataggggccttttaagtttagtccttacttaattttaatggttcttttagtcccta 6248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 223 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 551
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttactt 322  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||        ||||||    
T  1087 gggttaactatgtttctggtccctataaaattggaaatttttaagtttagtccttacttaattttaatag-ttttttagtccctacaaaaaaagttactt 989  T
Q  323 ctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnat-gacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |        | || ||||||| |||||||| ||||    
T  988 ctaattttagtccctcttacaaaaaagtttgtttgattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagataagtttagaacactataaaag 889  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaag 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  888 gttcatttactaaaatttagaattttttaagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaattaacaaattctggact 789  T
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
     | ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  788 caaaaatcaaattttgcgacaa-tttgtgcagatgaacttttagtaatgttcttatcacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacata 690  T
Q  622 aattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaa 721  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  689 aattaaacaaatttgaattgaagagggactaatactgagtgcagaaaaaaaaattaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggtctaaattttaa 590  T
Q  722 atgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    |  || |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  589 agatctcaattttatatagatcaaaaacatatttaaccc 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 760
Target Start/End: Original strand, 1007 - 1087
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  1007 ggactaaaa-aactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaaatttccaattttatagggaccagaaacatagttaaccc 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Original strand, 551 - 620
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||  || |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  551 gggttaaatatgtttttgatctatataaaattgagatctttaaaatttagaccttacttaattttaatag 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 242 - 759
Target Start/End: Original strand, 6075 - 6587
Alignment:
Q  242 tccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgtt 340  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  6075 tccctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaagaaaattacttctaattttagtccttgtt 6174  T
Q  341 acgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta 440  Q
    || ||||||||||||||||||||       | |||||||||||||| |         | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6175 acaacaaagtttgtttaattatc-------tcttaaatttttgaacgattttttcgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta 6267  T
Q  441 gaattttttaacatgaaacgaa--ttaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgc 538  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||| | |||   |||||||||||||||||    
T  6268 gaattttttaacatgaaaaaaaaattaaatatgatttttttaaaaccagaaaaattaaagataaatt-aacaaagtttgggcctagaaatcaaattttgc 6366  T
Q  539 gacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaa 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6367 gacaattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaa 6466  T
Q  639 ttgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatag 738  Q
    ||||| | | ||||||||||| || |||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6467 ttgagaatgcactaatactgagtgcaaatttttttattaaatactaaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgtctcaattttatag 6566  T
Q  739 agactaaaaacatatttaacc 759  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  6567 ggaccaaaaacatatttaacc 6587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6587 - 6519
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6587 ggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagacattttaagtttagtccttacttaattttaatag 6519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6140 - 6054
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||    
T  6140 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagggacaaagaatatatttaagcctt 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 226 - 761
Target Start/End: Original strand, 17255 - 17791
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttct 324  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||         |||||| |    
T  17255 ttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaatttctaagtttaatccttacttaattttaatagtttttttagtccctacaaaaataaattactttt 17354  T
Q  325 aattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggtt 424  Q
    ||||||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |         |||||||||| ||||| |||| || ||    
T  17355 aattttagtccctactaaaataaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaaagatttttttgagacaagtttagaacaccatgatagatt 17454  T
Q  425 catttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtag 524  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  ||     
T  17455 catttactaaaatttagaatttt-taacatgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacaacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacttaa 17553  T
Q  525 aaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaat 624  Q
    |||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  17554 aaatcaaattttgcaataattttttacggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaactataaat 17653  T
Q  625 taaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattt-taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || | || ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||     
T  17654 taaacaaatttgaattcagcagggactaatactgagtgcataactttttttgtagggattaaaagaactattaaaattaagtaaagactaaacttaaaag 17753  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
     || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17754 ctctcaattttataaggactaaaaacatatttaaccct 17791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17792 - 17705
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17792 tagggttaaatatgtttttagtccttataaaattgagagcttttaagtttagtctttacttaattttaatagttcttttaatccctac 17705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17333 - 17255
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17333 ggactaaaaaaactattaaaattaagtaaggattaaacttagaaattctcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 17255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 245 - 759
Target Start/End: Original strand, 99 - 603
Alignment:
Q  245 ctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-ttacttctaattttagtccttgttacg 343  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||         ||||||||||||||||||||||||||     
T  99 ctataaaattgggaacttctaagtttagtccttacttaattttaataggttttttagtccttacaaaagaaaattacttctaattttagtccttgttaca 198  T
Q  344 acaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  199 acaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagttcagaacactacgaaaggttcatttactaaaatttagaa 298  T
Q  444 ttttttaacatgaaacgaa-ttaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgaca 542  Q
    |||||||| ||||||  || |||||||| | ||||| || | ||||||| ||||            |||| | |||   |||||||||||||||| ||||    
T  299 ttttttaaaatgaaaaaaaattaaatataattttttgaaaacgacaaaaattaa------------caaaatctgggcctagaaatcaaattttgtgaca 386  T
Q  543 attttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 642  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  387 attttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcatgtgtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 486  T
Q  643 ggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagac 742  Q
    | | ||||||||||||| || | |||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| |||    
T  487 gaaaggactaatactgagtgcagaaatttttattagatactaaaagaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgtctaaattttatagggac 586  T
Q  743 taaaaacatatttaacc 759  Q
     ||||||||||||||||    
T  587 caaaaacatatttaacc 603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 161 - 75
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  161 taaggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagttcccaattttatagtgacaaaaaatatatttaagcctt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 535
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  603 ggttaaatatgtttttggtccctataaaatttagacattttaagtttagttcttacttaattttaatag 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 258 - 763
Target Start/End: Original strand, 6821 - 7317
Alignment:
Q  258 aacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgttta 357  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||        |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  6821 aacttttaaatttagtccttacttgattttaataggttttatagtccttacaaaaaaaattacttctaattttagtccttgttacaaca--gtttattta 6918  T
Q  358 attatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaa 457  Q
    ||||||||||||       |||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  6919 attatccttaaa-------atttttgaacgatttgattgagacaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt-aacctaaa 7010  T
Q  458 acgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagagga 557  Q
    | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  7011 atgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatga 7110  T
Q  558 acttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatact 657  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||     
T  7111 acttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaatggaggagagactaatacc 7210  T
Q  658 gattggaaaaatttattttaagg-actaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattta 756  Q
    |  || | || ||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7211 gggtgcataattttttttttaggaactaacataactattaaaattaagtaatgactaaacttaaaagatcccaattttatagagactaaaaacatattta 7310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7312 - 7245
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7312 gttaaatatgtttttagtctctataaaattgggatcttttaagtttagtcattacttaattttaatag 7245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 317 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1045
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |         | |||||||| ||||||||    
T  1484 ttacttcta-ttttagtccctattacaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactat 1386  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta---agatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||  ||||| |||||||||| ||||||||     
T  1385 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgatttttttttttaaatggtaaaagctaaagataaaattaacaaaa 1286  T
Q  514 tgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtt 613  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1285 tctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcaaagaaactttaagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcatgagtt 1186  T
Q  614 taagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggccta 713  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||  | ||||||||| || |||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1185 taagcataaataaaacaaatttgaattaaggagaaattaatactgagtgcaaaaaaaaaaattaagaactaaaagaactattaaaattaagtaaagacta 1086  T
Q  714 agcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatt 754  Q
    |  ||||||  | | ||||||||||| || |||||||||||    
T  1085 aatttaaaagatactaattttatagacaccaaaaacatatt 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1613 - 1532
Alignment:
Q  217 attatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttt 298  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  1613 attatagggttaaatatatttttggtccctataaaattgggaacttctaaatttagttcttacttaattttaatagtttttt 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 680 - 761
Target Start/End: Original strand, 1528 - 1608
Alignment:
Q  680 gactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  1528 gactaaaa-aactattaaaattaagtaagaactaaatttagaagttcccaattttatagggaccaaaaatatatttaaccct 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 292
Target Start/End: Original strand, 1047 - 1108
Alignment:
Q  231 tatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  1047 tatgtttttggtgtctataaaattagtatcttttaaatttagtctttacttaattttaatag 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 6833 - 7275
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  6833 ttacttctaattttagtcct-gctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactat 6931  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaatttt-ttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||  ||| ||| |     
T  6932 gaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatt 7031  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7032 tggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagttta 7131  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||| || |     || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  7132 agcataaattaaacaaatttaaactaaacagagactaatactgagtgcatggtatttttgtaaggactaaaacaattattaaaattaagtaaggactaaa 7231  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7232 cttaaaatgcctcaattttatag-gactaaaaacatatttaaccc 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 5855 - 5702
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || | |   || || ||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  5855 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattgagcagggactaatactaagtgcatagtatttttgtaaggacaaaaacaacgattagaattaagt 5756  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5755 aaggactaaacttaaaatgcctcaattttttagggactaaaaacatatttaacc 5702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 327 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 35588 - 35160
Alignment:
Q  327 ttttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttca 426  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |          ||||||||| |  | |||||||||||||    
T  35588 ttttagtccctgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagattattatgaaaggttca 35489  T
Q  427 tttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaa 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  || ||    
T  35488 attactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataa 35389  T
Q  527 atcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaatta 626  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35388 atcaaattttgcaataattttttgcggaggaacttttactaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaatta 35289  T
Q  627 aacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtc 726  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  35288 aacaaatttgaattga--agggactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaacttaaaatgcc 35191  T
Q  727 ccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35190 tcaattttatagggattaaaaacatatttaa 35160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 577 - 760
Target Start/End: Original strand, 38609 - 38792
Alignment:
Q  577 acacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttatttt 676  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || | ||  || || |    
T  38609 acacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatactgaatgcataatatttttgt 38708  T
Q  677 aaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38709 gaggactaaaacaactattaaaattaaataatgactaaacttaaaatgcctcgattttatagggactaaaaacatatttaaccc 38792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Original strand, 35160 - 35226
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35160 ttaaatatgtttttaatccctataaaattgaggca-ttttaagtttagttcttacttaattttaatag 35226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 329 - 761
Target Start/End: Original strand, 3953 - 4404
Alignment:
Q  329 ttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatt 428  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3953 ttagtccttgttacaacaaaatttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatt 4052  T
Q  429 tactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtggaagtagaaat 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||   || | ||||||||    
T  4053 tactaaaatttagaattttttaacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaat 4152  T
Q  529 caaattttgcgacaattttttg--tag-------------------aggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||                   |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  4153 caaattttgcgacaattttttgcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactca 4252  T
Q  608 agagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4253 agagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaggagagactaatactgagtgcagaaaaa---aaattagggactaaaagaacta-taaaattaagt 4348  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||   |||| ||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4349 aaaaactaaacttaaaaggtccatattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 4404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Original strand, 3737 - 3824
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3737 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatagggaccttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttagtccctac 3824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 3820 - 3738
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3820 ggactaaaaaacctattaaaattaagtaaggattaaacttaaaaggtccctattttatagggaccaaaaacatatttaaccct 3738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4405 - 4338
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaatttta 288  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4405 tagggttaaatatgtttttggtccctataaaatatggaccttttaagtttagtttttacttaatttta 4338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 260 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 7314 - 6816
Alignment:
Q  260 cttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaat 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||        |||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||||||    
T  7314 cttttaagtttaatccttatttaactttaatagcttttttagtccctacaaaaaaatttacttataattttagtctctgctaaaacaaagtttgtttaat 7215  T
Q  360 tatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaac 459  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||  |         |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7214 tatcattaaactcttaaattttttaatgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaagttcatttactaaaatttagaattttctaacacgaaac 7115  T
Q  460 gaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagat-aaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaa 558  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| || ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||    
T  7114 aaattaaatatgaattttttaaaaagataaaagttaaatataaaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgctataattttttgcggagaaa 7015  T
Q  559 cttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactg 658  Q
    |||||||||||||||| |||| | | || ||||| | || ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||||||||     
T  7014 cttttagtaatgttctaaacatgccagcaaaaaactattaaaaaatttaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattgaatagtagctaatactc 6915  T
Q  659 attggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    | || | |||   |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6914 agtgcagaaa--aaaattaaggactaaaagaattatttaaattaagtaaggactaaacttaaaaggtcccaattttatagggactaaaaatatatttaac 6817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 291
Target Start/End: Original strand, 6816 - 6883
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaata 291  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6816 ggttaaatatatttttagtccctataaaattgggaccttttaagtttagtccttacttaatttaaata 6883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 7)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 317 - 760
Target Start/End: Original strand, 25027 - 25458
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  25027 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactat 25126  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  25127 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 25226  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || ||||||||             |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25227 ggacatataaatcaaa-------------ttttgtggcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 25313  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata-ctgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||  | | || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  25314 gaataaattaaacaaatttgaattgagcagagattaatatttaaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaa 25413  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25414 cttaaaatgcctcaattttataggggctaaaaacatatttaaccc 25458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 318 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 24103 - 23671
Alignment:
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    |||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |         |||||||||| |||||        
T  24103 tacttctaattttagtcccttctaaaacaaagtttgtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac---- 24008  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtg 517  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  ||| ||| | ||    
T  24007 ---ggttcaattactaaaatttagaattttttaatttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctg 23911  T
Q  518 gaagtagaaatcaaattttgcga-caattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct-gcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
     |  || ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||    ||||||    
T  23910 aacatataaatcaaattttgcgattatttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagttta 23814  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |  | |   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||     
T  23813 agcataaattaaacaaatttgaattgagtagagactaatactaagttcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggattaaa 23714  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaac 758  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23713 cttaaaatgcctcaattttaaagggactaaaaacatatttaac 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 528 - 760
Target Start/End: Original strand, 23050 - 23282
Alignment:
Q  528 tcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaa 627  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23050 tcaaattttgcgatagttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaa 23149  T
Q  628 acaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcc 727  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  23150 acaaatttgaattgagcagagactaatactgagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcct 23249  T
Q  728 caattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23250 caattttatagggactaaaaacatatttaaccc 23282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 759
Target Start/End: Original strand, 24647 - 24798
Alignment:
Q  606 caagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagt 705  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  |  | |  || |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24647 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattgagcagagactaatactgagtg--actagtatttgtaaggactaaaacaactattaaaattaaat 24744  T
Q  706 aaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||| |||| |||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24745 aaggactaaacttaaaatgcttcaattttacagggactaaaaacatatttaacc 24798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23287 - 23213
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23287 ttattgggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 23213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 23671 - 23738
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23671 gttaaatatgtttttagtccctttaaaattgaggca-ttttaagtttaatccttacttaattttaatag 23738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25458 - 25389
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25458 gggttaaatatgtttttagcccctataaaattgaggca-ttttaagtttagtccttacttaattttaatag 25389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 317 - 757
Target Start/End: Original strand, 239982 - 240409
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  239982 ttacttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattatccttcaactgttaaatttttgaacgacttttttgagacaagtttagaacactat 240081  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgt 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  | ||||||||||||||||  ||| ||| | |    
T  240082 gaaaggttcaattaataaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatatttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatat 240181  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    |||  || | |||||||||||||             | |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  240182 ggacatatagatcaaattttgcg-------------gcggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaa 240268  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  240269 gaataaattaaacaaatttgaattgagcaaagactaatattgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaac 240368  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  240369 ttaaaatgcctcaattttatagggactaaaaacatatttaa 240409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 573 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 239561 - 239410
Alignment:
Q  573 cttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaattta 672  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || | ||  ||     
T  239561 cttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgagtaaggactaatactgagtgcataatattt 239462  T
Q  673 ttttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatg 724  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  239461 ttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatg 239410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 684 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 120708 - 120631
Alignment:
Q  684 aaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  120708 aaaataactattaaaattaattaaggactaaacttgaaagatctcaattttatacagacaaaaaacatatttaaccct 120631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 220 - 761
Target Start/End: Original strand, 3763 - 4307
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--t 317  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |    
T  3763 atagggttaaatatgtttttggtcccaataaaattgcgaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagtttttttaatccctacaaaaaaaaact 3862  T
Q  318 tacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| |||||||||    
T  3863 tacttataattatagtccctgctaaaataaattttgcttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatg 3962  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgt 516  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |  |||| ||| | |    
T  3963 aaaggttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatat 4062  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaa-ttttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    | | |||||||||||| ||||| ||  ||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4063 gaacgtagaaatcaaatttttgtga-tattttttttggaggacgttttaataacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagttta 4161  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| ||| || | |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||     
T  4162 agcataaattaaacaaatttggattgagtaagaactaatattgagtgcataaattttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataagaactaaa 4261  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    |||| || ||| ||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||    
T  4262 cttacaaggtcgcaattttgtatggaccgaaaacataattaaccct 4307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 683 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3765
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  3843 taaaaaaactattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggtcgcaattttattgggaccaaaaacatatttaaccct 3765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4308 - 4225
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || ||||||  || ||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4308 tagggttaattatgttttcggtccatacaaaattgcgaccttgtaagtttagttcttatttaattttaatagcttttttaatcc 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 220 - 543
Target Start/End: Original strand, 157901 - 158223
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn-tt 318  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||         ||    
T  157901 atagggttaaatatgtttttaatcc-tataaaattgagaacttctaagtttagtcctcacttaattttaataggtcttttagtccatacaaaaaataatt 157999  T
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatga 418  Q
     |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |       | |||||||||| ||||||||||    
T  158000 gcttctaattttactacctgttacaacaaagtttgtttaattctccttaaactcttcaatttttgaacgattttttga-gacaagtttagaacactatga 158098  T
Q  419 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattgtgg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  158099 aaggttcatttactaaaatttagaattttttaccatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgg 158198  T
Q  519 aagtagaaatcaaattttgcgacaa 543  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  158199 acgtagaaattaaattttgcgacaa 158223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 157984 - 157903
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  157984 ggactaaaagacctattaaaattaagtgaggactaaacttagaagttctcaattttatag-gattaaaaacatatttaaccct 157903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 319 - 760
Target Start/End: Original strand, 9932 - 10363
Alignment:
Q  319 acttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaac-aannnnnnnatgacaagtttataacactatg 417  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||         |||||||||| |||||||||    
T  9932 acttctaattttagtccctactaaaacaaagtttgtttaattattcttaaactcttaaattttttaatgaatttttttgagacaagtttagaacactatg 10031  T
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaatttttt--aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattg 515  Q
    ||||||||| ||| |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||   || ||| |     
T  10032 aaaggttcaattaataaaatttaattttttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaaacaataaaata 10131  T
Q  516 tggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 615  Q
    ||||  || ||||||||||||||| |             |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  10132 tggacatataaatcaaattttgcggc-------------ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtaaaaaaacttaagagttta 10218  T
Q  616 agcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaag 715  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  10219 agaataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaatattgaatgcatagtgtttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaagaactaaa 10318  T
Q  716 cttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10319 cttaaaatgactcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 10363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 574 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 9491 - 9309
Alignment:
Q  574 ttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttat 673  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |   || |    
T  9491 ttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaa-agtttaagcataaattaaacaaatttgaattgaggaaggactaatactgagtgcatagtatttt 9393  T
Q  674 tttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
    | |||||||||||| ||||||   ||||||||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9392 tgtaaggactaaaacaactat---aattaagtaaggattaaacttaaaatacctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 9309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 9309 - 9371
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaatt 285  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9309 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggta-ttttaagtttaatccttacttaatt 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10363 - 10294
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10363 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagtcattttaagtttagttcttacttaattttaatag 10294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 553 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6293 - 6072
Alignment:
Q  553 gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggacta 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  6293 gaggaacttttagtaacgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacatatttgaattgagtagggacta 6194  T
Q  653 atactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacata 752  Q
    ||| ||| || | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  6193 atattgagtgcataaactttttttagggactcaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaagaggtcccaattttttagggaccaaaaacata 6094  T
Q  753 tttaaccctttattatatttct 774  Q
    ||||||||| | || |||||||    
T  6093 tttaaccctattttttatttct 6072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 6083 - 6155
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6083 atagggttaaatatgtttttggtccctaaaaaattgggacctcttaagtttagtccttacttaattttaatag 6155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 221 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8873 - 8613
Alignment:
Q  221 tagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnnttac 320  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||        ||||    
T  8873 taggattaaatatgtttttggtccctataaaattgaaaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag-ttttttagtccctacaaaaaaaattac 8775  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |         || ||| ||| ||||||||||||    
T  8774 ttctaattttagtccctcttacaacaaagtttgtttgattattcttaaattcttaaatttttgaacgattttttttagataaggttagaacactatgaaa 8675  T
Q  421 -ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8674 aggttcatttactaaaatttagaattttttaagatgaaacgaattaaatatgaatttcttaa 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 496 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 8575 - 8362
Alignment:
Q  496 aagataaatttaacaaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattg 595  Q
    |||||||| |||||||| | |||| | | |||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||| ||| || |||| | ||||||||    
T  8575 aagataaaattaacaaaatttggacgcaaaaatcaaattttgcgacaatttgt-gcagatgaacttttagcaatgttgttaccatgtctacaaaaaattg 8477  T
Q  596 ttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattg--gaaaaatttattttaaggactaaaagaacta 693  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||   |  ||| |||||||||||||||    
T  8476 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgaagagggattaatactgaatgcagaaaaaaaaaaattagggactaaaagaacta 8377  T
Q  694 ttaaaattaagtaag 708  Q
    |||||||||| ||||    
T  8376 ttaaaattaaataag 8362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 757
Target Start/End: Original strand, 8791 - 8868
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8791 ggactaaaa-aactattaaaattaagtaaggattaaacttaaaagttttcaattttatagggaccaaaaacatatttaa 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 222 - 573
Target Start/End: Original strand, 47725 - 48077
Alignment:
Q  222 agggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnntt-ac 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||         || ||    
T  47725 agggttaaatatgtttttgatccctataaattttgaaacttataagtttagtccttacttaattttaatagcttttttagtccctataaaaataatttac 47824  T
Q  321 ttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaa 420  Q
     | || ||||||||| |   |  ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| |||| ||  | |    
T  47825 atgtagttttagtccctacgaaaacaaactttttctaattatccttaaactcttaaatttttgaacaattttcttgagacaagtttagaacattacaaga 47924  T
Q  421 ggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtgga 519  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||| |  |||    
T  47925 ggttcgttttctaaaatttagaattttttaacatgaaatgaattaaatataaattttttaa-acgacaaaagttcaagataaaagtaacaaatatccgga 48023  T
Q  520 agtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttc 573  Q
     |||||||| |||||||| || | |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  48024 cgtagaaataaaattttgagatatttttctgtaggcgaacttttagtaatgttc 48077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47807 - 47724
Alignment:
Q  679 ggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  | | || ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  47807 ggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttataagtttcaaaatttatagggatcaaaaacatatttaaccctt 47724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 32845 - 32922
Alignment:
Q  230 ttatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcccta 307  Q
    ||||||||||| || ||||||| || | ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  32845 ttatgtttttggtctctataaattttgaaacttctaagtttagtctttatttaattttaataacttttttagtcccta 32922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 556 - 760
Target Start/End: Original strand, 48967 - 49169
Alignment:
Q  556 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaata 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  48967 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattgagcagagactaa-a 49065  T
Q  656 ctgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatattt 755  Q
     ||| || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49066 ttgaatgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaatgcgtcaattttatagggact-aaaacatattt 49164  T
Q  756 aaccc 760  Q
    |||||    
T  49165 aaccc 49169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20048 - 19972
Alignment:
Q  226 ttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaat 302  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20048 ttaaatatatttttggtctctataaaattcggaccttttaaatttaatacttatttaattttaatagtttttttaat 19972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 683 - 757
Target Start/End: Original strand, 19974 - 20048
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||   |||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19974 taaaaaaactattaaaattaaataagtattaaatttaaaaggtccgaattttatagagaccaaaaatatatttaa 20048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 317 - 481
Target Start/End: Original strand, 21720 - 21884
Alignment:
Q  317 ttacttctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactat 416  Q
    |||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| ||||||||    
T  21720 ttacttataattttagtccatgctaaaacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacactat 21819  T
Q  417 gaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 481  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21820 aaaaggttcatttactaaaatttagaattttctaacatgaaacgaattaaatttgaatttcttaa 21884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 683 - 761
Target Start/End: Original strand, 21882 - 21960
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccct 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21882 taaaagaactattaaaattaagtaaggactaaacttaaaagatctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccct 21960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21962 - 21881
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa 301  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21962 atagggttaaatatgtttttagtccctataaaattgagatcttttaagtttagtccttacttaattttaatagttcttttaa 21881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 271
Target Start/End: Original strand, 21628 - 21681
Alignment:
Q  218 ttatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagttta 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  21628 ttatagggttaaatatgtttttggtccctataaaattgagaacttctaaattta 21681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 461 - 761
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3562
Alignment:
Q  461 aattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaat-tgtggaagtagaaatcaaatttt-gcgacaattttttgtagaggaa 558  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |  |||||||  | |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||   |||||     
T  3260 aattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggatgtagaaatcaaatttttgcgatatttttttcg-gaggat 3358  T
Q  559 cttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaa-ttgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatact 657  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||      
T  3359 cttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaattttgattgagtaaggactaatatg 3458  T
Q  658 gattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaa 757  Q
    || || | || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||| ||||||| ||| |||  |||||||| ||||    
T  3459 gagtgcagaatttttttgtaaggattaaaaaagctattaaaattaaataaggactaaacttataaggtcacaattttgtagggaccgaaaacataattaa 3558  T
Q  758 ccct 761  Q
    ||||    
T  3559 ccct 3562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 458
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2962
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctacnnnnnnnn--ttact 321  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||   | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||          |||||    
T  2727 ggttaaatatatttttggtccctataaaattgcaaccttctaagtttagtccttacttaattttaatagcctttttgatccctacaaaaataaatttact 2826  T
Q  322 tctaattttagtccttgttacgacaaagtttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaannnnnnnatgacaagtttataacactatgaaag 421  Q
    | ||||||||||||| | ||  | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |          |||||||||  ||||||||||||    
T  2827 tataattttagtcct-gctaaaataaattttgtttaattatcgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagcacactatgaaag 2925  T
Q  422 gttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaa 458  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2926 gttcatttactaaaatctataattttttaacatgaaa 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3572 - 3480
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatcc 304  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||  || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3572 tattttttttagggttaattatgttttcggtccctacaaaattgtgaccttataagtttagtccttatttaattttaatagcttttttaatcc 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2717
Alignment:
Q  691 ctattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctttattata 769  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  2795 ctattaaaattaagtaaggactaaacttagaaggttgcaattttatagggaccaaaaatatatttaacctttttttata 2717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 418 - 750
Target Start/End: Original strand, 283308 - 283640
Alignment:
Q  418 aaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaac-aaattgt 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  |||| ||| | |    
T  283308 aaaggttcgtttactaaaatttagaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatct 283407  T
Q  517 ggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 616  Q
    ||| | || |||  ||||||| || ||||||||| |||  || |||| || |||||||||| || | ||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  283408 ggacgcaggaatacaattttgagataattttttgcagataaaattttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaa 283507  T
Q  617 gcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagc 716  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| | | | || | || | | || || |||||||||  ||||||| ||||||||||||  | | |    
T  283508 gcat-aattaaacaaatttagatttagtagggactaaaattaagtgcataattgttttatatggactaaaaacactattataattaagtaaggatttaac 283606  T
Q  717 ttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaaca 750  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  283607 ttacaaagtctcaattttatagggaccaaaaaca 283640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 283064 - 282842
Alignment:
Q  510 aaattgtggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaag 609  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||     
T  283064 aaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaa 282965  T
Q  610 agtttaagcataaattaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaagg 709  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||| || | || ||| || || |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  282964 agtttaagcat-aattaaacaaatttagatttggtagggactaaaactgagtgcataatttttttatatggactaaaaacactattataattaagtaagg 282866  T
Q  710 cctaagcttaaaatgtcccaattt 733  Q
     |||| |||||||| |||||||||    
T  282865 actaaacttaaaatatcccaattt 282842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Original strand, 238234 - 238310
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  238234 ggttaaatatgtttttgatctctataaaattgggtacttctaagtttagtccttacttaattttaatagctttttta 238310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 238317 - 238234
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  238317 taaggactaaaaaagctattaaaattaagtaaggactaaacttagaagtacccaattttatagagatcaaaaacatatttaacc 238234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 624 - 760
Target Start/End: Original strand, 1 - 137
Alignment:
Q  624 ttaaacaaatttaaattgaggagggactaatactgattggaaaaatttattttaaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaat 723  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |   || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  1 ttaaacaaatttaaattgagtaaggactaatacttagtgcatagtatttttgtaaggactaaaacaactattaaaattaagtaaggacaaaacttaaaat 100  T
Q  724 gtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccc 760  Q
      | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  101 acctcaattttatagggactaaaaacatatttaaccc 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 137 - 68
Alignment:
Q  223 gggttaattatgtttttgatccctataaaatt-aggaacttttaagtttaatccttacttaattttaatag 292  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  137 gggttaaatatgtttttagtccctataaaattgaggta-ttttaagttttgtccttacttaattttaatag 68  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 52590 - 52512
Alignment:
Q  401 aagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52590 aagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagatttttttaacttgaaatgaattaaatatgaatttttt 52512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 52464 - 52347
Alignment:
Q  522 tagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcata 621  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||   ||| |||||||||||||||||| || | |  ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||     
T  52464 tagaaatcaaattttgagatatttttttagggagaaacttttagtaatgttctcaataggcgtgcaaaaaattatttaaaaacttaagagtttaagtat- 52366  T
Q  622 aattaaacaaatttaaatt 640  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  52365 aattaaataaatttgaatt 52347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 123563 - 123476
Alignment:
Q  212 tatttattatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggtttttta 300  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  123563 tatttatttaagggttaaatatgtttttggtccctataaaattggaaccttttaagtttagtccttactt-attttaataggtttttta 123476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 676 - 762
Target Start/End: Original strand, 123469 - 123554
Alignment:
Q  676 taaggactaaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaaccctt 762  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  123469 taaggactaaaaaacctattaaaat-aagtaaggactaaacttaaaaggttccaattttatagggaccaaaaacatatttaaccctt 123554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 479
Target Start/End: Original strand, 123242 - 123317
Alignment:
Q  404 tttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 479  Q
    |||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  123242 tttaaaacaatataaaagctgcatttactaaaatttaaaattttttaacttgagatgaattaaatataaatttttt 123317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6007 - 5927
Alignment:
Q  220 atagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaa 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6007 atagggttaaatatgtttttgatccctataaaattgagaacttgtaagtttagttcttaattaattttaat-ggttttttaa 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 683 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 27139 - 27063
Alignment:
Q  683 taaaagaactattaaaattaagtaaggcctaagcttaaaatgtcccaattttatagagactaaaaacatatttaacc 759  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27139 taaaaaaactattaaaattaaataagtactaaacttaaaaggtccgaattttatagagactaaaaacataattaacc 27063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 302
Target Start/End: Original strand, 27063 - 27141
Alignment:
Q  224 ggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaat 302  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27063 ggttaattatgtttttagtctctataaaattcggaccttttaagtttagtacttatttaattttaatagtttttttaat 27141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 308
Target Start/End: Original strand, 628 - 716
Alignment:
Q  219 tatagggttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  628 tatagggtcaaatatgtttttggtccctataaaattgtaaacttctaagtttagtctttacttaattttagta-gttttttattccctac 716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1037 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1037
Description:

Target: scaffold1037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 634 - 599
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  634 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1031 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1031
Description:

Target: scaffold1031; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 752 - 717
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  752 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9424 - 9345
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaatttaacaaa 512  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||  |||||||    
T  9424 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaa 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 134207 - 134290
Alignment:
Q  225 gttaattatgtttttgatccctataaaattaggaacttttaagtttaatccttacttaattttaataggttttttaatccctac 308  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||  |||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  134207 gttaaatatggttttgatccctataaattatggaagctttaagattagtctttacttaatttcaatagcttttttagtccctac 134290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 385
Target Start/End: Original strand, 235026 - 235061
Alignment:
Q  350 tttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaa 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  235026 tttgtttaattatgcttaaacttttaaatttttgaa 235061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6969 - 6899
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaagatgacaaaagttaaagataaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  6969 aaaaattagaattttttaacatgtaatgaattaaatattatttttttaaaaagccaaaaattcaagataaa 6899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 251
Target Start/End: Original strand, 3368 - 3405
Alignment:
Q  214 tttattatagggttaattatgtttttgatccctataaa 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3368 tttattttagggttaattatgtttttggtccctataaa 3405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43060 - 43015
Alignment:
Q  433 aaaatttagaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 478  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  43060 aaaaattagaattttttaacataacacaaattaaatatgaattttt 43015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University